View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0829_high_27 (Length: 409)

Name: NF0829_high_27
Description: NF0829
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0829_high_27
NF0829_high_27
[»] chr6 (94 HSPs)
chr6 (97-405)||(16455398-16455706)
chr6 (98-391)||(3027839-3028132)
chr6 (97-384)||(17012075-17012360)
chr6 (98-391)||(19696475-19696768)
chr6 (100-391)||(22857940-22858230)
chr6 (102-382)||(13057229-13057512)
chr6 (128-391)||(15719708-15719970)
chr6 (102-382)||(3631936-3632217)
chr6 (102-382)||(32280031-32280314)
chr6 (102-382)||(3390414-3390697)
chr6 (102-382)||(13039789-13040072)
chr6 (101-382)||(9019960-9020243)
chr6 (102-382)||(1230246-1230528)
chr6 (102-382)||(28241318-28241600)
chr6 (132-391)||(15367101-15367358)
chr6 (165-388)||(26945245-26945469)
chr6 (127-382)||(11983026-11983282)
chr6 (102-382)||(4816228-4816510)
chr6 (102-382)||(30967236-30967518)
chr6 (167-382)||(12186068-12186283)
chr6 (106-382)||(14458764-14459040)
chr6 (102-382)||(25477309-25477599)
chr6 (127-382)||(3629862-3630117)
chr6 (102-382)||(19704564-19704848)
chr6 (165-402)||(28037702-28037943)
chr6 (101-382)||(14507173-14507455)
chr6 (102-382)||(20915353-20915635)
chr6 (131-391)||(25078545-25078802)
chr6 (101-382)||(30034600-30034883)
chr6 (102-382)||(2628883-2629164)
chr6 (102-382)||(15541137-15541419)
chr6 (183-370)||(1069727-1069913)
chr6 (127-384)||(26932557-26932815)
chr6 (102-354)||(15532706-15532960)
chr6 (127-324)||(15530177-15530375)
chr6 (102-384)||(12195510-12195794)
chr6 (179-384)||(5273211-5273414)
chr6 (127-382)||(30728821-30729081)
chr6 (212-384)||(33309007-33309175)
chr6 (102-382)||(26065021-26065298)
chr6 (102-382)||(26084990-26085267)
chr6 (212-382)||(29754706-29754873)
chr6 (258-391)||(25465578-25465710)
chr6 (212-384)||(26066119-26066288)
chr6 (212-384)||(33311276-33311444)
chr6 (111-324)||(20526855-20527066)
chr6 (207-391)||(12937181-12937364)
chr6 (251-391)||(15346535-15346673)
chr6 (102-381)||(24338446-24338727)
chr6 (102-354)||(3233754-3234010)
chr6 (212-384)||(26068390-26068559)
chr6 (268-391)||(12911433-12911555)
chr6 (188-319)||(22490765-22490896)
chr6 (143-382)||(14466399-14466641)
chr6 (264-391)||(28078182-28078308)
chr6 (268-371)||(30445729-30445832)
chr6 (102-271)||(19227514-19227687)
chr6 (205-400)||(11262598-11262795)
chr6 (102-312)||(12161622-12161834)
chr6 (268-324)||(3833481-3833538)
chr6 (100-255)||(11138338-11138499)
chr6 (304-383)||(7294035-7294114)
chr6 (308-383)||(30443532-30443607)
chr6 (308-382)||(25941780-25941854)
chr6 (308-397)||(17038345-17038434)
chr6 (309-397)||(13878838-13878926)
chr6 (309-397)||(16786030-16786118)
chr6 (128-199)||(15346445-15346515)
chr6 (281-390)||(22870090-22870197)
chr6 (102-171)||(32447524-32447595)
chr6 (308-382)||(3577487-3577560)
chr6 (301-383)||(10584233-10584314)
chr6 (309-391)||(13883586-13883668)
chr6 (308-382)||(17694849-17694923)
chr6 (308-382)||(25465896-25465970)
chr6 (309-391)||(35201315-35201397)
chr6 (308-382)||(13467464-13467537)
chr6 (107-176)||(17904565-17904632)
chr6 (308-382)||(22342798-22342872)
chr6 (335-397)||(26887209-26887271)
chr6 (101-236)||(30443336-30443468)
chr6 (308-382)||(33215938-33216012)
chr6 (205-257)||(5165936-5165987)
chr6 (102-175)||(1072081-1072156)
chr6 (304-379)||(24501449-24501524)
chr6 (101-150)||(8995513-8995563)
chr6 (308-382)||(22351850-22351923)
chr6 (100-193)||(30445553-30445644)
chr6 (127-175)||(4595056-4595102)
chr6 (107-176)||(22352060-22352127)
chr6 (350-391)||(26455145-26455186)
chr6 (331-379)||(5757524-5757571)
chr6 (100-176)||(19702070-19702144)
chr6 (109-176)||(24542882-24542946)
[»] chr4 (133 HSPs)
chr4 (102-382)||(19322751-19323031)
chr4 (98-383)||(18537469-18537753)
chr4 (98-391)||(8756238-8756532)
chr4 (128-391)||(18534819-18535082)
chr4 (127-391)||(38890212-38890476)
chr4 (97-391)||(28453737-28454029)
chr4 (102-382)||(36378346-36378629)
chr4 (102-399)||(15032526-15032815)
chr4 (98-391)||(47150880-47151171)
chr4 (167-386)||(12102209-12102429)
chr4 (102-382)||(8631416-8631698)
chr4 (102-382)||(40637128-40637410)
chr4 (102-382)||(48486373-48486655)
chr4 (195-400)||(16185813-16186018)
chr4 (105-382)||(9148310-9148588)
chr4 (102-382)||(24880505-24880788)
chr4 (102-382)||(22802731-22803013)
chr4 (102-382)||(24348272-24348554)
chr4 (102-382)||(24888850-24889132)
chr4 (102-354)||(37313089-37313345)
chr4 (99-399)||(10112924-10113224)
chr4 (102-380)||(12395844-12396124)
chr4 (127-381)||(22780371-22780626)
chr4 (127-382)||(36380429-36380686)
chr4 (102-382)||(24879043-24879326)
chr4 (102-382)||(36921490-36921773)
chr4 (102-382)||(38928174-38928457)
chr4 (101-391)||(9863764-9864058)
chr4 (102-382)||(14633373-14633654)
chr4 (102-382)||(22044388-22044669)
chr4 (102-382)||(22046683-22046964)
chr4 (102-382)||(22800859-22801141)
chr4 (102-382)||(37089369-37089650)
chr4 (102-380)||(12400806-12401086)
chr4 (101-382)||(2484870-2485152)
chr4 (127-354)||(13544039-13544268)
chr4 (102-382)||(19095936-19096219)
chr4 (102-382)||(36919581-36919864)
chr4 (102-370)||(16453363-16453634)
chr4 (179-399)||(31983507-31983727)
chr4 (127-384)||(41997572-41997830)
chr4 (102-382)||(47274781-47275061)
chr4 (179-382)||(16455376-16455578)
chr4 (179-382)||(17662242-17662443)
chr4 (102-400)||(18409326-18409626)
chr4 (102-384)||(18709159-18709442)
chr4 (127-381)||(22782736-22782991)
chr4 (102-382)||(11006234-11006516)
chr4 (102-382)||(11435009-11435290)
chr4 (102-382)||(33415485-33415766)
chr4 (102-382)||(40091412-40091694)
chr4 (97-337)||(40998990-40999231)
chr4 (102-381)||(44599836-44600117)
chr4 (127-382)||(26085974-26086229)
chr4 (127-382)||(38409285-38409540)
chr4 (102-382)||(18847207-18847488)
chr4 (165-383)||(25357757-25357980)
chr4 (102-382)||(51015300-51015581)
chr4 (102-382)||(7941375-7941659)
chr4 (179-382)||(6764979-6765180)
chr4 (102-384)||(22132387-22132669)
chr4 (135-382)||(30136640-30136886)
chr4 (224-382)||(4215486-4215642)
chr4 (127-384)||(16934138-16934396)
chr4 (102-382)||(5198474-5198756)
chr4 (106-382)||(47868459-47868737)
chr4 (102-384)||(9174141-9174425)
chr4 (102-382)||(11008565-11008845)
chr4 (102-382)||(14787426-14787710)
chr4 (102-382)||(31849596-31849878)
chr4 (127-384)||(16931784-16932042)
chr4 (102-382)||(619445-619726)
chr4 (127-326)||(3824622-3824823)
chr4 (102-384)||(22134613-22134894)
chr4 (102-373)||(56030498-56030768)
chr4 (188-382)||(2891435-2891628)
chr4 (149-379)||(3982175-3982413)
chr4 (102-384)||(9176469-9176753)
chr4 (102-312)||(5637530-5637744)
chr4 (100-344)||(9022360-9022605)
chr4 (192-383)||(13547302-13547491)
chr4 (102-370)||(47210761-47211019)
chr4 (240-382)||(5635473-5635613)
chr4 (130-382)||(27499128-27499378)
chr4 (240-382)||(11437559-11437698)
chr4 (268-388)||(3578662-3578780)
chr4 (102-391)||(10114387-10114663)
chr4 (165-391)||(22295278-22295511)
chr4 (281-383)||(26557822-26557923)
chr4 (102-300)||(52942536-52942725)
chr4 (246-382)||(5101131-5101264)
chr4 (103-262)||(6132927-6133090)
chr4 (102-272)||(3937314-3937488)
chr4 (195-382)||(5336777-5336964)
chr4 (308-382)||(4884985-4885059)
chr4 (308-382)||(8529378-8529452)
chr4 (308-382)||(31300535-31300608)
chr4 (308-397)||(15831252-15831341)
chr4 (102-382)||(53405184-53405469)
chr4 (309-392)||(11853660-11853743)
chr4 (100-194)||(52043567-52043659)
chr4 (308-382)||(18587077-18587151)
chr4 (308-382)||(36769590-36769664)
chr4 (101-176)||(54906630-54906703)
chr4 (268-324)||(54928702-54928758)
chr4 (311-382)||(4556057-4556128)
chr4 (129-175)||(24446788-24446835)
chr4 (102-175)||(38270190-38270265)
chr4 (308-382)||(15312427-15312501)
chr4 (308-382)||(15317069-15317142)
chr4 (308-382)||(16688937-16689011)
chr4 (308-382)||(36771507-36771581)
chr4 (107-176)||(36771302-36771370)
chr4 (205-257)||(25699759-25699810)
chr4 (309-393)||(55822376-55822459)
chr4 (331-402)||(10047360-10047430)
chr4 (109-176)||(36769387-36769453)
chr4 (331-402)||(39245975-39246045)
chr4 (331-402)||(54867165-54867234)
chr4 (107-173)||(4558217-4558282)
chr4 (308-382)||(4558422-4558495)
chr4 (308-382)||(4570205-4570278)
chr4 (107-381)||(16638733-16639011)
chr4 (102-150)||(2891371-2891420)
chr4 (102-150)||(6764893-6764942)
chr4 (333-382)||(14789425-14789473)
chr4 (128-176)||(26557666-26557712)
chr4 (101-142)||(29609681-29609722)
chr4 (107-176)||(47566399-47566467)
chr4 (205-257)||(4556180-4556231)
chr4 (306-382)||(6133098-6133173)
chr4 (205-257)||(16489359-16489410)
chr4 (205-257)||(47566503-47566554)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (99-389)||(20146597-20146887)
chr2 (102-402)||(11578084-11578383)
chr2 (97-391)||(17897233-17897525)
chr2 (131-382)||(18800310-18800559)
chr2 (128-382)||(22874137-22874389)
chr2 (179-391)||(40699430-40699643)
chr2 (105-381)||(35107279-35107553)
chr2 (102-382)||(13910042-13910323)
chr2 (102-382)||(19502008-19502290)
chr2 (127-354)||(45239001-45239229)
chr2 (133-382)||(6264145-6264396)
chr2 (102-382)||(19007616-19007898)
chr2 (102-382)||(42923506-42923788)
chr2 (102-382)||(19504343-19504624)
chr2 (102-382)||(28196613-28196893)
chr2 (102-382)||(23452234-23452516)
chr2 (102-382)||(40032050-40032337)
chr2 (179-382)||(43623577-43623778)
chr2 (127-382)||(45279981-45280237)
chr2 (102-382)||(6258814-6259094)
chr2 (98-381)||(43139352-43139632)
chr2 (101-382)||(44289064-44289348)
chr2 (102-382)||(22287333-22287615)
chr2 (102-382)||(27104775-27105055)
chr2 (102-382)||(42064491-42064773)
chr2 (103-382)||(11739556-11739838)
chr2 (121-382)||(34979574-34979838)
chr2 (102-382)||(42452759-42453038)
chr2 (102-382)||(21520690-21520972)
chr2 (102-391)||(31732765-31733044)
chr2 (179-382)||(5375343-5375543)
chr2 (102-381)||(35217961-35218242)
chr2 (127-382)||(14837275-14837526)
chr2 (102-300)||(15539552-15539754)
chr2 (212-382)||(36558861-36559028)
chr2 (212-382)||(36561138-36561305)
chr2 (102-381)||(35215584-35215865)
chr2 (102-382)||(17848419-17848698)
chr2 (182-382)||(28459187-28459385)
chr2 (235-382)||(22407451-22407596)
chr2 (102-382)||(3022139-3022430)
chr2 (179-324)||(17849174-17849319)
chr2 (212-381)||(45332179-45332345)
chr2 (107-383)||(35028561-35028833)
chr2 (135-383)||(27136126-27136368)
chr2 (218-391)||(13828329-13828503)
chr2 (195-324)||(20589763-20589893)
chr2 (102-382)||(24162220-24162491)
chr2 (128-391)||(37962929-37963187)
chr2 (248-373)||(7462953-7463077)
chr2 (205-324)||(15693985-15694106)
chr2 (205-383)||(17921780-17921956)
chr2 (212-391)||(33604011-33604190)
chr2 (332-391)||(8173539-8173598)
chr2 (143-237)||(27583479-27583573)
chr2 (179-262)||(38414196-38414278)
chr2 (333-391)||(20592288-20592346)
chr2 (309-397)||(39687094-39687182)
chr2 (309-391)||(39680156-39680238)
chr2 (309-397)||(2736316-2736404)
chr2 (297-395)||(10942493-10942593)
chr2 (297-395)||(10948362-10948462)
chr2 (309-397)||(17462547-17462635)
chr2 (309-397)||(45679834-45679922)
chr2 (258-382)||(22707748-22707872)
chr2 (312-383)||(34575132-34575203)
chr2 (311-382)||(38191126-38191197)
chr2 (292-379)||(39287262-39287349)
chr2 (308-382)||(12781218-12781292)
chr2 (308-382)||(27517636-27517710)
chr2 (308-397)||(33670949-33671038)
chr2 (205-323)||(41303088-41303206)
chr2 (309-397)||(2741052-2741140)
chr2 (205-382)||(17943547-17943720)
chr2 (331-402)||(13569309-13569379)
chr2 (102-175)||(22407613-22407688)
chr2 (331-382)||(30479128-30479179)
chr2 (101-176)||(34575323-34575397)
chr2 (102-175)||(38020178-38020253)
chr2 (100-178)||(39287186-39287262)
chr2 (101-175)||(41304596-41304668)
chr2 (288-382)||(22163019-22163111)
chr2 (205-257)||(28458949-28459001)
chr2 (331-402)||(14699053-14699123)
chr2 (308-382)||(20050018-20050093)
chr2 (331-382)||(20054762-20054813)
chr2 (331-402)||(20522201-20522271)
chr2 (264-338)||(23870958-23871031)
chr2 (290-324)||(41304502-41304536)
chr2 (99-140)||(20146987-20147028)
chr2 (179-255)||(26345661-26345738)
chr2 (331-379)||(1345587-1345634)
chr2 (205-257)||(2736215-2736266)
chr2 (205-257)||(2740951-2741002)
chr2 (331-379)||(2838076-2838123)
chr2 (333-397)||(2869741-2869804)
chr2 (102-172)||(5377636-5377708)
chr2 (331-383)||(15697240-15697292)
chr2 (109-176)||(30261981-30262045)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (106-391)||(15808-16093)
[»] chr1 (119 HSPs)
chr1 (106-391)||(42922238-42922523)
chr1 (102-383)||(14183588-14183867)
chr1 (102-391)||(8347261-8347550)
chr1 (98-383)||(15669390-15669674)
chr1 (102-391)||(18800561-18800850)
chr1 (102-402)||(13125435-13125737)
chr1 (102-391)||(8349040-8349329)
chr1 (102-382)||(10399827-10400109)
chr1 (106-382)||(17186126-17186405)
chr1 (127-382)||(9241084-9241341)
chr1 (102-382)||(50076671-50076953)
chr1 (102-382)||(50078819-50079102)
chr1 (102-382)||(51750039-51750321)
chr1 (102-382)||(13215081-13215368)
chr1 (101-382)||(17324635-17324918)
chr1 (102-382)||(12302504-12302786)
chr1 (102-382)||(16428653-16428936)
chr1 (127-382)||(39462545-39462801)
chr1 (102-382)||(18839587-18839870)
chr1 (127-382)||(50307545-50307802)
chr1 (179-391)||(16561547-16561760)
chr1 (100-384)||(27916498-27916782)
chr1 (102-382)||(28840680-28840961)
chr1 (102-382)||(6756527-6756810)
chr1 (102-382)||(17318893-17319169)
chr1 (101-382)||(31735520-31735803)
chr1 (102-382)||(15294833-15295115)
chr1 (102-382)||(15823546-15823828)
chr1 (102-382)||(18307109-18307391)
chr1 (102-382)||(25127872-25128155)
chr1 (102-382)||(40133944-40134227)
chr1 (102-384)||(9459414-9459698)
chr1 (102-382)||(31425014-31425300)
chr1 (101-381)||(16226166-16226448)
chr1 (102-382)||(6823015-6823296)
chr1 (102-382)||(6995699-6995981)
chr1 (165-402)||(30738605-30738845)
chr1 (102-382)||(47906270-47906552)
chr1 (127-382)||(3579616-3579871)
chr1 (102-384)||(9463241-9463525)
chr1 (102-382)||(24325664-24325945)
chr1 (179-382)||(6115101-6115303)
chr1 (128-382)||(49495209-49495461)
chr1 (102-382)||(11457474-11457756)
chr1 (141-382)||(17324103-17324346)
chr1 (98-391)||(26520109-26520401)
chr1 (102-382)||(27336939-27337219)
chr1 (102-382)||(46431705-46431988)
chr1 (179-382)||(25248550-25248752)
chr1 (102-370)||(2617516-2617786)
chr1 (189-382)||(16429048-16429240)
chr1 (102-382)||(25251273-25251556)
chr1 (127-382)||(38925480-38925733)
chr1 (106-382)||(41646924-41647202)
chr1 (102-382)||(2949231-2949512)
chr1 (102-354)||(4131401-4131660)
chr1 (127-382)||(14097968-14098225)
chr1 (127-382)||(2510324-2510579)
chr1 (165-391)||(26613228-26613455)
chr1 (165-390)||(30790391-30790615)
chr1 (102-382)||(13761837-13762118)
chr1 (102-338)||(21948230-21948468)
chr1 (102-382)||(28842495-28842776)
chr1 (102-381)||(47179713-47179993)
chr1 (212-384)||(23785954-23786123)
chr1 (102-319)||(31422933-31423155)
chr1 (102-382)||(39932073-39932356)
chr1 (102-382)||(20291457-20291738)
chr1 (102-382)||(28998252-28998534)
chr1 (102-382)||(29003968-29004250)
chr1 (179-382)||(16432475-16432678)
chr1 (102-324)||(48665177-48665403)
chr1 (109-383)||(28279277-28279552)
chr1 (102-382)||(20302459-20302740)
chr1 (102-382)||(27339130-27339411)
chr1 (270-383)||(15916562-15916675)
chr1 (102-381)||(47177362-47177642)
chr1 (205-373)||(47451749-47451915)
chr1 (102-382)||(28207067-28207347)
chr1 (240-382)||(23816028-23816168)
chr1 (179-371)||(16231644-16231834)
chr1 (102-354)||(31489915-31490167)
chr1 (285-402)||(13127665-13127782)
chr1 (180-359)||(155788-155966)
chr1 (207-382)||(51752473-51752645)
chr1 (179-382)||(50248569-50248772)
chr1 (102-295)||(6823885-6824089)
chr1 (190-382)||(51757623-51757812)
chr1 (102-225)||(13127787-13127910)
chr1 (112-367)||(14352970-14353233)
chr1 (101-226)||(26332715-26332837)
chr1 (269-337)||(43104332-43104400)
chr1 (308-397)||(9526577-9526666)
chr1 (215-382)||(46783163-46783331)
chr1 (205-382)||(21353345-21353518)
chr1 (331-397)||(2232724-2232790)
chr1 (308-397)||(9521826-9521915)
chr1 (102-175)||(47451648-47451723)
chr1 (331-402)||(47703982-47704052)
chr1 (308-382)||(2393280-2393353)
chr1 (308-382)||(2401218-2401292)
chr1 (308-382)||(4144680-4144754)
chr1 (308-382)||(14997153-14997227)
chr1 (100-169)||(32261036-32261103)
chr1 (313-382)||(13358787-13358855)
chr1 (309-402)||(13598379-13598471)
chr1 (180-255)||(26332613-26332688)
chr1 (331-402)||(47102887-47102957)
chr1 (290-324)||(8213581-8213615)
chr1 (348-382)||(13785261-13785295)
chr1 (329-379)||(37069774-37069823)
chr1 (107-176)||(3091314-3091382)
chr1 (107-257)||(4144804-4144958)
chr1 (268-324)||(10115948-10116003)
chr1 (331-379)||(19072932-19072979)
chr1 (331-379)||(19120822-19120869)
chr1 (331-379)||(26644943-26644990)
chr1 (355-391)||(43104443-43104479)
chr1 (101-176)||(49959041-49959114)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (102-391)||(1629-1910)
[»] chr7 (117 HSPs)
chr7 (102-391)||(24817340-24817628)
chr7 (114-391)||(24813485-24813761)
chr7 (102-406)||(7188553-7188859)
chr7 (102-382)||(20137106-20137388)
chr7 (98-345)||(20091580-20091823)
chr7 (102-382)||(31435043-31435326)
chr7 (102-382)||(38393996-38394278)
chr7 (102-382)||(44724589-44724871)
chr7 (141-391)||(6332272-6332523)
chr7 (102-382)||(13099471-13099755)
chr7 (102-382)||(7471977-7472259)
chr7 (127-382)||(20299495-20299752)
chr7 (102-382)||(39145983-39146266)
chr7 (98-400)||(11081518-11081821)
chr7 (102-382)||(4295931-4296214)
chr7 (102-382)||(48457663-48457945)
chr7 (101-382)||(443604-443888)
chr7 (102-382)||(1849991-1850273)
chr7 (102-382)||(24748604-24748887)
chr7 (127-324)||(25276177-25276377)
chr7 (102-402)||(1049272-1049574)
chr7 (127-382)||(9679095-9679351)
chr7 (102-382)||(7470019-7470301)
chr7 (102-382)||(40946338-40946620)
chr7 (128-388)||(24465578-24465835)
chr7 (102-371)||(37412133-37412407)
chr7 (102-382)||(42330994-42331278)
chr7 (102-382)||(11355268-11355550)
chr7 (102-382)||(20297372-20297654)
chr7 (102-382)||(20626048-20626330)
chr7 (102-382)||(20629939-20630221)
chr7 (102-382)||(20642358-20642640)
chr7 (129-354)||(27832656-27832884)
chr7 (106-382)||(40836740-40837017)
chr7 (102-382)||(3878587-3878869)
chr7 (102-382)||(27306227-27306508)
chr7 (102-382)||(28487563-28487845)
chr7 (127-402)||(1046901-1047177)
chr7 (102-384)||(7351647-7351931)
chr7 (102-384)||(31155906-31156190)
chr7 (102-383)||(9680829-9681113)
chr7 (102-367)||(24258473-24258744)
chr7 (102-382)||(42223167-42223450)
chr7 (102-382)||(18345551-18345833)
chr7 (102-382)||(21678076-21678358)
chr7 (102-370)||(21680037-21680307)
chr7 (127-321)||(11757265-11757462)
chr7 (179-382)||(7092210-7092410)
chr7 (102-383)||(35639-35922)
chr7 (102-382)||(3035731-3036016)
chr7 (102-382)||(44574-44856)
chr7 (102-382)||(21592140-21592422)
chr7 (102-382)||(21990160-21990442)
chr7 (212-384)||(2935393-2935562)
chr7 (165-391)||(40281370-40281590)
chr7 (179-382)||(7094457-7094658)
chr7 (102-367)||(7349285-7349552)
chr7 (128-391)||(13290461-13290723)
chr7 (246-382)||(22393880-22394015)
chr7 (102-382)||(43253514-43253795)
chr7 (180-384)||(16297016-16297222)
chr7 (102-382)||(28485576-28485857)
chr7 (212-384)||(1606505-1606673)
chr7 (127-382)||(25542566-25542820)
chr7 (179-382)||(38396726-38396926)
chr7 (212-382)||(22137203-22137369)
chr7 (102-319)||(22828691-22828912)
chr7 (212-382)||(40552230-40552396)
chr7 (100-391)||(6048883-6049175)
chr7 (212-384)||(9027189-9027357)
chr7 (220-382)||(6046625-6046787)
chr7 (227-382)||(26295586-26295740)
chr7 (212-382)||(22108192-22108358)
chr7 (212-382)||(40549952-40550118)
chr7 (205-326)||(22251597-22251722)
chr7 (218-324)||(6348912-6349018)
chr7 (109-382)||(6067195-6067474)
chr7 (102-280)||(26804579-26804764)
chr7 (128-235)||(22392502-22392608)
chr7 (102-383)||(26210556-26210837)
chr7 (107-382)||(25356954-25357230)
chr7 (98-185)||(6348826-6348913)
chr7 (150-257)||(11084437-11084544)
chr7 (308-382)||(2075226-2075300)
chr7 (107-382)||(25351260-25351536)
chr7 (107-382)||(25410037-25410315)
chr7 (308-382)||(7464516-7464590)
chr7 (308-382)||(34546877-34546951)
chr7 (109-382)||(2120807-2121084)
chr7 (308-397)||(8378486-8378575)
chr7 (309-381)||(7069891-7069963)
chr7 (309-397)||(25405504-25405592)
chr7 (309-391)||(3320039-3320121)
chr7 (309-391)||(3324787-3324869)
chr7 (308-382)||(42006774-42006848)
chr7 (308-382)||(44010747-44010821)
chr7 (331-391)||(15540984-15541044)
chr7 (331-405)||(2990601-2990676)
chr7 (340-391)||(20091144-20091194)
chr7 (272-358)||(22280359-22280444)
chr7 (308-382)||(30247081-30247155)
chr7 (331-392)||(9190054-9190114)
chr7 (308-389)||(21369753-21369834)
chr7 (331-392)||(28617271-28617331)
chr7 (107-176)||(44016869-44016937)
chr7 (109-177)||(45366550-45366615)
chr7 (309-397)||(7074898-7074986)
chr7 (331-382)||(11759369-11759419)
chr7 (102-175)||(18567623-18567698)
chr7 (331-402)||(20284070-20284140)
chr7 (331-382)||(44016658-44016709)
chr7 (308-382)||(44143864-44143937)
chr7 (308-382)||(44512523-44512596)
chr7 (331-392)||(2580381-2580441)
chr7 (107-176)||(44010958-44011026)
chr7 (149-236)||(12310157-12310244)
chr7 (331-379)||(21983288-21983335)
[»] chr3 (161 HSPs)
chr3 (98-382)||(31151325-31151607)
chr3 (102-384)||(561767-562049)
chr3 (102-391)||(53597220-53597509)
chr3 (102-391)||(36871286-36871575)
chr3 (128-376)||(13420186-13420432)
chr3 (102-382)||(53917659-53917941)
chr3 (102-382)||(28761422-28761705)
chr3 (101-382)||(23633439-23633715)
chr3 (102-382)||(4308276-4308558)
chr3 (127-382)||(1313415-1313671)
chr3 (128-391)||(25635391-25635653)
chr3 (97-388)||(1673951-1674233)
chr3 (102-382)||(38890020-38890302)
chr3 (102-382)||(10956022-10956304)
chr3 (102-382)||(11170384-11170666)
chr3 (102-382)||(18099165-18099447)
chr3 (102-382)||(53915491-53915773)
chr3 (127-382)||(1321485-1321741)
chr3 (127-382)||(3314690-3314947)
chr3 (128-382)||(17795269-17795521)
chr3 (128-382)||(19103709-19103961)
chr3 (102-382)||(5926759-5927041)
chr3 (102-382)||(10958318-10958600)
chr3 (102-382)||(28101997-28102279)
chr3 (102-382)||(43421410-43421692)
chr3 (102-384)||(746737-747021)
chr3 (102-382)||(45882919-45883202)
chr3 (102-382)||(1626678-1626960)
chr3 (102-382)||(27101176-27101458)
chr3 (102-353)||(32264060-32264316)
chr3 (102-382)||(43228271-43228553)
chr3 (102-382)||(43423458-43423740)
chr3 (103-382)||(10084384-10084665)
chr3 (102-382)||(51727002-51727283)
chr3 (221-391)||(24181483-24181653)
chr3 (102-382)||(4103891-4104172)
chr3 (102-382)||(43226066-43226347)
chr3 (102-384)||(10621523-10621807)
chr3 (102-384)||(25388886-25389169)
chr3 (179-382)||(6484421-6484622)
chr3 (102-383)||(18162643-18162926)
chr3 (101-300)||(23637006-23637205)
chr3 (127-384)||(28413025-28413283)
chr3 (102-381)||(458264-458545)
chr3 (102-382)||(3859508-3859789)
chr3 (102-382)||(18096895-18097177)
chr3 (102-382)||(25533422-25533704)
chr3 (102-382)||(30005821-30006103)
chr3 (102-382)||(42990284-42990566)
chr3 (102-384)||(6063439-6063723)
chr3 (102-384)||(6065789-6066073)
chr3 (106-312)||(39715453-39715663)
chr3 (102-381)||(455887-456168)
chr3 (102-382)||(5191633-5191913)
chr3 (102-321)||(6561790-6562014)
chr3 (102-381)||(50493979-50494260)
chr3 (102-382)||(53468448-53468732)
chr3 (102-382)||(880446-880729)
chr3 (102-382)||(51943351-51943632)
chr3 (165-391)||(1620446-1620672)
chr3 (179-382)||(9604602-9604803)
chr3 (179-373)||(25688164-25688357)
chr3 (102-382)||(24979687-24979970)
chr3 (102-382)||(22114300-22114582)
chr3 (102-381)||(38210350-38210631)
chr3 (103-382)||(10191305-10191585)
chr3 (179-382)||(6231862-6232062)
chr3 (102-382)||(47148890-47149172)
chr3 (102-371)||(889779-890048)
chr3 (178-382)||(5899733-5899933)
chr3 (179-382)||(32219145-32219347)
chr3 (179-382)||(5522622-5522822)
chr3 (179-382)||(7606583-7606783)
chr3 (127-382)||(48361666-48361922)
chr3 (179-382)||(4666575-4666776)
chr3 (178-382)||(5886260-5886460)
chr3 (179-382)||(15780932-15781141)
chr3 (179-382)||(36011888-36012089)
chr3 (205-382)||(3306848-3307022)
chr3 (102-278)||(35777401-35777582)
chr3 (100-388)||(7768552-7768840)
chr3 (124-382)||(12267970-12268219)
chr3 (106-382)||(26720532-26720809)
chr3 (102-338)||(29956666-29956905)
chr3 (182-382)||(11168165-11168363)
chr3 (152-383)||(14634434-14634665)
chr3 (179-382)||(51674761-51674962)
chr3 (179-379)||(53591245-53591442)
chr3 (102-322)||(13419865-13420084)
chr3 (98-225)||(24177256-24177383)
chr3 (264-391)||(25634033-25634159)
chr3 (246-382)||(47701666-47701800)
chr3 (241-382)||(27635653-27635792)
chr3 (102-273)||(28100143-28100318)
chr3 (127-354)||(54691596-54691825)
chr3 (179-324)||(54884216-54884360)
chr3 (207-361)||(11007538-11007683)
chr3 (212-391)||(27420744-27420923)
chr3 (179-324)||(35917995-35918139)
chr3 (101-380)||(11066564-11066850)
chr3 (128-226)||(25633930-25634028)
chr3 (205-382)||(29913952-29914125)
chr3 (143-260)||(28137421-28137541)
chr3 (209-383)||(23941852-23942028)
chr3 (127-278)||(28181028-28181182)
chr3 (308-382)||(10612775-10612849)
chr3 (268-382)||(15823644-15823757)
chr3 (308-382)||(47878168-47878242)
chr3 (309-394)||(10094060-10094145)
chr3 (309-394)||(10100077-10100162)
chr3 (309-394)||(10200940-10201025)
chr3 (100-176)||(13893362-13893435)
chr3 (268-388)||(31021151-31021269)
chr3 (266-383)||(42992418-42992533)
chr3 (308-397)||(54193337-54193426)
chr3 (195-382)||(16996875-16997062)
chr3 (308-382)||(10897116-10897190)
chr3 (331-397)||(22625966-22626032)
chr3 (308-382)||(48390299-48390373)
chr3 (102-173)||(6231429-6231502)
chr3 (309-394)||(10207986-10208071)
chr3 (309-382)||(10595031-10595104)
chr3 (101-236)||(31021284-31021418)
chr3 (313-382)||(35919110-35919178)
chr3 (308-397)||(54188620-54188708)
chr3 (101-176)||(11072920-11072992)
chr3 (102-175)||(11163130-11163205)
chr3 (102-175)||(41849132-41849207)
chr3 (179-315)||(4560352-4560480)
chr3 (309-399)||(27544384-27544474)
chr3 (102-174)||(27635830-27635904)
chr3 (102-234)||(42992266-42992402)
chr3 (328-392)||(1417523-1417586)
chr3 (309-397)||(6303421-6303509)
chr3 (302-382)||(41849243-41849321)
chr3 (331-402)||(1736341-1736411)
chr3 (308-382)||(4535725-4535800)
chr3 (331-402)||(21711204-21711274)
chr3 (268-316)||(42297721-42297771)
chr3 (331-382)||(53894052-53894102)
chr3 (308-382)||(10949257-10949331)
chr3 (308-382)||(38002980-38003054)
chr3 (308-382)||(47882879-47882953)
chr3 (107-176)||(3329799-3329867)
chr3 (107-176)||(11079424-11079491)
chr3 (102-150)||(15780840-15780889)
chr3 (107-176)||(27762194-27762261)
chr3 (102-150)||(35918177-35918226)
chr3 (111-176)||(38002780-38002843)
chr3 (102-150)||(47701823-47701872)
chr3 (331-379)||(8370522-8370569)
chr3 (205-233)||(10595178-10595206)
chr3 (331-379)||(18552919-18552966)
chr3 (334-394)||(21334731-21334791)
chr3 (108-176)||(23941736-23941804)
chr3 (205-257)||(27544283-27544334)
chr3 (205-257)||(27762107-27762158)
chr3 (331-379)||(27974988-27975035)
chr3 (331-379)||(27986482-27986529)
chr3 (331-379)||(30709826-30709873)
chr3 (268-324)||(53973731-53973787)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (98-399)||(16629-16929)
[»] chr5 (100 HSPs)
chr5 (102-406)||(6661155-6661461)
chr5 (102-382)||(40221522-40221805)
chr5 (100-368)||(17413176-17413443)
chr5 (101-382)||(31472609-31472893)
chr5 (98-382)||(9020220-9020502)
chr5 (102-382)||(20053847-20054119)
chr5 (102-382)||(18511209-18511491)
chr5 (102-382)||(25804025-25804306)
chr5 (102-382)||(10529096-10529378)
chr5 (102-378)||(18596647-18596924)
chr5 (102-382)||(24126856-24127138)
chr5 (127-382)||(6745095-6745350)
chr5 (102-382)||(21948026-21948308)
chr5 (102-382)||(25921470-25921752)
chr5 (102-382)||(39854483-39854765)
chr5 (102-384)||(31545080-31545364)
chr5 (165-391)||(15143532-15143759)
chr5 (102-382)||(1189604-1189888)
chr5 (102-382)||(2174919-2175200)
chr5 (102-354)||(16092223-16092479)
chr5 (102-382)||(17072883-17073166)
chr5 (102-382)||(18509315-18509597)
chr5 (102-382)||(38882106-38882387)
chr5 (179-382)||(695959-696160)
chr5 (102-371)||(4236629-4236900)
chr5 (102-384)||(31179366-31179650)
chr5 (268-399)||(15445246-15445376)
chr5 (102-382)||(18466684-18466966)
chr5 (102-322)||(34530721-34530945)
chr5 (102-384)||(15552245-15552529)
chr5 (179-382)||(20505840-20506039)
chr5 (102-384)||(31542735-31543018)
chr5 (102-382)||(34477050-34477333)
chr5 (102-382)||(18469011-18469291)
chr5 (127-382)||(658353-658606)
chr5 (167-382)||(36208644-36208858)
chr5 (131-382)||(37705777-37706029)
chr5 (102-369)||(39398003-39398272)
chr5 (102-382)||(10474320-10474602)
chr5 (102-382)||(16776158-16776439)
chr5 (102-382)||(21684449-21684730)
chr5 (102-382)||(25904103-25904385)
chr5 (102-380)||(6756494-6756772)
chr5 (102-382)||(27910451-27910732)
chr5 (102-382)||(34479415-34479698)
chr5 (212-382)||(10749815-10749982)
chr5 (102-382)||(27912536-27912818)
chr5 (127-312)||(31466044-31466231)
chr5 (102-382)||(6747306-6747586)
chr5 (179-382)||(39798128-39798329)
chr5 (102-382)||(17818489-17818769)
chr5 (102-382)||(2818332-2818615)
chr5 (179-382)||(4410104-4410304)
chr5 (205-383)||(4897835-4898014)
chr5 (127-382)||(26097759-26098013)
chr5 (179-382)||(41585741-41585942)
chr5 (102-382)||(2954416-2954698)
chr5 (211-384)||(3373132-3373302)
chr5 (101-370)||(2144570-2144841)
chr5 (212-382)||(23665159-23665325)
chr5 (212-382)||(23793262-23793428)
chr5 (128-354)||(36402352-36402580)
chr5 (212-382)||(10757292-10757458)
chr5 (212-382)||(15354572-15354738)
chr5 (181-382)||(2723985-2724175)
chr5 (179-382)||(10586913-10587114)
chr5 (212-384)||(38960127-38960295)
chr5 (212-382)||(15356848-15357014)
chr5 (212-382)||(23741856-23742022)
chr5 (102-260)||(20045010-20045172)
chr5 (101-326)||(4754158-4754382)
chr5 (100-383)||(29748350-29748634)
chr5 (222-312)||(42770934-42771024)
chr5 (150-405)||(34033539-34033798)
chr5 (100-377)||(15224765-15225049)
chr5 (102-256)||(20043050-20043208)
chr5 (101-403)||(35430171-35430486)
chr5 (98-256)||(42770770-42770924)
chr5 (106-295)||(12556006-12556198)
chr5 (308-382)||(42238371-42238445)
chr5 (127-382)||(21288790-21289043)
chr5 (308-397)||(35385434-35385523)
chr5 (309-397)||(1170922-1171010)
chr5 (308-382)||(17841246-17841320)
chr5 (308-382)||(22672945-22673019)
chr5 (308-382)||(25445607-25445681)
chr5 (107-238)||(31782596-31782733)
chr5 (315-382)||(20043206-20043272)
chr5 (331-382)||(28786538-28786589)
chr5 (308-382)||(16093289-16093362)
chr5 (308-397)||(2297983-2298072)
chr5 (106-238)||(26098390-26098526)
chr5 (107-382)||(26406463-26406748)
chr5 (107-237)||(10627269-10627406)
chr5 (331-402)||(17004006-17004076)
chr5 (331-382)||(25452629-25452680)
chr5 (107-230)||(16093438-16093566)
chr5 (331-379)||(9353378-9353425)
chr5 (205-257)||(35385573-35385624)
chr5 (331-379)||(36932396-36932443)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (136-406)||(31162303-31162580)
chr8 (102-382)||(36865594-36865875)
chr8 (135-382)||(15956051-15956296)
chr8 (128-391)||(21480589-21480850)
chr8 (128-391)||(21482397-21482658)
chr8 (128-382)||(3005627-3005880)
chr8 (102-382)||(27911071-27911351)
chr8 (102-382)||(27957490-27957770)
chr8 (102-382)||(32339365-32339647)
chr8 (102-382)||(14419187-14419470)
chr8 (164-391)||(31035239-31035468)
chr8 (102-382)||(3874066-3874348)
chr8 (102-382)||(13858481-13858763)
chr8 (102-382)||(30480500-30480782)
chr8 (155-389)||(31578266-31578501)
chr8 (102-382)||(15809275-15809556)
chr8 (102-382)||(28251564-28251846)
chr8 (102-384)||(43079658-43079942)
chr8 (102-382)||(15072766-15073049)
chr8 (102-382)||(608790-609072)
chr8 (102-382)||(4424074-4424356)
chr8 (102-382)||(27106894-27107176)
chr8 (102-382)||(27829353-27829634)
chr8 (102-384)||(43082029-43082313)
chr8 (102-343)||(14807807-14808051)
chr8 (102-382)||(22684650-22684935)
chr8 (98-309)||(31573794-31574004)
chr8 (102-382)||(41384800-41385082)
chr8 (102-382)||(15068037-15068319)
chr8 (102-382)||(25952577-25952859)
chr8 (102-382)||(27827042-27827323)
chr8 (102-382)||(18810764-18811045)
chr8 (102-370)||(5372185-5372457)
chr8 (102-382)||(28283218-28283498)
chr8 (102-384)||(24873176-24873460)
chr8 (102-382)||(1225222-1225505)
chr8 (102-384)||(44720899-44721183)
chr8 (102-288)||(14477332-14477522)
chr8 (179-382)||(43530252-43530453)
chr8 (207-391)||(6376153-6376337)
chr8 (207-382)||(41382827-41383000)
chr8 (100-391)||(3895879-3896171)
chr8 (264-391)||(16833771-16833897)
chr8 (248-391)||(2468117-2468259)
chr8 (97-199)||(31035121-31035223)
chr8 (246-382)||(15185711-15185846)
chr8 (102-258)||(33541507-33541667)
chr8 (179-382)||(18813019-18813219)
chr8 (179-312)||(181636-181771)
chr8 (205-383)||(17847688-17847859)
chr8 (205-391)||(13985072-13985252)
chr8 (268-383)||(33020896-33021012)
chr8 (309-397)||(28328019-28328107)
chr8 (304-387)||(31566549-31566630)
chr8 (282-373)||(33541416-33541505)
chr8 (308-382)||(23179558-23179632)
chr8 (308-397)||(28890876-28890965)
chr8 (107-257)||(30423118-30423274)
chr8 (309-397)||(16757250-16757338)
chr8 (309-397)||(25684754-25684842)
chr8 (309-397)||(28332742-28332830)
chr8 (308-382)||(17799421-17799495)
chr8 (102-238)||(5622877-5623017)
chr8 (212-260)||(37214317-37214365)
chr8 (129-175)||(35872587-35872634)
chr8 (331-382)||(37214261-37214311)
chr8 (309-391)||(4812476-4812558)
chr8 (141-222)||(2468261-2468341)
chr8 (340-397)||(16752506-16752563)
chr8 (101-172)||(13986030-13986099)
chr8 (205-391)||(33838908-33839094)
chr8 (101-175)||(41382728-41382804)
chr8 (331-382)||(9021104-9021155)
chr8 (308-391)||(28895613-28895696)
chr8 (308-382)||(21033980-21034054)
chr8 (328-401)||(5702526-5702598)
chr8 (102-150)||(12517254-12517303)
chr8 (107-176)||(23179769-23179836)
chr8 (331-392)||(26403276-26403336)
chr8 (107-139)||(3276251-3276283)
chr8 (331-379)||(9765865-9765912)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (97-376)||(4819-5098)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (102-382)||(14379-14661)
scaffold0131 (179-370)||(15109-15298)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (101-382)||(79193-79476)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (102-382)||(41480-41762)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (102-382)||(69289-69570)
scaffold0025 (102-175)||(73227-73302)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (102-384)||(6208-6492)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (102-382)||(183638-183919)
scaffold0005 (102-382)||(52020-52304)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (127-382)||(11470-11726)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (102-382)||(4006-4286)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (102-384)||(50-334)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (102-382)||(79868-80150)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (102-382)||(29180-29461)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (179-382)||(1450-1650)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (127-354)||(85265-85495)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (102-380)||(2889-3168)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (212-382)||(22240-22406)
scaffold0140 (212-382)||(24515-24681)
scaffold0140 (331-379)||(8465-8512)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (102-312)||(2051-2264)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (102-269)||(35648-35819)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (267-376)||(57430-57539)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (309-397)||(3052-3140)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (308-391)||(16436-16519)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (308-382)||(16983-17057)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (309-402)||(5664-5756)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (102-150)||(1061-1110)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 94)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 97 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16455706 - 16455398
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16455706 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttttctcttggcaacgaacactagggttgtggttgattcaccttgggaa 16455607  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16455606 acactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 16455507  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttc 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16455506 taaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttctttc 16455407  T
Q  397 ttttctctc 405  Q
    |||| ||||    
T  16455406 ttttatctc 16455398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3028132 - 3027839
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  3028132 ctgaaaacaagggtttggaaggcaacacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaa 3028034  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  3028033 cactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgt 3027934  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3027933 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgtt 3027839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Original strand, 17012075 - 17012360
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  |||    
T  17012075 tctgaataaaagggtttagaagtaaaca-acaaactagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttctgaa 17012173  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  17012174 acaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 17012273  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17012274 taaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatttc 17012360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Original strand, 19696475 - 19696768
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||||||||    
T  19696475 ctgaaaacaagggtttagaaacaaaca-acaaattagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaatcactagggttcaaattgattcaccttgggaaa 19696573  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||||  ||||| | ||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19696574 cactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttg 19696673  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19696674 taaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 19696768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22858230 - 22857940
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  22858230 gaaaacaagggtttagaagctaacacaaaaactagggtttgta--gaattttctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcaccttgggaaaca 22858133  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaacccttt-gatatctcttttct 297  Q
     | | | |||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||   ||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  22858132 ctattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatctttg-t 22858034  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22858033 aaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgtt 22857940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 13057229 - 13057512
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  13057229 aaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 13057328  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13057329 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 13057428  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || | |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13057429 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactcggtcaacaaatt 13057512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719970
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||| ||    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttga-gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgg 15719806  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  15719807 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 15719906  T
Q  328 ggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
     | |||||| |  ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15719907 agttgctctttccccccatactaggtcaat-ttggaccgaacttggtaaacaaatttcatgtgtt 15719970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3632217 - 3631936
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||  |||||||||    
T  3632217 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaa 3632118  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3632117 cactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 3632018  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3632017 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3631936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 32280031 - 32280314
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  32280031 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaa 32280130  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32280131 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 32280230  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||    
T  32280231 aaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaaaaatt 32280314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3390414 - 3390697
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagtttt-ctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  3390414 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 3390513  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3390514 cactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 3390613  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||    
T  3390614 aaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccaaattgggtcaacaaatt 3390697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 13039789 - 13040072
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  13039789 aaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 13039888  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13039889 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 13039988  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  13039989 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 13040072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Original strand, 9019960 - 9020243
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||   |  ||||||| |||||||||    
T  9019960 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 9020059  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9020060 acactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 9020159  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9020160 taaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 9020243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1230528 - 1230246
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  1230528 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 1230429  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| |  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1230428 cactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 1230329  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1230328 aacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 1230246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28241600 - 28241318
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  28241600 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 28241501  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  28241500 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 28241401  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28241400 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28241318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 391
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367358
Alignment:
Q  132 tagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaag 231  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttgctcttggcaacaaacactagggttgg-gttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaag 15367199  T
Q  232 agattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggat 331  Q
    |||||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |    
T  15367200 agattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggct 15367298  T
Q  332 gctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15367299 gctctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 15367358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 26945245 - 26945469
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcggg-at 263  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   | |     
T  26945245 acactaaggttgtggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtag 26945344  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||| || |||||  ||||||    
T  26945345 acttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggac 26945444  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26945445 cgaactgggtaaacaaatttcgtgt 26945469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11983282 - 11983026
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  11983282 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 11983183  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  11983182 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 11983084  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11983083 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11983026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4816510 - 4816228
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  4816510 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 4816411  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4816410 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4816311  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4816310 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 30967236 - 30967518
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  30967236 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30967335  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  30967336 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30967435  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30967436 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 30967518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12186283 - 12186068
Alignment:
Q  167 actagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcg-ggatac 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||   ||| ||    
T  12186283 actagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagac 12186184  T
Q  266 ttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccg 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || | |||||||||| | ||| ||||    
T  12186183 ttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaat-ttgaaccg 12186085  T
Q  366 aactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||    
T  12186084 aactgggtaaacaaatt 12186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14459040 - 14458764
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttgt--tgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |   ||||||  ||||||||||| |    
T  14459040 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacact 14458943  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  14458942 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacg 14458843  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||| ||||||||| |  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14458842 ttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14458764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25477309 - 25477599
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  25477309 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25477408  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25477409 cactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 25477508  T
Q  298 aa-------agttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||        ||||||||||||||||||| |||  | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  25477509 aacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaaatgggtcaacaaatt 25477599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3630117 - 3629862
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||||     
T  3630117 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtt 3630018  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| |||    
T  3630017 acgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaac 3629919  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3629918 tgagggctgctctct-ccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3629862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19704848 - 19704564
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | |||||||| |||  |  |||||||| ||||||||||    
T  19704848 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19704749  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctct-ttt 295  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  19704748 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctcttt 19704649  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19704648 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 19704564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28037943 - 28037702
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggata 264  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||    | |    
T  28037943 acactagggttgtgagtgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaa 28037844  T
Q  265 -cttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtgga---acgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattg 360  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  28037843 tcttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttg 28037744  T
Q  361 gaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  28037743 gaccgagctgggtaaacaaattgtgttttttttttcttttct 28037702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14507455 - 14507173
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  14507455 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 14507356  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  14507355 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 14507257  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | |||| ||||| |||||| | || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14507256 taacgatacttatcat-atagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14507173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20915635 - 20915353
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  20915635 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 20915536  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  20915535 cactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 20915437  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20915436 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20915353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25078802 - 25078545
Alignment:
Q  131 ctagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaa 230  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||  || | |||| |||||||||||||||| ||    
T  25078802 ctagggtttgta--gagtttactcttggcaacaaacattagggttgaaattgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaa 25078705  T
Q  231 gagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagg 329  Q
    |||||||  | |||  |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | |     
T  25078704 gagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggagga 25078606  T
Q  330 atgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
     |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25078605 ctgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 25078545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30034883 - 30034600
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  30034883 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 30034784  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  30034783 acactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 30034684  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| || | || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30034683 taacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 30034600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2629164 - 2628883
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  2629164 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaa 2629065  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  2629064 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 2628966  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2628965 aacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaaatt 2628883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15541419 - 15541137
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  15541419 aaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 15541320  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15541319 cactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgt 15541220  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||  || | |||||||| | ||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15541219 aaagttattcatca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 15541137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069727
Alignment:
Q  183 attcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctt 282  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  283 tgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaat-ttggaccgaactg 1069727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26932815 - 26932557
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||||| | | ||||||  |||||||||||    
T  26932815 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggt 26932716  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||     
T  26932715 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggat 26932618  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26932617 tggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 26932557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15532960 - 15532706
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||| |||| |||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  15532960 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 15532861  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15532860 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 15532761  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||| | ||| |||||||||||    
T  15532760 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtca 15532706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15530375 - 15530177
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  15530375 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 15530276  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15530275 acgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 15530178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12195794 - 12195510
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  12195794 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 12195695  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  12195694 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 12195596  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12195595 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaagtttc 12195510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5273414 - 5273211
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaa 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5273414 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5273315  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    ||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||| ||||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  5273314 cccattgatttctctttg-taacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 5273218  T
Q  378 aaatttc 384  Q
    |||||||    
T  5273217 aaatttc 5273211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30729081 - 30728821
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||||     
T  30729081 aaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggtt 30728982  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata----tctcttttctaaagttactcatcattatagtg 319  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30728981 acgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtg 30728883  T
Q  320 gaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  30728882 gaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 30728821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 33309007 - 33309175
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  33309007 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 33309104  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33309105 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 33309175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 26065021 - 26065298
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  26065021 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26065117  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |    
T  26065118 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26065216  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||| | | ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26065217 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 26084990 - 26085267
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  26084990 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26085086  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |    
T  26085087 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26085185  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||| | | ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26085186 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29754873 - 29754706
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  29754873 agtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 29754775  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29754774 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 29754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465578
Alignment:
Q  258 cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagta 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||  |||| |||| |||||||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttg-taaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  358 ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 25465578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26066288 - 26066119
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||    
T  26066288 agtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatca 26066190  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26066189 -aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 26066119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 33311276 - 33311444
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  33311276 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 33311373  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33311374 -aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 33311444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 324
Target Start/End: Original strand, 20526855 - 20527066
Alignment:
Q  111 tttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatt 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | | ||||||    
T  20526855 tttagaaaccaacacaaaaactaggggttgta--gagtttgctcttgacaacaaacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggatt 20526952  T
Q  211 aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcat 309  Q
     ||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||   | | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20526953 gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcat 20527051  T
Q  310 cattatagtggaacg 324  Q
    |||||||||||||||    
T  20527052 cattatagtggaacg 20527066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12937364 - 12937181
Alignment:
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggata-cttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   ||   || |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  12937364 gattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctttg-taaagttac 12937266  T
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12937265 tcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgtt 12937181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 391
Target Start/End: Original strand, 15346535 - 15346673
Alignment:
Q  251 aattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactag 350  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||    
T  15346535 aattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactag 15346633  T
Q  351 gtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346634 gtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 15346673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24338727 - 24338446
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt---gttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| | |    |||||||  |||||| ||    
T  24338727 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaa 24338628  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | | |||| ||||| ||||| | || ||||||||   ||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24338627 acactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24338528  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  24338527 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc--ccccagactatgtcaat-ttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3234010 - 3233754
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  3234010 aaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3233911  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  3233910 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttg 3233811  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    ||| |||||||| |  ||||||| |||| | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  3233810 taacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtca 3233754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26068559 - 26068390
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||| |||||||    
T  26068559 agtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttgctcatca 26068461  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26068460 -aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 26068390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 268 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12911555 - 12911433
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12911555 attcttgtaaccatttaatatctctttg-taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaa 12911457  T
Q  368 ctgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  12911456 ccgggtaaacaaattttgtgtgtt 12911433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 319
Target Start/End: Original strand, 22490765 - 22490896
Alignment:
Q  188 ccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata 287  Q
    ||||| |||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22490765 ccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgata 22490864  T
Q  288 tctcttttctaaagttactcatcattatagtg 319  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22490865 tctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 382
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466641
Alignment:
Q  143 tagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg----ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattg 237  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||    |||||||  ||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggtt-ttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattg 14466497  T
Q  238 gaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctc 337  Q
    | | |||  ||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | || | |  |||| |     
T  14466498 ggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtt 14466597  T
Q  338 taccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  14466598 tcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcagcaaatt 14466641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28078308 - 28078182
Alignment:
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||| || || ||||||||| | || |||    
T  28078308 acttattcttgtaacc-tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttagac 28078210  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28078209 cgaacagggtaaacaaatttcgtgtgtt 28078182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 371
Target Start/End: Original strand, 30445729 - 30445832
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||    
T  30445729 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtcagtattggactgaa 30445828  T
Q  368 ctgg 371  Q
    ||||    
T  30445829 ctgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19227687 - 19227514
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | | | ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  19227687 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19227588  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattc 271  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19227587 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 400
Target Start/End: Original strand, 11262598 - 11262795
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccc---tttgatatctcttttctaaa 300  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||   ||  ||| |||||| |||||    ||||||||||||||  ||||    
T  11262598 aggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttg-taaa 11262695  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttctttt 400  Q
    |  ||||||||||||| || |||| |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11262696 gaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttt 11262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12161834 - 12161622
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||   |  ||| ||| | ||||||||    
T  12161834 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaa 12161737  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12161736 cactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 12161637  T
Q  298 aaagttactcatcat 312  Q
    || ||||||||||||    
T  12161636 aaggttactcatcat 12161622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833538
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt-actcatcattatagtggaacg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacg 3833538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 11138338 - 11138499
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg----ttg---ttgattcgccttg 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||    |||   ||||||| |||||    
T  11138338 gaaaacaagggtttagaagccaacactaaaactagggtt--tttagagtttactcttgacaacaaactttagggttgcgacttgagattgattcaccttg 11138435  T
Q  193 g-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaatta 255  Q
    | |||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11138436 gagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Original strand, 7294035 - 7294114
Alignment:
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7294035 actcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaattt 7294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 383
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443607
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||||||||||| |||| |  | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 30443607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 25941780 - 25941854
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25941780 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25941854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 17038345 - 17038434
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  17038345 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 17038434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 13878838 - 13878926
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  13878838 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 13878926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 16786030 - 16786118
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16786030 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 16786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346515
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaaca 15346515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22870197 - 22870090
Alignment:
Q  281 tttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |  | | ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22870197 tttgatatctctttg-taaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaa 22870101  T
Q  381 t-ttcgtgtgt 390  Q
    | |||||||||    
T  22870100 tattcgtgtgt 22870090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32447595 - 32447524
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactag 171  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32447595 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 32447524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3577560 - 3577487
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3577560 atcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 3577487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Original strand, 10584233 - 10584314
Alignment:
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  10584233 gttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaacaaattt 10584314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Original strand, 13883586 - 13883668
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13883586 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 13883668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17694923 - 17694849
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17694923 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17694849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25465970 - 25465896
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25465970 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35201397 - 35201315
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35201397 tcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 35201315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13467537 - 13467464
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13467537 atcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaatt 13467464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17904632 - 17904565
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17904632 agggtttagaagccaacaacaaaactagggtttg--tagagttttctctttgcaacaaacactaaggttg 17904565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22342872 - 22342798
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22342872 atcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 22342798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26887271 - 26887209
Alignment:
Q  335 ctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  26887271 ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 26887209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Original strand, 30443336 - 30443468
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttg-ggaaaca 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||| ||  || |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||    
T  30443336 aaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactatgatttgtagagaatt--ctgttggcaacaaacactagggttgatattgattcaccttgaagaaaca 30443433  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt 236  Q
     | | |||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  30443434 ctattaggat--agtcttctggtcacgggaagagatt 30443468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 33215938 - 33216012
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33215938 atcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 33216012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5165987 - 5165936
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  5165987 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1072156 - 1072081
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  1072156 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 1072081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24501524 - 24501449
Alignment:
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||||||||||||||   |  | |||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24501524 actcatcattatagtggaatagagagctgctctcttcccctgaataggtcagtattataccgaactgggtaaacaa 24501449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 150
Target Start/End: Original strand, 8995513 - 8995563
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8995513 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 8995563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22351923 - 22351850
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  22351923 atcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattaga-cgaactgggtaaacaaatt 22351850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 30445553 - 30445644
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg 193  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| ||||||    
T  30445553 gaaaacaatggtttagaagccaacattaaaactagggtttg--tagataattctcttggcaacaaacactacggttgagattgattcaccttgg 30445644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Original strand, 4595056 - 4595102
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4595056 aaaactagggtttgta--gagttttcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22352127 - 22352060
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22352127 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaac-aacactagggttg 22352060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26455186 - 26455145
Alignment:
Q  350 ggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26455186 ggtcagtattggactgaactggataaacaaatttcatgtgtt 26455145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 5757524 - 5757571
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5757524 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19702144 - 19702070
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19702144 gaaaacaagg-tttagaagccaacatacaaactagcgtttatagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggttg 19702070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24542946 - 24542882
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24542946 ggtttagaagccaacaccaaa-ctatggttt--atagagatttctcttggcaacaaacactagggttg 24542882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 133)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 19322751 - 19323031
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |    
T  19322751 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgggaaacact 19322850  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19322851 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 19322950  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19322951 ttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaatt 19323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 98 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18537753 - 18537469
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  18537753 ctgaaaacaagggtttagaaacaaaca-acaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaa 18537655  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18537654 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 18537555  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  18537554 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattt 18537469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8756532 - 8756238
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  8756532 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaa 8756433  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctctt-ggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || |   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  8756432 cactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 8756333  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8756332 taaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 8756238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534819
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||     
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacga 18534983  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  18534982 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggag 18534883  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18534882 gggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgtt 18534819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890212
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||   |||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacattagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacg 38890377  T
Q  227 ggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaa 326  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38890376 ggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacaga 38890277  T
Q  327 aggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
     || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890276 gggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 38890212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Original strand, 28453737 - 28454029
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  28453737 tctgaaaacaagggtttagaagccaacactaaaactagggtttgca--gagtttgctcttggcaagaaacactagggttgggattgattcaccttgggaa 28453834  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||  | | ||| |||||||||| | |||||||||||||||     
T  28453835 acactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttg 28453934  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453935 taaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 28454029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 36378346 - 36378629
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     |||||||| |||||| |||    
T  36378346 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaa 36378445  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  36378446 cactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgt 36378545  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36378546 gaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatt 36378629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15032815 - 15032526
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||         ||  ||||||||   || ||||||| |    
T  15032815 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctctttgcaacaaa---------tgaggttgattcatatttggaaacact 15032725  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| |||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15032724 attaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 15032625  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaact-gggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttt 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15032624 ttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgttctttcttt 15032526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47151171 - 47150880
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  47151171 ctgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaa-ctaaggttt--atagagtttgctcttggtaaccaacactagggttgaaattgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47151074 cactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 47150975  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |  |||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  47150974 taaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgtt 47150880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 386
Target Start/End: Original strand, 12102209 - 12102429
Alignment:
Q  167 actagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcg-ggatac 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||    
T  12102209 actagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagac 12102308  T
Q  266 ttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccg 365  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12102309 ttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccg 12102408  T
Q  366 aactgggtaaacaaatttcgt 386  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  12102409 aactaggtaaacaaatttcgt 12102429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8631698 - 8631416
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  8631698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 8631599  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  8631598 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 8631499  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  8631498 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 8631416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 40637128 - 40637410
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  40637128 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40637227  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  40637228 cactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 40637327  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40637328 aacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40637410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 48486373 - 48486655
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  48486373 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 48486472  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  48486473 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgt 48486572  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  48486573 aacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 48486655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185813
Alignment:
Q  195 aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtttt 393  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16185918 tg-taaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 16185820  T
Q  394 ttctttt 400  Q
     ||||||    
T  16185819 ctctttt 16185813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 382
Target Start/End: Original strand, 9148310 - 9148588
Alignment:
Q  105 caagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||     
T  9148310 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 9148409  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
    | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||     
T  9148410 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 9148508  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9148509 gttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 9148588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24880505 - 24880788
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||| ||| ||||||||||    
T  24880505 aaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaa 24880604  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24880605 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24880704  T
Q  298 aaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24880705 aaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 24880788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22803013 - 22802731
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  22803013 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 22802914  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22802913 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 22802814  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  22802813 aatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaat-ttgaaccgaactaggtcaacaaatt 22802731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24348272 - 24348554
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  24348272 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 24348371  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  24348372 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 24348471  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24348472 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 24348554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24888850 - 24889132
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  24888850 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaa 24888949  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24888950 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgt 24889049  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24889050 aacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 24889132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37313345 - 37313089
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  37313345 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaa 37313246  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  37313245 cactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgt 37313146  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||||||||| ||||    
T  37313145 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtca 37313089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 399
Target Start/End: Original strand, 10112924 - 10113224
Alignment:
Q  99 tgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  10112924 tgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaactagggtttg--tagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttaggaaac 10113021  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcac-gggaagagattggaacttttggtagaattag-gcgggatacttattcttgtaacc-ctttgatatctctttt 295  Q
    | | | | |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    | | ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  10113022 actattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-ttt 10113120  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtttttt 395  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||| | |  | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  10113121 gtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggtaaaaaaaattcatgtgttcttt 10113220  T
Q  396 cttt 399  Q
    ||||    
T  10113221 cttt 10113224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12396124 - 12395844
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  12396124 aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 12396025  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  12396024 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgt 12395925  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12395924 aaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacagggtcaacaaa 12395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22780626 - 22780371
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  22780626 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggt 22780527  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||     
T  22780526 tacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggat 22780429  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22780428 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 36380429 - 36380686
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||| |||||||     
T  36380429 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtt 36380528  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36380529 accggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 36380628  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |  | |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  36380629 tgagtgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggagcgaactgggtaaacaaatt 36380686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24879043 - 24879326
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  24879043 aaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 24879142  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24879143 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24879242  T
Q  298 aaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24879243 aaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 24879326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36921773 - 36921490
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  36921773 aaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36921674  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  36921673 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 36921574  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36921573 taacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 36921490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38928457 - 38928174
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  38928457 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 38928358  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  38928357 acactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttg 38928258  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38928257 taacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 38928174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 391
Target Start/End: Original strand, 9863764 - 9864058
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaaca-caaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |||||||||||     
T  9863764 aaaacaagggtttagaagccaaaaacaaaaactagggtttgta--gagtttgttcttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaacc 9863861  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |   ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  9863862 ctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttg-ta 9863960  T
Q  299 aagttactcatcat---tatagtggaacgaaaggatgctctctacccc--agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |  | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9863961 aagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 9864058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 14633373 - 14633654
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14633373 aaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14633472  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  14633473 cactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 14633571  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14633572 aatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14633654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22044669 - 22044388
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  22044669 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaa 22044570  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  22044569 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgt 22044471  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22044470 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22044388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22046964 - 22046683
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  22046964 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22046865  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  22046864 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22046766  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22046765 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22046683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22801141 - 22800859
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  22801141 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 22801042  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22801041 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 22800942  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22800941 aacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22800859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37089650 - 37089369
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  37089650 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 37089551  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  37089550 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 37089452  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  37089451 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 37089369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12401086 - 12400806
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  12401086 aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 12400987  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  12400986 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgt 12400887  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12400886 aaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacagggtcaacaaa 12400806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2485152 - 2484870
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  2485152 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaa 2485053  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  2485052 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 2484954  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  2484953 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 2484870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Original strand, 13544039 - 13544268
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  13544039 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 13544138  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13544139 acgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 13544237  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | |    ||||||||  ||||||||||||||    
T  13544238 ggagtactgctctctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 19095936 - 19096219
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| |||    
T  19095936 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaa 19096035  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19096036 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttg 19096135  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| |||| |  | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19096136 taacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 19096219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36919864 - 36919581
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  36919864 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36919765  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  36919764 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 36919665  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||   | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36919664 taacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 36919581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 370
Target Start/End: Original strand, 16453363 - 16453634
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  16453363 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16453462  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16453463 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16453562  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16453563 aaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactg 16453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983507
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaa 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||  ||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaac 31983529  T
Q  378 aaatttcgtgtgttttttcttt 399  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  31983528 aaatttcgtgtgttctttcttt 31983507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Original strand, 41997572 - 41997830
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||| ||     
T  41997572 aaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagtt 41997671  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||| ||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  41997672 acgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaac 41997771  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    | | ||  ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41997772 ggagggccgctctct-ccccagactaggttaat-ttggaccgaactggataaacaaatttc 41997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 47274781 - 47275061
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  |||||||  |||||||||    
T  47274781 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaa 47274879  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  47274880 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 47274979  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  47274980 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaacaaatt 47275061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 16455376 - 16455578
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16455376 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 16455475  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
     | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16455476 tcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 16455574  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  16455575 aatt 16455578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17662443 - 17662242
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17662443 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 17662344  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17662343 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 17662246  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  17662245 aatt 17662242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18409626 - 18409326
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||   |  ||||||  |||| || ||    
T  18409626 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaa 18409527  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18409526 cactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 18409427  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||| || |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18409426 -aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaat-ttggattgaactgggtaaacaaatttcgtgtttttttttt 18409329  T
Q  398 ttt 400  Q
    |||    
T  18409328 ttt 18409326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18709442 - 18709159
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  18709442 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaa 18709343  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  18709342 cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 18709244  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    || |  |||||||| |||||||||  | | |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709243 aacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 18709159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22782991 - 22782736
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  22782991 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggt 22782892  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||     
T  22782891 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggat 22782794  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22782793 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11006516 - 11006234
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  11006516 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11006417  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  11006416 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 11006318  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11006317 taatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggttaacaaatt 11006234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 11435009 - 11435290
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  11435009 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11435108  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||| |||| || |||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  11435109 cactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 11435207  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11435208 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11435290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33415766 - 33415485
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  33415766 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaa 33415668  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||  ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33415667 cactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 33415568  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  33415567 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaataaatt 33415485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40091694 - 40091412
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  40091694 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40091595  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40091594 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 40091495  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40091494 aatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40091412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40999231 - 40998990
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||   ||||||| ||| || ||    
T  40999231 tctgaaaacaagggtttagacgtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttgctcttgacaacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaa 40999132  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||   ||| |||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  40999131 acattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctctttt 40999032  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctc 337  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  40999031 gtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44600117 - 44599836
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  44600117 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 44600018  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||      
T  44600017 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg- 44599919  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44599918 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26086229 - 26085974
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  26086229 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 26086130  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| |    
T  26086129 acgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatc 26086032  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  26086031 ggaaggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaacaaatt 26085974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 38409285 - 38409540
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  38409285 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 38409384  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| |    
T  38409385 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatc 38409482  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38409483 ggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 38409540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18847207 - 18847488
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  18847207 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 18847306  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | || |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  18847307 cactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 18847405  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  18847406 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 18847488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 383
Target Start/End: Original strand, 25357757 - 25357980
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggta----gaattaggcgg 260  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||    |||||| |       
T  25357757 acactagggttgtgattgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagttt 25357856  T
Q  261 gat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtatt 359  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25357857 gaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtatt 25357956  T
Q  360 ggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25357957 ggacctaactgggtaaacaaattt 25357980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 51015300 - 51015581
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  51015300 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 51015399  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  51015400 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 51015498  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | |  |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  51015499 aacaatactcatcat-atagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 51015581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 7941375 - 7941659
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaa--cactagggttgttg--ttgattcgccttggga 195  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   | | ||  ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||    
T  7941375 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggga 7941474  T
Q  196 aacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    |||| | | |||||| ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7941475 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 7941574  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  7941575 gtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 7941659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 6764979 - 6765180
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6764979 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 6765078  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6765079 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 6765176  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  6765177 aatt 6765180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22132669 - 22132387
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  22132669 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22132571  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  22132570 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22132472  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22132471 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 22132387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 382
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136886
Alignment:
Q  135 ggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagaga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |   | ||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  30136640 ggtttgtatagagtttactcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaa 30136739  T
Q  235 ttggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgct 334  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  | || ||||    
T  30136740 ttgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgct 30136839  T
Q  335 ctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||| | | | ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  30136840 ctctcctcaatactaggtcaat-ttggaccgaattggataaacaaatt 30136886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 382
Target Start/End: Original strand, 4215486 - 4215642
Alignment:
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4215486 acgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 4215584  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4215585 ggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 4215642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16934396 - 16934138
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||||| | | ||||||  |||||||||||    
T  16934396 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggt 16934297  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||     
T  16934296 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggat 16934199  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934198 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 16934138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 5198474 - 5198756
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| | ||||||||    
T  5198474 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaa 5198573  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5198574 cactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 5198673  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  5198674 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgtgtcaacaaatt 5198756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 47868459 - 47868737
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||| ||||| |    
T  47868459 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacact 47868558  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  47868559 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacg 47868658  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  47868659 atactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 47868737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9174425 - 9174141
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  9174425 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaa 9174326  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||     
T  9174325 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 9174227  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174226 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 9174141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11008845 - 11008565
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  11008845 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11008746  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||     
T  11008745 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttg 11008649  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11008648 taatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 11008565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14787710 - 14787426
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14787710 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 14787611  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  14787610 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 14787511  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatg--ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14787510 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 14787426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31849878 - 31849596
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt---gttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |    |||||||| |||||||||    
T  31849878 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 31849779  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  31849778 acactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 31849680  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31849679 taacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16932042 - 16931784
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| |||||| | | ||||||  |||||||||||    
T  16932042 aaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggt 16931943  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||     
T  16931942 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggat 16931845  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931844 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 16931784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 619726 - 619445
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||  ||||||||||    
T  619726 aaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa 619627  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | | ||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  619626 cactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgt 619527  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  619526 aacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctct-cccctaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3824823 - 3824622
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| |||||     
T  3824823 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggtt 3824724  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  3824723 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggacc 3824625  T
Q  324 gaa 326  Q
    |||    
T  3824624 gaa 3824622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22134894 - 22134613
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  22134894 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-caaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22134796  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  22134795 cactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22134697  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134696 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 22134613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 373
Target Start/End: Original strand, 56030498 - 56030768
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  56030498 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 56030597  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| || |||||| |    
T  56030598 cactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgt 56030697  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 373  Q
    || |||| |||||||     || |||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  56030698 aacgttattcatcat----atgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 56030768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 382
Target Start/End: Original strand, 2891435 - 2891628
Alignment:
Q  188 ccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata 287  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  2891435 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgata 2891534  T
Q  288 tctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  | |  |||||||| |||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  2891535 tctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtaca-acttggaccgaactgggtcaacaaatt 2891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3982413 - 3982175
Alignment:
Q  149 tttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgttg--attcgccttgg-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaac 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||   |||| |||||| |||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  3982413 tttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggac 3982314  T
Q  242 ttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctac 340  Q
    ||| |||||||||| |   ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  3982313 tttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 3982214  T
Q  341 cccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  3982213 ctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9176753 - 9176469
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| | | | | ||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  9176753 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9176654  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  9176653 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 9176555  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||    
T  9176554 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacagagtcaacaaatttc 9176469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5637744 - 5637530
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  5637744 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 5637645  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5637644 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 5637545  T
Q  298 aaagttactcatcat 312  Q
    || ||||||||||||    
T  5637544 aacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 344
Target Start/End: Original strand, 9022360 - 9022605
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |||||| |||||    
T  9022360 gaaaacaagggtttagaagtcaacatcaaaactagggtttg--tagagaattctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttggagaaac 9022457  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaacc-ct-ttgatatctctttt 295  Q
    ||| | |||||  | | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||   | | ||| |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  9022458 agtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-ttt 9022556  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccca 344  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  9022557 gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 383
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547491
Alignment:
Q  192 gggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc 291  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  292 ttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || ||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactaggtcaataaattt 13547491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 47211019 - 47210761
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  |||||          |||||||    
T  47211019 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgttg----------ggaaaca 47210930  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaa 299  Q
     | | |||||| |||||||| || ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  47210929 ctattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 47210830  T
Q  300 agttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
     | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  47210829 cgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaat-ttggaccgaactg 47210761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5635613 - 5635473
Alignment:
Q  240 acttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctcta 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||     
T  5635613 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 5635473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 382
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499378
Alignment:
Q  130 actagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||  | || |||||| | | |||||| ||||| ||||| |||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  227 ggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaa 326  Q
      |||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||   | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  327 aggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     || |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 27499378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 382
Target Start/End: Original strand, 11437559 - 11437698
Alignment:
Q  240 acttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctcta 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||     
T  11437559 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11437698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3578780 - 3578662
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |  | || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3578780 attcttgtaacattttgatatctctttg-taaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaa 3578683  T
Q  368 ctgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3578682 ctgggtaaacaaatttcgtgt 3578662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Original strand, 10114387 - 10114663
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | || ||||||| |    
T  10114387 aaacaaggttttagaagccataacaaaaactagggtttgta--gagtctgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcactttaggaaacact 10114484  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
     | |||||| |||||||||||||||  |||||||||         ||||||||| |    |  ||| |||| ||||||| |   ||||||||||  ||||    
T  10114485 attaggattgagtctcttggtcacgataagagattga--------gtagaattatgtttaaagactaattcatgtaacctt---atatctctttg-taaa 10114572  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
     | ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  10114573 ttaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgtt 10114663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 391
Target Start/End: Original strand, 22295278 - 22295511
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat- 263  Q
    |||||||||||||   |||||| |||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||   ||      
T  22295278 acactagggttgtgagtgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaag 22295377  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttga------tatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagta 357  Q
    |||||||| |||||||||||||      |     |||| |||||||||||||||||||||||||| | |    |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22295378 acttattcctgtaaccctttgagtagaattaggattttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagta 22295477  T
Q  358 ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22295478 ttggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgtt 22295511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 383
Target Start/End: Original strand, 26557822 - 26557923
Alignment:
Q  281 tttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26557822 tttgatatctctttg-taaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaa 26557920  T
Q  381 ttt 383  Q
    |||    
T  26557921 ttt 26557923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52942725 - 52942536
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  52942725 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 52942626  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||             ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  52942625 cactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 52942539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 382
Target Start/End: Original strand, 5101131 - 5101264
Alignment:
Q  246 ggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| | || |||| ||| ||||||    
T  5101131 ggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  346 actaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  5101229 actaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 5101264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Original strand, 6132927 - 6133090
Alignment:
Q  103 aacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||| |||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||   |  |||| || || ||||||||    
T  6132927 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaac 6133026  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcggga 262  Q
    | | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  6133027 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3937488 - 3937314
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  3937488 aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 3937389  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattct 272  Q
    || | |  | ||| ||||||||||| || |||||||||||   |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3937388 cactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336777
Alignment:
Q  195 aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||   | | ||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |   ||||  | ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| | | ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaatt 5336777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 4884985 - 4885059
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4884985 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4885059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 8529378 - 8529452
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8529378 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 8529452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 31300535 - 31300608
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31300535 atcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 15831252 - 15831341
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  15831252 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatatcttgtgttctttct 15831341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 53405184 - 53405469
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||||| ||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  53405184 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 53405282  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatactta------ttcttgtaaccctttgatatctc 291  Q
    || | | | |||| ||||||||||| |||| |||||  ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||      |||||||||||| ||||| ||||    
T  53405283 cactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctc 53405382  T
Q  292 ttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||  || | ||||||||| |||||||||||  |  | |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  53405383 ttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctgctctc--ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 53405469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Original strand, 11853660 - 11853743
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11853660 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttt 11853743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52043659 - 52043567
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttggg 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  52043659 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactaaggtttg--tagagttttctcttgtcagcaaacactagggttgggattgattcaccttggg 52043567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 18587077 - 18587151
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18587077 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 18587151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 36769590 - 36769664
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36769590 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt 36769664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 54906630 - 54906703
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  54906630 aaaacaagggcttagaagccaacaataaaactagggtttg--taaagttttctctttgcaacaaacactagggttg 54906703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54928758 - 54928702
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54928758 attcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaacg 54928702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4556128 - 4556057
Alignment:
Q  311 attatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  4556128 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt 4556057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24446835 - 24446788
Alignment:
Q  129 aactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24446835 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtt 24446788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38270265 - 38270190
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  38270265 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtt 38270190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 15312427 - 15312501
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15312427 atcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 15312501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 15317069 - 15317142
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15317069 atcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 15317142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16689011 - 16688937
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| || || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16689011 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16688937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 36771507 - 36771581
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36771507 atcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 36771581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 36771302 - 36771370
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36771302 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttgaagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggttg 36771370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 25699759 - 25699810
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25699759 aggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-tttggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 393
Target Start/End: Original strand, 55822376 - 55822459
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtttt 393  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  55822376 tcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 55822459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10047430 - 10047360
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  10047430 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 10047360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Original strand, 36769387 - 36769453
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36769387 ggtttagaagccaacatacaaactagggtttgaagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggttg 36769453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39246045 - 39245975
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  39246045 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 39245975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54867234 - 54867165
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  54867234 tgctctct-ccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 54867165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 4558217 - 4558282
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactaggg 173  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  4558217 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaacaaacactaggg 4558282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 4558422 - 4558495
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4558422 atcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4558495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 4570205 - 4570278
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  4570205 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaaatt 4570278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 381
Target Start/End: Original strand, 16638733 - 16639011
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttg--ttgattcgcctt--gggaaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||||||   |||  ||||||| ||||     |||||    
T  16638733 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctctttgcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttaaacaaaaca 16638831  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||| |||   | | ||| ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||    
T  16638832 ctgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc-tttgta 16638928  T
Q  299 aagttactc--atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16638929 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct--cccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaat 16639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Original strand, 2891371 - 2891420
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2891371 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 2891420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Original strand, 6764893 - 6764942
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6764893 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6764942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14789473 - 14789425
Alignment:
Q  333 ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14789473 ctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14789425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 26557666 - 26557712
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26557666 aaactagggttt--atagagatttctcttggcaacaaacactagggttg 26557712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29609722 - 29609681
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgta 142  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29609722 aaaacaagggtttataagccaacactaaaactagggtttgta 29609681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 47566399 - 47566467
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47566399 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttatcttggcaacaaacactagggttg 47566467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4556231 - 4556180
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  4556231 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-tttggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 382
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133173
Alignment:
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaat-ttggatcgaattgggtcaacaaatt 6133173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 16489359 - 16489410
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  16489359 aggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 47566503 - 47566554
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  47566503 aggattgagtctcttggtcacaggaagagactggaa-tttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 99 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20146887 - 20146597
Alignment:
Q  99 tgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |||||||||||    
T  20146887 tgaaaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcccttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaac 20146788  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | |   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20146787 aatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgta 20146688  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20146687 aagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtg 20146597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11578383 - 11578084
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagtttt-ctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||||     
T  11578383 aaacaagggtttagaagtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttggggttgattcacctcgggaaacac 11578286  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  11578285 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaag 11578186  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttctttt 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11578185 gttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttt 11578086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17897525 - 17897233
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||   ||||||| |||||||||    
T  17897525 tctgagaacaagggtttagaagtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgctcttcgcaacaaacactagg-ttgagattgattcaccttgggaa 17897427  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17897426 acactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttg 17897327  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897326 taaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 17897233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 131 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800310
Alignment:
Q  131 ctagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaa 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttgg-gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaa 18800461  T
Q  231 gagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagga 330  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||     
T  18800460 gagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggc 18800361  T
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18800360 tactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatt 18800310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874389
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactatggttgg-gttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgg 22874235  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  22874236 gaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgag 22874335  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     | |||||||| || || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  22874336 agctgctctctccctcatactaggtcaat-ttggaccgaattgggtaaacaaatt 22874389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 391
Target Start/End: Original strand, 40699430 - 40699643
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaa 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||  ||||||| ||||||    
T  40699430 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 40699529  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40699530 tcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaac 40699629  T
Q  378 aaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||    
T  40699630 aaatttcgtgtgtt 40699643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 105 - 381
Target Start/End: Original strand, 35107279 - 35107553
Alignment:
Q  105 caagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtc 204  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||   ||||||| ||||| |||||| | |     
T  35107279 caagagtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaac---agggttgggattgattcaccttgagaaacattatt 35107375  T
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattag--gcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagt 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||     | | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||    
T  35107376 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgt 35107474  T
Q  303 tactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35107475 tactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13910323 - 13910042
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  13910323 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaa 13910224  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  13910223 caatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 13910125  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| |  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13910124 aacaatactcatcat-atagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 13910042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19502290 - 19502008
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  19502290 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19502191  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19502190 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 19502091  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19502090 aacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 19502008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 45239229 - 45239001
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttttctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  45239229 aaaactagggtttgtatagacttt-ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 45239131  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45239130 acgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 45239032  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | | || |||||||| |||||||||||||||    
T  45239031 ggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6264396 - 6264145
Alignment:
Q  133 agggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacggga 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  |    
T  6264396 agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgata 6264297  T
Q  230 agagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagg 329  Q
    | |||||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  6264296 aaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 6264197  T
Q  330 atgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6264196 ctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 6264145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 19007616 - 19007898
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| || |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  19007616 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaa 19007715  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | || ||| ||| ||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19007716 cactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 19007815  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19007816 aacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 19007898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42923788 - 42923506
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  42923788 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 42923689  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  42923688 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 42923589  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| | || |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42923588 aaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 42923506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19504624 - 19504343
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gttg-ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  19504624 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaa 19504525  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19504524 cactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 19504426  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19504425 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 19504343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 28196613 - 28196893
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  28196613 aaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaa 28196712  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28196713 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 28196812  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28196813 aacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtca--att-gaccgaactgggtcaacaaatt 28196893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23452516 - 23452234
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||    
T  23452516 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaa 23452417  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23452416 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 23452317  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  23452316 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 23452234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40032337 - 40032050
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  40032337 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40032238  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata----tctctt 293  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || ||||||| || | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    ||||||    
T  40032237 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctctt 40032138  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40032137 ttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40032050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43623778 - 43623577
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43623778 gttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 43623679  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  43623678 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 43623581  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  43623580 aatt 43623577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45280237 - 45279981
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||||| ||| | | |||||| |||||||||||     
T  45280237 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggtt 45280138  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  45280137 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 45280039  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  45280038 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 45279981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6259094 - 6258814
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  6259094 aaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 6258995  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6258994 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 6258897  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6258896 aaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 6258814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 381
Target Start/End: Original strand, 43139352 - 43139632
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  43139352 ctgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |   | ||| ||| |||||||| |||||| |||| |||     
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttg 43139548  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaagga-tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcattatagtggtac-agaggactgttcttttccctatactaggtcagtattagaccgaact-ggtaaacaaat 43139632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44289348 - 44289064
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttag-aagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  44289348 aaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 44289249  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44289248 acactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttg 44289149  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||  | || |||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  44289148 taagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 44289064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22287615 - 22287333
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| |||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  22287615 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 22287516  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    | || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22287515 cggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 22287416  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| || | | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22287415 aacgttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27104775 - 27105055
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  27104775 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaac-aaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27104873  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  27104874 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27104972  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27104973 aacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27105055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 42064491 - 42064773
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  42064491 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 42064590  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  42064591 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 42064689  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  42064690 aacaatactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42064773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11739838 - 11739556
Alignment:
Q  103 aacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| ||||||||   |  ||||||| |||||||||||    
T  11739838 aacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 11739739  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  |    
T  11739738 actattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaa 11739639  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11739638 aggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11739556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34979838 - 34979574
Alignment:
Q  121 aacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | | |||| ||||||    
T  34979838 aacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctc 34979739  T
Q  218 ttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatag 317  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34979738 ttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatag 34979639  T
Q  318 tggaacgaaaggatgctct-ctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| || | |||| |  ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  34979638 tggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 34979574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 42452759 - 42453038
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  42452759 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 42452856  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  42452857 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 42452956  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42452957 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 42453038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21520972 - 21520690
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| |||||    
T  21520972 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 21520873  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21520872 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgt 21520773  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  21520772 aacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactttgtcaacaaatt 21520690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31733044 - 31732765
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||| | ||||||||    
T  31733044 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaa 31732945  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || ||| |||||| |||||||||||            |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31732944 cactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 31732857  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31732856 aaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtaaacaaa-ttcgtgtgtt 31732765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5375543 - 5375343
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5375543 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattcttgtaac 5375445  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5375444 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 5375347  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  5375346 aatt 5375343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35218242 - 35217961
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  35218242 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35218143  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  35218142 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttg- 35218044  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35218043 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 14837275 - 14837526
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||      
T  14837275 aaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg-- 14837372  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
        ||||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14837373 ----gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaac 14837468  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  14837469 ggatggatgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaatt 14837526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15539754 - 15539552
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  15539754 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 15539655  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  15539654 cactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgt 15539555  T
Q  298 aaa 300  Q
    |||    
T  15539554 aaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36559028 - 36558861
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  36559028 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 36558930  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36558929 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 36558861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36561305 - 36561138
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  36561305 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 36561207  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36561206 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 36561138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35215865 - 35215584
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  35215865 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35215766  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||      
T  35215765 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg- 35215667  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35215666 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 17848419 - 17848698
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||   |  ||||||| | |||||||    
T  17848419 aaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaa 17848518  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||   |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17848519 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttg 17848614  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  17848615 taacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 17848698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28459385 - 28459187
Alignment:
Q  182 gattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccct 281  Q
    ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  28459385 gattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaaccca 28459286  T
Q  282 ttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||    
T  28459285 ttgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctcta-cctagactaggtcaat-ttggatcgaactagataaacaaat 28459188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407451
Alignment:
Q  235 ttggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgct 334  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 22407498  T
Q  335 ctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  22407497 ctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 22407451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3022139 - 3022430
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||| |||| |||||    
T  3022139 aaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaa 3022238  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  3022239 cactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttta-t 3022337  T
Q  298 aaagttactcatcattat---------agtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||         | || |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3022338 aaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3022430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 17849174 - 17849319
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| ||||| |||||| | | | |||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17849174 gttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 17849273  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17849274 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg 17849319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 45332345 - 45332179
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  45332345 agtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-tttgtaaaggtactcatca 45332247  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
     ||||||| |  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45332246 -tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 383
Target Start/End: Original strand, 35028561 - 35028833
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcag 206  Q
    |||||||||||  |||||  |||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| | | |     
T  35028561 agggtttagaatccaacaataaaatttgggtttgta--gagtttgctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattat 35028658  T
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcggga-tacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |   || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  35028659 gattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattac 35028758  T
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||  ||||||||| |  | |||||||| ||||  |||||||||||||   | |||||||| |||||||||||    
T  35028759 tcatcattgcagtggaacggagagctgctctctcccccttactaggtcagtat---atcgaactggctaaacaaattt 35028833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136126
Alignment:
Q  135 ggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagaga 234  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| | | |||||| | |||||||||||||| |||| |    
T  27136368 ggtttatatagagcttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaa 27136269  T
Q  235 ttggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgc 333  Q
    |||| |||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||       |||| ||||  | || ||     
T  27136268 ttgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc-------tagtagaacagagggttgt 27136176  T
Q  334 tctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27136175 tctctccccaaaactaagtcagtattggaccgaactgagtaaacaaattt 27136126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828329
Alignment:
Q  218 ttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattata 316  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  317 gtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||     | | |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgtt 13828329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589893
Alignment:
Q  195 aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcg-ggatacttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcattatagtgtaacg 20589893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24162491 - 24162220
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  24162491 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 24162392  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| |||||||||||  |          ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  24162391 cactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 24162303  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24162302 aatgctactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaaatt 24162220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37963187 - 37962929
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| |||| | ||||| | |   |||| ||||||||||||||      
T  37963187 aaactagggtttgtgtatagtttgctcttgacaacaaacaccatggttgt-gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacct 37963089  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||   | |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |      
T  37963088 gaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaac-agt 37962993  T
Q  328 gga-tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37962992 ggactgatctctctcccacactaggttaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 37962929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462953
Alignment:
Q  248 tagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagac 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| || | || |||||||| ||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  348 taggtcagtattggaccgaactgggt 373  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||    
T  7462978 taggtcaattttggaccgaactgggt 7462953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 324
Target Start/End: Original strand, 15693985 - 15694106
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagt 302  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||   ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15693985 aggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagt 15694084  T
Q  303 tactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  15694085 tactcatcattttagtggaacg 15694106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 383
Target Start/End: Original strand, 17921780 - 17921956
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattaggcgggata-cttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagt 302  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||    | | || ||||||| |||||||||||   |||||  ||||||    
T  17921780 aggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tctttcataaagt 17921876  T
Q  303 tactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    || ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  17921877 tagtcatcattatagtggaacggagggctgctctcta-cccagactaggtcagtatttgaccgaattaagtaaacaaattt 17921956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 391
Target Start/End: Original strand, 33604011 - 33604190
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatc 310  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||  ||||| || |||||||||   ||  ||| |||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  33604011 agtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctttg-taaagttactcatc 33604109  T
Q  311 attatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33604110 attatagtggaacggatgactgctctctcccccaagatagatcggtattggaacaaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 33604190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 391
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173598
Alignment:
Q  332 gctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 8173598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583479
Alignment:
Q  143 tagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27583573 tagagttttctcttggcaacgaacactaaggttgggagtgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38414278 - 38414196
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcggga 262  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38414278 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcggga 38414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 391
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592346
Alignment:
Q  333 ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgtt 20592346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 39687094 - 39687182
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  39687094 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 39687182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Original strand, 39680156 - 39680238
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39680156 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 39680238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 2736316 - 2736404
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2736316 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 2736404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10942593 - 10942493
Alignment:
Q  297 taaagttactcatca-ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttttt 394  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  | || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10942593 taaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgttttt 10942494  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  10942493 t 10942493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10948462 - 10948362
Alignment:
Q  297 taaagttactcatca-ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttttt 394  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  | || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10948462 taaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgttttt 10948363  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  10948362 t 10948362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 17462547 - 17462635
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  17462547 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 17462635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 45679834 - 45679922
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  45679834 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 45679922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707748
Alignment:
Q  258 cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatg--ctctctaccccagactaggtcag 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  | || ||  |||||| | |||||||||||||     
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaa 22707774  T
Q  356 tattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22707773 t-ttggactgaactaggtcaacaaatt 22707748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34575203 - 34575132
Alignment:
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  34575203 ttatagtggaacaaagagctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaattt 34575132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 382
Target Start/End: Original strand, 38191126 - 38191197
Alignment:
Q  311 attatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38191126 attatagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 38191197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287349
Alignment:
Q  292 ttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtcagtgttggaccaaacttgttaaacaa 39287349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12781292 - 12781218
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12781292 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 12781218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27517710 - 27517636
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27517710 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt 27517636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33671038 - 33670949
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  33671038 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatatcttgtgttctttct 33670949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41303206 - 41303088
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaatta-ggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |   | | ||| |||| ||||||| ||||  |  |||||| ||||||    
T  41303206 aggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaaccttttggaa--tcttttgtaaagt 41303109  T
Q  303 tactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41303108 tactcatcattatagtggaac 41303088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 2741052 - 2741140
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  2741052 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatatcttgtgttctttct 2741140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Original strand, 17943547 - 17943720
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  |||||      
T  17943547 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg-taaagaa 17943641  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||| |  |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17943642 actcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 17943720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13569379 - 13569309
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  13569379 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttattcctttct 13569309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22407688 - 22407613
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  22407688 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 22407613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 30479128 - 30479179
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30479128 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 30479179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34575397 - 34575323
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34575397 aaaacaagggtttagaagccaacactaaaacttgggattgtagag-tttttctcttggcaacaaacattagggttg 34575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 38020178 - 38020253
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  38020178 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtt 38020253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 178
Target Start/End: Original strand, 39287186 - 39287262
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  39287186 gaaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagaattctcttagcaacaaacactaggattgtt 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41304668 - 41304596
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  41304668 aaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactagggtttg--taaagttttctattggcaacaaacattagggtt 41304596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163019
Alignment:
Q  288 tctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |  | |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 22163019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28459001 - 28458949
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28459001 aggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 14699053 - 14699123
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  14699053 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 14699123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20050093 - 20050018
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc-agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20050093 atcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 20050018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20054813 - 20054762
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20054813 tgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 20054762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20522271 - 20522201
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  20522271 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 20522201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 338
Target Start/End: Original strand, 23870958 - 23871031
Alignment:
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct 338  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||    
T  23870958 acttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctct 23871031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41304536 - 41304502
Alignment:
Q  290 tcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41304536 tcttttctaaagttactcatcgttatagtggaacg 41304502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20147028 - 20146987
Alignment:
Q  99 tgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  20147028 tgaaaacaagggttaagaagtcaacaagaaaactagggtttg 20146987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgga-acttttggtagaatta 255  Q
    |||||||| |||| | ||||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 1345587 - 1345634
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1345587 tgctctctcccccagagtaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 2736215 - 2736266
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  2736215 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-tttggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 2740951 - 2741002
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  2740951 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838123
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 397
Target Start/End: Original strand, 2869741 - 2869804
Alignment:
Q  333 ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  2869741 ctctctcccctagagtaggtca-tattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgttct 2869804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5377708 - 5377636
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagg 172  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  5377708 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 5377636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 383
Target Start/End: Original strand, 15697240 - 15697292
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  15697240 tgctctctcctctagactaggtcagtattcgaccgaagtgggtatacaaattt 15697292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30262045 - 30261981
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30262045 ggtttagaagccaaca-acaaactacggttt--atagagttttctcttggcaataaacactagggttg 30261981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16093 - 15808
Alignment:
Q  106 aagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtca 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| | | | |    
T  16093 aagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactatta 15994  T
Q  206 ggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15993 ggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15894  T
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||| ||||||||| | |  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15893 tcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 15808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 119)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 391
Target Start/End: Original strand, 42922238 - 42922523
Alignment:
Q  106 aagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtca 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| | | | |    
T  42922238 aagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactatta 42922337  T
Q  206 ggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42922338 ggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 42922437  T
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||| ||||||||| | |  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42922438 tcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 42922523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14183867 - 14183588
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |    
T  14183867 aaacaagggtttagaatgcaacacaaa--ctagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacact 14183770  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  14183769 attataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaag 14183670  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14183669 ttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattt 14183588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8347550 - 8347261
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |||| ||||||| |    
T  8347550 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattgctcttggcaacaaacaccaaggttagggttgattcaccttaggaaacact 8347451  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | | |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8347450 attatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 8347351  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  8347350 ttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatttcgtgtgtt 8347261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15669674 - 15669390
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | || || |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15669674 ctgaaaactagggtttgggaggcagcacaaaag-tagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaa 15669576  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  15669575 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgt 15669476  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  15669475 aaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattt 15669390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18800850 - 18800561
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || || |||||| |    
T  18800850 aaacaaaggtttagaagtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttgctcttggccacaaatactagggttggggttgattcaccctgagaaacact 18800751  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  18800750 attaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaag 18800651  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| | || |    |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18800650 ttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgtt 18800561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13125737 - 13125435
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttg-tatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||| | |||||||||      
T  13125737 aaacaagggttaagaagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttgctcttggcgacaaacactagggttgaggttgattcacattgggaaacgc 13125638  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaa 299  Q
    ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13125637 tgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaa 13125538  T
Q  300 agttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||    
T  13125537 agttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctcttt 13125438  T
Q  400 tct 402  Q
    |||    
T  13125437 tct 13125435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8349329 - 8349040
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |    
T  8349329 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggtttattcaccttgggaaacact 8349230  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||    
T  8349229 attaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaag 8349130  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||   | || || ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8349129 ttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 8349040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10400109 - 10399827
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  10400109 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10400010  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10400009 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 10399910  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10399909 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10399827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17186405 - 17186126
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| |    
T  17186405 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 17186306  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  17186305 atcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaag 17186206  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  17186205 ttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtaaacaaatt 17186126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9241341 - 9241084
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||||||     
T  9241341 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggtt 9241242  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9241241 acgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 9241142  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9241141 ggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactggggaaacaaatt 9241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50076953 - 50076671
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  50076953 aaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 50076854  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  50076853 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 50076754  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  50076753 aaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 50076671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50079102 - 50078819
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  50079102 aaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 50079003  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  50079002 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 50078903  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  50078902 aaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaatttggtaaacaaatt 50078819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 51750039 - 51750321
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  51750039 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 51750138  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  51750139 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 51750238  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  51750239 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 51750321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 13215081 - 13215368
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  13215081 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 13215180  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata----tctctt 293  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||    
T  13215181 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctctt 13215280  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  13215281 ttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgcgtcaacaaatt 13215368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17324918 - 17324635
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  17324918 aaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 17324819  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  17324818 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 17324719  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17324718 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 17324635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12302786 - 12302504
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  12302786 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 12302687  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||| |    
T  12302686 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgt 12302587  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  12302586 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 12302504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 16428653 - 16428936
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  16428653 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaa 16428752  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16428753 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16428852  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16428853 aaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaatt 16428936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 39462545 - 39462801
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  39462545 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 39462644  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  39462645 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaac 39462743  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |  | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  39462744 ggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 39462801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18839587 - 18839870
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttaga-agtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| | |  ||||||| ||||||||||    
T  18839587 aaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaa 18839686  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18839687 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 18839786  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  | || |||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  18839787 aaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 18839870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50307802 - 50307545
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  50307802 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 50307703  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  50307702 tacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaa 50307604  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  50307603 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 50307545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 391
Target Start/End: Original strand, 16561547 - 16561760
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaa 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||||||||    
T  16561547 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaa 16561646  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16561647 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16561746  T
Q  378 aaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||    
T  16561747 aaatttcgtgtgtt 16561760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 384
Target Start/End: Original strand, 27916498 - 27916782
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||| |||||    
T  27916498 gaaaacaagggtttagaagccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaaca 27916595  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaacc--ctttgatatctcttttc 296  Q
     | | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||   ||  ||| |||||| |||||  |||||||||||||||      
T  27916596 ctattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttg- 27916694  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27916695 taaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatttc 27916782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 28840680 - 28840961
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  28840680 aaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 28840779  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  28840780 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 28840878  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28840879 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28840961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 6756527 - 6756810
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  6756527 aaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 6756626  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| |||||  || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  6756627 acactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttg 6756724  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  6756725 taaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagt-ttggaccgaactggatcaacaaatt 6756810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 17318893 - 17319169
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  17318893 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaa 17318992  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    |||      |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  17318993 cag------gattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgt 17319086  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17319087 taagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 17319169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31735803 - 31735520
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  31735803 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31735704  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | | | || ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  31735703 acactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttg 31735604  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31735603 taacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 31735520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15295115 - 15294833
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  15295115 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 15295016  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15295015 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 15294916  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15294915 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 15823546 - 15823828
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  15823546 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 15823645  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  15823646 cactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgt 15823745  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  15823746 aacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 15823828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18307109 - 18307391
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||| ||||||    
T  18307109 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 18307208  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||| |    
T  18307209 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgt 18307308  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||    
T  18307309 aaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaacggagtcaacaaatt 18307391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25127872 - 25128155
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  25127872 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaa 25127971  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  25127972 cactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgt 25128071  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||||||||||||| || |||| | || ||||||||  |||| ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||    
T  25128072 aaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaat-taggaccgaactgggtcaacaaatt 25128155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 40133944 - 40134227
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  40133944 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40134043  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
     | |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  40134044 tactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 40134143  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  40134144 aaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccggactaggtaaacaaatt 40134227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9459698 - 9459414
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  9459698 aaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9459599  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||     
T  9459598 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttg 9459500  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459499 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 9459414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31425300 - 31425014
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||    
T  31425300 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 31425201  T
Q  197 acagtgtcaggattaagt---ctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    ||| | | |||||| |||   |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31425200 acactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctctt 31425101  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31425100 ttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 31425014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 381
Target Start/End: Original strand, 16226166 - 16226448
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  16226166 aaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 16226265  T
Q  197 acagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    ||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  16226266 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 16226365  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
     ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16226366 -taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 6823015 - 6823296
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  6823015 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaac-aaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6823113  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
     | | | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  6823114 tactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 6823213  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6823214 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 6823296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6995981 - 6995699
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  6995981 aaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaa 6995882  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  6995881 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttat 6995782  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6995781 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 6995699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30738845 - 30738605
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat- 263  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||   ||      
T  30738845 acactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaag 30738746  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcat--tatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattgg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30738745 acttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattgg 30738646  T
Q  362 accgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30738645 accaaacttggtaaacaaatttcgtgtgttctctcttttct 30738605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 47906270 - 47906552
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  47906270 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 47906369  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  47906370 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 47906469  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  47906470 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 47906552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3579871 - 3579616
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| |||||||   | |||||| ||||||||| |     
T  3579871 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgatt 3579772  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  3579771 acggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tagtgaaac 3579674  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | |  |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3579673 ggatgattgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3579616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9463525 - 9463241
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  9463525 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9463426  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||     
T  9463425 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttg 9463327  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463326 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 9463241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24325664 - 24325945
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||   ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||||||    
T  24325664 aaacaagggttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaac 24325763  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  24325764 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 24325863  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  24325864 atgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaat-tttgaccgaactgggtcaacaaatt 24325945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6115303 - 6115101
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||  ||||| | | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6115303 gttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaac 6115204  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6115203 caattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  6115104 aatt 6115101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495209
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| |   |  ||| ||||| ||||||||||    
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttgctcttggcaacaaacactatggttga-gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacgg 49495363  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  49495362 taagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaag 49495263  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |  ||||| ||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||    
T  49495262 ggcttatctctccccaagactatgtcaat-ttagaccgaactaggtaaagaaatt 49495209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11457756 - 11457474
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttct-cttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |  |||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  11457756 aaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 11457657  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11457656 cactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 11457557  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11457556 aaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 11457474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 382
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324346
Alignment:
Q  141 tatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattg 237  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||   | ||||||||||||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  238 gaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctc 337  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctc 17324302  T
Q  338 taccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17324303 tccccatgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 17324346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26520401 - 26520109
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||| ||||||||||    
T  26520401 ctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaa 26520302  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttgg------tcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatct 290  Q
    || | | | |||| ||||||||||      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||       
T  26520301 cactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--- 26520205  T
Q  291 cttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 390  Q
          ||||||| || || |||||||||||||| | || |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26520204 -----gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgt 26520110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27337219 - 27336939
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  27337219 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagatttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 27337120  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | ||||||  |||||||||| ||||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  27337119 actattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 27337021  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27337020 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27336939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46431988 - 46431705
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  46431988 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 46431889  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  46431888 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 46431790  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct--accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || ||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  46431789 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 46431705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25248752 - 25248550
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25248752 gttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25248653  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25248652 ccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 25248554  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  25248553 aatt 25248550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 370
Target Start/End: Original strand, 2617516 - 2617786
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  2617516 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 2617615  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  2617616 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 2617715  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2617716 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactg 2617786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 382
Target Start/End: Original strand, 16429048 - 16429240
Alignment:
Q  189 cttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatat 288  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  16429048 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 16429147  T
Q  289 ctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16429148 ctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25251556 - 25251273
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| |||||    
T  25251556 aaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 25251457  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  25251456 cactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgt 25251357  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  | || |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  25251356 aaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 25251273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38925733 - 38925480
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||||||     
T  38925733 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 38925634  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||  |||    
T  38925633 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtaaaac 38925537  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  38925536 ggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaatt 38925480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 41646924 - 41647202
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| || || |   |||||||| |||||||||||| |    
T  41646924 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacact 41647023  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |    
T  41647024 attaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacg 41647123  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |  ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  41647124 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 41647202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2949512 - 2949231
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactaggg-ttgttg-ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  2949512 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaa 2949413  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  2949412 cactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 2949313  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2949312 aacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct-cccccgactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 2949231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4131660 - 4131401
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||  ||||||||||    
T  4131660 aaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa 4131561  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatct----ctt 293  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||  |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    |||    
T  4131560 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctctt 4131462  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  4131461 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 4131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14098225 - 14097968
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||| |||   |  ||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||||||     
T  14098225 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 14098126  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa-gttactcatcattatagtggaa 322  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  14098125 acgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaa 14098027  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | || |||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14098026 cggagggctgctctctcccacaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14097968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2510579 - 2510324
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||| |||||     
T  2510579 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggtt 2510480  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2510479 acgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 2510382  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2510381 ggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 2510324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26613455 - 26613228
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat- 263  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||   ||      
T  26613455 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaag 26613356  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  26613355 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgac 26613256  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26613255 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 26613228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30790615 - 30790391
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcg-ggat 263  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||| ||| |||||||| |  |||||  |||||||||||   |||     
T  30790615 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 30790517  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30790516 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 30790418  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 390  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||    
T  30790417 cgaactggataaacaaaattcgtgtgt 30790391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 13761837 - 13762118
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  |  ||||||||  ||||| |||    
T  13761837 aaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaa 13761936  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  13761937 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 13762035  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || | |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13762036 aacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 13762118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21948468 - 21948230
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  21948468 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaa 21948370  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  21948369 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 21948270  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct 338  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  21948269 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 21948230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 28842495 - 28842776
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| | ||||||||    
T  28842495 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaa 28842594  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  28842595 cactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 28842693  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |  ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28842694 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaat-ttggacagaactaggtcaacaaatt 28842776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 47179713 - 47179993
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | | ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  47179713 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 47179812  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  47179813 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 47179911  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47179912 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 23785954 - 23786123
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  23785954 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 23786052  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23786053 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 23786123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31423155 - 31422933
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  31423155 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaa 31423056  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  31423055 acactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttg 31422956  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtg 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  31422955 taaggttactcatcattatagtg 31422933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 39932073 - 39932356
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||  ||||||||||    
T  39932073 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaa 39932172  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  39932173 cactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgt 39932272  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctc-taccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39932273 aacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaat-ttggaccgaattgggtcaacaaatt 39932356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20291457 - 20291738
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| | ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20291457 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaa 20291556  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  20291557 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 20291655  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | | ||||||| ||||||||| || | || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20291656 aacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20291738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28998534 - 28998252
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  28998534 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 28998435  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||      
T  28998434 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgc 28998335  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||| ||| |||  | || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28998334 aacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28998252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29004250 - 29003968
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  29004250 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 29004151  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||      
T  29004150 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgc 29004051  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||| ||| |||  | || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29004050 aacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 29003968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 16432475 - 16432678
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16432475 gttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaac 16432574  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc-agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||   |  |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||    
T  16432575 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaac 16432673  T
Q  378 aaatt 382  Q
    |||||    
T  16432674 aaatt 16432678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 48665177 - 48665403
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  48665177 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaa 48665276  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcac-gggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  48665277 cactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 48665376  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48665377 taacgttactcatca-tatagtggaacg 48665403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 383
Target Start/End: Original strand, 28279277 - 28279552
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaacagtgtcagg 207  Q
    |||||||||| ||| |  |||| |||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||||| |||||| |||||| | | |||    
T  28279277 ggtttagaagccaataacaaaattagggtttgta--gagtttgctcttgacaacaaacactagggttgggattgattccccttggagaaacactattagg 28279374  T
Q  208 attaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttact 306  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | | ||| ||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  28279375 attgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttact 28279474  T
Q  307 catcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc-agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||   |  | || ||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28279475 catcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaattt 28279552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20302459 - 20302740
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20302459 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20302558  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  20302559 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 20302657  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | |||||||||  |||||||| || | |  | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  20302658 aacgatactcatcag-atagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 20302740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27339411 - 27339130
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  27339411 aaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27339312  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
     | | | | |||| |||||||| || ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  27339311 tactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27339213  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  27339212 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 27339130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 383
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916675
Alignment:
Q  270 tcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaact 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  370 gggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattt 15916675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 47177362 - 47177642
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | | ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  47177362 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 47177461  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  47177462 cactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 47177560  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  47177561 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcag-attggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 373
Target Start/End: Original strand, 47451749 - 47451915
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtta 304  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||    
T  47451749 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 47451848  T
Q  305 ctcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 373  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47451849 ctcatca-tatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 47451915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28207347 - 28207067
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  || |||| ||||||||||    
T  28207347 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaa 28207248  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | ||||||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||   || ||||| |||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  28207247 cactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 28207148  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||   |||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28207147 aacgttactcatc---atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28207067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 382
Target Start/End: Original strand, 23816028 - 23816168
Alignment:
Q  240 acttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctcta 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||     
T  23816028 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 23816168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Original strand, 16231644 - 16231834
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaa 277  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16231644 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16231743  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgg 371  Q
    ||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231744 cccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 16231834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Original strand, 31489915 - 31490167
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||||||||||||   | |||||||| |||||||||||    
T  31489915 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagt-ttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaac 31490013  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| | | ||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  31490014 actattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgta 31490113  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | |||| |||||| ||| ||| |||| | || |||||||  |||||||||||||||    
T  31490114 aggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtca 31490167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127665
Alignment:
Q  285 atatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T
Q  385 gtgtgttttttcttttct 402  Q
     |||||| | ||||||||    
T  13127682 atgtgttctctcttttct 13127665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155966
Alignment:
Q  180 ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaac 278  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||   ||  | | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtatt 359  Q
    | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  155888 cttttgttatctctttg-taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaatatt 155966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 382
Target Start/End: Original strand, 51752473 - 51752645
Alignment:
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttact 306  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||    
T  51752473 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgatact 51752571  T
Q  307 catcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||| ||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  51752572 caccat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 51752645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50248772 - 50248569
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| | |||||||||| | | |||||| ||||||||||| || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50248772 gttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 50248673  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatg--ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 376  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  | || ||  |||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||    
T  50248672 ccattgacatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaat-ttggtccgaattgggtcaa 50248575  T
Q  377 caaatt 382  Q
    ||||||    
T  50248574 caaatt 50248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 295
Target Start/End: Original strand, 6823885 - 6824089
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  6823885 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6823984  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg-------gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatct 290  Q
    || | | | |||| | ||||||||| ||||       |||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6823985 cactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttct 6824084  T
Q  291 ctttt 295  Q
    |||||    
T  6824085 ctttt 6824089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 382
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757812
Alignment:
Q  190 ttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatc 289  Q
    |||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  290 tcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||| ||| | |||||| || |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 51757812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13127910 - 13127787
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||   | ||||| |||||||||||| |    
T  13127910 aaacaagggtttagaagccaacaagaaaagtagggtttatatagagtttccttttggcaacaaacactagggttgggatagattcaccttgggaaacatt 13127811  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcac 225  Q
    ||  | ||||||||||||||||||    
T  13127810 gttggaattaagtctcttggtcac 13127787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 367
Target Start/End: Original strand, 14352970 - 14353233
Alignment:
Q  112 ttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttg--------ttgattcgccttgg-gaaaca 199  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||   |||        ||||||| |||||| ||||||    
T  14352970 ttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagaga--tttctcttggcaacaaacactaggtttgagattgaatcaccattgattcaccttggagaaaca 14353067  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgga-acttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  14353068 ctattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaact-attcttgtaaccctttgaaatct--tttgta 14353164  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||| | || ||||||| |||||||||    
T  14353165 aagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctcccccaaagtatgtcagtaatggaccgaa 14353233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26332837 - 26332715
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| |||| |||||||     
T  26332837 aaaacaagggtttagaagccaacacaaaaa-tagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactaggtttgggtttgattcaccttcggaaacac 26332741  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacg 226  Q
    | | |||||| |||||||||||||||    
T  26332740 tattaggatttagtctcttggtcacg 26332715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 337
Target Start/End: Original strand, 43104332 - 43104400
Alignment:
Q  269 ttcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  43104332 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 9526577 - 9526666
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  9526577 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 9526666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 382
Target Start/End: Original strand, 46783163 - 46783331
Alignment:
Q  215 ctcttggtcacgggaagagattg-gaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcat 312  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  46783163 ctcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcat 46783261  T
Q  313 tatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||  |  | || | ||| | ||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  46783262 tatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21353518 - 21353345
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  |||||      
T  21353518 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-taaagaa 21353424  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  21353423 actcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaatt 21353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 397
Target Start/End: Original strand, 2232724 - 2232790
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2232724 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 2232790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 9521826 - 9521915
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  9521826 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 9521915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 47451648 - 47451723
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  47451648 aaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 47451723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 47703982 - 47704052
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||    
T  47703982 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttttttcctttct 47704052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2393353 - 2393280
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2393353 atcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt 2393280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2401292 - 2401218
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2401292 atcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 2401218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4144754 - 4144680
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4144754 atcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4144680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 14997153 - 14997227
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14997153 atcattatagtggaacgaatagctgctctctcccccagaataggttatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 14997227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 169
Target Start/End: Original strand, 32261036 - 32261103
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacact 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32261036 gaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactaaggtttg--tagagttttctcttgacaacaaacact 32261103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 382
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358855
Alignment:
Q  313 tatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 13358855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13598471 - 13598379
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||| ||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  13598471 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 13598379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  180 ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaatta 255  Q
    ||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 47102887 - 47102957
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  47102887 tgctctctcccctagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcctttct 47102957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8213615 - 8213581
Alignment:
Q  290 tcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213615 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 8213581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13785295 - 13785261
Alignment:
Q  348 taggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13785295 taggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 13785261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37069823 - 37069774
Alignment:
Q  329 gatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37069823 gatgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3091382 - 3091314
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3091382 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggtaacaaacactagggttg 3091314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4144958 - 4144804
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  4144958 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaaa-aacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaaca 4144861  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  4144860 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 10115948 - 10116003
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10115948 attcttgaaaccatttgatatctctttg-taaagttactcatcattactgtggaacg 10116003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19072979 - 19072932
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19072979 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19120869 - 19120822
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19120869 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 26644943 - 26644990
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26644943 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 391
Target Start/End: Original strand, 43104443 - 43104479
Alignment:
Q  355 gtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104443 gtatttgatcgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 43104479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 49959041 - 49959114
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||  |||||  | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  49959041 aaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactatggtttg--tagagaatcctcttggcaacaaacattagggttg 49959114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1629
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||      
T  1910 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt--------caacaaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacaca 1819  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1818 attaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 1719  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1718 ttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 1629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 117)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24817628 - 24817340
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||    
T  24817628 aaacaagggtttagaagtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttgctctttgcaacaaacactagggttgg-gttgattcaccttggaaagcagt 24817530  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  24817529 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaag 24817430  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24817429 ttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaacttggtaaacgagtttcgtgtgtt 24817340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24813761 - 24813485
Alignment:
Q  114 agaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaag 213  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | | |||||| ||    
T  24813761 agaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaagaaacactagggttgg-gttgattcaccttgggaagcactattaggattgag 24813663  T
Q  214 tctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcatt 313  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24813662 tctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcatt 24813563  T
Q  314 atagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||| || | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24813562 atagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgtt 24813485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 406
Target Start/End: Original strand, 7188553 - 7188859
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |    
T  7188553 aaacaagggtttagaagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacact 7188652  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  7188653 attaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaag 7188752  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt--cgtgtgttttttcttt 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||  | |||||||    
T  7188753 ttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaattttgcgtgttctctttcttt 7188852  T
Q  400 tctctcg 406  Q
    |||||||    
T  7188853 tctctcg 7188859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20137388 - 20137106
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20137388 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20137289  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20137288 cactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 20137189  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20137188 aaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20137106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20091823 - 20091580
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20091823 ctgaaaacaagggtttcggaggcaacacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgctattggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaa 20091725  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20091724 cactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 20091625  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag 345  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| | || |||||||| ||||||    
T  20091624 aaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31435326 - 31435043
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  31435326 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 31435227  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31435226 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 31435127  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31435126 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttgtaccgaactgggtcaacaaatt 31435043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 38393996 - 38394278
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  38393996 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38394095  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  38394096 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 38394195  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38394196 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 38394278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 44724589 - 44724871
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  44724589 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 44724688  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  44724689 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 44724788  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  44724789 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 44724871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 141 - 391
Target Start/End: Original strand, 6332272 - 6332523
Alignment:
Q  141 tatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaa 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||||   |||| ||||| | | | |||| ||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  6332272 tatagagtttactcttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgaga 6332371  T
Q  241 cttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctcta 339  Q
    |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||     
T  6332372 ctttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctc 6332471  T
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6332472 ccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 6332523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13099755 - 13099471
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||    
T  13099755 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaa 13099656  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttc 296  Q
    || | | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  13099655 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttg 13099556  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13099555 taaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 13099471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7472259 - 7471977
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  7472259 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7472160  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  7472159 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 7472060  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  7472059 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 7471977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 20299495 - 20299752
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt---gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |    |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  20299495 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 20299594  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||     
T  20299595 tacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggat 20299693  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20299694 cggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20299752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39146266 - 39145983
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttaga-agtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     |||||||| |||||| |||    
T  39146266 aaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaa 39146167  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  39146166 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 39146067  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   || |||||| | ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  39146066 aaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaat-ttgtaccgaactgggtcaacaaatt 39145983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Original strand, 11081518 - 11081821
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | ||||||||    
T  11081518 ctgaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaacccttt--gatatctcttt 294  Q
    || | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||  ||| |||||||   ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  295 tctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    | |||||||||||||| ||| | ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctc 11081815  T
Q  395 tctttt 400  Q
    ||||||    
T  11081816 tctttt 11081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4296214 - 4295931
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||| |||||||||    
T  4296214 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaa 4296115  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  4296114 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttg 4296015  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||  | || |||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4296014 taacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtgaacaaatt 4295931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 48457663 - 48457945
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  || |||| ||| ||||||    
T  48457663 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaa 48457762  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  48457763 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 48457862  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  48457863 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 48457945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Original strand, 443604 - 443888
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  443604 aaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 443703  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  443704 acactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctctttta 443803  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  443804 taacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 443888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 1849991 - 1850273
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  1849991 aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 1850090  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||| ||||| | ||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1850091 cactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 1850190  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1850191 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 1850273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24748604 - 24748887
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| || |||||||    
T  24748604 aaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 24748703  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24748704 cactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24748803  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  24748804 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaatt 24748887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 324
Target Start/End: Original strand, 25276177 - 25276377
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||  ||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  25276177 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 25276276  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25276277 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 25276376  T
Q  324 g 324  Q
    |    
T  25276377 g 25276377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1049574 - 1049272
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  1049574 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 1049475  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  1049474 cactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 1049376  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttttttc 396  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  1049375 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttc 1049278  T
Q  397 ttttct 402  Q
    | ||||    
T  1049277 tcttct 1049272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 9679095 - 9679351
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  9679095 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 9679194  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9679195 acgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 9679293  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |    ||||||||  |||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||    
T  9679294 ggagtactgctctctttcccagactaggtcaat-ttggaccagactgggtcaacaaatt 9679351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7470301 - 7470019
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||    
T  7470301 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaa 7470202  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  7470201 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 7470102  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  7470101 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 7470019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 40946338 - 40946620
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||  | |||| |||    
T  40946338 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaa 40946437  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||||| || ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  40946438 cactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgt 40946537  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40946538 aacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40946620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 388
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465835
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttgctcttggcaacaaacactagggttgaa-ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgg 24465676  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||       
T  24465677 gaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggt 24465775  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    |  |||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24465776 gactgctctctcccccagactagatcaata-tgaaccgaactgagtaaacaaatttcgtgt 24465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37412407 - 37412133
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttg-gcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  37412407 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 37412308  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-tttt 295  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  37412307 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 37412208  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgg 371  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  37412207 gtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaat-ttggaccgaactgg 37412133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42331278 - 42330994
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  42331278 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 42331179  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggt--cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    || | | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42331178 cactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 42331079  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||||||| | ||||||| |||| | || |  ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42331078 gtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 42330994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 11355268 - 11355550
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  11355268 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 11355367  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  11355368 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgt 11355467  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||  |  | |||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11355468 aacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11355550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20297372 - 20297654
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20297372 aaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20297471  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20297472 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20297571  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  20297572 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaataaatt 20297654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20626048 - 20626330
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20626048 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20626147  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20626148 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20626247  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20626248 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20626330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20629939 - 20630221
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20629939 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20630038  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20630039 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20630138  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20630139 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20630221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20642358 - 20642640
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20642358 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20642457  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20642458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20642557  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20642558 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 20642640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27832884 - 27832656
Alignment:
Q  129 aactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcac 225  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||    
T  27832884 aactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 27832785  T
Q  226 gggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacga 325  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |     
T  27832784 gggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatgg 27832685  T
Q  326 aaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | || | |||||| |||||||||||||||    
T  27832684 agggcttctctctcccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40837017 - 40836740
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| |    
T  40837017 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 40836918  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |    
T  40836917 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacg 40836819  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40836818 atactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40836740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3878587 - 3878869
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactaggg-ttgttg-ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||    
T  3878587 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaa 3878686  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  3878687 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 3878786  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| |||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3878787 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27306508 - 27306227
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  27306508 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 27306410  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27306409 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgt 27306310  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27306309 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 27306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 28487563 - 28487845
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||    
T  28487563 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaa 28487662  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  28487663 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 28487762  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  28487763 aacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 28487845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1047177 - 1046901
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1047177 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 1047078  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||      
T  1047077 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatt 1046980  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    | | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  1046979 ggagggctgctctctcccccacactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttct 1046901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7351931 - 7351647
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  7351931 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7351832  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  7351831 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 7351733  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351732 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 7351647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31156190 - 31155906
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  31156190 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaa 31156091  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  31156090 cactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 31155992  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | |||||||| | ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155991 taacggtactcatcct-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 31155906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Original strand, 9680829 - 9681113
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||| |||||    
T  9680829 aaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 9680928  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  9680929 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttg 9681028  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || ||||||    
T  9681029 taaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactaggtcaataaattt 9681113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 24258473 - 24258744
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  24258473 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaa 24258572  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24258573 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24258672  T
Q  298 aaagttactcatc---attatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| | || ||||||||    |||||||||||| | ||||||||||    
T  24258673 aaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaat-ttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 42223167 - 42223450
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||    
T  42223167 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 42223266  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  42223267 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttg 42223366  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| || | | || |||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||| ||||||||    
T  42223367 taacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-tttgatcgaactgggtcaacaaatt 42223450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18345551 - 18345833
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18345551 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18345650  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  18345651 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18345750  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18345751 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtcaacaaatt 18345833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 21678076 - 21678358
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  21678076 aaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 21678175  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  21678176 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgt 21678275  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||| ||||||| |||    || |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||  ||||||||    
T  21678276 aaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaat-ttggaccgaactgggacaacaaatt 21678358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 370
Target Start/End: Original strand, 21680037 - 21680307
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  |||||||  |||||||||    
T  21680037 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaa 21680136  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  21680137 cactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgt 21680236  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  |  | |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  21680237 aaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaat-ttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 321
Target Start/End: Original strand, 11757265 - 11757462
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt---gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |    |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  11757265 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 11757364  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtgga 321  Q
     ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757365 tacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7092410 - 7092210
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092410 gttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7092311  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  7092310 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 7092214  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  7092213 aatt 7092210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Original strand, 35639 - 35922
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  35639 aaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 35738  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  35739 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 35838  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |  | |||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  35839 aacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaattt 35922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3035731 - 3036016
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  3035731 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3035830  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaaga---gattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttt 294  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||   |  ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3035831 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 3035930  T
Q  295 tctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |  || | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3035931 tgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3036016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 44574 - 44856
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||| |||||    
T  44574 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaa 44673  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  44674 cactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 44773  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |  | |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  44774 aacgttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 44856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21592422 - 21592140
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||     
T  21592422 aaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaag 21592323  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  21592322 cactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgt 21592223  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  21592222 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 21592140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 21990160 - 21990442
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||||    
T  21990160 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaa 21990259  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |    
T  21990260 cactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgt 21990359  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  21990360 aacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 21990442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 2935393 - 2935562
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  2935393 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 2935491  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2935492 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 2935562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40281590 - 40281370
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat- 263  Q
    ||||||||||||   || |||| ||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||      
T  40281590 acactagggttgggattaattcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaag 40281491  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40281490 acttattcttgtaaccctttgat-------ttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggac 40281398  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||    
T  40281397 agaactgtgtaaacaaattttgtgtgtt 40281370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7094658 - 7094457
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094658 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7094559  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |    
T  7094558 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaata 7094461  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  7094460 aatt 7094457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7349552 - 7349285
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  7349552 aaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7349453  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  7349452 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 7349354  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7349353 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290461
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacg 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||    |||||| |||| | |||||| | | || ||| ||||||||||||||     
T  13290723 aaactagggtttgta--gagttttctcttggcaacaaacactaggcttgggagtgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcaca 13290626  T
Q  227 ggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacga 325  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||||||||   ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||      
T  13290625 ggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttg-taaagttactcatcattatagcggaacag 13290527  T
Q  326 aaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |  | | | |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13290526 agagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 13290461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 382
Target Start/End: Original strand, 22393880 - 22394015
Alignment:
Q  246 ggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||||| ||| ||    
T  22393880 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccctag 22393979  T
Q  346 actaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  22393980 actaggtcaat-ttggaccaaactgggtaaacaaatt 22394015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43253795 - 43253514
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||    
T  43253795 aaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaac 43253696  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||| | |||| |||||  ||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  43253695 actattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgta 43253596  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |  | || |||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||    
T  43253595 acgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaataaatt 43253514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297016
Alignment:
Q  180 ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatactt-attcttgtaac 278  Q
    ||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    ||   || |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  279 cctttga-tatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  378 aaatttc 384  Q
    |||||||    
T  16297022 aaatttc 16297016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 28485576 - 28485857
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| |||||    
T  28485576 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaa 28485675  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  28485676 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgt 28485775  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||| || | |  | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28485776 aacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28485857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 1606505 - 1606673
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  1606505 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 1606602  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1606603 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 1606673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 25542566 - 25542820
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||     
T  25542566 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggtt 25542664  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  25542665 acaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 25542762  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |  | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  25542763 ggagagctgctctctcccctagactaggttaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 25542820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 38396726 - 38396926
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38396726 gttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38396825  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||| ||| |||  |||||||||| ||||||||| || | || | |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  38396826 ccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 38396922  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  38396923 aatt 38396926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 22137203 - 22137369
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  22137203 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 22137300  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22137301 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 22137369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22828912 - 22828691
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||   | ||||||||   || | |||    
T  22828912 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaa 22828813  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22828812 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 22828713  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtg 319  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  22828712 aaaattactcattattatagtg 22828691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 40552230 - 40552396
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  40552230 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 40552327  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40552328 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 40552396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 6048883 - 6049175
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttg-ggaaac 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| |||||  |||||    
T  6048883 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactagggtttgtaaaga--attctcttggcaacaaacactaggtttgggattgattcaccttgaagaaac 6048980  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    | | | |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||||   | | || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |    
T  6048981 actattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgt 6049079  T
Q  298 aaagttactcatcat--tatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |  | ||||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  6049080 aaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattccgtgtgtt 6049175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9027357 - 9027189
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  9027357 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 9027260  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9027259 -aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 9027189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 382
Target Start/End: Original strand, 6046625 - 6046787
Alignment:
Q  220 ggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagt 318  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6046625 ggtcacgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttg-taaagttactcatcattatagt 6046723  T
Q  319 ggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  6046724 ggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggatagacaaatt 6046787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 382
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295740
Alignment:
Q  227 ggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaa 326  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 26295685  T
Q  327 aggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     |  |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  26295686 tgactgctctctcctccagactaggtcaat-ttggactgaactggataaacaaatt 26295740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 22108192 - 22108358
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  22108192 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 22108289  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22108290 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 22108358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 40549952 - 40550118
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  40549952 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 40550049  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40550050 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 40550118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22251722 - 22251597
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata----tctcttttctaaa 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||| ||||    
T  22251722 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaa 22251623  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22251622 gttactcatcattatagtggaccgaa 22251597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349018
Alignment:
Q  218 ttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatag 317  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  318 tggaacg 324  Q
    |||||||    
T  6349012 tggaacg 6349018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6067474 - 6067195
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg------ttgttgattcgccttggg--aaacag 200  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||      || ||||||| |||||    |||||     
T  6067474 ggtttagaagccaacaaacaaactagggttt--atagagaattctcttggtaacaaacactagggttgggattgtttttgattcaccttgaacaaaacat 6067377  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaa 299  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||   ||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||    
T  6067376 tgataggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaa 6067278  T
Q  300 agttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||| ||||||||||| |||| |  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6067277 aggaactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaatt 6067195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 280
Target Start/End: Original strand, 26804579 - 26804764
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt-----gttgattcgccttggg 194  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    |||     |||||||| |||||||    
T  26804579 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttggg 26804678  T
Q  195 aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccc 280  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26804679 aaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392608
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttgctattggcaacaaacactagggttgg-gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 22392600  T
Q  228 gaagagat 235  Q
    ||||||||    
T  22392601 gaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Original strand, 26210556 - 26210837
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaacag 200  Q
    |||||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |     
T  26210556 aaacaaggttttagaatccaacctcaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaac-aacactagggttgtgattgattcaccttggagaaatac 26210652  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccc-tttgatatctcttttct 297  Q
    | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   | | ||| ||||||||||||| ||||||| |   |||      
T  26210653 tattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaacccttttgata-catgtttgg 26210751  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |  | | |||||| |||  || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26210752 aaagttactcatcattataatagaacggagagcttctctctcccctggagtaggttagtattggactgaactgggtaaacaaattt 26210837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 382
Target Start/End: Original strand, 25356954 - 25357230
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  25356954 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaac-aacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaaca 25357051  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  ||    
T  25357052 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-ta 25357146  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25357147 aagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25357230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Original strand, 6348826 - 6348913
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  6348826 ctgaaaacaagggtttagaagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagtttgctcttggcaacaaacattagggttgaggttgatt 6348913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 257
Target Start/End: Original strand, 11084437 - 11084544
Alignment:
Q  150 ttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggta 249  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  11084437 ttctcttggcaacaaacaatagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggta 11084536  T
Q  250 gaattagg 257  Q
     |||||||    
T  11084537 aaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 2075226 - 2075300
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2075226 atcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 2075300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 382
Target Start/End: Original strand, 25351260 - 25351536
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  25351260 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaac-aacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaaca 25351357  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  ||    
T  25351358 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-ta 25351452  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||  |||||||||||||||||| || |  | || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25351453 aagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25351536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 382
Target Start/End: Original strand, 25410037 - 25410315
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  25410037 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaac-aacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaaca 25410134  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  ||    
T  25410135 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-ta 25410229  T
Q  299 aagttactcat--cattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25410230 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25410315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7464590 - 7464516
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7464590 atcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 7464516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546877
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 34546877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 382
Target Start/End: Original strand, 2120807 - 2121084
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg------ttgttgattcgccttggg--aaacag 200  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||      |||||||||| ||||||   |||||     
T  2120807 ggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-ttttctcttggcaac-aactctagggttgggattgttgttgattcaccttggacaaaacac 2120904  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaa 299  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  |||    
T  2120905 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-taa 2120999  T
Q  300 agttactcat--cattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  ||||||  |||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2121000 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaatt 2121084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8378575 - 8378486
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  8378575 atcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 8378486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 381
Target Start/End: Original strand, 7069891 - 7069963
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7069891 tcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 7069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 25405504 - 25405592
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  25405504 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 25405592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3320121 - 3320039
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3320121 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 3320039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3324869 - 3324787
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3324869 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 3324787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 42006774 - 42006848
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  42006774 atcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatt 42006848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44010821 - 44010747
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44010821 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt 44010747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15541044 - 15540984
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15541044 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 15540984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2990676 - 2990601
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa-tttcgtgtgttttttcttttctctc 405  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||    
T  2990676 tgctccctcccccagagtaggtcggtattggaccgaactgggtaaacaaacttgcttgtgttctttctcttctctc 2990601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20091194 - 20091144
Alignment:
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20091194 ccccagactaggtcagtattggaccgaactggataaataaa-ttcgtgtgtt 20091144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22280444 - 22280359
Alignment:
Q  272 ttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtat 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||  || | ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22280444 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaacagaaagctgctctc-accacagactagatcagtat 22280359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 30247081 - 30247155
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||| ||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30247081 atcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatt 30247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Original strand, 9190054 - 9190114
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  9190054 tgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttt 9190114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 389
Target Start/End: Original strand, 21369753 - 21369834
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtg 389  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21369753 atcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaattttcttgtg 21369834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Original strand, 28617271 - 28617331
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  28617271 tgctctctcccccagagtaggtca-tattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgttt 28617331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44016937 - 44016869
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44016937 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggttg 44016869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 177
Target Start/End: Original strand, 45366550 - 45366615
Alignment:
Q  109 ggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgt 177  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45366550 ggtttagaagtcaaca-acaaactagagttt--atagagttttcttttggcaacaaacactagggttgt 45366615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 7074898 - 7074986
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | ||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||    
T  7074898 tcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 7074986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759419
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 11759419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 18567623 - 18567698
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18567623 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtt 18567698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20284140 - 20284070
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  20284140 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 20284070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44016709 - 44016658
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44016709 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaatt 44016658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44143937 - 44143864
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44143937 atcattatagtggaacggagagttgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaattggataaacaaatt 44143864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44512596 - 44512523
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||| |||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44512596 atcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 44512523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2580441 - 2580381
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||    
T  2580441 tgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgttt 2580381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44011026 - 44010958
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44011026 agggtttagaagccaacatacaaactatggtttatagagaatttt-tcttggcaacaaacactagggttg 44010958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12310244 - 12310157
Alignment:
Q  149 tttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttggg-aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt 236  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||| |||||   ||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12310244 tttctcttg-caacaaacactagggttgggattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21983335 - 21983288
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21983335 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 161)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 31151325 - 31151607
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  31151325 ctgaaaacaagggtttagaaatcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaa 31151424  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  31151425 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgt 31151522  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31151523 aaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaatt 31151607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 562049 - 561767
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | |||||||||| |    
T  562049 aaacaagggtttagaagtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttcaggttgattcacattgggaaacact 561951  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||    
T  561950 attaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaag 561851  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacc-ccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  561850 ttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttc 561767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Original strand, 53597220 - 53597509
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  53597220 aaacaagggtttataagtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacact 53597319  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||  | |||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  53597320 attaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaag 53597419  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  53597420 ttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggtaagctaatttcgtgtgtt 53597509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36871575 - 36871286
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    ||||||| |||||| ||||| |    
T  36871575 aaacaagggtttacaagccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttaggattgattcaccttggaaaacact 36871476  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
    || | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  36871475 gttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttg-taaa 36871377  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36871376 gttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgtt 36871286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420186
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttttctctaggcaacaaacactagggttga-gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 13420334  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  13420333 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggag 13420234  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 376  Q
     | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13420233 agctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggtaaa 13420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53917941 - 53917659
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  53917941 aaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 53917842  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  53917841 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 53917742  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53917741 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 53917659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28761705 - 28761422
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||   |  ||||||| |||||| ||||    
T  28761705 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaac 28761606  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28761605 actattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 28761506  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28761505 aagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaatt 28761422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Original strand, 23633439 - 23633715
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||  ||||||||     
T  23633439 aaaacaaggatttagaagccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgatttacc--gggaaacac 23633536  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  23633537 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaa 23633635  T
Q  301 gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||| || | | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||    
T  23633636 gttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaaatgggtaaacaaatt 23633715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4308558 - 4308276
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  4308558 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 4308459  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4308458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4308359  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4308358 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 4308276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 1313415 - 1313671
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||     
T  1313415 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagtt 1313514  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  1313515 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaac 1313613  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1313614 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 1313671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635653
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgg 25635490  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |     
T  25635491 gaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagag 25635590  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    || |||||||| |||  | ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25635591 ggttgctctctcccctcggctaggccaat-ttggaccaaactgcgtaaacaaatttcgtgtgtt 25635653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 1673951 - 1674233
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||    
T  1673951 tctgaaaataagggtttagaagttaacaagaaaactagtgtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttaggattgattcaccatgggaa 1674050  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  1674051 acactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttg 1674150  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    ||||||||||     ||    ||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1674151 taaagttact-----tt----tggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaattttgtgt 1674233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 38890020 - 38890302
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  38890020 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38890119  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  38890120 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 38890219  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38890220 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 38890302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10956304 - 10956022
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  10956304 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10956205  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  10956204 cattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 10956105  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10956104 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10956022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 11170384 - 11170666
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  11170384 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaa 11170483  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  11170484 cactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 11170583  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  11170584 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgggccgaactgggtcaacaaatt 11170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18099447 - 18099165
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18099447 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18099348  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  18099347 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18099248  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18099247 aacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaata-tggaccgaactgggtcaacaaatt 18099165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53915773 - 53915491
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||   | |||||||  ||||| ||||    
T  53915773 aaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaa 53915674  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  53915673 cattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 53915574  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||    
T  53915573 aatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-tttgactgaactgggtcaacaaatt 53915491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 1321485 - 1321741
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1321485 aaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 1321584  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    || |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  1321585 acaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 1321683  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1321684 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 1321741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 3314690 - 3314947
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  3314690 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 3314789  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    || ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  3314790 acaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaac 3314889  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3314890 ggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3314947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795521
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgg-gttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgg 17795367  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
     |||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  17795368 aaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaa 17795467  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||    
T  17795468 ggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgaaccgaattaggtaaacaaatt 17795521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103961
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgg-gttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgg 19103807  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
     |||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  19103808 aaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaa 19103907  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||    
T  19103908 ggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgaaccgaattaggtaaacaaatt 19103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5927041 - 5926759
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  5927041 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaa 5926942  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  5926941 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgt 5926842  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||| || |||| | |  |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  5926841 aaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 5926759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10958600 - 10958318
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  10958600 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10958501  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  10958500 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 10958401  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10958400 aacgttactcttca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10958318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28102279 - 28101997
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  28102279 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 28102180  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    |  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28102179 cgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 28102080  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  28102079 aaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaat-ttggaccaaactaggtcaacaaatt 28101997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43421692 - 43421410
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  43421692 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 43421593  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43421592 cactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 43421493  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  43421492 aacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 43421410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 746737 - 747021
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  746737 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 746836  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  746837 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 746935  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  746936 taacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 747021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 45882919 - 45883202
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||| || ||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  45882919 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaa 45883018  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  45883019 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 45883118  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc-agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  45883119 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 45883202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1626960 - 1626678
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||     |||||||| |||||| |||    
T  1626960 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaa 1626861  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1626860 cactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 1626761  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1626760 aaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtc-gatttggaccgaactaggtcaacaaatt 1626678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27101458 - 27101176
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  27101458 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 27101359  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  27101358 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgc 27101259  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  27101258 aacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 27101176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32264316 - 32264060
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  32264316 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 32264217  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  32264216 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttg 32264117  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  32264116 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 32264060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 43228271 - 43228553
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  43228271 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43228370  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  43228371 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 43228470  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  43228471 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaacaaatt 43228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43423740 - 43423458
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  43423740 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 43423641  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  43423640 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 43423541  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  |  | |||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  43423540 aacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 43423458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10084665 - 10084384
Alignment:
Q  103 aacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  10084665 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10084566  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  10084565 actattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgta 10084466  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10084465 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51727283 - 51727002
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||| || |||  | ||||||| |||||||||||    
T  51727283 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggtttgagggttgattcaccttgggaaac 51727184  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  51727183 actattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 51727084  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  51727083 acgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 51727002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 221 - 391
Target Start/End: Original strand, 24181483 - 24181653
Alignment:
Q  221 gtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtgg 320  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24181483 gtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 24181582  T
Q  321 aacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||| | |  |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24181583 aacggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgtt 24181653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4104172 - 4103891
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  4104172 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 4104073  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  4104072 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 4103974  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4103973 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 4103891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 43226066 - 43226347
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  43226066 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43226164  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  43226165 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 43226264  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  43226265 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 43226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10621807 - 10621523
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  10621807 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 10621708  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  10621707 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 10621609  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  | | || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621608 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 10621523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 25388886 - 25389169
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  25388886 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaa 25388984  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  25388985 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttg 25389083  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25389084 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 25389169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 6484421 - 6484622
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6484421 gttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaac 6484520  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6484521 ccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 6484618  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  6484619 aatt 6484622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 383
Target Start/End: Original strand, 18162643 - 18162926
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18162643 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 18162742  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  18162743 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgt 18162842  T
Q  298 aaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||    
T  18162843 aaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgga-cgaactgtgtcaacaaattt 18162926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 23637006 - 23637205
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||||| ||||||     
T  23637006 aaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacac 23637105  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaa 300  Q
    | | |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23637106 tattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28413283 - 28413025
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggatt-aagtctcttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  28413283 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggt 28413184  T
Q  223 cacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||| ||||||||     
T  28413183 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggat 28413086  T
Q  323 cgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  28413085 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaattaggtcaacaaatttc 28413025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 458264 - 458545
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  458264 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 458363  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  458364 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 458462  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  458463 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-gttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3859508 - 3859789
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  3859508 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3859607  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  |    
T  3859608 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttg-t 3859706  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3859707 aacaatactcatcat-atagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3859789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18097177 - 18096895
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18097177 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18097078  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  18097077 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgt 18096978  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18096977 aacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacgaatt 18096895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25533422 - 25533704
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  25533422 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 25533521  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  25533522 cactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25533621  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  25533622 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 25533704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 30005821 - 30006103
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  30005821 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 30005920  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  30005921 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 30006020  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30006021 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 42990284 - 42990566
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  42990284 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 42990383  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  42990384 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 42990483  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||| ||| | || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42990484 aacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6063723 - 6063439
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  6063723 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6063624  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  6063623 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 6063525  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  6063524 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtccacaaatttc 6063439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6066073 - 6065789
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  6066073 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6065974  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  6065973 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 6065875  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6065874 taacgaaactcatcat-atagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcag-attggacagaactgggtcaacaaatttc 6065789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 312
Target Start/End: Original strand, 39715453 - 39715663
Alignment:
Q  106 aagggtttaga-agtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| |||||| |    
T  39715453 aagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 39715552  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  39715553 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaag 39715652  T
Q  302 ttactcatcat 312  Q
    |||||||||||    
T  39715653 ttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 455887 - 456168
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  455887 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 455986  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  455987 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 456085  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  456086 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcggg-ttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 5191633 - 5191913
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  5191633 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 5191732  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  5191733 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 5191831  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |  | || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  5191832 aacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 5191913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 321
Target Start/End: Original strand, 6561790 - 6562014
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  6561790 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaa 6561889  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||     
T  6561890 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttg 6561989  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtgga 321  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  6561990 taaggtaactcatcattatagtgga 6562014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 50493979 - 50494260
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  50493979 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 50494078  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  50494079 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 50494177  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50494178 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53468732 - 53468448
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  53468732 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaa 53468634  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  53468633 cactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 53468534  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag--actaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||   ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  53468533 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 53468448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 880729 - 880446
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  880729 aaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 880630  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  880629 acactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttg 880530  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | || |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  880529 taaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgagctgggtcaacaaatt 880446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 51943351 - 51943632
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  51943351 aaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 51943450  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||||||| |    
T  51943451 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgt 51943549  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  51943550 aacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 51943632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1620672 - 1620446
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggata 264  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||      
T  1620672 acactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaag 1620573  T
Q  265 ctta-ttcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1620572 gctagttcttgtaaccctttgatatctctttg-taaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggac 1620474  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    | |||| ||| |||||| || |||||||    
T  1620473 caaactaggtgaacaaactttgtgtgtt 1620446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9604803 - 9604602
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9604803 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 9604704  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  9604703 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactaggtcaaca 9604606  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  9604605 aatt 9604602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25688357 - 25688164
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688357 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25688258  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 373  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25688257 ccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 25688164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24979687 - 24979970
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  24979687 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 24979786  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
     | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||| |    
T  24979787 tactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgt 24979886  T
Q  298 aaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  24979887 aaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 24979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22114582 - 22114300
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  22114582 aaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaa 22114483  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  22114482 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 22114383  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||| || | || | ||||| ||||| ||||| || | || | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22114382 aacgttactcatca-tataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22114300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 381
Target Start/End: Original strand, 38210350 - 38210631
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  38210350 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38210449  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||     
T  38210450 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 38210548  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  | |  | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38210549 taacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10191585 - 10191305
Alignment:
Q  103 aacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  10191585 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10191486  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||  ||||||||||| || |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  10191485 actattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgta 10191387  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10191386 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 6231862 - 6232062
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||  || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6231862 gttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6231960  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6231961 ccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 6232058  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  6232059 aatt 6232062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47149172 - 47148890
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| || ||   | |||||||| |||||| ||    
T  47149172 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aa 47149074  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  47149073 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 47148974  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaagga-tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  47148973 tatcgttactcatca-tatagtgaaac-agaggactgctctctcccccagactatgtcaat-ttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 890048 - 889779
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tct-cttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||   | |||||||| |||||||||    
T  890048 aaacaagggtttagaatggca--acaaaacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaa 889951  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  889950 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttg 889852  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgg 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | || || | ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  889851 taaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Original strand, 5899733 - 5899933
Alignment:
Q  178 tgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaa 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5899733 tgttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    ||| ||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  5899832 cccattgatttctctttgc-aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 5899928  T
Q  378 aaatt 382  Q
    |||||    
T  5899929 aaatt 5899933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 32219145 - 32219347
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  32219145 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaac 32219244  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaa-gttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    || ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||  ||||||||| | || | |||||||||||||||| |||    
T  32219245 ccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaat-ttggaccgaactgggtcaac 32219342  T
Q  378 aaatt 382  Q
    |||||    
T  32219343 aaatt 32219347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5522822 - 5522622
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5522822 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5522723  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5522722 ccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 5522626  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  5522625 aatt 5522622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7606783 - 7606583
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606783 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7606684  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
     | ||||| |||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  7606683 acattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 7606587  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  7606586 aatt 7606583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48361922 - 48361666
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||   |  ||||||| | |||||||||| | | |||||| |||||||| ||     
T  48361922 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagtt 48361823  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||| | ||||||  |||    
T  48361822 acgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aatatagtaaaac 48361724  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |  | |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  48361723 ggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 48361666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 4666575 - 4666776
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggata--cttattcttgta 276  Q
    ||||||||  ||||||||||| | | | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4666575 gttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgta 4666674  T
Q  277 accctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 376  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||    
T  4666675 atccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaa 4666770  T
Q  377 caaatt 382  Q
    ||||||    
T  4666771 caaatt 4666776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Original strand, 5886260 - 5886460
Alignment:
Q  178 tgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaa 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5886260 tgttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  278 ccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    ||| ||||| | || |||  || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  5886359 cccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 5886455  T
Q  378 aaatt 382  Q
    |||||    
T  5886456 aaatt 5886460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 15780932 - 15781141
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15780932 gttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 15781031  T
Q  279 cctttgata----tctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagg---atgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgg 371  Q
    || ||||||    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15781032 ccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaat-ttggaccgaactgg 15781130  T
Q  372 gtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||    
T  15781131 gtcaacaaatt 15781141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 36011888 - 36012089
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| | |||||||||| | | |||||| | | ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  36011888 gttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaac 36011987  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||    
T  36011988 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaat-ttggaccgaactggatcaaca 36012085  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  36012086 aatt 36012089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Original strand, 3306848 - 3307022
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtta 304  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3306848 aggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3306947  T
Q  305 ctcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| || | | || ||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3306948 ctcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaat-ttggaccgaactaggttaacaaatt 3307022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 278
Target Start/End: Original strand, 35777401 - 35777582
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  35777401 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35777500  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35777501 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 35777582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Original strand, 7768552 - 7768840
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaaca--ctagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||  ||| |||||   ||||||| |||||| |||    
T  7768552 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactaaggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacaaactaaggttgagattgattcaccttggaaaa 7768649  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||  |||||||||||   ||  ||| |||||||||||| ||| ||||  ||||      
T  7768650 cactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttaatatacctttg- 7768748  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  7768749 taaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaattgggtaaaaaaaattcgtgt 7768840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12268219 - 12267970
Alignment:
Q  124 acaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||||    
T  12268219 acaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctctt 12268120  T
Q  220 ggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtg 319  Q
    ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12268119 ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 12268032  T
Q  320 gaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     |||  | || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  12268031 aaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 12267970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 26720532 - 26720809
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||  | | |    
T  26720532 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-act 26720630  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |    
T  26720631 attaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacg 26720730  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  26720731 atactcatca-tatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaccaaatt 26720809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 338
Target Start/End: Original strand, 29956666 - 29956905
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  29956666 aaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 29956765  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    
T  29956766 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 29956865  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct 338  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  29956866 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 29956905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 382
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168363
Alignment:
Q  182 gattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccct 281  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  282 ttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 381  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaacttggtcaacaaat 11168362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634434
Alignment:
Q  152 ctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtaga 251  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||     
T  14634665 ctcttggcaacaaacact-gggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagc 14634567  T
Q  252 attaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactag 350  Q
    ||||||   ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |  ||||  |  ||||||||    
T  14634566 attaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactag 14634467  T
Q  351 gtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14634466 gttagtattagaccgaactaggtaaacaaattt 14634434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51674962 - 51674761
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51674962 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaat 51674863  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || || | | || |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  51674862 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 51674765  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  51674764 aatt 51674761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 379
Target Start/End: Original strand, 53591245 - 53591442
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  | ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  53591245 gttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaat 53591344  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||    
T  53591345 ccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggatcgaactaggtcaaca 53591441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Original strand, 13419865 - 13420084
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  13419865 aaacaaaggtttaaaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacact 13419962  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaac-cctttgatatctcttttctaa 299  Q
     | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||| ||  || | | | ||| |||||||   ||||||||||| ||| |||    
T  13419963 attaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tttgtaa 13420061  T
Q  300 agttactcatcattatagtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13420062 agttactcatcattatagtggaa 13420084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 24177256 - 24177383
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||| |||    
T  24177256 ctgaaaacaagagtttagatgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttggggttgattcaccttggaaaa 24177355  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcac 225  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||    
T  24177356 cactattaggattgagtctcttggtcac 24177383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 264 - 391
Target Start/End: Original strand, 25634033 - 25634159
Alignment:
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||| || | ||| ||    
T  25634033 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaat-ttgcac 25634131  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25634132 cgaactaggtaaacaaattttgtgtgtt 25634159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47701800 - 47701666
Alignment:
Q  246 ggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||    
T  47701800 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  346 actaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||    
T  47701701 attaggtcaat-ttggatcgaactggatcaacaaatt 47701666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635653
Alignment:
Q  241 cttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctac 340  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 27635694  T
Q  341 cccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27635693 cccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27635653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28100318 - 28100143
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  28100318 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 28100219  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattctt 273  Q
    |  | | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28100218 cgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 54691825 - 54691596
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| | | | |||||     
T  54691825 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggtt 54691726  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    | ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||  |||    
T  54691725 atgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaac 54691627  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | | || |||||||| ||| |||||| ||||    
T  54691626 ggagggctgctctctcccctagactatgtca 54691596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 54884216 - 54884360
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    ||||||||  ||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||||||     
T  54884216 gttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaat 54884314  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54884315 ctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 54884360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007538
Alignment:
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttact 306  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||         | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  307 catcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattgg 361  Q
    |||||||||||||||| |   || | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcagtattgg 11007538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 391
Target Start/End: Original strand, 27420744 - 27420923
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaactttt-ggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcat 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||   ||  ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||    
T  27420744 agtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatct--tttgtaaagttactcat 27420841  T
Q  310 cattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||| ||||||  |  | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  27420842 cattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattccatgtgtt 27420923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35918139 - 35917995
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| ||||| |||||| | | || ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  35918139 gttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaac 35918040  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  35918039 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacg 35917995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 380
Target Start/End: Original strand, 11066564 - 11066850
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttg--------ttgattcgcc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||   |||        ||||||| ||    
T  11066564 aaaacaagggtttagaagtcaacaacaaaactgaagtttgta--gagttttctcttggcaataaacactagggttgagattgaaccaccattgattcacc 11066661  T
Q  190 ttgg-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgata 287  Q
    |||| |||||| | | |||||| | ||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||   || ||| |||||||||| | ||||  |    
T  11066662 ttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaacatttggaa 11066761  T
Q  288 tctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    | |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11066762 tgt--tttgtatagttactcatcattatagtggaacatagagctgctctct--tccagagtaggtcagtattgaaccgaactgggtaaacaaa 11066850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634028
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggctgggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcacg 25634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29914125 - 29913952
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||  |||||      
T  29914125 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttg-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg-taaagaa 29914031  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29914030 actcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 29913952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137421
Alignment:
Q  143 tagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgga 239  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  240 acttttggtagaattaggcgg 260  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcgg 28137421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 23941852 - 23942028
Alignment:
Q  209 ttaagtctctt-ggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattaggcggga-tacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||| |||||||||    
T  23941852 ttaagtctctttggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattaggtttgaatacttattcttgtaaccgtttggaatct--tttgtaaagttac 23941949  T
Q  306 tcatca-ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||  | |||||||||| ||||  | |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23941950 tcaaaaattatagtggagcgaagagttgctctctcctccatagtaggtcagtattggaccaaactgggtaaataaattt 23942028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 278
Target Start/End: Original strand, 28181028 - 28181182
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||   |  ||||||| | ||||||||||   | |||||| ||||| |||||     
T  28181028 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggtt 28181127  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  28181128 acgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10612849 - 10612775
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10612849 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10612775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15823757 - 15823644
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| |  | ||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||    
T  15823757 attcttgtaaccctttgacatctctttg-taaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattggaccgaa 15823659  T
Q  368 ctgggtaaacaaatt 382  Q
     ||||||||||||||    
T  15823658 ttgggtaaacaaatt 15823644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47878242 - 47878168
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47878242 atcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatt 47878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10094145 - 10094060
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10094145 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttttt 10094060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10100162 - 10100077
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10100162 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttttt 10100077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10201025 - 10200940
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10201025 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttttt 10200940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Original strand, 13893362 - 13893435
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13893362 gaaaacaagg-tttagaagtcaacataaaaactagggtt--tatagagaattctcttggcaacaaacactagggttg 13893435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31021269 - 31021151
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgat-atctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccga 366  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31021269 attcttgtaacccttttaacatctctttg-taaagttactcatcattatattg-aacggagggctgctctc-accccagactaggtcagtataggatcga 31021173  T
Q  367 actgggtaaacaaatttcgtgt 388  Q
    ||| |||||| ||| |||||||    
T  31021172 actaggtaaaaaaaattcgtgt 31021151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 42992418 - 42992533
Alignment:
Q  266 ttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccg 365  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||   || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  42992418 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccg 42992515  T
Q  366 aactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||||||| |||||||||    
T  42992516 aactgggtcaacaaattt 42992533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 54193337 - 54193426
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  54193337 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 54193426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997062
Alignment:
Q  195 aaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||   ||  ||| |||||| |||  || | |||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctctt 16996973  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |   ||||  || |||||||||||||||||| |    ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16996974 tgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaatt 16997062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 10897116 - 10897190
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10897116 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10897190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22626032 - 22625966
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  22626032 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 22625966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48390373 - 48390299
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  48390373 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt 48390299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Original strand, 6231429 - 6231502
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactaggg 173  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6231429 aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10208071 - 10207986
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10208071 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttttt 10207986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10595104 - 10595031
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10595104 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10595031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31021418 - 31021284
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaaca 199  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| | || | |||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||    
T  31021418 aaaacatgggtttagaagccaaccctaaaactagggtttg--tagagtttgccctagtcaacaaacactagggttgggattgattcaccttggagaaaca 31021321  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt 236  Q
     | | |||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  31021320 ctattaggattgagtctcttgatcacatgaagagatt 31021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919110
Alignment:
Q  313 tatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 35919110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 54188620 - 54188708
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  54188620 atcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 54188708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 11072920 - 11072992
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11072920 aaaacaagggtttagaagtcaacaacaaaactagagtttg--gagagttttctcttggcaacaaac-ctagggttg 11072992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 11163130 - 11163205
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  11163130 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 11163205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 41849132 - 41849207
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  41849132 aaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 41849207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4560480 - 4560352
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    |||    |||||||    
T  4560480 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag----ctt----ttgtaac 4560389  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattat 315  Q
    || || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4560388 ccattaatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 399
Target Start/End: Original strand, 27544384 - 27544474
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttt 399  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  27544384 tcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttatgttctttcttt 27544474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27635904 - 27635830
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaa-cacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggt 174  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  27635904 aaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Original strand, 42992266 - 42992402
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||     |||||||| ||||| ||||    
T  42992266 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 42992365  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagaga 234  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  42992366 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaga 42992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Original strand, 1417523 - 1417586
Alignment:
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  1417523 ggatgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttt 1417586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 6303421 - 6303509
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  6303421 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccaaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 6303509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 382
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849321
Alignment:
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||| |||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 41849321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 1736341 - 1736411
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  1736341 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatattggtgtgtttgttcctttct 1736411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 4535725 - 4535800
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctac-cccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4535725 atcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4535800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21711274 - 21711204
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  21711274 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 21711204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42297771 - 42297721
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctctt--ttctaaagttactcatcattata 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  42297771 attcttgtaaccctttgatatctttttgttgtaaagttactcatcattata 42297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53894102 - 53894052
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  53894102 tgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 53894052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10949331 - 10949257
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| ||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  10949331 atcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagactgaactggataaacaaatt 10949257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 38002980 - 38003054
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  38002980 atcattatagtggaacagagagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatt 38003054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47882953 - 47882879
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||| ||| |||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  47882953 atcattatagtggaacataaagctgctctctcccctagactaagtcatcattagatcgaactgggtaaacaaatt 47882879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 3329799 - 3329867
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3329799 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaataaacactagggttg 3329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 11079424 - 11079491
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11079424 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaac-aacactagggttg 11079491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Original strand, 15780840 - 15780889
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15780840 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 15780889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27762261 - 27762194
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27762261 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaac-aacactagggttg 27762194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35918226 - 35918177
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35918226 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 35918177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 38002780 - 38002843
Alignment:
Q  111 tttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38002780 tttagaagtcaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaac-aacactagggttg 38002843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47701872 - 47701823
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47701872 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 47701823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 8370522 - 8370569
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8370522 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10595206 - 10595178
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagag 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10595206 aggattaagtctcttggtcacgggaagag 10595178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 18552919 - 18552966
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18552919 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21334791 - 21334731
Alignment:
Q  334 tctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttt 394  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||    
T  21334791 tctctcccccagagtaggtcattattggaccgaattggataaacaaatattgtgttttttt 21334731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Original strand, 23941736 - 23941804
Alignment:
Q  108 gggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  23941736 gggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagttttttctcttgacaataaacactaaggttg 23941804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 27544283 - 27544334
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  27544283 aggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27762158 - 27762107
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  27762158 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 27974988 - 27975035
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27974988 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 27986482 - 27986529
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27986482 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 30709826 - 30709873
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30709826 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 53973787 - 53973731
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  53973787 attcttgtatccatttaatatcttttttgtaaagttactcatcaatgtagtggaacg 53973731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16929 - 16629
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  16929 ctgaaaacaagggtttgaaagacaacacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttaggaaa 16831  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16830 cactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16731  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16730 aaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctct 16631  T
Q  398 tt 399  Q
    ||    
T  16630 tt 16629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 100)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6661461 - 6661155
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||| |    
T  6661461 aaacaagggtttagaagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgttcttggcaacaaacactagagttggggttgattcaccatgggaaacact 6661362  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6661361 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 6661262  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgt--tttttcttt 399  Q
    || ||||| |||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  6661261 ttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctttcttt 6661162  T
Q  400 tctctcg 406  Q
    |||||||    
T  6661161 tctctcg 6661155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 40221522 - 40221805
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||| |||    
T  40221522 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaa 40221621  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40221622 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 40221721  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40221722 aaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17413443 - 17413176
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaaca 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  17413443 gaaaacaagggtttagaaggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaaca 17413346  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
     | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17413345 ctattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgta 17413246  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaac 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  17413245 aagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31472893 - 31472609
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||   |  ||||||| |||||||||    
T  31472893 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaa 31472794  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||     
T  31472793 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttg 31472694  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  31472693 taaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 31472609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 9020220 - 9020502
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||    
T  9020220 ctgaaaacaagggtttgggaggcaacacaaaag-tagggtttgtatagagttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttggaaaa 9020317  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9020318 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 9020417  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9020418 aaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaatt 9020502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 20053847 - 20054119
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  20053847 aaacaagggtttagaaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgggaaacact 20053946  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaag 301  Q
     | |||||| |||||||||||   |     ||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  20053947 attaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaag 20054038  T
Q  302 ttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20054039 ttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaatt 20054119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18511491 - 18511209
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18511491 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18511392  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18511391 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 18511292  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  18511291 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 18511209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25804025 - 25804306
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  25804025 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25804124  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  25804125 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25804224  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  25804225 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaataaatt 25804306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10529378 - 10529096
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  10529378 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 10529279  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10529278 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 10529179  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10529178 aacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 10529096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Original strand, 18596647 - 18596924
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| || ||||   |  ||||||| |||||| ||||    
T  18596647 aaacaagggtata-aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaac 18596745  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  18596746 actgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgta 18596845  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  18596846 aagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 24126856 - 24127138
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gttg-ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| |  | ||||||  ||||||||||    
T  24126856 aaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaa 24126955  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  24126956 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 24127055  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24127056 aaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 24127138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 6745095 - 6745350
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtca 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |    
T  6745095 aaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 6745194  T
Q  225 cgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  6745195 cgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 6745293  T
Q  325 aaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     | || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6745294 gagggctgctctctcccccagacaaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 21948026 - 21948308
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  21948026 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 21948125  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21948126 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgt 21948225  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  21948226 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 21948308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25921752 - 25921470
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||    
T  25921752 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaa 25921653  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  25921652 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25921553  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  25921552 aacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 25921470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 39854483 - 39854765
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  39854483 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 39854582  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39854583 cactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 39854682  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  39854683 aacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 39854765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 31545080 - 31545364
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  31545080 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31545179  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  31545180 cactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 31545279  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | ||| ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545280 aacagt-actcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 31545364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 391
Target Start/End: Original strand, 15143532 - 15143759
Alignment:
Q  165 acactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat- 263  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||   ||      
T  15143532 acactagggttgagattgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaag 15143631  T
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  15143632 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgac 15143731  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15143732 cgaaatgggtaaacaaatttcgtgtgtt 15143759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1189888 - 1189604
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| | ||||||||    
T  1189888 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaa 1189789  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  1189788 cactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 1189689  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctac-cccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1189688 aaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 1189604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 2174919 - 2175200
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  2174919 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 2175018  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  2175019 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 2175117  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2175118 aacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 2175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16092479 - 16092223
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  16092479 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16092380  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  16092379 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgt 16092280  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| | | |||||||||||    
T  16092279 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtca 16092223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 17072883 - 17073166
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  17072883 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 17072982  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| | |||||||||||||  |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  17072983 cactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 17073082  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17073083 aaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18509597 - 18509315
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18509597 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18509498  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  18509497 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgt 18509398  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  18509397 aaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgaaccgaactaggtcaacaaatt 18509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 38882106 - 38882387
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  38882106 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38882205  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  38882206 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 38882304  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38882305 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 38882387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 695959 - 696160
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  695959 gttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 696057  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  696058 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 696156  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  696157 aatt 696160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 371
Target Start/End: Original strand, 4236629 - 4236900
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  4236629 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 4236728  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4236729 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4236828  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgg 371  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  4236829 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31179650 - 31179366
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  31179650 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31179551  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||      
T  31179550 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttg- 31179452  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179451 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 31179366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 268 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445246
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  368 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15445277 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttttctcttt 15445246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18466684 - 18466966
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18466684 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18466783  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  18466784 cactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18466883  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| |||| ||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  18466884 aacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 18466966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34530945 - 34530721
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  34530945 aaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 34530846  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  34530845 cactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 34530746  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34530745 aaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 15552245 - 15552529
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  15552245 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 15552344  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  15552345 cactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 15552443  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552444 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 15552529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20506039 - 20505840
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20506039 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20505940  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
     | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  20505939 acattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc--ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 31542735 - 31543018
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  31542735 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31542834  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||      
T  31542835 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgt 31542933  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
     | ||| ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31542934 aacagt-actcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 31543018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34477333 - 34477050
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  34477333 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34477234  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    || | | | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  34477233 cactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34477135  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34477134 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 34477050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18469011 - 18469291
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  18469011 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18469110  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  18469111 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgt 18469210  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  18469211 aacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaat-ttggaccgaactggattaacaaatt 18469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 658606 - 658353
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| |||||| | | |||||  |||||||||||     
T  658606 aaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggtt 658507  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  658506 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaac 658408  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | || ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  658407 ggatggctgctct---ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 658353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Original strand, 36208644 - 36208858
Alignment:
Q  167 actagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcggg-atac 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||   | | ||    
T  36208644 actagggttgttgttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagac 36208743  T
Q  266 ttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccg 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  36208744 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaat-ttggaccg 36208841  T
Q  366 aactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||    
T  36208842 aactgggtaaacaaatt 36208858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37706029 - 37705777
Alignment:
Q  131 ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||     
T  37706029 ctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 37705930  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||||||| |   ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||     
T  37705929 gaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 37705831  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  37705830 ggctattctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 37705777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39398272 - 39398003
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  39398272 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaa 39398173  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39398172 cactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 39398073  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaact 369  Q
     | |||||  || | ||||||  |||| | || |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  39398072 gacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaact 39398003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10474602 - 10474320
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||   |  ||||| | ||||||||||    
T  10474602 aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaa 10474503  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10474502 cactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttct 10474403  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10474402 aaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 10474320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 16776158 - 16776439
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  16776158 aaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 16776257  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  16776258 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgt 16776356  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||| ||||||||| || | || |||| ||| |||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  16776357 aacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 16776439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21684730 - 21684449
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |    
T  21684730 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 21684631  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  |    
T  21684630 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg-t 21684532  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  21684531 aacaatactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 21684449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25904103 - 25904385
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  25904103 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25904202  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  25904203 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgt 25904302  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||| |||| ||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25904303 aacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 25904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 6756494 - 6756772
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  6756494 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaa 6756593  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||| |    
T  6756594 cactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgt 6756691  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  6756692 aaggttacacatcattatagtgaaacg-agggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaa 6756772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27910451 - 27910732
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    |||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||   |  ||||||| |||||||||||    
T  27910451 aaacaaggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaac 27910550  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| | ||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27910551 actattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 27910650  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||| |  | |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27910651 acgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27910732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34479698 - 34479415
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  34479698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34479599  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
    || | | | ||||  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  34479598 cactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34479500  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34479499 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 34479415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 10749815 - 10749982
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  10749815 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 10749913  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10749914 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 10749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27912536 - 27912818
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || | |||| ||   |  ||||||| ||||||||||    
T  27912536 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaa 27912635  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27912636 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 27912735  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaagga-tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27912736 aacgatactcatca-tatagtggaac-agagaactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27912818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31466231 - 31466044
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||     |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||     
T  31466231 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggtt 31466132  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcat 312  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31466131 acgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 6747306 - 6747586
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg-ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||| ||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||    
T  6747306 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaac 6747405  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||    
T  6747406 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgta 6747504  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||||||| ||| ||||||||| || | || ||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6747505 acgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 6747586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 39798128 - 39798329
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798128 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 39798227  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| || | || |||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  39798228 ccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  39798326 aatt 39798329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17818769 - 17818489
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttg--ttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||   | |||||||  ||||||||||    
T  17818769 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaa 17818670  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | || | ||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818669 cactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 17818570  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | || |  ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17818569 aaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 17818489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2818615 - 2818332
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg---ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |   ||||||| |||||| ||    
T  2818615 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaa 2818516  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | | |||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||     
T  2818515 acactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 2818416  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  2818415 taacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 2818332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 4410104 - 4410304
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4410104 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4410203  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    |  ||||| |||||||  ||| | |||||||||| ||||||||  | |  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4410204 ctattgatttctctttg-taacgatactcatcat-atagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 4410300  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  4410301 aatt 4410304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 383
Target Start/End: Original strand, 4897835 - 4898014
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  4897835 aggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagtt 4897934  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
    |||||||||||||| |||||    || |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4897935 actcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattt 4898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 26097759 - 26098013
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||||| | | |||| | |||||||||||     
T  26097759 aaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggtt 26097857  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||| |   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26097858 acgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 26097956  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
     | ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26097957 -agaggctgctctctcctccagactaggtcaat-ttgaaccgaactgggtcaacaaatt 26098013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41585942 - 41585741
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| |   |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  41585942 gttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggagacttatttttgtaag 41585843  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
     | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41585842 tcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 41585745  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  41585744 aatt 41585741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 2954416 - 2954698
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||| ||||||||||||   |  ||||||| | |||| ||    
T  2954416 aaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaa 2954515  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| |||||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||     
T  2954516 acactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttg 2954614  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  2954615 taaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaat-tttgaccgaactgggtcaacaaatt 2954698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3373302 - 3373132
Alignment:
Q  211 aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatc 310  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  |||||||    
T  3373302 aagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatc 3373204  T
Q  311 attatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    || ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3373203 at-atagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 3373132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2144841 - 2144570
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacga-acactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaac 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||| |||||| |||||    
T  2144841 aaaacaagggtttagaagccaacactaaaactagggtttg--tagagtttgctcttggcaacaacacactagggttgggattgattcaccttggagaaac 2144744  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaacc-ctttgatatctctttt 295  Q
    | | | |||||  |||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||   | | ||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||    
T  2144743 actattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc-ttt 2144645  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||   ||||||||||||||||||    
T  2144644 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattggaccgaactg 2144570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 23665159 - 23665325
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  23665159 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 23665256  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23665257 -aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 23665325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23793428 - 23793262
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  23793428 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 23793331  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23793330 -aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 23793262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 36402580 - 36402352
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| ||| | | | |||||| | ||||||||| |    
T  36402580 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggtta 36402481  T
Q  225 cgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacg 324  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  36402480 cgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaaca 36402382  T
Q  325 aaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
     | |  |||||||| |||||||||||||||    
T  36402381 gatgtctgctctctcccccagactaggtca 36402352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 10757292 - 10757458
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||| |||||||||||    
T  10757292 agtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-tttgtaacgttactcatca 10757389  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10757390 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attagaccgaactgggtcaacaaatt 10757458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15354738 - 15354572
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |    
T  15354738 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatta 15354641  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15354640 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 15354572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 382
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724175
Alignment:
Q  181 tgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccc 280  Q
    |||||| ||||||||||||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcgggtgatttattcttgtaaccc 2724075  T
Q  281 tttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
     |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  2724076 attgatatctcttttgtaagattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 2724173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 10586913 - 10587114
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||| | |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  10586913 gttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaac 10587012  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||    
T  10587013 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac 10587109  T
Q  378 aaatt 382  Q
    |||||    
T  10587110 aaatt 10587114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38960295 - 38960127
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  38960295 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 38960198  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
      |||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38960197 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 38960127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15357014 - 15356848
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |    
T  15357014 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatta 15356917  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15356916 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 15356848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23742022 - 23741856
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  23742022 agtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 23741925  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23741924 -aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 23741856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 20045010 - 20045172
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttag-aagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20045010 aaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20045109  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgg 260  Q
    || | | | |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20045110 cactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Original strand, 4754158 - 4754382
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacag 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||  |||||     
T  4754158 aaaacaagggtttaaaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttgaaaaacac 4754255  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaacc-ctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | || ||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||   | |  || ||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||    
T  4754256 tattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccttttttatatctc-tttgta 4754354  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaa 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4754355 aagttactcatcaatatagtggatcgaa 4754382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 383
Target Start/End: Original strand, 29748350 - 29748634
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaac 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||| |||||||    |||||||| ||||| |||||    
T  29748350 gaaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagaattctcttggcaacaaacagtagggttaggattgattcgtcttggagaaac 29748447  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaa-ttaggcgggatacttattcttgtaac-cctttgatatctctttt 295  Q
    | |   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| | |    | | ||| ||||||||||| | |||||||| || |||    
T  29748448 actaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaactaaatttgaagactaattcttgtaactcttttgatatatc-ttt 29748546  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
     |||||  | |||| ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29748547 gtaaaggaattcattattatggtggaacgaagagctgctctctcccccaaagtaggtcagtattggaccgaacttggtaaataaattt 29748634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 42770934 - 42771024
Alignment:
Q  222 tcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcat 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42770934 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 34033798 - 34033539
Alignment:
Q  150 ttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattg-gaacttttgg 247  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||  |||||| |||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||  | | ||| ||    
T  34033798 ttctcttggcaacaaacactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttggg 34033699  T
Q  248 tagaattaggcgggat-acttattcttgtaacccttt-gatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagga-tgctctctacccca 344  Q
    |||||||| |   ||  |||| || | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | || | |||||||| ||||     
T  34033698 tagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaac-atagaactgctctct-cccct 34033601  T
Q  345 gactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt-cgtgtgttttttcttttctctc 405  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  34033600 gactaggtcagtattggatcgaactgggtaaacaaatttgcttgtgttctttctcttctctc 34033539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15225049 - 15224765
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggt---ttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-ga 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||   ||||| |||  |  ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||  ||    
T  15225049 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactagggtggcttgtagagaact--ctcttggcaacaaacactagggttatgattgattcaccttgaaga 15224952  T
Q  196 aacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgga-acttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctctt 293  Q
    |||| | | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||   ||  ||| ||| |||||||| |||||||  ||||    
T  15224951 aacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattaggtttgaagactaatttttgtaaccatttgataattctt 15224852  T
Q  294 ttctaaagttac---tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 377  Q
    || |||| ||||   ||||||||||| ||||||     | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15224851 ttgtaaacttacgactcatcattataatggaacagttagctgctctctgccccagactaggtcagtattgaaccgaactaggtaaac 15224765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Original strand, 20043050 - 20043208
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  20043050 aaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20043149  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattag 256  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  20043150 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 403
Target Start/End: Original strand, 35430171 - 35430486
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggtt---gttg--------ttgattcgcc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||    |||        ||||||| ||    
T  35430171 aaaacaagggtttagaagtcaacatcaaaactagggtttg--tacagttttctcttggcaataaacactagggtttggattgaatcaccattgattcacc 35430268  T
Q  190 ttgg-gaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaa-ccctttga 285  Q
    |||| |||||| | | |  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||   | | ||| ||||||||||  | |||||    
T  35430269 ttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttga 35430368  T
Q  286 tatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tc 384  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | || ||| |   ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  35430369 tatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataaacaaattctc 35430467  T
Q  385 gtgtgttttttcttttctc 403  Q
     |||||| ||||| |||||    
T  35430468 ttgtgttctttctcttctc 35430486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Original strand, 42770770 - 42770924
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| || |||||||    
T  42770770 ctgaaaacaagggtttggaaggcaacacaaaa--ttaggtttatatagaatttgctcttggcaacaaacactaaggttggggttcattcaccatgggaaa 42770867  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattag 256  Q
    |  | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  42770868 c--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12556198 - 12556006
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||   |  ||||||| |||||||||||| |    
T  12556198 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 12556099  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 295  Q
     | ||||||  |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  12556098 attaggattgtgtctcttggctacgggaagagattgg-agttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 12556006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 42238371 - 42238445
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42238371 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 42238445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Original strand, 21288790 - 21289043
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt---gtt-----gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |||     |||||||| |||||  ||||| | | |||||| ||| ||    
T  21288790 aaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatc 21288888  T
Q  218 ttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatag 317  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| | || |||||||||| | |        ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21288889 ttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatc-ttatag 21288979  T
Q  318 tggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  21288980 tgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 21289043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35385523 - 35385434
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  35385523 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 35385434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 1170922 - 1171010
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  1170922 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 1171010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17841320 - 17841246
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17841320 atcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 22672945 - 22673019
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22672945 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 22673019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 25445607 - 25445681
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25445607 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25445681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31782733 - 31782596
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || | | ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  31782733 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagataattt-ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaaca 31782635  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgg 238  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31782634 ctgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgg 31782596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 382
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043272
Alignment:
Q  315 tagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatt 20043272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 28786538 - 28786589
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28786538 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 28786589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16093362 - 16093289
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16093362 atcattatagtggaacgaaaagctgctctct-tcccatactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt 16093289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2298072 - 2297983
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  2298072 atcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatatcttgtgttctttct 2297983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26098526 - 26098390
Alignment:
Q  106 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaaacagt 201  Q
    |||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     |||||||| |||||  ||||| |    
T  26098526 aagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacact 26098427  T
Q  202 gtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgg 238  Q
     | | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26098426 attatgattgagtctcttggttacggaaagagattgg 26098390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26406748 - 26406463
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  26406748 agggtttagaaaccaacaaacaaactagggttt--atagagaattctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaaca 26406651  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccct-----ttgatatctctt 293  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||  | ||||||||||   ||  ||| |||||||||| |||     |  |||||||||    
T  26406650 ttgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagacttgag-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcaatatcaatatctctt 26406552  T
Q  294 ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |   ||||  | |||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26406551 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaactaggtaaacaaatt 26406463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 237
Target Start/End: Original strand, 10627269 - 10627406
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggtt------gttgttgattcgccttggg--aaac 198  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||| |||| || ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||      ||| ||||||| |||||    ||||    
T  10627269 agggtttagaagccaacatacaaactagtgtttatagagaattt-ctcttagcaacaaacactagggttaggattgtttttgattcaccttgaacaaaac 10627367  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattg 237  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10627368 actgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 10627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 17004006 - 17004076
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  17004006 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 17004076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 25452629 - 25452680
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25452629 tgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25452680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16093566 - 16093438
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg-----ttgttgattcgccttg-ggaaacag 200  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || | | ||| ||||||||||| |||||||||||||     || ||||||| |||||   |||||     
T  16093566 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagataattt-ctcttggcaacaaacactagggttgggatctttttgattcaccttgaaaaaacac 16093468  T
Q  201 tgtcaggattaagtctcttggtcacgggaa 230  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||    
T  16093467 tattaggattgagtctcttggtcacgggaa 16093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 9353378 - 9353425
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9353378 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35385624 - 35385573
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  35385624 aggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-tttggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 36932396 - 36932443
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36932396 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 136 - 406
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162580
Alignment:
Q  136 gtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagat 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||   |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactaacgttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagat 31162402  T
Q  236 tggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctc 335  Q
    ||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||    
T  31162403 tgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctc 31162502  T
Q  336 tctacccc--agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt-----ttttcttttctctcg 406  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  31162503 tctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctcttttttcttttctctcg 31162580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 36865594 - 36865875
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  36865594 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 36865693  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  36865694 cactattaggattgagtctctt---cacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgt 36865790  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc-agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36865791 aaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatt 36865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 135 - 382
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956296
Alignment:
Q  135 ggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagaga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgg-gttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagaga 15956149  T
Q  235 ttggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgct 334  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||    
T  15956150 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttct 15956249  T
Q  335 ctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||| || |||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15956250 ctctccctcagattaggtcaat-ttggactgaactgggtcaacaaatt 15956296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480850
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| | | || ||| ||||||||||| ||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttgctcttggcaacaaacactaggtttgg-gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgg 21480687  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  21480688 gaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagag 21480787  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21480788 ggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaacgaactgggtaaaaaaaattcgtgtgtt 21480850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482658
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||| | | | |||| ||||||||||| | ||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgg-gttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgg 21482495  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |     
T  21482496 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggag 21482595  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21482596 ggctgctctctcccccaaactaggtcaat-ttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 21482658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3005880 - 3005627
Alignment:
Q  128 aaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgg 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||   ||||||| | |||| ||||| | | || ||| ||||||||||||||||    
T  3005880 aaactagagtttgtatagagtttgctcttaacaacaaacaatagggttgga-ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacgg 3005782  T
Q  228 gaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaa 327  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  3005781 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggag 3005682  T
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3005681 gggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 3005627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27911071 - 27911351
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||    
T  27911071 aaacaagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 27911170  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  27911171 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgta 27911270  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  27911271 aagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27911351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27957490 - 27957770
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaac 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||    
T  27957490 aaacaagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 27957589  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttcta 298  Q
    | | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  27957590 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgta 27957689  T
Q  299 aagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  27957690 aagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27957770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 32339365 - 32339647
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  32339365 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaa 32339464  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32339465 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 32339564  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  32339565 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggttaacaaatt 32339647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14419470 - 14419187
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14419470 aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14419371  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  14419370 cactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgt 14419271  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14419270 aaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14419187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 391
Target Start/End: Original strand, 31035239 - 31035468
Alignment:
Q  164 aacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat 263  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||     
T  31035239 aacactatggttggggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaa 31035338  T
Q  264 -acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagacta--ggtcagtattg 360  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31035339 gacttattcttgtaaccctttgatatctctttg-taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattg 31035437  T
Q  361 gaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035438 gaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 31035468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 3874066 - 3874348
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  3874066 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3874165  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  3874166 cactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 3874265  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  3874266 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 3874348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13858763 - 13858481
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  13858763 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 13858664  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| |    
T  13858663 cactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgt 13858565  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13858564 aaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggacagaactgggtaaacaaatt 13858481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30480782 - 30480500
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  30480782 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 30480683  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30480682 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 30480583  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || |||| |||||| ||||||| || | | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30480582 aacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 30480500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31578501 - 31578266
Alignment:
Q  155 ttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaatt 254  Q
    |||| ||| ||||||| |||||   ||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31578501 ttggtaacaaacactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaatt 31578402  T
Q  255 aggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtc 353  Q
    |||   ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||| ||||||||||    
T  31578401 aggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtc 31578302  T
Q  354 agtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtg 389  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31578301 agtataggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtg 31578266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 15809275 - 15809556
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  15809275 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 15809373  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15809374 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 15809473  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15809474 aacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 15809556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28251846 - 28251564
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  28251846 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaa 28251747  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  28251746 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgt 28251647  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28251646 aatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 43079658 - 43079942
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  43079658 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43079757  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  43079758 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 43079856  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 43079942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 15072766 - 15073049
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| | |  ||||||| |||||| |||    
T  15072766 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaa 15072865  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagaga-ttggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15072866 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15072965  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  15072966 taacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 15073049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 608790 - 609072
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||| |||||    
T  608790 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 608889  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  608890 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 608989  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  608990 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 609072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 4424074 - 4424356
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| || |||||||    
T  4424074 aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaa 4424173  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |    
T  4424174 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgt 4424273  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| |  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4424274 aacattactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 4424356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27107176 - 27106894
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||    
T  27107176 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaa 27107077  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  27107076 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgt 27106977  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |  ||||||||||| ||||||| |||| | || |||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27106976 agggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 27106894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27829353 - 27829634
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  27829353 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27829452  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  27829453 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 27829551  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27829552 aacaatactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27829634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 43082029 - 43082313
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  43082029 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43082128  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  43082129 cactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 43082227  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082228 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 43082313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 343
Target Start/End: Original strand, 14807807 - 14808051
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14807807 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14807906  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  14807907 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 14808006  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctacccc 343  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  14808007 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccc 14808051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22684935 - 22684650
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  22684935 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 22684836  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccc---tttgatatctcttt 294  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |    
T  22684835 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctat 22684736  T
Q  295 tctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22684735 tgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 22684650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31574004 - 31573794
Alignment:
Q  98 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| ||||||||||    
T  31574004 ctgaaaacaaaggtttagaagccaacacgaaaactaggatttgta--gagttttctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||   | | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||     
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttg 31573807  T
Q  297 taaagttactcat 309  Q
    |||||||||||||    
T  31573806 taaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 41384800 - 41385082
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgtt--gttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     |||||||| ||||||||||    
T  41384800 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 41384899  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    ||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  41384900 caccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 41384999  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  41385000 aacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 41385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 15068037 - 15068319
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  || |||| ||||||||||    
T  15068037 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaa 15068136  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
     | | | |||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15068137 tactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 15068236  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||    
T  15068237 aacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggactgaactgggccaacaaatt 15068319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 25952577 - 25952859
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||| |||    
T  25952577 aaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 25952675  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  || || ||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  25952676 caatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 25952775  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25952776 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 25952859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 27827042 - 27827323
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  27827042 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27827141  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| || |||||||  ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  27827142 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 27827240  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27827241 aacaatactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 27827323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 18810764 - 18811045
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  18810764 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 18810863  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  18810864 cactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg-t 18810962  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  18810963 aacaatactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaat-ttgaaccgaactgggtcaacaaatt 18811045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5372457 - 5372185
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |  || |||| ||||||||||    
T  5372457 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaa 5372358  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  5372357 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgt 5372258  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctct-accccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5372257 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaat-ttggaccgaactg 5372185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28283498 - 28283218
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagtttt-ctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| | ||||||||    
T  28283498 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaa 28283399  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |    
T  28283398 cactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgt 28283300  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28283299 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 28283218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24873460 - 24873176
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||    
T  24873460 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaa 24873361  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||      
T  24873360 cactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttg- 24873262  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  24873261 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaattgagtcaacaaatttc 24873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 1225222 - 1225505
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  1225222 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaa 1225321  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttc 296  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||     
T  1225322 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttg 1225421  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||  ||||||| || || ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1225422 taacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 1225505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 44720899 - 44721183
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  44720899 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 44720998  T
Q  198 -cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
     || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  44720999 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 44721097  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||  | |  | |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44721098 taacggtactcatcat-atagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatttc 44721183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 288
Target Start/End: Original strand, 14477332 - 14477522
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14477332 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14477431  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatat 288  Q
    |  | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  14477432 cgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 43530252 - 43530453
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43530252 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaac 43530351  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  43530352 ccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 43530449  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  43530450 aatt 43530453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 6376153 - 6376337
Alignment:
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttac 305  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||   ||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6376153 gattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctttg-taaagttac 6376251  T
Q  306 tcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  6376252 tcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgtt 6376337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 382
Target Start/End: Original strand, 41382827 - 41383000
Alignment:
Q  207 gattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttact 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  41382827 gattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 41382926  T
Q  307 catcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||| ||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  41382927 catca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 41383000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 3895879 - 3896171
Alignment:
Q  100 gaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgg-gaaac 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||    |||||||  |||||| || |||||||| |||| ||||||||   ||||||| | |||| |||||    
T  3895879 gaaaacaagggtttagaagccaacattaaaacactagtttgta--gagtttgcttttggcaacaaacaatagggttgggattgattcactttggagaaac 3895976  T
Q  199 agtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatactta-ttcttgtaaccctt-tgatatctcttttc 296  Q
    | | |   |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||   || | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  3895977 actattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttg 3896076  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  3896077 taaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatttcgtgtgtt 3896171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 391
Target Start/End: Original strand, 16833771 - 16833897
Alignment:
Q  264 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggac 363  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | |||||     
T  16833771 acttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgga- 16833869  T
Q  364 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16833870 cgaactgggtaaacaaaattcgtgtgtt 16833897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468117
Alignment:
Q  248 tagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagac 347  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | || ||||||||  ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  348 taggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2468159 taggtcaat-ttggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgtt 2468117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Original strand, 31035121 - 31035223
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  31035121 tctgaaaacaatggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaa 31035220  T
Q  197 aca 199  Q
    |||    
T  31035221 aca 31035223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15185846 - 15185711
Alignment:
Q  246 ggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccag 345  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | |  || ||||| ||| ||    
T  15185846 ggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctag 15185747  T
Q  346 actaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15185746 actaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 15185711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33541667 - 33541507
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| | ||||||||    
T  33541667 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaa 33541568  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggc 258  Q
    || | | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541567 cactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 18813019 - 18813219
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||  ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18813019 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18813118  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||||||  |||   |||||||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  18813119 ccattgatttctctttg-taacaatactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 18813215  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  18813216 aatt 18813219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 312
Target Start/End: Original strand, 181636 - 181771
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtc-aggattaagtctcttggtcacg--ggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgt 275  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  181636 gttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgt 181735  T
Q  276 aaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcat 312  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  181736 aacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 383
Target Start/End: Original strand, 17847688 - 17847859
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||       
T  17847688 aggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacc-tttgatatctcttttgtaaa--- 17847783  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 383  Q
        ||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  17847784 ----atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaaaactaattt 17847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13985252 - 13985072
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagtt 303  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||  |||||  || |||||||    
T  13985252 aggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaatctc--ttataaagtt 13985155  T
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa-tttcgtgtgtt 391  Q
    || | |||||||||||||||  |  | ||||||   ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13985154 acccctcattatagtggaacagagagttgctct---ccccagagtaggtcagta---gaccgaactgggtaaacaaattttcgtgtgtt 13985072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33021012 - 33020896
Alignment:
Q  268 attcttgtaaccctttgatatctctt-ttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccga 366  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||    
T  33021012 attcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaacgaaaagctgctctctcccacagagtaggtcagtattggacaga 33020913  T
Q  367 actgggtaaacaaattt 383  Q
    | ||| | |||||||||    
T  33020912 attggattaacaaattt 33020896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 28328019 - 28328107
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  28328019 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 28328107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31566630 - 31566549
Alignment:
Q  304 actcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtg 387  Q
    ||||||||||||| ||||||  |  | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566630 actcatcattataatggaacagagagctgctctc--ccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtg 31566549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33541505 - 33541416
Alignment:
Q  282 ttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 373  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  33541505 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaattgggt 33541416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23179632 - 23179558
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23179632 atcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 23179558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 28890876 - 28890965
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  28890876 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 28890965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Original strand, 30423118 - 30423274
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg---ttgtt--gattcgccttggg--aaaca 199  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||  ||||| |||||    |||||    
T  30423118 agggtttagaagccaacaaacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggctgagattgttttgattcaccttgaacaaaaca 30423216  T
Q  200 gtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattagg 257  Q
     | | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30423217 cttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16757338 - 16757250
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16757338 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 16757250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 25684754 - 25684842
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  25684754 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 25684842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Original strand, 28332742 - 28332830
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  28332742 tcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 28332830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17799495 - 17799421
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17799495 atcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17799421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5623017 - 5622877
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt--gttgttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||     ||||||||  ||| |||||    
T  5623017 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaa 5622918  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgg 238  Q
    || | |  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5622917 cattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37214365 - 37214317
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgg 260  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37214365 agtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35872634 - 35872587
Alignment:
Q  129 aactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35872634 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtt 35872587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37214311 - 37214261
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  37214311 tgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 37214261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4812558 - 4812476
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4812558 tcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 4812476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  141 tatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | || ||| |||||||||||    
T  2468341 tatagagtttgctcttggcaacaaatactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16752563 - 16752506
Alignment:
Q  340 ccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16752563 ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 16752506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13986099 - 13986030
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13986099 aaaacaagggtttagaagtcaacaacaaaactagaatttg--tagagttttctcttggaaacaaacattagg 13986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33839094 - 33838908
Alignment:
Q  205 aggattaagtctcttggtcacgggaagagattgga-acttttggtagaattaggcgggat-acttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagt 302  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||||   ||  ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||    
T  33839094 aggattgagtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttggaatct--tttgtaaagt 33838999  T
Q  303 tactcatca-ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa-tttcgtgtgtt 391  Q
    |||| |  | ||||||||||||| |    |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33838998 tacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaacaaattttcgtgtgtt 33838908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 41382728 - 41382804
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  41382728 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtt 41382804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9021155 - 9021104
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9021155 tgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 9021104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 391
Target Start/End: Original strand, 28895613 - 28895696
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28895613 atcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 28895696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 21033980 - 21034054
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21033980 atcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 21034054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 401
Target Start/End: Original strand, 5702526 - 5702598
Alignment:
Q  328 ggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttc 401  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| ||||    
T  5702526 ggatgctctctcccccatattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttc 5702598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12517303 - 12517254
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12517303 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 12517254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23179836 - 23179769
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttg 176  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23179836 agggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagaga-atttctcttggcaac-aacactagggttg 23179769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Original strand, 26403276 - 26403336
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttt 392  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  26403276 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttt 26403336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 3276251 - 3276283
Alignment:
Q  107 agggtttagaagtcaacacaaaaactagggttt 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3276251 agggtttagaagccaacacaaaaactagggttt 3276283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 9765865 - 9765912
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9765865 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 376
Target Start/End: Original strand, 4819 - 5098
Alignment:
Q  97 tctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttttctcttggcaacgaacactagggttgttgttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | || | |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||   |||||||   |||||||    
T  4819 tctgaaaaaaaggatttagaagtaagca-acaaactagggtttatatagcgttttctctcagcaacaaacactagagttgagtttgattcatgttgggaa 4917  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctc-tttt 295  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4918 acactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttt 5017  T
Q  296 ctaaagttactcatcattatagtggaacgaaagga-tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 376  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5018 gtaaagatactcatcattatagtggaac-atagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaa 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14661 - 14379
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  14661 aaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14562  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14561 cactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 14462  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14461 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 370
Target Start/End: Original strand, 15109 - 15298
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15109 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 15208  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactg 370  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  15209 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaat-ttggaccgaactg 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 382
Target Start/End: Original strand, 79193 - 79476
Alignment:
Q  101 aaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  79193 aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaa 79292  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  79293 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 79392  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  79393 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 79476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41480
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  41762 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 41663  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  41662 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 41563  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | || |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  41562 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 41480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 69570 - 69289
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  69570 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 69471  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  69470 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 69372  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |  | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  69371 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 69289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 73302 - 73227
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt 175  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  73302 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 73227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 6208 - 6492
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  6208 aaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6307  T
Q  198 cagtgtcaggatt-aagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  6308 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 6406  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |||||||||||  |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  6407 taacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgagtcaacaaatttc 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 183919 - 183638
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  183919 aaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 183820  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  183819 cactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 183721  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  183720 aatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 183638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 52020 - 52304
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||    
T  52020 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 52119  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  52120 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 52219  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatg--ctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  52220 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccaaactgggtcaacaaatt 52304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11726 - 11470
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||   |  ||||||  |||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  11726 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 11627  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||      
T  11626 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatt 11528  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    | |  | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11527 ggagagctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaacaaatt 11470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 4006 - 4286
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  |||||||  |||||||||    
T  4006 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaa 4104  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4105 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 4204  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4205 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaaccgggtcaacaaatt 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 384
Target Start/End: Original strand, 50 - 334
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  50 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 149  T
Q  198 cagtgtcaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    || | | ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  150 cactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttg- 248  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 384  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  249 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 79868 - 80150
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctctt-ggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaa 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||   |  ||||||| |||||||||    
T  79868 aaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 79967  T
Q  197 acagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 296  Q
    ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||     
T  79968 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttg 80066  T
Q  297 taaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  80067 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggattgaactgggtcaacaaatt 80150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 382
Target Start/End: Original strand, 29180 - 29461
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |    
T  29180 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 29279  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  |    
T  29280 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg-t 29378  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    ||   |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29379 aacaatactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 29461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1450
Alignment:
Q  179 gttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1650 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1551  T
Q  279 cctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 378  Q
    || ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  1550 ccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 1454  T
Q  379 aatt 382  Q
    ||||    
T  1453 aatt 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Original strand, 85265 - 85495
Alignment:
Q  127 aaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaacagtgtcaggattaagtctcttggtc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||   |  ||||||| |||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||     
T  85265 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggtt 85364  T
Q  224 acgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaac 323  Q
    ||| ||||||||||  |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  85365 acgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaac 85464  T
Q  324 gaaaggatgctctctaccccagactaggtca 354  Q
    | | |  |||||||| |||||||||||||||    
T  85465 ggatgactgctctctcccccagactaggtca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 2889 - 3168
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||| |||||| |||    
T  2889 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 2988  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| | ||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  2989 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 3087  T
Q  298 aaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 380  Q
    || |  |||||||| |||||||||  | | || |||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  3088 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaat-ttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 22240 - 22406
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  22240 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 22337  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22338 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 22406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 24515 - 24681
Alignment:
Q  212 agtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatca 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  24515 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 24612  T
Q  312 ttatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
      |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24613 -aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 24681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 8465 - 8512
Alignment:
Q  331 tgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 379  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8465 tgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2264
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  || |||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  2051 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 2149  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccctttgatatctcttttct 297  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  2150 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgt 2249  T
Q  298 aaagttactcatcat 312  Q
    || ||| ||||||||    
T  2250 aacgttcctcatcat 2264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 35648 - 35819
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgttg--ttgattcgccttgggaaa 197  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||   |  || |||| ||| ||||||    
T  35648 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaa 35747  T
Q  198 cagtgtcaggattaagtctcttggtcacgggaagagattggaacttttggtagaattaggcgggatacttat 269  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35748 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 57539 - 57430
Alignment:
Q  267 tattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttactcatcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  57539 tattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacgga 57440  T
Q  367 actgggtaaa 376  Q
    ||| ||||||    
T  57439 actaggtaaa 57430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3140 - 3052
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttct 397  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  3140 tcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctttct 3052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 391
Target Start/End: Original strand, 16436 - 16519
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 391  Q
    ||||||||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16436 atcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtt 16519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17057 - 16983
Alignment:
Q  308 atcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 382  Q
    |||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5756 - 5664
Alignment:
Q  309 tcattatagtggaacgaaaggatgctctctaccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttttcttttct 402  Q
    |||| ||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||    
T  5756 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttct 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1061
Alignment:
Q  102 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtatagagttt 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1110 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1513 times since January 2019
Visitors: 6143