View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0811_low_36 (Length: 262)

Name: NF0811_low_36
Description: NF0811
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0811_low_36
NF0811_low_36
[»] chr3 (107 HSPs)
chr3 (11-233)||(1313565-1313787)
chr3 (15-226)||(43421298-43421509)
chr3 (15-226)||(43423346-43423557)
chr3 (11-226)||(53917540-53917758)
chr3 (11-226)||(880330-880545)
chr3 (11-226)||(27635532-27635752)
chr3 (9-226)||(3314847-3315068)
chr3 (11-226)||(45883102-45883323)
chr3 (11-219)||(51943540-51943753)
chr3 (15-226)||(6484523-6484735)
chr3 (11-226)||(53915372-53915590)
chr3 (12-226)||(4308157-4308375)
chr3 (15-218)||(12267857-12268061)
chr3 (11-226)||(1626560-1626777)
chr3 (11-226)||(32219247-32219468)
chr3 (11-226)||(36011990-36012209)
chr3 (11-233)||(51674643-51674867)
chr3 (12-226)||(43228454-43228671)
chr3 (9-226)||(17795421-17795637)
chr3 (9-226)||(19103861-19104077)
chr3 (15-226)||(32263919-32264133)
chr3 (1-226)||(3306924-3307150)
chr3 (12-226)||(27101057-27101275)
chr3 (11-226)||(18096774-18096994)
chr3 (12-205)||(41849243-41849437)
chr3 (11-227)||(24979869-24980092)
chr3 (38-226)||(47701578-47701765)
chr3 (9-233)||(4666672-4666896)
chr3 (11-226)||(53468330-53468550)
chr3 (12-226)||(9604481-9604701)
chr3 (11-226)||(18099044-18099264)
chr3 (12-226)||(43226248-43226461)
chr3 (11-226)||(42990467-42990684)
chr3 (38-226)||(6231963-6232152)
chr3 (38-226)||(48361572-48361765)
chr3 (21-224)||(23633619-23633819)
chr3 (11-226)||(25688034-25688255)
chr3 (12-226)||(10955900-10956121)
chr3 (9-226)||(18162826-18163048)
chr3 (11-219)||(15781045-15781259)
chr3 (33-226)||(47148794-47148989)
chr3 (15-232)||(53591341-53591559)
chr3 (11-226)||(1321642-1321864)
chr3 (12-206)||(5886381-5886582)
chr3 (12-206)||(5899854-5900055)
chr3 (12-226)||(10958196-10958417)
chr3 (9-226)||(28101880-28102096)
chr3 (21-226)||(54691460-54691668)
chr3 (12-226)||(51726880-51727101)
chr3 (12-226)||(25533605-25533808)
chr3 (12-225)||(10084262-10084482)
chr3 (38-222)||(5926670-5926854)
chr3 (9-226)||(28761319-28761523)
chr3 (12-226)||(11168264-11168486)
chr3 (13-224)||(31151508-31151719)
chr3 (48-226)||(39715632-39715809)
chr3 (9-142)||(880117-880251)
chr3 (11-150)||(28181242-28181383)
chr3 (12-226)||(38890203-38890425)
chr3 (12-214)||(5522499-5522709)
chr3 (12-219)||(10191185-10191397)
chr3 (64-233)||(25634043-25634212)
chr3 (15-225)||(26720711-26720928)
chr3 (12-214)||(5191827-5192035)
chr3 (12-214)||(7606476-7606670)
chr3 (55-226)||(42992433-42992606)
chr3 (94-226)||(30006004-30006137)
chr3 (12-214)||(25389080-25389291)
chr3 (12-204)||(3859712-3859895)
chr3 (13-226)||(561659-561871)
chr3 (114-226)||(11170567-11170678)
chr3 (33-151)||(8183035-8183154)
chr3 (13-214)||(36871185-36871384)
chr3 (12-226)||(22114176-22114399)
chr3 (11-214)||(4103769-4103978)
chr3 (114-194)||(35919098-35919178)
chr3 (12-179)||(53893927-53894105)
chr3 (12-214)||(746932-747143)
chr3 (139-224)||(889781-889865)
chr3 (13-226)||(25635544-25635754)
chr3 (12-179)||(50494208-50494383)
chr3 (12-179)||(458493-458669)
chr3 (65-225)||(1620394-1620554)
chr3 (12-179)||(456116-456292)
chr3 (11-164)||(42992610-42992766)
chr3 (12-214)||(10621400-10621612)
chr3 (12-179)||(28412904-28413080)
chr3 (69-225)||(53597400-53597557)
chr3 (109-226)||(24181543-24181660)
chr3 (176-233)||(54884310-54884367)
chr3 (12-179)||(6065667-6065844)
chr3 (139-226)||(35917952-35918037)
chr3 (12-97)||(11170671-11170755)
chr3 (12-178)||(38210580-38210755)
chr3 (12-179)||(6063317-6063494)
chr3 (84-225)||(14634393-14634535)
chr3 (167-226)||(29956849-29956907)
chr3 (168-226)||(13420222-13420280)
chr3 (64-217)||(27420822-27420973)
chr3 (145-191)||(28181185-28181230)
chr3 (38-150)||(26763205-26763313)
chr3 (62-186)||(1674166-1674292)
chr3 (153-225)||(11007545-11007617)
chr3 (123-173)||(30236249-30236299)
chr3 (129-178)||(16264354-16264403)
chr3 (129-178)||(25795785-25795834)
chr3 (129-178)||(32143325-32143374)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (11-226)||(33415368-33415584)
chr4 (11-226)||(38928058-38928273)
chr4 (11-226)||(16453546-16453762)
chr4 (11-226)||(22800739-22800958)
chr4 (12-226)||(4215543-4215756)
chr4 (11-226)||(40091294-40091511)
chr4 (12-226)||(17662125-17662341)
chr4 (11-226)||(22802611-22802830)
chr4 (11-233)||(36921372-36921596)
chr4 (12-226)||(40637311-40637531)
chr4 (11-215)||(47563009-47563213)
chr4 (12-226)||(24889033-24889251)
chr4 (11-233)||(36919463-36919687)
chr4 (11-226)||(47274963-47275178)
chr4 (11-226)||(2891528-2891746)
chr4 (13-226)||(36378529-36378742)
chr4 (38-226)||(24879226-24879419)
chr4 (11-226)||(12395724-12395941)
chr4 (11-226)||(12400686-12400903)
chr4 (12-226)||(14633555-14633776)
chr4 (9-222)||(37312956-37313158)
chr4 (11-226)||(13547391-13547609)
chr4 (38-226)||(24880688-24880883)
chr4 (11-226)||(5101166-5101370)
chr4 (11-226)||(14787308-14787527)
chr4 (11-226)||(16455478-16455680)
chr4 (22-226)||(48486556-48486764)
chr4 (49-226)||(36380586-36380764)
chr4 (12-226)||(5635351-5635572)
chr4 (11-201)||(6133098-6133291)
chr4 (9-226)||(18409225-18409443)
chr4 (11-222)||(27499283-27499502)
chr4 (11-214)||(37089246-37089456)
chr4 (11-194)||(14789307-14789495)
chr4 (12-214)||(22044266-22044475)
chr4 (12-214)||(22046561-22046770)
chr4 (9-226)||(19096120-19096338)
chr4 (12-226)||(8631293-8631515)
chr4 (11-226)||(24446536-24446737)
chr4 (9-222)||(41997733-41997943)
chr4 (9-226)||(619330-619543)
chr4 (12-214)||(26085851-26086061)
chr4 (12-204)||(51015504-51015703)
chr4 (13-226)||(19322930-19323142)
chr4 (12-214)||(9148501-9148693)
chr4 (12-226)||(24348455-24348659)
chr4 (11-226)||(6765081-6765301)
chr4 (12-214)||(31849473-31849683)
chr4 (12-214)||(11435203-11435413)
chr4 (13-226)||(18537360-18537571)
chr4 (15-226)||(38890112-38890322)
chr4 (12-214)||(2484748-2484957)
chr4 (13-224)||(12102326-12102531)
chr4 (15-164)||(52942368-52942523)
chr4 (12-214)||(11008442-11008652)
chr4 (62-225)||(25357879-25358042)
chr4 (15-223)||(30136789-30136996)
chr4 (12-226)||(7941560-7941781)
chr4 (12-171)||(3937160-3937316)
chr4 (38-225)||(3982087-3982272)
chr4 (12-226)||(5198657-5198862)
chr4 (12-214)||(11006128-11006321)
chr4 (12-214)||(11437611-11437821)
chr4 (13-226)||(18534718-18534929)
chr4 (12-214)||(38409453-38409662)
chr4 (12-226)||(47868638-47868860)
chr4 (13-226)||(8756138-8756348)
chr4 (11-217)||(49088816-49089010)
chr4 (9-226)||(53405372-53405594)
chr4 (11-149)||(3824483-3824630)
chr4 (9-110)||(56030815-56030913)
chr4 (12-214)||(18847402-18847610)
chr4 (12-214)||(9174020-9174230)
chr4 (12-214)||(9176348-9176558)
chr4 (65-214)||(16185770-16185920)
chr4 (12-179)||(16931665-16931839)
chr4 (12-214)||(22134491-22134701)
chr4 (38-225)||(28453920-28454109)
chr4 (12-97)||(47210671-47210754)
chr4 (13-226)||(15032429-15032645)
chr4 (12-177)||(18709038-18709212)
chr4 (13-225)||(9863945-9864160)
chr4 (12-214)||(22132263-22132476)
chr4 (126-225)||(26557823-26557922)
chr4 (62-215)||(22295412-22295565)
chr4 (13-97)||(5664605-5664687)
chr4 (40-214)||(10114565-10114737)
chr4 (149-226)||(13544196-13544272)
chr4 (62-225)||(47150826-47150989)
chr4 (12-179)||(44599714-44599888)
chr4 (105-179)||(16934118-16934193)
chr4 (12-214)||(22782611-22782822)
chr4 (166-225)||(31983564-31983623)
chr4 (139-226)||(47210762-47210848)
chr4 (181-222)||(54928700-54928741)
chr4 (114-214)||(22780358-22780457)
chr4 (11-74)||(38270028-38270088)
chr4 (166-226)||(9022543-9022602)
chr4 (170-225)||(40998990-40999045)
chr4 (84-225)||(3578632-3578766)
chr4 (129-179)||(5269234-5269284)
chr4 (38-225)||(10113108-10113292)
chr4 (65-118)||(52043497-52043550)
chr4 (129-178)||(5143263-5143312)
[»] chr7 (89 HSPs)
chr7 (11-226)||(44724772-44724988)
chr7 (11-226)||(13099351-13099572)
chr7 (9-226)||(42330878-42331093)
chr7 (11-226)||(31434927-31435143)
chr7 (11-233)||(443781-444008)
chr7 (11-226)||(21592023-21592239)
chr7 (20-226)||(22393915-22394120)
chr7 (9-226)||(21990343-21990563)
chr7 (11-226)||(27306110-27306326)
chr7 (11-226)||(24748787-24749000)
chr7 (11-226)||(4295815-4296030)
chr7 (11-226)||(9679252-9679470)
chr7 (82-226)||(20137061-20137205)
chr7 (11-226)||(42223351-42223566)
chr7 (16-226)||(20626231-20626443)
chr7 (16-226)||(20630122-20630334)
chr7 (16-226)||(20642541-20642753)
chr7 (11-226)||(37412001-37412223)
chr7 (11-226)||(9681013-9681231)
chr7 (11-226)||(21678259-21678472)
chr7 (11-226)||(39145865-39146083)
chr7 (12-226)||(48457846-48458067)
chr7 (14-224)||(21680222-21680435)
chr7 (12-226)||(38394179-38394400)
chr7 (12-226)||(20299653-20299874)
chr7 (12-226)||(7471855-7472076)
chr7 (11-226)||(27832522-27832729)
chr7 (12-226)||(18345734-18345955)
chr7 (13-226)||(26295640-26295850)
chr7 (9-226)||(11355451-11355672)
chr7 (11-226)||(7092087-7092308)
chr7 (12-226)||(44757-44978)
chr7 (13-226)||(7188732-7188942)
chr7 (12-226)||(20297555-20297776)
chr7 (15-164)||(26804764-26804917)
chr7 (15-226)||(43253394-43253613)
chr7 (12-226)||(1850174-1850395)
chr7 (23-226)||(3035917-3036127)
chr7 (11-226)||(7094334-7094556)
chr7 (9-226)||(24465730-24465943)
chr7 (12-233)||(28485752-28485979)
chr7 (12-214)||(40836618-40836827)
chr7 (12-226)||(28487746-28487967)
chr7 (12-226)||(35822-36043)
chr7 (11-149)||(22251464-22251605)
chr7 (12-176)||(11759369-11759541)
chr7 (12-226)||(40946521-40946744)
chr7 (12-226)||(3878770-3878993)
chr7 (15-226)||(7469901-7470118)
chr7 (12-214)||(38396839-38397053)
chr7 (12-214)||(25542733-25542942)
chr7 (105-226)||(24258656-24258781)
chr7 (63-222)||(6332417-6332574)
chr7 (83-222)||(24813450-24813591)
chr7 (88-225)||(11081703-11081842)
chr7 (116-214)||(1049283-1049380)
chr7 (38-222)||(16296934-16297115)
chr7 (12-214)||(1606584-1606793)
chr7 (116-214)||(1046912-1047009)
chr7 (12-97)||(9027068-9027151)
chr7 (64-226)||(24817287-24817450)
chr7 (84-226)||(25276334-25276465)
chr7 (12-214)||(2935473-2935683)
chr7 (114-214)||(22108271-22108370)
chr7 (114-214)||(22137282-22137381)
chr7 (114-214)||(40550031-40550130)
chr7 (114-214)||(40552309-40552408)
chr7 (12-179)||(7351526-7351702)
chr7 (23-119)||(6349097-6349191)
chr7 (114-214)||(31155896-31155995)
chr7 (166-226)||(20091584-20091641)
chr7 (169-226)||(22828672-22828729)
chr7 (114-214)||(9027179-9027278)
chr7 (12-87)||(1049164-1049239)
chr7 (170-225)||(22280379-22280434)
chr7 (141-225)||(6046688-6046772)
chr7 (109-225)||(13290454-13290569)
chr7 (12-87)||(1046792-1046868)
chr7 (114-224)||(6067183-6067294)
chr7 (12-90)||(7349152-7349228)
chr7 (180-226)||(6348975-6349021)
chr7 (9-51)||(20137024-20137066)
chr7 (12-65)||(22137439-22137493)
chr7 (64-214)||(40281316-40281468)
chr7 (12-65)||(40552466-40552520)
chr7 (123-199)||(2075226-2075303)
chr7 (129-178)||(9190052-9190101)
chr7 (129-173)||(12097867-12097911)
chr7 (13-107)||(20091041-20091132)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (24-226)||(22407346-22407550)
chr2 (11-226)||(19007799-19008016)
chr2 (13-226)||(14837426-14837642)
chr2 (11-226)||(6258696-6258913)
chr2 (11-226)||(6264027-6264245)
chr2 (13-226)||(28459073-28459286)
chr2 (15-219)||(22162907-22163111)
chr2 (11-233)||(42923385-42923612)
chr2 (11-225)||(22287215-22287431)
chr2 (15-226)||(28196796-28197007)
chr2 (12-226)||(43623458-43623676)
chr2 (11-226)||(17849276-17849493)
chr2 (11-226)||(21520568-21520789)
chr2 (11-194)||(3022362-3022548)
chr2 (11-226)||(5375224-5375442)
chr2 (12-226)||(17848599-17848814)
chr2 (38-226)||(22707657-22707849)
chr2 (15-226)||(31732666-31732873)
chr2 (47-225)||(44288982-44289163)
chr2 (48-219)||(40031968-40032143)
chr2 (12-226)||(45279876-45280080)
chr2 (11-226)||(7462824-7463044)
chr2 (44-222)||(23870979-23871161)
chr2 (11-214)||(27104968-27105178)
chr2 (104-231)||(11739534-11739661)
chr2 (12-226)||(23452111-23452333)
chr2 (9-226)||(45238874-45239073)
chr2 (11-226)||(11577991-11578205)
chr2 (12-204)||(13909920-13910119)
chr2 (67-226)||(18800251-18800410)
chr2 (11-153)||(15539409-15539553)
chr2 (11-233)||(34979468-34979682)
chr2 (109-226)||(22874289-22874406)
chr2 (13-225)||(17897134-17897341)
chr2 (12-214)||(24162098-24162307)
chr2 (12-204)||(42064695-42064878)
chr2 (114-226)||(42452940-42453050)
chr2 (62-225)||(20146540-20146704)
chr2 (105-226)||(19501986-19502107)
chr2 (105-226)||(19504321-19504442)
chr2 (63-225)||(40699534-40699697)
chr2 (23-107)||(38020360-38020444)
chr2 (12-214)||(36558755-36558948)
chr2 (12-179)||(35217844-35218013)
chr2 (12-214)||(36561015-36561225)
chr2 (16-174)||(20592288-20592444)
chr2 (92-221)||(35107458-35107590)
chr2 (12-95)||(19501876-19501958)
chr2 (12-179)||(35215467-35215636)
chr2 (9-65)||(22874431-22874487)
chr2 (114-214)||(45332166-45332265)
chr2 (12-93)||(19504211-19504291)
chr2 (9-215)||(37962823-37963027)
chr2 (12-67)||(42453802-42453857)
chr2 (21-105)||(38414071-38414155)
chr2 (84-210)||(17921871-17921996)
chr2 (181-226)||(20589850-20589895)
chr2 (181-225)||(15694064-15694108)
chr2 (166-214)||(33604092-33604140)
chr2 (11-74)||(11739455-11739518)
chr2 (117-215)||(39287262-39287361)
chr2 (126-225)||(13828338-13828438)
chr2 (129-173)||(17057369-17057413)
chr2 (129-173)||(17085352-17085396)
chr2 (123-214)||(17943631-17943723)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (11-225)||(18511090-18511307)
chr5 (11-226)||(2724076-2724293)
chr5 (11-226)||(40221705-40221929)
chr5 (9-226)||(36208759-36208975)
chr5 (16-225)||(18509201-18509413)
chr5 (9-226)||(10474200-10474419)
chr5 (13-226)||(696060-696273)
chr5 (11-217)||(21288953-21289159)
chr5 (15-226)||(26097915-26098127)
chr5 (9-226)||(25904286-25904505)
chr5 (11-226)||(41585614-41585840)
chr5 (11-233)||(1189486-1189712)
chr5 (9-226)||(39854666-39854889)
chr5 (1-226)||(6756675-6756901)
chr5 (11-226)||(18596828-18597045)
chr5 (11-226)||(2818211-2818431)
chr5 (11-233)||(36402204-36402431)
chr5 (15-226)||(658241-658449)
chr5 (11-226)||(20505721-20505937)
chr5 (11-225)||(21948210-21948434)
chr5 (11-226)||(17818369-17818586)
chr5 (11-226)||(16092079-16092296)
chr5 (11-221)||(26098165-26098380)
chr5 (11-226)||(6745251-6745473)
chr5 (9-226)||(17073066-17073289)
chr5 (15-226)||(2954600-2954811)
chr5 (11-226)||(24127039-24127257)
chr5 (11-226)||(31472493-31472709)
chr5 (11-192)||(20043206-20043390)
chr5 (11-226)||(37705661-37705876)
chr5 (11-215)||(6747498-6747709)
chr5 (12-226)||(25804208-25804428)
chr5 (12-226)||(25921348-25921569)
chr5 (15-179)||(31465871-31466039)
chr5 (12-214)||(38882300-38882492)
chr5 (11-226)||(16776340-16776560)
chr5 (15-226)||(6661074-6661282)
chr5 (12-226)||(10528972-10529195)
chr5 (11-226)||(18466867-18467089)
chr5 (11-226)||(27912719-27912941)
chr5 (12-226)||(4236812-4237032)
chr5 (12-214)||(34476927-34477137)
chr5 (12-214)||(34479292-34479502)
chr5 (12-214)||(2175113-2175305)
chr5 (13-223)||(20054021-20054231)
chr5 (11-214)||(10587026-10587219)
chr5 (43-226)||(39397916-39398089)
chr5 (11-226)||(18469194-18469414)
chr5 (15-215)||(12555796-12556008)
chr5 (12-204)||(21684327-21684526)
chr5 (15-226)||(39798230-39798431)
chr5 (15-226)||(27910633-27910834)
chr5 (12-178)||(4410252-4410425)
chr5 (11-107)||(20045290-20045386)
chr5 (12-214)||(38960006-38960216)
chr5 (12-214)||(10749895-10750104)
chr5 (13-225)||(15445154-15445362)
chr5 (11-110)||(34530593-34530692)
chr5 (15-226)||(9020401-9020612)
chr5 (12-204)||(31542939-31543138)
chr5 (12-214)||(10757371-10757580)
chr5 (12-176)||(3373011-3373184)
chr5 (69-225)||(4897913-4898068)
chr5 (61-225)||(15143650-15143817)
chr5 (114-214)||(15354560-15354659)
chr5 (114-214)||(23665238-23665337)
chr5 (114-214)||(23741844-23741943)
chr5 (114-214)||(23793250-23793349)
chr5 (12-179)||(31179247-31179421)
chr5 (64-214)||(2144504-2144647)
chr5 (114-214)||(15356836-15356935)
chr5 (161-225)||(17413198-17413262)
chr5 (114-204)||(31545285-31545374)
chr5 (84-225)||(35430365-35430506)
chr5 (114-179)||(15552474-15552539)
chr5 (188-226)||(34530724-34530762)
chr5 (196-226)||(42770993-42771023)
chr5 (14-121)||(42771064-42771167)
chr5 (129-178)||(10281755-10281804)
chr5 (181-226)||(20045223-20045268)
chr5 (129-174)||(31300644-31300689)
chr5 (12-95)||(15552569-15552650)
[»] chr1 (101 HSPs)
chr1 (11-226)||(11457356-11457573)
chr1 (12-226)||(47906453-47906670)
chr1 (9-222)||(17186011-17186222)
chr1 (11-219)||(4131256-4131467)
chr1 (11-226)||(18307292-18307509)
chr1 (11-226)||(31424896-31425113)
chr1 (11-226)||(16429140-16429353)
chr1 (11-226)||(2949113-2949329)
chr1 (11-226)||(9240968-9241184)
chr1 (9-219)||(13215275-13215486)
chr1 (15-226)||(17319070-17319283)
chr1 (11-226)||(25251155-25251373)
chr1 (11-226)||(14097849-14098068)
chr1 (11-226)||(40134127-40134344)
chr1 (11-226)||(17324513-17324734)
chr1 (11-226)||(28206946-28207164)
chr1 (11-226)||(6995574-6995798)
chr1 (11-226)||(12302385-12302603)
chr1 (11-226)||(18839770-18839988)
chr1 (21-226)||(16428836-16429040)
chr1 (13-233)||(6114989-6115208)
chr1 (11-226)||(31490096-31490312)
chr1 (40-233)||(50076583-50076777)
chr1 (9-226)||(38925360-38925576)
chr1 (11-225)||(39462703-39462922)
chr1 (9-226)||(50307421-50307644)
chr1 (11-226)||(25248432-25248650)
chr1 (11-214)||(27336818-27337026)
chr1 (11-214)||(27339009-27339217)
chr1 (11-226)||(41647103-41647321)
chr1 (12-226)||(15294711-15294932)
chr1 (12-226)||(23816069-23816289)
chr1 (60-226)||(6756709-6756877)
chr1 (15-226)||(50248455-50248670)
chr1 (12-226)||(51750222-51750443)
chr1 (11-226)||(15823729-15823950)
chr1 (13-226)||(15916573-15916786)
chr1 (12-226)||(2510219-2510423)
chr1 (12-226)||(10399704-10399926)
chr1 (11-226)||(28998128-28998351)
chr1 (11-226)||(29003844-29004067)
chr1 (12-233)||(31735399-31735626)
chr1 (11-226)||(17324246-17324474)
chr1 (11-226)||(25128055-25128273)
chr1 (12-214)||(28840874-28841083)
chr1 (15-226)||(16432577-16432783)
chr1 (11-226)||(39932256-39932480)
chr1 (12-214)||(13762031-13762240)
chr1 (12-226)||(2617699-2617922)
chr1 (100-226)||(50078793-50078919)
chr1 (12-214)||(28842689-28842898)
chr1 (12-194)||(13358787-13358978)
chr1 (13-226)||(14183490-14183690)
chr1 (12-214)||(46431582-46431794)
chr1 (15-226)||(47451825-47452027)
chr1 (11-190)||(31422740-31422923)
chr1 (100-226)||(3579589-3579714)
chr1 (12-155)||(13447150-13447301)
chr1 (52-226)||(49495137-49495309)
chr1 (13-226)||(18800458-18800671)
chr1 (12-179)||(51757759-51757939)
chr1 (11-110)||(50078670-50078769)
chr1 (116-226)||(6823197-6823306)
chr1 (13-225)||(13125346-13125555)
chr1 (12-214)||(9459311-9459503)
chr1 (12-214)||(9463138-9463330)
chr1 (11-105)||(3579464-3579558)
chr1 (117-226)||(24325846-24325954)
chr1 (16-226)||(30790288-30790499)
chr1 (13-226)||(8347161-8347371)
chr1 (12-174)||(20302692-20302846)
chr1 (38-226)||(15669304-15669492)
chr1 (83-226)||(42922413-42922557)
chr1 (63-225)||(16561651-16561813)
chr1 (12-194)||(20291670-20291861)
chr1 (105-179)||(51752592-51752667)
chr1 (11-97)||(25860287-25860369)
chr1 (12-214)||(23786034-23786244)
chr1 (11-226)||(8348938-8349150)
chr1 (13-222)||(13127576-13127782)
chr1 (12-179)||(16226396-16226573)
chr1 (65-225)||(27916681-27916840)
chr1 (84-225)||(26613194-26613337)
chr1 (12-179)||(16231792-16231968)
chr1 (21-96)||(30780361-30780436)
chr1 (166-214)||(155901-155949)
chr1 (166-226)||(21948227-21948286)
chr1 (109-225)||(30738609-30738727)
chr1 (181-225)||(43104345-43104389)
chr1 (12-97)||(47177683-47177767)
chr1 (21-91)||(51752696-51752764)
chr1 (123-214)||(21353342-21353434)
chr1 (12-71)||(24326008-24326067)
chr1 (12-179)||(47179942-47180118)
chr1 (70-121)||(26520061-26520114)
chr1 (185-226)||(31422930-31422971)
chr1 (129-173)||(4552637-4552681)
chr1 (181-217)||(8213579-8213615)
chr1 (188-220)||(28279455-28279487)
chr1 (129-173)||(31659362-31659406)
chr1 (182-226)||(48665361-48665404)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (11-226)||(24338329-24338543)
chr6 (11-226)||(9020144-9020364)
chr6 (11-226)||(3629745-3629960)
chr6 (11-226)||(3631818-3632034)
chr6 (11-219)||(30728703-30728913)
chr6 (12-226)||(11982906-11983125)
chr6 (23-226)||(1069609-1069815)
chr6 (11-226)||(15346565-15346779)
chr6 (11-222)||(15367253-15367464)
chr6 (59-226)||(12186000-12186168)
chr6 (11-226)||(15541024-15541236)
chr6 (12-226)||(28241196-28241417)
chr6 (11-226)||(13057412-13057625)
chr6 (9-226)||(14466541-14466759)
chr6 (83-226)||(13039972-13040117)
chr6 (11-226)||(32280214-32280429)
chr6 (12-194)||(14507051-14507241)
chr6 (12-194)||(26065231-26065421)
chr6 (12-194)||(26085200-26085390)
chr6 (12-226)||(1230123-1230345)
chr6 (12-226)||(4816105-4816327)
chr6 (12-226)||(30967419-30967640)
chr6 (12-214)||(2628760-2628970)
chr6 (15-226)||(3233605-3233826)
chr6 (14-226)||(14458643-14458863)
chr6 (110-226)||(3390597-3390713)
chr6 (9-226)||(15719860-15720074)
chr6 (15-226)||(3027740-3027950)
chr6 (100-212)||(10584227-10584340)
chr6 (121-226)||(15532674-15532777)
chr6 (76-226)||(12161502-12161653)
chr6 (12-226)||(19704438-19704664)
chr6 (67-214)||(22857891-22858038)
chr6 (13-225)||(19696659-19696868)
chr6 (12-226)||(30034480-30034699)
chr6 (49-226)||(26945362-26945539)
chr6 (62-225)||(25465524-25465686)
chr6 (109-206)||(25477519-25477616)
chr6 (12-214)||(29754583-29754793)
chr6 (14-105)||(3394708-3394800)
chr6 (15-107)||(25480217-25480309)
chr6 (12-214)||(26068269-26068479)
chr6 (12-214)||(33309086-33309296)
chr6 (13-226)||(17012258-17012466)
chr6 (12-214)||(20915231-20915440)
chr6 (12-176)||(26932437-26932609)
chr6 (12-214)||(33311355-33311565)
chr6 (12-214)||(26065995-26066208)
chr6 (69-225)||(28078136-28078291)
chr6 (11-141)||(22490917-22491045)
chr6 (62-214)||(12937126-12937278)
chr6 (126-225)||(16455421-16455521)
chr6 (12-179)||(5273090-5273266)
chr6 (62-225)||(28037659-28037825)
chr6 (100-225)||(25078529-25078653)
chr6 (12-179)||(12195388-12195565)
chr6 (154-214)||(12911471-12911531)
chr6 (12-62)||(18322482-18322532)
chr6 (167-225)||(30445743-30445801)
chr6 (54-122)||(15530084-15530156)
chr6 (172-226)||(15530166-15530219)
chr6 (65-148)||(17904287-17904368)
chr6 (180-225)||(3833495-3833541)
chr6 (83-199)||(30443532-30443652)
chr6 (109-225)||(11262678-11262793)
chr6 (168-225)||(20527025-20527081)
chr6 (129-178)||(31936591-31936640)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (11-226)||(41382901-41383120)
chr8 (11-226)||(15072950-15073168)
chr8 (11-222)||(14419069-14419283)
chr8 (15-226)||(30480386-30480599)
chr8 (11-226)||(25952759-25952976)
chr8 (11-222)||(13858368-13858577)
chr8 (11-222)||(36865778-36865995)
chr8 (11-226)||(33541289-33541506)
chr8 (11-226)||(15956196-15956409)
chr8 (12-226)||(28251445-28251663)
chr8 (11-226)||(15068220-15068438)
chr8 (11-226)||(15185598-15185811)
chr8 (11-223)||(27106781-27106990)
chr8 (11-226)||(14807990-14808217)
chr8 (9-226)||(2468010-2468226)
chr8 (22-226)||(41384983-41385192)
chr8 (64-215)||(1225417-1225568)
chr8 (9-226)||(21482549-21482766)
chr8 (12-226)||(3874249-3874453)
chr8 (11-184)||(37214143-37214319)
chr8 (11-226)||(35872335-35872536)
chr8 (11-226)||(5372060-5372274)
chr8 (12-226)||(43530354-43530575)
chr8 (11-204)||(27827246-27827446)
chr8 (11-204)||(27829557-27829757)
chr8 (9-226)||(21480741-21480958)
chr8 (12-226)||(22684527-22684749)
chr8 (12-226)||(15809457-15809678)
chr8 (12-226)||(4424257-4424479)
chr8 (12-214)||(28283096-28283304)
chr8 (12-226)||(32339548-32339770)
chr8 (12-226)||(608973-609197)
chr8 (43-145)||(181798-181901)
chr8 (13-226)||(31162448-31162664)
chr8 (12-204)||(18810968-18811168)
chr8 (12-204)||(18813142-18813342)
chr8 (11-194)||(14477520-14477706)
chr8 (13-233)||(3005521-3005735)
chr8 (110-226)||(27911253-27911367)
chr8 (110-226)||(27957672-27957786)
chr8 (12-178)||(44721129-44721303)
chr8 (62-225)||(31035358-31035522)
chr8 (64-225)||(31578216-31578373)
chr8 (100-225)||(6376229-6376354)
chr8 (12-179)||(43082258-43082433)
chr8 (12-97)||(3883470-3883553)
chr8 (160-233)||(16833781-16833854)
chr8 (12-179)||(43079887-43080062)
chr8 (11-105)||(27911441-27911533)
chr8 (11-105)||(27957860-27957952)
chr8 (166-224)||(3896063-3896121)
chr8 (168-222)||(14419732-14419786)
chr8 (12-97)||(24873073-24873158)
chr8 (64-150)||(31566493-31566578)
chr8 (129-178)||(19752438-19752487)
chr8 (114-158)||(28228669-28228714)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (12-226)||(14264-14478)
scaffold0131 (65-226)||(15211-15369)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (21-226)||(85422-85629)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (11-226)||(4188-4403)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (11-226)||(79377-79597)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (12-226)||(183516-183737)
scaffold0005 (11-226)||(52203-52422)
scaffold0005 (11-194)||(50235-50423)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-226)||(80051-80271)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-226)||(41358-41579)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (48-226)||(11387-11569)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-194)||(35817-36005)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (12-214)||(1327-1537)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (11-214)||(69166-69376)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (15-226)||(1529-1739)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-204)||(29384-29583)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (12-163)||(1326-1485)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (13-226)||(16536-16747)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (83-226)||(15774-15918)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (114-214)||(22319-22418)
scaffold0140 (114-214)||(24594-24693)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (12-179)||(279-439)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (12-214)||(6403-6612)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (12-97)||(12749-12832)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (116-179)||(4666-4729)
scaffold0891 (15-97)||(4555-4635)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (12-179)||(3117-3292)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (67-225)||(57367-57524)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 107)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1313787 - 1313565
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1313787 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 1313688  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1313687 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 1313589  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  1313588 acaaaagagatatcaatggattac 1313565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 43421298 - 43421509
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43421298 ttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacagcgagagaaaagaagag 43421397  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43421398 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 43421496  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||    
T  43421497 aagagatatcaat 43421509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 43423346 - 43423557
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43423346 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagag 43423445  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43423446 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 43423544  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||    
T  43423545 aagagatatcaat 43423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 53917540 - 53917758
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  53917540 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 53917639  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  53917640 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 53917738  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53917739 tttacaaaagagatatcaat 53917758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 880330 - 880545
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  880330 aaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 880429  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  880430 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactata-tgatgagtaacttt 880528  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  880529 acaaaagagatatcaat 880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27635532 - 27635752
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  27635532 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 27635631  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27635632 agagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagta 27635730  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  27635731 acgttacaaaagagatgtcaat 27635752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3315068 - 3314847
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  3315068 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaacgtagaaaacagcgagagaga 3314969  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  3314968 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaata 3314869  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  3314868 attttacaaaagagatatcaat 3314847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45883323 - 45883102
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||        
T  45883323 aaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccagaagtagaaaacagcaagagaaaaga 45883224  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  45883223 agagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagt 45883125  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  45883124 aacgttacaaaagagatatcaat 45883102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51943753 - 51943540
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51943753 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 51943654  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51943653 agagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 51943555  T
Q  205 actttacaaaagaga 219  Q
    || ||||||||||||    
T  51943554 acgttacaaaagaga 51943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6484735 - 6484523
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaaga 112  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6484735 ttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaataaga 6484636  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6484635 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttaca 6484537  T
Q  213 aaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||    
T  6484536 aaaaagatatcaat 6484523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 53915372 - 53915590
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  53915372 aaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 53915471  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  53915472 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaac 53915570  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  53915571 attacaaaagagatatcaat 53915590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 4308157 - 4308375
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  4308157 aacttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 4308256  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  4308257 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 4308355  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  4308356 gttacaaaagagaaatcaat 4308375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 12267857 - 12268061
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaagaaga 112  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  12267857 ttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaga 12267956  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12267957 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttaca 12268055  T
Q  213 aaagag 218  Q
    ||||||    
T  12268056 aaagag 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 1626560 - 1626777
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||| |       
T  1626560 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaaaacaacgagagagaaag 1626659  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  1626660 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacc 1626758  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1626759 ttacaaaagagatatcaat 1626777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32219468 - 32219247
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  32219468 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 32219369  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32219368 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 32219270  T
Q  205 ac-tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  32219269 acgtttacaaaaaagatatcaat 32219247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36012209 - 36011990
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  36012209 aaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 36012110  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  36012109 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaa 36012011  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  36012010 cgttacaaaagagatatcaat 36011990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 51674643 - 51674867
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  51674643 aaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 51674742  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||     
T  51674743 gaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaaca 51674841  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51674842 ttacaaaagagatatcaatggattac 51674867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43228671 - 43228454
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||| ||     
T  43228671 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaattagaaaacaacagcgagagtaaa 43228573  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  43228572 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaac 43228474  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  43228473 gttacaaaagagaaatcaat 43228454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17795637 - 17795421
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  17795637 ataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 17795541  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17795540 gaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaac 17795441  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17795440 tttacaaaagagatatcaat 17795421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19104077 - 19103861
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  19104077 ataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 19103981  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19103980 gaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaac 19103881  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19103880 tttacaaaagagatatcaat 19103861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 32263919 - 32264133
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  32263919 ttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaag 32264018  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32264019 agagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 32264117  T
Q  212 -aaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||    
T  32264118 aaaaagagatatcaat 32264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3307150 - 3306924
Alignment:
Q  1 ccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc 99  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3307150 ccaataaca-aaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagc 3307052  T
Q  100 ga--gagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 196  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  3307051 gaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct--aggagagagcaaccatccttttcactataat 3306954  T
Q  197 gatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306953 gatgagtaactttacaaaagagatatcaat 3306924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 27101057 - 27101275
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||     
T  27101057 aacttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcaaaaagtagaaaacaacagcaagagaaaa 27101156  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27101157 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaac 27101255  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     || ||||||||||||||||    
T  27101256 gttgcaaaagagatatcaat 27101275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 18096774 - 18096994
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  18096774 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 18096873  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  18096874 aaagaagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagta 18096972  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||| || ||||||    
T  18096973 acgttacaaaagggaaatcaat 18096994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41849437 - 41849243
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga----aa 107  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    ||    
T  41849437 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaaa 41849340  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41849339 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24980092 - 24979869
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgagag- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||     
T  24980092 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaacaacaacgagaga 24979993  T
Q  105 -aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24979992 aaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagt 24979894  T
Q  204 aac-tttacaaaagagatatcaatt 227  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  24979893 aacgtttacaaaaaagatattaatt 24979869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 47701578 - 47701765
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47701578 tcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaggaaagagaacgcaaaagaatttgttgatc 47701677  T
Q  138 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47701678 cagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 47701765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4666896 - 4666672
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--- 105  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||       
T  4666896 ataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtataaaacagcgagagagaa 4666797  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4666796 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 4666700  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4666699 ccttacaaaagagatatcaatggattac 4666672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 53468330 - 53468550
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |       
T  53468330 aaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaatagcgagagagaaag 53468429  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct--ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53468430 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 53468529  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  53468530 ccttacaaaagagatatcaat 53468550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 9604481 - 9604701
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||     
T  9604481 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataatcacaggccaaaaatagaaaacaacagcgagagaaaa 9604580  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  9604581 gaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 9604679  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  9604680 acgttacaaaagagaaatcaat 9604701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 18099044 - 18099264
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  18099044 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 18099143  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18099144 aaagaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagta 18099242  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |  |||||||||||| ||||||    
T  18099243 atgttacaaaagagaaatcaat 18099264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43226461 - 43226248
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa--acagcgagagaaa-- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  43226461 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaacaacagcgagagaaaag 43226364  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||     
T  43226363 gaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg 43226267  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43226266 ttacaaaagagaaatcaat 43226248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42990684 - 42990467
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |    
T  42990684 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 42990587  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  42990586 aaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaa 42990488  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||| ||||||    
T  42990487 cgttacaaaagagaaatcaat 42990467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6232152 - 6231963
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttga 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232152 tcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaaataaaaaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttga 6232053  T
Q  136 cctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6232052 cccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaat 6231963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 48361572 - 48361765
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  48361572 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttg 48361671  T
Q  132 ttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  48361672 ttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 48361765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23633819 - 23633619
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaaca 119  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23633819 tgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaacacaagccacaagtagaaaacatcgagagaaagaaagagagaaca 23633722  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23633721 caaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttac-aaagaga 23633624  T
Q  220 tatca 224  Q
    |||||    
T  23633623 tatca 23633619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 25688034 - 25688255
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc---gagagaa 106  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  25688034 aaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaaaacatcaacgagagaa 25688133  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  25688134 aaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgta 25688232  T
Q  205 ac-tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  25688233 acgtttacaaaagagatatcaat 25688255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 10955900 - 10956121
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10955900 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10955997  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10955998 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 10956096  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  10956097 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 10956121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18163048 - 18162826
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac---agcgagag 104  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18163048 ataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactgcagcgagag 18162949  T
Q  105 aaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18162948 aaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgag 18162851  T
Q  203 taac-tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||    
T  18162850 taacgtttacaaaataaatatcaat 18162826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15781259 - 15781045
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||    
T  15781259 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 15781160  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca---gccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||   ||| | |||| ||||||| |||| | ||    
T  15781159 gaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaata 15781060  T
Q  205 actttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||||    
T  15781059 actttacaaaagaga 15781045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 226
Target Start/End: Original strand, 47148794 - 47148989
Alignment:
Q  33 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatt 129  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||||    
T  47148794 gataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatt 47148893  T
Q  130 tgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47148894 tgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaat 47148989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53591559 - 53591341
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 113  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53591559 ttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacataagtcaaaagcagaaaacagcgagagaaaagaagag 53591460  T
Q  114 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||  ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53591459 agaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctg-gggagagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttac 53591362  T
Q  212 aaaagagatatcaattgatta 232  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  53591361 aaatgagatatcaatggatta 53591341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1321864 - 1321642
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  1321864 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 1321767  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  1321766 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 1321668  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  1321667 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 1321642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5886582 - 5886381
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||    
T  5886582 aacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacaacagcaagaag 5886484  T
Q  112 a---------gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    |         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  5886483 aaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 5886385  T
Q  203 taac 206  Q
    ||||    
T  5886384 taac 5886381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5900055 - 5899854
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||    
T  5900055 aacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcagcaagaag 5899957  T
Q  103 agaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  5899956 aaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 5899858  T
Q  203 taac 206  Q
    ||||    
T  5899857 taac 5899854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 10958196 - 10958417
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10958196 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10958293  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  10958294 acaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgaaga 10958392  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  10958393 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 10958417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 28101880 - 28102096
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28101880 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattaaa--cacaacccaaaagtagaaaacagcgagagaga 28101975  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  28101976 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagta 28102074  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28102075 actttacaaaagagatatcaat 28102096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 54691460 - 54691668
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagaga 116  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| |    
T  54691460 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaa 54691559  T
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  54691560 acataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  217 agatatcaat 226  Q
    ||||||||||    
T  54691659 agatatcaat 54691668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 51726880 - 51727101
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  51726880 aacttgatgtgtggggcaaga-ataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 51726976  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51726977 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatg 51727075  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  51727076 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 51727101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25533808 - 25533605
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  25533808 aacttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 25533715  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25533714 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 25533620  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||||    
T  25533619 aaaagagaaatcaat 25533605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 10084262 - 10084482
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10084262 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10084359  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  10084360 acaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 10084458  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  10084459 gtaacgttacaaaagagaaatcaa 10084482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Original strand, 5926670 - 5926854
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttg 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5926670 tcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacacaaa-gaatttgttg 5926767  T
Q  135 acctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5926768 acccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatatat 5926854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 28761319 - 28761523
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  28761319 ataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaaa--ttataatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaa- 28761414  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
              ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28761415 ----------acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaact 28761504  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28761505 ttacaaaagagatatcaat 28761523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11168486 - 11168264
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  11168486 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 11168389  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||     
T  11168388 caaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatata-tgata 11168290  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11168289 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 11168264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31151719 - 31151508
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaa-gaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||    
T  31151719 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagt-aagagtagaaaaacagcgagagaaaagaa 31151623  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||    
T  31151622 gagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaacttt 31151523  T
Q  210 acaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31151522 acaaaagagatatca 31151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715632
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga--gagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 143  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  144 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||| || || |  ||| ||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtat--gggggagagcaaccatctgtttcacta---tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 39715632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 880117 - 880251
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  880117 ataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaa 880216  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880217 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28181383 - 28181242
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  28181383 aaacttgatgtgtggagcaag-gacaatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgacagagaaaa 28181285  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181284 gaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38890425 - 38890203
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  38890425 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 38890328  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  38890327 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 38890229  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  38890228 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 38890203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 5522499 - 5522709
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  5522499 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 5522596  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  5522597 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 5522695  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  5522696 agtatcgttacaaa 5522709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 10191185 - 10191397
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  10191185 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 10191282  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  10191283 acaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 10191379  T
Q  202 gtaactttacaaaagaga 219  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  10191380 gtaacgttacaaaagaga 10191397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25634212 - 25634043
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 161  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25634212 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacaagagtaagaaaggagagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagt 25634115  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25634114 ctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattac 25634043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720711
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa------- 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||           
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  107 -agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagta 26720732  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaa 225  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  26720731 tcgttacaaaagagaaatcaa 26720711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5192035 - 5191827
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  5192035 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 5191938  T
Q  103 agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  5191937 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagaacagccctctgatccactata-tgatga 5191840  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||| | |||||||    
T  5191839 gtatcgttacaaa 5191827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 7606476 - 7606670
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |   ||  |||    
T  7606476 aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaggccaaaaagtagaaaacaac---agcgaga 7606570  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| ||    
T  7606571 aga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgtt 7606665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42992606 - 42992433
Alignment:
Q  55 agtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42992606 agtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtcca 42992509  T
Q  150 aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  42992508 aattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactata-tgatgactaacgttacaaaagagaaatcaat 42992433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30006137 - 30006004
Alignment:
Q  94 aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 191  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  30006137 aacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccact 30006038  T
Q  192 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30006037 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 30006004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25389291 - 25389080
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  25389291 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 25389194  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  25389193 tacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 25389095  T
Q  200 gagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||| |||||||    
T  25389094 gagtaacgttacaaa 25389080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3859895 - 3859712
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  3859895 aacttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 3859800  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||    
T  3859799 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata-tgatgagta 3859712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 561659 - 561871
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa-agaa- 110  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  561659 acttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacatcgagagaagagaaa 561754  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg-agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||   | |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  561755 gagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactt 561853  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  561854 tacaaaaaagatatcaat 561871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170567
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaa 11170580  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||||||    
T  11170579 aagagaaatcaat 11170567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Original strand, 8183035 - 8183154
Alignment:
Q  33 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8183035 gatagtcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttg 8183134  T
Q  132 ttgacctagttcggtccaaa 151  Q
    |||||| | ||||| |||||    
T  8183135 ttgacccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 36871185 - 36871384
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 110  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||    
T  36871185 acttgatgtgtggagcaaga-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagatagaaaacagcgagagaaaataaa 36871280  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  36871281 gagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaacttt 36871379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22114176 - 22114399
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca----gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||| |    ||||||       
T  22114176 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaaaaaacggcgagaaga 22114273  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| |||| ||||    
T  22114274 acacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgat 22114372  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22114373 gagtaacgttacaaaagagaaatcaat 22114399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 4103769 - 4103978
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||| | |||||||| ||||||   ||||||        
T  4103769 aaacttgatgcgtggagcaag-gatagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaa--gttataaatacatgtcaaaagtaaaaaacaacggcgagaagaa 4103865  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  4103866 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatg 4103964  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  4103965 agtatcgttacaaa 4103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919178
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 53893927 - 53894105
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||||||||||    | ||||||        
T  53893927 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-aagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 53894025  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
       ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53894026 cacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 747143 - 746932
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  747143 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 747046  T
Q  105 ---aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | |||| | ||||||| ||||    
T  747045 cacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgat 746947  T
Q  200 gagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||| |||||||    
T  746946 gagtaacgttacaaa 746932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 889781 - 889865
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatca 889865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25635754 - 25635544
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag- 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||      
T  25635754 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagtgaaagaaag 25635659  T
Q  112 -agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
     ||||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25635658 aagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaacttta 25635560  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| ||||||||||    
T  25635559 caaaatagatatcaat 25635544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50494383 - 50494208
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  50494383 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 50494286  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50494285 aaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 50494208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 458669 - 458493
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  458669 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 458572  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  458571 acaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagcc 458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Original strand, 1620394 - 1620554
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||    
T  1620394 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaaccacgagataaaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagt 1620491  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1620492 ctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaa 1620554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 456292 - 456116
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  456292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 456195  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  456194 acaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagcc 456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42992766 - 42992610
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  | | | |||||| ||||||||   ||||||   |    
T  42992766 aaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatatatgtcaaaagcagaaaacaatggcgagaagaa 42992669  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42992668 aaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 42992610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 10621400 - 10621612
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag---- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||        
T  10621400 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaga 10621497  T
Q  103 --agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||    
T  10621498 acacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tga 10621596  T
Q  199 tgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||| | |||||||    
T  10621597 tgagtaccgttacaaa 10621612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 28412904 - 28413080
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  28412904 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28413000  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
      ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28413001 acaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 28413080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53597557 - 53597400
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctga 165  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | |||| | | ||| | |||||||||| | |||||| || ||     
T  53597557 ttataaacacaagcaaaaa-tagaaaacaacgagagaaagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgt 53597460  T
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53597459 gggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaa 53597400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24181660 - 24181543
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24181660 aagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaact 24181562  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24181561 ttacaaaagaaatatcaat 24181543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884310
Alignment:
Q  176 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattac 54884310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 6065667 - 6065844
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6065667 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6065764  T
Q  105 ---aaagaag-aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
       ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6065765 cacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagcc 6065844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918037
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgaccag-tctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 35918037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11170755 - 11170671
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11170755 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 11170671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38210755 - 38210580
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  38210755 aacttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38210658  T
Q  103 agaaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
T  38210657 acaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagc 38210580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 6063317 - 6063494
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6063317 aacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6063414  T
Q  105 ---aaagaag-aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
       ||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6063415 cacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 6063494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 14634393 - 14634535
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcctt 181  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||| ||||||||||||| || | | |||| |||||  |  ||||  |||| |    
T  14634393 aaaagtagaaaat-gcgagagaaagaaagagagaaaatacgaaaatttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccat 14634491  T
Q  182 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634492 ccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 14634535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956849
Alignment:
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 29956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420280
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaat 13420280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27420973 - 27420822
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |     
T  27420973 aacaattataaacacaagc-aaaagtataaaacaatgagaaaaaga-gagagaacacatg-gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctacta 27420877  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 217  Q
    || ||||||||||| |  |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420876 tgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181185
Alignment:
Q  145 gtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 191  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26763313 - 26763205
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||||||  || |||  ||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||    
T  26763313 tcaagcaaccaaaacaatatggatg--acacttataaacataagcaaaaaatagaaaacagcgagagaaag-agagagaacacacaa-aatttgtctacc 26763218  T
Q  138 tagttcggtccaa 150  Q
     |||||| |||||    
T  26763217 cagttcgatccaa 26763205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674166
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||    
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagagaaaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacct 1674194  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtt 186  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1674193 agtctggtggagagagcagccatccgtt 1674166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007617
Alignment:
Q  153 tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaa 11007617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236249
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264403
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 16264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795834
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 25795834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143374
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 32143374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 33415368 - 33415584
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-g 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33415368 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 33415467  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33415468 aagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 33415566  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33415567 tacaaaagagatatcaat 33415584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 38928058 - 38928273
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  38928058 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagataaaaga 38928157  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  38928158 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgtt 38928256  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38928257 acaaaagagatgtcaat 38928273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16453762 - 16453546
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16453762 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaaaga 16453663  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16453662 agagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaacctt 16453563  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  16453562 acaaaagagatatcaat 16453546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22800739 - 22800958
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa---acagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22800739 aaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaa 22800838  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  22800839 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaa 22800937  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  22800938 cgttacaaaagagatatcaat 22800958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4215756 - 4215543
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4215756 aacttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaactgcgagagaaaagaa 4215657  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4215656 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttac 4215558  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  4215557 aaaagagatatcaat 4215543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 40091294 - 40091511
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||   ||    
T  40091294 aaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaacacaagccaaaagtagaaaatagcaagagagaaaa 40091393  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  40091394 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaca 40091492  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40091493 ttacaaaagagatatcaat 40091511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 17662125 - 17662341
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  17662125 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcgagaaaaag 17662224  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  17662225 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgt 17662323  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  17662324 tacaaaagagaaatcaat 17662341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 22802611 - 22802830
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag--a 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  22802611 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacagcgagagaaa 22802710  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22802711 aagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaa 22802809  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  22802810 cattacaaaagagatatcaat 22802830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 36921372 - 36921596
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  36921372 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcaagagagaaaa 36921471  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  36921472 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacg 36921570  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36921571 ttacaaaagagatatcaatggattac 36921596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40637531 - 40637311
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  40637531 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 40637432  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  40637431 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagta 40637333  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  40637332 acgttacaaaagagaaatcaat 40637311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47563213 - 47563009
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47563213 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagga 47563114  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  47563113 agagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactata-agatgagtaacctt 47563015  T
Q  210 acaaaa 215  Q
    ||||||    
T  47563014 acaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24889251 - 24889033
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  24889251 aacttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 24889152  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  24889151 agaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgataagtaac 24889053  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24889052 gttacaaaagagatatcaat 24889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 36919463 - 36919687
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||     
T  36919463 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 36919562  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || ||||||| |||||| ||||     
T  36919563 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactata-tgatgaataacg 36919661  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36919662 ttacaaaagagatatcaatggattac 36919687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47275178 - 47274963
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47275178 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 47275079  T
Q  110 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47275078 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 47274981  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47274980 tacaaaagagatatcaat 47274963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2891746 - 2891528
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |       
T  2891746 aaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 2891647  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||     
T  2891646 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaacc 2891547  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2891546 ttacaaaagagatatcaat 2891528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36378742 - 36378529
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  36378742 acttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaaacgaaaagtagaaaacagcaggagaaaagaag 36378644  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  36378643 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcac 36378544  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||    
T  36378543 aagagagatatcaat 36378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24879419 - 24879226
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24879419 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgt 24879320  T
Q  133 tgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24879319 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaat 24879226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 12395724 - 12395941
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  12395724 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagacaacgagacagaaag 12395823  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  12395824 gaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaacc 12395922  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12395923 ttacaaaagagatatcaat 12395941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 12400686 - 12400903
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga--gaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  12400686 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagacaacgagacagaaag 12400785  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  12400786 gaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaacc 12400884  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12400885 ttacaaaagagatatcaat 12400903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14633776 - 14633555
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  14633776 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 14633679  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14633678 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 14633580  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14633579 gtaacattacaaaagagaaatcaat 14633555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 37312956 - 37313158
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37312956 ataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcataagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 37313054  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
              ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37313055 ----------acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactt 37313144  T
Q  209 tacaaaagagatat 222  Q
    ||||||||||||||    
T  37313145 tacaaaagagatat 37313158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13547609 - 13547391
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |      
T  13547609 aaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaagatcgagagagaaa 13547510  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  13547509 ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaac 13547411  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13547410 tttacaaaagatatatcaat 13547391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24880883 - 24880688
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaattt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24880883 tcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaattt 24880784  T
Q  131 gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24880783 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaat 24880688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5101370 - 5101166
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||         
T  5101370 aaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaagggagaaaacaccgagaga----- 5101276  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  5101275 ----gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagatagcagccctccgttttactata-tgatgagtaaattta 5101182  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5101181 caaaagacatatcaat 5101166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 14787308 - 14787527
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  14787308 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 14787407  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14787408 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 14787504  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  14787505 aacgttacaaaagagatgtcaat 14787527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16455680 - 16455478
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||        
T  16455680 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcataagctaaaactagaaaacagcgagagaa---- 16455585  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
             || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  16455584 ---------cacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaacctta 16455494  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  16455493 caaaagagatatcaat 16455478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48486764 - 48486556
Alignment:
Q  22 gtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagagaaagaagagaga 116  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||| || ||||||| |    
T  48486764 gtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacatcaagagaaaaggaagagaaa 48486665  T
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48486664 acacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaag 48486566  T
Q  217 agatatcaat 226  Q
    |||| |||||    
T  48486565 agatttcaat 48486556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36380764 - 36380586
Alignment:
Q  49 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtc 147  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  36380764 aaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctc 36380665  T
Q  148 caaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36380664 caaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaat 36380586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 5635351 - 5635572
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  5635351 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 5635448  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  5635449 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 5635547  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  5635548 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 5635572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6133291 - 6133098
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||    
T  6133291 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 6133192  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  6133191 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 18409225 - 18409443
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  18409225 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaagacaaaagtagaaaatagcgagagaaaa 18409322  T
Q  109 aagagagaacacaaaa----gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    || | | || | ||||     |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||    
T  18409323 aaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggta 18409422  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18409423 ac-ttacaaaagagatatcaat 18409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27499502 - 27499283
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  27499502 aaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagagag 27499403  T
Q  110 --------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
            |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  27499402 agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctg-gggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatga 27499304  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  27499303 gtaaccttacaaaagagatat 27499283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 37089246 - 37089456
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  37089246 aaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 37089343  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  37089344 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatg 37089442  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  37089443 agtaacgttacaaa 37089456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 14789307 - 14789495
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  14789307 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 14789406  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14789407 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22044266 - 22044475
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  22044266 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 22044363  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22044364 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 22044462  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  22044463 gtaacgttacaaa 22044475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22046561 - 22046770
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||        
T  22046561 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacgacgagaagaac 22046658  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22046659 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 22046757  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  22046758 gtaacgttacaaa 22046770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19096338 - 19096120
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  19096338 ataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 19096243  T
Q  109 ------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  19096242 taaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataag 19096144  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  19096143 taacgttacaaaagagatatcaat 19096120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 8631293 - 8631515
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  8631293 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 8631390  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  8631391 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 8631489  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8631490 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 8631515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 24446536 - 24446737
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  24446536 aaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaaga 24446634  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  24446635 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgtt 24446720  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  24446721 acaaaagagatatcaat 24446737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41997943 - 41997733
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  41997943 ataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaa-acaaaagtagaaaacagcgagagcaaa 41997847  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | ||||||||||  |  | |||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  41997846 gaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctg-gggagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaac 41997749  T
Q  207 tttacaaaagagatat 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  41997748 tttacaaaagagatat 41997733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 619330 - 619543
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||    
T  619330 ataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatcacaagc-aaaagtagaaaacaacagcagagaa 619425  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  619426 gaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaac 619523  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  619524 gttacaaaagagatatcaat 619543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 26085851 - 26086061
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||    
T  26085851 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaa 26085948  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  26085949 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactata-tgatg 26086047  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  26086048 agtatcgttacaaa 26086061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51015703 - 51015504
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  51015703 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 51015606  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||    
T  51015605 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactata-tgatga 51015507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19323142 - 19322930
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||||| |    
T  19323142 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacgagc-aaaagtataaaacacctggagaaagaaag 19323046  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19323045 agagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaacttta 19322946  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  19322945 caaaagagatatcaat 19322930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9148693 - 9148501
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  9148693 aacttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gtgagaag 9148599  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9148598 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttac 9148504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24348659 - 24348455
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||   |  |||||    
T  24348659 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaacta-aat-acaagccaaaaatagaaaacaacg---gcgagaag 24348565  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24348564 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 24348470  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||||    
T  24348469 aaaagagaaatcaat 24348455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6765301 - 6765081
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga-gaa 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  6765301 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttataaatacaagccaaa-gtagaaaacaacggcgagaagaa 6765206  T
Q  107 -----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
         |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  6765205 caccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 6765107  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6765106 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 6765081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 31849473 - 31849683
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  31849473 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 31849570  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  31849571 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 31849669  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  31849670 agtatcgttacaaa 31849683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11435413 - 11435203
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||    
T  11435413 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaa 11435316  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  11435315 cacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 11435217  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  11435216 agtaacgttacaaa 11435203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 18537360 - 18537571
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  18537360 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtataaaacaacgagagaaagaaag 18537456  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18537457 agagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttta 18537555  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  18537556 caaaagagatatcaat 18537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 38890112 - 38890322
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  38890112 ttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaggcaaaattagaaaacagcgagagaaaagaaaga 38890208  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38890209 gagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac 38890307  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  38890308 aaaagagatatcaat 38890322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 2484748 - 2484957
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  2484748 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 2484845  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  2484846 acaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 2484944  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  2484945 gtaacgttacaaa 2484957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12102531 - 12102326
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  12102531 acttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-ga 12102436  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||| | || |||   |||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12102435 gagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 12102339  T
Q  212 aaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||    
T  12102338 aaaagagatatca 12102326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 52942368 - 52942523
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaag 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||    
T  52942368 ttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagaggaaaag 52942467  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  52942468 aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 52942523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 11008442 - 11008652
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||    | ||||||        
T  11008442 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 11008539  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  11008540 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 11008638  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  11008639 agtaccattacaaa 11008652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25358042 - 25357879
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| |    
T  25358042 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctag 25357944  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357943 tctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 25357879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30136996 - 30136789
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  30136996 ttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacaagagaaaagaaaga 30136900  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30136899 gagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttaca 30136800  T
Q  213 aaagagatatc 223  Q
    |||||||||||    
T  30136799 aaagagatatc 30136789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7941781 - 7941560
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  7941781 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatga-aat-acaaggcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 7941684  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7941683 acaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 7941585  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||    
T  7941584 gtatcgttacaaaagagaaatcaat 7941560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Original strand, 3937160 - 3937316
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa- 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  3937160 aacttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaa 3937255  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3937256 gagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 3982087 - 3982272
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||    
T  3982087 tcaagcaaccaaaaaaaagtgggtg--acagttataaacacaaacaaacgatagaaaacagcgagagaaaga-gagagaacacatgaaaaattgtttacc 3982183  T
Q  138 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3982184 ttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3982272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5198862 - 5198657
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||       | || |  |    
T  5198862 aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggcg 5198772  T
Q  112 aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||    
T  5198771 agaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaat 5198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 11006128 - 11006321
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||       | || |  |    
T  11006128 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaa-------acaacggcg 11006218  T
Q  112 aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||    
T  11006219 agaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccatta 11006317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11437821 - 11437611
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||    
T  11437821 aacttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 11437724  T
Q  108 ------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  11437723 cacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 11437625  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  11437624 agtaacgttacaaa 11437611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 18534718 - 18534929
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18534718 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaa-acaaaagtagaaaatagcgagagaaagaaag 18534814  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||| | |||||||  ||||    
T  18534815 agagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagtttta 18534913  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  18534914 caaaagagatatcaat 18534929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38409662 - 38409453
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  38409662 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38409565  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  38409564 aaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 38409466  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||| | |||||||    
T  38409465 gtatcgttacaaa 38409453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47868860 - 47868638
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------a 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||         |    
T  47868860 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataa-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaa 47868763  T
Q  102 gagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  47868762 cacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatg 47868664  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  47868663 agtatcgttacaaaagagaaatcaat 47868638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 8756138 - 8756348
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8756138 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacaacgagagaaagaaag 8756233  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| |||||  |||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8756234 agagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaacttta 8756332  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  8756333 caaaagagatatcaat 8756348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49089010 - 49088816
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |      
T  49089010 aaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaacg-- 49088913  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
               |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||   || ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  49088912 ----------caaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactata-tgatgactaacatt 49088824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53405594 - 53405372
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-------- 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||            
T  53405594 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaacatcggcgaaaag 53405497  T
Q  101 -agagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
     | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  || ||| ||||||| |||    
T  53405496 aacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagctctctgttccactata-tga 53405400  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| | || ||||||||| ||||||    
T  53405399 tgagtatcgtttcaaaagagaaatcaat 53405372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 3824483 - 3824630
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtag-aaaacagc------ga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||       |    
T  3824483 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagtagaaaaacagcagcaagaa 3824582  T
Q  102 gagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824583 gaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 56030913 - 56030815
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  56030913 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaa-acaaaagtagaaaacagcgagagaaag 56030817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18847610 - 18847402
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  18847610 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18847514  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18847513 cacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18847416  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  18847415 agtaccgttacaaa 18847402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 9174020 - 9174230
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||    ||| |||||         
T  9174020 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 9174117  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||  | ||||||| |||||    
T  9174118 cacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatg 9174216  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  9174217 agtaccgttacaaa 9174230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 9176348 - 9176558
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    ||| |||||         
T  9176348 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 9176445  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  9176446 cacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 9176544  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  9176545 agtaccgttacaaa 9176558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Original strand, 16185770 - 16185920
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16185770 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaaacaaaaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagt 16185867  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185868 ctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa 16185920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 16931665 - 16931839
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  16931665 aacttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 16931762  T
Q  105 -aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16931763 aaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16931839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22134491 - 22134701
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt-agaa----aacagcgag---- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    ||| |||||        
T  22134491 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaaga 22134588  T
Q  103 --agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
      | ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  22134589 acacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccaatccactata-tgat 22134686  T
Q  200 gagtaactttacaaa 214  Q
    ||||| | |||||||    
T  22134687 gagtaccgttacaaa 22134701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28454109 - 28453920
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     |||||||||||  | |||||||    
T  28454109 tcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgt 28454014  T
Q  133 tgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | ||| |||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454013 ttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28453920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 47210671 - 47210754
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47210671 aacttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 47210754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 15032429 - 15032645
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||     
T  15032429 acttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacataaac-aaaagtagaaaaacagcgagagaaagaaa 15032524  T
Q  111 ----gagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
        || ||||||||  | |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||  | |||| |||| || |||||||||    
T  15032525 gaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagta 15032623  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15032624 actttacaaaagagatatcaat 15032645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 18709038 - 18709212
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||          
T  18709038 aacttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaatagtagaaaacaacggcgagaagaac 18709135  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 177  Q
    | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18709136 acaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcag 18709212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9864160 - 9863945
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa--tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||| ||||||  || | ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  9864160 acttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataaaatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 9864065  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtct--gagggagagagcagccttccgtttcactata---gtgatgagt 203  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||    ||||||||    
T  9864064 agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagt 9863966  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  9863965 aactttac-aaagagatatcaa 9863945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22132263 - 22132476
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt-agaa----aacagcgag--- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    ||| |||||       
T  22132263 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaagaaaaacaacggcgagaag 22132360  T
Q  103 ---agaaagaagag-agaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
       | ||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  22132361 aacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactata-tg 22132459  T
Q  198 atgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||| | |||||||    
T  22132460 atgagtaccgttacaaa 22132476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||     
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagagaaaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgcccta 22295468  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    || || |||||||||||    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22295467 gtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5664687 - 5664605
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5664687 acttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatgacaaaccaaaagtagaaaaca 5664605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10114737 - 10114565
Alignment:
Q  40 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacct 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||    
T  10114737 aagcaaccaaaacaaagtgggtg--atagttataaacacaaga-aaaggtagataacaacgagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacct 10114642  T
Q  139 agttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | ||||  |||||| |||||||| | ||||||||    
T  10114641 aattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagttaatttacaaa 10114565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544196
Alignment:
Q  149 aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 13544196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47150989
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagagaaagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgaccta 47150923  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||  |||||| | || |  || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47150924 gtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaa 47150989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 44599714 - 44599888
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  44599714 aacttgatgtgtggagcaag-gataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaaggcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44599810  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44599811 aaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 44599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 16934118 - 16934193
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16934118 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16934193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22782611 - 22782822
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  22782611 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 22782708  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||    
T  22782709 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgat 22782807  T
Q  200 gagtaactttacaaa 214  Q
    ||||| | |||||||    
T  22782808 gagtatcgttacaaa 22782822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983623
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaa 31983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47210848
Alignment:
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaat 47210848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 54928700 - 54928741
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54928700 tccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 54928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 22780358 - 22780457
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22780358 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaa 22780456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 38270028 - 38270088
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 74  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  38270028 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataa 38270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9022602 - 9022543
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9022602 gggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaat 9022543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999045
Alignment:
Q  170 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 3578632 - 3578766
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||   |||||| ||| ||||||||| || | || ||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  3578632 aaaagtagaaaacaacgagagaaaga---gagtacacgaaa---tttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctc 3578724  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3578725 cattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 3578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269234
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10113292 - 10113108
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgac 136  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||| || ||||||||  | | ||| || ||    
T  10113292 tcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagtagataacattgagagagagaaagaaagaacacatga-attttttttac 10113197  T
Q  137 ctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||  ||| || ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10113196 ccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattac-aaagagatatcaa 10113108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Original strand, 52043497 - 52043550
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaac 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52043497 acagttataaacacaagc-aaacgtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaac 52043550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143312
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5143312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 89)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44724988 - 44724772
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag-ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-g 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44724988 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaatg 44724889  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  44724888 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgt 44724790  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44724789 tacaaaagagatatcaat 44724772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 13099351 - 13099572
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  13099351 aaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 13099450  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13099451 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaa 13099550  T
Q  206 ctttac-aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  13099551 ctttacaaaaagagatatcaat 13099572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 42330878 - 42331093
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  42330878 ataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaga- 42330976  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  42330977 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactt 42331075  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42331076 tacaaaagagatatcaat 42331093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 31434927 - 31435143
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31434927 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 31435026  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31435027 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttt 31435126  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  31435127 acaaaagagatatcaat 31435143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 444008 - 443781
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----a 105  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  444008 aaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 443909  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  443908 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagta 443810  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  443809 acgttataaaagagatatcaatggattac 443781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 21592023 - 21592239
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21592023 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 21592121  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  21592122 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacg 21592220  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21592221 ttacaaaagagatgtcaat 21592239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22394120 - 22393915
Alignment:
Q  20 atgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaac 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22394120 atgtggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaac 22394023  T
Q  119 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22394022 acaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 22393923  T
Q  219 atatcaat 226  Q
    ||||||||    
T  22393922 atatcaat 22393915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21990563 - 21990343
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21990563 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcgagagaga 21990464  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  21990463 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagta 21990365  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21990364 acgttacaaaagagatatcaat 21990343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27306110 - 27306326
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||    
T  27306110 aaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagaagaaaacaacagcgagagaaa 27306209  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27306210 agaagagagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 27306306  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  27306307 gttacaaaagagatatcaat 27306326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24749000 - 24748787
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24749000 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaataa 24748904  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24748903 agagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacctt 24748804  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  24748803 acaaaagagatatcaat 24748787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 4295815 - 4296030
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  4295815 aaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaacacaagccaaaagtagaaaatggcgagagaaaaga 4295914  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4295915 agagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgtt 4296013  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4296014 acaaaagagatgtcaat 4296030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9679470 - 9679252
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  9679470 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaa 9679371  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  9679370 ggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaac 9679272  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9679271 tttacaaaagagatatcaat 9679252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Original strand, 20137061 - 20137205
Alignment:
Q  82 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20137061 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccc 20137159  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137160 tccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 20137205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42223566 - 42223351
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||    
T  42223566 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaacaatgagagaaaaga 42223467  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  42223466 agagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgtt 42223368  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  42223367 acaaaagagatatcaat 42223351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20626443 - 20626231
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20626443 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20626346  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20626345 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20626247  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20626246 caaaagagaaatcaat 20626231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20630334 - 20630122
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20630334 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20630237  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20630236 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20630138  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20630137 caaaagagaaatcaat 20630122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20642753 - 20642541
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||     
T  20642753 tgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagat 20642656  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  20642655 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 20642557  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20642556 caaaagagaaatcaat 20642541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 37412001 - 37412223
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 106  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||        
T  37412001 aaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactagaaaacaacgagagaaaaga 37412100  T
Q  107 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
      ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  37412101 agagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagta 37412200  T
Q  205 actttac-aaaagagatatcaat 226  Q
    || |||| |||||||||||||||    
T  37412201 accttacaaaaagagatatcaat 37412223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9681231 - 9681013
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |      
T  9681231 aaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaagatcgagagagaaa 9681132  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9681131 ggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaac 9681033  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  9681032 tttacaaaagatatatcaat 9681013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21678472 - 21678259
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21678472 aaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgggagaaaaga 21678373  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||| ||    
T  21678372 agagagaacac--aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactata-tgataagtaacctt 21678276  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||||||    
T  21678275 acaaaagatatatcaat 21678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 39145865 - 39146083
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  39145865 aaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 39145964  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  || | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  39145965 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaacc 39146064  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39146065 ttacaaaagagatatcaat 39146083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48458067 - 48457846
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  48458067 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 48457970  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  48457969 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 48457871  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  48457870 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 48457846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21680435 - 21680222
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaaga 112  Q
    |||||| |||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21680435 cttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaga 21680336  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacc---tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21680335 gagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaacctt 21680237  T
Q  210 acaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  21680236 acaaaagagatatca 21680222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38394400 - 38394179
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  38394400 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 38394303  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  38394302 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 38394204  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  38394203 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 38394179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20299874 - 20299653
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  20299874 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaac 20299777  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||    
T  20299776 acaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatga 20299678  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20299677 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 20299653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 7471855 - 7472076
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  7471855 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 7471952  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  7471953 acaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactata-tgatga 7472051  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  7472052 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 7472076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 27832522 - 27832729
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||| || ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832522 aaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaa 27832619  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
     |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||     |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27832620 -agagataacacaagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaacttta 27832713  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||    
T  27832714 cagaagagatatcaat 27832729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18345955 - 18345734
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  18345955 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 18345858  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  18345857 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatga 18345759  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||    
T  18345758 gtatcgttacaaaagagaaatcaat 18345734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26295850 - 26295640
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26295850 acttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaaa--ttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgaaagaaagaa-a 26295754  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||  ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26295753 gagataacacaagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttaca 26295654  T
Q  213 aaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  26295653 aaagagatatcaat 26295640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11355672 - 11355451
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  11355672 ataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacaagagaga 11355573  T
Q  108 gaag----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||     
T  11355572 gaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactata-tgatgaga 11355474  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  11355473 aacgttacaaaaaagatatcaat 11355451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 7092087 - 7092308
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||   ||||||        
T  7092087 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaa 7092184  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7092185 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgattcactata-tgatg 7092282  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7092283 agtaacattacaaaagagaaatcaat 7092308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44978 - 44757
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||||         
T  44978 aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44881  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  44880 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatga 44782  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  44781 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 44757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7188942 - 7188732
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  7188942 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaa 7188846  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||  |||| | | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  7188845 gagaacacgcaa-aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttac 7188747  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||||||||    
T  7188746 aaaagaaatatcaat 7188732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20297776 - 20297555
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  20297776 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 20297679  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  20297678 acaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 20297580  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||    
T  20297579 gtatcgttacaaaagagaaatcaat 20297555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26804917 - 26804764
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaagaa 110  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  26804917 ttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacatcgagagaaaagaa 26804818  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26804817 gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctg 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 43253394 - 43253613
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag------ 104  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    ||||||||           
T  43253394 ttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaaacaacagcgagaagaacac 43253491  T
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||    
T  43253492 aaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagt 43253590  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  43253591 aacgttacaaaagagaaatcaat 43253613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1850395 - 1850174
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |          |     
T  1850395 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacagtgaaaagaac 1850298  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  1850297 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 1850199  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1850198 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 1850174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3036127 - 3035917
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag------aaagaagag 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||       |||||||||    
T  3036127 tggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagag 3036030  T
Q  114 ag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | || ||    
T  3036029 aggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttgca 3035931  T
Q  213 aaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| ||||||    
T  3035930 aaagagaaatcaat 3035917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 7094334 - 7094556
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||        
T  7094334 aaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 7094431  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7094432 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatg 7094530  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7094531 agtaacattacaaaagagaaatcaat 7094556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24465943 - 24465730
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24465943 ataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaa 24465846  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||| |   |||||||| ||  |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||    
T  24465845 gaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagt-ac 24465750  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24465749 tttacaaaagacatatcaat 24465730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28485979 - 28485752
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  28485979 aacttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggatagaagaac 28485882  T
Q  103 agaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || | |||| |||| ||||||    
T  28485881 acaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctga-ggagagagcaaccctctgattcattata-tgatga 28485784  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  28485783 gtaacgttacaaaagagaaatcaatggattac 28485752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 40836618 - 40836827
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  40836618 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 40836715  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  40836716 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 40836814  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||| | |||||||    
T  40836815 gtatcgttacaaa 40836827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28487967 - 28487746
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||         |     
T  28487967 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggctagaagaac 28487870  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  28487869 acaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactata-tgatga 28487771  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  28487770 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 28487746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36043 - 35822
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||         
T  36043 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 35946  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  35945 acaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactata-tgatga 35847  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  35846 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 35822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 22251464 - 22251605
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  22251464 aaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcaagagagaaag 22251563  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251564 gaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11759541 - 11759369
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  11759541 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 11759444  T
Q  103 agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 176  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11759443 acaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40946744 - 40946521
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag-- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |     ||||||       
T  40946744 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaaatagaaaaaaaaacggcgagaaga 40946647  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||    
T  40946646 acacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgat 40946548  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40946547 gagtaacgttacaaaagagaaatcaat 40946521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3878993 - 3878770
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaag-tgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    | ||||||       
T  3878993 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaaaacaacggcgagaaga 3878896  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  3878895 acacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 3878797  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3878796 gagtaacgttacaaaagagaaatcaat 3878770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 7469901 - 7470118
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------agaga 105  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         | | |    
T  7469901 ttgatgtgtggagcagg-gataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacaca 7469997  T
Q  106 aagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  7469998 aataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagta 7470096  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  7470097 acgttacaaaagagaaatcaat 7470118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38397053 - 38396839
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--------gcgaga 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |        ||||||    
T  38397053 aacttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaaaaaacaacggcgaga 38396956  T
Q  104 g------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 196  Q
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |    
T  38396955 agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactata-t 38396857  T
Q  197 gatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||  |||||||    
T  38396856 gatgagtaaagttacaaa 38396839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25542942 - 25542733
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  25542942 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 25542845  T
Q  103 agaaagaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  25542844 acaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactata-tgatga 25542746  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  25542745 gtaacgttacaaa 25542733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24258781 - 24258656
Alignment:
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact---atagtgatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||   ||| |||||    
T  24258781 aaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatg 24258682  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24258681 agtaactttacaaaagagatatcaat 24258656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332417
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacagaaaga-gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagt 6332478  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6332477 ctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 6332417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 24813450 - 24813591
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24813450 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagcc 24813548  T
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
     |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24813549 atccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatat 24813591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081703
Alignment:
Q  88 gtagaaaacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccg 184  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagaggaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccg 11081744  T
Q  185 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || || | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081743 ttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 214
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049380
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa 1049380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Original strand, 16296934 - 16297115
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||     
T  16296934 tcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagagaaaga-gagagaacacacggaaatttgtttaca 16297029  T
Q  138 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
     |||||||||||| | |||| | ||||  |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16297030 cagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatat 16297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1606793 - 1606584
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  1606793 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 1606696  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||    
T  1606695 aaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatga 1606597  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  1606596 gtaacgttacaaa 1606584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 214
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047009
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa 1047009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 9027068 - 9027151
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9027068 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaaca 9027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 24817287 - 24817450
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctgg 160  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  |||||| |    
T  24817287 aacagttataaacacaaac-aaaattagaaaacaacgagagaaaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctag 24817384  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24817385 tatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaat 24817450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25276465 - 25276334
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||           |    
T  25276465 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctg-gggag-----------c 25276378  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276377 cgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 25276334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2935683 - 2935473
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  2935683 aacttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 2935586  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  2935585 caaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 2935487  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  2935486 agtaacgttacaaa 2935473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108271
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 22108272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137282
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 22137283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40550031
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 40550032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552309
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 40552310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 7351526 - 7351702
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||          
T  7351526 aacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 7351623  T
Q  103 agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||    
T  7351624 acaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagcc 7351702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6349191 - 6349097
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaaca 119  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6349191 tggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaag-caaaagtagaaaatagcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31155995
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| | ||||||    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttacaa 31155994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Original strand, 20091584 - 20091641
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091584 gggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaat 20091641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828729
Alignment:
Q  169 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaat 22828729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 9027179 - 9027278
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9027179 agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 9027277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1049164 - 1049239
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc--aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  1049164 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaa 1049239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 22280379 - 22280434
Alignment:
Q  170 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22280379 gagagcagctttctgtttcactataatgatcaataactttacaaaagagatatcaa 22280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046688
Alignment:
Q  141 ttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 6046688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 13290454 - 13290569
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| | |||  || ||| | ||||| ||||||||||||    
T  13290454 aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaact 13290552  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13290553 ttac-aaagagatatcaa 13290569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1046792 - 1046868
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc--aaaacaaagtgt-atggaacagttataatcacaagccaaaa 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1046792 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtaatgga--agttataaatacaagccaaaa 1046868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 6067183 - 6067294
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  ||||       
T  6067183 agaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttac 6067282  T
Q  213 aaagagatatca 224  Q
    ||||||||||||    
T  6067283 aaagagatatca 6067294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Original strand, 7349152 - 7349228
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 90  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  7349152 aacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagta 7349228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6349021 - 6348975
Alignment:
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6349021 ttccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaat 6348975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 20137024 - 20137066
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 51  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137024 ataaatttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 20137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22137493 - 22137439
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22137493 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 22137439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281468
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||| | ||| || |    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagagaaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaactag 40281414  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||| ||||||||||| || | |||| ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  40281415 tctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40552520 - 40552466
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40552520 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 40552466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190052
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091132
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaa-acaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaa--gttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaa 20091132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407550
Alignment:
Q  24 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  121 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 22407544  T
Q  221 atcaat 226  Q
    ||||||    
T  22407545 atcaat 22407550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19008016 - 19007799
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |       
T  19008016 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaat 19007917  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  19007916 gaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacg 19007818  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19007817 ttacaaaagagatatcaat 19007799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14837642 - 14837426
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---ga 109  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||    
T  14837642 acttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacagcgagagagaaagga 14837543  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14837542 agagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaacctt 14837443  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  14837442 acaaaagagatatcaat 14837426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 6258696 - 6258913
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  6258696 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 6258795  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6258796 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaact 6258894  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6258895 ttacaaaagagatatcaat 6258913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 6264027 - 6264245
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |       
T  6264027 aaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaacacaagccgaaagtagaaaacaacgagagagaaag 6264126  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6264127 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaact 6264226  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6264227 ttacaaaagagatatcaat 6264245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 28459073 - 28459286
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 111  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28459073 acttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagggagagaaagaaag 28459172  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28459173 agagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtct-aggtagagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaa 28459271  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  28459272 aaaagagatatcaat 28459286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 22162907 - 22163111
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22162907 ttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataagcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagag 22163006  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22163007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 22163105  T
Q  214 aagaga 219  Q
    ||||||    
T  22163106 aagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 42923385 - 42923612
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---- 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||        
T  42923385 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaga 42923484  T
Q  106 -aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  42923485 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactata-tgacgagta 42923583  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42923584 actttacaaaagagatatcaatggattac 42923612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22287215 - 22287431
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||   ||     
T  22287215 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaattataaaaacaagtcaaacgtagaaaacagcgagagagaaag 22287314  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||     
T  22287315 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacg 22287413  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22287414 ttacaaaagagatatcaa 22287431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28197007 - 28196796
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  28197007 ttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaag 28196908  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28196907 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttac 28196811  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  28196810 aaaagagatatcaat 28196796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 43623458 - 43623676
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  43623458 aacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataatcataagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 43623557  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43623558 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaac 43623656  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  43623657 gttacaaaagagatatcaat 43623676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17849493 - 17849276
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  17849493 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaaacaacgggagagaaag 17849394  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  17849393 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagcc-cccgtttcactataatgatgagtaacc 17849295  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17849294 ttacaaaagagatatcaat 17849276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 21520568 - 21520789
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  21520568 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagag 21520667  T
Q  105 aaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21520668 aaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagt 21520766  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  21520767 aacgttacaaaagagatatcaat 21520789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3022548 - 3022362
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||       
T  3022548 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaaacaacgagagaaaaag 3022449  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  3022448 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattata 3022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 5375224 - 5375442
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||   |    
T  5375224 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaagagagaaa 5375323  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  5375324 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaat 5375422  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5375423 gttacaaaagagatatcaat 5375442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848599
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 17848715  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17848714 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 17848616  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  17848615 acaaaagagatatcaat 17848599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 22707657 - 22707849
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22707657 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaggcagaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttg 22707756  T
Q  135 acctagttcggtccaaattgacctggtct-gagg-gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22707757 acctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 22707849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732873
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagataga 31732763  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31732764 gaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaa 31732861  T
Q  215 agagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||    
T  31732862 agagatatcaat 31732873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289163
Alignment:
Q  47 caaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 143  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  144 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaa 44289163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032143
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagaga 40032143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 45279876 - 45280080
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  45279876 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 45279970  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  45279971 a----acacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 45280065  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||||    
T  45280066 aaaagagaaatcaat 45280080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 7462824 - 7463044
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaa- 106  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  7462824 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 7462923  T
Q  107 -agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
     ||||||||||||||||     ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||    
T  7462924 gagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggta 7463022  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  7463023 acgttacaaaagagaaatcaat 7463044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23871161 - 23870979
Alignment:
Q  44 aaccaaaacaaagtgtatggaa--cagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacct 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23871161 aaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaacagcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacct 23871062  T
Q  139 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23871061 agtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagagatat 23870979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27105178 - 27104968
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||        
T  27105178 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27105081  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27105080 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27104982  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||  |||||||    
T  27104981 agtaatgttacaaa 27104968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 11739534 - 11739661
Alignment:
Q  104 gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  11739534 gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagt 11739633  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaattgatt 231  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  11739634 aacctttcaaaagagatatcaatggatt 11739661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 23452111 - 23452333
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||||        
T  23452111 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 23452208  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  23452209 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 23452307  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  23452308 agtatcgttacaaaagagaaatcaat 23452333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 45238874 - 45239073
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgg-aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-a 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45238874 ataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatcaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 45238973  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||                    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45238974 aagaagagagaacacaaaaaaatttgttgaccta--------------------gtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaa 45239052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 11577991 - 11578205
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11577991 aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaa--gtt-taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 11578087  T
Q  111 gagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
     |||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  11578088 aagagaaaacacacgaaatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaacct 11578187  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11578188 tacaaaagagatatcaat 11578205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 13909920 - 13910119
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  13909920 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 13910017  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||    
T  13910018 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactata-tgatga 13910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 18800251 - 18800410
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg 164  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18800251 agttataatcgcaagc-aaaagtagaaaacagcagaagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctg 18800349  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18800350 -gggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaat 18800410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 15539409 - 15539553
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||   ||     
T  15539409 aaacttgatgtgtggagcaag-gattatcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 15539507  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539508 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 34979468 - 34979682
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||          
T  34979468 aaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaacagcgagag------ 34979561  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  34979562 ---agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaacctt 34979658  T
Q  210 acaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34979659 acaaaagagatataaatggattac 34979682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22874406 - 22874289
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22874406 aagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactt 22874307  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22874306 tacaaaagagatatcaat 22874289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 17897134 - 17897341
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17897134 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaag 17897228  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17897229 agagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaacttta 17897326  T
Q  211 caaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| |||||||||    
T  17897327 caaaatagatatcaa 17897341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 24162098 - 24162307
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||     
T  24162098 aacttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaac 24162195  T
Q  108 -----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  24162196 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactata-tgatga 24162294  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||| | |||||||    
T  24162295 gtagcattacaaa 24162307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064695
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||   | ||||||    
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacg---gcaagaag 42064784  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  42064783 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 42064695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452940
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 42452953  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||||||    
T  42452952 aagagaaatcaat 42452940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146704
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||| |    
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgactt 20146637  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146638 agtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 20146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 19501986 - 19502107
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||    
T  19501986 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagt 19502084  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | | |||||||||||| ||||||    
T  19502085 atcgttacaaaagagaaatcaat 19502107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 19504321 - 19504442
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  19504321 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagt 19504419  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | | |||||||||||| ||||||    
T  19504420 atcgttacaaaagagaaatcaat 19504442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699534
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaatagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgaccta 40699600  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| |||| |||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699599 gtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40699534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 38020444 - 38020360
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38020444 tggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtagaaaacagcgaaagaaa 38020360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 36558755 - 36558948
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagc-gagagaaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||| | | |||||       
T  36558755 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaa--- 36558849  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
         ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  36558850 -----gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgtt 36558943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 35217844 - 35218013
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||     
T  35217844 aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 35217941  T
Q  109 aagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    || || ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35217942 aaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35218013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 36561015 - 36561225
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||   ||||||        
T  36561015 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 36561112  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  36561113 caaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 36561211  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  36561212 agtaacgttacaaa 36561225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20592444 - 20592288
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagaga 114  Q
    |||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  20592444 tgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaag-caaaagtagaaaatatcaagagaaagaaagaga 20592348  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagag 174  Q
    |||||||  | |||||||| | | | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  20592347 gaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagag 20592288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35107590 - 35107458
Alignment:
Q  92 aaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||| |  ||||| || || |||||| |    
T  35107590 aaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttcc 35107491  T
Q  189 actatagtgatgagtaactttacaaaagagata 221  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107490 actataatgatgagtaacattacaaaagagata 35107458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 19501876 - 19501958
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19501876 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaa 19501958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 35215467 - 35215636
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| || | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||     
T  35215467 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 35215564  T
Q  109 aagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    || ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35215565 aaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35215636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22874487 - 22874431
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22874487 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 45332166 - 45332265
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45332166 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactata-tgatgagtacctttacaa 45332264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 19504211 - 19504291
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 93  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19504211 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaa 19504291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 37962823 - 37963027
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||     
T  37962823 ataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaa--gttataatcacaaat-aaaagtagaaaacaacttgagaaaa 37962919  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      || ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || || | |||||| ||| |  | ||||||||||| |||||| ||||    
T  37962920 gaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataac 37963018  T
Q  207 tttacaaaa 215  Q
    |||||||||    
T  37963019 tttacaaaa 37963027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42453857 - 42453802
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaaca 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42453857 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaaca 42453802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 38414071 - 38414155
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38414071 tgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggtaaaagtagaaaacaacgagaga 38414155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17921996 - 17921871
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||||||| || || ||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17921996 aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-gagagaacatacgaaaatttgtttacttaattcggtcaaatactgacctagtctg-ggtagagagcagccctc 17921899  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17921898 cgttccactataatgatgactaacttta 17921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589850
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaat 20589850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15694108 - 15694064
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15694108 tccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15694064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33604140 - 33604092
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33604140 gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 11739455 - 11739518
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 74  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11739455 aaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataa 11739518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39287361 - 39287262
Alignment:
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||| || ||||| | | |||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39287361 acacaaaataacttgtttaacaagtttggtccaacactgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828438
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtcca-aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||   | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  225 a 225  Q
    |    
T  13828438 a 13828438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17943723 - 17943631
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17943723 aagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa 17943631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 18511090 - 18511307
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  18511090 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 18511189  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18511190 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 18511288  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18511289 tttacaaaagagatatcaa 18511307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2724293 - 2724076
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  2724293 aaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgaaagaaaaag 2724194  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  2724193 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatc 2724095  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2724094 ttacaaaagagatatcaat 2724076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40221929 - 40221705
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40221929 aaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagag 40221830  T
Q  110 --------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
            ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40221829 agaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatga 40221730  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40221729 gtaactttacaaaagagatatcaat 40221705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36208975 - 36208759
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36208975 ataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaag 36208876  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36208875 aaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaact 36208778  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36208777 ttacaaaagagatatcaat 36208759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509413
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaag 111  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttac 18509399  T
Q  212 aaaagagatatcaa 225  Q
    |||| |||||||||    
T  18509400 aaaatagatatcaa 18509413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 10474200 - 10474419
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |     
T  10474200 ataaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaa 10474299  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10474300 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaa 10474398  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  10474399 ccttagaaaagagatatcaat 10474419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 696273 - 696060
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaa-ccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||     
T  696273 acttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaaac-aaaagtagaaaacaac-agagaaagaaa 696176  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  696175 gagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataacttta 696076  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  696075 caaaagagatatcaat 696060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21289159 - 21288953
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa-aga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  21289159 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaacaaa 21289060  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  21289059 agagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-agatgagtaacgtt 21288961  T
Q  210 acaaaaga 217  Q
    ||||||||    
T  21288960 acaaaaga 21288953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097915
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgag--agaaa-gaag 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactata-tgatgagtaacgttac 26097930  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  26097929 aaaagagatatcaat 26097915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25904505 - 25904286
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  25904505 ataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagagaa 25904406  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  25904405 aggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaa 25904307  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  25904306 cgttacaatagagatatcaat 25904286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 41585614 - 41585840
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga----- 105  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||         
T  41585614 aaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 41585713  T
Q  106 -aaga------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
     ||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41585714 gaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactata-tga 41585812  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585813 tgagtaacattacaaaagagatatcaat 41585840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 1189486 - 1189712
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||     
T  1189486 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactgcgagagagaaag 1189585  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag-ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  1189586 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaac 1189685  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1189686 cttacaaaagagatatcaatggattac 1189712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39854889 - 39854666
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  39854889 ataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacagcgagag 39854790  T
Q  105 aaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  39854789 aaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 39854691  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  39854690 gtagcgttacaaaagagatatcaat 39854666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6756901 - 6756675
Alignment:
Q  1 ccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756901 ccaataaca-aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcg 6756803  T
Q  101 agag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6756802 agagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccct-cgtttcactataatg 6756704  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6756703 atgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat 6756675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18597045 - 18596828
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18597045 aaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 18596946  T
Q  110 agaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18596945 agagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactt 18596846  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18596845 tacaaaagagatatcaat 18596828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 2818211 - 2818431
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  2818211 aaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 2818310  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  2818311 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata-tgatgagta 2818409  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  2818410 acgttacaaaagagatgtcaat 2818431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 36402204 - 36402431
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  36402204 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaacacaagctaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 36402303  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  36402304 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactata-tgatgagta 36402402  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36402403 acgttacaaaagagatatcaatggattac 36402431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 658241 - 658449
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  658241 ttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaacataagccaaaagtagaaaacagcaagagaaaagaagag 658340  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  658341 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 658436  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||    
T  658437 aagagatatcaat 658449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 20505721 - 20505937
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20505721 aaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaaaacaacgagagaaa 20505820  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20505821 ataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 20505917  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20505918 gttacaaaagagatatcaat 20505937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21948434 - 21948210
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21948434 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagag 21948335  T
Q  109 ---------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21948334 ggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgat 21948236  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21948235 gagtaacgttacaaaagagatatcaa 21948210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 17818369 - 17818586
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17818369 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 17818468  T
Q  111 g-----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| || ||| |||| || ||||||||||    
T  17818469 aggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgta-tgatgagtaa 17818565  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17818566 ctttacaaaagagatatcaat 17818586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 16092079 - 16092296
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16092079 aaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaacgcaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 16092177  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  16092178 gaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaacc 16092277  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  16092278 ttacaaaagagatctcaat 16092296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 26098165 - 26098380
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----a 105  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  26098165 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 26098264  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26098265 aggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccata-tgatgagta 26098363  T
Q  205 actttacaaaagagata 221  Q
    || ||||||||||||||    
T  26098364 acgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6745473 - 6745251
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  6745473 aaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagag 6745374  T
Q  105 aaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  6745373 aaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgag 6745275  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  6745274 taacgttacaaaagagaaatcaat 6745251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17073289 - 17073066
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagaga 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  17073289 ataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagaga 17073190  T
Q  106 aaga---agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    || |   ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  17073189 aaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgag 17073090  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17073089 taaccttacaaaagagatatcaat 17073066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2954811 - 2954600
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata-atcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 112  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2954811 ttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaga 2954712  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  2954711 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata-tgatgagtaactttac- 2954614  T
Q  213 aaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  2954613 aaagagatatcaat 2954600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24127257 - 24127039
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aa 107  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  24127257 aaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 24127158  T
Q  108 gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24127157 gaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 24127059  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24127058 cttacaaaagagatatcaat 24127039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 31472493 - 31472709
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||   ||  | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||       
T  31472493 aaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataattacaaaccaaaattagaaaacaatgagagaaaaga 31472589  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31472590 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaac 31472689  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31472690 tttacaaaagagatatcaat 31472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20043390 - 20043206
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatag-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20043390 aaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 20043291  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 192  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  20043290 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaaccattcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 37705661 - 37705876
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  37705661 aaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 37705760  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  37705761 gaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaacc 37705857  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37705858 ttacaaaagagatatcaat 37705876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6747709 - 6747498
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  6747709 aaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaaaacaacagcgagag 6747610  T
Q  105 aaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||    
T  6747609 aaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactata-tgacgag 6747511  T
Q  203 taactttacaaaa 215  Q
    |||| ||||||||    
T  6747510 taacgttacaaaa 6747498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25804428 - 25804208
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  25804428 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 25804331  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25804330 acaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgttccactata-tgatga 25804233  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  25804232 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 25804208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 25921348 - 25921569
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  25921348 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 25921445  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  25921446 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata-tgatga 25921544  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  25921545 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 25921569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 31465871 - 31466039
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaa 110  Q
    ||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  31465871 ttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaa 31465970  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  31465971 gagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc 31466039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38882492 - 38882300
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  38882492 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 38882398  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  38882397 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 38882303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16776560 - 16776340
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16776560 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 16776462  T
Q  108 --gaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
      ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| |||    
T  16776461 aagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgataagt 16776363  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  16776362 aacgttacaaaagagaaatcaat 16776340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 6661074 - 6661282
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  6661074 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaaga 6661170  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||  | |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  6661171 gaacacacga-aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaa 6661269  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||    
T  6661270 aagagatatcaat 6661282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 10528972 - 10529195
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10528972 aacttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10529069  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
       |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10529070 cacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgat 10529168  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10529169 gagtaacgttacaaaagagaaatcaat 10529195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18467089 - 18466867
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  18467089 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18466992  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| |||||    
T  18466991 cacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatg 18466893  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  18466892 agtatcgttacaaaagagaaatcaat 18466867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27912941 - 27912719
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||        
T  27912941 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27912844  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   || ||| ||||||| |||||    
T  27912843 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactata-tgatg 27912745  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  27912744 agtatcgttacaaaagagaaatcaat 27912719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4237032 - 4236812
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  4237032 aacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaac 4236935  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  4236934 acaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 4236837  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  4236836 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 4236812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 34476927 - 34477137
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  34476927 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 34477024  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  34477025 cacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 34477123  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  34477124 agtaacgttacaaa 34477137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 34479292 - 34479502
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||        
T  34479292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 34479389  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  34479390 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 34479488  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  34479489 agtaacgttacaaa 34479502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2175305 - 2175113
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  2175305 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 2175211  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||||    
T  2175210 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttac 2175116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20054231 - 20054021
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 110  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||||||   ||    
T  20054231 acttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaacgaagagagaaaagaaa 20054135  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20054134 gagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaacttt 20054035  T
Q  210 acaaaagagatatc 223  Q
    ||||||||||||||    
T  20054034 acaaaagagatatc 20054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10587219 - 10587026
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||   |  ||||    
T  10587219 aaacttgatgtgtggagcaag-gataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacg---gcgagaa 10587126  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  10587125 ga----acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt 10587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 39397916 - 39398089
Alignment:
Q  43 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39397916 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag---------agaacacaaaagaatgttttgacctagtt 39398006  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  39398007 cggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaagagatatcaat 39398089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18469414 - 18469194
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  18469414 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 18469317  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | |||| ||||| | |||||    
T  18469316 cacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggagagagcagctcttcgttccactaga-tgatg 18469220  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  18469219 agtatcgttacaaaagagaaatcaat 18469194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 12555796 - 12556008
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---------- 104  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  12555796 ttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaag 12555895  T
Q  105 ---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
       | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  12555896 agaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgcttta-agatga 12555994  T
Q  202 gtaactttacaaaa 215  Q
    ||||| ||||||||    
T  12555995 gtaacgttacaaaa 12556008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 21684327 - 21684526
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-agagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||        
T  21684327 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaac 21684424  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  21684425 acaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 21684523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39798431 - 39798230
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||      
T  39798431 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaaga-- 39798339  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||| | ||| |||    
T  39798338 --acacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-cgatgagtatcattataaa 39798242  T
Q  215 agagatatcaat 226  Q
    ||||| ||||||    
T  39798241 agagaaatcaat 39798230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27910834 - 27910633
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||   |  ||||||      
T  27910834 ttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtataaaacaacg---gcgagaaga-- 27910742  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| | |||||||    
T  27910741 --acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaa 27910645  T
Q  215 agagatatcaat 226  Q
    ||||| ||||||    
T  27910644 agagaaatcaat 27910633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4410425 - 4410252
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg------agag- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||      ||||     
T  4410425 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaaacagcggcgaaaagagc 4410329  T
Q  105 --aaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
      |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4410328 acaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagc 4410252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20045386 - 20045290
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20045386 aaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacgagagaaa 20045290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 38960006 - 38960216
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg----------- 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||               
T  38960006 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgacaagaagaac 38960103  T
Q  101 -agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
     | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||    
T  38960104 aaaagaaaaaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgat 38960201  T
Q  200 gagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||| |||||||    
T  38960202 gagtaacgttacaaa 38960216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10750104 - 10749895
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10750104 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10750007  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  10750006 caaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 10749909  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  10749908 agtaacgttacaaa 10749895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15445154 - 15445362
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||| ||| ||   |||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  15445154 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaaa--ttataaacacaagcaaaagatagaaaacatcgagagaaagaa-a 15445248  T
Q  113 gagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15445249 gagaaaacacacgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctg-ggaagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaacttta 15445347  T
Q  211 caaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||||    
T  15445348 caaaagagatatcaa 15445362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 34530593 - 34530692
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  34530593 aaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagacaacagcaacagaaagaa 34530692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9020612 - 9020401
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 113  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  9020612 ttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaataacgatagaaaagaagag 9020517  T
Q  114 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||   |||||  | ||  ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  9020516 agagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaatttta 9020417  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  9020416 caaaagagatatcaat 9020401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31543138 - 31542939
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcga-gag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||| |||       
T  31543138 aacttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgaggagaac 31543041  T
Q  105 -aaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  31543040 aaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 31542942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10757580 - 10757371
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10757580 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10757483  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  10757482 caaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 10757385  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  10757384 agtaacgttacaaa 10757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 3373011 - 3373184
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga---- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  3373011 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagag 3373108  T
Q  104 -gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 176  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  3373109 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagca 3373184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4898068 - 4897913
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgag 166  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| || || |    
T  4898068 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa-agaggaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatggg 4897972  T
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| |||||||  | ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4897971 ggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaa 4897913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143650
Alignment:
Q  61 tggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgac 156  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  157 ctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || ||||  |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15143650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354659
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| ||||||    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttacaa 15354658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665238
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 23665239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23741943
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 23741942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793349
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 23793348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 31179247 - 31179421
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||    ||| |||||         
T  31179247 aacttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataat--taaacacaagccaaaagtagaagaacaacggcgagaagaa 31179344  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31179345 cacaaagaagagaagaacacaga--aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31179421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 2144504 - 2144647
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 161  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||        |||||||||||| | ||   | ||    
T  2144504 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttc-------agttcggtccaatactggtttagt 2144594  T
Q  162 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2144595 ttgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 2144647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15356935
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| ||||||    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttacaa 15356934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 17413198 - 17413262
Alignment:
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17413198 tctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 17413262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545285
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagta 31545285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35430506 - 35430365
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 182  Q
    |||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||  ||| | ||||| || ||| |||    
T  35430506 aaaattagaaaacaacgagggagaagagaaagaacacaagagaatttgtttatccagttcagtccaatactgacctactctaaaggagataggagctttc 35430407  T
Q  183 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35430406 cgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 35430365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15552539 - 15552474
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15552539 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 15552474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 34530724 - 34530762
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34530724 cactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaat 34530762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42771023 - 42770993
Alignment:
Q  196 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42771023 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 42770993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42771167 - 42771064
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 112  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  42771167 cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagtaaccaaataaa--tgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcaagagaaatgaaga 42771073  T
Q  113 gagaacaca 121  Q
    |||||||||    
T  42771072 gagaacaca 42771064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281804
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagc 10281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20045268 - 20045223
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045268 tccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaat 20045223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15552650 - 15552569
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 95  Q
    ||||||||  ||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  15552650 aacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagctaaaagtagaaaa 15552569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 101)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 11457356 - 11457573
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  11457356 aaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 11457455  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11457456 gaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactata-tgatgagtaact 11457554  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11457555 ttacaaaagagatatcaat 11457573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47906670 - 47906453
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aaa 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  47906670 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 47906571  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  47906570 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacg 47906472  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  47906471 ttacaaaagagaaatcaat 47906453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 17186011 - 17186222
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17186011 ataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaaag 17186107  T
Q  109 aa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  17186108 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaact 17186207  T
Q  208 ttacaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||||||    
T  17186208 ttacaaaagagatat 17186222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 4131256 - 4131467
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||    
T  4131256 aaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaatagaaaacaacgagagagaaaa 4131355  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4131356 gaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaact 4131455  T
Q  208 ttacaaaagaga 219  Q
    ||||||||||||    
T  4131456 ttacaaaagaga 4131467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18307509 - 18307292
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  18307509 aaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 18307410  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18307409 gaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaact 18307311  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18307310 ttacaaaagagatatcaat 18307292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 31424896 - 31425113
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  31424896 aaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 31424995  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31424996 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaacc 31425094  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31425095 ttacaaaagagatatcaat 31425113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16429353 - 16429140
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16429353 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaaccaaaagt-gaaaacagcgagagaaaaga 16429257  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16429256 agagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaacctt 16429157  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  16429156 acaaaagagatatcaat 16429140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 2949113 - 2949329
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  2949113 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 2949212  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  2949213 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacg 2949310  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2949311 ttacaaaagagatgtcaat 2949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 9240968 - 9241184
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240968 aaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 9241067  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9241068 agagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttt 9241167  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  9241168 acaaaagagatatcaat 9241184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13215486 - 13215275
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---a 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13215486 ataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaa 13215387  T
Q  106 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  13215386 aggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaa 13215289  T
Q  206 ctttacaaaagaga 219  Q
     |||||||||||||    
T  13215288 atttacaaaagaga 13215275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17319283 - 17319070
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  17319283 ttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaacacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaag 17319184  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  17319183 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaac 17319085  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  17319084 aaaagagatatcaat 17319070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 25251155 - 25251373
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||     
T  25251155 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 25251254  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||     
T  25251255 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaacc 25251354  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  25251355 ttacaaaagatatatcaat 25251373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 14097849 - 14098068
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |      
T  14097849 aaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 14097948  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14097949 ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 14098047  T
Q  207 -tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  14098048 gtttacaaaagagatatcaat 14098068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40134344 - 40134127
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatag--tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40134344 aaacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatctcaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaa 40134247  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40134246 agaatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaac 40134147  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40134146 tttacaaaagagatatcaat 40134127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 17324513 - 17324734
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca-aaagtagaaaacagcgagagaa--- 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       
T  17324513 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataagccagaaagtagaaaacagcgagagaaaag 17324612  T
Q  107 ---agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17324613 aagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 17324711  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  17324712 aacgttacaaaagagatatcaat 17324734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 28206946 - 28207164
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28206946 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 28207045  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  28207046 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta---tgatgagta 28207142  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  28207143 acgttacaaaagagatgtcaat 28207164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 6995574 - 6995798
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6995574 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 6995673  T
Q  108 -------gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6995674 aagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatg 6995772  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  6995773 agtaacgttataaaagagatgtcaat 6995798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 12302385 - 12302603
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
T  12302385 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaa 12302484  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12302485 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 12302583  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  12302584 gttacaaaagagatgtcaat 12302603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18839988 - 18839770
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  18839988 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaaaacagcgagagagaaaa 18839889  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  18839888 gaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacc 18839789  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18839788 ttacaaaagagatatcaat 18839770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16429040 - 16428836
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaaca 119  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16429040 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaagaagagagaaca 16428943  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428942 caaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagaga 16428843  T
Q  220 tatcaat 226  Q
    |||||||    
T  16428842 tatcaat 16428836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115208
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 111  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaagacaacgagagaaaagaag 6115086  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6115087 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttac 6115186  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  6115187 aaaagagatatcaattggttac 6115208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31490312 - 31490096
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||   |||    
T  31490312 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagggagagagaaaa 31490213  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||     
T  31490212 taagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctg-gggggagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataacc 31490115  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31490114 ttacaaaagagatatcaat 31490096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 50076583 - 50076777
Alignment:
Q  40 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076583 aagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 50076682  T
Q  138 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50076683 cagttcggtccaaattgacatagtctg-gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattac 50076777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 38925360 - 38925576
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38925360 ataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaa 38925459  T
Q  107 a-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||    
T  38925460 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgttttacta---tgatgagtaa 38925555  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  38925556 cgttacaaaagagatatcaat 38925576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39462922 - 39462703
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  39462922 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaattagaaaacaacagcgagagaa 39462823  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  39462822 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgaata 39462724  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  39462723 acttttcaaaagagatatcaa 39462703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 50307421 - 50307644
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50307421 ataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagag 50307520  T
Q  105 aaaga--agagagaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50307521 aaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 50307619  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  50307620 gtaacgttacaaaagagatgtcaat 50307644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 25248432 - 25248650
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |       
T  25248432 aaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacaaaagtcaaaagtagaaaacagcgagagacaccg 25248531  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||     
T  25248532 gaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaacc 25248631  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25248632 ttacaaaagagatatcaat 25248650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 27336818 - 27337026
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  27336818 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 27336917  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  27336918 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 27337016  T
Q  205 actttacaaa 214  Q
    || |||||||    
T  27337017 acgttacaaa 27337026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 27339009 - 27339217
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  27339009 aaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 27339108  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  27339109 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactata-tgatgagta 27339207  T
Q  205 actttacaaa 214  Q
    || |||||||    
T  27339208 acgttacaaa 27339217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41647321 - 41647103
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaa 107  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  41647321 aaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcaagagagaaa 41647222  T
Q  108 g-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41647221 ggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaac 41647123  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  41647122 gttacaaaagagatatcaat 41647103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 15294711 - 15294932
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  15294711 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 15294808  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15294809 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 15294907  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15294908 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 15294932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23816289 - 23816069
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaag 108  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||     
T  23816289 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 23816190  T
Q  109 ----aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||| | || |||| |||||||||    
T  23816189 gaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattata-tgatgagta 23816091  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  23816090 acgttacaaaagagaaatcaat 23816069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756709
Alignment:
Q  60 atggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct 158  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagaggaaagaagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacct 6756778  T
Q  159 ggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756777 agtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 6756709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 50248455 - 50248670
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaagaag 111  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||   || ||||    
T  50248455 ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaccacaagccaaaagttgaaaacaacgagagagaaaggaag 50248554  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag--cagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  50248555 agagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaacctt 50248653  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| |||||    
T  50248654 acaaaagagatgtcaat 50248670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51750443 - 51750222
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  51750443 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 51750346  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  51750345 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 51750247  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  51750246 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 51750222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15823950 - 15823729
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga---gagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||    
T  15823950 aaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaaggcaaaagtagaaaacaacaacaagagaa 15823851  T
Q  107 a---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  15823850 aaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagt 15823752  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
T  15823751 aacgttacaatagagatatcaat 15823729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15916786 - 15916573
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  15916786 acttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaaacagcgagaaaaagaaa 15916689  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15916688 gagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaacttt 15916590  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  15916589 ataaaagagatatcaat 15916573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 2510219 - 2510423
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||   |  |||||    
T  2510219 aacttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaa--acaagtcaaaaatagaaaacaacg---gcgagaag 2510313  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2510314 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaactttac 2510408  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||| ||||||    
T  2510409 aagagagaaatcaat 2510423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 10399704 - 10399926
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  10399704 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 10399801  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  10399802 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 10399900  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  10399901 agtaacgttacaaaagagaaatcaat 10399926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 28998128 - 28998351
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28998128 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 28998227  T
Q  108 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  28998228 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 28998326  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  28998327 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 28998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 29003844 - 29004067
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29003844 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 29003943  T
Q  108 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  29003944 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 29004042  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  29004043 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 29004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 31735399 - 31735626
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||         
T  31735399 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaa-tagaaaacaacggcgagaagaac 31735495  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  31735496 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 31735594  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  31735595 gtatcgttacaaaagagaaatcaatggattac 31735626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17324474 - 17324246
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga- 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  17324474 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagtgagagagagag 17324375  T
Q  110 --agagagaac----------acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
      ||||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17324374 agagagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatg 17324275  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17324274 atgaataaccttacaaaagagatatcaat 17324246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25128273 - 25128055
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128273 aaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat-aaaagtagaaaacagcgagagaaaga 25128177  T
Q  110 a-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25128176 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagta 25128077  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  25128076 accttacaaaagagatatcaat 25128055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840874
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28840887  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  28840886 gtaacgttacaaa 28840874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16432783 - 16432577
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||     ||| ||||||||||    
T  16432783 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaa--gttataaacataaaccaaaagtagaaaaac---aga-aaagaagaga 16432690  T
Q  115 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16432689 gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaa 16432590  T
Q  214 aagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||    
T  16432589 aagagatatcaat 16432577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39932480 - 39932256
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    | ||||||       
T  39932480 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaaga 39932383  T
Q  105 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  39932382 acacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactata-tga 39932284  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39932283 tgagtatcgttacaaaagagaaatcaat 39932256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13762240 - 13762031
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  13762240 aacttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 13762143  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||    
T  13762142 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactata-tgatga 13762044  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  13762043 gtaacgttacaaa 13762031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2617922 - 2617699
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  2617922 aacttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 2617825  T
Q  108 -------gaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
           ||||||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  2617824 acacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgat 2617726  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2617725 gagtaacgttacaaaagagaaatcaat 2617699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 226
Target Start/End: Original strand, 50078793 - 50078919
Alignment:
Q  100 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  50078793 gagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgat 50078892  T
Q  200 gagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  50078893 gaataactttacaaaagagatatcaat 50078919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28842898 - 28842689
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28842898 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28842801  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28842800 acaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatga 28842702  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  28842701 gtaacgttacaaa 28842689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13358978 - 13358787
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  13358978 aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 13358881  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13358880 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 14183490 - 14183690
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||           
T  14183490 acttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagaagaaaacaacgagagac------ 14183580  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
         ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14183581 -----cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac 14183675  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  14183676 aaaagagatatcaat 14183690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 46431582 - 46431794
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  46431582 aacttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 46431679  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct--gagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  46431680 acaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactata-tga 46431778  T
Q  199 tgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||| | |||||||    
T  46431779 tgagtatcgttacaaa 46431794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47452027 - 47451825
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaaa--ga 109  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||  ||    
T  47452027 ttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaagcaacaacgagagaaaagga 47451928  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||             | ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47451927 agagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgtt 47451842  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47451841 acaaaagagatgtcaat 47451825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 31422740 - 31422923
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat-cacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---a 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||| |||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |    
T  31422740 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaa 31422839  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 190  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  31422840 agaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcac 31422923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 226
Target Start/End: Original strand, 3579589 - 3579714
Alignment:
Q  100 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||  || |||    
T  3579589 gagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcac--taatga 3579686  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579687 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 3579714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 13447150 - 13447301
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  13447150 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaaaaac 13447247  T
Q  103 agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 155  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447248 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 49495137 - 49495309
Alignment:
Q  52 caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  49495137 caaagtgtatggaaga--tataatcacaaac-aaaagtaaaaaacagtgagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaa 49495233  T
Q  151 attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49495234 attgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 49495309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 18800458 - 18800671
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 110  Q
    ||||||| ||| ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  18800458 acttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaacaaa 18800555  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||||  | |||||||| |||  ||| ||||| ||| | |||| || || ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18800556 aagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaacttt 18800654  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  18800655 acaaaagagatatcaat 18800671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51757939 - 51757759
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag-----aaaaca---gcgaga 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||     ||||||   ||||||    
T  51757939 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattg-aat-acaagccaaaagtagggaaaaaaacaacggcgaga 51757842  T
Q  104 g------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51757841 agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 51757759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 50078670 - 50078769
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50078670 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagagaa 50078769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823197
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 6823208  T
Q  216 gagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||    
T  6823207 gagaaatcaat 6823197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 13125346 - 13125555
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 110  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  13125346 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaaa 13125440  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||  | ||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13125441 gagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaacttt 13125539  T
Q  210 acaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  13125540 acaaaagagatatcaa 13125555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 9459311 - 9459503
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| || | || |        
T  9459311 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga---- 9459403  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||    
T  9459404 --agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac 9459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 9463138 - 9463330
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| || | || |        
T  9463138 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgaga---- 9463230  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | ||||    
T  9463231 --agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttac 9463327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 3579464 - 3579558
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579464 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagagagaga 3579558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24325954 - 24325846
Alignment:
Q  117 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24325954 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaag 24325856  T
Q  217 agatatcaat 226  Q
    ||| ||||||    
T  24325855 agaaatcaat 24325846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 30790288 - 30790499
Alignment:
Q  16 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa--gtagaaa-acagcgagagaaagaaga 112  Q
    |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  30790288 tgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaacaaaaatagtaaaaagacagcgagagaaagaa-a 30790384  T
Q  113 gagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||| |||| | |||||| ||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  30790385 gagagcacacacgaattttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctg-ggaagagagcagtcatccattccactataatgatgagtaacttta 30790483  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  30790484 caaaagagatatcaat 30790499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 8347161 - 8347371
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 111  Q
    |||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8347161 acttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaa--gttataaacataagc-aaaagtagaaaacagcgatagaaagaaag 8347256  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    ||||||||||  | ||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8347257 agagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaacttta 8347355  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  8347356 caaaagagatatcaat 8347371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20302846 - 20302692
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  ||||    
T  20302846 aacttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaa 20302752  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 174  Q
    ||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20302751 ga----acacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 20302692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 15669304 - 15669492
Alignment:
Q  38 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttga 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |    
T  15669304 tcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaa--gttataaacacaaac-aaaagtataacacagcgagagaaaagaaagagagaacacaacaaaatttgttta 15669400  T
Q  136 cctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |  ||||| ||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15669401 cacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaat 15669492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42922557 - 42922413
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  42922557 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 42922459  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42922458 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 42922413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16561813 - 16561651
Alignment:
Q  63 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 160  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |    
T  16561813 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacggcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctag 16561716  T
Q  161 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||  ||||||||||| || |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561715 tctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 16561651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20291861 - 20291670
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||         
T  20291861 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 20291764  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || || |||| | |||||||    
T  20291763 cacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactata 20291670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51752667 - 51752592
Alignment:
Q  105 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51752667 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 51752592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 25860287 - 25860369
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25860287 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 25860369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23786244 - 23786034
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  23786244 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 23786147  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  23786146 caaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 23786048  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  23786047 agtaacgttacaaa 23786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 8348938 - 8349150
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||    
T  8348938 aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaacaattagagaaagaa 8349033  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||  |||| | ||||  |||||||| || || ||  || ||||||| |||||||||||||    
T  8349034 agagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaactt 8349132  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||| ||||    
T  8349133 aacaaaagagataccaat 8349150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 13127576 - 13127782
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 110  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||      
T  13127576 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaaggagaaaacaatgagataaagaaaa 13127670  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13127671 gagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaacttt 13127769  T
Q  210 acaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||||    
T  13127770 acaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16226573 - 16226396
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  16226573 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 16226476  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16226475 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16226396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27916840 - 27916681
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 162  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    | |||||||| ||| | |||||||||| | |||||| |||    
T  27916840 acagttataaacacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaaaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtc 27916743  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27916742 tgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 27916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 26613194 - 26613337
Alignment:
Q  84 aaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||  |||| ||||||||| |||      
T  26613194 aaaagtagaaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctc 26613292  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26613293 tctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaa 26613337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16231968 - 16231792
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  16231968 aacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 16231871  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16231870 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16231792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 30780436 - 30780361
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 96  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30780436 tgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaaatcaaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 155949 - 155901
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  155949 gggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 155901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Original strand, 21948227 - 21948286
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21948227 gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 21948286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 30738609 - 30738727
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt--gatgagtaa 205  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||    
T  30738609 aagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaa 30738707  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  30738708 ctttacaaaagagacatcaa 30738727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104345
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 43104345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47177767 - 47177683
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47177767 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 47177683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51752764 - 51752696
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 91  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  51752764 tgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatt-gaat-acaagccaaaagtag 51752696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353434
Alignment:
Q  123 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa 21353434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24326067 - 24326008
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagtta 71  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  24326067 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaatta 24326008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47180118 - 47179942
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||         
T  47180118 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 47180021  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47180020 cacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg-gggagagagcagcc 47179942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520114
Alignment:
Q  70 tataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacaca 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacaca 26520114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 31422930 - 31422971
Alignment:
Q  185 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31422930 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaat 31422971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 217  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28279487 - 28279455
Alignment:
Q  188 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28279487 cactataatgatgagtaactttacaaaagagat 28279455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665361
Alignment:
Q  182 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 48665361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 24338329 - 24338543
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24338329 aaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaaaga 24338428  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338429 agagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtct--gggggagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacctt 24338526  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  24338527 acaaaagagatatcaat 24338543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9020364 - 9020144
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  9020364 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 9020265  T
Q  108 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  9020264 agggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagta 9020166  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9020165 actttacaaaagagatatcaat 9020144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 3629745 - 3629960
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtagaaaacagcgagag-aaag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3629745 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaagtagaaaacaacgagagaaaag 3629844  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||    
T  3629845 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctcagtttcactata-ttattagtaactt 3629942  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3629943 tacaaaagagatatcaat 3629960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 3631818 - 3632034
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  3631818 aaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagaaaaag 3631917  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  3631918 gaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggacagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacc 3632015  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3632016 ttacaaaagagatatcaat 3632034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 30728703 - 30728913
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||     
T  30728703 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 30728802  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  30728803 gaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataat-atgagtaact 30728901  T
Q  208 ttacaaaagaga 219  Q
    ||||||||||||    
T  30728902 ttacaaaagaga 30728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 11982906 - 11983125
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  11982906 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 11983005  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  11983006 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaa 11983104  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||| ||||||    
T  11983105 cgttacaaaagagaaatcaat 11983125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 1069609 - 1069815
Alignment:
Q  23 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaaca 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1069609 tggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaaca 1069708  T
Q  120 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 219  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1069709 taaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagaga 1069808  T
Q  220 tatcaat 226  Q
    |||||||    
T  1069809 tatcaat 1069815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15346779 - 15346565
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15346779 aaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacaagagaaagaa 15346680  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15346679 agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactata-tgatgaataacttt 15346582  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15346581 acaatagagatatcaat 15346565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15367464 - 15367253
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 109  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  15367464 aaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaatacgagagaaagaa 15367365  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15367364 agagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactata-tgatgaataactt 15367267  T
Q  209 tacaaaagagatat 222  Q
    ||||| ||||||||    
T  15367266 tacaatagagatat 15367253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186168
Alignment:
Q  59 tatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacc 157  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacc 12186099  T
Q  158 tggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186100 tagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 12186168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15541024 - 15541236
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aag 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||   | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||  ||     
T  15541024 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaagttg---gtaacagttataatcacaaac-aaaattagaaaacaacgagagagaaaa 15541119  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15541120 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactata-tgatgaataactt 15541218  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15541219 tacaaaagagatatcaat 15541236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 28241196 - 28241417
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  28241196 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaac 28241293  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28241294 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 28241392  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  28241393 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 28241417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13057625 - 13057412
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-- 108  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||   | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||       
T  13057625 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataatcacaaac-aaaagtagaaaacagatagagaaaaga 13057530  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13057529 aagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaacct 13057430  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13057429 tacaaaagagatatcaat 13057412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14466759 - 14466541
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc---gagaga 105  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||    
T  14466759 ataaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcagcgagaga 14466663  T
Q  106 aagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||    
T  14466662 aagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaata 14466563  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14466562 accttacaaaagagatatcaat 14466541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13040117 - 13039972
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  13040117 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 13040018  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13040017 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 13039972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32280429 - 32280214
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc--gagagaaag 108  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||   ||  | |||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  32280429 aaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaataacatgagagaaag 32280333  T
Q  109 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  32280332 gaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaact 32280233  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32280232 ttacaaaagagatatcaat 32280214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 14507051 - 14507241
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  14507051 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 14507148  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14507149 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata 14507241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26065421 - 26065231
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga---- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||        
T  26065421 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaa 26065322  T
Q  104 -gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  26065321 caaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 26065231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26085390 - 26085200
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgaga---- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||        
T  26085390 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaaaacaacagcaagaagaa 26085291  T
Q  104 -gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  26085290 caaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 26085200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 1230123 - 1230345
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||| ||||||   ||||||  ||     
T  1230123 aacttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaataca-aagccaaaagtataaaacaacggcgagaagaac 1230221  T
Q  108 -----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1230222 acaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatga 1230320  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1230321 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 1230345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 4816105 - 4816327
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    | ||||||        
T  4816105 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 4816202  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  4816203 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 4816301  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    
T  4816302 agtaccgttacaaaagagaaatcaat 4816327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30967640 - 30967419
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  30967640 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 30967543  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  30967542 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatga 30967444  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30967443 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 30967419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 2628760 - 2628970
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  2628760 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 2628857  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  2628858 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 2628956  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  2628957 agtaccgttacaaa 2628970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 3233605 - 3233826
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--g 108  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  3233605 ttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagg 3233704  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  3233705 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactata-cggtgagt 3233803  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  3233804 aacgttacaaaagagatgtcaat 3233826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 14458643 - 14458863
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa----- 106  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||         
T  14458643 cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacgacgagaagaaca 14458740  T
Q  107 ---agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 202  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    
T  14458741 caaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgag 14458839  T
Q  203 taactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14458840 taacgttacaaaagagaaatcaat 14458863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390597
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaat 3390597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15720074 - 15719860
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  15720074 ataaacttgatgtgtgga---agtgatagtcaagcaatcaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaacaaaaa-tagaaaacagcgagagaaa 15719981  T
Q  108 g--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
       |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| |  || ||||||||||| |||||||||    
T  15719980 agaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagta 15719882  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15719881 actttacaaaagagatatcaat 15719860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 3027740 - 3027950
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gag 113  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3027740 ttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagag 3027836  T
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||||||| |||  |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3027837 agaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 3027935  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  3027936 aaaagagatatcaat 3027950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10584340 - 10584227
Alignment:
Q  100 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10584340 gagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatga 10584241  T
Q  199 tgagtaactttaca 212  Q
    |||||||| |||||    
T  10584240 tgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532777
Alignment:
Q  121 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtct-agggatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  221 atcaat 226  Q
    ||||||    
T  15532772 atcaat 15532777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 226
Target Start/End: Original strand, 12161502 - 12161653
Alignment:
Q  76 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  12161502 cacaagacaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagt-ttagggagag 12161600  T
Q  173 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12161601 aacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 12161653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 19704438 - 19704664
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |     ||||||     
T  19704438 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaaacaacggcgagaa 19704535  T
Q  105 ------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
          |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  19704536 gaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tg 19704634  T
Q  198 atgagtaactttacaaa-agagatatcaat 226  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  19704635 atgagtaccgttacaaagagagaaatcaat 19704664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 22857891 - 22858038
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 164  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |||||    
T  22857891 agttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19696868 - 19696659
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 110  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||     
T  19696868 acttgatgtgtggagcaa-ag-taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaaaaacagcgagagaaagaaa 19696774  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19696773 gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataacttt 19696675  T
Q  210 acaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  19696674 acaaaagagatatcaa 19696659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 30034480 - 30034699
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||         
T  30034480 aacttgatgtatggagcaag-gataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 30034575  T
Q  105 --aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||    
T  30034576 acaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctata-tgatga 30034674  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30034675 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 30034699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26945539 - 26945362
Alignment:
Q  49 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggt 146  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  26945539 aaacaaagtgtaaggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggt 26945443  T
Q  147 ccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||  |||| |  |||| ||| |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26945442 ccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 25465524 - 25465686
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |     
T  25465524 ggaacaattataaactcaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacata 25465621  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    || || | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465622 gtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 25465686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477519
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaac 25477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 29754583 - 29754793
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||   ||||||        
T  29754583 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 29754680  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  29754681 caaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 29754779  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  29754780 agtaacgttacaaa 29754793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3394800 - 3394708
Alignment:
Q  14 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394800 cttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 3394708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25480309 - 25480217
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 107  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25480309 ttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaa 25480217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 26068269 - 26068479
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  26068269 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 26068366  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  26068367 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 26068465  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    || ||| |||||||    
T  26068466 agcaacgttacaaa 26068479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33309296 - 33309086
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  33309296 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 33309199  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  33309198 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 33309100  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  33309099 agtaacgttacaaa 33309086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17012466 - 17012258
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 111  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  17012466 acttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaac-gtta-aaacacaagccaaaagtagaaaatagtgagagaaagaaag 17012370  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 210  Q
    |||||| |  |   |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||  | |  |  | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  17012369 agagaatatga---aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctctatg-ttccctataacgatgagtaacttta 17012274  T
Q  211 caaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  17012273 caaaagagatatcaat 17012258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 20915231 - 20915440
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcga-gagaa--- 106  Q
    |||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||       
T  20915231 aacttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacgacgagaagaa 20915328  T
Q  107 -----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
         |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  20915329 cacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 20915426  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  20915427 agtaccgttacaaa 20915440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 26932437 - 26932609
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||||    ||| |||||         
T  26932437 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaggtagaaaaacaacggcgagaagaa 26932534  T
Q  103 -agaaagaagagagaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 176  Q
     | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  26932535 cacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagca 26932609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33311565 - 33311355
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  33311565 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 33311468  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  33311467 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactat-ttgatg 33311369  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  33311368 agtaacgttacaaa 33311355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 26065995 - 26066208
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  26065995 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaa 26066092  T
Q  105 --aaagaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
      ||||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||||||  ||    
T  26066093 caaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttg 26066191  T
Q  198 atgagtaactttacaaa 214  Q
    || |||||| |||||||    
T  26066192 ataagtaacgttacaaa 26066208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 28078136 - 28078291
Alignment:
Q  69 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgag 166  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || ||||    
T  28078136 ttataaacacaagc-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgag 28078232  T
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||||||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078233 ggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22491045 - 22490917
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||| || |||||||| |  |||| |||||||||||||||||   ||  | |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22491045 aaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaa---gtgggtaacaattataaacataggccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 22490949  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 141  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22490948 agagagagcacaaaagaatttgttgacctagt 22490917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937278
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacct 158  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||   |||||    
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacct 12937223  T
Q  159 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12937224 agtctg-gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 12937278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455521
Alignment:
Q  126 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  225 a 225  Q
    |    
T  16455521 a 16455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 5273090 - 5273266
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  5273090 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--ttttaaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 5273187  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
      ||||||||   |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5273188 caaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 5273266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 28037659 - 28037825
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaa-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctg 159  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||| | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||     
T  28037659 ggaacaattataaacacaaga-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaagaaaaaaaaaacacaatttgtttacccagctcggtccaaaactgaccta 28037756  T
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgt---ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28037757 gactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28037825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 25078529 - 25078653
Alignment:
Q  100 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| | ||| || ||| ||||| | |||||| |||| || |||    
T  25078529 gagaaaaagaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactg-ggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatga 25078626  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  25078627 cgagtaactttacaaaagagatatcaa 25078653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 12195388 - 12195565
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag----- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||         
T  12195388 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 12195485  T
Q  103 -agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     | ||||||||   ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12195486 cacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 12195565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911531
Alignment:
Q  154 gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 214  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 12911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18322532 - 18322482
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 62  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18322532 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30445801 - 30445743
Alignment:
Q  167 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445801 ggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 30445743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 15530084 - 15530156
Alignment:
Q  54 aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc----gagagaaagaagagagaacacaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||    
T  15530084 aagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530219
Alignment:
Q  172 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 15530219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 17904287 - 17904368
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc 148  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17904287 acagttataaacacaagc-aaaattagaaaacaacgagagaga-atgaaagaacacaaaataatttgtttacctagttctgtcc 17904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3833541 - 3833495
Alignment:
Q  180 ttccgtttcactatagtgatgagt-aactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3833541 ttccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaa 3833495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30443652 - 30443532
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa---gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  30443652 caaaaatagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagc 30443553  T
Q  179 cttccgtttcactatagtgat 199  Q
      |||||| ||||||| ||||    
T  30443552 tctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11262793 - 11262678
Alignment:
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   |||||| || |||| ||||||||  ||    
T  11262793 aagagagaacacacga-aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttct 11262695  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11262694 ttac-aaagagatatcaa 11262678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20527025
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttac-aaagagatatcaa 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936640
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41383120 - 41382901
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  41383120 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagccagaagtagaaaacaacagcgagagaaa 41383021  T
Q  108 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41383020 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaa 41382922  T
Q  206 ctttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  41382921 cgttacaaaagagatgtcaat 41382901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15073168 - 15072950
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  15073168 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 15073069  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  15073068 agaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaac 15072970  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  15072969 gttacaaaagagatatcaat 15072950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 14419069 - 14419283
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  14419069 aaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 14419168  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  14419169 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaacc 14419268  T
Q  208 ttacaaaagagatat 222  Q
    |||||||||| ||||    
T  14419269 ttacaaaagacatat 14419283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 30480386 - 30480599
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaag 111  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  30480386 ttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaag 30480485  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  30480486 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgactaacgttac 30480584  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  30480585 aaaagagatatcaat 30480599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25952976 - 25952759
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-- 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||       
T  25952976 aaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaacacaatccaaaagtagaaaacggcgagagaaaaga 25952877  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  25952876 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattt 25952777  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25952776 tacaaaagagatatcaat 25952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 13858368 - 13858577
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858368 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagtgagagaaagaa 13858465  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858466 agggagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacttt 13858564  T
Q  210 acaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||||    
T  13858565 acaaaagagatat 13858577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36865995 - 36865778
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36865995 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 36865896  T
Q  111 -----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
         || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36865895 aaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagta 36865796  T
Q  205 actttacaaaagagatat 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36865795 actttacaaaagagatat 36865778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 33541289 - 33541506
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |       
T  33541289 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaatcagcgagagagaaag 33541388  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 207  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  33541389 gaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactata-tgatgagtaacc 33541487  T
Q  208 ttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33541488 ttacaaaagagatatcaat 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15956409 - 15956196
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  15956409 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataatcacaaacgaaa-gtagaaaacaacgagagaaaaga 15956313  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15956312 agagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaacttt 15956213  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  15956212 acaaaagagatatcaat 15956196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 28251445 - 28251663
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa- 107  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||     
T  28251445 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccacaagtagaaaacaacagcgagagaaaa 28251544  T
Q  108 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  28251545 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaac 28251643  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  28251644 attacaaaagagaaatcaat 28251663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15068438 - 15068220
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagag-aa 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  15068438 aaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 15068339  T
Q  107 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  15068338 agaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattata-tgatgagtaac 15068240  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
     |||||||||||||||||||    
T  15068239 gttacaaaagagatatcaat 15068220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15185598 - 15185811
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15185598 aaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcataaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 15185694  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15185695 agagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaacctt 15185794  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  15185795 aaaaaagagatatcaat 15185811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 27106781 - 27106990
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27106781 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcaca-gacaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 27106877  T
Q  111 -gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |    
T  27106878 agagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccct 27106976  T
Q  210 acaaaagagatatc 223  Q
    ||||||||||||||    
T  27106977 acaaaagagatatc 27106990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14808217 - 14807990
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  14808217 aaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaa 14808118  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct----------gagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  14808117 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactata-tg 14808019  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14808018 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 14807990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 2468010 - 2468226
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||     
T  2468010 ataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaa--gttataatcacaaaacaaaattagaaaacaacgagagaaaa 2468107  T
Q  109 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
      |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  2468108 gaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaac 2468206  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2468207 tttacaaaagagatatcaat 2468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41385192 - 41384983
Alignment:
Q  22 gtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaa-gtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagag 115  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  41385192 gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagag 41385093  T
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41385092 aacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41384994  T
Q  216 gagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||    
T  41384993 gagatgtcaat 41384983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1225568 - 1225417
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1225568 aacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagta 1225469  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1225468 tgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21482766 - 21482549
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21482766 ataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaacagcgagagaa 21482670  T
Q  107 ag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  21482669 aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagta 21482571  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21482570 actttacaaaagagatatcaat 21482549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3874453 - 3874249
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||    
T  3874453 aacttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacg---gcgagaag 3874359  T
Q  112 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3874358 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 3874264  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| ||||||    
T  3874263 aaaagagaaatcaat 3874249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 37214143 - 37214319
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||     
T  37214143 aaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 37214242  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  37214243 gaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 35872335 - 35872536
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  35872335 aaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaagagaga-aaaga 35872433  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  35872434 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgtt 35872519  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  35872520 acaaaagagatatcaat 35872536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 5372060 - 5372274
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 109  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5372060 aaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaga 5372159  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |   |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5372160 a---agaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaacct 5372256  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  5372257 tacaaaaaagatatcaat 5372274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43530575 - 43530354
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||         
T  43530575 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaatggcaagaagaac 43530478  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  43530477 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactata-tgatga 43530379  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||    
T  43530378 gtagcgttacaaaagagaaatcaat 43530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27827446 - 27827246
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||        
T  27827446 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27827349  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27827348 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27827250  T
Q  201 agta 204  Q
    ||||    
T  27827249 agta 27827246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27829757 - 27829557
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||   ||||||        
T  27829757 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 27829660  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  27829659 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 27829561  T
Q  201 agta 204  Q
    ||||    
T  27829560 agta 27829557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21480958 - 21480741
Alignment:
Q  9 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  21480958 ataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagaagaaaacaacgagagaa 21480862  T
Q  107 ag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |   |||||||||||||  | | ||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21480861 aagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagta 21480763  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21480762 actttacaaaagagatatcaat 21480741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 22684527 - 22684749
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  22684527 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 22684624  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  22684625 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatg 22684723  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22684724 agtaacgttacaatagagaaatcaat 22684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15809678 - 15809457
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||         
T  15809678 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaaggcaaaaatagaaaacaacggcgagaagaac 15809581  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || | | ||||||| ||||||    
T  15809580 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactata-tgatga 15809482  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15809481 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 15809457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4424479 - 4424257
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  4424479 aacttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 4424382  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||    
T  4424381 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatg 4424283  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||    
T  4424282 agtaatgttacaaaagataaatcaat 4424257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 28283096 - 28283304
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |   ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28283096 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28283193  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28283194 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28283291  T
Q  202 gtaactttacaaa 214  Q
    ||||| |||||||    
T  28283292 gtaacgttacaaa 28283304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32339770 - 32339548
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||        
T  32339770 aacttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaataacggcgagaagaa 32339673  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  32339672 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 32339574  T
Q  201 agtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  32339573 agtatcgttacaaaagagatatcaat 32339548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 609197 - 608973
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--------- 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||             
T  609197 aacttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcaagaaga 609100  T
Q  101 agagaaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 198  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  609099 acacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tga 609001  T
Q  199 tgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  609000 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 608973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 181901 - 181798
Alignment:
Q  43 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  181901 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagt 181802  T
Q  142 tcgg 145  Q
    ||||    
T  181801 tcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31162664 - 31162448
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag---a 109  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    |    
T  31162664 acttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaa 31162567  T
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgaggg--agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 206  Q
    | ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||     
T  31162566 aaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaat 31162468  T
Q  207 tttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31162467 tttacaaaagagatatcaat 31162448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18811168 - 18810968
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa---acagcgag----- 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||         
T  18811168 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacgacagcgagaagaa 18811071  T
Q  103 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18811070 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18810972  T
Q  201 agta 204  Q
    ||||    
T  18810971 agta 18810968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18813342 - 18813142
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||        
T  18813342 aacttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacgacggcgagaagaa 18813245  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  18813244 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 18813146  T
Q  201 agta 204  Q
    ||||    
T  18813145 agta 18813142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14477706 - 14477520
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||  | |||| ||||||||   |||    
T  14477706 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaacacaagccaaaa-aaaaaaaaagcgagagagaaaa 14477608  T
Q  108 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||||||||||||||    
T  14477607 gaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactata 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 3005521 - 3005735
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||  |||||    ||||| ||||||||  |||     
T  3005521 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaatacaag--aaaaggtacaaacaacgagagaagaaagg 3005615  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  3005616 gagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttac 3005713  T
Q  212 aaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  3005714 aaaagagatatcaatggattac 3005735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27911367 - 27911253
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911367 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27911270  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27911269 acaatagagatatcaat 27911253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27957786 - 27957672
Alignment:
Q  110 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27957786 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27957689  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27957688 acaatagagatatcaat 27957672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44721303 - 44721129
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  44721303 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 44721206  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
      |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44721205 acaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagc 44721129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31035522 - 31035358
Alignment:
Q  62 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 159  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||     
T  31035522 ggaacaattaaaaacacaagc-aaaactagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccta 31035425  T
Q  160 --gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035424 tagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 31035358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 31578216 - 31578373
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 162  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||| | | |||||| |||    
T  31578216 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaga-gagagcacacaaaa---tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtc 31578310  T
Q  163 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |  ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578311 taggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 31578373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6376354 - 6376229
Alignment:
Q  100 gagagaaaga-agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6376354 gagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatg 6376256  T
Q  198 atgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6376255 atgagtaactttac-aaagagatatcaa 6376229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43082433 - 43082258
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||         
T  43082433 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacgtcgagaagaac 43082336  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43082335 aaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 3883470 - 3883553
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3883470 aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 3883553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16833854 - 16833781
Alignment:
Q  160 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattac 233  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16833854 gtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaatgattac 16833781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43080062 - 43079887
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgaga----- 103  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  43080062 aacttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 43079965  T
Q  104 gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
     ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43079964 aaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43079887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27911533 - 27911441
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27911533 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagaga 27911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27957952 - 27957860
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27957952 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagaga 27957860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3896121 - 3896063
Alignment:
Q  166 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 224  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3896121 gggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  168 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 222  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 24873073 - 24873158
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24873073 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaaggtagaaaaca 24873158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 31566493 - 31566578
Alignment:
Q  64 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 150  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31566493 aacaattataaacacaagc-agaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaa 31566578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752438
Alignment:
Q  129 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28228714 - 28228669
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 158  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28228714 agaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgacct 28228669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 14264 - 14478
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaag 108  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  14264 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaagg 14363  T
Q  109 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  14364 aagagagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgt 14460  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14461 tacaaaagagatatcaat 14478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15369 - 15211
Alignment:
Q  65 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |    
T  15369 acagttataatcacaa-acaaaagtagaaaacaacatgataaaagaagagagaacac--aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcat 15273  T
Q  164 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272 gggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 85629 - 85422
Alignment:
Q  21 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaac 118  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  85629 tgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaac 85530  T
Q  119 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 218  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  85529 acaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagag 85430  T
Q  219 atatcaat 226  Q
    ||||||||    
T  85429 atatcaat 85422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4403 - 4188
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4403 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 4304  T
Q  110 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4303 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 4206  T
Q  209 tacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4205 tacaaaagagatatcaat 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 79597 - 79377
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc-----gagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||     
T  79597 aaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcaagagaa 79498  T
Q  105 aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  79497 aaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagta 79399  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  79398 acgttacaaaagagaaatcaat 79377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 183516 - 183737
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  183516 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 183613  T
Q  105 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  183614 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatga 183712  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  183713 gtaacattacaaaagagaaatcaat 183737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52422 - 52203
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  52422 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 52323  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 203  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52322 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagt 52226  T
Q  204 aactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  52225 aacgttacaaaagagatgtcaat 52203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50423 - 50235
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac----agcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  50423 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaactagagagaaaa 50324  T
Q  107 agaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  50323 agaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 80271 - 80051
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  80271 aaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaa 80172  T
Q  107 a--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 204  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80171 aaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagta 80073  T
Q  205 actttacaaaagagatatcaat 226  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  80072 acgttacaaaagagatgtcaat 80051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 41358 - 41579
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg---------ag 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  41358 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgaaaagaac 41455  T
Q  103 agaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  41456 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatga 41554  T
Q  202 gtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  41555 gtaacgttacaaaagagaaatcaat 41579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 11387 - 11569
Alignment:
Q  48 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 142  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11387 aaaataaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggtt 11486  T
Q  143 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11487 cggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36005 - 35817
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||   |||||||||    
T  36005 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaactcgaaaacaacagcgagagaa 35906  T
Q  107 a-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 194  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  35905 aagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 1327 - 1537
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag--- 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    | ||||||        
T  1327 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagat 1424  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  1425 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatg 1523  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||| | |||||||    
T  1524 agtatcgttacaaa 1537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 69166 - 69376
Alignment:
Q  11 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  69166 aaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 69263  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  69264 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatg 69362  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  69363 agtaacgttacaaa 69376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1739
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 112  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||    
T  1529 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaaaga 1625  T
Q  113 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 211  Q
    |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1626 gagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttac 1724  T
Q  212 aaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||    
T  1725 aaaagagatatcaat 1739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29583 - 29384
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg-agagaa---- 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||        
T  29583 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaaacaacggagagaagaac 29486  T
Q  107 ----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 201  Q
        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  29485 acaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 29387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 1326 - 1485
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgag------ 102  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||          
T  1326 aacttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 1423  T
Q  103 agaaagaag-agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 163  Q
    | ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1424 acaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 16536 - 16747
Alignment:
Q  13 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||    
T  16536 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaa-ctaaacaaagtgcatgga--agttataaatacaag-caaaaatagaaaacaacgagagaaaagaaa 16631  T
Q  111 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 209  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  | || |  ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16632 gagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaacttt 16730  T
Q  210 acaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  16731 acaaaagagatatcaat 16747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Original strand, 15774 - 15918
Alignment:
Q  83 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 180  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  15774 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 15872  T
Q  181 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 226  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15873 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22319
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 22320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24594
Alignment:
Q  114 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 24595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 279
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||       | || |      
T  439 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggc 349  T
Q  111 gag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  348 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6403
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6612 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaata---ataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6516  T
Q  105 --aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 200  Q
      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  |||||    
T  6515 caaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatg 6417  T
Q  201 agtaactttacaaa 214  Q
    |||||| |||||||    
T  6416 agtaacgttacaaa 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 12749 - 12832
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  12749 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagacaaca 12832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4729
Alignment:
Q  116 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4666 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4635
Alignment:
Q  15 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 97  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4555 ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 4635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3292 - 3117
Alignment:
Q  12 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||||   ||||||        
T  3292 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 3196  T
Q  105 ---aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 179  Q
       |||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  3195 cacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagcc 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 57367 - 57524
Alignment:
Q  67 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatt-tgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 164  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||   || || | || ||||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  57367 agttataaacacaatcaaaagatagaaaacagtgagagaaaga-gagagaacacac--gatttgtttttacctagttccgtccaatactgacctagtctg 57463  T
Q  165 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 225  Q
     |||||||||||||  || ||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  57464 ggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaa 57524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5962 times since January 2019
Visitors: 5761