View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0812_low_127 (Length: 298)

Name: NF0812_low_127
Description: NF0812
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0812_low_127
NF0812_low_127
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (30-285)||(1668041-1668296)
chr8 (30-285)||(16658756-16659011)
chr8 (30-285)||(38521154-38521406)
chr8 (119-285)||(22014860-22015026)
chr8 (30-206)||(6786373-6786550)
chr8 (84-213)||(22432291-22432424)
chr8 (84-213)||(29182575-29182708)
chr8 (84-213)||(27576749-27576888)
chr8 (84-213)||(774680-774814)
chr8 (84-228)||(43916091-43916235)
chr8 (99-225)||(11472344-11472476)
chr8 (114-211)||(42808687-42808784)
chr8 (114-206)||(33360397-33360489)
chr8 (158-213)||(780362-780417)
chr8 (91-150)||(34212961-34213020)
chr8 (30-66)||(774839-774875)
chr8 (30-66)||(780493-780529)
chr8 (30-63)||(22014769-22014802)
chr8 (30-66)||(18068500-18068536)
chr8 (30-66)||(22432449-22432485)
chr8 (30-66)||(29182733-29182769)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (30-285)||(3935300-3935555)
chr2 (30-204)||(38978382-38978556)
chr2 (84-213)||(25697567-25697700)
chr2 (154-228)||(32339602-32339678)
chr2 (236-284)||(38978335-38978383)
chr2 (97-138)||(8485531-8485572)
chr2 (91-143)||(20917027-20917079)
chr2 (30-66)||(25697725-25697761)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (30-285)||(23218148-23218403)
chr4 (30-258)||(13740207-13740435)
chr4 (30-268)||(21355794-21356041)
chr4 (30-218)||(45143908-45144096)
chr4 (30-218)||(45152677-45152865)
chr4 (84-213)||(21604412-21604545)
chr4 (84-213)||(46164366-46164499)
chr4 (84-213)||(47825894-47826027)
chr4 (106-215)||(54785186-54785295)
chr4 (84-213)||(8432980-8433113)
chr4 (31-232)||(33753942-33754142)
chr4 (99-228)||(38115443-38115578)
chr4 (226-285)||(45144082-45144141)
chr4 (226-285)||(45152851-45152910)
chr4 (114-211)||(14799999-14800096)
chr4 (153-218)||(3187581-3187646)
chr4 (33-66)||(54785346-54785379)
chr4 (30-66)||(8433138-8433174)
chr4 (30-66)||(46164524-46164560)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (30-285)||(2338744-2338997)
chr3 (30-218)||(52893367-52893555)
chr3 (65-218)||(21239406-21239559)
chr3 (84-213)||(9456400-9456533)
chr3 (226-285)||(52893541-52893600)
chr3 (114-209)||(40922976-40923071)
chr3 (114-209)||(2733793-2733888)
chr3 (226-263)||(21239545-21239582)
chr3 (91-150)||(4329855-4329916)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (84-285)||(3174150-3174355)
chr5 (84-213)||(32863634-32863763)
chr5 (84-213)||(10572689-10572822)
chr5 (84-228)||(19209097-19209241)
chr5 (84-228)||(23737872-23738016)
chr5 (108-228)||(43300188-43300308)
chr5 (93-226)||(41958586-41958717)
chr5 (163-222)||(18739394-18739453)
chr5 (114-209)||(22273148-22273243)
chr5 (32-138)||(18739449-18739559)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (30-239)||(11143-11349)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (30-218)||(2403-2585)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (84-213)||(6472244-6472377)
chr7 (84-213)||(9371793-9371926)
chr7 (84-213)||(21358022-21358155)
chr7 (84-209)||(35012978-35013107)
chr7 (93-228)||(44660309-44660443)
chr7 (114-201)||(31419280-31419367)
chr7 (91-150)||(12003038-12003099)
chr7 (30-66)||(6472402-6472438)
chr7 (30-66)||(35013133-35013169)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (84-213)||(29599251-29599384)
chr1 (91-228)||(17480972-17481109)
chr1 (84-213)||(324665-324798)
chr1 (84-213)||(48184225-48184352)
chr1 (90-213)||(26354997-26355125)
chr1 (131-213)||(26014504-26014586)
chr1 (121-223)||(10801546-10801650)
chr1 (119-228)||(6165022-6165133)
chr1 (119-218)||(16764520-16764621)
chr1 (30-66)||(26354930-26354966)
chr1 (30-63)||(6165191-6165224)
chr1 (30-63)||(10801711-10801744)
chr1 (30-66)||(26014451-26014487)
chr1 (30-66)||(29599409-29599445)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (84-213)||(32397218-32397352)
chr6 (84-185)||(9302995-9303095)
chr6 (114-209)||(7171047-7171142)
chr6 (91-150)||(14654645-14654704)
chr6 (91-150)||(32397747-32397808)
chr6 (31-63)||(9302935-9302967)
[»] scaffold1084 (1 HSPs)
scaffold1084 (99-228)||(1208-1340)
[»] scaffold1300 (2 HSPs)
scaffold1300 (77-228)||(908-1067)
scaffold1300 (195-228)||(769-802)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (119-218)||(8366-8467)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (119-218)||(2888-2989)
scaffold0054 (30-63)||(2797-2830)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (114-211)||(39631-39728)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Original strand, 1668041 - 1668296
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1668041 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 1668140  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1668141 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgattgccatgagttc 1668240  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1668241 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgtggttctttgcccct 1668296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Original strand, 16658756 - 16659011
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16658756 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 16658855  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16658856 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgattgccatgagttc 16658955  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16658956 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgtccct 16659011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38521406 - 38521154
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38521406 gcgaccactcttctccttctccatccatcactgccgccgcgattactctcctccttc---agtttagagagttatctccatctctctccacaaaccctaa 38521310  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38521309 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgattgccatgagttc 38521210  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38521209 tttagttgattttcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 38521154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 119 - 285
Target Start/End: Original strand, 22014860 - 22015026
Alignment:
Q  119 acaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22014860 acaaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattattgtttgatgattacatattctttagttgatt 22014959  T
Q  219 tccatgagttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22014960 tccatgagttctttagttgattgttaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 22015026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 6786373 - 6786550
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6786373 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagttttgaaagctatctccatctctctccacaaaccctaa 6786472  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaa-ttgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgtt 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6786473 ttgctgtaacttgtaaggtaatgtgaaatttgaatgtaacttccttcaattctgattttgatttgatgattacatgtt 6786550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22432424 - 22432291
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22432424 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 22432325  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22432324 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 22432291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29182708 - 29182575
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182708 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 29182609  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29182608 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 29182575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 27576749 - 27576888
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttca--- 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27576749 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 27576848  T
Q  177 ---attatgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27576849 ctgattctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 27576888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 774814 - 774680
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc--tc--tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaa-ttgaatgtaatttccttcaat 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  774814 ttctttagtttagagagctatctccatccatccttctccacaaaccctaattgttgtaacttataaggtaatgtgaaatttgaatgtaatttccttcaat 774715  T
Q  179 tatgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  774714 tctgattctgatatgataattacatgttctttagt 774680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 43916091 - 43916235
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||    
T  43916091 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccataaaccctgattgttgtaaattgtaaggaaatgtgaattttaatgtaatttccttcaaatctga 43916190  T
Q  184 ttatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    || |  ||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43916191 ttcttctttaacgattgcatgttatttagttgattgccatgagtt 43916235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11472476 - 11472344
Alignment:
Q  99 agctatctccatctctctccaca---aaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttca----attatgattatgatt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||     
T  11472476 agctatcttcatctctctccacagaaaaccctaattgttgtaatttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattaattatgattctgata 11472377  T
Q  192 tgatgattacatgttctttagttgatttccatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11472376 tgatgattacatgttcttta-ttgattgccatga 11472344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 211
Target Start/End: Original strand, 42808687 - 42808784
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttcttta 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  42808687 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaatatgaaattgaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgttcttta 42808784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 33360397 - 33360489
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgtt 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  33360397 tctccacaaaccctaattctggtaaattgcaagttaatatgaaattgaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgtt 33360489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 780417 - 780362
Alignment:
Q  158 ttgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  780417 ttgaatgtaatttccttcaattctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 780362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34213020 - 34212961
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaa 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  34213020 gtttaaagagctatctccatctctctccacaaaccctagttcttgtaaattgtaaggtaa 34212961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 774875 - 774839
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  774875 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgc 774839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 780529 - 780493
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  780529 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgc 780493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 22014769 - 22014802
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22014769 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgc 22014802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 18068500 - 18068536
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18068500 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 18068536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22432485 - 22432449
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22432485 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 22432449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29182769 - 29182733
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29182769 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 29182733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3935555 - 3935300
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3935555 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctacttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 3935456  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3935455 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattataatttgatgattacatgttctttagttgattgccatgagttc 3935356  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3935355 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 3935300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38978556 - 38978382
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38978556 gcgatcactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcaattactctcctccttcttcagtttagaaagctatctccatctctctccacaaaccctaa 38978457  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatg 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38978456 ttgttgtaacttgtaaggtagtgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatg 38978382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25697700 - 25697567
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697700 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgttacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 25697601  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25697600 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 25697567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 32339602 - 32339678
Alignment:
Q  154 gaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacat--gttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  32339602 gaaattgaatgtaattttcttcaattatgattctgatttgatgattacatgagttctttagttgatttccataagtt 32339678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38978383 - 38978335
Alignment:
Q  236 tgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38978383 tgattgtcaactctaattgttaaacatgttgagtgttgttctttgcccc 38978335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8485572 - 8485531
Alignment:
Q  97 agagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaa 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8485572 agagctatctctatctctctccacaaaccctaattcttgtaa 8485531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 143
Target Start/End: Original strand, 20917027 - 20917079
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgt 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  20917027 gtttaaagagctatctccatctctctccacaaaccttagttcttgtaaattgt 20917079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25697761 - 25697725
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25697761 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 25697725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23218403 - 23218148
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23218403 gcgaccactctcctccttctccatccatcactgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagttatctccatctctctccacaaaccctaa 23218304  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23218303 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgattgccatgagttc 23218204  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23218203 tttagttgattttcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 23218148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13740435 - 13740207
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13740435 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 13740336  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13740335 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 13740236  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaa 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13740235 tttagttgattttcaactctaattgttaa 13740207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 21355794 - 21356041
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgatta---------ctctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccac 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21355794 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactttcattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccac 21355893  T
Q  121 aaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21355894 aaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaacgtgaaattgaatgtaatttccttcaattctgattctgatttgatgattacatgttctttagttgatttc 21355993  T
Q  221 catgagttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21355994 catgagttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgac 21356041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 45143908 - 45144096
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45143908 gcgatcactctcctccttctccatccatcaccgcctccgcgattactctcctcctccttcagtttagaaagctatctccatctctctccacaaaccctaa 45144007  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45144008 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 45144096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 45152677 - 45152865
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45152677 gcgatcactctcctccttctccatccatcaccgcctccgcgattactctcctcctccttcagtttagaaagctatctccatctctctccacaaaccctaa 45152776  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45152777 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 45152865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 21604412 - 21604545
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604412 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 21604511  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21604512 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 21604545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46164499 - 46164366
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46164499 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 46164400  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46164399 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 46164366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 47825894 - 47826027
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47825894 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 47825993  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47825994 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 47826027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54785295 - 54785186
Alignment:
Q  106 tccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54785295 tccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattctgatttgatgattacatgt 54785196  T
Q  206 tctttagttg 215  Q
    |||| |||||    
T  54785195 tcttaagttg 54785186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8433113 - 8432980
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8433113 ttctttagtttagaaagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgttacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgttatttccttcaatt 8433014  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8433013 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 8432980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33754142 - 33753942
Alignment:
Q  31 cgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaat 130  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||     ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33754142 cgaccactcacctacttctccatccatcaccgacgta---attactctcatccttcttcagttttgagagttatctccatctctttccacaaaccctaat 33754046  T
Q  131 tgttgtaacttgtaaggt-aatgtgaa--attgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacat--gttctttagttgatttccatga 225  Q
    ||||||||   |||| || ||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  33754045 tgttgtaa---gtaatgtgaaattgaaatattgaatgtaattttcttcaattatgattttgatttgatgattacatgagttctttagttgattgccatga 33753949  T
Q  226 gttcttt 232  Q
    | |||||    
T  33753948 gctcttt 33753942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 38115443 - 38115578
Alignment:
Q  99 agctatctccatctctctccacaa---accctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttc----aattatgattatgatt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||     
T  38115443 agctatcttcatctctctccacaacaaaccctaattgttgtaatttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattaattatgattctgata 38115542  T
Q  192 tgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38115543 tgatgattacatgtttttta-ttgattgccatgagtt 38115578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 45144082 - 45144141
Alignment:
Q  226 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45144082 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 45144141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 45152851 - 45152910
Alignment:
Q  226 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45152851 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 45152910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14800096 - 14799999
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttcttta 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  14800096 tctccacaaaccctaatttttgtaaatttcaaggtaatatgaaattaaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattacgtgttcttta 14799999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3187646 - 3187581
Alignment:
Q  153 tgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3187646 tgaaattgaatgtattttcctttaaatctgattcttctttgatgattacatgttctttaattgatt 3187581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 54785379 - 54785346
Alignment:
Q  33 accactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54785379 accactctcctccttctccatccatcaccgccgc 54785346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 8433174 - 8433138
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8433174 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 8433138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 46164560 - 46164524
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46164560 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 46164524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2338997 - 2338744
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2338997 gcgaccactctcctccttctccatccatcactgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagttatctccatctctctccacaaaccctaa 2338898  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2338897 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttg--tattacatgttctttatttgattgccatgagttc 2338800  T
Q  230 tttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2338799 tttagttgattttcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 2338744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 52893367 - 52893555
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52893367 gcgatcactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagaaagctatctccatctctctccacaaaccctaa 52893466  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52893467 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 52893555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 21239406 - 21239559
Alignment:
Q  65 gccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatg 164  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239406 gccgcgatcactctccttcttcttcagtttagaaagctatctccgtctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatg 21239505  T
Q  165 taatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239506 taatttccttcaattctgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 21239559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 9456400 - 9456533
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456400 ttctttagtttagacagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgaaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 9456499  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9456500 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 9456533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 52893541 - 52893600
Alignment:
Q  226 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52893541 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttctttgcccct 52893600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 40922976 - 40923071
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40922976 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaataagaaattgaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgttctt 40923071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 2733793 - 2733888
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  2733793 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaataagaaattgaatctattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgttctt 2733888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Original strand, 21239545 - 21239582
Alignment:
Q  226 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239545 gttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctg 21239582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4329916 - 4329855
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctctc--cacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaa 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  4329916 gtttaaagagctatctccatctctctctccacaaaccctagttctagtaaattgtaaggtaa 4329855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 84 - 285
Target Start/End: Original strand, 3174150 - 3174355
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3174150 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 3174249  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttcttt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3174250 atgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttctttagttgattgtcaactctaattgttaaacctgttgactgttgttcttt 3174349  T
Q  280 gcccct 285  Q
    ||||||    
T  3174350 gcccct 3174355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 32863634 - 32863763
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatga 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32863634 ttctttagtttagagagctatctccatccatctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattctga 32863733  T
Q  184 ttatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32863734 ttctgatttgatgattacatgttctttagt 32863763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 10572689 - 10572822
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572689 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 10572788  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10572789 gtgattctgatttgatgattacatgttctttagt 10572822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19209241 - 19209097
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatga 183  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19209241 ttcttcagtttaaagagctatctgcatctctctccataaaccctaattgttgtaaatcgtaaggtaacgtgaaattgaatgtaatttccttcaaatctga 19209142  T
Q  184 ttatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19209141 ttctgctttaatgattacatgttctttagttgattgccatgagtt 19209097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 23737872 - 23738016
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatga 183  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23737872 ttcttcagtttaaagagctatctgcatctctctccataaaccctaattgttgtaaattgtaaggtaacatgaaattgaatgtaatttccttcaaatctga 23737971  T
Q  184 ttatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23737972 ttcttctttaatgattacatgttctttagttgattgccatgagtt 23738016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Original strand, 43300188 - 43300308
Alignment:
Q  108 catctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  43300188 catctctctccataaaccctaattgttgtaaattataaggtaatgtgaaattgaatgtaatttcgttcaattctgatttttctttaatgattacatgttc 43300287  T
Q  208 tttagttgatttccatgagtt 228  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  43300288 ttttgttgatttcaatgagtt 43300308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41958717 - 41958586
Alignment:
Q  93 ttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgattt 192  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||    
T  41958717 ttagagagttatctc-atctctctccataaaccctaattgttgttaattacaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttcgttcaattctgatttttcttt 41958619  T
Q  193 gatgattacatgttctttagttgatttccatgag 226  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41958618 aatgattacatgtt-tttagttgatttcaatgag 41958586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18739453 - 18739394
Alignment:
Q  163 tgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttcca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18739453 tgtaatttccttcaattatgattctgatttgatgattacatgttatttagttgatttcca 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22273243 - 22273148
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22273243 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaataagaaattgaatctattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgttctt 22273148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18739559 - 18739449
Alignment:
Q  32 gaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttc---agtttagagagctat----ctccatctctctccacaaac 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||   | ||||||||||| |    || |||||||||||||||||    
T  18739559 gaccactctcctctttctccatccatcaccgccgc---gattactctccttcttcttcttcaatttagagagctttcttccttcatctctctccacaaac 18739463  T
Q  125 cctaattgttgtaa 138  Q
    ||||||| ||||||    
T  18739462 cctaattattgtaa 18739449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11349 - 11143
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11349 gcgaccactttcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttc---agtttagagagctatctccatctctctccacaaatcctaa 11253  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11252 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagttc 11153  T
Q  230 tttagttgat 239  Q
    ||||||||||    
T  11152 tttagttgat 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2585
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2403 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgccgcgattactctcctccttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaa 2502  T
Q  130 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2503 ttgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttca------attatgatttgatgattacatgttctttagttgatt 2585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6472377 - 6472244
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6472377 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 6472278  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6472277 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 6472244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 9371793 - 9371926
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9371793 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 9371892  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9371893 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 9371926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21358155 - 21358022
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358155 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 21358056  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21358055 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 21358022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35013107 - 35012978
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35013107 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatc 35013008  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctt 209  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35013007 ctgattctgatttgataattacatgttctt 35012978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 44660309 - 44660443
Alignment:
Q  93 ttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgattt 192  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||    
T  44660309 ttagagagttatctc-atctctctccataaaccctaattgttctaaattataaggtaatgtgaaattgaatgtaatttcgttcaattctgatttttcttt 44660407  T
Q  193 gatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44660408 aatgattacatgttctttagttgatttcaatgagtt 44660443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 31419280 - 31419367
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  31419280 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaataagaaattgaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattac 31419367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12003099 - 12003038
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctct--ccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaa 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12003099 gtttaaagagctatctccatctctctttccacacaccctaattcttgtaaattgtaaggtaa 12003038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 6472438 - 6472402
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6472438 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 6472402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 35013169 - 35013133
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35013169 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 35013133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29599384 - 29599251
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc----tctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29599384 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 29599285  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29599284 ctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 29599251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17481109 - 17480972
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  17481109 gtttaaagagctatctccatctctctccacaaatcctaattcttgtaaattgtaaggtaatgtgaaattgaatgtattttccttcaaatatgattattct 17481010  T
Q  191 ttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17481009 ttgatgattacatgttctttgattgatttccatgagtt 17480972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 324665 - 324798
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324665 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaagccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 324764  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  324765 ctgattctgatttgatgattagatgttctttagt 324798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 48184225 - 48184352
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctcca----tctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaatt 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  48184225 ttctttagtttagagagctatctccatccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttca--- 48184321  T
Q  180 atgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48184322 ---attctgatttgatgattacatgttctttagt 48184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Original strand, 26354997 - 26355125
Alignment:
Q  90 agtttagagagctatctccatc--tc--tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaa-ttgaatgtaatttccttcaattatgat 184  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26354997 agttcagagagctatctccatccatccttctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaatttgaatgtaacttccttcaattctgat 26355096  T
Q  185 tatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26355097 tctgatttgatgattacatgttctttagt 26355125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 213
Target Start/End: Original strand, 26014504 - 26014586
Alignment:
Q  131 tgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26014504 tgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattctgattctgatttgatgattacatgttatttagt 26014586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10801650 - 10801546
Alignment:
Q  121 aaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac--atgttctttagttgatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10801650 aaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaattgtcttcaattctgattctgatttgatgattacatatgttttttagttgatt 10801551  T
Q  219 tccat 223  Q
    |||||    
T  10801550 tccat 10801546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6165133 - 6165022
Alignment:
Q  119 acaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac--atgttctttagttga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  6165133 acaaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaattgtcttcaattctgattctgatttgatgattacatatgttttttacttga 6165034  T
Q  217 tttccatgagtt 228  Q
    || |||||||||    
T  6165033 ttgccatgagtt 6165022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16764621 - 16764520
Alignment:
Q  119 acaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac--atgttctttagttga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16764621 acaaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaattgtcttcaattctgattctgatttgatgattacatatgttttttagttga 16764522  T
Q  217 tt 218  Q
    ||    
T  16764521 tt 16764520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 26354930 - 26354966
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26354930 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgccgc 26354966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 6165224 - 6165191
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6165224 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgc 6165191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 10801744 - 10801711
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10801744 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgc 10801711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 26014451 - 26014487
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26014451 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 26014487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29599445 - 29599409
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgccgc 66  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29599445 gcgaccactcttctccttctccatccatcaccgccgc 29599409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 32397218 - 32397352
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatc--tc--tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaatt-gaatgtaatttccttcaat 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32397218 ttctttagtttagagagctatctccatccatccttctccacaaaccctaattgttgtaacttataaggtaatgtgaaatttgaatgtaatttccttcaat 32397317  T
Q  179 tatgattatgatttgatgattacatgttctttagt 213  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32397318 tctgattctgatttgatgattacatgttctttagt 32397352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 9302995 - 9303095
Alignment:
Q  84 ttcttcagtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatga 183  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9302995 ttctccagttcagagagttatctccatctctctccacaaaccctaattgtta-aacttgaaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattttga 9303093  T
Q  184 tt 185  Q
    ||    
T  9303094 tt 9303095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 7171047 - 7171142
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttctt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7171047 tctccacaaaccctaattcttgtaaattgcaaggtaataagaaattgaatctattttccttcaaatatgattattctctgatgattacatgttctt 7171142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14654704 - 14654645
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaa 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  14654704 gtttaaagagctatctccatctctctccacaaaccctagttcttgtaaattgtaaggtaa 14654645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 32397747 - 32397808
Alignment:
Q  91 gtttagagagctatctccatctc--tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaa 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  32397747 gtttaaagagctatctccatctctctctccacaaaccctagttcttgtaaattgtaaggtaa 32397808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 9302935 - 9302967
Alignment:
Q  31 cgaccactctcctccttcttcatccatcaccgc 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9302935 cgaccactctcctccttctccatccatcaccgc 9302967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1084 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1084
Description:

Target: scaffold1084; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1340
Alignment:
Q  99 agctatctccatctctctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttc----aattatgattatgatttga 194  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||    
T  1208 agctatcttcatctctcacaacaaacactaattgttgtaatttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattaattatgattctgatatga 1307  T
Q  195 tgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1308 tgattacatgtttttta-ttgattgccatgagtt 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1300 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold1300
Description:

Target: scaffold1300; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1067 - 908
Alignment:
Q  77 ctcctccttcttcagtttagag--agctatctccatctctctccacaa---accctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttc 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067 ctcctccatcttctgtttagattcagctatcttcatctctctccacaacaaaccctaattgttgtaatttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttc 968  T
Q  172 ct----tcaattatgattatgatttgatgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    ||    | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  967 ctttaattaattatgattctgatatgatgattatatgttcttta-ttgattgccatgagtt 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1300; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 769
Alignment:
Q  195 tgattacatgttctttagttgatttccatgagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  802 tgattacatgttctttagttgattaccatgagtt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8467 - 8366
Alignment:
Q  119 acaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac--atgttctttagttga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  8467 acaaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaattgtcttcaattctgattctgatttgatgattacatatgttttttagttga 8368  T
Q  217 tt 218  Q
    ||    
T  8367 tt 8366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 2888 - 2989
Alignment:
Q  119 acaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattac--atgttctttagttga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2888 acaaaccctaattgttgtaacttgtaagttaatgtgaaattgaatgtaattgtcttcaattctgattctgatttgatgattacatatgttttttagttga 2987  T
Q  217 tt 218  Q
    ||    
T  2988 tt 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 2797 - 2830
Alignment:
Q  30 gcgaccactctcctccttcttcatccatcaccgc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2797 gcgaccactctcctccttctccatccatcaccgc 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 211
Target Start/End: Original strand, 39631 - 39728
Alignment:
Q  114 tctccacaaaccctaattgttgtaacttgtaaggtaatgtgaaattgaatgtaatttccttcaattatgattatgatttgatgattacatgttcttta 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  39631 tctccacaaaccctaatttttgtaaatttcaaggtaatatgaaattaaatgtattttccttcaaatatgattattctctgatgattacgtgttcttta 39728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6369 times since January 2019
Visitors: 5767