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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0846_low_56 (Length: 491)

Name: NF0846_low_56
Description: NF0846
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0846_low_56
NF0846_low_56
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (112-424)||(24470821-24471138)
chr4 (119-424)||(24420488-24420799)
chr4 (151-424)||(24420392-24420665)
chr4 (149-424)||(24470959-24471234)
chr4 (110-422)||(24470531-24470849)
chr4 (154-422)||(24420778-24421046)
chr4 (110-424)||(24420872-24421192)
chr4 (110-408)||(24470291-24470595)
chr4 (174-422)||(24421210-24421458)
chr4 (128-401)||(24420751-24421024)
chr4 (115-377)||(24420967-24421235)
chr4 (151-419)||(24421021-24421289)
chr4 (110-403)||(24470339-24470638)
chr4 (349-424)||(24406527-24406602)
chr4 (149-419)||(24421165-24421435)
chr4 (157-413)||(24470488-24470744)
chr4 (110-395)||(24477374-24477665)
chr4 (115-403)||(24470488-24470782)
chr4 (229-424)||(24476790-24476976)
chr4 (110-377)||(24421159-24421432)
chr4 (174-424)||(24470265-24470515)
chr4 (272-368)||(24476885-24476981)
chr4 (268-424)||(24406425-24406587)
chr4 (119-419)||(24470684-24470989)
chr4 (149-419)||(24420637-24420907)
chr4 (149-422)||(24470288-24470561)
chr4 (149-393)||(24420327-24420571)
chr4 (157-413)||(24420979-24421235)
chr4 (149-424)||(24420584-24420859)
chr4 (211-403)||(24421277-24421469)
chr4 (268-408)||(24421320-24421460)
chr4 (174-422)||(24477491-24477739)
chr4 (211-403)||(24470254-24470446)
chr4 (268-408)||(24470263-24470403)
chr4 (104-233)||(24477392-24477527)
chr4 (409-489)||(24406436-24406521)
chr4 (295-386)||(24477065-24477156)
chr4 (178-403)||(24477462-24477687)
chr4 (149-243)||(24477064-24477158)
chr4 (409-449)||(24406379-24406419)
chr4 (268-379)||(24477630-24477741)
chr4 (236-368)||(24471142-24471274)
chr4 (355-423)||(24482187-24482255)
chr4 (196-279)||(24481477-24481559)
chr4 (437-489)||(24406538-24406589)
chr4 (193-308)||(24406499-24406614)
chr4 (193-299)||(24471147-24471253)
chr4 (174-206)||(24421495-24421527)
chr4 (174-206)||(24470196-24470228)
chr4 (355-395)||(24476729-24476769)
chr4 (351-403)||(24477291-24477343)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (178-395)||(4464-4681)
scaffold0879 (151-419)||(4485-4753)
scaffold0879 (112-377)||(4536-4807)
scaffold0879 (110-386)||(4582-4864)
scaffold0879 (154-413)||(4536-4795)
scaffold0879 (268-419)||(4458-4609)
scaffold0879 (283-422)||(4425-4564)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (211-401)||(41899872-41900062)
chr2 (157-395)||(41899830-41900068)
chr2 (119-386)||(41900127-41900400)
chr2 (154-351)||(41899826-41900023)
chr2 (214-403)||(41900302-41900491)
chr2 (211-378)||(41900279-41900446)
chr2 (149-303)||(41899826-41899980)
chr2 (151-376)||(41900089-41900314)
chr2 (355-422)||(41900571-41900638)
chr2 (268-386)||(41900511-41900629)
chr2 (128-403)||(41900158-41900433)
chr2 (211-338)||(41900511-41900638)
chr2 (163-319)||(41900290-41900446)
chr2 (110-257)||(41899824-41899977)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (163-302)||(11879442-11879581)
chr1 (211-314)||(11879442-11879545)
chr1 (166-302)||(11882303-11882439)
chr1 (166-302)||(11891537-11891673)
chr1 (259-383)||(11879442-11879566)
chr1 (211-383)||(11902038-11902210)
chr1 (163-299)||(11902038-11902174)
chr1 (331-400)||(11879349-11879418)
chr1 (178-302)||(11882411-11882535)
chr1 (178-302)||(11891645-11891769)
chr1 (210-255)||(11902373-11902418)
chr1 (162-314)||(11904952-11905104)
chr1 (110-251)||(11879479-11879626)
chr1 (190-278)||(11879661-11879749)
chr1 (151-302)||(11902074-11902225)
chr1 (329-419)||(11879464-11879554)
chr1 (332-422)||(11902063-11902153)
chr1 (162-284)||(11905000-11905122)
chr1 (149-227)||(52821569-52821647)
chr1 (355-395)||(11881952-11881992)
chr1 (355-395)||(11891186-11891226)
chr1 (259-419)||(11902038-11902198)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 112 - 424
Target Start/End: Original strand, 24470821 - 24471138
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc-----atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470821 ccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 24470920  T
Q  207 cgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtc 306  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24470921 cgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtc 24471020  T
Q  307 tataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtcttta 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  24471021 tataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccata 24471120  T
Q  407 agtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24471121 agtcacctccacctcctt 24471138  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 119 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24420799 - 24420488
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420799 tttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 24420700  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 312  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24420699 taaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataag 24420600  T
Q  313 tcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcac 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  24420599 tcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcac 24420500  T
Q  413 cgccacctcctt 424  Q
    | ||||||||||    
T  24420499 ctccacctcctt 24420488  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420392
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  251 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 350  Q
    ||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24420565 catatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T
Q  351 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
        |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24420465 ctactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcctt 24420392  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 149 - 424
Target Start/End: Original strand, 24470959 - 24471234
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470959 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcc 24471058  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
    ||||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24471059 tccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctcca 24471158  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24471159 tactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcctt 24471234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 422
Target Start/End: Original strand, 24470531 - 24470849
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24470531 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24470630  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  24470631 atatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatat 24470730  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    ||||| ||||| || | ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  24470731 gtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtat 24470830  T
Q  404 ttaagtcaccgccacctcc 422  Q
     ||||||||| || |||||    
T  24470831 ataagtcaccacctcctcc 24470849  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420778
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  254 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 353  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgt 24420847  T
Q  354 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24420846 ttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24420778  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24421192 - 24420872
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  24421192 ctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccacc 24421093  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  24421092 atatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatat 24420993  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    ||||| ||||| || | ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  24420992 gtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtat 24420893  T
Q  404 ttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  24420892 ataagtcaccaccacctcctt 24420872  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 408
Target Start/End: Original strand, 24470291 - 24470595
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||    
T  24470291 ctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccacc 24470390  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  24470391 atatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctat 24470490  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    || || ||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24470491 gtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtct 24470590  T
Q  404 ttaag 408  Q
     ||||    
T  24470591 ataag 24470595  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421210
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 273  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24421359  T
Q  274 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 373  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421358 cctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24421259  T
Q  374 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcc 24421210  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24421024 - 24420751
Alignment:
Q  128 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  24421024 cacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccaccccc 24420925  T
Q  228 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 327  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  || ||     
T  24420924 accatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccacca 24420825  T
Q  328 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 401  Q
    || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24420824 tcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24420751  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24420967
Alignment:
Q  115 tatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  209 tttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 308  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtata 24421036  T
Q  309 taagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 377  Q
    ||| || || |  || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421035 taaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24421289 - 24421021
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  24421289 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 24421190  T
Q  251 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 350  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  24421189 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 24421090  T
Q  351 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  24421089 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 24421021  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470339 - 24470638
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24470339 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24470438  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  24470439 atatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatat 24470538  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470539 gtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470638  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 349 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24406602 - 24406527
Alignment:
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406602 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406527  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24421435 - 24421165
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24421435 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccc 24421336  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || ||     
T  24421335 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccacct 24421236  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 24421165  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 413
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470744
Alignment:
Q  157 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 256  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||     
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  257 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 356  Q
    |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || || ||| ||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  357 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 413  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcacc 24470744  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24477665 - 24477374
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||      | |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||    
T  24477665 ctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccacc 24477566  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24477565 atatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatat 24477466  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 395  Q
    ||||| |||   |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  || ||||||||||    
T  24477465 gtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcacccccaactcctccacc 24477374  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470782
Alignment:
Q  115 tatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||      |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| |    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  209 tttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 308  Q
    | || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  309 taagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    |||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtct 24470782  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 229 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24476976 - 24476790
Alignment:
Q  229 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 328  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |             
T  24476976 ccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccac--------- 24476886  T
Q  329 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24476885 ctccttcaccccctcctccatatgtttatgaatctccacccccaccatctccttcacctcccccatcctatgtctataagtcacatccacctcctt 24476790  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24421432 - 24421159
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||    
T  24421432 ctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccacc 24421333  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||    
T  24421332 atatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttat 24421233  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 377  Q
    || || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421232 gtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 424
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470515
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 273  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24470364  T
Q  274 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 373  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470365 cctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24470464  T
Q  374 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    || | || |||||||| || || ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24470465 caacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcctt 24470515  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476885
Alignment:
Q  272 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccacc 24476885  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24406587 - 24406425
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa------at 361  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||      |     
T  24406587 ccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406488  T
Q  362 ctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406425  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 419
Target Start/End: Original strand, 24470684 - 24470989
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  24470684 tttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtcta 24470783  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 312  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||  |||| |||||||| || |||    
T  24470784 caaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcc-tccccaccatatgtttacaag 24470882  T
Q  313 tcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcac 412  Q
    || || | ||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  |||||||    
T  24470883 tcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcac 24470982  T
Q  413 cgccacc 419  Q
    | |||||    
T  24470983 caccacc 24470989  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24420907 - 24420637
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  24420907 ctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctcc 24420808  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
     || ||||| || | ||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24420807 accctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24420708  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24420707 tacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24420637  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 422
Target Start/End: Original strand, 24470288 - 24470561
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24470288 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctccccc 24470387  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  | || ||||| || || ||     
T  24470388 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccc 24470487  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24470561  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24420571 - 24420327
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||||||||    
T  24420571 ctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcc 24420472  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
    ||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||     
T  24420471 tccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctcct 24420372  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctcca 393  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24420371 tatatttacaagtctccacctccaccatctccatcacctcctcca 24420327  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24420979
Alignment:
Q  157 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 256  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  257 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 356  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || |||||||| ||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtata 24421036  T
Q  357 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 413  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  24421035 taaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 24420979  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24420859 - 24420584
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || || || || || || ||  |||| ||||| || || || |||||||| || || || ||    
T  24420859 ctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctccccc 24420760  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 348  Q
     |||||| | |||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||| || ||||||    
T  24420759 accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctcca 24420660  T
Q  349 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 424  Q
    ||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || || |||||||    
T  24420659 tatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctcctt 24420584  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421277
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24421277  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421320
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 367  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  368 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 408  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477491
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 273  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  274 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 373  Q
    || ||||| |  || || || |||||| ||||||| || || || | |||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  24477639 cctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccac 24477540  T
Q  374 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24477539 catctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24477491  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 403
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470446
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470446  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 408
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470403
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 367  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  368 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 408  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24477527 - 24477392
Alignment:
Q  104 ctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcct------ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccacc 197  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||      |||||||| ||||||   |  |||| |||||||||||| |||||    
T  24477527 ctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccacc 24477428  T
Q  198 acctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 233  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  24477427 acctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 24477392  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24406521 - 24406436
Alignment:
Q  409 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctc------caccatctccttcatctcactcgaccttatgtctttaagtcacc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24406521 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacctccaccatctccttcacctc-ctccaccttatgtctttaagtcacc 24406436  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477065
Alignment:
Q  295 cctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 386  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacc 24477065  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24477687 - 24477462
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 277  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||  || || || |||||| || ||||||  |||||||| || |    
T  24477687 ccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctc 24477588  T
Q  278 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 377  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24477587 cgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24477488  T
Q  378 tccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24477487 tccttcacctcccccaccatatgtct 24477462  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24477158 - 24477064
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 243  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24406419 - 24406379
Alignment:
Q  409 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406419 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406379  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477630
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 367  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  368 ccccaccatctc 379  Q
    | || |||||||    
T  24477641 cacctccatctc 24477630  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 368
Target Start/End: Original strand, 24471142 - 24471274
Alignment:
Q  236 cttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttc 335  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  24471142 cttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttc 24471241  T
Q  336 accccctcctccatatgtttacaaatctccacc 368  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24471242 accaccgcctccttatatttacaagtctccacc 24471274  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24482255 - 24482187
Alignment:
Q  355 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24482255 tacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  196 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24406589 - 24406538
Alignment:
Q  437 ctccacctccaccatctccttcatctcactcgaccttatgtctttaagtcacc 489  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24406589 ctccacccccaccatctccttcacctc-ctccaccttatgtctttaagtcacc 24406538  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24406614 - 24406499
Alignment:
Q  193 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 292  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  24406614 ccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgc 24406515  T
Q  293 cccctccatatgtcta 308  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  24406514 cacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  193 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 292  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  293 cccctcc 299  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24476769 - 24476729
Alignment:
Q  355 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 395  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24476769 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccacc 24476729  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24477343 - 24477291
Alignment:
Q  351 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24477343 tgtttacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtct 24477291  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4681
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 277  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctc 4563  T
Q  278 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 377  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || || || || || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  378 tccttcacctcctccacc 395  Q
     || ||||| ||||||||    
T  4664 cccatcaccccctccacc 4681  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4753
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  251 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 350  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 4684  T
Q  351 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  4685 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 4753  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 377
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4807
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  206 acgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgt 305  Q
    |  |||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  306 ctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 377  Q
     ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 4582 - 4864
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  4582 ctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccacc 4681  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  4682 atatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatat 4781  T
Q  304 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 386  Q
    ||||| ||||| || | ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4782 gtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 413
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4795
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  254 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 353  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  354 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 413  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 4795  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 419
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4609
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 367  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  368 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 4609  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4564
Alignment:
Q  283 ccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctcctt 382  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  383 cacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctcc 4564  T

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Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41900062 - 41899872
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  41900062 tacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttaca 41899963  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 401  Q
    ||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41899962 agtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgt 41899872  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899830
Alignment:
Q  157 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 256  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  257 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 356  Q
    | |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgttta 41899869  T
Q  357 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 395  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41899868 caagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41900400 - 41900127
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||| ||||| || |  || || || ||||| || |||||||||||||| || ||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 312  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||    
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaag 41900201  T
Q  313 tcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 386  Q
    || || |  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  41900200 tcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcacc 41900127  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899826
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  254 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatat 351  Q
    ||   |||| ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899923 atgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41900491 - 41900302
Alignment:
Q  214 aagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 313  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||    
T  41900491 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagt 41900392  T
Q  314 cccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    | || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  41900391 caccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtct 41900302  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900279
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  || || ||||||||||| |    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatct 378  Q
    | || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41899980 - 41899826
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  41899980 ctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcc 41899881  T
Q  249 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 303  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||||    
T  41899880 tccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41900314 - 41900089
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  41900314 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgc 41900215  T
Q  251 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 350  Q
    | ||| |  ||| |||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41900214 cttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 41900115  T
Q  351 tgtttacaaatctccacccccaccat 376  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  41900114 tgtttacaaatctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900571
Alignment:
Q  355 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctcc 41900571  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900511
Alignment:
Q  268 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  368 ccccaccatctccttcacc 386  Q
    | || || ||||| |||||    
T  41900529 cacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41900433 - 41900158
Alignment:
Q  128 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||| || ||| |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  41900433 caccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacc 41900334  T
Q  228 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 327  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||  |||| |||||||| |  || ||     
T  41900333 tccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccacca 41900234  T
Q  328 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 403  Q
    || || ||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41900233 tccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 41900158  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900511
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcacc 338  Q
    | || ||||  ||||| ||||| |||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900290
Alignment:
Q  163 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 262  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  263 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 319  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 41900290  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41899977 - 41899824
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||      |||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||    
T  41899977 ctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctcc 41899878  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatat 257  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  41899877 atatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatatat 41899824  T

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Target: chr1 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 302
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  163 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 262  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  263 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
     ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 314
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879545
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  311 agtc 314  Q
    ||||    
T  11879542 agtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882439
Alignment:
Q  166 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 264  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11882401  T
Q  265 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882402 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891673
Alignment:
Q  166 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 264  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11891635  T
Q  265 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891636 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879566
Alignment:
Q  259 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 358  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  359 aatctccacccccaccatctccttc 383  Q
    | || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttc 11879566  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 383
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902210
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 310  Q
    |||||||| || || || ||| || |||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || |    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  311 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 383  Q
    |||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 299
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  163 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 262  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  263 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 299  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 400
Target Start/End: Original strand, 11879349 - 11879418
Alignment:
Q  331 ccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 400  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11879349 ccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatcacctccaccaccttatg 11879418  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 302
Target Start/End: Original strand, 11882411 - 11882535
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 276  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11882411 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11882509  T
Q  277 ccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882510 ccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 302
Target Start/End: Original strand, 11891645 - 11891769
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 276  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11891645 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11891743  T
Q  277 ccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891744 ccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  210 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 255  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 314
Target Start/End: Original strand, 11904952 - 11905104
Alignment:
Q  162 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatcta 260  Q
    ||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||    
T  11904952 ttacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-ta 11905050  T
Q  261 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 314  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  |||||||||    
T  11905051 taagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtc 11905104  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 251
Target Start/End: Original strand, 11879479 - 11879626
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcca------tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||      ||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  11879479 ctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccacc 11879578  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctcc 251  Q
    ||||   ||||||  |||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  11879579 atactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  190 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacc 278  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Original strand, 11902074 - 11902225
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11902074 cctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctc 11902173  T
Q  251 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 302  Q
    | ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902174 cttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 419
Target Start/End: Original strand, 11879464 - 11879554
Alignment:
Q  329 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| |||||    
T  11879464 ctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 422
Target Start/End: Original strand, 11902063 - 11902153
Alignment:
Q  332 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 422  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11902063 cttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctcc 11902153  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 284
Target Start/End: Original strand, 11905000 - 11905122
Alignment:
Q  162 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctac 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||  |||     
T  11905000 ttacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactat 11905099  T
Q  262 atgtcaccaccaccaccatcccc 284  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  11905100 aagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52821647 - 52821569
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821647 ctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Original strand, 11881952 - 11881992
Alignment:
Q  355 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 395  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11881952 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11881992  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Original strand, 11891186 - 11891226
Alignment:
Q  355 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 395  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11891186 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11891226  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 419
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902198
Alignment:
Q  259 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 358  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  359 aatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 419  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||| |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccacc 11902198  T

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