View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0831_low_84 (Length: 243)

Name: NF0831_low_84
Description: NF0831
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0831_low_84
NF0831_low_84
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (46-214)||(18093903-18094071)
chr2 (46-214)||(10049174-10049342)
chr2 (46-214)||(28608156-28608324)
chr2 (46-214)||(1994115-1994283)
chr2 (46-214)||(6343903-6344071)
chr2 (46-214)||(14324387-14324555)
chr2 (46-214)||(3709843-3710011)
chr2 (46-214)||(11867405-11867573)
chr2 (46-214)||(19168807-19168975)
chr2 (46-214)||(26820552-26820720)
chr2 (46-214)||(28501214-28501382)
chr2 (46-214)||(35358798-35358966)
chr2 (46-214)||(4291827-4291994)
chr2 (46-214)||(21096633-21096801)
chr2 (46-214)||(26826460-26826628)
chr2 (46-214)||(30568045-30568213)
chr2 (55-214)||(9544814-9544972)
chr2 (46-214)||(4810481-4810649)
chr2 (58-214)||(16882865-16883021)
chr2 (58-214)||(17040555-17040711)
chr2 (46-214)||(9917883-9918051)
chr2 (46-215)||(45206146-45206315)
chr2 (46-214)||(42884325-42884492)
chr2 (49-214)||(33664957-33665122)
chr2 (46-214)||(14752103-14752270)
chr2 (46-214)||(36634267-36634434)
chr2 (46-163)||(33906255-33906372)
chr2 (131-215)||(7360963-7361047)
chr2 (159-214)||(33905229-33905284)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (40-214)||(16904191-16904365)
chr4 (46-214)||(40621062-40621230)
chr4 (46-214)||(17738958-17739125)
chr4 (46-214)||(35713317-35713484)
chr4 (46-214)||(52799961-52800127)
chr4 (46-214)||(741483-741651)
chr4 (46-214)||(15519764-15519932)
chr4 (46-214)||(15656016-15656184)
chr4 (46-210)||(35496719-35496883)
chr4 (46-214)||(39715702-39715870)
chr4 (47-214)||(575210-575377)
chr4 (46-214)||(10260512-10260680)
chr4 (46-214)||(13626968-13627136)
chr4 (46-214)||(21563775-21563943)
chr4 (46-214)||(24078582-24078750)
chr4 (46-214)||(26925454-26925622)
chr4 (46-214)||(43331296-43331464)
chr4 (46-214)||(51451362-51451530)
chr4 (46-214)||(53341325-53341493)
chr4 (46-214)||(55999904-56000072)
chr4 (46-214)||(5274950-5275118)
chr4 (46-214)||(23477820-23477988)
chr4 (46-214)||(28972009-28972177)
chr4 (46-214)||(14830715-14830883)
chr4 (46-214)||(19832591-19832759)
chr4 (46-214)||(28136260-28136428)
chr4 (46-207)||(7645316-7645477)
chr4 (46-214)||(33504192-33504360)
chr4 (46-214)||(34057769-34057937)
chr4 (46-214)||(19589763-19589931)
chr4 (46-214)||(36856046-36856214)
chr4 (46-214)||(47721269-47721437)
chr4 (46-202)||(1943427-1943583)
chr4 (46-209)||(39746050-39746213)
chr4 (46-127)||(54332846-54332927)
chr4 (131-215)||(16892064-16892148)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (46-214)||(51966908-51967076)
chr1 (46-214)||(4891035-4891202)
chr1 (46-214)||(29187285-29187452)
chr1 (46-214)||(33360637-33360804)
chr1 (46-214)||(50559956-50560124)
chr1 (46-214)||(18110623-18110791)
chr1 (46-214)||(18813124-18813292)
chr1 (46-214)||(29841863-29842030)
chr1 (46-214)||(31618595-31618763)
chr1 (46-214)||(42681297-42681464)
chr1 (46-214)||(43255730-43255898)
chr1 (46-214)||(50396144-50396312)
chr1 (46-214)||(10695367-10695534)
chr1 (46-214)||(34686493-34686661)
chr1 (46-214)||(38846400-38846568)
chr1 (46-210)||(13663592-13663756)
chr1 (46-205)||(28566894-28567053)
chr1 (46-214)||(34691031-34691199)
chr1 (46-214)||(41964106-41964274)
chr1 (46-214)||(52308741-52308908)
chr1 (46-214)||(52522745-52522913)
chr1 (46-215)||(48339298-48339467)
chr1 (46-210)||(41831231-41831395)
chr1 (46-214)||(15314159-15314326)
chr1 (61-210)||(18095722-18095870)
chr1 (104-214)||(49225183-49225293)
chr1 (40-83)||(21736710-21736753)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (44-214)||(44384116-44384286)
chr8 (46-214)||(12759146-12759314)
chr8 (46-214)||(14080008-14080176)
chr8 (46-214)||(23967566-23967734)
chr8 (46-214)||(37028610-37028778)
chr8 (46-214)||(41155283-41155451)
chr8 (46-214)||(42061840-42062008)
chr8 (46-214)||(6301652-6301820)
chr8 (46-214)||(20664106-20664274)
chr8 (46-214)||(30549472-30549640)
chr8 (46-214)||(44939215-44939383)
chr8 (46-214)||(44598417-44598586)
chr8 (46-214)||(22357623-22357791)
chr8 (46-214)||(30825097-30825265)
chr8 (46-214)||(36603246-36603414)
chr8 (46-202)||(41627556-41627712)
chr8 (46-210)||(42812128-42812292)
chr8 (46-214)||(44214222-44214390)
chr8 (46-202)||(45295230-45295386)
chr8 (46-214)||(41906500-41906668)
chr8 (46-214)||(41976110-41976277)
chr8 (64-214)||(19396543-19396692)
chr8 (46-214)||(33425434-33425601)
chr8 (57-214)||(27629323-27629480)
chr8 (46-214)||(39203283-39203451)
chr8 (46-159)||(19246809-19246922)
chr8 (46-159)||(19319993-19320106)
chr8 (46-154)||(6478669-6478776)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (46-214)||(17169961-17170128)
chr7 (46-214)||(33639881-33640047)
chr7 (46-214)||(47574515-47574683)
chr7 (49-214)||(27736245-27736410)
chr7 (46-214)||(3794409-3794576)
chr7 (46-214)||(6912537-6912705)
chr7 (46-214)||(14307832-14308000)
chr7 (46-214)||(33231140-33231308)
chr7 (46-214)||(39650132-39650301)
chr7 (46-214)||(5961600-5961768)
chr7 (46-214)||(19034840-19035008)
chr7 (46-214)||(20719628-20719796)
chr7 (46-214)||(20764298-20764466)
chr7 (46-214)||(34283283-34283451)
chr7 (46-214)||(42686470-42686638)
chr7 (46-214)||(31898971-31899141)
chr7 (46-212)||(8927085-8927251)
chr7 (57-214)||(42916751-42916908)
chr7 (46-214)||(47164750-47164919)
chr7 (46-214)||(29489876-29490044)
chr7 (46-214)||(11499533-11499701)
chr7 (46-214)||(19518926-19519094)
chr7 (46-214)||(19519500-19519668)
chr7 (46-214)||(19520074-19520242)
chr7 (46-214)||(23767631-23767798)
chr7 (62-214)||(47173391-47173543)
chr7 (46-214)||(9227415-9227583)
chr7 (46-202)||(48528945-48529100)
chr7 (44-177)||(17476838-17476972)
chr7 (44-177)||(17576242-17576376)
chr7 (44-177)||(17512481-17512614)
chr7 (44-177)||(17540600-17540733)
chr7 (44-177)||(17481284-17481418)
chr7 (44-177)||(17571796-17571930)
chr7 (46-181)||(4485842-4485977)
chr7 (134-214)||(9148293-9148373)
chr7 (46-118)||(9148358-9148430)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (46-214)||(1074461-1074629)
chr6 (46-214)||(1219459-1219626)
chr6 (46-214)||(7221625-7221793)
chr6 (46-214)||(18600184-18600352)
chr6 (46-214)||(24444862-24445029)
chr6 (46-214)||(9980246-9980412)
chr6 (46-214)||(13457910-13458078)
chr6 (46-215)||(12580976-12581145)
chr6 (46-214)||(248809-248977)
chr6 (46-214)||(22375044-22375212)
chr6 (46-214)||(14889136-14889304)
chr6 (46-214)||(34319972-34320140)
chr6 (46-214)||(34854837-34855005)
chr6 (46-214)||(17938403-17938572)
chr6 (58-214)||(25532150-25532306)
chr6 (46-214)||(33977851-33978019)
chr6 (44-214)||(11936982-11937152)
chr6 (50-215)||(7219995-7220160)
chr6 (49-210)||(15274488-15274649)
chr6 (46-214)||(3089230-3089396)
chr6 (46-194)||(2520065-2520213)
chr6 (46-205)||(1080788-1080946)
chr6 (46-171)||(4423308-4423433)
chr6 (131-215)||(11517657-11517741)
chr6 (131-215)||(11269609-11269693)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (46-214)||(55295969-55296137)
chr3 (46-212)||(22476607-22476772)
chr3 (46-214)||(5253432-5253600)
chr3 (46-214)||(11952467-11952635)
chr3 (46-214)||(17910941-17911109)
chr3 (46-214)||(35089025-35089193)
chr3 (46-214)||(52841712-52841880)
chr3 (46-214)||(917596-917764)
chr3 (46-214)||(2845937-2846105)
chr3 (46-214)||(39797520-39797688)
chr3 (46-214)||(44073900-44074068)
chr3 (46-214)||(8241603-8241771)
chr3 (46-210)||(16494782-16494946)
chr3 (46-214)||(51247268-51247436)
chr3 (46-214)||(6105304-6105472)
chr3 (46-214)||(11326832-11327000)
chr3 (46-214)||(31370207-31370375)
chr3 (46-206)||(36168642-36168802)
chr3 (46-214)||(40828117-40828285)
chr3 (46-210)||(52854631-52854795)
chr3 (46-214)||(54648700-54648868)
chr3 (46-210)||(54794144-54794308)
chr3 (46-214)||(35435873-35436041)
chr3 (46-204)||(16340578-16340736)
chr3 (46-215)||(23192428-23192597)
chr3 (46-210)||(49111974-49112140)
chr3 (46-214)||(12169124-12169292)
chr3 (46-214)||(48975580-48975748)
chr3 (46-214)||(21700748-21700916)
chr3 (44-177)||(50740297-50740431)
chr3 (44-177)||(50772423-50772557)
chr3 (56-117)||(28165286-28165347)
chr3 (179-214)||(18742111-18742146)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (46-214)||(19565-19731)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (46-214)||(34716523-34716689)
chr5 (46-214)||(25697705-25697872)
chr5 (46-214)||(31296720-31296888)
chr5 (46-214)||(34375589-34375757)
chr5 (57-214)||(27064765-27064922)
chr5 (46-214)||(3151792-3151960)
chr5 (46-214)||(12589467-12589634)
chr5 (46-214)||(19394352-19394520)
chr5 (46-214)||(30141438-30141607)
chr5 (46-214)||(41690210-41690376)
chr5 (46-214)||(3211385-3211553)
chr5 (46-214)||(7284540-7284708)
chr5 (46-214)||(30688179-30688347)
chr5 (46-214)||(33612327-33612495)
chr5 (46-214)||(35541048-35541216)
chr5 (46-214)||(3027322-3027491)
chr5 (46-214)||(3398521-3398688)
chr5 (46-214)||(37463263-37463431)
chr5 (49-214)||(4881148-4881313)
chr5 (46-214)||(20997127-20997294)
chr5 (46-214)||(26322262-26322429)
chr5 (46-213)||(1853106-1853273)
chr5 (46-214)||(289471-289639)
chr5 (46-214)||(19447007-19447162)
chr5 (44-175)||(20348847-20348973)
chr5 (46-143)||(2194100-2194197)
chr5 (139-214)||(2193650-2193725)
chr5 (46-100)||(21029083-21029137)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (46-214)||(8826-8994)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (46-209)||(13661-13824)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (46-214)||(12705-12871)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (49-214)||(14039-14204)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (46-214)||(27549-27717)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (46-210)||(153357-153521)
scaffold0006 (46-202)||(65817-65973)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (44-181)||(231552-231689)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (46-214)||(48965-49133)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (78-214)||(5475-5611)
scaffold0032 (78-214)||(11924-12060)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (46-214)||(118939-119107)
scaffold0010 (123-195)||(118592-118664)
[»] scaffold1884 (1 HSPs)
scaffold1884 (78-214)||(727-863)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (102-214)||(16576-16688)
[»] scaffold2007 (1 HSPs)
scaffold2007 (46-98)||(152-204)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 18093903 - 18094071
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093903 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 18094002  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18094003 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 18094071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 10049174 - 10049342
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049174 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 10049273  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10049274 taatacaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatataggttgatgagcagcctcgaac 10049342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28608324 - 28608156
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28608324 aagtgttaaggtcacgaaaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtcaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 28608225  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28608224 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagtagcctcgaac 28608156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 1994115 - 1994283
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  1994115 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 1994214  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994215 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 1994283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 6343903 - 6344071
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6343903 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 6344002  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344003 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 6344071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 14324387 - 14324555
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  14324387 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 14324486  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324487 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 14324555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3710011 - 3709843
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3710011 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 3709912  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3709911 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3709843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 11867405 - 11867573
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11867405 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 11867504  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11867505 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 11867573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 19168807 - 19168975
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19168807 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactttattgtgaaatca 19168906  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19168907 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19168975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26820720 - 26820552
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26820720 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 26820621  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26820620 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgggcaacctcgaac 26820552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28501382 - 28501214
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  28501382 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 28501283  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501282 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 28501214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 35358798 - 35358966
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35358798 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 35358897  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35358898 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 35358966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 4291827 - 4291994
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4291827 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaga-aatcaaattagattgtaaaataataatttactctaacaatgtattgtgaaatca 4291925  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291926 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 4291994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21096801 - 21096633
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21096801 aagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 21096702  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21096701 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 21096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26826628 - 26826460
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26826628 aagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactataacactgtattgtgaaatca 26826529  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26826528 taatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 26826460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 30568045 - 30568213
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30568045 aagtgttaaggtcacgagaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 30568144  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30568145 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacatccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 30568213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 9544814 - 9544972
Alignment:
Q  55 cgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaa 154  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9544814 cgtcgcgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaa 9544912  T
Q  155 cttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544913 cttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 9544972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4810649 - 4810481
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4810649 aagtgttaaggtcacgataataattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaataagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 4810550  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4810549 taatgcaaacttaataagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 4810481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16883021 - 16882865
Alignment:
Q  58 cacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactt 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16883021 cacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataaggcaaactt 16882922  T
Q  158 actaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16882921 actaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 16882865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17040711 - 17040555
Alignment:
Q  58 cacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactt 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17040711 cacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataaggcaaactt 17040612  T
Q  158 actaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17040611 actaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 17040555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 9917883 - 9918051
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9917883 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactctattgtgaaatca 9917982  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9917983 taatgcaaacttactaagatttaaacttatcaacaaccggataatgtaggttaatgagcagccttgaac 9918051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Original strand, 45206146 - 45206315
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45206146 aagtgttaaggtcacgacaacagttaaataaacatggtcaaaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 45206245  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45206246 taatgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaactggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaact 45206315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42884492 - 42884325
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42884492 aagtgttacggtcacaacaacaattcaagaaacatggt-aaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtatcgtgaaatca 42884394  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42884393 taatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 42884325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 33664957 - 33665122
Alignment:
Q  49 tgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataa 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33664957 tgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaataaaatcggattgtgaaataataagttactctagcactgttttgtgaaatcataa 33665056  T
Q  149 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  33665057 tgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaatcggatgatgtaggttgatgctcaacctcgaac 33665122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14752270 - 14752103
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14752270 aagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaacaacaatcaaattagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 14752171  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14752170 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacac-cagacgatgtaggttgatgaccagcctcgaac 14752103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 36634267 - 36634434
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36634267 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaattaaatcgaaatgtgaaa-aataggttactctaacactgtattgtgaaatca 36634365  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36634366 taatgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaacaggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 36634434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33906372 - 33906255
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33906372 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 33906273  T
Q  146 taatgcaaacttactaag 163  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33906272 taatgcaaacttactaag 33906255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7361047 - 7360963
Alignment:
Q  131 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7361047 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcagcctcaaact 7360963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33905284 - 33905229
Alignment:
Q  159 ctaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33905284 ctaagtcttaaacttcttaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 33905229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16904365 - 16904191
Alignment:
Q  40 ctttaaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtg 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16904365 ctttagaagtgttaacgtcacgagaacaattcaagaaatatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtg 16904266  T
Q  140 aaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16904265 aaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 16904191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40621230 - 40621062
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621230 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 40621131  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40621130 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgaacagcctcgaac 40621062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17739125 - 17738958
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17739125 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgta-tgtgaaatca 17739027  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739026 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaactaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 17738958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 35713317 - 35713484
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713317 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagttaaaa-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 35713415  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713416 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 35713484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52800127 - 52799961
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800127 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 52800030  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800029 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 52799961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 741483 - 741651
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  741483 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 741582  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741583 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 741651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15519932 - 15519764
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  15519932 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 15519833  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519832 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 15519764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 15656016 - 15656184
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15656016 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 15656115  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15656116 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 15656184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 35496719 - 35496883
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35496719 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaccaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatca 35496818  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35496819 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcaacctc 35496883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 39715702 - 39715870
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39715702 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactttaacactgtattgtgaaatca 39715801  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715802 taatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaatcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 39715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 575210 - 575377
Alignment:
Q  47 agtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcat 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  575210 agtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcat 575309  T
Q  147 aatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  575310 aatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaactggataatgtaggttgataagcagcctcgaac 575377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 10260512 - 10260680
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10260512 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 10260611  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10260612 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 10260680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13627136 - 13626968
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13627136 aagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatca 13627037  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13627036 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 13626968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21563943 - 21563775
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563943 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 21563844  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21563843 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 21563775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 24078582 - 24078750
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24078582 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 24078681  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24078682 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 24078750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 26925454 - 26925622
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26925454 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 26925553  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26925554 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 26925622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43331464 - 43331296
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43331464 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 43331365  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43331364 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 43331296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51451530 - 51451362
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51451530 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 51451431  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51451430 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 51451362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53341493 - 53341325
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  53341493 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatca 53341394  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53341393 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttaatgagcagcctcgaac 53341325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 55999904 - 56000072
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  55999904 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaattataagttactctaacactgtactgtgaaatca 56000003  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56000004 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 56000072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 5274950 - 5275118
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5274950 aagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 5275049  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5275050 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 5275118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23477988 - 23477820
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23477988 aagtgttaaagtcatgacgacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 23477889  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23477888 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 23477820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28972177 - 28972009
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28972177 aagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactataacactgtattgtgaaatca 28972078  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28972077 taatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 28972009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 14830715 - 14830883
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14830715 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtccaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 14830814  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14830815 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 14830883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 19832591 - 19832759
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19832591 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacctggtaaaaaaacaatcaaattggattgtaaaataataagttactgtaacactgtattgtgaaatca 19832690  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19832691 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19832759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 28136260 - 28136428
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28136260 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatgttcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 28136359  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28136360 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacatccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 28136428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 7645316 - 7645477
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7645316 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaattagattgtgaaataataagttattctaacactgtattgtgaaatca 7645415  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7645416 taatgcaaacttactaagtattaaagttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagc 7645477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 33504192 - 33504360
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33504192 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctcacactgtattgtaaaatca 33504291  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33504292 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 33504360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 34057769 - 34057937
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34057769 aagtgttaaactcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 34057868  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34057869 taatgcaaacttactaattcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 34057937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19589931 - 19589763
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19589931 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatgatcaataaacaatcaaatcagattgtcaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 19589832  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19589831 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccgaatgatgtaggttgatgaacagcctcgaac 19589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36856214 - 36856046
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36856214 aagtgttaaggtcacgacaacaatgcaaaaaacatggtcaaaagataatcaaatcggattgtgaaataataagatactccaacactgtattgtgaaatca 36856115  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36856114 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 36856046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 47721269 - 47721437
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47721269 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaataaacatggtcaaacaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 47721368  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  47721369 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatttaggttgatgaccagcctcgaac 47721437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1943583 - 1943427
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1943583 aagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaaaaacaatcaaattagactgtgaaataataagttactctaacattgtattgttaaatca 1943484  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  1943483 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggttgatgtaggttgatga 1943427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 39746050 - 39746213
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39746050 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaactatcaaattggattgtgaattaataagttactctaacactgtattgtgaaatca 39746149  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcct 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  39746150 taatacaaaattactaagtcttaaacttttcaacaaccagatgatgtaggttgatgagaagcct 39746213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 127
Target Start/End: Original strand, 54332846 - 54332927
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaa 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  54332846 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtaaaataataagttactctaa 54332927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16892148 - 16892064
Alignment:
Q  131 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16892148 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagaagcctcaaact 16892064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 51966908 - 51967076
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51966908 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 51967007  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51967008 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagccttgaac 51967076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4891202 - 4891035
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891202 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 4891104  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891103 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 4891035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 29187285 - 29187452
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29187285 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 29187383  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29187384 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 29187452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33360804 - 33360637
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33360804 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 33360706  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33360705 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 33360637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50560124 - 50559956
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50560124 aagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaccaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 50560025  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50560024 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgaacagcctcgaac 50559956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18110791 - 18110623
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18110791 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 18110692  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110691 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 18110623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18813292 - 18813124
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18813292 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 18813193  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18813192 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 18813124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 29841863 - 29842030
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29841863 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaa-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 29841961  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29841962 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 29842030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31618763 - 31618595
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31618763 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 31618664  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31618663 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 31618595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42681464 - 42681297
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681464 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaaa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 42681366  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681365 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 42681297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 43255730 - 43255898
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  43255730 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 43255829  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255830 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 43255898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 50396144 - 50396312
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  50396144 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 50396243  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396244 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 50396312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 10695367 - 10695534
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10695367 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagtt-ctctaacactgtattgtgaaatca 10695465  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695466 taacgcaaacttactaagtcttaaacttcccaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 10695534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34686661 - 34686493
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34686661 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 34686562  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34686561 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 34686493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 38846400 - 38846568
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38846400 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 38846499  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38846500 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagaagcctcgaac 38846568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 13663592 - 13663756
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13663592 aagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 13663691  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13663692 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctc 13663756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Original strand, 28566894 - 28567053
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28566894 aagtgttaatgtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 28566993  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28566994 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaccaaccggatgatgtaggttgatgagca 28567053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34691199 - 34691031
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34691199 aagtgttaaagtcacgactacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatca 34691100  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34691099 taatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 34691031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 41964106 - 41964274
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41964106 aagtgttaaaatcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 41964205  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41964206 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 41964274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52308908 - 52308741
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52308908 aagtgttaaggtcacgacaaca-tacaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattggaaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 52308810  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52308809 taattcaaacttactaagtcttaaatttctcaacaatcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 52308741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 52522745 - 52522913
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  52522745 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 52522844  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  52522845 taatgcaaacttactaagtcttaaatttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 52522913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48339467 - 48339298
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48339467 aagtgttaaggtcacgacaacaatttaataaacatggtcaaaaaacaatcaaatctgattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 48339368  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48339367 taatgcaaatttactaagtcttaaacttatcaacaaccggatgttgtaggttgatgagcagcctcgaact 48339298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 41831231 - 41831395
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41831231 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 41831330  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41831331 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaaacactggatgatgtaggttgatgagcaacctc 41831395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15314326 - 15314159
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15314326 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaa-catggtaaaaaaaaaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 15314228  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15314227 taatgcaaacttattaagtcttaaacttcttaacaaccgaatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 15314159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18095870 - 18095722
Alignment:
Q  61 gacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttac 159  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18095870 gacaactattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcgaatcagattgtgaaataataagttactctaac--tgtattgtaaaatcataatgcaaacttac 18095773  T
Q  160 taagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18095772 taagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctc 18095722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49225293 - 49225183
Alignment:
Q  104 ttgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgag 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  49225293 ttgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatctgattatttaggttgatgag 49225194  T
Q  204 cagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||    
T  49225193 cagcctcgaac 49225183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21736753 - 21736710
Alignment:
Q  40 ctttaaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggt 83  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21736753 ctttagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggt 21736710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 44384116 - 44384286
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44384116 aaaagtattaaggtcacgacaacaattcaataaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaat 44384215  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384216 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 44384286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12759314 - 12759146
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12759314 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattttgaaataataatttactctaacaccgtattgtgaaatca 12759215  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12759214 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgatcagcctcgaac 12759146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 14080008 - 14080176
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14080008 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 14080107  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14080108 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 14080176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 23967566 - 23967734
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  23967566 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 23967665  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967666 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 23967734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37028778 - 37028610
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  37028778 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 37028679  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028678 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 37028610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41155451 - 41155283
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41155451 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatca 41155352  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  41155351 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggtaaatgaacagcctcgaac 41155283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 42061840 - 42062008
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  42061840 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 42061939  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061940 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 42062008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 6301652 - 6301820
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6301652 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 6301751  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301752 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 6301820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 20664106 - 20664274
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20664106 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 20664205  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20664206 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 20664274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 30549472 - 30549640
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30549472 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 30549571  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30549572 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 30549640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44939383 - 44939215
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  44939383 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 44939284  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939283 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 44939215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44598586 - 44598417
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaa-tcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44598586 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatc 44598487  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44598486 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 44598417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 22357623 - 22357791
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22357623 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgagataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 22357722  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22357723 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctaaagaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 22357791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30825265 - 30825097
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30825265 aagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcacatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 30825166  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30825165 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 30825097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 36603246 - 36603414
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36603246 aagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattatgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 36603345  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36603346 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacatccggatgatgtacgttgatgagcagcctcgaac 36603414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41627712 - 41627556
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41627712 aagtgtcaatgtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaataagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 41627613  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41627612 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatga 41627556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 42812128 - 42812292
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42812128 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcgaattgtgaaataataagttattctaacactgtattgtgaaatta 42812227  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42812228 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctc 42812292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 44214222 - 44214390
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44214222 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatcgtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacacagtattgtgaaatca 44214321  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44214322 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 44214390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 45295230 - 45295386
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45295230 aagttttaaggtcacgacaacaattcaaggaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 45295329  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45295330 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatga 45295386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41906668 - 41906500
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41906668 aagtgttaatgtcacgataacaattcaagaaacatggtaaaaaaataatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaacactttattgtgaaatca 41906569  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41906568 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatataggttgatgagcagcctcgaac 41906500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41976277 - 41976110
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41976277 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggt-aaaaaacaatcaaatgagattgtgaaataatgatttactctaacactgcattgtgaaatca 41976179  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41976178 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggaaaatgtaggttaatgagcaacctcgaac 41976110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 19396543 - 19396692
Alignment:
Q  64 aacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaag 163  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19396543 aacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactta-taag 19396641  T
Q  164 tcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19396642 tcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 33425434 - 33425601
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33425434 aagtgttaaagtcacggcaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaaaatcaaatcggattgt-aaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 33425532  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33425533 taatccaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttaatgagcaacctcgaac 33425601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27629480 - 27629323
Alignment:
Q  57 tcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaact 156  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27629480 tcacgacaactattcaagaaacatggtcaaataacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcttaatgcaaact 27629381  T
Q  157 tactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27629380 tactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 27629323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39203451 - 39203283
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39203451 aagtgttaaggtcacgacaagaattcaagaaatatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattgtgaaatca 39203352  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  39203351 taatgcaaacttactaaatcttaaacttctcaataactggataatggaggttgataagcagtctcgaac 39203283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19246922 - 19246809
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19246922 aagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 19246823  T
Q  146 taatgcaaacttac 159  Q
    ||| ||||||||||    
T  19246822 taacgcaaacttac 19246809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19320106 - 19319993
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19320106 aagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 19320007  T
Q  146 taatgcaaacttac 159  Q
    ||| ||||||||||    
T  19320006 taacgcaaacttac 19319993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Original strand, 6478669 - 6478776
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6478669 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaagcatggtcaaaa-acaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtaatatgaaatca 6478767  T
Q  146 taatgcaaa 154  Q
    |||||||||    
T  6478768 taatgcaaa 6478776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17170128 - 17169961
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170128 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 17170030  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170029 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 17169961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 33639881 - 33640047
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33639881 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatt-actctaacactgtattgtgaaatca 33639978  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639979 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 33640047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 47574515 - 47574683
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  47574515 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 47574614  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574615 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 47574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 27736245 - 27736410
Alignment:
Q  49 tgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataa 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27736245 tgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataatagtttactctaacagtgtattgtgaaatcataa 27736344  T
Q  149 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27736345 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 27736410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3794576 - 3794409
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794576 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaaa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 3794478  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794477 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3794409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 6912537 - 6912705
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6912537 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaatgataagttactctaatactatattttgaaatca 6912636  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912637 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 6912705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14308000 - 14307832
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14308000 aagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 14307901  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14307900 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 14307832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 33231140 - 33231308
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33231140 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 33231239  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33231240 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 33231308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 39650132 - 39650301
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39650132 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaattaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 39650231  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39650232 ataatgtaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaataatgtaggttgatgagtagcctcgaac 39650301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5961768 - 5961600
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5961768 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggacaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactcaaacactgtattgtgaaatca 5961669  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5961668 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgcatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 5961600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 19034840 - 19035008
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19034840 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 19034939  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19034940 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19035008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20719796 - 20719628
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20719796 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 20719697  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20719696 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 20719628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20764466 - 20764298
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20764466 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacacagtattgtgaaatca 20764367  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20764366 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 20764298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 34283283 - 34283451
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34283283 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 34283382  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34283383 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 34283451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42686638 - 42686470
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  42686638 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaataatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattttattgtgaaatca 42686539  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42686538 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 42686470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 31898971 - 31899141
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaa--tcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31898971 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaat 31899070  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899071 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 31899141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 8927085 - 8927251
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8927085 aagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 8927184  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8927185 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaacggatgatgtaggttgatgagcaacctcga 8927251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42916908 - 42916751
Alignment:
Q  57 tcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaact 156  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42916908 tcacgacaacaattcaagaaacttggtcaaaaaacaaccaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaact 42916809  T
Q  157 tactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42916808 gactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgatcagcctcgaac 42916751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 47164750 - 47164919
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaa-aacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47164750 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatc 47164849  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  47164850 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgaacaacctcgaac 47164919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29490044 - 29489876
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29490044 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 29489945  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29489944 taatacaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 29489876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11499701 - 11499533
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11499701 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaattaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtaaaatca 11499602  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11499601 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 11499533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19519094 - 19518926
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19519094 aagtgttaaggtcacgacaacaattctataaacatggtcaaaaaccaatcaaatcggattgtgaaataataacttattctaacactgtattgtgaaatca 19518995  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19518994 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgacgagcagcctcgaac 19518926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19519668 - 19519500
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19519668 aagtgttaaggtcacgacaacaattctataaacatggtcaaaaaccaatcaaatcggattgtgaaataataacttattctaacactgtattgtgaaatca 19519569  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19519568 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgacgagcagcctcgaac 19519500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19520242 - 19520074
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19520242 aagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatca 19520143  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19520142 taatggaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcggatgatgtaggttgacgaacagcctcgaac 19520074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 23767631 - 23767798
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23767631 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 23767730  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  23767731 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctc-acaaccggatgatgtaggttgatgaccaacctcgaac 23767798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47173543 - 47173391
Alignment:
Q  62 acaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttacta 161  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47173543 acaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaatttacta 47173444  T
Q  162 agtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  47173443 agtcttaaacttctcaacaaccggatggtgtaggttgatgagcagtctcgaac 47173391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 9227415 - 9227583
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9227415 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaacaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 9227514  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9227515 taatgcaaacttatcaagtcttaaacttttcaacaactggatgatctaggttgatgaccagcctcgaac 9227583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 48528945 - 48529100
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48528945 aagtgttaaggtcgcgacaacaattcaagaaatatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacaatatattgtgaaatca 48529043  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48529044 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatga 48529100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17476972 - 17476838
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17476972 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaa 17476873  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17476872 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17476838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 17576242 - 17576376
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaa-aacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17576242 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaa 17576341  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17576342 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17576376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17512614 - 17512481
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17512614 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaat 17512515  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512514 cttaatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17512481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 17540600 - 17540733
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17540600 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaat 17540699  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540700 cttaatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17540733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17481418 - 17481284
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17481418 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaa 17481319  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17481318 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17481284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 17571796 - 17571930
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaa-aacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17571796 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaa 17571895  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571896 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17571930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 181
Target Start/End: Original strand, 4485842 - 4485977
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4485842 aagtgttatggtcacgacaataattcaagaaatgtggtcaaaaaacaatcaaatcagattatgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatca 4485941  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4485942 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 4485977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9148373 - 9148293
Alignment:
Q  134 attgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148373 attgtgaaataataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 9148293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9148430 - 9148358
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148430 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataat 9148358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 1074461 - 1074629
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1074461 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 1074560  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1074561 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 1074629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1219626 - 1219459
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219626 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 1219528  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219527 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 1219459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7221793 - 7221625
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7221793 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 7221694  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7221693 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 7221625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 18600184 - 18600352
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18600184 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 18600283  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18600284 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 18600352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24445029 - 24444862
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445029 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 24444931  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24444930 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 24444862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 9980246 - 9980412
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980246 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 9980343  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980344 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 9980412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 13457910 - 13458078
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  13457910 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 13458009  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458010 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 13458078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Original strand, 12580976 - 12581145
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12580976 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 12581075  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12581076 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaact 12581145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 248977 - 248809
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  248977 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 248878  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  248877 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 248809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 22375044 - 22375212
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22375044 aagtgttagtgtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 22375143  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22375144 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgtgcagcctcgaac 22375212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 14889136 - 14889304
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14889136 aagtgttaaagtcacgaaaacagttcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 14889235  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14889236 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 14889304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34320140 - 34319972
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34320140 aagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacttggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaatagtaagttactctaacactctattgtgaaatca 34320041  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34320040 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgatcagcctcgaac 34319972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34855005 - 34854837
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34855005 aagtgttaaagtcacgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 34854906  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34854905 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatggaggttgatgagcaacctcgaac 34854837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17938572 - 17938403
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17938572 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatc 17938473  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17938472 ataatgtaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcggatgatgtaggttaatgagcagcctcgaac 17938403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25532306 - 25532150
Alignment:
Q  58 cacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactt 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25532306 cacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcattatgcaaactt 25532207  T
Q  158 actaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25532206 actaagttttaaacttctcaacaactggataatttaggttgatgagcatcctcgaac 25532150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33978019 - 33977851
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33978019 aagtgttaagttcacgaaaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 33977920  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33977919 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgaacagcctcgaac 33977851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 11936982 - 11937152
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  11936982 aaaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattatgaaat 11937081  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11937082 aataatgcaaaattactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 11937152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 7219995 - 7220160
Alignment:
Q  50 gttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataat 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219995 gttaaggtcacgacaacaattaaataaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataat 7220094  T
Q  150 gcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7220095 gcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggattatgtaggttgatgattagcctcgaact 7220160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15274649 - 15274488
Alignment:
Q  49 tgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataa 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274649 tgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaagcaatcaaatcggattgagaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataa 15274550  T
Q  149 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15274549 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacctgatgatgtaggttgatgagcagcctc 15274488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 3089230 - 3089396
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3089230 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattatgaaataataagttactctaacac--tattgtgaaatca 3089327  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3089328 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaataacctgattatttaggttgatgagcagcctcgaac 3089396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2520213 - 2520065
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2520213 aagtgttaaggtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 2520114  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2520113 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtag 2520065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Original strand, 1080788 - 1080946
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1080788 aagtgttaaagtcatgacaacaattaag-aaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggactgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatca 1080886  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1080887 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagca 1080946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4423433 - 4423308
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4423433 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcaggttgtgaaataataagttactctaacattctattgtgaaatca 4423334  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423333 taatgcaaacttactaagtcttaaac 4423308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 11517657 - 11517741
Alignment:
Q  131 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11517657 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttatcaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcagcctcaaact 11517741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11269693 - 11269609
Alignment:
Q  131 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11269693 tgtattctgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttttaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcaacctcaaact 11269609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 55295969 - 55296137
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295969 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaattcagagtgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 55296068  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55296069 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 55296137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22476772 - 22476607
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22476772 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagttaaaaa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 22476674  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22476673 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcga 22476607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 5253432 - 5253600
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  5253432 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 5253531  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253532 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 5253600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 11952467 - 11952635
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11952467 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacgtagtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaatca 11952566  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11952567 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 11952635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 17910941 - 17911109
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17910941 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 17911040  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17911041 taatgcaaacttacgaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 17911109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 35089025 - 35089193
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35089025 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatca 35089124  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35089125 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcaacctcgaac 35089193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 52841712 - 52841880
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52841712 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaagttggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 52841811  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52841812 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 52841880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 917764 - 917596
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  917764 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 917665  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  917664 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 917596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 2845937 - 2846105
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2845937 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 2846036  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2846037 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaactgaatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 2846105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 39797520 - 39797688
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  39797520 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 39797619  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797620 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 39797688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 44073900 - 44074068
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44073900 aagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 44073999  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44074000 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 44074068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8241771 - 8241603
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8241771 aagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 8241672  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  8241671 taatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtgggttgatgagcagactcgaac 8241603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16494946 - 16494782
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16494946 aagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 16494847  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16494846 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctc 16494782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51247436 - 51247268
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51247436 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcggattgtcaaataataagttactctaacactgcattgtgaaatca 51247337  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51247336 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 51247268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 6105304 - 6105472
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6105304 aagtgttaaagtcatgacaagaattcaagaaacatgttaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttgctctaacactgtattgtgaaatca 6105403  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6105404 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 6105472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 11326832 - 11327000
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11326832 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaattggattgtgaaattataagttactctaacactgtattgtgaaatca 11326931  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11326932 taatgcaaacttactaagtcttaaactttttaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 11327000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 31370207 - 31370375
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31370207 aagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaccatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 31370306  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31370307 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 31370375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Original strand, 36168642 - 36168802
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36168642 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaacaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 36168741  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcag 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36168742 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcag 36168802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 40828117 - 40828285
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40828117 aagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtaaaataataatttactctaacactgttttgtgaaatca 40828216  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40828217 taatgcaaatttatcaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcaacctcgaac 40828285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 52854631 - 52854795
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52854631 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacattgtcaaaaaacaatcaaatcaaactgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 52854730  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52854731 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctc 52854795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 54648700 - 54648868
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54648700 aagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 54648799  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54648800 taatgcaaacttactaagtctcaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 54648868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 54794144 - 54794308
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54794144 aagtgttaaggtcacgacaacaactcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 54794243  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  54794244 taatgcaaacttactaagccttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgattaacagcctc 54794308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35436041 - 35435873
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  35436041 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaacaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactccaacactgtattttgaaatta 35435942  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35435941 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgatcagcctcgaac 35435873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16340736 - 16340578
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16340736 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaaaaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 16340637  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16340636 taatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatataggttgatgagc 16340578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23192597 - 23192428
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  23192597 aagtgttaaggtcacgacaacaattaaataaacatggtctaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataggttactctaatactgtactatgaaatca 23192498  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23192497 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaact 23192428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49112140 - 49111974
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa--caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49112140 aagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaat 49112041  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49112040 cataatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctc 49111974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 12169124 - 12169292
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12169124 aagtgttaaggtcacaaaaacaattcaagaaagatggtcaaacaacaattaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatca 12169223  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12169224 taatgcaaaattactaagtattaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcatcctcgaac 12169292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48975748 - 48975580
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48975748 aagtgctaaggttacgacgacaattcaaggaacatggtcaaaaaacaatcgaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 48975649  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  48975648 taatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaaccggctgatgtaggttgatgaacagtctcgaac 48975580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 21700748 - 21700916
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21700748 aagtgttaaggttatgacaacaattcaagaaacattgtcaaaaaacaaccaaatcggattgtgaactaataagttactctaacactatattgtgaaatca 21700847  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21700848 taatgcaaatttactcagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgacgagcagccttgaac 21700916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50740431 - 50740297
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50740431 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaac 50740332  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50740331 tcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctca 50740297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 50772423 - 50772557
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaa-tcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50772423 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaac 50772522  T
Q  143 tcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50772523 tcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctca 50772557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 28165286 - 28165347
Alignment:
Q  56 gtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataa 117  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28165286 gtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataa 28165347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 214
Target Start/End: Original strand, 18742111 - 18742146
Alignment:
Q  179 caagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18742111 caagcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 18742146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 19565 - 19731
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19565 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgg--aaaaaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 19662  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34716689 - 34716523
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34716689 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 34716592  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34716591 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 34716523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 25697705 - 25697872
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25697705 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatca 25697803  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697804 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 25697872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 31296720 - 31296888
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  31296720 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 31296819  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296820 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 31296888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 34375589 - 34375757
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34375589 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 34375688  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34375689 taatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 34375757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27064922 - 27064765
Alignment:
Q  57 tcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaact 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064922 tcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataaattactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaact 27064823  T
Q  157 tactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27064822 tactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 27064765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 3151792 - 3151960
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3151792 aagtgttaaggccacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 3151891  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3151892 taatgcaaacttgctaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3151960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 12589467 - 12589634
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589467 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaaa-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 12589565  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12589566 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgcaggttgatgagcagcctcgaac 12589634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19394520 - 19394352
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  19394520 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatca 19394421  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394420 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19394352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30141607 - 30141438
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141607 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaattaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 30141508  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30141507 ataatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccgaataatgtaggttgatgagtagcctcgaac 30141438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41690376 - 41690210
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690376 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaa--atcaaattagattgtgaaataatattttactctaacactgtattgtgaaatca 41690279  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41690278 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcttcgaac 41690210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 3211385 - 3211553
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3211385 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaaaaacaatcatatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatca 3211484  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3211485 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaataactggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3211553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7284708 - 7284540
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7284708 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 7284609  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  7284608 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgataagcaacctcgaac 7284540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30688347 - 30688179
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30688347 aagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 30688248  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30688247 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 30688179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 33612327 - 33612495
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33612327 aagtgtaaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 33612426  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33612427 taatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 33612495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 35541048 - 35541216
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35541048 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 35541147  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35541148 taatgcaaacttaccaagtcttaaacttcttaacaaccggatgatgtaggttgatgagtagcctcgaac 35541216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3027491 - 3027322
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  3027491 aagtgttaatgtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacatcgtattgtgaaatc 3027392  T
Q  145 ataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3027391 ataatgcaaacttactgagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3027322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 3398521 - 3398688
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3398521 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaa-aatcaaatcggattgtgaaataataagttattctaacactgtattttgaaatca 3398619  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3398620 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 3398688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37463431 - 37463263
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37463431 aagtgttaagttcatgagaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 37463332  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37463331 taatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 37463263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4881313 - 4881148
Alignment:
Q  49 tgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataa 148  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4881313 tgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaattaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcaaaa 4881214  T
Q  149 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4881213 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggtccatgagcagcctcgaac 4881148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 20997127 - 20997294
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20997127 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaattggattgtgaaa-aataggttactctaacactgtattgtgaaatca 20997225  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20997226 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaagttgatgagcagcctcgaac 20997294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 26322262 - 26322429
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26322262 aagtgttgaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 26322361  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26322362 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctc-acaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 26322429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 1853106 - 1853273
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |    
T  1853106 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtatggtgaaaaaa 1853205  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1853206 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggtcgatgagcagcctcgaa 1853273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 289639 - 289471
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  289639 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaacaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttcctctaacactatattttgaaatca 289540  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  289539 taatgcaaacttaccaagttttaaacttctcaacaatcggatgatgtaggttgatgaccagcctcgaac 289471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19447162 - 19447007
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||               
T  19447162 aagtgttaaggtcacgacaacaattctagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcggattgtgaaataataagttattctaacactgta----------- 19447074  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19447073 --atgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaac 19447007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20348973 - 20348847
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20348973 aaaagtgttaagatcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcg-----gattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaat 20348879  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttct 175  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20348878 gataatgcaaacttactaagtcttaaacttct 20348847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2194197 - 2194100
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2194197 aagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaat 2194100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2193725 - 2193650
Alignment:
Q  139 gaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2193725 gaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 2193650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21029137 - 21029083
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21029137 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaacaatcaaatc 21029083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8994 - 8826
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8994 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 8895  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8894 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 8826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 13661 - 13824
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13661 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgttcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatca 13760  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcct 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13761 taatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcct 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12871 - 12705
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12871 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaataaacatggtaaaaaaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 12774  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12773 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 12705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 14039 - 14204
Alignment:
Q  49 tgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataa 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14039 tgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgatcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataatattttactctatcattgtattgtgaaatcataa 14138  T
Q  149 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139 tgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 14204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 27549 - 27717
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27549 aagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatca 27648  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27649 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcaacctcgaac 27717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 153357 - 153521
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  153357 aagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaaaaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 153456  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  153457 taatgcaaacttactaattcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctc 153521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 65817 - 65973
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  65817 aagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaaaaacaatcaaattagactgtgaaataataagttactctaacattgtattgttaaatca 65916  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  65917 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggttgatgtaggttgatga 65973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 231689 - 231552
Alignment:
Q  44 aaaagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  231689 aaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaat 231590  T
Q  144 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  231589 cataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 231552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49133 - 48965
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49133 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggttaaataacaatcaaatctgattgtgaaattataagttactctaacactgtattttgaaatca 49034  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  49033 taatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgtgcattctcgaac 48965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 5475 - 5611
Alignment:
Q  78 catggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5475 catggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacaccgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 5574  T
Q  178 acaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5575 acaaccagataatttaggttgatgagcagcctcgaac 5611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 11924 - 12060
Alignment:
Q  78 catggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11924 catggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaatactttattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 12023  T
Q  178 acaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12024 acaaccagataatttaggttgatgagcagcctcgaac 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 119107 - 118939
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatca 145  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  119107 aagtgttaaggtcatggcaacaattgaagaaacatggtcgaaaaacaatcaaatcagattgtaaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatca 119008  T
Q  146 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  119007 taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatcaagtaggatgatgagtagcctcgaac 118939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 118664 - 118592
Alignment:
Q  123 tctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtagg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  118664 tctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatcatgtagg 118592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 863 - 727
Alignment:
Q  78 catggttaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  863 catggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactttaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctta 764  T
Q  178 acaagcggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  763 acacccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaac 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 16576 - 16688
Alignment:
Q  102 gattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaagcggataatgtaggttgatg 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16576 gattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatg 16675  T
Q  202 agcagcctcgaac 214  Q
    || ||||||||||    
T  16676 agaagcctcgaac 16688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2007
Description:

Target: scaffold2007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 152 - 204
Alignment:
Q  46 aagtgttaacgtcacgacaacaattcaggaaacatggttaaaaaacaatcaaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  152 aagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1780 times since January 2019
Visitors: 6150