View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0836_low_30 (Length: 492)

Name: NF0836_low_30
Description: NF0836
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0836_low_30
NF0836_low_30
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (121-476)||(30436335-30436690)
chr5 (123-476)||(30712659-30713012)
chr5 (121-476)||(30337754-30338112)
chr5 (121-476)||(30676517-30676875)
chr5 (123-476)||(30483920-30484276)
chr5 (126-476)||(30400593-30400946)
chr5 (123-476)||(29853830-29854186)
chr5 (121-476)||(29872693-29873051)
chr5 (130-474)||(30241619-30241966)
chr5 (121-476)||(30750162-30750523)
chr5 (121-476)||(30060888-30061249)
chr5 (126-475)||(30207042-30207394)
chr5 (127-394)||(17417828-17418095)
chr5 (134-398)||(30520867-30521131)
chr5 (134-398)||(30561207-30561471)
chr5 (239-394)||(30475979-30476134)
chr5 (239-394)||(17983502-17983657)
chr5 (239-324)||(30330526-30330611)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (121-476)||(26707851-26708209)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (123-476)||(20295813-20296169)
chr4 (136-394)||(52352563-52352821)
chr4 (251-393)||(13617200-13617342)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (126-408)||(25293181-25293457)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (126-475)||(7099941-7100293)
chr1 (126-475)||(7580953-7581305)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (7-59)||(7872494-7872546)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30436690 - 30436335
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30436690 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatttgggttaaca 30436591  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30436590 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatgttgcaacaatcatgg 30436491  T
Q  321 gaacatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttacaaagagcatacaaagtt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30436490 gaacatgggaaactcaccgtttgtctggtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttagacgttacaaagagcatacaaagtt 30436391  T
Q  421 tgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30436390 tgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30436335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 123 - 476
Target Start/End: Original strand, 30712659 - 30713012
Alignment:
Q  123 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30712659 tggaaagaaagctgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 30712758  T
Q  223 agatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatggga 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30712759 agatagatgggatcgtttaaaatctgttttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttattgtccacccgtgatgaggttgttgcaactatcatggga 30712858  T
Q  323 acatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttacaaagagcatacaaagtttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30712859 acatgggaaactcaccgtttgtctggtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttagacgttacaaagagcatacaaagtttg 30712958  T
Q  423 tggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30712959 tggaaataggaaaggagatagcaaagaaatgtaatggattgccacttgcagcaa 30713012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Original strand, 30337754 - 30338112
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30337754 aatggaaggaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 30337853  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  30337854 caagatagatggaatcgtttgaaatctgttttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatgttgcatcaatcatgg 30337953  T
Q  321 gaacatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaa 417  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   ||||| |||||||    
T  30337954 ggacatgggaaagtcaccgtttgtctggtctctctgatagtgattgttggttgttgttcaaacaacatgcatttaaacgtaacaaagaagaggatacaaa 30338053  T
Q  418 gtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30338054 gcttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30338112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Original strand, 30676517 - 30676875
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676517 aatggaaggaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaagatatttgctggttttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 30676616  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  30676617 caagatagatggaatcgtttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatgttgcatcaatcatgg 30676716  T
Q  321 gaacatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaa 417  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   ||||| |||||||    
T  30676717 ggacatgggaaagtcaccgtttgtctagtctctctgatagtgattgttggttgttgttcaaacaacatgcatttaaacgtaacaaagaagaggatacaaa 30676816  T
Q  418 gtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676817 gcttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30676875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 123 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30484276 - 30483920
Alignment:
Q  123 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30484276 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaacggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 30484177  T
Q  223 agatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatggga 322  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  30484176 agatagatggaatcgtttgaaatctgttttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatgttgcaacaatcatgggg 30484077  T
Q  323 acatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagt 419  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||     
T  30484076 acatgggaaagtcaccgtttatctggtctctcagatagtgattgttggttgttgttcaaacaacatgcatttagacgtaacaaagaagagcatacaaagc 30483977  T
Q  420 ttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30483976 ttgtggagattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30483920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 126 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30400946 - 30400593
Alignment:
Q  126 aaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30400946 aaagaaaggtgcaagaattgttgcaagggagaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 30400847  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| ||||||||||||    
T  30400846 tagatggaatcgtttgaaatctgttttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccacccgtgataaagttgttgcaacaatcatgggaaca 30400747  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagtttg 422  Q
    ||  || |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||| |   |||||| | || |  |||    
T  30400746 tgccaagctcactctttgtctggtctctctgatagtgaatgttggttgttgttcaaagaatatgcattgggacattatagagaagagcgtgcagaacttg 30400647  T
Q  423 tggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30400646 tagcaataggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30400593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 123 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29854186 - 29853830
Alignment:
Q  123 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 222  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29854186 tggaaagaagggtgcaagaattgttgcaaggtaaaatatatttgctggttttggatgatgtgtggaatcaaaatcaacaattggaatatgggttaacaca 29854087  T
Q  223 agatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatggga 322  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||    
T  29854086 agataaatggaatcatttgaagtctgtgttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgataaatttgttgcaacaatcatggga 29853987  T
Q  323 acatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagt 419  Q
    |||||  || |||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||  || ||   ||||||||||||||     
T  29853986 acatgccaagctcactctttgtatggtctctctgatagtgaatgttggttgttgttcaaagaatatgcatttggatatttcagagaagagcatacaaagc 29853887  T
Q  420 ttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29853886 ttgtggaaataggaaaggagattgtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 29853830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29873051 - 29872693
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||  |||||    
T  29873051 aatggaaagaaaggtgcaagaagtgctgcaaggtaaaaaatatttgctcgttttggatgatctgtggaacaaaacccaacaattggaatctggactaaca 29872952  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| ||| |||    
T  29872951 catgataagtggaatcatttgaagtctgtgttgtcgtgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccacccgtgataaagttgttgcaacaatcgtgg 29872852  T
Q  321 gaacatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaa 417  Q
    |||||||  || |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||   |||||||||||||    
T  29872851 gaacatgccaagctcactctttgtctggtatctctgatagtgaatgttggttgttgttcaaagaatatgcatttggatattacagagaagagcatacaaa 29872752  T
Q  418 gtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29872751 gcttatggaaataggaaaggagattgtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 29872693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 474
Target Start/End: Original strand, 30241619 - 30241966
Alignment:
Q  130 aaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaagataga 229  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  30241619 aaaggtgcaggaattgttacaaggtaaaatatatttgctagttttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatcagggttaacacgagagaaa 30241718  T
Q  230 tgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatggg 329  Q
    ||| |    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    |||| |||    
T  30241719 tggaacacattgaaatctgtgttgtcatgtggatccaaaggtagttccattttagtatccactcgtgatgaggttgttgcaacaatcacaaaaacaaggg 30241818  T
Q  330 aaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagtttgtgga 426  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |   |||||  ||||||| ||||| |    
T  30241819 aaactcaccgtttatctggtctctccgaggatgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcatttggacattatagagaagagagtacaaagcttgtgaa 30241918  T
Q  427 aattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagc 474  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30241919 aataggaaaggagattgtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagc 30241966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30750523 - 30750162
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30750523 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaagatatttgttggttttggatgatgtatggaatcaaaatgaacaattggaatcagggttaaca 30750424  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    | ||| | |||| |  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||| ||||  |    
T  30750423 cgagagaaatggaacaaattgaaacctgtgttgtcttgtggatccaaaggtagttccattttattgtccacccgtgatgaagttgttgcaacaatcacag 30750324  T
Q  321 gaacatgggaaac---tcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatac 414  Q
    |||||||  ||||   ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||   |||||| | |    
T  30750323 gaacatgccaaactcatcatcgtttgtcttctctctctgatagtgaatgttggctgttgttcgaacaatatgcatttggacattacaaagaagagcgtgc 30750224  T
Q  415 aaagtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
      |  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30750223 tgatctcgtggcaataggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 30750162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30061249 - 30060888
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30061249 aatggaaagagaggtgcaaggattgttgcaagggaaaagatatttgctggttttggatgatgtgtggaatcaaaatcaacaattggaatcagggttaaca 30061150  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    | ||| | |||| |  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||  |    
T  30061149 cgagagaaatggaacaaattgaaacctgtgttgtcttgtggatccaaaggtagttccattttagtgtccacccgtgatgaagttgttgcaacgatcacag 30061050  T
Q  321 gaacatgggaaac---tcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatac 414  Q
    ||||||   ||||   ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||   |||||| | |    
T  30061049 gaacataccaaactcatcatcgtttgtcttctctctctgatagtgaatgttggttgttgttcgaacaatatgcatttggacatcacaaagaagagcgtgc 30060950  T
Q  415 aaagtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
      |  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30060949 tgatctcgtggcaataggaaaggagatagtaaagaaatgcaatggattgcctcttgcagcaa 30060888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30207394 - 30207042
Alignment:
Q  126 aaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||  || ||||  |||||    
T  30207394 aaagaaaggtgcaggaattgctgcaaggtaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaacaaaaatcagcaattggaattcggattaagccaaga 30207295  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
     | |||| ||    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  30207294 gaaatggaatatactgaaatcagtgttatcgtgtggatccaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggttgttgcgacgatcatgggaaca 30207195  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagtttg 422  Q
    ||  |  |||| | ||| | |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||   | |   |||||| | || || |||    
T  30207194 tgccacgctcatcctttatatgttctctctgataatgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcatttggacaaaatagagaagagcgtgcagagcttg 30207095  T
Q  423 tggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagca 475  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30207094 tggaaataggaaaggagatagtaaagaaatgtgatggattgcctcttgcagca 30207042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 394
Target Start/End: Original strand, 17417828 - 17418095
Alignment:
Q  127 aagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatg-aacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    |||||||||| ||| | | ||| |||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  || ||||  |||||    
T  17417828 aagaaaggtgaaagaactattgaaaggtaaaagatattttctggttttggacgatgtgtggaa-caaaatgcaacaattagcattcggattaagccaaga 17417926  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
     | |||| ||   |||||||| || ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||    
T  17417927 gaaatggaatacgttgaaatcagtgtttatgtgtggatccaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggttgttgcggcaatcatgggaaca 17418026  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcattt 394  Q
    ||  || || | | ||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17418027 tgtcaagcttatcctttatatggtctctctgataatgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcattt 17418095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Original strand, 30520867 - 30521131
Alignment:
Q  134 gtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaagatagatggg 233  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||   |||| || || |||||| ||| ||||  ||||| | ||||     
T  30520867 gtgcaagaattgttggaaggtaaaagatatttgcttgttttggatgatgtgtggaacagaaatcaagaactggaatttggattaagccaagagaaatgga 30520966  T
Q  234 atcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaac 333  Q
    || | |||||||| || |||||   |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||  || |    
T  30520967 ataagttgaaatccgtgttgtcaactggatccaaaggttcatccattttagtctccactcgtgataaggatgttgctgagatcatgggaacatgccaagc 30521066  T
Q  334 tcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgac 398  Q
    ||| | ||||||| |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30521067 tcatcatttgtctggtctatctgaatatgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcatttcgac 30521131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Original strand, 30561207 - 30561471
Alignment:
Q  134 gtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaagatagatggg 233  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||   |||| || || |||||| ||| ||||  ||||| | ||||     
T  30561207 gtgcaagaattgttggaaggtaaaagatatttgcttgttttggatgatgtgtggaacagaaatcaagaactggaatttggattaagccaagagaaatgga 30561306  T
Q  234 atcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaac 333  Q
    || | |||||||| || |||||   |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||  || |    
T  30561307 ataagttgaaatccgtgttgtcaactggatccaaaggttcatccattttagtctccactcgtgataaggatgttgctgagatcatgggaacatgccaagc 30561406  T
Q  334 tcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgac 398  Q
    ||| | ||||||| |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30561407 tcatcatttgtctggtctatctgaatatgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcatttcgac 30561471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30476134 - 30475979
Alignment:
Q  239 ttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaactcacc 338  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||   | |||| |    
T  30476134 ttgaaatctgcgttgtcatgtggatccaaaggatcttccattttagtttccactcgtgataaggatgttgcagaaatcatgggaacatgtttagctcatc 30476035  T
Q  339 gtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcattt 394  Q
     ||| ||| |||||||||| |  || |||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  30476034 atttatctggtctctctgaaaacgaatgttggttgttgtttagacaatatgcattt 30475979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17983657 - 17983502
Alignment:
Q  239 ttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaactcacc 338  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||  | || |||||||||||   |||||  |    
T  17983657 ttgaagtctgtgttgtcttgtggatccaaaggtacttccattttagtgtctactcgtgacatggatgttgcctcaattatgggaacatgtccaactcgtc 17983558  T
Q  339 gtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcattt 394  Q
     | ||||   ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17983557 ctctgtcagttctctctgacaatgaatgttagttgttgttcaaacaatatgcattt 17983502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 30330526 - 30330611
Alignment:
Q  239 ttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaac 324  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||    
T  30330526 ttgaaatatgtgttgtcgtgtgtatccaaaggtagtttcatttttgcgtccactcctgatgaggttgttgcgacaatcatgggaac 30330611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 121 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26708209 - 26707851
Alignment:
Q  121 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26708209 aatggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatatgggttaaca 26708110  T
Q  221 caagatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgg 320  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  26708109 caagatagatggaatcgtttgaaatctgttttgtcctgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgataaggatgttgcaacaatcatgg 26708010  T
Q  321 gaacatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaa 417  Q
    |||||||  || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||    
T  26708009 gaacatgccaagctcactctttgtctggtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttagacattacagagaagagcatacaaa 26707910  T
Q  418 gtttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26707909 gcttgtggaaataggaaaggagatagtaaaaaaatgtaatggattacctcttgcagcaa 26707851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 123 - 476
Target Start/End: Original strand, 20295813 - 20296169
Alignment:
Q  123 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacaca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20295813 tggaaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgttgattttagatgatgtgtggaatcaaaatgatcaattggaatctgggttaacacc 20295912  T
Q  223 agatagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatggga 322  Q
     |||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  20295913 cgatatatggactcgtttgaaatctgttttgtcatgtggatcaaaaggtagttccattttagtgtcaactcgtgataaggatgttgcaacaatcatggga 20296012  T
Q  323 acatgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagt 419  Q
    |||||  || |||||  ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||     
T  20296013 acatgccaagctcactctttgtctggtctctcttacagtgattgttggttgttgttcaaacaacatgcatttagacattacagagaagagcatacaaagc 20296112  T
Q  420 ttgtggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 476  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296113 ttgtggaaataggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagcaa 20296169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 52352821 - 52352563
Alignment:
Q  136 gcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaagatagatgggat 235  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||  ||   || ||||  ||||| | |||| |     
T  52352821 gcaagaattgttgcaaggtaaaagatatttgttggttttggatgatgtgtggaatagaaatctagaattcaaactaggattaagccaagaaaaatggaac 52352722  T
Q  236 catttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaactc 335  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  52352721 aagttgaaatctgtgttgtcctgtggatccaaaggtgcttacattttagtttccacttgtgataaggatgttgcgacaatcatgggaacatgtcaaactc 52352622  T
Q  336 accgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcattt 394  Q
    | | ||| ||| | ||||| || |  || |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  52352621 atcatttatctggcctctcagagaaggaatgttggctgttattcaaacaatatgcattt 52352563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13617342 - 13617200
Alignment:
Q  251 ttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaacatgggaaactcaccgtttgtctagtc 350  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||  |||||||||| |||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||  |||||||   ||    
T  13617342 ttgtcttgtggattgaaaggtacttctgttttagtgtctactcgtgatatcgatgttgcatcaatcatgggaacatgctcaactcattgtttgtcagttc 13617243  T
Q  351 tctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatt 393  Q
    ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13617242 tctatgatggtgaatgttggttattgttcaaacaatatgcatt 13617200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 408
Target Start/End: Original strand, 25293181 - 25293457
Alignment:
Q  126 aaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||   | ||||| |||||    
T  25293181 aaagaaaggtgtaagaactattgcaaggtaaaatatatttgcttattttggacgatgtgtggaacaaaaatcagcaattggaattcagattaacccaaga 25293280  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
     | || | ||   ||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||||     
T  25293281 aaaattgaatatgttgaaatctgtattgtcggttggatccaatcgtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggttgttgcgacaataatgggaact 25293380  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttacaaaga 408  Q
    ||  || |||| |  ||||      ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  25293381 tgtcaagctcatccattgt------tctctaataacgaatgttggttgttgttcaaacaatatgcatttggacattacaaaga 25293457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7100293 - 7099941
Alignment:
Q  126 aaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    ||||||| ||||||| | || ||||||| | || || |||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||  ||  |||  |||||    
T  7100293 aaagaaaagtgcaagaaatgatgcaaggtacaagatgtttgttggttttggatgatgtgtggaacaaaaatgaagaatttgaattcggactaaaccaaga 7100194  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
     | |||| || | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||  | |||| |||||||    
T  7100193 gaaatggaataagttgaaatcggtgttgtcatgtggatccaaaggtacttccgttttagtgtctactcgtgatatggatgttgcctcaatcacgggaaca 7100094  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagtttg 422  Q
    ||   ||| |  | ||||||   ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||   |||||| | |  || |||    
T  7100093 tgcccaacccgtcctttgtcggttctctctgatcatgagtgctggttgttgttcaaacaatatgcatttggacattacagagaagagcgtgctgagcttg 7099994  T
Q  423 tggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagca 475  Q
    || |||| || |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||    
T  7099993 tgaaaataggcaaggagatagtaaaaaagtgtggaggattgcctcttgcagca 7099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 475
Target Start/End: Original strand, 7580953 - 7581305
Alignment:
Q  126 aaagaaaggtgcaaggattgttgcaagggaaaatatatttgctgattttggatgatgtgtggaatcaaaatgaacaattggaatctgggttaacacaaga 225  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||| ||||   ||| | || |||| |||| |||  ||   || ||    
T  7580953 aaagaaaggtgcaagaaatgttgcaaggaaaaagacgtttgctggttttggacgatgtttggataaaaagtcaagaatttgaatttggactagaccatga 7581052  T
Q  226 tagatgggatcatttgaaatctgttttgtcgtgtggatctaaaggtagttccattttagtgtccactcgtgatgaggatattgcaactatcatgggaaca 325  Q
     | |||| || | ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| | ||||||||||||    
T  7581053 gaaatggaataaattgaaatctgtgttgtctggtggatcgaaaggtacttccgttttagtgtctactcgtgatatggaggttgcatcaatcatgggaaca 7581152  T
Q  326 tgggaaactcaccgtttgtctagtctctctgatagtgactgttggttgttgttcaaacaacatgcatttcgacgttaca---aagagcatacaaagtttg 422  Q
    ||   |||||    ||||||   ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | | |   |||||  | || || |||    
T  7581153 tgctcaactcgttctttgtcagttctctctgatgatgaatgttggttattgttcaaacaatatgcatttggacatgatagagaagagagtgcagagcttg 7581252  T
Q  423 tggaaattggaaaggagatagtaaagaaatgtaatggattgcctcttgcagca 475  Q
    ||| ||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  7581253 tggcaataggcaaggagatagtaaaaaaatgtgcgggattgcctcttgcagca 7581305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7872546 - 7872494
Alignment:
Q  7 aggacaataaataaaaaagtcacacattgatctcatcacacgtctgaatcgga 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7872546 aggacaataaataaaaaagtcacacattgatctcatcacacgtctgaatcgga 7872494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 12 times since January 2019
Visitors: 6046