View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0851_low_6 (Length: 533)

Name: NF0851_low_6
Description: NF0851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0851_low_6
NF0851_low_6
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (96-528)||(34528018-34528451)
chr2 (96-528)||(34541992-34542425)
chr2 (96-528)||(44374811-44375240)
chr2 (96-528)||(44390392-44390821)
chr2 (96-528)||(6856129-6856557)
chr2 (100-524)||(25495612-25496031)
chr2 (102-528)||(26717678-26718098)
chr2 (102-528)||(26731811-26732231)
chr2 (96-528)||(41232487-41232917)
chr2 (96-528)||(35039713-35040140)
chr2 (96-528)||(20364701-20365135)
chr2 (96-528)||(35147970-35148400)
chr2 (96-528)||(17685107-17685538)
chr2 (96-528)||(42564548-42564979)
chr2 (96-528)||(42573172-42573603)
chr2 (96-525)||(24293204-24293630)
chr2 (96-528)||(35139629-35140059)
chr2 (96-525)||(24286636-24287062)
chr2 (96-527)||(15943160-15943591)
chr2 (96-527)||(15951670-15952102)
chr2 (99-482)||(26896703-26897083)
chr2 (193-528)||(20623360-20623692)
chr2 (102-525)||(20920483-20920914)
chr2 (96-327)||(42247647-42247880)
chr2 (103-327)||(16274631-16274852)
chr2 (103-327)||(16283807-16284028)
chr2 (140-525)||(17095634-17096007)
chr2 (99-327)||(28481201-28481428)
chr2 (96-387)||(30524690-30524972)
chr2 (96-327)||(34068843-34069069)
chr2 (103-327)||(10681504-10681728)
chr2 (212-525)||(17069159-17069464)
chr2 (212-525)||(17075152-17075457)
chr2 (96-327)||(21151291-21151520)
chr2 (103-327)||(21850302-21850527)
chr2 (103-327)||(21858737-21858962)
chr2 (103-327)||(34685555-34685778)
chr2 (96-327)||(15600587-15600819)
chr2 (103-396)||(27681103-27681394)
chr2 (103-327)||(22187188-22187413)
chr2 (103-387)||(42245347-42245627)
chr2 (96-327)||(29855198-29855428)
chr2 (103-327)||(31354892-31355115)
chr2 (103-327)||(34707978-34708200)
chr2 (96-387)||(42385921-42386204)
chr2 (96-387)||(42400805-42401088)
chr2 (96-232)||(35304648-35304786)
chr2 (96-327)||(34436946-34437175)
chr2 (103-327)||(11622221-11622446)
chr2 (96-327)||(33306727-33306957)
chr2 (96-327)||(3755057-3755285)
chr2 (96-327)||(3765108-3765336)
chr2 (96-327)||(2652889-2653117)
chr2 (96-517)||(21111029-21111446)
chr2 (457-528)||(44374481-44374551)
chr2 (140-194)||(17069063-17069117)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (96-528)||(1875516-1875949)
chr4 (96-528)||(1889631-1890064)
chr4 (96-523)||(772960-773381)
chr4 (96-525)||(12425388-12425815)
chr4 (96-524)||(10640153-10640578)
chr4 (96-528)||(8092908-8093336)
chr4 (96-528)||(8101713-8102141)
chr4 (96-524)||(12998337-12998763)
chr4 (96-525)||(21530277-21530710)
chr4 (96-525)||(27341684-27342107)
chr4 (96-448)||(52297571-52297922)
chr4 (96-287)||(20865831-20866021)
chr4 (96-327)||(4747573-4747803)
chr4 (96-327)||(55584329-55584559)
chr4 (96-255)||(4522386-4522545)
chr4 (99-327)||(26210555-26210782)
chr4 (99-327)||(26219315-26219542)
chr4 (346-525)||(20866046-20866220)
chr4 (103-387)||(21398999-21399278)
chr4 (103-327)||(25247334-25247559)
chr4 (96-387)||(18009988-18010273)
chr4 (96-233)||(26034133-26034271)
chr4 (103-327)||(10786621-10786844)
chr4 (103-327)||(19759787-19760011)
chr4 (103-327)||(19774543-19774767)
chr4 (103-387)||(19645042-19645320)
chr4 (103-327)||(34842659-34842883)
chr4 (103-387)||(14718676-14718963)
chr4 (103-223)||(21811045-21811167)
chr4 (96-229)||(25652618-25652753)
chr4 (103-204)||(14736961-14737064)
chr4 (274-327)||(24924585-24924638)
chr4 (265-387)||(14737083-14737205)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (96-528)||(4661856-4662290)
chr7 (96-528)||(13832513-13832941)
chr7 (96-528)||(13840543-13840971)
chr7 (102-528)||(24186105-24186525)
chr7 (102-528)||(1886910-1887327)
chr7 (102-528)||(1901011-1901428)
chr7 (102-528)||(18303039-18303463)
chr7 (151-524)||(10441978-10442350)
chr7 (102-528)||(17739359-17739789)
chr7 (96-327)||(5199151-5199380)
chr7 (96-327)||(5208268-5208497)
chr7 (99-296)||(10449323-10449521)
chr7 (96-525)||(43600353-43600778)
chr7 (222-524)||(33533462-33533758)
chr7 (108-387)||(17211194-17211466)
chr7 (103-387)||(16227657-16227936)
chr7 (103-387)||(16244535-16244814)
chr7 (96-327)||(16545414-16545644)
chr7 (96-327)||(16620018-16620248)
chr7 (103-327)||(16120674-16120898)
chr7 (103-327)||(16147414-16147638)
chr7 (96-233)||(4940264-4940401)
chr7 (96-327)||(29081931-29082161)
chr7 (96-327)||(29096690-29096920)
chr7 (103-327)||(40679923-40680146)
chr7 (102-326)||(16909812-16910034)
chr7 (103-387)||(29023320-29023599)
chr7 (105-387)||(29031758-29032035)
chr7 (140-528)||(4323562-4323946)
chr7 (96-327)||(17514320-17514549)
chr7 (96-327)||(17538665-17538894)
chr7 (96-327)||(27965929-27966158)
chr7 (96-327)||(27975382-27975611)
chr7 (96-327)||(15185501-15185730)
chr7 (96-387)||(16889722-16890005)
chr7 (96-327)||(15200121-15200350)
chr7 (103-327)||(558434-558656)
chr7 (103-327)||(568344-568566)
chr7 (103-327)||(27435207-27435433)
chr7 (103-327)||(27444237-27444463)
chr7 (102-327)||(44075192-44075415)
chr7 (103-327)||(2548907-2549129)
chr7 (103-327)||(2562793-2563015)
chr7 (96-201)||(19384082-19384187)
chr7 (105-232)||(36476755-36476884)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (96-528)||(16775036-16775469)
chr8 (96-528)||(16760599-16761032)
chr8 (102-528)||(17662446-17662869)
chr8 (102-528)||(17681575-17681998)
chr8 (96-527)||(25585023-25585449)
chr8 (96-528)||(30939290-30939720)
chr8 (96-528)||(17528834-17529263)
chr8 (96-524)||(4837534-4837962)
chr8 (96-528)||(39836182-39836613)
chr8 (102-528)||(39844230-39844655)
chr8 (102-525)||(17975437-17975864)
chr8 (96-525)||(26871384-26871829)
chr8 (96-525)||(23923024-23923456)
chr8 (96-327)||(36248708-36248940)
chr8 (96-327)||(22103596-22103830)
chr8 (98-327)||(19850778-19851010)
chr8 (98-327)||(19856814-19857046)
chr8 (102-327)||(36252471-36252697)
chr8 (96-293)||(4583602-4583798)
chr8 (102-520)||(26912703-26913124)
chr8 (96-327)||(36576715-36576943)
chr8 (103-327)||(14204497-14204721)
chr8 (103-327)||(14219138-14219362)
chr8 (96-237)||(4842979-4843121)
chr8 (103-327)||(16190569-16190793)
chr8 (96-232)||(15832007-15832143)
chr8 (103-387)||(23092654-23092932)
chr8 (103-327)||(31000785-31001009)
chr8 (103-327)||(31207676-31207901)
chr8 (96-327)||(25719020-25719249)
chr8 (105-327)||(6582856-6583076)
chr8 (103-232)||(22418206-22418338)
chr8 (103-217)||(17129388-17129505)
chr8 (103-289)||(22366905-22367093)
chr8 (102-167)||(25796693-25796758)
chr8 (265-327)||(17129260-17129322)
chr8 (202-324)||(22023032-22023149)
chr8 (96-157)||(1388264-1388326)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (103-525)||(28459589-28460004)
chr1 (96-525)||(41744674-41745095)
chr1 (96-517)||(32135281-32135698)
chr1 (96-528)||(28991278-28991712)
chr1 (96-528)||(3431573-3432004)
chr1 (96-528)||(31540961-31541391)
chr1 (96-528)||(31549530-31549960)
chr1 (96-524)||(13804027-13804449)
chr1 (96-528)||(13451833-13452265)
chr1 (96-525)||(2384976-2385402)
chr1 (100-522)||(43455847-43456273)
chr1 (100-524)||(23355586-23356014)
chr1 (98-525)||(51055286-51055711)
chr1 (96-327)||(21497053-21497286)
chr1 (102-289)||(13477078-13477264)
chr1 (96-327)||(31553360-31553589)
chr1 (96-327)||(31562494-31562723)
chr1 (102-289)||(8241041-8241229)
chr1 (96-327)||(32608594-32608822)
chr1 (96-225)||(23952221-23952350)
chr1 (103-387)||(22472503-22472781)
chr1 (144-525)||(36848721-36849100)
chr1 (103-387)||(16135066-16135343)
chr1 (102-327)||(22479631-22479855)
chr1 (102-306)||(21054901-21055105)
chr1 (102-327)||(20502117-20502341)
chr1 (103-327)||(34336791-34337016)
chr1 (96-232)||(52101236-52101374)
chr1 (105-327)||(3350707-3350927)
chr1 (96-327)||(38123598-38123827)
chr1 (264-525)||(11950125-11950385)
chr1 (103-327)||(12464224-12464449)
chr1 (106-327)||(18702459-18702676)
chr1 (96-288)||(4282679-4282866)
chr1 (96-160)||(35097550-35097615)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (96-528)||(50826316-50826741)
chr3 (96-528)||(50849112-50849544)
chr3 (96-525)||(27550816-27551247)
chr3 (96-528)||(30062800-30063228)
chr3 (96-528)||(18949613-18950043)
chr3 (96-528)||(39706805-39707230)
chr3 (96-525)||(4435387-4435811)
chr3 (102-525)||(4456178-4456596)
chr3 (96-528)||(41016348-41016778)
chr3 (96-525)||(18900503-18900931)
chr3 (102-524)||(2256387-2256804)
chr3 (96-528)||(27339031-27339453)
chr3 (102-525)||(17364673-17365097)
chr3 (102-528)||(16814560-16814981)
chr3 (102-525)||(17360031-17360455)
chr3 (116-525)||(18890340-18890748)
chr3 (96-525)||(8196389-8196817)
chr3 (102-528)||(17935023-17935453)
chr3 (96-525)||(51922232-51922660)
chr3 (96-524)||(13507412-13507842)
chr3 (107-524)||(3711560-3711969)
chr3 (96-528)||(8153300-8153730)
chr3 (174-528)||(41007569-41007920)
chr3 (96-525)||(18040857-18041289)
chr3 (96-472)||(43468242-43468620)
chr3 (96-327)||(15696883-15697116)
chr3 (96-327)||(15711173-15711406)
chr3 (101-327)||(15694570-15694798)
chr3 (234-524)||(9183894-9184178)
chr3 (96-327)||(14425782-14426016)
chr3 (96-326)||(8204200-8204432)
chr3 (96-327)||(2215089-2215319)
chr3 (96-387)||(6293687-6293970)
chr3 (96-327)||(6563757-6563987)
chr3 (96-327)||(6577426-6577656)
chr3 (103-325)||(1004289-1004510)
chr3 (96-387)||(10720872-10721157)
chr3 (99-327)||(18351184-18351413)
chr3 (164-525)||(27958025-27958376)
chr3 (111-327)||(16290847-16291062)
chr3 (355-525)||(8223112-8223285)
chr3 (103-327)||(11918377-11918601)
chr3 (103-327)||(11932947-11933171)
chr3 (102-423)||(21185592-21185907)
chr3 (103-327)||(1480034-1480258)
chr3 (96-327)||(5144436-5144666)
chr3 (365-525)||(18886343-18886505)
chr3 (96-387)||(27978685-27978970)
chr3 (103-327)||(13274853-13275079)
chr3 (96-525)||(27884540-27884957)
chr3 (392-525)||(14536879-14537009)
chr3 (103-327)||(17562867-17563091)
chr3 (103-387)||(31278579-31278856)
chr3 (96-229)||(17630358-17630492)
chr3 (103-327)||(7063800-7064025)
chr3 (103-327)||(4503535-4503760)
chr3 (96-232)||(13847839-13847977)
chr3 (96-327)||(15675242-15675470)
chr3 (96-327)||(15683784-15684012)
chr3 (103-326)||(17616653-17616877)
chr3 (103-327)||(7096647-7096872)
chr3 (96-327)||(22951850-22952080)
chr3 (96-327)||(22965824-22966054)
chr3 (96-387)||(25264700-25264983)
chr3 (96-387)||(25274194-25274477)
chr3 (111-327)||(30102067-30102286)
chr3 (99-525)||(9567447-9567867)
chr3 (96-210)||(27957344-27957459)
chr3 (96-387)||(24216157-24216430)
chr3 (347-494)||(27880175-27880326)
chr3 (213-306)||(27957882-27957974)
chr3 (96-233)||(27880426-27880562)
chr3 (96-154)||(29730585-29730643)
chr3 (103-168)||(12468968-12469036)
chr3 (96-167)||(10713598-10713670)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (96-528)||(19826553-19826977)
chr6 (96-528)||(20530671-20531102)
chr6 (96-528)||(23927352-23927779)
chr6 (96-528)||(27537179-27537604)
chr6 (96-528)||(27551388-27551813)
chr6 (96-528)||(33299884-33300313)
chr6 (118-525)||(13827528-13827927)
chr6 (96-528)||(15389387-15389818)
chr6 (96-528)||(5996418-5996847)
chr6 (96-528)||(5487095-5487522)
chr6 (96-528)||(14475346-14475778)
chr6 (96-528)||(30823153-30823581)
chr6 (96-528)||(25993341-25993772)
chr6 (96-528)||(35090310-35090740)
chr6 (96-528)||(25552175-25552605)
chr6 (96-525)||(25713510-25713940)
chr6 (96-525)||(13491796-13492222)
chr6 (169-525)||(25692775-25693131)
chr6 (169-525)||(25699416-25699772)
chr6 (96-327)||(16302939-16303170)
chr6 (96-524)||(12451490-12451900)
chr6 (96-327)||(21708539-21708769)
chr6 (96-325)||(27047221-27047449)
chr6 (96-325)||(27057465-27057693)
chr6 (102-387)||(16588922-16589199)
chr6 (102-387)||(16606181-16606458)
chr6 (96-327)||(16635375-16635603)
chr6 (96-327)||(16645332-16645560)
chr6 (96-327)||(18205110-18205341)
chr6 (96-327)||(18220109-18220340)
chr6 (103-387)||(25653891-25654168)
chr6 (96-327)||(24485415-24485646)
chr6 (99-327)||(24920437-24920663)
chr6 (103-387)||(23982686-23982965)
chr6 (103-327)||(21358594-21358819)
chr6 (103-327)||(23962576-23962801)
chr6 (96-327)||(27960235-27960466)
chr6 (96-327)||(30995499-30995729)
chr6 (96-327)||(18111887-18112118)
chr6 (96-327)||(18126432-18126663)
chr6 (96-327)||(28304189-28304419)
chr6 (96-327)||(28266476-28266705)
chr6 (96-327)||(28345225-28345454)
chr6 (348-524)||(18753591-18753766)
chr6 (96-157)||(13827922-13827983)
chr6 (102-152)||(28267771-28267822)
chr6 (102-152)||(28346520-28346571)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (96-517)||(19225643-19226058)
chr5 (96-528)||(43596678-43597109)
chr5 (96-528)||(43629472-43629903)
chr5 (96-528)||(1726791-1727221)
chr5 (96-528)||(28844949-28845380)
chr5 (96-528)||(28853559-28853990)
chr5 (96-528)||(24955466-24955895)
chr5 (96-528)||(24963926-24964355)
chr5 (96-524)||(31412620-31413047)
chr5 (96-525)||(31423523-31423953)
chr5 (155-528)||(20370777-20371143)
chr5 (155-528)||(20396480-20396846)
chr5 (209-524)||(21931231-21931546)
chr5 (96-327)||(41093722-41093956)
chr5 (96-327)||(20377709-20377940)
chr5 (96-327)||(20386498-20386729)
chr5 (96-327)||(33835302-33835531)
chr5 (96-327)||(33844001-33844230)
chr5 (103-327)||(23039050-23039273)
chr5 (96-232)||(23348714-23348851)
chr5 (103-326)||(23984696-23984920)
chr5 (103-327)||(27064026-27064248)
chr5 (103-327)||(23637282-23637506)
chr5 (103-327)||(23827926-23828150)
chr5 (103-327)||(23835384-23835608)
chr5 (103-387)||(17642366-17642643)
chr5 (103-387)||(21850816-21851093)
chr5 (96-327)||(11812595-11812824)
chr5 (103-327)||(21986346-21986570)
chr5 (103-327)||(21994994-21995218)
chr5 (96-327)||(26078529-26078759)
chr5 (96-327)||(26088508-26088738)
chr5 (96-327)||(11802519-11802748)
chr5 (103-327)||(26177025-26177248)
chr5 (100-327)||(12170305-12170530)
chr5 (100-327)||(12179734-12179959)
chr5 (103-327)||(31548224-31548447)
chr5 (103-232)||(21856977-21857108)
chr5 (96-327)||(27223321-27223551)
chr5 (96-327)||(27232792-27233022)
chr5 (96-327)||(3476937-3477167)
chr5 (96-327)||(3491707-3491937)
chr5 (103-232)||(21858730-21858861)
chr5 (96-387)||(36458526-36458809)
chr5 (96-327)||(27220314-27220546)
chr5 (105-327)||(23762462-23762684)
chr5 (96-149)||(21931541-21931594)
chr5 (265-387)||(23025830-23025946)
chr5 (102-152)||(29190253-29190304)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (96-481)||(109202-109584)
scaffold0002 (279-528)||(122953-123197)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (96-525)||(4160-4587)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (96-525)||(188332-188759)
scaffold0015 (96-327)||(194718-194949)
scaffold0015 (96-232)||(159154-159290)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (96-525)||(19565-19998)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (96-525)||(10187-10613)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (164-524)||(38672-39028)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (96-443)||(29774-30116)
[»] scaffold0545 (1 HSPs)
scaffold0545 (243-525)||(8011-8293)
[»] scaffold1804 (1 HSPs)
scaffold1804 (102-282)||(1-180)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (96-327)||(10139-10373)
[»] scaffold1120 (1 HSPs)
scaffold1120 (353-525)||(1258-1428)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (264-525)||(12494-12753)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (96-327)||(9971-10202)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (96-256)||(4297-4458)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (96-327)||(112-340)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (104-400)||(32325-32622)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (244-525)||(19404-19677)
scaffold0007 (277-525)||(26354-26598)
scaffold0007 (102-152)||(63287-63338)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (96-327)||(4495-4727)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (362-528)||(25384-25550)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (99-387)||(63135-63416)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (99-327)||(46624-46852)
[»] scaffold1481 (1 HSPs)
scaffold1481 (103-327)||(1457-1681)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (96-327)||(14832-15064)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (96-232)||(465-603)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (99-232)||(80513-80648)
scaffold0044 (99-232)||(64111-64246)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (103-387)||(83332-83612)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (96-232)||(21623-21760)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (103-327)||(3750-3974)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (96-232)||(145452-145591)
scaffold0023 (96-220)||(136490-136617)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (359-525)||(33159-33315)
scaffold0156 (96-158)||(29741-29803)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (103-194)||(22888-22980)
[»] scaffold1547 (1 HSPs)
scaffold1547 (203-327)||(1542-1662)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (96-154)||(2381-2439)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (96-154)||(22102-22160)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 34528018 - 34528451
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34528018 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 34528117  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528118 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 34528216  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34528217 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg--aaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagg 34528314  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34528315 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttggg 34528414  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34528415 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 34528451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 34541992 - 34542425
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34541992 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 34542091  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542092 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 34542190  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34542191 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg--aaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagg 34542288  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34542289 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttggg 34542388  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34542389 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 34542425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44375240 - 44374811
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
T  44375240 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaa 44375141  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375140 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 44375042  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375041 aaaaagtttcttttttgtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 44374947  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44374946 gtgaggttggtcagattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttggg 44374848  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44374847 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 44374811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44390821 - 44390392
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
T  44390821 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaa 44390722  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390721 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 44390623  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390622 aaaaagtttcttttttgtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 44390528  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44390527 gtgaggttggtcagattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttggg 44390429  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44390428 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 44390392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 6856129 - 6856557
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6856129 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 6856228  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856229 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 6856327  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6856328 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttatgatttttg-----aaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 6856422  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6856423 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggt 6856521  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6856522 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 6856557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 100 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 25496031 - 25495612
Alignment:
Q  100 cataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25496031 cataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttact-gaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 25495933  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25495932 atgtttttggttatttttatttgatttggaaagataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 25495834  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||          |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25495833 atttctttggtgggttaggttgattttaa-ttttttg-----aaaatggttttaagaagagataagaagcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggt 25495740  T
Q  399 tggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttgggttaca 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25495739 tggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaaggaaataaaaggaaaaaaacacttgggttaca 25495640  T
Q  497 aaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  25495639 agccaaggtttattaaaaaaatattttt 25495612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 26717678 - 26718098
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26717678 taggaacctcttacctaatttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagta 26717777  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717778 tgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 26717876  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26717877 tttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt 26717969  T
Q  400 ggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  26717970 ggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaa 26718068  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26718069 ccaaggtttattaagaaaatattttgggag 26718098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 26731811 - 26732231
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26731811 taggaacctcttacctaatttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagta 26731910  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731911 tgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 26732009  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26732010 tttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt 26732102  T
Q  400 ggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  26732103 ggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaa 26732201  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732202 ccaaggtttattaagaaaatattttgggag 26732231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 41232487 - 41232917
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41232487 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 41232586  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41232587 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 41232685  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  41232686 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 41232780  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  41232781 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 41232880  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41232881 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 41232917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35040140 - 35039713
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35040140 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 35040041  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35040040 agcat-tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcatctaa 35039943  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35039942 aaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 35039848  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  35039847 gaggttggtcggattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggt 35039749  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35039748 tacaaatcaaggtttattaagaaaatatttttggag 35039713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 20364701 - 20365135
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20364701 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggaggagaag 20364800  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20364801 aagtatgtttttggtcatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccaa 20364899  T
Q  295 aagaatt--tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20364900 aaaagttactttttggtgggttaggttgattttaagattttt---taaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 20364995  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa---acactt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20364996 tgaggttggtcaaattttaattacaaaaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagggacactt 20365095  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20365096 gggttaccagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 20365135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35148400 - 35147970
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35148400 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 35148301  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35148300 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 35148202  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  35148201 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 35148107  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35148106 tgagattgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 35148007  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35148006 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 35147970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 17685107 - 17685538
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17685107 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 17685206  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685207 aagtatgtttttggttatttttatttgaattggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 17685305  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||            ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17685306 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt--ttgaaaatgagtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 17685402  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17685403 tgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttggg 17685501  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17685502 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatacttttggag 17685538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 42564548 - 42564979
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42564548 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 42564647  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42564648 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 42564746  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  42564747 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 42564841  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  42564842 gtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgg 42564941  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42564942 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 42564979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 42573172 - 42573603
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42573172 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 42573271  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42573272 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 42573370  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  42573371 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 42573465  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  42573466 gtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgg 42573565  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42573566 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 42573603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24293630 - 24293204
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  24293630 attccgtaagaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagagagaag 24293531  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293530 aagtatgtttttggttatttttatttgatttgaaaggataacaatcctctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 24293432  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24293431 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagg 24293339  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaac-acttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24293338 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgg 24293239  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24293238 gttacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 24293204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35140059 - 35139629
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35140059 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 35139960  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35139959 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 35139861  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  35139860 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttacgatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 35139766  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35139765 tgagattgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 35139666  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35139665 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 35139629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24287062 - 24286636
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  24287062 attccgtaagaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagggagaag 24286963  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24286962 aagtatgtttttggttatttttatttgatttgaaaggataacaatcctctgcctacatacctttaaag-aaaagggatcaaaaccaatatagttcaccta 24286864  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24286863 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagg 24286771  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaac-acttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24286770 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgg 24286671  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24286670 gttacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 24286636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 96 - 527
Target Start/End: Original strand, 15943160 - 15943591
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15943160 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 15943259  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943260 aagtatgtttttggttatttttatttgacttggaaggataaaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 15943358  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataa 390  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15943359 tcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataa 15943453  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
     ||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  15943454 ggtgagattgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttg 15943553  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttgga 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15943554 ggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgga 15943591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 96 - 527
Target Start/End: Original strand, 15951670 - 15952102
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15951670 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 15951769  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat---aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951770 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 15951868  T
Q  292 ctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaata 389  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  15951869 ctcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggtatgagagaaaaaata 15951963  T
Q  390 aagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacactt 488  Q
    | ||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  15951964 aggtgagattgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacactt 15952063  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttgga 527  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15952064 gggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgga 15952102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 99 - 482
Target Start/End: Original strand, 26896703 - 26897083
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26896703 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 26896802  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896803 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaagtcctctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 26896901  T
Q  297 gaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
     | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26896902 aagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtg 26896994  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896995 aggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa 26897083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 193 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20623692 - 20623360
Alignment:
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20623692 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcacc 20623594  T
Q  293 taaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataa 390  Q
    |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||          |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20623593 taaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatg----ggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcgtgagataaaataa 20623499  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623498 ggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctactatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttg 20623399  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20623398 ggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 20623360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20920914 - 20920483
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20920914 taggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattgcctaaacatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 20920815  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20920814 gtttttggttatttttatttgatttggaaggacaaaaatcctttccctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcgcctaaaaaat 20920717  T
Q  301 ttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaag------ggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa- 391  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||           ||||||||||||      | ||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  20920716 ttctttttggtgggttagattgattttaatattttt---tgaaaaaaggttttaagaagagataagaataagaggcctcaaggcataagagaaaaaaaaa 20920620  T
Q  392 -----gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaca 485  Q
          ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20920619 aaaagatgatgttggtcaaattttaattacaagaaatttaagtctaatatggatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaca 20920521  T
Q  486 cttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20920520 ctt--gctgcaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 20920483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 42247647 - 42247880
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42247647 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 42247746  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247747 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcatacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 42247845  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42247846 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 42247880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16274852 - 16274631
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  16274852 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg----agaagaagtat 16274757  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16274756 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaat 16274658  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16274657 ttctttggtgggttaggttgattttaa 16274631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16284028 - 16283807
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  16284028 aggaaccgcttacctagattatcttgtgcaaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg----agaagaagtat 16283933  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16283932 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaat 16283834  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16283833 ttctttggtgggttaggttgattttaa 16283807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 140 - 525
Target Start/End: Original strand, 17095634 - 17096007
Alignment:
Q  140 ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaat 239  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17095634 ttgcttatttgaaaattattgc-taagagtctaagtgaaagaatggggg---aagaagtatgtcttttgttgtttttatttgatttggaaggattaac-t 17095728  T
Q  240 cctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnn 339  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||        
T  17095729 cttttgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcctgtaaagaatttctttggtgggttggattgattttaa-atttttgaaaa 17095826  T
Q  340 nnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaa 438  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |    
T  17095827 tt-----gttttaagaagggataagaggcctcaagacatgagagaaaataagatgaggttgatcaaattttaattataagaaacccaagtctaatatgga 17095921  T
Q  439 tgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  17095922 tgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacatttgggttaaaatcgaaggtttattaagaaaatatttttg 17096007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28481428 - 28481201
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28481428 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 28481329  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||    
T  28481328 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaa 28481232  T
Q  297 gaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481231 aaatttctttggtgggttaggttgattttaa 28481201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 30524690 - 30524972
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30524690 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaaga 30524789  T
Q  196 agtatgtttttgg-ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||     
T  30524790 agtatgtttttggtttatttttatttgatttggaagg--acaagccctctgcctacgtacccttttgg--gaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 30524885  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30524886 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 30524972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 34068843 - 34069069
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34068843 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcaaa----aaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaag 34068937  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34068938 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccctgcctatatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 34069034  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34069035 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 34069069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 10681504 - 10681728
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10681504 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattatcacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 10681603  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||    
T  10681604 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaat 10681701  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10681702 ttctttggtgggttaggttgattttaa 10681728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 525
Target Start/End: Original strand, 17069159 - 17069464
Alignment:
Q  212 tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17069159 tttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttctcgtgaagaatttctttggtgg 17069256  T
Q  312 gttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaatttta 411  Q
    ||| | |||||||||| | |||||          |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17069257 gttggattgattttaa-atttttgaaaat-----ggttttaagaagagatatgaggcctcaagacatgggagaaaataagatgaggttgatcaaatttta 17069350  T
Q  412 attacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcatt 510  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||    
T  17069351 attataagaaacccaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttaaactcgaaggtttatt 17069449  T
Q  511 aagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||    
T  17069450 aagaaaatatttttg 17069464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 212 - 525
Target Start/End: Original strand, 17075152 - 17075457
Alignment:
Q  212 tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17075152 tttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttcaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttctcgtgaagaatttctttggtgg 17075249  T
Q  312 gttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaatttta 411  Q
    ||| | |||||||||| | |||||          |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17075250 gttggattgattttaa-atttttgaaaat-----ggttttaagaagagatatgaggcctcaagacatgggagaaaataagatgaggttgatcaaatttta 17075343  T
Q  412 attacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcatt 510  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||    
T  17075344 attataagaaacccaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttaaactcgaaggtttatt 17075442  T
Q  511 aagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||    
T  17075443 aagaaaatatttttg 17075457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21151520 - 21151291
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21151520 attccataggaacctcttacctagattatattgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaa 21151422  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  21151421 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaatcgacgtagttccacc 21151325  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21151324 caaa-aatttctatggtgggttaggttgattttaa 21151291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 21850302 - 21850527
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21850302 aggaaccgcttacttaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21850401  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  21850402 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 21850499  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21850500 tttctttagtgggttaggctgattttaa 21850527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 21858737 - 21858962
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21858737 aggaaccgcttacttaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21858836  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  21858837 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 21858934  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21858935 tttctttagtgggttaggctgattttaa 21858962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34685778 - 34685555
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34685778 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 34685680  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  34685679 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 34685583  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685582 tttctttggtgggttaggttgattttaa 34685555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15600819 - 15600587
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15600819 attccgtaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaatttatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 15600720  T
Q  194 gaagtatgtttttggttat-ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  15600719 gaagtatgtttttggttattttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 15600622  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15600621 tcaagaatttccttggtgggttaggttgattttaa 15600587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 396
Target Start/End: Original strand, 27681103 - 27681394
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa--ttattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaag 197  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27681103 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattaccaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaag 27681202  T
Q  198 tatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |||||     
T  27681203 tatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaa 27681300  T
Q  298 aatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgag 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  27681301 aatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaaaaaaatgag 27681394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22187413 - 22187188
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  22187413 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagcaggagta 22187314  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| | ||||| |||||||   |  ||||||||||||||  | |||||||  || || ||    
T  22187313 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctacctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccactcaaaaa 22187216  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22187215 tttctttggtgggttaggttgattttaa 22187188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42245627 - 42245347
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42245627 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 42245529  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||   ||   || ||||||||||||||| | |||||||  |||||     
T  42245528 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccctttttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaa 42245431  T
Q  298 aatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42245430 aatttctttggtgggttaggttggttttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 42245347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29855428 - 29855198
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  29855428 attccataggaacctcttacctaaattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 29855330  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||  | |||||||  ||    
T  29855329 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccact 29855232  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855231 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 29855198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 31354892 - 31355115
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31354892 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtat 31354991  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  31354992 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 31355088  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31355089 ttctttggtgggttaagttgattttaa 31355115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34708200 - 34707978
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34708200 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 34708102  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  34708101 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgg--gaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaa 34708006  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34708005 tttctttggtgggttaggttgattttaa 34707978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42386204 - 42385921
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386204 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 42386106  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  42386105 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 42386008  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42386007 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 42385921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42401088 - 42400805
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42401088 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 42400990  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  42400989 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 42400892  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42400891 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 42400805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35304786 - 35304648
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35304786 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaa 35304687  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35304686 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 35304648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34437175 - 34436946
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34437175 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 34437077  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  34437076 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 34436979  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34436978 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 34436946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 11622221 - 11622446
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11622221 aggaaccgcttacttagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtat 11622320  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc-cttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||| ||||  ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  11622321 gtttttggttgtttttatttgatttgggagg--acaagtcctctgcctacgtaccattttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 11622418  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11622419 tttctttggtgggttaggttgattttaa 11622446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 33306727 - 33306957
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  33306727 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaaaaaattgcttatttgaaaaattattacctgaac-tctaagtgaaagaatggagggagaa 33306825  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  33306826 gaagtatgtttttagttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttaggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 33306923  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33306924 caaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 33306957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3755057 - 3755285
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||  |||||   ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3755057 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcctaatg-tctaaatgaaagaatggagggagaag 3755155  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  3755156 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 3755252  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3755253 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 3755285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3765108 - 3765336
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||  |||||   ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3765108 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcctaatg-tctaaatgaaagaatggagggagaag 3765206  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  3765207 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 3765303  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3765304 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 3765336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2653117 - 2652889
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||  |||||   ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  2653117 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaattatcgcctaatg-tctaaatgaaaggatggagggagaag 2653019  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  2653018 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 2652922  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2652921 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 2652889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21111446 - 21111029
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21111446 attccgtaggaacctcttgcctaaattatcttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattattgc-taagagtctaggtggaagaatgggggtagaag 21111348  T
Q  195 aagtatgtttttg--gttatttttatttgatttgg-aaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 291  Q
    || |||||||||   ||| || ||||||||||| | |||||||||  || | ||||||| ||| || ||      ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  21111347 aaatatgttttttttgttgttgttatttgattttgtaaggataaa--tcatttgcctacgtactctcaag-----agggatcaaaatcaa-gtagttctc 21111256  T
Q  292 ---ctaaagaatt-tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
       | ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111255 tctcaaaaaaattatttttggtgggttagattgattttaacatttttgaaaaaaaat--gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 21111158  T
Q  388 taaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacac 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||  || |||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  21111157 taagatgaggttggtcaaattttaattataagaaacccaaatctaatatagatattaaattgattaaacatttgattaagaaaa-aaaagg-aaaaacaa 21111060  T
Q  487 ttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaa 517  Q
    |||||||| || |||| ||| | ||||||||    
T  21111059 ttgggttaaaatccaaagtttaataagaaaa 21111029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 457 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44374551 - 44374481
Alignment:
Q  457 tttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44374551 tttgattaagaaaataaaaggaaaaa-cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 44374481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 17069063 - 17069117
Alignment:
Q  140 ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17069063 ttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaagtgaaagaatgggggaagaag 17069117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 1875516 - 1875949
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1875516 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 1875615  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875616 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 1875714  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875715 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 1875811  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1875812 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgg 1875911  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1875912 gttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 1875949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 1889631 - 1890064
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1889631 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 1889730  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1889731 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 1889829  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1889830 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 1889926  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1889927 tgaggttggtc-aattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttg 1890025  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1890026 ggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 1890064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 96 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 773381 - 772960
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  773381 attccataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 773282  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773281 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 773183  T
Q  296 agaatt--tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||  | ||||||||||| |||||||||||   |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  773182 aaagtttatttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcacgagataaaataaggt 773090  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  773089 gaggttagtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacccttgggt 772991  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttt 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  772990 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 772960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 12425388 - 12425815
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  12425388 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaa 12425487  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12425488 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 12425586  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagt 393  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||  |    
T  12425587 aaaaatttctttgatgggttaggttgattttaagaatttt----tgaaaatggttttaagaaaaga-aagaggcctcaagtcatgagagaaaaataagat 12425681  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaac-acttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12425682 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttggg 12425781  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12425782 ttacgaaccacggtttattaagaaaatatttttg 12425815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10640578 - 10640153
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10640578 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacttaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaaga 10640479  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640478 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 10640380  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||| ||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10640379 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgacttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 10640287  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaag--gaaaaaacacttgg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10640286 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaaacacttgg 10640187  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10640186 gttacaagccaaggtttattaagaaaatattttt 10640153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 8092908 - 8093336
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8092908 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaaga 8093007  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8093008 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctga 8093106  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8093107 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt---tagaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 8093200  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  8093201 gaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttggg 8093299  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8093300 ttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 8093336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 8101713 - 8102141
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8101713 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaaga 8101812  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8101813 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctga 8101911  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8101912 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt---tagaaaatggtttcaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 8102005  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  8102006 gaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttggg 8102104  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8102105 ttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 8102141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12998763 - 12998337
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12998763 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggataaga 12998664  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12998663 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaattcttttgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 12998565  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12998564 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaagcctcaaggcatgagataaaataaagt 12998472  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa---cacttg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  12998471 gaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagcaacttg 12998372  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12998371 ggttacaaaccaaggtttattaaaaaaatattttt 12998337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 21530277 - 21530710
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacc-taaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21530277 attccgtaggaacctcttaccctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaa 21530376  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21530377 gaagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 21530475  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21530476 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt----tgaaaatggttttaagaaaggataagaggcctcgaggcatgagagaaaataag 21530571  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa----acac 486  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  21530572 atgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaggacac 21530671  T
Q  487 ttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21530672 ttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttg 21530710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 27341684 - 27342107
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27341684 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttact-gaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 27341782  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341783 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 27341881  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||| |||||  ||||||           | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27341882 aaaaatttctttttggtgggtt-ggttgctttta--aatttt---agaaaatggtttttaagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 27341974  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27341975 tgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttggg 27342073  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27342074 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 27342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 52297922 - 52297571
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52297922 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 52297823  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297822 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccttttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 52297724  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||           || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52297723 aaaagtttctttttggtgggttaagttgattttaagattttt--ttgaaaatggggttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 52297627  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattca 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52297626 tgaggttggtcaaattttaattacaataaatcaagtctattatgaatattaattca 52297571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Original strand, 20865831 - 20866021
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20865831 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaaa 20865930  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20865931 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaatcaatgtagt 20866021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 4747573 - 4747803
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||| |    
T  4747573 attccataggaacctcttgcctaaattatcttgtgctaagttacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagga 4747671  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4747672 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 4747769  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4747770 caaaaatttctttggtgggttaggttggttttaa 4747803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 55584329 - 55584559
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  55584329 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttggaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagag 55584428  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55584429 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttcgaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 55584525  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55584526 caaaaatttctttggttggttaggttgattttaa 55584559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 255
Target Start/End: Original strand, 4522386 - 4522545
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522386 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 4522485  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522486 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 4522545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Original strand, 26210555 - 26210782
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26210555 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagt 26210654  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |||||     
T  26210655 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaa 26210752  T
Q  298 aatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26210753 aatttctttggtgggttaggttggttttaa 26210782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Original strand, 26219315 - 26219542
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219315 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagt 26219414  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |||||     
T  26219415 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaa 26219512  T
Q  298 aatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26219513 aatttctttggtgggttaggttggttttaa 26219542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 346 - 525
Target Start/End: Original strand, 20866046 - 20866220
Alignment:
Q  346 ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaat 445  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     || ||||||||| |||||    
T  20866046 ggttttaagaaggaataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttagtcaaattttaattacaagaaaa----tcaattatgaatattaat 20866141  T
Q  446 tcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20866142 tcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacccttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 20866220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 21398999 - 21399278
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21398999 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatat 21399098  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||    
T  21399099 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaat 21399195  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21399196 ttctttggtgggttaggttgattttaagattttt---ttgaaaatggttttaagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 21399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 25247334 - 25247559
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25247334 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 25247433  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  25247434 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 25247531  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  25247532 attctttggtgggttaggttgattttaa 25247559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18010273 - 18009988
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  18010273 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaa 18010174  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  18010173 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 18010077  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18010076 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 18009988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 26034133 - 26034271
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26034133 attccataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 26034232  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26034233 aagaatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat 26034271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10786844 - 10786621
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10786844 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 10786746  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  10786745 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttg-gaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 10786649  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10786648 tttctttagtgggttaggttgattttaa 10786621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19760011 - 19759787
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19760011 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 19759913  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  19759912 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 19759815  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19759814 tttctttggtgggttaagttgattttaa 19759787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19774767 - 19774543
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19774767 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 19774669  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  19774668 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 19774571  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19774570 tttctttggtgggttaagttgattttaa 19774543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 19645042 - 19645320
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19645042 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 19645140  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || ||    
T  19645141 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaa 19645237  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19645238 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 19645320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34842883 - 34842659
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  34842883 aggaaccgcttacatagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaaggagta 34842784  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  34842783 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 34842687  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  34842686 attctttggtgggttaggttgattttaa 34842659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 14718676 - 14718963
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14718676 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtat 14718775  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||   ||   |  ||||||||||||||| | |||||| |||  |||    
T  14718776 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaa 14718873  T
Q  297 gaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||           |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14718874 aaatttctttggtgggttaggttggttttaagattttttttgaaaaaaaggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 14718963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 223
Target Start/End: Original strand, 21811045 - 21811167
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21811045 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21811143  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21811144 tgtttttggttatttttatttgat 21811167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 25652618 - 25652753
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25652618 attccgtagaaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgggtacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagaaaa 25652717  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 229  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25652718 gaaatatgtttttgattatttttatttgatttggaa 25652753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Original strand, 14736961 - 14737064
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14736961 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtat 14737060  T
Q  201 gttt 204  Q
    ||||    
T  14737061 gttt 14737064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24924638 - 24924585
Alignment:
Q  274 aaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24924638 aaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 24924585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 387
Target Start/End: Original strand, 14737083 - 14737205
Alignment:
Q  265 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa-tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataa 363  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||           |||||||||||| || ||    
T  14737083 aaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaatttctttggtgggttaggttggttttaagattttttttgaaaaaaaggttttaagaagaga-aa 14737181  T
Q  364 gaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  14737182 gaggcctcaaggcatgagataaaa 14737205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 4661856 - 4662290
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4661856 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaaga 4661955  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4661956 agtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaattctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 4662054  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaag 392  Q
    | ||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4662055 aaaatttctttttggtgggttggattaattttaacaattttgtaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcataagagaaaaataaag 4662154  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4662155 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggt 4662253  T
Q  493 tacaaaccaaggttca-ttaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4662254 tacaaaccaaggtttatttaagaaaatatttttggag 4662290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13832941 - 13832513
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13832941 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 13832842  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13832841 agtatgtttttggtta-ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctca 13832744  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaagt 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  13832743 aaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggt 13832649  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  13832648 gaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggt 13832549  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13832548 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 13832513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13840971 - 13840543
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13840971 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 13840872  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13840871 agtatgtttttggtta-ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctca 13840774  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaagt 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  13840773 aaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggt 13840679  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  13840678 gaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggt 13840579  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13840578 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 13840543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 24186105 - 24186525
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24186105 taggaacctcttacctaatttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagta 24186204  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186205 tgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 24186303  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24186304 tttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt 24186396  T
Q  400 ggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  24186397 ggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaa 24186495  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24186496 ccaaggtttattaagaaaatattttgggag 24186525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 1886910 - 1887327
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1886910 taggaacctcttacctaatttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggg---aagaagta 1887006  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1887007 tgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 1887105  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1887106 tttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt 1887198  T
Q  400 ggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1887199 ggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaa 1887297  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1887298 ccaaggtttattaagaaaatattttgggag 1887327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 1901011 - 1901428
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1901011 taggaacctcttacctaatttatctttgtgctaaattcattgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggg---aagaagta 1901107  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901108 tgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 1901206  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1901207 tttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt 1901299  T
Q  400 ggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1901300 ggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaa 1901398  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1901399 ccaaggtttattaagaaaatattttgggag 1901428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 18303039 - 18303463
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18303039 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtat 18303138  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18303139 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagt 18303237  T
Q  301 ttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18303238 ttctttttggtgggttaggttgattttaa-aatttt--ttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggt 18303333  T
Q  399 tggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaa 497  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18303334 tggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaa 18303432  T
Q  498 accaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18303433 accaaggtttattaagaaaatatttttggag 18303463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 151 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10442350 - 10441978
Alignment:
Q  151 aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442350 aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 10442251  T
Q  251 atacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggt 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||            |||    
T  10442250 atacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaacaattt---aaaaaaaaaggt 10442156  T
Q  349 tttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattc 447  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442155 tttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattc 10442056  T
Q  448 aattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10442055 aattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaataatttt 10441978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 17739359 - 17739789
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739359 taggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 17739458  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17739459 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taactccttttcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaa 17739556  T
Q  300 tttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagtgag 396  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||          |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  17739557 gttctttttggtgggttagattgattttaataattttgaaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgag 17739656  T
Q  397 gttggtcaaattttaattacaa--gaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17739657 gttggtcaaattttaattaaaaagaaaattaagtctaatatggatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaa-gaaaaaacaattgggtta 17739755  T
Q  495 caaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17739756 caaagcaaggtttattaagaaaatatttttggag 17739789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 5199151 - 5199380
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5199151 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 5199249  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5199250 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 5199347  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5199348 aaaaatttctttggtgggttaggttggttttaa 5199380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 5208268 - 5208497
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5208268 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 5208366  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5208367 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 5208464  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5208465 aaaaatttctttggtgggttaggttggttttaa 5208497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10449521 - 10449323
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10449521 ccataggaatctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 10449422  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449421 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 10449323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 43600778 - 43600353
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  43600778 attccgtaggaacctattgcctaacttatcttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaag 43600679  T
Q  195 aagtatgtttttg-gttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||| || | ||  ||||||||||||   |||||||  ||    
T  43600678 aagtatgtttttttgttgtttttatttgatttggaaggataaa--tcctttgactacgtaccctaaagggaa--gggatcaaaaccgtcgtagttccact 43600583  T
Q  294 aaagaatt-tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
     || | || | ||||||||||| | |||||||||||| |||||           ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43600582 caaaagttctttttggtgggttggattgattttaacatttttgaaaaaaa----gttttaagaagagctaagaggcctcaaggcatgagagaaaataaga 43600487  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43600486 tgagattggctaaattttaattataagaaatccaagtctaatatggaggttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 43600387  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  43600386 ttaaaatccaaggtttcttaagaaaatatttttg 43600353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 222 - 524
Target Start/End: Original strand, 33533462 - 33533758
Alignment:
Q  222 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttga 321  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  33533462 atttggaaggattaac-tcctttgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcccctaaggaatttctttggtgggttggattga 33533559  T
Q  322 ttttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaa 421  Q
    |||||  | |||||          ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33533560 ttttagaagttttgaaaat-----ggtttgaagaagagataagaggcttcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaa 33533654  T
Q  422 a-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatat 520  Q
    | ||||||||| |||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  33533655 attcaagtctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcacttgggttaaaatccaaggtttactaagaaaatat 33533754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17211466 - 17211194
Alignment:
Q  108 cctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttt 205  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17211466 cctcttacctagattatcctgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 17211367  T
Q  206 tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17211366 tggttatttttatttgatttggaagga-atgattcccctgcctacatacccttgaag--aaacggatcaaaacccatgtagttcacctcaaaaatttctt 17211270  T
Q  306 tggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17211269 tggtggattaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 17211194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16227936 - 16227657
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16227936 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 16227837  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  16227836 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 16227739  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16227738 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16227657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16244814 - 16244535
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16244814 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 16244715  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  16244714 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 16244617  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16244616 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16244535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16545644 - 16545414
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16545644 attccataggaacctcttacctatattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 16545545  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  16545544 gaagtatgtttctgattatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 16545448  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16545447 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 16545414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 16620018 - 16620248
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16620018 attccataggaacctcttacctatattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 16620117  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  16620118 gaagtatgtttctgattatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 16620214  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620215 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 16620248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 16120674 - 16120898
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16120674 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 16120772  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  16120773 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaa 16120870  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120871 tttctttggtgggttaggttgattttaa 16120898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 16147414 - 16147638
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16147414 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 16147512  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  16147513 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaa 16147610  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147611 tttctttggtgggttaggttgattttaa 16147638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 4940264 - 4940401
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4940264 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaagttcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaaga 4940363  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4940364 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat 4940401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29082161 - 29081931
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29082161 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaa 29082063  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  29082062 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 29081965  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29081964 caaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 29081931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29096920 - 29096690
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29096920 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaa 29096822  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  29096821 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 29096724  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29096723 caaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 29096690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40680146 - 40679923
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40680146 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 40680047  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  40680046 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 40679950  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40679949 ttctttggtgggctaggttgattttaa 40679923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 16909812 - 16910034
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16909812 taggaacctcttacctaacttatcttgtgctaaaatcatttgcttacttgaaaattgttagctaaaaatctaagtgaaagagtggagggggaagaagtat 16909911  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||    
T  16909912 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctttgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttcccctcaaaaat 16910008  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgatttta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16910009 ttctttggtgggttaggttgatttta 16910034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29023599 - 29023320
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29023599 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 29023501  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || ||    
T  29023500 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggat--aagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaa 29023403  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29023402 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 29023320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29032035 - 29031758
Alignment:
Q  105 gaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29032035 gaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 29031937  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || ||||    
T  29031936 tttttggttatttttatttgatttggaaggat--aagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatt 29031839  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29031838 tctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 29031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4323946 - 4323562
Alignment:
Q  140 ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt----tggaaggataa 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||       
T  4323946 ttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctagatgaaagaaaggggggagaagaagtatgtttttg-ttgtttttatttgattgatttggaaggaatg 4323848  T
Q  236 aaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaatttt 334  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||      || ||||||| || |||||||| | || || ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4323847 aaatcctttgcctacatatccacaaat-----ggaatcaaaatcattgtagttctctctcaaaaatta-tttggtgggttagattgattttaacattttt 4323754  T
Q  335 gnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag-tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctat 432  Q
    |          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||| |||     
T  4323753 gaaaaaaa---ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaagttggttaa-ttttaattgcaagaaatccaagcctaa 4323658  T
Q  433 tatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4323657 tatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttaaaatccaaggtttaataagaaaatatttttggag 4323562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 17514320 - 17514549
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17514320 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 17514418  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  17514419 aagtatggttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 17514516  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17514517 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 17514549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17538894 - 17538665
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17538894 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 17538796  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  17538795 aagtatggttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 17538698  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538697 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 17538665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 27965929 - 27966158
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27965929 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 27966027  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  27966028 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 27966125  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27966126 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27966158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 27975382 - 27975611
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27975382 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 27975480  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  27975481 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 27975578  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975579 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27975611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15185730 - 15185501
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat--tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  15185730 attccataggaacctcttacctaaattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaaatattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 15185632  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||    
T  15185631 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttg-ggaagggatcaaaaccgacgtagttccact 15185535  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185534 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 15185501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 16889722 - 16890005
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16889722 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaagctacttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 16889820  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  16889821 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 16889918  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16889919 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16890005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15200350 - 15200121
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat--tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  15200350 attccataggaacctcttacctaaattattttgtgctaaactacttctttatttgaaaaaaatattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 15200252  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||    
T  15200251 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttg-ggaagggatcaaaaccgacgtagttccact 15200155  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200154 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 15200121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 558434 - 558656
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  558434 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 558532  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  558533 cttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatt 558630  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  558631 tctttggtgggttaggttgattttaa 558656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 568344 - 568566
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  568344 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 568442  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  568443 cttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatt 568540  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  568541 tctttggtgggttaggttgattttaa 568566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27435433 - 27435207
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |    
T  27435433 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaatt 27435334  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |    
T  27435333 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaa 27435236  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27435235 atttctttagtgggttaggttgattttaa 27435207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27444463 - 27444237
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |    
T  27444463 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaatt 27444364  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |    
T  27444363 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaa 27444266  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27444265 atttctttagtgggttaggttgattttaa 27444237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 44075192 - 44075415
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44075192 taggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctgagtgaaagaatggagggagaagaagtat 44075290  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  44075291 gtttttggttatttttatttgatttgggagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 44075388  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44075389 ttctttggtgggttaggttgattttaa 44075415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2549129 - 2548907
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2549129 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 2549031  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||||    
T  2549030 cttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatt 2548933  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2548932 tctttggtgggttaggttgattttaa 2548907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2563015 - 2562793
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2563015 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 2562917  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||||    
T  2562916 cttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatt 2562819  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2562818 tctttggtgggttaggttgattttaa 2562793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 19384082 - 19384187
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19384082 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaag 19384180  T
Q  195 aagtatg 201  Q
    |||||||    
T  19384181 aagtatg 19384187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 36476755 - 36476884
Alignment:
Q  105 gaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtt 203  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||  ||| | ||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36476755 gaaccgcttacctaaattatcatttgctaaattacttgttcatttgaaaaattattgcccaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 36476853  T
Q  204 tt-tggtta-tttttatttgatttggaagga 232  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||    
T  36476854 ttgttgttattttttatttgatttggaagga 36476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16775469 - 16775036
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16775469 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 16775370  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775369 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 16775271  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775270 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 16775174  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttgg 490  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16775173 tgcggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgg 16775074  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16775073 gttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 16775036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16761032 - 16760599
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16761032 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 16760933  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760932 aagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctatatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 16760834  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760833 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 16760737  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttgg 490  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16760736 tgcggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgg 16760637  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16760636 gttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 16760599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 17662446 - 17662869
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662446 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 17662545  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17662546 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaacctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtt 17662644  T
Q  302 tc--tttggtgggttaggttgattttaaca-attttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||           |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17662645 tctttttggtgggttaggttgattttaagatatttt---tgaaaatgggtttttagagggga-aagaggcctcaaggcatgaaagaaaataaagtgaggt 17662740  T
Q  399 tggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17662741 tggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttataaa 17662839  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662840 ccaaggtttattaagaaaatatttttggag 17662869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 17681575 - 17681998
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681575 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 17681674  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17681675 tttttggttatttttatttgatttggaatgataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtt 17681773  T
Q  302 tc--tttggtgggttaggttgattttaaca-attttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||           |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17681774 tctttttggtgggttaggttgattttaagatatttt---tgaaaatgggtttttagagggga-aagaggcctcaaggcatgaaagaaaataaagtgaggt 17681869  T
Q  399 tggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17681870 tggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttataaa 17681968  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17681969 ccaaggtttattaagaaaatatttttggag 17681998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 96 - 527
Target Start/End: Original strand, 25585023 - 25585449
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  25585023 attccgtaggaacctcttacctaaattaccttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagagtggagggagaaga 25585122  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25585123 agtatatttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 25585221  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtga 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25585222 agaatttctttggcgggttaggttgattttaattttttt----tttaaatagttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtga 25585317  T
Q  396 ggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 494  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25585318 ggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggtta 25585416  T
Q  495 caaaccaaggttcattaagaaaatatttttgga 527  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25585417 caaaccaaggtttattaagaaactatttttgga 25585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30939720 - 30939290
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30939720 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 30939621  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30939620 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 30939522  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  30939521 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 30939427  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  30939426 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 30939327  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30939326 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 30939290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17529263 - 17528834
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17529263 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatg-ggggagaaga 17529165  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529164 agtatatttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 17529066  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17529065 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaa-gaaaaagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggt 17528974  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg----aaaaaacactt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  17528973 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcattagattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaacactt 17528874  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17528873 gggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 17528834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Original strand, 4837534 - 4837962
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4837534 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctaatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 4837633  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837634 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttacag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 4837732  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4837733 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 4837828  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa---cactt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||    
T  4837829 tgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaagcaactt 4837928  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4837929 gggttacaaaccaaggtttatta--aaaatattttt 4837962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 39836182 - 39836613
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39836182 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 39836281  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39836282 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 39836380  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  39836381 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 39836475  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  39836476 gtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgg 39836575  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39836576 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 39836613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 39844230 - 39844655
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39844230 taggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 39844329  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39844330 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaa 39844428  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaagtgagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39844429 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgagg 39844523  T
Q  398 ttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttaca 496  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  39844524 ttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttaca 39844623  T
Q  497 aaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39844624 aaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 39844655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17975864 - 17975437
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17975864 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatctgaaagttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 17975765  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct-aaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17975764 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aatagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaaat 17975666  T
Q  301 ttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag---aaaataaagtga 395  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  17975665 ttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttg--aaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaaataaggtga 17975568  T
Q  396 ggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17975567 ggttgttcaaattttaattacaagcaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggtta 17975469  T
Q  495 caaaccaaggttca-ttaagaaaatatttttg 525  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  17975468 cgaaccaagttttacttaagaaaatatttttg 17975437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 26871384 - 26871829
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871384 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 26871483  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871484 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 26871582  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgag------------ 381  Q
    | ||||||  ||||||||||| | |||||||||| | ||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||                
T  26871583 aaaatttctttttggtgggttggattgattttaatattttt--tttgaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaaaaac 26871680  T
Q  382 --agaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaag-g 477  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26871681 aaaaaaaacaaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtataatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaa 26871780  T
Q  478 aaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaag-aaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26871781 aaaaaacacttgggttactaaccaaggtttattaagaaaaatatttttg 26871829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 23923024 - 23923456
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  23923024 attccgtaggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaggtctaagtgaaagaatggagggagga 23923123  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23923124 gaaatatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaattctttgcctacataccgttaaa-agaaagggatcaaaaccaatgtagttcatct 23923222  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataa 390  Q
    ||| ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||          |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23923223 aaaaaatatctttttggtgggctagattgattttaacaagtttg---gaaaaaaggttttaagaagagattagagacctcaaggcatgagagaaaaataa 23923319  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacactt 488  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23923320 gatgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatccaagtctaatattgatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacactt 23923419  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23923420 gggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 23923456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36248940 - 36248708
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248940 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 36248841  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248840 agtatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttgaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 36248742  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36248741 aaaatttctttttggtgggttaagttgattttaa 36248708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 22103596 - 22103830
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22103596 attccataggaacctcttacatagattatcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 22103695  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103696 gaagtatgtttttggttagttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 22103794  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22103795 aaaaagtttctttttggtgggttaagttgattttaa 22103830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19851010 - 19850778
Alignment:
Q  98 tccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19851010 tccaaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaaga 19850911  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850910 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 19850812  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19850811 aaagtttctttttggtgggttaggttgcttttaa 19850778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19857046 - 19856814
Alignment:
Q  98 tccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19857046 tccaaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaaga 19856947  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19856946 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 19856848  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19856847 aaagtttctttttggtgggttaggttgcttttaa 19856814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 36252471 - 36252697
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36252471 taggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagtagt 36252570  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36252571 atgcttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaa 36252668  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252669 gtttctttggtgggttaggttgattttaa 36252697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4583798 - 4583602
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4583798 attccgtaggaacctcttacctaaattatcctgtgctaaattgatttgcttacatgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 4583699  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583698 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 4583602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 520
Target Start/End: Original strand, 26912703 - 26913124
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26912703 taggaacctcttgcctaa-ttatcttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaat-gggggagaagaagtat 26912800  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaa-ccaatgtagttc---acctaaa 296  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     | |||    
T  26912801 gttttt-gttgtttttatttgatttggaaggat--aaatcctttgcctacatactcttaaag-aaaagggatcaaaacccaacgtagttcgttctcaaaa 26912896  T
Q  297 gaatt--tctttggtgggttaggttgattttaacaattttg---nnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||             |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||     
T  26912897 gaaatgatttttggtgggttagattgattttaacatttttgaaaagaaaaaaaaggttttaagaagagataagaggcctcaagacatgaaag--aataag 26912994  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26912995 atgaggttggtcaaattttaattatacgaaactcaactctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaagaaaaaacacttgg 26913094  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatat 520  Q
     ||| || | |||||| |||||||||||||    
T  26913095 attaaaatcaaaggtttattaagaaaatat 26913124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 36576715 - 36576943
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36576715 attccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 36576813  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  36576814 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccaacgtagttccactc 36576910  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36576911 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 36576943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14204721 - 14204497
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14204721 aggaaccgcttacctagattattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 14204622  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  14204621 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 14204524  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14204523 ttctttggtgggttaggttgattttaa 14204497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14219362 - 14219138
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14219362 aggaaccgcttacctagattattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 14219263  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  14219262 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 14219165  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14219164 ttctttggtgggttaggttgattttaa 14219138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 4842979 - 4843121
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4842979 attccttaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 4843078  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4843079 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaa 4843121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 16190569 - 16190793
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16190569 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 16190667  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||| ||||||||| | |||||||  || |||||    
T  16190668 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaaggaatcaaaaccgacgtagttccactcaagaa 16190765  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16190766 tttctttggtgggttaggttgattttaa 16190793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15832143 - 15832007
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15832143 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaaga 15832044  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15832043 aatatgtttttggttttttttatttgatttggaagga 15832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23092932 - 23092654
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23092932 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 23092833  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || |||    
T  23092832 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaat 23092736  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23092735 ttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 23092654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 31000785 - 31001009
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31000785 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 31000883  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||  | |||||||  || |||||    
T  31000884 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccactcaagaa 31000981  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31000982 tttatttggtgggttaggttgattttaa 31001009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 31207676 - 31207901
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  31207676 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggggaagaagtat 31207775  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  31207776 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 31207873  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31207874 tttctttggtgggttaggttgattttaa 31207901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25719249 - 25719020
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25719249 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttactcgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaa 25719151  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||| ||||||||| | |||||||   |    
T  25719150 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaaggaatcaaaaccgacgtagttccaat 25719054  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25719053 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 25719020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 6582856 - 6583076
Alignment:
Q  105 gaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6582856 gaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 6582955  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||| | | |||||||  ||||| ||||    
T  6582956 tttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaatcgacgtagttccactaaaaaatt 6583052  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6583053 tctt--gtgggttaggttgattttaa 6583076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22418338 - 22418206
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22418338 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 22418239  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22418238 tgtttttggttatttttatttgatttggaagga 22418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17129505 - 17129388
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17129505 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 17129406  T
Q  200 tgtttttggttattttta 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17129405 tgtttttggttattttta 17129388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 289
Target Start/End: Original strand, 22366905 - 22367093
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |    
T  22366905 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaatt 22367004  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||    
T  22367005 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttc 22367093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25796758 - 25796693
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa 167  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25796758 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa 25796693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17129322 - 17129260
Alignment:
Q  265 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17129322 aaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 17129260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Original strand, 22023032 - 22023149
Alignment:
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||   ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  22023032 ttttttgttgtttttatt-gatttggaaggatagaattctt-tgcctacatatcc---aaggaaaatggatcaaaatcaatgtagttcacctcaaaaatt 22023126  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattt 324  Q
    | ||||||||||| | |||||||    
T  22023127 tatttggtgggttggattgattt 22023149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Original strand, 1388264 - 1388326
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaatta 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  1388264 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaatta 1388326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 103 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28460004 - 28459589
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28460004 aggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattgttacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 28459905  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28459904 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgtctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaatcaatgtagttcacctaaagaat 28459806  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28459805 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcat--gagaaaataaagtgaggttg 28459711  T
Q  401 gtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaacc 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  28459710 gtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttaggttacaaacc 28459613  T
Q  501 aaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28459612 aaggtttattaa-aaattatttttg 28459589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 41744674 - 41745095
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41744674 attccgtaggaacctcttacctaatttatcctgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 41744773  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744774 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 41744872  T
Q  295 aagaatttc-tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    || | |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744873 aaaagtttcttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt---agaaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 41744966  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41744967 gaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttgggtt 41745064  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41745065 acaaaccaaggtttattaa-aaaatatttttg 41745095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 96 - 517
Target Start/End: Original strand, 32135281 - 32135698
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135281 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 32135380  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135381 agtatatttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 32135479  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32135480 aaagtttctttttggtgggtt-ggttaattttaacaattttg----gaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggt 32135574  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32135575 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggt 32135673  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaa 517  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  32135674 tacaaaccaaggtttattaagaaaa 32135698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 28991278 - 28991712
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28991278 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 28991377  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991378 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 28991476  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28991477 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggt 28991569  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa-------aca 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  28991570 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaagaca 28991669  T
Q  486 cttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28991670 cttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 28991712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 3431573 - 3432004
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431573 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 3431672  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431673 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 3431771  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3431772 aaagtttctttttgttgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 3431867  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  3431868 gaggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttggg 3431967  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431968 ttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 3432004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31541391 - 31540961
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31541391 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 31541292  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31541291 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 31541193  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  31541192 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 31541098  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  31541097 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 31540998  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31540997 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 31540961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31549960 - 31549530
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31549960 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 31549861  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31549860 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 31549762  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  31549761 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 31549667  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  31549666 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 31549567  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31549566 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 31549530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Original strand, 13804027 - 13804449
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804027 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 13804126  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804127 aaatatgttttttgttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcttacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 13804225  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||    ||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||      
T  13804226 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--ggtttt----agaaaatggttttaagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaga 13804317  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13804318 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacccttggg 13804416  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13804417 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 13804449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13452265 - 13451833
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13452265 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagcatggagggagaa 13452166  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452165 gaagtatgtttttggttatttttatttgttttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 13452067  T
Q  294 aaagaatt--tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataa 390  Q
    ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13452066 aaaaagtttctctttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataa 13451974  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaaacact 487  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  13451973 gatgagcttggtcaaattttaattacaagaaaatcgagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaataaaataaaaggaaaaaaaacact 13451874  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13451873 tgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 13451833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2385402 - 2384976
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2385402 attccgtaggaacctcttatctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 2385303  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385302 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattaaa--cctttgcctacatacccttaaag-gaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 2385206  T
Q  295 aagaa-tttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    || || |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2385205 aaaaagtttcttttgggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataag 2385113  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaag--gaaaaaacactt 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||    
T  2385112 gtgaggttgatcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaaataagcatttgattaagagaataaaagaaaaaaaaaaactt 2385013  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2385012 gggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 2384976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 100 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 43456273 - 43455847
Alignment:
Q  100 cataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43456273 cataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 43456174  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43456173 gtatatttttggttatttttatttgattttgaaggat-taactcctttgcctatatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 43456076  T
Q  297 gaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagt 393  Q
     ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||          | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  43456075 aaatttctttttggtgggttggattgattttaacaattttg--taaaaaaagattttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagat 43455978  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43455977 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaagtcaattaagcatttgattaagaaagtaaaaggaaaaaaacacttggg 43455878  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatattt 522  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43455877 ttaccaaccaaggtttattaagaaaatattt 43455847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 100 - 524
Target Start/End: Original strand, 23355586 - 23356014
Alignment:
Q  100 cataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaat----ctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     ||| | ||||||||||| |||||||    
T  23355586 catatgaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctactatgcgaaagaatgggcggagaag 23355685  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23355686 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 23355784  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa- 391  Q
    || || |||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  23355785 aaaaaattctttttggtgggttagattgattttaatatttttg-----aaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaaaac 23355879  T
Q  392 ---gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacact 487  Q
       |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23355880 aaggtgaggttggt-taattttaattgcaagaaaatcaaatctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacact 23355977  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23355978 tggattacaaaccaaggtttatcaagaaaatattttt 23356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 525
Target Start/End: Original strand, 51055286 - 51055711
Alignment:
Q  98 tccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51055286 tccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattaatttgcttatttaaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaa 51055385  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51055386 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taacttctttggctacatacccttaaa-agaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 51055483  T
Q  297 gaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
     |  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  51055484 aaggttctttttggtgggttagattgattttaacaattttg---gaaaacaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatg 51055580  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacactt-gggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  51055581 aggttggtcaaattttaattacaagaaactcaagtctaatatggatattaaattgattaagcatttgattgagaaaataaaagg--aaaacacttggggt 51055678  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    || |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51055679 taaagtccaaggtttattaagaaaatatttttg 51055711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 21497053 - 21497286
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21497053 attccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 21497152  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497153 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 21497251  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21497252 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 21497286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 102 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13477264 - 13477078
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13477264 taggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 13477165  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13477164 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttc 13477078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31553589 - 31553360
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31553589 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 31553491  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31553490 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 31553393  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31553392 aaaaatttctttggtgggttaggttggttttaa 31553360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31562723 - 31562494
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31562723 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 31562625  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31562624 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 31562527  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31562526 aaaaatttctttggtgggttaggttggttttaa 31562494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 289
Target Start/End: Original strand, 8241041 - 8241229
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8241041 taggaatctcttgcctaatttatcttgtgctaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtaa 8241140  T
Q  201 gtttt-tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8241141 gttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctttgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttc 8241229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32608822 - 32608594
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32608822 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaaga 32608723  T
Q  196 agtatgtttttgg-ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||     
T  32608722 agtatgtttttggtttatttttatttgatttggaagg--acaagccctctgcctacgtacccttttgg--gaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 32608627  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608626 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 32608594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23952350 - 23952221
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23952350 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 23952251  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgattt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23952250 agtatgtttttggttatttttatttgattt 23952221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22472781 - 22472503
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22472781 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 22472682  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  22472681 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 22472585  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22472584 tttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 22472503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 525
Target Start/End: Original strand, 36848721 - 36849100
Alignment:
Q  144 ttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatccta 243  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  36848721 ttatatgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttgtttttatttgatttggaatgataaa--ttctt 36848818  T
Q  244 tgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt-tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnn 342  Q
    ||||||| |||||| || | ||  ||||||||||||   |||| ||  || || | || | ||||||||||| | |||||||||| | |||||           
T  36848819 tgcctacgtaccctaaacggaa--gggatcaaaaccgtcgtagatccactcaaaagttctttttggtgggttggattgattttaaaatttttgaaaaaaa 36848916  T
Q  343 nnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgt 441  Q
        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  |    
T  36848917 ----gtttttagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattataagaaatccaagtctaatatggagat 36849012  T
Q  442 taattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg----aaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36849013 taaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaacacttgggttaaaatccaaggtttcttaagaaaatatttttg 36849100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16135343 - 16135066
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16135343 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 16135245  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  16135244 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 16135147  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16135146 ttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16135066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22479855 - 22479631
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22479855 taggaacctcttacctaa-ttatcttgtgctaaaattatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 22479757  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  22479756 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 22479659  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22479658 tttctttggtgggttaggttgattttaa 22479631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21055105 - 21054901
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21055105 taggaacctcttgcctaatttatcctgtgctaaattaattcgcttatttgaaaattattgcctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtat 21055006  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct-aaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  21055005 gtttttggttatttttatttgatttggaatgat-taacgccttttcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcccctgaaaaaa 21054908  T
Q  300 tttcttt 306  Q
    |||||||    
T  21054907 tttcttt 21054901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20502341 - 20502117
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20502341 taggaacctcttacctagattgtcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtggaagaatggagggagaagaagta 20502242  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| | ||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  20502241 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctacctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 20502145  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502144 tttctttggtgggttaggttgattttaa 20502117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 34336791 - 34337016
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34336791 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagt 34336890  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  34336891 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaa-a 34336987  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34336988 aattctttggtgggttaggttgattttaa 34337016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52101374 - 52101236
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52101374 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 52101275  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52101274 gaaatatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 52101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 3350707 - 3350927
Alignment:
Q  105 gaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgt 202  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3350707 gaaccgcttacttagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgt 3350806  T
Q  203 ttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaattt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||||| |||||||  || || |||||    
T  3350807 ttttggttgtttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgg--gaagggatcaaaaccaacgtagttccactcaaaaattt 3350902  T
Q  303 ctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3350903 ctttggtgggttaggttgattttaa 3350927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 38123598 - 38123827
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38123598 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 38123696  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  38123697 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 38123794  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38123795 aaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 38123827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 264 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11950385 - 11950125
Alignment:
Q  264 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggat 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||           |||||||||||| |||    
T  11950385 aaaaggtatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttggattgattttaacaatttt--tgtaaaaaaggttttaagaagagat 11950288  T
Q  362 aagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag-tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaa-gtctattatgaatgttaattcaattaagcattt 459  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| |||||    
T  11950287 tagagacctcaaggcataagagaaaaataagatgaggttgattaa-ttttaattgcaagaaatcaaagtctagtatgaatgttaagttgattaaacattt 11950189  T
Q  460 gattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11950188 gattaagaaaataaaagg--aaaacgcttatgttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 11950125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 12464224 - 12464449
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  12464224 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtat 12464323  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| | ||||| |||||  ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  12464324 g-ttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctacctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaga 12464420  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12464421 atttctttggtgggttagattgattttaa 12464449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18702676 - 18702459
Alignment:
Q  106 aacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgttt 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18702676 aaccgcttacctaaattatcttgtgctaagttacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaaaaagtatgttt 18702578  T
Q  205 ttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttct 304  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||  | || |||  ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | ||||||  ||| || |||||||    
T  18702577 ttgg-tattttttattgatttggaagg--acaagtcccttgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagtttccctcaaaaatttct 18702482  T
Q  305 ttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18702481 ttggtgggttaggttgattttaa 18702459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 4282679 - 4282866
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatatt-gtgctaaattcattgcttattt--gaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||| ||||| |||||  |||||| |||   || |||  |||||||| |||||| ||||||    
T  4282679 attccgtaggaacctcctacctaactttaatttgtgctaaattaattgcctattttcgaaaataattgtttacaaaattaagtgaa-gaatggagggaga 4282777  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagtt 288  Q
    ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||    
T  4282778 agaaacatgttttttgttgtttttatttgatttggaaggat--aaatcatttgcctacataccct-----aaaaagggatcaaaaccattgtagtt 4282866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 35097550 - 35097615
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattatta 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35097550 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattatta 35097615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 50826741 - 50826316
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50826741 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaaga 50826642  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826641 agtatgtttttggttatttttatttgacttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 50826543  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  50826542 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataagat 50826450  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50826449 gaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggtt 50826351  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50826350 acaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 50826316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 50849112 - 50849544
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50849112 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaaga 50849211  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849212 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 50849310  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50849311 aaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt-tttagaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataag 50849406  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaaacacttgg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50849407 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgg 50849506  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50849507 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 50849544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 27550816 - 27551247
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27550816 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatatctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 27550915  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550916 aagtatgtttttggttatttttacttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 27551014  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551015 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 27551109  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa-----acact 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||    
T  27551110 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaatgaaaggaaaaaaaaggacact 27551209  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27551210 tgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttg 27551247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 30062800 - 30063228
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30062800 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 30062899  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30062900 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 30062998  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaaca-attttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30062999 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatatttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataag 30063094  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30063095 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttggg 30063192  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30063193 ttacaaaccaaggtttattaa-aaaatatttttggag 30063228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 18949613 - 18950043
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18949613 attccataggaacctcttacctaatctatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatagggggagaag 18949712  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18949713 aagtatgtttttggttatttttatttgacttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 18949811  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18949812 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt---tagaaaatggttttgagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 18949905  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa-cacttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18949906 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaaggaaataaaaggaaaaaagcacttgg 18950005  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18950006 gttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 18950043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39707230 - 39706805
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  39707230 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagagg 39707131  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39707130 aagtatgtttttgattatttttatttgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 39707032  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39707031 aagaatttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtg 39706939  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  39706938 aggttggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggtt 39706840  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39706839 acaaaccaaggtttattaagaaaatattttgggag 39706805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4435811 - 4435387
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  4435811 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaaga 4435712  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4435711 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 4435613  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaaca-attttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    | | ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4435612 aaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatatttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 4435517  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4435516 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttgggt 4435419  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4435418 tacaaaccaaggtttattaa-aaaatatttttg 4435387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 102 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4456596 - 4456178
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4456596 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctacattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtata 4456497  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4456496 tttttggttatttttatttgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtt 4456398  T
Q  302 tc--tttggtgggttaggttgattttaaca-attttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4456397 tctttttggtgggttaggttgattttaagatatttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggt 4456302  T
Q  399 tggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaa 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4456301 tggtcaaattttaattacaagaaatcaaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttgggttacaaa 4456204  T
Q  499 ccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4456203 ccaaggtttattaa-aaaatatttttg 4456178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41016778 - 41016348
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41016778 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 41016679  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41016678 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 41016580  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  41016579 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 41016485  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  41016484 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 41016385  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41016384 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 41016348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 18900503 - 18900931
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18900503 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagg 18900602  T
Q  196 agtatg-tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900603 agtatgttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 18900701  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||          |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18900702 aaaagtttctttttgatgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggtttttagaaggga-aaaaggcctcgaggcatgagagaaaataagg 18900796  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa--cacttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  18900797 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcaacttgg 18900896  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18900897 attacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 18900931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2256804 - 2256387
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2256804 taggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtata 2256705  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2256704 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatt 2256606  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttgg 401  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| | |||||          |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2256605 tctttggcgagttaagttgattttaagatttttg----aaaataggttttaagaagagaaaggaagcctcaaggcatgagagaaaatgaggtgaggttgg 2256510  T
Q  402 tcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaacc 500  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  2256509 tcaagttttaattagaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaat-aaaggaaaagcaacttgggttacaaacc 2256411  T
Q  501 aaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  2256410 aaggtttattaagaaaatattttt 2256387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 27339031 - 27339453
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27339031 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaaga 27339130  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27339131 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccaaa 27339229  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27339230 aaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 27339325  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||||||||    
T  27339326 gaggttggtctaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaa------aaaagg--aaaacacttgggt 27339417  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27339418 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 27339453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17365097 - 17364673
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17365097 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtat 17364998  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17364997 gttttt-gttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccattgtagctcacctcaaaaat 17364900  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttg 400  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17364899 ttatttagtgggttaggttgattttaatattttt--tttgaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttg 17364802  T
Q  401 gtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaaacacttgggttacaa 497  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  17364801 gtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacta 17364702  T
Q  498 accaaggttcattaag-aaaatatttttg 525  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17364701 accaaggtttattaagaaaaatatttttg 17364673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Original strand, 16814560 - 16814981
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16814560 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaaaaagtat 16814659  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16814660 gtttttggttatttttatttgatttggaaggattaacttctt-tgcctacatacccttaaagaaa--gggatcaaaaccaatgtagttcacctaaataat 16814756  T
Q  301 ttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggt 398  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||  |||||           |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16814757 ttctttttgatgggtttggttgattttaa--atttt----agaaaatggttttgagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggt 16814850  T
Q  399 tggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaa 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16814851 tggtcaagttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaa 16814950  T
Q  498 accaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16814951 accaaggtttattaagaaaatatttttggag 16814981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17360455 - 17360031
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17360455 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtat 17360356  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17360355 gttttt-gttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccattgtagctcacctcaaaaat 17360258  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttg 400  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17360257 ttatttagtgggttaggttgattttaatattttt--tttgaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttg 17360160  T
Q  401 gtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaaacacttgggttacaa 497  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  17360159 gtcaaattttaattacaagaaaatcaagactaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacta 17360060  T
Q  498 accaaggttcattaag-aaaatatttttg 525  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17360059 accaaggtttattaagaaaaatatttttg 17360031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 116 - 525
Target Start/End: Original strand, 18890340 - 18890748
Alignment:
Q  116 ctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg-tttttggttattt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18890340 ctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatgggaggagaaggagtatgttttttggttattt 18890439  T
Q  215 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  18890440 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtggg 18890538  T
Q  313 ttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaa 412  Q
    ||||||||||||||| | |||||          || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18890539 ttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggattttagaaggga-aagaggcctcgaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaa 18890633  T
Q  413 ttacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggttcatt 510  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| || |||    
T  18890634 ttacaagaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcaacttggattacaaaccaagttttatt 18890733  T
Q  511 aagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||    
T  18890734 aagaaaatatttttg 18890748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 8196389 - 8196817
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattg-cttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8196389 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgattttcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaag 8196488  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196489 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 8196587  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  |||||| |||| |||||||||||   |||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196588 aaaaagtttctttttggt-ggtttggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 8196680  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acactt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8196681 gtgaggttggtcaaattttaatttcaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaaactt 8196780  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8196781 gggttacaaaccaagttttattaagaaaatacttttg 8196817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 102 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17935453 - 17935023
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17935453 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 17935354  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17935353 gtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaat 17935257  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttg 400  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17935256 ttttttggtgggtttggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttg 17935163  T
Q  401 gtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-----------aaaaaacactt 488  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||    
T  17935162 gtcaagttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaaaaaaaacactt 17935063  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17935062 gggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 17935023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Original strand, 51922232 - 51922660
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51922232 attccgtaagaacctcttacctagattatcttgtgctaaattgatttgtttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 51922331  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51922332 aagtatgtttttggttatttttctttgatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacctttaaag-aaaggggatcaaaaccaacgtagttcaccta 51922430  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51922431 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt---tagaaaatggttttaagaagggataagaggccttaaggcatgagagaaaataagg 51922524  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttg 489  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  51922525 tgaggttagtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaaacttg 51922624  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51922625 ggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 51922660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Original strand, 13507412 - 13507842
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13507412 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaaga 13507511  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13507512 ggtatgtttttggttatttttattcgatttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgcagttcaccta 13507610  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  13507611 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagagaggataagaggcctcaaggaatgagataaaataagg 13507703  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg------aaaaaaca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  13507704 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaaaca 13507803  T
Q  486 cttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13507804 cttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattttt 13507842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 107 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 3711969 - 3711560
Alignment:
Q  107 acctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttt 205  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3711969 acctcttacctaatttatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 3711870  T
Q  206 tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc-- 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  3711869 tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctgtgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctt 3711771  T
Q  304 tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtc 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3711770 tttggtgggtt-ggttgatttta--aattttagaaaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtc 3711674  T
Q  404 aaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaaacacttgggttacaaacca 501  Q
    ||||||||||||||||||         | |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  3711673 aaattttaattacaagaa---------aatcggaatattaattcaattaagcatttgattaaaaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacaagcca 3711583  T
Q  502 aggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  3711582 aggtttattaagaaaatattttt 3711560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 8153300 - 8153730
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8153300 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaag 8153399  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153400 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaa-caaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 8153498  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
     || | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8153499 gaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt---tagaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataag 8153592  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  8153593 gtgaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttg 8153691  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8153692 ggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 8153730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 174 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41007920 - 41007569
Alignment:
Q  174 gtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatc 273  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41007920 gtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatc 41007822  T
Q  274 aaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaa 373  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||    
T  41007821 aaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaa 41007727  T
Q  374 ggcatgagag--aaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaa 470  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007726 ggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaa 41007627  T
Q  471 taaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41007626 taaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 41007569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18041289 - 18040857
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18041289 attccataggaacctcttaactaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaatattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 18041190  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct- 293  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18041189 aagcatgttcttggttatttatatttgatttggaaggat-taactcccttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 18041093  T
Q  294 -aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag---aaaata 389  Q
     ||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  18041092 aaaagtttttttttggtgggttggattgattttaacaattttg-taaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgacagagaaaaata 18040994  T
Q  390 aagtgaggttggtcaaattttaattacaag--aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacact 487  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  18040993 aggtgaggttgttcaaattttaattacaagaaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacatt 18040895  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18040894 tgggttacgaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 18040857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 96 - 472
Target Start/End: Original strand, 43468242 - 43468620
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43468242 attccatatgaacctcttacctaaattatcttgtgttaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaaaggggggagaaa 43468341  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43468342 aagtatg-ttttggttatttttatttgatttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaaa-agaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 43468438  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttg--nnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataa 390  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43468439 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaacaattttgaagaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataa 43468538  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaata 472  Q
      |||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  43468539 gatgaggttgat-taattttaattgcaagaaatccaagtctaatatgaatattaagttgattaaacatttgattaagaaaata 43468620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15697116 - 15696883
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattatt-acctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15697116 attccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 15697017  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697016 aagtatggttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 15696918  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15696917 aaaaatttctttttggtgggttgggttgattttaa 15696883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15711406 - 15711173
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattatt-acctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15711406 attccattggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaag 15711307  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711306 aagtatggttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 15711208  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15711207 aaaaatttctttttggtgggttgggttgattttaa 15711173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15694798 - 15694570
Alignment:
Q  101 ataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattatt-acctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15694798 ataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagta 15694699  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15694698 tggttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaa 15694600  T
Q  300 tttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15694599 tttctttttggtgggttgggttgattttaa 15694570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 234 - 524
Target Start/End: Original strand, 9183894 - 9184178
Alignment:
Q  234 aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||    
T  9183894 aaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagatcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaa--at 9183989  T
Q  332 tttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtct 430  Q
    |||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9183990 ttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcttcaaggcatgagagaatataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtct 9184085  T
Q  431 attatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9184086 attatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 9184178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14426016 - 14425782
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14426016 attccataggaacctcttacatagattatcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 14425917  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425916 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 14425818  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  14425817 aaaaagtttctttttggtgggttaagttgattttaa 14425782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 96 - 326
Target Start/End: Original strand, 8204200 - 8204432
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8204200 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaag 8204299  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204300 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 8204398  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 326  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  8204399 aaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta 8204432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 2215089 - 2215319
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2215089 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 2215188  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215189 taagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 2215285  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215286 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 2215319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 6293687 - 6293970
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6293687 attccataggaacctcttacttagattattttgtgctaagttactcgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 6293785  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6293786 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 6293883  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6293884 aaaaatttctttgatgggttaggttgattttaagatttttg-----aagatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 6293970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6563987 - 6563757
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6563987 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatgtt-taagtgaaagaatggagggagaag 6563889  T
Q  195 aagtatgttttt-ggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563888 aagtatgttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 6563791  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563790 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 6563757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6577656 - 6577426
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6577656 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatgtt-taagtgaaagaatggagggagaag 6577558  T
Q  195 aagtatgttttt-ggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577557 aagtatgttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 6577460  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577459 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 6577426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 1004289 - 1004510
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1004289 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 1004387  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1004388 cttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatt 1004486  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgatttt 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1004487 tctttggtgggttagattgatttt 1004510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 10720872 - 10721157
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10720872 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 10720970  T
Q  195 aagtatgtttttggtt-atttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720971 aagtatgtttttggtttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 10721069  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     || |||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10721070 caaaaatttctttggtggtttagattgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 10721157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18351413 - 18351184
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18351413 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 18351314  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351313 gtatgtttttggttatttttatttaaattggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 18351217  T
Q  297 gaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18351216 aagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 18351184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 525
Target Start/End: Original strand, 27958025 - 27958376
Alignment:
Q  164 aaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||      
T  27958025 aaaaatctaagtgaaagaatgggg--agaagaaacatgtttttggtt----ttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacctttaaatg 27958118  T
Q  264 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttg--gtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggat 361  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||   |||||||||| | |||||          |||| ||||||| |||    
T  27958119 aaa-gggatcaaaatcaatgtcgttcacctaaaaaatttctttttagtgggttgaattgattttaa-atttttgaaaat-----ggttctaagaagagat 27958211  T
Q  362 aagaggcctcaaggcatgagagaaa--ataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatt 458  Q
    |||||||||||| |||||  | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27958212 aagaggcctcaaagcatggaaaaaagaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataaagtctaatgtgaatattaattcaattaagcatt 27958311  T
Q  459 tgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27958312 tgattaagaaaataaaagg--aaaacacttgggttaccaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 27958376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16291062 - 16290847
Alignment:
Q  111 cttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttgg 208  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16291062 cttacctagattatcttgtgctaaattcatttgtttacttgaaaaattataacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttgg 16290963  T
Q  209 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttgg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16290962 ttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaattttctttgg 16290866  T
Q  309 tgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16290865 tgggttaggttgattttaa 16290847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 355 - 525
Target Start/End: Original strand, 8223112 - 8223285
Alignment:
Q  355 aagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  8223112 aagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaatttcaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattat 8223211  T
Q  454 gcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8223212 gcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaaacttgggttacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 8223285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 11918377 - 11918601
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11918377 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 11918476  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  11918477 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 11918574  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11918575 ttctttggtgggttaggttgattttaa 11918601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 11932947 - 11933171
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11932947 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 11933046  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  11933047 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 11933144  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11933145 ttctttggtgggttaggttgattttaa 11933171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 423
Target Start/End: Original strand, 21185592 - 21185907
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21185592 taggaacctcttgcctaatttatcttgtgttaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaggtctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtat 21185691  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||  |||  |   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21185692 gttttttgttgtttttatttgatttggaaggat-taactcctttgcctacatatcc--aaaagatttgggatcaaaaccaatgcagttcccctaaagaat 21185788  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgag-agaaaataaagtgaggtt 399  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||   |||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||    
T  21185789 ttctttggtgagttggattgattttaaattttttg-----aaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaataagatgaggtt 21185883  T
Q  400 ggtcaaattttaattacaagaaat 423  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  21185884 gatcaaattttaattacaagaaat 21185907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1480258 - 1480034
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1480258 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 1480160  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  1480159 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 1480062  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1480061 tttctttggtgggttaggttgattttaa 1480034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 5144436 - 5144666
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5144436 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaa 5144534  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  5144535 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 5144632  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5144633 caaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 5144666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 365 - 525
Target Start/End: Original strand, 18886343 - 18886505
Alignment:
Q  365 aggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgatta 464  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18886343 aggcctcgaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgatta 18886442  T
Q  465 agaaaataaaaggaaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18886443 agaaaataaaaggaaaaaagcaacttggattacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 18886505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27978970 - 27978685
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  27978970 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaa 27978871  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  27978870 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 27978774  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27978773 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 27978685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13275079 - 13274853
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13275079 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 13274980  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  13274979 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 13274882  T
Q  300 t-ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13274881 tattctttggtgggttaggttgattttaa 13274853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27884957 - 27884540
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttattt-gaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  27884957 attccgtaggaacctcttgcctactttatcttgtgctaa-ttatttgcttattttgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggatggagaag 27884859  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ct 293  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||  ||       || |||||||||| |||||||| | ||    
T  27884858 aagtatgtttttg-ttgtttttatttgatttggaaggattaga-tcctttgcctacatatccacaagc-----ggaatcaaaaccattgtagttctctct 27884766  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
     || || |  ||||||||||| | |||||||||| | |||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27884765 caaaaagta-tttggtgggttggattgattttaaaagttttggaaat-----ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagat 27884672  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    || |||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27884671 gaagttggttaa-ttttaattacaaaaaatacaagtctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 27884573  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    || || |||||| | |||| |||||||||||||    
T  27884572 taaaatccaaggcttattaggaaaatatttttg 27884540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 392 - 525
Target Start/End: Original strand, 14536879 - 14537009
Alignment:
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14536879 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttggg 14536976  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14536977 ttacgaaccaaggtttattaa-aaaatatttttg 14537009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 17562867 - 17563091
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17562867 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 17562965  T
Q  200 tgtttttggtta-tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | |||||||||||||||| | |||||||  || || |    
T  17562966 tgtttttggttattttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttggaaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaa 17563062  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17563063 atttctttggtgggttaggttgattttaa 17563091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31278856 - 31278579
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31278856 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattatttcctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtat 31278757  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | | |||||  || || |||    
T  31278756 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgcagttccactcaaaaat 31278660  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31278659 ttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 31278579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17630492 - 17630358
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17630492 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 17630393  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17630392 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 17630358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 7063800 - 7064025
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7063800 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggagggagaataagtat 7063899  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||   | || ||    
T  7063900 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccaatcaaaaa 7063997  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7063998 tttctttggtgggttaggttgattttaa 7064025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 4503535 - 4503760
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4503535 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattatctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaaata 4503633  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||| | ||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |    
T  4503634 tgtttttggttttttttatttgatttggaagg--acaagtcctctacctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaa 4503731  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503732 atttctttggtgggttaggttgattttaa 4503760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 13847839 - 13847977
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13847839 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacttaagaatctaaatgaaagaatggagggagaag 13847938  T
Q  195 aagtatg-tttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13847939 aagtatgttttttgattatttttatttgatttggaagga 13847977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 15675242 - 15675470
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15675242 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaactacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 15675340  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  15675341 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 15675437  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15675438 aaaaatttctttagtggattaggttgattttaa 15675470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 15683784 - 15684012
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15683784 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaactacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 15683882  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  15683883 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 15683979  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15683980 aaaaatttctttagtggattaggttgattttaa 15684012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Original strand, 17616653 - 17616877
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  17616653 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtat 17616752  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| | ||||| |||||  ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  17616753 g-ttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctacctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaga 17616849  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgatttta 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17616850 atttctttggtgggttagattgatttta 17616877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 7096647 - 7096872
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||    
T  7096647 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggacggagaataagtat 7096746  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||   | || ||    
T  7096747 gtttttggttaattttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccaatcaaaaa 7096844  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7096845 tttctttggtgggttaggttgattttaa 7096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22952080 - 22951850
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||||| |||||   ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  22952080 attccataggaacctcttacttagattatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaaattattgcctaatg-tctaaatgagagaatggagggagaa 22951982  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  22951981 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 22951884  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22951883 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 22951850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22966054 - 22965824
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||||| |||||   ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  22966054 attccataggaacctcttacttagattatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaaattattgcctaatg-tctaaatgagagaatggagggagaa 22965956  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  22965955 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 22965858  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965857 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 22965824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25264983 - 25264700
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| |  |  || ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25264983 attccgtaggaacctcttatctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaaga 25264884  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |    
T  25264883 agtatgtttttagttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactca 25264786  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25264785 aaaatttctttagtgggttaggttgattttaagatttttg-----aagatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 25264700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25274477 - 25274194
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| |  |  || ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25274477 attccgtaggaacctcttatctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaaga 25274378  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |    
T  25274377 agtatgtttttagttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactca 25274280  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25274279 aaaatttctttagtgggttaggttgattttaagatttttg-----aagatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 25274194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30102286 - 30102067
Alignment:
Q  111 cttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa--ttattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttt 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30102286 cttacctagattatcttgtgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 30102187  T
Q  206 tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||  ||   |  ||| ||||||||||| | |||||||  ||||  || |||    
T  30102186 tggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttttgggaaaaggatcaaaaccgacgtagttccactaa--aaattc 30102091  T
Q  304 tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30102090 tttggtgggttaggttgattttaa 30102067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 525
Target Start/End: Original strand, 9567447 - 9567867
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9567447 ccataggaacctcttgcctactttatcttgtgttaaattaatttgcttatttgaaaataatgtc-taagagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaag 9567545  T
Q  198 tatgtttttg-gttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ctaa 295  Q
    |||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||   | || | |||||||||| ||  ||       || ||||||| |  |||||||| | || |    
T  9567546 tatgtttttttgtttcttttatt-gatttggaaggattgga-tcgtttgcctacatatccacaagt-----ggaatcaaaatcgttgtagttctctctta 9567638  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtga 395  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9567639 aaaatttatttggtgggttagattgattttaacatttttgaaaataaa---gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatga 9567735  T
Q  396 ggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaata-aaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||| || |||| |  |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||    
T  9567736 ggttggtcaaattttaattataagaaacccaaatctaatatggatattaaattgattaaagatttgattaagaaaatataaagaaaaaggcacttggatt 9567835  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    | ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  9567836 aaaattcaaggtttcttaagaaaatatttttg 9567867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 210
Target Start/End: Original strand, 27957344 - 27957459
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27957344 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatataagtgaaagaat-gggggagaa 27957442  T
Q  194 gaagtatgtttttggtt 210  Q
    |||||||||||||||||    
T  27957443 gaagtatgtttttggtt 27957459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 24216157 - 24216430
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24216157 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaag 24216255  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||          ||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  24216256 aagta----------tatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 24216343  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24216344 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 24216430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 347 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27880326 - 27880175
Alignment:
Q  347 gttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaata---aag-tgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatgt 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||| |||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||| || |    
T  27880326 gttttaagaagagataagaggcctcagggcatgagagaaaatatataagatgaagttggttaa-ttttaattacaagaaacccaagtctaatatggatat 27880228  T
Q  442 taattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 494  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880227 taaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 27880175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 27957882 - 27957974
Alignment:
Q  213 ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27957882 ttttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacccttaaa-tgaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttcttt 27957974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27880562 - 27880426
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttattt-gaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27880562 attccgtaggaacctcttgcctactttatcttgtgctaa-ttatttgcttattttgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaag 27880464  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27880463 aagtatgttttt-gttgtttttatttgatttggaaggat 27880426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 154
Target Start/End: Original strand, 29730585 - 29730643
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  29730585 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaa 29730643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12469036 - 12468968
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttg-aaaattattacctaaaaa 168  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12469036 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaa 12468968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Original strand, 10713598 - 10713670
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttg-aaaattattacctaaaa 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  10713598 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaattattgcctaaaa 10713670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 19826553 - 19826977
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19826553 attccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctacattcattgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggaaaaga 19826652  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826653 agtatgtttttggtcatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 19826751  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtga 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19826752 agaatttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtga 19826844  T
Q  396 ggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 494  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19826845 ggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggtta 19826943  T
Q  495 caaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19826944 caaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 19826977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 20530671 - 20531102
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20530671 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagatctaagtgaaagaatggggggagaag 20530770  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530771 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 20530869  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20530870 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagg 20530962  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa---acactt 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20530963 tgaggttggtaaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagacactt 20531062  T
Q  489 gggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20531063 gggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 20531102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23927779 - 23927352
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927779 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 23927680  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927679 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 23927581  T
Q  295 aagaatttc---tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    || | ||||   ||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  23927580 aaaagtttcttttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaagcctcaaggcatgagataaaataag 23927488  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23927487 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-aaaaacacttggg 23927389  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23927388 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 23927352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 27537604 - 27537179
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27537604 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 27537505  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537504 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 27537406  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27537405 aagaatttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtg 27537313  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27537312 aggttggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggtt 27537214  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27537213 acaaaccaaggtttattaagaaaatattttgggag 27537179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 27551813 - 27551388
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27551813 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 27551714  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551713 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 27551615  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27551614 aagaatttctttggtgggttaggttgatttta--atttttgaaaata-----gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtg 27551522  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27551521 aggttggtcaaattttaattacaaagaagtcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggtt 27551423  T
Q  494 acaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27551422 acaaaccaaggtttattaagaaaatattttgggag 27551388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 33300313 - 33299884
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33300313 attccatatgaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggg-agaag 33300215  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300214 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatctcatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 33300116  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300115 aaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 33300023  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaaacacttg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33300022 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttg 33299923  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33299922 ggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 33299884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 118 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13827927 - 13827528
Alignment:
Q  118 aaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttattttt 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827927 aaattancttgtgctaaattcattgcttatttgaacatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatgacgggagaagaagtatgtttttggttattttt 13827828  T
Q  217 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttag 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827827 atttgatttggaagtataaaaatctcatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttag 13827729  T
Q  317 gttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattac 416  Q
    ||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13827728 gttgattttaataattttgaaaaaaa----gttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaa-tttaattac 13827634  T
Q  417 aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13827633 aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaagcacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaa 13827537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 15389387 - 15389818
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15389387 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 15389486  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15389487 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtaattcaccta 15389585  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15389586 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt--ttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataagg 15389682  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15389683 tgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctatcatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttggg 15389781  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15389782 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 15389818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 5996847 - 5996418
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5996847 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaaattttacctaaaaatctaagtgaaagaatgaggggagaaga 5996748  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996747 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 5996649  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa-g 392  Q
    | | ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||           ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  5996648 aaagtttctttttggtgggtta-gttgatttta--aatttt----agaaaatggttttaagaagggaaaagaagcctcaaggcatgagataaaataaagg 5996556  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa-cacttgg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5996555 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcacttgg 5996456  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5996455 gttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 5996418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 5487095 - 5487522
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  5487095 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaaatcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggggaaga 5487194  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5487195 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccactgtagttcacctca 5487293  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5487294 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 5487386  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487387 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctactatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 5487486  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5487487 tacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 5487522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14475778 - 14475346
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14475778 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 14475679  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14475678 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaa-taaaatggatcaaaaccaatgtagttcacct 14475580  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14475579 aaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gattt----cagaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataag 14475487  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattac--aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--acact 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14475486 gtgaggttggtcaaattttaattacaaaaaaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacact 14475387  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14475386 tgggttacaagccaaggtttattaagaaaatgtttttggag 14475346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 30823153 - 30823581
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30823153 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaaga 30823252  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30823253 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctga 30823351  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30823352 aaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt---tagaaaatggtttcaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 30823445  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  30823446 gaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttggg 30823544  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30823545 ttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 30823581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 25993772 - 25993341
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25993772 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaaga 25993673  T
Q  196 agtatgt-ttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25993672 agtatgttttttgattatttttatttgatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 25993574  T
Q  295 aagaatttc-tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
    || ||  || |||| |||||| | |||||||||||||||||            |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  25993573 aaaaaaatcttttgatgggttggattgattttaacaatttt----agaaaaaagttttacgaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 25993478  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  25993477 gtgaggttgttcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgg 25993379  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25993378 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 25993341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 35090310 - 35090740
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35090310 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 35090409  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35090410 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaattttatgcctacatatctttaaa-aaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 35090508  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  35090509 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 35090603  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35090604 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaaacatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 35090703  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35090704 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 35090740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 25552605 - 25552175
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25552605 attccttaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaaga 25552506  T
Q  196 agtatgt-ttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25552505 agtatgttttttgattatttttatttgatttggaaggataaaaatgctctgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 25552407  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    ||   ||| |||||||||||   |||||||||||||||||              ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  25552406 aattttttttttggtgggttgaattgattttaacaattttaaaaaaaaa-----tttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 25552312  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |   |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25552311 ttgcgttgttcaaattttaattgcaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 25552212  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25552211 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 25552175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25713940 - 25713510
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25713940 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatctgaaagttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 25713841  T
Q  196 agtatgtttttgg----ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 291  Q
    |||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25713840 agtatgtttttggttttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaatcaatgtagttcac 25713742  T
Q  292 ct--aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaat 388  Q
    ||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||           ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  25713741 ctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggttgatttt--caatttt----agaaaatggttttaagaagggataattgtcctcaaggcatgagagaaaaat 25713649  T
Q  389 aaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaa-ttaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacac 486  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25713648 aagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacac 25713549  T
Q  487 ttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25713548 ttgggttacaaaccaagatttattaagaaaatatttttg 25713510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13492222 - 13491796
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492222 attccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 13492123  T
Q  195 aagtatgtttttggttat-ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492122 aagtatgtgtttggttattttttatttgatttggaaggat-tgactcctttgcctacatacccttaaa-tgaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 13492025  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatga-gagaaaataa 390  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||           ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |    
T  13492024 aaaaaatttctttttggtgggttagattgattttaatatttttgaaaat------gttttaagaagagataagaggccccaaggcatgaggaaaaaatga 13491931  T
Q  391 agtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13491930 gatgaggttggtcaaatttt-attacaagaaattcaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaggcacttg 13491832  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13491831 ggttaaaatccaaggtttactaagaaaatatttttg 13491796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 169 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25693131 - 25692775
Alignment:
Q  169 tctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25693131 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25693032  T
Q  266 aagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataa 363  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||||||||||  |||||           ||||||||||||||||||    
T  25693031 a-gggatcaaaatcaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggttgattttaa--atttt----agaaaatggttttaagaagggataa 25692940  T
Q  364 gaggcctcaaggcatgagagaaaataaag-tgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaatt-aagcatttg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25692939 gaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttg 25692840  T
Q  461 attaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25692839 attaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaagatttattaagaaaatatttttg 25692775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 169 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25699772 - 25699416
Alignment:
Q  169 tctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699772 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25699673  T
Q  266 aagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataa 363  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||||||||||  |||||           ||||||||||||||||||    
T  25699672 a-gggatcaaaatcaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggttgattttaa--atttt----agaaaatggttttaagaagggataa 25699581  T
Q  364 gaggcctcaaggcatgagagaaaataaag-tgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaatt-aagcatttg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25699580 gaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttg 25699481  T
Q  461 attaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25699480 attaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaagatttattaagaaaatatttttg 25699416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 16302939 - 16303170
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16302939 attccataggaacctcttatctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 16303038  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303039 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatttgactcccctacctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 16303136  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303137 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 16303170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Original strand, 12451490 - 12451900
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatct--aagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  12451490 attccgtaggaacctcttacctaaattattttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattacctagaaatatttaagtgagagaatggggggaga 12451589  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  12451590 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgac-tcctttgcctacatacccttaaagaaaatgg-atcaaaaccaatgtagttcccc 12451687  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaag 392  Q
    |||| || |||||||||||||| | ||||||||||   || ||           ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  12451688 taaaaaaattctttggtgggttggattgattttaaagtttatgaaaata-----gttttgagaagagataagaagcctcaaggcatgaga-aaaataaga 12451781  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||| |            |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12451782 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaattcaagtctaatatggacattaaat------------tgattaagaaaataaaaggaaaa--cacttggg 12451867  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||| |  |||||||| | |||||||||||||||    
T  12451868 ttaaagtccaaggtttactaagaaaatattttt 12451900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 21708539 - 21708769
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21708539 attccatagaaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 21708638  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21708639 caagtatgtttttggttacttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 21708735  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21708736 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 21708769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 325
Target Start/End: Original strand, 27047221 - 27047449
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27047221 attccataggaacctcttacttagattatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 27047319  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27047320 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 27047418  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgatttt 325  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27047419 aaaaatttctttggtgggttagattgatttt 27047449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 325
Target Start/End: Original strand, 27057465 - 27057693
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27057465 attccataggaacctcttacttagattatcttgtgctaagttacttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 27057563  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27057564 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 27057662  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgatttt 325  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27057663 aaaaatttctttggtgggttagattgatttt 27057693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16589199 - 16588922
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16589199 taggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 16589100  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||||    
T  16589099 tttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatt 16589003  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16589002 tctttggtgggttagattgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16588922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 387
Target Start/End: Original strand, 16606181 - 16606458
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16606181 taggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 16606280  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||||    
T  16606281 tttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatt 16606377  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16606378 tctttggtgggttagattgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 16606458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16635603 - 16635375
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16635603 attccgtaggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 16635504  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |    
T  16635503 agtatgtttttggttattttttattgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactca 16635407  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635406 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 16635375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16645560 - 16645332
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16645560 attccgtaggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 16645461  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |    
T  16645460 agtatgtttttggttattttttattgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactca 16645364  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16645363 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 16645332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 18205110 - 18205341
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18205110 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaa 18205209  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  18205210 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 18205307  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205308 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 18205341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 18220109 - 18220340
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18220109 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaa 18220208  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  18220209 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 18220306  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220307 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 18220340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25654168 - 25653891
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25654168 aggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 25654069  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||     
T  25654068 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaa 25653972  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25653971 ttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 25653891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 24485415 - 24485646
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24485415 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatcattttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggaga 24485514  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| | |||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  24485515 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgaatcctctgcctacgtgccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 24485611  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485612 tcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 24485646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24920663 - 24920437
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24920663 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgttaaatttatttgcttacttgaaaaattattacttaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 24920564  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||    
T  24920563 gtatgtttttggtcatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgg--aaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaa 24920468  T
Q  297 gaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24920467 aaatttctttggtgggttaggttgattttaa 24920437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 23982686 - 23982965
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23982686 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 23982784  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  23982785 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaa 23982882  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23982883 atttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 23982965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 21358594 - 21358819
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21358594 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21358692  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  21358693 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaa 21358790  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358791 atttctttggtgggttaggttgattttaa 21358819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 23962576 - 23962801
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23962576 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 23962674  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  23962675 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaa 23962772  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962773 atttctttggtgggttaggttgattttaa 23962801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27960466 - 27960235
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattca--ttgctta-tttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggag 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27960466 attccataggaacctcttacctaaattatcttatgctaaattcacttggcttactttgaaaaattatttcct-aaaatctaagtgaaagaatggagggag 27960368  T
Q  192 aagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||      
T  27960367 aagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttg-gaaagggatcaaaaccgacgtagttcca 27960271  T
Q  292 ctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27960270 ctcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27960235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 30995499 - 30995729
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat--tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  30995499 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcctaaag-tctaagtgaaagaatggagggagaa 30995597  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  30995598 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 30995695  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995696 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 30995729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18112118 - 18111887
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  18112118 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 18112020  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||| |||     
T  18112019 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 18111922  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18111921 caaaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 18111887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18126663 - 18126432
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  18126663 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 18126565  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||| |||     
T  18126564 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 18126467  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18126466 caaaaaatttctttagtgggttaggttgattttaa 18126432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28304419 - 28304189
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  28304419 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 28304321  T
Q  194 gaagtatgtttt-tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  28304320 gaagtatgttttcttgttatttttatttgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 28304224  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28304223 tcaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 28304189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28266705 - 28266476
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  28266705 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 28266607  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | || |||| ||||||| ||||| |   |  ||||||||||||||| | ||||||   ||    
T  28266606 gaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtaccc-tgttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttacact 28266510  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28266509 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 28266476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28345454 - 28345225
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  28345454 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 28345356  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | || |||| ||||||| ||||| |   |  ||||||||||||||| | ||||||   ||    
T  28345355 gaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtaccc-tgttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttacact 28345259  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345258 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 28345225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 524
Target Start/End: Original strand, 18753591 - 18753766
Alignment:
Q  348 ttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatgttaatt 446  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||| | |||||   |||| || |||| |    
T  18753591 ttttaaaaagagataagaggcatcaagacatgagagaaaataagatgaagtttttcaaattttaattataagaaacccaagtca--tatggatattaaat 18753688  T
Q  447 caattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
      ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  18753689 tgattaaacatttgattaaagaaataaaaggaaaaaacatttgagttaaaatccaaggtttattaagcaaatattttt 18753766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13827983 - 13827922
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaatta 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827983 attccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaatta 13827922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Original strand, 28267771 - 28267822
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaatt-cattgcttatttgaa 152  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28267771 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 28267822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Original strand, 28346520 - 28346571
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaatt-cattgcttatttgaa 152  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28346520 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 28346571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 96 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19226058 - 19225643
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19226058 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 19225959  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225958 aagtatgtttttggttatttttatttgatttgaaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 19225860  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagt 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  19225859 aagaatttcttcggtgggttaggttgatttta--atttttg-----aaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagat 19225767  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19225766 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaatacttgggt 19225668  T
Q  493 tacaaaccaaggttcattaagaaaa 517  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  19225667 tacaaaccaaggtttattaagaaaa 19225643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 43596678 - 43597109
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43596678 attccataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaa 43596777  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596778 gaagtatgtttttgtttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 43596876  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43596877 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataag 43596972  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43596973 gtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgg 43597071  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43597072 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 43597109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 43629472 - 43629903
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43629472 attccataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaa 43629571  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629572 gaagtatgtttttgtttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 43629670  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43629671 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataag 43629766  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43629767 gtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgg 43629865  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43629866 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 43629903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 1726791 - 1727221
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaa--atctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  1726791 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 1726890  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1726891 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 1726989  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1726990 aaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--gatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataag 1727082  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  1727083 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttg 1727182  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1727183 ggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttggag 1727221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28845380 - 28844949
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28845380 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 28845281  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845280 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 28845182  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  28845181 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 28845087  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28845086 gtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgg 28844987  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28844986 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 28844949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28853990 - 28853559
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28853990 attccgtaggaacctcttacctaatttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 28853891  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853890 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 28853792  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaa 391  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  28853791 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataag 28853697  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgg 490  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28853696 gtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgg 28853597  T
Q  491 gttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28853596 gttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 28853559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 24955466 - 24955895
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24955466 attccgtaggaacctcttacctaatttac-ttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 24955564  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24955565 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 24955663  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  24955664 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 24955758  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  24955759 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 24955858  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24955859 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 24955895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 528
Target Start/End: Original strand, 24963926 - 24964355
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24963926 attccgtaggaacctcttacctaatttac-ttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaag 24964024  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24964025 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 24964123  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag--aaaataaag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  24964124 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaaaaga-aagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataagg 24964218  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  24964219 tgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttggg 24964318  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24964319 ttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 24964355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 96 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31413047 - 31412620
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattaccta-aaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31413047 attccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgctaagttcattgcttatttgaaaattattacctagaaaatctaagtgaaagaatgggg--agaag 31412950  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412949 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 31412851  T
Q  295 aagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcat-gagagaaaataaa 391  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           | |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  31412850 aaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatggatttttagaagaga-aagaggcctcaaggcatagagataaaataag 31412755  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagca-tttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  31412754 gtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcattttgattaagaaaataaaaggaaaagcaacttg 31412655  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31412654 ggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 31412620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31423953 - 31423523
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  31423953 attccgtaggaacctcttatctaatttatcttgtgtttaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggagaaaa 31423854  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423853 agtgtgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 31423755  T
Q  296 agaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagt 393  Q
    | | ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||           |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31423754 aaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt---tgaaaatgggtttttagaaggga-aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggt 31423659  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattac-aagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaa---cacttg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  31423658 gaggttggtcaaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagtgacttg 31423559  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    | |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31423558 gattacaaaccaagttttattaagaaaacatttttg 31423523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 155 - 528
Target Start/End: Original strand, 20370777 - 20371143
Alignment:
Q  155 ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatac 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20370777 ttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatac 20370876  T
Q  255 ccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggtttta 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||           |||||||    
T  20370877 ccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaa--atttt----agaaaatggtttta 20370968  T
Q  353 agaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaatta 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20370969 agaagggataagaagcctcaaggcatcagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaatta 20371068  T
Q  453 agcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20371069 agcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 20371143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 155 - 528
Target Start/End: Original strand, 20396480 - 20396846
Alignment:
Q  155 ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatac 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20396480 ttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatgaaaatcctatgcctacatac 20396579  T
Q  255 ccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggtttta 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||           |||||||    
T  20396580 ccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaa--atttt----agaaaatggtttta 20396671  T
Q  353 agaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaatta 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20396672 agaagggataagaagcctcaaggcatcagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaatta 20396771  T
Q  453 agcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20396772 agcatttgattaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 20396846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 209 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21931546 - 21931231
Alignment:
Q  209 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt-- 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||      
T  21931546 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgcagttcacctaaaaagtttcttttt 21931448  T
Q  307 ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa--gtgaggttggtca 404  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||    
T  21931447 ggtgggttggattgattttaatatgttt----tgaaaatggttttaagaagaaataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaacaaggtgaggttggtca 21931352  T
Q  405 aattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaag 503  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21931351 aattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttactaaccaag 21931252  T
Q  504 gttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21931251 gtttattaagaaaatattttt 21931231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 41093722 - 41093956
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  41093722 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaaattattacctaaaagtataattgaaagaatggagggagaa 41093821  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093822 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 41093920  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41093921 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 41093956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20377940 - 20377709
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20377940 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 20377842  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20377841 aagtatgcttttagttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 20377742  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377741 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 20377709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20386729 - 20386498
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20386729 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 20386631  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20386630 aagtatgcttttagttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 20386531  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20386530 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 20386498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 33835302 - 33835531
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33835302 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 33835400  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33835401 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 33835498  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33835499 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 33835531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 33844001 - 33844230
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33844001 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 33844099  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33844100 aagtatgtttttggttacttttatttgatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 33844197  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33844198 aaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 33844230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23039273 - 23039050
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23039273 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 23039174  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||    
T  23039173 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccatt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaat 23039077  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23039076 ttctttggtgggttaggttgattttaa 23039050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 23348714 - 23348851
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23348714 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 23348813  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23348814 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 23348851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23984920 - 23984696
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23984920 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagta 23984821  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  23984820 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaggtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 23984723  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgatttta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23984722 tttctttggtgggttaggttgatttta 23984696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27064248 - 27064026
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27064248 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 27064150  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  27064149 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacatacccttttgg--gaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaa 27064054  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064053 tttctttggtgggttaggttgattttaa 27064026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23637506 - 23637282
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23637506 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 23637408  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  23637407 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 23637310  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23637309 tttctttggtgggttaggttggttttaa 23637282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 23827926 - 23828150
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23827926 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 23828024  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  23828025 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 23828122  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23828123 tttctttggtgggttaggttggttttaa 23828150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 23835384 - 23835608
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23835384 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 23835482  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||    
T  23835483 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaa 23835580  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23835581 tttctttggtgggttaggttggttttaa 23835608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17642643 - 17642366
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17642643 aggaaccgtttacctagattatcttgtgctaaattcattcgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtat 17642544  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  17642543 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 17642447  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17642446 ttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 17642366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 21850816 - 21851093
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21850816 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtat 21850915  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  21850916 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 21851012  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21851013 ttatttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 21851093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 11812595 - 11812824
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat-tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11812595 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcctaacg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 11812693  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||     
T  11812694 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactc 11812791  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11812792 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 11812824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 21986346 - 21986570
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21986346 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattattacttaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21986444  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  21986445 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 21986542  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986543 tttctttggtgggttaggttgattttaa 21986570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 21994994 - 21995218
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21994994 aggaaccgcttacctaaattatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattattacttaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagta 21995092  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || ||    
T  21995093 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaa 21995190  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995191 tttctttggtgggttaggttgattttaa 21995218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 26078529 - 26078759
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattg-ctta-tttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26078529 attccataggaacctcttacctaaattattttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacctaaaa-tctaagtgaaaaaatggagggaga 26078627  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  26078628 agaagtatgtttttggctatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttg-gaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 26078724  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26078725 tcaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 26078759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 26088508 - 26088738
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattg-ctta-tttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26088508 attccataggaacctcttacctaaattattttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacctaaaa-tctaagtgaaaaaatggagggaga 26088606  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  26088607 agaagtatgtttttggctatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttg-gaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 26088703  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088704 tcaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 26088738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 11802519 - 11802748
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat-tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11802519 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcctaacg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 11802617  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||| | |||||||  ||     
T  11802618 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaatggatcaaaaccgacgtagttccactc 11802715  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11802716 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 11802748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26177248 - 26177025
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26177248 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtat 26177149  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  26177148 gttttgggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 26177052  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26177051 ttctttggtgggttaggttgattttaa 26177025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 327
Target Start/End: Original strand, 12170305 - 12170530
Alignment:
Q  100 cataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat-tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12170305 cataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcctaacg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagt 12170403  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  12170404 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaga 12170501  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12170502 atttctttggtgggttaggttgattttaa 12170530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 327
Target Start/End: Original strand, 12179734 - 12179959
Alignment:
Q  100 cataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaat-tattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagt 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12179734 cataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaaatattgcctaacg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagt 12179832  T
Q  199 atgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  12179833 atgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaga 12179930  T
Q  299 atttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12179931 atttctttggtgggttaggttgattttaa 12179959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 31548224 - 31548447
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31548224 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtat 31548323  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |||| |||| || |||||||   |  | ||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  31548324 gtttttggttgtttttatttgatttggaatg--acaagtcctctgcccacgtaccctt-ttgggacagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 31548420  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31548421 ttctttggtgggttaggttgattttaa 31548447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 21856977 - 21857108
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21856977 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtat 21857076  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21857077 gtttttggttatttttatttgatttggaagga 21857108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 27223321 - 27223551
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat--tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| |||  | |||||   |||||||||||| |||| |||||||    
T  27223321 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcctaatg-tctaagtgaaagtatggagggagaa 27223419  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  27223420 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 27223517  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223518 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27223551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 27232792 - 27233022
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat--tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| |||  | |||||   |||||||||||| |||| |||||||    
T  27232792 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcctaatg-tctaagtgaaagtatggagggagaa 27232890  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  27232891 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 27232988  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27232989 caagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27233022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3476937 - 3477167
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  3476937 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 3477035  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||    
T  3477036 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttggggaagggatcaaaaccgacgtagttccact 3477133  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3477134 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 3477167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3491707 - 3491937
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  3491707 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaa 3491805  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |   |||||||||||||| | |||||||  ||    
T  3491806 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttggggaagggatcaaaaccgacgtagttccact 3491903  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491904 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 3491937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 21858730 - 21858861
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21858730 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggaaggagaagaagtat 21858829  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858830 gtttttggttatttttatttgatttggaagga 21858861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 36458809 - 36458526
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36458809 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaatacttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 36458711  T
Q  195 aagtatgtttttgg-ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  36458710 aagtatgtttttggtttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 36458614  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36458613 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 36458526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 27220314 - 27220546
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat--tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||| |||  | |||||   |||||||||||| |||| |||||||    
T  27220314 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaagctacttgtttatttgaaaaatatattgcctaatg-tctaagtgaaagtatggagggagaa 27220412  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||  ||   |  ||||||||||||||| | |||||||      
T  27220413 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttcca 27220510  T
Q  292 ctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220511 ctcaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 27220546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 23762462 - 23762684
Alignment:
Q  105 gaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23762462 gaaccgcttatctaaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatg 23762560  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   | || |||| |||||||||||||||   |  |||||||| |||||| |  || |||  ||||| |||     
T  23762561 tttttggttatttttatttgatttgaaag--aacaagtcctctgcctacataccctttttgggaaagggataaaaaccgacatatttccactaaaaaata 23762658  T
Q  302 tctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23762659 tctttggagggataggttggttttaa 23762684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21931594 - 21931541
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttattt 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21931594 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttattt 21931541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 387
Target Start/End: Original strand, 23025830 - 23025946
Alignment:
Q  265 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataag 364  Q
    |||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || |||    
T  23025830 aaagggattaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aag 23025923  T
Q  365 aggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  23025924 aggcctcaaggcatgagataaaa 23025946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29190304 - 29190253
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaatt-cattgcttatttgaa 152  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  29190304 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 29190253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 96 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 109584 - 109202
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  109584 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctgagtgaaagaatggagggagaaga 109485  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109484 agcattttttttgttatttttatttggttttgaaggataaaaaatcatatgcctacataccctttaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 109386  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109385 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttg---aaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtg 109289  T
Q  395 aggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109288 aggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa 109202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 279 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 123197 - 122953
Alignment:
Q  279 caatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123197 caatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgaaaaaaa---ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcat 123101  T
Q  379 gagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagga 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  123100 gagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg- 123002  T
Q  479 aaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  123001 -aaaacacttggtttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 122953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4587 - 4160
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4587 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaa 4488  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4487 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctc 4389  T
Q  295 aagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagt 393  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||  |    
T  4388 aaaaatttctttgatgggttaggttgattttaagaatttt----tgaaaatggttttaagaaaaga-aagaggcctcaagtcatgagagaaaaataagat 4294  T
Q  394 gaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaac-acttggg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4293 gaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttggg 4194  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4193 ttacgaaccacggtttattaagaaaatatttttg 4160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 188759 - 188332
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  188759 attccatatgatcctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttgctaacttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 188660  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  188659 gaagtatgtttttggttatttttatttgttttggaaagataaaaatcccttgcctacatacccttaaag-aaaatggatcaaaaccaatgtagttcacct 188561  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||  ||||||            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  188560 aaaaagtttctttttggtgggtt-cgttgatttta--aatttt----agaaaatagttttaagaagggataagatgcctcaaggcatgagataaaataag 188468  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaac-acttg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  188467 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaagaaaaagcaacttg 188368  T
Q  490 ggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  188367 ggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 188332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 194949 - 194718
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  194949 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 194850  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  194849 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccact 194752  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194751 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 194718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 159290 - 159154
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  159290 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaactacttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaag 159192  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  159191 aagtatgcttttggttatttttatttgatttggaagga 159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19998 - 19565
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19998 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 19899  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19898 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgactccct-tgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaacaccaatgtagttcacct 19801  T
Q  294 aaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| || ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  19800 aaaaaaattctttttggtgagttgggttgattttaacaattttgtaaaaaaa--ggttttaagaagagattagaggcctcaaggcataagagaaaaataa 19703  T
Q  392 g-tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaag--gaaaaaacact 487  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  19702 gatgaggttgttcaaattttaattacaagcaaatcaagtctaatatgaatgttaattcaatttagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaaacact 19603  T
Q  488 tgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19602 tgggttacagaccaaggtttattaagaaaatatttttg 19565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 96 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10613 - 10187
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10613 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcatacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 10514  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10513 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaagg--aaagggatcaaaaccaatgtagcttacct 10417  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaag 392  Q
    ||| | |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||      
T  10416 aaaaagtttctttgttgggtaggattgattttaacaattttgaaaaaaaaa--gttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataaga 10319  T
Q  393 tgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttggg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10318 tgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaacattaattcaattaagcatttaattaagaaaataaaagg--aaaacacttggg 10221  T
Q  492 ttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10220 ttaaagtccaaggtttattaagaaaatatttttg 10187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 164 - 524
Target Start/End: Original strand, 38672 - 39028
Alignment:
Q  164 aaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 263  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38672 aaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 38771  T
Q  264 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggat 361  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| ||||   |||||            |||||||||||||||    
T  38772 aaa-gggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgactttag--attttagaaaata----gttttaagaagggat 38863  T
Q  362 aagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttg 460  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38864 aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggttaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatcttaattcaattaagcatttg 38963  T
Q  461 attaagaaaataaaag-gaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatattttt 524  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38964 attaagaaaataaaagaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattttt 39028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 96 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30116 - 29774
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  30116 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaa 30017  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30016 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgaggttcacct 29919  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaa 391  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||   |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29918 aaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatttta--tatttt----agaaaatggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataag 29826  T
Q  392 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgtta 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29825 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgtta 29774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0545 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0545
Description:

Target: scaffold0545; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 243 - 525
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8293
Alignment:
Q  243 atgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnn 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||         
T  8011 atgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaat 8109  T
Q  341 nnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatg 440  Q
         ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8110 -----ggttttaagaaaggataagaggcctcgaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaata 8204  T
Q  441 ttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa----acacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8205 ttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttg 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1804 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1804
Description:

Target: scaffold1804; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 1
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  180 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaagaagtatg 81  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  80 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10373 - 10139
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacc-taaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10373 attccgtaggaacctcttaccctaaattatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaa 10274  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10273 gaagcatgtttttggttatttttatttgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaag-agaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 10175  T
Q  294 aaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10174 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1120 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1120
Description:

Target: scaffold1120; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 353 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1428 - 1258
Alignment:
Q  353 agaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaatta 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428 agaagggataagaggcctcaagacatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaatta 1329  T
Q  453 agcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1328 agcatttgattaagaaaataaaagg--aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 1258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 264 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12753 - 12494
Alignment:
Q  264 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||          |||||||||||| |||    
T  12753 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggttaggttgattttaatt-ttttgaaaat-----ggttttaagaagagat 12660  T
Q  362 aagaggcctcaaggcatgagagaaaa--taaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcattt 459  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659 aagaggcctcaaggcatgggagaaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcattt 12560  T
Q  460 gattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12559 gattaagaaaataaaaggaaaaacaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 12494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 9971 - 10202
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9971 attccatagaaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaa 10070  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10071 gaagtatgtttttggctatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaagaaaaa-ggatcaaaaccaatgtagttcacct 10168  T
Q  294 aaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10169 caaaaatttctttggtgggttaggttgattttaa 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4297
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458 attccataggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 4359  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4358 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctttgcctacgtaccc 4297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 112 - 340
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  112 attccgtaggaacctcttacctagattattttgtgctaaattcattgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaga 211  T
Q  196 agtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || |    
T  212 agtatgtttttggttattttttattgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactca 308  T
Q  296 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  309 agaatttctttggtgggttaggttgattttaa 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32622 - 32325
Alignment:
Q  104 ggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatg 201  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32622 ggaacctcttacttagattatcttatgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaataagtatg 32523  T
Q  202 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  32522 tttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag--aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatt 32426  T
Q  302 tc--tttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagtgaggt 398  Q
    ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||          |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32425 tctttttggtgggttggattgattttaacaattttg-taaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataaggtgaggt 32327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 244 - 525
Target Start/End: Original strand, 19404 - 19677
Alignment:
Q  244 tgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnn 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||            
T  19404 tgcctacatacccttaaagaaaa-gggatcaaaaccaatgtagttcccctaaagaatttctttggtgggttggattgattttaa-atttttgaaatt--- 19498  T
Q  344 nnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgtt 442  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||    
T  19499 --ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgaga-aaaataagttaaggttggtcaaattttaattacaagaaattcaagtctaatatggatatt 19595  T
Q  443 aattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    || |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  19596 aaattgattaaacatttgattaaggaaataaaaggaaaaaacacttgggtta-aatccaaggtttactaagaaaatatttttg 19677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 525
Target Start/End: Original strand, 26354 - 26598
Alignment:
Q  277 accaatgtagttcacctaaagaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggc 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26354 accaatgtagttcccctaaagaatttctttggtgggttggattgattttaa-atttttgaaaat-----ggttttaagaagagataagaggcctcaaggc 26447  T
Q  377 atgagagaaaataaa--gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataa 473  Q
    |||||| |||| |||   |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  26448 atgagaaaaaaaaaaagatgagattggtcaaattttaattgcaagaaatccaagtctaatatggatattaaaatgattaaacatttgattaaggaaataa 26547  T
Q  474 aaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    ||| |||||  |||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  26548 aagaaaaaagtacttgggtta-aatccaaggtttactaagaaaatatttttg 26598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 63338 - 63287
Alignment:
Q  102 taggaacctcttacctaaattatattgtgctaaatt-cattgcttatttgaa 152  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  63338 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 63287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4727 - 4495
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg-ggggaga 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4727 attccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggggaga 4628  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |    
T  4627 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccac 4530  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529 tcaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 4495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 362 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 25550 - 25384
Alignment:
Q  362 aagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaa-gaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttg 460  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25550 aagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttg 25451  T
Q  461 attaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttggag 528  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25450 attaagaaaataaaaag-gaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 63416 - 63135
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  63416 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 63317  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||    
T  63316 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaa 63220  T
Q  297 gaatttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  63219 aaatttctttggtgggttaggttgattttaagatttttg-----aaaatggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 63135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Original strand, 46624 - 46852
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgc-ttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46624 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttaattgcttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 46723  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  || ||    
T  46724 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaa 46821  T
Q  297 gaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46822 aaatttctttggcaggttaggttgattttaa 46852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1481 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1481
Description:

Target: scaffold1481; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1681 - 1457
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1681 aggaaccgcttacctaagttatcttgtgctaaattcatttggttacttgaaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 1582  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||| | |||||||  || || |||    
T  1581 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--actagtcctctgcctacgtaccctttttttgaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaat 1484  T
Q  301 ttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1483 ttctttggtgggttaggttgattttaa 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15064 - 14832
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15064 attccgtaggaacctcttacttagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaa 14965  T
Q  194 gaagtatgtttttggtt-atttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacc 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | ||| |||  |    
T  14964 gaagtatgtttttggttgttttttatttgatttgggagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtatttccac 14867  T
Q  293 taaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14866 tcaagaatttctttggtgggttaggttgattttaa 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 465 - 603
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  465 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaa 564  T
Q  194 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  565 gaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 232
Target Start/End: Original strand, 80513 - 80648
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80513 ccataggaacctcttacctagattatcttgttctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaa 80612  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80613 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 80648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 232
Target Start/End: Original strand, 64111 - 64246
Alignment:
Q  99 ccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  64111 ccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcctttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaactgaaagaatggaggaagaagaa 64210  T
Q  197 gtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64211 gtatatttttggttatttttatttgatttggtagga 64246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 83612 - 83332
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtat 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  83612 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaaaaatggagggagaagaagtat 83513  T
Q  201 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || ||    
T  83512 gtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaa 83415  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaacaattttgnnnnnnnnnnggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaa 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  83414 tttctttggtgagttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggttttaagaagaga-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 83332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 21623 - 21760
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21623 attccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggaggaagaag 21722  T
Q  195 aagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21723 aagcatgtttttggttatttttatttgatttgggagga 21760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Original strand, 3750 - 3974
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt--gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagta 199  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  3750 aggaaccgcttacctggattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaaggagta 3849  T
Q  200 tgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| || ||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  |  || ||    
T  3850 tgtttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgta-cctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaa 3946  T
Q  300 tttctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3947 tttctttgatgggttaggttgattttaa 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 145452 - 145591
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaat-ctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  145452 attccaaaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacatgaaaaattattacctaaaaaagctaagtgaaagaatggagggaga 145551  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145552 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 145591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Original strand, 136490 - 136617
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggggggaga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  136490 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggaga 136589  T
Q  193 agaagtatgtttttggttatttttattt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  136590 agaagtatgtttttggttatatttattt 136617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 359 - 525
Target Start/End: Original strand, 33159 - 33315
Alignment:
Q  359 gataagaggcctcaaggcatgagag-aaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatgttaattcaattaagca 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| || ||||| ||    
T  33159 gataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataaggtgaggttggt-tagttttaattacaagaaatccaagtctaatatggatattaaatcgattaaaca 33257  T
Q  457 tttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggttcattaagaaaatatttttg 525  Q
    |||||| ||||||        |||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  33258 tttgataaagaaa--------aaaaaacacttgggttacga---aaggtttattaagaaaatatttttg 33315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 158
Target Start/End: Original strand, 29741 - 29803
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29741 attccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattcattgcttatttgaaaattat 29803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 22888 - 22980
Alignment:
Q  103 aggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaag 194  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22888 aggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaag 22980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1547 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1547
Description:

Target: scaffold1547; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1662 - 1542
Alignment:
Q  203 ttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaattt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | ||||||  ||  || || ||    
T  1662 ttttggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagtt--ccacaaaaaatt 1567  T
Q  303 ctttggtgggttaggttgattttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1566 ctttggtgggttaggttgattttaa 1542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 154
Target Start/End: Original strand, 2381 - 2439
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  2381 attccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaactttgttgcttatttgaaaa 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 154
Target Start/End: Original strand, 22102 - 22160
Alignment:
Q  96 attccataggaacctcttacctaaattatattgtgctaaattcattgcttatttgaaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  22102 attccataggaacctcttacctagattattttgtgctaaactacttgtttatttgaaaa 22160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2768 times since January 2019
Visitors: 6167