View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0819_low_17 (Length: 358)

Name: NF0819_low_17
Description: NF0819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0819_low_17
NF0819_low_17
[»] chr8 (196 HSPs)
chr8 (2-345)||(6318895-6319238)
chr8 (2-345)||(26110789-26111132)
chr8 (2-345)||(3220190-3220533)
chr8 (2-345)||(43247883-43248226)
chr8 (2-345)||(19128306-19128649)
chr8 (2-345)||(18448928-18449271)
chr8 (2-345)||(32088648-32088991)
chr8 (2-345)||(19138838-19139181)
chr8 (2-345)||(32078075-32078418)
chr8 (2-345)||(9856851-9857199)
chr8 (2-345)||(15791678-15792022)
chr8 (2-344)||(26120465-26120810)
chr8 (2-345)||(251965-252310)
chr8 (2-345)||(849346-849691)
chr8 (2-345)||(6160582-6160924)
chr8 (2-345)||(210532-210877)
chr8 (2-345)||(241380-241725)
chr8 (2-345)||(724155-724500)
chr8 (2-345)||(794735-795080)
chr8 (2-345)||(36077494-36077838)
chr8 (2-345)||(36088080-36088424)
chr8 (2-345)||(36292477-36292822)
chr8 (2-345)||(36303080-36303425)
chr8 (2-345)||(6150627-6150969)
chr8 (2-344)||(15781089-15781432)
chr8 (2-345)||(3349006-3349350)
chr8 (2-345)||(3359603-3359947)
chr8 (2-345)||(13688947-13689292)
chr8 (2-345)||(29076288-29076632)
chr8 (2-345)||(29086539-29086883)
chr8 (2-345)||(44480648-44480992)
chr8 (2-345)||(44491264-44491608)
chr8 (2-345)||(9340701-9341045)
chr8 (2-345)||(9367845-9368189)
chr8 (2-345)||(31214570-31214914)
chr8 (8-345)||(20161616-20161953)
chr8 (8-344)||(23469846-23470181)
chr8 (8-345)||(19224492-19224829)
chr8 (9-344)||(18157815-18158150)
chr8 (8-344)||(16746560-16746895)
chr8 (9-344)||(30315082-30315421)
chr8 (8-344)||(19417911-19418247)
chr8 (8-344)||(19428486-19428822)
chr8 (9-344)||(18153297-18153631)
chr8 (8-344)||(18769522-18769858)
chr8 (9-342)||(40213555-40213887)
chr8 (129-345)||(13697185-13697403)
chr8 (9-345)||(22167409-22167748)
chr8 (9-345)||(22136244-22136583)
chr8 (9-345)||(3843081-3843415)
chr8 (9-341)||(20260005-20260335)
chr8 (9-341)||(21046635-21046965)
chr8 (149-345)||(20195543-20195739)
chr8 (212-345)||(23290458-23290590)
chr8 (114-345)||(23363687-23363920)
chr8 (100-345)||(7018894-7019141)
chr8 (8-161)||(20195697-20195851)
chr8 (218-344)||(26735573-26735698)
chr8 (24-324)||(17519552-17519857)
chr8 (24-326)||(40002576-40002885)
chr8 (215-325)||(23270531-23270641)
chr8 (132-341)||(19460556-19460767)
chr8 (132-341)||(19558234-19558445)
chr8 (215-344)||(15998808-15998936)
chr8 (24-326)||(45568410-45568719)
chr8 (130-341)||(22211869-22212082)
chr8 (30-305)||(28902839-28903119)
chr8 (9-191)||(7018768-7018956)
chr8 (132-341)||(23271689-23271900)
chr8 (132-322)||(29378961-29379157)
chr8 (29-322)||(21287756-21288056)
chr8 (268-345)||(21547625-21547702)
chr8 (130-341)||(8031392-8031608)
chr8 (9-142)||(22211776-22211911)
chr8 (30-326)||(19942585-19942884)
chr8 (29-189)||(21298504-21298666)
chr8 (240-317)||(12541041-12541118)
chr8 (249-341)||(15969520-15969610)
chr8 (9-161)||(19460707-19460862)
chr8 (9-161)||(19558385-19558540)
chr8 (30-140)||(19956838-19956949)
chr8 (30-192)||(1210243-1210408)
chr8 (30-173)||(15934132-15934277)
chr8 (29-210)||(21540426-21540606)
chr8 (219-312)||(24498761-24498857)
chr8 (104-326)||(21298332-21298560)
chr8 (9-69)||(23370386-23370446)
chr8 (30-143)||(18321659-18321773)
chr8 (219-324)||(17687372-17687479)
chr8 (33-326)||(26832425-26832722)
chr8 (30-305)||(29692683-29692963)
chr8 (9-161)||(23271594-23271749)
chr8 (245-326)||(15934381-15934463)
chr8 (25-182)||(33052374-33052531)
chr8 (30-173)||(18152148-18152295)
chr8 (30-300)||(40845888-40846163)
chr8 (30-145)||(14990563-14990681)
chr8 (24-161)||(29379097-29379236)
chr8 (9-115)||(8031593-8031702)
chr8 (237-312)||(24634749-24634826)
chr8 (30-144)||(45538938-45539055)
chr8 (245-318)||(19706874-19706947)
chr8 (30-165)||(22462138-22462275)
chr8 (239-331)||(24679101-24679194)
chr8 (30-189)||(1744640-1744802)
chr8 (30-173)||(14989952-14990099)
chr8 (244-326)||(22673149-22673233)
chr8 (30-144)||(25163605-25163721)
chr8 (34-192)||(12541131-12541289)
chr8 (248-326)||(20383060-20383139)
chr8 (219-318)||(27739279-27739382)
chr8 (14-144)||(33560699-33560833)
chr8 (30-304)||(43639155-43639431)
chr8 (30-146)||(2810340-2810458)
chr8 (239-305)||(16376048-16376114)
chr8 (245-303)||(19153407-19153464)
chr8 (30-132)||(19505938-19506040)
chr8 (241-326)||(19957053-19957139)
chr8 (30-144)||(20256011-20256128)
chr8 (30-144)||(20382894-20383011)
chr8 (30-144)||(30421934-30422050)
chr8 (244-305)||(43773491-43773553)
chr8 (30-189)||(17687473-17687631)
chr8 (29-144)||(18679348-18679465)
chr8 (29-144)||(18718537-18718654)
chr8 (244-326)||(22662436-22662520)
chr8 (219-306)||(23433607-23433693)
chr8 (30-69)||(12193524-12193563)
chr8 (30-69)||(12437952-12437991)
chr8 (30-69)||(13431121-13431160)
chr8 (30-69)||(17701352-17701391)
chr8 (30-69)||(17928664-17928703)
chr8 (39-144)||(18121618-18121725)
chr8 (239-306)||(18557421-18557487)
chr8 (81-187)||(18557523-18557630)
chr8 (30-69)||(19707119-19707158)
chr8 (30-69)||(21932492-21932531)
chr8 (30-187)||(25850494-25850653)
chr8 (243-305)||(30422117-30422180)
chr8 (30-192)||(39693018-39693184)
chr8 (245-304)||(43644269-43644328)
chr8 (30-69)||(43644507-43644546)
chr8 (30-69)||(43773730-43773769)
chr8 (30-69)||(45292445-45292484)
chr8 (239-289)||(1210421-1210471)
chr8 (237-307)||(13644660-13644728)
chr8 (237-307)||(13745085-13745153)
chr8 (30-144)||(17796954-17797070)
chr8 (239-289)||(17928475-17928525)
chr8 (30-174)||(18772196-18772342)
chr8 (39-144)||(22707865-22707971)
chr8 (131-184)||(24678970-24679024)
chr8 (244-305)||(33560932-33560994)
chr8 (243-303)||(14990196-14990257)
chr8 (39-76)||(17879237-17879274)
chr8 (245-318)||(18772050-18772123)
chr8 (239-300)||(23192484-23192545)
chr8 (24-69)||(24634929-24634974)
chr8 (245-318)||(25163429-25163502)
chr8 (245-305)||(45539155-45539215)
chr8 (245-304)||(15336807-15336867)
chr8 (245-304)||(15425872-15425932)
chr8 (245-304)||(15517176-15517236)
chr8 (244-326)||(16206620-16206703)
chr8 (30-144)||(16206831-16206947)
chr8 (29-69)||(17442319-17442359)
chr8 (245-304)||(18121827-18121887)
chr8 (30-173)||(22662619-22662766)
chr8 (30-69)||(15336589-15336628)
chr8 (30-69)||(15425654-15425693)
chr8 (30-69)||(15516958-15516997)
chr8 (30-69)||(17526233-17526272)
chr8 (219-312)||(17879066-17879161)
chr8 (30-69)||(19155854-19155893)
chr8 (248-331)||(19506063-19506146)
chr8 (245-304)||(20256232-20256291)
chr8 (30-69)||(23264126-23264165)
chr8 (30-69)||(24498610-24498649)
chr8 (34-69)||(24645942-24645977)
chr8 (245-304)||(25850708-25850767)
chr8 (30-69)||(27739493-27739532)
chr8 (30-65)||(36104811-36104846)
chr8 (245-326)||(12758456-12758538)
chr8 (140-189)||(17879155-17879205)
chr8 (245-326)||(18679163-18679245)
chr8 (245-326)||(18718352-18718434)
chr8 (131-193)||(27739402-27739464)
chr8 (102-187)||(28888788-28888874)
chr8 (244-305)||(39692907-39692969)
chr8 (238-307)||(5825261-5825328)
chr8 (100-192)||(6589865-6589958)
chr8 (247-315)||(17796783-17796852)
chr8 (244-276)||(6407159-6407191)
chr8 (33-69)||(6407336-6407372)
chr8 (244-326)||(18152393-18152477)
chr8 (240-288)||(33052303-33052351)
[»] chr5 (227 HSPs)
chr5 (2-345)||(27602870-27603213)
chr5 (2-345)||(39352953-39353296)
chr5 (2-345)||(16003343-16003686)
chr5 (2-345)||(27622219-27622562)
chr5 (2-345)||(39364946-39365289)
chr5 (2-345)||(5290027-5290371)
chr5 (2-345)||(5300598-5300942)
chr5 (2-345)||(30069355-30069699)
chr5 (2-345)||(6131256-6131599)
chr5 (2-345)||(9347007-9347350)
chr5 (2-345)||(15992781-15993124)
chr5 (2-345)||(23362576-23362919)
chr5 (2-345)||(34772375-34772718)
chr5 (2-345)||(34783320-34783663)
chr5 (2-345)||(36582009-36582353)
chr5 (2-345)||(36592564-36592908)
chr5 (2-345)||(9336420-9336763)
chr5 (2-345)||(40390822-40391165)
chr5 (2-345)||(40401484-40401827)
chr5 (2-345)||(22146988-22147330)
chr5 (2-345)||(31419128-31419471)
chr5 (2-344)||(22559902-22560244)
chr5 (2-345)||(23296742-23297087)
chr5 (2-345)||(23307310-23307655)
chr5 (2-345)||(23707907-23708252)
chr5 (2-345)||(30226946-30227291)
chr5 (2-345)||(30237473-30237818)
chr5 (2-345)||(31833948-31834295)
chr5 (2-345)||(31844426-31844773)
chr5 (2-345)||(40513439-40513784)
chr5 (2-345)||(10754957-10755300)
chr5 (2-341)||(22157571-22157909)
chr5 (2-345)||(27204257-27204600)
chr5 (2-345)||(14557467-14557812)
chr5 (2-345)||(14568104-14568449)
chr5 (2-345)||(23697249-23697594)
chr5 (2-345)||(33951250-33951595)
chr5 (2-345)||(37728703-37729047)
chr5 (2-345)||(37740019-37740363)
chr5 (2-345)||(39490400-39490745)
chr5 (2-345)||(39501590-39501935)
chr5 (2-345)||(42043249-42043594)
chr5 (2-345)||(42053824-42054169)
chr5 (2-345)||(31449019-31449362)
chr5 (2-345)||(35215971-35216315)
chr5 (2-345)||(35226555-35226899)
chr5 (2-345)||(22676581-22676927)
chr5 (2-345)||(22686472-22686818)
chr5 (2-345)||(9376913-9377257)
chr5 (2-345)||(14041062-14041406)
chr5 (2-345)||(14446452-14446796)
chr5 (2-345)||(14457064-14457408)
chr5 (2-345)||(15693483-15693827)
chr5 (2-345)||(15740433-15740777)
chr5 (2-345)||(15769593-15769937)
chr5 (2-345)||(24567554-24567898)
chr5 (2-345)||(24816337-24816681)
chr5 (2-345)||(24826925-24827269)
chr5 (2-345)||(27460626-27460970)
chr5 (2-345)||(27471025-27471369)
chr5 (2-345)||(6976273-6976619)
chr5 (2-345)||(6986763-6987109)
chr5 (2-345)||(14030509-14030853)
chr5 (2-345)||(17607524-17607868)
chr5 (2-345)||(17618139-17618483)
chr5 (2-345)||(17719382-17719726)
chr5 (2-345)||(17730034-17730378)
chr5 (2-345)||(27041663-27042007)
chr5 (2-345)||(27052287-27052631)
chr5 (2-345)||(31348998-31349342)
chr5 (2-345)||(31359612-31359956)
chr5 (2-345)||(36688159-36688503)
chr5 (2-345)||(36698725-36699069)
chr5 (8-345)||(43043123-43043460)
chr5 (2-345)||(24808377-24808721)
chr5 (8-345)||(1121354-1121691)
chr5 (8-345)||(1108596-1108933)
chr5 (8-344)||(20798167-20798502)
chr5 (8-344)||(19464442-19464779)
chr5 (8-344)||(23406917-23407252)
chr5 (8-344)||(8522312-8522648)
chr5 (8-344)||(19478472-19478809)
chr5 (8-344)||(36084932-36085267)
chr5 (8-344)||(36229210-36229545)
chr5 (7-344)||(17446150-17446486)
chr5 (23-344)||(42395470-42395790)
chr5 (8-344)||(43621347-43621683)
chr5 (8-344)||(20552286-20552622)
chr5 (8-325)||(34063092-34063409)
chr5 (8-321)||(20562796-20563110)
chr5 (8-341)||(21702581-21702918)
chr5 (8-344)||(24982872-24983209)
chr5 (8-344)||(34052431-34052766)
chr5 (7-325)||(17456784-17457102)
chr5 (8-325)||(24925609-24925928)
chr5 (36-344)||(23392900-23393207)
chr5 (8-341)||(21705421-21705765)
chr5 (130-345)||(7031608-7031823)
chr5 (9-324)||(37407119-37407434)
chr5 (9-345)||(106592-106927)
chr5 (9-345)||(20625238-20625574)
chr5 (9-342)||(20417376-20417707)
chr5 (9-324)||(32753418-32753733)
chr5 (24-324)||(20215591-20215897)
chr5 (128-345)||(21420215-21420431)
chr5 (33-326)||(40228012-40228312)
chr5 (29-324)||(23477732-23478032)
chr5 (2-161)||(7031762-7031921)
chr5 (130-324)||(13522581-13522779)
chr5 (133-345)||(35543694-35543908)
chr5 (132-341)||(40033321-40033534)
chr5 (130-341)||(36096215-36096428)
chr5 (130-341)||(36097672-36097885)
chr5 (130-341)||(20168630-20168843)
chr5 (31-326)||(32160102-32160404)
chr5 (132-324)||(23487908-23488104)
chr5 (29-326)||(25112357-25112661)
chr5 (29-326)||(25171448-25171752)
chr5 (179-341)||(13533323-13533486)
chr5 (132-341)||(1914787-1915000)
chr5 (24-341)||(11208484-11208806)
chr5 (9-142)||(36096122-36096257)
chr5 (9-142)||(36097579-36097714)
chr5 (9-142)||(35543599-35543733)
chr5 (9-142)||(13522737-13522872)
chr5 (9-131)||(20168537-20168661)
chr5 (30-326)||(10848126-10848426)
chr5 (9-132)||(13533474-13533599)
chr5 (30-326)||(7746177-7746478)
chr5 (24-161)||(1914940-1915079)
chr5 (30-144)||(20550432-20550547)
chr5 (130-245)||(13403702-13403817)
chr5 (240-331)||(26056184-26056276)
chr5 (30-144)||(643184-643299)
chr5 (30-326)||(28464821-28465120)
chr5 (29-161)||(40033247-40033381)
chr5 (29-187)||(20567302-20567461)
chr5 (29-145)||(23488061-23488178)
chr5 (244-312)||(21659581-21659649)
chr5 (30-326)||(33932622-33932921)
chr5 (30-144)||(2156757-2156872)
chr5 (47-189)||(12078357-12078502)
chr5 (30-144)||(21072720-21072835)
chr5 (30-144)||(21199484-21199599)
chr5 (30-172)||(22586466-22586609)
chr5 (30-326)||(30116320-30116619)
chr5 (30-192)||(34637065-34637226)
chr5 (30-174)||(16607020-16607166)
chr5 (25-115)||(26056004-26056093)
chr5 (253-326)||(31117232-31117306)
chr5 (239-305)||(31589637-31589703)
chr5 (30-326)||(35932490-35932790)
chr5 (241-305)||(6513128-6513193)
chr5 (30-161)||(34637976-34638109)
chr5 (245-305)||(13546223-13546283)
chr5 (245-304)||(9399318-9399377)
chr5 (30-144)||(12353279-12353393)
chr5 (44-161)||(13403755-13403874)
chr5 (30-144)||(23880604-23880719)
chr5 (30-326)||(28138958-28139260)
chr5 (30-144)||(23392088-23392205)
chr5 (245-326)||(25097528-25097610)
chr5 (245-326)||(25155498-25155580)
chr5 (239-305)||(26120517-26120583)
chr5 (30-326)||(35986716-35987016)
chr5 (30-114)||(6498806-6498891)
chr5 (245-305)||(11993265-11993326)
chr5 (30-192)||(20968701-20968866)
chr5 (245-305)||(90125-90185)
chr5 (244-326)||(3246140-3246224)
chr5 (30-304)||(19536781-19537058)
chr5 (30-302)||(26764883-26765157)
chr5 (244-326)||(30742336-30742420)
chr5 (245-304)||(643402-643461)
chr5 (30-69)||(3245925-3245964)
chr5 (30-69)||(4886637-4886676)
chr5 (33-144)||(6512916-6513030)
chr5 (30-69)||(9088583-9088622)
chr5 (30-144)||(9399099-9399214)
chr5 (30-69)||(13546008-13546047)
chr5 (30-69)||(15516584-15516623)
chr5 (245-326)||(17814317-17814400)
chr5 (30-69)||(21100186-21100225)
chr5 (30-69)||(21659826-21659865)
chr5 (30-69)||(25740725-25740764)
chr5 (30-69)||(29138889-29138928)
chr5 (30-69)||(31117493-31117532)
chr5 (30-69)||(31146118-31146157)
chr5 (33-147)||(89907-90024)
chr5 (30-68)||(13736618-13736656)
chr5 (245-326)||(22000729-22000811)
chr5 (245-326)||(26766537-26766619)
chr5 (244-304)||(13736773-13736834)
chr5 (130-190)||(23589237-23589298)
chr5 (245-318)||(23880428-23880501)
chr5 (244-304)||(33022040-33022101)
chr5 (239-304)||(39799536-39799601)
chr5 (244-326)||(4886317-4886401)
chr5 (248-326)||(6498666-6498746)
chr5 (245-304)||(12353496-12353556)
chr5 (245-305)||(20968623-20968683)
chr5 (245-305)||(21199702-21199762)
chr5 (30-144)||(23413457-23413573)
chr5 (220-312)||(24495158-24495248)
chr5 (237-312)||(9823663-9823736)
chr5 (94-192)||(17263182-17263281)
chr5 (30-69)||(17814580-17814619)
chr5 (248-326)||(23413679-23413758)
chr5 (30-69)||(26783969-26784008)
chr5 (30-69)||(30742596-30742635)
chr5 (30-69)||(39799359-39799398)
chr5 (244-305)||(15516347-15516409)
chr5 (239-305)||(23589095-23589161)
chr5 (39-69)||(25097319-25097349)
chr5 (39-69)||(25155289-25155319)
chr5 (241-306)||(22747800-22747863)
chr5 (245-318)||(26783716-26783789)
chr5 (8-37)||(42395450-42395479)
chr5 (244-326)||(9088324-9088408)
chr5 (244-276)||(14087239-14087271)
chr5 (130-189)||(20567330-20567390)
chr5 (14-69)||(25930622-25930678)
chr5 (219-271)||(26013259-26013310)
chr5 (101-192)||(26013301-26013393)
chr5 (248-326)||(29139107-29139187)
chr5 (244-276)||(31487643-31487675)
chr5 (33-69)||(31487850-31487886)
[»] chr3 (298 HSPs)
chr3 (2-345)||(23767441-23767784)
chr3 (2-345)||(4175102-4175445)
chr3 (2-345)||(6180873-6181216)
chr3 (2-345)||(6221047-6221390)
chr3 (2-345)||(13557121-13557464)
chr3 (2-345)||(23756845-23757188)
chr3 (2-345)||(37865992-37866335)
chr3 (2-345)||(37885125-37885468)
chr3 (2-345)||(9994238-9994581)
chr3 (2-345)||(13121209-13121552)
chr3 (2-345)||(14475768-14476111)
chr3 (2-345)||(19788569-19788912)
chr3 (2-345)||(5537366-5537709)
chr3 (2-345)||(5547950-5548293)
chr3 (2-345)||(9982230-9982573)
chr3 (2-345)||(12249784-12250127)
chr3 (2-345)||(13131451-13131794)
chr3 (2-345)||(23647295-23647639)
chr3 (2-345)||(6501348-6501691)
chr3 (2-345)||(12237958-12238301)
chr3 (2-345)||(19777932-19778275)
chr3 (2-345)||(39673228-39673570)
chr3 (2-345)||(10655608-10655952)
chr3 (2-345)||(20684124-20684466)
chr3 (2-345)||(6490694-6491037)
chr3 (2-344)||(10627286-10627629)
chr3 (2-345)||(5579979-5580324)
chr3 (2-345)||(5866041-5866386)
chr3 (2-345)||(5876640-5876985)
chr3 (2-345)||(8774203-8774547)
chr3 (2-345)||(10098614-10098958)
chr3 (2-345)||(24383864-24384209)
chr3 (8-345)||(23635256-23635593)
chr3 (2-345)||(37759216-37759560)
chr3 (2-345)||(13373011-13373356)
chr3 (2-345)||(13394199-13394544)
chr3 (2-345)||(18483590-18483934)
chr3 (2-345)||(20720658-20721003)
chr3 (2-345)||(38194270-38194614)
chr3 (2-345)||(39382236-39382580)
chr3 (2-345)||(12297146-12297492)
chr3 (2-345)||(504513-504857)
chr3 (2-345)||(526879-527223)
chr3 (2-345)||(4743284-4743628)
chr3 (2-345)||(4753871-4754215)
chr3 (2-345)||(5510242-5510586)
chr3 (2-345)||(5520420-5520764)
chr3 (2-345)||(11272729-11273074)
chr3 (2-345)||(13383605-13383950)
chr3 (2-345)||(35186923-35187267)
chr3 (2-345)||(39371599-39371943)
chr3 (2-345)||(41683224-41683568)
chr3 (2-345)||(41693793-41694137)
chr3 (2-345)||(20673539-20673882)
chr3 (2-345)||(12287324-12287670)
chr3 (2-345)||(28314577-28314922)
chr3 (2-345)||(38204805-38205150)
chr3 (2-345)||(5628363-5628707)
chr3 (2-345)||(16385621-16385965)
chr3 (2-345)||(24659446-24659790)
chr3 (2-345)||(24670026-24670370)
chr3 (2-345)||(28325193-28325536)
chr3 (8-345)||(29461564-29461901)
chr3 (8-345)||(29472416-29472753)
chr3 (9-344)||(933174-933510)
chr3 (8-344)||(1794835-1795170)
chr3 (8-325)||(11217076-11217393)
chr3 (8-344)||(1784422-1784757)
chr3 (8-344)||(11206425-11206760)
chr3 (8-344)||(48336790-48337125)
chr3 (2-344)||(19887698-19888040)
chr3 (8-344)||(7804869-7805205)
chr3 (8-344)||(24706906-24707242)
chr3 (8-344)||(7794958-7795294)
chr3 (8-325)||(9391555-9391872)
chr3 (7-344)||(4403822-4404157)
chr3 (9-324)||(11163398-11163712)
chr3 (8-322)||(9381009-9381323)
chr3 (8-344)||(9535157-9535493)
chr3 (8-344)||(17910353-17910692)
chr3 (7-344)||(38314243-38314583)
chr3 (9-324)||(13262024-13262340)
chr3 (27-344)||(4433309-4433624)
chr3 (9-326)||(8740478-8740795)
chr3 (9-344)||(14258416-14258751)
chr3 (9-345)||(27882930-27883265)
chr3 (9-341)||(9006861-9007192)
chr3 (9-324)||(14322043-14322358)
chr3 (9-345)||(8996309-8996644)
chr3 (9-324)||(16076494-16076811)
chr3 (9-345)||(1053255-1053591)
chr3 (9-345)||(17281787-17282122)
chr3 (9-344)||(29906534-29906869)
chr3 (130-345)||(8784817-8785034)
chr3 (9-345)||(1063684-1064020)
chr3 (9-345)||(13199598-13199936)
chr3 (9-324)||(29947699-29948016)
chr3 (9-324)||(29996853-29997170)
chr3 (9-312)||(29933913-29934217)
chr3 (9-312)||(29983067-29983371)
chr3 (9-324)||(2245928-2246248)
chr3 (134-344)||(15194516-15194726)
chr3 (191-345)||(33650747-33650901)
chr3 (152-344)||(13601782-13601973)
chr3 (133-344)||(28168659-28168870)
chr3 (9-341)||(31114340-31114677)
chr3 (9-260)||(16671515-16671766)
chr3 (2-151)||(14465332-14465481)
chr3 (215-345)||(11530344-11530474)
chr3 (9-324)||(51989499-51989821)
chr3 (2-145)||(8784989-8785132)
chr3 (29-341)||(13953607-13953923)
chr3 (186-344)||(19121370-19121527)
chr3 (24-324)||(22150605-22150911)
chr3 (29-324)||(17006553-17006854)
chr3 (148-303)||(18857426-18857580)
chr3 (21-345)||(14580685-14581012)
chr3 (9-191)||(15663059-15663242)
chr3 (29-326)||(15832765-15833068)
chr3 (191-318)||(24393356-24393483)
chr3 (100-345)||(15663180-15663427)
chr3 (236-345)||(35579002-35579111)
chr3 (29-326)||(49989618-49989921)
chr3 (9-187)||(15651424-15651603)
chr3 (100-342)||(15651545-15651789)
chr3 (135-324)||(27172428-27172622)
chr3 (24-341)||(41045086-41045408)
chr3 (237-343)||(13076442-13076547)
chr3 (132-324)||(10528733-10528931)
chr3 (132-324)||(17017389-17017586)
chr3 (29-326)||(12753121-12753425)
chr3 (15-161)||(17961073-17961223)
chr3 (163-345)||(21735713-21735896)
chr3 (24-322)||(11909535-11909840)
chr3 (9-132)||(21735868-21735992)
chr3 (132-326)||(45862162-45862362)
chr3 (104-326)||(15848499-15848726)
chr3 (9-161)||(28168811-28168965)
chr3 (246-344)||(7608861-7608958)
chr3 (131-326)||(37411992-37412193)
chr3 (132-326)||(13147650-13147851)
chr3 (24-192)||(18005988-18006158)
chr3 (280-345)||(27244975-27245040)
chr3 (29-190)||(15848699-15848862)
chr3 (29-189)||(51340509-51340671)
chr3 (240-341)||(27849572-27849668)
chr3 (240-331)||(13931347-13931439)
chr3 (21-161)||(27172565-27172706)
chr3 (30-144)||(52919976-52920091)
chr3 (104-323)||(51340340-51340565)
chr3 (25-192)||(13931453-13931620)
chr3 (30-187)||(8729489-8729648)
chr3 (30-187)||(9081376-9081535)
chr3 (9-159)||(45862066-45862220)
chr3 (24-132)||(12410292-12410399)
chr3 (24-161)||(10528871-10529010)
chr3 (250-324)||(17960968-17961043)
chr3 (30-144)||(15902736-15902853)
chr3 (219-324)||(17769645-17769754)
chr3 (219-324)||(19070946-19071055)
chr3 (30-305)||(2025467-2025744)
chr3 (239-304)||(13410752-13410817)
chr3 (33-305)||(50299613-50299887)
chr3 (39-190)||(932342-932492)
chr3 (30-326)||(17239424-17239725)
chr3 (29-159)||(37412134-37412266)
chr3 (30-144)||(16032137-16032252)
chr3 (30-145)||(21606157-21606275)
chr3 (30-144)||(26418178-26418293)
chr3 (30-144)||(29951939-29952054)
chr3 (30-144)||(30001093-30001208)
chr3 (30-192)||(49643263-49643429)
chr3 (245-326)||(2560542-2560624)
chr3 (239-305)||(11078134-11078200)
chr3 (30-144)||(12963586-12963703)
chr3 (30-192)||(13698862-13699026)
chr3 (30-144)||(22140304-22140420)
chr3 (303-345)||(30390841-30390883)
chr3 (245-318)||(3238057-3238130)
chr3 (239-331)||(21316905-21316998)
chr3 (245-318)||(23538884-23538957)
chr3 (30-143)||(30054683-30054799)
chr3 (30-192)||(49554003-49554168)
chr3 (30-144)||(8874621-8874737)
chr3 (24-115)||(13147838-13147930)
chr3 (253-305)||(20724466-20724518)
chr3 (30-144)||(22804523-22804641)
chr3 (30-192)||(41494490-41494654)
chr3 (239-305)||(6252799-6252866)
chr3 (30-140)||(12967854-12967965)
chr3 (30-144)||(14072240-14072354)
chr3 (30-187)||(14077822-14077980)
chr3 (239-306)||(19198588-19198655)
chr3 (248-303)||(22804746-22804801)
chr3 (30-184)||(27849689-27849843)
chr3 (30-192)||(38178147-38178312)
chr3 (30-144)||(14954969-14955085)
chr3 (29-161)||(17017526-17017660)
chr3 (30-144)||(21640406-21640523)
chr3 (239-305)||(22770571-22770637)
chr3 (245-326)||(26418397-26418479)
chr3 (30-144)||(28581645-28581761)
chr3 (30-144)||(40799437-40799553)
chr3 (30-326)||(40850333-40850633)
chr3 (244-305)||(47207083-47207145)
chr3 (240-317)||(8693512-8693589)
chr3 (240-317)||(9045399-9045476)
chr3 (240-312)||(15647145-15647218)
chr3 (253-305)||(6090105-6090157)
chr3 (30-192)||(7833129-7833292)
chr3 (245-305)||(14063710-14063770)
chr3 (30-145)||(17697158-17697274)
chr3 (244-326)||(28581462-28581546)
chr3 (244-303)||(49669207-49669267)
chr3 (30-69)||(1728518-1728557)
chr3 (105-144)||(11074019-11074058)
chr3 (30-192)||(11223054-11223220)
chr3 (240-318)||(12410413-12410492)
chr3 (30-69)||(13410549-13410588)
chr3 (245-304)||(13939275-13939334)
chr3 (239-306)||(14078029-14078096)
chr3 (30-69)||(15961132-15961171)
chr3 (30-69)||(16881906-16881945)
chr3 (30-69)||(19249914-19249953)
chr3 (30-144)||(20724630-20724745)
chr3 (30-69)||(21638746-21638785)
chr3 (30-69)||(22128662-22128701)
chr3 (30-69)||(22463595-22463634)
chr3 (30-69)||(22465053-22465092)
chr3 (30-69)||(24776035-24776074)
chr3 (30-69)||(25398759-25398798)
chr3 (30-69)||(29855026-29855065)
chr3 (30-69)||(46796870-46796909)
chr3 (30-69)||(47207321-47207360)
chr3 (30-69)||(47405925-47405964)
chr3 (245-326)||(49554216-49554299)
chr3 (240-317)||(932249-932327)
chr3 (33-130)||(1463847-1463942)
chr3 (239-289)||(6174730-6174780)
chr3 (245-326)||(12963806-12963888)
chr3 (239-305)||(13698783-13698849)
chr3 (30-305)||(13781087-13781367)
chr3 (30-144)||(13947877-13947994)
chr3 (34-132)||(16305651-16305749)
chr3 (257-331)||(16305781-16305855)
chr3 (245-326)||(29952157-29952239)
chr3 (245-326)||(30001311-30001393)
chr3 (244-305)||(30054898-30054960)
chr3 (30-144)||(53057232-53057349)
chr3 (244-304)||(13823446-13823507)
chr3 (247-300)||(20645537-20645590)
chr3 (244-304)||(31302728-31302789)
chr3 (253-318)||(52919830-52919895)
chr3 (219-331)||(1463738-1463853)
chr3 (244-326)||(2782835-2782919)
chr3 (30-144)||(2784604-2784722)
chr3 (131-190)||(4243694-4243754)
chr3 (104-144)||(8710404-8710444)
chr3 (104-144)||(9062291-9062331)
chr3 (238-302)||(12396450-12396514)
chr3 (33-69)||(18122119-18122155)
chr3 (246-305)||(20628153-20628213)
chr3 (244-326)||(21638991-21639075)
chr3 (244-303)||(22463751-22463811)
chr3 (244-303)||(22465209-22465269)
chr3 (34-69)||(2560804-2560839)
chr3 (30-69)||(3238309-3238348)
chr3 (30-69)||(5213195-5213234)
chr3 (30-69)||(6174954-6174993)
chr3 (102-192)||(10928533-10928624)
chr3 (30-69)||(11078307-11078346)
chr3 (43-305)||(12726750-12727016)
chr3 (245-304)||(12967687-12967746)
chr3 (30-69)||(16659120-16659159)
chr3 (30-69)||(16879634-16879673)
chr3 (30-69)||(18143248-18143287)
chr3 (30-69)||(20627936-20627975)
chr3 (81-187)||(22770414-22770521)
chr3 (31-160)||(23538666-23538797)
chr3 (243-305)||(53057446-53057509)
chr3 (244-305)||(1728734-1728796)
chr3 (239-305)||(4243830-4243896)
chr3 (245-318)||(11189378-11189452)
chr3 (133-190)||(13410623-13410681)
chr3 (239-289)||(15961340-15961389)
chr3 (219-285)||(20736609-20736673)
chr3 (244-305)||(40799276-40799338)
chr3 (244-305)||(46797114-46797176)
chr3 (152-189)||(8710418-8710455)
chr3 (152-189)||(9062305-9062342)
chr3 (262-326)||(10849947-10850012)
chr3 (101-185)||(12756018-12756103)
chr3 (130-190)||(22770433-22770494)
chr3 (244-276)||(2784473-2784505)
chr3 (242-306)||(20747315-20747377)
chr3 (246-305)||(29854784-29854844)
chr3 (33-69)||(33582848-33582884)
chr3 (41-69)||(49669003-49669031)
[»] chr1 (211 HSPs)
chr1 (2-345)||(4177390-4177733)
chr1 (2-345)||(5640099-5640442)
chr1 (2-345)||(19178434-19178777)
chr1 (2-345)||(19187313-19187656)
chr1 (2-345)||(12898370-12898713)
chr1 (2-342)||(33084039-33084380)
chr1 (2-345)||(5650656-5650999)
chr1 (2-345)||(21863136-21863479)
chr1 (2-345)||(10998173-10998516)
chr1 (2-345)||(12624170-12624513)
chr1 (2-345)||(35649080-35649425)
chr1 (2-345)||(38094549-38094894)
chr1 (2-345)||(38105174-38105519)
chr1 (2-345)||(12614705-12615048)
chr1 (2-345)||(12730022-12730365)
chr1 (2-345)||(12740615-12740958)
chr1 (2-345)||(36236818-36237163)
chr1 (2-345)||(36247365-36247710)
chr1 (2-345)||(21877241-21877585)
chr1 (2-345)||(35012403-35012741)
chr1 (2-345)||(3171096-3171440)
chr1 (2-345)||(3181698-3182042)
chr1 (2-345)||(7506775-7507120)
chr1 (2-345)||(7517372-7517717)
chr1 (2-345)||(35404781-35405126)
chr1 (2-345)||(35638428-35638770)
chr1 (2-345)||(5832692-5833036)
chr1 (2-345)||(5843294-5843638)
chr1 (2-345)||(51629576-51629921)
chr1 (2-345)||(51656837-51657182)
chr1 (2-345)||(2538010-2538354)
chr1 (2-345)||(47608320-47608664)
chr1 (2-345)||(47618928-47619272)
chr1 (8-325)||(7689854-7690174)
chr1 (8-345)||(5973233-5973570)
chr1 (8-345)||(154683-155021)
chr1 (8-344)||(4250959-4251298)
chr1 (8-325)||(20441711-20442028)
chr1 (7-325)||(18382297-18382615)
chr1 (27-344)||(7677320-7677637)
chr1 (9-345)||(12944685-12945020)
chr1 (8-344)||(39586448-39586782)
chr1 (8-278)||(148608-148879)
chr1 (8-344)||(39194488-39194826)
chr1 (9-324)||(17956734-17957051)
chr1 (133-345)||(23580816-23581028)
chr1 (2-209)||(4166870-4167077)
chr1 (9-345)||(20196088-20196424)
chr1 (9-345)||(22610371-22610709)
chr1 (9-345)||(11195464-11195800)
chr1 (9-345)||(674922-675256)
chr1 (9-345)||(14388523-14388860)
chr1 (9-345)||(41133013-41133349)
chr1 (9-345)||(18311369-18311705)
chr1 (104-344)||(47194680-47194919)
chr1 (196-345)||(16710308-16710457)
chr1 (8-191)||(47194891-47195074)
chr1 (212-345)||(4717606-4717739)
chr1 (9-341)||(5929054-5929390)
chr1 (9-341)||(23926406-23926744)
chr1 (149-298)||(9050994-9051143)
chr1 (29-341)||(28379337-28379654)
chr1 (33-324)||(22018690-22018987)
chr1 (2-145)||(23580715-23580857)
chr1 (235-345)||(25218042-25218152)
chr1 (235-345)||(36551159-36551269)
chr1 (236-345)||(13223528-13223637)
chr1 (236-345)||(24049120-24049229)
chr1 (236-345)||(36100015-36100124)
chr1 (130-345)||(46181367-46181585)
chr1 (24-324)||(26548673-26548979)
chr1 (238-345)||(9749843-9749950)
chr1 (29-324)||(17370400-17370701)
chr1 (29-341)||(19170747-19171063)
chr1 (26-323)||(34255935-34256238)
chr1 (130-341)||(45071117-45071330)
chr1 (132-341)||(20251148-20251361)
chr1 (104-326)||(22642220-22642448)
chr1 (9-161)||(9050882-9051036)
chr1 (9-161)||(46181275-46181429)
chr1 (130-284)||(28473660-28473818)
chr1 (24-189)||(22642392-22642559)
chr1 (9-142)||(20884278-20884412)
chr1 (12-194)||(19037499-19037685)
chr1 (9-142)||(20867249-20867383)
chr1 (282-345)||(19087862-19087925)
chr1 (9-161)||(28473756-28473912)
chr1 (14-192)||(31358822-31358999)
chr1 (9-142)||(45071024-45071159)
chr1 (30-326)||(7309175-7309475)
chr1 (30-326)||(21215100-21215400)
chr1 (9-143)||(52351080-52351217)
chr1 (249-341)||(19037351-19037441)
chr1 (130-245)||(20884370-20884483)
chr1 (218-341)||(21541148-21541275)
chr1 (289-345)||(10256424-10256480)
chr1 (124-192)||(19965760-19965828)
chr1 (24-174)||(22654989-22655141)
chr1 (130-283)||(44200443-44200604)
chr1 (249-341)||(23058938-23059028)
chr1 (293-345)||(5234663-5234715)
chr1 (33-192)||(8698351-8698510)
chr1 (9-69)||(20798689-20798749)
chr1 (240-312)||(23975486-23975558)
chr1 (9-145)||(44200559-44200697)
chr1 (19-159)||(7745493-7745634)
chr1 (25-192)||(2819728-2819895)
chr1 (30-281)||(14263854-14264106)
chr1 (14-161)||(20251301-20251452)
chr1 (29-159)||(21543566-21543698)
chr1 (30-192)||(26280474-26280638)
chr1 (30-187)||(17025386-17025545)
chr1 (30-192)||(26703070-26703233)
chr1 (30-304)||(10756803-10757081)
chr1 (30-305)||(21121488-21121766)
chr1 (245-303)||(22202376-22202434)
chr1 (14-305)||(37640387-37640683)
chr1 (12-305)||(25448961-25449260)
chr1 (30-305)||(44824185-44824461)
chr1 (130-229)||(52351174-52351271)
chr1 (30-305)||(21205296-21205574)
chr1 (30-305)||(23024171-23024449)
chr1 (258-341)||(52351269-52351350)
chr1 (30-144)||(18897017-18897131)
chr1 (2-60)||(21894963-21895022)
chr1 (240-318)||(31358730-31358809)
chr1 (215-305)||(7745657-7745752)
chr1 (303-345)||(11958472-11958514)
chr1 (30-174)||(16233552-16233698)
chr1 (30-144)||(30892633-30892750)
chr1 (30-146)||(48703741-48703859)
chr1 (239-331)||(22601219-22601311)
chr1 (240-318)||(22639682-22639762)
chr1 (30-192)||(27858232-27858397)
chr1 (245-305)||(12283800-12283860)
chr1 (245-305)||(12625195-12625255)
chr1 (30-131)||(18130434-18130537)
chr1 (245-305)||(22427980-22428040)
chr1 (30-144)||(36133742-36133858)
chr1 (30-305)||(42284019-42284297)
chr1 (31-234)||(19215064-19215268)
chr1 (34-144)||(21028336-21028447)
chr1 (9-69)||(24029083-24029145)
chr1 (30-140)||(2834230-2834343)
chr1 (250-312)||(8698265-8698327)
chr1 (30-115)||(14293107-14293193)
chr1 (245-318)||(26702771-26702845)
chr1 (30-144)||(33256773-33256890)
chr1 (30-144)||(33276945-33277062)
chr1 (30-144)||(35039705-35039822)
chr1 (239-304)||(16233759-16233824)
chr1 (132-210)||(21543548-21543624)
chr1 (33-305)||(21983974-21984249)
chr1 (244-304)||(23037145-23037206)
chr1 (244-326)||(1577223-1577307)
chr1 (30-144)||(2268070-2268186)
chr1 (131-190)||(9346298-9346358)
chr1 (30-305)||(10250367-10250642)
chr1 (131-190)||(16233624-16233684)
chr1 (239-299)||(18614301-18614361)
chr1 (30-69)||(2327859-2327898)
chr1 (241-312)||(12669814-12669883)
chr1 (30-69)||(18517583-18517622)
chr1 (245-326)||(21192506-21192589)
chr1 (30-69)||(22202157-22202196)
chr1 (30-69)||(22427761-22427800)
chr1 (245-300)||(22465452-22465507)
chr1 (244-318)||(22600826-22600901)
chr1 (30-69)||(23036930-23036969)
chr1 (30-69)||(38282181-38282220)
chr1 (30-69)||(48570654-48570693)
chr1 (30-144)||(16235732-16235848)
chr1 (30-187)||(22639779-22639934)
chr1 (245-326)||(28492924-28493005)
chr1 (30-144)||(46088528-46088645)
chr1 (245-305)||(2328076-2328137)
chr1 (30-305)||(21702193-21702470)
chr1 (31-145)||(23053913-23054026)
chr1 (247-331)||(26702965-26703049)
chr1 (30-69)||(1577483-1577522)
chr1 (30-69)||(12284042-12284081)
chr1 (30-69)||(12624977-12625016)
chr1 (30-69)||(18515612-18515651)
chr1 (30-69)||(19717140-19717179)
chr1 (132-190)||(22642421-22642480)
chr1 (30-69)||(28492824-28492863)
chr1 (30-69)||(30571814-30571853)
chr1 (30-69)||(32786363-32786402)
chr1 (244-318)||(36133569-36133644)
chr1 (244-325)||(48570868-48570951)
chr1 (245-304)||(48703642-48703701)
chr1 (246-304)||(9346157-9346215)
chr1 (239-305)||(17017969-17018035)
chr1 (130-171)||(20867341-20867383)
chr1 (30-132)||(21684477-21684579)
chr1 (239-305)||(21684593-21684659)
chr1 (244-305)||(38281763-38281825)
chr1 (245-305)||(14293265-14293326)
chr1 (239-276)||(18130613-18130650)
chr1 (39-159)||(23917355-23917477)
chr1 (259-331)||(24218713-24218786)
chr1 (132-192)||(35895684-35895745)
chr1 (102-143)||(35895704-35895745)
chr1 (244-304)||(46088368-46088429)
chr1 (30-70)||(2266714-2266753)
chr1 (239-326)||(23053731-23053819)
chr1 (245-305)||(26280687-26280746)
chr1 (244-326)||(32786578-32786662)
chr1 (241-304)||(33256988-33257052)
chr1 (241-304)||(33277160-33277224)
chr1 (244-276)||(38281974-38282006)
[»] chr6 (229 HSPs)
chr6 (2-345)||(9123488-9123831)
chr6 (2-345)||(9112851-9113194)
chr6 (2-345)||(12865044-12865387)
chr6 (2-345)||(32962290-32962633)
chr6 (2-345)||(3671544-3671887)
chr6 (2-345)||(27505439-27505782)
chr6 (2-345)||(12717192-12717537)
chr6 (2-345)||(12727841-12728186)
chr6 (2-345)||(25985577-25985922)
chr6 (2-345)||(34818148-34818493)
chr6 (2-345)||(32972909-32973253)
chr6 (2-345)||(34807516-34807862)
chr6 (2-345)||(3660880-3661223)
chr6 (2-345)||(12854518-12854861)
chr6 (2-345)||(26043709-26044052)
chr6 (2-345)||(27372329-27372672)
chr6 (2-345)||(27462679-27463022)
chr6 (2-345)||(17982857-17983202)
chr6 (2-345)||(17985066-17985411)
chr6 (2-345)||(31982982-31983326)
chr6 (2-345)||(26024955-26025299)
chr6 (2-345)||(26035529-26035873)
chr6 (2-345)||(26864282-26864626)
chr6 (2-345)||(26874906-26875250)
chr6 (2-345)||(27341190-27341534)
chr6 (2-345)||(27401930-27402274)
chr6 (2-345)||(27412589-27412933)
chr6 (2-345)||(29384248-29384592)
chr6 (2-345)||(32301399-32301743)
chr6 (2-345)||(32312088-32312432)
chr6 (2-345)||(33198824-33199168)
chr6 (2-345)||(4630367-4630711)
chr6 (2-345)||(16929947-16930291)
chr6 (2-345)||(16959118-16959462)
chr6 (2-341)||(28251919-28252257)
chr6 (2-341)||(28357066-28357404)
chr6 (2-345)||(27383930-27384273)
chr6 (2-341)||(7751591-7751932)
chr6 (8-344)||(12827191-12827526)
chr6 (8-344)||(20030266-20030601)
chr6 (8-344)||(20063017-20063352)
chr6 (8-344)||(25787201-25787535)
chr6 (8-344)||(18926126-18926460)
chr6 (8-344)||(7376120-7376456)
chr6 (9-324)||(16123897-16124214)
chr6 (9-324)||(32756918-32757232)
chr6 (9-345)||(31571912-31572247)
chr6 (100-345)||(27474314-27474559)
chr6 (100-345)||(27503812-27504057)
chr6 (9-345)||(17746147-17746483)
chr6 (9-326)||(27166806-27167123)
chr6 (9-324)||(29765053-29765368)
chr6 (9-345)||(18834997-18835331)
chr6 (9-345)||(18826602-18826936)
chr6 (9-322)||(5844605-5844919)
chr6 (154-345)||(25583409-25583600)
chr6 (9-345)||(22308285-22308621)
chr6 (149-345)||(12353080-12353277)
chr6 (150-344)||(10404043-10404236)
chr6 (9-324)||(25518201-25518520)
chr6 (163-345)||(11147708-11147888)
chr6 (2-191)||(27503997-27504185)
chr6 (9-324)||(25687113-25687432)
chr6 (9-341)||(11234995-11235331)
chr6 (9-342)||(17742067-17742400)
chr6 (9-341)||(21127576-21127913)
chr6 (191-345)||(12416902-12417055)
chr6 (9-341)||(7586623-7586960)
chr6 (2-191)||(27474499-27474686)
chr6 (130-341)||(31930950-31931163)
chr6 (132-345)||(17047082-17047297)
chr6 (236-345)||(1902231-1902340)
chr6 (130-341)||(18554797-18555010)
chr6 (8-145)||(12353252-12353389)
chr6 (236-345)||(27819055-27819164)
chr6 (24-341)||(22386149-22386470)
chr6 (29-326)||(20635079-20635382)
chr6 (29-324)||(17608795-17609095)
chr6 (9-147)||(4292420-4292558)
chr6 (130-341)||(12953586-12953799)
chr6 (24-341)||(19453005-19453327)
chr6 (132-341)||(11205472-11205683)
chr6 (163-342)||(9934131-9934308)
chr6 (197-345)||(22292390-22292538)
chr6 (8-132)||(11147612-11147736)
chr6 (258-345)||(12575773-12575860)
chr6 (9-305)||(14070539-14070843)
chr6 (258-345)||(18720210-18720297)
chr6 (9-161)||(31931101-31931255)
chr6 (236-344)||(30120483-30120590)
chr6 (9-142)||(18554968-18555102)
chr6 (9-142)||(12953495-12953628)
chr6 (135-345)||(17063726-17063935)
chr6 (2-88)||(31543252-31543338)
chr6 (9-132)||(9934036-9934159)
chr6 (9-305)||(14051858-14052152)
chr6 (219-312)||(14757752-14757848)
chr6 (28-192)||(18027209-18027373)
chr6 (9-132)||(25735921-25736044)
chr6 (239-318)||(15551392-15551471)
chr6 (21-145)||(17063895-17064019)
chr6 (288-345)||(18576226-18576283)
chr6 (9-161)||(11205623-11205778)
chr6 (249-324)||(25678926-25679001)
chr6 (29-145)||(17047254-17047371)
chr6 (293-345)||(11021457-11021509)
chr6 (9-142)||(19289744-19289879)
chr6 (295-345)||(5521748-5521798)
chr6 (30-305)||(12715913-12716193)
chr6 (130-245)||(19289837-19289950)
chr6 (215-341)||(21119154-21119284)
chr6 (240-331)||(18027387-18027479)
chr6 (239-306)||(21034409-21034476)
chr6 (245-326)||(3680470-3680552)
chr6 (240-312)||(15478450-15478522)
chr6 (239-331)||(24719437-24719530)
chr6 (15-131)||(15478259-15478374)
chr6 (33-305)||(17927171-17927445)
chr6 (239-326)||(25929835-25929923)
chr6 (30-144)||(7763196-7763311)
chr6 (244-326)||(13435242-13435325)
chr6 (30-192)||(15551484-15551646)
chr6 (30-144)||(19085700-19085817)
chr6 (30-115)||(19625382-19625468)
chr6 (245-326)||(20113347-20113429)
chr6 (30-142)||(21034534-21034647)
chr6 (245-305)||(14101148-14101208)
chr6 (245-305)||(24116206-24116266)
chr6 (30-144)||(29597615-29597731)
chr6 (244-304)||(29917407-29917467)
chr6 (30-160)||(32335363-32335494)
chr6 (30-326)||(12422621-12422919)
chr6 (30-192)||(13601659-13601825)
chr6 (30-192)||(14923703-14923866)
chr6 (30-147)||(15395178-15395297)
chr6 (30-304)||(19066510-19066787)
chr6 (219-324)||(30372716-30372823)
chr6 (30-144)||(9717383-9717499)
chr6 (239-305)||(12347471-12347537)
chr6 (30-144)||(15301756-15301873)
chr6 (246-304)||(15395333-15395391)
chr6 (39-187)||(17446155-17446304)
chr6 (30-115)||(18172720-18172806)
chr6 (30-115)||(18226995-18227081)
chr6 (244-305)||(18377821-18377883)
chr6 (245-303)||(18434919-18434977)
chr6 (244-305)||(19482131-19482193)
chr6 (244-305)||(21234538-21234600)
chr6 (30-144)||(24116369-24116486)
chr6 (245-326)||(25591979-25592061)
chr6 (30-144)||(26589139-26589256)
chr6 (31-69)||(31127801-31127839)
chr6 (33-305)||(33352723-33352997)
chr6 (245-305)||(16528689-16528750)
chr6 (239-304)||(18172925-18172990)
chr6 (239-304)||(18226811-18226876)
chr6 (254-326)||(19623336-19623409)
chr6 (30-131)||(25595733-25595833)
chr6 (30-142)||(26941981-26942094)
chr6 (245-305)||(15301594-15301654)
chr6 (292-344)||(17573069-17573120)
chr6 (245-304)||(21624471-21624531)
chr6 (131-190)||(24719301-24719361)
chr6 (131-190)||(24729086-24729146)
chr6 (2-78)||(26023151-26023227)
chr6 (239-306)||(7811387-7811454)
chr6 (30-69)||(10631721-10631760)
chr6 (30-69)||(10705025-10705064)
chr6 (30-69)||(16265643-16265682)
chr6 (30-69)||(17317016-17317055)
chr6 (30-69)||(18435158-18435197)
chr6 (241-304)||(19470047-19470110)
chr6 (30-144)||(19470209-19470324)
chr6 (30-69)||(19482370-19482409)
chr6 (245-288)||(19625206-19625249)
chr6 (33-115)||(20113192-20113275)
chr6 (30-69)||(20731197-20731236)
chr6 (30-69)||(21234776-21234815)
chr6 (30-69)||(21617862-21617901)
chr6 (30-69)||(22076898-22076937)
chr6 (81-187)||(23006548-23006655)
chr6 (81-187)||(23781711-23781818)
chr6 (30-187)||(24729014-24729173)
chr6 (30-69)||(32543882-32543921)
chr6 (244-305)||(10631513-10631575)
chr6 (244-305)||(15954077-15954139)
chr6 (244-305)||(17380956-17381018)
chr6 (248-305)||(19952282-19952340)
chr6 (239-304)||(24729222-24729288)
chr6 (9-55)||(25679024-25679070)
chr6 (244-305)||(26588977-26589039)
chr6 (272-345)||(27720866-27720937)
chr6 (30-187)||(16463143-16463304)
chr6 (239-300)||(17303976-17304037)
chr6 (244-312)||(21617618-21617687)
chr6 (227-324)||(31720245-31720345)
chr6 (112-144)||(10820696-10820728)
chr6 (33-144)||(14100933-14101045)
chr6 (239-287)||(14883651-14883699)
chr6 (239-326)||(14923879-14923966)
chr6 (30-142)||(19623523-19623638)
chr6 (219-312)||(24471041-24471137)
chr6 (239-326)||(32335199-32335287)
chr6 (30-69)||(7811631-7811670)
chr6 (245-326)||(13601523-13601606)
chr6 (30-69)||(15532118-15532157)
chr6 (31-66)||(16876525-16876560)
chr6 (30-69)||(19688397-19688436)
chr6 (30-69)||(19952064-19952103)
chr6 (243-305)||(32543644-32543707)
chr6 (239-289)||(19875234-19875284)
chr6 (101-143)||(22563160-22563202)
chr6 (239-305)||(26185164-26185230)
chr6 (238-312)||(34659352-34659424)
chr6 (245-305)||(7763031-7763092)
chr6 (245-305)||(9717222-9717283)
chr6 (253-305)||(12041230-12041283)
chr6 (236-285)||(21689533-21689580)
chr6 (130-190)||(23006567-23006628)
chr6 (239-304)||(23006704-23006769)
chr6 (239-304)||(23781597-23781662)
chr6 (130-190)||(23781738-23781799)
chr6 (130-190)||(32335363-32335424)
chr6 (96-144)||(13435423-13435471)
chr6 (241-312)||(16739828-16739900)
chr6 (244-276)||(19688192-19688224)
chr6 (244-276)||(22801549-22801581)
chr6 (219-312)||(24481086-24481182)
chr6 (257-305)||(29537991-29538039)
[»] chr2 (193 HSPs)
chr2 (2-345)||(16768464-16768807)
chr2 (2-345)||(24328098-24328441)
chr2 (2-345)||(1099559-1099902)
chr2 (2-345)||(7006171-7006514)
chr2 (2-345)||(9773668-9774011)
chr2 (2-345)||(11389173-11389516)
chr2 (2-345)||(22960696-22961039)
chr2 (2-345)||(24338768-24339111)
chr2 (2-345)||(29243743-29244086)
chr2 (2-345)||(29254322-29254665)
chr2 (6-345)||(43082175-43082514)
chr2 (2-345)||(43092784-43093127)
chr2 (2-345)||(4099335-4099678)
chr2 (2-345)||(4209410-4209753)
chr2 (2-345)||(4220002-4220345)
chr2 (2-345)||(9763132-9763475)
chr2 (2-345)||(17857801-17858144)
chr2 (2-345)||(22915228-22915571)
chr2 (2-345)||(34790581-34790924)
chr2 (2-345)||(34804724-34805067)
chr2 (2-345)||(18393001-18393346)
chr2 (2-345)||(34477449-34477793)
chr2 (2-345)||(40250714-40251058)
chr2 (2-345)||(32217393-32217738)
chr2 (2-345)||(40221853-40222197)
chr2 (2-344)||(36252208-36252550)
chr2 (2-345)||(9908526-9908872)
chr2 (2-345)||(11395536-11395881)
chr2 (2-345)||(11405852-11406197)
chr2 (2-345)||(35263111-35263455)
chr2 (2-345)||(35273736-35274080)
chr2 (2-345)||(9897938-9898284)
chr2 (2-345)||(10266514-10266858)
chr2 (2-345)||(10277091-10277435)
chr2 (2-345)||(27220901-27221245)
chr2 (2-345)||(35252502-35252846)
chr2 (2-345)||(43344928-43345272)
chr2 (2-345)||(43354543-43354887)
chr2 (2-345)||(30489188-30489531)
chr2 (2-345)||(39170459-39170803)
chr2 (8-345)||(2561009-2561346)
chr2 (8-344)||(24427956-24428291)
chr2 (8-344)||(21172836-21173174)
chr2 (8-344)||(24415391-24415726)
chr2 (8-344)||(28732272-28732607)
chr2 (9-344)||(26866595-26866929)
chr2 (8-344)||(18769275-18769609)
chr2 (8-344)||(28721686-28722021)
chr2 (9-325)||(26879202-26879518)
chr2 (108-345)||(21650975-21651213)
chr2 (9-324)||(38586457-38586775)
chr2 (9-324)||(27978753-27979068)
chr2 (9-324)||(28065282-28065597)
chr2 (9-345)||(36785170-36785506)
chr2 (9-345)||(967875-968210)
chr2 (9-342)||(22763176-22763511)
chr2 (9-345)||(1041671-1042006)
chr2 (9-341)||(24274552-24274882)
chr2 (9-345)||(17970641-17970975)
chr2 (9-324)||(22773896-22774215)
chr2 (9-345)||(19355838-19356177)
chr2 (179-344)||(30794332-30794497)
chr2 (29-323)||(23393113-23393412)
chr2 (9-341)||(20646980-20647317)
chr2 (132-341)||(19498457-19498668)
chr2 (24-323)||(24801988-24802293)
chr2 (132-324)||(19302918-19303114)
chr2 (24-323)||(24814955-24815260)
chr2 (130-324)||(19313482-19313680)
chr2 (130-341)||(38033296-38033510)
chr2 (29-323)||(1083368-1083669)
chr2 (130-307)||(22754871-22755054)
chr2 (2-86)||(21650895-21650979)
chr2 (9-161)||(19313389-19313544)
chr2 (196-341)||(38040521-38040669)
chr2 (9-161)||(19300382-19300537)
chr2 (9-161)||(19498362-19498517)
chr2 (30-192)||(21911311-21911476)
chr2 (290-345)||(20221144-20221199)
chr2 (240-312)||(22682798-22682871)
chr2 (240-312)||(14794452-14794523)
chr2 (9-69)||(17969581-17969641)
chr2 (240-312)||(19321021-19321093)
chr2 (249-341)||(22615225-22615315)
chr2 (39-306)||(24843578-24843847)
chr2 (30-165)||(26619548-26619685)
chr2 (101-192)||(16587510-16587602)
chr2 (9-145)||(22755009-22755148)
chr2 (245-305)||(24851329-24851389)
chr2 (25-192)||(15671053-15671221)
chr2 (30-144)||(18431386-18431501)
chr2 (30-144)||(18702278-18702393)
chr2 (30-192)||(24575522-24575688)
chr2 (132-228)||(19300477-19300571)
chr2 (245-326)||(21537852-21537934)
chr2 (33-131)||(25918265-25918363)
chr2 (237-306)||(8684995-8685062)
chr2 (30-161)||(14794307-14794438)
chr2 (245-305)||(22257575-22257635)
chr2 (39-187)||(22382974-22383125)
chr2 (30-305)||(22786103-22786381)
chr2 (30-144)||(28141049-28141165)
chr2 (30-192)||(20569197-20569363)
chr2 (30-187)||(22271625-22271784)
chr2 (30-144)||(24376644-24376758)
chr2 (245-304)||(28141268-28141327)
chr2 (30-144)||(10010198-10010315)
chr2 (245-326)||(10010418-10010500)
chr2 (239-305)||(22382859-22382925)
chr2 (25-194)||(22682882-22683051)
chr2 (245-326)||(24376458-24376540)
chr2 (30-144)||(38780931-38781048)
chr2 (30-326)||(44839785-44840085)
chr2 (30-143)||(20152449-20152564)
chr2 (239-304)||(21845537-21845602)
chr2 (24-69)||(22525269-22525314)
chr2 (239-303)||(10899171-10899235)
chr2 (238-306)||(17418219-17418285)
chr2 (245-305)||(18702114-18702174)
chr2 (30-326)||(19539768-19540069)
chr2 (131-190)||(21845678-21845738)
chr2 (245-305)||(22271504-22271564)
chr2 (245-305)||(25828536-25828595)
chr2 (29-69)||(31328410-31328450)
chr2 (29-69)||(31335131-31335171)
chr2 (30-69)||(6574576-6574615)
chr2 (30-69)||(14581171-14581210)
chr2 (30-144)||(21537699-21537813)
chr2 (105-144)||(21548821-21548860)
chr2 (238-305)||(21822976-21823041)
chr2 (30-69)||(21845771-21845810)
chr2 (30-69)||(22188551-22188590)
chr2 (30-69)||(22802083-22802122)
chr2 (33-144)||(23234543-23234656)
chr2 (245-304)||(26367074-26367133)
chr2 (237-312)||(26655335-26655408)
chr2 (30-69)||(28551367-28551406)
chr2 (30-69)||(31801336-31801375)
chr2 (310-345)||(38207709-38207744)
chr2 (30-69)||(40331722-40331761)
chr2 (33-115)||(44880734-44880817)
chr2 (30-144)||(22317127-22317243)
chr2 (12-130)||(38033205-38033326)
chr2 (245-326)||(40781828-40781910)
chr2 (239-304)||(21911489-21911554)
chr2 (30-67)||(22257817-22257854)
chr2 (130-190)||(22383001-22383062)
chr2 (30-114)||(22455436-22455521)
chr2 (239-304)||(24838480-24838545)
chr2 (219-287)||(27766146-27766213)
chr2 (29-69)||(1088980-1089020)
chr2 (245-305)||(18431604-18431664)
chr2 (219-315)||(27939418-27939516)
chr2 (245-304)||(39038307-39038367)
chr2 (314-345)||(5027893-5027924)
chr2 (34-69)||(13964431-13964466)
chr2 (247-305)||(13964641-13964700)
chr2 (239-286)||(15671234-15671281)
chr2 (241-326)||(20569412-20569499)
chr2 (30-69)||(23184750-23184789)
chr2 (245-300)||(23184968-23185023)
chr2 (30-69)||(23596013-23596052)
chr2 (245-300)||(23596231-23596286)
chr2 (245-284)||(27296835-27296874)
chr2 (30-69)||(30557769-30557808)
chr2 (30-140)||(39038089-39038200)
chr2 (30-69)||(45087430-45087469)
chr2 (244-305)||(6574761-6574823)
chr2 (39-69)||(10898980-10899010)
chr2 (240-306)||(21770295-21770359)
chr2 (244-305)||(22782279-22782341)
chr2 (244-305)||(22801845-22801907)
chr2 (39-69)||(24441173-24441203)
chr2 (245-318)||(24575395-24575469)
chr2 (30-68)||(27939600-27939638)
chr2 (244-305)||(28701876-28701938)
chr2 (244-305)||(34322596-34322658)
chr2 (244-304)||(22316967-22317028)
chr2 (253-305)||(25188772-25188825)
chr2 (245-305)||(30557988-30558049)
chr2 (30-67)||(35744426-35744463)
chr2 (245-304)||(6392038-6392098)
chr2 (94-161)||(19302910-19302978)
chr2 (244-276)||(22188767-22188799)
chr2 (104-144)||(22312304-22312344)
chr2 (245-304)||(22455625-22455685)
chr2 (248-288)||(26623123-26623163)
chr2 (244-326)||(28551583-28551667)
chr2 (33-69)||(28701664-28701700)
chr2 (244-276)||(28712362-28712394)
chr2 (33-69)||(33240296-33240332)
chr2 (33-69)||(33248217-33248253)
chr2 (244-303)||(40331163-40331223)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (2-345)||(11885-12228)
[»] chr7 (240 HSPs)
chr7 (2-345)||(166426-166769)
chr7 (2-345)||(177018-177361)
chr7 (2-345)||(5685050-5685393)
chr7 (2-345)||(9432795-9433138)
chr7 (2-345)||(37343731-37344074)
chr7 (2-345)||(48710917-48711260)
chr7 (2-345)||(9084815-9085158)
chr7 (2-345)||(9094529-9094872)
chr7 (2-345)||(26294455-26294799)
chr7 (2-345)||(468007-468350)
chr7 (2-345)||(6867651-6867994)
chr7 (2-345)||(6878283-6878626)
chr7 (2-345)||(9443391-9443734)
chr7 (2-345)||(20989184-20989527)
chr7 (2-341)||(21003434-21003773)
chr7 (2-345)||(22099269-22099612)
chr7 (2-345)||(26653751-26654094)
chr7 (2-345)||(26700080-26700423)
chr7 (2-345)||(17961150-17961495)
chr7 (2-342)||(24931029-24931370)
chr7 (2-345)||(22088654-22088997)
chr7 (2-345)||(2706038-2706383)
chr7 (8-345)||(14746101-14746439)
chr7 (2-345)||(17950544-17950889)
chr7 (2-345)||(40042534-40042879)
chr7 (2-345)||(40053083-40053428)
chr7 (2-345)||(1987070-1987414)
chr7 (2-345)||(1997691-1998035)
chr7 (2-345)||(24734282-24734627)
chr7 (2-345)||(24744229-24744574)
chr7 (2-345)||(26390522-26390867)
chr7 (2-345)||(26401164-26401509)
chr7 (2-345)||(42865357-42865701)
chr7 (2-345)||(42875983-42876327)
chr7 (2-345)||(8627478-8627823)
chr7 (2-345)||(2716642-2716987)
chr7 (2-345)||(11004715-11005059)
chr7 (2-345)||(8616916-8617260)
chr7 (2-345)||(8002491-8002835)
chr7 (2-345)||(8013136-8013480)
chr7 (2-345)||(4222138-4222482)
chr7 (8-345)||(3165266-3165603)
chr7 (8-345)||(20490538-20490875)
chr7 (8-344)||(1367163-1367498)
chr7 (8-344)||(15888760-15889095)
chr7 (8-344)||(30049053-30049388)
chr7 (8-324)||(31116942-31117258)
chr7 (8-325)||(588764-589081)
chr7 (8-344)||(21770374-21770709)
chr7 (8-344)||(9169719-9170054)
chr7 (8-344)||(9159264-9159599)
chr7 (9-324)||(40055185-40055501)
chr7 (9-345)||(18440727-18441062)
chr7 (130-345)||(4211569-4211785)
chr7 (133-345)||(540644-540857)
chr7 (2-206)||(455225-455429)
chr7 (9-341)||(3476774-3477104)
chr7 (9-344)||(38403644-38403979)
chr7 (9-312)||(18418677-18418981)
chr7 (9-342)||(8933099-8933430)
chr7 (81-345)||(17064034-17064297)
chr7 (9-345)||(48381718-48382054)
chr7 (9-341)||(15215852-15216183)
chr7 (9-342)||(12734598-12734929)
chr7 (9-342)||(26209982-26210313)
chr7 (9-342)||(29589523-29589859)
chr7 (149-345)||(44280055-44280251)
chr7 (9-345)||(13681853-13682186)
chr7 (2-209)||(11095719-11095928)
chr7 (9-324)||(8999370-8999694)
chr7 (202-345)||(457618-457761)
chr7 (149-324)||(38594256-38594430)
chr7 (215-345)||(19986159-19986289)
chr7 (217-345)||(20967200-20967328)
chr7 (2-161)||(540798-540959)
chr7 (130-345)||(24882945-24883162)
chr7 (14-324)||(11087485-11087803)
chr7 (8-161)||(44280209-44280363)
chr7 (197-324)||(25212471-25212598)
chr7 (24-322)||(13175058-13175362)
chr7 (2-161)||(4211724-4211883)
chr7 (219-345)||(11015335-11015463)
chr7 (25-326)||(4412462-4412771)
chr7 (9-161)||(38594144-38594298)
chr7 (29-326)||(4433039-4433343)
chr7 (257-345)||(23643198-23643286)
chr7 (268-345)||(1251598-1251675)
chr7 (270-345)||(23303859-23303934)
chr7 (9-161)||(24882853-24883007)
chr7 (29-305)||(602139-602421)
chr7 (277-345)||(12220354-12220422)
chr7 (280-345)||(22499347-22499412)
chr7 (250-345)||(6044957-6045050)
chr7 (282-345)||(1775665-1775728)
chr7 (227-320)||(1878923-1879018)
chr7 (289-345)||(45930881-45930937)
chr7 (240-312)||(11572876-11572949)
chr7 (219-322)||(12223090-12223196)
chr7 (296-345)||(6169834-6169883)
chr7 (30-114)||(2501517-2501600)
chr7 (30-326)||(4820839-4821137)
chr7 (239-306)||(7488620-7488687)
chr7 (25-192)||(25806882-25807051)
chr7 (30-144)||(13302397-13302514)
chr7 (244-318)||(19711733-19711807)
chr7 (240-312)||(2501662-2501735)
chr7 (30-274)||(12174844-12175089)
chr7 (245-318)||(13259125-13259198)
chr7 (245-318)||(13266465-13266538)
chr7 (30-192)||(13731178-13731344)
chr7 (30-192)||(15088036-15088202)
chr7 (92-192)||(23125436-23125537)
chr7 (30-192)||(5034875-5035039)
chr7 (30-137)||(19237540-19237648)
chr7 (240-312)||(25806797-25806869)
chr7 (30-144)||(13027406-13027521)
chr7 (30-144)||(13034342-13034457)
chr7 (40-192)||(13263271-13263421)
chr7 (239-326)||(16105646-16105733)
chr7 (302-345)||(24072140-24072183)
chr7 (30-187)||(25687345-25687503)
chr7 (240-317)||(15871754-15871832)
chr7 (239-305)||(16308426-16308492)
chr7 (239-305)||(16411383-16411449)
chr7 (30-112)||(18362071-18362153)
chr7 (30-326)||(27871070-27871370)
chr7 (30-144)||(32265224-32265341)
chr7 (30-144)||(48063316-48063433)
chr7 (30-305)||(11792284-11792562)
chr7 (30-147)||(16472227-16472342)
chr7 (244-326)||(1292443-1292527)
chr7 (30-326)||(4493927-4494229)
chr7 (248-326)||(11318757-11318837)
chr7 (245-305)||(14187063-14187123)
chr7 (30-138)||(16315043-16315154)
chr7 (33-189)||(9802671-9802829)
chr7 (30-326)||(10883675-10883976)
chr7 (30-187)||(13172858-13173016)
chr7 (245-304)||(13261338-13261397)
chr7 (33-144)||(16112392-16112506)
chr7 (40-305)||(16317070-16317337)
chr7 (30-326)||(331003-331304)
chr7 (245-326)||(5001549-5001631)
chr7 (39-144)||(7488418-7488524)
chr7 (245-326)||(13302213-13302295)
chr7 (245-326)||(13645803-13645885)
chr7 (30-144)||(16557094-16557211)
chr7 (30-144)||(16608451-16608568)
chr7 (30-144)||(28622863-28622980)
chr7 (244-305)||(28623080-28623142)
chr7 (30-144)||(29935849-29935964)
chr7 (92-192)||(11572762-11572863)
chr7 (130-190)||(16308289-16308350)
chr7 (240-331)||(16464371-16464461)
chr7 (30-174)||(22579719-22579866)
chr7 (245-305)||(24787735-24787796)
chr7 (30-144)||(2499574-2499690)
chr7 (245-305)||(5034669-5034729)
chr7 (244-326)||(8182312-8182396)
chr7 (244-326)||(13879522-13879606)
chr7 (245-305)||(19237758-19237818)
chr7 (245-305)||(29936069-29936128)
chr7 (30-305)||(48806384-48806662)
chr7 (30-69)||(8182544-8182583)
chr7 (30-69)||(11015575-11015614)
chr7 (30-69)||(11319020-11319059)
chr7 (14-69)||(12222922-12222977)
chr7 (30-192)||(13138401-13138567)
chr7 (30-69)||(13261118-13261157)
chr7 (30-144)||(13473002-13473117)
chr7 (30-69)||(14187304-14187343)
chr7 (30-69)||(14425070-14425109)
chr7 (30-69)||(14426161-14426200)
chr7 (30-69)||(15467530-15467569)
chr7 (30-69)||(15704993-15705032)
chr7 (30-69)||(15871583-15871622)
chr7 (30-69)||(19711517-19711556)
chr7 (245-304)||(21211267-21211326)
chr7 (30-69)||(21381933-21381972)
chr7 (240-306)||(23125356-23125423)
chr7 (30-69)||(23280465-23280504)
chr7 (30-69)||(24795219-24795258)
chr7 (30-69)||(30945864-30945903)
chr7 (30-69)||(33692206-33692245)
chr7 (245-304)||(41843147-41843206)
chr7 (245-326)||(44466446-44466529)
chr7 (245-318)||(2499424-2499498)
chr7 (30-305)||(2914114-2914394)
chr7 (33-184)||(9762184-9762337)
chr7 (244-305)||(15087925-15087987)
chr7 (245-326)||(16310630-16310712)
chr7 (244-305)||(19339969-19340031)
chr7 (244-305)||(30946079-30946141)
chr7 (253-326)||(33604259-33604333)
chr7 (244-305)||(35954625-35954687)
chr7 (34-174)||(44466570-44466712)
chr7 (244-305)||(48237561-48237623)
chr7 (227-300)||(10257765-10257841)
chr7 (245-305)||(13034560-13034621)
chr7 (30-144)||(13683134-13683250)
chr7 (47-159)||(15304135-15304249)
chr7 (245-305)||(16546057-16546118)
chr7 (245-305)||(16619544-16619605)
chr7 (124-192)||(20094637-20094706)
chr7 (244-326)||(13138617-13138701)
chr7 (245-301)||(14425926-14425982)
chr7 (244-303)||(19328732-19328792)
chr7 (245-304)||(21284096-21284156)
chr7 (245-289)||(21691751-21691795)
chr7 (244-326)||(33421104-33421188)
chr7 (245-305)||(39285226-39285286)
chr7 (30-69)||(1292644-1292683)
chr7 (30-69)||(1878763-1878802)
chr7 (30-69)||(2266020-2266059)
chr7 (239-306)||(13173065-13173132)
chr7 (34-69)||(13879785-13879820)
chr7 (30-69)||(16105470-16105509)
chr7 (30-69)||(19339753-19339792)
chr7 (30-69)||(21691945-21691984)
chr7 (244-318)||(22579903-22579978)
chr7 (244-318)||(23280673-23280748)
chr7 (244-305)||(2266234-2266296)
chr7 (244-305)||(9069134-9069196)
chr7 (244-305)||(9710524-9710586)
chr7 (39-69)||(12367250-12367280)
chr7 (244-282)||(15467316-15467354)
chr7 (94-144)||(16310477-16310527)
chr7 (245-326)||(16315262-16315343)
chr7 (39-69)||(16411617-16411647)
chr7 (244-305)||(16557309-16557371)
chr7 (244-305)||(16608291-16608353)
chr7 (39-76)||(9065113-9065150)
chr7 (271-324)||(9802571-9802624)
chr7 (245-318)||(12367460-12367533)
chr7 (255-326)||(15705218-15705291)
chr7 (244-276)||(16155483-16155515)
chr7 (245-289)||(18362253-18362297)
chr7 (30-66)||(19328518-19328554)
chr7 (282-330)||(20597757-20597805)
chr7 (244-276)||(33692421-33692453)
[»] chr4 (214 HSPs)
chr4 (2-345)||(450142-450485)
chr4 (2-345)||(4947903-4948246)
chr4 (2-345)||(15561430-15561773)
chr4 (2-345)||(18752840-18753183)
chr4 (2-345)||(18763450-18763793)
chr4 (2-345)||(21995979-21996322)
chr4 (2-345)||(22006577-22006920)
chr4 (2-345)||(27815296-27815639)
chr4 (2-345)||(48370697-48371040)
chr4 (2-345)||(14844004-14844347)
chr4 (2-345)||(19955313-19955656)
chr4 (2-345)||(30926845-30927188)
chr4 (2-345)||(17917617-17917961)
chr4 (2-345)||(17928265-17928609)
chr4 (2-345)||(460723-461066)
chr4 (2-345)||(5022302-5022645)
chr4 (2-345)||(30937423-30937766)
chr4 (2-345)||(24028436-24028782)
chr4 (2-345)||(19944678-19945021)
chr4 (2-345)||(52703354-52703697)
chr4 (2-345)||(29042007-29042351)
chr4 (2-345)||(16255432-16255775)
chr4 (2-345)||(18130590-18130936)
chr4 (2-345)||(27656164-27656509)
chr4 (2-345)||(27666737-27667082)
chr4 (2-345)||(55745603-55745947)
chr4 (2-345)||(16266025-16266368)
chr4 (2-345)||(24639813-24640157)
chr4 (2-345)||(36017901-36018245)
chr4 (2-345)||(36028454-36028798)
chr4 (2-345)||(49517700-49518044)
chr4 (2-345)||(55756214-55756558)
chr4 (2-345)||(40470937-40471281)
chr4 (2-345)||(10740945-10741289)
chr4 (2-345)||(10954714-10955058)
chr4 (2-345)||(40454698-40455043)
chr4 (2-345)||(10751519-10751863)
chr4 (2-345)||(10965288-10965632)
chr4 (2-345)||(25656701-25657045)
chr4 (8-344)||(10908975-10909310)
chr4 (8-345)||(18078263-18078602)
chr4 (8-344)||(16316898-16317233)
chr4 (8-344)||(16304674-16305009)
chr4 (9-344)||(10695209-10695542)
chr4 (8-344)||(14836459-14836794)
chr4 (9-344)||(5872939-5873272)
chr4 (9-341)||(3370284-3370617)
chr4 (9-341)||(3390024-3390357)
chr4 (10-344)||(15207746-15208079)
chr4 (7-321)||(19580830-19581144)
chr4 (9-324)||(10300120-10300436)
chr4 (9-326)||(11535428-11535746)
chr4 (25-286)||(4986784-4987045)
chr4 (117-344)||(25008463-25008689)
chr4 (9-345)||(31267150-31267485)
chr4 (9-345)||(11514601-11514936)
chr4 (9-345)||(24712993-24713332)
chr4 (8-342)||(49002338-49002670)
chr4 (9-342)||(55650893-55651224)
chr4 (130-344)||(47152528-47152740)
chr4 (151-344)||(19143504-19143696)
chr4 (9-341)||(19241589-19241926)
chr4 (9-341)||(18775036-18775372)
chr4 (197-324)||(8183486-8183613)
chr4 (235-345)||(9920958-9921068)
chr4 (9-341)||(18007441-18007778)
chr4 (236-345)||(28050129-28050238)
chr4 (130-341)||(16819825-16820038)
chr4 (236-345)||(49509543-49509652)
chr4 (216-344)||(19570584-19570711)
chr4 (130-341)||(23508713-23508926)
chr4 (191-345)||(10290191-10290345)
chr4 (130-341)||(14711253-14711468)
chr4 (130-341)||(14778917-14779132)
chr4 (32-326)||(33377762-33378062)
chr4 (236-325)||(17199074-17199163)
chr4 (8-132)||(4987052-4987176)
chr4 (262-345)||(3188988-3189071)
chr4 (262-345)||(20649445-20649528)
chr4 (264-345)||(29030156-29030237)
chr4 (132-324)||(36210587-36210784)
chr4 (9-142)||(23508884-23509018)
chr4 (9-161)||(47152436-47152589)
chr4 (168-341)||(18775515-18775689)
chr4 (9-142)||(16819732-16819867)
chr4 (219-345)||(39532269-39532395)
chr4 (9-114)||(8997637-8997743)
chr4 (9-143)||(17994173-17994310)
chr4 (24-159)||(1671908-1672045)
chr4 (29-132)||(39532174-39532277)
chr4 (14-305)||(9751982-9752277)
chr4 (249-341)||(18775930-18776020)
chr4 (14-192)||(17526825-17527003)
chr4 (25-191)||(18394032-18394198)
chr4 (30-326)||(3105879-3106178)
chr4 (9-161)||(14711159-14711315)
chr4 (30-305)||(55731221-55731497)
chr4 (25-192)||(7221998-7222165)
chr4 (30-326)||(14154455-14154755)
chr4 (30-173)||(16939534-16939681)
chr4 (30-144)||(17788498-17788613)
chr4 (30-305)||(19889443-19889717)
chr4 (30-144)||(23750060-23750175)
chr4 (30-144)||(41115216-41115331)
chr4 (245-331)||(13693194-13693280)
chr4 (299-345)||(43347078-43347124)
chr4 (13-161)||(14778827-14778979)
chr4 (130-229)||(17994267-17994364)
chr4 (39-144)||(23123055-23123163)
chr4 (30-192)||(13693299-13693459)
chr4 (30-305)||(16852877-16853155)
chr4 (245-305)||(55379683-55379743)
chr4 (30-187)||(13890323-13890482)
chr4 (102-326)||(16939352-16939576)
chr4 (30-187)||(17057573-17057731)
chr4 (30-192)||(18473519-18473682)
chr4 (24-161)||(36210508-36210647)
chr4 (30-144)||(29120900-29121016)
chr4 (30-144)||(40860205-40860322)
chr4 (239-331)||(14903084-14903177)
chr4 (30-143)||(37986070-37986186)
chr4 (30-304)||(6641059-6641336)
chr4 (245-305)||(11900564-11900624)
chr4 (30-144)||(12811635-12811751)
chr4 (245-305)||(15015064-15015124)
chr4 (258-341)||(17994362-17994442)
chr4 (239-331)||(18473414-18473506)
chr4 (244-326)||(19884084-19884168)
chr4 (239-326)||(20571666-20571754)
chr4 (30-144)||(56034107-56034223)
chr4 (152-246)||(8997740-8997831)
chr4 (245-304)||(12600134-12600193)
chr4 (30-144)||(15014845-15014960)
chr4 (245-326)||(15135080-15135163)
chr4 (48-142)||(18775816-18775911)
chr4 (219-285)||(19052738-19052803)
chr4 (219-318)||(24619079-24619181)
chr4 (30-144)||(55379847-55379961)
chr4 (30-326)||(17399134-17399434)
chr4 (30-115)||(17539965-17540051)
chr4 (30-144)||(17701215-17701332)
chr4 (245-303)||(23749899-23749957)
chr4 (55-192)||(32491310-32491447)
chr4 (30-326)||(6516839-6517137)
chr4 (245-305)||(14190088-14190149)
chr4 (245-318)||(16476056-16476129)
chr4 (245-305)||(16847921-16847982)
chr4 (245-318)||(17788718-17788791)
chr4 (30-192)||(37436000-37436164)
chr4 (246-326)||(41115436-41115517)
chr4 (24-68)||(1674476-1674520)
chr4 (29-192)||(3500111-3500278)
chr4 (240-288)||(7221936-7221984)
chr4 (30-144)||(14605364-14605480)
chr4 (240-326)||(17527016-17527104)
chr4 (130-190)||(18773577-18773637)
chr4 (247-326)||(22089637-22089717)
chr4 (244-326)||(22676198-22676282)
chr4 (245-305)||(29681194-29681254)
chr4 (244-326)||(54679279-54679363)
chr4 (30-69)||(3395202-3395241)
chr4 (30-69)||(8105250-8105289)
chr4 (245-304)||(8686121-8686180)
chr4 (30-69)||(11900803-11900842)
chr4 (30-140)||(11915242-11915353)
chr4 (239-302)||(16325167-16325230)
chr4 (30-69)||(19884314-19884353)
chr4 (30-69)||(21350659-21350698)
chr4 (30-69)||(29681005-29681044)
chr4 (30-69)||(36470441-36470480)
chr4 (30-69)||(38513490-38513529)
chr4 (30-69)||(54679540-54679579)
chr4 (30-144)||(10072468-10072584)
chr4 (30-144)||(15475603-15475720)
chr4 (245-318)||(16631800-16631874)
chr4 (30-144)||(22190380-22190497)
chr4 (222-312)||(22223437-22223525)
chr4 (245-318)||(36470329-36470403)
chr4 (30-68)||(45832998-45833036)
chr4 (105-189)||(9266769-9266854)
chr4 (245-318)||(18773455-18773528)
chr4 (245-304)||(8103659-8103719)
chr4 (245-305)||(11915074-11915134)
chr4 (241-304)||(14605578-14605642)
chr4 (244-326)||(45832738-45832822)
chr4 (30-305)||(56533520-56533799)
chr4 (227-312)||(8911037-8911120)
chr4 (239-318)||(10661838-10661917)
chr4 (239-318)||(10875983-10876062)
chr4 (244-318)||(15475819-15475898)
chr4 (30-69)||(16324974-16325013)
chr4 (239-306)||(18393952-18394019)
chr4 (253-326)||(19665716-19665791)
chr4 (30-69)||(20977070-20977109)
chr4 (30-69)||(22675982-22676021)
chr4 (30-69)||(25651555-25651594)
chr4 (219-300)||(32491438-32491521)
chr4 (262-305)||(37986307-37986350)
chr4 (30-69)||(39420195-39420234)
chr4 (132-189)||(1671908-1671966)
chr4 (244-305)||(13576791-13576853)
chr4 (39-69)||(15135342-15135372)
chr4 (94-187)||(16325024-16325118)
chr4 (244-305)||(17701431-17701493)
chr4 (222-312)||(19556050-19556137)
chr4 (248-305)||(37436212-37436270)
chr4 (239-304)||(13890209-13890274)
chr4 (271-312)||(15193165-15193206)
chr4 (244-304)||(39420380-39420441)
chr4 (253-305)||(3395023-3395075)
chr4 (239-303)||(10249309-10249373)
chr4 (131-190)||(13890350-13890410)
chr4 (134-189)||(24619175-24619231)
chr4 (244-303)||(56033948-56034008)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (2-345)||(40838-41181)
scaffold0047 (8-344)||(33293-33628)
scaffold0047 (30-69)||(8253-8292)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (2-345)||(30658-31003)
scaffold0133 (8-325)||(42911-43233)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (2-345)||(2218-2561)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (2-345)||(7487-7832)
scaffold0105 (2-345)||(37343-37688)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (2-345)||(7227-7570)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (2-345)||(7269-7611)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (8-345)||(14111-14448)
scaffold0028 (8-345)||(54514-54851)
scaffold0028 (30-69)||(81015-81054)
scaffold0028 (245-305)||(80775-80835)
scaffold0028 (31-69)||(6056-6094)
scaffold0028 (244-303)||(24446-24506)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (8-344)||(37125-37460)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (8-344)||(2609-2946)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (23-341)||(11012-11329)
scaffold0068 (23-341)||(8165-8489)
scaffold0068 (8-37)||(8145-8174)
scaffold0068 (8-37)||(10992-11021)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (9-345)||(12509-12845)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (9-345)||(40030-40365)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (9-345)||(35064-35401)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-345)||(4825-5159)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (9-312)||(1554-1857)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (9-345)||(57175-57511)
scaffold0084 (24-326)||(833-1142)
scaffold0084 (30-318)||(48698-48991)
scaffold0084 (245-326)||(31943-32026)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (9-342)||(15259-15591)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (9-345)||(16130-16469)
scaffold0012 (9-324)||(127190-127510)
scaffold0012 (9-69)||(140608-140668)
scaffold0012 (9-115)||(8045-8154)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (9-312)||(10680-10984)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (9-341)||(29003-29337)
scaffold0163 (245-326)||(25817-25899)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (191-345)||(23299-23453)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (198-344)||(8650-8796)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (13-337)||(18742-19084)
scaffold0099 (8-315)||(17346-17673)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (220-345)||(155682-155807)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (9-341)||(32335-32674)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (201-345)||(1-145)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (169-325)||(1-156)
scaffold0171 (245-326)||(28098-28181)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (9-324)||(40740-41064)
scaffold0017 (9-324)||(59286-59608)
scaffold0017 (179-345)||(174909-175074)
scaffold0017 (9-132)||(175062-175188)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (24-322)||(475697-476001)
scaffold0002 (24-322)||(482217-482521)
scaffold0002 (219-344)||(100148-100272)
scaffold0002 (24-69)||(157072-157117)
scaffold0002 (239-305)||(111786-111852)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (24-324)||(61090-61398)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (236-345)||(4255-4364)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (228-341)||(1743-1856)
[»] scaffold0570 (3 HSPs)
scaffold0570 (127-324)||(1-199)
scaffold0570 (24-324)||(2119-2424)
scaffold0570 (104-132)||(38-66)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (236-345)||(61136-61245)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (130-341)||(10275-10488)
scaffold0544 (9-142)||(10183-10317)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (130-341)||(1525-1738)
scaffold0443 (9-161)||(1431-1587)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (24-326)||(4474-4783)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (130-341)||(276-489)
scaffold0547 (9-142)||(447-582)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (146-345)||(5331-5531)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (130-341)||(29282-29495)
scaffold0001 (9-142)||(29190-29324)
scaffold0001 (281-345)||(411983-412047)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (24-323)||(1574-1879)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (130-341)||(60598-60813)
scaffold0005 (9-161)||(60751-60907)
scaffold0005 (245-304)||(211736-211796)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (130-341)||(57894-58107)
scaffold0073 (45-142)||(58065-58162)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (24-323)||(1381-1686)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (237-344)||(1418-1524)
scaffold0414 (30-69)||(7611-7650)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (29-326)||(20824-21127)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (254-341)||(52370-52457)
[»] scaffold0752 (4 HSPs)
scaffold0752 (130-341)||(763-976)
scaffold0752 (9-115)||(961-1069)
scaffold0752 (9-115)||(1576-1684)
scaffold0752 (130-245)||(1478-1591)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (135-342)||(38487-38695)
scaffold0149 (9-142)||(38390-38523)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (130-288)||(955-1117)
scaffold2071 (22-142)||(877-997)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (227-325)||(4437-4535)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (132-341)||(204-415)
scaffold0090 (132-341)||(4584-4795)
scaffold0090 (9-161)||(355-510)
scaffold0090 (9-161)||(4735-4890)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (104-324)||(11091-11315)
scaffold0422 (29-189)||(11259-11421)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (104-323)||(19923-20147)
scaffold0207 (29-159)||(10250-10382)
scaffold0207 (29-187)||(20123-20283)
scaffold0207 (132-189)||(10250-10308)
scaffold0207 (132-189)||(20151-20209)
[»] scaffold0050 (3 HSPs)
scaffold0050 (104-324)||(34977-35201)
scaffold0050 (29-189)||(35145-35307)
scaffold0050 (132-190)||(35174-35233)
[»] scaffold0771 (3 HSPs)
scaffold0771 (163-341)||(5747-5927)
scaffold0771 (29-130)||(5901-6003)
scaffold0771 (30-144)||(17-134)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (104-323)||(7010-7234)
scaffold0018 (24-189)||(6899-7066)
scaffold0018 (132-190)||(6978-7037)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (2-77)||(2725-2800)
[»] scaffold0011 (8 HSPs)
scaffold0011 (81-326)||(165135-165386)
scaffold0011 (30-305)||(65859-66136)
scaffold0011 (30-144)||(144904-145021)
scaffold0011 (39-186)||(59060-59208)
scaffold0011 (241-317)||(251037-251114)
scaffold0011 (239-305)||(58944-59010)
scaffold0011 (25-66)||(251224-251265)
scaffold0011 (244-326)||(145119-145203)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (29-234)||(4349-4554)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (279-345)||(10201-10267)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (277-341)||(17865-17929)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (29-326)||(38535-38839)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (215-324)||(1883-1998)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (29-326)||(9325-9631)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (261-344)||(21348-21430)
scaffold0251 (30-67)||(7443-7480)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (25-192)||(3844-4014)
scaffold0622 (239-318)||(4027-4106)
scaffold0622 (253-305)||(2040-2092)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (102-326)||(1-231)
[»] scaffold0007 (5 HSPs)
scaffold0007 (9-142)||(59683-59817)
scaffold0007 (30-173)||(63881-64027)
scaffold0007 (30-173)||(46207-46353)
scaffold0007 (130-192)||(59775-59838)
scaffold0007 (245-305)||(46044-46105)
[»] scaffold0040 (6 HSPs)
scaffold0040 (30-192)||(4464-4628)
scaffold0040 (253-318)||(6815-6880)
scaffold0040 (245-304)||(2731-2790)
scaffold0040 (30-115)||(1962-2048)
scaffold0040 (150-191)||(8279-8320)
scaffold0040 (102-172)||(8260-8331)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (132-322)||(2338-2534)
scaffold0220 (24-145)||(2259-2381)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (290-345)||(17858-17913)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (30-187)||(13542-13701)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (245-326)||(20-102)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (170-312)||(16338-16484)
scaffold0269 (29-145)||(6825-6942)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (267-344)||(7198-7274)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (149-278)||(13934-14068)
scaffold0349 (104-161)||(14026-14084)
scaffold0349 (272-345)||(10284-10355)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (30-326)||(16170-16469)
scaffold0247 (30-144)||(25830-25947)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (30-144)||(1201-1317)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (30-144)||(21429-21544)
scaffold0116 (30-144)||(2427-2544)
scaffold0116 (244-276)||(2643-2675)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (30-187)||(144405-144564)
scaffold0020 (245-305)||(144285-144345)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (30-191)||(7589-7749)
[»] scaffold0330 (2 HSPs)
scaffold0330 (30-192)||(107-272)
scaffold0330 (244-318)||(321-396)
[»] scaffold0004 (10 HSPs)
scaffold0004 (30-165)||(244734-244870)
scaffold0004 (239-306)||(87788-87855)
scaffold0004 (30-192)||(210891-211057)
scaffold0004 (30-144)||(219782-219897)
scaffold0004 (30-192)||(377999-378165)
scaffold0004 (245-326)||(219597-219679)
scaffold0004 (245-326)||(244952-245034)
scaffold0004 (30-66)||(88027-88063)
scaffold0004 (241-304)||(378214-378277)
scaffold0004 (238-304)||(382181-382245)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (34-144)||(158653-158764)
scaffold0022 (245-305)||(36809-36869)
scaffold0022 (245-305)||(134869-134929)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (236-318)||(2443-2525)
scaffold0598 (30-69)||(2246-2285)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (245-326)||(9263-9345)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (30-143)||(9501-9615)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (30-144)||(393-510)
scaffold0205 (246-305)||(611-671)
scaffold0205 (30-69)||(279-318)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (30-326)||(14475-14775)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (239-305)||(76625-76691)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (239-305)||(95-161)
scaffold0003 (39-69)||(329-359)
scaffold0003 (244-282)||(90725-90763)
scaffold0003 (33-69)||(90513-90549)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (30-143)||(13114-13230)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (239-331)||(9652-9745)
scaffold0351 (40-192)||(9486-9639)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-305)||(32239-32517)
[»] scaffold0758 (2 HSPs)
scaffold0758 (30-192)||(3767-3931)
scaffold0758 (239-304)||(3689-3754)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (245-305)||(16800-16860)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (245-305)||(20141-20201)
scaffold0035 (30-189)||(99660-99823)
scaffold0035 (30-69)||(19921-19960)
scaffold0035 (30-69)||(29413-29452)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (30-146)||(59556-59675)
scaffold0026 (245-305)||(59459-59519)
scaffold0026 (30-69)||(7544-7583)
scaffold0026 (245-326)||(7283-7364)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (30-144)||(1384-1498)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (245-300)||(2056-2111)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (240-326)||(37412-37499)
scaffold0120 (240-288)||(41545-41593)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (30-144)||(6144-6261)
scaffold0359 (244-318)||(6359-6434)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (30-115)||(5202-5288)
scaffold0273 (245-306)||(22396-22457)
scaffold0273 (132-183)||(22546-22598)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (30-144)||(88054-88171)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (30-144)||(263-380)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (239-305)||(268162-268228)
scaffold0009 (30-115)||(268353-268439)
scaffold0009 (30-69)||(84011-84050)
scaffold0009 (244-318)||(83759-83834)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (215-326)||(1191-1309)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (117-154)||(4829-4866)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (30-143)||(3183-3298)
scaffold0280 (244-326)||(3337-3421)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (245-305)||(73961-74022)
scaffold0025 (30-143)||(74126-74240)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (240-331)||(3925-4016)
scaffold0498 (33-144)||(729-841)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (30-69)||(1109-1148)
scaffold1359 (245-301)||(1327-1383)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (30-69)||(2599-2638)
scaffold0859 (244-305)||(2361-2423)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (30-69)||(1331-1370)
scaffold0772 (239-305)||(1538-1604)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (29-143)||(908-1023)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (30-69)||(5625-5664)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (30-69)||(2440-2479)
scaffold0530 (245-305)||(2688-2747)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (30-69)||(5801-5840)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (30-69)||(5811-5850)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (30-69)||(18648-18687)
scaffold0217 (30-69)||(22584-22623)
scaffold0217 (244-305)||(18411-18473)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (30-144)||(10561-10676)
scaffold0161 (30-144)||(15225-15340)
scaffold0161 (245-326)||(10779-10861)
scaffold0161 (245-326)||(15443-15525)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (30-69)||(5778-5817)
scaffold0069 (245-305)||(5939-6000)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (239-289)||(19473-19523)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (244-305)||(24010-24072)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (245-305)||(9343-9404)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (245-305)||(7412-7473)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (30-144)||(8697-8813)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (245-305)||(2610-2671)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (245-305)||(701-761)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (245-305)||(650-710)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (30-326)||(11554-11855)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (33-69)||(1277-1313)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (219-324)||(17387-17495)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (14-69)||(18202-18258)
scaffold0249 (244-276)||(18435-18467)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (239-326)||(18558-18646)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (240-331)||(17000-17092)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (29-69)||(44342-44382)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (244-326)||(35415-35499)
scaffold0056 (30-69)||(35258-35297)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (15-69)||(9-64)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (30-65)||(2928-2963)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (30-69)||(31356-31395)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (100-189)||(1755-1845)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (32-114)||(4968-5048)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (244-305)||(19292-19354)
scaffold0290 (32-69)||(19078-19115)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (245-331)||(2433-2519)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (32-69)||(2702-2739)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (100-192)||(6774-6867)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (120-192)||(111196-111269)
scaffold0036 (245-305)||(111322-111382)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (245-304)||(5595-5655)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (245-304)||(102950-103010)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 196)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6318895 - 6319238
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318895 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6318994  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318995 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6319094  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319095 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6319194  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319195 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6319238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26111132 - 26110789
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111132 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26111033  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111032 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26110933  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110932 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 26110833  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110832 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26110789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3220533 - 3220190
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220533 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3220434  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220433 cagaagtctcttgcctgcgtgtttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3220334  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220333 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 3220234  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220233 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3220190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43248226 - 43247883
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248226 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43248127  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248126 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 43248027  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248026 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 43247927  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247926 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43247883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19128649 - 19128306
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128649 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19128550  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128549 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19128450  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19128449 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtgttgtggaagg 19128350  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128349 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19128306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18449271 - 18448928
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449271 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18449172  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449171 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 18449072  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18449071 ctcatacttagaaagtattgcgcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttctggaagg 18448972  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448971 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18448928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32088648 - 32088991
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32088648 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 32088747  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088748 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32088847  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088848 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 32088947  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088948 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32088991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19139181 - 19138838
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19139181 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19139082  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19139081 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaatttttgtgaagt 19138982  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19138981 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaagg 19138882  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19138881 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19138838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32078075 - 32078418
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32078075 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 32078174  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078175 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32078274  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078275 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 32078374  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078375 aaccatgataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32078418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9856851 - 9857199
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtcttt-----attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9856851 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgt 9856950  T
Q  97 ttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9856951 ttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgt 9857050  T
Q  197 gaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857051 gaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 9857150  T
Q  297 gaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9857151 gaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtccttcttttctctgctc 9857199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 15791678 - 15792022
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791678 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15791777  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15791778 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaag 15791877  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791878 tctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 15791977  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791978 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15792022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26120810 - 26120465
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120810 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26120711  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---tttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  26120710 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttttgtga 26120611  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120610 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 26120511  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120510 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 26120465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 252310 - 251965
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252310 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 252211  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  252210 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 252111  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252110 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 252011  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252010 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 251965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 849346 - 849691
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849346 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 849445  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  849446 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 849545  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849546 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 849645  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849646 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 849691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6160924 - 6160582
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160924 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6160825  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160824 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6160725  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160724 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6160626  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6160625 aaccaggataactgcttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 6160582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 210532 - 210877
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  210532 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgat 210631  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  210632 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 210731  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210732 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 210831  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210832 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 210877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 241725 - 241380
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241725 aaatttaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 241626  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  241625 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 241526  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241525 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 241426  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241425 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 241380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 724155 - 724500
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  724155 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgat 724254  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  724255 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 724354  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724355 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 724454  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724455 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 724500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 795080 - 794735
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795080 aaatttaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 794981  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  794980 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 794881  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794880 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 794781  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794780 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 794735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36077838 - 36077494
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077838 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36077739  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36077738 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36077639  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077638 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36077540  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077539 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36077494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36088424 - 36088080
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088424 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36088325  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36088324 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36088225  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088224 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36088126  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088125 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36088080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36292822 - 36292477
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36292822 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgat 36292723  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36292722 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36292623  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292622 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36292523  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292522 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36292477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36303425 - 36303080
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36303425 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgat 36303326  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36303325 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36303226  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303225 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36303126  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303125 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36303080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6150969 - 6150627
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150969 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6150870  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150869 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6150770  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150769 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6150671  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6150670 aaccaggataactgcttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 6150627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 15781089 - 15781432
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781089 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15781188  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15781189 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaag 15781288  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781289 tctcatacttagaaagtactgagcagttgcaatctttgtgattatagtgaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 15781388  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781389 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 15781432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 3349006 - 3349350
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349006 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3349105  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3349106 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 3349205  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349206 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 3349304  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349305 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3349350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 3359603 - 3359947
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359603 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3359702  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3359703 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 3359802  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 3359901  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359902 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3359947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 13688947 - 13689292
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688947 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13689046  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13689047 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 13689146  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689147 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 13689246  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689247 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13689292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29076632 - 29076288
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076632 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29076533  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29076532 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 29076433  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076432 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 29076334  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076333 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29076288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29086883 - 29086539
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086883 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29086784  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29086783 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 29086684  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086683 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 29086585  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086584 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29086539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44480992 - 44480648
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480992 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 44480893  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44480892 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 44480793  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480792 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 44480694  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480693 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 44480648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44491608 - 44491264
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491608 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 44491509  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44491508 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 44491409  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491408 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 44491310  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491309 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 44491264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9341045 - 9340701
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341045 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9340946  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9340945 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9340846  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340845 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 9340747  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340746 ggaaccaggataactgactgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9340701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9368189 - 9367845
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368189 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9368090  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9368089 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9367990  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367989 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 9367891  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367890 ggaaccaggataactgactgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9367845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31214914 - 31214570
Alignment:
Q  2 aaattcaa-agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31214914 aaattcaatagtctagagtctttattatattgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttga 31214815  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214814 tcagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 31214715  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31214714 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaat 31214615  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31214614 gaaccaggataactgcttatgtctttgtctttcttttctctgctc 31214570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 20161616 - 20161953
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20161616 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 20161715  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20161716 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20161815  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  20161816 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccag 20161915  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161916 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20161953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 23469846 - 23470181
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23469846 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 23469945  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23469946 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 23470045  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23470046 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccag 23470145  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  23470146 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 23470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19224829 - 19224492
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19224829 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 19224730  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19224729 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcata 19224630  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19224629 cttaaagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 19224530  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19224529 gataactgtttgtgtctttgcccttcttttctctgctc 19224492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18158150 - 18157815
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  18158150 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaag 18158051  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18158050 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 18157952  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18157951 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 18157852  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18157851 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 18157815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16746895 - 16746560
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  16746895 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 16746796  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16746795 agtcttgcatgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16746696  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16746695 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtaaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccattttgtggaaggaaccag 16746596  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
     ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  16746595 aataactgctggtgtc-ttgcttttcttttctctgct 16746560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Original strand, 30315082 - 30315421
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30315082 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagt 30315181  T
Q  109 ctctt-----gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtct 203  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30315182 ctcttatcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcatcggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtct 30315281  T
Q  204 catactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30315282 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggagtacttccgatttgtggaaggaa 30315381  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30315382 ccaggataattgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 30315421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19418247 - 19417911
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19418247 aaagtctacagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19418148  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19418147 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 19418048  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19418047 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttctgatttgtggaaggaacca 19417948  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19417947 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 19417911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19428822 - 19428486
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19428822 aaagtctagagtctttaacgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19428723  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19428722 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 19428623  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19428622 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttctgatttgtggaaggaacca 19428523  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19428522 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 19428486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18153631 - 18153297
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  18153631 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaag 18153532  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18153531 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 18153433  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18153432 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 18153333  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18153332 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 18153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 18769522 - 18769858
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||| |||||||||||||    
T  18769522 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtattttttgtttgattagaa 18769621  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18769622 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtctgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 18769721  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18769722 acttagagagtattgaacatttttaatctttgtgattatggtgaaatctccttgaaattgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 18769821  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18769822 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 18769858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 40213555 - 40213887
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaatt-ctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || |||    
T  40213555 aagtctagagtctttattacattat-ttgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaagtcaaacatattttctctgtatttttgtttgaatataag 40213653  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213654 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagacttttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 40213753  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40213754 cttagagagtattgagcatttgtaatctttctgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 40213853  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  40213854 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctg 40213887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 129 - 345
Target Start/End: Original strand, 13697185 - 13697403
Alignment:
Q  129 cattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13697185 cattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 13697284  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697285 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 13697384  T
Q  327 gtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13697385 gtctttcttttctctgctc 13697403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 22167409 - 22167748
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  22167409 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 22167508  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22167509 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 22167606  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22167607 act-agatagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 22167705  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22167706 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 22167748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 22136244 - 22136583
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  22136244 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 22136343  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22136344 tctctcgcctgcctgcttgagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 22136441  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22136442 act-agatagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 22136540  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22136541 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 22136583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3843415 - 3843081
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3843415 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 3843317  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3843316 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 3843219  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3843218 act-agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttctggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 3843120  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3843119 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 3843081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 20260005 - 20260335
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  20260005 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 20260103  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20260104 cctctcgcctgcatgcttgagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 20260201  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| |  |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20260202 acta-gtgagtactgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 20260300  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20260301 caggataattgcttgtgtcct--tctttcttttctct 20260335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 21046635 - 21046965
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  21046635 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 21046733  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21046734 cctctcgcctgcatgcttgagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 21046831  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| |  |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21046832 acta-gtgagtactgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 21046930  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21046931 caggataattgcttgtgtcct--tctttcttttctct 21046965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20195739 - 20195543
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20195739 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagt 20195640  T
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195639 taaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20195543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23290590 - 23290458
Alignment:
Q  212 gaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290590 gaaagtattgagcagttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 23290492  T
Q  312 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290491 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23363920 - 23363687
Alignment:
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  23363920 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgcgcttgagcattt--gagaagtctcatactaag 23363823  T
Q  213 aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  23363822 agagtattgaacatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaactag 23363723  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23363722 gataattgattgtgtc--tctctttcttttctctgctc 23363687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Original strand, 7018894 - 7019141
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||    
T  7018894 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgaga 7018991  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgt 292  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  7018992 agtctcatact-agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccggtt 7019090  T
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7019091 tgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 7019141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20195851 - 20195697
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20195851 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 20195752  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  20195751 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 20195697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 26735573 - 26735698
Alignment:
Q  218 attgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735573 attgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 26735672  T
Q  318 tgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||    
T  26735673 tgtgtcttattc-ttcttttctctgct 26735698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 17519552 - 17519857
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  17519552 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 17519651  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  17519652 cttgagcat-agaagtcttttgctttagtgctttagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 17519748  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    || |||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||    
T  17519749 gatcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggaactgaactacttccggtttttggaaggaaccagtataattg 17519848  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
    |||||||||    
T  17519849 cttgtgtct 17519857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40002885 - 40002576
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  40002885 attgcattgtactgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 40002786  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |   ||||||    
T  40002785 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--tgaagtctcatactaggtgtagtatt 40002688  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgattatagt-----gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  40002687 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttaatggaactctccttagaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataatt 40002588  T
Q  315 gcttgtgtcttt 326  Q
    | ||||||||||    
T  40002587 gtttgtgtcttt 40002576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 325
Target Start/End: Original strand, 23270531 - 23270641
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23270531 agtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataact 23270630  T
Q  315 gcttgtgtctt 325  Q
    |||||||||||    
T  23270631 gcttgtgtctt 23270641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19460767 - 19460556
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  19460767 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggta-gtattgagcagttgt 19460671  T
Q  231 aatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  19460670 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaaccaagataattgcttgtgtc- 19460572  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  19460571 -tctctttcttttctct 19460556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19558445 - 19558234
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  19558445 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggta-gtattgagcagttgt 19558349  T
Q  231 aatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  19558348 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaaccaagataattgcttgtgtc- 19558250  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  19558249 -tctctttcttttctct 19558234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 344
Target Start/End: Original strand, 15998808 - 15998936
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  15998808 agtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtagaaggaaccagaataact 15998907  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  15998908 gcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 15998936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Original strand, 45568410 - 45568719
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  45568410 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 45568509  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   ||||||    
T  45568510 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 45568606  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||     
T  45568607 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgtaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataat 45568706  T
Q  314 tgcttgtgtcttt 326  Q
    | | |||||||||    
T  45568707 tacctgtgtcttt 45568719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 22211869 - 22212082
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22211869 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcctgagca--tttgggaagtctcatact-agagagtattgagcagtt 22211965  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| ||||||||     |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22211966 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttgaaagtgcaaaggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgt 22212065  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  22212066 c--tctctttcttttctct 22212082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28903119 - 28902839
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  28903119 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgag 28903020  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcag 226  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   | ||||||||| ||| |   ||||||||||||    
T  28903019 cataggaagtctcttgctttagtgcttgagtaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---taaagtctcatgctaggtgtagtattgagcag 28902923  T
Q  227 ttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  28902922 ttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatctgtggaaggaacc 28902839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 7018768 - 7018956
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  7018768 aagtctagagtttttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgattagaag 7018867  T
Q  108 tctc----ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    ||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7018868 tctctcgatcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 7018956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Original strand, 23271689 - 23271900
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  23271689 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagtagttgt 23271785  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| || |||||||     
T  23271786 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaactagtttaattgtttgtgtc- 23271884  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  23271885 -tctctttcttttctct 23271900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29379157 - 29378961
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  29379157 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 29379060  T
Q  230 taatctt-tgtgatta----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||  ||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29379059 taatctggtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgt 29378961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21288056 - 21287756
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  21288056 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 21287957  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  21287956 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtacttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 21287860  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |    
T  21287859 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcgttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcat 21287760  T
Q  319 gtgt 322  Q
    ||||    
T  21287759 gtgt 21287756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21547702 - 21547625
Alignment:
Q  268 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21547702 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21547625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8031608 - 8031392
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-ag-tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcag 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||   || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  8031608 attagaagtctcttgctttagctgcttgagcaaaggaagtctcttttctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 8031511  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    ||||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| |||||||    
T  8031510 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaatataattgcttgt 8031411  T
Q  321 gtctttgtctttcttttctct 341  Q
    | |  | ||||||||||||||    
T  8031410 gcc--tctctttcttttctct 8031392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 22211776 - 22211911
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  22211776 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 22211875  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  22211876 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 22211911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19942884 - 19942585
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||| |||||||||||    |||||||| |    
T  19942884 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcagttgtgcttgacc 19942785  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagt 227  Q
    ||||||||||||||| ||   | |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| | |||||   || | ||||||||    
T  19942784 attagaagtctcttgattgtattcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctctttctaagtttagcagtgagcagt 19942688  T
Q  228 tgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtc 323  Q
    |||||||   | |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  19942687 tgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtc 19942588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21298666 - 21298504
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||    
T  21298666 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgctcga 21298567  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21298566 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21298504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12541118 - 12541041
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12541118 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccggattgtggaaggaaccaagataattgct 12541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Original strand, 15969520 - 15969610
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15969520 gaaatctccttggaagtgcaagggggaccggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 15969610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19460862 - 19460707
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19460862 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19460763  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19460762 gtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19558540 - 19558385
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19558540 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19558441  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19558440 gtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19558385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 19956838 - 19956949
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19956838 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaaatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcttgcgtgcttgag 19956937  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    |||  |||||||    
T  19956938 cataggaagtct 19956949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 1210243 - 1210408
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||    |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  1210243 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtccaaaccaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagtcttttgcttctgtgcttgagc 1210342  T
Q  130 at-ta-gaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    || || ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1210343 atataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 1210408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 15934132 - 15934277
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  15934132 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15934231  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    ||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15934232 cataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttg 15934277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21540606 - 21540426
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
T  21540606 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctctttctttagtgcttga 21540507  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta 210  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  21540506 gcataggaagtctcttgcatgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatacta 21540426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 24498761 - 24498857
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtg--aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24498761 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtggaaaatctccttcgaaatgcaagggggactggactacttctggattgtggaaggaaccaggataa 24498857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21298560 - 21298332
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||  |||| |||   ||||||    
T  21298560 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctttgtgctgtagcaattt---gaagtc 21298464  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttg 294  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||    
T  21298463 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttg 21298364  T
Q  295 tggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||| | |||| ||  |||||||||    
T  21298363 tggaaggaacctgtataattgtctgtgtcttt 21298332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23370446 - 23370386
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23370446 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23370386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 18321659 - 18321773
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  18321659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 18321758  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||    
T  18321759 cattagaagtctctt 18321773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17687479 - 17687372
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  17687479 ttgagcaattgtaatcttatgtgattatagtgaaaaatctctttggaagtgcaagggagacttgactact-ccgaattgtgtaaggaaccaggataattg 17687381  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
    |||||||||    
T  17687380 cttgtgtct 17687372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26832722 - 26832425
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     |||||||||||    
T  26832722 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttttgcttgagcat 26832623  T
Q  132 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta-agaaagtattgagcagttg 229  Q
      ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| | ||   ||||||||| | |||     || | ||||||||||    
T  26832622 aggaagtctcttgacttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtt---tgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttg 26832526  T
Q  230 taatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctt 325  Q
    |||||   | | |  || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  26832525 taatcagatattttcttttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggactacttcctgtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctt 26832426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29692963 - 29692683
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  29692963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 29692864  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgct--tgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgag 223  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |   |||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||    ||||||||| | |||||   |||| ||||    
T  29692863 agcattagaagtctcttgatt-gtgttaaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttgctaagtttagtagtgag 29692769  T
Q  224 cagttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29692768 tagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 29692683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 23271594 - 23271749
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    || | |||| |  ||||||| |||||    
T  23271594 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaatcctgtttgaatagaa 23271693  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23271694 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 23271749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 15934381 - 15934463
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  15934381 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 15934463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33052531 - 33052374
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| | |||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| |   ||||    
T  33052531 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaaatgttcaatccaaactgatttctgtata-atttgtttgtttagaagtctcttgcatttttgct 33052433  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgc 182  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33052432 tgagcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgc 33052374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18152148 - 18152295
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  18152148 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaccattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 18152247  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  18152248 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 18152295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Original strand, 40845888 - 40846163
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40845888 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40845987  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  40845988 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 40846083  T
Q  225 agttgtaat-ctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaag 300  Q
    | |||||||  |  |  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  40846084 aattgtaataatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 40846163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 14990563 - 14990681
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  14990563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattcataagtctcttgcatttgtgcttg 14990662  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14990663 agcaatagaagtctcttgc 14990681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29379236 - 29379097
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  29379236 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 29379137  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  29379136 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 29379097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8031702 - 8031593
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8031702 aagtttagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8031603  T
Q  106 agtctcttgc 115  Q
    ||||||||||    
T  8031602 agtctcttgc 8031593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24634826 - 24634749
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  24634826 tgtgattatagtgaaaaatctccttggaagggcaagggagactggactacttctgggttgtggaagggacctggataa 24634749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 45538938 - 45539055
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  45538938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 45539037  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45539038 agcattagaagtctcttg 45539055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19706947 - 19706874
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  19706947 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactactttcgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 19706874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 22462138 - 22462275
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||| | |||||||||||||   | |||||||||    
T  22462138 ttgtatggtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgtaggtgtgcttgag 22462237  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  22462238 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 22462275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 24679101 - 24679194
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  24679101 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccagattgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctttctctt 24679194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1744802 - 1744640
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||     || |||    
T  1744802 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattttgtttgaattgagaagtctcttgcagttttgattg 1744704  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  1744703 agcaatagaagtctcttgattatgttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 1744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 14989952 - 14990099
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14989952 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 14990051  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    | || ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  14990052 atcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 14990099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22673233 - 22673149
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  22673233 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 22673149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25163721 - 25163605
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||||||||    
T  25163721 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcaattgtgcttga 25163622  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||    
T  25163621 gcattagaaatctcttg 25163605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12541289 - 12541131
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || | ||||  |||||||| || |||||||||||| |  |||||| |||||      
T  12541289 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttttgtgta-atttgtttgttttgaagtctcttgcttttgtgcttaagcatag 12541191  T
Q  134 gaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||| | |||| || | ||||||||| ||| |||| |||| || | |||||||||||||||    
T  12541190 gaaatatctttctattgtgcttgagtatttgaagtctctagcttttgtgcttgagcattt 12541131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Original strand, 20383060 - 20383139
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20383060 tgaagtctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 20383139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27739382 - 27739279
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaaggggg-actggactacttccgtgttgtggaa-ggaaccaggataact 314  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  27739382 ttgagtagttgtaatcttatgtgattatagtgaaaatctctttgaaactgcaaggggggactgaactacttccgaattgtggaaaggaaccaggataatt 27739283  T
Q  315 gctt 318  Q
    ||||    
T  27739282 gctt 27739279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 33560699 - 33560833
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtc 109  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||    
T  33560699 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtc 33560798  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  33560799 tcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 33560833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43639431 - 43639155
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  43639431 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 43639332  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| || |||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||| ||   ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  43639331 agcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 43639235  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  43639234 atttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttcc-agttgtggaaggaac 43639155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2810458 - 2810340
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||||||| || ||||||||    |||||||||    
T  2810458 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgattataactctcttgcagttgtgcttgag 2810359  T
Q  129 ca-ttagaagtctcttgct 146  Q
    || || |||||||||||||    
T  2810358 cagtttgaagtctcttgct 2810340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 16376048 - 16376114
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16376048 tgattttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggtcatgactacttccggtttgtggaagaaacc 16376114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19153464 - 19153407
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  19153464 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttcagt-ttgtggaaggaa 19153407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 19505938 - 19506040
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  19505938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtttaaaccaaacatctttctatgtaattttgtttgtttagaagtctcttacttgtgtgtttgagc 19506037  T
Q  130 att 132  Q
    |||    
T  19506038 att 19506040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Original strand, 19957053 - 19957139
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19957053 attttagtgaactctccttggaagtgcaagggggatagggctacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 19957139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20256011 - 20256128
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  20256011 ttgtattgtgaacatcgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 20256110  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20256111 agcattagaagtctcttg 20256128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20382894 - 20383011
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  20382894 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 20382993  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20382994 agcattagaaatctcttg 20383011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 30421934 - 30422050
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||    |||||||    
T  30421934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaac-attttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctctcgcagttgtgcttg 30422032  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30422033 agcattagaagtctcttg 30422050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43773553 - 43773491
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43773553 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 43773491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17687631 - 17687473
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||| |    
T  17687631 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttctcaa-ccaaact-tattctttgta-atttgtttgtttaggaagtctcttgcttttgtgcttggg 17687535  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  ||| ||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17687534 cataggaaatctcttgcttgtatgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 17687473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18679465 - 18679348
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||| |    |||||||    
T  18679465 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttg 18679366  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18679365 agcattagaagtctcttg 18679348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18718654 - 18718537
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||| |    |||||||    
T  18718654 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttg 18718555  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18718554 agcattagaagtctcttg 18718537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22662520 - 22662436
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  22662520 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttacggtttgtggaaggaacctgtataaactgcttgtgtcttt 22662436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Original strand, 23433607 - 23433693
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23433607 ttgagcatttgtaatcatgtgttattatagtgaaatc-ccttggaagtgcaaggga-actggactactcctgtgttgtgggaggaacca 23433693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12193563 - 12193524
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12193563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12193524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12437991 - 12437952
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12437991 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12437952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13431121 - 13431160
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13431121 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13431160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17701391 - 17701352
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701391 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17701352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17928703 - 17928664
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928703 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17928664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 18121618 - 18121725
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattag 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || || ||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||||||||||    
T  18121618 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--catttttctagtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattag 18121715  T
Q  135 aagtctcttg 144  Q
    ||||||||||    
T  18121716 aagtctcttg 18121725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18557487 - 18557421
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18557487 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggagtggactacttccggattgtggaagaaacca 18557421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18557630 - 18557523
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||||| | ||    
T  18557630 ttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgaacataggaaacctcttgcttttg 18557531  T
Q  180 tgcttgag 187  Q
    ||||||||    
T  18557530 tgcttgag 18557523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19707158 - 19707119
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707158 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19707119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21932531 - 21932492
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932531 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21932492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 25850494 - 25850653
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | || | |||| || |||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  25850494 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttttgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 25850593  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
     ||  |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  25850594 tataggaagactcttgtgtttatgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 25850653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 305
Target Start/End: Original strand, 30422117 - 30422180
Alignment:
Q  243 tatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  30422117 tatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttgtggaaggaacc 30422180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39693184 - 39693018
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || |||||||||| |    | |||||    
T  39693184 ttgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttacagttgcgcttg 39693085  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  39693084 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagcattt 39693018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43644328 - 43644269
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  43644328 tagtgaactctccttggaattgcaaggggggcaggactacttccggattgtggaaggaac 43644269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43644546 - 43644507
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644546 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43644507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43773769 - 43773730
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43773769 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 45292484 - 45292445
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45292484 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 45292445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Original strand, 1210421 - 1210471
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1210421 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagagggacaggactacttccg 1210471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13644728 - 13644660
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13644728 tgtgattatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagcgg-actggactactcctgtgttgtgggaggaaccag 13644660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13745153 - 13745085
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13745153 tgtgattatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagcgg-actggactactcctgtgttgtgggaggaaccag 13745085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17797070 - 17796954
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  17797070 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattttgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 17796972  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17796971 agcattagaagtctcttg 17796954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17928525 - 17928475
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17928525 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccg 17928475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18772342 - 18772196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| |||| || ||||||| || |||||||||||     ||||||||    
T  18772342 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctgaaacaaatttctttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcagttatgcttgag 18772243  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  18772242 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgc 18772196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22707971 - 22707865
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||    
T  22707971 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaag 22707872  T
Q  138 tctcttg 144  Q
    |||||||    
T  22707871 tctcttg 22707865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 24678970 - 24679024
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgcttagt-gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24678970 ttagaagtctcttgcttttttgcttgagcataggaagactcttgcgtgtgtgctt 24679024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 33560932 - 33560994
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  33560932 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgtgcaaggaacc 33560994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Original strand, 14990196 - 14990257
Alignment:
Q  243 tatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  14990196 tatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtggaaggaa 14990257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17879274 - 17879237
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17879274 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaac 17879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18772123 - 18772050
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| | |||| |||||    
T  18772123 tagtgaactctccttggaagtgcgagggggacaggactacttctggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 18772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 300
Target Start/End: Original strand, 23192484 - 23192545
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23192484 tgattttagtgaattctccttggaaaggcaagggggacaggactacttccgaattgtggaag 23192545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24634974 - 24634929
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24634974 attgttttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 24634929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25163502 - 25163429
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  || ||||||||||| | |||| |||||    
T  25163502 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagtctacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 25163429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 45539155 - 45539215
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  45539155 tagtgaaatctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 45539215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 15336807 - 15336867
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  15336807 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 15336867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 15425872 - 15425932
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  15425872 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 15425932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 15517176 - 15517236
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  15517176 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 15517236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16206703 - 16206620
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  16206703 atagtgaactctccttggaagtgcaaggggg-caggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 16206620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16206947 - 16206831
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  || || ||| ||| || |||||||  | ||||||||||||| |   |||||    
T  16206947 ttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--catttttctagtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcatttttgctt 16206850  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16206849 gagcattagaagtctcttg 16206831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 17442319 - 17442359
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17442319 attgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaa 17442359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 18121827 - 18121887
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  18121827 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 18121887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22662766 - 22662619
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  22662766 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttg 22662667  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22662666 agtaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 22662619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15336589 - 15336628
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336589 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15336628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15425654 - 15425693
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425654 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15425693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15516958 - 15516997
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516958 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15516997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 17526233 - 17526272
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17526233 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 17526272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17879161 - 17879066
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctc-cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||  || |||| |||||  | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17879161 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattattatgaaaaatctcttgtaagtgacaaggggactggattacttccggattgtggaaggaaccaggataa 17879066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19155893 - 19155854
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19155893 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19155854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 331
Target Start/End: Original strand, 19506063 - 19506146
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||  |||| |||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  19506063 tgaactctccttggaagtgcaagtggaacatgactacttccggattgtcgaagtaacctgtataattgcttgtgtctttctctt 19506146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 20256232 - 20256291
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||  |||||||||||||    
T  20256232 tagtgaactctccttggaagtgcaagggagacatgactatttccggtttgtggaaggaac 20256291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23264126 - 23264165
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23264126 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgctcaa 23264165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24498610 - 24498649
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24498610 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa 24498649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24645977 - 24645942
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24645977 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24645942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 25850708 - 25850767
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||    
T  25850708 tagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgacaacttccggattgtggaaggaac 25850767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27739532 - 27739493
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739532 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27739493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 36104846 - 36104811
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgt 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36104846 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 36104811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 12758456 - 12758538
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  12758456 tagtgaactctccttaacagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 12758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17879205 - 17879155
Alignment:
Q  140 tcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17879205 tcttgcttatgtgcttgagcattgaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 17879155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18679245 - 18679163
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  18679245 tagtgaactgtccttggatgtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 18679163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18718434 - 18718352
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  18718434 tagtgaactgtccttggatgtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 18718352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27739464 - 27739402
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttt 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||||    
T  27739464 ttagaagtctcttgctttctgcttgagcataggaaatctcttacttgtgtgcttgagtatttt 27739402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28888874 - 28888788
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| | || |||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28888874 tagaagtatcttgcttgtgtgcttgatcgttggaagtctctttcagttgtgattgagcattggaagtctcttgcatgtgtgcttgag 28888788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39692969 - 39692907
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  39692969 atagtgaactctacttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 39692907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5825328 - 5825261
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5825328 gtgattatagtgaaatcccct-gaaagtgaaagggg-actggactactcatgtgttgtggaaggaaccag 5825261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Original strand, 6589865 - 6589958
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6589865 attataagtatcttgcttgtgtgcttgaacattgggagtatcttgcttgtgtccttgagcattggaagtctcttctttgtgtgcttgagcattt 6589958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17796852 - 17796783
Alignment:
Q  247 gtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||| |||| | |||||||    
T  17796852 gtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaagaaacctgtataactg 17796783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6407191 - 6407159
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6407191 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 6407159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6407372 - 6407336
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6407372 tattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 6407336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 18152393 - 18152477
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  18152393 atagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 18152477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33052351 - 33052303
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  33052351 gattgtagtgaaatcttcttgaaagtgcaagggagattggactacttcc 33052303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 227)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27603213 - 27602870
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603213 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27603114  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603113 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 27603014  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603013 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27602914  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602913 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27602870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 39352953 - 39353296
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352953 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39353052  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353053 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39353152  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353153 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 39353252  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353253 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 39353296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16003686 - 16003343
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003686 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16003587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003586 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 16003487  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003486 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 16003387  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003386 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16003343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27622562 - 27622219
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622562 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27622463  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27622462 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttatgaagt 27622363  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622362 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27622263  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622262 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27622219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 39364946 - 39365289
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39364946 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39365045  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365046 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39365145  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365146 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 39365245  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39365246 aaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 39365289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5290371 - 5290027
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290371 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5290272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5290271 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 5290172  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290171 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 5290072  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290071 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5290027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5300942 - 5300598
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300942 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5300843  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5300842 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 5300743  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300742 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 5300643  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300642 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5300598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30069699 - 30069355
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069699 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30069600  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30069599 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcattttttgtgaag 30069500  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069499 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 30069400  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069399 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30069355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6131256 - 6131599
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131256 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6131355  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131356 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6131455  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131456 ctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6131555  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131556 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6131599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9347007 - 9347350
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9347007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 9347106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9347206  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347207 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9347306  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347307 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9347350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15993124 - 15992781
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993124 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15993025  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993024 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 15992925  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15992924 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaatg 15992825  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992824 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15992781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 23362576 - 23362919
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23362576 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgat 23362675  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362676 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23362775  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362776 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 23362875  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362876 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23362919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34772375 - 34772718
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772375 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34772474  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772475 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34772574  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772575 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatttttgtgattatagtgaaatctccttggtagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 34772674  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772675 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34772718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34783320 - 34783663
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783320 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34783419  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783420 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34783519  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783520 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatttttgtgattatagtgaaatctccttggtagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 34783619  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783620 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34783663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36582353 - 36582009
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36582353 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 36582254  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582253 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 36582154  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582153 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 36582054  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582053 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36582009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36592908 - 36592564
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36592908 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 36592809  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592808 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 36592709  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592708 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 36592609  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592608 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36592564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9336420 - 9336763
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9336420 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 9336519  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336520 tagaagtatcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9336619  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336620 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9336719  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336720 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9336763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40390822 - 40391165
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390822 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40390921  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390922 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 40391021  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40391022 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgtaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 40391121  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40391122 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40391165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40401484 - 40401827
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401484 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40401583  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401584 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 40401683  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401684 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 40401783  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401784 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40401827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 22146988 - 22147330
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146988 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22147087  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147088 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22147187  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147188 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22147286  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147287 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22147330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31419128 - 31419471
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31419128 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgat 31419227  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31419228 cagaagtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 31419327  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419328 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 31419427  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419428 aaccaggataacttcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31419471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 22559902 - 22560244
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22559902 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctttgtatttttgtttgat 22560001  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560002 cagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22560101  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22560102 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttatgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaagg 22560201  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560202 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 22560244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 23296742 - 23297087
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296742 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23296841  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23296842 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23296941  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296942 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 23297041  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297042 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23297087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 23307310 - 23307655
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307310 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23307409  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23307410 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23307509  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307510 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 23307609  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307610 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23307655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 23707907 - 23708252
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707907 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23708006  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23708007 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23708106  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708107 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 23708206  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708207 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23708252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30227291 - 30226946
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227291 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30227192  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30227191 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 30227092  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227091 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 30226992  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30226991 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30226946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30237818 - 30237473
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237818 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30237719  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30237718 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 30237619  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237618 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 30237519  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237518 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30237473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31833948 - 31834295
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833948 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31834047  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----tttttgtg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  31834048 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtg 31834147  T
Q  198 aagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834148 aagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 31834247  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834248 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31834295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31844426 - 31844773
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844426 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31844525  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----tttttgtg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  31844526 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtg 31844625  T
Q  198 aagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844626 aagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 31844725  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844726 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31844773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40513784 - 40513439
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513784 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40513685  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40513684 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40513585  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513584 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 40513485  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513484 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40513439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10754957 - 10755300
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754957 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattaagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10755056  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10755057 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagttcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcagttttgtgaagt 10755156  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10755157 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgaaagg 10755256  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755257 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10755300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 22157571 - 22157909
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157571 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22157670  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157671 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22157770  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157771 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22157869  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157870 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 22157909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 27204257 - 27204600
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204257 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27204356  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27204357 tagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgtgaagt 27204456  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204457 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27204556  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27204557 aaccaggataactgcttgtgtctctgtctttcttttctctgctc 27204600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14557812 - 14557467
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557812 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14557713  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14557712 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14557613  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557612 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattaaagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14557513  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557512 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14557467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14568449 - 14568104
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568449 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14568350  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14568349 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14568250  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568249 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattaaagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14568150  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568149 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14568104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 23697249 - 23697594
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697249 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23697348  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23697349 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcatagttttgtgaa 23697448  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697449 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 23697548  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697549 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23697594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33951595 - 33951250
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951595 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33951496  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  33951495 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 33951396  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951395 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 33951296  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951295 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33951250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37729047 - 37728703
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37729047 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37728948  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37728947 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37728848  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728847 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 37728749  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728748 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37728703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37740363 - 37740019
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740363 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37740264  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37740263 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37740164  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740163 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 37740065  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740064 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37740019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39490745 - 39490400
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490745 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39490646  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39490645 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39490546  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490545 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 39490446  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39490445 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 39490400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39501935 - 39501590
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501935 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39501836  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39501835 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39501736  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501735 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 39501636  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39501635 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 39501590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 42043249 - 42043594
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043249 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42043348  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42043349 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42043448  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043449 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 42043548  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043549 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42043594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 42053824 - 42054169
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053824 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42053923  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42053924 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42054023  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054024 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 42054123  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054124 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42054169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31449019 - 31449362
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31449019 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattatatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgat 31449118  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31449119 cagaagtctcttgcctgcgttcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtggttgagcatctttgtgaagt 31449218  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449219 ctcatacttagaaagtattgatcagttgtaatccttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 31449318  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449319 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31449362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 35215971 - 35216315
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215971 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35216070  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35216071 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35216170  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216171 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35216269  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216270 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35216315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 35226555 - 35226899
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226555 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35226654  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35226655 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35226754  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226755 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35226853  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226854 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 22676581 - 22676927
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676581 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 22676680  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22676681 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 22676780  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676781 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 22676880  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22676881 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 22676927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 22686472 - 22686818
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686472 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 22686571  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22686572 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 22686671  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686672 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 22686771  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22686772 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 22686818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9377257 - 9376913
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377257 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9377158  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9377157 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9377058  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377057 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 9376959  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9376958 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9376913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 14041062 - 14041406
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041062 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14041161  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14041162 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14041261  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041262 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14041360  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041361 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14041406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14446796 - 14446452
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446796 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14446697  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14446696 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14446597  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446596 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14446498  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446497 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14446452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14457408 - 14457064
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457408 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14457309  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14457308 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14457209  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457208 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14457110  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457109 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14457064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15693827 - 15693483
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693827 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15693728  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15693727 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15693628  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693627 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 15693529  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693528 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15693483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 15740433 - 15740777
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740433 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15740532  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15740533 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15740632  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740633 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 15740731  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740732 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15740777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 15769593 - 15769937
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769593 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15769692  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15769693 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15769792  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769793 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 15769891  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769892 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15769937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24567554 - 24567898
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567554 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24567653  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24567654 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24567753  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567754 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24567852  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567853 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24567898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24816681 - 24816337
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816681 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24816582  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24816581 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24816482  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816481 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24816383  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816382 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24816337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24827269 - 24826925
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827269 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24827170  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24827169 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24827070  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827069 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24826971  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826970 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24826925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 27460626 - 27460970
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460626 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27460725  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27460726 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27460825  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460826 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27460924  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460925 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27460970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 27471025 - 27471369
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471025 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27471124  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27471125 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27471224  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471225 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27471323  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471324 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27471369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6976273 - 6976619
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6976273 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttga 6976372  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6976373 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 6976472  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976473 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 6976572  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6976573 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 6976619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6986763 - 6987109
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6986763 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttga 6986862  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6986863 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 6986962  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6986963 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 6987062  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6987063 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 6987109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 14030509 - 14030853
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030509 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14030608  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14030609 taaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14030708  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030709 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 14030807  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030808 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14030853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17607524 - 17607868
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607524 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17607623  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17607624 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17607723  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607724 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17607822  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607823 ggaaccagtataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17607868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17618139 - 17618483
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618139 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17618238  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17618239 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17618338  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618339 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17618437  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618438 ggaaccagtataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17618483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17719382 - 17719726
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719382 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17719481  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17719482 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17719581  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719582 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17719680  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719681 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17719726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17730034 - 17730378
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730034 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17730133  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17730134 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17730233  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730234 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17730332  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730333 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17730378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27042007 - 27041663
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27042007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27041908  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27041907 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27041808  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041807 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27041709  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27041708 ggaaccaggataactgcctgtgtatttgtctttcttttctctgctc 27041663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27052631 - 27052287
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052631 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27052532  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27052531 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27052432  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052431 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27052333  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27052332 ggaaccaggataactgcctgtgtatttgtctttcttttctctgctc 27052287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31348998 - 31349342
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348998 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31349097  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31349098 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31349197  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349198 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 31349296  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349297 ggaaccaggataactgtctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31349342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31359612 - 31359956
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359612 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31359711  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31359712 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31359811  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359812 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 31359910  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359911 ggaaccaggataactgtctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31359956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 36688159 - 36688503
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688159 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36688258  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36688259 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36688358  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688359 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36688457  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688458 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36688503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 36698725 - 36699069
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698725 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36698824  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36698825 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36698924  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698925 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36699023  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36699024 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36699069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43043460 - 43043123
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  43043460 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattccttgtatttttgtttgatcagaag 43043361  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043360 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 43043261  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043260 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 43043161  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043160 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43043123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24808377 - 24808721
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808377 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24808476  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24808477 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 24808576  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808577 gtctcatactttaaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24808675  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808676 ggaaccaggataactgcatgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24808721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1121691 - 1121354
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1121691 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1121592  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1121591 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1121492  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1121491 cttagagagtattgagtatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 1121392  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121391 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1121354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1108933 - 1108596
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1108933 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1108834  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1108833 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagacttttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1108734  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1108733 cttagagagtattgagtatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 1108634  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108633 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1108596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 20798167 - 20798502
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20798167 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 20798266  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798267 cctcttgcctgtgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 20798366  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20798367 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatatccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 20798466  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20798467 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 20798502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 19464442 - 19464779
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19464442 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19464541  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19464542 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcata 19464641  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19464642 cttagagagtattgagcattttgtaatcttcgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 19464741  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464742 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 19464779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 23406917 - 23407252
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | |||    
T  23406917 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcaaaag 23407016  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23407017 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 23407116  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23407117 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 23407216  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  23407217 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 23407252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 8522312 - 8522648
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  8522312 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 8522411  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8522412 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttaatgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 8522511  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8522512 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 8522611  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8522612 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 8522648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 19478472 - 19478809
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19478472 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19478571  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19478572 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcata 19478671  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19478672 cttagagagtattgaacattttgtaatcttcgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 19478771  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478772 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 19478809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 36084932 - 36085267
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  36084932 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 36085031  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36085032 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtttcata 36085131  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36085132 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgcgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 36085231  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  36085232 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 36085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 36229210 - 36229545
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  36229210 aaagtctagagtttttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 36229309  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36229310 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 36229409  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36229410 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 36229509  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  36229510 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 36229545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17446486 - 17446150
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  17446486 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcaga 17446387  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17446386 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctca 17446288  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17446287 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaacc 17446188  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17446187 aggataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 17446150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 42395470 - 42395790
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42395470 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgcgtg 42395569  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattga 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42395570 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtctcatacttagagagtattga 42395669  T
Q  223 gcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395670 gcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 42395769  T
Q  323 ctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    | |||  |||||||||||||||    
T  42395770 c-ttgcttttcttttctctgct 42395790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43621683 - 43621347
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  43621683 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 43621584  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43621583 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 43621484  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  43621483 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatctgtggaaggaacca 43621384  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  43621383 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 43621347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 20552286 - 20552622
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20552286 aaagtctagagtctttaacgtattttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20552385  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20552386 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20552485  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20552486 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 20552585  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20552586 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 20552622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 34063092 - 34063409
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  34063092 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaa 34063191  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34063192 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 34063290  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34063291 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaacca 34063390  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  34063391 ggataactgtttgtgtctt 34063409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 321
Target Start/End: Original strand, 20562796 - 20563110
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20562796 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20562895  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20562896 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20562995  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20562996 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 20563095  T
Q  307 ggataactgcttgtg 321  Q
    |||||||||||||||    
T  20563096 ggataactgcttgtg 20563110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21702918 - 21702581
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgt-----attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||     
T  21702918 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatc 21702819  T
Q  103 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21702818 agaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtc 21702719  T
Q  203 tcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21702718 tcatacttaaagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagga 21702619  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  21702618 accaggataactgcttgtgtc-tcgtttttcttttctct 21702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24983209 - 24982872
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24983209 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 24983110  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24983109 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaagtctcat 24983010  T
Q  207 actaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24983009 gcttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 24982910  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  24982909 aggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 24982872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 34052431 - 34052766
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  34052431 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaa 34052530  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34052531 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 34052629  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34052630 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaatca 34052729  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  34052730 ggataactgtttgtgt-tttattcttcttttctctgct 34052766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17457102 - 17456784
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||||| ||||||| |||    
T  17457102 caaagtctagagtatttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattcccctgtattttttgtttgatcaga 17457003  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17457002 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctca 17456904  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17456903 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatcgtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttatggaaggaacc 17456804  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17456803 aggataactgcttgtgtctt 17456784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24925928 - 24925609
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24925928 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 24925829  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24925828 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaaatctcat 24925729  T
Q  207 actaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24925728 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 24925629  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24925628 aggataactgcttgtgtctt 24925609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 36 - 344
Target Start/End: Original strand, 23392900 - 23393207
Alignment:
Q  36 tgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23392900 tgagaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattaga 23392999  T
Q  136 agtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatct 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  23393000 agactcttgcttagtgcttgagcattggaagacttttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcaaacttagagagtattgagcatttgtaatct 23393099  T
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  23393100 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactgcttgtgtc-ttgcttttctt 23393198  T
Q  336 ttctctgct 344  Q
    |||||||||    
T  23393199 ttctctgct 23393207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21705765 - 21705421
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgt-----attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||     
T  21705765 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatc 21705666  T
Q  103 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21705665 agaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtc 21705566  T
Q  203 tcatactaagaaagt-------attgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    ||||||| | | |||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21705565 tcatacttaaagagtattgagcattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgt 21705466  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  21705465 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-tcgtttttcttttctct 21705421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 130 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7031823 - 7031608
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  7031823 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtattgagcatttg 7031724  T
Q  230 taatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031723 taatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtc 7031624  T
Q  330 tttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  7031623 tttcttttctctgctc 7031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 37407119 - 37407434
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  37407119 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaa 37407217  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37407218 gcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 37407316  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  37407317 acttagagagtattgaacatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaaggaacga 37407416  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37407417 ggataactgcttgtgtct 37407434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 106592 - 106927
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  106592 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacact-ttctgtgtatttctgtttgattagaag 106690  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  106691 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaattt--gagaagtctcat 106788  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  106789 actaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaac 106888  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  106889 caggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctgctc 106927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 20625238 - 20625574
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20625238 aagtctatagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 20625336  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20625337 cctctcgcatgcatgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagcctcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 20625435  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20625436 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaac 20625535  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20625536 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 20625574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 20417376 - 20417707
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20417376 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 20417474  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20417475 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 20417572  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20417573 acta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 20417671  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  20417672 caggataattgcttatgtc--tctctttcttttctctg 20417707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32753733 - 32753418
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  32753733 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 32753635  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  32753634 tctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 32753537  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  32753536 acta-gagagtattgagcatctgtaatctgtgtgatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccagtttgtggaaggaat 32753438  T
Q  305 caggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  32753437 caggataattgcttgtgtct 32753418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 20215591 - 20215897
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||  || ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  20215591 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaa--caattttctgtataattctgtttgaataaaagtctcttgctttag 20215688  T
Q  121 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagta 218  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||    
T  20215689 tgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagta 20215786  T
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  20215787 ttgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataat 20215886  T
Q  314 tgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||    
T  20215887 tgcttgtgtct 20215897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 128 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21420431 - 21420215
Alignment:
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcag 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21420431 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgaccattt--gagaagtctcatactaagagagaattgagcat 21420334  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21420333 ttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 21420234  T
Q  325 ttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  21420233 t--tctttcttttctctgctc 21420215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40228312 - 40228012
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  40228312 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 40228213  T
Q  132 tagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  40228212 aggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40228115  T
Q  230 taatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40228114 taatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctagtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 40228015  T
Q  324 ttt 326  Q
    |||    
T  40228014 ttt 40228012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23478032 - 23477732
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  23478032 attgtattctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttcagtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 23477933  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  23477932 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 23477836  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23477835 gttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgt 23477736  T
Q  321 gtct 324  Q
    ||||    
T  23477735 gtct 23477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7031921 - 7031762
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031921 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7031822  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  7031821 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 7031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13522779 - 13522581
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13522779 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagtt 13522683  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13522682 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 13522583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Original strand, 35543694 - 35543908
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgta 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35543694 agaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcatgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgta 35543790  T
Q  232 atctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 325  Q
    |||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  35543791 atctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc-- 35543888  T
Q  326 tgtctttcttttctctgctc 345  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  35543889 tctctttcttttctctgctc 35543908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Original strand, 40033321 - 40033534
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  40033321 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40033418  T
Q  230 taatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40033419 taatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 40033518  T
Q  324 tttgtctttcttttctct 341  Q
      | ||||||||||||||    
T  40033519 --tctctttcttttctct 40033534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 36096215 - 36096428
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  36096215 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatactaggta-gtattgagcagtt 36096311  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36096312 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 36096411  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||  ||||||||||||    
T  36096412 ctctg--tttcttttctct 36096428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 36097672 - 36097885
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  36097672 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatactaggta-gtattgagcagtt 36097768  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36097769 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 36097868  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||  ||||||||||||    
T  36097869 ctctg--tttcttttctct 36097885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 20168630 - 20168843
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20168630 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatactaggta-gtattgagcagtt 20168726  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20168727 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttatgt 20168826  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  20168827 c--tctctttcttttctct 20168843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32160404 - 32160102
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  32160404 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagc 32160305  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagt 227  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  32160304 ataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaaatctcttgcctgtgtgcttgagtaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 32160208  T
Q  228 tgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  32160207 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggaacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcatgt 32160108  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  32160107 gtcttt 32160102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23488104 - 23487908
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  23488104 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 23488008  T
Q  230 taatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||  |||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23488007 taatctgcgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtct 23487908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 25112357 - 25112661
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  25112357 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 25112456  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  25112457 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 25112553  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  25112554 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 25112653  T
Q  319 gtgtcttt 326  Q
    ||||||||    
T  25112654 gtgtcttt 25112661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 25171448 - 25171752
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  25171448 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 25171547  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  25171548 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 25171644  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  25171645 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 25171744  T
Q  319 gtgtcttt 326  Q
    ||||||||    
T  25171745 gtgtcttt 25171752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13533486 - 13533323
Alignment:
Q  179 gtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaaggg 272  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13533486 gtgcttgagcattt--gggaagtttcatacta-gatagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggg 13533390  T
Q  273 ggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13533389 ggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 13533323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1915000 - 1914787
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |  ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  1915000 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 1914903  T
Q  230 taatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||| |||||||||     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  1914902 taatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccggtttatggaaggaaccaatataattgcttgtgtc 1914803  T
Q  324 tttgtctttcttttctct 341  Q
      | ||||||||||||||    
T  1914802 --tctctttcttttctct 1914787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 11208484 - 11208806
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||   || | ||||| |||||||||||||| |  |    
T  11208484 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac--aattttctgtacaattctatttgaatagaagtctcttgctttag 11208581  T
Q  121 tgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta-agaaagta 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||     ||||    
T  11208582 tgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagtaaaggaagtatcttgc-tgtgtgcttgagcattt---tgaagtctcatactagttgtagta 11208677  T
Q  219 ttgagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat- 310  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||  |||||||||||||| | ||     
T  11208678 ttgagcagttgtaatcagttgtgattatacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggggcatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtata 11208777  T
Q  311 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  11208778 aattgcatgtgtctt--tctttcttttctct 11208806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 36096122 - 36096257
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36096122 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 36096221  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  36096222 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 36096257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 36097579 - 36097714
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36097579 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 36097678  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  36097679 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 36097714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 35543599 - 35543733
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||| |||||    
T  35543599 aagtctatagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgatcagaag 35543698  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  35543699 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 35543733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13522872 - 13522737
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  13522872 aagtctggagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 13522773  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  13522772 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 13522737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 20168537 - 20168661
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  20168537 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 20168636  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  20168637 gtctcttgctttagtgcttgagcat 20168661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10848426 - 10848126
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  10848426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 10848327  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| || |||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  10848326 agcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtagtgagc 10848230  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  10848229 atttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 10848132  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  10848131 gtcttt 10848126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13533599 - 13533474
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||  || |||||||||||||    
T  13533599 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacactattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgttattctgtttgattagaa 13533500  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13533499 gtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 13533474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 7746177 - 7746478
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||    ||||||||    
T  7746177 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattataagtctcttgcagttgtgcttga 7746276  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    |||||| |||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||   |||||||| | |||||   || | ||||||    
T  7746277 gcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagca 7746373  T
Q  226 gttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtg 321  Q
    |||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  7746374 gttgtaatcagatattacattctagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtg 7746473  T
Q  322 tcttt 326  Q
    |||||    
T  7746474 tcttt 7746478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1915079 - 1914940
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1915079 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1914980  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1914979 cttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcatt 1914940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20550547 - 20550432
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  20550547 ttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 20550448  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  20550447 cattagaagtctcttg 20550432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13403817 - 13403702
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagt 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  13403817 attagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 13403720  T
Q  228 tgtaatctttgtgattat 245  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13403719 tgtaatctgtgtgattat 13403702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 26056184 - 26056276
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  26056184 gattatagtgaaatatcattggaagttcaagggggactggactacttctggattgtggaaggaaccaagataattgctttgtgtctttctctt 26056276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 643184 - 643299
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  643184 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaagctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 643283  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  643284 catgagaagtctcttg 643299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 28464821 - 28465120
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  28464821 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 28464920  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||| |||||    |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  28464921 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgagc 28465016  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  28465017 atttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 28465114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 40033247 - 40033381
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  40033247 attgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 40033346  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40033347 gcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 40033381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20567461 - 20567302
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtattttt--gtttgattagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  20567461 attgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaac---attttctttattattctgtttgattagaagtctcttggttttgtgctt 20567365  T
Q  126 gagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  20567364 gagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcaaaggaaacctcttgcttttgtgcttgag 20567302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23488178 - 23488061
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  23488178 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 23488079  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||   ||||||||||||    
T  23488078 gcaaaggaagtctcttgc 23488061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21659649 - 21659581
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  21659649 atagtgaactctccttgaaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccagtataa 21659581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33932921 - 33932622
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  33932921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 33932823  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatact-aagaaagtattgag 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| || | ||   |||| ||||    
T  33932822 agcaatagaagtctcttgatt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttagtaaatttagtagtgag 33932727  T
Q  224 cagttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttg 319  Q
    || ||||||||   |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||    
T  33932726 catttgtaatc--agatattgcatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 33932629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 2156757 - 2156872
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  2156757 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 2156856  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  2156857 catatgaagtctcttg 2156872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12078502 - 12078357
Alignment:
Q  47 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatt-tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg--agcattagaagtctctt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| | || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||||    
T  12078502 ctgattgtatatcaagtgttcaattcaaacaatattctttataatctttgtttg-ttaaaagtctcttgcttttgtgcttgcaagcataggaagtctctt 12078404  T
Q  144 gctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12078403 gcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 12078357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21072720 - 21072835
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| || |||||||||||    |||||||||    
T  21072720 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatataagtctcttgcagttgtgcttgag 21072819  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21072820 cattaaaagtctcttg 21072835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21199484 - 21199599
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21199484 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttgag 21199583  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21199584 cataagaagtctcttg 21199599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 22586466 - 22586609
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    || | |||| || |||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  22586466 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacccaaacatttttatgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttggttttgtgcttgagc 22586565  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactctt 172  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||    
T  22586566 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctctt 22586609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 30116320 - 30116619
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  30116320 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 30116419  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  30116420 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgagc 30116515  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  30116516 atttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 30116613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34637226 - 34637065
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  34637226 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacatatttctttgta-atttgtttgttcagaagtctcttgcttttgtgtttgagc 34637129  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||  ||| ||||||| ||  ||||||||| ||| ||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  34637128 atatgaaatctcttgtttgtgtgcttgagtatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagcattt 34637065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16607166 - 16607020
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||    |||||||||    
T  16607166 ttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtagttctgtttgaatagaagtatcttgcaattgtgcttgag 16607067  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  16607066 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgc 16607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Original strand, 26056004 - 26056093
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  26056004 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaagttatttctgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgc 26056093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31117306 - 31117232
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  31117306 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataactactttgtgtcttt 31117232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 31589637 - 31589703
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31589637 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaatgaacc 31589703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 35932490 - 35932790
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  35932490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 35932589  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||| |||   |||||||||||| ||||   ||||||| |||||||   |||| |||||    
T  35932590 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcctgcagttgtgcttgagcaatttt---aagtctcttactaagtttagtagtgagc 35932686  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  35932687 atttgtaatca--gatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 35932784  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  35932785 gtcttt 35932790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 305
Target Start/End: Original strand, 6513128 - 6513193
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  6513128 attatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacc 6513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34638109 - 34637976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||    
T  34638109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcatttgtggttaag 34638010  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34638009 catatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt 34637976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 13546223 - 13546283
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13546223 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 13546283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 9399318 - 9399377
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  9399318 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaac 9399377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12353279 - 12353393
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  12353279 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12353377  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12353378 cataagaagtctcttg 12353393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13403874 - 13403755
Alignment:
Q  44 ccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  13403874 ccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtctct 13403775  T
Q  143 tg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    || ||  |||||||||||||    
T  13403774 tgcctgcgtgcttgagcatt 13403755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23880719 - 23880604
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||| || ||||||||||||||    |||||||||    
T  23880719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 23880620  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
     || ||||||||||||    
T  23880619 tatcagaagtctcttg 23880604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28139260 - 28138958
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  28139260 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 28139162  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaaga-----aagtatt 220  Q
    || | ||||||||||||| ||| || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||      | ||| |    
T  28139161 agtaatagaagtctcttgattatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagcacgtagt 28139066  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgc 316  Q
    ||||| ||||||||   |  ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| | || || |||    
T  28139065 gagcaattgtaatca--gatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttcctttttgtggaaggaacctgtataaattgc 28138968  T
Q  317 ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||    
T  28138967 ttgtgtcttt 28138958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 23392088 - 23392205
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  23392088 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 23392187  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23392188 agcaatagaagtctcttg 23392205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 25097528 - 25097610
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  25097528 tagtgaactctccttggaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 25097610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 25155498 - 25155580
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  25155498 tagtgaactctccttggaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 25155580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 26120517 - 26120583
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26120517 tgattttagtgacttctccttggaagtacaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 26120583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 35986716 - 35987016
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35986716 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttatgcttg 35986815  T
Q  127 agcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| | | || |  ||||||  |||| |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||| ||| |    
T  35986816 agcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaagtttagtagtgaac 35986912  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| | || ||||||||||    
T  35986913 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggtagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaactgcttgt 35987010  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  35987011 gtcttt 35987016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6498891 - 6498806
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| | |||||||||||    
T  6498891 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatggaagtctcttg 6498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11993326 - 11993265
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  11993326 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 11993265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20968866 - 20968701
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||||    
T  20968866 ttgtgttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttatgtgtaattttttttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 20968767  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  ||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||| | | |||||||||||||    
T  20968766 cataggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttttatgcttgagcattt 20968701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 90125 - 90185
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  90125 tagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 90185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 3246140 - 3246224
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgga-ctacttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  3246140 atagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacaggaccgacttccgttttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 3246224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 19536781 - 19537058
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  19536781 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaa-tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 19536879  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| | |||     || | |||||    
T  19536880 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttgctagttttagcagtgagc 19536975  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  19536976 agttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacatgactacttccgatttgtggaaggaac 19537058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26765157 - 26764883
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||  |||||||||||||    |||||||    
T  26765157 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgatttgagaagtctcttgcagttgtgcttg 26765059  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaa-gaaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| ||||||    |||| |||||    
T  26765058 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaactttagtagtgagc 26764963  T
Q  225 -agttgtaatc-tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaagga 302  Q
     | ||||||||   | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  26764962 aatttgtaatcagatatta-tatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagga 26764883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30742420 - 30742336
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  30742420 atagtgaaccctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttcctggttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 30742336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 643402 - 643461
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  643402 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtagaaggaac 643461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 3245925 - 3245964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3245964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4886676 - 4886637
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886676 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4886637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 6512916 - 6513030
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||    ||||||||||    
T  6512916 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagc 6513015  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||    
T  6513016 attagaagtctcttg 6513030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9088622 - 9088583
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9088622 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9088583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 9399099 - 9399214
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  9399099 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 9399198  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  9399199 catatgaagtctcttg 9399214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13546008 - 13546047
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13546008 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13546047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15516623 - 15516584
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516623 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15516584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17814400 - 17814317
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  17814400 tagtgaactctccttggaagagcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 17814317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21100186 - 21100225
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100186 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21100225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21659865 - 21659826
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659865 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21659826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25740764 - 25740725
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25740764 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25740725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 29138889 - 29138928
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29138889 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29138928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31117532 - 31117493
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117532 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31117493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 31146118 - 31146157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31146157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 89907 - 90024
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||||    
T  89907 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaccttaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 90006  T
Q  130 attagaagtctcttgctt 147  Q
    ||||||||||||||||||    
T  90007 attagaagtctcttgctt 90024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 13736618 - 13736656
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736618 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 13736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 22000729 - 22000811
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||    
T  22000729 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttctggtttgtggaagaaacctgtataattgctttgtgtcttt 22000811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 26766537 - 26766619
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  26766537 tagtgaactcttcttggaaatgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 26766619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Original strand, 13736773 - 13736834
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  13736773 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 13736834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23589298 - 23589237
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23589298 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcttaggaagacttttgcgtttgtgcttgagcat 23589237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23880501 - 23880428
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||| |||||||| | |||| |||||    
T  23880501 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacatccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 23880428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33022101 - 33022040
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  33022101 atagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 33022040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 39799536 - 39799601
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||    
T  39799536 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatggctacttctgaattgtggaaggaac 39799601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4886401 - 4886317
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  4886401 atagtgaactttccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 4886317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6498746 - 6498666
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  6498746 tgaactctccgtggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 6498666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 12353496 - 12353556
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  12353496 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggcttgtggaaggaac 12353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20968683 - 20968623
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  20968683 tagtgaactctgcttggaagtgcaaggaggacatgactacttccggattgtggaaggaacc 20968623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 21199702 - 21199762
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21199702 tagtgaactctcctcgaaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 21199762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 23413457 - 23413573
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||    || | |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||||||||    
T  23413457 ttgtattgtgaacaccagtgattgtatatcaagtgttcatcctcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttga 23413556  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  23413557 gcattagaagtctcttg 23413573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 24495158 - 24495248
Alignment:
Q  220 tgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||    
T  24495158 tgagcaattgtaatcagtgagattataatgaaatc-ccttgaaagtgcaagggg-actggactactcttgtgttgtgggaggaaccagtataa 24495248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9823736 - 9823663
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9823736 tgtgatgatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagggggt-tggactacttctgtgttgtgggaggaatcagtataa 9823663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Original strand, 17263182 - 17263281
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  17263182 tgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcgtatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgaacattt 17263281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17814619 - 17814580
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17814619 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaa 17814580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Original strand, 23413679 - 23413758
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  23413679 tgaactctccttggaagtgaaagggggacaagactacttccggtttgtgtaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 23413758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26784008 - 26783969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26784008 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 26783969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30742635 - 30742596
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30742635 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 30742596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 39799359 - 39799398
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39799359 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 39799398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15516409 - 15516347
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| |||||||    
T  15516409 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggtaggaacc 15516347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23589161 - 23589095
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||    
T  23589161 tgattttagtgaactatcctcggaagtgcaagggggacagaactacttccgaattatggaaggaacc 23589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 25097319 - 25097349
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25097319 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25097349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 25155289 - 25155319
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25155289 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25155319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22747863 - 22747800
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||    
T  22747863 attatagtgaaatc-ccttggaagtgcaa-ggggactggactactcttgtgttatgggaggaacca 22747800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26783789 - 26783716
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||||    
T  26783789 tagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaatactacttccggtttgttgaaggaacctgtataattgctt 26783716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 42395450 - 42395479
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395450 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 42395479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9088408 - 9088324
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  9088408 atagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagactgatttccgatttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 9088324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 14087239 - 14087271
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14087239 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 14087271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20567390 - 20567330
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20567390 attagaagtctcttggttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagca 20567330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 25930622 - 25930678
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25930622 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaactgttcaa 25930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26013310 - 26013259
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagg 271  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26013310 ttgagcatttgtaatctatgagattatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagg 26013259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26013393 - 26013301
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |  | ||| ||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  26013393 ttagaagtgtcttgcttgcatgcttaagcattggaagtctctttcagttgtgattgagcatctgaagtctcttgtttgtgtgcttgagcattt 26013301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Original strand, 29139107 - 29139187
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  29139107 tgaactctccttggaagtgcaaggggggcaggactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 29139187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31487675 - 31487643
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31487675 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 31487643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31487886 - 31487850
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31487886 tattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 31487850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 298)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23767784 - 23767441
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767784 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23767685  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767684 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23767585  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767584 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 23767485  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767484 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23767441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 4175102 - 4175445
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175102 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4175201  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175202 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4175301  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175302 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4175401  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175402 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4175445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6180873 - 6181216
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180873 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6180972  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180973 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6181072  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181073 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6181172  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181173 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6181216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6221047 - 6221390
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221047 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6221146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221147 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6221246  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221247 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6221346  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221347 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6221390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13557464 - 13557121
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557464 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13557365  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557364 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13557265  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557264 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 13557165  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557164 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13557121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23757188 - 23756845
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757188 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23757089  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757088 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23756989  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756988 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 23756889  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756888 aaccaggacaactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23756845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37866335 - 37865992
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866335 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37866236  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866235 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37866136  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866135 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 37866036  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866035 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37865992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37885468 - 37885125
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885468 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37885369  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885368 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37885269  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885268 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 37885169  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885168 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37885125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9994238 - 9994581
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994238 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9994337  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9994338 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 9994437  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994438 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9994537  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994538 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9994581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13121552 - 13121209
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121552 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13121453  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121452 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13121353  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121352 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 13121253  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121252 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13121209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14476111 - 14475768
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14476111 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14476012  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14476011 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 14475912  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475911 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 14475812  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475811 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14475768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19788912 - 19788569
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788912 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19788813  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788812 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19788713  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788712 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19788613  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19788612 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttttctgctc 19788569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5537366 - 5537709
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5537366 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 5537465  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537466 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5537565  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537566 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5537665  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537666 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5537709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5547950 - 5548293
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5547950 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 5548049  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548050 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5548149  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548150 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5548249  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548250 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5548293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9982230 - 9982573
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982230 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9982329  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9982330 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 9982429  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982430 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttatgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9982529  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982530 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12249784 - 12250127
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249784 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12249883  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12249884 tataagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 12249983  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249984 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12250083  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250084 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12250127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13131794 - 13131451
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131794 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13131695  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131694 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13131595  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131594 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 13131495  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131494 aaccaggataacagcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13131451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23647639 - 23647295
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647639 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23647540  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23647539 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 23647440  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647439 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 23647340  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647339 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23647295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6501348 - 6501691
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501348 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6501447  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6501448 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 6501547  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501548 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6501647  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6501648 aaccaggataactgcttgtgtttttgtttttcttttctctgctc 6501691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12237958 - 12238301
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237958 aaattcaaagtctatagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12238057  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12238058 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgttcttgagcagttttgtgaagt 12238157  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238158 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12238257  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238258 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12238301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19778275 - 19777932
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778275 aaattcaaagtctagagtctgtactttattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19778176  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778175 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19778076  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778075 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19777976  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777975 aaccaggataacaacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19777932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 39673228 - 39673570
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673228 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39673327  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673328 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39673427  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673428 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 39673527  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39673528 aaccaggataactgctt-tgtctttgtctttcttttctctgctc 39673570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10655608 - 10655952
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10655608 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 10655707  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10655708 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatctttgtgaag 10655807  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655808 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcgttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 10655907  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655908 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10655952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 20684124 - 20684466
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684124 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20684223  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684224 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 20684323  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684324 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 20684422  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684423 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20684466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6490694 - 6491037
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490694 aaattcaaagtccagagtctttattgtattgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6490793  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6490794 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 6490893  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490894 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6490993  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6490994 aaccaggataactgcttgtgtttttgtttttcttttctctgctc 6491037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 10627286 - 10627629
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627286 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 10627385  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10627386 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaag 10627485  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10627486 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcgttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgtgttgtggaag 10627585  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627586 gaaccaggaaaactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 10627629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5579979 - 5580324
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5579979 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5580078  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5580079 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5580178  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580179 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5580278  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5580279 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 5580324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5866041 - 5866386
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866041 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5866140  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5866141 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5866240  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866241 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5866340  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866341 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5866386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5876640 - 5876985
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876640 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5876739  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5876740 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5876839  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876840 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5876939  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876940 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5876985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8774547 - 8774203
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774547 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8774448  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8774447 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 8774348  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774347 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 8774249  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774248 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8774203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10098958 - 10098614
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098958 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10098859  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10098858 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 10098759  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098758 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10098660  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098659 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10098614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24383864 - 24384209
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24383864 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24383963  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24383964 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24384063  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384064 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24384163  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384164 ggaaccaagataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24384209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23635593 - 23635256
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23635593 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 23635494  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635493 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 23635394  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635393 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 23635294  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635293 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23635256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37759560 - 37759216
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759560 aaattcaaagtctagagtctttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 37759461  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759460 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 37759361  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37759360 tctcacacttagaaagtattgaggagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaag 37759261  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759260 gaaccatgataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37759216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 13373011 - 13373356
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373011 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13373110  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13373111 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13373210  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373211 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 13373310  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373311 ggaactaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13373356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 13394199 - 13394544
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394199 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13394298  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13394299 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13394398  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394399 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 13394498  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394499 ggaactaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13394544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18483934 - 18483590
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483934 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18483835  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18483834 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 18483735  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483734 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 18483636  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483635 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18483590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20721003 - 20720658
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20721003 aaattcaaagtctagagtcttttctatattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20720904  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  20720903 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 20720804  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 20720704  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720703 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20720658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38194614 - 38194270
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194614 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38194515  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38194514 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38194415  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194414 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 38194316  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194315 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38194270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39382580 - 39382236
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382580 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39382481  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39382480 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39382381  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382380 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 39382282  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382281 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 39382236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12297146 - 12297492
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297146 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 12297245  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12297246 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 12297345  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297346 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 12297445  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12297446 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 12297492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 504513 - 504857
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504513 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 504612  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  504613 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 504712  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504713 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 504811  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  504812 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 504857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 526879 - 527223
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526879 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 526978  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  526979 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 527078  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527079 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 527177  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  527178 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 527223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4743628 - 4743284
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743628 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4743529  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4743528 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4743429  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743428 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 4743330  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743329 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4743284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4754215 - 4753871
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754215 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4754116  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4754115 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4754016  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754015 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 4753917  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753916 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4753871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5510586 - 5510242
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510586 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5510487  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5510486 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5510387  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510386 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5510288  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510287 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5510242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5520764 - 5520420
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520764 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5520665  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5520664 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5520565  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520564 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5520466  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520465 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5520420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 11272729 - 11273074
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272729 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11272828  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  11272829 tagaagtctctcgcctgagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 11272928  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272929 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 11273028  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11273029 ggaaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 11273074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 13383605 - 13383950
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383605 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13383704  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13383705 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagttcttgagcattggaagactcttacttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13383804  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383805 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 13383904  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383905 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13383950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35187267 - 35186923
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187267 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35187168  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35187167 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35187068  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187067 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35186969  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35186968 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35186923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39371943 - 39371599
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371943 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39371844  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  39371843 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtatgcttgagcatagttttgtgaa 39371744  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371743 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 39371645  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371644 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 39371599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41683568 - 41683224
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683568 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 41683469  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41683468 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 41683369  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683368 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 41683270  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683269 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41683224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41694137 - 41693793
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694137 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 41694038  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41694037 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 41693938  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693937 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 41693839  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693838 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41693793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 20673539 - 20673882
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673539 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20673638  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20673639 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 20673738  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20673739 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaag 20673837  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673838 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20673882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12287324 - 12287670
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287324 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 12287423  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12287424 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttggttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 12287523  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287524 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 12287623  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12287624 aggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 12287670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 28314577 - 28314922
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28314577 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 28314676  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28314677 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 28314776  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314777 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 28314875  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314876 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 28314922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38205150 - 38204805
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205150 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38205051  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38205050 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38204951  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204950 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtgga 38204852  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204851 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38204805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5628363 - 5628707
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628363 aaattctaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5628462  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5628463 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5628562  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628563 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaa-ggggactggactacttccgtgttgtggaa 5628661  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5628662 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 5628707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16385965 - 16385621
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385965 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16385866  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16385865 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16385766  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385765 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 16385667  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385666 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16385621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24659790 - 24659446
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24659790 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 24659691  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24659690 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24659591  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659590 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24659492  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659491 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24659446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24670370 - 24670026
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24670370 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 24670271  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24670270 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24670171  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670170 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24670072  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670071 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24670026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 28325193 - 28325536
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28325193 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 28325292  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28325293 ttagaagtctcttgcctg--tgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 28325390  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325391 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 28325489  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325490 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 28325536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 29461564 - 29461901
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29461564 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 29461663  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29461664 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 29461763  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  29461764 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgttattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactag 29461863  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461864 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29461901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 29472416 - 29472753
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29472416 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 29472515  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29472516 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 29472615  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  29472616 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactag 29472715  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472716 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29472753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 933510 - 933174
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||     
T  933510 aagtctagagtctttaacgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacctatttcattgtatttttgtttgatcagaagc 933411  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933410 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatac 933311  T
Q  209 taagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  933310 ttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 933211  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933210 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 933174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 1794835 - 1795170
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  1794835 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 1794934  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1794935 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1795034  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1795035 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 1795134  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1795135 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 1795170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 11217076 - 11217393
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  11217076 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 11217175  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11217176 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgagtgcttgagcatttttgagaagtctcata 11217275  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11217276 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 11217375  T
Q  308 gataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11217376 gataactgcttgtgtctt 11217393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 1784422 - 1784757
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||    
T  1784422 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttaatcagaag 1784521  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1784522 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1784621  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1784622 cttagagagtatcgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccattttgtggaaggaaccag 1784721  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1784722 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 1784757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 11206425 - 11206760
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  11206425 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 11206524  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11206525 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtatgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 11206624  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11206625 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 11206724  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  11206725 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 11206760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48337125 - 48336790
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  48337125 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaag 48337026  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48337025 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 48336926  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48336925 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 48336826  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  48336825 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 48336790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 19887698 - 19888040
Alignment:
Q  2 aaattcaa-agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  19887698 aaattcaagagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttga 19887797  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19887798 tcagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagattcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 19887897  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19887898 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 19887997  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19887998 gaaccaagataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 19888040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 7804869 - 7805205
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| |||||    
T  7804869 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattatatttttgtttgatcagaag 7804968  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804969 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 7805068  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagt-tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7805069 cttagagagtattgagcactgtgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaacca 7805168  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  7805169 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 7805205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 24706906 - 24707242
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24706906 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcactgtatttttgtttgatcagaag 24707005  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24707006 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaaatctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 24707105  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24707106 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 24707205  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  24707206 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 24707242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 7794958 - 7795294
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  7794958 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 7795057  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795058 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 7795157  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagt-tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7795158 cttagagagtattgagcactgtgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttcgaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaacca 7795257  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  7795258 ggataactacttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 7795294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 9391555 - 9391872
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9391555 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9391654  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9391655 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcatgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9391754  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9391755 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggacttcttccgatttgtggaaggaaccag 9391854  T
Q  308 gataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9391855 gataactgcttgtgtctt 9391872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4404157 - 4403822
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4404157 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaa 4404058  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4404057 gactcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 4403959  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4403958 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 4403859  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4403858 ggataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 4403822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11163712 - 11163398
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  11163712 aagtctagagtctttatggtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaaga 11163613  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11163612 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 11163514  T
Q  209 taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  11163513 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactagg 11163414  T
Q  309 ataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  11163413 ataactgcttgtgtct 11163398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 322
Target Start/End: Original strand, 9381009 - 9381323
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9381009 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9381108  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9381109 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcacttttaagaagtctcata 9381208  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9381209 cttagatagtactgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 9381308  T
Q  308 gataactgcttgtgt 322  Q
    | |||||||||||||    
T  9381309 ggtaactgcttgtgt 9381323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9535493 - 9535157
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9535493 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9535394  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9535393 cctcttgcctgcatgcttgagcattagaagactcttgcttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttagaagtctcata 9535294  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9535293 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 9535194  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  9535193 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 9535157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 17910353 - 17910692
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt---gtttgattag 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | |||  |||||||||   ||||||| ||    
T  17910353 aaagtctagagtctttaacgtattgtagtgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaatcaaaaatatttcattgtatttttcttgtttgatcag 17910452  T
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910453 aagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 17910552  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcag-ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17910553 atacttagagagtattgagcagtttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaa 17910652  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  17910653 ccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 17910692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38314583 - 38314243
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattga-----gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  38314583 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgat 38314484  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  38314483 cagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggtagactcttgtctgtgtgcttgagca-ttttgagaagt 38314385  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38314384 ctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtggttatagtgaaatctccttggaactgcaagggggactggactacttccgttttgtggaagg 38314285  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  38314284 aaccaggataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 38314243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 13262024 - 13262340
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  13262024 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 13262122  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13262123 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 13262222  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13262223 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaacggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 13262322  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13262323 ggataactgcttgtgtct 13262340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4433624 - 4433309
Alignment:
Q  27 gtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4433624 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttg 4433525  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcag 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  4433524 agcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 4433426  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4433425 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactgcttgtgtctta 4433326  T
Q  327 gtctttcttttctctgct 344  Q
     || ||||||||||||||    
T  4433325 ttc-ttcttttctctgct 4433309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 8740478 - 8740795
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  8740478 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 8740577  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8740578 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 8740676  T
Q  209 taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8740677 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagagcaagggagactggactactttcgatttgtggaaggaaccag 8740776  T
Q  308 gataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  8740777 gataattgcttgtgtcttt 8740795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Original strand, 14258416 - 14258751
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaatt-ctctgtattttt-gtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || | |||||||||| ||||||| ||||    
T  14258416 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagatattttccctgtattttttgtttgatcagaa 14258515  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14258516 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcctgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 14258614  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  14258615 acttagagagtattcagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacaa 14258714  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  14258715 ggataactgcttatgtcttattc-ttcttttctctgct 14258751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27883265 - 27882930
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  27883265 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 27883167  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27883166 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 27883068  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27883067 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 27882968  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27882967 aggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctgctc 27882930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 9006861 - 9007192
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9006861 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 9006959  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  9006960 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagagcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagcatttt-gagaagtctcat 9007058  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9007059 actcagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 9007158  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9007159 aggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctct 9007192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 14322043 - 14322358
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  14322043 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 14322141  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  14322142 gcctctagcctacgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattagaagactcttgcctgtgtggttgagcatttt-gagaagtctcat 14322240  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    | | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14322241 agttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 14322340  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14322341 ggataactgcttgtgtct 14322358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 8996309 - 8996644
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8996309 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaaaaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 8996407  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8996408 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaaaactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 8996506  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8996507 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 8996606  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8996607 aaaataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctgctc 8996644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16076811 - 16076494
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16076811 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 16076713  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16076712 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 16076614  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16076613 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 16076514  T
Q  305 caggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16076513 caggataattgcttgtgtct 16076494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1053591 - 1053255
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1053591 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtcttttcgtttgattagaag 1053493  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1053492 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 1053394  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1053393 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 1053294  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1053293 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 1053255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 17281787 - 17282122
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17281787 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 17281885  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  17281886 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 17281983  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17281984 actaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaac 17282083  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  17282084 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 17282122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Original strand, 29906534 - 29906869
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29906534 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29906632  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29906633 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcat 29906730  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29906731 acttagagagtattgaacatttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaac 29906830  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29906831 caggataactgcttgtgtcttact-tttcttttctctgct 29906869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8785034 - 8784817
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcag 226  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8785034 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 8784935  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784934 ttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 8784836  T
Q  327 gtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8784835 gtctttcttttctctgctc 8784817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1064020 - 1063684
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1064020 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtcttttcgtttgattagaag 1063922  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1063921 cctctcgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 1063823  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  1063822 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggacaacttctggtttgtggaaggaac 1063723  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1063722 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 1063684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 13199598 - 13199936
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  13199598 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaag 13199697  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13199698 tctctcgcctgcgtgcttgacgattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 13199795  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13199796 act-agagagtattaagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagg 13199894  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  13199895 aaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 13199936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 29947699 - 29948016
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29947699 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29947797  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29947798 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcat 29947895  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29947896 acttagagagtattgaacatttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 29947995  T
Q  305 caggataa-ctgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  29947996 caggataatttgcttgtgtct 29948016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 29996853 - 29997170
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29996853 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29996951  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29996952 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcat 29997049  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29997050 acttagagagtattgaacatttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 29997149  T
Q  305 caggataa-ctgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  29997150 caggataatttgcttgtgtct 29997170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 29933913 - 29934217
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  29933913 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacattttctgtgtaattttgtttgattggaagt 29934012  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29934013 ctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcata 29934110  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  29934111 cttagagagtattgagcatttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggatcc 29934210  T
Q  306 aggataa 312  Q
    |||||||    
T  29934211 aggataa 29934217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 29983067 - 29983371
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  29983067 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacattttctgtgtaattttgtttgattggaagt 29983166  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29983167 ctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcata 29983264  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  29983265 cttagagagtattgagcatttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggatcc 29983364  T
Q  306 aggataa 312  Q
    |||||||    
T  29983365 aggataa 29983371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2246248 - 2245928
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  2246248 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 2246149  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  2246148 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 2246051  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2246050 act-tgagagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaaatacaagggggactggactacttccggtttgtggaag 2245952  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  2245951 gaaccatgataattgcttgtgtct 2245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 134 - 344
Target Start/End: Original strand, 15194516 - 15194726
Alignment:
Q  134 gaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt-gtaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  15194516 gaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgtgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgtaa 15194615  T
Q  233 tctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtcttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  15194616 tctttgtgattatagtgaaatctcctaggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgctttt 15194714  T
Q  333 cttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||    
T  15194715 cttttctctgct 15194726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33650901 - 33650747
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650901 ttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 33650802  T
Q  291 gttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650801 gttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33650747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13601973 - 13601782
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13601973 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaa 13601874  T
Q  252 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  13601873 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 13601782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28168870 - 28168659
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgta 231  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28168870 agaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgta 28168771  T
Q  232 atctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||    
T  28168770 atctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactacttgtgtc-tcgtttt 28168672  T
Q  332 tcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||    
T  28168671 tcttttctctgct 28168659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 31114340 - 31114677
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  31114340 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 31114439  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||    
T  31114440 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattat--tgaagtctc 31114537  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31114538 atact-aggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 31114636  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31114637 aggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 31114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 16671515 - 16671766
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||     
T  16671515 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagc 16671613  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  16671614 ctctcgcatgtgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca-tttagagaagtctcata 16671712  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtgaaatctccttg 260  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16671713 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttg 16671766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14465481 - 14465332
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465481 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14465382  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465381 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtg 14465332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11530474 - 11530344
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530474 agtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 11530375  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530374 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11530344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 51989499 - 51989821
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    | || |||| || ||||||||||||    
T  51989499 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaatttactgtgtaattctgtttgattaga 51989598  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||  |  |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51989599 agtctcttgttttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 51989696  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51989697 atact-aggtagtattgagcagttgtaatctgtatgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 51989795  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  51989796 aggaatcagtataattgcttgtgtct 51989821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8785132 - 8784989
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8785132 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8785033  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8785032 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgc 8784989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13953923 - 13953607
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  13953923 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 13953824  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  13953823 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 13953727  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13953726 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctg 13953627  T
Q  320 tgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  13953626 tgtctt--tctttcttttctct 13953607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 344
Target Start/End: Original strand, 19121370 - 19121527
Alignment:
Q  186 agcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactact 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121370 agcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactact 19121469  T
Q  286 tccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19121470 tccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 19121527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22150911 - 22150605
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22150911 attgcattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22150812  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  22150811 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctctttcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 22150714  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||    
T  22150713 gagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaaccagtataattg 22150614  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
    | |||||||    
T  22150613 catgtgtct 22150605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17006854 - 17006553
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  ||||||||    
T  17006854 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatataagtctcttgctttagtgcttga 17006755  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  17006754 gcataagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 17006657  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  17006656 gttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccagtttgtggaagaaaccagtataatcgcttgt 17006557  T
Q  321 gtct 324  Q
    ||||    
T  17006556 gtct 17006553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 303
Target Start/End: Original strand, 18857426 - 18857580
Alignment:
Q  148 agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18857426 agtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatag 18857524  T
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18857525 tgaaatctccttagaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaa 18857580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14581012 - 14580685
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaatt-ctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || |||| || ||||||| |||||||||||||| |     
T  14581012 tttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttt 14580913  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt--ggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaa 215  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||    
T  14580912 agtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatact-tgaaa 14580816  T
Q  216 gtattgagcagttgtaatctttgtgatta------tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||      ||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14580815 gtattgagcagttgtaatctgtgagattattgatttagtgaaaatctccttggaagtgcaaggg----tagactacttccggattgtggaaggaaccagg 14580720  T
Q  309 ataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  14580719 ataactgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 14580685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 15663059 - 15663242
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  15663059 aagtctagagtctgtattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagt 15663158  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15663159 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 15663242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15833068 - 15832765
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  15833068 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagttcttga 15832969  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  15832968 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 15832872  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15832871 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctg 15832772  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  15832771 tgtcttt 15832765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 318
Target Start/End: Original strand, 24393356 - 24393483
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24393356 ttttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctcctttgtattgcaagggggactggactacttccgt 24393455  T
Q  291 gttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24393456 gttgtggaaggaaccaggataactgctt 24393483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Original strand, 15663180 - 15663427
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||    
T  15663180 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgaga 15663277  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgt 292  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |   |    
T  15663278 agtctcatact-agagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatctcttagtgaaaatctccttgaaagtgcaagggggactggtctactttcagtt 15663376  T
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15663377 tgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tatctttcttttctctgctc 15663427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Original strand, 35579002 - 35579111
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35579002 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttctt 35579101  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  35579102 ttctctgctc 35579111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 49989921 - 49989618
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  49989921 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 49989822  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  49989821 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgcagtattgagca 49989725  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
     ||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  49989724 attgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgtctg 49989625  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  49989624 tgtcttt 49989618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 15651424 - 15651603
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  15651424 aagtctagagtctgtattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagt 15651523  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15651524 ctctcgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtccttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 15651603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 342
Target Start/End: Original strand, 15651545 - 15651789
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||  | ||    
T  15651545 attagaagactcttgctttagtccttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctacgtgcttgagcattt--gaga 15651642  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgt 292  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  15651643 agtctcatacta-gagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatctcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtt 15651741  T
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||    
T  15651742 tgtggaaggaaccaggataattgcttgcgtc--tatctttcttttctctg 15651789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27172622 - 27172428
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27172622 aagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcatacta-gagagtattgagcagttgtaat 27172526  T
Q  234 ctttgtgattat------agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    || |||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27172525 ctgtgtgattattgatttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 27172428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41045408 - 41045086
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |   ||    
T  41045408 attgcattgtattgtgaacaccaccaatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttaatg 41045309  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  41045308 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgaaca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 41045211  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||| || |||| |    
T  41045210 gagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccagtttgtagaaggaactagtataatt 41045111  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    | |||||||  | ||||||||||||||    
T  41045110 gtttgtgtc--tctctttcttttctct 41045086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13076547 - 13076442
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13076547 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcctttcttt 13076449  T
Q  337 tctctgc 343  Q
    |||||||    
T  13076448 tctctgc 13076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10528931 - 10528733
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  10528931 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttatg--aagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 10528834  T
Q  230 taatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||| |||||||||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10528833 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagttcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc 10528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17017586 - 17017389
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  17017586 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 17017489  T
Q  230 taatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  17017488 taatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataatcgcttgtgtct 17017389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 12753121 - 12753425
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  12753121 attgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 12753220  T
Q  128 gcattagaagtctc-ttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  12753221 gcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 12753317  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| | | |    
T  12753318 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattacct 12753417  T
Q  319 gtgtcttt 326  Q
    ||||||||    
T  12753418 gtgtcttt 12753425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17961223 - 17961073
Alignment:
Q  15 agagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17961223 agagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtccaaccaatttctttatatttttgtttgaatagaagtctctt 17961124  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcatt--agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17961123 gcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcttgctttagtgcttgagcatt 17961073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21735896 - 21735713
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctc 256  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||     |||| |||||||    
T  21735896 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaatttgtgtgattatttcttagtggaaatctc 21735800  T
Q  257 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  21735799 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctttgctc 21735713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 11909535 - 11909840
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  11909535 attgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 11909634  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   ||||||    
T  11909635 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgggcttgagcaaaggaagtttcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 11909731  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||     
T  11909732 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaagggagacaggactgactttcggtttgtggaaggaaccagtataat 11909831  T
Q  314 tgcttgtgt 322  Q
    ||| |||||    
T  11909832 tgcctgtgt 11909840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21735992 - 21735868
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || | |||| || ||||||||||||||    
T  21735992 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattagaag 21735893  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21735892 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 21735868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 326
Target Start/End: Original strand, 45862162 - 45862362
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  45862162 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgcagtattgagcagttg 45862258  T
Q  230 taatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    |||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  45862259 taatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctgtgt 45862358  T
Q  323 cttt 326  Q
    ||||    
T  45862359 cttt 45862362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15848726 - 15848499
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  15848726 gaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 15848630  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15848629 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgt 15848530  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  15848529 ggaaggaaccagtataattgtctgtgtcttt 15848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28168965 - 28168811
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28168965 aagtctagagtttttattgcattgtatttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 28168867  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  28168866 gtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatt 28168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Original strand, 7608861 - 7608958
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  7608861 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggagtacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 7608958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37412193 - 37411992
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagtt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  37412193 ttagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 37412097  T
Q  229 gtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    ||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  37412096 gtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcttgtg 37411997  T
Q  322 tcttt 326  Q
    |||||    
T  37411996 tcttt 37411992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13147851 - 13147650
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca-gtt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |   ||||||||||| |||    
T  13147851 tagaagtctcttgctttagtgcttgatcaaagtaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattttg--aagtctcatactaggtgtagtattgagcaagtt 13147754  T
Q  229 gtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  13147753 gtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatgtgt 13147654  T
Q  323 cttt 326  Q
    ||||    
T  13147653 cttt 13147650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18006158 - 18005988
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  18006158 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac-caatttcttgtatttgtgtttgaatagaagtctcttgctttagtgc 18006060  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcat-tg-gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  18006059 ttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatctgagaagtctcttgctttagtgcttgagcattt 18005988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Original strand, 27244975 - 27245040
Alignment:
Q  280 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27244975 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27245040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15848862 - 15848699
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  ||||||||    
T  15848862 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgttttagtgcttga 15848763  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  15848762 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 15848699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51340671 - 51340509
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |   |||||||    
T  51340671 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttaatgcttga 51340572  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51340571 gcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 51340509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27849668 - 27849572
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||||||||    
T  27849668 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccggattgtggaaggaacgaggataattgctt-----tttgtctttcttttct 27849574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13931439 - 13931347
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg-cttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  13931439 gattatagtgaaatctccttagatgtgcaaaggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgttttgtgtctttctctt 13931347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27172706 - 27172565
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc-tgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || ||||||| || ||||||||||| |     
T  27172706 tttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaa--caattttcttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttt 27172609  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27172608 agtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 27172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52920091 - 52919976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  52920091 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 52919992  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  52919991 cattagaagtctcttg 52919976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51340565 - 51340340
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||| ||    
T  51340565 gaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaaatc 51340469  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttg 294  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||    
T  51340468 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggagaggactgacttccgttttg 51340369  T
Q  295 tggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    || |||||||| | |||| ||||||||||    
T  51340368 tgaaaggaacctgtataattgcttgtgtc 51340340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13931620 - 13931453
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |   ||||    
T  13931620 ttgttttgtattgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttacttttttgct 13931522  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||  ||  |||||| |||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13931521 tgagcataggatatctctttcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 13931453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 8729489 - 8729648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||     
T  8729489 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 8729588  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||    
T  8729589 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgtttgag 8729648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 9081376 - 9081535
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||     
T  9081376 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 9081475  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||    
T  9081476 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgtttgag 9081535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 45862066 - 45862220
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgatta 103  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||||||  || ||||||| ||    
T  45862066 aagtatagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaa--caattttctgtataattctgtttgaata 45862163  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  45862164 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 45862220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 12410292 - 12410399
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  12410292 attgttttgtattgtgaacaccactgattgtatataaattgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttgtgtgc 12410390  T
Q  124 ttgagcatt 132  Q
    |||||||||    
T  12410391 ttgagcatt 12410399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10529010 - 10528871
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  10529010 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 10528911  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10528910 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 10528871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17961043 - 17960968
Alignment:
Q  250 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17961043 aaatcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccagtataaattgcttgtgtct 17960968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15902853 - 15902736
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  15902853 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttg 15902754  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15902753 agcattagaagtctcttg 15902736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Original strand, 17769645 - 17769754
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaaggggga-ctggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  17769645 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctccttggaagtgcaaatgggaactggactatttccggattgtggaaggaactaggataatt 17769744  T
Q  315 gcttgtgtct 324  Q
    | ||||||||    
T  17769745 gtttgtgtct 17769754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Original strand, 19070946 - 19071055
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaaggggga-ctggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  19070946 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctccttggaagtgcaaatgggaactggactatttccggattgtggaaggaactaggataatt 19071045  T
Q  315 gcttgtgtct 324  Q
    | ||||||||    
T  19071046 gtttgtgtct 19071055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2025744 - 2025467
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  2025744 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttg 2025645  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  2025644 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 2025549  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  2025548 atttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgaaaggaacc 2025467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 13410752 - 13410817
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  13410752 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgaattgtggaaggaac 13410817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 50299887 - 50299613
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  50299887 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagc 50299788  T
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    | || |||||||||| ||  || |  |||| | ||||| |||| ||   |||||||||||| |||   |||||||| |||||||   |||| |||||| |    
T  50299787 aatataagtctcttgattgtgttcaggagcctaggaagtctctcgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatt 50299691  T
Q  228 tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  50299690 tgtaatcaga-tatttatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 50299613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 932492 - 932342
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||| |||  |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |    
T  932492 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-caaacttatttctaagtaatttc-tttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataagaaat 932395  T
Q  139 ctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||| | | |||||||||||||||    
T  932394 ctcttgcttgtgtgattgagtatttgaagtctcgtacttgtgtgcttgagcat 932342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 17239424 - 17239725
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  17239424 ttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 17239523  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   |||||||||| | |||   |||||||| | |||||   || | |||||    
T  17239524 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagc 17239620  T
Q  225 agttgtaatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtg 321  Q
    ||||||||||   ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  17239621 agttgtaatcagatttacattttagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtg 17239720  T
Q  322 tcttt 326  Q
    |||||    
T  17239721 tcttt 17239725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37412266 - 37412134
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  37412266 attgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgtttagaagtctcttgctttagtgcttga 37412167  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    |||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  37412166 gcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 37412134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16032252 - 16032137
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  16032252 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 16032153  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  16032152 cataggaagtctcttg 16032137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 21606157 - 21606275
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  21606157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 21606256  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  21606257 agcaatagaagtctcttgc 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 26418178 - 26418293
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26418178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26418277  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  26418278 cataggaagtctcttg 26418293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 29951939 - 29952054
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  29951939 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 29952038  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29952039 cataagaagtctcttg 29952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 30001093 - 30001208
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  30001093 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 30001192  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  30001193 cataagaagtctcttg 30001208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 49643263 - 49643429
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  49643263 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 49643362  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  49643363 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 49643429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2560624 - 2560542
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  2560624 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 2560542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11078200 - 11078134
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11078200 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacc 11078134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12963586 - 12963703
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  12963586 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 12963685  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12963686 agcattagaagtctcttg 12963703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13699026 - 13698862
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactca--attctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||   |||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  13699026 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccccaa-tcatttttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgcttga 13698928  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||    
T  13698927 gcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtttcatgcttgtgtgcttgaacattt 13698862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22140420 - 22140304
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22140420 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22140322  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22140321 agcattagaagtctcttg 22140304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30390883 - 30390841
Alignment:
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30390883 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30390841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3238130 - 3238057
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  3238130 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 3238057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21316998 - 21316905
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg-cttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  21316998 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggagacaagactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgatttgtgtctttgtctt 21316905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 23538884 - 23538957
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  23538884 tagtgaactctccttggaagtgcaatggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 23538957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 30054683 - 30054799
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  30054683 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 30054782  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30054783 agcaatagaagtctctt 30054799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 49554003 - 49554168
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  49554003 ttgtattgtgaacaccgctgattgtaaatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 49554102  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  49554103 gcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 49554168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 8874621 - 8874737
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    |||||| |    
T  8874621 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttaa 8874720  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  8874721 gcattagaagtctcttg 8874737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13147930 - 13147838
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  13147930 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 13147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20724518 - 20724466
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20724518 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 20724466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 22804523 - 22804641
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga---ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  | ||||  ||| || |||||||   |||||||||||||||    ||||||    
T  22804523 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaaatttcttagtaattctgtttgaattttagaagtctcttgcagttgtgctt 22804622  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22804623 gagcattagaagtctcttg 22804641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41494654 - 41494490
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||| | |||||||||||||| |  |||||||||    
T  41494654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttaaatagaagtctcttgcatttgtgcttgag 41494555  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||| |||||||| ||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  41494554 cataagaagtctattgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 41494490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6252866 - 6252799
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactg-gactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  6252866 tgattttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggacagaaactacttccggtttgtggaaggaacc 6252799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12967965 - 12967854
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  12967965 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12967866  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
     ||| |||||||    
T  12967865 aattggaagtct 12967854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14072354 - 14072240
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  14072354 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaac-attttttatgtatttttgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgag 14072256  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  14072255 cataggaagtctcttg 14072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 14077822 - 14077980
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||    
T  14077822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattttgtttgagtagaagtcttttgcagttatgcttgag 14077920  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  14077921 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgag 14077980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Original strand, 19198588 - 19198655
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19198588 tgattttagtgaactctccttggaagttcaagggggagtggactactcccggattgtggaaggaacca 19198655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Original strand, 22804746 - 22804801
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22804746 tgaaatctcattggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaa 22804801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27849843 - 27849689
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | || | ||||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||| |||    
T  27849843 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgtccaaaccaaacttatttatgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgcttaagc 27849745  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||    
T  27849744 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttttgtgctt 27849689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 38178147 - 38178312
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  38178147 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaagtaagaagtctcttgcagttgtgcttg 38178245  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  38178246 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 38178312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14955085 - 14954969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14955085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 14954987  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  14954986 agcaatagaggtctcttg 14954969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17017660 - 17017526
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||     |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17017660 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaacttaaataattttctgtgtatttctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17017561  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  17017560 gcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 17017526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21640523 - 21640406
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21640523 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 21640424  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| || ||||||||||    
T  21640423 agcaatataagtctcttg 21640406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 22770571 - 22770637
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22770571 tgattttagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactacttccgaattgtggaaggaacc 22770637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 26418397 - 26418479
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  26418397 tagtgaactctacttggaagtgcaaggggcacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 26418479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28581761 - 28581645
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  28581761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 28581663  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28581662 agcattagaagtctcttg 28581645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40799553 - 40799437
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40799553 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40799455  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40799454 agcattagaagtctcttg 40799437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40850633 - 40850333
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    || ||||    
T  40850633 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtacttg 40850534  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   |||| |||| |||||||   |||| |||||    
T  40850533 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaactctcttactaagtttagtagtgagc 40850437  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  40850436 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 40850339  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  40850338 gtcttt 40850333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47207145 - 47207083
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  47207145 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 47207083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8693589 - 8693512
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||   || | |||||||||||||||| ||||    
T  8693589 gattatagtgaaatctccttggacaagcaagggggactgcactacttccagatttttgaaggaaccaggataattgct 8693512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9045476 - 9045399
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||   || | |||||||||||||||| ||||    
T  9045476 gattatagtgaaatctccttggacaagcaagggggactgcactacttccagatttttgaaggaaccaggataattgct 9045399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15647218 - 15647145
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  15647218 gattatagtgaaaatgttcttggaagtgcaaggggtactggagtacttccgcattgtggaaggaaccgggataa 15647145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6090157 - 6090105
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6090157 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 6090105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 7833129 - 7833292
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||| |    
T  7833129 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgtttagaagtatcttgcatttgtgcttgtg 7833228  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  ||  ||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  7833229 cataggacatctcttgcaagtgtgcttgagtattggaagtctcttg-atgtgtgcttgagaattt 7833292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 14063710 - 14063770
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||    
T  14063710 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccagtttgtggaaggaacc 14063770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17697274 - 17697158
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  17697274 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17697175  T
Q  129 cattagaagtctcttgc 145  Q
    |||  ||||||||||||    
T  17697174 cataggaagtctcttgc 17697158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28581546 - 28581462
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  28581546 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 28581462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Original strand, 49669207 - 49669267
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  49669207 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaa 49669267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1728518 - 1728557
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1728518 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1728557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11074058 - 11074019
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11074058 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttg 11074019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11223220 - 11223054
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  11223220 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11223121  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    | |||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  11223120 accattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 11223054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 318
Target Start/End: Original strand, 12410413 - 12410492
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12410413 gattatagtgaaaatctccttggaagtgtaagggaagctggactacttctggattgtggaaggaaccaagataattgctt 12410492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13410549 - 13410588
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410549 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13410588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13939334 - 13939275
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||    
T  13939334 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgacaacttccggtttgtggaaggaac 13939275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Original strand, 14078029 - 14078096
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||    
T  14078029 tgattttagtgaactctcctttgaagtgcaagggggagtggactacttccagattatggaaggaacca 14078096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15961132 - 15961171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15961132 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15961171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16881945 - 16881906
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16881906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19249914 - 19249953
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19249914 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19249953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20724745 - 20724630
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  20724745 ttgtattatgaacaccactgattatatatcaggcgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtatcttgcttgtgtgcttgag 20724646  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  20724645 cataggaagtctcttg 20724630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21638746 - 21638785
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21638746 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21638785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22128701 - 22128662
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128701 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22463595 - 22463634
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22463595 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22463634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22465053 - 22465092
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22465053 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22465092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24776035 - 24776074
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24776035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24776074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 25398759 - 25398798
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398759 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25398798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29855065 - 29855026
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855065 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29855026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 46796870 - 46796909
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46796870 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 46796909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 47207360 - 47207321
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207360 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47207321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 47405925 - 47405964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47405925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47405964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 49554216 - 49554299
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  49554216 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 49554299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 932327 - 932249
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  932327 gattatagtgaaaatctctttggaagtacgagggggactgggttacttctgtattgtggaaggaaccatgataattgct 932249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1463942 - 1463847
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1463942 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaact-tattctttgta-atttgtttgtttaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 1463847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6174780 - 6174730
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6174780 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagaactacttccg 6174730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 12963806 - 12963888
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  12963806 tagtgaactctccttggaagtgtaagggggacatgattacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 12963888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13698849 - 13698783
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13698849 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagagggacaagactactaccggattgtggaaggaacc 13698783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 13781087 - 13781367
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  || |||||||||||     |||||||    
T  13781087 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgtagttgtgcttg 13781186  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    | |||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| | |||||   || | |||||    
T  13781187 aacattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttgctaagtttagcagtgagc 13781282  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||   | | | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13781283 agttgtaatcagatatttcattttagtgaactctccttggatgtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaacc 13781367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13947994 - 13947877
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  13947994 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttg 13947895  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13947894 aacattagaagtctcttg 13947877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Original strand, 16305651 - 16305749
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  16305651 attgtgaacaccattgattgtatattaattgttcaaaccaaacatctttctctgtagttttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttcagcatt 16305749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Original strand, 16305781 - 16305855
Alignment:
Q  257 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||||    
T  16305781 cttggaagtgcaagggggacaggtctacttccgaattgtggaaggaacctgtataatttcttgcgtctttctctt 16305855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 29952157 - 29952239
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  29952157 tagtgaactccccttgaaagtgcaaaggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 29952239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 30001311 - 30001393
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  30001311 tagtgaactccccttgaaagtgcaaaggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 30001393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 30054898 - 30054960
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  30054898 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 30054960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 53057232 - 53057349
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||| ||    
T  53057232 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcctg 53057331  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53057332 agcattagaagtctcttg 53057349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13823507 - 13823446
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  13823507 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 13823446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20645590 - 20645537
Alignment:
Q  247 gtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  20645590 gtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 20645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31302789 - 31302728
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||    
T  31302789 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaac 31302728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52919895 - 52919830
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||| | |||| |||||    
T  52919895 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccgatttgtggaagaaacctgtataattgctt 52919830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1463853 - 1463738
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttg-tgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| |||    ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  1463853 ttgagcaattgtaatcttgcatgattatagtgaaaaatatctttggaagtgcaagggggactagactaattcttgattgtggaagaaaccatgataattg 1463754  T
Q  316 cttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||| |||| ||||    
T  1463753 cttgtgactttttctt 1463738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2782919 - 2782835
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  2782919 atagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 2782835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2784722 - 2784604
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa--gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||    
T  2784722 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgctt 2784623  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  2784622 gagcaatagaagtctcttg 2784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 4243694 - 4243754
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4243694 ttagaagtctcttgcttttgtggttgaacataggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcat 4243754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8710444 - 8710404
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8710444 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatagaagtctcttg 8710404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9062331 - 9062291
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9062331 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatagaagtctcttg 9062291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12396514 - 12396450
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  12396514 gtgattttagcgaactctccttggaagtgcaagggagataggactacttccggtttgtggaagga 12396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 18122119 - 18122155
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122119 tattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18122155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 20628153 - 20628213
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||    
T  20628153 agtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtggaaggaacc 20628213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 21638991 - 21639075
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| |||||||||| | || || |||||||||||||    
T  21638991 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgaggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 21639075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Original strand, 22463751 - 22463811
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22463751 atagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaa 22463811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Original strand, 22465209 - 22465269
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22465209 atagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaa 22465269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2560839 - 2560804
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2560839 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3238348 - 3238309
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3238348 ttgtattgtgaacaccactgtttgtatatcaagtgttcaa 3238309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5213234 - 5213195
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5213234 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 5213195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6174993 - 6174954
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6174993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtcttcaa 6174954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10928624 - 10928533
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  10928624 tagaagtttcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctttcagttgtgattgagcgttagaagtctcttgcttgtgtgcttaagcattt 10928533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11078346 - 11078307
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11078346 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 11078307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 305
Target Start/End: Original strand, 12726750 - 12727016
Alignment:
Q  43 accactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtct 140  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  12726750 accactggttgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtct 12726849  T
Q  141 cttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatc---t 235  Q
    |||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||||    |||||||| | |||||   |||| |||||||||||||||   |    
T  12726850 cttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttagcattt----gaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagat 12726945  T
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     |   ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  12726946 attacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtagaaggaacc 12727016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12967746 - 12967687
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  12967746 tagtgaactctccttgaaagtgcaatggggacatgactactttcgggttgtggaaggaac 12967687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16659120 - 16659159
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16659120 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16659159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16879673 - 16879634
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16879673 ttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 16879634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 18143248 - 18143287
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143248 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 18143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 20627936 - 20627975
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20627936 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 20627975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Original strand, 22770414 - 22770521
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||| | | ||    
T  22770414 ttctttgtaattctgttcgattagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttccttttg 22770513  T
Q  180 tgcttgag 187  Q
    ||||||||    
T  22770514 tgcttgag 22770521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 23538666 - 23538797
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||  | |||| |||| || | ||||| ||||||||||||||    ||||||||||    
T  23538666 tgtattgtgaacaccgcttattgtatatcaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 23538765  T
Q  130 attagaagtctcttg-cttagtgcttgagcat 160  Q
    ||  |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  23538766 ataggaagtctcttgatttagttcttgagcat 23538797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 305
Target Start/End: Original strand, 53057446 - 53057509
Alignment:
Q  243 tatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  53057446 tatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttcgtggaaggaacc 53057509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 1728734 - 1728796
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1728734 atagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 1728796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 4243830 - 4243896
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||   | ||||||||  ||||||||||||||    
T  4243830 tgattttagtgaagtctctttggaagtgcaagggggacaatattacttccggattgtggaaggaacc 4243896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11189452 - 11189378
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||| | |||| |||||    
T  11189452 tagtgaactctcgttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 11189378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 13410623 - 13410681
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13410623 agaagtttcttgctcttgtgcttgagcataggaaaactcttgcgtttgtgcttgagcat 13410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Original strand, 15961340 - 15961389
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15961340 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggactacttccg 15961389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 285
Target Start/End: Original strand, 20736609 - 20736673
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactact 285  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20736609 ttgagcatttgtaatgtttgaggttatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaa-ggggactggactact 20736673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40799338 - 40799276
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  40799338 atagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtagaaggaacc 40799276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 46797114 - 46797176
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  46797114 atagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 46797176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8710455 - 8710418
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8710455 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 8710418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9062342 - 9062305
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9062342 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 9062305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10850012 - 10849947
Alignment:
Q  262 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  10850012 aagtgcaaggaggagtggactacttccggattgtggaaggaaccactataattgctttgtgtcttt 10849947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 12756018 - 12756103
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttg 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |  | ||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  12756018 ttagaagtctcttgcttgtgtgcttaagcattggaagtctctttcaattgtgattgagcattgaaaatctcttgcttgtgtgcttg 12756103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 22770433 - 22770494
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||    
T  22770433 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 22770494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2784505 - 2784473
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2784505 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 2784473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Original strand, 20747315 - 20747377
Alignment:
Q  242 ttatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  20747315 ttatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagggg-actggactacttttgtgttatgggaggaacca 20747377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29854844 - 29854784
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29854844 agtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 29854784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33582884 - 33582848
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33582884 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaa 33582848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #298
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 69
Target Start/End: Original strand, 49669003 - 49669031
Alignment:
Q  41 acaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49669003 acaccactgattgtatatcaagtgttcaa 49669031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 211)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4177733 - 4177390
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177733 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4177634  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177633 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4177534  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177533 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4177434  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177433 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4177390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5640099 - 5640442
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640099 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5640198  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640199 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5640298  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640299 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5640398  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640399 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5640442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19178777 - 19178434
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178777 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19178678  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178677 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19178578  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178577 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19178478  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178477 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19178434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19187656 - 19187313
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187656 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19187557  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187556 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19187457  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187456 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19187357  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187356 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19187313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12898370 - 12898713
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898370 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12898469  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898470 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12898569  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898570 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12898669  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898670 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12898713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33084380 - 33084039
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084380 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33084281  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33084280 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 33084181  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084180 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 33084081  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084080 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 33084039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 5650656 - 5650999
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650656 aaattcaaagtctagggtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5650755  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5650756 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttgtgaagt 5650855  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650856 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5650955  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650956 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5650999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21863479 - 21863136
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863479 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21863380  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863379 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21863280  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863279 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 21863180  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21863179 aaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 21863136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10998173 - 10998516
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998173 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10998272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998273 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 10998372  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10998373 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggaccggactacttccgtgttgtggaagg 10998472  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998473 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10998516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12624170 - 12624513
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624170 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12624269  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624270 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12624369  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624370 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12624469  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624470 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12624513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 35649080 - 35649425
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649080 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35649179  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35649180 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35649279  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649280 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35649379  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649380 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35649425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38094894 - 38094549
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094894 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38094795  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38094794 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38094695  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094694 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 38094595  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094594 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38094549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38105519 - 38105174
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105519 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38105420  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38105419 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38105320  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105319 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 38105220  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105219 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38105174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12614705 - 12615048
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614705 aaattcaaagtctagagttttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12614804  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614805 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12614904  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614905 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12615004  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12615005 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12615048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12730365 - 12730022
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730365 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12730266  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730265 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12730166  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12730165 ctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgtcgtggaagg 12730066  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730065 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12730022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12740958 - 12740615
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740958 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12740859  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740858 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12740759  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12740758 ctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgtcgtggaagg 12740659  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740658 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12740615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 36236818 - 36237163
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36236818 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36236917  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36236918 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36237017  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237018 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36237117  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237118 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36237163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 36247365 - 36247710
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247365 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36247464  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36247465 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36247564  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247565 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36247664  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247665 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36247710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21877585 - 21877241
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgttt-ga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21877585 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttga 21877486  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877485 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 21877386  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21877385 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaag 21877286  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21877285 gaaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 21877241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35012741 - 35012403
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012741 aaattcaaagtctagagtccttattgtattgt-----gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35012647  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012646 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 35012547  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012546 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 35012447  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012446 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35012403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3171440 - 3171096
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171440 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3171341  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3171340 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 3171241  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171240 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 3171142  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171141 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3171096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3182042 - 3181698
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3182042 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3181943  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3181942 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 3181843  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181842 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 3181744  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181743 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3181698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7507120 - 7506775
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507120 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7507021  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7507020 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7506921  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506920 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 7506821  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7506820 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 7506775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7517717 - 7517372
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517717 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7517618  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517617 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7517518  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517517 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 7517418  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7517417 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 7517372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 35404781 - 35405126
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35404781 aaattcatagtctagagtcttttctgtactgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35404880  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35404881 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35404980  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35404981 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35405080  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405081 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35405126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 35638428 - 35638770
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35638428 aaattaaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctg-atttttgtttgat 35638526  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638527 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 35638626  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638627 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 35638726  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638727 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35638770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5833036 - 5832692
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5833036 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5832937  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5832936 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5832837  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832836 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5832738  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832737 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5832692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5843638 - 5843294
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843638 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5843539  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5843538 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5843439  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843438 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 5843340  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843339 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5843294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 51629576 - 51629921
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629576 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 51629675  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51629676 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 51629775  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629776 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 51629875  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629876 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 51629921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 51656837 - 51657182
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51656837 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 51656936  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51656937 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 51657036  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657037 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 51657136  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657137 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 51657182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2538354 - 2538010
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538354 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2538255  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2538254 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2538155  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538154 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 2538056  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538055 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2538010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 47608320 - 47608664
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608320 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 47608419  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47608420 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 47608519  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608520 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 47608618  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608619 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 47608664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 47618928 - 47619272
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47618928 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 47619027  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47619028 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 47619127  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619128 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 47619226  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619227 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 47619272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 7689854 - 7690174
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689854 aaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 7689953  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat---ttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  7689954 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattagttttgtgaagtctc 7690053  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690054 atacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 7690153  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctt 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7690154 caggataactgcttgtgtctt 7690174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5973570 - 5973233
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||    
T  5973570 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgcatttttgtttgatcagaag 5973471  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5973470 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 5973371  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5973370 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 5973271  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973270 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5973233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 154683 - 155021
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  154683 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 154782  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  154783 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcattttttgagaagtctcat 154882  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  154883 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 154982  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154983 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 155021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 4250959 - 4251298
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  4250959 aaagtctagagtctttattgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 4251058  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgt----gaagtct 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||    
T  4251059 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttttagaagtct 4251158  T
Q  204 catactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4251159 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaa 4251258  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  4251259 ccatgataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 4251298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 20441711 - 20442028
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20441711 aaagtctagagtctttatcgtattgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20441810  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20441811 actcttgcctgcgtgcttgagcattataagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20441910  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20441911 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggagtggactacttccgatttgtggaaggaaccag 20442010  T
Q  308 gataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  20442011 gataactgcttttgtctt 20442028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Original strand, 18382297 - 18382615
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18382297 caaagtctaaagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatgtttccctgtattttttgtttgatcaga 18382396  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18382397 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctca 18382495  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18382496 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 18382595  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18382596 aggataactgcttgtgtctt 18382615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7677637 - 7677320
Alignment:
Q  27 gtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  7677637 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgtgtgcttg 7677538  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcag 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  7677537 agcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaaaactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 7677438  T
Q  227 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc-aggataactgcttgtgtctt 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  7677437 tcgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaatgataactgcttgtgtc-t 7677339  T
Q  326 tgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  7677338 tgcttttcttttctctgct 7677320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12945020 - 12944685
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12945020 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 12944921  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  12944920 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattgtaagtctcttgcctgcgtgcttgagtatttt-gagaagtctcata 12944822  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12944821 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 12944722  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12944721 ggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctgctc 12944685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39586782 - 39586448
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||   ||||||||||||||| | |||    
T  39586782 aaagtctagagtctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaatcaaacttatttcatggtatttttgtttgatcataag 39586683  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39586682 actcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 39586584  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  39586583 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttatggaatgaaccag 39586484  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  39586483 gataactggttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 39586448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Original strand, 148608 - 148879
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  148608 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 148707  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  148708 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 148807  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactg 278  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  148808 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggaggactg 148879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 39194488 - 39194826
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  39194488 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 39194587  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39194588 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 39194687  T
Q  207 actaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa-ggaac 304  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39194688 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattgtagtgaaatctagctggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagggaac 39194787  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  39194788 caggataactgtttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 39194826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17957051 - 17956734
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  17957051 aagtctagagtctttattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaagatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 17956953  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt-gagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17956952 gtctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgagaagtctca 17956853  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  17956852 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaact 17956753  T
Q  306 aggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  17956752 aggataactgtttgtgtct 17956734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Original strand, 23580816 - 23581028
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23580816 agaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcatttgtaa 23580915  T
Q  233 tctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtcttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580916 tctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtcttt 23581015  T
Q  333 cttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||    
T  23581016 cttttctctgctc 23581028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4167077 - 4166870
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167077 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4166978  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4166977 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4166878  T
Q  202 ctcatact 209  Q
    ||||||||    
T  4166877 ctcatact 4166870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 20196088 - 20196424
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20196088 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctctgtattttttgtttgaatagaag 20196186  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20196187 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 20196285  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20196286 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 20196385  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  20196386 aggataattgcttgtgtctcact-tttcttttctctgctc 20196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 22610371 - 22610709
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  22610371 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 22610470  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  22610471 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcctgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 22610568  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22610569 ct-agaaagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagg 22610667  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22610668 aacgaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 22610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 11195464 - 11195800
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11195464 aagtctagagtctttattgcattgtattgataacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 11195562  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11195563 cctcttgcctgcttgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgatcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 11195661  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11195662 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgatttttaatgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 11195761  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  11195762 caggataattgcttgtgtc--tcgctttcttttctctgctc 11195800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 675256 - 674922
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || | |||| |||||||||||||||||    
T  675256 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattagaag 675158  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  675157 cctctcgcctgcgtgcttgagcgttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 675060  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattata-gtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  675059 acta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttgtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 674961  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  674960 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 674922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 14388523 - 14388860
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || | |||| || |||||||||| |||    
T  14388523 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacattttt-tgtgtaattctgtttgattaagaa 14388621  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  14388622 gcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctca 14388720  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  14388721 tacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaatgaa 14388820  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  14388821 ccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 14388860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 41133013 - 41133349
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgt---atttttgtttgattag 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||   |||| |||||||||||    
T  41133013 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagagttcaaagtcaaac--aattttctgtgtaatttatgtttgattag 41133110  T
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtct 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||  | |||||||    
T  41133111 aagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtct 41133208  T
Q  204 catactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41133209 catacta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccggtttgtggaagg 41133307  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  41133308 aaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 41133349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 18311369 - 18311705
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||    
T  18311369 aagtttagagtccttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattatgtttgaatagaag 18311467  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18311468 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 18311566  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  18311567 acttagagagtattgagcatttgtaatatgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaat 18311666  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18311667 taggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 18311705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47194919 - 47194680
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  47194919 gaagactcttgcctatgtgcttgatcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcatttt-gagaagtc 47194821  T
Q  203 tcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194820 tcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 47194721  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  47194720 accaggataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 47194680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 196 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16710457 - 16710308
Alignment:
Q  196 tgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710457 tgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 16710358  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710357 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47195074 - 47194891
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  47195074 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 47194975  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  47194974 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgatcatt 47194891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4717739 - 4717606
Alignment:
Q  212 gaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717739 gaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 4717640  T
Q  312 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717639 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4717606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5929390 - 5929054
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||||||||    
T  5929390 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattaga 5929291  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  5929290 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctc 5929193  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5929192 atact-aggtagtattgagcagtt-taatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtgga 5929095  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||    
T  5929094 agaaaccaggataattgtttgtgtc--tctctttcttttctct 5929054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23926744 - 23926406
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  23926744 aagtctagagtcttttattgcattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 23926645  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||   ||| |||||||||    
T  23926644 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtccttgagca--attgagaagtctca 23926547  T
Q  206 tactaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23926546 tactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 23926447  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23926446 aggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 23926406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Original strand, 9050994 - 9051143
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9050994 gtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagt 9051093  T
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9051094 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtgga 9051143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28379654 - 28379337
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  28379654 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 28379555  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||| ||    
T  28379554 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtttgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgaaca 28379457  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||| ||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28379456 gttgtaatctgtgtgattattacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttg 28379357  T
Q  320 tgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||  | ||||||||||||||    
T  28379356 tgtc--tctctttcttttctct 28379337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22018987 - 22018690
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22018987 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 22018888  T
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
      |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  22018887 aggaagtctctttctttagtgcttgagcaaaggaagtgtcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 22018790  T
Q  230 taatctttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  22018789 taatctgtgtgattaaacttagtgaaaatatccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtct 22018690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 23580715 - 23580857
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580715 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23580814  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  23580815 cagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 23580857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 25218042 - 25218152
Alignment:
Q  235 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218042 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 25218141  T
Q  335 tttctctgctc 345  Q
    |||||||||||    
T  25218142 tttctctgctc 25218152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 36551159 - 36551269
Alignment:
Q  235 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551159 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 36551258  T
Q  335 tttctctgctc 345  Q
    |||||||||||    
T  36551259 tttctctgctc 36551269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13223637 - 13223528
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223637 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 13223538  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  13223537 ttctctgctc 13223528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Original strand, 24049120 - 24049229
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049120 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 24049219  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  24049220 ttctctgctc 24049229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36100124 - 36100015
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36100124 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 36100025  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  36100024 ttctctgctc 36100015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 345
Target Start/End: Original strand, 46181367 - 46181585
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46181367 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 46181463  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    ||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46181464 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 46181563  T
Q  322 tctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||  | ||||||||||||||||||    
T  46181564 tc--tctctttcttttctctgctc 46181585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 26548673 - 26548979
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  26548673 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtg 26548772  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  26548773 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgactgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 26548870  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    |||||||||||||    |||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  26548871 gagcagttgtaataagagtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattg 26548970  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
    | |||||||    
T  26548971 catgtgtct 26548979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 345
Target Start/End: Original strand, 9749843 - 9749950
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749843 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctttt 9749942  T
Q  338 ctctgctc 345  Q
    ||||||||    
T  9749943 ctctgctc 9749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17370701 - 17370400
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17370701 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17370602  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  17370601 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 17370505  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  17370504 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaatggggactcgactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatg 17370405  T
Q  320 tgtct 324  Q
    |||||    
T  17370404 tgtct 17370400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 19170747 - 19171063
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  19170747 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 19170846  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    |||   |||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  19170847 gcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 19170943  T
Q  226 gttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  19170944 gttgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcttg 19171043  T
Q  320 tgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||  | ||||||||||||||    
T  19171044 tgtc--tctctttcttttctct 19171063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 323
Target Start/End: Original strand, 34255935 - 34256238
Alignment:
Q  26 tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  34255935 tgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgataagaagtctcttgctttagtgct 34256034  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgag 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||    
T  34256035 tgagcataagaagtctcttgctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgag 34256131  T
Q  224 cagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    |||||||||||  |||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||    
T  34256132 cagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctacttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgc 34256231  T
Q  317 ttgtgtc 323  Q
     ||||||    
T  34256232 ctgtgtc 34256238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 45071117 - 45071330
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  45071117 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctagcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatactacgta-gtattgagcagtt 45071213  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||| | |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45071214 gtaatttgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgt 45071313  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  45071314 c--tctctttcttttctct 45071330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20251361 - 20251148
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  20251361 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttttg--aagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 20251264  T
Q  230 taatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||| |||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20251263 taatctgtgtgattatttgttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 20251164  T
Q  324 tttgtctttcttttctct 341  Q
      | ||||||||||||||    
T  20251163 --tctctttcttttctct 20251148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22642448 - 22642220
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  22642448 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtc 22642351  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22642350 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgt 22642251  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22642250 ggaaggaaccagtataattgcctgtgtcttt 22642220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 9050882 - 9051036
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9050882 aagtctagagtcataattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaatatttctctgtatttttgtttgattagaag 9050981  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  9050982 cctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 9051036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 46181275 - 46181429
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  46181275 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 46181374  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  46181375 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagcatt 46181429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28473818 - 28473660
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  28473818 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagtagtt 28473722  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 284  Q
    ||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28473721 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 28473660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22642559 - 22642392
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22642559 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22642460  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22642459 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagca 22642392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 20884278 - 20884412
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  20884278 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaag 20884377  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||    
T  20884378 tctcttgctttagtgcttgagcattggaattctct 20884412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19037685 - 19037499
Alignment:
Q  12 tctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  19037685 tctagagtctttcaattgcattttattgtgaacaccacttatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 19037586  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttt 194  Q
    ||||||| |  |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  19037585 ctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattttt 19037499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 20867249 - 20867383
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  20867249 aagtctagagtcttttactgcattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 20867348  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  20867349 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Original strand, 19087862 - 19087925
Alignment:
Q  282 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19087862 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19087925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28473912 - 28473756
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  28473912 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 28473813  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  28473812 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 28473756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31358999 - 31358822
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31358999 tagagtctcaattgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctctt 31358902  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    || |  | ||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  31358901 gcttttgcgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagaatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagcattt 31358822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 45071024 - 45071159
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  45071024 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 45071123  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  45071124 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 45071159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7309475 - 7309175
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||| |  |||||||    
T  7309475 ttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttg 7309376  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    | |||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| | |||||   || | |||||    
T  7309375 aacattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttgctaagtttagcagtgagc 7309280  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    | ||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  7309279 atttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttagaagtgcaagggggacagtactacttccgatttgtggaaggaacctatataattgcttgtg 7309180  T
Q  322 tcttt 326  Q
    |||||    
T  7309179 tcttt 7309175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 21215100 - 21215400
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  21215100 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtatttttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21215199  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  21215200 agcaatagaagtctcttgattgtgttccggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaaggttagtagtgagc 21215296  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  21215297 atttgtaatca--gatattacatagtgaattccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 21215394  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  21215395 gtcttt 21215400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 52351080 - 52351217
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  52351080 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 52351179  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  52351180 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctt 52351217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19037441 - 19037351
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  19037441 gaaatctccttggaagtgcaaggtggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 19037351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Original strand, 20884370 - 20884483
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20884370 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaattctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 20884466  T
Q  229 gtaatctttgtgattat 245  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20884467 gtaatctgtgtgattat 20884483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21541275 - 21541148
Alignment:
Q  218 attgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  21541275 attgagcagttgtaatcaattgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtata 21541176  T
Q  312 actgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    | ||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  21541175 attgcatgtgtcct--tctttcttttctct 21541148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 289 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10256480 - 10256424
Alignment:
Q  289 gtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256480 gtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10256424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 192
Target Start/End: Original strand, 19965760 - 19965828
Alignment:
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19965760 ttgagcattagaagtctcctgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgcgtgcttgagcattt 19965828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22655141 - 22654989
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  22655141 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtg 22655042  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22655041 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgc 22654989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44200604 - 44200443
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg----tgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagc 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |    |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||    
T  44200604 attagaaatctcttgctttagtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtgcgcgcatgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggta-gtattgagc 44200508  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggacta 283  Q
    ||||||||||| ||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44200507 agttgtaatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactgaacta 44200443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23059028 - 23058938
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23059028 gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccggtttgtggaaggaaccagtatagttgcttgtgtc--tctctttcttttctct 23058938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5234715 - 5234663
Alignment:
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5234715 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5234663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8698510 - 8698351
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  8698510 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacgaaacttaattctttgta-atttgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgagcata 8698412  T
Q  133 agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
     ||| |||||||| || ||||||||| ||| |||| || || | ||||||||||| |||||    
T  8698411 ggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttgaagtctttttcttgtgtgcttgaacattt 8698351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20798749 - 20798689
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798749 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20798689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 23975486 - 23975558
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  23975486 gattatagttaaatcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccatgataa 23975558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44200697 - 44200559
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    || | |||| || |||||||||||||    
T  44200697 aagtctagagtctttccttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgattagaa 44200598  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  44200597 atctcttgctttagtgcttgagcatatgaagtctcttgc 44200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 7745493 - 7745634
Alignment:
Q  19 tctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 117  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||  |||| ||||||| |    
T  7745493 tcttcattgcattgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgataggaagactcttgctt 7745592  T
Q  118 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagca 159  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  7745593 gtgtgcttgagcataggaagtctcttgctgtgtgcttgagca 7745634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 2819728 - 2819895
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  2819728 ttgttttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgct 2819826  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||  ||||||| | ||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2819827 tgagcattggaaatcttttgcttgtgtgcttgggtatctgaagtctcatgcttgtgtgcttgaacattt 2819895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 281
Target Start/End: Original strand, 14263854 - 14264106
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14263854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagtctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcttttgtgcttg 14263953  T
Q  127 agcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||   ||||||| ||||||    ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  14263954 agcaatagaagtctcttgacttagttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcatt----tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 14264049  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggac 281  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14264050 aattgtaatc--agatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacgggac 14264106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20251452 - 20251301
Alignment:
Q  14 tagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  20251452 tagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtct 20251353  T
Q  111 cttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20251352 cttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 20251301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21543698 - 21543566
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  21543698 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 21543599  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||   |||||||||||||  |||||||||||    
T  21543598 gcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21543566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 26280474 - 26280638
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||    
T  26280474 ttgtatcgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 26280573  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||||| ||||    
T  26280574 catatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtattt 26280638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 17025386 - 17025545
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  17025386 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttgag 17025485  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  17025486 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 17025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26703233 - 26703070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    || | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  26703233 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatctttatatgtaattttgtttgtttataagtctcttgcttttgtgcttgagc 26703134  T
Q  130 attagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||   || |||||||| |  | ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  26703133 atagaaaatctcttgcatgtgcgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagcattt 26703070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10757081 - 10756803
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  10757081 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 10756982  T
Q  129 cattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcag 226  Q
    |||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   |||||||||| | |||   |||||||| | |||||   || | |||||||    
T  10756981 cattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagcag 10756885  T
Q  227 ttgtaatct----ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||||     ||    || ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  10756884 ttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaac 10756803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 21121488 - 21121766
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||  ||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21121488 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattccgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21121587  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgag 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||   |||| ||||    
T  21121588 agcaatagaagtctcttgatt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtgag 21121683  T
Q  224 cagttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    || ||||||||   |  |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21121684 catttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Original strand, 22202376 - 22202434
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22202376 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaa 22202434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37640683 - 37640387
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tta-gaagt 108  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  ||| |||||    
T  37640683 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttaggaagt 37640584  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||||||    ||||||||||| ||||||||||||| | | || |  |||||| | ||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  37640583 ctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcata 37640487  T
Q  208 ctaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||   |  |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||    
T  37640486 ctaagtatagtattgagcagttgtaatc--agatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtggaaggaa 37640389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Original strand, 25448961 - 25449260
Alignment:
Q  12 tctagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||     
T  25448961 tctagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaaa 25449060  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||  || |  ||||||  |||| || ||||   ||||||||||||||    ||||||||| |    
T  25449061 tctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctattgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctctt 25449156  T
Q  207 actaag-aaagtattgagcagttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||   |||| |||||| ||||||||   | |    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  25449157 actaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattactttatagtgaacgctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagg 25449256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 44824185 - 44824461
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  44824185 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 44824283  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    ||||| || |||||||   |||| |||||    
T  44824284 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtttcttactaagtttagtagtgagc 44824379  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  44824380 aattgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 44824461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 52351174 - 52351271
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  52351174 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagcagtt 52351270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 21205296 - 21205574
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21205296 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21205395  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaa-gaaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||| |  |||| |||||    
T  21205396 agcaatagaagtctcttgattgtgttccggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaaggttagtagtgagc 21205492  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  21205493 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 21205574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23024449 - 23024171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  23024449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 23024350  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   |||| ||||||||||||   |||| |||||    
T  23024349 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaattctcatactaagtttagtagtgagc 23024253  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  23024252 atttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacc 23024171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Original strand, 52351269 - 52351350
Alignment:
Q  258 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  52351269 ttggaagtgcaggggggactggactacttccggtttgtagaaggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 52351350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 18897017 - 18897131
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  18897017 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttg-ttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 18897115  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | ||||||||||    
T  18897116 cataaaaagtctcttg 18897131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21895022 - 21894963
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21895022 aaattcaaagtctagagtcttttcttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 21894963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31358809 - 31358730
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31358809 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaggggggattggactacttctagattgtggaaggaaccaggataattgctt 31358730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 305
Target Start/End: Original strand, 7745657 - 7745752
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  7745657 agtattgagcaattgtaatctgtgtgattatttttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacatggctacttccggtttgtggaaggaacc 7745752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11958514 - 11958472
Alignment:
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958514 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11958472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 16233552 - 16233698
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| |||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16233552 ttgtattgtgaacaccactgatagtatgtcaagtgttcaacctcaaacatatttctatgtaattgtgtttgtttagaagtttcttgcttttgtgcttgag 16233651  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||| ||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||    
T  16233652 cataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgc 16233698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30892750 - 30892633
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  30892750 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatcttctgtgtaattctatttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttg 30892651  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30892650 agcattagaagtctcttg 30892633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48703859 - 48703741
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  48703859 ttgtatcgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 48703760  T
Q  128 gcattagaagtctcttgct 146  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  48703759 gcatttgaagtctcttgct 48703741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 22601219 - 22601311
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  22601219 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccg-attgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctttctctt 22601311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22639762 - 22639682
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22639762 gattatagtgaaaaatctcctttgaagtgcaaggggaactggactacttccaggttgtggaaggaaataggataattgctt 22639682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27858397 - 27858232
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27858397 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 27858298  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||   || ||||||| ||  ||||||||| | ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27858297 catagaaaatctcttgtttgtgtgcttgagtatttgaaagtctcttgcttgtatgcttgagcattt 27858232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12283860 - 12283800
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  12283860 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 12283800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 12625195 - 12625255
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  12625195 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 12625255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 18130434 - 18130537
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa--gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18130434 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 18130533  T
Q  128 gcat 131  Q
    ||||    
T  18130534 gcat 18130537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 22427980 - 22428040
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22427980 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 22428040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36133858 - 36133742
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  36133858 ttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 36133759  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  36133758 gcattagaagtctcttg 36133742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42284297 - 42284019
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  42284297 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 42284198  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||| |||||    
T  42284197 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaagtttagtagtgagc 42284101  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||    
T  42284100 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccagtttgtggaaggaacc 42284019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19215268 - 19215064
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||    
T  19215268 tgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttga 19215170  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| | ||| |||||||   |||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  19215169 gcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt---tgaagtctcatactaagtttagtattgagca 19215073  T
Q  226 gttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  19215072 attgtaatc 19215064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21028447 - 21028336
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||     |||||||||||     
T  21028447 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaactatattctttgtaattctgtttgaatagaagtatcttgcagttatgcttgagcata 21028348  T
Q  133 agaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||    
T  21028347 aaaagtctcttg 21028336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 24029083 - 24029145
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttat--tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24029083 aagtctagagtctttaaactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24029145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2834343 - 2834230
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  2834343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattgtgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 2834244  T
Q  127 agcattagaagtct 140  Q
    ||||||||||||||    
T  2834243 agcattagaagtct 2834230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8698327 - 8698265
Alignment:
Q  250 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  8698327 aaatctccttggaagtgcaatggggactagactacttctggattgtggaaggaacgaggataa 8698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 14293107 - 14293193
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  14293107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatagaagtcttttgc 14293193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 26702771 - 26702845
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  26702771 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 26702845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 33256773 - 33256890
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |  ||||    
T  33256773 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttg 33256872  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33256873 agcattagaagtctcttg 33256890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 33276945 - 33277062
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |  ||||    
T  33276945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttg 33277044  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33277045 agcattagaagtctcttg 33277062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35039822 - 35039705
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  35039822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 35039723  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  35039722 aacattataagtctcttg 35039705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 16233759 - 16233824
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  16233759 tgattttagtgaactctccttggaagcgcaagggggacaagactacttccggattgtggaaggaac 16233824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21543624 - 21543548
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  21543624 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatacta 21543548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21984249 - 21983974
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||    
T  21984249 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagc 21984150  T
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    | ||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||  ||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||||||   |||| |||||| |    
T  21984149 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtatcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatt 21984053  T
Q  228 tgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||   |  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21984052 tgtaatca--gatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21983974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Original strand, 23037145 - 23037206
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  23037145 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 23037206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1577307 - 1577223
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct-tgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1577307 atagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctctgtgtcttt 1577223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2268186 - 2268070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  2268186 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgaagttgtgcttga 2268087  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  2268086 gcattagaagtctcttg 2268070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9346358 - 9346298
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9346358 ttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtgtatgcttgagcat 9346298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10250642 - 10250367
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  10250642 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 10250544  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagca 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  ||||||  |||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| ||||||   |||  ||||||    
T  10250543 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaatttagttgtgagca 10250448  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     ||||||  |  |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10250447 attgtaa--taagatattagatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 10250367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 16233624 - 16233684
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16233624 ttagaagtttcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcat 16233684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18614361 - 18614301
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  18614361 tgattttagtgaattctccttggaagttcaagggggagtggactacttccggattgtggaa 18614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2327859 - 2327898
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Original strand, 12669814 - 12669883
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12669814 attatagtgaaat-tccttggaagtgcaagggg-actggactactattgtgttgtgggaggaaccagtataa 12669883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 18517583 - 18517622
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18517583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18517622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 21192506 - 21192589
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21192506 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgttgaaggaaccagtataattgctttgtgtcttt 21192589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22202157 - 22202196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22202196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22427761 - 22427800
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22427761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22427800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 22465452 - 22465507
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  22465452 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaag 22465507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 22600826 - 22600901
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  22600826 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 22600901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23036930 - 23036969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23036930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23036969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38282220 - 38282181
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282220 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38282181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 48570654 - 48570693
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48570654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 48570693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 16235732 - 16235848
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16235732 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16235830  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16235831 agcattagaagtctcttg 16235848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22639934 - 22639779
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||  ||| |||| |  |||||||  ||| |  ||||||| ||    
T  22639934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ccaaact-tattctttgta-atttatttgttaggaagtcttctgcttttgtgcttgtgc 22639838  T
Q  130 attagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22639837 atagaaagtctcttgcttttgtgcttgagcatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgag 22639779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 28492924 - 28493005
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  28492924 tagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggataggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 28493005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 46088645 - 46088528
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  46088645 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 46088546  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  46088545 agcaatagaagtctcttg 46088528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 2328076 - 2328137
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  2328076 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccaatttgtggaaggaacc 2328137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21702470 - 21702193
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||| ||||||    || ||||    
T  21702470 ttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtttcttgcagttgttcttg 21702371  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  21702370 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 21702275  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21702274 aattgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagagggataggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21702193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23054026 - 23053913
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||    
T  23054026 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaacctcaaa--catttctttttaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttgagc 23053929  T
Q  130 attagaagtctcttgc 145  Q
    ||  ||||||| ||||    
T  23053928 ataggaagtctattgc 23053913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26703049 - 26702965
Alignment:
Q  247 gtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||    
T  26703049 gtgaactctctttggaagtgcaagagggacagaactacttccagattgtggaaggaacttgtataattgcttgtgtctttatctt 26702965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1577522 - 1577483
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1577522 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1577483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12284081 - 12284042
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12284081 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaa 12284042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 12624977 - 12625016
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12624977 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaa 12625016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18515651 - 18515612
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18515651 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18515612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19717179 - 19717140
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19717179 ttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaa 19717140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22642480 - 22642421
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  22642480 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 22642421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 28492824 - 28492863
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28492824 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 28492863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30571853 - 30571814
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571853 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30571814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 32786363 - 32786402
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32786363 ttgtattgcgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 32786402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36133644 - 36133569
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  36133644 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggccagggctaacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 36133569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 325
Target Start/End: Original strand, 48570868 - 48570951
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtctt 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  48570868 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtctt 48570951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48703701 - 48703642
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  |||||||||||||    
T  48703701 tagtgaactctccttggaagtgcaatgggggcatgactacttccggtttgtggaaggaac 48703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9346215 - 9346157
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||||||    
T  9346215 agtgaactctccttggaagtgcaaaggggacatgactacttacggattgtggaaggaac 9346157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17018035 - 17017969
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  || |||||||||||    
T  17018035 tgattttagcgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttctgatttatggaaggaacc 17017969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 171
Target Start/End: Original strand, 20867341 - 20867383
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactct 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20867341 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 21684477 - 21684579
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||  |||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  21684477 ttgtattgtgaacatcagtgattgtatatcaagtgttcaaagcaaacatctttctgtgtaattttgtttatttagaaatctctttcttttgtgcttgagc 21684576  T
Q  130 att 132  Q
    |||    
T  21684577 att 21684579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 21684593 - 21684659
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  21684593 tgattttagtgaattctacttggaattgcaagggggacatggctacttccgaattgtggaaggaacc 21684659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38281825 - 38281763
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38281825 atagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccgatttgtggaaggaacc 38281763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 14293265 - 14293326
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggac-tacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||  ||||||||||||||    
T  14293265 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagacttatttccggtttgtggaaggaacc 14293326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 276
Target Start/End: Original strand, 18130613 - 18130650
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18130613 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 18130650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23917477 - 23917355
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa--actcaattctctgtatt-tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  ||| | |||| |||| | |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||    
T  23917477 gaacacctctgattgtatatcaagtgttcaaccaaacaact-atttctttgtaatctttgtttg-ttagaagtcttttgcttgtctgcttgagcataaga 23917380  T
Q  136 agtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  23917379 agtctcttgcttgtgtgcttgagca 23917355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24218786 - 24218713
Alignment:
Q  259 tggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg-cttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  24218786 tggaagagaaaggaggactggactacttccggatcgtggaaggaaccagaataattgccttgtgtctttctctt 24218713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35895745 - 35895684
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||    
T  35895745 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctttcttgtgtgattgaccattt 35895684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35895745 - 35895704
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35895745 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctt 35895704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46088429 - 46088368
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  46088429 atagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 46088368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2266753 - 2266714
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag 70  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2266753 ttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaag 2266714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23053819 - 23053731
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |    |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  23053819 tgattttagtgaactctccttgaaaatgcaagggggagtggactactcctagattgtggaaggaaccactataattgctttgtgtcttt 23053731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 26280687 - 26280746
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||   ||||||||||||||    
T  26280687 tagtgaactctccttggaagtgcaaggggg-taggactacttcctgattgtggaaggaacc 26280746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 32786578 - 32786662
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||   |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  32786578 atagtgaactctccttggaagtgcaagggagacaggattgacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 32786662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 33256988 - 33257052
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  33256988 attttagtgaactctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 33257052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 33277160 - 33277224
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  33277160 attttagtgaactctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 33277224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38282006 - 38281974
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38282006 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 38281974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 229)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9123488 - 9123831
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123488 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9123587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123588 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9123687  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123688 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9123787  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123788 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9123831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9112851 - 9113194
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112851 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9112950  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112951 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9113050  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113051 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9113150  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113151 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12865387 - 12865044
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865387 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12865288  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12865287 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagt 12865188  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865187 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 12865088  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865087 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12865044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32962290 - 32962633
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962290 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32962389  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962390 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32962489  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962490 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 32962589  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32962590 aaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 32962633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3671887 - 3671544
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671887 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3671788  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671787 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3671688  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671687 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 3671588  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671587 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3671544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27505782 - 27505439
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505782 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27505683  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27505682 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27505583  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505582 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27505483  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505482 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27505439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12717192 - 12717537
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717192 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12717291  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12717292 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 12717391  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717392 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 12717491  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717492 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12717537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 12727841 - 12728186
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727841 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12727940  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12727941 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 12728040  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728041 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 12728140  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728141 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12728186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25985922 - 25985577
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985922 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 25985823  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25985822 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 25985723  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985722 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 25985623  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985622 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 25985577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34818148 - 34818493
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818148 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34818247  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34818248 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 34818347  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818348 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 34818447  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818448 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34818493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32972909 - 32973253
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972909 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32973008  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973009 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32973108  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973109 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtggaag 32973208  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32973209 gaaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 32973253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34807516 - 34807862
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807516 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34807615  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---tttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  34807616 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 34807715  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807716 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 34807815  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807816 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3661223 - 3660880
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661223 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3661124  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661123 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3661024  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3661023 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactttcgtgttgtggaagg 3660924  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3660923 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3660880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12854861 - 12854518
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854861 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12854762  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12854761 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagt 12854662  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12854661 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccatgttgtggaagg 12854562  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854561 aaccaggataactgcttatgtctttgtctttcttttctctgctc 12854518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26044052 - 26043709
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044052 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26043953  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26043952 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagctttgtgaagt 26043853  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043852 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 26043753  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26043752 aaccaggataattgcttgtgtctttgtttttcttttctctgctc 26043709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27372672 - 27372329
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372672 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27372573  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27372572 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27372473  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372472 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27372373  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372372 aaccaggataactacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27372329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27463022 - 27462679
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463022 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27462923  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27462922 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27462823  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462822 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27462723  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462722 aaccaggataactacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27462679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17982857 - 17983202
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982857 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17982956  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17982957 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 17983056  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983057 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17983156  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983157 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17983202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17985066 - 17985411
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985066 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17985165  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17985166 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 17985265  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985266 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17985365  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985366 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17985411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 31982982 - 31983326
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31982982 aaattcaaagtctagagtcttttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31983081  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31983082 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31983181  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983182 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 31983280  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983281 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31983326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26025299 - 26024955
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025299 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26025200  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26025199 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26025100  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025099 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26025001  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025000 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26024955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26035873 - 26035529
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035873 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26035774  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26035773 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26035674  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035673 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26035575  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035574 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26035529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26864626 - 26864282
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864626 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26864527  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26864526 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 26864427  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864426 gtctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26864328  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864327 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26875250 - 26874906
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875250 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26875151  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26875150 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 26875051  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875050 gtctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26874952  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874951 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26874906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27341534 - 27341190
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341534 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27341435  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27341434 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27341335  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341334 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27341236  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341235 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27341190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27402274 - 27401930
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402274 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27402175  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27402174 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27402075  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402074 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27401976  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27401975 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27412933 - 27412589
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412933 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27412834  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27412833 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27412734  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412733 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27412635  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412634 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27412589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29384592 - 29384248
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384592 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29384493  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29384492 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 29384393  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384392 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 29384294  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384293 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29384248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32301399 - 32301743
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301399 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32301498  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32301499 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 32301598  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301599 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 32301697  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301698 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32301743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 32312088 - 32312432
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312088 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32312187  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32312188 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 32312287  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312288 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 32312386  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312387 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32312432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33199168 - 33198824
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33199168 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33199069  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33199068 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 33198969  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198968 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttggtgattatagtcaaatctccttagaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 33198869  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198868 gaaccagaataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33198824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4630711 - 4630367
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630711 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4630612  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4630611 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4630512  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630511 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 4630413  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4630412 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgactttcttttctctgctc 4630367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16930291 - 16929947
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930291 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16930192  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16930191 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16930092  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930091 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 16929993  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929992 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16929947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16959462 - 16959118
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959462 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16959363  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16959362 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16959263  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959262 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 16959164  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959163 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16959118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 28251919 - 28252257
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28251919 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 28252018  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28252019 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 28252117  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252118 ctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 28252217  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252218 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 28252257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 28357066 - 28357404
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28357066 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 28357165  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28357166 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 28357264  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357265 ctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 28357364  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357365 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 28357404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27384273 - 27383930
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27384273 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 27384174  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27384173 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27384075  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384074 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 27383975  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383974 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27383930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 7751591 - 7751932
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7751591 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 7751690  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7751691 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 7751790  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtg-aaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7751791 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaaatctctttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtggaa 7751890  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7751891 ggaaccaggataactgcttgtttctttgtctttcttttctct 7751932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12827526 - 12827191
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  12827526 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 12827427  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12827426 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactattgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 12827327  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12827326 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagttaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 12827227  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  12827226 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 12827191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 20030266 - 20030601
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||| |||||    
T  20030266 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgatcagaag 20030365  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20030366 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20030465  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20030466 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 20030565  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20030566 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 20030601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 20063017 - 20063352
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||    
T  20063017 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgattagaag 20063116  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20063117 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20063216  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20063217 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 20063316  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20063317 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 20063352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25787535 - 25787201
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  25787535 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 25787436  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25787435 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-ttttgagaagtgtcata 25787337  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25787336 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 25787237  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25787236 gataactgtttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 25787201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 18926126 - 18926460
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  18926126 aaagtctagagtctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 18926225  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18926226 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgag-aattttgagaagtctcata 18926324  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18926325 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagaaaccag 18926424  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18926425 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 18926460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 7376120 - 7376456
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  7376120 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 7376219  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7376220 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcata 7376319  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7376320 cttagagagtattgagcattttgtaatcttcgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 7376419  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  7376420 ggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 7376456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 16123897 - 16124214
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16123897 aagtctagagtctttattacattgtatttgtgaacatcactgattgtacatcaagtgttcaaggtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaa 16123996  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16123997 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgctttagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 16124096  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  16124097 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccgatttgtggaaggaacca 16124196  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
     |||||||||||||||||    
T  16124197 tgataactgcttgtgtct 16124214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32757232 - 32756918
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  32757232 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 32757134  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32757133 gtctcttgtctgcgtacttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 32757034  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32757033 acttag--agtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 32756936  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32756935 ggataactgcttgtgtct 32756918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31572247 - 31571912
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  31572247 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaagc 31572149  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31572148 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 31572050  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  31572049 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaacca 31571950  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  31571949 ggataattgcttgtgtc-tcgcttttcttttctctgctc 31571912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27474559 - 27474314
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27474559 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaa 27474461  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474460 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 27474361  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474360 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27474314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27504057 - 27503812
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27504057 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaa 27503959  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503958 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttgttgattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 27503859  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503858 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27503812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 17746147 - 17746483
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17746147 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 17746245  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17746246 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 17746344  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17746345 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 17746444  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  17746445 aggataattgcttgtgtc-tcgcttttcttttctctgctc 17746483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 27166806 - 27167123
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27166806 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaagc 27166904  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27166905 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 27167003  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27167004 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 27167103  T
Q  307 ggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  27167104 ggataattgcttgtgtcttt 27167123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29765368 - 29765053
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  29765368 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctttgtatttttgtttgaatagaagc 29765270  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29765269 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 29765171  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29765170 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaaggaggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 29765071  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| |||||||||||    
T  29765070 ggataattgcttgtgtct 29765053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 18834997 - 18835331
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||     
T  18834997 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagc 18835095  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18835096 ctctcgcttctgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 18835194  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18835195 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 18835294  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18835295 ggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 18835331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 18826602 - 18826936
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18826602 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagt 18826700  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    || | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18826701 ctgtcgcctgtgtgcttgagtattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaaatctcata 18826799  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  18826800 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttatggaaggaacca 18826899  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18826900 ggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 18826936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5844919 - 5844605
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  5844919 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 5844821  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5844820 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagtagagtcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 5844722  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  5844721 acttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaagc 5844622  T
Q  306 aggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||    
T  5844621 aggataattgcttgtgt 5844605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25583600 - 25583409
Alignment:
Q  154 tgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaat 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25583600 tgagcattggaagactcatgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaat 25583501  T
Q  254 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25583500 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtcattcttttctctgctc 25583409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22308621 - 22308285
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22308621 aagtctagagtctttattgcattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttctgtttgattagaag 22308523  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22308522 cctcttgcctgcttgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 22308424  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22308423 actaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattattgaaaatctccttcgaagtgcaagggggactggactacttacggattgtggaaggaac 22308324  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22308323 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 22308285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12353277 - 12353080
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12353277 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatag 12353178  T
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353177 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12353080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 344
Target Start/End: Original strand, 10404043 - 10404236
Alignment:
Q  150 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10404043 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtg 10404142  T
Q  250 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  10404143 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 10404236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25518520 - 25518201
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  25518520 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 25518421  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| || || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  25518420 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctgtagtgcttgagcattgaaagtcttttgcctgcgtacttgagca--tttgagaagtctcat 25518323  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25518322 act-aggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgggttgtggaagg 25518224  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||||||  ||||||||    
T  25518223 aaccagtataactatttgtgtct 25518201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 345
Target Start/End: Original strand, 11147708 - 11147888
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147708 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtattaagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgga 11147807  T
Q  263 agtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11147808 agtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct--tgtctttgtctttcttttctctgctc 11147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27504185 - 27503997
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27504185 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 27504086  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  27504085 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 27503997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 25687113 - 25687432
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||||||||||    
T  25687113 aagtctagagtctttattgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattagaag 25687211  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  25687212 actcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgagtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 25687309  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  25687310 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaa 25687408  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  25687409 gaaccaggataattgcttgtgtct 25687432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11235331 - 11234995
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  11235331 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 11235232  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11235231 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctca 11235134  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  11235133 tact-agatagtattgagcagttgtaatttgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaa 11235035  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11235034 ggaatcagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 11234995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 17742067 - 17742400
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||||| |||    
T  17742067 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctatgtaattctgtttgattaagaa 17742165  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||  | |||||||||    
T  17742166 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcccgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctca 17742263  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaa-gtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17742264 tacta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgcgattattagtggaaatctccttaaaaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagga 17742362  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    || ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  17742363 actaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 17742400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21127913 - 21127576
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  21127913 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 21127814  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  21127813 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 21127716  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21127715 atact-aggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 21127617  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  21127616 aggaaccagtataattgcttatgtc--tctctttcttttctct 21127576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Original strand, 12416902 - 12417055
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12416902 ttttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 12417000  T
Q  291 gttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12417001 gttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12417055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 7586623 - 7586960
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    |||| ||||  | ||||||||||||    
T  7586623 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagcgttcaaactcaaacaattttctgtgtaaatctgtttgattaga 7586722  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  7586723 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 7586820  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7586821 atact-aggtagtattgagcagttgtaatcagtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 7586919  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  7586920 aggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 7586960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27474686 - 27474499
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27474686 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 27474587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  27474586 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 27474499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31931163 - 31930950
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31931163 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagtt 31931067  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31931066 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 31930967  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  31930966 c--tctctttcttttctct 31930950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 132 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17047297 - 17047082
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17047297 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcatgcttgagca--tttgagaagtctcatact-tgatagtattgagcagttgt 17047201  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| ||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17047200 aatctgtgtgattattttttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc- 17047102  T
Q  325 ttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  17047101 -tctctttcttttctctgctc 17047082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1902340 - 1902231
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902340 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 1902241  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  1902240 ttctctgctc 1902231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18555010 - 18554797
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18555010 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagtt 18554914  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18554913 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 18554814  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  18554813 c--tctctttcttttctct 18554797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12353389 - 12353252
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12353389 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 12353290  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12353289 cctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgc 12353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Original strand, 27819055 - 27819164
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27819055 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttctt 27819154  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  27819155 ttctctgctc 27819164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22386470 - 22386149
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22386470 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22386371  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| |   | ||||    
T  22386370 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcatgcctgcgtacttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtaatatt 22386274  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |    
T  22386273 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagtataatt 22386174  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||    
T  22386173 gcctgtgtctt--tctttcttttctct 22386149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20635382 - 20635079
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20635382 attgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20635283  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  20635282 gcataggaagtctcttgctttagtacttgagcaaatgaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagttt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 20635186  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  20635185 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctg 20635086  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  20635085 tgtcttt 20635079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 17608795 - 17609095
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17608795 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17608894  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaag-tattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||| |||||| |   | ||||||| |    
T  17608895 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtcttatactaggtgtggtattgagta 17608991  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17608992 gttgtaatctgtgtgattaaacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgt 17609091  T
Q  321 gtct 324  Q
    ||||    
T  17609092 gtct 17609095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4292558 - 4292420
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||||     
T  4292558 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaaaatttcgctgtatttttgtttgaatagaagc 4292459  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4292458 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctt 4292420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 12953586 - 12953799
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  12953586 attagaagcctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcatacta-gatagtattgagcaatt 12953682  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12953683 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgt 12953782  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  12953783 c--tctctttcttttctct 12953799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 19453005 - 19453327
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  19453005 attgcattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgatttagtg 19453104  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19453105 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtatcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 19453202  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatt-----atagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||      |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |    
T  19453203 gagcagttgtaatctgtgtgattttttcttagtggaaatctccttggaaatacaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccggtataatt 19453302  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||    
T  19453303 gcttgtgtc--tctctttcttttctct 19453327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11205683 - 11205472
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11205683 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-agatagtattgagcagttgt 11205587  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||| | ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  11205586 aatatgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttctggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc- 11205488  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  11205487 -tctctttcttttctct 11205472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 342
Target Start/End: Original strand, 9934131 - 9934308
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttg 260  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  9934131 gaagactctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcgtactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttg 9934228  T
Q  261 gaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9934229 gaagtgcgagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 9934308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22292538 - 22292390
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22292538 gaagtctcatactaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttccggattg 22292439  T
Q  295 tggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22292438 tggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 22292390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 11147612 - 11147736
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11147612 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgataagaag 11147711  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||| || |||||||||||||    
T  11147712 actcttgcgtgtgtgcttgagcatt 11147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Original strand, 12575773 - 12575860
Alignment:
Q  258 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575773 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12575860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 14070539 - 14070843
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  14070539 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 14070638  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||    
T  14070639 agtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttg-ttgtgtgcttgagcattt---tgaagtctc 14070734  T
Q  205 atac-taagaaagtattgagcagttgtaatc-tttgtgattatagt-----gaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtg 296  Q
     ||| |    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  14070735 gtacttgttgaagtattgagcagttgtaatcagttgtgattatacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtg 14070834  T
Q  297 gaaggaacc 305  Q
    |||||||||    
T  14070835 gaaggaacc 14070843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18720297 - 18720210
Alignment:
Q  258 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720297 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18720210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31931255 - 31931101
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  31931255 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 31931156  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  31931155 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 31931101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 344
Target Start/End: Original strand, 30120483 - 30120590
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  30120483 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactacttgtgtc-ttgcttttctt 30120581  T
Q  336 ttctctgct 344  Q
    |||||||||    
T  30120582 ttctctgct 30120590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18555102 - 18554968
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  18555102 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 18555003  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  18555002 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 18554968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 12953495 - 12953628
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || | |||| || ||||||||||||||     
T  12953495 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacaaatttttgtgtaattctgtttgattagaagc 12953594  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  12953595 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 12953628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17063935 - 17063726
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  | |||||||||||| | || |||||||| || |||||||    
T  17063935 aagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgtttgagcattt--gagaagtctcatac-atgatagtattgaacaattgtaat 17063839  T
Q  234 ctttgtgattat------agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    || || ||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17063838 ctgtgagattattgatttagtgaaaatctccttggaagtgcaaggg----tagactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc--t 17063745  T
Q  327 gtctttcttttctctgctc 345  Q
     ||||||||||||||||||    
T  17063744 ctctttcttttctctgctc 17063726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 31543252 - 31543338
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31543252 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactgaaactcaattctctgt 31543338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 9934036 - 9934159
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  9934036 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttgattagaag 9934134  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  9934135 actctcgcctgcgtgcttgagcatt 9934159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 14051858 - 14052152
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  14051858 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 14051957  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||| ||||   |||||||||    
T  14051958 agtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggatgtctcttg-ttgtgtgcttgagaattt---tgaagtctc 14052053  T
Q  205 atac-taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaagga 302  Q
     ||| |    ||||||||||||||||| |   || |  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  14052054 gtacttgttgaagtattgagcagttgtga---ttatacttagtg-gaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagga 14052149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14757848 - 14757752
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14757848 ttgagcatttgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgaattgtggaaggaaccatgataa 14757752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 18027209 - 18027373
Alignment:
Q  28 tattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18027209 tattgtattatgaacaccactgattttatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttga 18027307  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  18027308 gcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtcccttgcttgtgtgcttgagcattt 18027373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 25735921 - 25736044
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  25735921 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttgattagaag 25736019  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||| |  |||||||||||||    
T  25736020 actcttgctttagtgcttgagcatt 25736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15551471 - 15551392
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551471 tgattttagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgctt 15551392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17064019 - 17063895
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc-tgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || ||||||| || ||||||||||| |     
T  17064019 tttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaa--caattttcttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttt 17063922  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17063921 agtgcttgagcattggaagtctcttgc 17063895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18576283 - 18576226
Alignment:
Q  288 cgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576283 cgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18576226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11205778 - 11205623
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  11205778 aagtctagagtctttgattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 11205679  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11205678 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 11205623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25679001 - 25678926
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25679001 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttgtggaaggaaccaggataattgcgtgtgtct 25678926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17047371 - 17047254
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17047371 attgtattgagaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17047272  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  17047271 gcattggaagtctcttgc 17047254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11021509 - 11021457
Alignment:
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11021509 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11021457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 19289744 - 19289879
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  19289744 aagtccagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 19289843  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||    
T  19289844 gtctcttcctttagtgcttgagcataggaagtctct 19289879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 345
Target Start/End: Original strand, 5521748 - 5521798
Alignment:
Q  295 tggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521748 tggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5521798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 12715913 - 12716193
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||  | |||||||    
T  12715913 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaggtgtgcttg 12716012  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||| |    |||||| | |||||   || | |||||    
T  12716013 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaattctcttgcagttgtgcttgagcatttat----agtctcttgctaagtttagcaatgagc 12716108  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12716109 agttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 12716193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Original strand, 19289837 - 19289950
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19289837 attagaagtctcttcctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 19289933  T
Q  229 gtaatctttgtgattat 245  Q
    ||||| | |||||||||    
T  19289934 gtaatatgtgtgattat 19289950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21119284 - 21119154
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||     
T  21119284 agtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttagaagtgtaagggggactgaactacttccagtatgtggaaggaaccagt 21119185  T
Q  309 ataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21119184 ataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 21119154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 18027387 - 18027479
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct-tgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18027387 gattatagtgaaatctccttagaagtgcaagggagactggactacttccagattgtggaagaaatcaggataattgctatgtgtctttctctt 18027479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21034476 - 21034409
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21034476 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggagtggactacttctgtattgtggaaggaacca 21034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3680552 - 3680470
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3680552 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 3680470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 15478450 - 15478522
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  15478450 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggg-actggactacttccggattgtggaaggaaccaagataa 15478522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 24719437 - 24719530
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  24719437 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctggattgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctttctctt 24719530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 15478259 - 15478374
Alignment:
Q  15 agagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  15478259 agagtctgaattgttttgtattgtgaacaccattgattgtatagcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttg 15478357  T
Q  115 cctgcgtgcttgagcat 131  Q
    | |  ||||||||||||    
T  15478358 cttttgtgcttgagcat 15478374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17927445 - 17927171
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  17927445 tattgtgaacaccactgattgtttatcaagtattcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 17927346  T
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttg 229  Q
      ||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||  |||||||   |||| ||||| | |||   |||||||| | ||||    || ||||||||||||    
T  17927345 gggaagtctcttgattttgctcttgagcataggaaatctcttgcaattgtgtttgagtagttt---gaagtctcttgctaattttagcattgagcagttg 17927249  T
Q  230 taatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||   |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  17927248 taatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccagtttgtggaaggaacc 17927171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25929923 - 25929835
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  25929923 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgttgaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 25929835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7763311 - 7763196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  7763311 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 7763212  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  7763211 cataggaagtctcttg 7763196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13435325 - 13435242
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13435325 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactacttccggtttgtggaaggaacctgcataattgctttgtgtcttt 13435242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15551646 - 15551484
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||| ||||  ||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15551646 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaattgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtctgtttagaagtctcttgctttggtgcttgagc 15551548  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||  ||| | ||||| ||   |||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15551547 ataggaaatttcttgtttctatgcttgagtatttgaagtatcttgcttgtgtgcttgagcattt 15551484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19085817 - 19085700
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  19085817 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 19085718  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19085717 agcattagaagtctcttg 19085700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19625468 - 19625382
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19625468 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 19625382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 20113347 - 20113429
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20113347 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaagtaacctgtataattgctttgtgtcttt 20113429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21034647 - 21034534
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21034647 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 21034548  T
Q  129 cattagaagtctct 142  Q
    |||  |||||||||    
T  21034547 cataggaagtctct 21034534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 14101148 - 14101208
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14101148 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 14101208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24116266 - 24116206
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24116266 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctggtttgtggaaggaacc 24116206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29597731 - 29597615
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  29597731 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 29597632  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
     ||||| ||||||||||    
T  29597631 acattaaaagtctcttg 29597615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29917467 - 29917407
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  29917467 atagtgaactctccttggaagtgcaacggggactagactacttccggtttgtggaaggaac 29917407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32335494 - 32335363
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  32335494 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcttttgtgcttgag 32335396  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcat 160  Q
    |||  ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  32335395 cataggaagtctattgcgtttgtgcttgagcat 32335363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12422919 - 12422621
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  ||||||||| |||    |||||||    
T  12422919 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttg 12422821  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  12422820 agcaatagaagactcttgattgtgttcaggagcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgagc 12422725  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  12422724 atttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggagtgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 12422627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13601825 - 13601659
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||     || ||||    
T  13601825 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaatttagaagtctcttggagttgtacttg 13601726  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  13601725 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 13601659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 14923703 - 14923866
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||    || | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  14923703 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcgaaccaaacatctttatgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttaagc 14923802  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||  ||| ||| ||||||  ||||||||  ||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  14923803 ataggaaatctattgcttgtgtgcttgaatatttgaagtctctttcttgtgtgattgagcattt 14923866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 15395178 - 15395297
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||| ||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15395178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtatgtctagaagtctcttgcttgtctgcttgag 15395277  T
Q  129 ca-ttagaagtctcttgctt 147  Q
     | || ||||||||||||||    
T  15395278 tatttggaagtctcttgctt 15395297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 19066510 - 19066787
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||| |||| ||||    |||||||    
T  19066510 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaggtctattgcagttgtgcttg 19066609  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||| |||||    
T  19066610 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaagtttagtagtgagc 19066706  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  19066707 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 19066787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30372823 - 30372716
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| | |||    
T  30372823 ttgagcaattgtaattttgtgtaattatagtgaaaatctccttggaaatgcaagtgggattggactacttccggattgtataaggaaccaagattattgc 30372724  T
Q  317 ttgtgtct 324  Q
    ||||||||    
T  30372723 ttgtgtct 30372716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9717499 - 9717383
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  9717499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 9717401  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9717400 agcaatagaagtctcttg 9717383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12347537 - 12347471
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12347537 tgattttagtgaactttccttggaagtgcaatggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 12347471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15301873 - 15301756
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  15301873 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 15301774  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||| |||||||    
T  15301773 agcattagaattctcttg 15301756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 15395333 - 15395391
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15395333 agtgaactctccttggaagtgcaagagggacaggactacttccggattgtggaaggaac 15395391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Original strand, 17446155 - 17446304
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||  ||||    
T  17446155 gaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatt-ttctttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaag 17446253  T
Q  138 tctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  17446254 tctcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgctgttgtgcttgag 17446304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 18172720 - 18172806
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18172720 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgc 18172806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18227081 - 18226995
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18227081 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgc 18226995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18377883 - 18377821
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18377883 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggaccggactgacttccggtttgtggaaggaacc 18377821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18434977 - 18434919
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18434977 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggagtacttccgatttgtggaaggaa 18434919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19482193 - 19482131
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19482193 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19482131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21234600 - 21234538
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21234600 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21234538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24116486 - 24116369
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  24116486 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagctgtgcttg 24116387  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24116386 agcattagaagtctcttg 24116369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25592061 - 25591979
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct-tgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  25592061 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgctatgtgtcttt 25591979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26589256 - 26589139
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  26589256 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttg 26589157  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26589156 agcaatagaagtctcttg 26589139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 31127801 - 31127839
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127801 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31127839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 305
Target Start/End: Original strand, 33352723 - 33352997
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||    
T  33352723 tattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 33352822  T
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    | ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||   |||| |||||| |    
T  33352823 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatt 33352918  T
Q  228 tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  33352919 tgtaatcagattttacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggatatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 33352997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16528750 - 16528689
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16528750 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 16528689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 18172925 - 18172990
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  18172925 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacatgactacttccggattgtggaaggaac 18172990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18226876 - 18226811
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  18226876 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacatgactacttccggattgtggaaggaac 18226811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19623409 - 19623336
Alignment:
Q  254 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19623409 ctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 19623336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25595833 - 25595733
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  25595833 ttgtattgtgaacatcactgcttgtatatcaagtgttcaaatcaaacatttttctgtgtaattttg-ttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 25595735  T
Q  130 at 131  Q
    ||    
T  25595734 at 25595733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26942094 - 26941981
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26942094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26941995  T
Q  129 cattagaagtctct 142  Q
    |||  |||||||||    
T  26941994 catatgaagtctct 26941981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15301654 - 15301594
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||    
T  15301654 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggtctacttctggtttgtggaaggaacc 15301594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 344
Target Start/End: Original strand, 17573069 - 17573120
Alignment:
Q  292 ttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  17573069 ttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 17573120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21624531 - 21624471
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  21624531 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 21624471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 24719301 - 24719361
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24719301 ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtgtgtgggcttgagcat 24719361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 24729086 - 24729146
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24729086 ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatacgaagactcttgcgtgtgggcttgagcat 24729146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 26023151 - 26023227
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactc 78  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  26023151 aaatccaaaggctagagtctttatggtattgtatggagaacacccctaatggtttatcaggtgttcaagtccaactc 26023227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7811454 - 7811387
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7811454 tgattttagtgaaatctccttataagtgcaatgaggagtggactacttccggtttgtggaaggaacca 7811387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10631760 - 10631721
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631760 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10631721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 10705025 - 10705064
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705025 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10705064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16265643 - 16265682
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265643 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16265682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 17317016 - 17317055
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317016 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18435197 - 18435158
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18435197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19470110 - 19470047
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  19470110 attatagtgaactctccttagaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaac 19470047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19470324 - 19470209
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     ||||||||    
T  19470324 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttttgcttgag 19470225  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  19470224 cataggaagtctcttg 19470209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19482409 - 19482370
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482409 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19482370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19625249 - 19625206
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19625249 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttcc 19625206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 20113192 - 20113275
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  20113192 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 20113275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 20731197 - 20731236
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20731197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20731236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21234815 - 21234776
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234815 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21234776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21617901 - 21617862
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21617901 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21617862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22076898 - 22076937
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22076898 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22076937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Original strand, 23006548 - 23006655
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  23006548 ttctgtgtaattatgtttgattagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttg 23006647  T
Q  180 tgcttgag 187  Q
    ||||||||    
T  23006648 tgcttgag 23006655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23781818 - 23781711
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  23781818 ttctgtgtaattatgtttgattagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttg 23781719  T
Q  180 tgcttgag 187  Q
    ||||||||    
T  23781718 tgcttgag 23781711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 24729014 - 24729173
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24729014 ttgtattatgaacatcattgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 24729113  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  |||| ||||||| |  | |||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  24729114 catacgaagactcttgcgtgtgggcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 24729173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 32543921 - 32543882
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 32543882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10631575 - 10631513
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10631575 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 10631513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15954139 - 15954077
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15954139 atagtgatctctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 15954077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17381018 - 17380956
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17381018 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 17380956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 19952282 - 19952340
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19952282 tgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19952340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 24729222 - 24729288
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaa-gtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  24729222 tgattttagtgaactctccttggaaagtgcaagggggacaagactacttccggattgtggaaggaac 24729288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25679070 - 25679024
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgta 55  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25679070 aagtctagagtcttaattgcattgtattgtgaacaccactgattgta 25679024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26589039 - 26588977
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  26589039 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 26588977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27720937 - 27720866
Alignment:
Q  272 gggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||    
T  27720937 gggactgggctacttccggattgtggaaggaaccagtataactgtttctgtc--tatctttcttttctctgctc 27720866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 16463143 - 16463304
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacacca-ctgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaac-tcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |   || | |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  16463143 ttgtattgtgaacaccaactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttg 16463242  T
Q  127 agcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    || ||  |||||||||||   |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  16463243 agtataggaagtctcttgtagtagtgcttgagcataggaaacctcttgcgtttgtgcttgag 16463304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 300
Target Start/End: Original strand, 17303976 - 17304037
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||    
T  17303976 tgattgtagtgaactctccttggaagtgcaagggagacatgactacttccggtttgtggaag 17304037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21617687 - 21617618
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21617687 atagtgaactctcctttgaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaatgaaccagtataa 21617618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 324
Target Start/End: Original strand, 31720245 - 31720345
Alignment:
Q  227 ttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||  |||||  | || ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31720245 ttgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctcattctaagtgataaggagactgaactacttccaggttgtggaatgaaccaggataattgcttgtgtc 31720344  T
Q  324 t 324  Q
    |    
T  31720345 t 31720345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10820728 - 10820696
Alignment:
Q  112 ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10820728 ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 10820696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 14100933 - 14101045
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  14100933 tattgtgaataccactgattgtatttcaagtgtccaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 14101032  T
Q  132 tagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||    
T  14101033 tagaagtctcttg 14101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 287
Target Start/End: Original strand, 14883651 - 14883699
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttc 287  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14883651 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggaccagactacttc 14883699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Original strand, 14923879 - 14923966
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggg-ggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||  | |||| || ||||||||||    
T  14923879 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggaggaat-gactacttccggattgtggaaggaacatgtataattgtttgtgtcttt 14923966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19623638 - 19623523
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||| |||||||    |||||||    
T  19623638 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagactcttgcagttgtgcttg 19623539  T
Q  127 agcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  19623538 agcattagaagtctct 19623523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 24471041 - 24471137
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaag-ggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||    
T  24471041 ttgagcaattataatcttgtgtggttatagcgaaaatctccttagaagtgcaagaggggactggactactttcggattgtagaaggaaccatgataa 24471137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32335287 - 32335199
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  32335287 tgattttagtgaactctccttggaaatgcaaaggggacatgactatttccggattgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 32335199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7811670 - 7811631
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7811670 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7811631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13601606 - 13601523
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac-tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13601606 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 13601523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15532118 - 15532157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532118 ttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15532157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16876560 - 16876525
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876560 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 16876525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688397
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19688436 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 19688397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19952064 - 19952103
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19952064 ttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 19952103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32543707 - 32543644
Alignment:
Q  243 tatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32543707 tatagtgaactctccttgaaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 32543644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19875284 - 19875234
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  19875284 tgattttagtgaactctccttggaagtgaaagggggacatgactacttccg 19875234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 22563160 - 22563202
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22563160 ttagaattctcttgcatgcgtgcttgagcattggaagtctctt 22563202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26185230 - 26185164
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  26185230 tgattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaagactacatccggattgtggaagtaacc 26185164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34659424 - 34659352
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34659424 gtgattatagtgaaatc-ccttagaagtacaagggg-actggactactcttgtgttgtgggaggaaccagtataa 34659352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7763092 - 7763031
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7763092 tagtgaactcttcttgaaagtgcaagggggacgggactgacttccggtttgtggaaggaacc 7763031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9717283 - 9717222
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  9717283 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggtcaggactgactttcgatttgtggaaggaacc 9717222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12041283 - 12041230
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12041283 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 12041230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 21689533 - 21689580
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactact 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21689533 ttgtgattatagtgaaatc-ccttggaagtggaa-ggggactggactact 21689580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 23006567 - 23006628
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||    
T  23006567 attagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcat 23006628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 23006704 - 23006769
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  23006704 tgattttagtgaactctccttgaaagtggaagggggacatgactacttccggattatggaaggaac 23006769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23781662 - 23781597
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  23781662 tgattttagtgaactctccttgaaagtggaagggggacatgactacttccggattatggaaggaac 23781597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23781799 - 23781738
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||    
T  23781799 attagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcat 23781738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32335424 - 32335363
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  32335424 attataagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctattgcgtttgtgcttgagcat 32335363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13435471 - 13435423
Alignment:
Q  96 tttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  13435471 tttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttg 13435423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16739900 - 16739828
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctc-cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  16739900 attatagtgaaaaatctcttgtaagtgaaaaggggactggactacttccggattgtggaagaaactaggataa 16739828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19688224 - 19688192
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19688224 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 19688192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22801581 - 22801549
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22801581 atagtgaaatctccttggaaatgcaagggggac 22801549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 24481086 - 24481182
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggg-gactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||    
T  24481086 ttgagcaattataatcttgtgtggttattgtgaaaatctccttgggagtggaaggggggactggactacattcggattgtagaaggaaccaggataa 24481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29538039 - 29537991
Alignment:
Q  257 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||    
T  29538039 cttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacc 29537991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 193)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16768807 - 16768464
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768807 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16768708  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768707 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 16768608  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768607 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 16768508  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768507 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16768464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24328098 - 24328441
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328098 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24328197  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328198 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 24328297  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328298 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 24328397  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328398 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24328441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 1099559 - 1099902
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099559 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1099658  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099659 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 1099758  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099759 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 1099858  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099859 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1099902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 7006171 - 7006514
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006171 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7006270  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006271 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7006370  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006371 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 7006470  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006471 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9773668 - 9774011
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773668 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9773767  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773768 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9773867  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773868 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9773967  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773968 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 11389173 - 11389516
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389173 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11389272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389273 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 11389372  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389373 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 11389472  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389473 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11389516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 22960696 - 22961039
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960696 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22960795  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960796 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22960895  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960896 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22960995  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960996 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22961039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24338768 - 24339111
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338768 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24338867  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24338868 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattttgtgaagt 24338967  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338968 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 24339067  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339068 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24339111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29244086 - 29243743
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244086 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29243987  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243986 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctttcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 29243887  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243886 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 29243787  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243786 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29243743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254322
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254665 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29254566  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254565 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 29254466  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254465 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgttattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 29254366  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254365 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29254322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43082514 - 43082175
Alignment:
Q  6 tcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43082514 tcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcaga 43082415  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082414 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 43082315  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082314 tacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 43082215  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082214 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43082175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43093127 - 43092784
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093127 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43093028  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093027 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 43092928  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092927 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 43092828  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092827 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43092784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4099678 - 4099335
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099678 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4099579  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099578 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4099479  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099478 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4099379  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099378 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4099335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4209753 - 4209410
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209753 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4209654  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209653 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4209554  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209553 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4209454  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209453 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4209410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4220345 - 4220002
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220345 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4220246  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220245 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4220146  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220145 ctcatacttagaaagtattgagtagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4220046  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220045 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4220002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9763132 - 9763475
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763132 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9763231  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763232 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9763331  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763332 ctcatatttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9763431  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763432 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9763475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17857801 - 17858144
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857801 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17857900  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857901 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 17858000  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858001 ctcatacttagaaaatattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 17858100  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858101 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17858144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 22915228 - 22915571
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915228 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22915327  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915328 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22915427  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915428 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22915527  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915528 aaccaggataattgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22915571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34790581 - 34790924
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790581 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34790680  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34790681 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34790780  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790781 ctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 34790880  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34790881 aaccaggataactgctggtgtctttgtctttcttttctctgctc 34790924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 34804724 - 34805067
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804724 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34804823  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34804824 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34804923  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804924 ctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 34805023  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34805024 aaccaggataactgctggtgtctttgtctttcttttctctgctc 34805067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 18393001 - 18393346
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393001 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18393100  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18393101 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 18393200  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393201 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 18393300  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393301 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18393346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34477793 - 34477449
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34477793 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 34477694  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34477693 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 34477594  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477593 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 34477494  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477493 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34477449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40251058 - 40250714
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtata-tcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40251058 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 40250959  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250958 ttagaagtcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 40250859  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250858 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 40250759  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250758 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40250714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32217738 - 32217393
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217738 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32217639  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32217638 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 32217539  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217538 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 32217439  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32217438 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctttgctc 32217393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40222197 - 40221853
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtata-tcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40222197 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 40222098  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40222097 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 40221998  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40221997 tcttatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaag 40221898  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221897 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40221853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 36252208 - 36252550
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252208 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36252307  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252308 tagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttacgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 36252407  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36252408 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtggaagg 36252507  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36252508 aaccaggataactgcttgtgtcattgtctttcttttctctgct 36252550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9908526 - 9908872
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908526 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9908625  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---tttttgtga 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  9908626 tagaagtctcttgtctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 9908725  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908726 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgtaagggggactggactacttccgtgttgtgga 9908825  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908826 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9908872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 11395536 - 11395881
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395536 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11395635  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  11395636 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 11395735  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395736 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 11395835  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395836 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11395881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 11405852 - 11406197
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11405852 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11405951  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  11405952 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 11406051  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406052 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 11406151  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406152 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11406197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35263455 - 35263111
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263455 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35263356  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35263355 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35263256  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263255 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35263157  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263156 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35263111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35274080 - 35273736
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35274080 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35273981  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35273980 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35273881  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273880 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35273782  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273781 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35273736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 9897938 - 9898284
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9897938 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacttaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9898037  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---tttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  9898038 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 9898137  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9898138 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttatgga 9898237  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9898238 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9898284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10266858 - 10266514
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266858 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10266759  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10266758 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10266659  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266658 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10266560  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266559 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10266514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10277435 - 10277091
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277435 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10277336  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10277335 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10277236  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277235 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10277137  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277136 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10277091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27221245 - 27220901
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27221245 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgat 27221146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27221145 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27221046  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221045 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27220947  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220946 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27220901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35252846 - 35252502
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252846 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaactcaattctctgtatttttgtttgat 35252747  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35252746 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35252647  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252646 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 35252548  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252547 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35252502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43345272 - 43344928
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345272 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43345173  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  43345172 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgta 43345073  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345072 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 43344974  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43344973 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43354887 - 43354543
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354887 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43354788  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  43354787 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgta 43354688  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354687 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 43354589  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354588 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43354543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 30489188 - 30489531
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30489188 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctcagtatttttgtttgat 30489287  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  30489288 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtcttttgaagt 30489387  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489388 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 30489487  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489488 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30489531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 39170459 - 39170803
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39170459 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 39170558  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39170559 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 39170658  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170659 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 39170757  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39170758 ggaaccaggataactgcatgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 39170803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2561346 - 2561009
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2561346 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaatttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 2561247  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2561246 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 2561147  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2561146 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagttaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 2561047  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561046 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 24427956 - 24428291
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24427956 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaag 24428055  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24428056 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 24428155  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24428156 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 24428255  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  24428256 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 24428291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 21172836 - 21173174
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | |||    
T  21172836 aaagtctagagtctttaacgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcataag 21172935  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21172936 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 21173035  T
Q  207 actaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173036 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 21173135  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173136 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 21173174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 24415391 - 24415726
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24415391 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaag 24415490  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24415491 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 24415590  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24415591 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggtgactggacaacttccgttttgtggaaggaaccag 24415690  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  24415691 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 24415726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 28732272 - 28732607
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  28732272 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 28732371  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28732372 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 28732471  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28732472 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 28732571  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28732572 gataactgtttgtgtc-ttgcctttcttttctctgct 28732607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26866929 - 26866595
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  26866929 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaag 26866830  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26866829 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgaggattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 26866731  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26866730 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 26866631  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26866630 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 26866595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 18769275 - 18769609
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  18769275 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 18769374  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18769375 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 18769473  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  18769474 cttagagagcattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaagaaaccag 18769573  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18769574 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 18769609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 28721686 - 28722021
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||| |||||    
T  28721686 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatatcattgtatttttgtttgatcagaag 28721785  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28721786 ccttttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 28721885  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28721886 cttagagagtattgagcatttgcaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 28721985  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28721986 gataactgcttgtgtc-ttgcctttcttttctctgct 28722021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26879518 - 26879202
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  26879518 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctatattttttgtttgatcagaag 26879419  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26879418 actcttgcctacgtgcttgagcattagaaaactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 26879320  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26879319 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 26879220  T
Q  308 gataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26879219 gataactgcttgtgtctt 26879202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 108 - 345
Target Start/End: Original strand, 21650975 - 21651213
Alignment:
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21650975 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctca 21651074  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651075 tacttagaaagtattgagcagttgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 21651173  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651174 aggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21651213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 38586457 - 38586775
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  | ||    
T  38586457 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacataa 38586555  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtga--agtctc 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  38586556 gtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttttgagaagtctc 38586655  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38586656 atacttagagagtattgagcacttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaatgaac 38586755  T
Q  305 caggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38586756 caggataactgcttgtgtct 38586775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 27978753 - 27979068
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  27978753 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 27978851  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27978852 actctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 27978950  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27978951 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 27979050  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
     |||||||||||||||||    
T  27979051 agataactgcttgtgtct 27979068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 28065282 - 28065597
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  28065282 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 28065380  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28065381 actctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 28065479  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  28065480 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacta 28065579  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
     ||||| |||||||||||    
T  28065580 tgataattgcttgtgtct 28065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 36785170 - 36785506
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36785170 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgttagtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 36785268  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36785269 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgaccattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 36785367  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36785368 acttagagagtattgagcatttgtaatttttgtgattcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 36785467  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  36785468 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 36785506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 967875 - 968210
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  967875 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 967973  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  967974 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 968071  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  968072 actaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagagcaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaac 968171  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  968172 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 968210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22763511 - 22763176
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22763511 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 22763413  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22763412 tctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 22763315  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22763314 acttagagagtattgagcatttgtaatatgtg-gattatttcttagtgtaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 22763216  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22763215 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 22763176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1042006 - 1041671
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||    
T  1042006 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacttt-ttctgtgtattgttgtttgattagaag 1041908  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1041907 cctctcgcctgtgtgcttgagcattataagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 1041810  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1041809 actaagagagtattgagcatttgtaatctataagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaac 1041710  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1041709 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 1041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24274882 - 24274552
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24274882 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacata-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 24274784  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  24274783 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 24274686  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24274685 acta-gtgagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcgagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 24274587  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24274586 caggataattgcttgtgtcct--tctttcttttctct 24274552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 17970641 - 17970975
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  17970641 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 17970739  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  17970740 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtttcat 17970837  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  17970838 acta-gttagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaac 17970936  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  17970937 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttctctctgctc 17970975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22774215 - 22773896
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  22774215 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttaattggaag 22774117  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22774116 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctttcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 22774019  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22774018 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttccggtttgtggaag 22773920  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  22773919 gaaccaggataaatgcttgtgtct 22773896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19356177 - 19355838
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  19356177 aagtctagagtcttttactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 19356078  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||  ||||||||||    
T  19356077 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgctttagtgcctgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttaggaagtctcat 19355980  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19355979 act-agatagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttgttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 19355881  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19355880 aaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 19355838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30794497 - 30794332
Alignment:
Q  179 gtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt-gtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggact 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30794497 gtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggact 30794398  T
Q  278 ggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30794397 ggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 30794332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 23393113 - 23393412
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
T  23393113 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttga 23393212  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  23393213 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagca 23393309  T
Q  226 gttgtaatct-ttgtgatta---tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||||  |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23393310 gttgtaatcagttgtgattaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgt 23393409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 20646980 - 20647317
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  20646980 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 20647079  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||    
T  20647080 agtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--ggaagtctc 20647177  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20647178 atact-aggtagtattaagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 20647276  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  20647277 aagaaccagtataattgcctgtgtc--tctctttcttttctct 20647317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Original strand, 19498457 - 19498668
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19498457 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 19498553  T
Q  231 aatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19498554 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataactgcttgtgtc- 19498652  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  19498653 -tctctttcttttctct 19498668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Original strand, 24801988 - 24802293
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  24801988 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 24802087  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||| |||||||||   ||||||||||||||| |   ||||||    
T  24802088 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcatgagcattt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 24802184  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |    
T  24802185 gagcagttgtaatcagttgtgattaaactttgtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaagaaccagtataatt 24802284  T
Q  315 gcttgtgtc 323  Q
    || ||||||    
T  24802285 gcatgtgtc 24802293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Original strand, 19302918 - 19303114
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19302918 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagcagttgt 19303014  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||| ||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19303015 aatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggagggaaccaggataattgcttgtgtct 19303114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Original strand, 24814955 - 24815260
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  24814955 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 24815054  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   ||||||    
T  24815055 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtatt 24815151  T
Q  221 gagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |    
T  24815152 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttgaaagtgtaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccggtataatt 24815251  T
Q  315 gcttgtgtc 323  Q
    | |||||||    
T  24815252 gtttgtgtc 24815260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 324
Target Start/End: Original strand, 19313482 - 19313680
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  19313482 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-cggtagtattgagcagtt 19313578  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
     |||||| ||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19313579 ataatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 19313678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 38033296 - 38033510
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  38033296 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgcgtgcttgagcattttt-tgaagtctcatactaggta-gtattgagcagtt 38033393  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  38033394 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttctggtttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgt 38033493  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  38033494 c--tctctttcttttctct 38033510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1083669 - 1083368
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  1083669 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 1083570  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  1083569 gcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 1083473  T
Q  226 gttgtaat-ctttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||   |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||  | |||| |||||    
T  1083472 gttgtaataagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacatgtataattgctt 1083373  T
Q  319 gtgtc 323  Q
    |||||    
T  1083372 gtgtc 1083368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22755054 - 22754871
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||||||||| |   ||| ||||| |||    
T  22755054 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttaagcatct--gtgaagtctcatactaggtgtagtgttgagaagt 22754957  T
Q  228 tgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    |||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22754956 tgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 22754871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 21650895 - 21650979
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctct 86  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21650895 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctct 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19313389 - 19313544
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  19313389 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 19313488  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  19313489 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19313544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 341
Target Start/End: Original strand, 38040521 - 38040669
Alignment:
Q  196 tgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38040521 tgaagtctcatactaggta-gtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttccg 38040619  T
Q  290 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
      |||||||||||||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||||    
T  38040620 gtttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgtc--tctctttcttttctct 38040669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19300382 - 19300537
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19300382 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19300481  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19300482 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19300537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19498362 - 19498517
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19498362 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19498461  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19498462 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 21911311 - 21911476
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21911311 ttgtattgtgaacaccactgattgggtatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgag 21911410  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21911411 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgctagtgtgcttgagcattt 21911476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20221199 - 20221144
Alignment:
Q  290 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20221199 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20221144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22682871 - 22682798
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  22682871 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaacaggataa 22682798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 14794452 - 14794523
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14794452 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaa-ggggactggactacttccgaattgttgaaggaaccaggataa 14794523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 17969581 - 17969641
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969581 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17969641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 19321021 - 19321093
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19321021 gattttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgaattgtggaaggaaccatgataa 19321093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22615315 - 22615225
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  22615315 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaatgaaccagtataatttcttgtatc--tctctttcttttctct 22615225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24843847 - 24843578
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||    
T  24843847 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagcataggaag 24843748  T
Q  138 tctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta-agaaagtattgagcagttgtaatc- 234  Q
    |||||||  || || |||||||||  |||  |||||||   ||||||||   |||  | ||||||||| | |||     || | |||||| ||||||||     
T  24843747 tctcttgattttgttcttgagcataagaaatctcttgcagttgtgcttg---attagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtaatca 24843651  T
Q  235 -tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
      |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24843650 aatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggtggagtggactacttccggtttgtggaaggaacca 24843578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 26619548 - 26619685
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26619548 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26619647  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  26619648 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 26619685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 16587510 - 16587602
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  16587510 ttagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattggaagtctgtttcatttgtgattgagcattggaagtctcttgtttgtgtgcttgaacattt 16587602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22755148 - 22755009
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||||||||    
T  22755148 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccgctgattttatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttgattaga 22755049  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||||    
T  22755048 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgc 22755009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 24851329 - 24851389
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24851329 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacc 24851389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 15671053 - 15671221
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  15671053 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatccaaacttatttct-tgta-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgct 15671150  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagac--tcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||   || ||||||||||  |||||| || ||| |||| |  | |||| |||||||||||||||||    
T  15671151 tgagcatataaaatctcttgcttgtgtgcttaagtatttgaagtcttttttgcttgtgtgcttgagcattt 15671221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 18431386 - 18431501
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  18431386 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctgttgcagttgtgcttgag 18431485  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  18431486 cataggaagtctcttg 18431501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18702393 - 18702278
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     ||||||||    
T  18702393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttatgcttgag 18702294  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  18702293 cataggaagtctcttg 18702278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24575688 - 24575522
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  24575688 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 24575589  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  24575588 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 24575522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 19300477 - 19300571
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19300477 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-aggtagtattgagcagtt 19300571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 21537852 - 21537934
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  21537852 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 21537934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25918363 - 25918265
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25918363 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatccttctatgtaattttgtttatttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 25918265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8685062 - 8684995
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8685062 tgtgattatagtgaaatc-ccttggaagtgcaagggg-actggactactcctgtgttgtgggaggaacca 8684995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 14794307 - 14794438
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | || | ||||  |||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||     
T  14794307 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaaaccaaacttatttgtgtgta-atttgtttgtttagaagtatcttacttttgtgcttgagt 14794405  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcatt 161  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14794406 atttgaagtctcttacttgtgtgcttgagcatt 14794438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22257635 - 22257575
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22257635 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccgatttgtggaaggaacc 22257575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22383125 - 22382974
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag--tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaa 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | || | |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  22383125 gaacaacactgatagtatatcaagtgttcaaccctcaaacaaatttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaa 22383026  T
Q  137 gtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||   |||||| | ||||||||||    
T  22383025 gtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacgtcttgcttttgtgcttgag 22382974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 22786103 - 22786381
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22786103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22786202  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||| |   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  22786203 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttacagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 22786299  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22786300 atttgtaatc--agatattacatagtaaactctccttggaagtacaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 22786381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 28141049 - 28141165
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  28141049 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 28141148  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| ||||||||||    
T  28141149 gcattaaaagtctcttg 28141165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 20569197 - 20569363
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||| ||    
T  20569197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcctg 20569296  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  20569297 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 20569363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22271784 - 22271625
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || | |||| || ||||||| || |||||||||||     |||||| |    
T  22271784 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatatgtaattctgtttgaatataagtctcttgcagttatgcttggg 22271685  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  22271684 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 22271625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24376758 - 24376644
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  24376758 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 24376659  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || || ||||||||||    
T  24376658 ca-tataagtctcttg 24376644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 28141268 - 28141327
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  28141268 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaac 28141327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 10010198 - 10010315
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| || |||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  10010198 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctgtgtaattctgtttgaatttagaaatctcttgcagttgtgcttg 10010297  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10010298 agcattagaagtctcttg 10010315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 10010418 - 10010500
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  10010418 tagtgaactctccttgaaagtgtaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 10010500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22382925 - 22382859
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22382925 tgattttagtgaactctccttggaagagccagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 22382859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22683051 - 22682882
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| | || | ||||  |||||||| || |||||||||||| |  ||| |    
T  22683051 ttgttttgtattctgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaaaccaaacttatttatgtgta-atttgtttgtttggaagtctcttgcttttgtgtt 22682953  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttt 194  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||  ||||||||| |||  ||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  22682952 tgagcataggaaatctcttggttgtgtgcttgagtattttaagtctctagcttgtgtgcttgagcattttt 22682882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24376540 - 24376458
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  24376540 tagtgaactctccttagaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 24376458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38781048 - 38780931
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||     |||||||    
T  38781048 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacctttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttg 38780949  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38780948 agcattagaagtctcttg 38780931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44840085 - 44839785
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||| ||||||    |||||||    
T  44840085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtttcttgcagttgtgcttg 44839986  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||| ||||| || |||   |||||||| |||||||   |||| |||||    
T  44839985 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgaacaattt---gaagtctcttactaagtttagtagtgagc 44839889  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  44839888 atttgtaatca--gatattacatagtgaattctccttggaagtgtaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 44839791  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  44839790 gtcttt 44839785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 20152449 - 20152564
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  20152449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 20152547  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  20152548 agcattagaagtctctt 20152564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21845602 - 21845537
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||    
T  21845602 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctcgattgtggaaggaac 21845537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 22525269 - 22525314
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525269 attgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22525314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 10899171 - 10899235
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  10899171 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggaggagtggactactttcggattgtggaaggaa 10899235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 17418219 - 17418285
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  17418219 gtgattatagtgaaat-tccttggaagcgcaagggg-actggactactcctgtgttgtgggaggaacca 17418285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18702174 - 18702114
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  18702174 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactactttcggtttgtggaaggaacc 18702114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19540069 - 19539768
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| || ||||||||||||    ||||||||    
T  19540069 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttga 19539970  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   |||||||||| | |||   |||||||| | |||||   || | ||||||    
T  19539969 gcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagca 19539873  T
Q  226 gttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtg 321  Q
    |||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  19539872 gttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagttcaagcgggacaggactatttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtg 19539773  T
Q  322 tcttt 326  Q
    |||||    
T  19539772 tcttt 19539768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21845738 - 21845678
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21845738 ttagaagtcttttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcat 21845678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22271564 - 22271504
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22271564 tagtgaactctcctttgaagtccaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 22271504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25828595 - 25828536
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25828595 tagtgaactctccttggaagtgcaaggggg-caggactacttccggtttgtggaaggaacc 25828536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 31328410 - 31328450
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328410 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31328450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 31335131 - 31335171
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31335131 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31335171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 6574576 - 6574615
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574576 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6574615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14581210 - 14581171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581210 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14581171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21537699 - 21537813
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21537699 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 21537798  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || || ||||||||||    
T  21537799 ca-taaaagtctcttg 21537813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Original strand, 21548821 - 21548860
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21548821 aagtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 21548860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21823041 - 21822976
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21823041 gtgattatagtgaaatc-ccttggaagtgcaatggg-actggactactcctgtgttgtgggaggaacc 21822976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21845810 - 21845771
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845810 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21845771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22188551 - 22188590
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188551 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22188590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22802122 - 22802083
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802122 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22802083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23234656 - 23234543
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    ||||||||||    
T  23234656 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacttttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagc 23234557  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  23234556 a-tagaagtctcttg 23234543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 26367074 - 26367133
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||    
T  26367074 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactactttcgatttgtggaaggaac 26367133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Original strand, 26655335 - 26655408
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  26655335 tgtgattatagtgaaatc-ccttgaaagtgcaagggg-actggaccactcctgtgttgtgggaggaaccagtataa 26655408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 28551367 - 28551406
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28551367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28551406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 31801336 - 31801375
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31801336 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38207744 - 38207709
Alignment:
Q  310 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38207744 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38207709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 40331761 - 40331722
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 40331722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 44880817 - 44880734
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44880817 tattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgc 44880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22317243 - 22317127
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22317243 ttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22317145  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22317144 agcattagaagtctcttg 22317127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 38033205 - 38033326
Alignment:
Q  12 tctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    |||| | || || | |||||||||||||    
T  38033205 tctagagtctttcaattgcattatattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctatttgattagaagt 38033304  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||||| |  |||||||||||    
T  38033305 ctcttgctttagtgcttgagca 38033326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40781910 - 40781828
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  40781910 tagtgaactcttattggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 40781828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Original strand, 21911489 - 21911554
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21911489 tgattttagtaaactctccttggaagtgcaaggaggacaggactacttccggattgtggaatgaac 21911554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22257854 - 22257817
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 22257817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22383062 - 22383001
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22383062 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcat 22383001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 22455436 - 22455521
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  22455436 ttgtattgtgaagaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttg 22455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24838545 - 24838480
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||  |||||||||||||    
T  24838545 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacataacaacttccgatttgtggaaggaac 24838480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Original strand, 27766146 - 27766213
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttc 287  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27766146 ttgagcaattgtaatctagtgtgattatagtgaaat-tccttggaagtgtaa-ggggactggactacttc 27766213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1089020 - 1088980
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1089020 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 1088980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 18431604 - 18431664
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  18431604 tagtgaactctcattggaagtgcaacggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 18431664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27939516 - 27939418
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  | || || |||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27939516 ttgagcaattgtaatcgtctgtgattatagtgaaaaatatcgttcgaagtgcaagggagt-tggactacttccggattgtggacggaaccaggataactg 27939418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 39038307 - 39038367
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  39038307 tagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 39038367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 345
Target Start/End: Original strand, 5027893 - 5027924
Alignment:
Q  314 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5027893 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5027924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Original strand, 13964431 - 13964466
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964431 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13964466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Original strand, 13964641 - 13964700
Alignment:
Q  247 gtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13964641 gtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 13964700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 15671234 - 15671281
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 286  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15671234 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactactt 15671281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Original strand, 20569412 - 20569499
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20569412 attttagtgaactctccttggaagtgctagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 20569499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23184750 - 23184789
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23184750 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 23184789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 23184968 - 23185023
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  23184968 tagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 23185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23596013 - 23596052
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23596013 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 23596052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 23596231 - 23596286
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  23596231 tagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 23596286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27296874 - 27296835
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296874 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactac 27296835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 30557769 - 30557808
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557769 ttgtattgtggacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30557808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 39038089 - 39038200
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  39038089 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 39038188  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    ||| | ||||||    
T  39038189 cataacaagtct 39038200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 45087430 - 45087469
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45087430 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 45087469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 6574761 - 6574823
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  6574761 atagtaaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacc 6574823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 10898980 - 10899010
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898980 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10899010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 306
Target Start/End: Original strand, 21770295 - 21770359
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  21770295 gattatagtgaaatct-cttagaagtgcaa-ggggactggattactcccatgttgtgggaggaacca 21770359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 22782279 - 22782341
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  22782279 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggatggaacc 22782341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22801907 - 22801845
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22801907 atagtgaacactccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttgtggaaggaacc 22801845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 24441173 - 24441203
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24441173 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24441203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24575469 - 24575395
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  24575469 tagtgaactctccttggaagtgcaaaggggagaggactggcttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctt 24575395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27939638 - 27939600
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27939638 ttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttca 27939600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 28701876 - 28701938
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  28701876 atagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 28701938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 34322596 - 34322658
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34322596 atagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 34322658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22317028 - 22316967
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22317028 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaac 22316967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25188825 - 25188772
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  25188825 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 25188772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 30557988 - 30558049
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  30557988 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacc 30558049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 35744426 - 35744463
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35744426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttc 35744463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6392098 - 6392038
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  6392098 tagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 6392038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 161
Target Start/End: Original strand, 19302910 - 19302978
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19302910 tgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19302978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 22188767 - 22188799
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22188767 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 22188799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 22312304 - 22312344
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22312304 gaagtctctatcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttg 22312344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 22455625 - 22455685
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22455625 tagtgaactctccttggaattgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 22455685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Original strand, 26623123 - 26623163
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26623123 tgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttcc 26623163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 28551583 - 28551667
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  28551583 atagcgaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttgcggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 28551667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 28701664 - 28701700
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28701664 tattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 28701700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 28712362 - 28712394
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28712362 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 28712394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33240332 - 33240296
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33240332 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 33240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33248253 - 33248217
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33248253 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 33248217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40331223 - 40331163
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||    
T  40331223 atagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcatgactgacttccggtttgtggaaggaa 40331163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12228 - 11885
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12228 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12129  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12128 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12029  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 11929  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11928 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 240)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 166769 - 166426
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166769 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 166670  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166669 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 166570  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166569 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 166470  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166469 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 166426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 177361 - 177018
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177361 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 177262  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177261 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 177162  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177161 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 177062  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177061 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5685393 - 5685050
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685393 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5685294  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5685293 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgtgcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaaat 5685194  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685193 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5685094  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685093 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5685050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9433138 - 9432795
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9433138 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9433039  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9433038 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagt 9432939  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432938 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9432839  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432838 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9432795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37344074 - 37343731
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37344074 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37343975  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343974 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37343875  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343874 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 37343775  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343774 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37343731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 48710917 - 48711260
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48710917 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 48711016  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711017 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 48711116  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711117 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 48711216  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711217 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 48711260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9085158 - 9084815
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085158 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9085059  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085058 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9084959  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084958 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9084859  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084858 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9084815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9094872 - 9094529
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094872 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9094773  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094772 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9094673  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094672 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 9094573  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094572 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9094529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 26294455 - 26294799
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294455 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26294554  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26294555 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 26294654  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294655 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 26294754  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294755 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 468007 - 468350
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 468106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 468206  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  468207 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtggaagg 468306  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468307 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 468350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6867651 - 6867994
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867651 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6867750  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867751 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6867850  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867851 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6867950  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6867951 aaccaggataactgcttgtgtctttgtccttcttttctctgctc 6867994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 6878283 - 6878626
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878283 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6878382  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878383 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6878482  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878483 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 6878582  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6878583 aaccaggataactgcttgtgtctttgtccttcttttctctgctc 6878626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9443734 - 9443391
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443734 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9443635  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9443634 cagaagtctctttcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagt 9443535  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9443534 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgtgttgtggaagg 9443435  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443434 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9443391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20989527 - 20989184
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989527 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20989428  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989427 cagaagtctcttgtctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 20989328  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989327 ctcatacttagaaagtattgagcatctgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 20989228  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989227 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20989184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 21003434 - 21003773
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003434 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21003533  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003534 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21003633  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003634 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgttattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 21003733  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003734 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 21003773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22099612 - 22099269
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099612 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22099513  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22099512 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcgtgcttgagcatttttgtgaagt 22099413  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099412 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22099313  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099312 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22099269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 26653751 - 26654094
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653751 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26653850  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653851 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26653950  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653951 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 26654050  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26654051 aaccaggataactgcttgtgtccttgtctttcttttctctgctc 26654094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 26700080 - 26700423
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700080 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26700179  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700180 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26700279  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700280 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 26700379  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26700380 aaccaggataactgcttgtgtccttgtctttcttttctctgctc 26700423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17961150 - 17961495
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961150 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17961249  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961250 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 17961349  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961350 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17961449  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961450 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17961495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 24931029 - 24931370
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931029 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24931128  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-atttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24931129 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 24931228  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931229 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 24931328  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931329 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 24931370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22088997 - 22088654
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088997 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22088898  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  22088897 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcatgcttgagcatttttgtgaagt 22088798  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088797 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22088698  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088697 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22088654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 2706038 - 2706383
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706038 aaattcaaagtctagagtcttttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2706137  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2706138 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2706237  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706238 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 2706337  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706338 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2706383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 14746101 - 14746439
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746101 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtaaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaag 14746200  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgc-ttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14746201 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgtgaagtctcat 14746300  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746301 acttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 14746400  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746401 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14746439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17950544 - 17950889
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950544 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17950643  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--tttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17950644 tagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 17950743  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950744 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 17950843  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950844 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17950889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40042534 - 40042879
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042534 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40042633  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40042634 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40042733  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042734 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 40042833  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042834 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40042879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40053083 - 40053428
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053083 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40053182  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40053183 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40053282  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053283 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 40053382  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053383 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40053428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1987414 - 1987070
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987414 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1987315  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1987314 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 1987215  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987214 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 1987116  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987115 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1987070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1998035 - 1997691
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998035 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1997936  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1997935 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 1997836  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997835 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 1997737  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997736 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1997691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24734627 - 24734282
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734627 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24734528  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  24734527 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24734428  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734427 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24734328  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24734327 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 24734282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24744574 - 24744229
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744574 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24744475  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  24744474 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24744375  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744374 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24744275  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24744274 ggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 24744229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 26390522 - 26390867
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390522 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26390621  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26390622 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26390721  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390722 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26390821  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390822 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26390867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 26401164 - 26401509
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401164 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26401263  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26401264 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26401363  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401364 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 26401463  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401464 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26401509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42865701 - 42865357
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865701 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42865602  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42865601 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42865502  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865501 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 42865403  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865402 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42865357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42876327 - 42875983
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876327 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42876228  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42876227 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42876128  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876127 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 42876029  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876028 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8627823 - 8627478
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627823 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8627724  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat-ttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8627723 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 8627624  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagt-tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627623 tctcatactttgaaagtattgagcagtatgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 8627524  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627523 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8627478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 2716642 - 2716987
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716642 aaattcaaagtctagagtcttttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2716741  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2716742 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgaccattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2716841  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716842 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 2716941  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716942 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2716987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11005059 - 11004715
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005059 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11004960  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11004959 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 11004860  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004859 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 11004761  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004760 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11004715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8617260 - 8616916
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8617260 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8617161  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-tttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8617160 tagaagtctcttgcctgcgtgattgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaattttttgtgaag 8617061  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8617060 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttctggaag 8616961  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8616960 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8616916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 8002491 - 8002835
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002491 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8002590  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  8002591 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaa 8002690  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002691 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 8002789  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002790 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8002835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 8013136 - 8013480
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013136 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8013235  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  8013236 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaa 8013335  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013336 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 8013434  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013435 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8013480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4222482 - 4222138
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222482 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4222383  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4222382 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 4222283  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222282 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 4222184  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4222183 ggaaccgggataactgcttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 4222138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3165603 - 3165266
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  3165603 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 3165504  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3165503 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 3165404  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3165403 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 3165304  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165303 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3165266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20490875 - 20490538
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20490875 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaaccccactgattgtatatcaagtgttcgagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 20490776  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20490775 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20490676  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20490675 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 20490576  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490575 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20490538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1367498 - 1367163
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1367498 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1367399  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1367398 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1367299  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1367298 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccattttgtggaaggaaccag 1367199  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1367198 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 1367163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 15888760 - 15889095
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  15888760 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaag 15888859  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15888860 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 15888959  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15888960 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 15889059  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  15889060 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 15889095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30049388 - 30049053
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  30049388 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 30049289  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30049288 actcttgcatgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 30049189  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30049188 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactttcgttttgtggaaggaaccag 30049089  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30049088 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 30049053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 31116942 - 31117258
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  31116942 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 31117041  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117042 actcttgcctgcgcgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 31117141  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31117142 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 31117241  T
Q  308 gataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  31117242 gataactgcttgtgtct 31117258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 589081 - 588764
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  589081 aaagtttagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacataattcattgtatttttgtttgatcagaag 588982  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  588981 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgaacattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 588882  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  588881 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 588782  T
Q  308 gataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  588781 gataactgcttgtgtctt 588764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 21770374 - 21770709
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  21770374 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 21770473  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21770474 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 21770573  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21770574 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 21770673  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  21770674 gataactgcttgtatc-ttgcttttcttttctctgct 21770709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9170054 - 9169719
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9170054 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9169955  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9169954 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagcctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9169855  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9169854 cttagagagtattgatcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 9169755  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  9169754 gataactgnttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 9169719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9159599 - 9159264
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9159599 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9159500  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9159499 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagcctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9159400  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9159399 cttagagagtattgatcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 9159300  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  9159299 gataactgtttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 9159264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 40055185 - 40055501
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||  ||||    
T  40055185 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacttt-ttctgtgtatttttgtttgaacagaa 40055283  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40055284 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactattgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 40055383  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40055384 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 40055483  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40055484 ggataactgcttgtgtct 40055501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18441062 - 18440727
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18441062 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacact-ttctgtgtatttctgtttgattagaag 18440964  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18440963 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 18440866  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18440865 actaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 18440766  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18440765 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 18440727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4211785 - 4211569
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttt--gtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4211785 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagt 4211686  T
Q  228 tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttg 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4211685 tgtaatctt-gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctgtg 4211587  T
Q  328 tctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4211586 tctttcttttctctgctc 4211569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 540857 - 540644
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgta 231  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  540857 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgta 540758  T
Q  232 atctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  540757 atctttgtgattatagcgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 540658  T
Q  332 tcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||    
T  540657 tcttttctctgctc 540644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 455225 - 455429
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455225 aaattcaaagtctagagtcttttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 455324  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455325 tagaagtcttttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 455424  T
Q  202 ctcat 206  Q
    |||||    
T  455425 ctcat 455429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 3476774 - 3477104
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  3476774 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 3476873  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3476874 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttaagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcata 3476971  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3476972 cta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacc 3477070  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3477071 aggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctct 3477104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Original strand, 38403644 - 38403979
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38403644 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacattttt-tctgtatctttgtttgaatagaag 38403742  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  38403743 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagtatttt-gagaagtctcat 38403841  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38403842 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 38403941  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  38403942 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgct 38403979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18418981 - 18418677
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18418981 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacact-ttctgtgtatttctgtttgattagaag 18418883  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18418882 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 18418785  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18418784 actaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 18418685  T
Q  305 caggataa 312  Q
    ||||||||    
T  18418684 caggataa 18418677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8933430 - 8933099
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8933430 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 8933332  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  8933331 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 8933234  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8933233 acta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 8933135  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8933134 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 8933099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 81 - 345
Target Start/End: Original strand, 17064034 - 17064297
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17064034 ttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgcg 17064133  T
Q  180 tgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactg 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17064134 tgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggaatg 17064232  T
Q  279 gactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17064233 gactacttccgttttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctgctc 17064297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48382054 - 48381718
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  48382054 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattagaag 48381956  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48381955 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 48381857  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  48381856 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaac 48381757  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48381756 taggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 48381718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15216183 - 15215852
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15216183 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac---attttctgtataattttgtttgaataga 15216087  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||    
T  15216086 agtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgctttagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctc 15215989  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat--agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15215988 atacta-gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttagttaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagg 15215890  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15215889 aaccaggataattgcttgtgtcct--tctttcttttctct 15215852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 12734598 - 12734929
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  12734598 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaactttgtttgaatagaag 12734696  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12734697 cctctcgcctgcgtgcttgagccttagaagaatcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 12734794  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12734795 acta-gagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 12734893  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  12734894 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 12734929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 26209982 - 26210313
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  26209982 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagtag 26210080  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26210081 tctctcccctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 26210178  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtga-aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26210179 acta-gagagtattgagcatctgtaatctgtgtgattattagtgggaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 26210277  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26210278 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 26210313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29589859 - 29589523
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29589859 aagtctagagtctttattgcattgtaatgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29589760  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29589759 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 29589662  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29589661 act-agatagtattgagcatttgtgatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 29589563  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29589562 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctg 29589523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44280251 - 44280055
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44280251 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagt 44280152  T
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280151 taaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 44280055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13682186 - 13681853
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc--tgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||   ||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  13682186 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgtttaaagtcaaac---attttcggtgtaattttgtttgattaga 13682090  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  13682089 agcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctc 13681992  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13681991 atact-agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttcgaagtgcaa-ggggtctggactacttccggtttgtggaagga 13681894  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  13681893 accaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 13681853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11095928 - 11095719
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095928 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11095829  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  11095828 tacaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattataagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgaacataaatttgtgaa 11095729  T
Q  200 gtctcatact 209  Q
     |||||||||    
T  11095728 ttctcatact 11095719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 8999370 - 8999694
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8999370 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8999469  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  8999470 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatttgaagtttcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 8999567  T
Q  205 atactaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8999568 atactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgg 8999667  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  8999668 aaggaatcagtataattgcttgtgtct 8999694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 202 - 345
Target Start/End: Original strand, 457618 - 457761
Alignment:
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  457618 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtggaagg 457717  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457718 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 457761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 324
Target Start/End: Original strand, 38594256 - 38594430
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagt 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38594256 gtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagt 38594354  T
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38594355 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 38594430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 345
Target Start/End: Original strand, 19986159 - 19986289
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986159 agtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 19986258  T
Q  315 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986259 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19986289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 217 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20967328 - 20967200
Alignment:
Q  217 tattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967328 tattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 20967229  T
Q  317 ttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967228 ttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20967200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 540959 - 540798
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtat-ttttgtttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  540959 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 540860  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  540859 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 540798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 345
Target Start/End: Original strand, 24882945 - 24883162
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24882945 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 24883041  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24883042 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccgggataattgcttgtgt 24883141  T
Q  323 ctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |  | ||||||||||||||||||    
T  24883142 c--tctctttcttttctctgctc 24883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 11087485 - 11087803
Alignment:
Q  14 tagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||  ||| || ||||||| |||||||||    
T  11087485 tagagtctttcaattgcattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgggtaattctgtttgaatagaagtct 11087584  T
Q  111 cttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatact 209  Q
    ||||| |  |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11087585 cttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact 11087682  T
Q  210 aag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagt-----gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    | |   ||||||||||||||||||||| |||||||| | |     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11087683 aggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagcggaaatcgccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaa 11087782  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  11087783 ccaatataattgcttgtgtct 11087803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44280363 - 44280209
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44280363 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 44280264  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  44280263 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 44280209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 25212471 - 25212598
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 296  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25212471 gaagtctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtg 25212570  T
Q  297 gaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25212571 gaaggaaccaggataactgtttgtgtct 25212598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 13175058 - 13175362
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||   |  |||    
T  13175058 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtg 13175157  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || | || || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |   |||| |    
T  13175158 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctatagcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcagactaggtgtagtact 13175255  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  13175256 gagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattg 13175355  T
Q  316 cttgtgt 322  Q
    |||||||    
T  13175356 cttgtgt 13175362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4211883 - 4211724
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211883 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4211784  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  4211783 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 4211724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11015463 - 11015335
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatc-tttgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11015463 ttgagcatttgtaatcatttgtgattatagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggaactgaactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgc 11015364  T
Q  317 ttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015363 ttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 326
Target Start/End: Original strand, 4412462 - 4412771
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  4412462 ttgtattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgc 4412561  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattg 221  Q
    ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||    
T  4412562 ttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattg 4412658  T
Q  222 agcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact--acttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    |||||||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||||||| | ||||     
T  4412659 agcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgaacttccggtttgtggaaggaacctgtataat 4412758  T
Q  314 tgcttgtgtcttt 326  Q
    ||| |||||||||    
T  4412759 tgcctgtgtcttt 4412771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 38594144 - 38594298
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38594144 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcattatcaaacttttttctttgtatttttgtttgaatagaag 38594243  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  38594244 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagcatt 38594298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 4433039 - 4433343
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  4433039 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 4433138  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||   || |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  4433139 gcatagaaattctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 4433235  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
     ||||||||  |||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |    
T  4433236 tttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactttccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcct 4433335  T
Q  319 gtgtcttt 326  Q
    ||||||||    
T  4433336 gtgtcttt 4433343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23643286 - 23643198
Alignment:
Q  257 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23643286 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcattgtctttcttttctctgctc 23643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 345
Target Start/End: Original strand, 1251598 - 1251675
Alignment:
Q  268 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1251598 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 345
Target Start/End: Original strand, 23303859 - 23303934
Alignment:
Q  270 gggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23303859 gggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23303934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 24882853 - 24883007
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  24882853 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 24882952  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24882953 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 24883007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 602421 - 602139
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  602421 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaaacaattttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgctttagtgcttg 602322  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac-taagaaagtattgagc 224  Q
    |||||  |||||||||| |||  ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||| |    |||||||||||    
T  602321 agcatctgaagtctcttacttgtgtgtttgagca-tagaagtctcttgc-tgtgtgcttgagca---atctgaagtctcatacttgtttaagtattgagc 602227  T
Q  225 agttgtaatctt-tgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  602226 agttgtaatcttgtgtgattatacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcgatttgtggaaggaacc 602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12220422 - 12220354
Alignment:
Q  277 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12220422 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12220354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Original strand, 22499347 - 22499412
Alignment:
Q  280 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22499347 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22499412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 345
Target Start/End: Original strand, 6044957 - 6045050
Alignment:
Q  250 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  6044957 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccatgataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 6045050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1775728 - 1775665
Alignment:
Q  282 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775728 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1775665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 320
Target Start/End: Original strand, 1878923 - 1879018
Alignment:
Q  227 ttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1878923 ttgtaatcttatgtgattatagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggggctggactacttccgaattgtggaaggaaccaggataattgcttgt 1879018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 289 - 345
Target Start/End: Original strand, 45930881 - 45930937
Alignment:
Q  289 gtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45930881 gtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 45930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 11572876 - 11572949
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  11572876 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggaatgtggaaggaaccaggataa 11572949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 322
Target Start/End: Original strand, 12223090 - 12223196
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||||| ||    
T  12223090 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctccttagaagtgcaagggggactggaccacttctggattgtggatgaaaccaggataattg 12223189  T
Q  316 cttgtgt 322  Q
    |||||||    
T  12223190 cttgtgt 12223196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 345
Target Start/End: Original strand, 6169834 - 6169883
Alignment:
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6169834 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6169883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 2501517 - 2501600
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2501517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaact-tattctttgtaatttcgtttgtttagaagtctcttg 2501600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4821137 - 4820839
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactca-attctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |  || ||||  |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  4821137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactacaaacatattccttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagatgtgcttg 4821038  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| || |||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  4821037 agcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtatagtagtgagc 4820942  T
Q  225 agttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgt 322  Q
    | ||||||||   |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  4820941 aattgtaatcaaatactact-tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgt 4820843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Original strand, 7488620 - 7488687
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7488620 tgattttagtgaactctccttggaagtgtaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacca 7488687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25807051 - 25806882
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| | ||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  25807051 ttgttttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctttata-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgct 25806953  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25806952 tgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 25806882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13302514 - 13302397
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  13302514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 13302415  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13302414 agcattagaagtctcttg 13302397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 19711733 - 19711807
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||| |||||    
T  19711733 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttatggaaggaaccagtataattgctt 19711807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 2501662 - 2501735
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  2501662 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccaaattatggaaggaaccaggataa 2501735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 12174844 - 12175089
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  12174844 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 12174943  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  12174944 agcaatagaagtctcttgattgcgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 12175039  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaaggggg 274  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12175040 aattgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggg 12175089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 13259125 - 13259198
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  13259125 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 13259198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 13266465 - 13266538
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  13266465 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 13266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 13731178 - 13731344
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  13731178 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 13731277  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  13731278 agcattagaagtctcttgctt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 13731344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15088202 - 15088036
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  15088202 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 15088103  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  15088102 agcattagaagtctcttgatt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 15088036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23125537 - 23125436
Alignment:
Q  92 tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23125537 tttgtttgtttagaagtctcttacttttgggcttgagcattagaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcat 23125438  T
Q  191 tt 192  Q
    ||    
T  23125437 tt 23125436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5035039 - 5034875
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  5035039 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattttgtttgtctagaagtatcttgcttttgtgcttgag 5034940  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  |||||||||||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||    
T  5034939 cataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtattt 5034875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 19237540 - 19237648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| | || ||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  19237540 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttataatttagtttgaatagaagtctcttgcttatgtgcttgag 19237639  T
Q  129 cattagaag 137  Q
    ||| |||||    
T  19237640 cataagaag 19237648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25806869 - 25806797
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  25806869 gattatagtgaaatctcgttggaagtgcaagagggactaaactacttccggattgtggaaggaaccaagataa 25806797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13027406 - 13027521
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13027406 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13027505  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13027506 cataagaagtctcttg 13027521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13034342 - 13034457
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13034342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13034441  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | ||||||||||    
T  13034442 cataataagtctcttg 13034457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13263421 - 13263271
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtc 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||    
T  13263421 aacacctctgattgtatatcaagtgttcatctcaaact-tattctttgta-atctgtttga-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtc 13263325  T
Q  140 tcttgcttagtg--cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||| |||||  |||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||    
T  13263324 tcttgc-tagtgtacttgagaatttgaagtcttttgcttgtgtgcttgagcattt 13263271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Original strand, 16105646 - 16105733
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16105646 tgattttagtgaactctccttagaagtgcaaggagggcaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgcttgtgtcttt 16105733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24072183 - 24072140
Alignment:
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24072183 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24072140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 25687345 - 25687503
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || |||||||||||    |||||||||    
T  25687345 ttgtattgggaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattatgtttgaataaaagtctcttgcagttgtgcttgag 25687443  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  25687444 cataagaagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcatttgtgcttgag 25687503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Original strand, 15871754 - 15871832
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15871754 gattatagtgaaaatatccttggaagtacaaaggggactggactacttccagattgtggaaggaaccaggataattgct 15871832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 16308426 - 16308492
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16308426 tgattttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 16308492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16411449 - 16411383
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16411449 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagtgggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 16411383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 18362071 - 18362153
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctct 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18362071 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagcctct 18362153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27871370 - 27871070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  27871370 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttg 27871271  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||   |||| |||||    
T  27871270 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtgagc 27871174  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  27871173 atttgtaatc--agatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 27871076  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  27871075 gtcttt 27871070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 32265224 - 32265341
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  32265224 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 32265323  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32265324 agcaatagaagtctcttg 32265341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 48063316 - 48063433
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  48063316 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 48063415  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48063416 agcaatagaagtctcttg 48063433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11792562 - 11792284
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||    || | |||| || | ||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  11792562 ttgtattgtgaacaccattgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 11792463  T
Q  129 cattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcag 226  Q
    |||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||||| | ||| ||| || | |||   |||||||| | |||||   || | |||||||    
T  11792462 cattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgttcttaagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcaatgagcag 11792366  T
Q  227 ttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11792365 ttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 11792284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16472342 - 16472227
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||||    
T  16472342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgta-atttgtttg-ttataagtctcttgcttttgtggttgagc 16472245  T
Q  130 attagaagtctcttgctt 147  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  16472244 atgggaaatctcttgctt 16472227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1292527 - 1292443
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  1292527 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 1292443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4494229 - 4493927
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt-gcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  4494229 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctctttgcaattgtgcttga 4494130  T
Q  128 gcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| |||||||||||| || |||||   |||||| ||||| ||||||    |||||||||||| |||   |||||||| | |||||   || | |||||    
T  4494129 gcataagaagtctcttgatt-gtgctcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagc 4494034  T
Q  225 agttgtaatct----ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttg 319  Q
    ||||||||||     ||    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||| |||    
T  4494033 agttgtaatcagatattacatttttagtgaactctcctttgaagtgcaagggggacaggaatacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctttg 4493934  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  4493933 tgtcttt 4493927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11318837 - 11318757
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  11318837 tgaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 11318757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14187123 - 14187063
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14187123 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccgatttgtggaaggaacc 14187063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 16315043 - 16315154
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  16315043 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 16315142  T
Q  127 agcattagaagt 138  Q
    ||||||||||||    
T  16315143 agcattagaagt 16315154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9802829 - 9802671
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa-actcaattctctgtattttt-gtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | | |||  |||| || | ||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9802829 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaactaaacaattatttccttgtaattctagtttg-ttataagtgtcttgcttgtgtgcttgagca 9802731  T
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9802730 tgtgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttatgtgcttgagca 9802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 10883675 - 10883976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  10883675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 10883774  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||    |||||||| | |||     || | |||||    
T  10883775 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgttcttgagcattt----gaagtctcttgctagttttagcagtgagc 10883870  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgt 320  Q
    ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||| ||||    
T  10883871 agttgtaatcaaatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctttgt 10883970  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  10883971 gtcttt 10883976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 13172858 - 13173016
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  13172858 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccacaaac-attttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgag 13172956  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
     ||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  13172957 tataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcggaaacctcttgcttttgtgcttgag 13173016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 13261338 - 13261397
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  13261338 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccagtttgtggaaggaac 13261397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 16112392 - 16112506
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    ||||||||||    
T  16112392 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 16112491  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  16112492 agtagaagtctcttg 16112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 16317070 - 16317337
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||| || ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  16317070 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctatgtaattatgttcgaatagtagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagt 16317169  T
Q  139 ctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatc-- 234  Q
    |||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   |||||||||| | |||   |||||||| | |||||   || | |||||||||||||||      
T  16317170 ctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcag 16317266  T
Q  235 -tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     | |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  16317267 atattaaattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggac-ggactacttcctgtttgtggaaggaacc 16317337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 331304 - 331003
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  331304 ttgtattatgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 331205  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| | ||| |   || | |||||    
T  331204 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttgctaggtttagcagtgagc 331109  T
Q  225 agttgtaatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  331108 atttgtaatcagatattacttatagtgaactctccttggaagtgccagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 331009  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  331008 gtcttt 331003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 5001549 - 5001631
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  5001549 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactactttcgatttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 5001631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 7488418 - 7488524
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||    
T  7488418 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaag 7488517  T
Q  138 tctcttg 144  Q
    |||||||    
T  7488518 tctcttg 7488524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13302295 - 13302213
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13302295 tagtgaactatccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 13302213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13645885 - 13645803
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13645885 tagtgaactctgcttggaagtgcaagggggacaggactacttacggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 13645803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 16557094 - 16557211
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16557094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16557193  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16557194 agcattcgaagtctcttg 16557211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16608568 - 16608451
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16608568 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16608469  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16608468 agcattcgaagtctcttg 16608451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 28622863 - 28622980
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||| ||||||    |||||||    
T  28622863 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtgtcttgcagttgtgcttg 28622962  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28622963 agcattagaagtctcttg 28622980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 28623080 - 28623142
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  28623080 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 28623142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 29935849 - 29935964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||     ||||||    
T  29935849 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--caattttctggtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttatgcttg 29935946  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29935947 agcattaaaagtctcttg 29935964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Original strand, 11572762 - 11572863
Alignment:
Q  92 tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11572762 tttgtttgtttagaagtgtcttgcttttgtgattgagcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcat 11572861  T
Q  191 tt 192  Q
    ||    
T  11572862 tt 11572863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 16308289 - 16308350
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16308289 attagaagtctcttacttttgtgcttgagcataggaagactcttacgtgtgtgcttgagcat 16308350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16464461 - 16464371
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||    
T  16464461 gattatagtga--tctccttggaattgcaagggggactggactacttccagattatggaaggaactagtataattgctttgtgtctttctctt 16464371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 22579719 - 22579866
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |  ||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  22579719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattcttcttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 22579818  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22579819 agca-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgc 22579866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24787796 - 24787735
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24787796 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacc 24787735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2499690 - 2499574
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  2499690 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 2499591  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||| |||||||    
T  2499590 gcataagaaatctcttg 2499574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5034729 - 5034669
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  5034729 tagtgaattctccttggaagtccaagggggacaggactacctccggattgtggaaggaacc 5034669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8182396 - 8182312
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  8182396 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 8182312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13879606 - 13879522
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13879606 atagtgaactctccttagaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 13879522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 19237758 - 19237818
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19237758 tagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 19237818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 29936069 - 29936128
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29936069 tagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 29936128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 48806384 - 48806662
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  48806384 ttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 48806483  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| | | || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||| || ||   |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  48806484 agcaatagaagtctcttgataatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaatt---tgaagtctcatactaagtttagtattgagc 48806580  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48806581 atttgtaatc--agatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 48806662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8182583 - 8182544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8182544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11015614 - 11015575
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015614 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11319059 - 11319020
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319059 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11319020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 12222922 - 12222977
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12222922 tagagtctaaattgttttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12222977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 13138401 - 13138567
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||  |||  ||||||||||  || |||| |||||||    |||||||    
T  13138401 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacctcaaacatttttcattgtgattttgtttgaatttggaagcctcttgcagttgtgcttg 13138500  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  13138501 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagcattt 13138567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13261118 - 13261157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13261157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13473002 - 13473117
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13473002 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaggctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13473101  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | | ||||||||    
T  13473102 cataaaatgtctcttg 13473117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14187343 - 14187304
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14187343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14425109 - 14425070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14426200 - 14426161
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426200 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14426161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15467569 - 15467530
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467569 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15467530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15704993 - 15705032
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15704993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15705032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15871583 - 15871622
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15871583 ttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 15871622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19711517 - 19711556
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19711517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19711556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 21211267 - 21211326
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  21211267 tagtgaactctccttgcaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaac 21211326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21381933 - 21381972
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21381972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23125423 - 23125356
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23125423 gattatagtgaaaatccccttggaagtgcaagtgagattggactacttccggattgtggaaggaacca 23125356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23280465 - 23280504
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280465 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23280504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24795219 - 24795258
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795219 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24795258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 30945864 - 30945903
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945864 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30945903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 33692206 - 33692245
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33692206 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 33692245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 41843147 - 41843206
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  41843147 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaac 41843206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44466529 - 44466446
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  44466529 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 44466446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2499498 - 2499424
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  2499498 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggtcaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaatgctt 2499424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 2914114 - 2914394
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  2914114 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 2914213  T
Q  127 agcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |   |||||  |||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| | |||||   || | |||||    
T  2914214 agcattagaagtctcttgactgtgttcagaagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttgctaagtttagcagtgagc 2914309  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   | |   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2914310 aattgtaatcagatattacattatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 2914394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9762337 - 9762184
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa-actcaattctctgtattt-ttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | | |||  |||| || ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9762337 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaactaaacaattatttccttgtaattcttgtttg-ttataagtttcttgcttgtgtgcttgagca 9762239  T
Q  131 ttagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    |  ||||||||||||||  || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  9762238 tgtgaagtctcttgcttgtgtacttgagcatatgaagtctcttgcttgtgtgctt 9762184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15087987 - 15087925
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15087987 atagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcaggactgacttccgatttgtggaaggaacc 15087925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 16310630 - 16310712
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  16310630 tagtgaactctccatggaattgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 16310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 19339969 - 19340031
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19339969 atagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgtggaaggaacc 19340031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 30946079 - 30946141
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  30946079 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacc 30946141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33604333 - 33604259
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  33604333 tctccttggaagtggaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 33604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 35954625 - 35954687
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  35954625 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 35954687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44466712 - 44466570
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||  || || |  ||||||     
T  44466712 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgttttatcagaagtctcttgattgtgttcaagagcata 44466613  T
Q  133 agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  44466612 ggaagtctcttgcagttgtgtttgagcatttgaagtctcttgc 44466570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 48237561 - 48237623
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48237561 atagtgaattctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 48237623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Original strand, 10257765 - 10257841
Alignment:
Q  227 ttgtaatcttt-gtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||    
T  10257765 ttgtaatcttttgtgattatagtgaaaaatgtccttggaagtgcaagggggtttggactacttctggattgtggaag 10257841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 13034560 - 13034621
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13034560 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 13034621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13683250 - 13683134
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    ||||||||    
T  13683250 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttga 13683151  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||||    
T  13683150 gtattagaagtctcttg 13683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15304249 - 15304135
Alignment:
Q  47 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac--tcaattctctgta-tttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  15304249 ctgattgtatatcaagtgttcaac-caaacaattatttctttgtaatttttgtttg-ttagaagtttcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctctt 15304152  T
Q  144 gctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15304151 gcttgtgtgcttgagca 15304135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 16546057 - 16546118
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||    
T  16546057 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaacc 16546118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16619605 - 16619544
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||    
T  16619605 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaacc 16619544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20094706 - 20094637
Alignment:
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20094706 ttgagtattagaagtctattgcttgtgtgctcgagcattgaaagactcttgtttgtgtgcttgagcattt 20094637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 13138617 - 13138701
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  13138617 atagtgaactctcgttggaagtgcaagggggacatgactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 13138701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14425982 - 14425926
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  14425982 tagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaagg 14425926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Original strand, 19328732 - 19328792
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||    
T  19328732 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaa 19328792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 21284096 - 21284156
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  21284096 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactcccggtttgtggaaggaac 21284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21691795 - 21691751
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21691795 tagtgaactctccttggaagttcaagggggacaggactacttccg 21691751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33421188 - 33421104
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  33421188 atagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 33421104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 39285226 - 39285286
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39285226 tagtgaactctctttggaagtggaagggagacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 39285286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1292683 - 1292644
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1292683 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 1292644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1878763 - 1878802
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1878763 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1878802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2266020 - 2266059
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2266020 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaa 2266059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Original strand, 13173065 - 13173132
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||    
T  13173065 tgattttagtgaactatccttggaagtgcaagggggagtggacttcttccagattgtggaatgaacca 13173132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13879820 - 13879785
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879820 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13879785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16105470 - 16105509
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16105470 ttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 16105509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19339753 - 19339792
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339753 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19339792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21691984 - 21691945
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21691984 ttgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaa 21691945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 22579903 - 22579978
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||| | |||| |||||    
T  22579903 atagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 22579978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 23280673 - 23280748
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  23280673 atagtaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 23280748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 2266234 - 2266296
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||  ||||||||||||||    
T  2266234 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaaggctgacttccggtttgtggaaggaacc 2266296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9069196 - 9069134
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||||    
T  9069196 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaagaacc 9069134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 9710524 - 9710586
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9710524 atagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 9710586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 12367250 - 12367280
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12367250 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12367280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15467354 - 15467316
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15467354 atagtgaattctccttggaagtgcaagggggacaggact 15467316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Original strand, 16310477 - 16310527
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  16310477 tgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttg 16310527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 16315262 - 16315343
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  16315262 tagtgaattctccttggaagtgcaaggggg-catgactacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 16315343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16411647 - 16411617
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411647 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16411617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 16557309 - 16557371
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  16557309 atagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgtgcaaggaacc 16557371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16608353 - 16608291
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  16608353 atagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgtgcaaggaacc 16608291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9065150 - 9065113
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9065150 gaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaac 9065113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9802624 - 9802571
Alignment:
Q  271 ggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9802624 ggggactggactacttccggattatggaagcaaccaggataattgtttgtgtct 9802571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 12367460 - 12367533
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||| | |||| |||||    
T  12367460 tagtgaactttccttggaagtgcaagggggacataactacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctt 12367533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 326
Target Start/End: Original strand, 15705218 - 15705291
Alignment:
Q  255 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  15705218 tccttggaagtgcaagggggacaggactgacttacggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 15705291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 16155483 - 16155515
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16155483 atagtgaattctccttggaagtgcaagggggac 16155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 289
Target Start/End: Original strand, 18362253 - 18362297
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18362253 tagtgaactctccttggaagggcaagggggacaggaccacttccg 18362297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 19328518 - 19328554
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19328518 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgtt 19328554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20597805 - 20597757
Alignment:
Q  282 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtct 330  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20597805 tacttccggattgtgaaaggaaccaggatagttgcttgtgtctttgtct 20597757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 33692421 - 33692453
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33692421 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 33692453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 214)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 450485 - 450142
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450485 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 450386  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450385 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 450286  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450285 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 450186  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450185 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 450142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4948246 - 4947903
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948246 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4948147  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948146 tagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4948047  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948046 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 4947947  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4947946 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4947903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 15561430 - 15561773
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561430 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15561529  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561530 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 15561629  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561630 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 15561729  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561730 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15561773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 18752840 - 18753183
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752840 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18752939  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18752940 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 18753039  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753040 ctcatactttgatagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagagcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 18753139  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753140 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18753183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 18763450 - 18763793
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763450 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18763549  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18763550 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 18763649  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763650 ctcatactttgatagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 18763749  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763750 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18763793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21996322 - 21995979
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996322 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21996223  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996222 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21996123  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996122 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 21996023  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996022 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21995979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22006920 - 22006577
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006920 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22006821  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006820 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22006721  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006720 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 22006621  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006620 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22006577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 27815296 - 27815639
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815296 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27815395  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815396 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgaacattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 27815495  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815496 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 27815595  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815596 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27815639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48371040 - 48370697
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48371040 aaattcaaagtccagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 48370941  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370940 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 48370841  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370840 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 48370741  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370740 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 48370697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 14844004 - 14844347
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844004 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14844103  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844104 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 14844203  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844204 ctcatacttagaaagtattaagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 14844303  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844304 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14844347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 19955313 - 19955656
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955313 aaattcatagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19955412  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955413 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19955512  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955513 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19955612  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955613 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19955656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 30926845 - 30927188
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30926845 aaattcaaagtctagagtcttttctgtcttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30926944  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30926945 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 30927044  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927045 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 30927144  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927145 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30927188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17917961 - 17917617
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917961 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17917862  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-atttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17917861 tagaagtctcttgcctgcgtgcttaagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 17917762  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917761 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 17917662  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917661 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17917617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17928609 - 17928265
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928609 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17928510  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-atttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17928509 tggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 17928410  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928409 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 17928310  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928309 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17928265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 461066 - 460723
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461066 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 460967  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460966 tagaattctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 460867  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460866 ctcatacttagaaagtattgagcagtagtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 460767  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460766 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 460723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5022645 - 5022302
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022645 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5022546  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5022545 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 5022446  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022445 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtaattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 5022346  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022345 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5022302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 30937423 - 30937766
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30937423 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctccgtatttttgtttgat 30937522  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937523 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 30937622  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30937623 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggggaactggactacttccgtgttgtggaagg 30937722  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937723 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30937766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24028436 - 24028782
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028436 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24028535  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---tttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  24028536 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 24028635  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24028636 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtattgtgga 24028735  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028736 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24028782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 19944678 - 19945021
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944678 aaattcatagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19944777  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944778 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgaacattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19944877  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944878 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 19944977  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944978 aaccaggataactgtttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19945021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52703697 - 52703354
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52703697 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaactcaaactcaattctctgtatttttgtttcat 52703598  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703597 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 52703498  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703497 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 52703398  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703397 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 52703354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 29042007 - 29042351
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29042106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29042107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 29042206  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042207 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 29042305  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042306 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29042351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16255775 - 16255432
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16255775 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttga 16255676  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255675 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 16255576  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255575 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 16255477  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255476 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16255432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 18130590 - 18130936
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgttt-ga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18130590 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttga 18130689  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18130690 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 18130789  T
Q  199 agtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130790 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 18130889  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130890 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18130936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27656509 - 27656164
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656509 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27656410  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27656409 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27656310  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656309 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27656210  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27656209 ggaaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 27656164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27667082 - 27666737
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667082 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27666983  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27666982 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27666883  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666882 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 27666783  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27666782 ggaaccaggataactgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 27666737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 55745603 - 55745947
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745603 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 55745702  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  55745703 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 55745802  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745803 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 55745901  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745902 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 55745947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16266368 - 16266025
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16266368 aaattcaaagtctagagtcttttctacattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttga 16266269  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266268 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 16266169  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266168 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 16266070  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266069 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16266025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24640157 - 24639813
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24640157 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24640058  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24640057 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 24639958  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639957 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 24639859  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639858 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36018245 - 36017901
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018245 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36018146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36018145 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36018046  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018045 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36017947  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36017946 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36017901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36028798 - 36028454
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028798 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36028699  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36028698 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36028599  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028598 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 36028500  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028499 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36028454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49518044 - 49517700
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49518044 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 49517945  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49517944 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 49517845  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517844 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 49517746  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517745 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 49517700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 55756214 - 55756558
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55756214 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctttgtatttttgtttgat 55756313  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  55756314 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 55756413  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756414 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 55756512  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756513 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 55756558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40470937 - 40471281
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt-attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40470937 aaattcaaagtctagagactttattgtttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttga 40471036  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40471037 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 40471136  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40471137 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 40471236  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471237 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40471281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10740945 - 10741289
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10740945 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10741044  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10741045 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10741144  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741145 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10741243  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741244 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10741289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10954714 - 10955058
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10954714 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10954813  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10954814 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10954913  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10954914 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10955012  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955013 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10955058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40454698 - 40455043
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt--attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40454698 aaattcaaagtctagagtctttattgttttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttg 40454797  T
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaa 199  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40454798 atcagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaa 40454897  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40454898 gtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaa 40454997  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454998 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40455043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10751519 - 10751863
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10751519 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10751618  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10751619 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10751718  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751719 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10751817  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751818 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10751863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 10965288 - 10965632
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10965288 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10965387  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10965388 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10965487  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965488 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatc-ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 10965586  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965587 ggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10965632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25657045 - 25656701
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt-attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657045 aaattcaaagtctagagtctttattgtttttttattgagaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttga 25656946  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25656945 tcagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 25656846  T
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25656845 tttcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 25656746  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656745 gaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 25656701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10909310 - 10908975
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  10909310 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 10909211  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10909210 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 10909111  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10909110 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 10909011  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10909010 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 10908975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 18078263 - 18078602
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18078263 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 18078362  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaagtctca 205  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18078363 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagcctcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctca 18078462  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18078463 tacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtgttgtggaaggaacc 18078562  T
Q  306 aggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18078563 aggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 18078602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16317233 - 16316898
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  16317233 aaagtctagagtctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 16317134  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16317133 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16317034  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16317033 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 16316934  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16316933 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 16316898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16305009 - 16304674
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| |||||    
T  16305009 aaagtctagagtctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttatttgatcagaag 16304910  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16304909 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16304810  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16304809 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 16304710  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16304709 gataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 16304674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10695542 - 10695209
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  10695542 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaaga 10695443  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10695442 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 10695344  T
Q  209 taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10695343 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccagg 10695244  T
Q  309 ataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10695243 ataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 10695209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 14836459 - 14836794
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  14836459 aaagtttatagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 14836558  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  14836559 actctagcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcata 14836658  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14836659 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 14836758  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  14836759 gataaatgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 14836794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5873272 - 5872939
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  5873272 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttctttgtatttttgtttgaatagaagc 5873173  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5873172 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagta-ttttgagaagtctcatac 5873074  T
Q  209 taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  5873073 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtgggaggaaccagg 5872974  T
Q  309 ataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  5872973 ataactgcttgtgtc-tcgtttttcttttctctgct 5872939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3370617 - 3370284
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  3370617 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcataatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaag 3370518  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttt-gtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3370517 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctaagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 3370418  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3370417 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 3370318  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  3370317 ggataattgcttgtgtc-tcgtgtttcttttctct 3370284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3390357 - 3390024
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  3390357 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaag 3390258  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttt-gtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3390257 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctaagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 3390158  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3390157 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 3390058  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  3390057 ggataactgctcgtgtc-tcgtgtttcttttctct 3390024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 15207746 - 15208079
Alignment:
Q  10 agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaagt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| |||||     
T  15207746 agtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaaga 15207845  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15207846 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagcatttt-gagaagtctcatac 15207944  T
Q  209 taagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15207945 ttagagagtattgagcatttgtaatcttagtgattatggtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccagg 15208044  T
Q  309 ataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  15208045 ataactgcttgtgccttattc-ttcttttctctgct 15208079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19581144 - 19580830
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattt-ttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||| | |    
T  19581144 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttcttttttgatcaaa 19581045  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19581044 agactcttgcccgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactctttcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctca 19580946  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19580945 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccgttttgtggaaggaacc 19580846  T
Q  306 aggataactgcttgtg 321  Q
    ||||||||||||||||    
T  19580845 aggataactgcttgtg 19580830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10300436 - 10300120
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  10300436 aagtctagagtctttattgcattgaattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 10300337  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10300336 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctagcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcata 10300238  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10300237 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 10300138  T
Q  307 ggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| |||||||||||    
T  10300137 ggataattgcttgtgtct 10300120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11535746 - 11535428
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535746 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 11535648  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11535647 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 11535549  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11535548 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacc 11535449  T
Q  306 aggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  11535448 aggataattgcttgtgtcttt 11535428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 286
Target Start/End: Original strand, 4986784 - 4987045
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4986784 ttgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgct 4986883  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4986884 tgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagc 4986983  T
Q  225 agttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4986984 atttgtaatctttgtgattatagtgaaatctgcttggaagtgtaagggggactggactactt 4987045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 117 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25008689 - 25008463
Alignment:
Q  117 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  25008689 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 25008590  T
Q  217 tattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25008589 tattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgc 25008490  T
Q  317 ttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25008489 ttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 25008463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 31267150 - 31267485
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31267150 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 31267248  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31267249 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 31267347  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31267348 acttagagaatattgagcatttgtaatctttgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaa-ggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 31267446  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31267447 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 31267485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11514936 - 11514601
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11514936 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctatgtatttttgtttgaatagaag 11514838  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  11514837 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 11514740  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11514739 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 11514640  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||||    
T  11514639 caggataattgcttgcatc--tctctttcttttctctgctc 11514601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24713332 - 24712993
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt----a 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||      |    
T  24713332 aagtctagagtctttattgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacgtaca 24713234  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtct 203  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||||||    
T  24713233 gaagcctctcgtctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactctttcctgcgtgcttgagcatttt-gaaaagtct 24713135  T
Q  204 catactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24713134 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaatggggactggactacttccgatttgtggaagga 24713035  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  24713034 accaggataattgcttgtgtc-tcgcttttcttttctctgctc 24712993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 49002338 - 49002670
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| |||||    
T  49002338 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaa 49002436  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||    
T  49002437 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagcattt--gagaagtctca 49002534  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49002535 tacta-gagagtattgagcatctgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaa 49002633  T
Q  304 ccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||||    
T  49002634 ccagaataattggttgtgtc--tctctttcttttctctg 49002670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 55651224 - 55650893
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  55651224 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 55651126  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  55651125 tctcttgccttcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 55651028  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  55651027 acta-gagagtattgagcatctgtaatctgtgtgatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtagaaggaac 55650929  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||    
T  55650928 caggataattgtttgtgtc--tctctttcttttctctg 55650893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 344
Target Start/End: Original strand, 47152528 - 47152740
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  47152528 attagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttg 47152626  T
Q  230 taatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47152627 taatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttattc 47152726  T
Q  330 tttcttttctctgct 344  Q
     ||||||||||||||    
T  47152727 -ttcttttctctgct 47152740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 19143504 - 19143696
Alignment:
Q  151 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19143504 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtga 19143603  T
Q  251 aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19143604 aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 19143696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19241926 - 19241589
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  19241926 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 19241827  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  19241826 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 19241729  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19241728 atact-aggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggaggactggactacttccggtttgtgga 19241630  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  19241629 aggaaccagtataattgcttgtg--tttatctttcttttctct 19241589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 18775036 - 18775372
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  18775036 aagtctagagtctttaattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 18775135  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||     
T  18775136 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcc 18775233  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatt-----atagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18775234 cactaggca-gtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 18775332  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  18775333 ggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 18775372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 8183486 - 8183613
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 296  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8183486 gaagtctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtgttgtg 8183585  T
Q  297 gaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183586 gaaggaaccaggataactgcttgtgtct 8183613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 9920958 - 9921068
Alignment:
Q  235 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9920958 tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttct 9921057  T
Q  335 tttctctgctc 345  Q
    |||||||||||    
T  9921058 tttctctgctc 9921068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 18007441 - 18007778
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  18007441 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 18007540  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||    
T  18007541 agtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--ggaagtctc 18007638  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18007639 atact-aggtagtattaagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 18007737  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  18007738 aagaaccagtataattgcctgtgtc--tctctttcttttctct 18007778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28050238 - 28050129
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050238 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 28050139  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  28050138 ttctctgctc 28050129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 16819825 - 16820038
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16819825 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gttagtattgagcagtt 16819921  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16819922 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 16820021  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||  ||||||||||||    
T  16820022 ctctg--tttcttttctct 16820038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49509652 - 49509543
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49509652 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttctt 49509553  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  49509552 ttctctgctc 49509543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19570711 - 19570584
Alignment:
Q  216 gtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19570711 gtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactg 19570612  T
Q  316 cttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  19570611 cttgtatcttattc-ttcttttctctgct 19570584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23508926 - 23508713
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23508926 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 23508830  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23508829 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccggtttgtggaatgaaccaggataattgcttgtgt 23508730  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  23508729 c--tctctttcttttctct 23508713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10290345 - 10290191
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290345 ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattattagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 10290246  T
Q  290 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  10290245 atttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc-tcgcttttcttttctctgctc 10290191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 14711253 - 14711468
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  14711253 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 14711350  T
Q  228 tgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    |||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14711351 tgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtg 14711450  T
Q  322 tctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||  | ||||||||||||||    
T  14711451 tc--tctctttcttttctct 14711468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 14778917 - 14779132
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  14778917 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 14779014  T
Q  228 tgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    |||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14779015 tgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtg 14779114  T
Q  322 tctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||  | ||||||||||||||    
T  14779115 tc--tctctttcttttctct 14779132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33378062 - 33377762
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||  ||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  33378062 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgcgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagca 33377963  T
Q  131 ttagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagtt 228  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
T  33377962 taggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagaagtt 33377866  T
Q  229 gtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  33377865 gtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgtaatggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgt 33377766  T
Q  323 cttt 326  Q
    ||||    
T  33377765 cttt 33377762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Original strand, 17199074 - 17199163
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199074 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 17199163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4987176 - 4987052
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  4987176 aaagtctagagtctttattgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaag 4987077  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4987076 actcttgcctgcgtgcttgagcatt 4987052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 3188988 - 3189071
Alignment:
Q  262 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3188988 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3189071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 20649445 - 20649528
Alignment:
Q  262 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649445 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20649528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 29030156 - 29030237
Alignment:
Q  264 gtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29030156 gtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29030237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Original strand, 36210587 - 36210784
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |   ||| |||||||||||    
T  36210587 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaattctcatactaggtgtagtcttgagcagttg 36210684  T
Q  230 taatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  36210685 taatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaacgaaccagtataattgtttgtgtct 36210784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23509018 - 23508884
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  23509018 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 23508919  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  23508918 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 23508884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 47152436 - 47152589
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac-tcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47152436 aagtttagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaagtcaaacatattttccctgtatctttgtttgattagaag 47152535  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  47152536 actcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 47152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 341
Target Start/End: Original strand, 18775515 - 18775689
Alignment:
Q  168 ctcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttgg 261  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||     |||| ||||||| ||||    
T  18775515 ctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcatactaggca-gtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctcgttgg 18775611  T
Q  262 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||    
T  18775612 aagtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtc--tctctttcttttctct 18775689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 16819732 - 16819867
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  16819732 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 16819831  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  16819832 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 16819867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 345
Target Start/End: Original strand, 39532269 - 39532395
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||     
T  39532269 ttgagcatttgtaatctgtgtgatttttagtgaaaatctccttgtaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgt 39532368  T
Q  317 ttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39532369 ttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 39532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 8997637 - 8997743
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  8997637 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagacaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 8997736  T
Q  108 tctcttg 114  Q
    |||||||    
T  8997737 tctcttg 8997743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 17994173 - 17994310
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  17994173 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 17994272  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  17994273 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctt 17994310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1672045 - 1671908
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1672045 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1671946  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagca 159  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1671945 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 1671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 39532174 - 39532277
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39532174 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatctttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 39532272  T
Q  128 gcatt 132  Q
    |||||    
T  39532273 gcatt 39532277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 9751982 - 9752277
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtc 109  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||    
T  9751982 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtc 9752081  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||    ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  9752082 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcttgagcataggatgtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatac 9752178  T
Q  209 taag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgga-ctacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||   |  |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9752179 taagtttagtattgagcatttgtaatc--agatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacaggaccgacttccggtttgtggaaggaac 9752276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Original strand, 18775930 - 18776020
Alignment:
Q  249 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||    
T  18775930 gaaatctcgttggaagtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtc--tctctttcttttctct 18776020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 17526825 - 17527003
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  17526825 tagagtctgaattgttttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaactgaattctttgta-atttgtttgtttagaagtctttt 17526923  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    || |  ||||||||| ||  ||| | ||| | ||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  17526924 gcttttgtgcttgagaatacgaaatatctagtttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtatgcttgagcattt 17527003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18394198 - 18394032
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |  |||  |||||||| || |||||||||||  |  |||||    
T  18394198 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttattttttcgta-atttgtttgttttgaagtctcttgtttttgtgct 18394100  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18394099 tgagcataagaaatctgttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgttcttgagcatt 18394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 3105879 - 3106178
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  ||||||||    
T  3105879 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcatttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttga 3105978  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||   |||| ||| ||    
T  3105979 gcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtgaaca 3106075  T
Q  226 gttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtg 321  Q
     ||||||||   |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||    
T  3106076 tttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacataactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 3106173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 14711159 - 14711315
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  14711159 aagtctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 14711258  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14711259 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14711315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55731497 - 55731221
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |  ||||||||||||| |  |||||||    
T  55731497 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-ttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 55731399  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||||   |||| ||| |    
T  55731398 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgaac 55731303  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  55731302 atttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacc 55731221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7222165 - 7221998
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| |  |||||    
T  7222165 ttgttttgtattatgaacaccagtgattgcatatcaagtgttcaaataaaacttatttctgtgta-atttgtttgtttagaaatctcttgcttttgtgct 7222067  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  |||||||||  || |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  7222066 tgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtgtttgaagtctcttgcttatgtgcttgagcattt 7221998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 14154455 - 14154755
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctc--tgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||  |||| || |||||||  ||||||||||||||| |  |||||    
T  14154455 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac---attttccttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgct 14154551  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattga 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||||    |||||||| | |||||   || | |||    
T  14154552 tgagcattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttgctaagtttagcagtga 14154647  T
Q  223 gcagttgtaatctttgtgatta----tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgc 316  Q
     || ||||||||   || ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||    
T  14154648 acatttgtaatca--gttattacacctagtgaattctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgc 14154745  T
Q  317 ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||    
T  14154746 ttgtgtcttt 14154755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16939681 - 16939534
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  16939681 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 16939582  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||    
T  16939581 agcaatagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 16939534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 17788498 - 17788613
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  17788498 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17788597  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| |||| |||||||    
T  17788598 cataagaattctcttg 17788613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 19889443 - 19889717
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag--tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19889443 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaacctcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 19889541  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagta-ttgagca 225  Q
    ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||| | |||   |||||||| | ||      ||  |||| ||    
T  19889542 gcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagttt---gaagtctcttgctttt---gtgcttgatca 19889635  T
Q  226 gttgtaatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
     ||||||||   |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19889636 attgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 19889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23750175 - 23750060
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  23750175 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagtcgtgcttgag 23750076  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23750075 cataagaagtctcttg 23750060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 41115216 - 41115331
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  41115216 ttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 41115315  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  41115316 cataagaagtctcttg 41115331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13693280 - 13693194
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  13693280 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggattatggaaggaacctgtataattgcttgtgtctttctctt 13693194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 345
Target Start/End: Original strand, 43347078 - 43347124
Alignment:
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43347078 aggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43347124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 14778827 - 14778979
Alignment:
Q  13 ctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtc 109  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  14778827 ctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtc 14778926  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14778927 tcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14778979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 17994267 - 17994364
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  17994267 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagcagtt 17994363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23123163 - 23123055
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23123163 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgccattgtgcttgagcattaga 23123064  T
Q  136 agtctcttg 144  Q
    |||||||||    
T  23123063 agtctcttg 23123055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13693459 - 13693299
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  | ||||| |  ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||    
T  13693459 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaa--catctttctgtgtaattgtttgtttagaagtctctagcttttgtgcttgagc 13693362  T
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||   || ||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  13693361 atacaaaatctcttgcttatgtg-ttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagcattt 13693299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16853155 - 16852877
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  16853155 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacata-ttctttgtacttctgtttgaagtgagaagtctcttgcatttgtgcttg 16853057  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||||    |||||||| ||||||    |||| |||||    
T  16853056 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcattt----gaagtctcttactaaatttagtagtgagc 16852961  T
Q  225 agttgtaatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16852960 aattgtaatcagatattacttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 16852877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55379743 - 55379683
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55379743 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccgttttgtggaaggaacc 55379683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13890482 - 13890323
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  13890482 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttccacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 13890383  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  |||| || |||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  13890382 cataggaagactattgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 13890323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16939576 - 16939352
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    ||||    
T  16939576 tagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaag 16939481  T
Q  201 tctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtg 296  Q
    |||| |||||||   |||| |||||| ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  16939480 tctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtg 16939383  T
Q  297 gaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16939382 gaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 16939352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 17057573 - 17057731
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  17057573 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcttttgtgcttgag 17057671  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  ||||||| |||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  17057672 catatgaagtcttttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 17057731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18473682 - 18473519
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    |||| |||| |||| |||| | | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  18473682 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaccatctttctatgtaattttatttgttcataagtctcttgcttttgtgcttgagc 18473583  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18473582 ataggaaatctcttgcttgtgtggttgagtatttgaagtctcttgcttgtatgcttgagcattt 18473519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 36210508 - 36210647
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  36210508 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 36210607  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36210608 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 36210647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29121016 - 29120900
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||   ||||||||    
T  29121016 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagtcgtgcttg 29120918  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29120917 agcattagaagtctcttg 29120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40860322 - 40860205
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || || ||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40860322 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgattgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40860223  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40860222 agcattagaagtctcttg 40860205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 14903084 - 14903177
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  14903084 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggagacaggactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctttctctt 14903177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 37986070 - 37986186
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    || ||||    
T  37986070 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtacttg 37986169  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  37986170 agcattagaagtctctt 37986186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6641336 - 6641059
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  6641336 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttg 6641237  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta-agaaagtattgagc 224  Q
    |||||  ||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| | |||     || | |||||    
T  6641236 agcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttgctagttttagcagtgagc 6641141  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  6641140 agttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttcggt-ttgtggaaggaac 6641059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11900624 - 11900564
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11900624 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 11900564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12811635 - 12811751
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || | |||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  12811635 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcgttgtaattctatttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 12811734  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  12811735 gcattagaagtctcttg 12811751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 15015064 - 15015124
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15015064 tagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacc 15015124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Original strand, 17994362 - 17994442
Alignment:
Q  258 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  17994362 ttggaagtgca-gggggactggactacttccggtttgtagaaggaaccagtataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 17994442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18473506 - 18473414
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||| ||||    
T  18473506 tgattttagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgcttttgtatttctctt 18473414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19884168 - 19884084
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19884168 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 19884084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Original strand, 20571666 - 20571754
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20571666 tgattttagtgaactatccttggaagtgcaagagggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 20571754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 56034223 - 56034107
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  56034223 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 56034124  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  56034123 gcatttgaagtctcttg 56034107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 8997740 - 8997831
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattata 246  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8997740 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcgtact-agatagtattgagcaattgtaatctgtgtgattata 8997831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12600193 - 12600134
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12600193 tagtgaactctccttggaagttcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaac 12600134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15014845 - 15014960
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||    |||||||||    
T  15014845 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15014944  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15014945 cataagaagtctcttg 15014960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15135163 - 15135080
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  15135163 tagtgaactctccttggatgcgcaagggggactggactaacttccggtttgtggaaggaacctgtataactgctttgtgtcttt 15135080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Original strand, 18775816 - 18775911
Alignment:
Q  48 tgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  18775816 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaatcttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcccgagtgcttgagtattggaagtctct 18775911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19052803 - 19052738
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactact 285  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19052803 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtgaaatc-ccttggaagtgcaa-ggggactggactact 19052738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24619181 - 24619079
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaa--tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||    
T  24619181 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattaaagtgaaaaatctcattggaagtgcatgggggactagactacttccaaattatggaaggaatcaggataattg 24619082  T
Q  316 ctt 318  Q
    |||    
T  24619081 ctt 24619079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 55379961 - 55379847
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  55379961 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttccgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 55379862  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || |||||||||||||    
T  55379861 ca-tagaagtctcttg 55379847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 17399134 - 17399434
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||     |||||||    
T  17399134 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttg 17399233  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||| ||| |||||||   |||| |||||    
T  17399234 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagactcttactaagtttagtagtgagc 17399330  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac-tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgt 320  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||    
T  17399331 atttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 17399428  T
Q  321 gtcttt 326  Q
    ||||||    
T  17399429 gtcttt 17399434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17540051 - 17539965
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17540051 ttgtattgtgaacatcactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgc 17539965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 17701215 - 17701332
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  17701215 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 17701314  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17701315 agcaatagaagtctcttg 17701332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23749957 - 23749899
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  23749957 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaa 23749899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Original strand, 32491310 - 32491447
Alignment:
Q  55 atatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgct 153  Q
    |||||||||||||||   ||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  32491310 atatcaagtgttcaaactaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgtttttgtgtttgagcataggaaatctcttgcttatgagct 32491408  T
Q  154 tgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32491409 tgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 32491447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6517137 - 6516839
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||| ||||     ||||||    
T  6517137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttatgcttg 6517039  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgag 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||   |||| ||||    
T  6517038 agcaatagaagtctcttgatt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaagtctcttactaagtttagtagtgag 6516944  T
Q  224 cagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttg 319  Q
    || || |||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||    
T  6516943 caattttaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 6516846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 14190088 - 14190149
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  14190088 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacc 14190149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 16476056 - 16476129
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||    
T  16476056 tagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacatgtataactgctt 16476129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16847982 - 16847921
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16847982 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 16847921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Original strand, 17788718 - 17788791
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  17788718 tagtgaactctccttggaaatgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 17788791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 37436000 - 37436164
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  37436000 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgagttagaagtctcttgcagttgtgcttga 37436099  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  37436100 gca-tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 37436164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 326
Target Start/End: Original strand, 41115436 - 41115517
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  41115436 agtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctacttccggtttgaggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 41115517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1674520 - 1674476
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674520 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 1674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 3500111 - 3500278
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    ||||||    
T  3500111 attgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgctt 3500210  T
Q  126 gagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| | | || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  3500211 gagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 3500278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7221984 - 7221936
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7221984 gattatagtgaaatctcattgaaagtgcaaggcggactggactacttcc 7221936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 14605364 - 14605480
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||  || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  14605364 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 14605463  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14605464 gcatttgaagtctcttg 14605480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 17527016 - 17527104
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17527016 gattatagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggggctggactactttccgatcatggaaggaaccagaataattgctttgtgtcttt 17527104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18773637 - 18773577
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18773637 attagaagtctattgatttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtgtgtgcttgagcat 18773577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22089717 - 22089637
Alignment:
Q  247 gtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  22089717 gtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactaattccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 22089637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 22676198 - 22676282
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  22676198 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 22676282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 29681194 - 29681254
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  29681194 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttctggtttgtggaaggaacc 29681254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54679363 - 54679279
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  54679363 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 54679279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3395241 - 3395202
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395241 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3395202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8105289 - 8105250
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8105289 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 8686121 - 8686180
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8686121 tagtgaactctccttgaaagtgcaaggggggcaggactacttccggtttgtggaaggaac 8686180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11900842 - 11900803
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11900842 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11915353 - 11915242
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  11915353 ttgtattgtgaccaccactggttgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 11915254  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    ||| | ||||||    
T  11915253 cataacaagtct 11915242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 16325167 - 16325230
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||    
T  16325167 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggattatggaagga 16325230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19884353 - 19884314
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884353 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21350659 - 21350698
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21350659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21350698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 29681005 - 29681044
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29681005 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29681044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 36470480 - 36470441
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36470480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36470441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38513529 - 38513490
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38513529 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38513490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 54679579 - 54679540
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679579 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 54679540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10072584 - 10072468
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  10072584 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 10072486  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10072485 agcattagaagtctcttg 10072468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15475603 - 15475720
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  15475603 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaatctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 15475702  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15475703 agcaatagaagtctcttg 15475720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16631874 - 16631800
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  16631874 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 16631800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22190497 - 22190380
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22190497 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22190398  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22190397 agcaatagaagtctcttg 22190380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 22223437 - 22223525
Alignment:
Q  222 agcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22223437 agcaattgtaatatgtgagattatagtgaaatc-ccttggaagtgcaa-gaggacttgactactcctgtgttgtgggaggaaccagtataa 22223525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36470403 - 36470329
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  36470403 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 36470329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45833036 - 45832998
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45833036 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 45832998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9266854 - 9266769
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9266854 aagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcttgtgtgcttgagtattgaaagtctcttgtatgtgtgcttgagca 9266769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18773528 - 18773455
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  18773528 tagtgaactctccttgaaagggcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgctt 18773455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8103719 - 8103659
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||    
T  8103719 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaac 8103659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11915134 - 11915074
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11915134 tagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaagactacttctggtttgtggaaggaacc 11915074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 14605578 - 14605642
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||    
T  14605578 attttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaac 14605642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45832822 - 45832738
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  45832822 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttttggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 45832738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 56533520 - 56533799
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga----ttagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||||    |||||||||||||||    |||||    
T  56533520 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-atattctttgtaattctgtttgaatttttagaagtctcttgcagttgtgct 56533618  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattga 222  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||   |||| |||    
T  56533619 tgagcatcagaagtttcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtagtga 56533715  T
Q  223 gcagttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| ||||||||   |  |||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56533716 gcaattgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggaagacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 56533799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8911120 - 8911037
Alignment:
Q  227 ttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  8911120 ttgtaatcttgtgtgattatagtgaaatc-ccttagaagtgtaagggg--ctggattactcctgtgttgtgggaggaaccagtataa 8911037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 318
Target Start/End: Original strand, 10661838 - 10661917
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  10661838 tgattttagtgaactctcctgggaggtgcaagtgggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 10661917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 318
Target Start/End: Original strand, 10875983 - 10876062
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  10875983 tgattttagtgaactctcctgggaggtgcaagtgggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 10876062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 15475819 - 15475898
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaaggggga-----ctggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  15475819 atagtgaactctccttggaagtgcaggggggggggggctggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctt 15475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16324974 - 16325013
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16324974 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 16325013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18394019 - 18393952
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18394019 tgattttagtaaaatttctttggaagtgcaagggggagtaaactacttccgaattgtggaaggaacca 18393952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19665791 - 19665716
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19665791 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 19665716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20977109 - 20977070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20977109 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 20977070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22675982 - 22676021
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22675982 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaa 22676021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 25651555 - 25651594
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651555 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25651594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Original strand, 32491438 - 32491521
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgt-gattatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  32491438 ttgagcatttgtaatcagtgtagattatagtgaaaatctccttgaaagtgcaagagggactgaactacttctggattgtggaag 32491521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 305
Target Start/End: Original strand, 37986307 - 37986350
Alignment:
Q  262 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37986307 aagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 37986350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 39420195 - 39420234
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39420195 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 39420234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1671966 - 1671908
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  1671966 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 1671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 13576791 - 13576853
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13576791 atagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 13576853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15135372 - 15135342
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135372 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15135342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Original strand, 16325024 - 16325118
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  16325024 tgtttgattagaagtctattgcttttgtgcttgagcataagaagaatcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 16325118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 17701431 - 17701493
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  17701431 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgttgaaggaacc 17701493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 19556050 - 19556137
Alignment:
Q  222 agcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||| ||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19556050 agcaattgtaatatatgagattatagtgaaat-tcattggaagtgcaa-cgggactggactactt-tgtgttgtgggaggaaccagtataa 19556137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 37436212 - 37436270
Alignment:
Q  248 tgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  37436212 tgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 37436270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13890274 - 13890209
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||  |||||||||||||    
T  13890274 tgattttagtgaactctccttggaagtacaagggggacaaaactactttcgaattgtggaaggaac 13890209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15193206 - 15193165
Alignment:
Q  271 ggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15193206 ggggactggactacttccgaattatggaaggaaccaggataa 15193165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Original strand, 39420380 - 39420441
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  39420380 atagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 39420441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3395075 - 3395023
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  3395075 tctccttggaagtgcaagagggacatgactactttcggtttgtggaaggaacc 3395023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10249373 - 10249309
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  10249373 tgattttagtgaactcttcttggaggtgcaagggggacatgactagttccggtttgtggaaggaa 10249309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13890410 - 13890350
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  13890410 ttagaagactcttgcttttgtgcttgagcataggaagactattgtgtttgtgcttgagcat 13890350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24619231 - 24619175
Alignment:
Q  134 gaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24619231 gaagtctcttgcttttgtgcttgagcatttaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 24619175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 56034008 - 56033948
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||    
T  56034008 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaa 56033948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 40838 - 41181
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40838 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40937  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40938 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 41037  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41038 ctcatacttagaaagtattaagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 41137  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41138 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 33293 - 33628
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  33293 aaagtttatagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 33392  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  33393 actctagcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcata 33492  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33493 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 33592  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  33593 gataaatgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 33628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8292 - 8253
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8292 ttgtattgggaacaccactgattgtatattaagtgttcaa 8253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31003 - 30658
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31003 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30904  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30903 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 30804  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 30704  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30703 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 42911 - 43233
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  42911 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcttggtatttttgtttgatcagaag 43010  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----tttttgtgaagtct 203  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||    
T  43011 cctctggcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttttgaagtct 43110  T
Q  204 catactaagaaagtattgagc-agttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    |||||| ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43111 catacttagagagtattaagcgttttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaagga 43210  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  43211 accaagataactgcttgtgtctt 43233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2218
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2462  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2461 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcatagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 2362  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2361 ctcatactttgaaagtattgagcatttgtaatcttggtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgcaagg 2262  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2261 aaccagaataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7832 - 7487
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7832 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7733  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7732 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7633  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7632 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 7533  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7532 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 37343 - 37688
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37442  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat--ttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37443 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37542  T
Q  200 gtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 37642  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37643 ggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 7227 - 7570
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7227 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7326  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327 tagaagtttcttgcctgcgtgcttgatcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7426  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7427 ctcatacttagacagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 7526  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7527 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 7269 - 7611
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7269 aaattcaaagtctagagtctttattgttttgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgat 7368  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7369 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7468  T
Q  202 ctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7469 ctcttacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtcaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagg 7568  T
Q  302 aaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  7569 aaccaggataattgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgctc 7611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14448 - 14111
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14448 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 14349  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14348 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 14249  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14248 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 14149  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14148 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 54514 - 54851
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  54514 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 54613  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54614 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 54713  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54714 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 54813  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54814 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 54851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 81054 - 81015
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81054 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 81015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 80835 - 80775
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  80835 tagtgaactctccttggaagtacaatgaggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 80775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6094
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6056 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaa 6094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Original strand, 24446 - 24506
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaa 303  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||    
T  24446 atagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaa 24506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 37125 - 37460
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  37125 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 37224  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37225 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 37324  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37325 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 37424  T
Q  308 gataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  37425 gataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 37460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 344
Target Start/End: Original strand, 2609 - 2946
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  2609 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaag 2708  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2709 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 2808  T
Q  208 ctaagaaagtattgagca-gttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2809 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 2908  T
Q  307 ggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2909 ggataactgcttgtgtctttgcctttcttttctctgct 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11012 - 11329
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11012 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtg 11111  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattga 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  11112 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatacttaaagagtattga 11211  T
Q  223 gcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212 gcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 11311  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    | | || ||||||||||||    
T  11312 c-tcgtttttcttttctct 11329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8165 - 8489
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8165 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtg 8264  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagt----- 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||         
T  8265 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatacttaaagagtattga 8364  T
Q  218 --attgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8365 gcattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactg 8464  T
Q  316 cttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||| | || ||||||||||||    
T  8465 cttgtgtc-tcgtttttcttttctct 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 8145 - 8174
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8145 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11021
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10992 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 11021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 12509 - 12845
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12509 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgatagaatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 12607  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12608 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtccttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttt-gagaagtctcat 12706  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12707 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 12806  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12807 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 12845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40365 - 40030
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40365 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 40267  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  40266 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcat 40169  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40168 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 40069  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40068 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 40030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35401 - 35064
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||| || |||||||||||||||    
T  35401 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtctaactattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 35302  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  35301 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 35204  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagga 302  Q
    || ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  35203 ct-agagagtattgaacatttgtaatctgtgtgattatttttagtagaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttgtggaagga 35105  T
Q  303 accaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  35104 accaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5159 - 4825
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5159 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 5061  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  5060 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 4963  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4962 act-agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttgtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 4864  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  4863 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 4825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1857 - 1554
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  1857 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 1758  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1757 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcata 1660  T
Q  208 ctaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1659 cta-gtgagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacc 1561  T
Q  306 aggataa 312  Q
    |||||||    
T  1560 aggataa 1554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 57175 - 57511
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  57175 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgttttaatagaag 57273  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  57274 cctctcgcctgcgtgcttgtgcattagaagactcttgcattagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtatcat 57372  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  57373 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaac 57472  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  57473 caggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Original strand, 833 - 1142
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||   |  |||    
T  833 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtg 932  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||| | |||   |||||||||||||| |   ||||||    
T  933 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagtaattt---gaagtctcatactaggtgtagtatt 1029  T
Q  221 gagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||     
T  1030 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataat 1129  T
Q  314 tgcttgtgtcttt 326  Q
    ||| |||||||||    
T  1130 tgcctgtgtcttt 1142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48991 - 48698
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  48991 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 48892  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||    |||||||| |  ||||   |||| |||||    
T  48891 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtggttgagcattt----gaagtctcttgttaagtttagtagtgagc 48796  T
Q  225 agttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  48795 agttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 48698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32026 - 31943
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  32026 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 31943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15591 - 15259
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15591 aagtctagagtctttgttgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgatcagaag 15493  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  15492 cctctcgcctgcgtgcttgaccattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttcagcattt--gagaagtctcat 15395  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15394 actaagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 15295  T
Q  305 caggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctg 342  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15294 cagaataattgcttgtgtctt--tctttcttttctctg 15259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16130
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||||| |||    
T  16469 aagtcgagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattaagaa 16371  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||  | |||||||||    
T  16370 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgcgcttgagcattt--gagaagtctca 16273  T
Q  206 tactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  16272 tactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatctttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactagttccggtttgtggaag 16173  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  16172 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctctgctc 16130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 127510 - 127190
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||||| ||||    
T  127510 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattggaag 127412  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  127411 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 127314  T
Q  207 actaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaa 299  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  127313 actaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 127215  T
Q  300 ggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  127214 ggaaccaggataattgctcgtgtct 127190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 140668 - 140608
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140668 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 140608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Original strand, 8045 - 8154
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8045 aagtctagagtctttcacttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8144  T
Q  106 agtctcttgc 115  Q
    ||||||||||    
T  8145 agtctcttgc 8154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 10680 - 10984
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  10680 aagtctagagaatttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtgtatttttatttgaatagaag 10778  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||  | || ||||||||||    
T  10779 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcacctgcgtgcttgagca--tctgagaagtctcat 10876  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-tagtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10877 actaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattattagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaac 10976  T
Q  305 caggataa 312  Q
    ||||||||    
T  10977 caggataa 10984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29337 - 29003
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29337 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacacacttgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29238  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29237 tctctcgcctgcgtgcctaagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctctcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcat 29140  T
Q  207 actaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29139 acta--gatgtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 29042  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  29041 gaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 29003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25899 - 25817
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  25899 tagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 25817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23453 - 23299
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453 ttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgt 23354  T
Q  291 gttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23353 gttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtgtttgtctttcttttctctgctc 23299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 198 - 344
Target Start/End: Original strand, 8650 - 8796
Alignment:
Q  198 aagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8650 aagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtgg 8749  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8750 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 8796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19084 - 18742
Alignment:
Q  13 ctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtat-atcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  19084 ctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtattatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaagcct 18985  T
Q  111 ctt-gcctgcgtgcttgagc-attagaagtctcttg-cttagt-gcttgagcatt--ggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat---ttttgtgaagt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |    
T  18984 ctttgcctgtgtgcttgagctattagaagactcttgtcttagttgcttgagcatttgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcataatttttgagaaat 18885  T
Q  202 ctcatactaagaaagtatt-gagcagttg--taatctttgt-gattatagtgaaatctccttggaagtgcaag-ggggact-ggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  18884 ctcatacttagagagtattagagcattttgttaatctttgttgattatagtgaaatctccttggaagtgcaaggggggactgggactacttccgatttgt 18785  T
Q  296 ggaaggaaccaggataact-gcttgtgtctttgtctttctttt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  18784 ggaaggaaccaggataactcgcttgtgtctttgcttttctttt 18742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 17346 - 17673
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaa-ctcaattctctgtatttttgtttg--atta 103  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||   || |    
T  17346 aaagtctagagtctctaacgtattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaacttatttcattgtatttttgttttgtatca 17445  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttg-agcattggaagactc-ttgcgtgtgtg-cttgagc--atttttgt-g 197  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  17446 gaagcctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgtagcattggaagactctttgcgtgtgtgacttgagctattttttgtag 17545  T
Q  198 aagtctcatactaagaaagtattg-agcagtt--gtaatc-tttgtgatt--atagtgaaat-ctccttgg-aagtgcaa-gggggactggactacttcc 288  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||| ||   ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17546 aagtctcatgcttagagagtattgtagcattttgttaatcttttgtgatttaatagtgaaatactccttggaaagtgcaaggggggactggactacttcc 17645  T
Q  289 gt-gttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17646 gtatttgtggaaggaaccaggataactg 17673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 220 - 345
Target Start/End: Original strand, 155682 - 155807
Alignment:
Q  220 tgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155682 tgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 155781  T
Q  320 tgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  155782 tgtctttgtctttcttttctctgctc 155807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32674 - 32335
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  32674 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 32575  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  32574 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 32477  T
Q  205 atactaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||  | ||||||||     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  32476 atactaggtgtagtattgagcagttgtaaattgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgccagggggactgaactacttccggtttgtgg 32377  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  32376 aaggaaccaatataattgcttgtgtc--tctctttcttttctct 32335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 345
Target Start/End: Original strand, 1 - 145
Alignment:
Q  201 tctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 100  T
Q  301 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  101 gaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttattttctctgctc 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 169 - 325
Target Start/End: Original strand, 1 - 156
Alignment:
Q  169 tcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgca 268  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 tcttgcctatgtgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaattgca 99  T
Q  269 agggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100 agggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 28098 - 28181
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  28098 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 28181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 40740 - 41064
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  40740 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaaaaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 40839  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||    
T  40840 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctacgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 40937  T
Q  205 atactaag-aaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgg 297  Q
    |||||| |   | ||||||||||||||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  40938 atactaggtgtaatattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtgg 41037  T
Q  298 aaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    
T  41038 aaggaaccagtataattgcttgtgtct 41064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 59286 - 59608
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| ||||    
T  59286 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtaaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaataga 59385  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  59386 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 59483  T
Q  205 atactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgga 298  Q
    ||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  59484 atact-aggtagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttctggtttgtgga 59582  T
Q  299 aggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||    
T  59583 aggaaccagtataattgtttgtgtct 59608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 175074 - 174909
Alignment:
Q  179 gtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat-agtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  175074 gtgcttgagcatttt-gagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgatttttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggac 174976  T
Q  277 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  174975 tggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttctttcctctgctc 174909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 175188 - 175062
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgatt---gtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  175188 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacatcactgattattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaataga 175089  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  175088 agcctcttgcctacgtgcttgagcatt 175062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 475697 - 476001
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  475697 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtg 475796  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  475797 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 475894  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  475895 gagcagttgtaatatgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccagtttgtggaaggaaccagtataattg 475994  T
Q  316 cttgtgt 322  Q
    |||||||    
T  475995 cttgtgt 476001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 482217 - 482521
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  482217 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtg 482316  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  482317 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 482414  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  482415 gagcagttgtaatatgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccagtttgtggaaggaaccagtataattg 482514  T
Q  316 cttgtgt 322  Q
    |||||||    
T  482515 cttgtgt 482521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 100272 - 100148
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  100272 ttgagcatttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgctt 100173  T
Q  319 gtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||  || ||||||||||||||    
T  100172 gtgtcttattc-ttcttttctctgct 100148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 157072 - 157117
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157072 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 157117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 111852 - 111786
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  111852 tgattttagtgaactctccttggaagtacaagggagacaggactactttcggattgtggaaggaacc 111786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 61398 - 61090
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  61398 attgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 61299  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc--ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtat 219  Q
    |||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |   |||||    
T  61298 cttgagcataggaagtctcttgctttttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgcgaagtctcatactaggtgtagtat 61201  T
Q  220 tgagcagttgtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 313  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  61200 tgagcagttataatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataat 61101  T
Q  314 tgcttgtgtct 324  Q
    |||||||||||    
T  61100 tgcttgtgtct 61090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4364 - 4255
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4364 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 4265  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  4264 ttctctgctc 4255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 228 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1856 - 1743
Alignment:
Q  228 tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1856 tgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttg 1757  T
Q  328 tctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||    
T  1756 tctttcttttctct 1743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 324
Target Start/End: Original strand, 1 - 199
Alignment:
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagca 225  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  1 agcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatacttagagagtattgaaca 98  T
Q  226 gttgtaatctttgtgattat-agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
     ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  99 tttgtaatctgtgagattattagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaagaaccaggataattgcttgtgtc 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 2119 - 2424
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  2119 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtg 2218  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  2219 cttgagcat-agaagcctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcatgcatgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 2315  T
Q  221 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 315  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  2316 gagcagttgtaatcagtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataattg 2415  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
     ||||||||    
T  2416 tttgtgtct 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 132
Target Start/End: Original strand, 38 - 66
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 66  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Original strand, 61136 - 61245
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61136 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttctt 61235  T
Q  336 ttctctgctc 345  Q
    ||||||||||    
T  61236 ttctctgctc 61245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 10275 - 10488
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10275 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 10371  T
Q  229 gtaatctttgtgatt-----atagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10372 gtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgt 10471  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  10472 c--tctctttcttttctct 10488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 10183 - 10317
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  10183 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 10282  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  10283 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 1525 - 1738
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  1525 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact-aggtagtattgagcagtt 1621  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1622 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgt 1721  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  1722 c--tctctttcttttctct 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1587
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  1431 aagtctagagtctctcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 1530  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1531 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4783 - 4474
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  4783 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 4684  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |   ||||||    
T  4683 cttgagcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--tgaagtctcatactaggtgtagtatt 4586  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  4585 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataatt 4486  T
Q  315 gcttgtgtcttt 326  Q
    || | |||||||    
T  4485 gcctctgtcttt 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 276
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  489 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtctcatactaggta-gtattgagcagtt 393  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  392 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 293  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    || ||  ||||||||||||    
T  292 ctctg--tttcttttctct 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 447
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  582 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 483  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  482 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Original strand, 5331 - 5531
Alignment:
Q  146 ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5331 ttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaattt--gggaagtctcatacta-gagagtattgagcagttgtaatctgtgtgattat 5427  T
Q  246 -----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttct 339  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  5428 ttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tctctttcttttct 5525  T
Q  340 ctgctc 345  Q
    ||||||    
T  5526 ctgctc 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29495
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29282 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcatgcatgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 29378  T
Q  229 gtaatctttgtgatt-----atagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29379 gtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctcattggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 29478  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  29479 c--tctctttcttttctct 29495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 29190 - 29324
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29190 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29289  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  29290 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 345
Target Start/End: Original strand, 411983 - 412047
Alignment:
Q  281 ctacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  411983 ctacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 412047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1879
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1574 attgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1673  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |   ||||||    
T  1674 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcgtactaggtgtagtatt 1770  T
Q  221 gagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |    
T  1771 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataatt 1870  T
Q  315 gcttgtgtc 323  Q
    || ||||||    
T  1871 gcatgtgtc 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 60813 - 60598
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  60813 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt--gtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 60716  T
Q  228 tgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 321  Q
    |||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  60715 tgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtg 60616  T
Q  322 tctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||  | ||||||||||||||    
T  60615 tc--tctctttcttttctct 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 60907 - 60751
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  60907 aagtctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 60808  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  60807 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 60751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 211796 - 211736
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||    
T  211796 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggaatgacttccggtttgtggaaggaac 211736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 58107 - 57894
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  58107 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctacatgcttgagcattt--gggaagtctcatacta-gatagtattgagcagtt 58011  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
     |||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  58010 ataatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttatggaaggaaccaggataattgcttgtgt 57911  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  57910 c--tctctttcttttctct 57894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 58162 - 58065
Alignment:
Q  45 cactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  58162 cactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 58065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1686
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  |||    
T  1381 attgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtg 1480  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| ||||| |   ||||||    
T  1481 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtctcgtactaggtgtagtatt 1577  T
Q  221 gagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |    
T  1578 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataatt 1677  T
Q  315 gcttgtgtc 323  Q
    || ||||||    
T  1678 gcatgtgtc 1686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1418
Alignment:
Q  237 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1524 tgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttt 1426  T
Q  337 tctctgct 344  Q
    ||||||||    
T  1425 tctctgct 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 7611 - 7650
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7611 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 20824 - 21127
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20824 attgtattgtgaacaccactgattgtatattatttgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20923  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   ||||||||| |    
T  20924 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagta 21020  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 319  Q
    |||||||||  |||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  21021 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaacactccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgtatg 21120  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  21121 tgtcttt 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 52370 - 52457
Alignment:
Q  254 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52370 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 763
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | | | |||||||||| | | |||||||||||||    
T  976 attagaagtctcttgctttagtccttgaacataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggcattctcatactaggta-gtattgagcagtt 880  T
Q  229 gtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    ||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  879 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 780  T
Q  323 ctttgtctttcttttctct 341  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  779 c--tctctttcttttctct 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1069 - 961
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  1069 aagtctagagtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 970  T
Q  107 gtctcttgc 115  Q
    |||||||||    
T  969 gtctcttgc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1684 - 1576
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  1684 aagtctagagtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 1585  T
Q  107 gtctcttgc 115  Q
    |||||||||    
T  1584 gtctcttgc 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1478
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  | | | |||||||||| | | |||||||||||||    
T  1591 attagaagtctcttgctttagttcttgatcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggcattctcatactaggta-gtattgagcagtt 1495  T
Q  229 gtaatctttgtgattat 245  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1494 gtaatctgtgtgattat 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 342
Target Start/End: Original strand, 38487 - 38695
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  38487 aagtctcttgctttagtgcttgagcattg-aagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gggaagtcttatacta-gatagtattgagcagttgtaat 38582  T
Q  234 ctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttg 327  Q
    || |||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  38583 ctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggaactggactacttacggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc--tc 38680  T
Q  328 tctttcttttctctg 342  Q
    |||||||||||||||    
T  38681 tctttcttttctctg 38695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 38390 - 38523
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || | || |||||||||  |||    
T  38390 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctatgcaattctgtttgatttaaag 38489  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  38490 tctcttgctttagtgcttgagcatt-gaagtctct 38523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 288
Target Start/End: Original strand, 955 - 1117
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  955 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-agatagtattgagcagtt 1051  T
Q  229 gtaatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    ||||||| ||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Original strand, 877 - 997
Alignment:
Q  22 ttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 121  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  877 ttattgcattgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagt 976  T
Q  122 gcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  977 gcttgagcattggaagtctct 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Original strand, 4437 - 4535
Alignment:
Q  227 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4437 ttgtaatctttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactatttccgatttgtggaaggaaccatgataactgtttgtgtctt 4535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 204
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  415 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-aggtagtattgagcagttgt 319  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||| | ||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  318 aatatgtgtgattatttcttagtcaaaatctccttggaagtgcaaggggtactgaactacttctggtttgtggaaggaaccaagataattgcttgtgtc- 220  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  219 -tctctttcttttctct 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4584
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4795 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact-aggtagtattgagcagttgt 4699  T
Q  231 aatctttgtgatta-----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||| | ||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  4698 aatatgtgtgattatttcttagtcaaaatctccttggaagtgcaaggggtactgaactacttctggtttgtggaaggaaccaagataattgcttgtgtc- 4600  T
Q  325 ttgtctttcttttctct 341  Q
     | ||||||||||||||    
T  4599 -tctctttcttttctct 4584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 510 - 355
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  510 aagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaa 411  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  || |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  410 gtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4890 - 4735
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  4890 aagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaa 4791  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  || |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4790 gtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11315 - 11091
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  11315 gaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 11219  T
Q  203 tcatactaagaaag-tattgagcagttgtaatctttgtgattatagtga-----aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 296  Q
    |||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  11218 tcatactaggtgtggtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaactgagtgaaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttccgatttgtg 11119  T
Q  297 gaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11118 gaaggaaccagtataattgcttgtgtct 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11259
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||    
T  11421 attgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctattgctttagtgcttga 11322  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| |  |||||||||||    
T  11321 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagca 11259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20147 - 19923
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  20147 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagaaaagggagtctcttgctttagtgcttgagaaaaggaagtctcttgcttgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 20051  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  20050 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggaactggactacttccagtttgt 19951  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  19950 ggaaggaaccagtataattgcatgtgtc 19923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10382 - 10250
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  10382 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 10283  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagca 159  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10282 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20283 - 20123
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||  |||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20283 attgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattcagtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20184  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  20183 gcataggaagtctcttgcttgattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgag 20123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10308 - 10250
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  10308 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20209 - 20151
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  20209 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgattgcttgagca 20151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35201 - 34977
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  35201 gaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 35105  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtg 296  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||    
T  35104 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggaaactggactactttcggtttgtg 35005  T
Q  297 gaaggaaccaggataactgcttgtgtct 324  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  35004 gaaggaaccagtataattgcctgtgtct 34977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35145
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  35307 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 35208  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  35207 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagca 35145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35233 - 35174
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  35233 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 35174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5747
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tct 255  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||    
T  5927 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactct 5831  T
Q  256 ccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  5830 ccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctt--tctttcttttctct 5747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6003 - 5901
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  6003 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttga 5904  T
Q  128 gca 130  Q
    |||    
T  5903 gca 5901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 17
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  134 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttg 35  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||||||||    
T  34 aacattagaagtctcttg 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Original strand, 7010 - 7234
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  7010 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 7106  T
Q  203 tcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgt 295  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7107 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttgaaagtgtaagggggactggactacttccgatttgt 7206  T
Q  296 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 323  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||    
T  7207 ggaaggaaccggtataattgtttgtgtc 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 6899 - 7066
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  6899 attgcattgtaatgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 6998  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  6999 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7037
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  6978 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 7037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 2725 - 2800
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaact 77  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725 aaattcaaagtcgagagtctttattgttttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaact 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 8)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 326
Target Start/End: Original strand, 165135 - 165386
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctc-ttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  165135 ttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtg 165234  T
Q  180 tgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaaggg 272  Q
    |||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  165235 tgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcatttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggg 165331  T
Q  273 ggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
     ||| ||| | |||||||  |||||||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  165332 agacaggagtgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgcctgtgtcttt 165386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 65859 - 66136
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  65859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 65958  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    ||||||||| | |||||   |||| |||||    
T  65959 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt----tgaagtctcttgctaagtttagtagtgagc 66054  T
Q  225 agttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    | ||||||||   |  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  66055 atttgtaatc--agatattacatagtgaactctccttggaagtggaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 66136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 144904 - 145021
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  144904 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 145003  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  145004 agcaatagaagtctcttg 145021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 59208 - 59060
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||  ||||    
T  59208 gaacaccactgattgtatgtcaaatgttcaacctcaaacatt-ttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtggttgagcataggaag 59110  T
Q  138 tctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    | |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  59109 tatcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttga 59060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 251114 - 251037
Alignment:
Q  241 attatagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct 317  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||    
T  251114 attatagtgaaaatctccttgaaagtgcaagggagatttgactacttccagattgtggaaggaaccagaataattgct 251037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 59010 - 58944
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  59010 tgattttagtgaactctccttggaaatgcaagagggacatgactacttccgaattgtggaagaaacc 58944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 251265 - 251224
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  251265 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtt 251224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 145119 - 145203
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  145119 atagtgaactatacttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 145203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 4349 - 4554
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  4349 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 4448  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  4449 gcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 4545  T
Q  226 gttgtaatc 234  Q
    |||||||||    
T  4546 gttgtaatc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 10201 - 10267
Alignment:
Q  279 gactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201 gactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17865
Alignment:
Q  277 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17929 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctct 17865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Original strand, 38535 - 38839
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  38535 attgtatagtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 38634  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagca 225  Q
    ||||   |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||   |||||| |||||||| |   |||||||||||    
T  38635 gcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcctgagaaatt---tgaagtgtcatactaggtgtagtattgagca 38731  T
Q  226 gttgtaatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggac-tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |    
T  38732 gttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggatgtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcct 38831  T
Q  319 gtgtcttt 326  Q
    ||||||||    
T  38832 gtgtcttt 38839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Original strand, 1883 - 1998
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatctttgtgattat-----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||     
T  1883 agtattgagcagttgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaacagt 1982  T
Q  309 ataactgcttgtgtct 324  Q
    |||| |||||||||||    
T  1983 ataattgcttgtgtct 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9631 - 9325
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc--gtgctt 125  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| |    ||||||    
T  9631 attgtactgtgaacaccactgatggtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaatactgtttgaatagaagtctcttgctttttagtgctt 9532  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgag 223  Q
    ||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |   |||||||||    
T  9531 gagcataggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgtgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgag 9435  T
Q  224 cagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc 316  Q
    |||||||||||  |||||||||    |||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||    
T  9434 cagttgtaatcagttgtgattaagcttagttatactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgc 9335  T
Q  317 ttgtgtcttt 326  Q
     |||||||||    
T  9334 ctgtgtcttt 9325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21430 - 21348
Alignment:
Q  261 gaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  21430 gaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc-ttgcttttcttttctctgct 21348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7480 - 7443
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 3844 - 4014
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||| |  ||||    
T  3844 ttgttttgtattgtgaacaccgctgattgtatattaagtgttcaatctcaaacattattctgtgtaattgtgtttgtttataagtctcttgcttttgtgc 3943  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3944 ttgagcatatgaaatctcttgcttatgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 318
Target Start/End: Original strand, 4027 - 4106
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||||| | |||| |||||    
T  4027 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttctggattgtgtaaggaacctgtataattgctt 4106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2092 - 2040
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  2092 tctccttggaagtgcaaatgggacaggactacttccagtttgtggaaggaacc 2040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 1 - 231
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||| |||   ||||    
T  1 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaattt---gaag 97  T
Q  201 tctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgt 292  Q
    | ||| |||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  98 tgtcaaactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtt 197  T
Q  293 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||    
T  198 tgtggaaggaacctgtataattgcatgtctcttt 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 59683 - 59817
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | |||  || ||||||||||||||    
T  59683 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttttgtgtcattctgtttgattagaag 59782  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||   |  ||||||||||||| |||||||||    
T  59783 tctctttttttagtgcttgagcattggaagtctct 59817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 64027 - 63881
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  64027 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacataa-tctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 63929  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  63928 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 63881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46353 - 46207
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  46353 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaagataa-tctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 46255  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  46254 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 46207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 192
Target Start/End: Original strand, 59775 - 59838
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  59775 attagaagtctctttttttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt 59838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46105 - 46044
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||||    
T  46105 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtagaaggaacc 46044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4628
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgctttggtgcttgag 4562  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4563 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattt 4628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Original strand, 6815 - 6880
Alignment:
Q  253 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||||    
T  6815 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtgaaaggaacctgtataattgctt 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 2731 - 2790
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  2731 tagtgaactctccttggaagtgaaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaac 2790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2048
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  1962 ttgtattgtgaacaccgctgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaaaattttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Original strand, 8279 - 8320
Alignment:
Q  150 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8279 tgcttgagcattggaagcctcttgcttgtgtgcttgagcatt 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Original strand, 8260 - 8331
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactctt 172  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8260 tagaagtctctttcttgtatgcttgagcattggaagcctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctt 8331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 322
Target Start/End: Original strand, 2338 - 2534
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaag-aaagtattgagcagttg 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  2338 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 2434  T
Q  230 taatc-tttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 322  Q
    |||||  |||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  2435 taatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaagggagacaggactgactttcggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgt 2534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2381
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2259 attgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtg 2358  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  2359 cttgagcataggaagtctcttgc 2381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17913 - 17858
Alignment:
Q  290 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913 tgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13701 - 13542
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||    
T  13701 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttatatttttgttttaatagaagtctcttgcttgtgtacttgag 13602  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  13601 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 13542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 20 - 102
Alignment:
Q  245 tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  20 tagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtcttt 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16484 - 16338
Alignment:
Q  170 cttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttgga 262  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  16484 cttgcttgtgtgcttgagcaattt---gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttgga 16388  T
Q  263 agtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  16387 agtgcaagggggattggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataa 16338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6942 - 6825
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  6942 attgtattgtgaacaccactgattgtatattatgtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 6843  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  6842 gcataggaagtctcttgc 6825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7274 - 7198
Alignment:
Q  267 caagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7274 caagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttattc-ttcttttctctgct 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13934
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgatta---- 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||        
T  14068 gtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgataagtctcatact-agagagtattgagcatctgtaatctgtgtgattattga 13972  T
Q  245 ---tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactg 278  Q
       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971 ttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactg 13934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14084 - 14026
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14084 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 14026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10284
Alignment:
Q  272 gggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 345  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||    
T  10355 gggactgggctacttccggattgtggaaggaaccagtataactgtttctgtc--tatctttcttttctctgctc 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Original strand, 16170 - 16469
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    |||| |||| || ||||||| |  ||||||||||||||   |||||||    
T  16170 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgccgttgtgcttg 16269  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgag 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    ||| |||| |||||||   |||| ||||    
T  16270 agcaatagaagtctcttgatt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt----gaaatctcttactaagtttagtagtgag 16364  T
Q  224 cagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttg 319  Q
    || ||||||||   |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||    
T  16365 catttgtaatca--gatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 25830 - 25947
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  25830 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 25929  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25930 agcaatagaagtctcttg 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1201
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  1317 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagtcgtgcttga 1218  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  1217 gcatttgaagtctcttg 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21429 - 21544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    | |||||||    
T  21429 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgggcttgag 21528  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  21529 cattagaagtctcttg 21544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtg-ttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  2427 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttcacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttg 2526  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2527 agcaatagaagtctcttg 2544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2675
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2643 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 2675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 144564 - 144405
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  144564 ttgtattgtggacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 144465  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  144464 cataagaagtctcttgatttagttcttcagcataggaaatctcttgcatttgtgcttgag 144405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 144345 - 144285
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  144345 tagtgaactctccttagaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacc 144285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7749 - 7589
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||    
T  7749 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-tcaaacttatttctgtgt-gatttgtttgtttagaagtctcttgcttttatgcttgagc 7652  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 191  Q
    ||  ||| | ||||||||  || |||||| ||| ||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  7651 ataggaaatttcttgcttgtgtacttgagtatttgaagtatcttgcttgtgcgcttgagcatt 7589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 107 - 272
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacttcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 206  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  207 gcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 321 - 396
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  321 atagtgaactatccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 10)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 244734 - 244870
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  244734 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt-ttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaactctcttgcttgtgtgcttgag 244832  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  244833 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 244870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 87855 - 87788
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  87855 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggagtgaactacttccggattgtggaaggaacca 87788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 211057 - 210891
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  211057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 210958  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  210957 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 210891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 219897 - 219782
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||     
T  219897 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcacacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgaa 219798  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  219797 cataagaagtctcttg 219782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 377999 - 378165
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  377999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 378098  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  ||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  378099 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagactcttgcagttgtgcttgagcattt 378165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 219679 - 219597
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||    
T  219679 tagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccgatttgtggaagaaacctgtataattgctttgtgtcttt 219597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 244952 - 245034
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  244952 tagtgaaccctccttgaaagtgcaagggggacacgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 245034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 88063 - 88027
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  88063 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 88027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 378214 - 378277
Alignment:
Q  241 attatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||    
T  378214 attttagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcatgactacttccagtttgtggaaggaac 378277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 382245 - 382181
Alignment:
Q  238 gtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  382245 gtgattatagtgaaatctc-ttagaactgcaagggg-agtggactactcctgtgttgtggaaggaac 382181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 158764 - 158653
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||     
T  158764 attgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctctttcttgtgtgcttgagcata 158665  T
Q  133 agaagtctcttg 144  Q
     |||||||||||    
T  158664 ggaagtctcttg 158653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36809
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  36869 tagtgaactctccttgtaagtgcaaaggggataggactacttctggtttgtggaaggaacc 36809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 134929 - 134869
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  134929 tagtgaactctccttgtaagtgcaaaggggataggactacttctggtttgtggaaggaacc 134869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Original strand, 2443 - 2525
Alignment:
Q  236 ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||    
T  2443 ttgtaattttagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacaggactacttccgaattgtggaaggaacctgtataattgctt 2525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2246 - 2285
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2246 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9345 - 9263
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  9345 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 9263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9501
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  9615 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 9516  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    ||| |||||||||||    
T  9515 cataagaagtctctt 9501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 393 - 510
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttg 492  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  493 agcattacaagtctcttg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 611 - 671
Alignment:
Q  246 agtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  611 agtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 318 - 279
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  318 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14775 - 14475
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||| ||||||    ||||||||    
T  14775 ttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtttcttgcagttgtgcttga 14676  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa-agtattgagca 225  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||  |||||||   |||||||||| | |||   |||||||| | |||||   || | ||||||    
T  14675 gcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt---gaagtctcttgctaagtttagcagtgagca 14579  T
Q  226 gttgtaatct--ttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgt 322  Q
    |||||||||   ||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  14578 gttgtaatcagatttacattttagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgt 14479  T
Q  323 cttt 326  Q
    ||||    
T  14478 cttt 14475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 76691 - 76625
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  76691 tgattttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 76625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 161 - 95
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  161 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaagtgggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 329
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 282
Target Start/End: Original strand, 90725 - 90763
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  90725 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact 90763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 90513 - 90549
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  90513 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 90549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13230 - 13114
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  13230 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 13131  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    | |||||||||||||||    
T  13130 aacattagaagtctctt 13114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Original strand, 9652 - 9745
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt-gtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||    
T  9652 tgattttagtgaactctccttggaagtacaagggggacaggactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgcttcgtgtctttctctt 9745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Original strand, 9486 - 9639
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtc 139  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||| ||||||||   || ||    
T  9486 aacacaactgatagtatatcaagtgttcaaaccaaacatttttctgtgtaattttgtttgtttagaagtcttttgcttttgtgattgagcatagaaaatc 9585  T
Q  140 tcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||| |||  ||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||||||||||    
T  9586 tctttcttctgtgcttgagtatttgcagtctcttacttgtgtgcttgagcattt 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 32239 - 32517
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||  |||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  32239 ttgtattatgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttcattgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 32338  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacta-agaaagtattgagcag 226  Q
    |||  |||||||||||  ||||| |||||| || ||||  |||||||   |||||||||| | ||   ||||||||| | |||     || | |||||||    
T  32339 catatgaagtctcttgatttagttcttgagtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtt---tgaagtctctttctagttttagcagtgagcag 32435  T
Q  227 ttgtaatc---tttgtgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||   | |   ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  32436 ttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 32517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3931 - 3767
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattc-tctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||     ||| | |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3931 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaatccaaatatttttcctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 3832  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||  ||| ||| ||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3831 cataggaaatcttttgcttgtgtgcttgagtattttaagtctcttgcttgtgtgattgagcattt 3767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3754 - 3689
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||    
T  3754 tgattttagtgaactctccttggaagtacaagggggagaagactacttccggattgtggaaggaac 3689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 16800 - 16860
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  16800 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacgtgactacttccggtttgtggaaggaacc 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 20141 - 20201
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20141 tagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 20201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 99660 - 99823
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||| |||| |  |||||||    
T  99660 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctattgcatttgtgcttg 99759  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||||    
T  99760 agcaatagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagca 99823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19921 - 19960
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29452 - 29413
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59556
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  59675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 59576  T
Q  127 agcattagaagtctcttgct 146  Q
    || |||||||||||||||||    
T  59575 agaattagaagtctcttgct 59556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 59519 - 59459
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  59519 tagtgaactctccttggaagtgcaaggggtacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 59459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7583 - 7544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7583 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7283
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct-tgtgtcttt 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7364 tagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggataggactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgctatgtgtcttt 7283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1498 - 1384
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |  ||| |||||    
T  1498 ttgtattgtgaacaccactgattgtagatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgattagaattttcttgcttatgtggttgag 1399  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || |||| ||||||||    
T  1398 ca-tagaggtctcttg 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 2056 - 2111
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  2056 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaag 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 37412 - 37499
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  37412 gattttagtaaactctccttggaagagcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtcttt 37499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41593 - 41545
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 288  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41593 gattttagtaaactctccttggaagagcaagggggacaggactacttcc 41545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6261
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  6144 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 6243  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  6244 agcattaaaagtctcttg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6434
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||| | |||| |||||    
T  6359 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccattttgtggaaggaacctgtataattgctt 6434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5202
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  5288 ttgtattgtgcacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgc 5202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22457 - 22396
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacca 306  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  22457 tagtgaactctccttgaaagtgcaagggggagtggactactctcggattgtggaaggaacca 22396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22598 - 22546
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgct 183  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22598 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcgtttgtgct 22546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 88054 - 88171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  88054 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 88153  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  88154 agcaatagaagtctcttg 88171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 263
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  380 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 281  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  280 agcaatagaagtctcttg 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 268228 - 268162
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  268228 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggaataggactacttccggtttgtggaaggaacc 268162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 268439 - 268353
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  268439 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 268353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 84050 - 84011
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84050 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 84011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 83834 - 83759
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||| ||| | |||| |||||    
T  83834 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggtacctgtataattgctt 83759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1309 - 1191
Alignment:
Q  215 agtattgagcagttgtaatct-ttgtgatta----tagtgaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccag 307  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  1309 agtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaaggaacctg 1210  T
Q  308 gataactgcttgtgtcttt 326  Q
     |||| ||  |||||||||    
T  1209 tataattgtctgtgtcttt 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Original strand, 4829 - 4866
Alignment:
Q  117 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgctt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4829 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgctt 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3298
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  3183 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 3281  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||| ||||||||||    
T  3282 agcatttgaagtctctt 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3421
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  3337 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 3421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 74022 - 73961
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  74022 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 73961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 74240 - 74126
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  74240 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 74141  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    |||  ||||||||||    
T  74140 cataggaagtctctt 74126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 3925 - 4016
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgct-tgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3925 gattacagtgaaatctcattggaagtgcaa-agggactgaactacttccggattgtgcaaggaaccaagataattgctctgtgtctttatctt 4016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 729 - 841
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || | ||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||    
T  729 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctatttgaatagaagtatcttgcagttgtgcttgagcat 828  T
Q  132 tagaagtctcttg 144  Q
      |||||||||||    
T  829 aggaagtctcttg 841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1109 - 1148
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 1327 - 1383
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagg 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  1327 tagtgaactctacttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaagg 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2638 - 2599
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2638 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2423 - 2361
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2423 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagtactaacttccggtttgtggaaggaacc 2361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1331 - 1370
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1331 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 1538 - 1604
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||   |||| |||||||||    
T  1538 tgattatagtgaactctccttggaagtgcatgggtgacaagactacttccagattgttgaaggaacc 1604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1023 - 908
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  1023 attgtattgtgaacaccacatattgtatatcaagttttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 924  T
Q  128 gcattagaagtctctt 143  Q
    ||||  ||||||||||    
T  923 gcataggaagtctctt 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5664 - 5625
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5664 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2440 - 2479
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2440 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 2688 - 2747
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2688 tagtgaactctccttggaagtgcaa-gggcacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 2747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5840 - 5801
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5811
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18687 - 18648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18687 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22584 - 22623
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18473 - 18411
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18473 atagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 18411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 10561 - 10676
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||||||||||||||||     |||||||||    
T  10561 ttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttgattagaagtctcttgtagttgtgcttgag 10660  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10661 catcagaagtctcttg 10676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15340
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||||||||||||||||     |||||||||    
T  15225 ttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttgattagaagtctcttgtagttgtgcttgag 15324  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15325 catcagaagtctcttg 15340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 10779 - 10861
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  10779 tagtgaacttttcttggaagtgcaagggggacaggactacttttggtttgtggaaggaacctgtataattgcattgtgtcttt 10861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 15443 - 15525
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  15443 tagtgaacttttcttggaagtgcaagggggacaggactacttttggtttgtggaaggaacctgtataattgcattgtgtcttt 15525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5817
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5778 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 5939 - 6000
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  5939 tagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19523 - 19473
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 289  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19523 tgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcaggactacttccg 19473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24010
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24072 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 24010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9343
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9404 tagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 7412 - 7473
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7412 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 7473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8813 - 8697
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atta-gaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||    |||||||    
T  8813 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaagctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattatgaagtctcttgcagttgtgcttg 8715  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8714 agcaatagaagtctcttg 8697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2671 - 2610
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc-gtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  2671 tagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacaagactacttccggttttgtggaaggaacc 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 761 - 701
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  761 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggataggactactttcggtttgtggaaagaacc 701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 650 - 710
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  650 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggataggactactttcggtttgtggaaagaacc 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11855 - 11554
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |  |||||||||||||    |||||||    
T  11855 ttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11756  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactaagaa--agtattgag 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||||    |||||||||||| |||   |||||||| ||||||     |||| ||||    
T  11755 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaatttttagtagtgag 11659  T
Q  224 cagttgtaatctttgtgatta--tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttg 319  Q
    || ||||||||   |  ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||    
T  11658 catttgtaatca--gatattacttagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 11561  T
Q  320 tgtcttt 326  Q
    |||||||    
T  11560 tgtcttt 11554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1313
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1277 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17495 - 17387
Alignment:
Q  219 ttgagcagttgtaatctt-tgtgattatagtgaaatctc-cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactg 315  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||  | ||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||| || ||    
T  17495 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattatagtgaaaaatctcttgtaagtgacaaggggactagactgcttccggattgtggaaagaaccaggataaattg 17396  T
Q  316 cttgtgtct 324  Q
    |||||||||    
T  17395 cttgtgtct 17387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 18202 - 18258
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18202 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa 18258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 18435 - 18467
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18435 atagtgaactctccttggaagtgcaagggggac 18467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18646 - 18558
Alignment:
Q  239 tgattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtcttt 326  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  18646 tgattttagtgaactctctttgaaagtgcaaggaggagtggaccacttccggattgtggaaggaaccactataattgctttgtgtcttt 18558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 17000 - 17092
Alignment:
Q  240 gattatagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgc-ttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |   ||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  17000 gattataatgaaatctccttggaagtgcaaaggagattggactactttcagattgtggaagaaatcagtataattgctttgtgtctttctctt 17092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 44342 - 44382
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44342 attgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaa 44382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 35415 - 35499
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaaccaggat-aactgcttgtgtcttt 326  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  35415 atagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtcttt 35499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 35258 - 35297
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 9
Alignment:
Q  15 agagtctttattgtatt-gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  64 agagtctgtattttattcgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2963 - 2928
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgt 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 2928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31395 - 31356
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31395 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 31356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  1845 attataagactcttgcttgtgtgcttgagcataaaaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtcgcttgcttgtgttcttaagca 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5048 - 4968
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  5048 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaaaccaaact-tattctttcta-atttgtttgtttagaagtctcttg 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Original strand, 19292 - 19354
Alignment:
Q  244 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19292 atagtgaactctccttggaagtgcaaggatgacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Original strand, 19078 - 19115
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19078 gtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaa 19115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Original strand, 2433 - 2519
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctt 331  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||  || |||||||||  |||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| ||||    
T  2433 tagtgaactctcattggaagtgcaaggaggataggtctacttccggattgtggaaggaacctgtataatttcttgtgtatttctctt 2519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2739 - 2702
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2739 gtattgtgaacagcactgattgtatatcaagtgttcaa 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6867 - 6774
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  6867 attataagtatcttgcttgtgtgcttgaacattggcagtatcttgcttgtgtccttgagcattggaagtctcttgtttgtgtgcttgaacattt 6774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 111196 - 111269
Alignment:
Q  120 gtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||| |||||||   |||| ||||||||||    
T  111196 gtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagcattt 111269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 111322 - 111382
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  111322 tagtgaaatctccttggaagtgcaagagggacaagatgactaccggtttgtggaaggaacc 111382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5655 - 5595
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  5655 tagtgaactctcgttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaac 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 103010 - 102950
Alignment:
Q  245 tagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgtgttgtggaaggaac 304  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  103010 tagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 102950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6353 times since January 2019
Visitors: 5767