View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0811_low_31 (Length: 281)

Name: NF0811_low_31
Description: NF0811
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0811_low_31
NF0811_low_31
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (11-241)||(1313557-1313787)
chr3 (15-241)||(43421298-43421524)
chr3 (15-241)||(43423346-43423572)
chr3 (11-241)||(53917540-53917773)
chr3 (11-241)||(880330-880560)
chr3 (9-241)||(3314832-3315068)
chr3 (11-226)||(27635532-27635752)
chr3 (15-241)||(6484508-6484735)
chr3 (11-241)||(45883087-45883323)
chr3 (11-241)||(53915372-53915605)
chr3 (11-219)||(51943540-51943753)
chr3 (12-241)||(4308157-4308390)
chr3 (11-241)||(1626560-1626792)
chr3 (11-241)||(51674643-51674875)
chr3 (15-218)||(12267857-12268061)
chr3 (11-241)||(36011975-36012209)
chr3 (12-241)||(43228439-43228671)
chr3 (9-241)||(17795406-17795637)
chr3 (9-241)||(19103846-19104077)
chr3 (11-241)||(32219232-32219468)
chr3 (15-241)||(32263919-32264148)
chr3 (1-241)||(3306909-3307150)
chr3 (12-241)||(27101057-27101290)
chr3 (11-241)||(18096774-18097009)
chr3 (9-241)||(4666664-4666896)
chr3 (38-241)||(47701578-47701780)
chr3 (11-241)||(24979855-24980092)
chr3 (11-241)||(53468330-53468565)
chr3 (12-241)||(9604481-9604716)
chr3 (11-241)||(18099044-18099279)
chr3 (12-241)||(43226233-43226461)
chr3 (38-241)||(6231948-6232152)
chr3 (12-205)||(41849243-41849437)
chr3 (11-241)||(25688034-25688270)
chr3 (11-241)||(42990452-42990684)
chr3 (9-241)||(18162811-18163048)
chr3 (33-241)||(47148794-47149004)
chr3 (11-241)||(1321627-1321864)
chr3 (38-226)||(48361572-48361765)
chr3 (12-241)||(5899820-5900055)
chr3 (12-241)||(10955900-10956136)
chr3 (21-241)||(23633602-23633819)
chr3 (15-241)||(53591332-53591559)
chr3 (9-241)||(28101880-28102111)
chr3 (11-241)||(15781019-15781259)
chr3 (12-241)||(5886347-5886582)
chr3 (12-241)||(10958196-10958432)
chr3 (12-241)||(51726880-51727116)
chr3 (12-241)||(25533590-25533808)
chr3 (21-241)||(54691460-54691683)
chr3 (38-241)||(5926670-5926873)
chr3 (9-241)||(28761319-28761538)
chr3 (12-241)||(11168249-11168486)
chr3 (12-241)||(10084262-10084498)
chr3 (12-241)||(38890188-38890425)
chr3 (48-241)||(39715617-39715809)
chr3 (12-241)||(5522499-5522735)
chr3 (64-241)||(25634035-25634212)
chr3 (13-224)||(31151508-31151719)
chr3 (9-142)||(880117-880251)
chr3 (12-239)||(5191803-5192035)
chr3 (11-150)||(28181242-28181383)
chr3 (12-241)||(10191185-10191419)
chr3 (12-240)||(25389055-25389291)
chr3 (15-225)||(26720711-26720928)
chr3 (55-241)||(42992418-42992606)
chr3 (94-241)||(30005989-30006137)
chr3 (12-214)||(7606476-7606670)
chr3 (114-241)||(11170552-11170678)
chr3 (12-241)||(3859676-3859895)
chr3 (13-241)||(561659-561886)
chr3 (12-241)||(22114176-22114414)
chr3 (11-241)||(4103769-4104004)
chr3 (33-151)||(8183035-8183154)
chr3 (12-241)||(746906-747143)
chr3 (13-214)||(36871185-36871384)
chr3 (139-241)||(889781-889882)
chr3 (13-241)||(25635529-25635754)
chr3 (114-194)||(35919098-35919178)
chr3 (12-179)||(53893927-53894105)
chr3 (12-241)||(50494148-50494383)
chr3 (12-241)||(458433-458669)
chr3 (12-241)||(456056-456292)
chr3 (65-238)||(1620394-1620567)
chr3 (12-241)||(10621400-10621638)
chr3 (12-241)||(28412904-28413140)
chr3 (109-241)||(24181528-24181660)
chr3 (69-241)||(53597384-53597557)
chr3 (139-241)||(35917952-35918052)
chr3 (11-164)||(42992610-42992766)
chr3 (12-241)||(6065667-6065904)
chr3 (176-235)||(54884308-54884367)
chr3 (12-241)||(6063317-6063554)
chr3 (12-97)||(11170671-11170755)
chr3 (167-241)||(29956834-29956907)
chr3 (168-241)||(13420222-13420295)
chr3 (84-239)||(14634393-14634549)
chr3 (12-178)||(38210580-38210755)
chr3 (172-241)||(6561958-6562028)
chr3 (64-217)||(27420822-27420973)
chr3 (145-191)||(28181185-28181230)
chr3 (38-150)||(26763205-26763313)
chr3 (62-186)||(1674166-1674292)
chr3 (153-225)||(11007545-11007617)
chr3 (123-173)||(30236249-30236299)
chr3 (129-178)||(16264354-16264403)
chr3 (129-178)||(25795785-25795834)
chr3 (129-178)||(32143325-32143374)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (11-241)||(33415368-33415599)
chr4 (11-241)||(38928058-38928288)
chr4 (11-241)||(16453531-16453762)
chr4 (11-241)||(22800739-22800973)
chr4 (12-241)||(4215528-4215756)
chr4 (11-241)||(36921372-36921604)
chr4 (11-241)||(40091294-40091526)
chr4 (12-241)||(17662125-17662356)
chr4 (11-241)||(22802611-22802845)
chr4 (12-241)||(40637296-40637531)
chr4 (11-241)||(36919463-36919695)
chr4 (12-241)||(24889018-24889251)
chr4 (11-215)||(47563009-47563213)
chr4 (11-241)||(47274948-47275178)
chr4 (11-238)||(2891516-2891746)
chr4 (38-241)||(24879211-24879419)
chr4 (13-241)||(36378514-36378742)
chr4 (12-241)||(14633540-14633776)
chr4 (9-241)||(37312956-37313177)
chr4 (38-241)||(24880673-24880883)
chr4 (11-241)||(5101151-5101370)
chr4 (11-241)||(12395724-12395956)
chr4 (11-241)||(12400686-12400918)
chr4 (11-241)||(13547376-13547609)
chr4 (11-241)||(16455463-16455680)
chr4 (22-241)||(48486541-48486764)
chr4 (11-226)||(14787308-14787527)
chr4 (12-241)||(5635351-5635587)
chr4 (49-241)||(36380571-36380764)
chr4 (9-241)||(18409225-18409458)
chr4 (11-241)||(37089246-37089482)
chr4 (12-241)||(22046561-22046796)
chr4 (12-241)||(8631293-8631530)
chr4 (11-201)||(6133098-6133291)
chr4 (9-239)||(19096107-19096338)
chr4 (12-241)||(22044266-22044501)
chr4 (11-222)||(27499283-27499502)
chr4 (11-194)||(14789307-14789495)
chr4 (11-241)||(24446536-24446752)
chr4 (9-241)||(41997714-41997943)
chr4 (12-241)||(9148475-9148693)
chr4 (12-241)||(24348440-24348659)
chr4 (12-241)||(51015468-51015703)
chr4 (9-242)||(619330-619559)
chr4 (11-241)||(6765066-6765301)
chr4 (12-241)||(26085851-26086087)
chr4 (12-241)||(31849473-31849709)
chr4 (12-241)||(11435177-11435413)
chr4 (13-241)||(18537360-18537586)
chr4 (13-241)||(19322915-19323142)
chr4 (15-241)||(38890112-38890337)
chr4 (12-241)||(2484748-2484983)
chr4 (13-241)||(12102309-12102531)
chr4 (12-241)||(7941545-7941781)
chr4 (12-241)||(5198642-5198862)
chr4 (12-241)||(11006128-11006347)
chr4 (62-241)||(25357863-25358042)
chr4 (12-241)||(11437585-11437821)
chr4 (13-241)||(18534718-18534944)
chr4 (12-241)||(11008442-11008676)
chr4 (12-241)||(38409427-38409662)
chr4 (15-164)||(52942368-52942523)
chr4 (15-223)||(30136789-30136996)
chr4 (12-241)||(47868623-47868860)
chr4 (12-171)||(3937160-3937316)
chr4 (38-225)||(3982087-3982272)
chr4 (9-241)||(53405357-53405594)
chr4 (13-241)||(8756138-8756363)
chr4 (11-241)||(49088791-49089010)
chr4 (11-149)||(3824483-3824630)
chr4 (12-241)||(18847376-18847610)
chr4 (9-110)||(56030815-56030913)
chr4 (12-241)||(9176348-9176584)
chr4 (12-241)||(22134491-22134727)
chr4 (12-241)||(9174020-9174256)
chr4 (12-241)||(16931665-16931899)
chr4 (13-241)||(15032429-15032660)
chr4 (65-214)||(16185770-16185920)
chr4 (38-239)||(28453906-28454109)
chr4 (12-241)||(18709038-18709274)
chr4 (12-97)||(47210671-47210754)
chr4 (12-241)||(22132263-22132502)
chr4 (13-239)||(9863931-9864160)
chr4 (149-241)||(13544181-13544272)
chr4 (12-241)||(22782611-22782848)
chr4 (139-241)||(47210762-47210863)
chr4 (105-241)||(16934118-16934253)
chr4 (62-241)||(47150826-47151005)
chr4 (126-225)||(26557823-26557922)
chr4 (62-215)||(22295412-22295565)
chr4 (114-241)||(22780358-22780483)
chr4 (12-241)||(44599714-44599948)
chr4 (13-97)||(5664605-5664687)
chr4 (40-214)||(10114565-10114737)
chr4 (166-225)||(31983564-31983623)
chr4 (181-222)||(54928700-54928741)
chr4 (11-74)||(38270028-38270088)
chr4 (166-226)||(9022543-9022602)
chr4 (170-225)||(40998990-40999045)
chr4 (84-225)||(3578632-3578766)
chr4 (129-179)||(5269234-5269284)
chr4 (38-225)||(10113108-10113292)
chr4 (65-118)||(52043497-52043550)
chr4 (196-241)||(3824636-3824681)
chr4 (129-178)||(5143263-5143312)
chr4 (196-241)||(5637531-5637576)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (11-241)||(44724757-44724988)
chr7 (11-241)||(13099351-13099587)
chr7 (9-241)||(42330878-42331108)
chr7 (11-241)||(31434927-31435158)
chr7 (11-241)||(443773-444008)
chr7 (20-241)||(22393900-22394120)
chr7 (11-241)||(21592023-21592254)
chr7 (11-241)||(24748772-24749000)
chr7 (11-241)||(27306110-27306341)
chr7 (9-226)||(21990343-21990563)
chr7 (11-241)||(9679237-9679470)
chr7 (82-241)||(20137061-20137220)
chr7 (11-241)||(4295815-4296045)
chr7 (16-241)||(20626216-20626443)
chr7 (16-241)||(20630107-20630334)
chr7 (16-241)||(20642526-20642753)
chr7 (11-240)||(21678245-21678472)
chr7 (11-241)||(42223336-42223566)
chr7 (11-241)||(37412001-37412238)
chr7 (12-241)||(48457831-48458067)
chr7 (11-241)||(9680998-9681231)
chr7 (11-241)||(39145865-39146098)
chr7 (12-241)||(38394164-38394400)
chr7 (14-241)||(21680205-21680435)
chr7 (12-241)||(20299638-20299874)
chr7 (12-241)||(7471855-7472091)
chr7 (11-241)||(27832522-27832744)
chr7 (12-241)||(18345719-18345955)
chr7 (13-241)||(26295625-26295850)
chr7 (11-241)||(7092087-7092323)
chr7 (12-241)||(44742-44978)
chr7 (12-241)||(20297540-20297776)
chr7 (9-241)||(11355436-11355672)
chr7 (12-241)||(1850159-1850395)
chr7 (23-241)||(3035902-3036127)
chr7 (11-241)||(7094334-7094571)
chr7 (12-241)||(28485744-28485979)
chr7 (12-241)||(40836618-40836853)
chr7 (15-241)||(43253394-43253628)
chr7 (13-226)||(7188732-7188942)
chr7 (15-164)||(26804764-26804917)
chr7 (12-241)||(28487731-28487967)
chr7 (12-241)||(35807-36043)
chr7 (9-226)||(24465730-24465943)
chr7 (12-241)||(40946506-40946744)
chr7 (12-241)||(3878755-3878993)
chr7 (15-241)||(7469901-7470133)
chr7 (11-149)||(22251464-22251605)
chr7 (12-176)||(11759369-11759541)
chr7 (12-241)||(25542707-25542942)
chr7 (105-241)||(24258641-24258781)
chr7 (12-241)||(38396813-38397053)
chr7 (83-241)||(24813450-24813610)
chr7 (63-241)||(6332398-6332574)
chr7 (116-241)||(1049283-1049406)
chr7 (116-241)||(1046912-1047035)
chr7 (12-240)||(1606559-1606793)
chr7 (88-225)||(11081703-11081842)
chr7 (84-241)||(25276319-25276465)
chr7 (12-241)||(2935447-2935683)
chr7 (12-240)||(9027068-9027303)
chr7 (38-222)||(16296934-16297115)
chr7 (114-240)||(22108246-22108370)
chr7 (114-240)||(22137257-22137381)
chr7 (114-240)||(40550006-40550130)
chr7 (114-240)||(40552284-40552408)
chr7 (12-241)||(7351526-7351762)
chr7 (64-241)||(24817287-24817465)
chr7 (114-241)||(31155896-31156021)
chr7 (23-119)||(6349097-6349191)
chr7 (166-241)||(20091584-20091656)
chr7 (169-241)||(22828672-22828744)
chr7 (141-241)||(6046672-6046772)
chr7 (12-87)||(1049164-1049239)
chr7 (109-239)||(13290454-13290583)
chr7 (170-225)||(22280379-22280434)
chr7 (114-239)||(6067183-6067309)
chr7 (12-241)||(7349152-7349383)
chr7 (180-241)||(6348960-6349021)
chr7 (12-87)||(1046792-1046868)
chr7 (9-51)||(20137024-20137066)
chr7 (12-65)||(22137439-22137493)
chr7 (64-214)||(40281316-40281468)
chr7 (12-65)||(40552466-40552520)
chr7 (123-199)||(2075226-2075303)
chr7 (129-178)||(9190052-9190101)
chr7 (196-241)||(11757408-11757453)
chr7 (129-173)||(12097867-12097911)
chr7 (13-107)||(20091041-20091132)
chr7 (188-241)||(22251604-22251661)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (24-241)||(22407346-22407565)
chr2 (11-241)||(19007784-19008016)
chr2 (11-241)||(6258696-6258928)
chr2 (11-241)||(6264027-6264260)
chr2 (13-241)||(14837411-14837642)
chr2 (13-241)||(28459073-28459301)
chr2 (11-241)||(42923385-42923620)
chr2 (15-241)||(28196781-28197007)
chr2 (12-241)||(43623458-43623691)
chr2 (11-241)||(22287215-22287447)
chr2 (15-219)||(22162907-22163111)
chr2 (11-241)||(17849261-17849493)
chr2 (11-239)||(21520568-21520802)
chr2 (11-241)||(5375224-5375457)
chr2 (38-241)||(22707657-22707864)
chr2 (11-194)||(3022362-3022548)
chr2 (12-241)||(17848585-17848814)
chr2 (15-241)||(31732666-31732888)
chr2 (47-241)||(44288982-44289179)
chr2 (12-241)||(45279876-45280095)
chr2 (48-241)||(40031968-40032169)
chr2 (44-241)||(23870960-23871161)
chr2 (11-241)||(7462824-7463059)
chr2 (11-241)||(27104942-27105178)
chr2 (104-242)||(11739534-11739672)
chr2 (12-241)||(23452111-23452348)
chr2 (9-241)||(45238874-45239088)
chr2 (67-241)||(18800251-18800425)
chr2 (11-241)||(34979468-34979690)
chr2 (12-241)||(13909920-13910155)
chr2 (11-241)||(11577991-11578220)
chr2 (13-241)||(17897134-17897357)
chr2 (109-241)||(22874274-22874406)
chr2 (11-153)||(15539409-15539553)
chr2 (12-241)||(24162098-24162333)
chr2 (12-241)||(42064659-42064878)
chr2 (114-241)||(42452925-42453050)
chr2 (105-241)||(19501986-19502122)
chr2 (105-241)||(19504321-19504457)
chr2 (62-225)||(20146540-20146704)
chr2 (12-241)||(36558755-36558974)
chr2 (63-241)||(40699518-40699697)
chr2 (12-241)||(36561015-36561251)
chr2 (23-107)||(38020360-38020444)
chr2 (12-241)||(35217844-35218073)
chr2 (16-174)||(20592288-20592444)
chr2 (92-221)||(35107458-35107590)
chr2 (12-241)||(35215467-35215696)
chr2 (114-241)||(45332166-45332291)
chr2 (9-241)||(37962823-37963050)
chr2 (12-95)||(19501876-19501958)
chr2 (9-65)||(22874431-22874487)
chr2 (12-93)||(19504211-19504291)
chr2 (12-67)||(42453802-42453857)
chr2 (181-241)||(20589835-20589895)
chr2 (21-105)||(38414071-38414155)
chr2 (84-210)||(17921871-17921996)
chr2 (181-239)||(15694050-15694108)
chr2 (166-214)||(33604092-33604140)
chr2 (11-74)||(11739455-11739518)
chr2 (117-215)||(39287262-39287361)
chr2 (200-241)||(27136195-27136236)
chr2 (126-241)||(13828338-13828454)
chr2 (129-173)||(17057369-17057413)
chr2 (129-173)||(17085352-17085396)
chr2 (123-214)||(17943631-17943723)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (11-241)||(18511090-18511323)
chr5 (11-241)||(2724061-2724293)
chr5 (11-241)||(40221690-40221929)
chr5 (9-241)||(36208744-36208975)
chr5 (13-241)||(696045-696273)
chr5 (9-241)||(10474200-10474434)
chr5 (11-241)||(1189486-1189720)
chr5 (16-225)||(18509201-18509413)
chr5 (9-241)||(39854651-39854889)
chr5 (15-241)||(26097900-26098127)
chr5 (9-241)||(25904271-25904505)
chr5 (11-217)||(21288953-21289159)
chr5 (15-241)||(658241-658464)
chr5 (11-226)||(41585614-41585840)
chr5 (11-241)||(17818369-17818601)
chr5 (11-241)||(16092079-16092311)
chr5 (11-241)||(36402204-36402439)
chr5 (11-241)||(6745236-6745473)
chr5 (1-226)||(6756675-6756901)
chr5 (11-241)||(21948194-21948434)
chr5 (11-226)||(18596828-18597045)
chr5 (11-241)||(20505721-20505952)
chr5 (11-226)||(2818211-2818431)
chr5 (15-240)||(2954586-2954811)
chr5 (9-241)||(17073051-17073289)
chr5 (11-221)||(26098165-26098380)
chr5 (11-241)||(37705661-37705891)
chr5 (11-241)||(24127024-24127257)
chr5 (11-226)||(31472493-31472709)
chr5 (11-192)||(20043206-20043390)
chr5 (11-241)||(6747473-6747709)
chr5 (12-241)||(25804193-25804428)
chr5 (12-241)||(25921348-25921584)
chr5 (15-240)||(31465871-31466089)
chr5 (12-241)||(38882274-38882492)
chr5 (15-241)||(6661074-6661297)
chr5 (12-241)||(10528972-10529210)
chr5 (11-241)||(18466852-18467089)
chr5 (11-241)||(16776326-16776560)
chr5 (11-241)||(27912704-27912941)
chr5 (12-241)||(4236797-4237032)
chr5 (12-241)||(34476927-34477163)
chr5 (12-241)||(34479292-34479528)
chr5 (12-241)||(2175087-2175305)
chr5 (43-241)||(39397916-39398104)
chr5 (11-241)||(10587000-10587219)
chr5 (13-223)||(20054021-20054231)
chr5 (15-241)||(39798215-39798431)
chr5 (11-238)||(18469182-18469414)
chr5 (15-241)||(27910618-27910834)
chr5 (12-241)||(21684327-21684562)
chr5 (15-215)||(12555796-12556008)
chr5 (12-241)||(4410191-4410425)
chr5 (12-240)||(38960006-38960241)
chr5 (12-241)||(10749869-10750104)
chr5 (15-241)||(9020386-9020612)
chr5 (11-107)||(20045290-20045386)
chr5 (13-239)||(15445154-15445376)
chr5 (12-241)||(10757345-10757580)
chr5 (11-110)||(34530593-34530692)
chr5 (12-204)||(31542939-31543138)
chr5 (69-239)||(4897899-4898068)
chr5 (12-241)||(3373011-3373247)
chr5 (114-240)||(15354560-15354684)
chr5 (114-240)||(23665213-23665337)
chr5 (114-240)||(23741844-23741968)
chr5 (114-240)||(23793250-23793374)
chr5 (61-241)||(15143634-15143817)
chr5 (114-240)||(15356836-15356960)
chr5 (12-241)||(31179247-31179481)
chr5 (161-241)||(17413198-17413278)
chr5 (114-241)||(15552414-15552539)
chr5 (114-241)||(31545249-31545374)
chr5 (64-214)||(2144504-2144647)
chr5 (84-225)||(35430365-35430506)
chr5 (196-241)||(42770978-42771023)
chr5 (188-241)||(34530724-34530777)
chr5 (181-239)||(20045210-20045268)
chr5 (14-121)||(42771064-42771167)
chr5 (129-178)||(10281755-10281804)
chr5 (129-174)||(31300644-31300689)
chr5 (12-95)||(15552569-15552650)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (11-241)||(11457356-11457588)
chr1 (12-241)||(47906438-47906670)
chr1 (9-241)||(17186011-17186241)
chr1 (11-241)||(16429125-16429353)
chr1 (11-241)||(25251155-25251388)
chr1 (11-241)||(31424896-31425128)
chr1 (11-241)||(4131256-4131493)
chr1 (11-241)||(14097849-14098083)
chr1 (11-226)||(18307292-18307509)
chr1 (11-241)||(9240968-9241199)
chr1 (15-241)||(17319055-17319283)
chr1 (9-241)||(13215249-13215486)
chr1 (11-241)||(40134112-40134344)
chr1 (11-226)||(2949113-2949329)
chr1 (11-241)||(18839755-18839988)
chr1 (13-241)||(6114989-6115216)
chr1 (21-241)||(16428821-16429040)
chr1 (11-241)||(17324513-17324749)
chr1 (40-241)||(50076583-50076785)
chr1 (11-226)||(28206946-28207164)
chr1 (9-241)||(38925360-38925591)
chr1 (11-226)||(6995574-6995798)
chr1 (11-226)||(12302385-12302603)
chr1 (11-242)||(39462686-39462922)
chr1 (11-241)||(25248432-25248665)
chr1 (11-241)||(27336818-27337052)
chr1 (11-241)||(31490081-31490312)
chr1 (9-241)||(50307421-50307659)
chr1 (11-241)||(27339009-27339243)
chr1 (12-241)||(15294711-15294947)
chr1 (12-241)||(23816054-23816289)
chr1 (60-241)||(6756694-6756877)
chr1 (11-241)||(41647088-41647321)
chr1 (15-241)||(50248455-50248685)
chr1 (12-241)||(51750207-51750443)
chr1 (11-241)||(15823714-15823950)
chr1 (12-241)||(2510219-2510438)
chr1 (12-241)||(10399704-10399941)
chr1 (12-241)||(31735399-31735634)
chr1 (13-237)||(15916562-15916786)
chr1 (11-241)||(17324231-17324474)
chr1 (11-241)||(25128040-25128273)
chr1 (11-226)||(28998128-28998351)
chr1 (11-226)||(29003844-29004067)
chr1 (15-242)||(16432561-16432783)
chr1 (12-241)||(28840848-28841083)
chr1 (12-241)||(13762005-13762240)
chr1 (12-241)||(2617684-2617922)
chr1 (11-239)||(39932243-39932480)
chr1 (100-241)||(50078793-50078934)
chr1 (12-241)||(28842663-28842898)
chr1 (12-241)||(46431582-46431820)
chr1 (13-241)||(14183490-14183705)
chr1 (100-241)||(3579589-3579729)
chr1 (12-194)||(13358787-13358978)
chr1 (52-239)||(49495137-49495322)
chr1 (11-241)||(31422740-31422986)
chr1 (15-226)||(47451825-47452027)
chr1 (13-241)||(18800458-18800686)
chr1 (12-155)||(13447150-13447301)
chr1 (12-241)||(51757699-51757939)
chr1 (116-241)||(6823182-6823306)
chr1 (13-241)||(13125346-13125571)
chr1 (117-241)||(24325831-24325954)
chr1 (16-241)||(30790288-30790514)
chr1 (13-241)||(8347161-8347386)
chr1 (12-241)||(9459311-9459529)
chr1 (12-241)||(9463138-9463356)
chr1 (12-241)||(20302627-20302846)
chr1 (11-110)||(50078670-50078769)
chr1 (38-241)||(15669304-15669507)
chr1 (83-241)||(42922398-42922557)
chr1 (12-241)||(20291625-20291861)
chr1 (11-105)||(3579464-3579558)
chr1 (105-241)||(51752532-51752667)
chr1 (63-241)||(16561635-16561813)
chr1 (12-241)||(23786008-23786244)
chr1 (12-241)||(16226336-16226573)
chr1 (11-241)||(8348938-8349165)
chr1 (11-97)||(25860287-25860369)
chr1 (13-222)||(13127576-13127782)
chr1 (84-241)||(26613194-26613353)
chr1 (12-241)||(16231732-16231968)
chr1 (65-225)||(27916681-27916840)
chr1 (166-241)||(21948227-21948301)
chr1 (109-241)||(30738609-30738743)
chr1 (21-96)||(30780361-30780436)
chr1 (166-239)||(155877-155949)
chr1 (181-238)||(43104332-43104389)
chr1 (12-241)||(47177531-47177767)
chr1 (12-241)||(47179882-47180118)
chr1 (182-241)||(48665346-48665404)
chr1 (21-91)||(51752696-51752764)
chr1 (123-214)||(21353342-21353434)
chr1 (12-71)||(24326008-24326067)
chr1 (70-121)||(26520061-26520114)
chr1 (129-173)||(4552637-4552681)
chr1 (181-217)||(8213579-8213615)
chr1 (188-220)||(28279455-28279487)
chr1 (129-173)||(31659362-31659406)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (11-241)||(24338329-24338558)
chr6 (11-241)||(9020129-9020364)
chr6 (11-241)||(3629745-3629975)
chr6 (11-241)||(3631818-3632049)
chr6 (12-241)||(11982906-11983140)
chr6 (23-241)||(1069609-1069830)
chr6 (11-219)||(30728703-30728913)
chr6 (11-241)||(15346550-15346779)
chr6 (11-241)||(15367234-15367464)
chr6 (59-241)||(12186000-12186183)
chr6 (12-241)||(28241196-28241432)
chr6 (11-241)||(13057397-13057625)
chr6 (11-240)||(15541024-15541250)
chr6 (83-241)||(13039957-13040117)
chr6 (11-241)||(32280199-32280429)
chr6 (9-240)||(14466527-14466759)
chr6 (12-241)||(14507051-14507286)
chr6 (12-241)||(1230123-1230360)
chr6 (12-241)||(4816105-4816342)
chr6 (12-241)||(26065186-26065421)
chr6 (12-241)||(26085155-26085390)
chr6 (12-241)||(30967404-30967640)
chr6 (12-241)||(2628760-2628996)
chr6 (14-241)||(14458643-14458878)
chr6 (15-241)||(3233605-3233841)
chr6 (110-241)||(3390582-3390713)
chr6 (9-241)||(15719845-15720074)
chr6 (121-241)||(15532674-15532792)
chr6 (15-241)||(3027740-3027965)
chr6 (76-241)||(12161502-12161668)
chr6 (12-241)||(19704438-19704679)
chr6 (13-241)||(19696643-19696868)
chr6 (12-241)||(30034480-30034714)
chr6 (100-212)||(10584227-10584340)
chr6 (12-241)||(29754583-29754819)
chr6 (67-214)||(22857891-22858038)
chr6 (109-241)||(25477477-25477616)
chr6 (12-241)||(26068269-26068505)
chr6 (49-226)||(26945362-26945539)
chr6 (12-240)||(33309061-33309296)
chr6 (62-225)||(25465524-25465686)
chr6 (12-241)||(20915231-20915466)
chr6 (12-240)||(33311330-33311565)
chr6 (12-241)||(26065995-26066234)
chr6 (12-241)||(26932437-26932672)
chr6 (14-105)||(3394708-3394800)
chr6 (13-241)||(17012243-17012466)
chr6 (15-107)||(25480217-25480309)
chr6 (62-239)||(12937126-12937302)
chr6 (126-241)||(16455421-16455537)
chr6 (62-241)||(28037659-28037841)
chr6 (69-225)||(28078136-28078291)
chr6 (11-141)||(22490917-22491045)
chr6 (12-241)||(5273090-5273326)
chr6 (12-241)||(12195388-12195625)
chr6 (100-241)||(25078529-25078669)
chr6 (154-239)||(12911471-12911555)
chr6 (167-239)||(30445729-30445801)
chr6 (12-62)||(18322482-18322532)
chr6 (172-241)||(15530166-15530233)
chr6 (54-122)||(15530084-15530156)
chr6 (188-241)||(22490843-22490896)
chr6 (180-239)||(3833481-3833541)
chr6 (65-148)||(17904287-17904368)
chr6 (168-239)||(20527011-20527081)
chr6 (83-199)||(30443532-30443652)
chr6 (109-225)||(11262678-11262793)
chr6 (129-178)||(31936591-31936640)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (11-241)||(15072935-15073168)
chr8 (11-241)||(14419069-14419302)
chr8 (15-241)||(30480386-30480614)
chr8 (11-241)||(36865759-36865995)
chr8 (11-226)||(41382901-41383120)
chr8 (11-241)||(25952744-25952976)
chr8 (11-241)||(15956181-15956409)
chr8 (11-222)||(13858368-13858577)
chr8 (11-241)||(15068205-15068438)
chr8 (11-226)||(33541289-33541506)
chr8 (11-240)||(15185598-15185825)
chr8 (12-241)||(28251445-28251678)
chr8 (11-241)||(27106781-27107008)
chr8 (11-241)||(14807975-14808217)
chr8 (9-241)||(2468010-2468241)
chr8 (22-226)||(41384983-41385192)
chr8 (64-241)||(1225390-1225568)
chr8 (9-241)||(21482534-21482766)
chr8 (12-241)||(3874234-3874453)
chr8 (11-184)||(37214143-37214319)
chr8 (11-241)||(35872335-35872551)
chr8 (11-241)||(5372060-5372289)
chr8 (12-241)||(43530339-43530575)
chr8 (9-241)||(21480726-21480958)
chr8 (11-241)||(27827210-27827446)
chr8 (11-241)||(27829521-27829757)
chr8 (12-241)||(15809442-15809678)
chr8 (12-241)||(4424242-4424479)
chr8 (12-241)||(32339533-32339770)
chr8 (12-226)||(22684527-22684749)
chr8 (12-241)||(608958-609197)
chr8 (12-241)||(28283096-28283330)
chr8 (13-241)||(3005521-3005743)
chr8 (12-241)||(18810932-18811168)
chr8 (12-241)||(18813106-18813342)
chr8 (13-241)||(31162433-31162664)
chr8 (43-145)||(181798-181901)
chr8 (11-194)||(14477520-14477706)
chr8 (110-241)||(27911238-27911367)
chr8 (110-241)||(27957657-27957786)
chr8 (12-241)||(44721068-44721303)
chr8 (62-241)||(31035342-31035522)
chr8 (64-239)||(31578216-31578387)
chr8 (100-225)||(6376229-6376354)
chr8 (12-241)||(43082198-43082433)
chr8 (12-241)||(43079827-43080062)
chr8 (160-237)||(16833777-16833854)
chr8 (12-97)||(3883470-3883553)
chr8 (11-105)||(27911441-27911533)
chr8 (11-105)||(27957860-27957952)
chr8 (166-224)||(3896063-3896121)
chr8 (168-222)||(14419732-14419786)
chr8 (166-241)||(181726-181797)
chr8 (12-97)||(24873073-24873158)
chr8 (64-150)||(31566493-31566578)
chr8 (129-178)||(19752438-19752487)
chr8 (114-158)||(28228669-28228714)
chr8 (198-239)||(31573794-31573835)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (12-241)||(14264-14493)
scaffold0131 (65-241)||(15196-15369)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (21-241)||(85407-85629)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (11-241)||(4173-4403)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (11-241)||(79362-79597)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (12-241)||(183516-183752)
scaffold0005 (11-226)||(52203-52422)
scaffold0005 (11-194)||(50235-50423)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-226)||(80051-80271)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-241)||(41358-41594)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (48-241)||(11387-11584)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-194)||(35817-36005)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (12-241)||(1327-1563)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (11-241)||(69166-69402)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (15-241)||(1529-1754)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-241)||(29348-29583)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (13-241)||(16536-16762)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (83-241)||(15774-15933)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (12-163)||(1326-1485)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (12-241)||(6377-6612)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (12-241)||(219-439)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (114-240)||(22294-22418)
scaffold0140 (114-240)||(24569-24693)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (12-241)||(3057-3292)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (12-97)||(12749-12832)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (116-179)||(4666-4729)
scaffold0891 (15-97)||(4555-4635)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (67-240)||(57367-57539)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (166-241)||(2218-2292)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1313787 - 1313557
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1313787 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 1313688  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1313687 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 1313589  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313588 acaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1313557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 43421298 - 43421524
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43421298 ttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacagcgagagaaaagaagag 43421397  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43421398 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 43421496  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43421497 aagagatatcaatgggttacaagaataa 43421524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 43423346 - 43423572
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43423346 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagag 43423445  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43423446 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 43423544  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||    
T  43423545 aagagatatcaatgagttacaagaataa 43423572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 53917540 - 53917773
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  53917540 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 53917639  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  53917640 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 53917738  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53917739 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53917773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 880330 - 880560
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  880330 aaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 880429  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  880430 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactata-tgatgagtaacttt 880528  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  880529 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 880560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3315068 - 3314832
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  3315068 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaacgtagaaaacagcgagagaga 3314969  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  3314968 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaata 3314869  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3314868 attttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3314832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27635532 - 27635752
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  27635532 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 27635631  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27635632 agagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagta 27635730  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  27635731 acgttacaaaagagatgtcaat 27635752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6484735 - 6484508
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaaga 112  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6484735 ttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaataaga 6484636  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6484635 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttaca 6484537  T
Q  213 aaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  6484536 aaaaagatatcaatgggttacaagaataa 6484508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45883323 - 45883087
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||        
T  45883323 aaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccagaagtagaaaacagcaagagaaaaga 45883224  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  45883223 agagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagt 45883125  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  45883124 aacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 45883087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 53915372 - 53915605
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  53915372 aaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 53915471  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  53915472 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaac 53915570  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53915571 attacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53915605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51943753 - 51943540
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51943753 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 51943654  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51943653 agagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 51943555  T
Q  205 actttacaaaagaga 219  Q
    || ||||||||||||    
T  51943554 acgttacaaaagaga 51943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 4308157 - 4308390
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  4308157 aacttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 4308256  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  4308257 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 4308355  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4308356 gttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4308390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1626560 - 1626792
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||| |       
T  1626560 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaaaacaacgagagagaaag 1626659  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  1626660 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacc 1626758  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1626759 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1626792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 51674643 - 51674875
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  51674643 aaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 51674742  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||     
T  51674743 gaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaaca 51674841  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51674842 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 51674875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 12267857 - 12268061
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaagaaga 112  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  12267857 ttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaga 12267956  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12267957 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttaca 12268055  T
Q  213 aaagag 218  Q
    ||||||    
T  12268056 aaagag 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36012209 - 36011975
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  36012209 aaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 36012110  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  36012109 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaa 36012011  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36012010 cgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36011975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43228671 - 43228439
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||| ||     
T  43228671 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagtaaa 43228573  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  43228572 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaac 43228474  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43228473 gttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43228439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17795637 - 17795406
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  17795637 ataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 17795541  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17795540 gaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaac 17795441  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17795440 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17795406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19104077 - 19103846
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  19104077 ataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 19103981  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19103980 gaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaac 19103881  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19103880 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19103846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32219468 - 32219232
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  32219468 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 32219369  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32219368 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 32219270  T
Q  205 ac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  32219269 acgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataa 32219232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 32263919 - 32264148
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  32263919 ttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaag 32264018  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32264019 agagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 32264117  T
Q  212 -aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32264118 aaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32264148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3307150 - 3306909
Alignment:
Q  1 ccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc 99  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3307150 ccaataaca-aaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagc 3307052  T
Q  100 ga--gagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 196  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  3307051 gaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtcta--ggagagagcaaccatccttttcactataat 3306954  T
Q  197 gatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3306953 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3306909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 27101057 - 27101290
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||     
T  27101057 aacttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcaaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaa 27101156  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27101157 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaac 27101255  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27101256 gttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 27101290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18096774 - 18097009
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  18096774 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 18096873  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  18096874 aaagaagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagta 18096972  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||| || |||||| | ||||||||||||    
T  18096973 acgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataa 18097009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4666896 - 4666664
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--- 105  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||       
T  4666896 ataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtataaaacagcgagagagaa 4666797  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4666796 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 4666700  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4666699 ccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 4666664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 47701578 - 47701780
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47701578 tcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaggaaagagaacgcaaaagaatttgttgatc 47701677  T
Q  138 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 237  Q
     |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47701678 cagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 47701776  T
Q  238 ataa 241  Q
    ||||    
T  47701777 ataa 47701780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24980092 - 24979855
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgagag- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||     
T  24980092 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaacaacaacgagaga 24979993  T
Q  105 -aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24979992 aaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagt 24979894  T
Q  204 aac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  24979893 aacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataa 24979855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 53468330 - 53468565
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |       
T  53468330 aaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaatagcgagagagaaag 53468429  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt--ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53468430 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 53468529  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53468530 ccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53468565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9604481 - 9604716
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||     
T  9604481 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataatcacaggccaaaaatagaaaacaacagcgagagaaaa 9604580  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  9604581 gaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 9604679  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9604680 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18099044 - 18099279
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  18099044 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 18099143  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18099144 aaagaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagta 18099242  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18099243 atgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43226461 - 43226233
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa--acagcgagagaaa-- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  43226461 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaacaacagcgagagaaaag 43226364  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||     
T  43226363 gaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg 43226267  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43226266 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43226233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6232152 - 6231948
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttga 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232152 tcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaaataaaaaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttga 6232053  T
Q  136 cctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 235  Q
    || ||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6232052 cccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaa 6231954  T
Q  236 gaataa 241  Q
    ||||||    
T  6231953 gaataa 6231948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41849437 - 41849243
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga----aa 107  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    ||    
T  41849437 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaaa 41849340  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41849339 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25688034 - 25688270
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc---gagagaa 106  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  25688034 aaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaaaacatcaacgagagaa 25688133  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  25688134 aaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgta 25688232  T
Q  205 ac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25688233 acgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25688270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42990684 - 42990452
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |    
T  42990684 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 42990587  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  42990586 aaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaa 42990488  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  42990487 cgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42990452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18163048 - 18162811
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac---agcgagag 104  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18163048 ataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactgcagcgagag 18162949  T
Q  105 aaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18162948 aaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgag 18162851  T
Q  203 taac-tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  18162850 taacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataa 18162811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 241
Target Start/End: Original strand, 47148794 - 47149004
Alignment:
Q  33 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatt 129  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||||    
T  47148794 gataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatt 47148893  T
Q  130 tgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattga 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |     
T  47148894 tgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatggg 47148992  T
Q  230 ttacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||    
T  47148993 ttacaagaataa 47149004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1321864 - 1321627
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  1321864 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 1321767  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  1321766 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 1321668  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1321667 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1321627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 48361572 - 48361765
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  48361572 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttg 48361671  T
Q  132 ttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  48361672 ttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 48361765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5900055 - 5899820
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||    
T  5900055 aacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcagcaagaag 5899957  T
Q  103 agaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  5899956 aaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 5899858  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| || | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5899857 taacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5899820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10955900 - 10956136
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10955900 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10955997  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10955998 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 10956096  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  10956097 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10956136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23633819 - 23633602
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaaca 119  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23633819 tgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaacacaagccacaagtagaaaacatcgagagaaagaaagagagaaca 23633722  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23633721 caaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttac-aaagaga 23633624  T
Q  220 tatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||   | ||||||||||||    
T  23633623 tatcatcgggttacaagaataa 23633602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53591559 - 53591332
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53591559 ttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacataagtcaaaagcagaaaacagcgagagaaaagaagag 53591460  T
Q  114 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||  ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53591459 agaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctg-gggagagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttac 53591362  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53591361 aaatgagatatcaatggattagaagaataa 53591332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 28101880 - 28102111
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28101880 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattaaa--cacaacccaaaagtagaaaacagcgagagaga 28101975  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  28101976 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagta 28102074  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28102075 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28102111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15781259 - 15781019
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||    
T  15781259 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 15781160  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca---gccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||   ||| | |||| ||||||| |||| | ||    
T  15781159 gaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaata 15781060  T
Q  205 actttacaaaagag----atatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||    
T  15781059 actttacaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataa 15781019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5886582 - 5886347
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||    
T  5886582 aacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacaacagcaagaag 5886484  T
Q  112 a---------gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    |         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  5886483 aaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 5886385  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| || | ||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  5886384 taacgtttc-aaagacaaatcaatgggttacaagaataa 5886347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10958196 - 10958432
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10958196 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10958293  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  10958294 acaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgaaga 10958392  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  10958393 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10958432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 51726880 - 51727116
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  51726880 aacttgatgtgtggggcaaga-ataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 51726976  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51726977 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatg 51727075  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51727076 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51727116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25533808 - 25533590
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  25533808 aacttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 25533715  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25533714 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 25533620  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25533619 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25533590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 54691460 - 54691683
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagaga 116  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| |    
T  54691460 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaa 54691559  T
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  54691560 acataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  217 agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||  | |||||||||||    
T  54691659 agatatcaatgaaatacaagaataa 54691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 5926670 - 5926873
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttg 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5926670 tcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacacaaa-gaatttgttg 5926767  T
Q  135 acctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattaca 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||    
T  5926768 acccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttaca 5926866  T
Q  235 agaataa 241  Q
    |||||||    
T  5926867 agaataa 5926873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 28761319 - 28761538
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  28761319 ataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaaa--ttataatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaa- 28761414  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
              ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28761415 ----------acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaact 28761504  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28761505 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28761538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11168486 - 11168249
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  11168486 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 11168389  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||     
T  11168388 caaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatata-tgata 11168290  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11168289 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11168249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10084262 - 10084498
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10084262 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10084359  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  10084360 acaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 10084458  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  10084459 gtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataa 10084498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38890425 - 38890188
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  38890425 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 38890328  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  38890327 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 38890229  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38890228 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38890188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715617
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga--gagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 143  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  144 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| ||| || || |  ||| ||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtat--gggggagagcaaccatctgtttcacta---tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 39715617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 5522499 - 5522735
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  5522499 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 5522596  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  5522597 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 5522695  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5522696 agtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5522735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25634212 - 25634035
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 161  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25634212 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacaagagtaagaaaggagagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagt 25634115  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25634114 ctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 25634035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31151719 - 31151508
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaa-gaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||    
T  31151719 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagt-aagagtagaaaaacagcgagagaaaagaa 31151623  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||    
T  31151622 gagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaacttt 31151523  T
Q  210 acaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31151522 acaaaagagatatca 31151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 880117 - 880251
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  880117 ataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaa 880216  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880217 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5192035 - 5191803
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  5192035 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 5191938  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  5191937 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagaacagccctctgatccactata-tgatga 5191840  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  5191839 gtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 5191803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28181383 - 28181242
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  28181383 aaacttgatgtgtggagcaag-gacaatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgacagagaaaa 28181285  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181284 gaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10191185 - 10191419
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10191185 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10191282  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  10191283 acaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 10191379  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| || ||  | ||||||||||||    
T  10191380 gtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataa 10191419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25389291 - 25389055
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  25389291 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 25389194  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  25389193 tacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 25389095  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25389094 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 25389055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720711
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa------- 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||           
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  107 -agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagta 26720732  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaa 225  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  26720731 tcgttacaaaagagaaatcaa 26720711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42992606 - 42992418
Alignment:
Q  55 agtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42992606 agtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtcca 42992509  T
Q  150 aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  42992508 aattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactata-tgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42992418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30006137 - 30005989
Alignment:
Q  94 aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 191  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  30006137 aacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccact 30006038  T
Q  192 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  30006037 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 30005989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 7606476 - 7606670
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |   ||  |||    
T  7606476 aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaggccaaaaagtagaaaacaac---agcgaga 7606570  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| ||    
T  7606571 aga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgtt 7606665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170552
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaa 11170580  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11170579 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 11170552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3859895 - 3859676
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  3859895 aacttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 3859800  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||   ||||    
T  3859799 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata-tgatgagtattgttac 3859705  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  3859704 -aaagagaaatcaatgtgttacaagaataa 3859676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 561659 - 561886
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa-agaa- 110  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  561659 acttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacatcgagagaagagaaa 561754  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg-agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||   | |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  561755 gagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactt 561853  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  561854 tacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataa 561886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22114176 - 22114414
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca----gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||| |    ||||||       
T  22114176 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaaaaaacggcgagaaga 22114273  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| |||| ||||    
T  22114274 acacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgat 22114372  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22114373 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22114414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 4103769 - 4104004
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||| | |||||||| ||||||   ||||||        
T  4103769 aaacttgatgcgtggagcaag-gatagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaa--gttataaatacatgtcaaaagtaaaaaacaacggcgagaagaa 4103865  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  4103866 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatg 4103964  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4103965 agtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4104004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Original strand, 8183035 - 8183154
Alignment:
Q  33 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8183035 gatagtcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttg 8183134  T
Q  132 ttgacctagttcggtccaaa 151  Q
    |||||| | ||||| |||||    
T  8183135 ttgacccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 747143 - 746906
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  747143 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 747046  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | |||| | ||||||| ||||    
T  747045 cacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgat 746947  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  746946 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 746906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 36871185 - 36871384
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 110  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||    
T  36871185 acttgatgtgtggagcaaga-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagatagaaaacagcgagagaaaataaa 36871280  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  36871281 gagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaacttt 36871379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 889781 - 889882
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaa 889879  T
Q  239 taa 241  Q
    |||    
T  889880 taa 889882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25635754 - 25635529
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag- 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||      
T  25635754 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagtgaaagaaag 25635659  T
Q  112 -agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
     ||||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25635658 aagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaacttta 25635560  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25635559 caaaatagatatcaatgggttacaagaataa 25635529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919178
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 53893927 - 53894105
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||||||||||    | ||||||        
T  53893927 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-aagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 53894025  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
       ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53894026 cacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50494383 - 50494148
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  50494383 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 50494286  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  50494285 aaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 50494187  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  50494186 gtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 50494148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 458669 - 458433
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  458669 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 458572  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
    | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  458571 acaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 458473  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  458472 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 458433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 456292 - 456056
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  456292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 456195  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
    | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  456194 acaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 456096  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  456095 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 456056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Original strand, 1620394 - 1620567
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||    
T  1620394 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaaccacgagataaaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagt 1620491  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    ||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  1620492 ctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaa 1620567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10621400 - 10621638
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||       
T  10621400 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaga 10621497  T
Q  105 ----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
        ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||    
T  10621498 acacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tga 10621596  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10621597 tgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10621638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 28412904 - 28413140
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  28412904 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28413000  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
      ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  28413001 acaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 28413099  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28413100 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28413140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24181660 - 24181528
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24181660 aagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaact 24181562  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  24181561 ttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataa 24181528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53597557 - 53597384
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctga 165  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | |||| | | ||| | |||||||||| | |||||| || ||     
T  53597557 ttataaacacaagcaaaaa-tagaaaacaacgagagaaagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgt 53597460  T
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  53597459 gggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataa 53597384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918052
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgaccag-tctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 35918049  T
Q  239 taa 241  Q
    |||    
T  35918050 taa 35918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42992766 - 42992610
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  | | | |||||| ||||||||   ||||||   |    
T  42992766 aaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatatatgtcaaaagcagaaaacaatggcgagaagaa 42992669  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42992668 aaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 42992610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 6065667 - 6065904
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  6065667 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6065764  T
Q  103 -agaaagaa-gag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||  |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  6065765 cacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactata-tgat 6065863  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6065864 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6065904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884308
Alignment:
Q  176 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 235  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa 54884308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 6063317 - 6063554
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6063317 aacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6063414  T
Q  105 ---aaagaag-aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  6063415 cacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 6063513  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6063514 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6063554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11170755 - 11170671
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11170755 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 11170671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956834
Alignment:
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29956834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420295
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 13420295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 14634393 - 14634549
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcctt 181  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||| ||||||||||||| || | | |||| |||||  |  ||||  |||| |    
T  14634393 aaaagtagaaaat-gcgagagaaagaaagagagaaaatacgaaaatttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccat 14634491  T
Q  182 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14634492 ccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaat 14634549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38210755 - 38210580
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  38210755 aacttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38210658  T
Q  103 agaaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
T  38210657 acaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagc 38210580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561958
Alignment:
Q  172 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataa 6561958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27420973 - 27420822
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |     
T  27420973 aacaattataaacacaagc-aaaagtataaaacaatgagaaaaaga-gagagaacacatg-gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctacta 27420877  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 217  Q
    || ||||||||||| |  |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420876 tgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181185
Alignment:
Q  145 gtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 191  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26763313 - 26763205
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||||||  || |||  ||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||    
T  26763313 tcaagcaaccaaaacaatatggatg--acacttataaacataagcaaaaaatagaaaacagcgagagaaag-agagagaacacacaa-aatttgtctacc 26763218  T
Q  138 tagttcggtccaa 150  Q
     |||||| |||||    
T  26763217 cagttcgatccaa 26763205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674166
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||    
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagagaaaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacct 1674194  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtt 186  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1674193 agtctggtggagagagcagccatccgtt 1674166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007617
Alignment:
Q  153 tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaa 11007617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236249
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264403
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 16264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795834
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 25795834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143374
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 32143374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 33415368 - 33415599
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-g 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33415368 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 33415467  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33415468 aagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 33415566  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33415567 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 33415599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 38928058 - 38928288
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  38928058 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagataaaaga 38928157  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  38928158 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgtt 38928256  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  38928257 acaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 38928288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16453762 - 16453531
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16453762 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaaaga 16453663  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16453662 agagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaacctt 16453563  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16453562 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16453531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 22800739 - 22800973
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa---acagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22800739 aaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaa 22800838  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  22800839 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaa 22800937  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22800938 cgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22800973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4215756 - 4215528
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4215756 aacttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaactgcgagagaaaagaa 4215657  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4215656 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttac 4215558  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4215557 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4215528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 36921372 - 36921604
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  36921372 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcaagagagaaaa 36921471  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  36921472 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacg 36921570  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36921571 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36921604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 40091294 - 40091526
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||   ||    
T  40091294 aaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaacacaagccaaaagtagaaaatagcaagagagaaaa 40091393  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  40091394 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaca 40091492  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40091493 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40091526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 17662125 - 17662356
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  17662125 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcgagaaaaag 17662224  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  17662225 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgt 17662323  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17662324 tacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 17662356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 22802611 - 22802845
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  22802611 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaa 22802710  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22802711 aagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaa 22802809  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22802810 cattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22802845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40637531 - 40637296
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  40637531 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 40637432  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  40637431 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagta 40637333  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40637332 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40637296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 36919463 - 36919695
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||     
T  36919463 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 36919562  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || ||||||| |||||| ||||     
T  36919563 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactata-tgatgaataacg 36919661  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36919662 ttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36919695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24889251 - 24889018
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  24889251 aacttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 24889152  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  24889151 agaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgataagtaac 24889053  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24889052 gttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataa 24889018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47563213 - 47563009
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47563213 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagga 47563114  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  47563113 agagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactata-agatgagtaacctt 47563015  T
Q  210 acaaaa 215  Q
    ||||||    
T  47563014 acaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47275178 - 47274948
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47275178 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 47275079  T
Q  110 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47275078 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 47274981  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47274980 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47274948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2891746 - 2891516
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |       
T  2891746 aaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 2891647  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||     
T  2891646 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaacc 2891547  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2891546 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 2891516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24879419 - 24879211
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24879419 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgt 24879320  T
Q  133 tgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgatt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  24879319 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggtt 24879221  T
Q  232 acaagaataa 241  Q
    ||||||||||    
T  24879220 acaagaataa 24879211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36378742 - 36378514
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  36378742 acttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaaacgaaaagtagaaaacagcaggagaaaagaag 36378644  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  36378643 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcac 36378544  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||||||   ||||||||||||    
T  36378543 aagagagatatcaatgagttacaagaataa 36378514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14633776 - 14633540
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  14633776 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 14633679  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14633678 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 14633580  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14633579 gtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14633540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 37312956 - 37313177
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37312956 ataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcataagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 37313054  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
              ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37313055 ----------acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactt 37313144  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  37313145 tacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 37313177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24880883 - 24880673
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaattt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24880883 tcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaattt 24880784  T
Q  131 gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattga 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  24880783 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatggg 24880685  T
Q  230 ttacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||    
T  24880684 ttacaagaataa 24880673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5101370 - 5101151
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||         
T  5101370 aaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaagggagaaaacaccgagaga----- 5101276  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  5101275 ----gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagatagcagccctccgttttactata-tgatgagtaaattta 5101182  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  5101181 caaaagacatatcaatgggttacaagaataa 5101151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 12395724 - 12395956
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  12395724 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagacaacgagacagaaag 12395823  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  12395824 gaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaacc 12395922  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12395923 ttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12395956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 12400686 - 12400918
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  12400686 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagacaacgagacagaaag 12400785  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  12400786 gaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaacc 12400884  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12400885 ttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12400918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13547609 - 13547376
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |      
T  13547609 aaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaagatcgagagagaaa 13547510  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  13547509 ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaac 13547411  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  13547410 tttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 13547376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16455680 - 16455463
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||        
T  16455680 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcataagctaaaactagaaaacagcgagagaa---- 16455585  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
             || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  16455584 ---------cacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaacctta 16455494  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16455493 caaaagagatatcaatgagttacaagaataa 16455463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48486764 - 48486541
Alignment:
Q  22 gtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagaga 116  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||| || ||||||| |    
T  48486764 gtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacatcaagagaaaaggaagagaaa 48486665  T
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48486664 acacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaag 48486566  T
Q  217 agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||   ||||||||||||    
T  48486565 agatttcaatgtgttacaagaataa 48486541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 14787308 - 14787527
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  14787308 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 14787407  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14787408 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 14787504  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  14787505 aacgttacaaaagagatgtcaat 14787527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 5635351 - 5635587
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  5635351 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 5635448  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  5635449 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 5635547  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5635548 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5635587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36380764 - 36380571
Alignment:
Q  49 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtc 147  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  36380764 aaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctc 36380665  T
Q  148 caaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  36380664 caaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 36380571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 18409225 - 18409458
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  18409225 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaagacaaaagtagaaaatagcgagagaaaa 18409322  T
Q  109 aagagagaacacaaaa----gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    || | | || | ||||     |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||    
T  18409323 aaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggta 18409422  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18409423 ac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18409458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 37089246 - 37089482
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  37089246 aaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 37089343  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  37089344 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatg 37089442  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  37089443 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 37089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22046561 - 22046796
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||        
T  22046561 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacgacgagaagaac 22046658  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22046659 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 22046757  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22046758 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22046796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 8631293 - 8631530
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  8631293 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 8631390  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  8631391 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 8631489  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8631490 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 8631530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6133291 - 6133098
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||    
T  6133291 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 6133192  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  6133191 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19096338 - 19096107
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  19096338 ataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 19096243  T
Q  109 ------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  19096242 taaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataag 19096144  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19096143 taacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 19096107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22044266 - 22044501
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  22044266 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 22044363  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22044364 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 22044462  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  22044463 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 22044501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27499502 - 27499283
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  27499502 aaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagagag 27499403  T
Q  110 --------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
            |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  27499402 agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctg-gggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatga 27499304  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  27499303 gtaaccttacaaaagagatat 27499283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 14789307 - 14789495
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  14789307 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 14789406  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14789407 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 24446536 - 24446752
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  24446536 aaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaaga 24446634  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  24446635 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgtt 24446720  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24446721 acaaaagagatatcaatggcttacaaaaataa 24446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41997943 - 41997714
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  41997943 ataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaa-acaaaagtagaaaacagcgagagcaaa 41997847  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | ||||||||||  |  | |||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  41997846 gaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctg-gggagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaac 41997749  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  41997748 tttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 41997714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9148693 - 9148475
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  9148693 aacttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gtgagaag 9148599  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9148598 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttac 9148504  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9148503 -aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24348659 - 24348440
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||   |  |||||    
T  24348659 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaacta-aat-acaagccaaaaatagaaaacaacg---gcgagaag 24348565  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24348564 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 24348470  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24348469 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24348440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51015703 - 51015468
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  51015703 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 51015606  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||    
T  51015605 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactata-tgatga 51015507  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51015506 gtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51015468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 619330 - 619559
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||    
T  619330 ataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatcacaagc-aaaagtagaaaacaacagcagagaa 619425  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  619426 gaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaac 619523  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 242  Q
     ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  619524 gttacaaaagagatatcaatgggttataagaataat 619559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6765301 - 6765066
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-gaa 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  6765301 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttataaatacaagccaaa-gtagaaaacaacggcgagaagaa 6765206  T
Q  107 -----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
         |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  6765205 caccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 6765107  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6765106 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6765066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 26085851 - 26086087
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||    
T  26085851 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaa 26085948  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  26085949 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactata-tgatg 26086047  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  26086048 agtatcgttac-aaagagaaaacaatgggttacaagaataa 26086087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 31849473 - 31849709
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  31849473 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 31849570  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  31849571 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 31849669  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31849670 agtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11435413 - 11435177
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||    
T  11435413 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaa 11435316  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  11435315 cacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 11435217  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11435216 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11435177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 18537360 - 18537586
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  18537360 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtataaaacaacgagagaaagaaag 18537456  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18537457 agagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttta 18537555  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18537556 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18537586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19323142 - 19322915
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||| |    
T  19323142 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacgagc-aaaagtataaaacacctggagaaagaaag 19323046  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19323045 agagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaacttta 19322946  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19322945 caaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 19322915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 38890112 - 38890337
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  38890112 ttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaggcaaaattagaaaacagcgagagaaaagaaaga 38890208  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38890209 gagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac 38890307  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38890308 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38890337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 2484748 - 2484983
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  2484748 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 2484845  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  2484846 acaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 2484944  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2484945 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2484983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12102531 - 12102309
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  12102531 acttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-ga 12102436  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||| | || |||   |||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12102435 gagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 12102339  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  12102338 aaaagagatatcagtgggttacaagaataa 12102309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7941781 - 7941545
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  7941781 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatga-aat-acaaggcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 7941684  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7941683 acaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 7941585  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7941584 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7941545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5198862 - 5198642
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||       | || |  |    
T  5198862 aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggcg 5198772  T
Q  112 aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||    
T  5198771 agaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5198642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 11006128 - 11006347
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||       | || |  |    
T  11006128 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaa-------acaacggcg 11006218  T
Q  112 aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||    
T  11006219 agaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccatta 11006317  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11006318 c-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25358042 - 25357863
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| |    
T  25358042 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctag 25357944  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25357943 tctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25357863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11437821 - 11437585
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||    
T  11437821 aacttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 11437724  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  11437723 cacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 11437625  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11437624 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11437585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 18534718 - 18534944
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18534718 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaatagcgagagaaagaaag 18534814  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||||  | |||| ||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||| | |||||||  ||||    
T  18534815 agagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagtttta 18534913  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18534914 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18534944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 11008442 - 11008676
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||    | ||||||        
T  11008442 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 11008539  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  11008540 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 11008638  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | ||||||   ||| |||||| | ||||||||||||    
T  11008639 agtaccattacaa---agaaatcaatgggttacaagaataa 11008676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38409662 - 38409427
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  38409662 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38409565  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  38409564 aaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 38409466  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38409465 gtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38409427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 52942368 - 52942523
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaag 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||    
T  52942368 ttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagaggaaaag 52942467  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  52942468 aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 52942523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30136996 - 30136789
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  30136996 ttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacaagagaaaagaaaga 30136900  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30136899 gagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttaca 30136800  T
Q  213 aaagagatatc 223  Q
    |||||||||||    
T  30136799 aaagagatatc 30136789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47868860 - 47868623
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------a 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||         |    
T  47868860 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataa-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaa 47868763  T
Q  102 gagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  47868762 cacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatg 47868664  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47868663 agtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47868623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Original strand, 3937160 - 3937316
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa- 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  3937160 aacttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaa 3937255  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3937256 gagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 3982087 - 3982272
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||    
T  3982087 tcaagcaaccaaaaaaaagtgggtg--acagttataaacacaaacaaacgatagaaaacagcgagagaaaga-gagagaacacatgaaaaattgtttacc 3982183  T
Q  138 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3982184 ttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3982272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53405594 - 53405357
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-------- 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||            
T  53405594 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaacatcggcgaaaag 53405497  T
Q  101 -agagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
     | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  || ||| ||||||| |||    
T  53405496 aacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagctctctgttccactata-tga 53405400  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  53405399 tgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 53405357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 8756138 - 8756363
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8756138 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacaacgagagaaagaaag 8756233  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| |||||  |||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8756234 agagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaacttta 8756332  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  8756333 caaaagagatatcaatgagttacaagaataa 8756363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49089010 - 49088791
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |      
T  49089010 aaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaacg-- 49088913  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
               |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||   || ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  49088912 ----------caaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactata-tgatgactaacatt 49088824  T
Q  210 acaaaag-agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  49088823 acaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 3824483 - 3824630
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtag-aaaacagc------ga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||       |    
T  3824483 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagtagaaaaacagcagcaagaa 3824582  T
Q  102 gagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824583 gaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18847610 - 18847376
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  18847610 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18847514  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18847513 cacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18847416  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18847415 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18847376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 56030913 - 56030815
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  56030913 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaa-acaaaagtagaaaacagcgagagaaag 56030817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9176348 - 9176584
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    ||| |||||         
T  9176348 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 9176445  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  9176446 cacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 9176544  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9176545 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9176584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22134491 - 22134727
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag--aaaaca---gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||   ||||||   ||||||       
T  22134491 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaaga 22134588  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  22134589 acacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgat 22134686  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22134687 gagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22134727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9174020 - 9174256
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  9174020 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 9174117  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||  | ||||||| |||||    
T  9174118 cacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatg 9174216  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  9174217 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 9174256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 16931665 - 16931899
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  16931665 aacttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 16931762  T
Q  105 -aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
     |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||    
T  16931763 aaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgag 16931861  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16931862 tttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16931899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 15032429 - 15032660
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||     
T  15032429 acttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacataaac-aaaagtagaaaaacagcgagagaaagaaa 15032524  T
Q  111 ----gagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
        || ||||||||  | |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||  | |||| |||| || |||||||||    
T  15032525 gaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagta 15032623  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15032624 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15032660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Original strand, 16185770 - 16185920
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16185770 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaaacaaaaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagt 16185867  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185868 ctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa 16185920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28454109 - 28453906
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     |||||||||||  | |||||||    
T  28454109 tcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgt 28454014  T
Q  133 tgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgatt 231  Q
    | ||| |||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28454013 ttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagttt 28453914  T
Q  232 acaagaat 239  Q
    ||||||||    
T  28453913 acaagaat 28453906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 18709038 - 18709274
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||          
T  18709038 aacttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaatagtagaaaacaacggcgagaagaac 18709135  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
    | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | |||  | ||||||| |||||    
T  18709136 acaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactata-tgatg 18709234  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18709235 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18709274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 47210671 - 47210754
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47210671 aacttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 47210754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22132263 - 22132502
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag--aaaaca---gcgagag- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||   ||||||   ||||||      
T  22132263 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaag 22132360  T
Q  105 -----aaagaagaga-gaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
         |||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  22132361 aacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactata-tg 22132459  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22132460 atgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9864160 - 9863931
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa--tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||| ||||||  || | ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  9864160 acttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataaaatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 9864065  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtct--gagggagagagcagccttccgtttcactata---gtgatgagt 203  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||    ||||||||    
T  9864064 agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagt 9863966  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  9863965 aactttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 9863931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544181
Alignment:
Q  149 aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22782611 - 22782848
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  22782611 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 22782708  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||||   ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  22782709 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 22782807  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22782808 gagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22782848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47210863
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 47210860  T
Q  239 taa 241  Q
    |||    
T  47210861 taa 47210863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 16934118 - 16934253
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||    
T  16934118 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagt 16934216  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
      | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16934217 ttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16934253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47151005
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagagaaagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgaccta 47150923  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  |||||| | || |  || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  47150924 gtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 47151005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||     
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagagaaaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgcccta 22295468  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    || || |||||||||||    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22295467 gtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 22780358 - 22780483
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| |    
T  22780358 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-a 22780455  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22780456 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 22780483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 44599714 - 44599948
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  44599714 aacttgatgtgtggagcaag-gataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaaggcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44599810  T
Q  105 -aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  44599811 aaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 44599909  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  | |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  44599910 gtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 44599948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5664687 - 5664605
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5664687 acttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatgacaaaccaaaagtagaaaaca 5664605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10114737 - 10114565
Alignment:
Q  40 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacct 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||    
T  10114737 aagcaaccaaaacaaagtgggtg--atagttataaacacaaga-aaaggtagataacaacgagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacct 10114642  T
Q  139 agttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | ||||  |||||| |||||||| | ||||||||    
T  10114641 aattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagttaatttacaaa 10114565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983623
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaa 31983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 54928700 - 54928741
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54928700 tccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 54928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 38270028 - 38270088
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 74  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  38270028 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataa 38270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9022602 - 9022543
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9022602 gggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaat 9022543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999045
Alignment:
Q  170 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 3578632 - 3578766
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||   |||||| ||| ||||||||| || | || ||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  3578632 aaaagtagaaaacaacgagagaaaga---gagtacacgaaa---tttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctc 3578724  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3578725 cattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 3578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269234
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10113292 - 10113108
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgac 136  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||| || ||||||||  | | ||| || ||    
T  10113292 tcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagtagataacattgagagagagaaagaaagaacacatga-attttttttac 10113197  T
Q  137 ctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||  ||| || ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10113196 ccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattac-aaagagatatcaa 10113108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Original strand, 52043497 - 52043550
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaac 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52043497 acagttataaacacaagc-aaacgtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaac 52043550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Original strand, 3824636 - 3824681
Alignment:
Q  196 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3824636 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3824681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143312
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5143312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Original strand, 5637531 - 5637576
Alignment:
Q  196 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5637531 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5637576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44724988 - 44724757
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag-ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-g 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44724988 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaatg 44724889  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  44724888 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgt 44724790  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44724789 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 44724757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 13099351 - 13099587
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  13099351 aaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 13099450  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13099451 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 13099550  T
Q  206 ctttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13099551 ctttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13099587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 42330878 - 42331108
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  42330878 ataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaga- 42330976  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  42330977 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactt 42331075  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42331076 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42331108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 31434927 - 31435158
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31434927 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 31435026  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31435027 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttt 31435126  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31435127 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 31435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 444008 - 443773
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----a 105  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  444008 aaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 443909  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  443908 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagta 443810  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  443809 acgttataaaagagatatcaatggattacaagaataa 443773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22394120 - 22393900
Alignment:
Q  20 atgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaac 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22394120 atgtggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaac 22394023  T
Q  119 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22394022 acaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 22393923  T
Q  219 atatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  22393922 atatcaatgggttacaagaataa 22393900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 21592023 - 21592254
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21592023 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 21592121  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  21592122 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacg 21592220  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  21592221 ttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 21592254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24749000 - 24748772
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24749000 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaataa 24748904  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24748903 agagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacctt 24748804  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24748803 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24748772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27306110 - 27306341
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||    
T  27306110 aaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagaagaaaacaacagcgagagaaa 27306209  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27306210 agaagagagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 27306306  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27306307 gttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 27306341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21990563 - 21990343
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21990563 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcgagagaga 21990464  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  21990463 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagta 21990365  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21990364 acgttacaaaagagatatcaat 21990343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9679470 - 9679237
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  9679470 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaa 9679371  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  9679370 ggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaac 9679272  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9679271 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9679237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 20137061 - 20137220
Alignment:
Q  82 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20137061 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccc 20137159  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20137160 tccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20137220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 4295815 - 4296045
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  4295815 aaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaacacaagccaaaagtagaaaatggcgagagaaaaga 4295914  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4295915 agagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgtt 4296013  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  4296014 acaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 4296045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20626443 - 20626216
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20626443 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20626346  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20626345 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20626247  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20626246 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20626216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20630334 - 20630107
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20630334 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20630237  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20630236 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20630138  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20630137 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20630107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20642753 - 20642526
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20642753 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20642656  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20642655 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20642557  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20642556 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20642526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21678472 - 21678245
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21678472 aaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgggagaaaaga 21678373  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||| ||    
T  21678372 agagagaacac--aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactata-tgataagtaacctt 21678276  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21678275 acaaaagatatatcaatgggttacaagaata 21678245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42223566 - 42223336
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||    
T  42223566 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaacaatgagagaaaaga 42223467  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  42223466 agagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgtt 42223368  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  42223367 acaaaagagatatcaataggtttcaagaataa 42223336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 37412001 - 37412238
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||        
T  37412001 aaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactagaaaacaacgagagaaaaga 37412100  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  37412101 agagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagta 37412200  T
Q  205 actttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37412201 accttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 37412238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48458067 - 48457831
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  48458067 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 48457970  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  48457969 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 48457871  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  48457870 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 48457831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9681231 - 9680998
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |      
T  9681231 aaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaagatcgagagagaaa 9681132  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9681131 ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaac 9681033  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  9681032 tttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 9680998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 39145865 - 39146098
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  39145865 aaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 39145964  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  || | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  39145965 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaacc 39146064  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  39146065 ttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 39146098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38394400 - 38394164
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  38394400 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38394303  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  38394302 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 38394204  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38394203 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38394164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21680435 - 21680205
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaaga 112  Q
    |||||| |||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21680435 cttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaga 21680336  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacc---tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21680335 gagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaacctt 21680237  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  21680236 acaaaagagatatcattgggttacaagaataa 21680205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20299874 - 20299638
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  20299874 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaac 20299777  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||    
T  20299776 acaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatga 20299678  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20299677 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20299638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 7471855 - 7472091
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  7471855 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 7471952  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  7471953 acaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactata-tgatga 7472051  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7472052 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7472091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27832522 - 27832744
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||| || ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832522 aaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaa 27832619  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
     |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||     |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27832620 -agagataacacaagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaacttta 27832713  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27832714 cagaagagatatcaatgggttacaagaataa 27832744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18345955 - 18345719
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  18345955 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 18345858  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  18345857 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatga 18345759  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18345758 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18345719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26295850 - 26295625
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26295850 acttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaaa--ttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgaaagaaagaa-a 26295754  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||  ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26295753 gagataacacaagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttaca 26295654  T
Q  213 aaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26295653 aaagagatatcaatgggttacaagaataa 26295625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 7092087 - 7092323
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||   ||||||        
T  7092087 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaa 7092184  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7092185 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgattcactata-tgatg 7092282  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7092283 agtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7092323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44978 - 44742
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||||         
T  44978 aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44881  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  44880 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatga 44782  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44781 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20297776 - 20297540
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  20297776 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 20297679  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  20297678 acaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 20297580  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20297579 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20297540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11355672 - 11355436
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  11355672 ataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacaagagaga 11355573  T
Q  108 gaag----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||     
T  11355572 gaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactata-tgatgaga 11355474  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  11355473 aacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 11355436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1850395 - 1850159
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |          |     
T  1850395 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacagtgaaaagaac 1850298  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  1850297 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 1850199  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1850198 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1850159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3036127 - 3035902
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||    
T  3036127 tggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagag 3036030  T
Q  114 ag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | || ||    
T  3036029 aggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttgca 3035931  T
Q  213 aaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3035930 aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3035902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 7094334 - 7094571
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||        
T  7094334 aaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 7094431  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7094432 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatg 7094530  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7094531 agtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7094571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28485979 - 28485744
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  28485979 aacttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggatagaagaac 28485882  T
Q  103 agaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || | |||| |||| ||||||    
T  28485881 acaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctga-ggagagagcaaccctctgattcattata-tgatga 28485784  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28485783 gtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 28485744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 40836618 - 40836853
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  40836618 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 40836715  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  40836716 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 40836814  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40836815 gtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40836853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 43253394 - 43253628
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag------ 104  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    ||||||||           
T  43253394 ttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaaacaacagcgagaagaacac 43253491  T
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||    
T  43253492 aaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagt 43253590  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  43253591 aacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 43253628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7188942 - 7188732
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  7188942 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaa 7188846  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||  |||| | | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  7188845 gagaacacgcaa-aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttac 7188747  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||||||||    
T  7188746 aaaagaaatatcaat 7188732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26804917 - 26804764
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaa 110  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  26804917 ttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacatcgagagaaaagaa 26804818  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26804817 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctg 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28487967 - 28487731
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||         |     
T  28487967 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggctagaagaac 28487870  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  28487869 acaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactata-tgatga 28487771  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28487770 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28487731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36043 - 35807
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||         
T  36043 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 35946  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  35945 acaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactata-tgatga 35847  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  35846 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24465943 - 24465730
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24465943 ataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaa 24465846  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||| |   |||||||| ||  |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||    
T  24465845 gaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagt-ac 24465750  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24465749 tttacaaaagacatatcaat 24465730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40946744 - 40946506
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |     ||||||       
T  40946744 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaaatagaaaaaaaaacggcgagaaga 40946647  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||    
T  40946646 acacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgat 40946548  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40946547 gagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataa 40946506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3878993 - 3878755
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaag-tgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    | ||||||       
T  3878993 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaaaacaacggcgagaaga 3878896  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  3878895 acacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 3878797  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3878796 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3878755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 7469901 - 7470133
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agaga 105  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         | | |    
T  7469901 ttgatgtgtggagcagg-gataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacaca 7469997  T
Q  106 aagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  7469998 aataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagta 7470096  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7470097 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7470133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 22251464 - 22251605
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  22251464 aaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcaagagagaaag 22251563  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251564 gaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11759541 - 11759369
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  11759541 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 11759444  T
Q  103 agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 176  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11759443 acaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25542942 - 25542707
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  25542942 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 25542845  T
Q  103 agaaagaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  25542844 acaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactata-tgatga 25542746  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25542745 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25542707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24258781 - 24258641
Alignment:
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt---gatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| |   ||||    
T  24258781 aaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatg 24258682  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24258681 agtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24258641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38397053 - 38396813
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--------gcgaga 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |        ||||||    
T  38397053 aacttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaaaaaacaacggcgaga 38396956  T
Q  104 g------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 196  Q
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |    
T  38396955 agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactata-t 38396857  T
Q  197 gatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||  |||| ||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  38396856 gatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 38396813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Original strand, 24813450 - 24813610
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24813450 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagcc 24813548  T
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24813549 atccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataa 24813610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332398
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacagaaaga-gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagt 6332478  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  6332477 ctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 6332398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049406
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaa 1049380  T
Q  216 gagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||    
T  1049381 gagaaatcaatgggttacaagaataa 1049406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047035
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaa 1047009  T
Q  216 gagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||    
T  1047010 gagaaatcaatgggttacaagaataa 1047035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1606793 - 1606559
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  1606793 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 1606696  T
Q  105 -aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||    
T  1606695 aaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatga 1606597  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1606596 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 1606559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081703
Alignment:
Q  88 gtagaaaacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccg 184  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagaggaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccg 11081744  T
Q  185 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || || | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081743 ttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25276465 - 25276319
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||           |    
T  25276465 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctg-gggag-----------c 25276378  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25276377 cgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataa 25276319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2935683 - 2935447
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  2935683 aacttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 2935586  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  2935585 caaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 2935487  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2935486 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2935447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 9027068 - 9027303
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag-aga-- 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   || || |||      
T  9027068 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggctagaagaac 9027165  T
Q  106 ------aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
          || |||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||  ||||    
T  9027166 ataattaataaga-agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactat-ttgat 9027263  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  9027264 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 9027303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Original strand, 16296934 - 16297115
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||     
T  16296934 tcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagagaaaga-gagagaacacacggaaatttgtttaca 16297029  T
Q  138 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
     |||||||||||| | |||| | ||||  |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16297030 cagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatat 16297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108246
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22108273  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  22108272 aagagaaatcaatgggttacaagaata 22108246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137257
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22137284  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  22137283 aagagaaatcaatgggttacaagaata 22137257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40550006
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 40550033  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  40550032 aagagaaatcaatgggttacaagaata 40550006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552284
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 40552311  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  40552310 aagagaaatcaatgggttacaagaata 40552284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 7351526 - 7351762
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  7351526 aacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 7351623  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
    | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  7351624 acaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 7351722  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7351723 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7351762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 24817287 - 24817465
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctgg 160  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  |||||| |    
T  24817287 aacagttataaacacaaac-aaaattagaaaacaacgagagaaaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctag 24817384  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  24817385 tatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataa 24817465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156021
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| | |||| |    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttac-a 31155993  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31155994 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 31156021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6349191 - 6349097
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaaca 119  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6349191 tggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaag-caaaagtagaaaatagcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 20091584 - 20091656
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20091584 gggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20091656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 241
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828744
Alignment:
Q  169 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046672
Alignment:
Q  141 ttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaat 6046674  T
Q  240 aa 241  Q
    ||    
T  6046673 aa 6046672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1049164 - 1049239
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc--aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  1049164 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaa 1049239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 239
Target Start/End: Original strand, 13290454 - 13290583
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| | |||  || ||| | ||||| ||||||||||||    
T  13290454 aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaact 13290552  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  13290553 ttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 13290583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 22280379 - 22280434
Alignment:
Q  170 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22280379 gagagcagctttctgtttcactataatgatcaataactttacaaaagagatatcaa 22280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 239
Target Start/End: Original strand, 6067183 - 6067309
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  ||||       
T  6067183 agaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttac 6067282  T
Q  213 aaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||    
T  6067283 aaagagatatcagaggattacaagaat 6067309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 7349152 - 7349383
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa--aacagcgaga------ 103  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||          
T  7349152 aacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtaaaaacaacggcgagaagaacg 7349249  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7349250 caaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 7349344  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  7349345 gtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6349021 - 6348960
Alignment:
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6349021 ttccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataa 6348960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1046792 - 1046868
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc--aaaacaaagtgt-atggaacagttataatcacaagccaaaa 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1046792 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtaatgga--agttataaatacaagccaaaa 1046868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 20137024 - 20137066
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 51  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137024 ataaatttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 20137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22137493 - 22137439
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22137493 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 22137439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281468
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||| | ||| || |    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagagaaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaactag 40281414  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||| ||||||||||| || | |||| ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  40281415 tctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40552520 - 40552466
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40552520 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 40552466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190052
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11757453 - 11757408
Alignment:
Q  196 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11757453 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11757408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091132
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaa-acaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaa--gttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaa 20091132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251604 - 22251661
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaag----agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||    
T  22251604 cactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataa 22251661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407565
Alignment:
Q  24 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  121 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 22407544  T
Q  221 atcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  22407545 atcaatgggttacaagaataa 22407565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19008016 - 19007784
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |       
T  19008016 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaat 19007917  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  19007916 gaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacg 19007818  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19007817 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19007784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 6258696 - 6258928
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  6258696 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 6258795  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6258796 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaact 6258894  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6258895 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6258928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 6264027 - 6264260
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |       
T  6264027 aaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaacacaagccgaaagtagaaaacaacgagagagaaag 6264126  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6264127 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaact 6264226  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6264227 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6264260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14837642 - 14837411
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---ga 109  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||    
T  14837642 acttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacagcgagagagaaagga 14837543  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14837542 agagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaacctt 14837443  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14837442 acaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 14837411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 28459073 - 28459301
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 111  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28459073 acttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagggagagaaagaaag 28459172  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28459173 agagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtct-aggtagagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaa 28459271  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28459272 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28459301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 42923385 - 42923620
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---- 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||        
T  42923385 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaga 42923484  T
Q  106 -aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  42923485 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactata-tgacgagta 42923583  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923584 actttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 42923620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28197007 - 28196781
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  28197007 ttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaag 28196908  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28196907 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttac 28196811  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28196810 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28196781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 43623458 - 43623691
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  43623458 aacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataatcataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 43623557  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43623558 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 43623656  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43623657 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 43623691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 22287215 - 22287447
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||   ||     
T  22287215 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaattataaaaacaagtcaaacgtagaaaacagcgagagagaaag 22287314  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||     
T  22287315 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacg 22287413  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22287414 ttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 22287447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 22162907 - 22163111
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22162907 ttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataagcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagag 22163006  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22163007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 22163105  T
Q  214 aagaga 219  Q
    ||||||    
T  22163106 aagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17849493 - 17849261
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  17849493 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaaacaacgggagagaaag 17849394  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  17849393 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagcc-cccgtttcactataatgatgagtaacc 17849295  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  17849294 ttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 17849261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 21520568 - 21520802
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  21520568 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 21520667  T
Q  105 aaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21520668 aaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagt 21520766  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21520767 aacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21520802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 5375224 - 5375457
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||   |    
T  5375224 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaagagagaaa 5375323  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  5375324 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaat 5375422  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5375423 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 5375457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 22707657 - 22707864
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22707657 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaggcagaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttg 22707756  T
Q  135 acctagttcggtccaaattgacctggtct-gagg-gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgatta 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  22707757 acctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggtta 22707855  T
Q  233 caagaataa 241  Q
    |||||||||    
T  22707856 caagaataa 22707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3022548 - 3022362
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||       
T  3022548 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaaacaacgagagaaaaag 3022449  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  3022448 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattata 3022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848585
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 17848715  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17848714 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 17848616  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17848615 acaaaagagatatcaa-tggttacaagaataa 17848585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732888
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagataga 31732763  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31732764 gaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaa 31732861  T
Q  215 agagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    
T  31732862 agagatatcaatgggttacaagaataa 31732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289179
Alignment:
Q  47 caaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 143  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  144 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 44289179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 45279876 - 45280095
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  45279876 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 45279970  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  45279971 a----acacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 45280065  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  45280066 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 45280095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032169
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag----agatatcaattgattacaagaa 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||| | |||||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaa 40032166  T
Q  239 taa 241  Q
    |||    
T  40032167 taa 40032169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23871161 - 23870960
Alignment:
Q  44 aaccaaaacaaagtgtatggaa--cagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacct 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23871161 aaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaacagcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacct 23871062  T
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  23871061 agtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaa 23870963  T
Q  239 taa 241  Q
    |||    
T  23870962 taa 23870960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 7462824 - 7463059
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaa- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  7462824 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 7462923  T
Q  107 -agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     ||||||||||||||||     ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||    
T  7462924 gagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggta 7463022  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  7463023 acgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 7463059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27105178 - 27104942
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||        
T  27105178 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27105081  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27105080 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27104982  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27104981 agtaatgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 11739534 - 11739672
Alignment:
Q  104 gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  11739534 gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagt 11739633  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 242  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11739634 aacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataat 11739672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 23452111 - 23452348
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||||        
T  23452111 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 23452208  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  23452209 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 23452307  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23452308 agtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 45238874 - 45239088
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgg-aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-a 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45238874 ataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatcaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 45238973  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||                    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45238974 aagaagagagaacacaaaaaaatttgttgaccta--------------------gtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaa 45239052  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45239053 ctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 45239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 18800251 - 18800425
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg 164  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18800251 agttataatcgcaagc-aaaagtagaaaacagcagaagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctg 18800349  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18800350 -gggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18800425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 34979468 - 34979690
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||          
T  34979468 aaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaacagcgagag------ 34979561  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  34979562 ---agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaacctt 34979658  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34979659 acaaaagagatataaatggattacaagaataa 34979690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 13909920 - 13910155
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  13909920 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 13910017  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||    
T  13910018 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactata-tgatga 13910116  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  13910117 gtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13910155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 11577991 - 11578220
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11577991 aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaa--gtt-taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 11578087  T
Q  111 gagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
     |||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  11578088 aagagaaaacacacgaaatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaacct 11578187  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11578188 tacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 11578220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 17897134 - 17897357
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17897134 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaag 17897228  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17897229 agagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaacttta 17897326  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  17897327 caaaatagatatcaaagggttacaagaataa 17897357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22874406 - 22874274
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22874406 aagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactt 22874307  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  22874306 tacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 22874274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 15539409 - 15539553
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||   ||     
T  15539409 aaacttgatgtgtggagcaag-gattatcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 15539507  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539508 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 24162098 - 24162333
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||     
T  24162098 aacttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaac 24162195  T
Q  108 -----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  24162196 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactata-tgatga 24162294  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  24162295 gtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24162333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064659
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||   | ||||||    
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacg---gcaagaag 42064784  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||   |||    
T  42064783 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgtta 42064689  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42064688 c-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 42064659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452925
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 42452953  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42452952 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 42452925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 19501986 - 19502122
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||    
T  19501986 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagt 19502084  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19502085 atcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 19504321 - 19504457
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  19504321 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagt 19504419  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19504420 atcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 19504457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146704
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||| |    
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgactt 20146637  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146638 agtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 20146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 36558755 - 36558974
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagc-gagagaaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||| | | |||||       
T  36558755 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaa--- 36558849  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
         ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  36558850 -----gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgtt 36558943  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  36558944 ac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36558974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699518
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaatagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgaccta 40699600  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| |||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  40699599 gtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataa 40699518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 36561015 - 36561251
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||   ||||||        
T  36561015 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 36561112  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  36561113 caaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 36561211  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  36561212 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36561251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 38020444 - 38020360
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38020444 tggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtagaaaacagcgaaagaaa 38020360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 35217844 - 35218073
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||     
T  35217844 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 35217941  T
Q  109 aagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    || || ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  |     
T  35217942 aaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcg 35218040  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  35218041 ttac-aaagagaaatcaacgggttacaagaataa 35218073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20592444 - 20592288
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagaga 114  Q
    |||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  20592444 tgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaag-caaaagtagaaaatatcaagagaaagaaagaga 20592348  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagag 174  Q
    |||||||  | |||||||| | | | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  20592347 gaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagag 20592288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35107590 - 35107458
Alignment:
Q  92 aaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||| |  ||||| || || |||||| |    
T  35107590 aaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttcc 35107491  T
Q  189 actatagtgatgagtaactttacaaaagagata 221  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107490 actataatgatgagtaacattacaaaagagata 35107458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 35215467 - 35215696
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| || | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||     
T  35215467 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 35215564  T
Q  109 aagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    || ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  |     
T  35215565 aaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcg 35215663  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  35215664 ttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 35215696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 45332166 - 45332291
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  45332166 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactata-tgatgagtacctttac-a 45332263  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||    
T  45332264 aagagaaatcaatgggttacaataataa 45332291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 37962823 - 37963050
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||     
T  37962823 ataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaa--gttataatcacaaat-aaaagtagaaaacaacttgagaaaa 37962919  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      || ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || || | |||||| ||| |  | ||||||||||| |||||| ||||    
T  37962920 gaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataac 37963018  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||   | |||||| ||||||||||||||    
T  37963019 tttacaaaa---aaatcaatggattacaagaataa 37963050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 19501876 - 19501958
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19501876 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaa 19501958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22874487 - 22874431
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22874487 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 19504211 - 19504291
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 93  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19504211 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaa 19504291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42453857 - 42453802
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaaca 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42453857 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaaca 42453802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589835
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataa 20589835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 38414071 - 38414155
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38414071 tgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggtaaaagtagaaaacaacgagaga 38414155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17921996 - 17921871
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||||||| || || ||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17921996 aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-gagagaacatacgaaaatttgtttacttaattcggtcaaatactgacctagtctg-ggtagagagcagccctc 17921899  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17921898 cgttccactataatgatgactaacttta 17921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15694108 - 15694050
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15694108 tccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaat 15694050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33604140 - 33604092
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33604140 gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 11739455 - 11739518
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 74  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11739455 aaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 11739518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39287361 - 39287262
Alignment:
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||| || ||||| | | |||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39287361 acacaaaataacttgtttaacaagtttggtccaacactgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136236
Alignment:
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 27136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828454
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtcca-aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||   | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  225 attgattacaagaataa 241  Q
    |  |  |||||||||||    
T  13828438 aagggctacaagaataa 13828454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17943723 - 17943631
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17943723 aagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa 17943631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18511090 - 18511323
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  18511090 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 18511189  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18511190 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 18511288  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18511289 tttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 18511323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2724293 - 2724061
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  2724293 aaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgaaagaaaaag 2724194  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  2724193 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatc 2724095  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2724094 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 2724061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40221929 - 40221690
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40221929 aaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagag 40221830  T
Q  110 --------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
            ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40221829 agaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatga 40221730  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40221729 gtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40221690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36208975 - 36208744
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36208975 ataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaag 36208876  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36208875 aaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaact 36208778  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36208777 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36208744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 696273 - 696045
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaa-ccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||     
T  696273 acttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaaac-aaaagtagaaaacaac-agagaaagaaa 696176  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  696175 gagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataacttta 696076  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  696075 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 696045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 10474200 - 10474434
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |     
T  10474200 ataaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaa 10474299  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10474300 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaa 10474398  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10474399 ccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 10474434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1189486 - 1189720
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||     
T  1189486 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactgcgagagagaaag 1189585  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag-ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  1189586 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaac 1189685  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1189686 cttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1189720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509413
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaag 111  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttac 18509399  T
Q  212 aaaagagatatcaa 225  Q
    |||| |||||||||    
T  18509400 aaaatagatatcaa 18509413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39854889 - 39854651
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  39854889 ataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacagcgagag 39854790  T
Q  105 aaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  39854789 aaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 39854691  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39854690 gtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 39854651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097900
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgag--agaaa-gaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactata-tgatgagtaacgttac 26097930  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  26097929 aaaagagatatcaatgagttacaagaataa 26097900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25904505 - 25904271
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  25904505 ataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagagaa 25904406  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  25904405 aggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaa 25904307  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  25904306 cgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataa 25904271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21289159 - 21288953
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa-aga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  21289159 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaacaaa 21289060  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  21289059 agagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-agatgagtaacgtt 21288961  T
Q  210 acaaaaga 217  Q
    ||||||||    
T  21288960 acaaaaga 21288953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 658241 - 658464
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  658241 ttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaacataagccaaaagtagaaaacagcaagagaaaagaagag 658340  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  658341 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 658436  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  658437 aagagatatcaatgggttacaagaataa 658464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 41585614 - 41585840
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga----- 105  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||         
T  41585614 aaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 41585713  T
Q  106 -aaga------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
     ||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41585714 gaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactata-tga 41585812  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585813 tgagtaacattacaaaagagatatcaat 41585840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 17818369 - 17818601
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17818369 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 17818468  T
Q  111 g-----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| || ||| |||| || ||||||||||    
T  17818469 aggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgta-tgatgagtaa 17818565  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17818566 ctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17818601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 16092079 - 16092311
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16092079 aaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaacgcaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 16092177  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  16092178 gaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaacc 16092277  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16092278 ttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataa 16092311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 36402204 - 36402439
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  36402204 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaacacaagctaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 36402303  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  36402304 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactata-tgatgagta 36402402  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36402403 acgttacaaaagagatatcaatggattacaataataa 36402439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6745473 - 6745236
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  6745473 aaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagag 6745374  T
Q  105 aaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  6745373 aaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 6745275  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6745274 taacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6745236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6756901 - 6756675
Alignment:
Q  1 ccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756901 ccaataaca-aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcg 6756803  T
Q  101 agag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6756802 agagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccct-cgtttcactataatg 6756704  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6756703 atgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat 6756675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21948434 - 21948194
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21948434 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagag 21948335  T
Q  109 ---------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21948334 ggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgat 21948236  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21948235 gagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataa 21948194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18597045 - 18596828
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18597045 aaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 18596946  T
Q  110 agaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18596945 agagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactt 18596846  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18596845 tacaaaagagatatcaat 18596828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 20505721 - 20505952
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20505721 aaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaaaacaacgagagaaa 20505820  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20505821 ataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 20505917  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20505918 gttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 20505952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 2818211 - 2818431
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  2818211 aaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 2818310  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  2818311 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata-tgatgagta 2818409  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  2818410 acgttacaaaagagatgtcaat 2818431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2954811 - 2954586
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata-atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 112  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2954811 ttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaga 2954712  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  2954711 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata-tgatgagtaactttac- 2954614  T
Q  213 aaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  2954613 aaagagatatcaatgggttacaagaata 2954586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17073289 - 17073051
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagaga 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  17073289 ataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagaga 17073190  T
Q  106 aaga---agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    || |   ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  17073189 aaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgag 17073090  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17073089 taaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17073051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 26098165 - 26098380
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----a 105  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  26098165 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 26098264  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26098265 aggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccata-tgatgagta 26098363  T
Q  205 actttacaaaagagata 221  Q
    || ||||||||||||||    
T  26098364 acgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 37705661 - 37705891
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  37705661 aaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 37705760  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  37705761 gaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaacc 37705857  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37705858 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 37705891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24127257 - 24127024
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aa 107  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  24127257 aaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 24127158  T
Q  108 gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24127157 gaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 24127059  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24127058 cttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 24127024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 31472493 - 31472709
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||   ||  | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||       
T  31472493 aaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataattacaaaccaaaattagaaaacaatgagagaaaaga 31472589  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31472590 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaac 31472689  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31472690 tttacaaaagagatatcaat 31472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20043390 - 20043206
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatag-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20043390 aaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 20043291  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 192  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  20043290 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaaccattcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6747709 - 6747473
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  6747709 aaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagag 6747610  T
Q  105 aaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||    
T  6747609 aaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactata-tgacgag 6747511  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||    
T  6747510 taacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataa 6747473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25804428 - 25804193
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  25804428 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 25804331  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25804330 acaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 25804233  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25804232 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25804193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 25921348 - 25921584
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  25921348 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 25921445  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  25921446 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata-tgatga 25921544  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25921545 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 31465871 - 31466089
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaa 110  Q
    ||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  31465871 ttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaa 31465970  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||          ||||| |||||||||||||||    
T  31465971 gagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc----------ctata-tgatgagtaacttta 31466059  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  31466060 caaaatagatatcaatgggttacaagaata 31466089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38882492 - 38882274
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  38882492 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 38882398  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  38882397 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 38882303  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38882302 -aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38882274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 6661074 - 6661297
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  6661074 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaaga 6661170  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||  | |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  6661171 gaacacacga-aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaa 6661269  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6661270 aagagatatcaatgggttacaagaataa 6661297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10528972 - 10529210
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10528972 aacttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10529069  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10529070 cacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgat 10529168  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10529169 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10529210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18467089 - 18466852
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  18467089 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18466992  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| |||||    
T  18466991 cacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatg 18466893  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18466892 agtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18466852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16776560 - 16776326
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16776560 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 16776462  T
Q  108 --gaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
      ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| |||    
T  16776461 aagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgataagt 16776363  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16776362 aacgttacaaaagagaaatcaa-tggttacaagaataa 16776326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27912941 - 27912704
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||        
T  27912941 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27912844  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   || ||| ||||||| |||||    
T  27912843 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactata-tgatg 27912745  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27912744 agtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27912704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4237032 - 4236797
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  4237032 aacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 4236935  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  4236934 acaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 4236837  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4236836 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4236797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 34476927 - 34477163
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  34476927 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 34477024  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  34477025 cacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 34477123  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  34477124 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34477163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 34479292 - 34479528
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||        
T  34479292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 34479389  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  34479390 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 34479488  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  34479489 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34479528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2175305 - 2175087
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  2175305 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 2175211  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||||    
T  2175210 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttac 2175116  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2175115 -aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2175087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 39397916 - 39398104
Alignment:
Q  43 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39397916 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag---------agaacacaaaagaatgttttgacctagtt 39398006  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39398007 cggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 39398104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10587219 - 10587000
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||   |  ||||    
T  10587219 aaacttgatgtgtggagcaag-gataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacg---gcgagaa 10587126  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  10587125 ga----acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt 10587031  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  10587030 ac-aaagagaaatcaatgggttaaaagaataa 10587000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20054231 - 20054021
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 110  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||||||   ||    
T  20054231 acttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaacgaagagagaaaagaaa 20054135  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20054134 gagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaacttt 20054035  T
Q  210 acaaaagagatatc 223  Q
    ||||||||||||||    
T  20054034 acaaaagagatatc 20054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39798431 - 39798215
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||      
T  39798431 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga-- 39798339  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||| | ||| |||    
T  39798338 --acacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-cgatgagtatcattataaa 39798242  T
Q  215 agagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39798241 agagaaatcaatgggttacaagaataa 39798215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18469414 - 18469182
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  18469414 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18469317  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | |||| ||||| | |||||    
T  18469316 cacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggagagagcagctcttcgttccactaga-tgatg 18469220  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  18469219 agtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 18469182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27910834 - 27910618
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||   |  ||||||      
T  27910834 ttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtataaaacaacg---gcgagaaga-- 27910742  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| | |||||||    
T  27910741 --acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaa 27910645  T
Q  215 agagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27910644 agagaaatcaatgggttacaagaataa 27910618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 21684327 - 21684562
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-agagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||        
T  21684327 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaac 21684424  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  21684425 acaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 21684523  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||   |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  21684524 gtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 21684562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 12555796 - 12556008
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---------- 104  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  12555796 ttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaag 12555895  T
Q  105 ---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
       | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  12555896 agaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgcttta-agatga 12555994  T
Q  202 gtaactttacaaaa 215  Q
    ||||| ||||||||    
T  12555995 gtaacgttacaaaa 12556008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4410425 - 4410191
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg------agag- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||      ||||     
T  4410425 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacagcggcgaaaagagc 4410329  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||    
T  4410328 acaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatga 4410230  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4410229 gtatcgttac-aaagagaaatcaataggttacaagaataa 4410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 38960006 - 38960241
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg----------- 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||               
T  38960006 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgacaagaagaac 38960103  T
Q  101 -agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||    
T  38960104 aaaagaaaaaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgat 38960201  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  38960202 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 38960241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10750104 - 10749869
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10750104 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10750007  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  10750006 caaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 10749909  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10749908 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10749869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9020612 - 9020386
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  9020612 ttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaataacgatagaaaagaagag 9020517  T
Q  114 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||   |||||  | ||  ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  9020516 agagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaatttta 9020417  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9020416 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20045386 - 20045290
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20045386 aaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacgagagaaa 20045290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 15445154 - 15445376
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||| ||| ||   |||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  15445154 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaaa--ttataaacacaagcaaaagatagaaaacatcgagagaaagaa-a 15445248  T
Q  113 gagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15445249 gagaaaacacacgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctg-ggaagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaacttta 15445347  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15445348 caaaagagatatcaaagggttacaagaat 15445376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10757580 - 10757345
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10757580 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10757483  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  10757482 caaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 10757385  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  10757384 agtaacgttac-aaagaaaaatcaatgggttacaagaataa 10757345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 34530593 - 34530692
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  34530593 aaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagacaacagcaacagaaagaa 34530692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31543138 - 31542939
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcga-gag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||| |||       
T  31543138 aacttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaggagaac 31543041  T
Q  105 -aaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  31543040 aaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 31542942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4898068 - 4897899
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgag 166  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| || || |    
T  4898068 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa-agaggaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatggg 4897972  T
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||| |||||||  | ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  4897971 ggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaat 4897899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 3373011 - 3373247
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg------agag 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      ||||    
T  3373011 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagag 3373108  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||  | ||||||| |||||    
T  3373109 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatg 3373207  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3373208 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3373247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354684
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15354657  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  15354658 aagagaaatcaatgggttacaagaata 15354684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665213
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23665240  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23665239 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23665213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23741968
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23741941  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23741942 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23741968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793374
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23793347  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  23793348 aagagaaatcaatgggttacaagaata 23793374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143634
Alignment:
Q  61 tggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgac 156  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  157 ctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||  |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 15143634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15356960
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15356933  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  15356934 aagagaaatcaatgggttacaagaata 15356960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 31179247 - 31179481
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||    ||| |||||         
T  31179247 aacttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataat--taaacacaagccaaaagtagaagaacaacggcgagaagaa 31179344  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  31179345 cacaaagaagagaagaacacaga--aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 31179441  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  31179442 agtttcgttac-aaagagaaatgaatgggttacaagaataa 31179481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Original strand, 17413198 - 17413278
Alignment:
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17413198 tctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 17413278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15552539 - 15552414
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | |||| |    
T  15552539 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttac-a 15552442  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15552441 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 15552414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545249
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||   |||| |    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttac-a 31545277  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31545276 aagagaaatcaatgggttacaagaataa 31545249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 2144504 - 2144647
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||        |||||||||||| | ||   | ||    
T  2144504 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttc-------agttcggtccaatactggtttagt 2144594  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2144595 ttgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 2144647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35430506 - 35430365
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||  ||| | ||||| || ||| |||    
T  35430506 aaaattagaaaacaacgagggagaagagaaagaacacaagagaatttgtttatccagttcagtccaatactgacctactctaaaggagataggagctttc 35430407  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35430406 cgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 35430365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42771023 - 42770978
Alignment:
Q  196 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42771023 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 42770978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 34530724 - 34530777
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  34530724 cactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 34530777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20045268 - 20045210
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  20045268 tccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttaaaagaat 20045210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42771167 - 42771064
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 112  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  42771167 cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagtaaccaaataaa--tgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcaagagaaatgaaga 42771073  T
Q  113 gagaacaca 121  Q
    |||||||||    
T  42771072 gagaacaca 42771064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281804
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagc 10281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15552650 - 15552569
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 95  Q
    ||||||||  ||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  15552650 aacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagctaaaagtagaaaa 15552569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 11457356 - 11457588
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  11457356 aaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 11457455  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11457456 gaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactata-tgatgagtaact 11457554  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11457555 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 11457588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47906670 - 47906438
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaa 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  47906670 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 47906571  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  47906570 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacg 47906472  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47906471 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47906438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17186011 - 17186241
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17186011 ataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaaag 17186107  T
Q  109 aa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  17186108 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaact 17186207  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  17186208 ttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 17186241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16429353 - 16429125
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16429353 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaaccaaaagt-gaaaacagcgagagaaaaga 16429257  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16429256 agagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaacctt 16429157  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16429156 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16429125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25251155 - 25251388
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       
T  25251155 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 25251254  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||     
T  25251255 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaacc 25251354  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  25251355 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataa 25251388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 31424896 - 31425128
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  31424896 aaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 31424995  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31424996 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaacc 31425094  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31425095 ttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31425128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 4131256 - 4131493
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||    
T  4131256 aaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaatagaaaacaacgagagagaaaa 4131355  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4131356 gaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaact 4131455  T
Q  208 ttacaaaag----agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||    |||||||||| | ||||||||||||    
T  4131456 ttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataa 4131493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 14097849 - 14098083
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |      
T  14097849 aaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 14097948  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14097949 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 14098047  T
Q  207 -tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14098048 gtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18307509 - 18307292
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  18307509 aaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 18307410  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18307409 gaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaact 18307311  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18307310 ttacaaaagagatatcaat 18307292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 9240968 - 9241199
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240968 aaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 9241067  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9241068 agagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttt 9241167  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9241168 acaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 9241199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17319283 - 17319055
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  17319283 ttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaacacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaag 17319184  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  17319183 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaac 17319085  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17319084 aaaagagatatcaataagttacaagaataa 17319055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13215486 - 13215249
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---a 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13215486 ataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaa 13215387  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  13215386 aggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaa 13215289  T
Q  206 ctttacaaaagag----atatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||    
T  13215288 atttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataa 13215249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40134344 - 40134112
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatag--tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40134344 aaacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatctcaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaa 40134247  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40134246 agaatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaac 40134147  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  40134146 tttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 40134112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 2949113 - 2949329
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  2949113 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 2949212  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  2949213 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacg 2949310  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2949311 ttacaaaagagatgtcaat 2949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18839988 - 18839755
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  18839988 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaaaacagcgagagagaaaa 18839889  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  18839888 gaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacc 18839789  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18839788 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18839755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115216
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 111  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaagacaacgagagaaaagaag 6115086  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6115087 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttac 6115186  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6115187 aaaagagatatcaattggttacaagaataa 6115216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16429040 - 16428821
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaaca 119  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16429040 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaagaagagagaaca 16428943  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428942 caaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagaga 16428843  T
Q  220 tatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  16428842 tatcaatgggttacaagaataa 16428821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 17324513 - 17324749
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca-aaagtagaaaacagcgagagaa--- 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  17324513 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataagccagaaagtagaaaacagcgagagaaaag 17324612  T
Q  107 ---agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17324613 aagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 17324711  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17324712 aacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17324749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 241
Target Start/End: Original strand, 50076583 - 50076785
Alignment:
Q  40 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076583 aagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 50076682  T
Q  138 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 237  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50076683 cagttcggtccaaattgacatagtctg-gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaaga 50076781  T
Q  238 ataa 241  Q
    ||||    
T  50076782 ataa 50076785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 28206946 - 28207164
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28206946 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 28207045  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  28207046 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta---tgatgagta 28207142  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  28207143 acgttacaaaagagatgtcaat 28207164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 38925360 - 38925591
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38925360 ataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaa 38925459  T
Q  107 a-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||    
T  38925460 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgttttacta---tgatgagtaa 38925555  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38925556 cgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38925591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 6995574 - 6995798
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6995574 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 6995673  T
Q  108 -------gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6995674 aagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatg 6995772  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  6995773 agtaacgttataaaagagatgtcaat 6995798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 12302385 - 12302603
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
T  12302385 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 12302484  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12302485 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 12302583  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  12302584 gttacaaaagagatgtcaat 12302603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39462922 - 39462686
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  39462922 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaa 39462823  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  39462822 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgaata 39462724  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  39462723 acttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataat 39462686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25248432 - 25248665
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |       
T  25248432 aaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacaaaagtcaaaagtagaaaacagcgagagacaccg 25248531  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||     
T  25248532 gaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaacc 25248631  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25248632 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25248665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27336818 - 27337052
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  27336818 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 27336917  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  27336918 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 27337016  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27337017 acgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27337052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31490312 - 31490081
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||   |||    
T  31490312 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagggagagagaaaa 31490213  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||     
T  31490212 taagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctg-gggggagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataacc 31490115  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31490114 ttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31490081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 50307421 - 50307659
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50307421 ataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagag 50307520  T
Q  105 aaaga--agagagaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50307521 aaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 50307619  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  50307620 gtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 50307659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27339009 - 27339243
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  27339009 aaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 27339108  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  27339109 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactata-tgatgagta 27339207  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27339208 acgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27339243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 15294711 - 15294947
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  15294711 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 15294808  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15294809 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 15294907  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15294908 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23816289 - 23816054
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||     
T  23816289 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 23816190  T
Q  109 ----aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||| | || |||| |||||||||    
T  23816189 gaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattata-tgatgagta 23816091  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23816090 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23816054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756694
Alignment:
Q  60 atggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct 158  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagaggaaagaagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacct 6756778  T
Q  159 ggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6756777 agtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 6756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41647321 - 41647088
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaa 107  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  41647321 aaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcaagagagaaa 41647222  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41647221 ggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 41647123  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41647122 gttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 41647088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 50248455 - 50248685
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||   || ||||    
T  50248455 ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaccacaagccaaaagttgaaaacaacgagagagaaaggaag 50248554  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag--cagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  50248555 agagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaacctt 50248653  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  50248654 acaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 50248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51750443 - 51750207
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  51750443 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 51750346  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  51750345 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 51750247  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51750246 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51750207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15823950 - 15823714
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga---gagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||    
T  15823950 aaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaaggcaaaagtagaaaacaacaacaagagaa 15823851  T
Q  107 a---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  15823850 aaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagt 15823752  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15823751 aacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15823714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 2510219 - 2510438
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||   |  |||||    
T  2510219 aacttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaa--acaagtcaaaaatagaaaacaacg---gcgagaag 2510313  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2510314 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaactttac 2510408  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2510409 aagagagaaatcaatgggttacaagaataa 2510438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 10399704 - 10399941
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10399704 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10399801  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  10399802 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 10399900  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10399901 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10399941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 31735399 - 31735634
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||         
T  31735399 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaa-tagaaaacaacggcgagaagaac 31735495  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  31735496 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 31735594  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31735595 gtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 31735634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15916786 - 15916562
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  15916786 acttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaaacagcgagaaaaagaaa 15916689  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15916688 gagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaacttt 15916590  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaaga 237  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15916589 ataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17324474 - 17324231
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  17324474 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagtgagagagagag 17324375  T
Q  110 --agagagaac----------acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
      ||||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17324374 agagagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatg 17324275  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17324274 atgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17324231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25128273 - 25128040
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128273 aaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat-aaaagtagaaaacagcgagagaaaga 25128177  T
Q  110 a-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25128176 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagta 25128077  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25128076 accttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataa 25128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 28998128 - 28998351
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28998128 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 28998227  T
Q  108 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  28998228 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 28998326  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  28998327 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 28998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 29003844 - 29004067
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29003844 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 29003943  T
Q  108 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  29003944 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 29004042  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  29004043 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 29004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16432783 - 16432561
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||     ||| ||||||||||    
T  16432783 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaa--gttataaacataaaccaaaagtagaaaaac---aga-aaagaagaga 16432690  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16432689 gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaa 16432590  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaataat 242  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16432589 aagagatatcaatgggttacaagaataat 16432561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840848
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28840887  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28840886 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28840848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13762240 - 13762005
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  13762240 aacttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 13762143  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||    
T  13762142 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactata-tgatga 13762044  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  13762043 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13762005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2617922 - 2617684
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  2617922 aacttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 2617825  T
Q  108 -------gaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
           ||||||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  2617824 acacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgat 2617726  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2617725 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2617684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39932480 - 39932243
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    | ||||||       
T  39932480 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaaga 39932383  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  39932382 acacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactata-tga 39932284  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  39932283 tgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 39932243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 50078793 - 50078934
Alignment:
Q  100 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  50078793 gagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgat 50078892  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  50078893 gaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 50078934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28842898 - 28842663
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28842898 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28842801  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28842800 acaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatga 28842702  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28842701 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28842663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 46431582 - 46431820
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  46431582 aacttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 46431679  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct--gagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  46431680 acaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactata-tga 46431778  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  46431779 tgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 46431820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 14183490 - 14183705
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||           
T  14183490 acttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagaagaaaacaacgagagac------ 14183580  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
         ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14183581 -----cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac 14183675  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  14183676 aaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 14183705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 3579589 - 3579729
Alignment:
Q  100 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||  || |||    
T  3579589 gagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcac--taatga 3579686  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3579687 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3579729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13358978 - 13358787
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  13358978 aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 13358881  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13358880 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 49495137 - 49495322
Alignment:
Q  52 caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  49495137 caaagtgtatggaaga--tataatcacaaac-aaaagtaaaaaacagtgagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaa 49495233  T
Q  151 attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||| | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49495234 attgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 49495322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 31422740 - 31422986
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat-cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||| |||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |    
T  31422740 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaa 31422839  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg------------tttcactata 194  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |            ||||||||||    
T  31422840 agaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactata 31422939  T
Q  195 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  31422940 atgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 31422986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47452027 - 47451825
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaaa--ga 109  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||  ||    
T  47452027 ttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacaacgagagaaaagga 47451928  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||             | ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47451927 agagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgtt 47451842  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47451841 acaaaagagatgtcaat 47451825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 18800458 - 18800686
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 110  Q
    ||||||| ||| ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  18800458 acttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaacaaa 18800555  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||||  | |||||||| |||  ||| ||||| ||| | |||| || || ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18800556 aagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaacttt 18800654  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18800655 acaaaagagatatcaatgggatacaagaataa 18800686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 13447150 - 13447301
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  13447150 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaac 13447247  T
Q  103 agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 155  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447248 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51757939 - 51757699
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag-----aaaaca---gcgaga 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||     ||||||   ||||||    
T  51757939 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattg-aat-acaagccaaaagtagggaaaaaaacaacggcgaga 51757842  T
Q  104 g------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 196  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |    
T  51757841 agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-t 51757743  T
Q  197 gatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||| | |||| ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  51757742 ggtgagtatcgttac-aaagagaaatcgataggttacaagaataa 51757699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823182
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 6823208  T
Q  216 gagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||   ||||||||||||    
T  6823207 gagaaatcaatgagttacaagaataa 6823182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 13125346 - 13125571
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 110  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  13125346 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaaa 13125440  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||  | ||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13125441 gagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaacttt 13125539  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13125540 acaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 13125571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24325954 - 24325831
Alignment:
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24325954 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaag 24325856  T
Q  217 agatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||    
T  24325855 agaaatcaatgggttacaagaataa 24325831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 30790288 - 30790514
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa--gtagaaa-acagcgagagaaagaaga 112  Q
    |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  30790288 tgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaacaaaaatagtaaaaagacagcgagagaaagaa-a 30790384  T
Q  113 gagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||| |||| | |||||| ||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  30790385 gagagcacacacgaattttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctg-ggaagagagcagtcatccattccactataatgatgagtaacttta 30790483  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30790484 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30790514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 8347161 - 8347386
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    |||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8347161 acttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaa--gttataaacataagc-aaaagtagaaaacagcgatagaaagaaag 8347256  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | ||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8347257 agagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaacttta 8347355  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8347356 caaaagagatatcaatgggttacaagaataa 8347386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9459311 - 9459529
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| || | || |        
T  9459311 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga---- 9459403  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||    
T  9459404 --agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac 9459500  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  9459501 -aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9459529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 9463138 - 9463356
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| || | || |        
T  9463138 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga---- 9463230  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||    
T  9463231 --agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac 9463327  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  9463328 -aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9463356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20302846 - 20302627
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||    
T  20302846 aacttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaa 20302752  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | |||| | ||||||  ||||||||| | |||    
T  20302751 ga----acacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactat-ctgatgagtatcgtta 20302657  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20302656 c-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20302627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 50078670 - 50078769
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50078670 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagagaa 50078769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 15669304 - 15669507
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttga 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |    
T  15669304 tcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaa--gttataaacacaaac-aaaagtataacacagcgagagaaaagaaagagagaacacaacaaaatttgttta 15669400  T
Q  136 cctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattaca 234  Q
    |  ||||| ||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  15669401 cacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttaca 15669500  T
Q  235 agaataa 241  Q
    |||||||    
T  15669501 agaataa 15669507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42922557 - 42922398
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  42922557 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 42922459  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42922458 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42922398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20291861 - 20291625
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  20291861 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 20291764  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || || |||| | ||||||| |||||    
T  20291763 cacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactata-tgatg 20291665  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || | | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20291664 agaatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20291625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 3579464 - 3579558
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579464 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagagagaga 3579558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51752667 - 51752532
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||    
T  51752667 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagt 51752569  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  51752568 atcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51752532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16561813 - 16561635
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |    
T  16561813 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacggcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctag 16561716  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  ||||||||||| || |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16561715 tctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 16561635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23786244 - 23786008
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  23786244 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 23786147  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  23786146 caaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 23786048  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  23786047 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23786008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16226573 - 16226336
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  16226573 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 16226476  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  16226475 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 16226377  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16226376 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16226336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8348938 - 8349165
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||    
T  8348938 aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaacaattagagaaagaa 8349033  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||  |||| | ||||  |||||||| || || ||  || ||||||| |||||||||||||    
T  8349034 agagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaactt 8349132  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  8349133 aacaaaagagataccaatgagttacaagaataa 8349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 25860287 - 25860369
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25860287 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 25860369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 13127576 - 13127782
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 110  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||      
T  13127576 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaaggagaaaacaatgagataaagaaaa 13127670  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13127671 gagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaacttt 13127769  T
Q  210 acaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||||    
T  13127770 acaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Original strand, 26613194 - 26613353
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||  |||| ||||||||| |||      
T  26613194 aaaagtagaaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctc 26613292  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  26613293 tctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 26613353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16231968 - 16231732
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  16231968 aacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 16231871  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  16231870 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 16231773  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16231772 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16231732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27916840 - 27916681
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 162  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    | |||||||| ||| | |||||||||| | |||||| |||    
T  27916840 acagttataaacacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaaaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtc 27916743  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27916742 tgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 27916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 21948227 - 21948301
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21948227 gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 21948301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 30738609 - 30738743
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt--gatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||    
T  30738609 aagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaa 30738707  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  30738708 ctttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataa 30738743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 30780436 - 30780361
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 96  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30780436 tgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaaatcaaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 155949 - 155877
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  155949 gggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagataacaaaaggttacaagaat 155877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104332
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaa 238  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 43104332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47177767 - 47177531
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||         
T  47177767 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 47177670  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  47177669 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgat 47177572  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47177571 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47177531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47180118 - 47179882
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  47180118 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 47180021  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  47180020 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgat 47179923  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47179922 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47179882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665346
Alignment:
Q  182 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 48665346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51752764 - 51752696
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 91  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  51752764 tgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatt-gaat-acaagccaaaagtag 51752696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353434
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa 21353434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24326067 - 24326008
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagtta 71  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  24326067 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaatta 24326008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520114
Alignment:
Q  70 tataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacaca 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacaca 26520114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 217  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28279487 - 28279455
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28279487 cactataatgatgagtaactttacaaaagagat 28279455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 24338329 - 24338558
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24338329 aaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 24338428  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338429 agagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtct--gggggagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacctt 24338526  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24338527 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24338558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9020364 - 9020129
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  9020364 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 9020265  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  9020264 agggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagta 9020166  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9020165 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 3629745 - 3629975
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtagaaaacagcgagag-aaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3629745 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaagtagaaaacaacgagagaaaag 3629844  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||    
T  3629845 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctcagtttcactata-ttattagtaactt 3629942  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3629943 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3629975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 3631818 - 3632049
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  3631818 aaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagaaaaag 3631917  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  3631918 gaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggacagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacc 3632015  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3632016 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3632049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 11982906 - 11983140
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  11982906 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 11983005  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  11983006 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaa 11983104  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11983105 cgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11983140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 1069609 - 1069830
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaaca 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1069609 tggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaaca 1069708  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1069709 taaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagaga 1069808  T
Q  220 tatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  1069809 tatcaatgggttacaagaataa 1069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 30728703 - 30728913
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||     
T  30728703 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 30728802  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  30728803 gaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataat-atgagtaact 30728901  T
Q  208 ttacaaaagaga 219  Q
    ||||||||||||    
T  30728902 ttacaaaagaga 30728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15346779 - 15346550
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15346779 aaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacaagagaaagaa 15346680  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15346679 agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactata-tgatgaataacttt 15346582  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15346581 acaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15346550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15367464 - 15367234
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  15367464 aaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaatacgagagaaagaa 15367365  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15367364 agagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactata-tgatgaataactt 15367267  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15367266 tacaatagagatattaatgggttacaagaataa 15367234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186183
Alignment:
Q  59 tatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacc 157  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacc 12186099  T
Q  158 tggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12186100 tagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 12186183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 28241196 - 28241432
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  28241196 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaac 28241293  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28241294 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 28241392  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28241393 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28241432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13057625 - 13057397
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-- 108  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||   | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||       
T  13057625 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataatcacaaac-aaaagtagaaaacagatagagaaaaga 13057530  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13057529 aagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaacct 13057430  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13057429 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13057397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 15541024 - 15541250
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||   | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||  ||     
T  15541024 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaagttg---gtaacagttataatcacaaac-aaaattagaaaacaacgagagagaaaa 15541119  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15541120 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactata-tgatgaataactt 15541218  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15541219 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15541250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13040117 - 13039957
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  13040117 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 13040018  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13040017 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13039957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32280429 - 32280199
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaag 108  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||   ||  | |||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  32280429 aaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaataacatgagagaaag 32280333  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  32280332 gaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaact 32280233  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32280232 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32280199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14466759 - 14466527
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc---gagaga 105  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||    
T  14466759 ataaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcagcgagaga 14466663  T
Q  106 aagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||    
T  14466662 aagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaata 14466563  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14466562 accttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 14466527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 14507051 - 14507286
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  14507051 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 14507148  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  14507149 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgataa 14507247  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14507248 gtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14507286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 1230123 - 1230360
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||| ||||||   ||||||  ||     
T  1230123 aacttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaataca-aagccaaaagtataaaacaacggcgagaagaac 1230221  T
Q  108 -----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1230222 acaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatga 1230320  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1230321 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1230360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 4816105 - 4816342
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    | ||||||        
T  4816105 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 4816202  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  4816203 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 4816301  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4816302 agtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4816342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26065421 - 26065186
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga---- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||        
T  26065421 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaa 26065322  T
Q  104 -gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | | |||    
T  26065321 caaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-taacgag 26065224  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  26065223 taacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26065186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26085390 - 26085155
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga---- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||        
T  26085390 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaa 26085291  T
Q  104 -gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | | |||    
T  26085290 caaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-taacgag 26085193  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  26085192 taacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26085155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30967640 - 30967404
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  30967640 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 30967543  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  30967542 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatga 30967444  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  30967443 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30967404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 2628760 - 2628996
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  2628760 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 2628857  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  2628858 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 2628956  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2628957 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2628996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 14458643 - 14458878
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa----- 106  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||         
T  14458643 cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacgacgagaagaaca 14458740  T
Q  107 ---agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    
T  14458741 caaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgag 14458839  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14458840 taacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14458878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 3233605 - 3233841
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--g 108  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  3233605 ttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagg 3233704  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  3233705 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactata-cggtgagt 3233803  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  3233804 aacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 3233841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390582
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15720074 - 15719845
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  15720074 ataaacttgatgtgtgga---agtgatagtcaagcaatcaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaacaaaaa-tagaaaacagcgagagaaa 15719981  T
Q  108 g--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| |  || ||||||||||| |||||||||    
T  15719980 agaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagta 15719882  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15719881 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15719845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 241
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532792
Alignment:
Q  121 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtct-agggatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  221 atcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  15532772 atcaatgggttacaagaataa 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 3027740 - 3027965
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gag 113  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3027740 ttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagag 3027836  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||||||| |||  |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3027837 agaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 3027935  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3027936 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 3027965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Original strand, 12161502 - 12161668
Alignment:
Q  76 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  12161502 cacaagacaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagttt-agggagag 12161600  T
Q  173 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12161601 aacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 12161668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 19704438 - 19704679
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |     ||||||     
T  19704438 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaaacaacggcgagaa 19704535  T
Q  105 ------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
          |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  19704536 gaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tg 19704634  T
Q  198 atgagtaactttacaaa-agagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19704635 atgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataa 19704679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19696868 - 19696643
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||     
T  19696868 acttgatgtgtggagcaa-ag-taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaaaaacagcgagagaaagaaa 19696774  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19696773 gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataacttt 19696675  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19696674 acaaaagagatatcaaaggattacaagaataa 19696643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 30034480 - 30034714
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||         
T  30034480 aacttgatgtatggagcaag-gataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 30034575  T
Q  105 --aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||    
T  30034576 acaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctata-tgatga 30034674  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  30034675 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30034714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10584340 - 10584227
Alignment:
Q  100 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10584340 gagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatga 10584241  T
Q  199 tgagtaactttaca 212  Q
    |||||||| |||||    
T  10584240 tgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 29754583 - 29754819
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||   ||||||        
T  29754583 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 29754680  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  29754681 caaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 29754779  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  29754780 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 29754819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 22857891 - 22858038
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 164  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |||||    
T  22857891 agttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477477
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag------ 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||          
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacga 25477517  T
Q  203 -taactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25477516 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25477477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 26068269 - 26068505
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  26068269 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 26068366  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  26068367 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 26068465  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26068466 agcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26068505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26945539 - 26945362
Alignment:
Q  49 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggt 146  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  26945539 aaacaaagtgtaaggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggt 26945443  T
Q  147 ccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||  |||| |  |||| ||| |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26945442 ccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33309296 - 33309061
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  33309296 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 33309199  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  33309198 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 33309100  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33309099 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33309061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 25465524 - 25465686
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |     
T  25465524 ggaacaattataaactcaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacata 25465621  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || || | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465622 gtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 25465686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 20915231 - 20915466
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcga-gagaa--- 106  Q
    |||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||       
T  20915231 aacttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacgacgagaagaa 20915328  T
Q  107 -----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
         |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  20915329 cacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 20915426  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  20915427 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20915466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33311565 - 33311330
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  33311565 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 33311468  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  33311467 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactat-ttgatg 33311369  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  33311368 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33311330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 26065995 - 26066234
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  26065995 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 26066092  T
Q  105 --aaagaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
      ||||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||  ||    
T  26066093 caaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttg 26066191  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26066192 ataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26066234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 26932437 - 26932672
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||||    ||| |||||         
T  26932437 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaggtagaaaaacaacggcgagaagaa 26932534  T
Q  103 -agaaagaagagagaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||  | ||||||| |||||    
T  26932535 cacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatg 26932632  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26932633 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26932672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3394800 - 3394708
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394800 cttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 3394708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17012466 - 17012243
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 111  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  17012466 acttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaac-gtta-aaacacaagccaaaagtagaaaatagtgagagaaagaaag 17012370  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||| |  |   |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||  | |  |  | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  17012369 agagaatatga---aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctctatg-ttccctataacgatgagtaacttta 17012274  T
Q  211 caaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17012273 caaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17012243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25480309 - 25480217
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25480309 ttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaa 25480217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937302
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||   |||||    
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacct 12937223  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  12937224 agtctg-gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12937302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455537
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  225 attgattacaagaataa 241  Q
    |  | ||||||||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataa 16455537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 28037659 - 28037841
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaa-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||| | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||     
T  28037659 ggaacaattataaacacaaga-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaagaaaaaaaaaacacaatttgtttacccagctcggtccaaaactgaccta 28037756  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgt---ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28037757 gactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 28037841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 28078136 - 28078291
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgag 166  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || ||||    
T  28078136 ttataaacacaagc-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgag 28078232  T
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078233 ggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22491045 - 22490917
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||| || |||||||| |  |||| |||||||||||||||||   ||  | |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22491045 aaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaa---gtgggtaacaattataaacataggccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 22490949  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 141  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22490948 agagagagcacaaaagaatttgttgacctagt 22490917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 5273090 - 5273326
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  5273090 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--ttttaaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 5273187  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||  ||||    
T  5273188 caaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-agatg 5273286  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5273287 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5273326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 12195388 - 12195625
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  12195388 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 12195485  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||||   ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  12195486 cacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 12195584  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  12195585 gagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 12195625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 25078529 - 25078669
Alignment:
Q  100 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| | ||| || ||| ||||| | |||||| |||| || |||    
T  25078529 gagaaaaagaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactg-ggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatga 25078626  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25078627 cgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25078669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911555
Alignment:
Q  154 gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30445801 - 30445729
Alignment:
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  30445801 ggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 30445729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18322532 - 18322482
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 62  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18322532 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530233
Alignment:
Q  172 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaa-tggttacaagaataa 15530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 15530084 - 15530156
Alignment:
Q  54 aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc----gagagaaagaagagagaacacaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||    
T  15530084 aagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22490896 - 22490843
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22490896 cactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22490843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3833541 - 3833481
Alignment:
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagt-aactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3833541 ttccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 3833481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 17904287 - 17904368
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc 148  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17904287 acagttataaacacaagc-aaaattagaaaacaacgagagaga-atgaaagaacacaaaataatttgtttacctagttctgtcc 17904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20527011
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaat 20527011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30443652 - 30443532
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa---gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  30443652 caaaaatagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagc 30443553  T
Q  179 cttccgtttcactatagtgat 199  Q
      |||||| ||||||| ||||    
T  30443552 tctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11262793 - 11262678
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   |||||| || |||| ||||||||  ||    
T  11262793 aagagagaacacacga-aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttct 11262695  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11262694 ttac-aaagagatatcaa 11262678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936640
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15073168 - 15072935
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  15073168 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 15073069  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  15073068 agaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaac 15072970  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15072969 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15072935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 14419069 - 14419302
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  14419069 aaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 14419168  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  14419169 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaacc 14419268  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  14419269 ttacaaaagacatattaatgggttacaagaataa 14419302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 30480386 - 30480614
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaag 111  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  30480386 ttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaag 30480485  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  30480486 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgactaacgttac 30480584  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30480585 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30480614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36865995 - 36865759
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36865995 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 36865896  T
Q  111 -----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
         || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36865895 aaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagta 36865796  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  36865795 actttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 36865759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41383120 - 41382901
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  41383120 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagccagaagtagaaaacaacagcgagagaaa 41383021  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41383020 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaa 41382922  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  41382921 cgttacaaaagagatgtcaat 41382901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25952976 - 25952744
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-- 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||       
T  25952976 aaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaacacaatccaaaagtagaaaacggcgagagaaaaga 25952877  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  25952876 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattt 25952777  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25952776 tacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 25952744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15956409 - 15956181
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  15956409 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataatcacaaacgaaa-gtagaaaacaacgagagaaaaga 15956313  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15956312 agagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaacttt 15956213  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15956212 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15956181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 13858368 - 13858577
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858368 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaa 13858465  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858466 agggagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacttt 13858564  T
Q  210 acaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||||    
T  13858565 acaaaagagatat 13858577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15068438 - 15068205
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  15068438 aaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 15068339  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  15068338 agaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattata-tgatgagtaac 15068240  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15068239 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15068205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 33541289 - 33541506
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |       
T  33541289 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaatcagcgagagagaaag 33541388  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  33541389 gaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactata-tgatgagtaacc 33541487  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33541488 ttacaaaagagatatcaat 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 15185598 - 15185825
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15185598 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcataaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 15185694  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15185695 agagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaacctt 15185794  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15185795 aaaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15185825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 28251445 - 28251678
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||     
T  28251445 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccacaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 28251544  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  28251545 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaac 28251643  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
     |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  28251644 attacaaaagagaaatcaatgggttataagaataa 28251678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 27106781 - 27107008
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27106781 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcaca-gacaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 27106877  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |    
T  27106878 agagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccct 27106976  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27106977 acaaaagagatatctatgggttacaagaataa 27107008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14808217 - 14807975
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  14808217 aaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 14808118  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct----------gagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  14808117 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactata-tg 14808019  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14808018 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14807975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 2468010 - 2468241
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||     
T  2468010 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaa--gttataatcacaaaacaaaattagaaaacaacgagagaaaa 2468107  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  2468108 gaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaac 2468206  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  2468207 tttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataa 2468241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41385192 - 41384983
Alignment:
Q  22 gtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaa-gtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagag 115  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  41385192 gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagag 41385093  T
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41385092 aacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41384994  T
Q  216 gagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||    
T  41384993 gagatgtcaat 41384983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1225568 - 1225390
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1225568 aacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagta 1225469  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  1225468 tgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 1225390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21482766 - 21482534
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21482766 ataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaa 21482670  T
Q  107 ag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  21482669 aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagta 21482571  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21482570 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21482534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3874453 - 3874234
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  3874453 aacttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 3874359  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3874358 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 3874264  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3874263 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3874234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 37214143 - 37214319
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||     
T  37214143 aaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 37214242  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  37214243 gaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 35872335 - 35872551
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  35872335 aaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaaga 35872433  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  35872434 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgtt 35872519  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  35872520 acaaaagagatatcaatggcttacaaaaataa 35872551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 5372060 - 5372289
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5372060 aaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaga 5372159  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |   |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5372160 a---agaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaacct 5372256  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  5372257 tacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 5372289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43530575 - 43530339
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||         
T  43530575 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcaagaagaac 43530478  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  43530477 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactata-tgatga 43530379  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  43530378 gtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataa 43530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21480958 - 21480726
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  21480958 ataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagaagaaaacaacgagagaa 21480862  T
Q  107 ag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |   |||||||||||||  | | ||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21480861 aagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagta 21480763  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21480762 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21480726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27827446 - 27827210
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||        
T  27827446 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27827349  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27827348 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27827250  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27827249 agtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27827210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27829757 - 27829521
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||   ||||||        
T  27829757 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27829660  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27829659 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27829561  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27829560 agtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27829521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15809678 - 15809442
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||         
T  15809678 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaaggcaaaaatagaaaacaacggcgagaagaac 15809581  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || | | ||||||| ||||||    
T  15809580 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactata-tgatga 15809482  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15809481 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15809442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4424479 - 4424242
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  4424479 aacttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 4424382  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||    
T  4424381 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatg 4424283  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  4424282 agtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataa 4424242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32339770 - 32339533
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||        
T  32339770 aacttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaataacggcgagaagaa 32339673  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  32339672 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 32339574  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32339573 agtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32339533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22684527 - 22684749
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  22684527 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 22684624  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  22684625 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatg 22684723  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22684724 agtaacgttacaatagagaaatcaat 22684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 609197 - 608958
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--------- 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||             
T  609197 aacttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcaagaaga 609100  T
Q  101 agagaaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  609099 acacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tga 609001  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  609000 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 608958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 28283096 - 28283330
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |   ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28283096 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28283193  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28283194 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28283291  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | || |||||||||    
T  28283292 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttgcaagaataa 28283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 3005521 - 3005743
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||  |||||    ||||| ||||||||  |||     
T  3005521 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaatacaag--aaaaggtacaaacaacgagagaagaaagg 3005615  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  3005616 gagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttac 3005713  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3005714 aaaagagatatcaatggattacaagaataa 3005743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18811168 - 18810932
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac---agcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||        
T  18811168 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacgacagcgagaagaa 18811071  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18811070 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18810972  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18810971 agtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18810932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18813342 - 18813106
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||        
T  18813342 aacttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacgacggcgagaagaa 18813245  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18813244 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18813146  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||   |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18813145 agtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18813106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31162664 - 31162433
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag---a 109  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    |    
T  31162664 acttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaa 31162567  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgaggg--agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||     
T  31162566 aaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaat 31162468  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31162467 tttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 181901 - 181798
Alignment:
Q  43 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  181901 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagt 181802  T
Q  142 tcgg 145  Q
    ||||    
T  181801 tcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14477706 - 14477520
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||  | |||| ||||||||   |||    
T  14477706 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaacacaagccaaaa-aaaaaaaaagcgagagagaaaa 14477608  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||||||||||||||    
T  14477607 gaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactata 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27911367 - 27911238
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911367 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27911270  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  27911269 acaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27911238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27957786 - 27957657
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27957786 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27957689  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  27957688 acaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27957657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44721303 - 44721068
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  44721303 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44721206  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||    
T  44721205 acaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactata-tgatga 44721107  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44721106 gtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44721068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31035522 - 31035342
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||     
T  31035522 ggaacaattaaaaacacaagc-aaaactagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccta 31035425  T
Q  160 --gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  31035424 tagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaagggttacaagaataa 31035342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 239
Target Start/End: Original strand, 31578216 - 31578387
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||| | | |||||| |||    
T  31578216 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaga-gagagcacacaaaa---tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtc 31578310  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    |  ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  31578311 taggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaat 31578387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6376354 - 6376229
Alignment:
Q  100 gagagaaaga-agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6376354 gagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatg 6376256  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6376255 atgagtaactttac-aaagagatatcaa 6376229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43082433 - 43082198
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||         
T  43082433 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgtcgagaagaac 43082336  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  43082335 aaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 43082237  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43082236 gtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43082198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43080062 - 43079827
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  43080062 aacttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 43079965  T
Q  105 -aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  43079964 aaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 43079866  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43079865 gtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43079827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16833854 - 16833777
Alignment:
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaaga 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16833854 gtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaatgattacaaga 16833777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 3883470 - 3883553
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3883470 aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 3883553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27911533 - 27911441
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27911533 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagaga 27911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27957952 - 27957860
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27957952 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagaga 27957860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3896121 - 3896063
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3896121 gggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 181797 - 181726
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  181797 gggagagagcagtcatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataa 181726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 24873073 - 24873158
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24873073 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaaggtagaaaaca 24873158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 31566493 - 31566578
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31566493 aacaattataaacacaagc-agaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaa 31566578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752438
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28228714 - 28228669
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28228714 agaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgacct 28228669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573835
Alignment:
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaat 31573835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 14264 - 14493
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  14264 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaagg 14363  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  14364 aagagagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgt 14460  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14461 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15369 - 15196
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |    
T  15369 acagttataatcacaa-acaaaagtagaaaacaacatgataaaagaagagagaacac--aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcat 15273  T
Q  164 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15272 gggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 85629 - 85407
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaac 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  85629 tgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaac 85530  T
Q  119 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 218  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  85529 acaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagag 85430  T
Q  219 atatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  85429 atatcaatgggttacaagaataa 85407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4403 - 4173
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4403 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 4304  T
Q  110 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4303 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 4206  T
Q  209 tacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4205 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 79597 - 79362
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||     
T  79597 aaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcaagagaa 79498  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  79497 aaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagta 79399  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  79398 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 79362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 183516 - 183752
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  183516 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 183613  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  183614 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 183712  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  183713 gtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 183752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52422 - 52203
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  52422 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 52323  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52322 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 52226  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  52225 aacgttacaaaagagatgtcaat 52203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50423 - 50235
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  50423 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 50324  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  50323 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 80271 - 80051
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  80271 aaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 80172  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80171 aaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagta 80073  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  80072 acgttacaaaagagatgtcaat 80051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 41358 - 41594
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  41358 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaac 41455  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  41456 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 41554  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  41555 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 41594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 11387 - 11584
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11387 aaaataaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggtt 11486  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11487 cggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36005 - 35817
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||   |||||||||    
T  36005 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaactcgaaaacaacagcgagagaa 35906  T
Q  107 a-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  35905 aagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 1327 - 1563
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  1327 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagat 1424  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  1425 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 1523  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1524 agtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 69166 - 69402
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  69166 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 69263  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  69264 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatg 69362  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  69363 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 69402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1754
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||    
T  1529 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaaaga 1625  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1626 gagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttac 1724  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1725 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29583 - 29348
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-agagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||        
T  29583 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaac 29486  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  29485 acaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 29387  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||   |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  29386 gtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 16536 - 16762
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||    
T  16536 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaa-ctaaacaaagtgcatgga--agttataaatacaag-caaaaatagaaaacaacgagagaaaagaaa 16631  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  | || |  ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16632 gagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaacttt 16730  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16731 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Original strand, 15774 - 15933
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  15774 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 15872  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15873 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 1326 - 1485
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  1326 aacttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 1423  T
Q  103 agaaagaag-agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 163  Q
    | ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1424 acaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6377
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6612 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaata---ataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6516  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  6515 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 6417  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6416 agtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 219
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||       | || |      
T  439 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggc 349  T
Q  111 gaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||  | ||    
T  348 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgtt 250  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    || ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  249 ac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22294
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22321  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||    
T  22320 aagagaaatcaatgagttacaagaata 22294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24569
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 24596  T
Q  214 aagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||    
T  24595 aagagaaatcaatgagttacaagaata 24569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3292 - 3057
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||||   ||||||        
T  3292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 3196  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  3195 cacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactata-tgatg 3097  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    |||  | |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3096 agtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 12749 - 12832
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  12749 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagacaaca 12832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4729
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4666 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4635
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4555 ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 4635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Original strand, 57367 - 57539
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatt-tgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 164  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||   || || | || ||||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  57367 agttataaacacaatcaaaagatagaaaacagtgagagaaaga-gagagaacacac--gatttgtttttacctagttccgtccaatactgacctagtctg 57463  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaata 240  Q
     |||||||||||||  || ||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  57464 ggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaata 57539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2292 - 2218
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaagaataa 241  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  2292 gggagagagtagccctccgattcactata-tgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataa 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5292 times since January 2019
Visitors: 5755