View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0819_low_36 (Length: 252)

Name: NF0819_low_36
Description: NF0819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0819_low_36
NF0819_low_36
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (1-231)||(16797926-16798156)
chr3 (1-231)||(16808753-16808983)
chr3 (1-229)||(17241978-17242206)
chr3 (1-231)||(38814388-38814618)
chr3 (1-231)||(3833678-3833908)
chr3 (9-231)||(15482666-15482889)
chr3 (1-222)||(20461372-20461594)
chr3 (1-229)||(31097426-31097656)
chr3 (2-229)||(15849958-15850183)
chr3 (9-222)||(327044-327259)
chr3 (1-222)||(7793221-7793444)
chr3 (67-229)||(4589131-4589294)
chr3 (40-231)||(16696789-16696980)
chr3 (67-229)||(19775353-19775516)
chr3 (106-231)||(15464869-15464993)
chr3 (116-231)||(8489459-8489573)
chr3 (1-231)||(15941776-15942006)
chr3 (2-213)||(11854757-11854969)
chr3 (24-222)||(2897718-2897917)
chr3 (106-231)||(5223068-5223192)
chr3 (23-213)||(15617398-15617589)
chr3 (23-161)||(7109776-7109913)
chr3 (23-161)||(7113711-7113848)
chr3 (23-161)||(22321742-22321879)
chr3 (23-161)||(22336797-22336934)
chr3 (23-161)||(27409538-27409675)
chr3 (23-161)||(28949802-28949939)
chr3 (106-231)||(12339470-12339594)
chr3 (2-213)||(11070092-11070304)
chr3 (104-230)||(11854422-11854547)
chr3 (2-213)||(30065970-30066182)
chr3 (23-231)||(1598374-1598581)
chr3 (106-229)||(16750570-16750689)
chr3 (2-158)||(11300384-11300539)
chr3 (106-213)||(4111231-4111334)
chr3 (106-213)||(15964993-15965096)
chr3 (106-213)||(15968917-15969020)
chr3 (106-213)||(15972841-15972944)
chr3 (106-213)||(19775789-19775892)
chr3 (2-161)||(55022945-55023103)
chr3 (2-213)||(11165402-11165614)
chr3 (106-231)||(11300743-11300868)
chr3 (110-213)||(4107383-4107482)
chr3 (106-213)||(37439618-37439721)
chr3 (63-161)||(14499403-14499500)
chr3 (1-97)||(16865005-16865101)
chr3 (9-134)||(322703-322828)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-231)||(19211870-19212101)
chr1 (9-213)||(23819179-23819383)
chr1 (23-229)||(12646876-12647082)
chr1 (3-231)||(46975471-46975699)
chr1 (1-231)||(20138086-20138317)
chr1 (1-231)||(18882371-18882601)
chr1 (1-231)||(36819180-36819412)
chr1 (1-229)||(16080316-16080545)
chr1 (67-229)||(20229167-20229330)
chr1 (31-227)||(24783002-24783199)
chr1 (23-213)||(20228703-20228894)
chr1 (116-231)||(33797286-33797400)
chr1 (23-161)||(16375352-16375489)
chr1 (23-161)||(21407430-21407567)
chr1 (23-161)||(52639616-52639753)
chr1 (2-213)||(1010744-1010956)
chr1 (106-229)||(39244123-39244242)
chr1 (106-229)||(39247678-39247797)
chr1 (106-213)||(1925111-1925214)
chr1 (106-213)||(20924125-20924228)
chr1 (106-229)||(41388223-41388342)
chr1 (9-87)||(33797681-33797759)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (1-231)||(18774206-18774438)
chr5 (1-231)||(18784049-18784281)
chr5 (23-231)||(42805423-42805632)
chr5 (23-231)||(26742640-26742849)
chr5 (1-231)||(26666003-26666233)
chr5 (1-231)||(26937600-26937830)
chr5 (23-231)||(24532942-24533150)
chr5 (4-231)||(20232554-20232781)
chr5 (1-231)||(33409232-33409462)
chr5 (1-231)||(25229278-25229508)
chr5 (1-231)||(25293434-25293664)
chr5 (3-231)||(16674156-16674384)
chr5 (23-231)||(21885083-21885291)
chr5 (1-231)||(4036223-4036454)
chr5 (1-229)||(17718311-17718538)
chr5 (1-231)||(21340639-21340869)
chr5 (23-231)||(26172468-26172676)
chr5 (9-231)||(23535469-23535690)
chr5 (67-229)||(10752949-10753112)
chr5 (106-231)||(18355961-18356085)
chr5 (106-231)||(20911148-20911272)
chr5 (23-161)||(20295922-20296059)
chr5 (74-222)||(17410452-17410601)
chr5 (23-161)||(19472614-19472751)
chr5 (106-213)||(10753385-10753488)
chr5 (63-213)||(15236714-15236865)
chr5 (13-87)||(18356475-18356549)
chr5 (9-134)||(21366545-21366670)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (9-231)||(16231355-16231578)
chr8 (1-231)||(30308626-30308855)
chr8 (1-231)||(23834175-23834407)
chr8 (3-231)||(22044887-22045116)
chr8 (1-231)||(23846887-23847117)
chr8 (1-145)||(22028647-22028791)
chr8 (9-149)||(18619564-18619704)
chr8 (23-231)||(32605214-32605422)
chr8 (1-231)||(15538452-15538682)
chr8 (49-231)||(32598682-32598864)
chr8 (1-231)||(15531893-15532122)
chr8 (23-231)||(17828477-17828684)
chr8 (121-231)||(21383657-21383766)
chr8 (123-231)||(21387077-21387184)
chr8 (23-161)||(19278177-19278314)
chr8 (23-161)||(21972479-21972616)
chr8 (23-161)||(21976564-21976701)
chr8 (23-161)||(22111926-22112063)
chr8 (106-231)||(14398086-14398210)
chr8 (23-213)||(43251834-43252025)
chr8 (23-231)||(17055283-17055481)
chr8 (106-213)||(18862627-18862730)
chr8 (106-213)||(21827996-21828099)
chr8 (110-213)||(21410971-21411070)
chr8 (110-213)||(21805463-21805562)
chr8 (57-231)||(24445435-24445608)
chr8 (49-145)||(20465958-20466054)
chr8 (23-99)||(22113622-22113697)
chr8 (23-99)||(22135125-22135200)
chr8 (23-99)||(22166275-22166350)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (1-231)||(8917430-8917660)
chr7 (1-231)||(18930-19161)
chr7 (1-231)||(9593348-9593579)
chr7 (1-231)||(13461764-13461995)
chr7 (9-221)||(11987225-11987438)
chr7 (1-231)||(13149158-13149388)
chr7 (9-231)||(16724511-16724732)
chr7 (9-231)||(17701525-17701746)
chr7 (82-226)||(16457310-16457455)
chr7 (1-159)||(9644384-9644542)
chr7 (1-231)||(15728328-15728558)
chr7 (1-231)||(12318130-12318361)
chr7 (9-231)||(13635349-13635572)
chr7 (9-231)||(16583259-16583481)
chr7 (1-231)||(14216918-14217148)
chr7 (23-229)||(6801217-6801424)
chr7 (1-222)||(11312660-11312882)
chr7 (1-181)||(15605144-15605326)
chr7 (23-231)||(18556976-18557184)
chr7 (23-231)||(35151609-35151817)
chr7 (67-231)||(16275495-16275660)
chr7 (106-231)||(13918757-13918881)
chr7 (106-231)||(25927480-25927604)
chr7 (23-231)||(15580694-15580903)
chr7 (106-231)||(1859063-1859187)
chr7 (123-229)||(2530384-2530491)
chr7 (23-213)||(18279424-18279615)
chr7 (23-161)||(12714939-12715076)
chr7 (23-161)||(12718743-12718880)
chr7 (23-161)||(16907095-16907232)
chr7 (23-161)||(18283441-18283578)
chr7 (23-213)||(39722287-39722478)
chr7 (106-231)||(7519335-7519460)
chr7 (23-161)||(12704553-12704690)
chr7 (23-161)||(12723654-12723791)
chr7 (23-149)||(16114328-16114453)
chr7 (23-149)||(16117481-16117606)
chr7 (106-229)||(18425443-18425562)
chr7 (23-213)||(26292416-26292607)
chr7 (106-213)||(45169988-45170091)
chr7 (1-85)||(16438906-16438990)
chr7 (2-161)||(33182-33340)
chr7 (2-213)||(70638-70850)
chr7 (2-213)||(74747-74959)
chr7 (9-134)||(14429994-14430119)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (3-231)||(16741209-16741438)
chr6 (4-231)||(12706692-12706920)
chr6 (23-231)||(5616708-5616917)
chr6 (1-231)||(2685191-2685421)
chr6 (23-229)||(19662775-19662981)
chr6 (1-231)||(9482165-9482395)
chr6 (3-231)||(20803427-20803656)
chr6 (1-231)||(1587603-1587833)
chr6 (4-231)||(22592679-22592905)
chr6 (1-231)||(12496312-12496542)
chr6 (1-222)||(17804209-17804431)
chr6 (1-222)||(25767040-25767262)
chr6 (23-231)||(21702291-21702499)
chr6 (67-229)||(31478168-31478331)
chr6 (67-229)||(1644293-1644456)
chr6 (23-213)||(1644726-1644917)
chr6 (23-229)||(22429924-22430131)
chr6 (106-231)||(23414649-23414773)
chr6 (106-231)||(27556407-27556531)
chr6 (23-161)||(11566937-11567074)
chr6 (2-213)||(18955636-18955848)
chr6 (23-161)||(23395143-23395280)
chr6 (23-161)||(8243936-8244073)
chr6 (23-149)||(23990007-23990132)
chr6 (106-229)||(16624137-16624256)
chr6 (2-161)||(14472345-14472503)
chr6 (23-158)||(18917160-18917294)
chr6 (23-149)||(19870677-19870802)
chr6 (2-213)||(22862967-22863179)
chr6 (106-213)||(31477792-31477895)
chr6 (23-145)||(12618739-12618860)
chr6 (74-231)||(25135616-25135774)
chr6 (106-213)||(16760316-16760419)
chr6 (106-213)||(22949129-22949232)
chr6 (106-213)||(22953085-22953188)
chr6 (106-213)||(23871573-23871676)
chr6 (106-213)||(23875529-23875632)
chr6 (9-87)||(27415822-27415900)
chr6 (122-231)||(27416187-27416289)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (3-231)||(6131-6359)
scaffold0546 (23-231)||(1903-2111)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (3-231)||(6948-7176)
scaffold0109 (23-231)||(11196-11404)
scaffold0109 (74-231)||(38763-38921)
scaffold0109 (23-145)||(35837-35958)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-231)||(19889-20119)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-231)||(24840-25072)
scaffold0012 (106-213)||(189359-189462)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-231)||(3402-3633)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (1-231)||(1951633-1951864)
chr4 (1-231)||(18222250-18222481)
chr4 (1-231)||(18228725-18228956)
chr4 (1-231)||(17152359-17152589)
chr4 (23-231)||(18236895-18237104)
chr4 (9-231)||(3412802-3413022)
chr4 (1-231)||(16243272-16243502)
chr4 (1-231)||(26243537-26243767)
chr4 (1-231)||(19757473-19757703)
chr4 (1-231)||(19782103-19782333)
chr4 (1-231)||(23139275-23139504)
chr4 (3-231)||(2014782-2015010)
chr4 (23-231)||(28569338-28569546)
chr4 (67-231)||(14708571-14708736)
chr4 (9-186)||(9530483-9530659)
chr4 (23-231)||(42997344-42997552)
chr4 (4-222)||(36133837-36134056)
chr4 (67-229)||(15224800-15224963)
chr4 (106-231)||(43256390-43256514)
chr4 (9-231)||(18602625-18602833)
chr4 (2-213)||(17810293-17810505)
chr4 (23-213)||(9556551-9556742)
chr4 (23-163)||(5756832-5756971)
chr4 (106-231)||(22634398-22634525)
chr4 (2-213)||(14757295-14757507)
chr4 (23-213)||(4561228-4561419)
chr4 (1-231)||(45938152-45938381)
chr4 (106-213)||(10712874-10712977)
chr4 (106-213)||(10926644-10926747)
chr4 (23-145)||(33742468-33742589)
chr4 (106-213)||(14954149-14954252)
chr4 (106-213)||(25689891-25689994)
chr4 (3-213)||(27534047-27534258)
chr4 (166-231)||(18609340-18609405)
chr4 (9-87)||(43256041-43256119)
chr4 (106-213)||(12487732-12487835)
chr4 (9-80)||(18609219-18609290)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-229)||(18232-18461)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-231)||(23219-23438)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-231)||(228253-228475)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-231)||(5872-6102)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-231)||(9907-10137)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-231)||(173295-173524)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (9-231)||(23187079-23187301)
chr2 (9-231)||(23598342-23598564)
chr2 (23-229)||(22461083-22461289)
chr2 (1-231)||(19928374-19928604)
chr2 (1-231)||(27263276-27263507)
chr2 (1-231)||(18855333-18855561)
chr2 (1-222)||(24735415-24735637)
chr2 (1-231)||(60820-61049)
chr2 (58-231)||(41666953-41667127)
chr2 (3-154)||(19688630-19688780)
chr2 (23-231)||(26125212-26125415)
chr2 (23-213)||(41530904-41531089)
chr2 (106-231)||(31344881-31345005)
chr2 (2-213)||(10101518-10101730)
chr2 (23-161)||(27601871-27602008)
chr2 (23-213)||(24649378-24649569)
chr2 (23-213)||(27379327-27379518)
chr2 (23-213)||(27383373-27383564)
chr2 (23-161)||(12901406-12901543)
chr2 (23-161)||(24628373-24628510)
chr2 (106-213)||(30344973-30345076)
chr2 (106-213)||(1283410-1283513)
chr2 (23-128)||(15477711-15477815)
chr2 (106-155)||(25961510-25961559)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-231)||(18358-18588)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (1-161)||(3-163)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (9-231)||(9545-9768)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (2-231)||(18505-18735)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-231)||(63858-64087)
scaffold0042 (11-231)||(75742-75961)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (3-231)||(2547-2775)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (23-231)||(77065-77273)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (3-231)||(12907-13136)
scaffold0044 (23-231)||(62264-62472)
scaffold0044 (26-231)||(19191-19397)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-222)||(66287-66509)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-222)||(53577-53799)
scaffold0031 (106-213)||(36068-36171)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-231)||(9424-9654)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (58-231)||(8503-8677)
scaffold0111 (58-231)||(15647-15821)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (9-231)||(372-579)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (23-231)||(1880-2088)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (58-231)||(9338-9512)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-231)||(36310-36539)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-231)||(139715-139944)
scaffold0003 (116-231)||(71072-71180)
scaffold0003 (9-87)||(71461-71539)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (67-229)||(80300-80463)
scaffold0029 (23-213)||(65422-65613)
scaffold0029 (23-213)||(61506-61697)
scaffold0029 (2-213)||(80736-80945)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (74-231)||(15341-15499)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (82-228)||(16615-16762)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (67-229)||(80712-80876)
scaffold0037 (9-145)||(21448-21584)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (23-213)||(4995-5186)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (9-180)||(13367-13539)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-135)||(10458-10589)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (106-229)||(30890-31012)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-161)||(58613-58750)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (106-231)||(6684-6808)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (144-231)||(20479-20566)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (2-213)||(3748-3960)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (106-213)||(11483-11586)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (106-213)||(14069-14172)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (2-213)||(12443-12655)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (23-131)||(902-1009)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (163-231)||(207883-207951)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (106-198)||(433-521)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (106-213)||(32642-32745)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (2-145)||(1362-1505)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (49-159)||(247-357)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (106-213)||(471-575)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (9-134)||(1605-1730)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16797926 - 16798156
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16797926 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 16798025  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16798026 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaact 16798125  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798126 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 16798156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16808753 - 16808983
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16808753 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 16808852  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16808853 tgtatttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaact 16808952  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16808953 atattgcatgagtatgaataagttgatgatg 16808983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17242206 - 17241978
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17242206 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgat 17242107  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  17242106 tgcccttacttgaattattgttgattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 17242008  T
Q  201 atgttgcatgagtatg-aataagttgatga 229  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17242007 atgttgcatgagtctgaaataagttgatga 17241978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38814618 - 38814388
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  38814618 aggaactttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgat 38814519  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  38814518 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 38814419  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  38814418 aagttgcatgtctatcaataagctgatgatg 38814388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3833908 - 3833678
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  3833908 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 3833809  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  3833808 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 3833709  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3833708 aagttgcatgtctatgaataagctgatgatg 3833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15482889 - 15482666
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||    
T  15482889 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tta 15482791  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttg 206  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||||| ||||    
T  15482790 cttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 15482691  T
Q  207 catgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15482690 catgagtctgaataagttgatgatg 15482666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20461372 - 20461594
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  20461372 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 20461471  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  20461472 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 20461570  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  20461571 ctaagttgcatgagtctgaataag 20461594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31097426 - 31097656
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacga-aatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 99  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||   ||||  ||| ||||||    
T  31097426 aggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattga 31097525  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaa 197  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||| |||| |||||  | |    
T  31097526 ttccact-acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaatta 31097624  T
Q  198 actatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31097625 actatgttgcatgagtctgaataagttgatga 31097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 15849958 - 15850183
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||   |||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  15849958 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgatt 15850057  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaacta 201  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||| || |||||    
T  15850058 gcata-acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgt-gaaaatgaattgttattaaacttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaacta 15850155  T
Q  202 tgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15850156 agttgcatgagactgaataagttgatga 15850183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 327044 - 327259
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||    
T  327044 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tta 327142  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgat-ttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| ||  ||||| |||  |||||  | ||||| |||    
T  327143 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagtt 327242  T
Q  206 gcatgagtatgaataag 222  Q
    |||||||| ||||||||    
T  327243 gcatgagtctgaataag 327259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7793221 - 7793444
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  7793221 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgat 7793320  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttg-attatgttgcacttgtttttaa 197  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| || |||||| |||  |||||  | |    
T  7793321 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaatta 7793419  T
Q  198 actatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  7793420 actaagttgcatgagtctgaataag 7793444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 4589131 - 4589294
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  4589131 tgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 4589230  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4589231 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 4589294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16696980 - 16696789
Alignment:
Q  40 actgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaatt 138  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16696980 actgtgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgatcatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaact 16696882  T
Q  139 gttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
     |||| |||| |||||| || |  ||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16696881 attgagaatgttttgttctttaacttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 16696789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19775516 - 19775353
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  19775516 tgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 19775417  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19775416 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 19775353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15464993 - 15464869
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  15464993 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 15464895  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15464894 gcatgagtatgaataagttgatgatg 15464869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489573
Alignment:
Q  116 tattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtat 215  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtat 8489557  T
Q  216 gaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  8489558 gaataagttgatgatg 8489573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15941776 - 15942006
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggatt-ga 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||| || || |||||| ||  | ||||| ||||| ||| ||||||  ||| || ||||||| |||||||| ||    
T  15941776 aggaactttaggtgctaatgagacctattagaggtaatgactgtgagctttgaagattttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggatttga 15941875  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    |||  ||||||||| |||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||    
T  15941876 ttgcctttacttgatttattgctaattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaac 15941974  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||  || | ||||| ||||||||    
T  15941975 taagttgcatgtctaagtataagctgatgatg 15942006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11854969 - 11854757
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  |||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  11854969 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11854870  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  11854869 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaac 11854771  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  11854770 taagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 2897718 - 2897917
Alignment:
Q  24 cctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 123  Q
    |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||    
T  2897718 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttactggaattattattg 2897816  T
Q  124 aatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  2897817 aatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataa 2897916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5223192 - 5223068
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  5223192 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 5223094  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  5223093 gtatgagtatgaataagttgatgatg 5223068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15617589 - 15617398
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  15617589 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattacatt-acttgaattattatt 15617491  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15617490 gaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7109913 - 7109776
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  7109913 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 7109815  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  7109814 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 7109776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7113848 - 7113711
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  7113848 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 7113750  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  7113749 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 7113711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22321879 - 22321742
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22321879 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 22321781  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22321780 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 22321742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22336934 - 22336797
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22336934 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 22336836  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22336835 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 22336797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 27409538 - 27409675
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  27409538 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 27409636  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27409637 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 27409675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28949939 - 28949802
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  28949939 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 28949841  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  28949840 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 28949802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12339594 - 12339470
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  12339594 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 12339496  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12339495 gcatgagtatgaataagttgatgatg 12339470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11070304 - 11070092
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  11070304 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11070205  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || |||    
T  11070204 gcatt-acttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaac 11070106  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  11070105 taagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11854547 - 11854422
Alignment:
Q  104 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatg 203  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| |    
T  11854547 atttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  204 ttgcatgagtatgaataagttgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11854448 ttgcatgagtatgaataagttgttgat 11854422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30066182 - 30065970
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  30066182 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 30066083  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  30066082 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 30065984  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  30065983 taagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 1598374 - 1598581
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggatt-gattgtatttacttgaattattgt 121  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||| || || |||| |||| ||| |||||  || |||||| |||||||    
T  1598374 acctattagggataatgactgtgaactgtgatgattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatgaatttgattgccttcacttga-ttattgt 1598472  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtta-ttaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaata 220  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||  |||| |||    
T  1598473 taattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagcttgatgtgatttgattatgctgca-atgttatttaactaagttgcatgtctatgtata 1598570  T
Q  221 agttgatgatg 231  Q
    || ||||||||    
T  1598571 agctgatgatg 1598581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 16750570 - 16750689
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  16750570 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 16750665  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  16750666 gcaagaatatgaataagttgatga 16750689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 11300384 - 11300539
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  |||||| ||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  11300384 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11300483  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttatt 158  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  11300484 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 4111231 - 4111334
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  4111231 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 4111326  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  4111327 gcatgagt 4111334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15965096 - 15964993
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  15965096 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15965001  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  15965000 gcatgagt 15964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15969020 - 15968917
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  15969020 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15968925  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  15968924 gcatgagt 15968917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15972944 - 15972841
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  15972944 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 15972849  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  15972848 gcatgagt 15972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19775892 - 19775789
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  19775892 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 19775797  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  19775796 gcatgagt 19775789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55023103 - 55022945
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  55023103 ggaactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 55023004  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  55023003 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag 55022945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 11165402 - 11165614
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | ||||||| || |   ||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  11165402 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11165501  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  11165502 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 11165600  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || ||| |||||||    
T  11165601 taagttacatgagt 11165614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 11300743 - 11300868
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||    
T  11300743 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacgttatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagtt 11300841  T
Q  206 gcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  11300842 gcatgagtctgaaataagttgatgatg 11300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 4107383 - 4107482
Alignment:
Q  110 ttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcat 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4107383 ttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 4107478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 37439618 - 37439721
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | || ||||| |||||||| |||    
T  37439618 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaactaagtt 37439713  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  37439714 gcatgagt 37439721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14499500 - 14499403
Alignment:
Q  63 gaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    |||||| ||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14499500 gaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag 14499403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 16865005 - 16865101
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggatt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  16865005 aggaactttaggtactaatgtgacctatcaaagataatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaagagattatgaaatgatttatggatt 16865101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 322828 - 322703
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| |||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| |||| |||     
T  322828 taggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt- 322730  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaaga 134  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  322729 acttgaaatattattgaatgatcaaga 322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19212101 - 19211870
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19212101 aggaactttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 19212002  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  19212001 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 19211902  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19211901 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 19211870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 23819179 - 23819383
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23819179 taggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtcttta 23819278  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||    
T  23819279 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgca 23819378  T
Q  209 tgagt 213  Q
    |||||    
T  23819379 tgagt 23819383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12647082 - 12646876
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12647082 acctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtt 12646983  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aataa 221  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||    
T  12646982 gattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgaatctgaaataa 12646884  T
Q  222 gttgatga 229  Q
    ||||||||    
T  12646883 gttgatga 12646876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46975699 - 46975471
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  46975699 gaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattg 46975600  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || |||||     
T  46975599 tctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaa 46975500  T
Q  203 gttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  46975499 gttgcacgtctatgaataagctgatgatg 46975471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20138317 - 20138086
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | || |||| ||||||||| |    
T  20138317 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattggt 20138218  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  20138217 tgcctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 20138118  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20138117 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 20138086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18882601 - 18882371
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| | ||    
T  18882601 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaataat 18882502  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  |||| || ||||    
T  18882501 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaact 18882402  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  18882401 aagttgcatttttatgaataagctgatgatg 18882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36819180 - 36819412
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||    
T  36819180 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgat 36819279  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatg-atttgttattaagtt--tgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaa 197  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||| |||  |||||  | |    
T  36819280 tgcattt-cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 36819378  T
Q  198 actatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36819379 actaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 36819412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16080316 - 16080545
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  16080316 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 16080415  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||  || ||  | ||    
T  16080416 tgca-ttacttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaa 16080514  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  16080515 ctaagttgcatgagtctgaatatgatgatga 16080545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 20229167 - 20229330
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||     
T  20229167 tgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaactta 20229266  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20229267 atgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 20229330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Original strand, 24783002 - 24783199
Alignment:
Q  31 aagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatc 130  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24783002 aagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcatt-acttgaattattattgaatgatc 24783100  T
Q  131 aagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgat 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||   || ||||||| |||||||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  24783101 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgat 24783199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 20228703 - 20228894
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  20228703 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 20228801  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20228802 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 20228894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33797400 - 33797286
Alignment:
Q  116 tattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtat 215  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  33797400 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtat 33797302  T
Q  216 gaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  33797301 gaataagttgatgatg 33797286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 16375352 - 16375489
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16375352 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 16375450  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16375451 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 16375489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21407567 - 21407430
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21407567 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 21407469  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  21407468 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 21407430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52639753 - 52639616
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  52639753 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 52639655  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  52639654 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 52639616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1010956 - 1010744
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  1010956 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 1010857  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  1010856 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 1010758  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  1010757 taagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 39244123 - 39244242
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  39244123 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattcttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 39244218  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  39244219 gcaagaatatgaataagttgatga 39244242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 39247678 - 39247797
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  39247678 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattcttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 39247773  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  39247774 gcaagaatatgaataagttgatga 39247797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 1925111 - 1925214
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  1925111 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 1925206  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  1925207 gcatgagt 1925214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 20924125 - 20924228
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  20924125 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 20924220  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  20924221 gcatgagt 20924228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Original strand, 41388223 - 41388342
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||| |||||  || ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  41388223 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaatttttattaagcttgatacgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 41388318  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  41388319 gcaagaatatgaataagttgatga 41388342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33797759 - 33797681
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33797759 taggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 33797681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18774438 - 18774206
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaa-ttatggattga 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18774438 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattga 18774339  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18774338 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 18774239  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18774238 tatgttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18774206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18784281 - 18784049
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaa-ttatggattga 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18784281 aggaactttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattga 18784182  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18784181 ttgtatttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 18784082  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18784081 tatgttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18784049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42805632 - 42805423
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42805632 acctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattttatttacttgaattattatt 42805533  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaa-taa 221  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||| | ||||||||||| |||| |||    
T  42805532 aaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagtctgaattaa 42805433  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  42805432 gttgatgatg 42805423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 26742640 - 26742849
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26742640 acctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgtatttactcgaattattatt 26742739  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaa-taa 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||| |||    
T  26742740 gaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagcctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaactaa 26742839  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  26742840 gttgatgatg 26742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26666003 - 26666233
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26666003 aggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgat 26666102  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  26666103 tgcccttacttgaattattgttgattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 26666201  T
Q  201 atgttgcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26666202 atgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26666233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26937600 - 26937830
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26937600 aggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgat 26937699  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  26937700 tgcccttacttgaattattgttgattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 26937798  T
Q  201 atgttgcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26937799 atgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 24532942 - 24533150
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24532942 acctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtt 24533041  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aataa 221  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24533042 gattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataa 24533140  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  24533141 gttgatgatg 24533150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20232781 - 20232554
Alignment:
Q  4 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 103  Q
    |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20232781 aactttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 20232682  T
Q  104 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatg 203  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  20232681 ctttacttgaattattgttgattgatcaa-taattgttgagaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 20232583  T
Q  204 ttgcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20232582 ttgcataagtctgaaataagttgatgatg 20232554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33409462 - 33409232
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  33409462 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 33409363  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  33409362 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 33409263  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33409262 aagttgcatgtctatgaataagctgatgatg 33409232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25229278 - 25229508
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  25229278 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaa 25229376  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25229377 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 25229476  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25229477 taagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25229508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25293434 - 25293664
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  25293434 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaa 25293532  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25293533 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 25293632  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25293633 taagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25293664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16674384 - 16674156
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| || ||| || |||| ||| |||||||||    
T  16674384 gaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattgattg 16674285  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || |||||     
T  16674284 cctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaa 16674185  T
Q  203 gttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  16674184 gttgcatgtttaagaataagctgatgatg 16674156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21885083 - 21885291
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  21885083 acctattaaagataattattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgt 21885181  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  21885182 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 21885281  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  21885282 gttgatgatg 21885291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4036454 - 4036223
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||     
T  4036454 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaa 4036356  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaat-tgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
     | || || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4036355 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaa 4036256  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4036255 ctaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 4036223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17718311 - 17718538
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| || |||||| || |||| |||| ||||||    
T  17718311 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgat 17718410  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||  |||  |||| || ||||    
T  17718411 ttcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaacatgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaact 17718510  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17718511 aagttgcatg-ttatgaataagctgatga 17718538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21340639 - 21340869
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  21340639 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtgat 21340738  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  21340739 tgcctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 21340837  T
Q  201 atgttgcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21340838 aagttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 21340869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26172676 - 26172468
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  26172676 acctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattacacttacttgaattgttgt 26172578  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| |||| ||||| |||    
T  26172577 tgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgaatgattatgattaa 26172478  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  26172477 gttgatgatg 26172468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 23535469 - 23535690
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| | |||    
T  23535469 taggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattat-acgtgatttattgatagattgca-tta 23535566  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttg 206  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| ||||    
T  23535567 ctttaattattattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 23535665  T
Q  207 catgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  23535666 catgagtctgaataagttgatgatg 23535690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10753112 - 10752949
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  10753112 tgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 10753013  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10753012 atgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 10752949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18356085 - 18355961
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  18356085 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagtt 18355987  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18355986 gcatgagtatgaataagttgatgatg 18355961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 20911148 - 20911272
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  20911148 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 20911246  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20911247 gcatgagtatgaataagttgatgatg 20911272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20296059 - 20295922
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  20296059 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 20295961  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  20295960 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 20295922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410452
Alignment:
Q  74 tgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtga 171  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtga 17410503  T
Q  172 tttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    | |||||||| |||  |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17410502 tctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 17410452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 19472614 - 19472751
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  19472614 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttaaattattatt 19472712  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  19472713 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 19472751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10753488 - 10753385
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  10753488 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10753393  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  10753392 gcatgagt 10753385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Original strand, 15236714 - 15236865
Alignment:
Q  63 gaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag- 161  Q
    |||||| |||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||     
T  15236714 gaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcatt-acttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc 15236812  T
Q  162 -tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
      ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15236813 tgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18356549 - 18356475
Alignment:
Q  13 tactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtga 87  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  18356549 tactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 18356475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 21366545 - 21366670
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| |||| |||     
T  21366545 taggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt- 21366643  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaaga 134  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21366644 acttgaaatattattgaatgatcaaga 21366670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16231355 - 16231578
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231355 taggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcattta 16231454  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  16231455 cttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16231554  T
Q  209 tgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  16231555 tgagtctgaattaagttgatgatg 16231578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30308626 - 30308855
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30308626 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgat 30308725  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30308726 tgtatt-acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaatctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaact 30308824  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308825 aatttgcatgagtatgaataagttgatgatg 30308855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23834407 - 23834175
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaatt-atggattga 99  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  23834407 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactga 23834308  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  23834307 ttgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaac 23834208  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23834207 tatgttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 23834175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22045116 - 22044887
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045116 gaactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 22045017  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||     
T  22045016 catttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaa 22044917  T
Q  203 gttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22044916 gttgcatgagtctgaattaagttgacgatg 22044887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23846887 - 23847117
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  23846887 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 23846986  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  23846987 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 23847086  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23847087 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22028791 - 22028647
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22028791 aggaactttaagtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 22028692  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22028691 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18619704 - 18619564
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18619704 taggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtcttta 18619605  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatga 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18619604 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatga 18619564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32605422 - 32605214
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  32605422 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgt 32605324  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  32605323 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 32605224  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  32605223 gttgatgatg 32605214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15538682 - 15538452
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  15538682 aggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgat 15538583  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  15538582 tgcctttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 15538483  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  15538482 aagttgcatgtctatgtataagctgatgatg 15538452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32598864 - 32598682
Alignment:
Q  49 tgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaat 147  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  32598864 tgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaat 32598766  T
Q  148 gatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32598765 gatttgttatttgacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 32598682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15532122 - 15531893
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||| |||||  || ||||||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  15532122 aggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgat 15532024  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  15532023 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 15531924  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  15531923 aagttgcatgtctatgtataagctgatgatg 15531893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 17828477 - 17828684
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggatt-gattgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||| || || |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17828477 acctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattgtctttacttga-ttattgt 17828575  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||| ||||||||  |||| ||||    
T  17828576 taattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagttgcatgtctatgtataa 17828674  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    | ||||||||    
T  17828675 gctgatgatg 17828684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21383766 - 21383657
Alignment:
Q  121 ttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaata 220  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21383766 ttgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 21383668  T
Q  221 agttgatgatg 231  Q
    |||||||||||    
T  21383667 agttgatgatg 21383657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21387184 - 21387077
Alignment:
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21387184 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 21387086  T
Q  223 ttgatgatg 231  Q
    |||||||||    
T  21387085 ttgatgatg 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 19278177 - 19278314
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  19278177 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 19278275  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  19278276 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 19278314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 21972479 - 21972616
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21972479 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 21972577  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  21972578 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 21972616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 21976564 - 21976701
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21976564 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 21976662  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  21976663 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 21976701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22112063 - 22111926
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22112063 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 22111965  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22111964 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 22111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 14398086 - 14398210
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  14398086 ttactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttattaagctttatgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 14398184  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14398185 gcatgagtatgaataagttgatgatg 14398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43252025 - 43251834
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  43252025 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 43251927  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  43251926 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 17055283 - 17055481
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  17055283 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgt 17055381  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||          | | |||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  17055382 tgaa----------actattgagaatgatttgttatttaagttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 17055471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 18862627 - 18862730
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  18862627 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 18862722  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  18862723 gcatgagt 18862730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 21827996 - 21828099
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  21827996 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 21828091  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  21828092 gcatgagt 21828099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21411070 - 21410971
Alignment:
Q  110 ttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcat 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21411070 ttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 21410975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21805562 - 21805463
Alignment:
Q  110 ttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcat 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21805562 ttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcat 21805467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 231
Target Start/End: Original strand, 24445435 - 24445608
Alignment:
Q  57 ttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggatt-gattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtt 155  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| || || |||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24445435 ttttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattgcctttacgtga-ttattgtcaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgtt 24445532  T
Q  156 attaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||   |||||||||||||||||| || |  |||| || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  24445533 atgaaacctgatgtgatttgattatgctgtaaatgttatttaactaagttgcatgtctatgtataagctgatgatg 24445608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 20465958 - 20466054
Alignment:
Q  49 tgtgaagcttttacgaaatgttaagt-gattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||  |||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  20465958 tgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20466054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Original strand, 22113622 - 22113697
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 99  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113622 acctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22113697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Original strand, 22135125 - 22135200
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 99  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22135125 acctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22135200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Original strand, 22166275 - 22166350
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 99  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22166275 acctattaaagataatgattatgaagtgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22166350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8917660 - 8917430
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8917660 aggaactttgggtgctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgat 8917561  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8917560 tgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaact 8917461  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917460 aagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 8917430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18930 - 19161
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18930 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 19029  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  19030 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 19129  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19130 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 19161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9593579 - 9593348
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9593579 aggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgat 9593480  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  9593479 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 9593380  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9593379 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 9593348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13461995 - 13461764
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaa-ttatggattga 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13461995 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattga 13461896  T
Q  100 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  13461895 ttgtttttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaac 13461796  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461795 taatttgcatgagtatgaataagttgatgatg 13461764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11987438 - 11987225
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaa-gatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11987438 taggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattgcattt 11987339  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  11987338 acttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgc 11987239  T
Q  208 atgagtatgaataa 221  Q
    |||||| |||||||    
T  11987238 atgagtctgaataa 11987225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13149388 - 13149158
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  13149388 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 13149289  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  13149288 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 13149189  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13149188 aagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 13149158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16724511 - 16724732
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtattt 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  16724511 taggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatattt 16724609  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  16724610 atttgaattattgttgaatgatcaagaacta-ttgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgc 16724708  T
Q  208 atgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16724709 atgagtatgaataagttgatgatg 16724732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 17701525 - 17701746
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtattt 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  17701525 taggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatattt 17701623  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  17701624 atttgaattattgttgaatgatcaagaacta-ttgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgc 17701722  T
Q  208 atgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17701723 atgagtatgaataagttgatgatg 17701746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Original strand, 16457310 - 16457455
Alignment:
Q  82 aagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16457310 aagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  182 ttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aataagttga 226  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttga 16457455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9644542 - 9644384
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9644542 aggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgat 9644443  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttatta 159  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9644442 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15728558 - 15728328
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||     
T  15728558 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaa 15728460  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15728459 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 15728360  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15728359 taagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 15728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12318361 - 12318130
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  12318361 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgat 12318262  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  12318261 tgca-ttacttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 12318163  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12318162 ctaagttgcatgagtctgaataagatgatgatg 12318130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 13635349 - 13635572
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||   |||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |    
T  13635349 taggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-a 13635447  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttg 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||||| ||||    
T  13635448 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 13635547  T
Q  207 catgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13635548 catgagtctgaataagttgatgatg 13635572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16583481 - 16583259
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| |    
T  16583481 taggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttatg-attgattgcatt-a 16583384  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||||| ||||    
T  16583383 cttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttg 16583284  T
Q  207 catgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16583283 catgagtctgaataagttgatgatg 16583259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14217148 - 14216918
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  14217148 aggaactgtaggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattgaa 14217050  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||    
T  14217049 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaac 14216950  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14216949 taagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 14216918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6801424 - 6801217
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaa-ttatggattgattgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6801424 acctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgcccttacttgaattattgt 6801325  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aata 220  Q
    | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  6801324 taattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagcttgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgggtctgaaata 6801226  T
Q  221 agttgatga 229  Q
    |||||||||    
T  6801225 agttgatga 6801217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11312882 - 11312660
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  11312882 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 11312783  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  11312782 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 11312684  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  11312683 ctaagttgcatgagtctgaataag 11312660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15605144 - 15605326
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  15605144 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgat 15605243  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatg-atttgttattaag--tttgatgtgatttgattatg 181  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  15605244 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 15605326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18557184 - 18556976
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt-gtatttacttgaattattgt 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18557184 acctattaaagatattatctgagaactgtgaagcctt-atgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatttacttgaattattgt 18557086  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    | ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18557085 taaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgactatgtataa 18556986  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  18556985 gttgatgatg 18556976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35151817 - 35151609
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  35151817 acctattaaagatactgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttgcttgaattattgt 35151719  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    |||||||| |||||  | ||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  35151718 tgaatgatgaagaagctattgagtatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 35151619  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  35151618 gttgatgatg 35151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16275660 - 16275495
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattgat-tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || || |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| |  |||    
T  16275660 tgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaactgttgttgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgttatttaacttg 16275561  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275560 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 16275495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 13918757 - 13918881
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  13918757 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 13918855  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13918856 gcatgagtatgaataagttgatgatg 13918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 25927480 - 25927604
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  25927480 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttattaagtttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 25927578  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25927579 gcatgagtatgaataagttgatgatg 25927604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15580903 - 15580694
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||| | ||| || ||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  15580903 acctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgcatt-acttgaattattatt 15580805  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaata 220  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15580804 gaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtctgaata 15580705  T
Q  221 agttgatgatg 231  Q
    || ||||||||    
T  15580704 agatgatgatg 15580694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 1859063 - 1859187
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  1859063 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttattaagcttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 1859161  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1859162 gcatgagtatgaataagttgatgatg 1859187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 2530384 - 2530491
Alignment:
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatg-tgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2530384 gaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataa 2530483  T
Q  222 gttgatga 229  Q
    ||||||||    
T  2530484 gttgatga 2530491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18279615 - 18279424
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18279615 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 18279517  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| | || |||||||| |||  ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  18279516 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 18279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12715076 - 12714939
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  12715076 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 12714978  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12714977 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 12714939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12718880 - 12718743
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  12718880 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 12718782  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12718781 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 12718743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 16907095 - 16907232
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16907095 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 16907193  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16907194 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 16907232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18283578 - 18283441
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18283578 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 18283480  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  18283479 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 18283441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39722478 - 39722287
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  39722478 acctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcatt-acttgaattattatt 39722380  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  39722379 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 7519335 - 7519460
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  7519335 ttacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 7519433  T
Q  206 gcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | |||||| |||| ||| |||||||||    
T  7519434 ggatgagtctgaattaaattgatgatg 7519460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 12704553 - 12704690
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  12704553 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatgcatt-acttgaattattatt 12704651  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12704652 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 12704690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12723791 - 12723654
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  12723791 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 12723693  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  12723692 gaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaag 12723654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16114453 - 16114328
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16114453 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 16114355  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatga 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16114354 gaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16114328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16117606 - 16117481
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16117606 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 16117508  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatga 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16117507 gaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16117481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18425562 - 18425443
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  18425562 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 18425467  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  18425466 gcaagaatatgaataagttgatga 18425443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26292607 - 26292416
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||    
T  26292607 acctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattaa-ttgaattattatt 26292509  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| | || |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  26292508 gaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 45169988 - 45170091
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  45169988 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 45170083  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  45170084 gcatgagt 45170091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 16438906 - 16438990
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagt 85  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  16438906 aggaactttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattatgaagt 16438990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33340 - 33182
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  33340 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 33241  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  33240 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag 33182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 70638 - 70850
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  70638 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 70737  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || |||    
T  70738 gcatt-acttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaac 70836  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  70837 taagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 74747 - 74959
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  74747 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 74846  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || |||    
T  74847 gcatt-acttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaac 74945  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  74946 taagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14430119 - 14429994
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| |||| |||     
T  14430119 taggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt- 14430021  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaaga 134  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14430020 acttgaaatattattgaatgatcaaga 14429994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16741438 - 16741209
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741438 gaactttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 16741339  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||     
T  16741338 catttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaa 16741239  T
Q  203 gttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  16741238 gttgcatgtgtctgaattaagttgatgatg 16741209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12706920 - 12706692
Alignment:
Q  4 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 103  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  12706920 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgc 12706821  T
Q  104 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  12706820 atttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 12706721  T
Q  204 ttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12706720 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 12706692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 5616708 - 5616917
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagctttt-acgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgt 121  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616708 acctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgt 5616807  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  5616808 tgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataa 5616907  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  5616908 gttgatgatg 5616917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2685191 - 2685421
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2685191 aggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgat 2685290  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||   |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  2685291 tgcccttacttgaattattgtcgattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 2685389  T
Q  201 atgttgcatgagtatg-aataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2685390 atgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 2685421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19662981 - 19662775
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19662981 acctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtt 19662882  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aataa 221  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19662881 gattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataa 19662783  T
Q  222 gttgatga 229  Q
    ||||||||    
T  19662782 gttgatga 19662775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9482165 - 9482395
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  9482165 aggaactttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgat 9482264  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||  |||| || ||||    
T  9482265 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaact 9482364  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9482365 aagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9482395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 20803427 - 20803656
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat-t 101  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  20803427 gaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaat 20803526  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaacta 201  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20803527 atacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 20803626  T
Q  202 tgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20803627 agctgcatgaatatgaataagttgatgatg 20803656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1587603 - 1587833
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||     
T  1587603 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaa 1587701  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  1587702 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 1587801  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1587802 taagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 1587833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 22592679 - 22592905
Alignment:
Q  4 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 103  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||     
T  22592679 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 22592777  T
Q  104 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatg 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| |    
T  22592778 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaactaag 22592877  T
Q  204 ttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22592878 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 22592905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12496542 - 12496312
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  12496542 aggaactttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattgat 12496443  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   || |||||| |||||||| ||||  |||| || ||||    
T  12496442 tgcctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttgtgatctgattatgctgcaaatgttatttaact 12496343  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  12496342 aagttgcatgtctatgaataagctgatgatg 12496312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17804431 - 17804209
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  17804431 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 17804332  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  17804331 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 17804233  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17804232 ctaagttgcatgagtctgaataag 17804209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25767040 - 25767262
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  25767040 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgat 25767139  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   ||| |||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  25767140 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaa 25767238  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  25767239 ctaagttgcatgagtctgaataag 25767262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21702499 - 21702291
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  21702499 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactttcttgaatttttgt 21702401  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||    
T  21702400 tgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataa 21702301  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  21702300 gttgatgatg 21702291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 31478168 - 31478331
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  31478168 tgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 31478267  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31478268 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 31478331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1644456 - 1644293
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  1644456 tgttaaatgattaagaaatgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 1644357  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1644356 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 1644293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1644917 - 1644726
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  1644917 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 1644819  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1644818 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 1644726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 22429924 - 22430131
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22429924 acctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 22430022  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaata 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  | |||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  22430023 aaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagtctgaata 22430122  T
Q  221 agttgatga 229  Q
     | ||||||    
T  22430123 tgatgatga 22430131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23414773 - 23414649
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  23414773 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 23414675  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23414674 gcatgagtatgaataagttgatgatg 23414649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27556531 - 27556407
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  27556531 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 27556433  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27556432 gcatgagtatgaataagttgatgatg 27556407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11567074 - 11566937
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  11567074 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 11566976  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  11566975 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 11566937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 18955636 - 18955848
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  |||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||    
T  18955636 ggaactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgatt 18955735  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||  ||||| ||||||    
T  18955736 gcatt-acttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaac 18955834  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  18955835 taagttgcatgagt 18955848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23395280 - 23395143
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  23395280 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 23395182  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  23395181 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 23395143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8244073 - 8243936
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  8244073 acctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 8243975  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  8243974 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 8243936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23990132 - 23990007
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  23990132 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 23990034  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatga 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23990033 gaatgatcaggaagttgttgaaaatga 23990007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16624256 - 16624137
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  16624256 ttacttgaagtattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagtttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 16624161  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  16624160 gcaagaatatgaataagttgatga 16624137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14472503 - 14472345
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  14472503 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 14472404  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14472403 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag 14472345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Original strand, 18917160 - 18917294
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  18917160 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttgcttgaattattatt 18917258  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttatt 158  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  18917259 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 18917294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19870802 - 19870677
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  19870802 acctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 19870704  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatga 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19870703 gaatgatcaggaagttgttgaaaatga 19870677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22863179 - 22862967
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  22863179 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22863080  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || |||    
T  22863079 gcatt-acttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaac 22862981  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  22862980 taagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 31477792 - 31477895
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  31477792 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 31477887  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  31477888 gcatgagt 31477895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 12618739 - 12618860
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  12618739 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 12618837  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    ||||||||| | | |||||||||    
T  12618838 gaatgatcagggagttgttgaaa 12618860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 25135616 - 25135774
Alignment:
Q  74 tgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgat 172  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||| | ||||| |||| | |  ||||||||||    
T  25135616 tgattatgaagtgaactatgaattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaacctattgagagtgattcgttacttaacttgatgtgat 25135715  T
Q  173 ttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||| ||| ||||  |||| || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25135716 ttgataatgctgcaaatgttatttaattgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 25135774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16760419 - 16760316
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  16760419 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 16760324  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||| ||||    
T  16760323 gcacgagt 16760316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22949232 - 22949129
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  22949232 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 22949137  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  22949136 gcatgagt 22949129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22953188 - 22953085
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  22953188 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 22953093  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  22953092 gcatgagt 22953085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23871676 - 23871573
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  23871676 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 23871581  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  23871580 gcatgagt 23871573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23875632 - 23875529
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  23875632 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 23875537  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  23875536 gcatgagt 23875529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 27415822 - 27415900
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  27415822 taggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 27415900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 27416187 - 27416289
Alignment:
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||      |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  27416187 tgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaatat 27416279  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  27416280 gttgatgatg 27416289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 6131 - 6359
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6131 gaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattg 6230  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  6231 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactat 6330  T
Q  203 gttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6331 gttgcatgagcatgaataagttgatgatg 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 1903
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||   |||| |||| |||||| | ||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  2111 acctattaaagataatgatcaagaactgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgt 2013  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    | ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || ||||  ||||||||| |||||||||    
T  2012 taaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataa 1913  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  1912 gttgatgatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7176 - 6948
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7176 gaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattg 7077  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  7076 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactat 6977  T
Q  203 gttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6976 gttgcatgagcatgaataagttgatgatg 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 11196 - 11404
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||   |||| |||| |||||| | ||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  11196 acctattaaagataatgatcaagaactgtggagcttt-atgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgt 11294  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    | ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || ||||  ||||||||| |||||||||    
T  11295 taaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataa 11394  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  11395 gttgatgatg 11404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 38763 - 38921
Alignment:
Q  74 tgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgat 172  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  ||||||| ||    
T  38763 tgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtcat 38862  T
Q  173 ttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||| ||| ||||  |||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38863 ttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 38921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 35837 - 35958
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  35837 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 35935  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  35936 gaatgatcaggaagttgttgaaa 35958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19889 - 20119
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  19889 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgat 19988  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19989 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaact 20088  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20089 aagttgcatgaatctgaataagttgatgatg 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24840 - 25072
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24840 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 24939  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatc-aagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  24940 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 25039  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25040 tgagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 25072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 189359 - 189462
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  189359 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 189454  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  189455 gcatgagt 189462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3402 - 3633
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3402 aggaactttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgat 3501  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||||    
T  3502 tgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaact 3601  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3602 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1951633 - 1951864
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1951633 aggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgat 1951732  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  1951733 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 1951832  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1951833 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 1951864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18222250 - 18222481
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18222250 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 18222349  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  18222350 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 18222449  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  18222450 aagttgcatgagtctgaattaagttcatgatg 18222481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18228725 - 18228956
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18228725 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 18228824  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || || || ||||    
T  18228825 tgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagcttgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaact 18228924  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18228925 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18228956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17152359 - 17152589
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17152359 aggaactttaggtgttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 17152458  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  17152459 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 17152557  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17152558 aagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 17152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18237104 - 18236895
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagctttt-acgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgt 121  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237104 acctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgt 18237005  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18237004 tgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataa 18236905  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  18236904 gttgatgatg 18236895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3413022 - 3412802
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtattt 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  3413022 taggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatattt 3412925  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  3412924 a-ttgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagttgc 3412826  T
Q  208 atgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3412825 atgagtatgaataagttgatgatg 3412802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16243272 - 16243502
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | || |||| |||||||||||    
T  16243272 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattgat 16243371  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  16243372 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 16243471  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16243472 aagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 16243502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26243537 - 26243767
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  26243537 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgat 26243636  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  26243637 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 26243736  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  26243737 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 26243767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19757473 - 19757703
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  19757473 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 19757572  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  19757573 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 19757672  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  19757673 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19757703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19782333 - 19782103
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  19782333 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 19782234  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  19782233 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 19782134  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  19782133 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19782103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23139504 - 23139275
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23139504 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgat 23139405  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  23139404 tgcccatacttgaattattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 23139306  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23139305 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23139275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2015010 - 2014782
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| || |||| |||||||||||||    
T  2015010 gaactttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattgattg 2014911  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactat 202  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||     
T  2014910 cctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaa 2014811  T
Q  203 gttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2014810 gttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 2014782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 28569338 - 28569546
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  28569338 acctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactcacttgaattgttgt 28569436  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28569437 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 28569536  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  28569537 gttgatgatg 28569546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 14708571 - 14708736
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  |  |||    
T  14708571 tgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaacttg 14708670  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14708671 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 14708736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9530659 - 9530483
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  || |||| |||||| ||||||  ||||    
T  9530659 taggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtgattgccttta 9530560  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgca 186  Q
    || ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9530559 ctcgaattattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttattattaagcttgatgtgatttgattatgctgca 9530483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 42997344 - 42997552
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  42997344 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgt 42997442  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||  ||||||||| |||||||||    
T  42997443 taaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataa 42997542  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  42997543 gttgatgatg 42997552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 36133837 - 36134056
Alignment:
Q  4 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 103  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||     
T  36133837 aactttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 36133936  T
Q  104 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaacta 201  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| | | |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | |||||    
T  36133937 a-ttacttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 36134035  T
Q  202 tgttgcatgagtatgaataag 222  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  36134036 agttgcatgagtctgaataag 36134056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15224963 - 15224800
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  15224963 tgttaaatgattaagaagtgaattatgaattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 15224864  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15224863 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 15224800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 43256390 - 43256514
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||    
T  43256390 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagtt 43256488  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43256489 gcatgagtatgaataagttgatgatg 43256514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 18602625 - 18602833
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaaga-tattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||            
T  18602625 taggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagcttt-atgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-------- 18602715  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
          ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||| |    
T  18602716 ------attattgttgaatgattgagaaatgattgagaatgatttgttgtttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttc 18602809  T
Q  208 atgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  18602810 atgagtatgaataagttgacgatg 18602833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17810505 - 17810293
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  17810505 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 17810406  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  17810405 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 17810307  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  17810306 taagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9556742 - 9556551
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  9556742 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattagtatt 9556644  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  9556643 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 5756832 - 5756971
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  5756832 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 5756930  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtt 163  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5756931 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagtt 5756971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 22634398 - 22634525
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||||| |    
T  22634398 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 22634497  T
Q  204 ttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  22634498 ttgcatgcgtctgaataagttgatgatg 22634525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 14757295 - 14757507
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  14757295 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 14757394  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || |||    
T  14757395 gcatt-acttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaac 14757493  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  14757494 taagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 4561228 - 4561419
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  4561228 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 4561326  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| | ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  4561327 gaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45938381 - 45938152
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattata-aagtgaattatggatt-g 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||| | ||  |||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  || |||| |||||||| |    
T  45938381 aggaactttaggtgctaatgagacctattagaaatgatgactatgaactgtgaagattttacgaactgttaagagataattgaaatgaaatatggatttg 45938282  T
Q  99 attgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    ||||  || |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||    
T  45938281 attgcctt-acttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaa 45938185  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||| | ||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  45938184 ctaagatgcatgtctatgtataagctgatgatg 45938152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10712977 - 10712874
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  10712977 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10712882  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  10712881 gcatgagt 10712874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10926747 - 10926644
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  10926747 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 10926652  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  10926651 gcatgagt 10926644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33742589 - 33742468
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  33742589 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 33742491  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    ||||||||| | | |||||||||    
T  33742490 gaatgatcagggagttgttgaaa 33742468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 14954149 - 14954252
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  14954149 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 14954244  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  14954245 gcatgagt 14954252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25689994 - 25689891
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  25689994 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 25689899  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  25689898 gcatgagt 25689891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27534258 - 27534047
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||   |||| || ||||  |||||||||||| |   |||||| |||||  |||||| |||| |||| |||||||||    
T  27534258 gaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattg 27534159  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||   ||||| ||||  ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  27534158 ca-ttacttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaact 27534060  T
Q  201 atgttgcatgagt 213  Q
    | |||||||||||    
T  27534059 aagttgcatgagt 27534047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609405
Alignment:
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataagttgacgatg 18609405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 43256041 - 43256119
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  43256041 taggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 43256119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12487835 - 12487732
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||    
T  12487835 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgacatgaattgattatgctgtaattgttgttaaactaagtt 12487740  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  12487739 gcatgagt 12487732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 18609219 - 18609290
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaaga-tattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattat 80  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18609219 taggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagc-tttatgaattgttaagtgattat 18609290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18232 - 18461
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18232 aggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgat 18331  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  18332 tgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 18431  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaa-taagttgatga 229  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18432 aagttgcatgagtctgaattaagttgatga 18461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23438 - 23219
Alignment:
Q  13 tactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttg 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23438 tactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttg 23339  T
Q  113 aattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||| ||||||    
T  23338 aattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaactatgtttcatgag 23239  T
Q  213 tatgaa-taagttgatgatg 231  Q
    | |||| || ||||||||||    
T  23238 tctgaattacgttgatgatg 23219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 228253 - 228475
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  228253 taggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgcattta 228352  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  228353 cttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 228452  T
Q  209 tgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  228453 tgagtctgaataagttgatgatg 228475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5872 - 6102
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  5872 aggaactttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattgaa 5970  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  5971 atatacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 6070  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6071 taagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 6102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10137 - 9907
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  10137 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 10038  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  10037 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 9938  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9937 aagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 173524 - 173295
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||  ||| |||||||    
T  173524 aggaactttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgat 173425  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  173424 tgcatt-acttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 173326  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  173325 aagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 173295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23187301 - 23187079
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23187301 taggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattta 23187202  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| |   |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||    
T  23187201 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttcca 23187102  T
Q  209 tgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23187101 tgagtatgaataagttgatgatg 23187079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23598564 - 23598342
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23598564 taggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattta 23598465  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| |   |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||    
T  23598464 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttcca 23598365  T
Q  209 tgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23598364 tgagtatgaataagttgatgatg 23598342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 22461083 - 22461289
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22461083 acctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtt 22461182  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatg-aataa 221  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22461183 gattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataa 22461281  T
Q  222 gttgatga 229  Q
    ||||||||    
T  22461282 gttgatga 22461289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19928374 - 19928604
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||| | |||||| || |||| |||||||||||    
T  19928374 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattgat 19928473  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  19928474 tgtctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 19928573  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  19928574 aagttgcatgtttatgaataatctgatgatg 19928604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27263507 - 27263276
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  27263507 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagcttt-acggattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaa 27263409  T
Q  101 -tgtatttacttgaatt-attgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
     | || || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27263408 atatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaa 27263309  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27263308 ctaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 27263276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18855333 - 18855561
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||| |||| | ||||    
T  18855333 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtgat 18855432  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  18855433 tgcctttacttgaattattgttaattgatcaag-aattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaact 18855531  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  18855532 aagttgcatg-ttatgaataaactgatgatg 18855561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24735637 - 24735415
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  24735637 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 24735538  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
     | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  24735537 cgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 24735439  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  24735438 ctaagttgcatgagtctgaataag 24735415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 61049 - 60820
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||     
T  61049 aggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagcttt-atgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaa 60951  T
Q  101 -tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |   |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  60950 atatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtga-ttgattatgctgcaattgttattaaac 60852  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  60851 taagttgcatgaatatgaataagttgttgatg 60820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41667127 - 41666953
Alignment:
Q  58 tttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtta 156  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  41667127 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatgaattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgtta 41667028  T
Q  157 ttaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41667027 tttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 41666953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 19688630 - 19688780
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19688630 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 19688729  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgt 154  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19688730 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgt 19688780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26125415 - 26125212
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  26125415 acctattaaagataatgatcaagaactgtgaagcttt-atggattgttaaatgattatgaagtgaattatggatttaattatacttacttgaattgttgt 26125317  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttatt-aagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaata 220  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  26125316 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttt-atgtgatttgattatg-----cttgttatttaactaagttgcatgattatgaata 26125223  T
Q  221 agttgatgatg 231  Q
    |||||||||||    
T  26125222 agttgatgatg 26125212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 41530904 - 41531089
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  41530904 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 41531002  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41531003 gaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 41531089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31345005 - 31344881
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || || ||||| |||    
T  31345005 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagtt 31344907  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31344906 gcatgagtatgaataagttgatgatg 31344881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 10101518 - 10101730
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  10101518 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 10101617  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  10101618 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 10101716  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  10101717 taagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27602008 - 27601871
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  27602008 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 27601910  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27601909 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 27601871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24649569 - 24649378
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  24649569 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 24649471  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  24649470 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 27379327 - 27379518
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  27379327 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttactttaattattatt 27379425  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| | || |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27379426 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 27383373 - 27383564
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  27383373 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttactttaattattatt 27383471  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| | || |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27383472 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 12901406 - 12901543
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  12901406 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 12901504  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12901505 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag 12901543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 24628373 - 24628510
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  24628373 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattg-cttgaattattatt 24628471  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  24628472 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 24628510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 30344973 - 30345076
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  30344973 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 30345068  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  30345069 gcatgagt 30345076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1283513 - 1283410
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||    
T  1283513 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatctaagtt 1283418  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  1283417 gcatgagt 1283410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15477815 - 15477711
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  15477815 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 15477717  T
Q  123 gaatga 128  Q
    ||||||    
T  15477716 gaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 25961510 - 25961559
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  25961510 ttacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgtt 25961559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18588 - 18358
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  18588 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactgat 18489  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||  |||| || ||||    
T  18488 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaact 18389  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18388 aagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 3
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  163 aggaactttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 64  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  63 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaag 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 9545 - 9768
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  9545 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcattta 9644  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgtt-gaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgc 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||  | |||||||||||    
T  9645 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaactatgttgc 9744  T
Q  208 atgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  9745 atgagtctaaataagttgatgatg 9768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18735
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  18505 ggaactttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 18604  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || | |    
T  18605 gca-ttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacc 18703  T
Q  200 tatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18704 taagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 18735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 64087 - 63858
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  64087 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgat 63988  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  63987 tgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 63888  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  63887 aagttgcatg-ttatgaataagctgatgatg 63858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 75961 - 75742
Alignment:
Q  11 ggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttact 110  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| || |||| ||||||| |||||  ||||||    
T  75961 ggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggatagattgcctttact 75862  T
Q  111 tgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatg 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| || |  |||| || ||||| ||||||||    
T  75861 tgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgcatg 75762  T
Q  211 agtatgaataagttgatgatg 231  Q
      |||||||||| ||||||||    
T  75761 -ttatgaataagctgatgatg 75742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 2547 - 2775
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||  ||| |||||||||    
T  2547 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattg 2646  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
     | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||| |||| |||||  | ||||    
T  2647 ga-ttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaact 2744  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2745 aagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 77065 - 77273
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  77065 acctattaaagataatgattatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgt 77163  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  77164 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 77263  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  77264 gttgatgatg 77273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13136 - 12907
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  13136 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 13037  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| | |  |||||  | ||||    
T  13036 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaact 12938  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12937 aagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 62472 - 62264
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat-tgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||    
T  62472 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgt 62374  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  62373 tgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 62274  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  62273 gttgatgatg 62264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19397 - 19191
Alignment:
Q  26 tattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaa 125  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  19397 tatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttactttaattattattgaa 19299  T
Q  126 tgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagt 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| | |  |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19298 tgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagt 19199  T
Q  224 tgatgatg 231  Q
    ||||||||    
T  19198 tgatgatg 19191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 66287 - 66509
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  66287 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 66386  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  66387 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 66485  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  66486 ctaagttgcatgagtctgaataag 66509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53799 - 53577
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  53799 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 53700  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||  | ||    
T  53699 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 53601  T
Q  199 ctatgttgcatgagtatgaataag 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  53600 ctaagttgcatgagtctgaataag 53577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 36068 - 36171
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  36068 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 36163  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  36164 gcatgagt 36171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9654 - 9424
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||| |||||| || |||| |||| ||||||    
T  9654 aggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattgat 9555  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || | |||||| |||||  ||||  |||| || ||||    
T  9554 tgcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaact 9455  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9454 aagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8677 - 8503
Alignment:
Q  58 tttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtta 156  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  8677 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgtta 8578  T
Q  157 ttaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8577 tttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 8503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15821 - 15647
Alignment:
Q  58 tttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtta 156  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  15821 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgtta 15722  T
Q  157 ttaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15721 tttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 15647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 579 - 372
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||                 
T  579 taggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagc-tttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga------------- 494  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgca 208  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||    
T  493 -ttgaattattgttgaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgca 395  T
Q  209 tgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  394 tgattatgaataagttgatgatg 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2088 - 1880
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 121  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  2088 acctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaattctggattgaattatacttacttgaattgttgt 1990  T
Q  122 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataa 221  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1989 tgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaagttgcatgattatgaataa 1890  T
Q  222 gttgatgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  1889 gttgatgatg 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9512 - 9338
Alignment:
Q  58 tttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg-tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgtta 156  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  9512 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatcctacttacttgagttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgtta 9413  T
Q  157 ttaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    || |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9412 tttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36539 - 36310
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36539 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattgat 36440  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||   ||||   |||| ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || || |    
T  36439 tgccattacccaaattgttgttaattgatcaag-aattgttaagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaatt 36341  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  36340 aagttgcatgtttatgaataaactgatgatg 36310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 139944 - 139715
Alignment:
Q  1 aggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||    
T  139944 aggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtgat 139845  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact 200  Q
    ||  |||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||    
T  139844 tgcctttactcgaattattgattattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 139746  T
Q  201 atgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    | ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  139745 aagttgcatgtttatgaataaactgatgatg 139715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 71180 - 71072
Alignment:
Q  116 tattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtat 215  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||      |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  71180 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtat 71088  T
Q  216 gaataagttgatgatg 231  Q
    ||||| ||||||||||    
T  71087 gaatatgttgatgatg 71072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 71539 - 71461
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  71539 taggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtga 71461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 80463 - 80300
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttg 165  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||    
T  80463 tgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaacttg 80364  T
Q  166 atgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  80363 atgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 65422 - 65613
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  65422 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 65520  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  65521 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 61506 - 61697
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  61506 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 61604  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  61605 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 80945 - 80736
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| ||||  |||||||    
T  80945 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgatt 80846  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaacta 201  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  80845 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagatgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacta 80748  T
Q  202 tgttgcatgagt 213  Q
     |||||||||||    
T  80747 agttgcatgagt 80736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15499 - 15341
Alignment:
Q  74 tgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgat 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15499 tgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttggatgatcaagaaactaatgagaatgatttgttatttaacttgatgtgat 15400  T
Q  173 ttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15399 ttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcataattatgaataagttgatgatg 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16762
Alignment:
Q  82 aagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattat 180  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  16615 aagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatatgatttgattat 16714  T
Q  181 gttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatg 228  Q
    | |||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  16715 gctgcaattgttatttaactaagtcgcatgattatgaataagttgatg 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 80712 - 80876
Alignment:
Q  67 tgttaagtgattataaagtgaa-ttatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagttt 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  ||    
T  80712 tgttaaatgattatgaagtgaaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaactt 80811  T
Q  165 gatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  80812 gatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 21448 - 21584
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||     
T  21448 taggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtatt- 21546  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21547 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 21584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 4995 - 5186
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  4995 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 5093  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagt 213  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||  |||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5094 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 180
Target Start/End: Original strand, 13367 - 13539
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtattta 108  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||    
T  13367 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tta 13465  T
Q  109 cttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagt--ttgatgtgatttgattat 180  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||   ||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  13466 ctttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattat 13539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 10458 - 10589
Alignment:
Q  3 gaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 102  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10458 gaactttaagtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattg 10557  T
Q  103 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaa 135  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10558 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31012 - 30890
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||| || ||||| |||    
T  31012 ttactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagtt 30914  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30913 gcatgagtatgaataagttgatga 30890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 58613 - 58750
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  58613 acctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattatt 58711  T
Q  123 gaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  58712 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaag 58750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6808 - 6684
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||    
T  6808 ttactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 6710  T
Q  206 gcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6709 gcatgagtatgaataagttcatgatg 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 20479 - 20566
Alignment:
Q  144 aaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20479 aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 20566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 3748 - 3960
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||   |||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  3748 ggaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 3847  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  3848 gcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 3946  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || |||||||||||    
T  3947 taagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 11483 - 11586
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  11483 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 11578  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  11579 gcatgagt 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 14069 - 14172
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  14069 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagtt 14164  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  14165 gcatgagt 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12655 - 12443
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgatt 101  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||  | |||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  12655 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12556  T
Q  102 gtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaac 199  Q
    | | |||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  12555 gca-ttacttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 12457  T
Q  200 tatgttgcatgagt 213  Q
    || ||| |||||||    
T  12456 taagttacatgagt 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Original strand, 902 - 1009
Alignment:
Q  23 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgtt 122  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  902 acctattaaagataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattatt 1000  T
Q  123 gaatgatca 131  Q
    |||||||||    
T  1001 gaatgatca 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Original strand, 207883 - 207951
Alignment:
Q  163 ttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgttgcatgagtatgaataagttgatgatg 231  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  207883 ttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 433
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaa 198  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  521 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaa 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 32642 - 32745
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaactatgtt 205  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||    
T  32642 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-taaattgttattaagcttgacatgaattgattatgctgtaattgttgttaaactaagtt 32737  T
Q  206 gcatgagt 213  Q
    ||||||||    
T  32738 gcatgagt 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 1362 - 1505
Alignment:
Q  2 ggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgat 100  Q
    |||||| ||| || |||||  ||||||| ||||| || |||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  || | ||    
T  1362 ggaactttagttagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataat 1461  T
Q  101 tgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaa 145  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1462 tgcatt-acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 247
Alignment:
Q  49 tgtgaagcttttacgaaatgttaagt-gattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaat 147  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||  || | |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  357 tgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcatt-acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaat 259  T
Q  148 gatttgttatta 159  Q
    || ||| |||||    
T  258 gaattgatatta 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 575 - 471
Alignment:
Q  106 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgtttttaaact-atgt 204  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||  ||||| || |||| | ||    
T  575 ttacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaa-tgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgctattgttatttaactaaagt 480  T
Q  205 tgcatgagt 213  Q
    |||||||||    
T  479 tgcatgagt 471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1730 - 1605
Alignment:
Q  9 taggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtattt 107  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| |||| |||     
T  1730 taggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt- 1632  T
Q  108 acttgaattattgttgaatgatcaaga 134  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1631 acttgaaatattattgaatgatcaaga 1605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6996 times since January 2019
Visitors: 5773