View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0849_low_18 (Length: 336)

Name: NF0849_low_18
Description: NF0849
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0849_low_18
NF0849_low_18
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (88-336)||(27611029-27611277)
chr6 (88-336)||(27718406-27718654)
chr6 (88-336)||(27724872-27725120)
chr6 (88-336)||(27698521-27698769)
chr6 (88-336)||(28781051-28781299)
chr6 (90-330)||(27678864-27679104)
chr6 (88-336)||(28786190-28786438)
chr6 (88-336)||(28792311-28792559)
chr6 (88-336)||(27604732-27604980)
chr6 (95-330)||(27593054-27593289)
chr6 (91-336)||(26802354-26802599)
chr6 (88-336)||(26646391-26646639)
chr6 (88-336)||(26752359-26752607)
chr6 (90-330)||(27677643-27677883)
chr6 (90-330)||(27706431-27706671)
chr6 (133-336)||(27229144-27229347)
chr6 (99-329)||(27531235-27531465)
chr6 (99-336)||(26655901-26656138)
chr6 (99-336)||(26761872-26762109)
chr6 (102-335)||(25579632-25579865)
chr6 (102-336)||(25481654-25481888)
chr6 (88-307)||(26884104-26884325)
chr6 (102-336)||(26142777-26143011)
chr6 (88-330)||(31284206-31284448)
chr6 (99-319)||(27338103-27338323)
chr6 (99-319)||(27398843-27399063)
chr6 (88-335)||(26622889-26623136)
chr6 (88-335)||(26728867-26729114)
chr6 (102-336)||(26055838-26056072)
chr6 (102-336)||(26075808-26076042)
chr6 (102-336)||(26048757-26048991)
chr6 (102-336)||(26069926-26070160)
chr6 (102-336)||(25538452-25538686)
chr6 (88-314)||(26823774-26824000)
chr6 (124-330)||(28234482-28234688)
chr6 (114-330)||(26861534-26861750)
chr6 (100-307)||(28139482-28139689)
chr6 (88-330)||(28242722-28242964)
chr6 (99-305)||(26848603-26848809)
chr6 (108-330)||(28181032-28181254)
chr6 (99-274)||(28149912-28150086)
chr6 (108-285)||(28185329-28185506)
chr6 (113-270)||(28325459-28325616)
chr6 (108-330)||(28226868-28227090)
chr6 (98-269)||(26937073-26937244)
chr6 (133-244)||(25506981-25507092)
chr6 (108-269)||(28297760-28297921)
chr6 (108-269)||(28514152-28514313)
chr6 (102-269)||(26341975-26342142)
chr6 (145-317)||(29825958-29826130)
chr6 (94-329)||(27214336-27214571)
chr6 (94-329)||(27234657-27234892)
chr6 (88-206)||(27427633-27427751)
chr6 (113-302)||(26635636-26635825)
chr6 (113-302)||(26741602-26741791)
chr6 (113-302)||(27665169-27665358)
chr6 (94-318)||(25071589-25071813)
chr6 (94-318)||(26949591-26949815)
chr6 (118-302)||(26974998-26975182)
chr6 (117-336)||(28098425-28098644)
chr6 (189-304)||(26811453-26811568)
chr6 (95-266)||(2184880-2185051)
chr6 (223-302)||(26959111-26959190)
chr6 (94-248)||(2184288-2184442)
chr6 (223-305)||(26617269-26617351)
chr6 (223-305)||(26723197-26723279)
chr6 (133-278)||(26893543-26893688)
chr6 (264-336)||(27427806-27427878)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (88-336)||(14383-14630)
scaffold0349 (90-336)||(3450-3697)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (88-336)||(4698-4946)
scaffold0277 (88-336)||(13659-13907)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (88-336)||(7437-7685)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (154-336)||(10-192)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (88-304)||(268371-268587)
chr1 (88-284)||(28164376-28164572)
chr1 (88-304)||(28127693-28127910)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (88-336)||(18679581-18679829)
chr4 (87-336)||(18655490-18655739)
chr4 (88-336)||(18699414-18699662)
chr4 (88-336)||(18724099-18724347)
chr4 (88-336)||(18731518-18731766)
chr4 (108-335)||(5091001-5091228)
chr4 (88-206)||(18073804-18073922)
chr4 (109-206)||(17989088-17989185)
chr4 (264-336)||(17989240-17989312)
chr4 (264-336)||(18073677-18073749)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (88-304)||(29273797-29274013)
chr8 (217-329)||(31903770-31903882)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (108-330)||(34643-34865)
scaffold0038 (88-330)||(42884-43126)
scaffold0038 (113-270)||(116774-116931)
scaffold0038 (108-330)||(27366-27588)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (113-330)||(58334-58551)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (113-269)||(3279667-3279823)
chr2 (113-305)||(17993736-17993928)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (124-285)||(16688974-16689135)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (88-206)||(59612-59730)
scaffold0003 (264-336)||(59485-59557)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (196-240)||(214469-214513)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 27611029 - 27611277
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611029 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27611128  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611129 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27611228  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611229 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 27611277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 27718406 - 27718654
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718406 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27718505  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718506 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27718605  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27718606 aagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgccc 27718654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 27724872 - 27725120
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724872 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27724971  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724972 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27725071  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27725072 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgccc 27725120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 27698521 - 27698769
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27698521 aaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataa 27698620  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698621 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27698720  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27698721 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgccc 27698769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28781299 - 28781051
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781299 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataa 28781200  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28781199 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28781100  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781099 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 28781051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 90 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27679104 - 27678864
Alignment:
Q  90 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679104 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 27679005  T
Q  190 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 289  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27679004 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaa 27678905  T
Q  290 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  27678904 gagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtca 27678864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28786438 - 28786190
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786438 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 28786339  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28786338 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28786239  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786238 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 28786190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28792559 - 28792311
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28792559 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 28792460  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28792459 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28792360  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792359 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 28792311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 27604732 - 27604980
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27604732 aaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataa 27604831  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27604832 aaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagt 27604931  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27604932 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgccc 27604980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 27593054 - 27593289
Alignment:
Q  95 ggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593054 ggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 27593153  T
Q  195 agattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 294  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27593154 agactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 27593253  T
Q  295 ttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  27593254 ttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtca 27593289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26802599 - 26802354
Alignment:
Q  91 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802599 acgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 26802500  T
Q  191 tcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaag 290  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26802499 ttctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataag 26802400  T
Q  291 agccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  26802399 agccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgccc 26802354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26646639 - 26646391
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646639 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26646540  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26646539 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26646440  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26646439 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgccc 26646391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26752607 - 26752359
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752607 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26752508  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26752507 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26752408  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26752407 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgccc 26752359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 90 - 330
Target Start/End: Original strand, 27677643 - 27677883
Alignment:
Q  90 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27677643 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaa 27677742  T
Q  190 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 289  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27677743 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaa 27677842  T
Q  290 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  27677843 gagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtca 27677883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 90 - 330
Target Start/End: Original strand, 27706431 - 27706671
Alignment:
Q  90 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27706431 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaa 27706530  T
Q  190 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 289  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27706531 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaa 27706630  T
Q  290 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
     ||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||||    
T  27706631 aagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtca 27706671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 133 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229144
Alignment:
Q  133 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  233 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  333 gccc 336  Q
    ||||    
T  27229147 gccc 27229144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Original strand, 27531235 - 27531465
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    ||||||||| | |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27531235 accctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagat 27531334  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    |  |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27531335 ttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgt 27531434  T
Q  299 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtc 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27531435 agagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtc 27531465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26656138 - 26655901
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||    
T  26656138 accctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 26656039  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26656038 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 26655939  T
Q  299 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||| |||||    
T  26655938 agagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgccc 26655901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26762109 - 26761872
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||    
T  26762109 accctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 26762010  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26762009 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 26761910  T
Q  299 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||| |||||    
T  26761909 agagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgccc 26761872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25579865 - 25579632
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  25579865 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 25579766  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25579765 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25579666  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcc 335  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||    
T  25579665 gattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcc 25579632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25481888 - 25481654
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||||     
T  25481888 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattct 25481789  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25481788 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25481689  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||||    
T  25481688 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgccc 25481654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26884325 - 26884104
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatta--tgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaat 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||    
T  26884325 aaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaat 26884226  T
Q  186 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26884225 aaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtta 26884126  T
Q  286 gtaagagccttgtagagatttc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26884125 gtaagagccttgtagagatttc 26884104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26143011 - 26142777
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26143011 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26142912  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26142911 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 26142812  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | ||||||   || |||||||||| |||||    
T  26142811 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgccc 26142777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31284448 - 31284206
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  31284448 aaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataa 31284349  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31284348 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 31284249  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||    
T  31284248 aagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtca 31284206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 319
Target Start/End: Original strand, 27338103 - 27338323
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||     
T  27338103 accccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagac 27338202  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27338203 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgt 27338302  T
Q  299 agagatttctggtaaaaccgt 319  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  27338303 agagattgccggtaaaaccgt 27338323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 319
Target Start/End: Original strand, 27398843 - 27399063
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||     
T  27398843 accccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagac 27398942  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27398943 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgt 27399042  T
Q  299 agagatttctggtaaaaccgt 319  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  27399043 agagattgccggtaaaaccgt 27399063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26623136 - 26622889
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26623136 aaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataa 26623037  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26623036 aaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 26622937  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcc 335  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| ||||    
T  26622936 aagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcc 26622889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26729114 - 26728867
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26729114 aaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataa 26729015  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26729014 aaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 26728915  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcc 335  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| ||||    
T  26728914 aagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcc 26728867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26056072 - 26055838
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||     
T  26056072 ctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattct 26055973  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26055972 tcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttataga 26055873  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||||    
T  26055872 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgccc 26055838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26076042 - 26075808
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||     
T  26076042 ctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattct 26075943  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26075942 tcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttataga 26075843  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||||    
T  26075842 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgccc 26075808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26048991 - 26048757
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26048991 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26048892  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26048891 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26048792  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||||    
T  26048791 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgccc 26048757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26070160 - 26069926
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26070160 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26070061  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26070060 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26069961  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||||    
T  26069960 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgccc 26069926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25538686 - 25538452
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||     
T  25538686 ctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattct 25538587  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 301  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25538586 tcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttataga 25538487  T
Q  302 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||| | ||||||   || |||||||||| |||||    
T  25538486 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgccc 25538452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26824000 - 26823774
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26824000 aaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataa 26823901  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || |||||||| ||   ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  26823900 aaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgt 26823801  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaa 314  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  26823800 aagagccttgtagagattgccggtaaa 26823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234482
Alignment:
Q  124 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 223  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  224 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcg 323  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  ||||||||| | |||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  324 agtgtca 330  Q
    |||||||    
T  28234488 agtgtca 28234482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26861750 - 26861534
Alignment:
Q  114 gcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttg 213  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  26861750 gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattg 26861651  T
Q  214 aggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaa 313  Q
      |||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26861650 tcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaa 26861551  T
Q  314 aaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||| |  |||||||||    
T  26861550 aaccataccgagtgtca 26861534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28139689 - 28139482
Alignment:
Q  100 ccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  28139689 ccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagatt 28139590  T
Q  200 catcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgta 299  Q
    | |||||||| || | |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||| || || ||||||||   ||||  |||||| |||||    
T  28139589 cttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgta 28139490  T
Q  300 gagatttc 307  Q
    ||||||||    
T  28139489 gagatttc 28139482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28242964 - 28242722
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  28242964 aaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatga 28242865  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |      
T  28242864 aaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttaca 28242765  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||    
T  28242764 aagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtca 28242722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26848809 - 26848603
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||||||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| ||     
T  26848809 acccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgag 26848710  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 298  Q
    || ||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |    
T  26848709 tcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttat 26848610  T
Q  299 agagatt 305  Q
    |||||||    
T  26848609 agagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28181254 - 28181032
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28181254 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28181155  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 307  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||    
T  28181154 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28181055  T
Q  308 tggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
      |||||||| |  |||||||||    
T  28181054 cagtaaaaccataacgagtgtca 28181032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28150086 - 28149912
Alignment:
Q  99 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||     
T  28150086 accctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggac 28149987  T
Q  199 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 274  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28149986 tcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28185506 - 28185329
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28185506 cttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28185407  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 285  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  28185406 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtca 28185329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325459
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggta 270  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggta 28325459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28227090 - 28226868
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28227090 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 28226991  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 307  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  28226990 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 28226891  T
Q  308 tggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
      |||||||| |  |||||||||    
T  28226890 cagtaaaaccataacgagtgtca 28226868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26937244 - 26937073
Alignment:
Q  98 gaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctaga 197  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  ||    
T  26937244 gaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccgga 26937145  T
Q  198 ttcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 269  Q
     || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937144 atcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 25506981 - 25507092
Alignment:
Q  133 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 232  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25506981 agttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgattt 25507080  T
Q  233 catctcctcttt 244  Q
    ||||||||||||    
T  25507081 catctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Original strand, 28297760 - 28297921
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  28297760 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 269  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28297860 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28514313 - 28514152
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  28514313 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 269  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28514213 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28514152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 26341975 - 26342142
Alignment:
Q  102 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 201  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| || ||     
T  26341975 ctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactct 26342074  T
Q  202 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 269  Q
    |||||||| ||||  |||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  26342075 tcaatggctttgacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggt 26342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29826130 - 29825958
Alignment:
Q  145 caaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 244  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||    ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29826130 caaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctcttt 29826031  T
Q  245 gaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaacc 317  Q
    |||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29826030 gaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27214571 - 27214336
Alignment:
Q  94 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 193  Q
    |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||    
T  27214571 aggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcc 27214472  T
Q  194 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 293  Q
    | || || |||||   |||| |||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||    
T  27214471 tcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagc 27214372  T
Q  294 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtc 329  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  27214371 tttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtc 27214336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 27234657 - 27234892
Alignment:
Q  94 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 193  Q
    |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||    
T  27234657 aggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcc 27234756  T
Q  194 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 293  Q
    | || || |||||   |||| |||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||    
T  27234757 tcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagc 27234856  T
Q  294 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtc 329  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  27234857 tttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtc 27234892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 27427633 - 27427751
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  27427633 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 27427732  T
Q  188 aaatcctagattcatcaat 206  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  27427733 aaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635636
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 302  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26635636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741602
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 302  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26741602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 302
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665358
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  |||| || | |  |||   |||||| ||||| ||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 302  Q
      ||||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25071813 - 25071589
Alignment:
Q  94 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 193  Q
    ||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   ||| |    
T  25071813 aggcgactcttttccttgaagtagtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggcaattc 25071714  T
Q  194 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 293  Q
    | || || ||||||  |||| |||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25071713 tcgaatcttcaatgctcttgcggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagc 25071614  T
Q  294 cttgtagagatttctggtaaaaccg 318  Q
     || || ||||| | ||||||||||    
T  25071613 tttataaagattaccggtaaaaccg 25071589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26949815 - 26949591
Alignment:
Q  94 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 193  Q
    |||||||| |||  |||| || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   ||||||| ||   |||   ||| |    
T  26949815 aggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattc 26949716  T
Q  194 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 293  Q
    | ||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  26949715 tcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagc 26949616  T
Q  294 cttgtagagatttctggtaaaaccg 318  Q
     || |||||||| | ||| ||||||    
T  26949615 tttatagagattaccggtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26974998
Alignment:
Q  118 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 217  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  ||||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttgagga 26975083  T
Q  218 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 302  Q
    | || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26975082 gcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26974998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Original strand, 28098425 - 28098644
Alignment:
Q  117 gtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagg 216  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| || || || ||||||||||      
T  28098425 gtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgaca 28098524  T
Q  217 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaac 316  Q
    || ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  28098525 agggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaac 28098624  T
Q  317 cgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    | |  |||||||| ||||||    
T  28098625 cataccgagtgtcggtgccc 28098644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  189 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 288  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  289 agagccttgtagagat 304  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2185051 - 2184880
Alignment:
Q  95 ggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 194  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || || ||||| || ||||| ||    
T  2185051 ggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattct 2184952  T
Q  195 agattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 266  Q
     ||||| |||||||| || |  || |||||||| |||||| | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184951 ggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttcaccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959111
Alignment:
Q  223 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 302  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26959111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2184442 - 2184288
Alignment:
Q  94 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 193  Q
    ||||| ||||||| |||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || ||||| || ||||| |    
T  2184442 aggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattc 2184343  T
Q  194 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 248  Q
    | || || |||||||| || |  ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||    
T  2184342 tggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttcaccccctcgttgaag 2184288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617269
Alignment:
Q  223 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 305  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26617269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723197
Alignment:
Q  223 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 305  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26723197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 278
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893688
Alignment:
Q  133 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 232  Q
    ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| |||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  233 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 278  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||    
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattcc 26893688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Original strand, 27427806 - 27427878
Alignment:
Q  264 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  27427806 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgccc 27427878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14630
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14383 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataa 14481  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 14581  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14582 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgccc 14630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3697
Alignment:
Q  90 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3450 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaa 3549  T
Q  189 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3550 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 3649  T
Q  289 agagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3650 agagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgccc 3697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 4698 - 4946
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4698 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataa 4797  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4798 aaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 4897  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4898 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgccc 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 13659 - 13907
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13659 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 13758  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13759 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 13858  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13859 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 13907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7685 - 7437
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7685 aaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 7586  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7585 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 7486  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7485 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 7437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Original strand, 10 - 192
Alignment:
Q  154 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 253  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  254 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 88 - 304
Target Start/End: Original strand, 268371 - 268587
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268371 aaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 268470  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  268471 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 268570  T
Q  288 aagagccttgtagagat 304  Q
    |||||||||||||||||    
T  268571 aagagccttgtagagat 268587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 284
Target Start/End: Original strand, 28164376 - 28164572
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28164376 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataa 28164475  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 284  Q
    |||| | |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||    
T  28164476 aaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtc 28164572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 304
Target Start/End: Original strand, 28127693 - 28127910
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28127693 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataa 28127792  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcag 286  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||||     
T  28127793 aaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcat 28127892  T
Q  287 taagagccttgtagagat 304  Q
     ||| |||||||||||||    
T  28127893 aaagggccttgtagagat 28127910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 18679581 - 18679829
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18679581 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18679680  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18679681 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagt 18679780  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18679781 aagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgccc 18679829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 336
Target Start/End: Original strand, 18655490 - 18655739
Alignment:
Q  87 aaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaata 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655490 aaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaata 18655589  T
Q  187 aaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcag 286  Q
    || |||||||| || | |||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18655590 aagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 18655689  T
Q  287 taagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18655690 taagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgccc 18655739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 18699414 - 18699662
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18699414 aaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18699513  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18699514 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18699613  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||| ||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18699614 aagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgccc 18699662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 18724099 - 18724347
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18724099 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18724198  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18724199 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18724298  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18724299 aagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgccc 18724347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 18731518 - 18731766
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18731518 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18731617  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18731618 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18731717  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||  |||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18731718 aagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgccc 18731766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 5091001 - 5091228
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||   ||| | |||| ||||||| | ||||    
T  5091001 cttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatg 5091100  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 307  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  ||||||||||    
T  5091101 gccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttc 5091200  T
Q  308 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcc 335  Q
      ||||||||||  |||||||| |||||    
T  5091201 cagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcc 5091228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18073922 - 18073804
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  18073922 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 18073823  T
Q  188 aaatcctagattcatcaat 206  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  18073822 aaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989185
Alignment:
Q  109 ttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Original strand, 17989240 - 17989312
Alignment:
Q  264 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  17989240 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgccc 17989312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18073749 - 18073677
Alignment:
Q  264 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  18073749 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgccc 18073677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 304
Target Start/End: Original strand, 29273797 - 29274013
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273797 aaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 29273896  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29273897 aaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 29273996  T
Q  288 aagagccttgtagagat 304  Q
    ||||| |||||||||||    
T  29273997 aagagtcttgtagagat 29274013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903770
Alignment:
Q  217 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaac 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  317 cgtggcgagtgtc 329  Q
    | | |||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtc 31903770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34865 - 34643
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  34865 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 34766  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 307  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||     
T  34765 gccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagatttt 34666  T
Q  308 tggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
     ||||||||| | ||||||||||    
T  34665 cggtaaaaccatagcgagtgtca 34643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43126 - 42884
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  43126 aaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatga 43027  T
Q  188 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 287  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |      
T  43026 aaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttaca 42927  T
Q  288 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||    
T  42926 aagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtca 42884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116774
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggta 270  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggta 116774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27588 - 27366
Alignment:
Q  108 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 207  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27588 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 27489  T
Q  208 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 307  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  27488 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 27389  T
Q  308 tggtaaaaccgtggcgagtgtca 330  Q
      |||||||| |  |||||||||    
T  27388 cagtaaaaccataacgagtgtca 27366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 330
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58551
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 312  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  313 aaaccgtggcgagtgtca 330  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtca 58551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279667
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || || || ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 269  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggt 3279667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 305
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993928
Alignment:
Q  113 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 212  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | || || ||   |||   ||| || || || ||||||  |||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaagacgataatcgcaattcttgagtcttcaatgctctt 17993835  T
Q  213 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 305  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17993836 gaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagatt 17993928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16689135 - 16688974
Alignment:
Q  124 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 223  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || || ||||| |||||||  |||||||    
T  16689135 atgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatg 16689036  T
Q  224 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 285  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16689035 gtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtca 16688974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 59730 - 59612
Alignment:
Q  88 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 187  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  59730 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 59631  T
Q  188 aaatcctagattcatcaat 206  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  59630 aaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 59557 - 59485
Alignment:
Q  264 gaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgccc 336  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  59557 gaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgccc 59485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Original strand, 214469 - 214513
Alignment:
Q  196 gattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcct 240  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  214469 gattcatcaattgccttgaaaagtgatggtgtaatttcatctcct 214513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2864 times since January 2019
Visitors: 6167