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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0836_low_144 (Length: 250)

Name: NF0836_low_144
Description: NF0836
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0836_low_144
NF0836_low_144
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (7-250)||(31051174-31051418)
chr1 (7-250)||(31057674-31057918)
chr1 (7-250)||(34739616-34739859)
chr1 (7-250)||(44409630-44409874)
chr1 (22-250)||(38152264-38152487)
chr1 (26-250)||(8093150-8093375)
chr1 (7-250)||(25387790-25388032)
chr1 (7-250)||(25381821-25382065)
chr1 (12-250)||(1077874-1078113)
chr1 (26-250)||(50305827-50306052)
chr1 (37-243)||(27954798-27955007)
chr1 (37-245)||(24927076-24927293)
chr1 (95-250)||(25275421-25275576)
chr1 (67-245)||(33458254-33458434)
chr1 (30-245)||(24964017-24964229)
chr1 (71-176)||(12183961-12184069)
chr1 (156-245)||(4280165-4280254)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (7-250)||(48166808-48167052)
chr4 (7-250)||(48160589-48160833)
chr4 (7-250)||(26957089-26957333)
chr4 (7-250)||(6257491-6257734)
chr4 (7-250)||(26971841-26972084)
chr4 (7-250)||(10733638-10733879)
chr4 (7-250)||(10947407-10947648)
chr4 (26-250)||(10739643-10739866)
chr4 (26-250)||(10953412-10953635)
chr4 (27-250)||(44831920-44832144)
chr4 (26-250)||(50168225-50168450)
chr4 (7-250)||(24287617-24287860)
chr4 (27-250)||(17627080-17627304)
chr4 (20-250)||(35177420-35177657)
chr4 (12-184)||(50155657-50155826)
chr4 (48-236)||(19686644-19686833)
chr4 (22-116)||(33458567-33458662)
chr4 (26-116)||(33461696-33461787)
chr4 (147-245)||(50426882-50426980)
chr4 (44-245)||(49976236-49976429)
chr4 (203-250)||(33461797-33461844)
chr4 (12-70)||(4632192-4632250)
chr4 (203-250)||(33458672-33458719)
chr4 (22-134)||(9237128-9237239)
chr4 (148-243)||(4632012-4632108)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (7-250)||(10760936-10761180)
chr3 (7-250)||(10769255-10769499)
chr3 (7-250)||(49151242-49151485)
chr3 (7-250)||(49157309-49157552)
chr3 (7-250)||(38449349-38449593)
chr3 (12-250)||(30051393-30051630)
chr3 (7-250)||(38455836-38456080)
chr3 (26-250)||(28964510-28964735)
chr3 (7-250)||(8331417-8331660)
chr3 (7-250)||(11840011-11840255)
chr3 (7-250)||(42191506-42191750)
chr3 (7-250)||(42197448-42197692)
chr3 (7-250)||(10238498-10238742)
chr3 (7-250)||(10244620-10244864)
chr3 (7-250)||(26429703-26429947)
chr3 (83-250)||(23138779-23138946)
chr3 (7-250)||(17056079-17056321)
chr3 (30-207)||(46656353-46656531)
chr3 (109-249)||(53071640-53071780)
chr3 (84-250)||(11846340-11846507)
chr3 (7-250)||(55003695-55003931)
chr3 (115-249)||(24643885-24644019)
chr3 (26-128)||(48128344-48128447)
chr3 (33-250)||(2982536-2982756)
chr3 (67-245)||(17601879-17602058)
chr3 (130-250)||(8474544-8474665)
chr3 (121-245)||(34300073-34300197)
chr3 (28-117)||(13367144-13367233)
chr3 (28-117)||(9760481-9760570)
chr3 (26-250)||(12108970-12109196)
chr3 (7-97)||(13444840-13444931)
chr3 (198-250)||(9586490-9586542)
chr3 (7-113)||(53069335-53069443)
chr3 (130-199)||(27103274-27103344)
chr3 (26-70)||(17593493-17593537)
chr3 (185-243)||(52222937-52222995)
chr3 (29-70)||(24643838-24643878)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (7-249)||(31002007-31002250)
chr2 (7-250)||(30964957-30965201)
chr2 (7-249)||(31007985-31008228)
chr2 (7-250)||(28683231-28683474)
chr2 (7-250)||(44717091-44717335)
chr2 (5-250)||(13149973-13150219)
chr2 (20-250)||(35439669-35439900)
chr2 (7-250)||(13455729-13455973)
chr2 (7-250)||(13461670-13461914)
chr2 (7-250)||(35084965-35085209)
chr2 (7-250)||(35090938-35091182)
chr2 (7-250)||(36750044-36750288)
chr2 (7-250)||(19879224-19879472)
chr2 (80-250)||(35442192-35442362)
chr2 (42-250)||(7771508-7771716)
chr2 (26-176)||(11048859-11049010)
chr2 (26-245)||(23343198-23343409)
chr2 (37-207)||(29832878-29833052)
chr2 (169-250)||(23283873-23283955)
chr2 (66-193)||(31651318-31651446)
chr2 (42-214)||(28765248-28765421)
chr2 (42-117)||(23284708-23284784)
chr2 (139-204)||(8342605-8342671)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (7-250)||(3811455-3811698)
chr7 (7-250)||(3817597-3817840)
chr7 (7-250)||(351417-351660)
chr7 (7-249)||(339012-339253)
chr7 (7-250)||(22742215-22742459)
chr7 (26-250)||(5849160-5849385)
chr7 (7-250)||(35148295-35148538)
chr7 (42-250)||(35152849-35153058)
chr7 (7-245)||(26383304-26383542)
chr7 (7-250)||(28421245-28421488)
chr7 (7-250)||(5979460-5979706)
chr7 (17-179)||(42767500-42767661)
chr7 (6-250)||(43539625-43539851)
chr7 (150-237)||(26380751-26380838)
chr7 (22-160)||(7608146-7608286)
chr7 (119-239)||(18666881-18667006)
chr7 (7-69)||(20238762-20238824)
chr7 (148-245)||(8824446-8824542)
chr7 (147-244)||(30219501-30219598)
chr7 (70-204)||(18656999-18657132)
chr7 (32-96)||(15843730-15843795)
chr7 (32-96)||(15860839-15860904)
chr7 (144-187)||(24689729-24689772)
chr7 (37-74)||(15843687-15843724)
chr7 (37-74)||(15860796-15860833)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (7-250)||(28525672-28525915)
chr5 (7-250)||(28531768-28532011)
chr5 (7-250)||(41296909-41297153)
chr5 (7-250)||(7389833-7390077)
chr5 (14-250)||(20499768-20500005)
chr5 (7-250)||(12686465-12686708)
chr5 (7-250)||(12692567-12692810)
chr5 (7-250)||(32094507-32094751)
chr5 (14-250)||(32097315-32097551)
chr5 (26-250)||(30384690-30384913)
chr5 (7-245)||(19060057-19060298)
chr5 (7-250)||(30771913-30772155)
chr5 (80-250)||(8706746-8706916)
chr5 (26-135)||(14609915-14610024)
chr5 (123-250)||(14609761-14609888)
chr5 (7-245)||(19066398-19066632)
chr5 (26-245)||(26509492-26509705)
chr5 (154-243)||(26318676-26318765)
chr5 (191-230)||(25408435-25408474)
chr5 (7-135)||(26318545-26318677)
chr5 (165-245)||(22647931-22648012)
chr5 (7-99)||(33753521-33753612)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (7-250)||(8651089-8651333)
chr6 (17-250)||(21197336-21197571)
chr6 (7-250)||(21770851-21771094)
chr6 (7-250)||(21191155-21191400)
chr6 (7-230)||(31756506-31756728)
chr6 (7-250)||(21783610-21783855)
chr6 (7-250)||(4580607-4580851)
chr6 (7-250)||(25353843-25354085)
chr6 (12-250)||(30905872-30906110)
chr6 (7-250)||(25343257-25343498)
chr6 (7-171)||(21789833-21789999)
chr6 (130-250)||(17581234-17581354)
chr6 (124-250)||(6096940-6097067)
chr6 (7-128)||(17581388-17581506)
chr6 (37-245)||(1105948-1106158)
chr6 (27-117)||(28728047-28728137)
chr6 (71-245)||(12801889-12802063)
chr6 (130-175)||(1283280-1283325)
chr6 (155-245)||(13007350-13007441)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (7-250)||(10705468-10705711)
chr8 (7-250)||(22220013-22220257)
chr8 (12-250)||(10699659-10699898)
chr8 (7-250)||(5542446-5542691)
chr8 (45-250)||(39735863-39736068)
chr8 (7-250)||(32896642-32896886)
chr8 (12-250)||(42033427-42033669)
chr8 (7-250)||(32890518-32890762)
chr8 (7-250)||(36818602-36818845)
chr8 (83-250)||(39727647-39727814)
chr8 (16-250)||(42993295-42993529)
chr8 (83-250)||(14417591-14417758)
chr8 (22-250)||(9934913-9935140)
chr8 (64-250)||(1883185-1883367)
chr8 (80-245)||(17954141-17954308)
chr8 (7-58)||(39727594-39727645)
chr8 (161-222)||(30890531-30890593)
chr8 (7-59)||(14417763-14417814)
chr8 (130-166)||(11641418-11641454)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (7-250)||(173176-173419)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (35-250)||(1507-1717)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (7-250)||(12025-12269)
scaffold0208 (7-250)||(6152-6396)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (37-250)||(13903-14117)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (28-245)||(5602-5821)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (7-245)||(698-936)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (83-250)||(961-1128)
scaffold0363 (7-59)||(905-956)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (14-245)||(38063-38293)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31051418 - 31051174
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31051418 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 31051319  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051318 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 31051219  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051218 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 31051174  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31057918 - 31057674
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31057918 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 31057819  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057818 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 31057719  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057718 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 31057674  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34739859 - 34739616
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34739859 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 34739761  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739760 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 34739661  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34739660 aactaaggccctcaatttataaatagctaatataattattgttac 34739616  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44409874 - 44409630
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44409874 ggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtattggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcattattccgttaatgggccat 44409775  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44409774 ccggacatccactcattgagtccatattaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaacctaatagccttattacctaatttaatcactaatc 44409675  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44409674 aattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 44409630  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 38152264 - 38152487
Alignment:
Q  22 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 121  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||    
T  38152264 ttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatggtcattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc-----at 38152358  T
Q  122 tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152359 tgagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 38152458  T
Q  222 tgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38152459 tgataaataattaatataattattgttac 38152487  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 8093150 - 8093375
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8093150 cgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattga 8093249  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||    
T  8093250 gtccatatcaactaattaaacatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgattattaatcaactaagactcacaattga 8093349  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  8093350 taaataactaatataattattgttac 8093375  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 25387790 - 25388032
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25387790 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccat 25387889  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaa 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387890 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 25387985  T
Q  204 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  25387986 tcaattaaggctcacaattgataaataaataatataattattattac 25388032  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 25381821 - 25382065
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25381821 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccat 25381920  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25381921 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 25382016  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25382017 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 25382065  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1078113 - 1077874
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccgga 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1078113 agagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccgga 1078014  T
Q  111 catccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1078013 catccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatca 1077918  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1077917 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 1077874  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50306052 - 50305827
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcat--t 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50306052 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgtt 50305953  T
Q  123 gagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50305952 gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 50305857  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50305856 ttgataaatagctaatataattattattac 50305827  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27955007 - 27954798
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatc 133  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27955007 tattggggatcataacatcttttatattggatgaccattatgatttcccattattccactaatgagccatccatacatccactcatattgagtccatatc 27954908  T
Q  134 aactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||    
T  27954907 aactaattaaatatttaattaattatcaaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagcctcacaattgataaataact 27954808  T
Q  234 aatataatta 243  Q
    ||||||||||    
T  27954807 aatataatta 27954798  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 24927076 - 24927293
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaa 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |    
T  24927076 tattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccagacatccac-cattgagtccatatcca 24927174  T
Q  136 ctacttaaatatttaattaatta--------tccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgata 226  Q
     || |||| || |||||||||||        || || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||    
T  24927175 ttaattaattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgata 24927274  T
Q  227 aatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24927275 aatagctaatataattatt 24927293  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Original strand, 25275421 - 25275576
Alignment:
Q  95 taatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattactta 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25275421 taatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattactta 25275516  T
Q  191 atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25275517 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 25275576  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 33458254 - 33458434
Alignment:
Q  67 atggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcat-tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat 164  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  | ||||| |||||  || |||||||||||| |||||||| | |    
T  33458254 atggtcattagggtttctcgttatttcattaatggatcatccggacatccactcacattagtccatatcagttaattaaatatttaagtaattatctagt 33458353  T
Q  165 tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  33458354 tagaaatctaatagcattattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataactatt 33458434  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 24964017 - 24964229
Alignment:
Q  30 tacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccc 129  Q
    |||||| | |||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |     
T  24964017 tacggtgtcttggtgatcatagcatcttttatattagatgacaattagggtttccatttttccgttaatgggtcattcagacatccacccattgagttca 24964116  T
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaa 228  Q
    |||| | || ||||    |||||||||  || || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||    
T  24964117 tatccattaattaa----ttaattaatattctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaa 24964212  T
Q  229 tagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||    
T  24964213 tagctaatataattatt 24964229  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 12183961 - 12184069
Alignment:
Q  71 ccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattag 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12183961 ccattagggtttctcattattccgttaattggccatccggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaaatag 12184060  T
Q  168 aaatctaat 176  Q
    |||||||||    
T  12184061 aaatctaat 12184069  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Original strand, 4280165 - 4280254
Alignment:
Q  156 ttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4280165 ttatcaaattagatatctaataatcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattatt 4280254  T

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Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48167052 - 48166808
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48167052 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 48166953  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166952 ccgaacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 48166853  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166852 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 48166808  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48160833 - 48160589
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48160833 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 48160734  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160733 ccgaacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 48160634  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160633 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 48160589  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 26957089 - 26957333
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26957089 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccat 26957188  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26957189 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatt 26957288  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957289 aattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 26957333  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 6257491 - 6257734
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257491 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 6257590  T
Q  107 cggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6257591 cggatatccactcattgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatca 6257690  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6257691 actaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 6257734  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 26971841 - 26972084
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26971841 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatggaccatc 26971940  T
Q  107 cggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26971941 cagacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatccttatcacttaatttgatcactaatca 26972040  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972041 attaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 26972084  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10733638 - 10733879
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10733638 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10733734  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733735 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 10733834  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10733835 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 10733879  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10947407 - 10947648
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10947407 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10947503  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947504 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 10947603  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10947604 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 10947648  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 10739643 - 10739866
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10739643 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaa 10739740  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10739741 gtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattga 10739840  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10739841 taaatagctaatataattattattac 10739866  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 10953412 - 10953635
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10953412 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaa 10953509  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10953510 gtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattga 10953609  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10953610 taaatagctaatataattattattac 10953635  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 44831920 - 44832144
Alignment:
Q  27 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcca-ttattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44831920 gtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcactcattgag 44832019  T
Q  126 tccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  44832020 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaattaaaaatcttataaccttattacttaatttgatcactaatcaactaagatctataattgat 44832119  T
Q  226 aaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  44832120 aaataactaatataattattgttac 44832144  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50168450 - 50168225
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  50168450 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccactcattga 50168351  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  50168350 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttgatttgaccactaatcaattaagactcacaattga 50168251  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50168250 taaatagctaatataattattattac 50168225  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24287860 - 24287617
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24287860 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 24287762  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24287761 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaata----tccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 24287666  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24287665 aatcaattaaggctcacaatttataaatagctaatataattattattac 24287617  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 17627080 - 17627304
Alignment:
Q  27 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcca-ttattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 125  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||  |   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  17627080 gtgtactgtgtattggggatcatggcctcttttatatttaacaaccattagggttttcaattattccgttaatgggtcatcctgacatcccctcattgag 17627179  T
Q  126 tccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||| ||| || || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| |||    
T  17627180 tccatattaattaatcaaatatttaattaattatctaattggaaatctaataggcttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgat 17627279  T
Q  226 aaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  17627280 aaatagctaatataattattattac 17627304  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35177657 - 35177420
Alignment:
Q  20 tattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccact 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  35177657 tattgttgtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcatccagacatacact 35177558  T
Q  119 c--attgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc-- 214  Q
    |  ||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  35177557 cgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattatctaattagaaaactaacagccttattacttaatttgatcactaatcaattaatgctc 35177458  T
Q  215 --ccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
       || |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35177457 gttcataattgataaatatctaatataattattattac 35177420  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50155826 - 50155657
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccgga 110  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |||||||||  ||||||||    
T  50155826 agagagagttttg-cgtgtacggtgtattggggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccgga 50155728  T
Q  111 catccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 184  Q
    |||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50155727 catccactc---gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagccttat 50155657  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 19686644 - 19686833
Alignment:
Q  48 atagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaata 146  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| | |||||| || |||||||    
T  19686644 atagtctcttttatattggatggtcagtagggtttctcattatttcgttaatgggtcatccagacatccactgcttgagttcatatcaattaattaaata 19686743  T
Q  147 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaat 236  Q
    || ||||||||||   |||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19686744 ttcaattaattattttattataaatttaacagtcttattatttaatttgatcactaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaat 19686833  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Original strand, 33458567 - 33458662
Alignment:
Q  22 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatcca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33458567 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccgttagggtttcgcattatttcgttaatgggccatccagacatcca 33458662  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 116
Target Start/End: Original strand, 33461696 - 33461787
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatcca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  33461696 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgatcatcagggtttcccattatcccgttaatgagtcatccggacatcca 33461787  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50426980 - 50426882
Alignment:
Q  147 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||  |||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50426980 tttaattaattatctcattgaaaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattatt 50426882  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49976429 - 49976236
Alignment:
Q  44 gaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactact 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||        ||||| ||||||||| |||  ||| ||| |||| | || |    
T  49976429 gaccataacctcttttatattggatggccattagggttttccattattacgt--------catccagacatccacccatattgaatccatatccattaat 49976338  T
Q  141 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 239  Q
    |||    |||||||||  || ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  49976337 taa----ttaattaatattctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattaataaatagctaatata 49976242  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461844
Alignment:
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33461797 atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 33461844  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4632250 - 4632192
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgg 70  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4632250 agagaaagtattgtcatgtactgtatattggggaccataacctcttttatattggatgg 4632192  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458719
Alignment:
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33458672 atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgttac 33458719  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9237239 - 9237128
Alignment:
Q  22 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 120  Q
    |||||||||||  | ||||||| | |||||||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9237239 ttgtcgtgtacaatgtattgggaatcatagcctctt--atagtgtgatggtcattaaggtttccattatcccgttaattggtcatccagacatccactca 9237142  T
Q  121 ttgagtccctatca 134  Q
    | |||||| |||||    
T  9237141 tagagtccatatca 9237128  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4632108 - 4632012
Alignment:
Q  148 ttaattaattatccaattagaaatctaatag-ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  4632108 ttaattaatactctaagtagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgataaataactaatataatta 4632012  T

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Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10760936 - 10761180
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10760936 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10761035  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761036 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 10761135  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761136 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 10761180  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10769255 - 10769499
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10769255 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10769354  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769355 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 10769454  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769455 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 10769499  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49151485 - 49151242
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49151485 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 49151387  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151386 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatc 49151287  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151286 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 49151242  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49157552 - 49157309
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49157552 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 49157454  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157453 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatc 49157354  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157353 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 49157309  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 38449349 - 38449593
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38449349 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 38449448  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449449 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 38449548  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449549 aactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 38449593  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 30051393 - 30051630
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggac 111  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051393 agagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggac 30051491  T
Q  112 atccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 211  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051492 atccactcgttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatctttattacttaatttgatcactaatcaactaa 30051591  T
Q  212 ggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051592 ggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 30051630  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 38455836 - 38456080
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38455836 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 38455935  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455936 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 38456035  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38456036 aactaacactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 38456080  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28964735 - 28964510
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28964735 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccactcattga 28964636  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28964635 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaataactttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattta 28964536  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28964535 taaatagctaatataattattgttac 28964510  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8331660 - 8331417
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8331660 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 8331562  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8331561 ccggacatccactcattaagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatccaattagaaatcttatatccttattacttaatttgatcactaatc 8331462  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331461 aactaaggtccacaattgataaatagctaatataattattgttac 8331417  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 11840011 - 11840255
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11840011 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 11840110  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11840111 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 11840206  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11840207 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 11840255  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 42191506 - 42191750
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42191506 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 42191605  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42191606 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 42191701  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42191702 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 42191750  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 42197448 - 42197692
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42197448 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 42197547  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42197548 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 42197643  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42197644 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 42197692  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10238498 - 10238742
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10238498 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10238597  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10238598 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacact 10238693  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10238694 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 10238742  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 10244620 - 10244864
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10244620 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 10244719  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10244720 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacact 10244815  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10244816 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 10244864  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 26429703 - 26429947
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26429703 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 26429802  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26429803 ccggacatccactcatgttgagcccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 26429898  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26429899 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 26429947  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 23138779 - 23138946
Alignment:
Q  83 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23138779 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtctt 23138878  T
Q  183 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138879 attacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 23138946  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 17056079 - 17056321
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  17056079 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagggtttcccattattccgttaataggc-at 17056176  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17056177 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 17056272  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17056273 aatcaattaaggctcacaattgataaatagataatataattattattac 17056321  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46656531 - 46656353
Alignment:
Q  30 tacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtcc 128  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |    
T  46656531 tacggtgtattgggaaccataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccactcatcgagtac 46656432  T
Q  129 ctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46656431 atatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatcaa 46656353  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071780
Alignment:
Q  109 gacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071640 gacatccactcattgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 53071739  T
Q  209 taaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 249  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53071740 taaggctcacaattgataaataactaatataattattgtta 53071780  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 250
Target Start/End: Original strand, 11846340 - 11846507
Alignment:
Q  84 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagcctt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11846340 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaattagcctt 11846439  T
Q  183 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11846440 attacttaatttgatcactaatccattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattac 11846507  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 55003695 - 55003931
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  55003695 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatgac------gtttcccattattccgttaatgggtcatc 55003787  T
Q  107 cggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55003788 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 55003883  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || || |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  55003884 ataaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattac 55003931  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Original strand, 24643885 - 24644019
Alignment:
Q  115 cactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24643885 cactcgttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagac 24643984  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattattgtta 249  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24643985 tcacaattgataaataactaatgtaattattgtta 24644019  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 48128344 - 48128447
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccatt-agggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48128344 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattga 48128443  T
Q  125 gtcc 128  Q
    ||||    
T  48128444 gtcc 48128447  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 2982536 - 2982756
Alignment:
Q  33 ggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtccct 130  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||  ||||  |||||||   |    
T  2982536 ggtatatttgggaccatgacctcttttatatttgttggtcattaggattttcattattcttttaatgggtcatcctgacatatactcgtattgagtttat 2982635  T
Q  131 atcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaat 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  2982636 atcaactaattaaatatttaattaatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgctattgataaat 2982735  T
Q  230 agctaatataattattgttac 250  Q
    || | ||||||||||| ||||    
T  2982736 agattatataattattattac 2982756  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 17601879 - 17602058
Alignment:
Q  67 atggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaa 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  17601879 atggccattagggtttgtcattattccgttaatgggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaa 17601974  T
Q  164 t-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17601975 aatagaaatctaattagccttattacttaatttgaccactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattatt 17602058  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Original strand, 8474544 - 8474665
Alignment:
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaact-aaggcccacaattgataaa 228  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  8474544 tatcaattaattaaatatttaattaattattgaattataaatctaataacattattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgattaa 8474643  T
Q  229 tagctaatataattattgttac 250  Q
     || ||||||||||||| ||||    
T  8474644 aagttaatataattattattac 8474665  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300073
Alignment:
Q  121 ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  | |||||    
T  34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatttaatagtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcacaa 34300098  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  34300097 ttgataaatagttaatataattatt 34300073  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 13367144 - 13367233
Alignment:
Q  28 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13367144 tgtacggtatattggggaccatagcctc-tttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggaccatccagacatccac 13367233  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9760570 - 9760481
Alignment:
Q  28 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  9760570 tgtacggtatattggggaccatatcctc-tttatattggatgaccattagggtttcctattattcctttaatggaccatccagacatccac 9760481  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 12108970 - 12109196
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--t 122  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||    |||| |||||||||||||| | | ||||  |||||| ||||||  |    
T  12108970 cgtgtacgatgtattgaggaccgtactctcttttatattgaatgaccattgttatttctcattattccgttaacgagtcatctagacatcaactcatatt 12109069  T
Q  123 gagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    |||||| |||||| || | |||| |||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||    
T  12109070 gagtccatatcaattaatcaaatgtttaatcaattatctaattagaaa-cttataacattatcacttaattttatcactaatcaattaaagatcacaatt 12109168  T
Q  223 gataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  12109169 gataaataactaatacaattattattac 12109196  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13444931 - 13444840
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaa 97  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13444931 ggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatttcgttaa 13444840  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 9586490 - 9586542
Alignment:
Q  198 cactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9586490 cactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 9586542  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 53069335 - 53069443
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctc--ttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggcc 103  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  53069335 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattgaggaccatagcctcttttttatattggacgatcattagggtttcccattattctgttaatgggtc 53069433  T
Q  104 atccggacat 113  Q
    ||||||||||    
T  53069434 atccggacat 53069443  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Original strand, 27103274 - 27103344
Alignment:
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatc-taatagccttattacttaatttgatca 199  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  27103274 tatcaattaattaaatatttaattaattatccaatttaaaatcttaattgtcttattactttatttgatca 27103344  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 17593493 - 17593537
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgg 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17593493 cgtgtacggtatatttgggaccagagcctcttttatattgtatgg 17593537  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 52222937 - 52222995
Alignment:
Q  185 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  52222937 tacttaattatatcactaattaattaaggccccaaattgataaatagataatataatta 52222995  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Original strand, 24643838 - 24643878
Alignment:
Q  29 gtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgg 70  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24643838 gtacggtgtattgggg-ccatagcctcttttatattggatgg 24643878  T

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Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31002250 - 31002007
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31002250 ggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcat 31002151  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002150 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 31002051  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002050 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 31002007  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30965201 - 30964957
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30965201 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcccattattccgttaatgggccat 30965102  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30965101 ccggacatccactcattgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatc 30965002  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965001 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 30964957  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31008228 - 31007985
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31008228 ggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcat 31008129  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008128 tcggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 31008029  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008028 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 31007985  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 28683231 - 28683474
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28683231 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 28683329  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683330 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 28683429  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28683430 aactaaggcccacaattgataaataactaatataattattgttac 28683474  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 44717091 - 44717335
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44717091 ggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttccattattccgttaatgggccat 44717190  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717191 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 44717290  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717291 aactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 44717335  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 13149973 - 13150219
Alignment:
Q  5 gaggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggcc 103  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13149973 gaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtc 13150072  T
Q  104 atccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13150073 atccgtacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcaataa 13150172  T
Q  204 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150173 tcaactaatgcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 13150219  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Original strand, 35439669 - 35439900
Alignment:
Q  20 tattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccact 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439669 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 35439768  T
Q  119 cattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
    |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  35439769 cattaagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcac 35439868  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35439869 aattgataaataacgaatataattattgttac 35439900  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13455973 - 13455729
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13455973 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 13455874  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13455873 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 13455778  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13455777 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 13455729  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13461914 - 13461670
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13461914 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 13461815  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13461814 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 13461719  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13461718 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 13461670  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 35084965 - 35085209
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35084965 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 35085064  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35085065 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 35085160  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35085161 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 35085209  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 35090938 - 35091182
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35090938 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 35091037  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35091038 ccggacatccactcatgttgagtctatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 35091133  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35091134 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 35091182  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36750288 - 36750044
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36750288 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 36750189  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36750188 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 36750093  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36750092 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 36750044  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19879472 - 19879224
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttat-----attggatggccattagggtttccattattccgttaatggg 101  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19879472 ggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattggcgaccataacctcttttatgttatattggatggccattaagtttcccattattccgttaatggg 19879373  T
Q  102 ccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcact 201  Q
     |||| |||||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19879372 tcatctggacattcactcattgagtcaatatcaattaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcact 19879273  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19879272 aatcaactaaggctcacaattaataaatagctaatatagttattattac 19879224  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 35442192 - 35442362
Alignment:
Q  80 tttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442192 tttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 35442291  T
Q  180 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35442292 cttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgttac 35442362  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Original strand, 7771508 - 7771716
Alignment:
Q  42 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccc-tatcaactact 140  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  7771508 gggaccataacct-ttttatattggatgacgattaggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatcgagtcccgtatcaactaat 7771606  T
Q  141 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7771607 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaatagctaatataa 7771706  T
Q  241 ttattgttac 250  Q
    ||||||||||    
T  7771707 ttattgttac 7771716  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 11048859 - 11049010
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  11048859 cgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccacccattga 11048958  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11048959 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaatcagaaatctaat 11049010  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23343409 - 23343198
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccac--tcattg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||    
T  23343409 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttccattattctgttaatgggtcatccggacatccacctatattg 23343310  T
Q  124 agtccctatcaactacttaaatatttaattaatta-tccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    ||||| |||| |            ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  23343309 agtccatatcca------------ttaattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaat 23343222  T
Q  222 tgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23343221 tgataaatagttaatataattatt 23343198  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29833052 - 29832878
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatt------gagtccc 129  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||      ||||||     
T  29833052 tattggggaccatagcat---ttatatcgaatgaccattagggtttctcattattctgttgatgggtcattctgacattcactcattcccattgagtcca 29832956  T
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 207  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29832955 tatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaagtctaatagtcttattacttaattttatcactaatcaa 29832878  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283873
Alignment:
Q  169 aatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23283955 aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattattattac 23283873  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31651446 - 31651318
Alignment:
Q  66 gatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat 164  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |      
T  31651446 gatggtcattaaggtttcccattattcttttaatggatcatctagacatcgactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatctaca 31651347  T
Q  165 tagaaatctaatagccttattacttaatt 193  Q
    || ||||||||| |  |||||||||||||    
T  31651346 taaaaatctaattgatttattacttaatt 31651318  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28765421 - 28765248
Alignment:
Q  42 gggaccatagcctcttttatattggatggccattag-ggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtccctatcaacta 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||  |||| |||||  || |||| | |||||| ||    
T  28765421 gggaccattgcctcttttatattgaatcgccattagagttttccattattccgttgatgagtcatccatacattcactcatatcgagttcatatcaatta 28765322  T
Q  139 cttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
     ||| |   ||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28765321 tttata---ttagttaattatccaaataaaaatataattagccttatcatttaatttgatcactaatcaattaaggc 28765248  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23284784 - 23284708
Alignment:
Q  42 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccac 117  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23284784 gggaccataacatcttttatatttgatggccattagagtttcacattattccgttaatgggtcatcagaacatccac 23284708  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 8342605 - 8342671
Alignment:
Q  139 cttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8342605 cttaaacatataattaattatctaattagaaatctaattaatcttattatttaatttgatcactaat 8342671  T

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Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 3811455 - 3811698
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3811455 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 3811553  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811554 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 3811653  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811654 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 3811698  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 3817597 - 3817840
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3817597 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 3817695  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3817696 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttcatcactaatc 3817795  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817796 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 3817840  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 351660 - 351417
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  351660 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccagtaatgggccat 351562  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351561 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 351462  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351461 aactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttac 351417  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 339253 - 339012
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  339253 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccattaggtttcccattattccagtaatgggccatc 339155  T
Q  107 cggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339154 cggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 339055  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 249  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339054 actaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgtta 339012  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 22742215 - 22742459
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22742215 ggagaagagagagttttgccatgtacggtatattggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 22742314  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22742315 ccggacatccactcattgagtccatatcaactacttatatatttaattaattatctaattagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaatc 22742414  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22742415 aactaaggctcacagttgataaataactaatataattattgttac 22742459  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5849385 - 5849160
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5849385 cgtgtacggtatattgaggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatggaccatccgaacatccactcattga 5849286  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5849285 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattga 5849186  T
Q  225 taaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  5849185 taaataactaatataattattgttac 5849160  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 35148295 - 35148538
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  35148295 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggatcatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccat 35148393  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148394 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatccaatagccttattacttaatttgatcactaatc 35148493  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148494 aactaaggctcataattgataaatagctaatataattattgttac 35148538  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35153058
Alignment:
Q  42 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaat 35152948  T
Q  141 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35152949 taaatatttaattaattatccaattagaaatcgaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataa 35153048  T
Q  241 ttattgttac 250  Q
    ||||||||||    
T  35153049 ttattgttac 35153058  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26383542 - 26383304
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  26383542 ggagaagagagagt-ttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccattaatgggtcat 26383444  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383443 ccggacatccactcattgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 26383344  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383343 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattatt 26383304  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 28421245 - 28421488
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28421245 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 28421343  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28421344 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 28421439  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28421440 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 28421488  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 5979460 - 5979706
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctctttta-tattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggcca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  5979460 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttcccattattctgttaattggcca 5979559  T
Q  105 tccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcac 200  Q
    |||| |||||||  ||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5979560 tccgaacatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcac 5979655  T
Q  201 taatcaactaa-ggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| ||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5979656 taatcaattaagggctctaaattgataaataactaatataattattattac 5979706  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 42767500 - 42767661
Alignment:
Q  17 gagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatcc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  42767500 gagtattgccgtgtacggtatattcgggaccatagcctcttttatat---atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatcc 42767596  T
Q  116 actcattga-gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 179  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42767597 actcattgaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagc 42767661  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43539851 - 43539625
Alignment:
Q  6 aggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggcca 104  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  43539851 aggagaagagagagt-ttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtca 43539753  T
Q  105 tccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||                 |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43539752 tccagacatccactcattgagtccatatcaattaattaaat-----------------attataaatctaa-aaccttattacttaatttgatcactaat 43539671  T
Q  205 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  43539670 caattaaggctcacaaatgataaataattaatataattatttttac 43539625  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380751
Alignment:
Q  150 aattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26380838 aattaattatccaattagaaatctaatagccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata 26380751  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7608286 - 7608146
Alignment:
Q  22 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg-tttccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 120  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7608286 ttgtcttgtccggtgtattggggaccataacatcttttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactca 7608187  T
Q  121 ttgagtccctatcaactactt-aaatatttaattaattatc 160  Q
    || |  || ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7608186 ttaaccccatatcaactaattaaaatatttaattaattatc 7608146  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 239
Target Start/End: Original strand, 18666881 - 18667006
Alignment:
Q  119 cattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaat---tatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa--ctaagg 213  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  18666881 cattgagtccatatcaactaattaaaaatttaattaataactatacaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacttatcaattataagg 18666980  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatata 239  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||    
T  18666981 ctcacggttgataaataactaatata 18667006  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20238824 - 20238762
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 69  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238824 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 20238762  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8824542 - 8824446
Alignment:
Q  148 ttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8824542 ttaattaattatctaaa-agaaatctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataattatt 8824446  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 30219501 - 30219598
Alignment:
Q  147 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattat 244  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  30219501 tttaattaactatctaattagaaatctaataactttataacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaataactactattattat 30219598  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Original strand, 18656999 - 18657132
Alignment:
Q  70 gccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattaga 168  Q
    ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| || || || ||    ||||||||||||||| || |    
T  18656999 gccattaggatttaccattattgtattaatgggtcatccagacatccactcatagagtccatattaattaatttaaa---taattaattatccaaataaa 18657095  T
Q  169 aatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18657096 aatctaattagccttattacttaatgtgatcactaat 18657132  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15843795 - 15843730
Alignment:
Q  32 cggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgtta 96  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15843795 cggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccgtta 15843730  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15860904 - 15860839
Alignment:
Q  32 cggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgtta 96  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15860904 cggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccgtta 15860839  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24689772 - 24689729
Alignment:
Q  144 atatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattac 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24689772 atatttaattaattatcaaattaaaaatctaatagccttattac 24689729  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15843724 - 15843687
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccat 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15843724 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccat 15843687  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15860833 - 15860796
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccat 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15860833 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccat 15860796  T

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Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 28525672 - 28525915
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28525672 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 28525770  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525771 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatc 28525870  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525871 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 28525915  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 28531768 - 28532011
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28531768 ggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 28531866  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531867 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatc 28531966  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531967 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 28532011  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41297153 - 41296909
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  41297153 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcat 41297054  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297053 ccggacatccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 41296954  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41296953 aactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 41296909  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 7389833 - 7390077
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7389833 ggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattccgttaatgggtcat 7389932  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389933 ccgaacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 7390032  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7390033 aactaagactcacaattgataaatagctaatataattatcgttac 7390077  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20500005 - 20499768
Alignment:
Q  14 agagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggaca 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20500005 agagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggccatccagaca 20499906  T
Q  113 tccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20499905 tccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcttactagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaag 20499806  T
Q  213 gcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20499805 actcacaattgataaatagctaatataattattattac 20499768  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 12686465 - 12686708
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12686465 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 12686563  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12686564 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 12686659  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12686660 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 12686708  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 12692567 - 12692810
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12692567 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 12692665  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692666 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 12692761  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12692762 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 12692810  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 32094507 - 32094751
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32094507 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 32094606  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32094607 ccggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 32094702  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32094703 aatcaattaaggctcacaattgataaatagttaatataattattattac 32094751  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 32097315 - 32097551
Alignment:
Q  14 agagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggaca 112  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097315 agagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggaca 32097414  T
Q  113 tccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaact 209  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  32097415 tccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcttattatttaatttgatcactaaccaatt 32097510  T
Q  210 aaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32097511 aaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 32097551  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 30384690 - 30384913
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||     
T  30384690 cgtgtacggtgtattggg-accatagtctcttttatattggatgactattagattttccattattccgttaatgagtcatccagacatccactcattgaa 30384788  T
Q  126 tccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||| |||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  30384789 tccatatctattaatgaaatatttaattaattatctaattagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcacaactgat 30384888  T
Q  226 aaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30384889 aaatagctaatataattattattac 30384913  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 19060057 - 19060298
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19060057 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggacat 19060155  T
Q  106 ccggacatccactc--attgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    || |||||||||||  ||||||||| |||| | || |||| || |||||||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19060156 ccagacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcacta 19060255  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19060256 atcaattaagtctccaaattgacaaatagctaatataattatt 19060298  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30772155 - 30771913
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||    
T  30772155 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatatattgtggaccatagtctcttctatattggatgatcatcagggtttttcattattctgttaatgggtcat 30772057  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 203  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772056 ccagacatccactcatattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaataagaaactttatagccttattacttaatttgatcactaa 30771957  T
Q  204 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||| |||||| ||||| |||||   |||||||||||||||| ||||    
T  30771956 tcaattaaggctcacaactgata---agctaatataattattattac 30771913  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 8706746 - 8706916
Alignment:
Q  80 tttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||  ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |     
T  8706746 tttccattattccgttaatgggtcatctgcatatccacttattggatccatatcaattaattaaatatttaataaattatctaattagaaatttaatcgt 8706845  T
Q  180 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8706846 cttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgataaatagctaatataattattattac 8706916  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14610024 - 14609915
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 125  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610024 cgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 14609925  T
Q  126 tccctatcaa 135  Q
    ||| ||||||    
T  14609924 tccatatcaa 14609915  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609761
Alignment:
Q  123 gagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttactagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaatt 14609789  T
Q  223 gataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14609788 gataagtaactaatataattattattac 14609761  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 19066398 - 19066632
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg-tttccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19066398 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtccggtgtattggggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgttaatgggtcat 19066496  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    || |||||||||||||  | ||| |||| |    |||| || | |||||||  || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19066497 ccagacatccactcatata-tccatatcca----ttaattaatcaattaatattctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaat 19066591  T
Q  205 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||| |||||| |   ||||| |||||  |||||||||||||    
T  19066592 caattaaggctccagattgacaaataattaatataattatt 19066632  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26509705 - 26509492
Alignment:
Q  26 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||   ||  | |||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  26509705 cgtgtacggtatatcgtggaccataacctcttatagtgtgatttgccattaaagtttctcaatattccgttgatggaccatccaaacatccactcataga 26509606  T
Q  125 gtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattg 223  Q
    || | |||||| || || ||    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||     | |||||| |  |||||    
T  26509605 gttcatatcaattattttaaa---taattaattatccaaatagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcact-----attaaggctccaaattg 26509514  T
Q  224 ataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  26509513 ataaatagttaatataattatt 26509492  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Original strand, 26318676 - 26318765
Alignment:
Q  154 aattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    ||||||| || || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26318676 aattatctaaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataatta 26318765  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Original strand, 25408435 - 25408474
Alignment:
Q  191 atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaata 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25408435 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 25408474  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 26318545 - 26318677
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg--tttccattattccgttaatgggcc 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||    
T  26318545 ggagaagagagagt-ttgtcgtttccgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggacc 26318643  T
Q  104 atccggacatccactc--attgagtccctatcaa 135  Q
    |||  ||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  26318644 atctagacattcactcaaattgagtccatatcaa 26318677  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 22647931 - 22648012
Alignment:
Q  165 tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22647931 tagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattatt 22648012  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Original strand, 33753521 - 33753612
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatg 99  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| || || ||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33753521 ggagaagagagagtatggt-gtgtacggtgtactgaggaacataggctctttta-atatgatggtcattagggtttcccattattccgttaatg 33753612  T

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Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 8651089 - 8651333
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8651089 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 8651188  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8651189 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatc 8651288  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651289 aactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttac 8651333  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 21197336 - 21197571
Alignment:
Q  17 gagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatcc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197336 gagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatcc 21197435  T
Q  116 actcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21197436 actcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcagttaaggc 21197535  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
     |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21197536 tctaaattgataaataactaatataattattattac 21197571  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 21770851 - 21771094
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  21770851 ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccgtagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatggtc-at 21770949  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21770950 ccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatc 21771049  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771050 aattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 21771094  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 21191155 - 21191400
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttc-cattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21191155 ggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcacattattccgttaatgggccat 21191254  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21191255 ccgaacatccactcattgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttgatcactaat 21191354  T
Q  205 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21191355 caattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattac 21191400  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 31756506 - 31756728
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  31756506 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc-ttaatgggtcat 31756603  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756604 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 31756703  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaata 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  31756704 aactaagacccacaattgataaata 31756728  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 21783610 - 21783855
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggac--catagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggcc 103  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21783610 ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtc 21783708  T
Q  104 atccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21783709 atccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagttttattacttaatttgatcactaa 21783808  T
Q  204 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21783809 tccactaagactcacaattgataaatagttaatataattattattac 21783855  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 4580607 - 4580851
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  4580607 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggtcat 4580706  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4580707 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 4580802  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4580803 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 4580851  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25354085 - 25353843
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25354085 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcccattattccgttaatgggccat 25353986  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25353985 ccggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaa-ataaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 25353891  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25353890 atcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 25353843  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 30905872 - 30906110
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccgga 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||  ||||| ||    
T  30905872 agagagagt-ttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattatggtttcccattattctgttaaaggatcatccaga 30905970  T
Q  111 catccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaacta 210  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  30905971 catctactcatagagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaacta 30906070  T
Q  211 aggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30906071 aggctcacaattgataaataactaatataattattattac 30906110  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25343498 - 25343257
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25343498 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatggaccat 25343400  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25343399 ccgaacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaa-ataaatctaattagccttattacttaatttaatcacta 25343305  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25343304 atcaattaaggttcacaattgataaatagctaatataattattattac 25343257  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 21789833 - 21789999
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggac--catagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggcc 103  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21789833 ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtc 21789931  T
Q  104 atccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaat 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789932 atccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaat 21789999  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17581354 - 17581234
Alignment:
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaat 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17581354 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaccataatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaat 17581255  T
Q  230 agctaatataattattgttac 250  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  17581254 agttaatataattattattac 17581234  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096940
Alignment:
Q  124 agtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaa-ttagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||    
T  6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaatagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaatt 6096968  T
Q  223 gataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  6096967 gacaaataagtaatataattattgttac 6096940  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17581506 - 17581388
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  17581506 ggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---ttggggaccatagcctcttttatattggacggttattaggtttcccattattccgttaatgggtcatc 17581410  T
Q  107 cggacatccactcattgagtcc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17581409 cggacatccactcattgagtcc 17581388  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1106158 - 1105948
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaa 135  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  1106158 tattggggaccatatcctcatttatactcaatgatcattacggttttccattatttcgttaatgagtcatccggacatccactcattgaatccatattaa 1106059  T
Q  136 ctactt-aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagcta 234  Q
     || || ||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||| | |    
T  1106058 ttaatttaaatatttaattaattatgtagttaaaaatttaatagccttatcatttaatttgaacactaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaa 1105959  T
Q  235 atataattatt 245  Q
    |||||||||||    
T  1105958 atataattatt 1105948  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28728137 - 28728047
Alignment:
Q  27 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28728137 gtgtacggtatattggggaccatagcctcatt-atataggatggccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccggacatccac 28728047  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Original strand, 12801889 - 12802063
Alignment:
Q  71 ccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattag 167  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  ||| |    ||||||| |||||||||  || || |||    
T  12801889 ccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccaaatcca----ttaaataattaattaatattctaaatag 12801984  T
Q  168 aaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12801985 aaatctaataagctttattacttaaattgatcactaatcaattaaggctccaaattgacaaatagctaatataattatt 12802063  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1283325 - 1283280
Alignment:
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa 175  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283325 tatcaattaattaaatatataattaattatccaattagaaatctaa 1283280  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13007441 - 13007350
Alignment:
Q  155 attatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||| || ||||||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13007441 attatctaactagaaatttaattagtcttattgtttaatttgatcattaatcaattagggctccaaattgataaataactaatataattatt 13007350  T

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Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10705711 - 10705468
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705711 ggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggtttccattattccgttaatgggccatc 10705612  T
Q  107 cggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10705611 cggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatca 10705512  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705511 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 10705468  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 22220013 - 22220257
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22220013 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 22220112  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22220113 ccggacatccattcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatacccttattacttaatttgatcactaatc 22220212  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22220213 aactaaggcttacgattgataaatagctaatataactattgttac 22220257  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10699898 - 10699659
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccgga 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10699898 agagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcccattactccgttaatgggtcatccgga 10699799  T
Q  111 catccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaacta 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10699798 catccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctaattacttaatttgatcactaatcaatta 10699699  T
Q  211 aggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10699698 aggctcacaattgataaataactagtataattattgttac 10699659  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 5542446 - 5542691
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5542446 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 5542545  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5542546 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaat 5542645  T
Q  205 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5542646 caattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattac 5542691  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Original strand, 39735863 - 39736068
Alignment:
Q  45 accatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  39735863 accagagcctcttttatattagatggccattagggtttcccttattccgttaatgggtcatccggacatccactgattgagtccatatcaactaattaaa 39735962  T
Q  145 tatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735963 tatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataattat 39736062  T
Q  245 tgttac 250  Q
    ||||||    
T  39736063 tgttac 39736068  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32896886 - 32896642
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32896886 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 32896787  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32896786 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 32896691  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32896690 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 32896642  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42033669 - 42033427
Alignment:
Q  12 agagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggc----catc 106  Q
    ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||    
T  42033669 agagagagt-ttgccgtgtacaatgtattggggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatc 42033571  T
Q  107 cggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033570 cggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaattagaaatctaataaccttattacttaatttgatcactaatca 42033471  T
Q  207 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033470 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 42033427  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32890762 - 32890518
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32890762 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 32890663  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32890662 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 32890567  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32890566 aatcaattaagggtcacaattgataaatagctaatataattattattac 32890518  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36818845 - 36818602
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36818845 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 36818747  T
Q  106 ccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36818746 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcact 36818651  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36818650 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 36818602  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 39727647 - 39727814
Alignment:
Q  83 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 182  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39727647 ccattgttccgttaatgggctatccggacatccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagcctt 39727746  T
Q  183 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727747 attacttaatttgatcactaatcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgttac 39727814  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Original strand, 42993295 - 42993529
Alignment:
Q  16 agagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatc 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42993295 agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcccattattccgttaatgggccatc-ggacatc 42993393  T
Q  115 cactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaacta 210  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42993394 cactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaatta 42993489  T
Q  211 aggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42993490 aggctcacaattgataaataactaatataattattattac 42993529  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14417758 - 14417591
Alignment:
Q  83 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 182  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417758 ccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 14417659  T
Q  183 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14417658 attacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattattac 14417591  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9935140 - 9934913
Alignment:
Q  22 ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactca- 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  9935140 ttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggatatccactcat 9935042  T
Q  121 -ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||| ||||||  | |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  9935041 gttgagtccatatcaataaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcactaatcaattaagactca 9934946  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9934945 caattgataaataactaatataattattattac 9934913  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 250
Target Start/End: Original strand, 1883185 - 1883367
Alignment:
Q  64 tggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatc 160  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    ||||    |||||||||  ||    
T  1883185 tggatggccattaaggtttcccattatttcgttaatgggtcatccggacatccactcatattgagtccatatcca----ttaa----ttaattaatattc 1883276  T
Q  161 caattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1883277 taaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaagtaaggctccaaattgataaatagctaatataattattattac 1883367  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17954308 - 17954141
Alignment:
Q  80 tttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatt--gagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    | |||||||||||||    
T  17954308 tttccattattccgttagtgggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaattaatta----aatagaaatctaata 17954213  T
Q  178 gccttattactt----aatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||    ||| |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17954212 ggcttattactttagtaatctgatcactaatcaattaagtctccaaattgataaatagctaatataattatt 17954141  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 39727594 - 39727645
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttt 58  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39727594 ggagaagagagagttttgttgtgtacggtatattggggaccatatcctcttt 39727645  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Original strand, 30890531 - 30890593
Alignment:
Q  161 caattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  30890531 caattagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 14417814 - 14417763
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctctttt 59  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14417814 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 14417763  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11641454 - 11641418
Alignment:
Q  130 tatcaactacttaaatatttaattaattatccaatta 166  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11641454 tatcaattaattaaatatttaattaattatccaatta 11641418  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 173176 - 173419
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  173176 ggagaagagagagt-ttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatagaacat 173274  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173275 ccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 173374  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  173375 aactaagacccacaattgataaatcgctaatataattattattac 173419  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1717
Alignment:
Q  35 tatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatc 133  Q
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T  1507 tatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggattttccattattccg------ggtcatccggacatccactcattgagtccatatc 1600  T
Q  134 aactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagct 233  Q
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T  1601 aactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagct 1700  T
Q  234 aatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  1701 aatataattattgttac 1717  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12269 - 12025
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12269 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 12170  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12169 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 12074  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12073 aatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattac 12025  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6396 - 6152
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-ccattattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6396 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccat 6297  T
Q  106 ccggacatccactca--ttgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6296 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 6201  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6200 aatcaattaaggctttaaattgataaataactaatataattattattac 6152  T

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Target: scaffold0064 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14117 - 13903
Alignment:
Q  37 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaa 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14117 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgaatccatatcaa 14018  T
Q  136 ctacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaa 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14017 ctaattaaatatttaattaattatccaattacaaatctaatagaattattacttaatttgatcactagtcaattaaggctcacgattgataaatagctaa 13918  T
Q  236 tataattattgttac 250  Q
    |||||||||| ||||    
T  13917 tataattattattac 13903  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5602
Alignment:
Q  28 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgag 125  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  5821 tgtacgatgtattgggaaccatagcctcttttatattgaatggccgttaggtttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatattgag 5722  T
Q  126 tccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5721 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatcgaattagaaatctaatagtcatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgat 5622  T
Q  226 aaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5621 aaataactaatataattatt 5602  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 698
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccat 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  936 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcat 838  T
Q  106 ccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 205  Q
    |  ||||| |||||||||||| | |||||  || ||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837 ctagacattcactcattgagtacatatcagttaattaaatatttaatcaattatctgattttaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 738  T
Q  206 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  737 aattgaggctcacaattgataaataactaatataattatt 698  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 961 - 1128
Alignment:
Q  83 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 182  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  961 ccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagcctt 1060  T
Q  183 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1061 attacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattattac 1128  T

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Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 905 - 956
Alignment:
Q  7 ggagcagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctctttt 59  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  905 ggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 956  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38293 - 38063
Alignment:
Q  14 agagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattagggtttcc-attattccgttaatgggccatccggac 111  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||  |||    
T  38293 agagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctctt--atagtgtgatgatcattagggttttctattattccgttaatcggtcatctagac 38196  T
Q  112 atcca-ctcattgagtccctatcaactacttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa--tagccttattacttaatttgatcactaatcaac 208  Q
    ||||| |  ||| ||||| |||||| || |||||    ||||||||||| | | |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  38195 atccaccatattaagtccatatcaattaattaaa----taattaattattcgaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatcactattcaat 38100  T
Q  209 taaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||     |||||||||||| |||||| |||||||    
T  38099 taaggtttcaaattgataaataactaataaaattatt 38063  T

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