View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0829_low_19 (Length: 464)

Name: NF0829_low_19
Description: NF0829
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0829_low_19
NF0829_low_19
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (94-428)||(21593484-21593831)
chr6 (87-428)||(3808701-3809058)
chr6 (94-428)||(2972940-2973289)
chr6 (94-428)||(5043445-5043795)
chr6 (94-408)||(26830124-26830454)
chr6 (94-428)||(17762807-17763158)
chr6 (87-428)||(603082-603430)
chr6 (94-423)||(22424826-22425170)
chr6 (1-207)||(16578424-16578632)
chr6 (1-207)||(16616748-16616956)
chr6 (1-207)||(16653166-16653374)
chr6 (90-304)||(5406196-5406422)
chr6 (90-304)||(5410521-5410747)
chr6 (1-207)||(16554923-16555131)
chr6 (1-207)||(16631479-16631687)
chr6 (90-304)||(9183028-9183255)
chr6 (1-204)||(412158-412362)
chr6 (87-304)||(2171525-2171754)
chr6 (90-304)||(5413391-5413616)
chr6 (90-293)||(31404671-31404887)
chr6 (41-176)||(6097398-6097533)
chr6 (94-304)||(28137409-28137632)
chr6 (1-162)||(34167180-34167341)
chr6 (1-171)||(13154005-13154176)
chr6 (90-293)||(16452325-16452543)
chr6 (90-293)||(30834532-30834750)
chr6 (94-262)||(21588916-21589098)
chr6 (3-204)||(3072670-3072871)
chr6 (1-207)||(6027300-6027507)
chr6 (1-207)||(25421359-25421567)
chr6 (46-207)||(27647915-27648075)
chr6 (90-304)||(26954283-26954509)
chr6 (94-213)||(17758072-17758191)
chr6 (90-304)||(33160348-33160577)
chr6 (90-304)||(33211182-33211409)
chr6 (117-304)||(3038926-3039127)
chr6 (90-192)||(5409066-5409167)
chr6 (1-171)||(34164948-34165120)
chr6 (1-171)||(33342010-33342183)
chr6 (94-213)||(26800636-26800755)
chr6 (120-306)||(4045364-4045566)
chr6 (90-177)||(16569107-16569193)
chr6 (133-357)||(25073457-25073698)
chr6 (259-419)||(5740970-5741131)
chr6 (334-428)||(17757902-17757998)
chr6 (280-402)||(11660452-11660574)
chr6 (252-293)||(16567160-16567201)
chr6 (118-185)||(9572667-9572735)
chr6 (209-247)||(16554869-16554907)
chr6 (209-247)||(16631425-16631463)
chr6 (209-247)||(27647861-27647899)
chr6 (252-293)||(16568997-16569038)
chr6 (135-218)||(2908502-2908586)
chr6 (211-247)||(16578650-16578686)
chr6 (211-247)||(16616694-16616730)
chr6 (209-247)||(6027246-6027284)
chr6 (209-247)||(13153913-13153951)
chr6 (209-247)||(16653112-16653150)
chr6 (209-247)||(25421305-25421343)
chr6 (209-247)||(33342237-33342275)
chr6 (209-247)||(34164856-34164894)
chr6 (209-247)||(34167078-34167116)
chr6 (94-138)||(19643894-19643938)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (90-427)||(34310712-34311065)
chr7 (98-428)||(6431789-6432134)
chr7 (87-428)||(2390100-2390456)
chr7 (94-423)||(4512391-4512735)
chr7 (96-428)||(29608554-29608902)
chr7 (94-423)||(3258819-3259162)
chr7 (94-428)||(4508707-4509056)
chr7 (94-428)||(48599335-48599684)
chr7 (99-428)||(2360978-2361321)
chr7 (94-423)||(22269796-22270140)
chr7 (94-428)||(4510549-4510898)
chr7 (94-428)||(8359316-8359668)
chr7 (1-207)||(20343951-20344156)
chr7 (1-207)||(18392103-18392311)
chr7 (87-304)||(35853859-35854089)
chr7 (240-424)||(6360073-6360258)
chr7 (1-207)||(18388667-18388875)
chr7 (90-306)||(23554982-23555212)
chr7 (90-304)||(29990999-29991225)
chr7 (99-428)||(22328395-22328748)
chr7 (90-304)||(27347761-27347988)
chr7 (90-304)||(36146405-36146633)
chr7 (1-176)||(1560572-1560749)
chr7 (90-293)||(14069830-14070047)
chr7 (90-293)||(14379858-14380075)
chr7 (90-292)||(30024729-30024945)
chr7 (1-204)||(39731426-39731628)
chr7 (90-304)||(31732966-31733193)
chr7 (90-304)||(48489375-48489602)
chr7 (114-304)||(48491523-48491727)
chr7 (94-213)||(32358055-32358173)
chr7 (90-304)||(47676133-47676360)
chr7 (92-304)||(43864188-43864413)
chr7 (94-293)||(31105394-31105607)
chr7 (102-293)||(47673953-47674157)
chr7 (90-304)||(4586105-4586332)
chr7 (1-207)||(6594465-6594673)
chr7 (90-304)||(8153286-8153513)
chr7 (90-304)||(41317431-41317658)
chr7 (1-171)||(32060229-32060400)
chr7 (90-213)||(25615902-25616025)
chr7 (1-207)||(6592247-6592455)
chr7 (90-304)||(18126588-18126815)
chr7 (90-304)||(41649008-41649234)
chr7 (90-304)||(19502122-19502350)
chr7 (87-303)||(26417261-26417489)
chr7 (90-304)||(1113601-1113828)
chr7 (41-204)||(43504102-43504266)
chr7 (87-303)||(25766953-25767180)
chr7 (90-304)||(38671219-38671446)
chr7 (90-303)||(495980-496206)
chr7 (90-304)||(4178719-4178945)
chr7 (41-207)||(24789896-24790062)
chr7 (87-304)||(48408747-48408979)
chr7 (87-213)||(6359946-6360071)
chr7 (91-213)||(2759195-2759316)
chr7 (94-304)||(4253529-4253754)
chr7 (90-304)||(12097864-12098083)
chr7 (101-213)||(23565069-23565180)
chr7 (104-288)||(23343934-23344130)
chr7 (94-304)||(36574517-36574740)
chr7 (101-199)||(31518965-31519063)
chr7 (90-188)||(24525499-24525596)
chr7 (152-290)||(31518752-31518905)
chr7 (217-304)||(4538677-4538764)
chr7 (217-304)||(24526034-24526121)
chr7 (217-402)||(1360290-1360478)
chr7 (94-218)||(18396362-18396486)
chr7 (132-216)||(5116650-5116735)
chr7 (217-304)||(2761439-2761526)
chr7 (92-168)||(30814530-30814605)
chr7 (230-304)||(24514912-24514984)
chr7 (101-299)||(3904624-3904837)
chr7 (94-198)||(5513668-5513771)
chr7 (218-304)||(5514148-5514234)
chr7 (101-218)||(26639364-26639486)
chr7 (217-304)||(39731321-39731399)
chr7 (342-406)||(5116475-5116539)
chr7 (277-402)||(23794024-23794149)
chr7 (217-304)||(30843370-30843457)
chr7 (209-247)||(1562135-1562173)
chr7 (209-247)||(20343897-20343935)
chr7 (347-401)||(43363683-43363737)
chr7 (252-293)||(25615817-25615858)
chr7 (154-217)||(27073861-27073925)
chr7 (154-217)||(27204388-27204452)
chr7 (209-247)||(6592471-6592509)
chr7 (209-247)||(6594689-6594727)
chr7 (209-247)||(18388891-18388929)
chr7 (209-247)||(18392327-18392365)
chr7 (230-298)||(23565215-23565280)
chr7 (209-247)||(32060455-32060493)
chr7 (217-247)||(43504293-43504323)
chr7 (342-402)||(22552697-22552757)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (94-428)||(11348516-11348865)
chr1 (94-428)||(13547090-13547439)
chr1 (87-428)||(42297968-42298325)
chr1 (94-428)||(13549001-13549350)
chr1 (94-428)||(29136066-29136415)
chr1 (90-428)||(37033068-37033423)
chr1 (94-428)||(37168115-37168465)
chr1 (94-428)||(7482231-7482580)
chr1 (94-428)||(193429-193778)
chr1 (94-428)||(47255340-47255689)
chr1 (94-428)||(47114989-47115340)
chr1 (94-428)||(31925708-31926056)
chr1 (98-428)||(34603394-34603740)
chr1 (92-428)||(19754309-19754664)
chr1 (90-428)||(19752503-19752857)
chr1 (217-428)||(37879048-37879261)
chr1 (1-207)||(44203685-44203893)
chr1 (70-293)||(8550765-8551001)
chr1 (1-207)||(9036471-9036677)
chr1 (1-204)||(40282435-40282636)
chr1 (251-428)||(28242206-28242385)
chr1 (90-304)||(28265551-28265778)
chr1 (1-204)||(20622146-20622349)
chr1 (90-293)||(28220223-28220440)
chr1 (90-293)||(31659192-31659409)
chr1 (90-304)||(28223418-28223645)
chr1 (1-204)||(9987259-9987461)
chr1 (90-304)||(834164-834391)
chr1 (90-304)||(3189275-3189502)
chr1 (90-304)||(3198092-3198319)
chr1 (90-304)||(3206931-3207158)
chr1 (90-304)||(44455104-44455331)
chr1 (90-288)||(49918309-49918521)
chr1 (1-207)||(51765450-51765656)
chr1 (1-204)||(21054016-21054217)
chr1 (90-293)||(3156820-3157036)
chr1 (90-293)||(4552634-4552851)
chr1 (90-293)||(13659333-13659550)
chr1 (90-304)||(20762616-20762844)
chr1 (117-303)||(1833467-1833667)
chr1 (90-304)||(3847118-3847345)
chr1 (90-304)||(50167172-50167399)
chr1 (90-207)||(13316348-13316465)
chr1 (90-293)||(46064872-46065089)
chr1 (90-302)||(13137973-13138196)
chr1 (90-293)||(37503554-37503768)
chr1 (90-304)||(50169207-50169434)
chr1 (90-293)||(37559864-37560083)
chr1 (297-428)||(34602557-34602689)
chr1 (90-293)||(45644351-45644569)
chr1 (114-306)||(15820249-15820455)
chr1 (133-284)||(16455585-16455750)
chr1 (90-304)||(196904-197132)
chr1 (90-304)||(10925167-10925397)
chr1 (114-304)||(23555286-23555489)
chr1 (87-304)||(41360859-41361088)
chr1 (120-428)||(6808265-6808595)
chr1 (90-304)||(30476443-30476672)
chr1 (216-402)||(41135664-41135852)
chr1 (94-304)||(927977-928202)
chr1 (90-303)||(40122193-40122421)
chr1 (94-185)||(28242382-28242472)
chr1 (94-193)||(37876767-37876865)
chr1 (118-402)||(22079166-22079461)
chr1 (249-400)||(25651931-25652084)
chr1 (134-213)||(9109459-9109539)
chr1 (114-217)||(36683735-36683828)
chr1 (103-213)||(37282701-37282811)
chr1 (82-213)||(2926557-2926688)
chr1 (103-305)||(44650172-44650389)
chr1 (122-212)||(5459956-5460046)
chr1 (136-213)||(2263016-2263094)
chr1 (117-213)||(3460745-3460841)
chr1 (291-428)||(16216709-16216844)
chr1 (118-203)||(13938195-13938281)
chr1 (154-218)||(25652130-25652195)
chr1 (294-397)||(3331403-3331505)
chr1 (209-292)||(8871178-8871259)
chr1 (105-162)||(8871074-8871130)
chr1 (318-398)||(12318720-12318801)
chr1 (144-212)||(32471510-32471579)
chr1 (92-218)||(12318522-12318647)
chr1 (154-212)||(16914234-16914294)
chr1 (217-293)||(51765349-51765425)
chr1 (209-247)||(9036417-9036455)
chr1 (328-368)||(6068471-6068512)
chr1 (209-305)||(44646914-44647010)
chr1 (291-361)||(10157501-10157571)
chr1 (141-202)||(4535527-4535589)
chr1 (217-247)||(9987202-9987232)
chr1 (217-247)||(20622376-20622406)
chr1 (209-247)||(21053958-21053996)
chr1 (217-247)||(40282377-40282407)
chr1 (209-247)||(44203631-44203669)
chr1 (103-165)||(44646814-44646875)
chr1 (93-138)||(15916626-15916671)
chr1 (93-138)||(31422862-31422906)
chr1 (291-403)||(33775756-33775866)
chr1 (236-289)||(37282848-37282901)
chr1 (253-301)||(1485947-1485995)
[»] chr5 (88 HSPs)
chr5 (94-428)||(40147079-40147428)
chr5 (94-428)||(213287-213633)
chr5 (94-428)||(5057865-5058212)
chr5 (92-428)||(28278134-28278485)
chr5 (90-428)||(38746823-38747176)
chr5 (94-428)||(27015350-27015690)
chr5 (96-423)||(27637615-27637961)
chr5 (90-304)||(25412706-25412932)
chr5 (1-207)||(25078174-25078382)
chr5 (1-207)||(25136143-25136351)
chr5 (1-204)||(9789132-9789335)
chr5 (1-207)||(10593312-10593519)
chr5 (1-207)||(22536199-22536403)
chr5 (1-204)||(16409532-16409736)
chr5 (92-304)||(13239696-13239921)
chr5 (41-204)||(26177939-26178103)
chr5 (90-293)||(42428427-42428644)
chr5 (94-407)||(16640941-16641269)
chr5 (1-204)||(29720422-29720623)
chr5 (1-204)||(29722582-29722783)
chr5 (90-304)||(533713-533940)
chr5 (41-204)||(18441595-18441759)
chr5 (90-293)||(13488157-13488374)
chr5 (1-204)||(29751068-29751270)
chr5 (90-304)||(13343005-13343232)
chr5 (41-176)||(26170848-26170983)
chr5 (90-293)||(32636778-32636995)
chr5 (90-304)||(28750652-28750879)
chr5 (1-304)||(30182533-30182845)
chr5 (1-207)||(40382355-40382563)
chr5 (90-303)||(537970-538196)
chr5 (90-303)||(42426232-42426458)
chr5 (1-171)||(40380181-40380352)
chr5 (90-304)||(39468546-39468773)
chr5 (73-293)||(33831634-33831866)
chr5 (90-203)||(37439200-37439313)
chr5 (90-304)||(36074039-36074268)
chr5 (94-293)||(16452035-16452247)
chr5 (101-293)||(30682930-30683134)
chr5 (90-293)||(8565943-8566160)
chr5 (94-304)||(31182917-31183138)
chr5 (268-414)||(4160465-4160611)
chr5 (92-402)||(316609-316933)
chr5 (1-171)||(16544499-16544672)
chr5 (105-303)||(9049354-9049565)
chr5 (1-207)||(16546684-16546894)
chr5 (117-298)||(13695713-13695910)
chr5 (92-399)||(33906028-33906350)
chr5 (94-304)||(3075659-3075882)
chr5 (161-303)||(42926838-42926968)
chr5 (90-293)||(42309932-42310149)
chr5 (249-394)||(35616023-35616167)
chr5 (90-171)||(19806454-19806534)
chr5 (217-304)||(19806328-19806414)
chr5 (165-304)||(5887487-5887640)
chr5 (132-218)||(10054854-10054940)
chr5 (290-403)||(14689622-14689735)
chr5 (94-188)||(42926965-42927058)
chr5 (300-428)||(21205873-21206002)
chr5 (133-218)||(3325957-3326043)
chr5 (132-216)||(8445761-8445846)
chr5 (99-159)||(4160702-4160762)
chr5 (232-304)||(37439078-37439148)
chr5 (277-370)||(8019464-8019557)
chr5 (249-375)||(10700818-10700945)
chr5 (209-247)||(22536419-22536457)
chr5 (209-247)||(29751290-29751328)
chr5 (157-218)||(32609579-32609641)
chr5 (154-211)||(35616220-35616278)
chr5 (217-304)||(16409427-16409505)
chr5 (104-203)||(30793195-30793293)
chr5 (144-214)||(22097912-22097981)
chr5 (252-319)||(32576471-32576538)
chr5 (209-247)||(10593258-10593296)
chr5 (118-218)||(10700674-10700772)
chr5 (209-247)||(16544407-16544445)
chr5 (209-247)||(25078120-25078158)
chr5 (209-247)||(25136089-25136127)
chr5 (217-247)||(29720364-29720394)
chr5 (217-247)||(29722524-29722554)
chr5 (209-247)||(40380090-40380128)
chr5 (93-202)||(14971007-14971114)
chr5 (217-304)||(26170726-26170803)
chr5 (217-304)||(26177835-26177912)
chr5 (93-138)||(38882340-38882384)
chr5 (249-285)||(8445686-8445722)
chr5 (94-138)||(18596881-18596924)
chr5 (141-213)||(32576344-32576416)
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (90-424)||(34491035-34491383)
chr3 (94-428)||(6095600-6095949)
chr3 (87-428)||(49199462-49199821)
chr3 (94-423)||(46860294-46860642)
chr3 (94-428)||(4569769-4570120)
chr3 (94-427)||(54593524-54593871)
chr3 (87-428)||(30235943-30236299)
chr3 (94-428)||(41819523-41819872)
chr3 (87-428)||(43403737-43404083)
chr3 (87-428)||(43401794-43402140)
chr3 (92-428)||(47304070-47304420)
chr3 (127-423)||(36018674-36018987)
chr3 (1-304)||(23200047-23200360)
chr3 (94-428)||(55301972-55302315)
chr3 (1-207)||(6716554-6716760)
chr3 (1-207)||(54635179-54635384)
chr3 (3-304)||(23197850-23198161)
chr3 (1-207)||(3617503-3617711)
chr3 (1-304)||(19683799-19684113)
chr3 (90-304)||(9581227-9581454)
chr3 (1-207)||(25637480-25637691)
chr3 (90-304)||(45095109-45095335)
chr3 (209-423)||(5434006-5434222)
chr3 (90-304)||(29196383-29196612)
chr3 (90-293)||(7762220-7762437)
chr3 (90-304)||(44331489-44331716)
chr3 (90-304)||(44700476-44700703)
chr3 (90-304)||(37408403-37408630)
chr3 (90-304)||(40734442-40734669)
chr3 (90-304)||(5258140-5258368)
chr3 (90-293)||(7764422-7764636)
chr3 (90-304)||(5236454-5236680)
chr3 (90-293)||(16498984-16499200)
chr3 (240-428)||(40913157-40913350)
chr3 (1-207)||(45283037-45283247)
chr3 (1-204)||(7779912-7780114)
chr3 (103-303)||(46173311-46173515)
chr3 (46-204)||(801148-801307)
chr3 (90-304)||(5260319-5260547)
chr3 (87-293)||(9636119-9636340)
chr3 (101-304)||(22835010-22835226)
chr3 (90-293)||(40735337-40735554)
chr3 (90-304)||(760791-761018)
chr3 (90-304)||(29682303-29682530)
chr3 (114-304)||(29810812-29811016)
chr3 (90-293)||(51398768-51398985)
chr3 (90-304)||(31314389-31314616)
chr3 (1-171)||(4598430-4598601)
chr3 (90-304)||(39153358-39153585)
chr3 (90-305)||(9666463-9666693)
chr3 (1-171)||(10211485-10211656)
chr3 (101-293)||(53921511-53921717)
chr3 (101-302)||(32891049-32891264)
chr3 (1-207)||(4600651-4600859)
chr3 (1-171)||(10209265-10209436)
chr3 (90-293)||(29813017-29813234)
chr3 (1-171)||(10056309-10056481)
chr3 (1-171)||(10058531-10058703)
chr3 (1-171)||(10060753-10060925)
chr3 (1-171)||(10062975-10063147)
chr3 (1-171)||(10065197-10065369)
chr3 (87-203)||(40913352-40913467)
chr3 (82-388)||(26323060-26323385)
chr3 (90-304)||(23391906-23392133)
chr3 (161-335)||(31340268-31340456)
chr3 (135-398)||(35138746-35139026)
chr3 (294-428)||(1683306-1683440)
chr3 (90-213)||(32744433-32744555)
chr3 (90-293)||(23410326-23410543)
chr3 (1-133)||(10067435-10067568)
chr3 (92-402)||(20937501-20937826)
chr3 (253-372)||(39127421-39127541)
chr3 (118-218)||(33191876-33191974)
chr3 (102-161)||(27305719-27305777)
chr3 (296-402)||(34795713-34795819)
chr3 (217-290)||(26386618-26386692)
chr3 (133-203)||(51352150-51352219)
chr3 (213-304)||(2075190-2075281)
chr3 (99-203)||(4055769-4055874)
chr3 (94-168)||(2075076-2075149)
chr3 (99-203)||(4075476-4075581)
chr3 (143-213)||(5373282-5373353)
chr3 (118-207)||(5433906-5433989)
chr3 (128-218)||(25491003-25491092)
chr3 (217-280)||(5373198-5373263)
chr3 (209-247)||(6716500-6716538)
chr3 (209-299)||(40519323-40519413)
chr3 (209-247)||(45282983-45283021)
chr3 (209-247)||(54635125-54635163)
chr3 (142-218)||(1313852-1313929)
chr3 (157-213)||(2020188-2020245)
chr3 (217-247)||(801091-801121)
chr3 (141-218)||(3148037-3148115)
chr3 (209-247)||(3617449-3617487)
chr3 (209-247)||(4598655-4598693)
chr3 (209-247)||(4600876-4600914)
chr3 (217-247)||(6718684-6718714)
chr3 (209-247)||(10056217-10056255)
chr3 (209-247)||(10058439-10058477)
chr3 (209-247)||(10060661-10060699)
chr3 (209-247)||(10062883-10062921)
chr3 (209-247)||(10065105-10065143)
chr3 (209-247)||(10067327-10067365)
chr3 (209-247)||(10209173-10209211)
chr3 (209-247)||(10211393-10211431)
chr3 (209-247)||(25637426-25637464)
chr3 (209-267)||(51352240-51352298)
chr3 (174-207)||(4386908-4386941)
chr3 (154-218)||(8166516-8166581)
chr3 (154-218)||(24635301-24635366)
chr3 (159-188)||(31340242-31340271)
chr3 (145-213)||(54739004-54739072)
chr3 (294-357)||(36796686-36796749)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (94-423)||(45726752-45727096)
chr2 (96-428)||(1631735-1632082)
chr2 (94-428)||(35446885-35447234)
chr2 (99-428)||(42288117-42288460)
chr2 (92-423)||(24397881-24398228)
chr2 (1-207)||(13655936-13656146)
chr2 (1-207)||(12647293-12647501)
chr2 (90-409)||(17450428-17450748)
chr2 (1-304)||(4484239-4484554)
chr2 (90-304)||(2334414-2334641)
chr2 (1-304)||(30833290-30833605)
chr2 (90-304)||(5723252-5723478)
chr2 (90-293)||(17057366-17057583)
chr2 (90-293)||(17085349-17085566)
chr2 (1-304)||(36987986-36988299)
chr2 (90-304)||(45099699-45099926)
chr2 (94-428)||(33647988-33648340)
chr2 (90-293)||(36318006-36318223)
chr2 (90-304)||(723741-723968)
chr2 (90-304)||(29867813-29868040)
chr2 (90-304)||(36773506-36773733)
chr2 (90-304)||(38312184-38312411)
chr2 (1-204)||(32289621-32289825)
chr2 (1-304)||(4503044-4503356)
chr2 (90-294)||(6595002-6595221)
chr2 (1-204)||(6266749-6266951)
chr2 (90-304)||(34139767-34139995)
chr2 (90-304)||(11151588-11151815)
chr2 (114-304)||(42362296-42362500)
chr2 (90-306)||(33162447-33162676)
chr2 (90-304)||(14633822-14634050)
chr2 (90-304)||(11067249-11067476)
chr2 (90-304)||(11690445-11690672)
chr2 (90-304)||(36205661-36205887)
chr2 (94-306)||(17490149-17490368)
chr2 (128-304)||(13121712-13121901)
chr2 (94-213)||(7451167-7451284)
chr2 (132-304)||(7815311-7815498)
chr2 (94-217)||(26353229-26353351)
chr2 (94-304)||(11049493-11049721)
chr2 (118-402)||(30218068-30218358)
chr2 (90-168)||(39284930-39285007)
chr2 (217-304)||(39284829-39284916)
chr2 (160-304)||(24885605-24885763)
chr2 (105-203)||(28671989-28672088)
chr2 (120-213)||(42019896-42019992)
chr2 (132-304)||(14202450-14202631)
chr2 (93-213)||(24197946-24198065)
chr2 (213-304)||(12123718-12123809)
chr2 (300-402)||(43730992-43731093)
chr2 (133-218)||(42261524-42261610)
chr2 (230-304)||(5700273-5700347)
chr2 (117-163)||(42412117-42412162)
chr2 (154-218)||(34811281-34811346)
chr2 (294-398)||(42261826-42261930)
chr2 (388-428)||(7451118-7451158)
chr2 (209-247)||(6266691-6266729)
chr2 (118-213)||(7597036-7597130)
chr2 (170-213)||(4561137-4561180)
chr2 (129-218)||(41454278-41454366)
chr2 (142-211)||(3897041-3897111)
chr2 (209-247)||(12647517-12647555)
chr2 (209-247)||(13656162-13656200)
chr2 (93-138)||(42064725-42064770)
chr2 (277-320)||(16676152-16676196)
chr2 (294-334)||(42261694-42261734)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (94-428)||(4283342-4283691)
chr8 (94-428)||(42434992-42435341)
chr8 (90-428)||(40221563-40221916)
chr8 (94-428)||(11383804-11384152)
chr8 (120-423)||(40328602-40328922)
chr8 (132-428)||(44353610-44353923)
chr8 (94-401)||(18655246-18655567)
chr8 (1-207)||(3439558-3439763)
chr8 (1-292)||(42498149-42498452)
chr8 (90-304)||(15212730-15212957)
chr8 (90-293)||(34254327-34254543)
chr8 (1-207)||(25690009-25690215)
chr8 (90-293)||(27811232-27811449)
chr8 (90-304)||(33352094-33352321)
chr8 (90-304)||(43036367-43036594)
chr8 (90-304)||(17982597-17982825)
chr8 (90-304)||(4731602-4731829)
chr8 (90-293)||(34256503-34256719)
chr8 (90-304)||(31218201-31218429)
chr8 (100-304)||(18141764-18141981)
chr8 (1-171)||(15290614-15290785)
chr8 (1-171)||(15470983-15471154)
chr8 (1-186)||(2627811-2627995)
chr8 (87-305)||(10930193-10930424)
chr8 (90-306)||(5689213-5689442)
chr8 (90-306)||(40321022-40321251)
chr8 (90-304)||(3303667-3303894)
chr8 (90-304)||(44303798-44304027)
chr8 (94-302)||(8965692-8965914)
chr8 (91-304)||(1746216-1746442)
chr8 (90-293)||(19945355-19945574)
chr8 (90-306)||(1345368-1345597)
chr8 (90-304)||(6598916-6599143)
chr8 (90-304)||(6674369-6674596)
chr8 (1-171)||(42575232-42575402)
chr8 (100-304)||(1292471-1292687)
chr8 (90-304)||(12702631-12702862)
chr8 (114-304)||(30143286-30143488)
chr8 (102-304)||(30291549-30291767)
chr8 (105-304)||(8153705-8153914)
chr8 (87-304)||(19491693-19491922)
chr8 (94-213)||(4162546-4162663)
chr8 (91-304)||(9765693-9765914)
chr8 (99-304)||(18106087-18106302)
chr8 (90-303)||(41366612-41366837)
chr8 (90-304)||(4743211-4743427)
chr8 (99-213)||(10015130-10015241)
chr8 (101-207)||(3772247-3772352)
chr8 (94-184)||(4733784-4733873)
chr8 (101-218)||(7597658-7597776)
chr8 (94-202)||(3073875-3073981)
chr8 (118-218)||(11712024-11712125)
chr8 (302-402)||(40585569-40585669)
chr8 (118-212)||(32902197-32902292)
chr8 (249-402)||(33655474-33655628)
chr8 (132-213)||(1822341-1822423)
chr8 (132-213)||(1856786-1856868)
chr8 (143-293)||(10929753-10929907)
chr8 (217-304)||(41364984-41365071)
chr8 (94-213)||(29796320-29796441)
chr8 (290-402)||(10240004-10240113)
chr8 (239-293)||(4162454-4162508)
chr8 (294-401)||(10020292-10020398)
chr8 (142-218)||(30909412-30909487)
chr8 (357-408)||(9633816-9633867)
chr8 (278-402)||(10101351-10101475)
chr8 (145-213)||(11137074-11137146)
chr8 (120-171)||(38863949-38864000)
chr8 (209-247)||(3439504-3439542)
chr8 (230-275)||(3772164-3772209)
chr8 (153-213)||(10240203-10240264)
chr8 (173-217)||(41364926-41364970)
chr8 (217-247)||(2627735-2627765)
chr8 (209-247)||(15290522-15290560)
chr8 (209-247)||(15470891-15470929)
chr8 (209-247)||(25689955-25689993)
chr8 (144-233)||(38860413-38860505)
chr8 (158-213)||(3231859-3231915)
[»] chr4 (110 HSPs)
chr4 (87-428)||(54882838-54883194)
chr4 (94-428)||(50673848-50674196)
chr4 (94-423)||(379202-379548)
chr4 (102-428)||(35662260-35662600)
chr4 (94-428)||(12073210-12073560)
chr4 (97-428)||(41964233-41964580)
chr4 (114-428)||(8665225-8665556)
chr4 (87-381)||(2209578-2209889)
chr4 (94-419)||(46703327-46703669)
chr4 (87-428)||(50262694-50263048)
chr4 (94-428)||(6655774-6656123)
chr4 (94-428)||(8647956-8648306)
chr4 (87-423)||(12119362-12119714)
chr4 (94-340)||(40632353-40632612)
chr4 (90-390)||(27416962-27417273)
chr4 (171-428)||(55085442-55085715)
chr4 (90-304)||(56178633-56178860)
chr4 (94-329)||(41639345-41639593)
chr4 (118-430)||(33989678-33989989)
chr4 (1-207)||(8393448-8393656)
chr4 (1-207)||(8395657-8395865)
chr4 (90-304)||(48142986-48143215)
chr4 (92-304)||(52095361-52095586)
chr4 (90-304)||(26175633-26175860)
chr4 (90-304)||(5429623-5429850)
chr4 (90-306)||(36463386-36463615)
chr4 (92-293)||(36994478-36994693)
chr4 (94-293)||(29999806-30000019)
chr4 (90-304)||(9927455-9927681)
chr4 (90-293)||(48893635-48893856)
chr4 (94-302)||(31474096-31474318)
chr4 (90-304)||(34570411-34570638)
chr4 (90-304)||(47038408-47038633)
chr4 (92-304)||(54199906-54200130)
chr4 (90-304)||(12739547-12739774)
chr4 (90-304)||(52467351-52467579)
chr4 (92-304)||(37740570-37740794)
chr4 (90-304)||(5871764-5871991)
chr4 (90-304)||(29254438-29254665)
chr4 (90-207)||(5370079-5370196)
chr4 (291-428)||(26364083-26364222)
chr4 (51-204)||(31495274-31495428)
chr4 (90-304)||(13009441-13009655)
chr4 (94-304)||(6542180-6542405)
chr4 (90-287)||(3913408-3913618)
chr4 (90-207)||(12743922-12744038)
chr4 (90-207)||(12745311-12745427)
chr4 (94-304)||(4587902-4588126)
chr4 (1-171)||(7124992-7125163)
chr4 (136-304)||(24969055-24969238)
chr4 (90-204)||(13992289-13992402)
chr4 (87-213)||(26364285-26364410)
chr4 (134-303)||(12745476-12745659)
chr4 (94-304)||(37229722-37229947)
chr4 (90-213)||(46147388-46147510)
chr4 (2-171)||(5136155-5136327)
chr4 (2-171)||(5138380-5138552)
chr4 (99-419)||(26699447-26699786)
chr4 (1-171)||(7122773-7122944)
chr4 (132-304)||(12747794-12747980)
chr4 (90-304)||(45687179-45687407)
chr4 (90-304)||(52082660-52082881)
chr4 (94-303)||(5207843-5208066)
chr4 (120-424)||(33089721-33090021)
chr4 (114-310)||(21688186-21688397)
chr4 (134-207)||(12744087-12744160)
chr4 (101-402)||(22882759-22883077)
chr4 (101-402)||(22934423-22934741)
chr4 (94-293)||(51337018-51337231)
chr4 (290-393)||(41961264-41961368)
chr4 (351-428)||(40630802-40630879)
chr4 (302-402)||(3785934-3786034)
chr4 (209-304)||(29056301-29056396)
chr4 (158-401)||(32091324-32091583)
chr4 (320-428)||(34112430-34112539)
chr4 (217-402)||(35369578-35369763)
chr4 (174-304)||(41639207-41639351)
chr4 (135-218)||(6677513-6677597)
chr4 (92-218)||(34112861-34112986)
chr4 (209-306)||(48142508-48142605)
chr4 (94-213)||(21703836-21703955)
chr4 (94-218)||(44967829-44967953)
chr4 (230-302)||(5370238-5370308)
chr4 (120-214)||(37754986-37755081)
chr4 (294-402)||(35370553-35370661)
chr4 (132-213)||(48142413-48142497)
chr4 (156-218)||(44570427-44570490)
chr4 (353-428)||(46569821-46569896)
chr4 (209-247)||(8393394-8393432)
chr4 (209-247)||(8395603-8395641)
chr4 (141-210)||(16422653-16422723)
chr4 (252-314)||(52065530-52065592)
chr4 (140-213)||(53345266-53345340)
chr4 (217-304)||(13992429-13992509)
chr4 (217-260)||(26364223-26364267)
chr4 (170-218)||(34788851-34788899)
chr4 (92-218)||(38811189-38811313)
chr4 (249-300)||(5349853-5349904)
chr4 (102-204)||(29056416-29056518)
chr4 (142-213)||(40975057-40975128)
chr4 (209-247)||(5136063-5136101)
chr4 (209-247)||(5138288-5138326)
chr4 (209-247)||(7122682-7122720)
chr4 (209-247)||(7124901-7124939)
chr4 (217-247)||(31495455-31495485)
chr4 (249-306)||(3677403-3677460)
chr4 (118-213)||(5349959-5350052)
chr4 (291-332)||(25723433-25723474)
chr4 (249-335)||(44570541-44570630)
chr4 (218-275)||(53345189-53345246)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (94-428)||(7146-7494)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (87-428)||(11376-11732)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (94-425)||(18004-18348)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (149-428)||(80338-80633)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (1-171)||(3633-3804)
scaffold0674 (209-247)||(3857-3895)
[»] scaffold0491 (3 HSPs)
scaffold0491 (1-304)||(11070-11385)
scaffold0491 (1-204)||(8644-8846)
scaffold0491 (217-304)||(8873-8959)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (1-207)||(2511-2719)
scaffold0565 (209-247)||(2735-2773)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (92-275)||(434504-434703)
scaffold0002 (133-218)||(490359-490445)
scaffold0002 (294-398)||(490661-490765)
scaffold0002 (294-334)||(490529-490569)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (90-304)||(114547-114774)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (90-304)||(861-1087)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (90-293)||(149094-149311)
[»] scaffold0137 (2 HSPs)
scaffold0137 (1-207)||(6326-6536)
scaffold0137 (209-247)||(6272-6310)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (1-126)||(1-126)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (92-293)||(20414-20629)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (94-205)||(10546-10656)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (105-218)||(27453-27567)
scaffold0219 (249-306)||(27614-27670)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (274-401)||(1591-1729)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (141-218)||(25097-25175)
scaffold0053 (258-319)||(24981-25041)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (257-304)||(19117-19163)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593484
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 21593733  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21593732 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 21593634  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593633 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcaca 21593534  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21593533 agactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaa 21593484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3809058
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 3808800  T
Q  187 -tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||              |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||    
T  3808801 atgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacacttg-tgatttt 3808899  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3808900 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcctttgatttcactaaggattttctcttt 3808998  T
Q  369 tggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3808999 tggttttacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 3809058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973289
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 2973038  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2973039 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacactta-tgattttcactctcc 2973137  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2973138 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 2973237  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  2973238 caagactcacccaagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaa 2973289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043445
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5043695 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactca-tgattttcactctca 5043597  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5043596 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgattccactaaggatcttctcttttggtttca 5043497  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5043496 caagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 5043445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 94 - 408
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830454
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggatta 26830222  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-aacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26830223 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactca-tgattttcactctc 26830321  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttc 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26830322 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttctcttttggtttc 26830421  T
Q  376 acaagagtcacccaagttgctcacaaatgactc 408  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26830422 acaagactcgcccaagttgctcacaaatgactc 26830454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762807
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagtta 17763059  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||     
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctct 17762959  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17762958 caaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctctttttgtttca 17762859  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17762858 caagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 17762807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603430
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 603180  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactct--aatttctaccc-----ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | || |     | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  603181 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttctacccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactatccc 603279  T
Q  280 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcac 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  603280 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 603379  T
Q  378 aagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  603380 aagactcacccaagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaa 603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22425170
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggt 191  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactct 22425024  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22425025 cccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa-ccccaaaagagaaccaacccttagctttgatttcctaaggatattctcttttggtttca 22425123  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||    
T  22425124 caagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgttt 22425170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16578424 - 16578632
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16578424 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttc 16578522  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  16578523 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 16578621  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  16578622 gaaattagctt 16578632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16616956 - 16616748
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16616956 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttc 16616858  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  16616857 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 16616759  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  16616758 gaaattagctt 16616748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16653374 - 16653166
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16653374 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttc 16653276  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  16653275 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 16653177  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  16653176 gaaattagctt 16653166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5406196 - 5406422
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5406196 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 5406295  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5406296 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 5406395  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5406396 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5410521 - 5410747
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5410521 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 5410620  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5410621 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 5410720  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5410721 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16555131 - 16554923
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16555131 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttc 16555033  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  16555032 acccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 16554934  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  16554933 gaaattagctt 16554923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16631687 - 16631479
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16631687 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttc 16631589  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  16631588 acccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 16631490  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  16631489 gaaattagctt 16631479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183255
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 9183126  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9183127 gttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 9183226  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9183227 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 412362 - 412158
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  412362 cctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcac 412264  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  412263 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaaga 412164  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  412163 aattag 412158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 2171525 - 2171754
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171525 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 2171624  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
     ||||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2171625 -gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 2171723  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2171724 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5413391 - 5413616
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5413391 agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 5413489  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5413490 gttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 5413589  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5413590 -accaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 5413616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 31404671 - 31404887
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31404671 agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 31404770  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31404771 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactc 31404870  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaat 293  Q
      ||||||||||||||||    
T  31404871 -accaaggtgtttacaat 31404887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 6097398 - 6097533
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097398 acaatcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 6097497  T
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097498 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 6097533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137632
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggtta 28137507  T
Q  194 caagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||| ||||              ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28137508 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28137607  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28137608 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28137632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34167341 - 34167180
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  34167341 cctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 34167243  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  34167242 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34167180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13154176 - 13154005
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  13154176 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggtca 13154078  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13154077 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 13154005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 16452325 - 16452543
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagg 16452424  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16452425 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 16452524  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  16452525 tc-accaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 30834532 - 30834750
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30834532 agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 30834631  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30834632 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 30834731  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||  || |||||||||||||    
T  30834732 tc-accgaggtgtttacaat 30834750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588916
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 21589000  T
Q  194 caagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactca 262  Q
    |||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21588999 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 21588916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 3072670 - 3072871
Alignment:
Q  3 tagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  || ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  3072670 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcaccc 3072767  T
Q  103 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  3072768 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaa 3072867  T
Q  201 ttag 204  Q
    ||||    
T  3072868 ttag 3072871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6027507 - 6027300
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6027507 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatg-gagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6027410  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  6027409 cccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 6027311  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  6027310 gaaattagctt 6027300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25421567 - 25421359
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  25421567 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 25421469  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  25421468 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 25421370  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  25421369 gaaattagctt 25421359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27648075 - 27647915
Alignment:
Q  46 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatct 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||    
T  27648075 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtact 27647977  T
Q  146 ctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27647976 ctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 27647915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954509
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatga 26954381  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26954382 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttataccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactc 26954481  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||    
T  26954482 cccaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26954509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758072
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaa 17758072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 33160348 - 33160577
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  33160348 agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 33160447  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatga-ttttca 272  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  33160448 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttca 33160547  T
Q  273 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33160548 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33160577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211409
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatga 33211280  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    | |||||||||||| ||||| ||| |||              |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  33211281 gctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagt 33211380  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33211381 gacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 304
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039127
Alignment:
Q  117 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca---- 212  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagct 3039025  T
Q  213 ----------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 301  Q
              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  3039026 cacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttccc 3039124  T
Q  302 aac 304  Q
    |||    
T  3039125 aac 3039127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 192
Target Start/End: Original strand, 5409066 - 5409167
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5409066 agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 5409164  T
Q  190 gtt 192  Q
    |||    
T  5409165 gtt 5409167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 34165120 - 34164948
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  34165120 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 34165024  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34165023 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 34164948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 33342010 - 33342183
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagataca---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattg 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  33342010 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattg 33342106  T
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33342107 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 33342183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800636
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgggtt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagtt 26800657  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26800656 acaagaaattagcttcaacaa 26800636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045364
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc- 217  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctca 4045467  T
Q  218 --------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
                  ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4045466 taaagaacaaaccctaatttctaccattttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaa 4045367  T
Q  304 ctc 306  Q
    |||    
T  4045366 ctc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16569107
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 16569107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073457
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc-------------- 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||                  
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  218 taatttctacccttttcccaatctca-ccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatcta 315  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||  || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25073598 taatttctaccattttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatcta 25073500  T
Q  316 acccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaagg 357  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  25073499 acccccaaaagagaatcaacccttagcctttaatttcctaagg 25073457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 419
Target Start/End: Original strand, 5740970 - 5741131
Alignment:
Q  259 ctcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaag 356  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  5740970 ctcaatgattt-cactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttgatttactaag 5741068  T
Q  357 gatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgt 419  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5741069 gatcttcactttttgtttctcaagattcacccaaattgctcacaaaagactcccttctcatgt 5741131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17757998 - 17757902
Alignment:
Q  334 actcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17757998 actcttagcctttgatttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 17757902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660452
Alignment:
Q  280 aaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcac 377  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| || |    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacccc--aaaatgaaccaacccttagcctttgaattcctatggttatcctcttttggtctccc 11660477  T
Q  378 aagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||    
T  11660476 aagattcatccaaattgctcacaaa 11660452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16567201 - 16567160
Alignment:
Q  252 caagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16567201 caagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9572735 - 9572667
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 185  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572735 tgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16554907 - 16554869
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554907 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16631463 - 16631425
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631463 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27647899 - 27647861
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647899 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16569038 - 16568997
Alignment:
Q  252 caagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16569038 caagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaat 16568997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908502
Alignment:
Q  135 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||  || |||||| ||||||||| ||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaaagagttgtaaaaaattatcttcaacaagctct 2908502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Original strand, 16578650 - 16578686
Alignment:
Q  211 caaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578650 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 16578686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16616730 - 16616694
Alignment:
Q  211 caaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616730 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 16616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6027284 - 6027246
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6027284 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 6027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13153951 - 13153913
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13153951 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16653150 - 16653112
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16653150 aacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaa 16653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25421343 - 25421305
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421343 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 25421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 33342237 - 33342275
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33342237 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 33342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34164894 - 34164856
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164894 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34167116 - 34167078
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167116 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34311065
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgt 34310811  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34310812 gttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcact 34310910  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34310911 ctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggt 34311010  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttcca 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34311011 ttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttcca 34311065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 98 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431789
Alignment:
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaag 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaag 6432036  T
Q  198 aaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaag 282  Q
    |||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6432035 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaat 6431937  T
Q  283 gtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431936 gtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaag 6431837  T
Q  381 agtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6431836 actcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaa 6431789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2390456 - 2390100
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  2390456 aagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaa 2390358  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2390357 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacactta-tgattttc 2390259  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2390258 gctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctctttt 2390159  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  2390158 ggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaa 2390100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512735
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggtta 4512489  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||              |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4512490 caagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactca-tgattttcactctcc 4512588  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4512589 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 4512688  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4512689 caagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttt 4512735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 96 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608554
Alignment:
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 195  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 29608804  T
Q  196 agaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    |||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||| ||    
T  29608803 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctca 29608704  T
Q  281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29608703 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttctattttggtttcaca 29608604  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29608603 agactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 29608554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258819
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagtta 3259064  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||              || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  3259063 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcc 3258964  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258963 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttaggtttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcaca 3258864  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  3258863 agactcacccaagttgctaataaaagactctccactcatatgttt 3258819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4509056
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4508805  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||| || |||              |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4508806 caagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactca-tgattttcactctcc 4508904  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4508905 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttatcttttggtttca 4509004  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4509005 caagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 4509056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599684
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagtta 48599433  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  48599434 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatca-tgattttcactcctc 48599532  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48599533 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 48599632  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  48599633 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaa 48599684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 428
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361321
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 2361076  T
Q  199 aattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    ||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2361077 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaagg 2361175  T
Q  284 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaaga 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2361176 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataaga 2361274  T
Q  382 gtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2361275 ctcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 2361321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269796
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggtta 22270042  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22270041 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcc 22269942  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22269941 caaggtgtttagaattgttt-ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctatgatttcactaaggatcttctattttggtttca 22269843  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  22269842 caagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgttt 22269796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510898
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggtta 4510647  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||              |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4510648 caagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactca-tgattttcactctcc 4510746  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4510747 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 4510846  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4510847 caagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 4510898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359668
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||| || ||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8359416 acaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactca-tgattttcactctc 8359514  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa-cccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8359515 tcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggttt 8359614  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  8359615 cacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 8359668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20344156 - 20343951
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344156 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 20344058  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  20344057 ccagttcggtcc-aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 20343960  T
Q  199 aattagctt 207  Q
    |||||||||    
T  20343959 aattagctt 20343951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18392103 - 18392311
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18392103 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 18392201  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  18392202 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 18392300  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  18392301 gaaattagctt 18392311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35854089 - 35853859
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35854089 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 35853990  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
     ||||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35853989 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 35853890  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35853889 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 35853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 240 - 424
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360258
Alignment:
Q  240 ctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctt 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactca-tgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 6360171  T
Q  340 ag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgtttt 424  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6360172 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttt 6360258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18388667 - 18388875
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18388667 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 18388765  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  18388766 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 18388864  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  18388865 gaaattagctt 18388875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23554982
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagt 23555113  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23555112 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 23555013  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23555012 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990999
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagg 29991126  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29991125 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 29991026  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29991025 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29990999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 428
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328748
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaag 197  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  198 aaattagcttcaaca---------------aactctaatttctaccctt--ttcccaatctc----accaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||               |||||||||||||| ||||  |||||||||||    |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattcc 22328594  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa-cccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  22328595 ctcaaggtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttgattacataaggatattctcttttagttt 22328694  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  22328695 cccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaa 22328748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27347988 - 27347761
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347988 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 27347890  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27347889 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 27347790  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27347789 cacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 27347761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146633
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 36146503  T
Q  190 gttacaagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||| |||||||||||||               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36146504 gttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 36146602  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36146603 tcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1560572 - 1560749
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |     
T  1560572 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtt 1560670  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070047
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 14069928  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14069929 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 14070028  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14070029 cacccaaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380075
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 14379956  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14379957 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 14380056  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14380057 cacccaaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024945
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgg 30024827  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30024828 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 30024927  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaa 292  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30024928 cacccaaggtgtttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39731628 - 39731426
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  39731628 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 39731532  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  39731531 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaaga 39731432  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  39731431 aattag 39731426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733193
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 31733064  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||              ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31733065 gttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 31733164  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31733165 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31733193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489375
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgg 48489504  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  48489503 gttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcact 48489404  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48489403 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491523
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca- 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 48491628  T
Q  213 -------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
                 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  48491627 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgttt 48491529  T
Q  299 cccaac 304  Q
    ||||||    
T  48491528 cccaac 48491523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358173
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 32358153  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32358154 caagaaattagcttcaacaa 32358173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676360
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgg 47676231  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47676232 gttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcact 47676331  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47676332 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 47676360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864188
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggt 43864315  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||| ||||||||||||||||              ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43864314 tacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 43864215  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43864214 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43864188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 293
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105607
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggtta 31105492  T
Q  194 caagaaattagcttcaac--------------aaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31105493 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31105592  T
Q  279 caaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||    
T  31105593 caaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 293
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674157
Alignment:
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 201  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 47674050  T
Q  202 tagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
    |||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47674051 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 47674150  T
Q  287 ttacaat 293  Q
    |||||||    
T  47674151 ttacaat 47674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4586332 - 4586105
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgg 4586234  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4586233 gttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacact 4586134  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4586133 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4586105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6594465 - 6594673
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6594465 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6594563  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  6594564 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 6594662  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  6594663 gaaattagctt 6594673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153286
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatga 8153415  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8153414 gttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 8153315  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153314 cacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 8153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317658
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 41317529  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
     |||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41317530 attacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcact 41317629  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41317630 catccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 32060229 - 32060400
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  32060229 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 32060327  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32060328 ccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 32060400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25616025 - 25615902
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25616025 agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgg 25615926  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  25615925 gttacaagaaattagcttaaacaa 25615902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6592247 - 6592455
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6592247 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6592345  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  6592346 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 6592444  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  6592445 gaaattagctt 6592455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18126815 - 18126588
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126815 agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 18126717  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||              ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18126716 gttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcact 18126617  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18126616 cacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 18126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649234
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 41649106  T
Q  190 gttacaagaaattagct--------tc------aacaaactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||        ||      ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41649107 gttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 41649205  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41649206 tacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41649234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19502350 - 19502122
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19502350 agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 19502251  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||              ||||||||| ||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  19502250 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcac 19502151  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502150 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26417489 - 26417261
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26417489 aagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 26417392  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26417391 tgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 26417292  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    || | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26417291 acccgctcaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1113828 - 1113601
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113828 agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 1113730  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||              ||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1113729 gttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 1113630  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1113629 cacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 1113601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 43504102 - 43504266
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43504102 acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagatt 43504200  T
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattag 204  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43504201 gaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 43504266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Original strand, 25766953 - 25767180
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25766953 aagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaa 25767052  T
Q  186 atgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25767053 aggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgatttt 25767149  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25767150 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671446
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgt 38671317  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||| ||||              ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38671318 gttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgct 38671417  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38671418 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 38671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 495980 - 496206
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  495980 agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgg 496078  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||              || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  496079 gttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcact 496178  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  496179 cacccaaggtttttacaa-tgtttcccaa 496206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4178945 - 4178719
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4178945 agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagg 4178847  T
Q  190 gttacaagaaattagctt---caa---ca--------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||   |||   ||        ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4178846 gttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 4178747  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4178746 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4178719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24790062 - 24789896
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790062 acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 24789964  T
Q  140 tgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 207  Q
     |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24789963 agtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaa-atgttacaagaaattagctt 24789896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48408979 - 48408747
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-a 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  48408979 aagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaa 48408880  T
Q  185 aatgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattt 269  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||              |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48408879 aaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 48408780  T
Q  270 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48408779 tcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48408747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6360071
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 6360044  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6360045 tgggttacaagaaattagcttcaacaa 6360071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 213
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759316
Alignment:
Q  91 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgag 2759293  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2759294 ttacaagaaattagcttcaacaa 2759316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253754
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  193 acaagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||| ||||||||||||               ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcac 4253727  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  4253728 ctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12098083
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||||    
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgg 12097954  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12097955 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 12098054  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12098055 cacccaagatgtttacaa-tgtttcccaac 12098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565180
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaa 23565167  T
Q  201 ttagcttcaacaa 213  Q
    |||| ||||||||    
T  23565168 ttagtttcaacaa 23565180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343934
Alignment:
Q  104 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaatta 23344034  T
Q  204 gcttcaacaaactc---------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt 288  Q
    |||||||||| |||               |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23344033 gcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574740
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 36574614  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||               ||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| |    
T  36574615 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcac 36574713  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  36574714 ctaaggtgtttacaaatgttttccaac 36574740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518965
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 31518965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 188
Target Start/End: Original strand, 24525499 - 24525596
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 188  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525499 agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518752
Alignment:
Q  152 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttccc 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||              |||||||||||  |||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  237 aatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 4538677 - 4538764
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4538677 ctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt-tttcccaac 4538764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 24526034 - 24526121
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24526034 ctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 402
Target Start/End: Original strand, 1360290 - 1360478
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcac-caacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatct 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  1360290 ctaatttctacctttttcccaatctcattccatgaacaagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatct 1360388  T
Q  315 aa-cccccaaaagagaaccaactctta-gctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    || ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1360389 aaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttgatttcccaaaaatattctcttttggttttccaagactcactcaagttgctcgcaaa 1360478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396362
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa-atgtt 18396388  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18396387 acaaaaaaataggttcaacaaactct 18396362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5116735 - 5116650
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  5116735 ggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaact 5116650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761526
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 2761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814530
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514984
Alignment:
Q  230 ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24514984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 299
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904837
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  200 attagcttc---------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    ||||  |||               ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttctaccattttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaagg 3904821  T
Q  284 tgtttacaattgtttc 299  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3904822 tgtttacaaatgtttc 3904837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 5513668 - 5513771
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  5513668 tgtttacccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 5513765  T
Q  193 acaaga 198  Q
    | ||||    
T  5513766 ataaga 5513771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Original strand, 5514148 - 5514234
Alignment:
Q  218 taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5514148 taatttctactcttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaaggtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26639486 - 26639364
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaa----agagatacaaatgggttaca 195  Q
    |||||||||| |||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||    | | ||||||| ||||||||    
T  26639486 ccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatatatatacaaaagggttaca 26639387  T
Q  196 agaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  26639386 agaaattaacatcaacaaactct 26639364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39731399 - 39731321
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39731399 ctaatttctaccctttttccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39731321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5116539 - 5116475
Alignment:
Q  342 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgac 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  5116539 ctttgatttcctgaggatcttctcttttggttacccaagactcacctaagtttatcacaaatgac 5116475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 402
Target Start/End: Original strand, 23794024 - 23794149
Alignment:
Q  277 cccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  23794024 cccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccacaaaatga--accaaccattagcctttgattttctaaggatctcctcttttggtct 23794121  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    |  | || |||||||| |||||||||||    
T  23794122 cttacgattcacccaaattgctcacaaa 23794149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 30843370 - 30843457
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||| |||| ||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  30843370 ctaatttataccttttactcaatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 30843457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 1562135 - 1562173
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562135 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 1562173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20343935 - 20343897
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343935 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 401
Target Start/End: Original strand, 43363683 - 43363737
Alignment:
Q  347 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  43363683 atttcctaaagatcttctcttttggtctctcaagattcacccaaattgctcacaa 43363737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25615858 - 25615817
Alignment:
Q  252 caagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25615858 caagacactcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaat 25615817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27073925 - 27073861
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc 217  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27073925 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactc 27073861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 27204388 - 27204452
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc 217  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27204388 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactc 27204452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 6592471 - 6592509
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592471 aacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 6594689 - 6594727
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6594689 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 6594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 18388891 - 18388929
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18388891 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 18388929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 18392327 - 18392365
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18392327 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 18392365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Original strand, 23565215 - 23565280
Alignment:
Q  230 ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23565215 ttttcctaatctcaccaatgaacaagacact---tcatgttcactcacccaaggtgtttacaaatgttt 23565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 32060455 - 32060493
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32060455 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 32060493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Original strand, 43504293 - 43504323
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504293 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 22552697 - 22552757
Alignment:
Q  342 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||    
T  22552697 ctttgatttcctatgaatcttctcttttggtctcccaagattcacccatgtagttcacaaa 22552757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348516
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggtta 11348767  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11348766 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 11348668  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11348667 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 11348568  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11348567 caagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaa 11348516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547439
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 13547188  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||| |||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13547189 caagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 13547287  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13547288 caaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttca 13547387  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13547388 caagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaa 13547439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 42297968 - 42298325
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42297968 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 42298067  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  42298068 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttt 42298166  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  42298167 actctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttcacttaggatcttctctttt 42298266  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42298267 ggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 42298325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549350
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 13549099  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    || |||||||| || ||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13549100 catgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 13549198  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13549199 caaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttca 13549298  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13549299 caagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaa 13549350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136066
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 29136217  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29136216 caaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 29136117  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  29136116 caagactcacccaagttgctcacaaaaaactctccactcatgt-ttttccaa 29136066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033423
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatg 37033167  T
Q  189 ggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37033168 gattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcac 37033266  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttgg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37033267 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgg 37033366  T
Q  372 tttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37033367 tttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 37033423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168115
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 37168367  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37168366 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctc 37168268  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttc 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37168267 tcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttc 37168168  T
Q  376 acaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  37168167 acaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 37168115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482580
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 7482329  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccctttt-cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||    
T  7482330 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttc 7482429  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcac 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7482430 ccaaggtgtttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagctttgatttcctaaggatcttctctttttgtttcac 7482529  T
Q  378 aagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7482530 aagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 7482580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193429
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtta 193680  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  193679 caagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcaccctcc 193581  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  193580 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 193481  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  193480 caagactcatccaagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaa 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255689
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 47255538  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47255539 caaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 47255638  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  47255639 caagactca-ctaagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaa 47255689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47114989
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctc 47115142  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttc 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47115141 ccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcattaaggatcttctcttttggtttc 47115042  T
Q  376 acaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  47115041 acaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaa 47114989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31926056
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31925806  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31925807 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 31925905  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31925906 caaggtgtttacaactgcttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 31926004  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||    
T  31926005 caagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactcacgtgtttcccaa 31926056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603394
Alignment:
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaa 196  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaa 34603642  T
Q  197 gaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaa 281  Q
    ||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  34603641 gaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaa 34603542  T
Q  282 ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603541 ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaag 34603442  T
Q  381 agtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  34603441 actcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaa 34603394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 92 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754309
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggt 19754566  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19754565 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 19754467  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta-gctttgatttc----ctaaggatcttctcttttg 370  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||     ||||||| ||||||||||    
T  19754466 tctcaaggtgtttacgaatgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatcctttgatttcacttataaggattttctcttttg 19754367  T
Q  371 gtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19754366 gtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 19754309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752503
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcg 19752759  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccctttt--cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19752758 gttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcac 19752660  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttgg 371  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19752659 tctctcaaggtgtttacgattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgg 19752560  T
Q  372 tttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  19752559 tttcacaagactcatctaagttgctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaa 19752503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 37879048 - 37879261
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatcta 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879048 ctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatcta 37879146  T
Q  316 acccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccac 413  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37879147 acccccaaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccac 37879246  T
Q  414 tcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||| ||||    
T  37879247 tcatgtgtttcccaa 37879261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44203893 - 44203685
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  44203893 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 44203795  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  44203794 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 44203696  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  44203695 gaaattagctt 44203685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 8550765 - 8551001
Alignment:
Q  70 agaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 169  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550765 agaaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 8550862  T
Q  170 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaa 254  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  8550863 ttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaa 8550962  T
Q  255 gacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8550963 gacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9036677 - 9036471
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  9036677 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttc 9036580  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  9036579 acccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 9036481  T
Q  198 aaattagctt 207  Q
    ||||||||||    
T  9036480 aaattagctt 9036471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40282636 - 40282435
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  40282636 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcac 40282539  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  40282538 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 40282440  T
Q  200 attag 204  Q
    |||||    
T  40282439 attag 40282435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242206
Alignment:
Q  251 acaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatt 349  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttgatt 28242286  T
Q  350 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28242285 tcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 28242206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265778
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgg 28265649  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28265650 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcact 28265749  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28265750 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20622146 - 20622349
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  20622146 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcac 20622243  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatacaaatgggttacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||  |||||||||    
T  20622244 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaa-aggttacaag 20622342  T
Q  198 aaattag 204  Q
    |||||||    
T  20622343 aaattag 20622349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220440
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 28220321  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220322 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcact 28220421  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  28220422 cacccaaggtgttttcaat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659192
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgg 31659311  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31659310 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 31659211  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  31659210 cacccaaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223645
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 28223516  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28223517 gttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 28223616  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  28223617 cacccaaggtgtcttcaa-tgtttcccaac 28223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9987461 - 9987259
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9987461 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa-gagattgttca 9987364  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||    
T  9987363 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaa-aggttgcaaga 9987265  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  9987264 aattag 9987259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834391
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 834262  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||              ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  834263 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacg 834362  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  834363 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 834391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3189502 - 3189275
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  3189502 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaaga 3189403  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3189402 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 3189303  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3189302 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3198319 - 3198092
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  3198319 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaaga 3198220  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3198219 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 3198120  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3198119 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3198092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3207158 - 3206931
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  3207158 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaaga 3207059  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3207058 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 3206959  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3206958 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3206931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44455331 - 44455104
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  44455331 agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatga 44455233  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44455232 gttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcact 44455133  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44455132 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44455104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918309
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 49918423  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49918422 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 49918323  T
Q  275 ctcccaaggtgttt 288  Q
    | ||||||||||||    
T  49918322 cacccaaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51765656 - 51765450
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  51765656 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 51765560  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  51765559 cccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaag 51765460  T
Q  198 aaattagctt 207  Q
    ||||||||||    
T  51765459 aaattagctt 51765450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21054217 - 21054016
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  21054217 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcac 21054120  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||    
T  21054119 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttgcaagaa 21054021  T
Q  200 attag 204  Q
    |||||    
T  21054020 attag 21054016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3157036 - 3156820
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3157036 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 3156938  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3156937 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 3156838  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |  ||| ||||||||||||    
T  3156837 c-accagggtgtttacaat 3156820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552851
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggg 4552732  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4552733 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccct 4552832  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  4552833 cacccaaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659550
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgg 13659431  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    || ||||||||||||||||||||              ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13659432 gtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 13659531  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
      |||||||||||||||||    
T  13659532 accccaaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20762844 - 20762616
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20762844 agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagg 20762745  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20762744 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcac 20762645  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20762644 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 20762616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833467
Alignment:
Q  117 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca---- 212  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |        
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagatt 1833568  T
Q  213 ----------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 301  Q
              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1833567 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccc 1833469  T
Q  302 aa 303  Q
    ||    
T  1833468 aa 1833467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847345
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 3847216  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3847217 gttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 3847316  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3847317 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167399
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 50167270  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50167271 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 50167370  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50167371 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 50167399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316465
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 13316447  T
Q  190 gttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13316448 gttacaagaaattagctt 13316465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064872
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatga 46064991  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||              ||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46064990 gttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 46064891  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  46064890 cacccaaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138196
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgg 13138071  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact-------------ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||             |||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  13138072 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacgacctaatttctatccatttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 13138171  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttccca 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  13138172 cccaaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 37503554 - 37503768
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  37503554 agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---g 37503649  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37503650 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 37503749  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  37503750 cacccaaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169434
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatga 50169305  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50169306 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 50169405  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50169406 cacccaaggtatttacaa-tgtttcccaac 50169434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 37559864 - 37560083
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37559864 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatg 37559962  T
Q  189 ggttacaagaaattagc-ttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttca 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||              ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37559963 ggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 37560062  T
Q  273 ctctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  37560063 ctcacctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602689
Alignment:
Q  297 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgc 395  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgc 34602656  T
Q  396 tcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  34602657 tcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaa 34602689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644569
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 45644449  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| |||               ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45644450 gttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcac 45644549  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  45644550 tcacccaagatgtttacaat 45644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820249
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaa 15820356  T
Q  214 act--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
     ||              ||||||| ||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15820355 gctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttt 15820257  T
Q  299 cccaactc 306  Q
    ||||||||    
T  15820256 cccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455585
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac-------------aaactcta 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcactagaaaaaatcta 16455651  T
Q  220 atttct-acccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16455650 atttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197132
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 188  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatg 197002  T
Q  189 ggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
     |||||||||||||| ||| ||||              ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  197003 agttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 197102  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  197103 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 197132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925167
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaa 10925299  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||              ||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10925298 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 10925199  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10925198 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 10925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555489
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca- 212  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaa 23555384  T
Q  213 -------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
                 ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  23555385 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaa-tgttt 23555483  T
Q  299 cccaac 304  Q
    ||||||    
T  23555484 cccaac 23555489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41361088 - 41360859
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41361088 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 41360990  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||              ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41360989 tgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttc 41360891  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41360890 actcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 41360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808265
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact-- 216  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||      
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctct 6808496  T
Q  217 ------------------ctaatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 297  Q
                      |||||||||||| ||| || |||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||    
T  6808495 ccaagaacaaacctaatcctaatttctaccatttccctaatctctactcatgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtt 6808396  T
Q  298 tcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgct 396  Q
    || |||||||||||||||| || | |||||||||||||  |  | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||    
T  6808395 tctcaactctagaatctaa-cctcgaaagagaaccaaccttccgtctttgattacataatgatcttctcttttggttttccattactcaccctagttgct 6808297  T
Q  397 cacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  6808296 cacaaatgactcttcattcatgtgttttccaa 6808265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 30476443 - 30476672
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476443 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 30476541  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa---cgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||| |||||| ||||||||              ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  30476542 gttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttc 30476640  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30476641 acccacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 30476672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41135852 - 41135664
Alignment:
Q  216 tctaatttctacccttttcccaatctcacca-acgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctagaatc 313  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||  || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  41135852 tctaatttctaccctttttctattctcctcacaggaacaagagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatc 41135754  T
Q  314 taacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  41135753 taacccccaaaagagaaccaatccttagcctttaatttccaaatgatcttctcttttggtttcctaagactcacccaagtttctcacaaa 41135664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928202
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggtta 928075  T
Q  194 caagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||               ||||||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  928076 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcac 928175  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  928176 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122421
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaat 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaat 40122291  T
Q  188 gggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttca 272  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||              || ||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  40122292 gagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttta 40122391  T
Q  273 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40122392 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876865
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079166
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  217 c--------------taatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcc 300  Q
    |              ||||||||||| |||| ||||||||  || | ||||||||     ||||  |||||||| ||  | || ||| | |||||||||     
T  22079361 cacaaagaacaaacataatttctaccatttttccaatctcttcccatgaacaaga-----aatg-gtttcactcacctgaagtttttcccaattgtttct 22079268  T
Q  301 caactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcac 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  22079267 caactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatccttagcctttgatttcataagcatcttatattttggtttgccaagactcacctaagttgctcac 22079169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25652084 - 25651931
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaac-ccccaaaagagaaccaactctt-agctttg 346  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||| |  ||||    
T  25652084 gaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaccttcataaaagagaaccaattcttaatatttg 25651985  T
Q  347 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 400  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25651984 attttctaaggatcttcacttttgctttcccaagattcacccaagttgctcaca 25651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 213
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109539
Alignment:
Q  134 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaa 9109539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683735
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttctta----------caaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 36683739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282811
Alignment:
Q  103 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaat 37282799  T
Q  202 tagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||    
T  37282800 tagcttcaacaa 37282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2926688 - 2926557
Alignment:
Q  82 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagaga 180  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  2926688 caccaaaga-attgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagaga 2926590  T
Q  181 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    | ||||  |||||||| |||||| ||| |||||    
T  2926589 tgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaa 2926557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Original strand, 44650172 - 44650389
Alignment:
Q  103 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaat 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |  |||||| ||||    
T  44650172 agttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaat 44650270  T
Q  202 tagcttcaacaaactc---------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
    |||| | |||||||||               |||||| |||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  44650271 tagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacatttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgt 44650370  T
Q  287 ttacaattgtttcccaact 305  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  44650371 ttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459956
Alignment:
Q  122 ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaa-atgttacaagaaattagcttcaaca 5459956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 213
Target Start/End: Original strand, 2263016 - 2263094
Alignment:
Q  136 agattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2263016 agattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaa 2263094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3460841 - 3460745
Alignment:
Q  117 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3460841 ttgacctactctag-gaagatattgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaa 3460745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 428
Target Start/End: Original strand, 16216709 - 16216844
Alignment:
Q  291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 389  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| | |||| ||    
T  16216709 aattgtttctcaactctagaatctaaccct--aaactaaaccaactcgtagcctttgatttcctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactca 16216806  T
Q  390 agttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16216807 agttgctcac-aatgactctcctctcatgtgtttgccaa 16216844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13938281 - 13938195
Alignment:
Q  118 tgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaatgggttacaagaaatta 203  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  13938281 tgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaatta 13938195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652130
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactct 25652130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3331505 - 3331403
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| ||||    
T  3331505 tgtttcccaactctagaatccaacccc-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttcctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaagt 3331408  T
Q  393 tgctc 397  Q
    |||||    
T  3331407 tgctc 3331403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 8871178 - 8871259
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaa 292  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8871178 aacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact--atgattttcgctcatccaaggtgtttacaa 8871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  105 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 162  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 398
Target Start/End: Original strand, 12318720 - 12318801
Alignment:
Q  318 ccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 398  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  12318720 cccccaaagagaaccaacccttagcctttgatttccaaaagattttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctca 12318801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471510
Alignment:
Q  144 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaaca 32471510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 12318522 - 12318647
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||| ||||| ||| |||||||  ||||||||   | || |||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  12318522 attgtttacctagttcggtccaataatgaactactatgggggagaga--gatctctctgcttcagtatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatgg 12318619  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12318620 ttacaagaaattagcttcaacaagctct 12318647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914294
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaa-ttagcttcaaca 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaaca 16914294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51765425 - 51765349
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttc--ccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51765425 ctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9036455 - 9036417
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036455 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6068512 - 6068471
Alignment:
Q  328 gaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttt 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6068512 gaaccaactcttagcctttgatttcctaaggatcttctcttt 6068471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Original strand, 44646914 - 44647010
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 305  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  44646914 aacaaaccataatttttacatttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcatccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10157571 - 10157501
Alignment:
Q  291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatct 361  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10157571 aattgtttttcaactttagaatctaaccccctaaat-gaaccaacccttagtctttgatttcctaaggatct 10157501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535589
Alignment:
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 202  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 4535589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9987232 - 9987202
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987232 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Original strand, 20622376 - 20622406
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622376 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21053996 - 21053958
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21053996 aacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaa 21053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40282407 - 40282377
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282407 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44203669 - 44203631
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44203669 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 44203631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 165
Target Start/End: Original strand, 44646814 - 44646875
Alignment:
Q  103 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatga 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646814 agttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33775866 - 33775756
Alignment:
Q  291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||| || || ||||| || | ||    
T  33775866 aattgtttcccaattctagaatctaa-cctcaaaag-gaacaaactcttagtctttgattttctaa-aatctcatcttttagtctctcaagattcgctca 33775770  T
Q  390 agttgctcacaaat 403  Q
    ||||||||||||||    
T  33775769 agttgctcacaaat 33775756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Original strand, 37282848 - 37282901
Alignment:
Q  236 caatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttta 289  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  37282848 caatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactcatacaaggtgttta 37282901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 301
Target Start/End: Original strand, 1485947 - 1485995
Alignment:
Q  253 aagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  1485947 aagatactcaatgattttcactcacttaatgtgtttacaattgtttccc 1485995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 88)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147079
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 40147330  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40147329 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgatttccactctcc 40147231  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40147230 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 40147131  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  40147130 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 40147079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213287
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 213435  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  213434 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc----cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 213339  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  213338 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 213287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5057865
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggata 5058114  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    ||||||| |||||||||||| |||            |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5058113 caagaaaatagcttcaacaagctcacagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactcttcca 5058015  T
Q  281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttga-tttcctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5058014 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttcaca 5057915  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5057914 agactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaa 5057865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 92 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278134
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggt 28278387  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28278386 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactct 28278288  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||    
T  28278287 cccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcatttgatttcactaacaatcttctcttttgattt 28278188  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||    
T  28278187 cacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaa 28278134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38746823
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgg 38747078  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38747077 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactca-tgattttcact 38746979  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38746978 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcaataaggatcttctcttttggt 38746879  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  38746878 ttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaa 38746823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015350
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt-- 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtat 27015592  T
Q  192 ----tacaagaaattagcttcaacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
        | ||| || ||  |    |  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27015591 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactca-tgattttcactctcccaagatgt 27015494  T
Q  287 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27015493 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactc 27015394  T
Q  385 acccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27015393 acccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 27015350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 96 - 423
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637961
Alignment:
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttac 194  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttac 27637713  T
Q  195 aagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccc 279  Q
    |||||||||| || ||||| |||              |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  27637714 aagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttcc 27637813  T
Q  280 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatct--tctcttttggtttc 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  27637814 aaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaacaaacttttagtctttgatttcactaaggatcttctctcttttggtttc 27637913  T
Q  376 acaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  27637914 acaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgttt 27637961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25412932 - 25412706
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25412932 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 25412833  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25412832 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 25412733  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25412732 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 25412706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25078382 - 25078174
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25078382 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 25078284  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  25078283 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 25078185  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  25078184 gaaattagctt 25078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25136351 - 25136143
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25136351 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 25136253  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  25136252 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 25136154  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  25136153 gaaattagctt 25136143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 9789132 - 9789335
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||  || ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9789132 cctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcac 9789230  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  9789231 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 9789330  T
Q  200 attag 204  Q
    |||||    
T  9789331 attag 9789335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10593519 - 10593312
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10593519 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaa-gagattgttc 10593422  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  10593421 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 10593323  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  10593322 gaaattagctt 10593312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 22536199 - 22536403
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22536199 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcac 22536296  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  22536297 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 22536395  T
Q  200 attagctt 207  Q
    ||||||||    
T  22536396 attagctt 22536403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16409736 - 16409532
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  || ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16409736 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttca 16409638  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  16409637 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaaga 16409538  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  16409537 aattag 16409532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13239921 - 13239696
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13239921 attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagt 13239822  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaac--------------aaactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  13239821 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 13239723  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13239722 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26178103 - 26177939
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26178103 acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 26178004  T
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26178003 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 26177939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428644
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 42428525  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaac--------------aaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||||||              ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42428526 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 42428625  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42428626 cacccaaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 407
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641269
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa---gttcttacaaagagatacaaaagagtta 16641036  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttctaccctttt---cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
      |||||| ||||||||||| |||               ||||||||||| ||||   | ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16641037 tcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactc 16641136  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
     | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  16641137 actcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttgattttttaagtatcttctcttttggttt 16641236  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgact 407  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  16641237 cacaagactcaccaaagttgttcacaattgact 16641269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29720623 - 29720422
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcac 29720526  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  29720525 ccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 29720427  T
Q  200 attag 204  Q
    |||||    
T  29720426 attag 29720422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29722783 - 29722582
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcac 29722686  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  29722685 ccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 29722587  T
Q  200 attag 204  Q
    |||||    
T  29722586 attag 29722582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533713
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 533842  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  533841 gttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcact 533742  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  533741 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 18441595 - 18441759
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 140  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18441595 acaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagatt 18441694  T
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18441695 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattag 18441759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488157
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 13488276  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13488275 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcact 13488176  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13488175 cacccaaggtgtttacaat 13488157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 29751068 - 29751270
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29751068 cctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtaca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacacc-aagagattgttca 29751165  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  29751166 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 29751264  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  29751265 aattag 29751270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13343005
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagg 13343134  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
     |||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13343133 attacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 13343034  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343033 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26170983 - 26170848
Alignment:
Q  41 acaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170983 acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 26170884  T
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170883 gaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 26170848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32636995 - 32636778
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32636995 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgg 32636897  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636896 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcact 32636797  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  32636796 cacccaaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 28750652 - 28750879
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28750652 agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgg 28750750  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||| ||||||| ||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28750751 gttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 28750850  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28750851 cacccaaggtgttttcaa-tgtttcccaac 28750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30182845 - 30182533
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| ||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  30182845 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 30182751  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30182750 tccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaa 30182651  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||||||  |||              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30182650 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggt 30182552  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  30182551 gtttgcaa-tgtttcccaac 30182533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40382563 - 40382355
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  40382563 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 40382465  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  40382464 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 40382366  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  40382365 gaaattagctt 40382355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 537970
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 538098  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  538097 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcact 537998  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  537997 cacccaaggtgtttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426458
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 42426330  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||| |||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42426331 gttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcact 42426430  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42426431 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42426458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40380352 - 40380181
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  40380352 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 40380254  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40380253 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 40380181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468773
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 39468644  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39468645 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcact 39468744  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  39468745 cactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831634
Alignment:
Q  73 aaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta 172  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaaaga--ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttctta 33831770  T
Q  173 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||    
T  33831769 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagac 33831670  T
Q  258 actcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33831669 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 33831634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439200
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 37439214  T
Q  190 gttacaagaaatta 203  Q
    ||||||||||||||    
T  37439213 gttacaagaaatta 37439200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 36074039 - 36074268
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  36074039 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaga 36074137  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc----ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36074138 gttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 36074237  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074238 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36074268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16452035
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 16452149  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16452148 caagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcact-tac 16452050  T
Q  279 caaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||    
T  16452049 caaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 293
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683134
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaaga 30683028  T
Q  199 aattagcttcaaca-----------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
    ||||||||||||||           ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30683029 aattagcttcaacaagttcacaaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgt 30683127  T
Q  287 ttacaat 293  Q
    |||||||    
T  30683128 ttacaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566160
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgg 8566041  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||              |||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8566042 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 8566141  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8566142 cacccaaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182917
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaat-ggtta 31183041  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccc 279  Q
    |||||||||| ||| ||||||||              ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacct 31182941  T
Q  280 aaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  31182940 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4160611 - 4160465
Alignment:
Q  268 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctct 366  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  4160611 tttcactcaaccaatgtgtttacaattgtttctcaactct-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttaattacctaaggatcttctct 4160513  T
Q  367 tttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccact 414  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4160512 tttggtttcccaagattcaccctagttgctcacaaatgactctccact 4160465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316609
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatc---tcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||| ||||| |||||   || || |  ||||||| || |||||| ||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttctacctttttctcaatcttttccccta--aacaagagacccaatga-tttcac 316737  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    || ||| || | ||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  316736 tcacccgagtttttcccaattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcct-aggattttctcttttggt 316638  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  316637 ctcccaagattca-ccaagttgctcacaaa 316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16544672 - 16544499
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagataca---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattg 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16544672 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattg 16544576  T
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16544575 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 16544499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 303
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049565
Alignment:
Q  105 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 204  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattag 9049452  T
Q  205 cttc--------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac 290  Q
    ||||              ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  9049453 cttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttac 9049552  T
Q  291 aattgtttcccaa 303  Q
    || ||||||||||    
T  9049553 aaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16546894 - 16546684
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagataca---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattg 95  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16546894 cctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattg 16546798  T
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtt 192  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||    
T  16546797 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtt 16546699  T
Q  193 acaagaaattagctt 207  Q
    |||||||||||||||    
T  16546698 acaagaaattagctt 16546684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 298
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695910
Alignment:
Q  117 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt-------- 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  208 -------caacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
            ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaaatgttt 13695910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 399
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906350
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||              ||||||| ||||| |||| |||| ||  || | |    |||||||||||||| |||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccatttcacaatttcttcccatg----agacactcaatgatgttcactc 33906223  T
Q  276 tcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaac-caactc-ttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttgg 371  Q
    || ||||||||||  || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906224 tcgcaaggtgtttctcatttgtttcacaactctagaatatatccccccaaa-agaacgccagtcattagcctttgatttcctaaggatcttctcttttgg 33906322  T
Q  372 tttcacaagagtcacccaagttgctcac 399  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33906323 tttcccaagactcacccaagttgctcac 33906350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075882
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggtta 3075757  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||              ||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  3075758 caagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatc 3075857  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  3075858 aaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3075882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926838
Alignment:
Q  161 aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacact 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||           |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctcatatt-----------cccaatctcaccaaagaacaagacact 42926880  T
Q  261 caatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926879 caatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310149
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaaga 42310030  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccct-tttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||              | ||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42310031 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcact 42310130  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
      |||||  ||||||||||    
T  42310131 tacccaaaatgtttacaat 42310149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35616167 - 35616023
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttga 347  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||   ||||||    
T  35616167 gaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaaccac-aaaagagaatcaactctagcctttga 35616070  T
Q  348 tttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttg 394  Q
    |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  35616069 tttcttgatgatcttcgcttttggtttcccaagactcaccaaagttg 35616023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806454
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19806414 - 19806328
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19806414 ctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19806328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 304
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887640
Alignment:
Q  165 agttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||              ||||||||| || ||||| ||||||||| || |    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  250 aacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5887640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 218
Target Start/End: Original strand, 10054854 - 10054940
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10054854 ggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaa-aggttataagaaattagcttcaacaaactct 10054940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 403
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689735
Alignment:
Q  290 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |     
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcccc-aaaagagaaccaacccctagcctttgattttctaaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatct 14689720  T
Q  389 aagttgctcacaaat 403  Q
    |||||||||||||||    
T  14689721 aagttgctcacaaat 14689735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42927058 - 42926965
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 188  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927058 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 428
Target Start/End: Original strand, 21205873 - 21206002
Alignment:
Q  300 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 398  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || | |||||||| || || |    
T  21205873 ccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttgatttcataaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctga 21205972  T
Q  399 caaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21205973 caaatgactcctcactcatgtgtttcccaa 21206002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3326043 - 3325957
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3326043 gagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctct 3325957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8445846 - 8445761
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8445846 ggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaact 8445761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 159  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37439148 - 37439078
Alignment:
Q  232 ttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37439148 ttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 37439078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8019557 - 8019464
Alignment:
Q  277 cccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttg 370  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8019557 cccaaggtgtttcctaattatttcccaactatagaatctaacccccaaaa-ataaccaac-cttagcctttgattttctaaggatcttcacttttg 8019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 375
Target Start/End: Original strand, 10700818 - 10700945
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttg 346  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||   |||||  ||||| ||||     
T  10700818 gaacaaaatactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttcctaattgtttcccatttttagaatctagcccccaaaag-tcaccaaaccttagcctttt 10700916  T
Q  347 atttcctaaggatcttctcttttggtttc 375  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  10700917 atttcctgaggatcttcacgtttggtttc 10700945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 22536419 - 22536457
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536419 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 29751290 - 29751328
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751290 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32609641 - 32609579
Alignment:
Q  157 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32609641 tatcaataagttctttacaaagaaatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaaactct 32609579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616220
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaac 35616220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16409505 - 16409427
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  16409505 ctaatttctaccctttttccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 16409427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30793293 - 30793195
Alignment:
Q  104 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 202  Q
    |||||||||||   |||| |||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  30793293 gttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaaatggttacaataaatt 30793196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097912
Alignment:
Q  144 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaa 22097912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 319
Target Start/End: Original strand, 32576471 - 32576538
Alignment:
Q  252 caagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccc 319  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  32576471 caagagacttaatgattttcactcatcttaggtgtttacaattgtttcccaacccaagaatctcaccc 32576538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10593296 - 10593258
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10593296 aacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 10700674 - 10700772
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  10700674 tgacctactatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataag-aattagcttcaacaagct 10700770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16544445 - 16544407
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16544445 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 16544407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25078158 - 25078120
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25078158 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 25078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25136127 - 25136089
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25136127 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 25136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29720394 - 29720364
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720394 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29722554 - 29722524
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722554 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40380128 - 40380090
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40380128 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14971114 - 14971007
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgaccta-ctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  14971114 ttgttcacccagttcggcccaaatttgacctatttcttgag--gagatagatttctccaattcactattaaagagtttcttacaaagtgatacaa--gag 14971019  T
Q  191 ttacaagaaatt 202  Q
    ||||||||||||    
T  14971018 ttacaagaaatt 14971007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26170803 - 26170726
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  26170803 ctaatttctacccttttcc-aatctcaccaa-------gacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 26170726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26177912 - 26177835
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  26177912 ctaatttctacccttttcc-aatctcaccaa-------gacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 26177835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8445722 - 8445686
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtg 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8445722 gaacaagactctcaatgattttcactctctcaaggtg 8445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 32576344 - 32576416
Alignment:
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||| | | |||||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  32576344 gatctctcaacttcactattaattagttctttaaaagagatacaaaatggttataagtaattagcttcaacaa 32576416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 90 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491035
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 34491285  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||  || |||||||    
T  34491284 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca--gaatttcact 34491187  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34491186 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggt 34491087  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgtttt 424  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34491086 ttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttt 34491035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095949
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 6095698  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||| |||||| ||              || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6095699 caagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactca-tgattttcactctcc 6095797  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6095798 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 6095897  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6095898 caagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 6095949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 49199462 - 49199821
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199462 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 49199561  T
Q  187 -tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49199562 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactca-tgatttt 49199660  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49199661 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 49199760  T
Q  369 tggtttcacaagagtc-acccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  49199761 tggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaa 49199821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860294
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 46860543  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatga-ttttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  46860542 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctc 46860443  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac--tcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860442 ccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctcttagtctttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 46860343  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46860342 cacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttt 46860294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569769
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4570021  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||| || |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4570020 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 4569921  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  4569920 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaagatcatctcttttggtttca 4569821  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  4569820 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 4569769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 94 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593524
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 54593773  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||| |||||||||||||||| |||              |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54593772 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 54593674  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  54593673 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttca 54593575  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttcca 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  54593574 caagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttcca 54593524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30235943
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 30236201  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30236200 taggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactca-tgattttc 30236102  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30236101 actatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagccttcgatttcactaaggatcttctctttt 30236002  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30236001 ggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaa 30235943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819872
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||  |||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 41819721  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcac 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  41819722 ccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagctttgatttcataaagatcttctcttttggtttcat 41819821  T
Q  378 aagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  41819822 aagactcactcaagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaa 41819872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43404083
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa- 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaac 43403836  T
Q  186 atgggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||              ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43403837 atgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 43403935  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||            |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  43403936 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactttag------------aaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 43404023  T
Q  369 tggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43404024 tagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaa 43404083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 43401794 - 43402140
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43401794 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaa 43401893  T
Q  186 atgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43401894 atgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 43401992  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  43401993 cactctcccaaggtgtttacaatcgtttcccaactctag------------aaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 43402080  T
Q  369 tggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  43402081 tggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaa 43402140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 92 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304070
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggt 47304322  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||              |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304321 tacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactca-tgattttcactct 47304223  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47304222 cccagggtgtttaaaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtttttgatttcactaaggatattctcttttggttt 47304123  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  47304122 tacaagactcacctaagttgctcacaaa-aactctccactcatgtgtttcccaa 47304070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018674
Alignment:
Q  127 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc-------- 217  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||            
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  218 ------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 310  Q
          ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 36018789  T
Q  311 atctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36018788 atctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactc 36018689  T
Q  409 cccactcatgtgttt 423  Q
     ||| ||||||||||    
T  36018688 tccattcatgtgttt 36018674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 23200047 - 23200360
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaag-tgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  23200047 cctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 23200143  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23200144 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaa 23200243  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||||||  |||              ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23200244 attagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggt 23200341  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23200342 gtttacaa-tgtttcccaac 23200360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302315
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggtta 55302071  T
Q  194 caaga---------aattagcttcaacaaact--ctaatttctacccttttcccaatctcacca-acgaacaagacactcaatgattttcactctcccaa 281  Q
    |||||         ||||||||||||||||||  | ||   | |||||  |     |||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55302072 caagaaatacaagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatt----tctacccatatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaa 55302166  T
Q  282 ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaa 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302167 ggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaa 55302266  T
Q  380 gagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    || |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  55302267 gactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaa 55302315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6716760 - 6716554
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716760 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 6716661  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  6716660 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 6716562  T
Q  200 attagctt 207  Q
    ||||||||    
T  6716561 attagctt 6716554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54635384 - 54635179
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635384 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 54635286  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  54635285 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 54635187  T
Q  200 attagctt 207  Q
    ||||||||    
T  54635186 attagctt 54635179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Original strand, 23197850 - 23198161
Alignment:
Q  3 tagatctaatctaggaaacaag-tgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  23197850 tagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacc 23197946  T
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23197947 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaat 23198046  T
Q  202 tagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
    ||||||  |||              ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23198047 tagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgt 23198144  T
Q  287 ttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||| |||||||||||    
T  23198145 ttacaa-tgtttcccaac 23198161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3617711 - 3617503
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  3617711 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 3617613  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  3617612 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 3617514  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  3617513 gaaattagctt 3617503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 19683799 - 19684113
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaa-acaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||| | |||| || |||||| ||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  19683799 cctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 19683894  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683895 cccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaa 19683994  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||||||  |||              ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19683995 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggt 19684094  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  19684095 gtttacaa-tgtttcccaac 19684113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581227
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 9581355  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9581354 gttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc 9581255  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9581254 acccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9581227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25637691 - 25637480
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaa-caatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25637691 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggt 25637592  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||    
T  25637591 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttac 25637493  T
Q  195 aagaaattagctt 207  Q
    |||||||||||||    
T  25637492 aagaaattagctt 25637480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095109
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 45095236  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45095235 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 45095136  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45095135 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45095109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 423
Target Start/End: Original strand, 5434006 - 5434222
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttc--ccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5434006 aacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttcccaactc 5434104  T
Q  307 tagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatga 405  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  5434105 tataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttgattacataaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaacttgctcacaaaaga 5434204  T
Q  406 ctccccactcatgtgttt 423  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  5434205 ctctccactcatgtgttt 5434222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196612
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 29196481  T
Q  190 gttacaagaaattagctt---------------caacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||| ||||||||||||||                ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29196482 gttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 29196581  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196582 tcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762220
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 7762338  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7762337 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcact 7762238  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |  |||||||||| |||||    
T  7762237 c-accaaggtgttcacaat 7762220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331489
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgg 44331618  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
     ||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44331617 cttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 44331518  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44331517 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700703
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatag 44700573  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44700574 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 44700673  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44700674 cacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37408630 - 37408403
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37408630 agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 37408531  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37408530 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcact 37408431  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  37408430 c-actaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37408403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734442
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgt 40734571  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40734570 gttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 40734471  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40734470 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5258140 - 5258368
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5258140 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 5258239  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5258240 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5258339  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258340 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7764636 - 7764422
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7764636 agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 7764537  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||              ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7764536 gttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 7764439  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaat 293  Q
      ||||||||||||||||    
T  7764438 -accaaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5236454 - 5236680
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236454 agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 5236551  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236552 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5236651  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5236652 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5236680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16498984
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgg 16499102  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca-------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    || ||||||||||||||||||||             ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  16499101 gtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacta 16499002  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaat 293  Q
     |||||||||||||||||    
T  16499001 ccccaaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 240 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40913350 - 40913157
Alignment:
Q  240 ctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac----tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40913350 ctcaccaatgaacaagacactca-taattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac 40913252  T
Q  336 tctt-agctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40913251 ccttaacctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 40913157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45283247 - 45283037
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45283247 cctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttc 45283150  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac----aaagagatacaaatgggtta 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||  |||||    
T  45283149 actcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaa-aggtta 45283051  T
Q  194 caagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||    
T  45283050 caagaaattagctt 45283037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7779912 - 7780114
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaca-cacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | | |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7779912 cctagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaataca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttca 7780009  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  7780010 cccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaa-aggttacaaga 7780108  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  7780109 aattag 7780114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173311
Alignment:
Q  103 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 46173417  T
Q  203 agcttcaacaaact--ctaatttctaccct--tttc--ccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 296  Q
    ||||||||||| ||  | ||   | |||||  ||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173416 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 46173318  T
Q  297 ttcccaa 303  Q
    |||||||    
T  46173317 ttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 801307 - 801148
Alignment:
Q  46 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatct 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  801307 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 801209  T
Q  146 ctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  801208 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 801148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5260319 - 5260547
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5260319 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 5260418  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5260419 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcac 5260518  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5260519 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5260547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 293
Target Start/End: Original strand, 9636119 - 9636340
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9636119 aagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaa 9636218  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
     ||||||||||||||||| ||  |||              ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9636219 agggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgatttt 9636318  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  9636319 cactc-accaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 304
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835226
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 22835108  T
Q  201 ttagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtg 285  Q
    ||||||| ||||| ||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22835109 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 22835208  T
Q  286 tttacaattgtttcccaac 304  Q
     |||||| |||||||||||    
T  22835209 attacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735337
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactg 40735456  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40735455 gttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 40735356  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
     | ||||||||||||||||    
T  40735355 tttccaaggtgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 761018 - 760791
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  761018 agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 760920  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  760919 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 760820  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  |||||||||||| || |||||||||||    
T  760819 catccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 760791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682303
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 29682432  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29682431 gtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcact 29682332  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682331 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29682303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810812
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca- 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 29810917  T
Q  213 -------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
                 |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29810916 gttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttt 29810818  T
Q  299 cccaac 304  Q
    ||||||    
T  29810817 cccaac 29810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51398985 - 51398768
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 51398887  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51398886 gttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcact 51398787  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  51398786 catccaaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314389
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgg 31314518  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31314517 gttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcact 31314418  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31314417 cacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 31314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 4598430 - 4598601
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  4598430 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 4598526  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4598527 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 4598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153585
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatga 39153456  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  39153457 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcatt 39153556  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39153557 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39153585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 305
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666693
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatga 9666561  T
Q  190 gttacaagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||               |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9666562 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 9666661  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 305  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9666662 tcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10211656 - 10211485
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10211656 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggt 10211560  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10211559 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10211485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 293
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921717
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaa 53921609  T
Q  201 ttagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtg 285  Q
    ||||||| ||||| ||              ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  53921610 ttagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtt 53921709  T
Q  286 tttacaat 293  Q
    ||||||||    
T  53921710 tttacaat 53921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891049
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 32891166  T
Q  201 ttagcttcaacaaactc---------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||||||||||| |||               |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32891165 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggt 32891066  T
Q  285 gtttacaattgtttccca 302  Q
    |||||||| |||||||||    
T  32891065 gtttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 4600651 - 4600859
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  4600651 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 4600747  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||  ||||||    
T  4600748 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaa-aggttac 4600846  T
Q  195 aagaaattagctt 207  Q
    |||||||||||||    
T  4600847 aagaaattagctt 4600859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10209436 - 10209265
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10209436 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggt 10209340  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10209339 cacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10209265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813017
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgg 29813136  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  29813135 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcact 29813036  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  29813035 cacccaatgtgtttacaat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10056481 - 10056309
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10056481 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10056385  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10056384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10056309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10058703 - 10058531
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10058703 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10058607  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10058606 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10058531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10060925 - 10060753
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10060925 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10060829  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10060828 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10060753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10063147 - 10062975
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10063147 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10063051  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10063050 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10062975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10065369 - 10065197
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10065369 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10065273  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10065272 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 10065197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40913467 - 40913352
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40913467 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaa 40913369  T
Q  187 tgggttacaagaaatta 203  Q
    || ||||||||||||||    
T  40913368 tgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 388
Target Start/End: Original strand, 26323060 - 26323385
Alignment:
Q  82 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagatt-gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaaga 178  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| || ||| | ||  ||| |||||| | ||||||||||||||| || || ||||    
T  26323060 caccaaaga-attgtttacccacttcggtccaacaatgacctactctagggggataaataagatatctccacttcactatcaatgagttttttaccaaga 26323158  T
Q  179 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct--------------aatttctacccttttcccaatctca-ccaacgaacaagacactcaa 263  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||              ||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||    
T  26323159 tatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttacccttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaa 26323258  T
Q  264 tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatct 361  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  26323259 tgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttcctaaggatat 26323358  T
Q  362 tctcttttggtttcacaagagtcaccc 388  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  26323359 tcttttttggtctcccaagactcaccc 26323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392133
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgg 23392004  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||              |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  23392005 gttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcact 23392104  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23392105 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23392133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 335
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340456
Alignment:
Q  161 aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct--------------aatttctaccc-ttttcccaatctcacc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||               ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  246 aacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac 335  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaac 31340456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 398
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35139026
Alignment:
Q  135 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------ta 219  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||              ||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  220 atttctacccttttcccaatctcac-caacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctagaatctaac 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||     
T  35138846 atttctacccatttctcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattgttt-ccaactttaaaatttaa- 35138943  T
Q  318 ccccaaaagagaaccaactcttagc--tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 398  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||  |||||||||||    
T  35138944 ccccaaaagagaattaacccttagcttttttatttcctaaggatcttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctca 35139026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683306
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacccc-aaaagataaccaacccttagcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaagt 1683342  T
Q  393 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1683341 tgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaa 1683306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744555
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatga 32744531  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  32744532 gttacaagaaattagcttaaacaa 32744555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 23410326 - 23410543
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  23410326 agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgg 23410424  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||| | ||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23410425 gttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcact 23410524  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | | |||||||||||||||    
T  23410525 cactcaaggtgtttacaat 23410543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10067568 - 10067435
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10067568 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 10067472  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067471 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20937826 - 20937501
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||   |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  20937826 attgtttacctagttctgtccaactatgacatactttgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaaggg 20937728  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaactct--------------aatttctacccttttcccaatctcac-caacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||              ||||||||||  ||| || |||||   | | |||||||| |||||||||||  |||||    
T  20937727 ttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataatttctacctattttccgatctctttctatgaacaagagactcaatgattg-cactc 20937629  T
Q  276 tcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtt 373  Q
      | ||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20937628 atctaagctgttttccaattatttctcaactctagaatcta-ctcccaaaagagaaccaacctttatcctttgatttcctaagaatcttctcttttggtc 20937530  T
Q  374 tcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    || ||||| |||||||||||  |||||||    
T  20937529 tcccaagaatcacccaagtttgtcacaaa 20937501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39127541 - 39127421
Alignment:
Q  253 aagacactcaatgattttcactctcccaaggt-gtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgattt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  39127541 aagacgctcaatgattttcactcttccaaggtattttccaattgtttccaaactctagaatttaa-ccacaaaagagaactaacccttagcctttgattt 39127443  T
Q  351 cctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  39127442 cctaagggtattctcttttggt 39127421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33191974 - 33191876
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33191974 tgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacata-aaat-ggttacaagaacttagcttcaacaagct 33191878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34795819 - 34795713
Alignment:
Q  296 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttg 394  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  34795819 tttcccaactttagaatttaaccac-aaaagagaaccatcccttagcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagttt 34795721  T
Q  395 ctcacaaa 402  Q
    || |||||    
T  34795720 cttacaaa 34795713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 26386618 - 26386692
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttac 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26386618 ctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352219
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaat-ggttacaagaaatta 51352219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Original strand, 2075190 - 2075281
Alignment:
Q  213 aactctaatttctaccctttt-cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||    
T  2075190 aactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-agcaaggtgtttataaatgtttcccaac 2075281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055874
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatg-ggttaca 195  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttaca 4055866  T
Q  196 agaaatta 203  Q
    ||||||||    
T  4055867 agaaatta 4055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 168
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075149
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 168  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 4075476 - 4075581
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatg-ggttaca 195  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  4075476 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttaca 4075573  T
Q  196 agaaatta 203  Q
    ||||||||    
T  4075574 agaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373282
Alignment:
Q  143 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaa 5373282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Original strand, 5433906 - 5433989
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5433906 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccac-------cggttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctt 5433989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Original strand, 25491003 - 25491092
Alignment:
Q  128 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25491003 tggaggagaga--gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctct 25491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5373263 - 5373198
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccctttt--cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5373263 ctaatttctacccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6716538 - 6716500
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716538 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 40519323 - 40519413
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 299  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  40519323 aacaaactctaatttctattgttttcctaatatctccaatgaataagacattcaatgattttcactcacaaaaaatgtttacaattgtttc 40519413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45283021 - 45282983
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283021 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 45282983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54635163 - 54635125
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635163 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1313929
Alignment:
Q  142 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctct 1313929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2020245 - 2020188
Alignment:
Q  157 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2020245 tatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaa 2020188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 801121 - 801091
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801121 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 3148037 - 3148115
Alignment:
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3148037 gatctctgcacttcacaatcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctct 3148115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3617487 - 3617449
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3617487 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 3617449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 4598655 - 4598693
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4598655 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 4600876 - 4600914
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4600876 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 4600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6718714 - 6718684
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718714 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 6718684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10056255 - 10056217
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056255 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10058477 - 10058439
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058477 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10060699 - 10060661
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060699 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10062921 - 10062883
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062921 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10065143 - 10065105
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065143 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10067365 - 10067327
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10067365 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10067327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10209211 - 10209173
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10209211 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10211431 - 10211393
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10211431 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25637464 - 25637426
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25637464 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 25637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Original strand, 51352240 - 51352298
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgat 267  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  51352240 aacaaaccctaacttctatcattttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386908
Alignment:
Q  174 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt 4386908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166581
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactct 8166581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635301
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactct 24635301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 188
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340271
Alignment:
Q  159 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 31340271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739072
Alignment:
Q  145 tctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||| ||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttac-ataaattagtttcaacaa 54739072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36796749 - 36796686
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaagg 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36796749 tgtttcccaactcttgaatctaaccctcaaaag-taatcaacccttagcctttgatttcctaagg 36796686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726752
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 45726998  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45726997 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactca-tgattttcactctcc 45726899  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45726898 caaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 45726799  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45726798 catgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttt 45726752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 428
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1632082
Alignment:
Q  96 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 195  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 1631833  T
Q  196 agaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    ||| |||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1631834 agatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctctca 1631932  T
Q  281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1631933 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcaca 1632032  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1632033 agactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 1632082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447234
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 35446983  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||              || ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35446984 caagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 35447082  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  35447083 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttta 35447182  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35447183 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 35447234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 99 - 428
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288460
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaata 42288214  T
Q  199 aattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    ||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42288215 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactcg-tgattttcactctcccaagg 42288313  T
Q  284 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaaga 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288314 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaaga 42288413  T
Q  382 gtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  42288414 ctcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 42288460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 92 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24397881
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttctacccttt--tcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||               ||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcac 24398029  T
Q  274 tctcccaa-ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24398028 tcttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaa---gaaccaacccttagctttgactttctaaggatattctcttttggt 24397932  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24397931 ttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgttt 24397881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 13655936 - 13656146
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  13655936 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattggt 13656035  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  13656036 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttaca 13656134  T
Q  196 agaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||    
T  13656135 agaaattagctt 13656146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12647293 - 12647501
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  12647293 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 12647391  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  12647392 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 12647490  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  12647491 gaaattagctt 12647501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450428
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc------------acaaatgg 17450663  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||              |||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450662 gttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 17450564  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtt 373  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17450563 cacccaaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctttgatttcctaatgatcttctcttttggtt 17450464  T
Q  374 tcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactcc 409  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17450463 tcacaagactcacccaagtttctcacaattgactcc 17450428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4484239 - 4484554
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaag-caacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  4484239 cctagatctaatctaggaaacaaa-gtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 4484335  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4484336 cccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaaga 4484435  T
Q  199 aattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaag 282  Q
    |||||||||  |||              ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  4484436 aattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaag 4484533  T
Q  283 gtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  4484534 gtgtttacaa-tgtttcccaac 4484554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334641
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaga 2334513  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||              ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2334514 gttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 2334613  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2334614 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2334641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30833605 - 30833290
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  30833605 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 30833509  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30833508 cccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaaga 30833409  T
Q  199 aattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaag 282  Q
    ||||| |||  |||              ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||     
T  30833408 aattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaa 30833311  T
Q  283 gtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  30833310 gtgtttacaa-tgtttcccaac 30833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723478
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaag 5723351  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5723352 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 5723451  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723452 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057583
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 17057464  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17057465 gttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 17057564  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17057565 cacccaaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085566
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 17085447  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17085448 gttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 17085547  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17085548 cacccaaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 36987986 - 36988299
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  |  |||||||| |||| || |||||| ||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  36987986 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 36988081  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36988082 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaa 36988181  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||| ||  |||              ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36988182 attagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggt 36988280  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  36988281 gtttacta-tgtttcccaac 36988299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45099926 - 45099699
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  45099926 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaga 45099828  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45099827 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 45099728  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45099727 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33647988
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  193 acaagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatct-caccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    ||| ||||||||||||               ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |  | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactct 33648141  T
Q  277 cccaaggtg-tttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgattt-cctaaggatcttctcttttggttt 374  Q
    |||||| || |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33648140 cccaagatgttttacggttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaagataattaaccctt-gctttgatttccctaaggatcttctcttttggttt 33648042  T
Q  375 cacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     | |||| || || |||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  33648041 tataagactcgcctaagtagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaa 33647988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318223
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 36318104  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||| ||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36318105 gttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36318204  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  36318205 cacccaaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 723741 - 723968
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg 723839  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||              |||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  723840 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 723939  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  723940 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867813
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgg 29867942  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29867941 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 29867842  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29867841 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29867813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773506
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatga 36773635  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36773634 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36773535  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36773534 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36773506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312184
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgg 38312313  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38312312 gttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 38312213  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38312212 cacacaaggtgtatacaa-tgtttcccaac 38312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32289825 - 32289621
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  || ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32289825 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttca 32289727  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  32289726 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaaga 32289627  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  32289626 aattag 32289621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4503044 - 4503356
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| ||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  4503044 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 4503138  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  4503139 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaa 4503237  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    ||||||||  |||              ||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4503238 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 4503336  T
Q  284 tgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  4503337 tgtttacaa-tgtttcccaac 4503356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 294
Target Start/End: Original strand, 6595002 - 6595221
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  6595002 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagg 6595101  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6595102 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcac 6595201  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaatt 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  6595202 tct-ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6266951 - 6266749
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||  || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6266951 cctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa-gagattgttca 6266854  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  6266853 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 6266755  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  6266754 aattag 6266749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34139995
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatg 34139865  T
Q  189 ggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||              ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34139866 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 34139965  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34139966 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 34139995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151815
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgg 11151686  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||              || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11151687 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcact 11151786  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11151787 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362296
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 42362401  T
Q  214 act--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
     ||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42362400 gctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttt 42362302  T
Q  299 cccaac 304  Q
    ||||||    
T  42362301 cccaac 42362296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162676
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgg 33162545  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  33162546 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaat 33162645  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33162646 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14634050
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 188  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatg 14633920  T
Q  189 ggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14633921 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 14634020  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14634021 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14634050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067249
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 11067378  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11067377 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcact 11067278  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11067277 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11067249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690445
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgg 11690574  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||              ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11690573 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 11690474  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11690473 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11690445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 36205661 - 36205887
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  36205661 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaaga 36205759  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36205760 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36205859  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36205860 c-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 36205887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 306
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490368
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagtta 17490247  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc----------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||           |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||  |    
T  17490248 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaatttctaccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccacccactg 17490346  T
Q  284 tgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||    
T  17490347 tgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121712
Alignment:
Q  128 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc---------- 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||              
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  218 -----taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
         ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451167
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaatta 7451187  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7451186 caagaaattagcttcaacaa 7451167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815498
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc---------------aacaaact 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||               |||||||     
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaacc 7815410  T
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7815411 ctaatttcaacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 7815498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353229
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgtta 26353253  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26353252 caagaaattagcttcaacaaactc 26353229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11049721 - 11049493
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgggtt 192  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11049721 tgtttacccagttcagtccaat-ttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggtt 11049623  T
Q  193 acaagaaattagcttc------------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    | ||||||||||||||                  ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11049622 ataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttataccattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcact 11049523  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049522 tacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 30218068 - 30218358
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||    
T  30218068 tgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagct 30218167  T
Q  217 ct--------------aatttctacccttttcccaatctcac-caacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 301  Q
    ||              || |||||||| |||| |||||||   | | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||          ||||    
T  30218168 ctccaagaacaaacctaacttctacccatttctcaatctccttccatgaacaagacactcaatgatttccactctgtcaaggtgtt----------tccc 30218257  T
Q  302 aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 400  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30218258 aactctagagcctaacccccaaaagagaaccaatatttagcttttgatttcctaaggatc-ccccttttggtttcgcaagactcactcaagttgctcaca 30218356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284930
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39284916 - 39284829
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39284916 ctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39284829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885605
Alignment:
Q  160 caatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcac 244  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||| | |||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  245 caacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  105 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 203  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Original strand, 42019896 - 42019992
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  42019896 acctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaa 42019992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202631
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc-------------- 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||| ||||| |||                  
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-------gatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaca 14202542  T
Q  218 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaag--acactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14202543 taatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14202631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24198065 - 24197946
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  24198065 ttgtttacccagttcggcccaaacgtgacctacgtctggagaagata--gatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaa--ggg 24197970  T
Q  191 ttacaagaaattag-cttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  24197969 ttacaagaaattagccttcaacaa 24197946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Original strand, 12123718 - 12123809
Alignment:
Q  213 aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  12123718 aactctaatttatactcattttccaatctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43731093 - 43730992
Alignment:
Q  300 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 398  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  43731093 ccaactctagaatttaacccc-aaaaga-aaccaacctttagactttgatttcctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctca 43730996  T
Q  399 caaa 402  Q
    ||||    
T  43730995 caaa 43730992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261610
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctct 42261610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Original strand, 5700273 - 5700347
Alignment:
Q  230 ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5700273 ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaac 5700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412117
Alignment:
Q  117 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811346
Alignment:
Q  154 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctct 34811346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 398
Target Start/End: Original strand, 42261826 - 42261930
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  | |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||| || |||||||    
T  42261826 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagt 42261924  T
Q  393 tgctca 398  Q
    ||||||    
T  42261925 tgctca 42261930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7451118
Alignment:
Q  388 caagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaa 7451118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6266729 - 6266691
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266729 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 213
Target Start/End: Original strand, 7597036 - 7597130
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||    
T  7597036 tgacctactctgaaggagaga--gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaa 7597130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561137
Alignment:
Q  170 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaacaa 4561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41454366 - 41454278
Alignment:
Q  129 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  41454366 ggaggagaga--gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctct 41454278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3897111 - 3897041
Alignment:
Q  142 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 211  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  3897111 atctctctaatccactttcaatgagttctttacaaaattatacaaaagagttacaaaaaattagcttcaac 3897041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 12647517 - 12647555
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12647517 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 12647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 13656162 - 13656200
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13656162 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  93 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16676196 - 16676152
Alignment:
Q  277 cccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccc 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16676196 cccaaggtgttttccaattgtttccaaactctagaatctaacccc 16676152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 334
Target Start/End: Original strand, 42261694 - 42261734
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  42261694 tgtttcccaactctagagtctaacccctaaaagggaaccaa 42261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283342
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4283593  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4283592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 4283494  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4283493 taaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 4283394  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  4283393 caagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaa 4283342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435341
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 42435090  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42435091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 42435189  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42435190 caaagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 42435289  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  42435290 caagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaa 42435341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221563
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgg 40221818  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40221817 gttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactca-tgattttcact 40221719  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40221718 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggt 40221619  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  40221618 tttacaagactcacctaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 40221563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383804
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagtta 11384054  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||              |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11384053 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcat-aatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 11383956  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11383955 caaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 11383856  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  11383855 caagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaa 11383804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 120 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328602
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc- 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||     
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctca 40328823  T
Q  218 -------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
                 |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40328822 caaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaa 40328724  T
Q  304 ctctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40328723 ctctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcatagcctttgatttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaa 40328624  T
Q  402 atgactccccactcatgtgttt 423  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  40328623 aagactctacactcatgtgttt 40328602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353610
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa--------------actc 217  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||              || |    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 44353824  T
Q  218 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353823 taatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa 44353724  T
Q  317 cccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccact 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  44353723 cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccact 44353624  T
Q  415 catgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||||    
T  44353623 catgtgttttccaa 44353610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655246
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 18655469  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18655468 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcc 18655370  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18655369 caaggtgtttacaattgtttcctaagtctagaatctaa-ccccaaaagagtatcaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttca 18655271  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaa 401  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18655270 caagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3439763 - 3439558
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3439763 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcat 3439665  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  3439664 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 3439566  T
Q  200 attagctt 207  Q
    ||||||||    
T  3439565 attagctt 3439558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42498452 - 42498149
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||| | |||| || |||||| ||||||||  |||| | |||||||  |||||||||  |||||||    
T  42498452 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 42498357  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42498356 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaa 42498257  T
Q  200 attagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    |||||||||||||              ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42498256 attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 42498158  T
Q  284 tgtttacaa 292  Q
    |||||||||    
T  42498157 tgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212730
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 15212859  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15212858 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcact 15212759  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15212758 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15212730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 34254327 - 34254543
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34254327 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagg 34254426  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||| |||  |||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34254427 gttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 34254526  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaat 293  Q
      ||||||||||||||||    
T  34254527 -accaaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25690215 - 25690009
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690215 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-cactcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttca 25690117  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  25690116 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 25690018  T
Q  199 aattagctt 207  Q
    |||||||||    
T  25690017 aattagctt 25690009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811232
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgg 27811351  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27811350 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 27811251  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | |||||||||||||||||    
T  27811250 cacccaaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352094
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 33352223  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  33352222 gttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaat 33352123  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33352122 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036367
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 43036496  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
     |||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43036495 attacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 43036396  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43036395 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17982825 - 17982597
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17982825 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 17982726  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||| |||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17982725 gttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 17982626  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17982625 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 17982597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4731829 - 4731602
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731829 agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 4731731  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4731730 gttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 4731631  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4731630 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 34256503 - 34256719
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34256503 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 34256602  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||| |||  |||              ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34256603 gttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacac 34256702  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaat 293  Q
      ||||||||||||||||    
T  34256703 -accaaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31218429 - 31218201
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31218429 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagg 31218330  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31218329 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 31218230  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31218229 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141764
Alignment:
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaa 18141883  T
Q  200 attagcttcaacaaact-------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtg 285  Q
    |||||||||||||| ||             ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18141882 attagcttcaacaagctcacaaagaacaacctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtg 18141783  T
Q  286 tttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18141782 tttacaaatgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15290785 - 15290614
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||    
T  15290785 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggaca 15290687  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15290686 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 15290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15471154 - 15470983
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||    
T  15471154 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggaca 15471056  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15471055 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 15470983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2627995 - 2627811
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  || ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  2627995 cctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattattcac 2627898  T
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2627897 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaa 2627811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 305
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930424
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaa 10930291  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaac--------------aaactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||               ||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  10930292 tgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttc 10930390  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 305  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10930391 actctcccaaaatgtttacaattgtttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689213
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 5689344  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||              |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5689343 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcact 5689244  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5689243 cacccaaggtgtttacaa-tgtttccaaactc 5689213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321022
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgg 40321153  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  40321152 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagt 40321053  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40321052 cactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303894
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 3303765  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  3303766 gttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcact 3303865  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3303866 cactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3303894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44304027 - 44303798
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44304027 agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagg 44303928  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc---ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttca 272  Q
     |||||||||||||||||  |||              |||  ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44303927 attacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 44303828  T
Q  273 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44303827 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44303798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 302
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965914
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggtta 8965790  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
     ||||||||| |||||||||||||               ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8965791 taagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8965890  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttccca 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  8965891 caaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746442
Alignment:
Q  91 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggg 1746314  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1746315 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 1746414  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1746415 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 1746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 19945355 - 19945574
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg- 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  19945355 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagt 19945454  T
Q  189 ggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttca 272  Q
    |||||||||||||||||||  |||              |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19945455 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 19945554  T
Q  273 ctctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  19945555 ctc-accaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Original strand, 1345368 - 1345597
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1345368 agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgg 1345466  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||              ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  1345467 gttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcact 1345566  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1345567 cacccaaggtgtttacaa-tatttcccaactc 1345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598916
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgg 6599045  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  6599044 gttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcact 6598945  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6598944 cactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6598916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674369
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgg 6674498  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  6674497 gttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcact 6674398  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6674397 cactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6674369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 42575232 - 42575402
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac-aatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  42575232 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaaccaaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtc 42575328  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575329 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 42575402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 304
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292687
Alignment:
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 1292568  T
Q  200 attagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    |||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1292569 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggt 1292668  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||| || | |||||||||||    
T  1292669 gttcac-agtgtttcccaac 1292687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702862
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagg 12702729  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc------ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12702730 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattt 12702829  T
Q  270 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12702830 tcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12702862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143286
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca- 212  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 30143389  T
Q  213 -------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
                 ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  30143388 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgttt 30143292  T
Q  299 cccaac 304  Q
    ||||||    
T  30143291 cccaac 30143286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291549
Alignment:
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 30291669  T
Q  201 ttagcttcaacaaact---------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    ||||||||||||| ||               ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30291668 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggt 30291569  T
Q  285 gtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30291568 gtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153705
Alignment:
Q  105 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttag 8153816  T
Q  205 cttcaac---------aaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaaca--agacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||         |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  8153815 cttcaacaaagctcagaaaccctaatttctaccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgtatacaaa 8153716  T
Q  294 tgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||    
T  8153715 tgtttcccaac 8153705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 19491693 - 19491922
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19491693 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 19491791  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||              ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19491792 tgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttc 19491890  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19491891 actcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 19491922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162546
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4162566  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4162565 caagaaattagcttcaacaa 4162546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765693
Alignment:
Q  91 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg 9765817  T
Q  191 ttacaagaaattagctt---caa---ca--------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    |||||||||||||||||   |||   ||        ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  9765816 ttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa----tttcactc 9765721  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9765720 acccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9765693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 304
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106302
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaaga 18106182  T
Q  199 aattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaagg 283  Q
    ||||||||||||||              |||| || |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18106183 aattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaagg 18106282  T
Q  284 tgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  18106283 tgtttacaa-tgtttcccaac 18106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366837
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaatag 41366709  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||               |||||||||||| ||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  41366710 gttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcact 41366809  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41366810 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743427
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaatgg 4743299  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaac--------------tctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||               |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4743300 gttacaagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgct 4743398  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743399 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015130
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaaga 10015145  T
Q  199 aattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||||    
T  10015144 aattagcttcaacaa 10015130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772247
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaa 3772254  T
Q  201 ttagctt 207  Q
    |||||||    
T  3772253 ttagctt 3772247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733784
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 184  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597658
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  200 attagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  7597676 attagcttcaacaagctct 7597658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgtta 3073972  T
Q  194 caagaaatt 202  Q
    |||||||||    
T  3073973 caagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712125
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  11712124 ct 11712125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40585669 - 40585569
Alignment:
Q  302 aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 400  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||    
T  40585669 aactttagaatcta-cccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcaca 40585571  T
Q  401 aa 402  Q
    ||    
T  40585570 aa 40585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902292
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 212  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaaca 32902292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 402
Target Start/End: Original strand, 33655474 - 33655628
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||| |||| | ||||    
T  33655474 gaacaagacactcaatgattt-cactcatccaagatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaacccttaacctttg 33655572  T
Q  347 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  33655573 attttctaaggatcttctcttttgttctcctaagattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1822423 - 1822341
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1822423 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 1822341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1856868 - 1856786
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1856868 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 1856786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  143 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga-----------gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  229 c-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 41364984 - 41365071
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41364984 ctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796441
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || ||||||   ||    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatgt 29796419  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  29796420 tacaagaaatcagcttcaacaa 29796441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10240113 - 10240004
Alignment:
Q  290 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||    ||||| ||| |||    
T  10240113 caattgtttcccaaatctagaatctaacccc--aaagagaaccaactcttagc-ctgattttttaaggatcttcttttttagtagtccaagattcatcca 10240017  T
Q  390 agttgctcacaaa 402  Q
    |||| ||||||||    
T  10240016 agttactcacaaa 10240004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4162508 - 4162454
Alignment:
Q  239 tctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4162508 tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaat 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10020398 - 10020292
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| ||||    
T  10020398 tgtttcccaactctagaatccaaccca-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttcctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaagt 10020301  T
Q  393 tgctcacaa 401  Q
    || ||||||    
T  10020300 tgttcacaa 10020292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909412
Alignment:
Q  142 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagtttaaacaagctct 30909412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 408
Target Start/End: Original strand, 9633816 - 9633867
Alignment:
Q  357 gatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactc 408  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9633816 gatcttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactc 9633867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 402
Target Start/End: Original strand, 10101351 - 10101475
Alignment:
Q  278 ccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttc 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |   |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||    
T  10101351 ccaaggtgtttacaaattatttcctaacactagaatctaaccccaaaacgt--accaacccttagactttgatttaataaggatctcctcttttgatctc 10101448  T
Q  376 acaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10101449 ctaagattcatccaagttgctcacaaa 10101475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137074
Alignment:
Q  145 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaa 11137074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38864000 - 38863949
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 171  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38864000 acctactatgcaggggagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3439542 - 3439504
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439542 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 3439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3772209 - 3772164
Alignment:
Q  230 ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3772209 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactc 3772164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240203
Alignment:
Q  153 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaa 10240203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 217
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41364970
Alignment:
Q  173 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc 217  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactc 41364970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2627765 - 2627735
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627765 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15290560 - 15290522
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15290560 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15470929 - 15470891
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15470929 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25689993 - 25689955
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25689993 aacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 233
Target Start/End: Original strand, 38860413 - 38860505
Alignment:
Q  144 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag-cttcaac---aaactctaatttctaccctttt 233  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  38860413 ctctccaatccactatcaaatagtttcttacaaagagatacaa--tagttataagaaattagccttcaacaataaaccctaatttctaccctttt 38860505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3231915
Alignment:
Q  158 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaa 3231915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 110)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 54883194 - 54882838
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883194 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 54883096  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54883095 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttc 54882997  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54882996 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctctttt 54882897  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  54882896 ggtttcacgagactcacccaagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaa 54882838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50674196
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 50673946  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc-------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccc 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||             |||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  50673947 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagacaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactca-tgattttcactctccc 50674045  T
Q  280 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcac 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50674046 aaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 50674145  T
Q  378 aagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50674146 aagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 50674196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 94 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379202
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggtta 379449  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatga-ttttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  379448 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctc 379349  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  379348 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttgatttca 379249  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  379248 caagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttt 379202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662260
Alignment:
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 35662502  T
Q  202 tagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt-cactctcccaaggtg 285  Q
    ||||||||||||||||              |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  35662501 tagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactca-tgatttttcacactctcaaggtg 35662403  T
Q  286 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtca 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35662402 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactca 35662303  T
Q  386 cccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  35662302 cccaagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaa 35662260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073210
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||| |||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactca-tgattttcacactcc 12073362  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12073361 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 12073262  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  12073261 taagactcacccaagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaa 12073210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 97 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964233
Alignment:
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttaca 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttaca 41964482  T
Q  196 agaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    | |||||||||| ||||| |||              |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  41964481 ataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttccca 41964382  T
Q  281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcaca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41964381 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa-ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcaca 41964283  T
Q  379 agagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  41964282 agactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaa 41964233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 114 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665225
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 8665457  T
Q  214 actct--------------aatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 298  Q
     ||||              ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8665456 gctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgttt 8665357  T
Q  299 cccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactc-ttagctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgct 396  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8665356 cccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaacacataacctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgct 8665257  T
Q  397 cacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  8665256 cacaaaagactctccactcctgtgtttcccaa 8665225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 87 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2209889 - 2209578
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209889 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 2209790  T
Q  187 -tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  2209789 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactca-tgatttt 2209691  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2209690 cactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 2209591  T
Q  369 tggtttcacaaga 381  Q
    |||||||||||||    
T  2209590 tggtttcacaaga 2209578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703327
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggtt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||              |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 46703470  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46703469 ccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaacttttagcctttgatttcctaaggattttctcttttggtttca 46703370  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgt 419  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  46703369 caagactcacccaagttgctgacaaaagactctccattcatgt 46703327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Original strand, 50262694 - 50263048
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262694 aagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 50262793  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||              ||||||| | || ||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||    
T  50262794 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatctcaataa---acaagacactca-tgattttc 50262889  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  50262890 actctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaagggtcttctctttt 50262989  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50262990 ggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 50263048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655774
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 6656025  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||              |||||||||||| ||||  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6656024 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactca-tgattttcactctcc 6655926  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttga-tttcctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6655925 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttca 6655826  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6655825 caagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 6655774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8647956
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 8648208  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
     |||||||||||||||||||||||              ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  8648207 taagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttc 8648108  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8648107 caaggtgtttacagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaacacataacatttgatttcactaaggatcttctcttttgatttca 8648008  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  8648007 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaa 8647956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 87 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119362
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 185  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119714 aagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaa 12119616  T
Q  186 atgggttacaagaaattagcttcaa---------------caaactctaatttctacccttttc-ccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattt 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||               |||||  |||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  12119615 aagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattt 12119516  T
Q  270 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctctttt 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12119515 tcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttaacttcgatttcttaaggatcttctctttt 12119416  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 423  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12119415 ggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgttt 12119362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632353
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 40632514  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40632513 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 40632415  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40632414 caaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40632353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 90 - 390
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417273
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 27417060  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27417061 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 27417159  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggt 372  Q
    |||||    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27417160 ctccc----tgtttacaattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttcttttttggt 27417255  T
Q  373 ttcacaagagtcacccaa 390  Q
    || |||||| ||||||||    
T  27417256 tttacaagactcacccaa 27417273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 171 - 428
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085715
Alignment:
Q  171 tacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaaga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttccaatctcaccaatgaacaaga 55085541  T
Q  257 cactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-cta 354  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
T  55085542 cagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttgatttcacta 55085641  T
Q  355 aggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  55085642 aggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 55085715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 56178633 - 56178860
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56178633 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 56178732  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56178733 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 56178832  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56178833 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 56178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639345
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggtta 41639495  T
Q  194 caagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |              ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41639494 caagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-gtgattttcactctcc 41639396  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639395 taaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989678
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaact 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaact 33989890  T
Q  217 ct--aatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatct 314  Q
    ||  ||   | | |||  |     |||  |||  |||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33989889 ctctaagaacaaacctagtt----tcttcccat-gaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttcccaactctagaatct 33989795  T
Q  315 aacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccac 413  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33989794 aacctccaaaagagaacaaatccttagcctttgattacctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccac 33989695  T
Q  414 tcatgtgttttccaatc 430  Q
    |||||||||| ||||||    
T  33989694 tcatgtgtttcccaatc 33989678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8393656 - 8393448
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  8393656 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttc 8393558  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  8393557 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 8393459  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  8393458 gaaattagctt 8393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8395865 - 8395657
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  8395865 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttc 8395767  T
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  8395766 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 8395668  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  8395667 gaaattagctt 8395657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48143215 - 48142986
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  48143215 agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagg 48143116  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48143115 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 48143016  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48143015 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48142986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095586
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggt 52095459  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    ||||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  52095460 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 52095559  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52095560 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52095586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175860
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 26175731  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||              ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26175732 gttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 26175831  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26175832 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26175860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429623
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgg 5429752  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5429751 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5429652  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5429651 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5429623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463615
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgg 36463484  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||              |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36463485 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcact 36463584  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463585 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994478
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggt 36994595  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  36994594 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 36994495  T
Q  277 cccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||    
T  36994494 cccaaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 293
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000019
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagtt 29999905  T
Q  193 acaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||  |||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  29999906 acaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc-ac 30000004  T
Q  279 caaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||    
T  30000005 caaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 9927455 - 9927681
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927455 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 9927553  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9927554 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcact 9927653  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9927654 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9927681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893856
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatga 48893733  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca------------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgatttt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||                  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893734 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 48893833  T
Q  271 cactctcccaaggtgtttacaat 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  48893834 cactcacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474096
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 31474220  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact---------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31474219 caagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31474120  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttccca 302  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  31474119 ccaaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 34570411 - 34570638
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34570411 agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgg 34570509  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34570510 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 34570609  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  34570610 cacccaagatgttttcaa-tgtttcccaac 34570638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038633
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaat-g 47038505  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
     ||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47038506 attacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 47038605  T
Q  276 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||    
T  47038606 acccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 47038633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Original strand, 54199906 - 54200130
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54199906 attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 54200003  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54200004 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 54200103  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54200104 cccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 54200130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739774
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgg 12739645  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12739646 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccact 12739745  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12739746 cacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12739774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467579
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgg 52467449  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||              ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  52467450 gttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 52467549  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52467550 cacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740570
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 37740696  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||              ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  37740695 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc- 37740597  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37740596 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37740570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871764
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgg 5871893  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaact--------------ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||              ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5871892 gttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5871793  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5871792 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5871764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254438
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29254665 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgg 29254567  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||| |||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  29254566 gttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcatt 29254467  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29254466 cacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 29254438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370196
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagg 5370178  T
Q  190 gttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5370179 gttacaagaaattagctt 5370196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 291 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26364083
Alignment:
Q  291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 26364123  T
Q  389 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26364122 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 26364083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 31495274 - 31495428
Alignment:
Q  51 gatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctcca 150  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31495274 gataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctcca 31495372  T
Q  151 atccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattag 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31495373 atcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 31495428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009655
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgt 13009539  T
Q  190 gttacaagaaa--ttagcttcaacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgt 286  Q
     ||||||||||  | |     ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13009540 tttacaagaaagctcacgaagaacaaac-ctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 13009638  T
Q  287 ttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13009639 ttacaa-tgtttcccaac 13009655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542405
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaa 6542278  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact---------------ctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||               ||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  6542279 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactca 6542378  T
Q  277 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6542379 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6542405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913408
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgg 3913521  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaaa--------------ctctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||              ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3913520 gttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 3913421  T
Q  275 ctcccaaggtgtt 287  Q
    | |||||||||||    
T  3913420 cacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744038
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 12744020  T
Q  190 gttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12744021 gttacaagaaattagctt 12744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745427
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 12745409  T
Q  190 gttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12745410 gttacaagaaattagctt 12745427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587902
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 4588028  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaact---------------ctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||                |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4588027 caagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcac 4587928  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4587927 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4587902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7125163 - 7124992
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  7125163 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattgttca 7125065  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7125064 cccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 7124992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969055
Alignment:
Q  136 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaat 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||              || ||||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  222 ttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 13992289 - 13992402
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  13992289 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaaga 13992387  T
Q  190 gttacaagaaattag 204  Q
    |||||||||||||||    
T  13992388 gttacaagaaattag 13992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26364410 - 26364285
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26364410 aagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaa 26364312  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  26364311 tgagttacaagaaattagcttcaacaa 26364285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745659
Alignment:
Q  134 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactcta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||              ||| |||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaacccta 12745575  T
Q  220 atttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12745576 atttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229947
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-gggtt 192  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactc---------------taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctc 277  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||               ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcac 37229920  T
Q  278 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37229921 ccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147510
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatga 46147486  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  46147487 gttacaagaaattagcttcaacaa 46147510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5136327 - 5136155
Alignment:
Q  2 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac--aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  5136327 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 5136231  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5136230 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 5136155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5138552 - 5138380
Alignment:
Q  2 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaac--aatcacaagata--caaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  5138552 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgg 5138456  T
Q  97 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5138455 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 5138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 419
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699786
Alignment:
Q  99 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaag 197  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  198 aaattagcttc---------------aacaaactctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctccca 280  Q
    |||||||||||               ||||||| ||||| | |||||||  |||  |||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattttcactcaccca 26699646  T
Q  281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaa-ctcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaa 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| | ||| |||| |||||||| ||||   ||    
T  26699647 aagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttgattacataaagatcatctcttttagttttctaa 26699746  T
Q  380 gagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgt 419  Q
    || ||| |  ||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  26699747 gactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgt 26699786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7122944 - 7122773
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  7122944 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaaca-caaagaaattgttca 7122846  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7122845 cccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 7122773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747980
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca--------------aactc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||              ||| |    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 12747893  T
Q  218 taatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12747894 taatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12747980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687407
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatga 45687277  T
Q  190 gttacaagaaattagctt---------------caacaaactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    |||| |||||||||||||                ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||||    
T  45687278 gttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcac 45687377  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45687378 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082881
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgg 52082752  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||              || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  52082753 gttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcact 52082852  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52082853 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52082881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 303
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208066
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||     
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttg 5207941  T
Q  194 caagaaattagcttc---------------aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    ||| |||||||||||               ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  5207942 caataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacc 5208041  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  5208042 caaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089721
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc- 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||     
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctct 33089922  T
Q  218 -------------taatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 303  Q
                 |||||||||  | | || |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||    
T  33089921 ccaagaacaaacataatttctattcatctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaagg----------tgtttcccaa 33089832  T
Q  304 ctctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  33089831 ctctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcctttgattttctaaggatcttctcttttg-----------gtctcccaagttgctcacaaa 33089743  T
Q  403 tgactccccactcatgtgtttt 424  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  33089742 tgactctccactcatgtgtttt 33089721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21688397 - 21688186
Alignment:
Q  114 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21688397 aacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaa 21688298  T
Q  214 actc--------------taatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 297  Q
     |||              ||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21688297 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacactca-tgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtt 21688199  T
Q  298 tcccaactctaga 310  Q
    |||||||||||||    
T  21688198 tcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744160
Alignment:
Q  134 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 12744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 22882759 - 22883077
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22882759 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22882856  T
Q  200 attagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    |||||||||||||||||              ||||||| || || |||  |||||||   | | ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |     
T  22882857 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagc 22882956  T
Q  285 gtttac-aattgtttcccaactctagaatctaa-cccccaaaagagaaccaactctta-gctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaaga 381  Q
    |||  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  22882957 gttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcctaaga 22883056  T
Q  382 gtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
     || ||||| |||||||||||    
T  22883057 ctcgcccaaattgctcacaaa 22883077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 402
Target Start/End: Original strand, 22934423 - 22934741
Alignment:
Q  101 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22934423 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22934520  T
Q  200 attagcttcaacaaact--------------ctaatttctacccttttcccaatctc-accaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggt 284  Q
    |||||||||||||||||              ||||||| || || |||  |||||||   | | ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |     
T  22934521 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagc 22934620  T
Q  285 gtttac-aattgtttcccaactctagaatctaa-cccccaaaagagaaccaactctta-gctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaaga 381  Q
    |||  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  22934621 gttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcctaaga 22934720  T
Q  382 gtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
     || ||||| |||||||||||    
T  22934721 ctcgcccaaattgctcacaaa 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337018
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggtta 51337133  T
Q  194 caagaaattagcttca------acaaa--------ctctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
     || |||||| ||| |      |||||        |  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  51337132 taataaattatcttaaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacc 51337033  T
Q  279 caaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||    
T  51337032 caaggtgtttacaat 51337018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 290 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961264
Alignment:
Q  290 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttcctaaggatattcttttttggtctcccaagactcaccc 41961269  T
Q  389 aagtt 393  Q
    |||||    
T  41961268 aagtt 41961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 351 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40630879 - 40630802
Alignment:
Q  351 cctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  40630879 cctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaa 40630802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 302 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785934
Alignment:
Q  302 aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| |||||||||    
T  3786034 aactctagaatcta-cccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttcctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcaca 3785936  T
Q  401 aa 402  Q
    ||    
T  3785935 aa 3785934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29056396 - 29056301
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29056396 aacaaactctaattcctaccattttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091324
Alignment:
Q  158 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct--------------aatttctacccttttcccaatct- 241  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||              |||||||| | ||||||||||||     
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctagcattttcccaatctt 32091484  T
Q  242 caccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta 340  Q
    | || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||     
T  32091483 ctcccatgaacaagagactcaatgattt-cgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatcttaccccaaaaa-agaaccaacacttt 32091386  T
Q  341 gc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | | |||||||||| ||||||    
T  32091385 gcctttgatttcctaaggatcttctcctctggtctcccaaaacttacccaagttgttcacaa 32091324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34112539 - 34112430
Alignment:
Q  320 ccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatg 418  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34112539 ccaaaagagaaccaaactttagcctttgatttcctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacagatgactctccactcatg 34112440  T
Q  419 tgttttccaa 428  Q
    ||||||||||    
T  34112439 tgttttccaa 34112430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 402
Target Start/End: Original strand, 35369578 - 35369763
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcac-caacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctagaatct 314  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||     
T  35369578 ctaatttctactcatttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactct-acaaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatcc 35369676  T
Q  315 aacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 402  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| | ||   ||| |||||||||||||| |||||    
T  35369677 aa-ccccaaaagagaaccaacccttagcctttga-ttcccaaagatcttctattttgctatccatagactcacccaagttgcttacaaa 35369763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639207
Alignment:
Q  174 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagaca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              || ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  259 ctcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41639251 ctcg-tgattttcactctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677513
Alignment:
Q  135 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctct 6677513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34112986 - 34112861
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| ||| | ||||||||||   ||||||||| | | |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  34112986 attgtttaccaaattcggtccaacaatgacctactataggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaaggg 34112889  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34112888 ttacatgaaattagcttcaacaagctct 34112861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 48142508 - 48142605
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  48142508 aacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Original strand, 21703836 - 21703955
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |    
T  21703836 tgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaaaagggt 21703934  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21703935 acaagaaatcatcttcaacaa 21703955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 218
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44967953
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggtt 192  Q
    |||| |||||| |||||||||   |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaat-ggtt 44967927  T
Q  193 acaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  44967928 acaagaaattggcttcagcaagctct 44967953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Original strand, 5370238 - 5370308
Alignment:
Q  230 ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 302  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  5370238 tttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttccca 5370308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 37754986 - 37755081
Alignment:
Q  120 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaa 214  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37754986 acctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaagaaattatcttcaccaaa 37755081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 402
Target Start/End: Original strand, 35370553 - 35370661
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||    
T  35370553 tgtttcccaattctataatctaactcc-aaaagagaaccaaccattagcctttgatttcccaaagatcttctattttggtatccatagactcacccaagt 35370651  T
Q  393 tgctcacaaa 402  Q
    |||| |||||    
T  35370652 tgcttacaaa 35370661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 48142413 - 48142497
Alignment:
Q  132 ggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48142413 ggagagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaa 48142497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570490
Alignment:
Q  156 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctct 44570490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 428
Target Start/End: Original strand, 46569821 - 46569896
Alignment:
Q  353 taaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  46569821 taaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaa 46569896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8393432 - 8393394
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393432 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 8393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8395641 - 8395603
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395641 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 8395603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422723
Alignment:
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 210  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaa 16422723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52065592 - 52065530
Alignment:
Q  252 caagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatct 314  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  52065592 caagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaagaatct 52065530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345266
Alignment:
Q  140 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaa 53345266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 13992429 - 13992509
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccctttt--cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13992429 ctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26364267 - 26364223
Alignment:
Q  217 ctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacact 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26364267 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788899
Alignment:
Q  170 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctct 34788899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 38811189 - 38811313
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt-tcttacaaagagatacaaatggg 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||  |||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||| |||||||  ||    
T  38811189 attgtttacccagttcggtccaacaatgacctactcttggggagaga--gatctctccgcttcactatcaatgagtcatttacaaaga-atacaaaatgg 38811285  T
Q  191 ttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    | || ||||||||  |||||||||||||    
T  38811286 tcactagaaattaaattcaacaaactct 38811313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5349904 - 5349853
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  5349904 gaacaagacactcaaagattttcaatcatccaaggtgtttacaaatgtttcc 5349853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29056518 - 29056416
Alignment:
Q  102 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  29056518 cagttcggtcaaaa-tggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaa 29056420  T
Q  201 ttag 204  Q
    ||||    
T  29056419 ttag 29056416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 40975057 - 40975128
Alignment:
Q  142 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||    
T  40975057 atctctctaatctactatcaaagagtcattacaaagagatacaatagagttaccagaaattaacttcaacaa 40975128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5136101 - 5136063
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5136101 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5138326 - 5138288
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5138326 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7122720 - 7122682
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7122720 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 7122682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7124939 - 7124901
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7124939 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 7124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 247
Target Start/End: Original strand, 31495455 - 31495485
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495455 ctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3677460 - 3677403
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3677460 gaactagagactcaatgattttctctcatacaaggtgtttataattgtttcccaactc 3677403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5350052 - 5349959
Alignment:
Q  118 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||    
T  5350052 tgacctactctgg-ggagaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaa 5349959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 332
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723474
Alignment:
Q  291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc 332  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc 25723474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Original strand, 44570541 - 44570630
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactcta-ga-atctaacccccaaaagagaaccaac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||||| ||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||    
T  44570541 gaacaagacactcaatgattttcactcttctaatgtgtttcccaattatttccaaactctacgatatctaacccttaaaagagaaacaac 44570630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53345246 - 53345189
Alignment:
Q  218 taatttctacccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  53345246 taatttctatcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactc 53345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7146
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 7396  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7395 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 7297  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7296 caaggtgtttacaattgtttcc-agctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttca 7198  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7197 caagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaa 7146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11732 - 11376
Alignment:
Q  87 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11732 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 11633  T
Q  187 tgggttacaagaaattagcttcaacaa--------------actctaatttctaccctttt-cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttc 271  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||              || |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11632 tgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 11533  T
Q  272 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctctttt 369  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11532 actcacc-aaggtgtttacaat-gtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctctttt 11435  T
Q  370 ggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11434 ggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaa 11376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 425
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18348
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  194 caagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcc 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactca-tgattttcactctcc 18201  T
Q  279 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttca 376  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18202 caaagtgtttacaattgtttcc-aactctataatctaacccc-aaaagagaaccaactcttagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttta 18299  T
Q  377 caagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttc 425  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18300 caagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgttttc 18348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 149 - 428
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80633
Alignment:
Q  149 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactc--------------taatttctaccc-tttt 233  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||              |||||||||||| ||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  234 cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacca 333  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaacca 80536  T
Q  334 actcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 428  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  80537 acccttagcctttgatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaa 80633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 3633 - 3804
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  3633 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggtca 3731  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3732 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 3804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 3857 - 3895
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3857 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 11070 - 11385
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  11070 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 11166  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11167 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaaga 11266  T
Q  199 aattagcttcaaca--------------aactctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaag 282  Q
    |||||| ||  |||              ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  11267 aattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaag 11364  T
Q  283 gtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  11365 gtgtttacaa-tgtttcccaac 11385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8644 - 8846
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  8644 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttca 8740  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8741 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaaga 8840  T
Q  199 aattag 204  Q
    ||||||    
T  8841 aattag 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 304
Target Start/End: Original strand, 8873 - 8959
Alignment:
Q  217 ctaatttctacccttttc--ccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8873 ctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactc-accaaggtctttacaa-tgtttcccaac 8959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 2511 - 2719
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  2511 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaaaagattgttca 2609  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  2610 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttacaa 2708  T
Q  197 gaaattagctt 207  Q
    |||||||||||    
T  2709 gaaattagctt 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Original strand, 2735 - 2773
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2735 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 434703 - 434504
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggt 434604  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccctttt--cccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactc 275  Q
    ||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  434603 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490445
Alignment:
Q  133 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctct 490445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 398
Target Start/End: Original strand, 490661 - 490765
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  | |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||| || |||||||    
T  490661 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagt 490759  T
Q  393 tgctca 398  Q
    ||||||    
T  490760 tgctca 490765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 334
Target Start/End: Original strand, 490529 - 490569
Alignment:
Q  294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  490529 tgtttcccaactctagagtctaacccctaaaagggaaccaa 490569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114547
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagc 114675  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||              |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  114674 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 114575  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  114574 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 861
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagg 989  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcac 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||              ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  988 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcac 890  T
Q  274 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  889 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149311
Alignment:
Q  90 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgg 149192  T
Q  190 gttacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcact 274  Q
    || ||||||||||||||||||||              ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  149193 gtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 149292  T
Q  275 ctcccaaggtgtttacaat 293  Q
      |||||||||||||||||    
T  149293 accccaaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6536 - 6326
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagata---caaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  6536 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacac-aaagagattggt 6438  T
Q  98 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttac 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || || ||||    
T  6437 cacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagggcttac 6339  T
Q  195 aagaaattagctt 207  Q
    |||||||||||||    
T  6338 aagaaattagctt 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6310 - 6272
Alignment:
Q  209 aacaaactctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6310 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgacacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  126 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggtca 28  T
Q  100 cccagttcggtccaaacttgacctact 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27 cccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Original strand, 20414 - 20629
Alignment:
Q  92 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt 191  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggt 20512  T
Q  192 tacaagaaattagcttcaaca--------------aactctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaacgaacaagacactcaatgattttcactct 276  Q
    |||||||||||||||||||||              ||  ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||     
T  20513 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactca 20612  T
Q  277 cccaaggtgtttacaat 293  Q
    |||||||||||||||||    
T  20613 cccaaggtgtttacaat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10546
Alignment:
Q  94 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 193  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggtta 10558  T
Q  194 caagaaattagc 205  Q
    ||| ||||||||    
T  10557 caataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27567
Alignment:
Q  105 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 203  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 27552  T
Q  204 gcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  27553 gcttcaacaagctct 27567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 27614 - 27670
Alignment:
Q  249 gaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 306  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27614 gaacaagagactcaaagattt-cactcatccaaggtgtttacaaatgtttcccaactc 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 401
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1729
Alignment:
Q  274 tctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctt----------agc-tttgatttcctaaggatct 361  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||          ||| |||||||||||||||||||    
T  1591 tctcccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaa-ccccaaaagagaaccaacacttataagttataagcttttgatttcctaaggatct 1689  T
Q  362 tctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 401  Q
    ||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||    
T  1690 tctcttttgatctcccaagactcgcccaagttgctcacaa 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25097
Alignment:
Q  141 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaactct 218  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactct 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25041 - 24981
Alignment:
Q  258 actcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccc 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  25041 actcaatgattt-cactctcccaaggtgtttacaattgtttccaaacccaagaatctcaccc 24981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19163
Alignment:
Q  257 cactcaatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19117 cactcaatgattttcactcacccaa-gtgtttacaaatgtttcccaac 19163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 496 times since January 2019
Visitors: 6130