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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
Legend |
| Query |
| Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0856_low_83 (Length: 369)
Name: NF0856_low_83
Description: NF0856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
[»] NF0856_low_83 |
 |  |
|
[»] scaffold0380 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0239 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0264 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0154 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1335 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0983 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0789 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0768 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0366 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0427 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0308 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1515 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0172 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0654 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0007 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0330 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0027 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0496 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0475 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0060 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0166 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0130 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0074 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0262 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0015 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0459 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0140 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0236 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0533 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0187 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0939 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0024 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1989 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 206)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 31787124 - 31787359
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
31787124 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
31787223 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31787224 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
31787322 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
31787323 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtactattt |
31787359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 3163231 - 3163458
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3163231 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactccctcttt-caattctttcatttatcttt |
3163329 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3163330 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
3163428 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3163429 |
acgtcatacaatttgggacggagggagtac |
3163458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 42787911 - 42788141
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
42787911 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttcttttaattctttcatttatct |
42788010 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
42788011 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
42788109 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
42788110 |
aaacatcatacaatttaggacggagggagtac |
42788141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 48747289 - 48747518
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
48747289 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttagctattttttactctctcttctttcaattctttcgtttatct |
48747388 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
48747389 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
48747487 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48747488 |
aaatgtcatacaatttgggacggagggagta |
48747518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8330195 - 8330424
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
8330195 |
atatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctattctttcaattctttcatttatct |
8330294 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
8330295 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
8330393 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8330394 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8330424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8878817 - 8879046
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
8878817 |
atatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
8878916 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
8878917 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
8879015 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8879016 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
8879046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43555048 - 43554819
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
43555048 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatct |
43554949 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43554948 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcaacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
43554850 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43554849 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43554819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 49872554 - 49872783
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
49872554 |
atatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
49872653 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49872654 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
49872752 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49872753 |
aaacgtcctacaatttgggacggagggagta |
49872783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 50776217 - 50776445
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgcttt-acaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
50776217 |
atatgtcgcttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaatcatttattactctattctttcaattctttcatttatctt |
50776316 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
50776317 |
tcccatatta-tttattaagcacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatacccaa |
50776415 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
50776416 |
aacgtcatacaatttgggatggagggagta |
50776445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8307841 - 8308070
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
8307841 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
8307940 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8307941 |
ttcccttatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatttcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
8308039 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
8308040 |
aaacgtcatacaatttgggacggatggagta |
8308070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 28011123 - 28011351
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
28011123 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactacttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
28011222 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28011223 |
tcccatatta-tttattacggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
28011321 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28011322 |
aacgtcttacaatttgggacggagggagta |
28011351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 17180727 - 17180957
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17180727 |
atatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcgtttatct |
17180826 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
17180827 |
ttcccatatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcta |
17180925 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17180926 |
aaacgttatataatttgggacggagggagtac |
17180957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 30469570 - 30469796
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30469570 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaactatttattactctcttctttcaattctttcatttatcttt |
30469669 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
30469670 |
cccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttt-ccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgcaaaatgctcaat |
30469767 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30469768 |
acgtcatataatttgggacggagggagta |
30469796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12959523 - 12959290
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12959523 |
atatgtcgctttaaaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
12959424 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatt--tatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
12959423 |
ttcccatattatttattattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatacc |
12959324 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
12959323 |
caaaacgtcatacaatttgggacggaaggagtac |
12959290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15824341 - 15824113
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
15824341 |
tatgtcgctttacaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
15824242 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15824241 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
15824143 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15824142 |
aacttcatacaatttgggacggagggagta |
15824113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 21362501 - 21362724
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
21362501 |
atatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattctttcatttatct |
21362600 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21362601 |
tttccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
21362699 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
21362700 |
aaacgtcatacaatttgggacggag |
21362724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52001235 - 52001004
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
52001235 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
52001136 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52001135 |
ttcacatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
52001037 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
52001036 |
aaacgtcgtacaatttggaacggaggtagtaca |
52001004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 45430060 - 45430289
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
45430060 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattgtatccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
45430159 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
45430160 |
ttcctatatta-tttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatggcta |
45430258 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45430259 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45430289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 52666867 - 52667095
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
52666867 |
atatgtcgttttacaatgccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattttttcatttatct |
52666966 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
52666967 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttctta--atgtgtgaaatgccca |
52667063 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52667064 |
aaacgtcatacattttgggacggagggagtac |
52667095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16128770 - 16128542
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
16128770 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatct |
16128671 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
16128670 |
ttctcatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttca-cacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
16128573 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16128572 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16128542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26061888 - 26061659
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
26061888 |
atatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcatattataaccttaactatttattactatatcttttttcaattctttcatttatat |
26061789 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
26061788 |
tttccatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
26061690 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26061689 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
26061659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 46398654 - 46398883
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
46398654 |
atatgttgctttacaatacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataaccttaattaattattactccctcttcttttagttctttcatttatct |
46398753 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46398754 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
46398852 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46398853 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46398883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4750425 - 4750197
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
4750425 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaagtcttttatttatctt |
4750326 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
4750325 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatgtccaa |
4750227 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4750226 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4750197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 39674076 - 39674308
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
39674076 |
gtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatctattaccctctcttctttcaattctttaatttatctttcc |
39674175 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |
|
|
T |
39674176 |
catatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtatcaaatgcccaagac |
39674274 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
T |
39674275 |
gtcatacaatttgaaacggagggagtataatttt |
39674308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 10426569 - 10426796
Alignment:
Q |
16 |
atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
10426569 |
atgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactccatcttctttcaattacttcatttatattt |
10426668 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
10426669 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcatttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatgcctaaa |
10426767 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10426768 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
10426796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16051873 - 16051643
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
16051873 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaacgttacttttcctcttataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
16051774 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta--atatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
16051773 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgtgaaatgtcc |
16051675 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16051674 |
aaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
16051643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 23624898 - 23625127
Alignment:
Q |
15 |
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111 |
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T |
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211 |
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23625096 |
T |
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242 |
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T |
23625097 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23625127 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26541248 - 26541019
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
26541248 |
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26541149 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
26541148 |
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26541050 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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T |
26541049 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
26541019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28646204 - 28646433
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
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28646303 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
28646304 |
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28646402 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
28646403 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
28646433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44343869 - 44343640
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
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T |
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44343770 |
T |
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Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
44343769 |
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44343671 |
T |
 |
Q |
213 |
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243 |
Q |
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|| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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T |
44343670 |
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44343640 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29361461 - 29361241
Alignment:
Q |
23 |
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120 |
Q |
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T |
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29361362 |
T |
 |
Q |
121 |
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220 |
Q |
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T |
29361361 |
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29361263 |
T |
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Q |
221 |
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242 |
Q |
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T |
29361262 |
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29361241 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 32557953 - 32558181
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
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32558052 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
32558053 |
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32558151 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
32558152 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32558181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39655408 - 39655639
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttat--ttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttat |
109 |
Q |
|
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|
T |
39655408 |
atatgtcgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatatttattactctctcttctttcaattctttcatttat |
39655507 |
T |
 |
Q |
110 |
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209 |
Q |
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T |
39655508 |
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39655606 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
39655607 |
caaaacgtcatacattttgggacgaagggagta |
39655639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29095302 - 29095531
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
29095302 |
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29095401 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
29095402 |
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29095500 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
29095501 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29095531 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31925293 - 31925064
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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|
T |
31925293 |
atatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcccttctttcaattccttcatttatct |
31925194 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
31925193 |
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31925095 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
31925094 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
31925064 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26333509 - 26333281
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
26333509 |
tatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgctctttcttttttcaattctttcatttatctt |
26333410 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
26333409 |
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26333311 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
26333310 |
aacatcatacaatttgggacggagggagta |
26333281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49980492 - 49980264
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
49980492 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctt |
49980393 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
49980392 |
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49980294 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
49980293 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49980264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 29672367 - 29672586
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Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-caattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
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T |
29672367 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactgttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatc |
29672466 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
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T |
29672467 |
a-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgctcaaaacgtcata |
29672565 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
29672566 |
caatttgggacggagggagta |
29672586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38238921 - 38239148
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattaattttcctattatatccttaactatttattactctctcctttcaattccttcatttatcttt |
38239020 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
38239021 |
cacatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
38239119 |
T |
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Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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| ||||| ||||||||||| | |||||| |
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T |
38239120 |
acgtcatacaatttgggacgaaaggagta |
38239148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13896590 - 13896361
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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T |
13896590 |
atatgtcgttttacaataccattgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactagttattactctttcttctttcaattctttcatttattt |
13896491 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
13896490 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
13896392 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
13896391 |
aaacgtcatacaatttgggacgaaaggagta |
13896361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40403922 - 40403697
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
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T |
40403922 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattgtatctttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctt |
40403823 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
40403822 |
tcccatat-aatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
40403724 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
40403723 |
aacgtcatacaatttgggatggaggga |
40403697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 25984431 - 25984659
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
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|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcattcttttttcaattctttcatttatctt |
25984530 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
|
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|
T |
25984531 |
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25984629 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
25984630 |
aacgtcatacaatttggaacggagggagta |
25984659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49419587 - 49419357
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatct |
49419488 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
49419487 |
ttcccatatca-tttatcgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttt-ccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
49419390 |
T |
 |
Q |
212 |
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244 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
49419389 |
aaatatcatacaatttgagacggaggaagtaca |
49419357 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6920956 - 6920729
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
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|
T |
6920956 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctctcctttcaattccttcatttatcttt |
6920857 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
6920856 |
ctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
6920758 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
6920757 |
acgtcatacaatttgggacgaatggagta |
6920729 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24322745 - 24322563
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
24322745 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaaccttaatgttatttttcctattataaccttagctatttattactctctttactttcaattctttcatttatct |
24322646 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaat |
195 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
24322645 |
ttcccatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaat |
24322563 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 16010972 - 16011201
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
16010972 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
16011071 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
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|
T |
16011072 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccaaa |
16011170 |
T |
 |
Q |
213 |
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243 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||||||||||| |
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|
T |
16011171 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagtac |
16011201 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22172654 - 22172428
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
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T |
22172654 |
tatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttcttttttcaattctttcatttttctttc |
22172555 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
22172554 |
acatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
22172456 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||||| |
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|
T |
22172455 |
cgtcatacaatttgggaccgagggagta |
22172428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 24589554 - 24589783
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24589554 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
24589653 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtg-aaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
T |
24589654 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaatgccca |
24589752 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
24589753 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
24589783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 26834883 - 26835112
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
|
T |
26834883 |
atatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
26834982 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
26834983 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
26835081 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26835082 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
26835112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 27952661 - 27952890
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
27952661 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatct |
27952760 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
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|
T |
27952761 |
ttctcatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacactaaattaataatatttcttaataagtgtgaaatgccca |
27952859 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27952860 |
aaacatcgtacaatttgggacggagggagta |
27952890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8712103 - 8711875
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8712103 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
8712004 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
T |
8712003 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaacatgtgtgaaatgctcaa |
8711905 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
8711904 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8711875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 9066377 - 9066605
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||||| || |
|
|
T |
9066377 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttagctatttattactctctcttatttcaattcctttatttatttt |
9066476 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |
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|
T |
9066477 |
tcccatatca-tttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatatcttaatatgtgtgaaatactcaa |
9066575 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
9066576 |
aacatcatacaatttgggacggaggaagta |
9066605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 16705350 - 16705578
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16705350 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttactattatatccttaaatatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
16705449 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
T |
16705450 |
ttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaaaatgtgtgaaatgctcaa |
16705548 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16705549 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16705578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 39282588 - 39282816
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
39282588 |
tatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactgtttcttttttcaaatctttcatttatctt |
39282687 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
39282688 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
39282786 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39282787 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39282816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 48355807 - 48356035
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
48355807 |
tatgtcgctttacaataccgatgaaacattaatgttacttttcatattataacattaactatttattcctctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
48355907 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatcttttttccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcgtaa |
48356005 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
48356006 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
48356035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 19010832 - 19011058
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
19010832 |
atatgtcgatttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgctctcttctttcaattccttcatttatcttt |
19010931 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
19010932 |
cacatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcattcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaa |
19011030 |
T |
 |
Q |
214 |
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242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19011031 |
acgtcata-aatttgggacggagggagta |
19011058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1037686 - 1037463
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc----aattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||||| |
|
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T |
1037686 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatc |
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T |
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Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
1037586 |
tttcccatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccatattatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
1037488 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1037487 |
aaaacatcatacaatttgggacgga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1044592 - 1044369
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc----aattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||||| |
|
|
T |
1044592 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatc |
1044493 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
1044492 |
tttcccatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccatattatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
1044394 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1044393 |
aaaacatcatacaatttgggacgga |
1044369 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8462507 - 8462278
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
8462507 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatta |
8462408 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
8462407 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
8462309 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8462308 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
8462278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
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Target Start/End: Complemental strand, 16011584 - 16011359
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
16011584 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcc |
16011485 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
16011484 |
gatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaac |
16011386 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
16011385 |
gtcatacaatttgagacggagagagta |
16011359 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31045568 - 31045339
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31045568 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttcttttaattccttcatttatctt |
31045469 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31045468 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttaacacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
31045370 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
31045369 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagtac |
31045339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32162437 - 32162209
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32162437 |
atatatcgctttacaataccaatgaaaaattaat-ttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
32162339 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32162338 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgccca |
32162240 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
32162239 |
aaacatcatacaatttaggacggagggagta |
32162209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34967556 - 34967327
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
34967556 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactctctcttttttcaatttcttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
34967456 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
34967358 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34967357 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
34967327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 38816904 - 38817133
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
T |
38816904 |
tatgtcggtttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttctttatttatctt |
38817003 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
38817004 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgtccaa |
38817102 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38817103 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
38817133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40052373 - 40052144
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
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|
T |
40052373 |
atatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactcttttttctttcaattattttatttatct |
40052274 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40052273 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
40052175 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
40052174 |
aaacgtcatacaatttggaacggaggaagta |
40052144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 51560801 - 51561030
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
51560801 |
atatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatattattttttctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattcattcatttatct |
51560900 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51560901 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
51560999 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51561000 |
aaatttcatacaatttgggacggagggagta |
51561030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
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Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9265011 - 9264791
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9265011 |
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9264912 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
9264911 |
ttctcatatta---tattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccagacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
9264815 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
9264814 |
aaacgtcatataatctaggacgga |
9264791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 35096668 - 35096896
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35096668 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
35096768 |
tcccatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacaattcttaatatgtgtgaaatacccaa |
35096866 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
35096867 |
aacgtcattcaatttggaacggagggagta |
35096896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47393607 - 47393379
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15 |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47393607 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
47393508 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
47393507 |
tcccatatca-tttattaaacataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatctccaa |
47393409 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47393408 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
47393379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2619572 - 2619349
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|
|
|||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
2619572 |
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2619473 |
T |
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Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
2619472 |
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2619374 |
T |
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Q |
212 |
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236 |
Q |
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|
||| || || |||||||||||||| |
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T |
2619373 |
aaacgtcgtacaatttgggacggag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 28359864 - 28359634
Alignment:
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19 |
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116 |
Q |
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T |
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tcgctttacaataccaataaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttccc |
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T |
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Q |
117 |
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216 |
Q |
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T |
28359765 |
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28359667 |
T |
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Q |
217 |
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249 |
Q |
|
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||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |
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T |
28359666 |
tcatacaatttgggacggaggaagtaccatttt |
28359634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
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Target Start/End: Original strand, 18127389 - 18127619
Alignment:
Q |
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110 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
111 |
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210 |
Q |
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T |
18127489 |
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18127587 |
T |
 |
Q |
211 |
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242 |
Q |
|
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|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
18127588 |
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18127619 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34347326 - 34347555
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Q |
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
34347426 |
ttcttatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
34347524 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
34347525 |
aaacgtcatacaatttggaacggagagagta |
34347555 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 42379247 - 42379476
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Q |
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112 |
Q |
|
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T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattattgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
42379347 |
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42379445 |
T |
 |
Q |
213 |
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243 |
Q |
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|| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
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T |
42379446 |
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42379476 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 42728273 - 42728494
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Q |
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Q |
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T |
42728273 |
tatgtagctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatatc |
42728372 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
42728373 |
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42728471 |
T |
 |
Q |
213 |
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235 |
Q |
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|| ||||||||||||| ||||| |
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T |
42728472 |
aacgtcatataatttggaacgga |
42728494 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 52833654 - 52833883
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
52833654 |
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52833753 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
52833754 |
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52833852 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
52833853 |
aaacgtcatacaatttgggacagaggaagta |
52833883 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3552785 - 3552557
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
|
|
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T |
3552785 |
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3552686 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
3552685 |
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3552587 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
3552586 |
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3552557 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 32145409 - 32145637
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Q |
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112 |
Q |
|
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|
T |
32145409 |
tatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatattacttttcctattatatcctcaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctt |
32145508 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
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T |
32145509 |
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32145607 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32145608 |
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32145637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51983985 - 51983754
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Q |
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111 |
Q |
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||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |
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T |
51983985 |
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T |
 |
Q |
112 |
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209 |
Q |
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T |
51983885 |
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51983787 |
T |
 |
Q |
210 |
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242 |
Q |
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|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
51983786 |
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51983754 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42334483 - 42334249
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Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
42334483 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
42334384 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
42334383 |
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42334285 |
T |
 |
Q |
213 |
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248 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||| | |||| ||||| |
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|
T |
42334284 |
aacgtcatacaatttaggacggaagaagtataattt |
42334249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 46160394 - 46160615
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
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|
T |
46160394 |
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46160493 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
46160494 |
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46160585 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
46160586 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46160615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3550044 - 3550273
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
3550044 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttccttttgtatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaa-tagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
3550144 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctctttcccacacaatattaaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
3550242 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|
T |
3550243 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
3550273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 30679337 - 30679550
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23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
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|
T |
30679337 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatat |
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T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
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| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
30679437 |
ca-tttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacctcat |
30679535 |
T |
 |
Q |
221 |
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235 |
Q |
|
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| |||||| |||||| |
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|
T |
30679536 |
acaatttgagacgga |
30679550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 42709731 - 42709959
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
42709731 |
atatgtcgctttacaataccaata-aacattaatgttattttttcgattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttattt |
42709829 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
42709830 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatatcttttccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgccca |
42709928 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
42709929 |
aaacatcatacaatttgggacggaaggagta |
42709959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45467274 - 45467053
Alignment:
Q |
22 |
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119 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
45467274 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgctatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcacata |
45467175 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
45467174 |
tca-tttattaaggataatttcttaaaacaactcataacacctctttcccgtacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtca |
45467076 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45467075 |
tacaatttgggacggagggagta |
45467053 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 4227810 - 4228030
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
4227810 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttaatttatcttttccatat |
4227909 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
4227910 |
ca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcat |
4228008 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4228009 |
acaatttggaacggagggagta |
4228030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5653713 - 5653489
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
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T |
5653713 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctcttttcttttaattttttcatttatctt |
5653614 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
5653613 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcaaa |
5653515 |
T |
 |
Q |
213 |
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238 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
5653514 |
aacgtcatacaattttggacggaggg |
5653489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 14202988 - 14203216
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14202988 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttccaattctttcatttatctt |
14203087 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
14203088 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaatattaattatatttcttaatatgtgtgagatgcctaa |
14203186 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14203187 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14203216 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 2994191 - 2994406
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2994191 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcactcttctttcaatttattcatttatctt |
2994290 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2994291 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaccaactcacaatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
2994389 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgg |
229 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |
|
|
T |
2994390 |
aacgtcatacaatttgg |
2994406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 12966954 - 12967180
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12966954 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctt |
12967053 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
12967054 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacataatattaattatatttcttgatatatgtgaaatgcccaa |
12967152 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12967153 |
aacgtcatacaatttgggacggagggag |
12967180 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13985496 - 13985266
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttag-ttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
13985496 |
atatgttgatttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaacttatttattactctctcttctttcaattccttcatttatt |
13985397 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
13985396 |
tttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgcgtgaaatgccc |
13985298 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
13985297 |
aaaacgtcatacaatttgggatggagagagta |
13985266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14795145 - 14794917
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
14795145 |
atatgtcgctttacgataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtcattaactatttattactctcttttcttttaattccttcgtttatct |
14795046 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
14795045 |
ttcccat-ttaatt-attaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
14794948 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14794947 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14794917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16630079 - 16629886
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
16630079 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
16629980 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16629979 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
16629886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41529164 - 41529393
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
41529164 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatat |
41529263 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||| | || ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41529264 |
ttcctatatca-ttcattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatgttaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
41529362 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
41529363 |
aaacgtcgtacaatttggaatggagggagta |
41529393 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 42643163 - 42643392
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
42643163 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
42643263 |
ttcctatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgttaaatgccca |
42643361 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||| | ||||||| ||||| |
|
|
T |
42643362 |
aaacgtcatacaattcgcgacggagagagta |
42643392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35379740 - 35379516
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
35379740 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
35379641 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
35379640 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
35379542 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
35379541 |
aaacgtcatacaatttgggacggagg |
35379516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 48509842 - 48509979
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104 |
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203 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48509842 |
atttatcttttccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttctacataatattaattgcatttcttaatatgtgtga |
48509940 |
T |
 |
Q |
204 |
aatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
48509941 |
aatacccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
48509979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15575082 - 15574868
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | | | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
15575082 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatcatatcttcaactatttattactctttcttctttaaattatttcatttatcttttccata |
15574983 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
15574982 |
tca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtca |
15574884 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| |
|
|
T |
15574883 |
tacaatttgggacgga |
15574868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2458543 - 2458772
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2458543 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
2458642 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
2458643 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
2458741 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2458742 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2458772 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
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Target Start/End: Original strand, 13352506 - 13352735
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111 |
Q |
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|
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T |
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13352605 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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||| |||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |
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T |
13352606 |
ttctcatac-aacttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgccta |
13352704 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||||||||| |||||||||||||| |
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T |
13352705 |
aaacgtcatataatttaggacggagggagta |
13352735 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39673724 - 39673495
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Q |
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111 |
Q |
|
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|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| | |
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T |
39673724 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactccctcttcttttaattatttcatttattt |
39673625 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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T |
39673624 |
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39673526 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39673525 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39673495 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41621009 - 41620776
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Q |
10 |
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107 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
41621009 |
aataatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcattt |
41620910 |
T |
 |
Q |
108 |
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207 |
Q |
|
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T |
41620909 |
atcttttccatacca-tttatttgggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcgccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
41620811 |
T |
 |
Q |
208 |
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242 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
41620810 |
accaaaatatcttacaatttgaaacggagggagta |
41620776 |
T |
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Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42219813 - 42219584
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
42219813 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctattctttcaattatttcatttatct |
42219714 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
42219713 |
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42219615 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
42219614 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
42219584 |
T |
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Target: chr1; HSP #104
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Target Start/End: Complemental strand, 47038529 - 47038309
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Q |
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120 |
Q |
|
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T |
47038529 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcgtaactatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctttctcatat |
47038430 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |
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|
T |
47038429 |
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47038331 |
T |
 |
Q |
221 |
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242 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||||||||| |
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|
T |
47038330 |
acaatttagaacggagggagta |
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T |
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Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | || || |||||||||||| |
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|
T |
49367464 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattcatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttctaagtcattcatttatctt |
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T |
 |
Q |
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212 |
Q |
|
|
| |||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
49367364 |
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49367266 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| ||||||||| |
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T |
49367265 |
aatatcatacaatttgggacagagggagta |
49367236 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 50942677 - 50942905
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
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|
T |
50942677 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttt |
50942776 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | || |
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T |
50942777 |
tctcatttta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattttttgatatgtgtgaaatgtctaa |
50942875 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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T |
50942876 |
aacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 52703425 - 52703653
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Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
52703425 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctactctcaagtcattcatttatctt |
52703524 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |
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|
T |
52703525 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatgcgtgtgaaatacccaa |
52703623 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
52703624 |
aacgtcatacaatttaggacggaggaagta |
52703653 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 40100540 - 40100760
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40100540 |
atatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaagtatttattactctcttctttcaatttcttcatttatcttt |
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T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||| |
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|
T |
40100640 |
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40100738 |
T |
 |
Q |
214 |
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235 |
Q |
|
|
| ||||| |||| | |||||| |
|
|
T |
40100739 |
acgtcatacaattcgagacgga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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Q |
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
T |
36633174 |
caattccttcatttatctttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatatgaattacatttctta |
36633076 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
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|
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|
T |
36633075 |
atatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttgggacggagagagta |
36633027 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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Target Start/End: Complemental strand, 8012589 - 8012451
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197 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8012589 |
tcttttatttatttttcccatatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
8012491 |
T |
 |
Q |
198 |
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237 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
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|
T |
8012490 |
atgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #111
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112 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| || |
|
|
T |
10085767 |
tatgtcgctttacactaccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctctcattccaagtcattcatttatttt |
10085866 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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| | || | | |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
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T |
10085867 |
ttcaatgtca-tttattaaatacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
10085965 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10085966 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
10085995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #112
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111 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |
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|
T |
5467121 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcccattatatccttaactatttattactctctattctttcaattctttaatttatca |
5467022 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| | | |
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|
T |
5467021 |
ttctcatac-aacttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgtcta |
5466923 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
5466922 |
aaacgtcatataatttggaacggag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #113
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112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
23827386 |
tatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
23827485 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
|
T |
23827486 |
tcccatat------------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
23827573 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
23827574 |
aacgtattacaatttgggacagagggagta |
23827603 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #114
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Target Start/End: Original strand, 25792211 - 25792433
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Q |
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T |
25792211 |
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25792303 |
T |
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Q |
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213 |
Q |
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T |
25792304 |
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25792402 |
T |
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Q |
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244 |
Q |
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| ||||||||||| ||| |||||||||||| |
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T |
25792403 |
acgtcatataatttaggatggagggagtaca |
25792433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 27999676 - 27999904
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
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T |
27999676 |
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27999775 |
T |
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Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
27999776 |
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27999873 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
27999874 |
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27999904 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23549430 - 23549201
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
23549430 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
23549331 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgca--caatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
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T |
23549330 |
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23549234 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
23549233 |
caaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
23549201 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48363597 - 48363368
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
48363597 |
atatgccgctttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccgtaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
48363498 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
48363497 |
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48363399 |
T |
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Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|||| |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
48363398 |
aaatgtcatataatttgggacggagggagta |
48363368 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51905819 - 51905594
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
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T |
51905819 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
51905720 |
T |
 |
Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
51905719 |
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51905621 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
51905620 |
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51905594 |
T |
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Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 52688193 - 52688422
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
52688193 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
52688292 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
52688293 |
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52688391 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |
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T |
52688392 |
aaacgtcatacaatttggaacggaggaagta |
52688422 |
T |
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Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 4226294 - 4226512
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Q |
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Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |
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T |
4226294 |
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4226393 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
4226394 |
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4226481 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
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T |
4226482 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
4226512 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26551693 - 26551469
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Q |
19 |
tcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
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T |
26551693 |
tcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttccc |
26551594 |
T |
 |
Q |
117 |
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216 |
Q |
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T |
26551593 |
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26551495 |
T |
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Q |
217 |
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242 |
Q |
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||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
26551494 |
tcatacaatttgggacggagggagta |
26551469 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Original strand, 31181315 - 31181464
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Q |
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196 |
Q |
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T |
31181315 |
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31181413 |
T |
 |
Q |
197 |
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247 |
Q |
|
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|
T |
31181414 |
cgtgtgaaatgcccaaaatgtcatataatttgtgacagatggagtaaaatt |
31181464 |
T |
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Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Original strand, 38665111 - 38665338
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Q |
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Q |
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T |
38665111 |
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38665210 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|
T |
38665211 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatattc-tttcccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcctaa |
38665308 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || ||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
38665309 |
aacgtcgtacaatttaggacggagagagta |
38665338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 46762175 - 46762327
Alignment:
Q |
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117 |
Q |
|
|
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|
T |
46762175 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaactatttattactatatt-------ttctttcaattatctttccca |
46762267 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatat |
178 |
Q |
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T |
46762268 |
tatt-atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatgttttttttccacacaatat |
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T |
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Target: chr1; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 14 - 244
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8768675 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
8768575 |
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8768477 |
T |
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Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
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|
T |
8768476 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagtaca |
8768444 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5432280 - 5432133
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
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|
T |
5432280 |
caattctttcatttatctttctcatatca-tttattaagtataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttctta |
5432182 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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|
T |
5432181 |
atatgtgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttaggacagaggaagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
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Q |
|
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T |
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atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactactaattactctctcttctttcaattatttaatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
7318703 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcca |
7318605 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
7318604 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
7318574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28121309 - 28121538
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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T |
28121309 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
28121408 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcac--aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
|
|
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T |
28121409 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataattt--cttttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgac |
28121505 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
28121506 |
aaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
28121538 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
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Q |
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T |
31023816 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacattttctattatacccttaactatttattattctctcttctttcatttctttaatctatct |
31023717 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31023716 |
ttttcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcttatacaatattaattacatttcttaatacttgtgaaatgccca |
31023618 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31023617 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
31023587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31500753 - 31500524
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31500753 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactgttaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
31500654 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |
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T |
31500653 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacgcaatattaattgcatttcttaatacgtgttaaatgacca |
31500555 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
31500554 |
aaacgtcttacaatttgggacggatggagta |
31500524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 31809525 - 31809754
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31809525 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaagtattaattactccttcttctttcaattatttcatttatct |
31809624 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
31809625 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacaatttttaatacctgtgaaatggcca |
31809723 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31809724 |
aaacgtcattcaatttggaacggagggagta |
31809754 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33488128 - 33487899
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33488128 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
33488029 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
33488028 |
tttccatac-aatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
33487930 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
33487929 |
aaacgtcttacaatttgggacggaggaagta |
33487899 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6540690 - 6540466
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6540690 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattgtttcatttatct |
6540591 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
6540590 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgatca |
6540492 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
6540491 |
aaacgtcatacaatttggaacggagg |
6540466 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 11353616 - 11353848
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
11353616 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactttttcttctttcaattttttcatttatctt |
11353715 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |
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|
T |
11353716 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatatatatgaaatgttcaa |
11353814 |
T |
 |
Q |
213 |
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246 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
11353815 |
aacgtcgtacaatttgggacggaaggagcacaat |
11353848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35369620 - 35369389
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatc- |
110 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
35369620 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
35369521 |
T |
 |
Q |
111 |
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209 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |
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|
T |
35369520 |
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35369422 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35369421 |
cgaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
35369389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38680109 - 38679881
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
T |
38680109 |
tatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattcctttatttatctt |
38680010 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |
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|
T |
38680009 |
tctcatatcg-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatacaagtgaaatgtctaa |
38679911 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
38679910 |
aacatcatacagtttgggacggagggagta |
38679881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46436509 - 46436277
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattcttt-catttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
46436509 |
atatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattgattactctctcttctttcaattattttcatttatc |
46436410 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
46436409 |
ttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatggcc |
46436311 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
46436310 |
aaaacgtcatacaatttgggacggatggagtaca |
46436277 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 16436111 - 16436326
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
16436111 |
atatgtcgctttacaataccaataaaatattaatattacttttcttattatatctttaactatttattactctctattctttcaattccttcatctatct |
16436210 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
16436211 |
tttccatatca-tttattaaggataattttataaaacagctcataatatctctttctcatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgacca |
16436309 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| |
|
|
T |
16436310 |
aaacgtcatacaatttg |
16436326 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Original strand, 24583944 - 24584069
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Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtg-aaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24583944 |
tattcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaatgcccaaaacg |
24584043 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24584044 |
tcatacaatttgggacggagggagta |
24584069 |
T |
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Target: chr1; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 39501747 - 39501954
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Q |
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tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39501747 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatat |
39501846 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |
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|
T |
39501847 |
ca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccatacaatatcaattacatttcttaatatatgtgaaatggccaaaacgtcat |
39501945 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgg |
229 |
Q |
|
|
| ||||||| |
|
|
T |
39501946 |
acaatttgg |
39501954 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9411025 - 9410878
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||| |
|
|
T |
9411025 |
caattctttcatttatctttcctatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataacttataatatatctttcccaaacaatattaattttatttttta |
9410927 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
9410926 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtataatttgggacggaaggagta |
9410878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #142
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2733896 - 2734125
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2733896 |
atatgtcgttttatgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
2733995 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |
|
|
T |
2733996 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcgtccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatggtca |
2734094 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2734095 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
2734125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7038087 - 7037968
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
7038087 |
atttattaaggacaatattgtaaaacaattcttaatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaatgtcatac |
7037988 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
7037987 |
aatttgggacgaagggagta |
7037968 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10656798 - 10656569
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10656798 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
10656699 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |
|
|
T |
10656698 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatggcca |
10656600 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10656599 |
aaacgttatacaatttgggacggagggagta |
10656569 |
T |
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Target: chr1; HSP #145
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Target Start/End: Complemental strand, 32049558 - 32049335
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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T |
32049558 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt-atttttccttttatatccttaactattcattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |
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|
T |
32049459 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctcttttccacacaatattaata-cattttttaatatgtgtgaaatatctaa |
32049362 |
T |
 |
Q |
213 |
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239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
32049361 |
aacgtcatacaatttaggacgaaggga |
32049335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32871480 - 32871266
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Q |
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124 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | |
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|
T |
32871480 |
caataccaattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcctgtatca-t |
32871382 |
T |
 |
Q |
125 |
ttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataa |
224 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |
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|
T |
32871381 |
ttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaat--ctctcacacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgttcaaaacgtcgtacaa |
32871284 |
T |
 |
Q |
225 |
tttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |
|
|
T |
32871283 |
tttgggacggagggagta |
32871266 |
T |
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Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 39782469 - 39782653
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |
|
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T |
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atatgtcgttttacaatatcaatgcaacattgacgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttacttcaattcttttatttatat |
39782568 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatat |
197 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
39782569 |
ttctcatatt-atttattaaaaacaattttgtaaaacaattcataatatttatttttcatacaatattaattacatttcttaatat |
39782653 |
T |
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Target: chr1; HSP #148
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Target Start/End: Complemental strand, 17179485 - 17179278
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Q |
22 |
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119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| | || || |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17179485 |
ctttacaataccaatgaagaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttactactttctcttcttctaagtcattcatttatctttcatata |
17179386 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
T |
17179385 |
tca-tttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccttttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaatatca |
17179287 |
T |
 |
Q |
220 |
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228 |
Q |
|
|
|| |||||| |
|
|
T |
17179286 |
tacaatttg |
17179278 |
T |
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Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19316537 - 19316389
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Q |
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193 |
Q |
|
|
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|
T |
19316537 |
caattctttcattcatcttttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccacacaatattaattacatttctta |
19316439 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||| |||| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
19316438 |
atatgtgttaaatggccaaaaacgtcgtacaatttgggacggaggaagta |
19316389 |
T |
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Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46272971 - 46272757
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
46272971 |
atatatcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttttattatatccttaactatttattgtcatctcttctttcaattccttcatttatct |
46272872 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |
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|
T |
46272871 |
ttctcatatct-tttattgaggacaattttgtaaaacaacgcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtaaaatgtcca |
46272773 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |
|
|
T |
46272772 |
aaacatcatacaattt |
46272757 |
T |
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Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 50324883 - 50325029
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
50324883 |
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50324982 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
50324983 |
tcccata-tcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatat |
50325029 |
T |
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Target: chr1; HSP #152
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
41457930 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatct |
41457831 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| | ||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
41457830 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaatttataatttctgttctccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
41457732 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
41457731 |
aaacgtcgtacaatttcggacggagagagta |
41457701 |
T |
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Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45269198 - 45268970
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Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45269198 |
tatgtcgttttataatctcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttatttcaattatttcatttatctt |
45269099 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
T |
45269098 |
ttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaataaccaa |
45269000 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
45268999 |
aacgtcatacaatttgagacggaggaagta |
45268970 |
T |
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Target: chr1; HSP #154
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Query Start/End: Original strand, 14 - 228
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Q |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1395734 |
atatgtcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactacctcttctttcaattatttcatttatct |
1395833 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
1395834 |
tttccatact-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaatattaattacatttcttaata-ctgtgaaatggcca |
1395931 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| |
|
|
T |
1395932 |
aaacgtcatacaatttg |
1395948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48110809 - 48110665
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ttctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
48110809 |
ttctttcatttatctttcccatatca-tttatcaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttctagacaaaattaattacatttcttaata |
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T |
 |
Q |
197 |
tgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||||| |
|
|
T |
48110710 |
cgtatgaaattcccaaaacgtcatataatttggaacagaaggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #156
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111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
3788102 |
atatgtcattttacaatacaaatgcaatattaatgttacttttcctattatatccttaactcttaattactccctattctttcaattatttcatttttct |
3788201 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |
|
|
T |
3788202 |
tttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatggcca |
3788300 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |
|
|
T |
3788301 |
aaacgtcatacaattt |
3788316 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #157
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| |
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|
T |
50309850 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttctta |
50309752 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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|
|
T |
50309751 |
atacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttaggacggaaggagta |
50309703 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #158
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17 |
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114 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
7572528 |
tgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattgtatccttaactatttattactctcccttcttttaattttttcatttatctttc |
7572429 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgt |
201 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||| |||| |
|
|
T |
7572428 |
ttatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcgctttcccacacaaaattaattacattttttaatacgtgt |
7572343 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #159
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49251783 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatccttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatg |
49251684 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
49251683 |
tca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaatattaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
|
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|
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T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31583315 - 31583085
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
31583315 |
atatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttttaattatttcatttatct |
31583216 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagca-tttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| || |||||||||| ||| |||||| || |
|
|
T |
31583215 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacattttcttaatacgtgcgaaatggcc |
31583117 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31583116 |
aaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
31583085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 44789323 - 44789544
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44789323 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctatcatatcattaagtatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatct |
44789422 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |
|
|
T |
44789423 |
ttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcgtaatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtcta |
44789521 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgg |
234 |
Q |
|
|
||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
44789522 |
aaacgtcatacaattcgggacgg |
44789544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 83133 - 83063
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
T |
83133 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
83063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Original strand, 16108530 - 16108639
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggg |
230 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
16108530 |
aggacaattttataatataactcataatatatcttttccacataatattaattgcatttattaataggtgtgaaatgtttaaaacgtcatacattttggg |
16108629 |
T |
 |
Q |
231 |
acggagggag |
240 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
16108630 |
acggagggag |
16108639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15170291 - 15170059
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatc- |
110 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
15170291 |
atatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
15170192 |
T |
 |
Q |
111 |
-tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | || | || |||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |
|
|
T |
15170191 |
ttttttcata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccccacacaatattaattatatttcttaatacgt-taaaatgg |
15170094 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15170093 |
ccaaaacatcatacaatttgggacggagggagtac |
15170059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46569147 - 46568957
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
46569147 |
atatgtcgttttataatac-aattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatactttcatttatct |
46569049 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
46569048 |
tt-ccatat--atttgttaaggacaattttgtaaaacaacttatattatctctttcacacacaatattaattacatttattaatatgcgtgaaat |
46568957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 13387580 - 13387651
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
13387580 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
13387651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23825228 - 23825157
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
23825228 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaactattaattactc |
23825157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 38606200 - 38606153
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38606200 |
gtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
38606153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51417593 - 51417522
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
51417593 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
51417522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Original strand, 24583885 - 24583941
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
24583885 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
24583941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34186479 - 34186415
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
34186479 |
gctttacaatatcaatgaaacattaatattactttttctattataaccttaattatgtattactc |
34186415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Original strand, 52177930 - 52178061
Alignment:
Q |
104 |
atttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtga |
203 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| || | | |
|
|
T |
52177930 |
atttatctttctcatatca-tttattaagaacaattttgcaaaacgactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtttaa |
52178028 |
T |
 |
Q |
204 |
aatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
52178029 |
aatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggag |
52178061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10977893 - 10977834
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta |
82 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
10977893 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatacccttaactatttatta |
10977834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 290498 - 290428
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
T |
290498 |
atatgccgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
290428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31681759 - 31681559
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
31681759 |
tatgccgctttacaataccaaagaaacattaatgttatttttactattatatccttaactatttattactttctcttctttcaagtcattcatttatctt |
31681660 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| || | ||||| | ||||||||||| ||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||||| || ||| |||||||| |
|
|
T |
31681659 |
tcttat-gtcatttactaaggacaattttgtaaaataattaataatatccatttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtatgagatgcccaa |
31681561 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
31681560 |
aa |
31681559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35150159 - 35150094
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35150159 |
caattatttaatttatctttctcatat-aatttattaaggataattttataaaacaactcataatat |
35150094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 290390 - 290258
Alignment:
Q |
103 |
catttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtg |
202 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
T |
290390 |
catttatcttttccatatca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtg |
290292 |
T |
 |
Q |
203 |
aaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||| ||||| || || |||||||||||||| |
|
|
T |
290291 |
aaatggtcaaaaagtcttacaatttgggacggag |
290258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 232
Target Start/End: Original strand, 46288098 - 46288207
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||||| | |||||| ||| |
|
|
T |
46288098 |
atttattaaggataattttataaaacaactcataatatatctttttaatacaaaattaattgtattttttaatacgtgtgaaatgacaaaaataatttat |
46288197 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
46288198 |
aatttgggac |
46288207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 16966704 - 16966776
Alignment:
Q |
13 |
aatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
16966704 |
aatatgtcgctttacaataacaatgaaacattaatattatttttcatattatatctttacatatttattactc |
16966776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 40132285 - 40132353
Alignment:
Q |
17 |
tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
40132285 |
tgtcgctttacgatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactc |
40132353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 161
Target Start/End: Original strand, 27352395 - 27352461
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatatt |
161 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27352395 |
caatactttaatttatatttctcatat-aatttattaaagacaattttataaaacaactcataatatt |
27352461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 236
Target Start/End: Original strand, 50326237 - 50326288
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
50326237 |
cattttttaatatgtgtgaaatgtctaaaacatcatataatttgggacggag |
50326288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5432389 - 5432339
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5432389 |
tatgtcactttagaataccaattaaacattaatgttacttttcctattata |
5432339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 35691724 - 35691662
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
35691724 |
tttacaataccaataaaacattaattttactttttatattatacccttaattatttattactc |
35691662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 39640327 - 39640393
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
39640327 |
gtcgcttaacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaattattaattact |
39640393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 47562578 - 47562643
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
47562578 |
caattctttaatttatctttctcatatca-tttattaaggacaattttataaaacaatacataatat |
47562643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 52177839 - 52177889
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
52177839 |
tatgtctctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattata |
52177889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25279402 - 25279293
Alignment:
Q |
134 |
acaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagca-tttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| |||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||| || |
|
|
T |
25279402 |
acaattttgtaaaataactcataatattcctttaccatactaaattaattacatttttttaatacgtgtgaaattccaaaaacatcttataatttggaac |
25279303 |
T |
 |
Q |
233 |
ggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |
|
|
T |
25279302 |
ggatggagta |
25279293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26448170 - 26448042
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
T |
26448170 |
caattctttaatttatctttcacat-ttcatttattaaggacaattttgtaacacaactcacaatatcttttttccatataaaattaattacatttctta |
26448072 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatata |
223 |
Q |
|
|
||| ||| || || |||||| |||||||| |
|
|
T |
26448071 |
atacatgtaaattgaccaaaacatcatata |
26448042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 47945893 - 47945957
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
T |
47945893 |
aattctttcatttatcttttttatatta-tttattaaggacaattttataaaacaattcgtaatat |
47945957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49251619 - 49251570
Alignment:
Q |
199 |
tgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
49251619 |
tgtgaaatgcctaaaacgtcatataatttgggacggagggagtagaattt |
49251570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3280977 - 3280857
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| |
|
|
T |
3280977 |
atttattaaggaaaaatttgtaaaataactcataatatctctttctcagacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtat |
3280878 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
3280877 |
aatttgagacggagagagtac |
3280857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 6597068 - 6597124
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
6597068 |
atttcttaatacgtgtaaaatgcctaaaatatcatacaatttgggatggagagagta |
6597124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 9902133 - 9902237
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
9902133 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcgttatatcacctttccatacaaaattaattacatttcttgatacgtatgaaatgtctaaaatatcatat |
9902232 |
T |
 |
Q |
223 |
aattt |
227 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
9902233 |
aattt |
9902237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41617472 - 41617416
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
41617472 |
atttcttaacacatgtgaaatgtccaaaatgtcatataatttgggacggaggaagta |
41617416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 20793396 - 20793463
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
20793396 |
gtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttattttttttattatatccttaattattaattactc |
20793463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 34022398 - 34022363
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgt |
49 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
34022398 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgt |
34022363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36633291 - 36633221
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
36633291 |
atatgttgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcatattatatccttaaccatttattactc |
36633221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 242
Target Start/End: Original strand, 39387642 - 39387753
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggg |
230 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |
|
|
T |
39387642 |
aggacaattttctaaaacaacccataatatatatttttcacacgatattgattagatttcttaatacatgtgaaatgcctaaatcatcatataatttttg |
39387741 |
T |
 |
Q |
231 |
acggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||| |
|
|
T |
39387742 |
acagagggagta |
39387753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41617637 - 41617595
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
41617637 |
tttacaataccagtgaaacattaatgttactttttctattata |
41617595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 33086803 - 33086868
Alignment:
Q |
163 |
cttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
33086803 |
cttttccacacaatattaattgcatttcttaacatgtattaaatgtccaaaacgtcatacaatttg |
33086868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Original strand, 50972933 - 50972995
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataat |
158 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
50972933 |
caattctttaatttatctttcacatac--atttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
50972995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6519719 - 6519648
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttt |
166 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
6519719 |
caattctttaatttatttttctcatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatttcttt |
6519648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Original strand, 27422690 - 27422742
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataa |
66 |
Q |
|
|
|||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
T |
27422690 |
atatgtcgttatagaataccaatgcaatattaatgttactttttctataataa |
27422742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 204
Target Start/End: Original strand, 36317723 - 36317831
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctt |
192 |
Q |
|
|
||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
36317723 |
caattatttcattttattttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctctttttc--acaatattaattatatttctt |
36317819 |
T |
 |
Q |
193 |
aatatgtgtgaa |
204 |
Q |
|
|
||||| |||||| |
|
|
T |
36317820 |
aatatatgtgaa |
36317831 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 166)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37881657 - 37881430
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37881657 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattattctcttctttcaattctttcatttatcttt |
37881558 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
37881557 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaa |
37881459 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
37881458 |
acgtcatacaatttgggacggggggagta |
37881430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 13987601 - 13987830
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13987601 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
13987700 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13987701 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
13987799 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13987800 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13987830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 937847 - 938080
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
937847 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctatctttttcaattctttcatttatctt |
937946 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatatta----atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
937947 |
tcccatattatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
938046 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
938047 |
ctaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
938080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27366460 - 27366231
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
27366460 |
atatatcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
27366361 |
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T |
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27366231 |
T |
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Target: chr5; HSP #5
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T |
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T |
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23320290 |
T |
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Target: chr5; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 36302921 - 36302692
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Q |
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36302822 |
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T |
36302722 |
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36302692 |
T |
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Target: chr5; HSP #7
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Q |
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T |
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211 |
Q |
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T |
39729687 |
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T |
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242 |
Q |
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T |
39729588 |
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39729558 |
T |
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Q |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
115 |
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Q |
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T |
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T |
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215 |
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T |
13662238 |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 25538095 - 25538324
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T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
25538195 |
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25538293 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
25538294 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25538324 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 35288170 - 35288398
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Q |
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111 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
35288270 |
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35288368 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
35288369 |
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35288398 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
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Q |
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T |
12659062 |
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12659161 |
T |
 |
Q |
114 |
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Q |
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T |
12659162 |
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12659260 |
T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
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T |
12659261 |
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12659289 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
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113 |
Q |
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|
T |
27807967 |
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27807868 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
27807867 |
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27807769 |
T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
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T |
27807768 |
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27807740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
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Q |
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T |
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atatgtcgctttacaatacctatgcaatattaatgttatttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaattctttcatttatct |
35809354 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
35809353 |
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35809255 |
T |
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Q |
212 |
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239 |
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T |
35809254 |
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35809227 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
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T |
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35189332 |
T |
 |
Q |
115 |
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214 |
Q |
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T |
35189333 |
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35189431 |
T |
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Q |
215 |
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242 |
Q |
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T |
35189432 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
35189459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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Q |
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T |
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tatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
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T |
 |
Q |
113 |
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211 |
Q |
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T |
40041054 |
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T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
40041153 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatct |
4456547 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
4456548 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgccca |
4456646 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
4456647 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4456677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 28377693 - 28377919
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Q |
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Q |
|
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T |
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tatgtcactttacgataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatattcttaattatttattacttttttttttcaattctttcatttatctttc |
28377792 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
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T |
28377793 |
ccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
28377891 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28377892 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
28377919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40915639 - 40915411
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Q |
15 |
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|
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T |
40915639 |
tatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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Q |
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T |
40915539 |
tcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
40915441 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
40915440 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40915411 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 42940822 - 42941050
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T |
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Q |
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212 |
Q |
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T |
42940922 |
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42941020 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
42941021 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42941050 |
T |
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Target: chr5; HSP #20
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T |
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Q |
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211 |
Q |
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T |
8050543 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgccca |
8050641 |
T |
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Q |
212 |
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240 |
Q |
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T |
8050642 |
aaacgtcatacaatttgggaccgagggag |
8050670 |
T |
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Target: chr5; HSP #21
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Q |
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T |
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T |
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Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
26256454 |
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26256552 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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T |
26256553 |
aaacgtcata-catttgggacggagggagta |
26256582 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 12360843 - 12361071
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Q |
|
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tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
12360942 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
12360943 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatattactttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
12361041 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
12361042 |
aacgttatacaatttgggacggagggagta |
12361071 |
T |
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Target: chr5; HSP #23
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Q |
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Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
9461513 |
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9461611 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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||| ||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
9461612 |
aaacgtcatataatttgggacggaggaagta |
9461642 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | |
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T |
36302485 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttattt |
36302386 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
36302385 |
ttcccatat-aatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
36302287 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |
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T |
36302286 |
aaacgtcatacaatttgggatggatggagta |
36302256 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
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Q |
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119 |
Q |
|
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||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |
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|
T |
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ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcata |
36347326 |
T |
 |
Q |
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219 |
Q |
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| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
36347325 |
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36347227 |
T |
 |
Q |
220 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36347226 |
tacaatttgggacggagggagta |
36347204 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
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|
T |
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tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
5378091 |
tcctatatta-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
5377993 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|
T |
5377992 |
aacatcgtacaatttgggacggagggagta |
5377963 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
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|
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|
T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
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T |
27293424 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtcaaatgcccaa |
27293326 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
27293325 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
27293296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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Q |
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T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
29816360 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29816458 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
29816459 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29816488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34607021 - 34606793
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Q |
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112 |
Q |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
34606921 |
tctcatatct-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
34606823 |
T |
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Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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T |
34606822 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34606793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
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|
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T |
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atatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
43359807 |
ttctcatatta-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacgatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgccca |
43359905 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
43359906 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43359936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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 |
Q |
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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T |
4047728 |
tccaatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
4047630 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
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T |
4047629 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
4047600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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T |
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tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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 |
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213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
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|
|
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2606647 - 2606418
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
2606647 |
atatctcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcgtttatct |
2606548 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2606547 |
ttcccgtatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgccca |
2606449 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2606448 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2606418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 11130207 - 11130440
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
11130207 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
11130306 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
11130307 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtctaa |
11130405 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11130406 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtacaatt |
11130440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 20495492 - 20495721
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20495492 |
atatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatct |
20495591 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
20495592 |
tttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
20495690 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20495691 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
20495721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 34163178 - 34163407
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34163178 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttcatttatctt |
34163277 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggac-aattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34163278 |
tcctatatca-tttattaaggaataattttgtaaaacaactcataatatctctttaccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
34163376 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34163377 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34163407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19282664 - 19282479
Alignment:
Q |
18 |
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117 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
19282664 |
gtcgctttacaataccaatgcaatattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctcttctttcaattatttcatttatctttccca |
19282565 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtga |
203 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19282564 |
tatta-tttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattgcatttcttaatatgtgtga |
19282479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25784756 - 25784528
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25784756 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
25784657 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25784656 |
tcccatatca-tttatgaaggataattttgtaaaaaaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
25784558 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25784557 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
25784528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29000941 - 29000705
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29000941 |
tatgtcactttagaataccaatggaacattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
29000842 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29000841 |
tctcatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29000743 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaattttg |
250 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
29000742 |
aacgtcatacaatttgggacgaagggagtataattttg |
29000705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7363324 - 7363094
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
7363324 |
atatgtcgctatacaataccaatgaaaatttaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
7363225 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
7363224 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacttttcttaatatgtgttaaatgccca |
7363126 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7363125 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagtac |
7363094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14153722 - 14153501
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14153722 |
tatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctt |
14153623 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14153622 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
14153524 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
14153523 |
aacgtcatacaatttgggacgga |
14153501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 6335014 - 6335226
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
6335014 |
ctttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaattatttattaccccttc-------ttctttcatttatctttctcatatc |
6335106 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
6335107 |
a-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
6335205 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
6335206 |
caatttgggacggaggaagta |
6335226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9246080 - 9246296
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
T |
9246080 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcattaactatttattactatctcttcttttaattttttcatttatct |
9246179 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9246180 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccgcacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
9246278 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgg |
229 |
Q |
|
|
||| | ||||||||||| |
|
|
T |
9246279 |
aaacgttatataatttgg |
9246296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 9591410 - 9591602
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
9591410 |
tatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
9591509 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
9591510 |
tcccatatta-tttattaaggacagttttgtaaaacaactcacaatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaat |
9591602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39896025 - 39895797
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39896025 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattactgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
39895926 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
39895925 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
39895827 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39895826 |
aacatcatacaatttgggacggagggagta |
39895797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 8542815 - 8543044
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| | |
|
|
T |
8542815 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattggtctctcttcttttaattccttcatttatat |
8542914 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8542915 |
ttcccatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgccca |
8543013 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
8543014 |
aaacatcata-catttaggatggagggagtac |
8543044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8042580 - 8042358
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8042580 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctt |
8042481 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
8042480 |
tctcata-tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataata------tcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
8042388 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8042387 |
aacgttatacaatttgggacggagggagta |
8042358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 12503901 - 12504127
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12503901 |
tatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
12504000 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12504001 |
tcccatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatt--tttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
12504097 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||| || ||||||| ||||| |
|
|
T |
12504098 |
aacatcatacaatctgagacggagtgagta |
12504127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22635763 - 22635534
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
T |
22635763 |
tatgttgctttacgatataaatgcaactttaatgtcactttttctattataacattaactatttattactctctcttatttcaattcttttatttatttt |
22635664 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
22635663 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
22635565 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
22635564 |
aacgtcatacaatttggaacggagggagtac |
22635534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27187439 - 27187210
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||| |
|
|
T |
27187439 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgatctctcttctttcaaatccttcatttatct |
27187340 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27187339 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
27187241 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
27187240 |
aaacgttatacaatttaggacggatggagta |
27187210 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 35869985 - 35870214
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaa-tgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
35869985 |
tatgtcgctttacaataccaaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatgcttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
35870084 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
35870085 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttca |
35870183 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
35870184 |
aaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
35870214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 36487339 - 36487567
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
36487339 |
tatgtcgttttacaataccaatgaagcattaatgttattttttctattatatccttaattatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctt |
36487438 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
36487439 |
tcccatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatattcatttttcacacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
36487537 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36487538 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36487567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 15856356 - 15856582
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
15856356 |
atatgtcgttttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatct |
15856455 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
15856456 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
15856554 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15856555 |
aaacttcatacaatttgggacggaggga |
15856582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2914478 - 2914707
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2914478 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
2914577 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
2914578 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
2914676 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2914677 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2914707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6517624 - 6517407
Alignment:
Q |
26 |
acaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaa |
123 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
6517624 |
acaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattcttttatttatctttctcatatca- |
6517526 |
T |
 |
Q |
124 |
tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatata |
223 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |
|
|
T |
6517525 |
tttattaaggataattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaaacatcataca |
6517426 |
T |
 |
Q |
224 |
atttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
T |
6517425 |
atttaggacggagggagta |
6517407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 9201184 - 9201413
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
9201184 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatct |
9201283 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || || | |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |
|
|
T |
9201284 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaataattctttatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaataccta |
9201382 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9201383 |
aaacatcatacaatttggaacggagggagta |
9201413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 14341807 - 14342027
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
14341807 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaacactaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttc-------ttctttcatttatattt |
14341899 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
14341900 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatgtcccacacaacattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaa |
14341998 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14341999 |
acgtcatacaatttgggatagagggagta |
14342027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34382047 - 34381819
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
34382047 |
tatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatgtt |
34381948 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34381947 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
34381849 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34381848 |
aacgtcgtacaatttgtgacggagggagta |
34381819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 1122519 - 1122666
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
1122519 |
caattatttcatttgtctttcccatat-aatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttatta |
1122617 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1122618 |
atatgtgtgaaatgcctaaaatatcgtacaatttggaacggagggagta |
1122666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 8225663 - 8225904
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc-------aattctttcatt |
106 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
8225663 |
atatgtcgctttacaataccaatgaataattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaatataatttcttcatt |
8225762 |
T |
 |
Q |
107 |
tatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8225763 |
tatctttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttttttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
8225861 |
T |
 |
Q |
207 |
gcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
T |
8225862 |
gcccaaaacatcatacaatttggaacagagggagtataatttt |
8225904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9577699 - 9577471
Alignment:
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14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9577699 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctattctttcaattatttcatttatct |
9577600 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
9577599 |
tttccatac--atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
9577502 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9577501 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
9577471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28024617 - 28024854
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
28024617 |
atatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataactttaattatttattactctatcttctttcaattctttcatttat-t |
28024715 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgc---------acaatattaatagcatttcttaatatgtgtg |
202 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
28024716 |
tttccata-taatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaacaatattaattgtatttcttaatatgtgtg |
28024814 |
T |
 |
Q |
203 |
aaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28024815 |
aaatacccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
28024854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41348960 - 41348740
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
41348960 |
atatgtcgctttataataccaatgaaagattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattact-------ttctcttctttcatttatcttt |
41348868 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
T |
41348867 |
cccatatca-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaatatattacatttcttaatatgtgtgaaatgtctaaa |
41348769 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
41348768 |
acgtcatacaatttgggacggagcgagta |
41348740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 7458631 - 7458860
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
7458631 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattaccctattttctttcaattatttcatttatct |
7458730 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
7458731 |
ttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgacca |
7458829 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
7458830 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
7458860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8883253 - 8883482
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8883253 |
atatgtcgctttacaataccgatgaaaaattaatattatttttcctattatattattaactatttattgctctcttctttcaattccttcatttatcttt |
8883352 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata--tgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
8883353 |
ccaatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgtgaaatgccca |
8883451 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8883452 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8883482 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21772874 - 21772645
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
21772874 |
atatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatct |
21772775 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
21772774 |
ttcttatatca-tttattaaggataattttgtaaaataattcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttagtatgtgtgaaatgccca |
21772676 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
21772675 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
21772645 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 231
Target Start/End: Original strand, 26630452 - 26630645
Alignment:
Q |
39 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggaca |
136 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
26630452 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattcttttatttatctttcctatatta-tttattaaggaca |
26630550 |
T |
 |
Q |
137 |
attttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |
|
|
T |
26630551 |
attttgtaaaacaactaataatatcttttttccacacgatattaattgcattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtaatacaatttggga |
26630645 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34381596 - 34381371
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34381596 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctctaactatttattactctttctcatttcaattttttcatttatctt |
34381497 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
34381496 |
ttccataaca-tttattaaggatcgttttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgatatgcccaa |
34381398 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
34381397 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
34381371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38394353 - 38394124
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
38394353 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttcttttaattatttcatttatct |
38394254 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
38394253 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
38394155 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38394154 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
38394124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 4431567 - 4431798
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4431567 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
4431666 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
4431667 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgacca |
4431765 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4431766 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtaca |
4431798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13978450 - 13978233
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
13978450 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
13978351 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13978350 |
tctcata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
13978263 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13978262 |
aacgtcatataatttgggacggaggaagta |
13978233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29619444 - 29619214
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
29619444 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactttctcttttttcaattccttcatttatct |
29619345 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtg-aaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
T |
29619344 |
ttcccttatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcatttccacataatattaattacatttcttaatatatgtgaaaatgccc |
29619246 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
29619245 |
aaaacgtcttacaatttgggatagagggagta |
29619214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32706786 - 32707015
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32706786 |
atatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
32706885 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
32706886 |
tttccat-gccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
32706984 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32706985 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32707015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 9641078 - 9641310
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
9641078 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
9641177 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
9641178 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
9641276 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
T |
9641277 |
gtcatacaatttggaacggagggagtataatttt |
9641310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39990426 - 39990196
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39990426 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatt-attattcttttttctttcaattctttcatttatctt |
39990328 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| | |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
39990327 |
ttc-atatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
39990230 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaat |
246 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39990229 |
aatgtcatacaatttaggacggagggagtacaat |
39990196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10602059 - 10601827
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-----caattctttcattta |
108 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |
|
|
T |
10602059 |
atatgtagctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttttttttttttcaattcctttattta |
10601960 |
T |
 |
Q |
109 |
tctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10601959 |
tcttttccatatca-tttattaaggacaattttataaaataactcataatatctatttctcacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatag |
10601861 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
10601860 |
ccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
10601827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 32833619 - 32833842
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32833619 |
atatgtcgctttacaatcccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
32833718 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
32833719 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatggcca |
32833817 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
32833818 |
aaatatcatacaatttaggacggag |
32833842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4890092 - 4889945
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
4890092 |
caattctttcatttatctttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttctta |
4889994 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4889993 |
atatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
4889945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18473203 - 18472984
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18473203 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactatatccttaactattttactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatc |
18473104 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |
|
|
T |
18473103 |
a-tttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatttgtttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaagcccaaaacctcgta |
18473005 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18473004 |
caatttgggacggagggagta |
18472984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 440071 - 439842
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
440071 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
439972 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
439971 |
tttccatatca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgtaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
439873 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
439872 |
aaatgtcatacaatttggaacggagggagta |
439842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 11313000 - 11313217
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || || || ||||||||||| |
|
|
T |
11313000 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaagattaatgtttcttttcctattatatccttaactatttattacactctcttctttcagtttcttcatttatct |
11313099 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11313100 |
ttctcatatca-tttactaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaaaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
11313198 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttggg |
230 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
11313199 |
aaacgtcatacaatttggg |
11313217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 18048629 - 18048858
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18048629 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
18048728 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |
|
|
T |
18048729 |
tttccatacca-tttcttaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtaaaatggcca |
18048827 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
18048828 |
aaacgtcatacaattttggacggagggagta |
18048858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18094699 - 18094478
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
18094699 |
ctttacaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcata |
18094600 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
18094599 |
tca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacactatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
18094501 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
18094500 |
tacaatttaggacggagagagta |
18094478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 19712541 - 19712758
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
19712541 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
19712640 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
19712641 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaaaac |
19712739 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacgg |
234 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
19712740 |
gtcatacaatttaggacgg |
19712758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21195263 - 21195034
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
21195263 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
21195164 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| | ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
21195163 |
tttccatac-aatttattaaggataatattgtaaaacaattaataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
21195065 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21195064 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
21195034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24781191 - 24780962
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24781191 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
24781092 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
24781091 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccgcacaatattaattaaatttcttaatacatgtgaaattgcca |
24780993 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24780992 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24780962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Original strand, 37410771 - 37410913
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
37410771 |
aattctttcatttatctttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctttttttcacacaatattaattacatttcttaa |
37410869 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggg |
238 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
37410870 |
tatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggatggaggg |
37410913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2881875 - 2882100
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |
|
|
T |
2881875 |
atatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattatttttcctattataacattaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatat |
2881974 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
2881975 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaattcataatatattttttccac---ataataattgcatttcttaatatgtctgaaatg-cca |
2882069 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
2882070 |
aaacgtcatacaatttaagacggagagagta |
2882100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 29665369 - 29665604
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29665369 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
29665468 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
29665469 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgatca |
29665567 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
29665568 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagtaaaattt |
29665604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39410643 - 39410444
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39410643 |
tatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
39410544 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||| ||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39410543 |
tcccgtatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
39410445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43403460 - 43403280
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
43403460 |
atatgtcgcattacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatcttt |
43403361 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaat |
195 |
Q |
|
|
| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
43403360 |
ctcata-tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaattttaattacatttcttaat |
43403280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 9248983 - 9249213
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
9248983 |
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T |
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Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
9249083 |
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9249181 |
T |
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Q |
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243 |
Q |
|
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T |
9249182 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagtac |
9249213 |
T |
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Target: chr5; HSP #93
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Target Start/End: Complemental strand, 10832740 - 10832593
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
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||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||| |
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T |
10832740 |
caattttttcatttatcttttccatatta-tttataatggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattgtatttctta |
10832642 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
|
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T |
10832641 |
atatgtgtgaaatatccaaaacgtcatacaatttgggacagagggagta |
10832593 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14640225 - 14639998
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
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T |
14640225 |
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14640126 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
14640125 |
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14640027 |
T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
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| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
14640026 |
acgtcttacaatttgggacggagggagta |
14639998 |
T |
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Target: chr5; HSP #95
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10934979 - 10934750
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttattt |
10934880 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
10934879 |
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10934781 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
10934780 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
10934750 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15268500 - 15268271
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
15268500 |
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15268401 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
15268400 |
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15268302 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
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T |
15268301 |
aaacgtcatacaatttgggacagagggagta |
15268271 |
T |
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Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 16745425 - 16745568
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Q |
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193 |
Q |
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T |
16745425 |
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16745523 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
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||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
16745524 |
atatgtgtgaaatacccaaaacatc----aatttgggacggagggagta |
16745568 |
T |
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Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22510455 - 22510684
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Q |
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111 |
Q |
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T |
22510455 |
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22510554 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
22510555 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
22510653 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
22510654 |
aaacgtcatacaatttggaacggaggaagta |
22510684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39527486 - 39527714
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
39527486 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttctttcaattatttcatttatct |
39527585 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
39527586 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtttgaaatggcca |
39527684 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
39527685 |
aaacgccatacaattt-ggacggagggagta |
39527714 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 40555124 - 40555353
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
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T |
40555124 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactctctcttttttcaattatttcatttatct |
40555223 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
40555224 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
40555322 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
40555323 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
40555353 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22801913 |
atatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatct |
22801814 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcaca-atattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
22801813 |
ttctcatatca-tttattaaggataattttataaaataactcataatat--ctttttccaacacatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
22801717 |
T |
 |
Q |
211 |
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227 |
Q |
|
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|||| |||||| ||||| |
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|
T |
22801716 |
aaaacatcatacaattt |
22801700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40275406 - 40275178
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
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|
T |
40275406 |
tatgttgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctt |
40275307 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |
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T |
40275306 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaaaattaattacatttcttaatgcgtgtgaaatacccaa |
40275208 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|
|| || || ||||||||||||||| |||| |
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T |
40275207 |
aacgtcgtacaatttgggacggaggaagta |
40275178 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #103
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5847031 - 5846804
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |
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|
T |
5847031 |
atatgtcgttttataatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttctttcaattattttatttatcttt |
5846932 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
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T |
5846931 |
tccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatcggcaaa |
5846833 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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| ||||| |||||||||||||| ||||| |
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|
T |
5846832 |
acgtcatacaatttgggacggagagagta |
5846804 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #104
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgatacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
4744859 |
ttcctata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttattttccccacacaatattaatgacatttcttaatatgtgcgaaatgacca |
4744957 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
4744958 |
aaacgtcatacaatttgggacgaatggagta |
4744988 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
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14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
|
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T |
32292508 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatattcttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
32292607 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
32292608 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
32292706 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
32292707 |
aaacgtcatacaatttgagacggatggagta |
32292737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34900227 - 34899998
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
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T |
34900227 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
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T |
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tttccata-ccttttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacagaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
34900029 |
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Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|
T |
34900028 |
atacgtcatacaatttggaacggatggagta |
34899998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40365518 - 40365289
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
40365518 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatccttaattattaattactctctcttcttttaattatttcatttatct |
40365419 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
40365418 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatagcca |
40365320 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40365319 |
aaacttcttacaatttgggacggagggagta |
40365289 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16284930 - 16284817
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
16284930 |
atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtg-aatgcccaaaacatcatac |
16284832 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |
|
|
T |
16284831 |
aatttgggacggagg |
16284817 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20656485 - 20656338
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatt--actcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||| |
|
|
T |
20656485 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattacactctcttctttcaattcctttatttatct |
20656386 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20656385 |
ttccaata-tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
20656338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 23991766 - 23991834
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta |
82 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
23991766 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttatta |
23991834 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33629956 - 33629728
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaata---ccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcattta |
108 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
33629956 |
atatgtcgctttacaataataccaataaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaattatttcattta |
33629857 |
T |
 |
Q |
109 |
tctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
33629856 |
tcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaatttcatttcttaatacgtgtgaaatga |
33629758 |
T |
 |
Q |
209 |
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238 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
33629757 |
ccaaaacgtcatacaatttgcgacggaggg |
33629728 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 37337081 - 37337285
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
37337081 |
tatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctt |
37337180 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
37337181 |
tttcata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaa |
37337268 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgg |
229 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
37337269 |
aatgtcatacaatttgg |
37337285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 11247974 - 11248203
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
11247974 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
11248073 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
11248074 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgtca |
11248172 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11248173 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
11248203 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13090090 - 13089865
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || ||||||||| ||||| |
|
|
T |
13090090 |
gtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcttattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatttttcc |
13089991 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |
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|
T |
13089990 |
tatatca-tttactaaggacaattttataaaacaattcataatatccctttccaacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgtccaaaac |
13089892 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
13089891 |
gtcatacaatttgggatggagggagta |
13089865 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 18652259 - 18652488
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18652259 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatctccttgactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
18652358 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
18652359 |
ttctcata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatttctcttccccatacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
18652457 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18652458 |
aaacgtcatacattttgggacggagggagta |
18652488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31196279 - 31196051
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
31196279 |
tatgtcgctttacaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctt |
31196180 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| || || || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
31196179 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatctatttcccacataaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatgcccaa |
31196081 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31196080 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
31196051 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2620268 - 2620037
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2620268 |
atatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaacgttacttttcctattatatgcttaactattaattacttcctcttctttcaattatttcatttatct |
2620169 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttattta-ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
T |
2620168 |
tttccatacca-tttattaaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctaccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgtaatggcc |
2620070 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2620069 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
2620037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 10370602 - 10370789
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
10370602 |
atatgtcgctttacaatattaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
10370701 |
T |
 |
Q |
112 |
ttccc-atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgt |
199 |
Q |
|
|
||||| |||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
10370702 |
ttccccatatca-tttattgaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
10370789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 15 - 235
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
6923069 |
tatgtcactttacaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcttttttctttcaattctttcatttatc-- |
6923166 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
6923167 |
----atatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatggccaa |
6923261 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
6923262 |
aacgacatacaatttgggacgga |
6923284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30077361 - 30077135
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
30077361 |
atatgttgctttataatactaatacaatattaatgttgtttttcctattataaccctaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
30077262 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |
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|
T |
30077261 |
ttctcatatta-tttatcaag-ataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattacatttctta--atgtgtgaaataccca |
30077166 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
30077165 |
aaacgtcatacaatttgagacgaagggagta |
30077135 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33798 - 33680
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194 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
33798 |
aattctttcatttatctttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaaaattaattatatttcttaa |
33700 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
33699 |
tatgtatgaaatgaccaaaa |
33680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3633979 - 3634207
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3633979 |
tatgtcactttacaatactaatgaaacattaacgttatttttccaattatatctttaactatttattactattttttctttcaactctttcatttatctt |
3634078 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
3634079 |
ttccatatca-tttattaatgataattttgtaaaacaactcataatatctatttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
3634177 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
3634178 |
aacgtcaataaatttaggacggagggagta |
3634207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 35080330 - 35080541
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
35080330 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttctcata- |
35080428 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
35080429 |
tcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaatattga---------ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
35080519 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
35080520 |
acaatttgggacggagtgagta |
35080541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8035798 - 8036024
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8035798 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
8035897 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
8035898 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttcttaata---ctgaaatgacca |
8035993 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8035994 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
8036024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 10164732 - 10164921
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
10164732 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccctaactatttattactctttctcctttcaattttttcatttatctt |
10164831 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatatta-atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtga |
203 |
Q |
|
|
| | ||| | ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10164832 |
ttc--tatgacatttattaagaacaatcttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
10164921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 5070834 - 5071031
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
5070834 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatct |
5070933 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccat---attaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|| |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
5070934 |
tttccataccatttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaat |
5071031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18026126 - 18025897
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18026126 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatatttatgttacttttcctattctatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
18026027 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
18026026 |
tttacatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
18025928 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
18025927 |
aaacgtcttacaatttgggacggatggagta |
18025897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Original strand, 23991869 - 23991948
Alignment:
Q |
135 |
caattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
23991869 |
caattttataaaagaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaa |
23991948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39630568 - 39630796
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnca--attctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||| |
|
|
T |
39630568 |
atatgtcgttttacgatactaatgaaatattgatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttcttataattatttaatttatct |
39630667 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
39630668 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataat-ttctcttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcca |
39630765 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
39630766 |
aaacgtcatacaatttgggacagagggagta |
39630796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39932865 - 39933094
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
39932865 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
39932964 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
39932965 |
ttctcata-ccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgatca |
39933063 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
39933064 |
aaacgtcatacattttacgacggagggagta |
39933094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 5288901 - 5288971
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
5288901 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataattttaattatttattact |
5288971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Original strand, 13033184 - 13033294
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13033184 |
atttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaattgtgtttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatgc |
13033283 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
13033284 |
aatttgggacg |
13033294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Original strand, 13103157 - 13103267
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13103157 |
atttattaaggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaattgtgtttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatgc |
13103256 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
13103257 |
aatttgggacg |
13103267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21582735 - 21582515
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
21582735 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaattattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
21582636 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| || | |||||| ||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
21582635 |
ca-tttattaagcataattttgtaaaacaactcctaatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcat |
21582537 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21582536 |
tcaatttgggacggagggagta |
21582515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27535040 - 27534810
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
27535040 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttcttttaattatttcatttatct |
27534941 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
27534940 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatctcttaatacgtgtgaaatggtca |
27534842 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27534841 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagtac |
27534810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35584853 - 35584706
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
35584853 |
caattatttcatttatctttttcatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttctta |
35584755 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35584754 |
atacgtgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
35584706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 21486685 - 21486756
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
21486685 |
atatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttactttttctgttatatccttaactatttattactc |
21486756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4890163 - 4890113
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4890163 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
4890113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13510449 - 13510385
Alignment:
Q |
172 |
acaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
13510449 |
acaatattaattacatttcttaatttgtgtgaaatgaacaaaatatcatataattagggacggag |
13510385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3098307 - 3098225
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3098307 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctatacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
3098225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3099262 - 3099192
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
3099262 |
tatgtcactttacgataccaattaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactc |
3099192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 590230 - 590173
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
590230 |
catttcttaatatatgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttgggacgaagggagta |
590173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 590365 - 590308
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
590365 |
atatgtcgttttagaatcccaatacaactttaatgttacttttcctattataacctta |
590308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 16626411 - 16626488
Alignment:
Q |
124 |
tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgt |
201 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
16626411 |
tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgt |
16626488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40029674 - 40029618
Alignment:
Q |
104 |
atttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatatt |
161 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40029674 |
atttatctttctcatacta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatt |
40029618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 21780742 - 21780806
Alignment:
Q |
172 |
acaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
21780742 |
acaatattaattacacttcttaatttgtgtgaaatgaacaaaatatcatataattagggacggag |
21780806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28119088 - 28119048
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta |
63 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28119088 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
28119048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2123894 - 2123729
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
2123894 |
gtcgttttacaataccgatgaaacattaatattatttttcttattatatcattaactatttattattctctcttctttcatttctttaatttatctttct |
2123795 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
2123794 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaat |
2123729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 15251408 - 15251455
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
15251408 |
gtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactata |
15251455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 16745354 - 16745404
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
16745354 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttac-tttcctattata |
16745404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24520601 - 24520530
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
24520601 |
atatgtcgctttataataccaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactc |
24520530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20655049 - 20654983
Alignment:
Q |
176 |
tattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
20655049 |
tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatatccaaaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
20654983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 235
Target Start/End: Original strand, 26678237 - 26678330
Alignment:
Q |
141 |
tataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
T |
26678237 |
tataaaacaacttataatattacttttcaatataaaattaattacattt-ttaatatgtgtgaaatgctcaaaatatcttgtaatttgagacgga |
26678330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 235
Target Start/End: Original strand, 26949847 - 26949940
Alignment:
Q |
141 |
tataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
T |
26949847 |
tataaaacaacttataatattacttttcaatataaaattaattacattt-ttaatatgtgtgaaatgctcaaaatatcttgtaatttgagacgga |
26949940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 86719 - 86631
Alignment:
Q |
110 |
ctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgt |
199 |
Q |
|
|
||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
86719 |
ctttcccatatca-tttatcgaggagaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgt |
86631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39914376 - 39914280
Alignment:
Q |
145 |
aaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
39914376 |
aaacaactcgtaatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaagtg-ccaaaacgtcatataatttgagacggaaggagta |
39914280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 1313267 - 1313330
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
1313267 |
ctttacaataccaatgaaacatcaatattatttttcctattatacacttaactatttattactc |
1313330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2993199 - 2993053
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
2993199 |
aattctttcatttttttttctcatatct-tttattaagaacaatcttataaaataagtcataatatttctttctcatacaatattaattaaatttcttaa |
2993101 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
2993100 |
tacacatgaaatgtccaaaatgttatataatttgagacgaagggagta |
2993053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 10371449 - 10371500
Alignment:
Q |
191 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
10371449 |
ttaatatgtgtgaaattcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
10371500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 85
Target Start/End: Original strand, 31747854 - 31747897
Alignment:
Q |
42 |
attaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31747854 |
attaatgttacttttcctgttatatccttaattatttattactc |
31747897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13557335 - 13557281
Alignment:
Q |
172 |
acaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatt |
226 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13557335 |
acaatattaattacacttcttaatttgtgtgaaatgaacaaaatatcatataatt |
13557281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43402423 - 43402381
Alignment:
Q |
193 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
43402423 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
43402381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4911510 - 4911473
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
4911510 |
atttattaaggacaattttataaaacaacacataatat |
4911473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28118953 - 28118896
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
28118953 |
catttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcttataatttgggatggaaggagta |
28118896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15251344 - 15251300
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
15251344 |
gctttacaataccaatgaaacattgatgttatttttccttttata |
15251300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 39612924 - 39613003
Alignment:
Q |
148 |
caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
39612924 |
caactcataatatttcttttcaatacaaaattaattacattttttaatatgtatgaaatgatc-aaatatcatataatttg |
39613003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 201)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 9724639 - 9724868
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9724639 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
9724738 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9724739 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
9724837 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9724838 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
9724868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39628897 - 39629126
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39628897 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
39628996 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
39628997 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
39629095 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39629096 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39629126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39638447 - 39638676
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39638447 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
39638546 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
39638547 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
39638645 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39638646 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39638676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42827711 - 42827484
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42827711 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacgtttcctattataaccttagctatttattactctcttatttcaattctttcatttatcttt |
42827612 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
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|
|
T |
42827611 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaaaagctaaa |
42827513 |
T |
 |
Q |
214 |
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242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42827512 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
42827484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 9470862 - 9471086
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9470862 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatttatct |
9470961 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9470962 |
ttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
9471060 |
T |
 |
Q |
212 |
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237 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
9471061 |
aaacatcatacaatttgggatggagg |
9471086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 31602940 - 31602709
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31602940 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
31602841 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat--tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31602840 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
31602742 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31602741 |
caaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
31602709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34356569 - 34356798
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
34356569 |
atatgtcgctttacaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttctct |
34356668 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34356669 |
tttccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccca |
34356767 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
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T |
34356768 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34356798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12988208 - 12987980
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |
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|
T |
12988208 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
12988109 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | |
|
|
T |
12988108 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaaagacta |
12988010 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagt |
241 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
12988009 |
aaacgtcatagaatttgggacggagggagt |
12987980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 21545310 - 21545542
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
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|
T |
21545310 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
21545409 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21545410 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
21545508 |
T |
 |
Q |
211 |
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244 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
21545509 |
aaaacgtcatacaatttgggacggaaggagtaca |
21545542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28719737 - 28719966
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
28719737 |
atatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
28719836 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28719837 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
28719935 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
28719936 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
28719966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 17833964 - 17834184
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17833964 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttaattct-------ttcaattctttcatttattttt |
17834056 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |
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|
T |
17834057 |
ctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtctaaa |
17834155 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17834156 |
acgtcatacaatttgggacggaggaagta |
17834184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26394046 - 26393820
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26394046 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatct |
26393947 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
26393946 |
ttcacatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcaacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
26393848 |
T |
 |
Q |
212 |
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239 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
26393847 |
aaacgtcatataatttaggacggaggga |
26393820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29342761 - 29342990
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
29342761 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaattctttcatttattt |
29342860 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
29342861 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacacaatattaattgcattccttaatatgtgtgaaatgtcca |
29342959 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
29342960 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
29342990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7427395 - 7427167
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
7427395 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
7427296 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7427295 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
7427197 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7427196 |
aacgtcatataatttgggacggagggagta |
7427167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26805051 - 26804824
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26805051 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
26804952 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26804951 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacac--tattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
26804855 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
26804854 |
aaacgtcatacaatttgatacggagggagta |
26804824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 29949153 - 29949383
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29949153 |
tatgtcgttttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
29949252 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29949253 |
tcccatatcaatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29949352 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29949353 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
29949383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18203244 - 18203016
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
18203244 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactttttcttatttcaattctttcatttatttt |
18203145 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18203144 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
18203046 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18203045 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18203016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22453540 - 22453312
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
22453540 |
tatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctt |
22453441 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
22453440 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
22453342 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22453341 |
aacatcatataatttgggacggagggagta |
22453312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 13429123 - 13429357
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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|
T |
13429123 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
13429222 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
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T |
13429223 |
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13429321 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |
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T |
13429322 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtataatt |
13429357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9268029 - 9267800
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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|
T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
9267930 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
9267929 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatactaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
9267831 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9267830 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
9267800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 11181298 - 11181527
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |
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|
T |
11181298 |
atatgtcgctttacgatatcaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattatttcatttattt |
11181397 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
11181398 |
ttctcatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
11181496 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|||||| ||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
11181497 |
aaatattatacaatttgggacggagggagta |
11181527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28712390 - 28712619
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
28712390 |
atatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
28712489 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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|
|
T |
28712490 |
ttcccatatta-tttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
28712588 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
28712589 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
28712619 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44263333 - 44263104
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
44263333 |
atatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcgtattataaccttcactatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
44263234 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |
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|
T |
44263233 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaaggccca |
44263135 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44263134 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44263104 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16872585 - 16872357
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
16872585 |
tatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
16872486 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
16872485 |
tcacatatca-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
16872387 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
16872386 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16872357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25838698 - 25838470
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
25838698 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
25838599 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
25838598 |
ttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacgatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
25838500 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
25838499 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25838470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32395262 - 32395034
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
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|
T |
32395262 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctattttctttcaattccttcatttatctt |
32395163 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
32395162 |
tctcatatca-tttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
32395064 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
32395063 |
aacatcataaaatttgggacggagggagta |
32395034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 543800 - 543570
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Q |
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110 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
543800 |
atatgtcgctttacaatacccatgtaacattaatgttactttttccaattataacattaattatttattactccctcttctttcaattctttcatttatc |
543701 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |
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|
T |
543700 |
tttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
543602 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
543601 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
543570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3598868 - 3598642
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |
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|
T |
3598868 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattctttcatttattt |
3598769 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
3598768 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatatcttaatatgtgtgaaatgccca |
3598670 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| |||||| |
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|
T |
3598669 |
aaacgtcatacaatttgggacagaggga |
3598642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 29867312 - 29867538
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
29867312 |
atatgttgcttttaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
29867411 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
29867412 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaatacctcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
29867510 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| || |||||| |
|
|
T |
29867511 |
aaacgtcgtacaatttggaacagaggga |
29867538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 35631082 - 35631312
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
35631082 |
atatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
35631181 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
35631182 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
35631280 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35631281 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
35631312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 548226 - 548021
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Q |
38 |
caacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggac |
135 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
T |
548226 |
caacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattatttcatttatctttcccatatta-tttattaagaac |
548128 |
T |
 |
Q |
136 |
aattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
548127 |
aattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
548028 |
T |
 |
Q |
236 |
gggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
548027 |
gggagta |
548021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1513550 - 1513322
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
1513550 |
atatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctatcttctttcaattctttcatttatct |
1513451 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
1513450 |
ttcccatatta-tatattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgt-aaatgtcca |
1513353 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||| |||||||| |
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T |
1513352 |
aaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
1513322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5449528 - 5449299
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
5449528 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaattttaatgttatttttcctattataatcttaactatttattactctctcttcttccaattctttcatttatct |
5449429 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
5449428 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatttattttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccta |
5449330 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5449329 |
aaacgccatacaatttaggacggagggagta |
5449299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22578260 - 22578489
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22578260 |
atatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
22578359 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22578360 |
ttccaatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattccttaatatgtgtgaaatgccca |
22578458 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22578459 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
22578489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28727379 - 28727608
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
28727379 |
atatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
28727478 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28727479 |
ttcccatatta-tttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
28727577 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
28727578 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
28727608 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 242
Target Start/End: Original strand, 44053129 - 44053338
Alignment:
Q |
34 |
aatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttattta |
131 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
44053129 |
aatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatta-tttattaa |
44053227 |
T |
 |
Q |
132 |
ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
44053228 |
gaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtttgaaatgcctaaaacgtcatacaatttggga |
44053327 |
T |
 |
Q |
232 |
cggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
44053328 |
cggagggagta |
44053338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 19715283 - 19715511
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19715283 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactatttcttctttcaattctttcatttatctt |
19715382 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
T |
19715383 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccatacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
19715481 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19715482 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19715511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 24333064 - 24333292
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
24333064 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattttaaccttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctt |
24333163 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
24333164 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
24333262 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24333263 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24333292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 29938346 - 29938574
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29938346 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
29938445 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29938446 |
tcctatatta-tttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29938544 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29938545 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29938574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30087953 - 30087725
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30087953 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
30087854 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30087853 |
tcctatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
30087755 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30087754 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30087725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 40488194 - 40488411
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40488194 |
atatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaacgatttattactctcttctttcaattctttcatttatcttt |
40488293 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
40488294 |
ctcataata-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcctacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaa |
40488392 |
T |
 |
Q |
214 |
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232 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
40488393 |
acgtcatacaatttgggac |
40488411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Original strand, 44052927 - 44053122
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
44052927 |
atatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
44053026 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
44053027 |
ttcccatatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtttgaaatgc |
44053122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2031616 - 2031388
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2031616 |
atatgtcgctttacaatatccatgcaatattaatgttacttttcctattataacattaatcatttattattctctcttctttcaattttttcatttatct |
2031517 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2031516 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
2031418 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2031417 |
aaacat-atacaatttgggacggagggagta |
2031388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 24616572 - 24616798
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24616572 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattgtatccttaactatttattactttcttctttcaattctttcatttatctttc |
24616671 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24616672 |
tcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
24616770 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24616771 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
24616798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 5830998 - 5831226
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
5830998 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccataactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
5831097 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5831098 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctccttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
5831196 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
5831197 |
aacgtcatacaatttgggacggatggagta |
5831226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 30526213 - 30526441
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30526213 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
30526312 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
30526313 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
30526411 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30526412 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30526441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39169015 - 39168787
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39169015 |
tatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctt |
39168916 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|
T |
39168915 |
ttccatat-aatttattgaggacaatcttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
39168817 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
39168816 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagta |
39168787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 39284252 - 39284480
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
39284252 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
39284351 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
39284352 |
tcctatat-aatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
39284450 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39284451 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39284480 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17949663 - 17949433
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
17949663 |
atatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccttcttctttcaattatttcatttatct |
17949564 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
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|
T |
17949563 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacgtaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
17949465 |
T |
 |
Q |
211 |
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242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17949464 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
17949433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24422536 - 24422309
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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|
T |
24422536 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcctttcaattccttcatttatcttt |
24422437 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
24422436 |
ctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccgaaa |
24422338 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
24422337 |
acgtcatacaatttaggacagagggagta |
24422309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 596997 - 597225
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
596997 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
597095 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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T |
597096 |
ttctcatatcaatt-attgaggacaattttgtaaaacaactcataatatttttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
597194 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
597195 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
597225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 6247674 - 6247899
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
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|
T |
6247674 |
gtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttctttcaattccttcatttatctttcc |
6247773 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
6247774 |
catat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
6247872 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
6247873 |
gtcatgcaatttgggacggatggagta |
6247899 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10709326 - 10709097
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
10709326 |
atatgtcgctttacaatactcatgcaacattaatattacttttccaattacaaccttaattaattattactccctcttctttcaattctttcatttatct |
10709227 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
10709226 |
tccccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgtttttcttaatatgtgtgaaatgccta |
10709128 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
10709127 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
10709097 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22553247 - 22553038
Alignment:
Q |
34 |
aatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttattta |
131 |
Q |
|
|
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|
T |
22553247 |
aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctcccttctttcaattctttcatttatcttactcatatta-tttattaa |
22553149 |
T |
 |
Q |
132 |
ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |
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|
T |
22553148 |
ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacattattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgttatacaatttggga |
22553049 |
T |
 |
Q |
232 |
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242 |
Q |
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||||||||||| |
|
|
T |
22553048 |
cggagggagta |
22553038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42946645 - 42946421
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42946645 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctt |
42946546 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42946545 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaa-aactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
42946448 |
T |
 |
Q |
213 |
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239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
42946447 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
42946421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 11714494 - 11714722
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
11714494 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattactttatcttatttcaattccttcatttatctt |
11714593 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11714594 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
11714692 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11714693 |
aacgttatacaatttgggacggagggagta |
11714722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 23606239 - 23606467
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23606239 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
23606338 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
T |
23606339 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtccaa |
23606437 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23606438 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23606467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 37505011 - 37505234
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37505011 |
tatgtcactttataatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
37505110 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
T |
37505111 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
37505209 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37505210 |
aacgtcatataatttgggacggagg |
37505234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 34908736 - 34908965
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn---caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
34908736 |
tatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaattctttcatttatct |
34908835 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34908836 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
34908934 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
34908935 |
aaacgtcatacaatttgggatggagggagta |
34908965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42192451 - 42192222
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn---caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
42192451 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttatttttttcaattctttcatttatct |
42192352 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
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T |
42192351 |
ttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttccgacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgccca |
42192253 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
42192252 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42192222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4395491 - 4395263
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | | || |||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
4395491 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattatatcataact-atatattactctctcttatttcaattctttcatttattt |
4395393 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |
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|
T |
4395392 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttctttatatgtgtcaaatgttca |
4395294 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|
T |
4395293 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
4395263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12113564 - 12113343
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
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|
T |
12113564 |
tatgtcgctttacaatatcagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct-----atttattactcttttttttcaattccttcatttatctttc |
12113470 |
T |
 |
Q |
115 |
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214 |
Q |
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T |
12113469 |
ccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaa |
12113371 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
12113370 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
12113343 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31873642 - 31873417
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
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T |
31873642 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcc |
31873543 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
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||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
31873542 |
catatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttctcatacaatattaattacgtttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
31873444 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31873443 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
31873417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34141644 - 34141415
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
34141644 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgtttttcctattatatccttaactatttattactctttattctttcaattatttcatttatct |
34141545 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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T |
34141544 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttca |
34141446 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
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T |
34141445 |
aaacgtcataaaatttgggacagagggagta |
34141415 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38896684 - 38896456
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
38896684 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctt |
38896585 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
38896584 |
tcctatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
38896486 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
38896485 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
38896456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40734924 - 40734692
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn------caattctttcattta |
108 |
Q |
|
|
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|
T |
40734924 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcattcattta |
40734825 |
T |
 |
Q |
109 |
tctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
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T |
40734824 |
tctttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatttgtgaaatgc |
40734726 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| |
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T |
40734725 |
ccaaaacgtcatacaatctcggacggaggaagta |
40734692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42373232 - 42373003
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
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|
T |
42373232 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctcttatttcaattcattcatttatctttc |
42373133 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
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||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |
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T |
42373132 |
tcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaa |
42373034 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
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T |
42373033 |
cattatacaatttgtgacggagggagtacaa |
42373003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 3310857 - 3311087
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
3310857 |
atatgtcattttacattaccaatgcaatattaatgttactttttctattataaccttagttatttattagtctctcttcttttaattctttcatttatct |
3310956 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
|
T |
3310957 |
ttcccatattatttt-ttagggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaataccca |
3311055 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |
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T |
3311056 |
aaacgtcatacaatttgatacggaggaagtac |
3311087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14433375 - 14433146
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
14433375 |
atatgtcgctttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
14433276 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
14433275 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgccca |
14433177 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |
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T |
14433176 |
aaacgtcatacaatttaggacggatggagta |
14433146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27919651 - 27919423
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |
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|
T |
27919651 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcattatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
27919552 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
T |
27919551 |
tcacatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaataagtgtgaaatgcccaa |
27919453 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
27919452 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
27919423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30597273 - 30597045
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30597273 |
tatgtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctgtcttctttcaattccttcatttatctt |
30597174 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
30597173 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaa |
30597075 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
30597074 |
aacgttatacaatttgggacggagggagta |
30597045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35544218 - 35543990
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
35544218 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatttccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttt |
35544119 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|
T |
35544118 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
35544020 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
35544019 |
aacatcgtacaatttgggacgaagggagta |
35543990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 42927171 - 42927399
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
42927171 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
42927270 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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T |
42927271 |
tctcat-ttcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgctcaa |
42927369 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42927370 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42927399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2099190 - 2098966
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
2099190 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatct |
2099091 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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T |
2099090 |
ttcccat------ttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgacca |
2098997 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
T |
2098996 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
2098966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32629819 - 32629590
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn---caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
32629819 |
tatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaattctttcatttatct |
32629720 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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|
T |
32629719 |
ttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
32629621 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
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T |
32629620 |
aaacatcatacaatttggaacggagggagta |
32629590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 26746883 - 26747112
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
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26746982 |
T |
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Q |
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211 |
Q |
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T |
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26747081 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
|
|
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T |
26747082 |
aaacatcatacaatttgggacgaatggagta |
26747112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39645934 - 39645708
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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|
T |
39645934 |
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39645835 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
39645834 |
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39645738 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
39645737 |
aacgtcatagaatttgggacggagggagta |
39645708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 600276 - 600048
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
600276 |
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600177 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||| || |||||||||| |
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T |
600077 |
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600048 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 6878568 - 6878796
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
6878568 |
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6878667 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
6878668 |
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6878766 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
6878767 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6878796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 30852030 - 30852254
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
30852030 |
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30852129 |
T |
 |
Q |
113 |
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211 |
Q |
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T |
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30852228 |
T |
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Q |
212 |
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237 |
Q |
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T |
30852229 |
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30852254 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 36652490 - 36652718
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
36652490 |
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36652589 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
36652590 |
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36652688 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
36652689 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36652718 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28074487 - 28074270
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
28074487 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
28074388 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
28074387 |
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28074300 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
28074299 |
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28074270 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14810104 - 14809878
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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T |
14810104 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatcaatgttacttttcctattatatccttagctatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
14810005 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
14810004 |
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14809906 |
T |
 |
Q |
212 |
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239 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||||||||||| |
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T |
14809905 |
aagcgtcatataacttgggacggaggga |
14809878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24612898 - 24613128
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcc-tattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
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T |
24612898 |
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24612997 |
T |
 |
Q |
111 |
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210 |
Q |
|
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T |
24612998 |
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24613096 |
T |
 |
Q |
211 |
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242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||| |
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|
T |
24613097 |
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24613128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37664953 - 37664732
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
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|
T |
37664953 |
ctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcata |
37664854 |
T |
 |
Q |
120 |
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219 |
Q |
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| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
37664853 |
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37664755 |
T |
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Q |
220 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||| |
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|
T |
37664754 |
tacaatttgaaacggagggagta |
37664732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38044969 - 38045198
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|
T |
38044969 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctattttctttcaattatttcatttatct |
38045068 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
38045069 |
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38045167 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
38045168 |
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38045198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 4135743 - 4135971
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
4135743 |
tatgtcactttacaataccagtgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaattcttttatttatttt |
4135842 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
4135843 |
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4135941 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||| |||||||| |
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|
T |
4135942 |
aatattatacaatttgggacatagggagta |
4135971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 5371596 - 5371824
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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T |
5371596 |
tatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctattctttcaagtcttttatttatctt |
5371695 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
5371696 |
tcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattattttccttaatatggatgaaatatccaa |
5371794 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
5371795 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5371824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 16421916 - 16422144
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||| || |
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T |
16421916 |
tatgtcactttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcgttcatttatttt |
16422015 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
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T |
16422016 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgcccaa |
16422114 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
16422115 |
aatatcatacaatttgggacggagggagta |
16422144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8378309 - 8378086
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Q |
20 |
cgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttccca |
117 |
Q |
|
|
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|
T |
8378309 |
cgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattatttcatttatctttccca |
8378210 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatat |
217 |
Q |
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T |
8378209 |
tatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttctcacacaatattaattacatttcttaataggtgtgaaatgtccaaaatgt |
8378111 |
T |
 |
Q |
218 |
catataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
8378110 |
catacaatttgggacggaggaagta |
8378086 |
T |
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Target: chr8; HSP #91
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgttttacagtaccaatgaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
899489 |
ttcccttatca-tttatagaggacaattttgtaaaacagctcataatatttctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
899391 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
899390 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
899360 |
T |
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Target: chr8; HSP #92
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Target Start/End: Original strand, 1366805 - 1367034
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115 |
Q |
|
|
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T |
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gtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttc |
1366904 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
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T |
1366905 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
1367003 |
T |
 |
Q |
216 |
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246 |
Q |
|
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||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
1367004 |
gtcatacaatttgggacggagggagtacaat |
1367034 |
T |
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Target: chr8; HSP #93
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Q |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
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Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
1953427 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaataagtgtgaaatagcca |
1953525 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
1953526 |
aaacatcatataatttgggacggagggagta |
1953556 |
T |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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T |
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atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
14584739 |
tttccatac-aatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
14584641 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
T |
14584640 |
aaacatcatacaatttggaacggagggagta |
14584610 |
T |
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccatctcttctttcaattatttcatttatct |
28849110 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
28849111 |
ttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgatca |
28849209 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28849210 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
28849240 |
T |
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Target: chr8; HSP #96
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111 |
Q |
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|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
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T |
30157621 |
atatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattaatttttctattgtaactttaactattttttactatctattttttcaattctttcatttatct |
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T |
 |
Q |
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ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
T |
30157521 |
ttcc-atatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt-tgaaatgccca |
30157425 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30157424 |
aaacatcata-catttggaacggagggagta |
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T |
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119 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37965055 |
ctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccata |
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T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
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T |
37964955 |
tca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtca |
37964857 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||| || |||||| |
|
|
T |
37964856 |
tacaatttgggacagaaggagta |
37964834 |
T |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42981249 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42981349 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
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T |
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Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
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tttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataatcttaactgtttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcacatat |
2120378 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
2120377 |
ta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaat |
2120293 |
T |
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Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
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atatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataactttaactatttattattatctcttctttcaattttttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |
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|
T |
4924560 |
ttctcatatta-tttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatcttttttctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgatatgtcca |
4924658 |
T |
 |
Q |
212 |
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227 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |
|
|
T |
4924659 |
aaacgtcatacaattt |
4924674 |
T |
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Q |
|
|
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|
|
T |
11587899 |
tctttcatttatctttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatat |
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T |
 |
Q |
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gtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
11587800 |
gtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
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Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
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ttacaataccaatgaaacattaatgttaatttttctattatattcttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatc |
17911121 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
17911122 |
a-tttattaaggacaatttagtaagacaactcataat--tctttttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgctcaaaatatcat |
17911218 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |
|
|
T |
17911219 |
ataatttgggacgga |
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Target: chr8; HSP #103
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18673423 |
atatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
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T |
 |
Q |
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ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttcccacacaatattaattacatatcttaatatgtgtgaaatg |
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ttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaa |
123 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| | |
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|
T |
5062338 |
ttacaatactaatgaaacattaatgttatttatcctattatatccttacatatttattactctcttctttcaattcttttatttatttttcctatatca- |
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T |
 |
Q |
124 |
tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatata |
223 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||| |
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|
T |
5062239 |
tttattaaggacaattttataaaacaactgataatatatcttttccacacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatgatgaaaatgtagtata |
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T |
 |
Q |
224 |
atttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
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atttaggacggagggagtac |
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Q |
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atgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
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|
|
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|
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Target: chr8; HSP #106
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Target Start/End: Complemental strand, 21582947 - 21582721
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21582947 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttagttttcctattatatccttaactatttat-actctttcgtttttcaattctttcatttatctt |
21582849 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21582848 |
tcccatac--atttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
21582751 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
21582750 |
aacgtcgtataatttgggacgttgggagta |
21582721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Original strand, 11018490 - 11018707
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Q |
30 |
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127 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
11018490 |
taccaatgcaacattaatgttaatttttctattataatcttaattatttcttattatcccttttttcaattctttcatttatctttcc-atatta-ttta |
11018587 |
T |
 |
Q |
128 |
tttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
|| | || |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
11018588 |
ttaaagaaaattttgtaaaacaattcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttattaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
11018687 |
T |
 |
Q |
228 |
gggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||| |||| |
|
|
T |
11018688 |
gggatggatggagtataatt |
11018707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16861975 - 16861746
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
16861975 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttgactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
16861876 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
16861875 |
ttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
16861777 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
16861776 |
aaacgtcatacattttgggacggagggagta |
16861746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40325549 - 40325320
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
40325549 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
40325450 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
40325449 |
tttccatatca-tttattagggataattttgtaaaacaactcgtaatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
40325351 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
40325350 |
aaacatcatacaatttaggacggaaggagta |
40325320 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6010339 - 6010111
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
6010339 |
tatgtcgttttagaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactttctctccttccaagtcattcatttatctt |
6010240 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6010239 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttttaaatatgtatgaaatgcccaa |
6010141 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6010140 |
aacgtcatacaatttaaaacggagggagta |
6010111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32642543 - 32642399
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Q |
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193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
32642543 |
caattctttcatttatcttatccatacta-tttattaaggacaatttt-taaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttctta |
32642446 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
||| || |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
32642445 |
atacgtatgaaatacccaaaacatcatacaatttgggacggagggag |
32642399 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 4393943 - 4394169
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
4393943 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcttattatatccttaactattaattcctctctcttctttcgattatttcatttatct |
4394042 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||| |||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
4394043 |
ttctcatacta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataat-ttcttttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgacc |
4394140 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
4394141 |
aaaatgtcatataatttagaacggaggga |
4394169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13779797 - 13779572
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
13779797 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcc---tatatcattaactattttttactctttcttctttcaattctttcatttatttt |
13779701 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13779700 |
tcccata-tcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatcatttcttttttccacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgtccaa |
13779602 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13779601 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
13779572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 28868776 - 28868998
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
28868776 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatctatct |
28868875 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
28868876 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
28868974 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
28868975 |
aaacgtcatacaatttggaacgga |
28868998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
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Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37954703 |
tatgtcactttacactacaaatgaaatattaatgttaccttttctattatatccttaattatttattattctttcttctttcaattctttcatttatctt |
37954604 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
37954603 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttctcatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcctaa |
37954505 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
37954504 |
aacgtcatacaatttaggacggag |
37954481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38194693 - 38194463
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
38194693 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtaacttttcctattatatccttaactattaattactcttttttctttcaattattttatttatcc |
38194594 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
38194593 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
38194495 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38194494 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
38194463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 1042426 - 1042652
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1042426 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctgttatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
1042525 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
1042526 |
tccaatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacac--tattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
1042622 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
1042623 |
aacgtcatacaatttgggacgtaggaagta |
1042652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 6796156 - 6796385
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
6796156 |
tatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatatt |
6796255 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| || ||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
6796256 |
tcccatatca-tttattaagaacaatttagtaaaataactcataacatctatttcccacataatattaataacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
6796354 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
| ||||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
6796355 |
atcgtcatacaatttgtgatggagggagtac |
6796385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 45186967 - 45187196
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
45186967 |
atatgtcgctttacagtaccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
45187066 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
45187067 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatgacca |
45187165 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45187166 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45187196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 27667524 - 27667692
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|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27667524 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttaatactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
27667623 |
T |
 |
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113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
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|
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|
|
T |
27667624 |
tcccatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaat |
27667692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 40483790 - 40484000
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |
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|
T |
40483790 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
40483889 |
T |
 |
Q |
120 |
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219 |
Q |
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T |
40483890 |
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40483977 |
T |
 |
Q |
220 |
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242 |
Q |
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|| |||||||||||||||||||| |
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T |
40483978 |
tacaatttgggacggagggagta |
40484000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41541205 - 41540977
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
41541205 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacataaatgttaaatttcatattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
41541106 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
41541105 |
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41541007 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| |||||||||| |
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|
T |
41541006 |
aacgtcgtataatttgggatggagggagta |
41540977 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 45439567 - 45439804
Alignment:
Q |
14 |
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108 |
Q |
|
|
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T |
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45439666 |
T |
 |
Q |
109 |
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208 |
Q |
|
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|||||| ||||| | || ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
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|
T |
45439667 |
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45439765 |
T |
 |
Q |
209 |
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247 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |
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T |
45439766 |
ccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtataatt |
45439804 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31230612 - 31230476
Alignment:
Q |
105 |
tttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaa |
204 |
Q |
|
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|
T |
31230612 |
tttatctttcccatatca-tgtatagaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
31230514 |
T |
 |
Q |
205 |
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242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
31230513 |
atgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
31230476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 14762478 - 14762624
Alignment:
Q |
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193 |
Q |
|
|
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|
T |
14762478 |
caattctttaatttatctttctcatacca-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatttcttttccatacaaaattaattatatttctta |
14762576 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
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T |
14762577 |
atacgtgtgacatgcccaaaacgtcatataatttaggac-gagggagta |
14762624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 18526388 - 18526616
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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T |
18526388 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttatct |
18526487 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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T |
18526488 |
tttccatacca--ttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
18526585 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
18526586 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
18526616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 9267691 - 9267801
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
9267691 |
atatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
9267790 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
9267791 |
ttcccatatta |
9267801 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 9268084 - 9268203
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
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T |
9268084 |
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9268183 |
T |
 |
Q |
223 |
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242 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||||| |
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|
T |
9268184 |
aattttggacggagagagta |
9268203 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 24524347 - 24524466
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
24524347 |
atttattaaagacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaatactaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
24524446 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24524447 |
aatttgggacggagggagta |
24524466 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 31692788 - 31693017
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
31692788 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
31692887 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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T |
31692888 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
31692986 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
31692987 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
31693017 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 33012118 - 33012347
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33012118 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
33012217 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
33012218 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
33012316 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| || || ||||| |||||||||||||| |
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T |
33012317 |
aaacgtcttacaatttaggacggagggagta |
33012347 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 36514172 - 36514393
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
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||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |
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T |
36514172 |
ctttacaattacaatgaaacattaatttttcttttcttattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatatttctcata |
36514271 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
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| | |||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
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T |
36514272 |
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36514370 |
T |
 |
Q |
220 |
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242 |
Q |
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|| ||||||||||||| |||||| |
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T |
36514371 |
tacaatttgggacggatggagta |
36514393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44023632 - 44023403
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
44023632 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
44023533 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
44023532 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacaa |
44023434 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
44023433 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
44023403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
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|
T |
16999328 |
caattccttcatttatcttttctatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttttta |
16999426 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
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|
T |
16999427 |
atatatgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
16999475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23897735 - 23897963
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111 |
Q |
|
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T |
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atatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || |
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T |
23897835 |
ttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatatcaattacatttcttaatacgtgtaaaatggcc- |
23897932 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
23897933 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23897963 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 24450573 - 24450801
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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|
T |
24450573 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatttt |
24450672 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttc-cgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|| | | | ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |
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T |
24450673 |
tctc-gaatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataata-tctttttctcacacaatattaattacattttttaatatatgtgaaataccca |
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T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
24450771 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
24450801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 34865789 - 34865908
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
34865789 |
atttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaataggtgtgaaatgcccaaatcgtcatac |
34865888 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34865889 |
aatttgggacggagggagta |
34865908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42159234 - 42159016
Alignment:
Q |
16 |
atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
42159234 |
atgtcgctttacaatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaattatttattagtctttcttctttcaattttttcatttatcttt |
42159135 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
42159134 |
cccatat-aatttattacggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacgatactaattagatttcttaata--tgtgaaatgctcaaa |
42159038 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
42159037 |
acctcatacaatttaggacgga |
42159016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 15225894 - 15226124
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
15225894 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattaaatcattaactattaattactctctcttgtttcaattatttcatttatat |
15225993 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
15225994 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcc |
15226092 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15226093 |
aaaacgtaatacaatttgggacggagggagta |
15226124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 167740 - 167859
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
167740 |
atttattaatgataattttgtaaaacaattcataatatttctttctcacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatac |
167839 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
167840 |
aatttgggacggagggagta |
167859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5733290 - 5733145
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||| |
|
|
T |
5733290 |
aattctttcatttatctttct-atat-aatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacattttttaa |
5733193 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5733192 |
tacatgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5733145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38367664 - 38367436
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38367664 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatctt |
38367565 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttc-cgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | ||| || |||| |||||| |||||||| | ||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
38367564 |
tcctatatcatttt-ttaaggataattttgtaaaacaatttataatat-ctttttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgccta |
38367467 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
38367466 |
aaacgtcatacaatttgaaacggatggagta |
38367436 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38451009 - 38451238
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38451009 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
38451108 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
38451109 |
tttccata-ccatatattagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgcca |
38451207 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
38451208 |
aaacgtcttacaatttgggatggagggagta |
38451238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41256427 - 41256198
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
41256427 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatct |
41256328 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
41256327 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagtca |
41256229 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
T |
41256228 |
aaacgtcatacaatttggaacagagggagta |
41256198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 24523991 - 24524061
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
24523991 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattact |
24524061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 29440920 - 29441148
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
29440920 |
tatgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcctattatatccttaaccattttctactttctcttcttccaagtcattcatttatctt |
29441019 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
T |
29441020 |
tcctatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaatttataatatcccttttccacacaaaattaattagatttcttaatacgtgtgaaatatctaa |
29441118 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
29441119 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagta |
29441148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 4174590 - 4174825
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||||||| |
|
|
T |
4174590 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaaatatttcatttatct |
4174689 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
4174690 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaatagctcataatttctcttccctacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaataacca |
4174788 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
4174789 |
aaacgtcgtacaatttgggacggaggaagtacaattt |
4174825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4631164 - 4630945
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||| |
|
|
T |
4631164 |
tatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctatcttctttcttttcatttatttatctt |
4631065 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctt-aatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
4631064 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccatataatataaattatatttcttaaatacgtgtgaaatgccca |
4630966 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
4630965 |
aaacgtcatataatttgggac |
4630945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Original strand, 8738029 - 8738220
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| | || ||| || || ||||||||| |
|
|
T |
8738029 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcttttactatttattgccttctctactttcaagtcatttatttatctt |
8738128 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
8738129 |
ttccatatca-tttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatttcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaa |
8738220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15286586 - 15286439
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
15286586 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatct |
15286487 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15286486 |
tttttatatt-atttattaagaacaattttataaaacaactcataatat |
15286439 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15466955 - 15466808
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
15466955 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaattttttcctttatct |
15466856 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15466855 |
tttttatatt-atttattaagaacaattttataaaacaactcataatat |
15466808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37163760 - 37163529
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
37163760 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
37163661 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
37163660 |
tttccata-ccatttattatggataattttgtaaaacaactcaaaatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgtca |
37163562 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37163561 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7884515 - 7884321
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Q |
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111 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| |
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|
T |
7884515 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactttcttttcttttaattatttcatttatct |
7884416 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
7884415 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
7884321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 23550708 - 23550930
Alignment:
Q |
16 |
atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
23550708 |
atgtctctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttttattatatcattaactatttattattttctcttctttcaattctttaatttatcttt |
23550807 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
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| ||| || | |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |
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T |
23550808 |
cttatacta-tctattaaagacaattttgtaaaacaactcgtaatatttatttcccacacaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaatgccaaaa |
23550906 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
23550907 |
acatcatacaatttgggacggagg |
23550930 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3562498 - 3562278
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttccca |
117 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||| | || | |
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|
T |
3562498 |
gtcgttttacaataccgatgaaccattaatgttattttttctattatacccttaactgtttattactctcttctttcaattcttcaatttatttctctcg |
3562399 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatat |
217 |
Q |
|
|
|| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |
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|
T |
3562398 |
tacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatgtctctttcccatacaaaattaattacatttcttaatacgcgtgaaatgcccaaaacgt |
3562300 |
T |
 |
Q |
218 |
catataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
3562299 |
catataatttgggacgggggga |
3562278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 3457079 - 3457300
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
3457079 |
atatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaaca--ttact-ctctcttctttcaattatttcatttattttt |
3457175 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||| || |||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
T |
3457176 |
tccatacta-tttattaagaataattttgtaaaacaactcataat-ttcttttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagccaa |
3457273 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3457274 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
3457300 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 15595662 - 15595741
Alignment:
Q |
163 |
cttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
15595662 |
cttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacagagggagta |
15595741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 26513743 - 26513972
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
26513743 |
atatgtcactttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
26513842 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || || || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
26513843 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaagcaactcataatttttgttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
26513941 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||| || ||||| |
|
|
T |
26513942 |
aaacgtcttacaatttgggacgaagagagta |
26513972 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 31231101 - 31231030
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31231101 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcgtattatatccttaactatttattactc |
31231030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37390961 - 37390763
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataa----ccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
37390961 |
ctttacaataccaatgaaacattaacgttactttttctattatatatatccttaactatttattactcttttttctttcaattatttcatttatctttct |
37390862 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaatttta-taaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
37390861 |
catatca-tttatgaaggataatttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgcgaaatgcccaaaa |
37390763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37954392 - 37954167
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
37954392 |
gtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatattcttaactattaattactctcgcttctttcaattatttcatttatcttttc |
37954293 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |
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|
T |
37954292 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaataacttataatttctcttccccacataatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggtcaaaac |
37954194 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37954193 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
37954167 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 36821948 - 36822092
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
36821948 |
caattctttaatttatcttttccatgccaatt-attgaggacaactttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaata---tttctta |
36822043 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||| |||||| |
|
|
T |
36822044 |
atacgtgtgaaatgcctaaaacatcatacaattcgggagggaaggagta |
36822092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16736652 - 16736438
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatctttcccat |
118 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |
|
|
T |
16736652 |
gctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttattttttccat |
16736553 |
T |
 |
Q |
119 |
attaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatc |
218 |
Q |
|
|
| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
16736552 |
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16736454 |
T |
 |
Q |
219 |
atataatttgggacgg |
234 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |
|
|
T |
16736453 |
atacaatttgagacgg |
16736438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 5665726 - 5665871
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
5665726 |
atatgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttacttttactattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
5665825 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataat |
158 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
5665826 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
5665871 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11589020 - 11588949
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
11589020 |
atatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactc |
11588949 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20091201 - 20091131
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
20091201 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactc |
20091131 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #167
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Target Start/End: Original strand, 15595495 - 15595625
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Q |
31 |
accaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttat |
128 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
15595495 |
accaatgcaactttaatattactttccctattataatcttaactatttataactttcttttctttcaattctttcatttatttttctcatatta-tttat |
15595593 |
T |
 |
Q |
129 |
ttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
| |||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
15595594 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatat |
15595625 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #168
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Q |
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
23681862 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaccaactcataatttctcttccccacccaatattaattatatttctta |
23681764 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaattttg |
250 |
Q |
|
|
||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
23681763 |
atacgtgtaaaatggccaaaacgtcatacaatttaggatggagggagtataattttg |
23681707 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9792294 - 9792223
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9792294 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatattactttttctattatatccttaaatatttattactc |
9792223 |
T |
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Target: chr8; HSP #170
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17524799 |
atatgtcgttttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
17524700 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |
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|
T |
17524699 |
ttttcata-ccatttattagagataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatggtca |
17524601 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
T |
17524600 |
aaacgtcatacaatttaagacagagggagta |
17524570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #171
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Q |
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85 |
Q |
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|
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|
|
T |
27421276 |
atatgccgctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactc |
27421347 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #172
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
43564640 |
atatgtcgctttacaatatcaataaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
43564711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 1214745 - 1214849
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || || |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
1214745 |
atttattaaggacaattttataaaacaattcataatatt--tttttcacataaaattaattatatttcttaatacgtgttaaatgttcaaaacttcatat |
1214842 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgg |
229 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
1214843 |
aatttgg |
1214849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 14762391 - 14762461
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgt--tacttttcctattataaccttagttatttatta |
82 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
14762391 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatatttatcctattatatccttaattatttatta |
14762461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 43414044 - 43413993
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
43414044 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattata |
43413993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43537034 - 43536833
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
43537034 |
atatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttccgattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
43536935 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |
|
|
T |
43536934 |
ttttcata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtatgaaatggcca |
43536836 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
43536835 |
aaa |
43536833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 12000536 - 12000606
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
12000536 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcattaactatttattactc |
12000606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 18185435 - 18185501
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
18185435 |
gtcgctttacaataacaataaagtattaatgttacttttcttattataactttaattatttattact |
18185501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 167354 - 167426
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaa--cattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
167354 |
tatgtcactttacaataccaatataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactc |
167426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 4408019 - 4408072
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataac |
67 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
4408019 |
atatgttgcgttacaataccaatacaacattaatgttactttttctatgataac |
4408072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8566004 - 8565947
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
8566004 |
catttcttaatacgtgtaaaatgtctaaaatatcatataatttgagacggaggaagta |
8565947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 242
Target Start/End: Original strand, 4408139 - 4408207
Alignment:
Q |
174 |
aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
4408139 |
aatattaatgacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgagacggaggaagta |
4408207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Original strand, 27116754 - 27116826
Alignment:
Q |
163 |
cttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
27116754 |
cttttccatacaacattaattacatttcttaatttgtgtgaaatgatcgaaatatcatatagtttgggacgga |
27116826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 35455468 - 35455603
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
T |
35455468 |
tttacaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactctcttcttttaattctttaatttatctttcatata-cc |
35455566 |
T |
 |
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataata |
159 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
35455567 |
atttattaaggataattttgtaaaccaactcataata |
35455603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 6806728 - 6806779
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
6806728 |
atatgtcgttatacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattata |
6806779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6899996 - 6899893
Alignment:
Q |
124 |
tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatata |
223 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | || || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
6899996 |
tttattaaggacaattttgcaaaacatctcataatatcttttttacacagaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatagccaaaatttcatata |
6899897 |
T |
 |
Q |
224 |
attt |
227 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
6899896 |
attt |
6899893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 17505143 - 17505206
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
17505143 |
ctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactc |
17505206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9792183 - 9792093
Alignment:
Q |
124 |
tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
9792183 |
tttattaatgacaattttataaaattgctcataatatctctttcccacacaatattaattgtatttctcaatatgtgctaaatgctcaaaa |
9792093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28481942 - 28481852
Alignment:
Q |
138 |
ttttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
T |
28481942 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatttattaatacatgtgaaatgacaaaaacgtcatataatttg |
28481852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33987382 - 33987272
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggg |
230 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||| | || |||| |||||| ||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
33987382 |
aggacaattttgtaaaacagtttatcatatctattttccacacaaaattaattatattttttaacaagtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttggg |
33987283 |
T |
 |
Q |
231 |
acggagggagt |
241 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
33987282 |
acggagggagt |
33987272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 36821864 - 36821934
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
T |
36821864 |
atatgtcgttttacaataccactaaaaaattaatgttacatttcctattatatcctcaactatttattact |
36821934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 156
Target Start/End: Original strand, 38870312 - 38870373
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcata |
156 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
38870312 |
caattctttcatttatttttctcgtat-aatttattaaggacaattttgtaaaataactcata |
38870373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40879315 - 40879261
Alignment:
Q |
188 |
ttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
40879315 |
ttcttgatacgtgtgaaatgtccaaaatatcgtgtactttgggacggagggagta |
40879261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 9635130 - 9635179
Alignment:
Q |
193 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9635130 |
aatatgtataaaatgtccaaaatgtcatataattttggacggagggagta |
9635179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 16998948 - 16998997
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta |
63 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
16998948 |
atatgtcactttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatatta |
16998997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Original strand, 44012347 - 44012419
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattcctttt |
167 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
44012347 |
caattctttaatttatctttctcatacca-tttattgaggataatgttgtaaaacaactcataatatttctttt |
44012419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Original strand, 23597317 - 23597353
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtta |
51 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
23597317 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtta |
23597353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33299495 - 33299439
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
33299495 |
atttcttaatacgtgtgaaatgactaaatcatcttataatttgggacagagggagta |
33299439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38503188 - 38503132
Alignment:
Q |
29 |
ataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || || | ||||||||||| |
|
|
T |
38503188 |
ataccaatgaaacattaatgttacttcttctattatatccataatgatttattactc |
38503132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38829185 - 38829141
Alignment:
Q |
202 |
gaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaat |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
38829185 |
gaaatgaccaaaacgtcatataatttgggacggatggagtacaat |
38829141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Original strand, 42981504 - 42981540
Alignment:
Q |
171 |
cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42981504 |
cacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
42981540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 173)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 518520 - 518747
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
518520 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttctttcaattctttcatttatcttt |
518619 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
T |
518620 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatacctaaa |
518718 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
518719 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
518747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1666985 - 1666756
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
1666985 |
atatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
1666886 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
1666885 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcatttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
1666787 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1666786 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
1666756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3870812 - 3871040
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3870812 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctt |
3870911 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
3870912 |
tcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
3871010 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3871011 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
3871040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 44421625 - 44421860
Alignment:
Q |
8 |
cgaataatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcat |
105 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
44421625 |
cgaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctctcttctttcaattctttcat |
44421724 |
T |
 |
Q |
106 |
ttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44421725 |
ttatctttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaa |
44421823 |
T |
 |
Q |
206 |
tgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44421824 |
tgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44421860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5005249 - 5005020
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
5005249 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
5005150 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
5005149 |
tttccatatta-tttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
5005051 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5005050 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5005020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 6713941 - 6714170
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
6713941 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctatcttctttcaattctttcatttatat |
6714040 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6714041 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
6714139 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6714140 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6714170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41787112 - 41786883
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
41787112 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
41787013 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
41787012 |
ttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatcttttttccacacaatattaattacatttcttaatatgagtgaaatgtcca |
41786914 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41786913 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
41786883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26850048 - 26849820
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26850048 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
26849949 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26849948 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
26849850 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26849849 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
26849820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2443506 - 2443277
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
2443506 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
2443407 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
2443406 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatatgtgaaatgccta |
2443308 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
2443307 |
aaacgtcatacaatttggaacgaagggagta |
2443277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29027024 - 29027253
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
29027024 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
29027123 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29027124 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatgttaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
29027222 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
29027223 |
aaacgtcatacaatttaggacggatggagta |
29027253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19240840 - 19240612
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| || |
|
|
T |
19240840 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctctcttctttcaaatcttttatttatatt |
19240741 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
19240740 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
19240642 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
19240641 |
aacgtcatataatttgggacggagagagta |
19240612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Original strand, 36443572 - 36443800
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36443572 |
gtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaattatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
36443671 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
36443672 |
catatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaac |
36443770 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
36443771 |
atcatacaatttaggacggagggagtacaa |
36443800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 44195617 - 44195853
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgcttt-acaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
44195617 |
atatgtcgcttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaaccatttattactatctcttctttcaattctttcatttata |
44195716 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
44195717 |
tttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
44195815 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
44195816 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagtactattt |
44195853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21134633 - 21134404
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
21134633 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattctctcttctttcaattctttcatttatat |
21134534 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
21134533 |
ttcccatatta-tttattaagaacaattttgtaaaataattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaataagtgtgaaatgccta |
21134435 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21134434 |
aaacgtcatacaatttgggagggagggagta |
21134404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39927716 - 39927488
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
39927716 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
39927617 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
39927616 |
tcccataata-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattagttacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
39927518 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
39927517 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
39927488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3873637 - 3873452
Alignment:
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
3873538 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatg |
198 |
Q |
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T |
3873537 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
3873452 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 14885073 - 14885302
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
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atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
14885172 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
14885173 |
ttcccatat-aatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
14885271 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
14885272 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14885302 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19275167 - 19274940
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Q |
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112 |
Q |
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T |
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tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcatctttcaattctttcatttatctt |
19275068 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
19275067 |
tcccatatca--ttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacacagtattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgtccaa |
19274970 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
19274969 |
aacatcatataatttgggacggagggagta |
19274940 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 19576101 - 19576330
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Q |
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttattt |
19576200 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
19576201 |
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19576299 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
19576300 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
19576330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 42056091 - 42056320
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Q |
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Q |
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T |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
42056191 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
42056289 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
42056290 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42056320 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 14527805 - 14528033
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctt |
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T |
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Q |
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212 |
Q |
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T |
14527905 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
14528003 |
T |
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Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
14528004 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagta |
14528033 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 19002961 - 19003189
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Q |
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112 |
Q |
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T |
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tatgtcacattagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
19003061 |
tcccatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
19003159 |
T |
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Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
19003160 |
aacgtcatataatttgggacggaggaagta |
19003189 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 34036154 - 34036382
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
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T |
34036154 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
34036253 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
34036254 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaactacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
34036352 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34036353 |
aacgtcatataatttgggacggagggagta |
34036382 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 325358 - 325129
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
325358 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
325259 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
325258 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatcgctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
325160 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
325159 |
aaacgtcatacaatttgggacggatggagta |
325129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28181714 - 28181485
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|
T |
28181714 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttgctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
28181615 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|
T |
28181614 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
28181516 |
T |
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Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
28181515 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
28181485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24000350 - 24000122
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
24000350 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtttcttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
24000250 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
24000152 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
24000151 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24000122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 41095981 - 41096209
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
41095981 |
tatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
41096081 |
tttcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
41096179 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
41096180 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41096209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 10877360 - 10877583
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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T |
10877360 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctt |
10877459 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
10877460 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
10877558 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |
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|
T |
10877559 |
aacgtcatacaatttgggacggagg |
10877583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22061034 - 22061263
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
22061034 |
atatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattattctttcttctttcaattatttcatttatct |
22061133 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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|
T |
22061134 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttataaaacaactcataatatctttttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgttaaatgccca |
22061232 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
22061233 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
22061263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23494497 - 23494726
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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T |
23494497 |
atatgtcactttacaatactaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatct |
23494596 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
23494597 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaatttataatatttttttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
23494695 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
23494696 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
23494726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28786950 - 28786721
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
28786950 |
atatgtcgctttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
28786851 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28786850 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
28786752 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
28786751 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
28786721 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 29360807 - 29361032
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
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T |
29360807 |
gtcgctttacaataccaatgaaacattaattttactttttctattatatctttaactatttattactctctattctttcaattttttcttttatctttcc |
29360906 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
29360907 |
catatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttctacataatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
29361005 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |
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T |
29361006 |
gtcatataatttgggacggagggagta |
29361032 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 28330800 - 28331028
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
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T |
28330800 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattcattcatttatctt |
28330899 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
28330900 |
tcctatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
28330998 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
28330999 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
28331028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40425186 - 40424958
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
40425186 |
tatgtcactttacaataccaatgcaactttaatattatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
40425087 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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| |||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
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T |
40425086 |
tttcatacta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatacccaa |
40424988 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || ||||||||| ||||||||||||| |
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T |
40424987 |
aacgtcgtataatttgagacggagggagta |
40424958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5669233 - 5669006
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |
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|
T |
5669233 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttattt |
5669134 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |
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T |
5669133 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatccctttcccacacaatattaattatatttcttaata--tgtgaaatgtcca |
5669037 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5669036 |
aaacatcatacaatttaggacggagggagta |
5669006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 25556919 - 25557113
Alignment:
Q |
34 |
aatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttattta |
131 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |
|
|
T |
25556919 |
aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatatta-tttattaa |
25557017 |
T |
 |
Q |
132 |
ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
25557018 |
ggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacttcatacaattt |
25557113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5443888 - 5443659
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
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T |
5443888 |
atatgtcgttttacaatatcaatgtaatattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactatctattctttcaattctttcatttatct |
5443789 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |
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|
T |
5443788 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtaaaatgctca |
5443690 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5443689 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
5443659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23498092 - 23498320
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
23498092 |
atatgtcgctttata-taccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattccttcatttatct |
23498190 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23498191 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
23498289 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23498290 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
23498320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 1780344 - 1780562
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||| |
|
|
T |
1780344 |
atatgtcgctttaaaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattatt-------atctcttatttcatttatcttt |
1780436 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
1780437 |
ctcatatta-tttattaaggacaattttataaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgcatttattaatatgtgtgaaatgcctaaa |
1780535 |
T |
 |
Q |
214 |
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240 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||| | |||||| |
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|
T |
1780536 |
acgtcatacaatttgggatgaagggag |
1780562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13849490 - 13849262
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13849490 |
tatgtcactttagaatagcaatgaaacattagtgttatttttcctattatatccttaactatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctt |
13849391 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13849390 |
tcccatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatatccaa |
13849292 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
13849291 |
aatatcatacaatttaggacggagggagta |
13849262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14943489 - 14943261
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14943489 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
14943390 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
14943389 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
14943291 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
14943290 |
aacatcatacaatttggaacgaagggagta |
14943261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 38448168 - 38448396
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38448168 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatgttgtatccttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctt |
38448267 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
38448268 |
tcccatatca-tttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
38448366 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|| |||| |||||||||||||||||||| |
|
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T |
38448367 |
aacgacatacaatttgggacggagggagta |
38448396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19166402 - 19166179
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Q |
20 |
cgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttccca |
117 |
Q |
|
|
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|
T |
19166402 |
cgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttccca |
19166303 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatat |
217 |
Q |
|
|
||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
19166302 |
tatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgt |
19166204 |
T |
 |
Q |
218 |
catataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19166203 |
catacaatttgggacggagggagta |
19166179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7491680 - 7491450
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
|
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|
T |
7491680 |
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7491581 |
T |
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Q |
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211 |
Q |
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T |
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7491482 |
T |
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Q |
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243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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T |
7491481 |
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7491450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9047464 - 9047238
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
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T |
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9047365 |
T |
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Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
213 |
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Q |
|
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T |
9047265 |
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9047238 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12208366 - 12208136
Alignment:
Q |
14 |
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110 |
Q |
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T |
 |
Q |
111 |
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210 |
Q |
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T |
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12208168 |
T |
 |
Q |
211 |
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242 |
Q |
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|||| |||||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
12208167 |
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12208136 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 27183110 - 27183336
Alignment:
Q |
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113 |
Q |
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T |
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27183209 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
27183210 |
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27183307 |
T |
 |
Q |
214 |
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242 |
Q |
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| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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T |
27183308 |
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27183336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 27832652 - 27832878
Alignment:
Q |
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113 |
Q |
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T |
27832652 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatcttt |
27832751 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
27832752 |
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27832849 |
T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
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| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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T |
27832850 |
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27832878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8059866 - 8060095
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
8059866 |
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8059965 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
8059966 |
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8060064 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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|||| || || ||||| || ||||||||||| |
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T |
8060065 |
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8060095 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8247364 - 8247135
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
8247364 |
atatatcgctttacaataccaataaaaaattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
8247265 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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T |
8247264 |
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8247166 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
8247165 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8247135 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27341812 - 27341584
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
27341812 |
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27341714 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
27341713 |
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27341615 |
T |
 |
Q |
213 |
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243 |
Q |
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T |
27341614 |
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27341584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29513423 - 29513651
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
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|
|
T |
29513423 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaattctttcatttattt |
29513522 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
29513523 |
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29513620 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| | ||| ||||| ||||||||| |||| |
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T |
29513621 |
aaacgtaatacaatttaggacggaggaagta |
29513651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Target Start/End: Complemental strand, 29843886 - 29843665
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Q |
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atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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|
T |
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29843787 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
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T |
29843786 |
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29843688 |
T |
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Q |
214 |
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236 |
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| |||||| |||||| ||||||| |
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|
T |
29843687 |
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29843665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31909802 - 31909573
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
31909802 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgatatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattatttcatttatct |
31909703 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
31909702 |
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31909604 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
31909603 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
31909573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32674613 - 32674386
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Q |
19 |
tcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
|
|
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|
T |
32674613 |
tcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctc |
32674514 |
T |
 |
Q |
117 |
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216 |
Q |
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T |
32674513 |
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32674416 |
T |
 |
Q |
217 |
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246 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32674415 |
tcgtacaatttgggacggagggagtacaat |
32674386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 40649107 - 40649336
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
40649107 |
tatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
40649206 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
40649207 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
40649305 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
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T |
40649306 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
40649336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
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T |
12467685 |
tatgtcactctagaataccaatgaaacattaatgctattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
12467784 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
12467785 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
12467883 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12467884 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12467913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 36068160 - 36068388
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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|
|
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|
T |
36068160 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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Q |
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T |
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tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
36068358 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|| ||||| || || |||||||||||||| |
|
|
T |
36068359 |
aacgtcatacaaattaggacggagggagta |
36068388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40171763 - 40171540
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
T |
40171663 |
ttccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttacccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaa |
40171565 |
T |
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Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
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||||||||| ||||||||| ||||| |
|
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T |
40171564 |
aatatcatacaatttgggatggagg |
40171540 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 6596530 - 6596750
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Q |
23 |
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120 |
Q |
|
|
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T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactttttcttctttcaattatttcatttatttttcccatat |
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T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
6596630 |
ca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcat |
6596728 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
6596729 |
acaatttgggatggaaggagta |
6596750 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11154466 - 11154274
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
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T |
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atatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttactttttctgttataatcttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatttatct |
11154367 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |
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T |
11154366 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccagacaatattaattgtattttttaatatgtctgaaa |
11154274 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 13375367 - 13375595
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Q |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatcttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
13375466 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
13375467 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
13375565 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13375566 |
aacgtcgtacaatttgggacggaggaagta |
13375595 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 40833524 - 40833752
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40833524 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
40833623 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
40833624 |
tatcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaaaatgtgtgaaatgcccaa |
40833722 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40833723 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40833752 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 1204968 - 1205190
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Q |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1204968 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcatttttcaattctttcatttatctt |
1205067 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
T |
1205068 |
tctcatatca-tttaataaggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatttgtgaaatgtctaa |
1205166 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
1205167 |
aacatcatacaatttgggacggag |
1205190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 6579756 - 6579985
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn---caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6579756 |
tatgtcactttagaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactgtttattactctttctttttttcaattctttcatttatct |
6579855 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
T |
6579856 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttgcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgctca |
6579954 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6579955 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6579985 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 27863115 - 27863262
Alignment:
Q |
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193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
27863115 |
caattctttcatttatctttctcatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttttta |
27863213 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27863214 |
atatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
27863262 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3628603 - 3628390
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Q |
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120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
3628603 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaattatttattagtctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatat |
3628504 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |
|
|
T |
3628503 |
ta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtctaaaacgtcat |
3628405 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
| ||||||| ||||| |
|
|
T |
3628404 |
acaatttggaacgga |
3628390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5748676 - 5748455
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Q |
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ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
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Q |
|
|
|||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
5748676 |
ctttacgataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatattcttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttctcgta |
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T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
5748576 |
tca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtca |
5748478 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5748477 |
tacaatttgggacggagggagta |
5748455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28206634 - 28206405
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
28206634 |
atatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcccttctttcaatttcttcatttatct |
28206535 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |
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|
T |
28206534 |
tttccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtcta |
28206436 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28206435 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
28206405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 30803500 - 30803712
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
30803500 |
ctttacaataccaatgaaacattaatattactttttctattatatctttaactatttattactcgttc-------ttctttcatttatcttttccatatt |
30803592 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
30803593 |
a-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcata |
30803691 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
30803692 |
caatttgggactgagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 40171947 - 40172166
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |
|
|
T |
40171947 |
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T |
 |
Q |
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ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
40172040 |
ccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaa |
40172138 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40172139 |
cgttatacaatttgggacggagggagta |
40172166 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43521620 - 43521385
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
43521620 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
43521521 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
43521520 |
tttccatac-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
43521422 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
43521421 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagtacgattt |
43521385 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4898125 - 4897978
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Q |
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|
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
4898125 |
caattctttcatttatcctttacatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttctta |
4898027 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
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Q |
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|
T |
4898026 |
atatatgtgaaatgtccaaattgtcatacaatttgggacggagggagta |
4897978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4945519 - 4945372
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
4945519 |
caattctttcatttatcctttacatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttctta |
4945421 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4945420 |
atatatgtgaaatgtccaaattgtcatacaatttgggacggagggagta |
4945372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39235208 - 39234978
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
T |
39235208 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattccttaatttatctt |
39235109 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
39235108 |
tcctatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgctcaa |
39235010 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||| ||| |||| |
|
|
T |
39235009 |
aacgtcatacaatttaggacggaaggaataca |
39234978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1420887 - 1420670
Alignment:
Q |
19 |
tcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
1420887 |
tcgctttacaatactaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatctttgactatttattactctctcttctttcaattccttaatttatctttccc |
1420788 |
T |
 |
Q |
117 |
atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
1420787 |
atatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgcccaaaacg |
1420689 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1420688 |
tcatacaatttgggacgga |
1420670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 12363676 - 12363904
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
12363676 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatacccttcactatttattgccttatctacttccaagtcattcatttatctt |
12363775 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
12363776 |
tctcatatca-tttattaaggataattttataaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgcccaa |
12363874 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12363875 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12363904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 15848681 - 15848909
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
15848681 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctt |
15848780 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
T |
15848781 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatgcgtgtgaaatactcaa |
15848879 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
15848880 |
aacgtcatacaatttgggacggatggagta |
15848909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3376569 - 3376430
Alignment:
Q |
101 |
ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
3376569 |
ttcatttatctttcccatatta-tttattgaggataatttt-taaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
3376472 |
T |
 |
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3376471 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
3376430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 34213183 - 34213400
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
34213183 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
34213282 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34213283 |
ttccata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
34213370 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | |||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
34213371 |
aacaccatacaatttaggacggaggaagta |
34213400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2893961 - 2893758
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || |
|
|
T |
2893961 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttactactctcttctttcaatcctt-catttatctttcctgtac- |
2893864 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
2893863 |
-atttattagggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcata |
2893765 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttg |
228 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
2893764 |
caatttg |
2893758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32068442 - 32068213
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32068442 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
32068343 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
32068342 |
tttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
32068244 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32068243 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
32068213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 27244942 - 27245170
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27244942 |
tatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
27245041 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
27245042 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattatatttcttaataagtttgaaatgcccaa |
27245140 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
27245141 |
aacgtcgtacaatttgggacggaggaagta |
27245170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 41186841 - 41187036
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
41186841 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaatcctt-catttatttttcc |
41186939 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41186940 |
catatca-tttattgaggataattttgtaaaacaacttaaaatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
41187036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1221264 - 1221047
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
1221264 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
1221165 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
1221164 |
tcccata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
1221077 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | ||| ||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
1221076 |
aacgttatacaatttggaacggaaggagta |
1221047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 22060704 - 22060931
Alignment:
Q |
16 |
atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||| ||| |
|
|
T |
22060704 |
atgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatattt |
22060803 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
22060804 |
ctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaa |
22060902 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22060903 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
22060931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37111226 - 37110999
Alignment:
Q |
16 |
atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
37111226 |
atgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttt |
37111127 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
37111126 |
tccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaa |
37111028 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37111027 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
37110999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 5421489 - 5421711
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataac-cttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
5421489 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatttcttaactatttattactctctctcctttcaattccttcctttatct |
5421588 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
5421589 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatggcca |
5421687 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
5421688 |
aaacgtcatacaatttgggacgga |
5421711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28248512 - 28248739
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
28248512 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaactttaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattctttaatttatcttt |
28248611 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
28248612 |
tccatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccaaacaaaattaatttaatttcttaatacgtgtgaaatgcctaaa |
28248710 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
28248711 |
acgtcatactatttaggacggagggagta |
28248739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 4826350 - 4826575
Alignment:
Q |
18 |
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115 |
Q |
|
|
||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |
|
|
T |
4826350 |
gtcgctttataatatcaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattattctctcttgtttcaattcatttatttaaccttct |
4826449 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
4826450 |
catatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaac |
4826548 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4826549 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
4826575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 9527506 - 9527735
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9527506 |
atatgtcactttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
9527605 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
9527606 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
9527704 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9527705 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
9527735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 16062584 - 16062797
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16062584 |
tatgtcactgtagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatctt |
16062683 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
16062684 |
tcccgtat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttagcacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcacaa |
16062782 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |
|
|
T |
16062783 |
aacgtcatacaattt |
16062797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22154239 - 22154006
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
22154239 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactcactcttctttcaattatttcatttattt |
22154140 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
22154139 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
22154041 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaat |
246 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22154040 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagtacaat |
22154006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30549796 - 30549567
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30549796 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
30549697 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
30549696 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
30549598 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30549597 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30549567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38959790 - 38960019
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38959790 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctctcctttcaattatttcatttatct |
38959889 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
T |
38959890 |
tttccatac-aatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatctgtgtgaaatggcca |
38959988 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38959989 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
38960019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18450155 - 18449927
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| || || ||||||||| |
|
|
T |
18450155 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattaatttatctt |
18450056 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| |
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|
T |
18450055 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatactcaa |
18449957 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18449956 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18449927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33677357 - 33677130
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
33677357 |
atatgtcgctttacaatactgatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctcttctttcaatgctttaatttatcttt |
33677258 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
T |
33677257 |
ctcata-ccatttataaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaaaattatttatatttcttaatacatgttaaatgcctaaa |
33677159 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
T |
33677158 |
acgtcatacaatttgagatggagggagta |
33677130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36602172 - 36602025
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
36602172 |
caattctttaatttatctttttcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttctta |
36602074 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
36602073 |
atatgtgtgaaatgcctaaaacgtcgtacaatttgggacagagggagta |
36602025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38993542 - 38993769
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
38993542 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttctttcaattatttcatttatattt |
38993641 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
38993642 |
tccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaa |
38993740 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||| || ||||||| | ||||| |||| |
|
|
T |
38993741 |
acatcttacaatttggaatggaggaagta |
38993769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 11216651 - 11216876
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
11216651 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
11216750 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
11216751 |
catacca-tttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
11216849 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
11216850 |
gtcatacaatttgggacagagggagta |
11216876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 36845873 - 36846094
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
36845873 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaattatttcatttatat |
36845972 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
36845973 |
tttccata-caatttattaaggataattttgtaaatcaactcataatttctcttctccacccaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
36846071 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgg |
234 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||| |
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|
T |
36846072 |
aaacgtcatacaatttgagacgg |
36846094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 37985578 - 37985807
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
37985578 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactttttcttctttcaattatttcatttatct |
37985677 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
37985678 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgatca |
37985776 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37985777 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
37985807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8341699 - 8341470
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
8341699 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcata |
8341600 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttct--------taatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
8341599 |
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8341501 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
8341500 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
8341470 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Original strand, 39407832 - 39408032
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Q |
15 |
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112 |
Q |
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|||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
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T |
39407832 |
tatgtcactttagaataccactgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctt |
39407931 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
39407932 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcgcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
39408030 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
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T |
39408031 |
aa |
39408032 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
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Target Start/End: Complemental strand, 43257417 - 43257285
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94 |
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193 |
Q |
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T |
43257417 |
caattcttttatttatttttcccatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattatatttctta |
43257319 |
T |
 |
Q |
194 |
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227 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
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|
T |
43257318 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
43257285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39958387 - 39958153
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
39958387 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaattatatcatttattt |
39958288 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
39958287 |
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39958189 |
T |
 |
Q |
212 |
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247 |
Q |
|
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||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |
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T |
39958188 |
aaacgtcatataatttgggacagagggagtataatt |
39958153 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1684354 - 1684142
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Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattc--tttcatttatctttcccat |
118 |
Q |
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T |
1684354 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaattcaattttatttatctttctcat |
1684255 |
T |
 |
Q |
119 |
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218 |
Q |
|
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|| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || |
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T |
1684254 |
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1684156 |
T |
 |
Q |
219 |
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232 |
Q |
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T |
1684155 |
atacaatttaggac |
1684142 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4646611 - 4646390
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Q |
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ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
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T |
4646611 |
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4646512 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
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| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
4646511 |
tca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttccccatactgtattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
4646413 |
T |
 |
Q |
220 |
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242 |
Q |
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|
|| ||||| ||||||||||||| |
|
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T |
4646412 |
tacaatttaagacggagggagta |
4646390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6027078 - 6026849
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Q |
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111 |
Q |
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T |
6027078 |
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6026979 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
6026978 |
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6026880 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
6026879 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
6026849 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14309131 - 14308902
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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T |
14309131 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
14309032 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||| || | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |
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T |
14309031 |
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14308933 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| || || ||||||||||||||| |||| |
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T |
14308932 |
aaacgtcttacaatttgggacggaggaagta |
14308902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22375245 - 22375016
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Q |
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111 |
Q |
|
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|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |
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T |
22375245 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattacttcatcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
22375145 |
tttccatacca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
22375047 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
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T |
22375046 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
22375016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 25899056 - 25899280
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
25899056 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcattaactatttattaccatttcttttttcaattctt-catttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
25899155 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacattttttaatatatatgaaatgctcaa |
25899253 |
T |
 |
Q |
213 |
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239 |
Q |
|
|
|| || ||| ||||||| ||||||||| |
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|
T |
25899254 |
aacattatacaatttggtacggaggga |
25899280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #113
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| | ||||||||| |
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|
T |
30564211 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaagtattaattactccctcttctttcaattatatcatttatcg |
30564112 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
30564111 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
30564013 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||| |||||| | ||||||||||| |
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T |
30564012 |
aaacttcatacaatttgaggcggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
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Q |
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|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcac--aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
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|| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
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T |
31072542 |
ttttcatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataattt--cttttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgac |
31072446 |
T |
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Q |
210 |
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242 |
Q |
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||||| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
31072445 |
caaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
31072413 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
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gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
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Q |
|
|
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T |
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gtcgttttacaataccaatgaaacatcaatgttactttttctattatacccttgactatttattactttatcttctttcaattctttaatttatctttcc |
10197942 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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T |
10197941 |
cataaca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaattaattacatt-cttaatacgtatgaaatgtccaaaac |
10197844 |
T |
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Q |
216 |
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241 |
Q |
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|||||||||||| |||||||||||| |
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|
T |
10197843 |
gtcatataatttgagacggagggagt |
10197818 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #116
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15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaacgttatttttcctattatattcttaactatttattactttctctcattccaaatcattcatttatttt |
20925824 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
20925823 |
tcccatgtca-tttattaattacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtatgaaatacccaa |
20925725 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
20925724 |
aacgtcgtacaatttgggacggaaggagta |
20925695 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
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|
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T |
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Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
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T |
35669841 |
ttttcata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
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T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
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|
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||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |
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T |
35669940 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
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94 |
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193 |
Q |
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T |
14723936 |
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14724034 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
|
|
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|
T |
14724035 |
atacgtgtaaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14724083 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
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Target Start/End: Complemental strand, 14780929 - 14780700
Alignment:
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111 |
Q |
|
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||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |
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T |
14780929 |
atatgtccctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaattatttcatttattt |
14780830 |
T |
 |
Q |
112 |
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210 |
Q |
|
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T |
14780829 |
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14780732 |
T |
 |
Q |
211 |
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242 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
14780731 |
aaaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
14780700 |
T |
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Target: chr2; HSP #120
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2048224 - 2047995
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
2048224 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
2048124 |
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2048026 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
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||| ||| | ||||||||| ||| |||||| |
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|
T |
2048025 |
aaacatcgtgcaatttgggatggatggagta |
2047995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
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Target Start/End: Original strand, 12192461 - 12192656
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Q |
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110 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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T |
12192461 |
atatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatct |
12192560 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
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||| |||| | ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |
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T |
12192561 |
tttttcata-tcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatatgttaaatg |
12192656 |
T |
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Target: chr2; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 21288906 - 21289136
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Q |
|
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T |
21288906 |
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21289005 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttt-tccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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T |
21289006 |
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21289103 |
T |
 |
Q |
211 |
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243 |
Q |
|
|
|||| | ||| |||||| |||||||||||||| |
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T |
21289104 |
aaaacgttatacaatttgagacggagggagtac |
21289136 |
T |
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Target: chr2; HSP #123
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Target Start/End: Original strand, 38150573 - 38150720
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Q |
|
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T |
38150573 |
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38150672 |
T |
 |
Q |
112 |
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160 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
38150673 |
ttcacatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
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T |
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Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
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Target Start/End: Original strand, 44987859 - 44987999
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Q |
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200 |
Q |
|
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T |
44987859 |
ttcatttatttttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcatattatctctttcccacacaaaattaattacattttttaatacgtg |
44987957 |
T |
 |
Q |
201 |
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242 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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T |
44987958 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
44987999 |
T |
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Target: chr2; HSP #125
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Target Start/End: Original strand, 36174011 - 36174240
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
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T |
36174011 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatatt-tatccttaactattaattactctaccttctttcaattatttcatttatct |
36174109 |
T |
 |
Q |
112 |
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210 |
Q |
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T |
36174110 |
ttttcatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatggcca |
36174208 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
36174209 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36174240 |
T |
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Target: chr2; HSP #126
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
41285830 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatct |
41285731 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | | |
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|
T |
41285730 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatagcta |
41285632 |
T |
 |
Q |
212 |
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231 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
41285631 |
aaacatcatacaatttggga |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #127
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Target Start/End: Original strand, 17399815 - 17400044
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17399815 |
atatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
17399914 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||| | ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
17399915 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaatttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
17400013 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||| || ||||||| || ||||||||| |
|
|
T |
17400014 |
aaacatcttacaatttggaaccgagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #128
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Target Start/End: Complemental strand, 27863027 - 27862798
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
27863027 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctttattattaattactctcttttctttcaattatttcatttatct |
27862928 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| | | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |
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|
T |
27862927 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccctacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtaaaatggcca |
27862829 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27862828 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
27862798 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43446588 - 43446817
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Q |
14 |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||| |
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|
T |
43446588 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattattctctcttatttcaattatatcatttatct |
43446687 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |
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|
T |
43446688 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatttctcttccctaaacaatattaattacatttcttaatatgtgtggaatggcca |
43446786 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |
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T |
43446787 |
aaacgtcatacaatttgggatggaggaagta |
43446817 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 7669784 - 7669931
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Q |
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
7669784 |
caattctttcattcttatttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttttacacaatattaaatacatttttta |
7669882 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
7669883 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaagacgaagggagta |
7669931 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8444224 - 8443999
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14 |
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111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8444224 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
8444125 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
8444124 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcata--atttctcttccccac---tttaattacatttcttaatacttgtgaaatggcca |
8444031 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
8444030 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagtac |
8443999 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 136 - 243
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235 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
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|
T |
9110809 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
9110908 |
T |
 |
Q |
236 |
gggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
9110909 |
gggagtac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22050694 - 22050465
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
22050694 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
22050595 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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T |
22050594 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggaca |
22050496 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||| ||||||||| |
|
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T |
22050495 |
aaacgtcgtacaatttgggatagagggagta |
22050465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 29411995 - 29412114
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
29411995 |
atttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatac |
29412094 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29412095 |
aatttgggacggagggagta |
29412114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29432909 - 29432716
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
29432909 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttcttttaattatttcatttatct |
29432810 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
29432809 |
tttccata-tcatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaat |
29432716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 16198447 - 16198671
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
16198447 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttgtttttcctattatatccttaactattatttactctctcttctttcaattatttcatttatct |
16198546 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
16198547 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaacccataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
16198645 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |
|
|
T |
16198646 |
aaacgtcttacaatttgggacggagg |
16198671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 13196426 - 13196628
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |
|
|
T |
13196426 |
tttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatgcttaattatttattactcttttatttcaattctataatttatctttttcata-cc |
13196524 |
T |
 |
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
13196525 |
atttattatggacaattttgtaaaacaacccataatatt-tttttctgtacaaaattaattacattttataatacgtgtgaaatgctcaaaacgtcatat |
13196623 |
T |
 |
Q |
223 |
aattt |
227 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
13196624 |
aattt |
13196628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 14834053 - 14834276
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttc--cc |
116 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
14834053 |
gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttttcc |
14834152 |
T |
 |
Q |
117 |
atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
14834153 |
atacca-tttattaaggataattttgtaaa-caactcataattaatcttcgccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacg |
14834250 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
14834251 |
tcatacaatttgggacggaggaagta |
14834276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 34504396 - 34504467
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
34504396 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactc |
34504467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36598806 - 36598577
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | || ||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
36598806 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaaatactctctcttctttcaattatttcatttatat |
36598707 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
36598706 |
tttccatact-atttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgctatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
36598608 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
36598607 |
aaacgtcttacaatttgggacggagagagta |
36598577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40483622 - 40483393
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
40483622 |
atatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
40483523 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
40483522 |
ttttcatacca-tttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggcca |
40483424 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| | |||||| ||||| |
|
|
T |
40483423 |
aaacgtcatacaatttagaacggagagagta |
40483393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 30780111 - 30780181
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
30780111 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattact |
30780181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36174584 - 36174366
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
36174584 |
tatgtcgctttacaatactaatgaaacatta-tgttatttttcctattatatccttaattatttattaccc-------tctcttctttcatttatctttt |
36174493 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||| | ||||||| |||| || ||| |||| |||||| |||||| |||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
36174492 |
tcat-gtcatttattaaggaaaactttgtaaatcaactcgtaatatctctttcccataaaatattaattgtatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaa |
36174394 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||| | ||||||| |||| |
|
|
T |
36174393 |
cgtcatacaatttagaacggaggaagta |
36174366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19505858 - 19505632
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
19505858 |
tatgtcgttttacaataccaacgaagcattaatgttatttttcctattatatccttaactattttctactttctcttcttccaaatcattcatttatctt |
19505759 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
19505758 |
tcctatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatattcatttctcacacaaaattaat-taattttttaatacgtgtgaaatggccaa |
19505661 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagt |
241 |
Q |
|
|
|| ||| || ||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
19505660 |
aacatcgtacaatctgggacagagggagt |
19505632 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 8495333 - 8495547
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8495333 |
atatgtcactttacaataccaataaaatatttatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
8495432 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
8495433 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
8495531 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||| || ||||| |
|
|
T |
8495532 |
aaacatcttacaattt |
8495547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 43681112 - 43681281
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttc-ctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
43681112 |
atatgtcgttttacaataccaatataacattagtgttatttttttctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatc |
43681211 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
43681212 |
tttcccatgtt-atttattaaggataattttataaaataac-aataatacctcttttccacacaatattaat |
43681281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 45423290 - 45423438
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
45423290 |
atatgtctctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcttgttatctcctcaattatttattaatcttttttctttcaattctttcatttatct |
45423389 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatatt |
161 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
45423390 |
ttctcatatca-tttattaaaaacaattttataaaacaacttataatatt |
45423438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44710060 - 44709913
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44710060 |
atatgtccctttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctcaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatct |
44709961 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
T |
44709960 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatat |
44709913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45383568 - 45383421
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttac-ttttcctattataaccttagttatttatt--actcnnnnnnnncaattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
45383568 |
atatgttgctttacaataccaatgaagcattaatgttacttttttctattatatccttaattatttattgccctctcatatttcaattctttaatttatc |
45383469 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataata |
159 |
Q |
|
|
||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
45383468 |
tttttcatact-atttattgaggacaattttgtaaatcaactcataata |
45383421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 9110701 - 9110752
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
9110701 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 37988236 - 37988307
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Q |
14 |
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85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
37988236 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactc |
37988307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 15269554 - 15269626
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta-taaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
15269554 |
atatgtcgttttacaataccaaaaaaacattaatgttacttttcatattactatccttagctatttattactc |
15269626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5274582 - 5274520
Alignment:
Q |
97 |
ttctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5274582 |
ttctttcatttatttttctcatacta-tttattaaagacaattttataaaacaactcataatat |
5274520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 44019777 - 44019828
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
44019777 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattata |
44019828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 6312273 - 6312343
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6312273 |
tatgtcactttacaataccgatgaaacattaatgttatttttgttattatatccttaactatttattactc |
6312343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 8001653 - 8001718
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8001653 |
caatttttttatttatctttcccatatca-tttattaatgacaattttataaaaaaactcataatat |
8001718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44652252 - 44652198
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
44652252 |
cattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaacatcatacaatttgagacggaggga |
44652198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35020273 - 35020232
Alignment:
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35020273 |
tgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
35020232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Original strand, 39293410 - 39293467
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttat |
80 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
39293410 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttat |
39293467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42801115 - 42801059
Alignment:
Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
42801115 |
aatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattataacttta-ctatttattactc |
42801059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 4079854 - 4079938
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4079854 |
atttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattatattttttaatatgtgtgaaatg |
4079938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 4553375 - 4553443
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta |
82 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
4553375 |
atatgtcattttacaataccattgaaacaataatgttgcttttcttattatatccttaattatttatta |
4553443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 85
Target Start/End: Original strand, 27525045 - 27525089
Alignment:
Q |
41 |
cattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
27525045 |
cattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc |
27525089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35020353 - 35020305
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
70 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
35020353 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcctt |
35020305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4898354 - 4898311
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttc |
57 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
4898354 |
atatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4898311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4945748 - 4945705
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttc |
57 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
4945748 |
atatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4945705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 7669682 - 7669733
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7669682 |
atatgtcgttttacaatatcgatgaaacattaatgctacttttcctattata |
7669733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 9053581 - 9053652
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
9053581 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttattttttctattttatccttaactattaattactc |
9053652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Original strand, 27862747 - 27862791
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaa---taccaatgcaacattaatgttacttt |
55 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27862747 |
atatgtcgctttacaacaataccaatgcaacattaatgttacttt |
27862791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 22294492 - 22294533
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
|||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22294492 |
atttcttaatttatgtgaaatgaccaaaatatcatataattt |
22294533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 47
Target Start/End: Original strand, 42017928 - 42017961
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaat |
47 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
42017928 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaat |
42017961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 242
Target Start/End: Original strand, 20213947 - 20214015
Alignment:
Q |
174 |
aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| |
|
|
T |
20213947 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtggaatgtccaaaacgtcatacaaataaggacggagggagta |
20214015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44653650 - 44653614
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttc |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
44653650 |
gctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
44653614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 131)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6335170 - 6334944
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
6335170 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttatttcaattctttcatttatttttc |
6335071 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6335070 |
ccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
6334972 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6334971 |
cgtcttacaatttgggacggagggagta |
6334944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 20605624 - 20605853
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20605624 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatct |
20605723 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20605724 |
ttcccatgtta-tttattaaggataattttataaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
20605822 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
20605823 |
aaacgtcatacaatttaggacggatggagta |
20605853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29344031 - 29344259
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
29344031 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaattctttcatttatct |
29344130 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29344131 |
ttccca-atta-ttcattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
29344228 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
29344229 |
aaacatcatacaatttaggacggagggagta |
29344259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6792000 - 6791770
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6792000 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaattctttcatttatct |
6791901 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
6791900 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
6791802 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
6791801 |
aaaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
6791770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 24430204 - 24430426
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
24430204 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacatttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatct |
24430303 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
24430304 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtaaaatgctca |
24430402 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
24430403 |
aaacgtcatacaatttgggacgga |
24430426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8415229 - 8414992
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8415229 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
8415130 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8415129 |
ttccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
8415031 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta-caattttg |
250 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
8415030 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtagcaattttg |
8414992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9660452 - 9660223
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9660452 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
9660353 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9660352 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
9660254 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9660253 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
9660223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 29818238 - 29818473
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
29818238 |
atatgtcgctttagaatatcaatgcaacattaatcttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
29818337 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
29818338 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgcgtgaactgccca |
29818436 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29818437 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtacaattt |
29818473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29455406 - 29455626
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
29455406 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattact-------ttctcttctttcatttatcttt |
29455498 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
29455499 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaactactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaa |
29455597 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| || || |||||| ||||||||||||| |
|
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T |
29455598 |
acgtcgtacaatttgagacggagggagta |
29455626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 11000423 - 11000650
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
11000423 |
atatatcgctttacaataccaatgcaacaataatgttactttttctattataaccttaattatttattactctttattctttcaattatttcatttatct |
11000522 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
T |
11000523 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacatctcataatat--cttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtaaaatgtcta |
11000619 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| | ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
11000620 |
aaatgttatacaatttaggacggagggagta |
11000650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 1352527 - 1352756
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1352527 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
1352626 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
1352627 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatacccaa |
1352725 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
1352726 |
aacgtcatacaatttgggacggagggggtac |
1352756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 3787148 - 3787377
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3787148 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
3787247 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3787248 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
3787346 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3787347 |
aacatcatacaatttgggacggagggagtac |
3787377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 6850065 - 6850294
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6850065 |
atatgtcgctttacaatactaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
6850164 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
6850165 |
ttctcatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaaaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
6850263 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
6850264 |
aaacgtcatacattttgggatggagggagta |
6850294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13631289 - 13631060
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
13631289 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatct |
13631190 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13631189 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
13631091 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13631090 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13631060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 21858589 - 21858810
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21858589 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatctttcccata |
21858688 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
21858689 |
tca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
21858787 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21858788 |
tacaatttgggacggagggagta |
21858810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28075246 - 28075017
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
28075246 |
atatgtcgctttacaatacctatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaaatatttattactctctcttctttcaattcttttattgatct |
28075147 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
28075146 |
tttccatatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatttattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
28075048 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
28075047 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
28075017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32609847 - 32610076
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
32609847 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatct |
32609946 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
32609947 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatattca |
32610045 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32610046 |
aaacgacatacaatttggaacggagggagta |
32610076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 78387 - 78171
Alignment:
Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatt |
125 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
78387 |
aataccaatgcaacattaatgtcacttttccgattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatta-tt |
78289 |
T |
 |
Q |
126 |
tatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataat |
225 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |
|
|
T |
78288 |
tattaaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcacaaaacgtcatacaat |
78189 |
T |
 |
Q |
226 |
ttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
T |
78188 |
ttgggatggagggagtac |
78171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 26409103 - 26409331
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26409103 |
tatgtcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
26409202 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
26409203 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
26409301 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26409302 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
26409331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8550223 - 8550453
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgcttt-acaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
8550223 |
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T |
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T |
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T |
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Target: chr6; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 11172941 - 11173169
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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T |
11173140 |
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11173169 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 31492936 - 31493164
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Q |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
113 |
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Q |
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T |
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31493134 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
31493135 |
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T |
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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 31498325 - 31498553
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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212 |
Q |
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T |
31498425 |
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31498523 |
T |
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Q |
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Q |
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T |
31498524 |
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31498553 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17275471 - 17275248
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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Q |
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T |
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T |
17275272 |
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17275248 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 12058624 - 12058851
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Q |
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113 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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| ||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
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T |
12058724 |
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12058822 |
T |
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Q |
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Q |
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| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
12058823 |
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12058851 |
T |
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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 5489637 - 5489838
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111 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
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Q |
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T |
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214 |
Q |
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T |
5489836 |
aaa |
5489838 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 11615408 - 11615637
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Q |
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111 |
Q |
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|
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T |
11615408 |
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11615507 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
11615508 |
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11615606 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
11615607 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
11615637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12499697 - 12499468
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12499697 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatct |
12499598 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
12499597 |
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12499499 |
T |
 |
Q |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
12499498 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12499468 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 12509204 - 12509433
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
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|
|
T |
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atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatct |
12509303 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
12509304 |
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12509402 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
12509403 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12509433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 6835768 - 6835996
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
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6835867 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
6835868 |
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6835966 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
6835967 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6835996 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 29901250 - 29901466
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
29901250 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacattattgttactttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
29901349 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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|
T |
29901350 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaatgcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctta |
29901448 |
T |
 |
Q |
212 |
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229 |
Q |
|
|
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|
T |
29901449 |
aaatgtcatacaatttgg |
29901466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31949366 - 31949138
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
31949366 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctt |
31949267 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
T |
31949266 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatgcccaa |
31949168 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
31949167 |
aacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
31949138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3337437 - 3337656
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
3337437 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttc-------ttctttcatttatctttc |
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T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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T |
3337530 |
ccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaaaa |
3337628 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
3337629 |
catcatacaatttaggacggagggagta |
3337656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 6612433 - 6612659
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatt-tatctttc |
114 |
Q |
|
|
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|
T |
6612433 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcattgtatctttc |
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T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
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|||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
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T |
6612533 |
ccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaa |
6612631 |
T |
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Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6612632 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
6612659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3888618 - 3888846
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
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|
T |
3888618 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctt |
3888717 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|
T |
3888718 |
tcacatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgacatgcccaa |
3888816 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|
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|
T |
3888817 |
aacgtcatacaatttgggacagagggagta |
3888846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8493623 - 8493395
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
8493623 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcattcatctt |
8493524 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8493523 |
tcccatatga-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaaaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
8493425 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8493424 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8493395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25526878 - 25526650
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
25526878 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
25526779 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25526778 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
25526680 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
25526679 |
aacgtcatacaatttggggcggagggagta |
25526650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30510980 - 30510752
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
30510980 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
30510881 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
30510880 |
tcccat-ttcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
30510782 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
30510781 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30510752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2010295 - 2010066
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
2010295 |
atatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattctttcatttatct |
2010196 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
2010195 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaatatattacattttttaatatatgtgaaatgtcta |
2010097 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
2010096 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2010066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 14304401 - 14304630
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
14304401 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
14304500 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
T |
14304501 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatgccca |
14304599 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |
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|
T |
14304600 |
aaacgtcatacaatttggaacggagagagta |
14304630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 14499163 - 14499392
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
14499163 |
atatgtcgctttacaataccattgaaacattaacgttatttttcctattatatccttaaatatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
14499262 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
14499263 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctta |
14499361 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
14499362 |
aaacgtcataaaatttaggacggagagagta |
14499392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 1778879 - 1779106
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1778879 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgtta-ttttcctattatatccttaactatttattactctcccttctttcaattcattcatttatctt |
1778977 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
1778978 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccaaa |
1779076 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1779077 |
aacgtcatgcaatttggaacggagggagta |
1779106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35040060 - 35039832
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
35040060 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacatttcctattatatccttcactatttattgcattctctacttccaagtcattcatttatctt |
35039961 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35039960 |
tcacatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
35039862 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35039861 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
35039832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12507026 - 12506797
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12507026 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttatttctttttcttttttcaattccttcatttatct |
12506927 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |
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|
T |
12506926 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatgttca |
12506828 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
12506827 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12506797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 17941664 - 17941884
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
17941664 |
tatgtcgctttacaataccaataaaa-attaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctt |
17941762 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
17941763 |
tcccatatca-tttgttaaggacaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
17941861 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||| |
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|
T |
17941862 |
aacgtcatacaattttggacgga |
17941884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2603621 - 2603393
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
2603621 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtaactttttctattatatccttaactatttattattcttttttttttcaattcttacatttatctt |
2603522 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2603521 |
ttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
2603423 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2603422 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2603393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14310992 - 14310764
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
14310992 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
14310893 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
14310892 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
14310794 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| |||||||| |
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T |
14310793 |
aacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
14310764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 17360655 - 17360883
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
17360655 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcatattatatccttaactatctattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
17360754 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
17360755 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctaaa |
17360853 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17360854 |
aatgtcatacaatttgggacggagggagta |
17360883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7245918 - 7245692
Alignment:
Q |
14 |
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113 |
Q |
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T |
7245918 |
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7245819 |
T |
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Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
7245818 |
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7245721 |
T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |||||||||||||| |
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|
T |
7245720 |
acgtcatataatttaggacggagggagta |
7245692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9038473 - 9038252
Alignment:
Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
9038473 |
atatgtcgctttataataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
9038375 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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T |
9038374 |
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9038276 |
T |
 |
Q |
212 |
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235 |
Q |
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T |
9038275 |
aaatgtcatacaatttgggacgga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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Target Start/End: Original strand, 8201515 - 8201736
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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T |
8201515 |
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8201614 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
8201615 |
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T |
 |
Q |
212 |
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234 |
Q |
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T |
8201714 |
aaacgtcatacaatttgggacgg |
8201736 |
T |
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Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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Target Start/End: Complemental strand, 16524744 - 16524515
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
16524644 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
16524546 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
16524545 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16524515 |
T |
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Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
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Target Start/End: Complemental strand, 30739377 - 30739152
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Q |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
30739377 |
tatgtcactttagaataccaatgatacattaatattatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
30739278 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
30739277 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
30739179 |
T |
 |
Q |
213 |
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239 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||||| ||||||| |
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T |
30739178 |
aacgtcatacaatttgggatggaggga |
30739152 |
T |
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Target: chr6; HSP #54
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Target Start/End: Original strand, 200120 - 200324
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Q |
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136 |
Q |
|
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T |
200120 |
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200218 |
T |
 |
Q |
137 |
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236 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
200219 |
attttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggag |
200318 |
T |
 |
Q |
237 |
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242 |
Q |
|
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|||||| |
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T |
200319 |
ggagta |
200324 |
T |
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Target: chr6; HSP #55
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Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
30240262 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatttccttcactatttattaccttctctactctcaagtcattcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |
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T |
30240362 |
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30240460 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30240461 |
aacatcatacaatttgggacggagggagta |
30240490 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32393690 - 32393457
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14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
32393591 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat----agcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |
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T |
32393590 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattataagtatttcttaatatgtataaaatg |
32393492 |
T |
 |
Q |
208 |
cccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
T |
32393491 |
tccaaaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
32393457 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
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Target Start/End: Original strand, 18105768 - 18105907
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Q |
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tcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgt |
201 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
18105768 |
tcatttatctttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaaatacatttcttaatatgtgt |
18105866 |
T |
 |
Q |
202 |
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242 |
Q |
|
|
|||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18105867 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18105907 |
T |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
9961370 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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|
T |
9961470 |
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9961568 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
9961569 |
aaacttcatacaatttgggacagagagagta |
9961599 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
14600660 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactttctcttctttcaattatttcatttattt |
14600561 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
14600560 |
tttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataat-ttctcttcccccacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
14600463 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
14600462 |
aaacatcatacaatttaggacggagggagta |
14600432 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
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Q |
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Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19098574 |
atatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattgctctctcttcattcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
19098674 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaac-cataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
19098771 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
19098772 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
19098802 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
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Q |
|
|
|||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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T |
30238964 |
tttccatatta-tttattaagaacaaatttgtaaaacaactcttaatatctctttttcacgcaaaattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
30239062 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| || ||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
30239063 |
aaacattatacaatttaggacggagtgagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
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111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
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atatgtcattttacaatagcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatcattaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
31004059 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
31004157 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
31004158 |
aaacgttatacactttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 242
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Q |
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attaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaatt |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
T |
31503930 |
attaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatca-tttattaaggacaatt |
31504028 |
T |
 |
Q |
140 |
ttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
31504029 |
ttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgccgtacaatttggaacggaggga |
31504128 |
T |
 |
Q |
240 |
gta |
242 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
31504129 |
gta |
31504131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 1228451 - 1228679
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1228451 |
tatgtcactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttccgattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatctt |
1228550 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
1228551 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaa |
1228649 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
1228650 |
aacgttatacaatttgggacggatggagta |
1228679 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 4130908 - 4131108
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4130908 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctt |
4131007 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4131008 |
ttccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatttatctttcccatacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
4131106 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
4131107 |
aa |
4131108 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 4657939 - 4658088
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
4657939 |
caattctttcatttatcttttctatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttctta |
4658037 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4658038 |
atatgtgtgaaatgctcaaaatgtcatacaatttgagacggagggagtaca |
4658088 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10364594 - 10364450
Alignment:
Q |
97 |
ttctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10364594 |
ttctttcatttatctttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaata |
10364496 |
T |
 |
Q |
197 |
tgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10364495 |
tgtgtaaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
10364450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 16970472 - 16970650
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
16970472 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctgttataaccttaaatatttattactctctcttctttcagttctttcatttatct |
16970571 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttct |
191 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
16970572 |
ttctcatatt-atttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttct |
16970650 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7896990 - 7896787
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
7896990 |
gctttgcaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattact-------atctcttctttcatttatatttctcatat |
7896898 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
|| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
T |
7896897 |
ta-tttattaaggaaaattttgtaaaacaacccataatatattttttccacataatattaattgaattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgttat |
7896799 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
| |||||||||| |
|
|
T |
7896798 |
acaatttgggac |
7896787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 34283402 - 34283627
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
34283402 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
34283501 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
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|
T |
34283502 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaac |
34283600 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34283601 |
gtcttacaatttgggacggagggagta |
34283627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 7358521 - 7358744
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
7358521 |
atatgtcactttacaatatcaatcaaacattaatgttactttttttattatattcttaattatttattactttttcttctttcaattctttcatttattt |
7358620 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
7358621 |
ttcccatatca-tttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatataaattacatttcttaatacgtatgaaatgccca |
7358719 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
7358720 |
aaatatcatacaatttagaacggag |
7358744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 32142431 - 32142619
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32142431 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctatctttttcatttccttcatttatcttt |
32142530 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtga |
203 |
Q |
|
|
||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32142531 |
cccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtga |
32142619 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 10027905 - 10028048
Alignment:
Q |
96 |
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195 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
10027905 |
attctttcatttatcttttccatatta-tttattaagaataattttgtaaaacaattcataatattttttttccacacaatattaattgtatttcttaat |
10028003 |
T |
 |
Q |
196 |
atgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
10028004 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacagagggag |
10028048 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4981363 - 4981162
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4981363 |
atatgtcgctttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatgtctttaactatttattactctcttttctttcaattcattcatttatct |
4981264 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
4981263 |
ttctcatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
4981165 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
4981164 |
aaa |
4981162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 9461629 - 9461858
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |
|
|
T |
9461629 |
atatgtcgctttacaataacaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttatttatttatct |
9461728 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
9461729 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttctcacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgacca |
9461827 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| | ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9461828 |
agacgtcatacaatttaggacggagggagta |
9461858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10629543 - 10629314
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10629543 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaattatttcatttatct |
10629444 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
10629443 |
ttttcatacta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
10629345 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10629344 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
10629314 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24178282 - 24178511
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24178282 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
24178381 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
24178382 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
24178480 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
24178481 |
aaacgtcatacaatttgggtcggaggaagta |
24178511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 33254389 - 33254618
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || |||||||| |
|
|
T |
33254389 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacatttcatattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattcatttatttatct |
33254488 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | |
|
|
T |
33254489 |
ttcccatatta-tttattgaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttctcacacaatattaattacatttcttattatgtgtgaaattgcta |
33254587 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33254588 |
atacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33254618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 3819657 - 3819877
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
3819657 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatct |
3819756 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
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|
T |
3819757 |
tttccatact-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggtca |
3819855 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3819856 |
aaacgtcatacaatttgggacg |
3819877 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 11130173 - 11130353
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11130173 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttgcttattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattctttcatttatctttct |
11130272 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatat |
197 |
Q |
|
|
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|
|
T |
11130273 |
catatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttttaatatcttttttccacgcaatattaattgcatttcttaatat |
11130353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15989806 - 15989586
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
15989806 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaatctttcttatttcaattctttcatttatctttctcatat |
15989707 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
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|
T |
15989706 |
ca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacatagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatattcaaaacgtcat |
15989608 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
15989607 |
acaatttaggacggaaggagta |
15989586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 32588732 - 32588960
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
32588732 |
tatgtcgctttacaataccaatgaagctttaatgttattttttctattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctt |
32588831 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |
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|
T |
32588832 |
tcctatatca-tttactaatgacaattttgtaaaacaattcataatatccctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtatgaaatgcccaa |
32588930 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32588931 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32588960 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 11173321 - 11173516
Alignment:
Q |
48 |
gttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataa |
145 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| || |||| ||| ||| |
|
|
T |
11173321 |
gttactttttctattataaccttaactatttattactctatcttatttcaattcttacatttatttttctcatatta-tttattaagtacaagtttgtaa |
11173419 |
T |
 |
Q |
146 |
aacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11173420 |
aacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
11173516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 16465871 - 16466073
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
16465871 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaatattaatgttattttttctattataaccttagtaatttattactctatcttctttcaattctttcatttattt |
16465970 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataa-tattccttttccgcacaatattaatagcatttc---ttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
|| | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
16465971 |
tttctat----atttattaaagacaattttataaaacaactcataagtatctcttttccacacaatattaattacatttctaattaatatgtgtaaaatg |
16466066 |
T |
 |
Q |
208 |
cccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
16466067 |
cccaaaa |
16466073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 10133730 - 10133948
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-caattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10133730 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacaatcatgttactttttctattacatccttaactatttattactctttctttttcaattctttcatttatcttt |
10133829 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
10133830 |
cttatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgtaatgctcaaa |
10133928 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
| ||| || ||||| ||||| |
|
|
T |
10133929 |
acatcgtacaatttaggacg |
10133948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11213611 - 11213501
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11213611 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataactttagttatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
11213512 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
11213511 |
ttcccatatta |
11213501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21139978 - 21139748
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
21139978 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttctttcaattatttcatttatcttt |
21139879 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
21139878 |
tccata-ccatttattagggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacgcaatattaattagatttcttaatacgtgtgaaattgccaaa |
21139780 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21139779 |
acgtcttacaatttgggacggagggagtacaa |
21139748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6334945 - 6334718
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
6334945 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctt |
6334846 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
6334845 |
ttccata-ccatttattagagataattttgtaaaacaactcataat-tttttttgtcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaa |
6334748 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
6334747 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
6334718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19687874 - 19687728
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19687874 |
aattttttcatttatttttcccatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat-ctttttccaacacaatattaattacatttctta |
19687777 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19687776 |
ataagcgtgaaaggcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19687728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31022613 - 31022383
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31022613 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
31022514 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
31022513 |
tttccata-ccatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatttctattccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatagcca |
31022415 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31022414 |
aaacatcatacaatttgggtcggagggagtac |
31022383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1228228 - 1228059
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
1228228 |
atatgtcgctttaaaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatct |
1228129 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
T |
1228128 |
ttctcatatta-tttattgaggataattttataaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaat |
1228059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4148297 - 4148192
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
4148297 |
atatgtcgctttacaatacgaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttctttcaattcttttatttatcttt |
4148198 |
T |
 |
Q |
114 |
cccata |
119 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
4148197 |
tccata |
4148192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 690381 - 690269
Alignment:
Q |
130 |
taggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgg |
229 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
690381 |
taggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcttaaaacatcatacaatttgg |
690282 |
T |
 |
Q |
230 |
gacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |
|
|
T |
690281 |
gacggggggagta |
690269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 17441943 - 17442090
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
17441943 |
caattatttcttttatcattcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattatatttctta |
17442041 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
17442042 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttaggacggaggaagta |
17442090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16466384 - 16466159
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16466384 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttt |
16466285 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |
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|
T |
16466284 |
cata-ccatttatcaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatggtcaaaac |
16466186 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16466185 |
gtcgtacaatttgggacggagggagta |
16466159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4147928 - 4147808
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaa-ctcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
T |
4147928 |
atttattaaggacaattttgtaaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgccata |
4147829 |
T |
 |
Q |
222 |
taatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4147828 |
caatttatgacggagggagta |
4147808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 6833801 - 6833869
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta |
82 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6833801 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttatta |
6833869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 15497897 - 15498078
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatt--actcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
15497897 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccggaactatttattgctctctcttcattcaatttcttcatttatct |
15497996 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
15497997 |
tttccata-tcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaa |
15498078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9225635 - 9225410
Alignment:
Q |
17 |
tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || || ||||||||||| |
|
|
T |
9225635 |
tgtcgctttacaataccaatgaagcattaatgttatttttcatattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattaatttatctttc |
9225536 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
9225535 |
tcatatcaattc--taaggacaattttgtaaaacagttcataatatccattttccacacaaaattaattacatttcttaatacatgtgaaatgtccaaaa |
9225438 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
9225437 |
cgtcatacaatttgagacggaaggagta |
9225410 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34219047 - 34218908
Alignment:
Q |
101 |
ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||| | |||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
34219047 |
ttcatttatctttcc-atatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaagtaattacatttcttaataggtg |
34218950 |
T |
 |
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
34218949 |
tgaaatgtccaaaatatcgtataatctgggacgaagggagta |
34218908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 14386600 - 14386747
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14386600 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttctta |
14386698 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || ||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
14386699 |
atacgtatgaaatgaccaaaacatcgtacaatttgggatggagggagta |
14386747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5609426 - 5609294
Alignment:
Q |
98 |
tctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatat |
197 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
5609426 |
tctttcatttatttttcccatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcattttcccacataaatttaattacatttcttaatat |
5609328 |
T |
 |
Q |
198 |
gtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
5609327 |
gtgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttggga |
5609294 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12278571 - 12278431
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
12278571 |
caattctttcgtttatctttctcatatca-tttattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaatattaagtatatttctta |
12278473 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
12278472 |
atacgtatgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacgga |
12278431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1114438 - 1114354
Alignment:
Q |
151 |
ctcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
1114438 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaatgtcatacaatttggaacgga |
1114354 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24053172 - 24052949
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24053172 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattattatctcttctttcaattatttcatttatct |
24053073 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||| ||| |
|
|
T |
24053072 |
tttccata-ccatttattatggataattttgtaaaaaaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatt------tacgtgtgaaatggcca |
24052980 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24052979 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24052949 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27080560 - 27080346
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
27080560 |
atatgtcactttgcaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcactaactattcattactctctcttcttttaattctttcatttatct |
27080461 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |
|
|
T |
27080460 |
ttcacatatca-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcatattatctttttcccacacaaaattaattacatttcttaatacataagaaatggcca |
27080362 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| |
|
|
T |
27080361 |
aaacgtcatataattt |
27080346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1114536 - 1114469
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1114536 |
gtcgctttacaattccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactc |
1114469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 17441711 - 17441778
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatt |
81 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
17441711 |
atatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatattcttaattatttatt |
17441778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10364695 - 10364625
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10364695 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactc |
10364625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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Target Start/End: Original strand, 290389 - 290614
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Q |
10 |
aataatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcattt |
107 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |
|
|
T |
290389 |
aataatatgtcgctttacaataccaatg-aacattaattttattttttatattatatctttaactatttattactctctcttctttcaactctttaattt |
290487 |
T |
 |
Q |
108 |
atctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
290488 |
ttctttttcatacca-tttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctattttctactcaaaattaattatatttcttaatatgtatgaaatg |
290586 |
T |
 |
Q |
208 |
cccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
290587 |
cttaaaacgtcatacaatttgggacgga |
290614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
690478 |
ctttataataccaatgaaacattaatgttactttt-ctattataaccttaactatttattactc |
690416 |
T |
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Target: chr6; HSP #112
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Q |
143 |
taaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
7499705 |
taaaacaattcataatatctcttttcaacacaaaattagttacatttcttaatacgtgtgaaatgtctaaaacatcatataatttggaacggaggtagta |
7499606 |
T |
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
12278968 |
ctttacaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactc |
12278905 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #114
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Q |
147 |
acaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||| |||||| || |||||||||| |
|
|
T |
24915689 |
acaattcataatatctcttttccacataatattaattgcatttcttaatatgtgcgaaatactcaaaacattatacaatttgagatggagggagta |
24915594 |
T |
 |
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39 |
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138 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||| ||| |
|
|
T |
33841317 |
aacattaatattactttttctattatattcttaactatttattacttttttttttcaattctttaatttatctttctcgta-ccatttattaaggataat |
33841415 |
T |
 |
Q |
139 |
tttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
33841416 |
tttgtaaaacaacttataatatttctttcccacacaaaattaattatatttcttaatatgtg |
33841477 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #116
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
29017082 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctactatatccttaactattaattactc |
29017153 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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|
|||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
35030409 |
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Q |
98 |
tctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatat |
197 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
21047389 |
tctttaatttatctttctcatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttatgcaaaattaattacatttcgtaatac |
21047291 |
T |
 |
Q |
198 |
gtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
21047290 |
gtgtcaaatagtcaaaacgtcatataatttaggacggagagagtac |
21047245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21072195 - 21072048
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
21072195 |
atatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattactttttctattatatccgtagctatttattactctctcttctttcaaatctttaatttatct |
21072096 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
21072095 |
ttctcatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
21072048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7885302 - 7885144
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Q |
39 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggaca |
136 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |
|
|
T |
7885302 |
aacattaatgttactttttctattatatcattagctatttattactctctcttctttcaattatttaatttatctttcttatact-atttattaaggaca |
7885204 |
T |
 |
Q |
137 |
attttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||| |
|
|
T |
7885203 |
attttgtaaaataactaataatatctcttttccatacaaaatgaattacatttcttaata |
7885144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3401518 - 3401407
Alignment:
Q |
133 |
gacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
3401518 |
gacaattttgtaaaataactcataatacatattttccatacaaaattaattacattttttaatacgtatgaaatgtccaaaacgtcatatagtttgggac |
3401419 |
T |
 |
Q |
233 |
ggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
|| |||||||| |
|
|
T |
3401418 |
agaaggagtaca |
3401407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 290751 - 290813
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
290751 |
ctttacaatatcaatgaagcattaatgttacttttcatattatataattaattatttattact |
290813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13587003 - 13586942
Alignment:
Q |
98 |
tctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13587003 |
tctttaatttatctttctcataata-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatat |
13586942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25509939 - 25509878
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataa |
157 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
25509939 |
aattctttaatttatctttctcatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
25509878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32655086 - 32654993
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatat |
217 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32655086 |
atttattaagaacaattttgtaaaacacctaataatatctctttctcgtacaaaattaatttcatttctta-tacgtgtgaaatgcccaaaatat |
32654993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 78554 - 78525
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
43 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
78554 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
78525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 7595995 - 7596107
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| | | | |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
T |
7595995 |
caattctttaatttatctttccgacacca-tttattaaggaaaattgtgtaaaacaactcataatatttctttatcatacaaaattaattacatttttta |
7596093 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |
|
|
T |
7596094 |
atacgtgtgaaatg |
7596107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31712569 - 31712512
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
T |
31712569 |
catttcttaatatatgttaaatgtccaaaacatcatataatttagtacagagggagta |
31712512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 34219135 - 34219066
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || | |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
34219135 |
tatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatattatttcttctattatatccttaactatttattact |
34219066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 31712747 - 31712671
Alignment:
Q |
9 |
gaataatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
31712747 |
gaattataagtcgctttaaaatatcaatggaacattaattttactttttctcttatacttttagctatttattactc |
31712671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Original strand, 32614722 - 32614785
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataat |
158 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
32614722 |
caattctttaatttatctttctcttatca-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataat |
32614785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 210)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23237055 - 23237284
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
23237055 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
23237154 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
T |
23237155 |
ttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaataccta |
23237253 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23237254 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23237284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32402734 - 32402964
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32402734 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
32402833 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32402834 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
32402932 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32402933 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32402964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2409797 - 2410026
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
2409797 |
atatgtctctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
2409896 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
2409897 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataaatcataatatatcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgagtgaaatgccca |
2409995 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2409996 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2410026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41608850 - 41608621
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
41608850 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttt |
41608751 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41608750 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
41608652 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
41608651 |
aacgtcatacaatttggcacggagggagtac |
41608621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26707392 - 26707200
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26707392 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttcatttatct |
26707293 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26707292 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaa |
26707200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38615283 - 38615054
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
38615283 |
atatgtcgctttacaatacaaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatct |
38615184 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38615183 |
ttcccatgtta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
38615085 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38615084 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
38615054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49226610 - 49226413
Alignment:
Q |
29 |
ataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttat |
128 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
T |
49226610 |
ataccaatgcaatattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttctttcaattctttcatttatttttcccatatta-tttat |
49226512 |
T |
 |
Q |
129 |
ttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
49226511 |
taaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcttttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
49226413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4294155 - 4293926
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4294155 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
4294056 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
4294055 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacatctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
4293957 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4293956 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4293926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 26799399 - 26799628
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
26799399 |
atatgtcattttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaattctttcatttatct |
26799498 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
|
T |
26799499 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttattttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
26799597 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
26799598 |
aaacgtcatacaatttaggacggaggaagta |
26799628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37730980 - 37730751
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
37730980 |
atatgtcgctttacagtaccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtctctcttcttccaattctttcatttatct |
37730881 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
37730880 |
ttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccca |
37730782 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
37730781 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
37730751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47477198 - 47476973
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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T |
47477198 |
tatgttgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattcttttatttatttt |
47477099 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
47477098 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatcccttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
47477000 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
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|| || || ||||||||||||||||| |
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|
T |
47476999 |
aacgtcttacaatttgggacggaggga |
47476973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 45250126 - 45250354
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
45250126 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctt |
45250225 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
45250226 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
45250324 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
45250325 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45250354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29832292 - 29832091
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
29832292 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
29832193 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
29832192 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
29832094 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
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|
T |
29832093 |
aaa |
29832091 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 43566052 - 43566278
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
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|
T |
43566052 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctcttatttcaattctttcatttatttttc |
43566151 |
T |
 |
Q |
115 |
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214 |
Q |
|
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|
T |
43566152 |
acatatta-tttattaaggacaattttgtagaacaattcataatatctcttttccacacaaaattaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaa |
43566250 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
43566251 |
cgtcatacaatttgggacggaaggagta |
43566278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11248973 - 11248745
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
11248973 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
11248874 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|
T |
11248873 |
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11248775 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
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T |
11248774 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
11248745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19807053 - 19806827
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
19807053 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattattttatttatct |
19806954 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
19806953 |
ttctcatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacatctcataatatttcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatatgtgaaatgccca |
19806855 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
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T |
19806854 |
aaacgtcattcaatttgtgacggaggga |
19806827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48510862 - 48510633
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
|
T |
48510862 |
atatgtcgttttacattaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttatttttatctcttctttcaattctttcatttatct |
48510763 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
48510762 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
48510664 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
48510663 |
aaacatcatacaatttgggacagagggagta |
48510633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 26882779 - 26883007
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
26882779 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttccaattatatccttaagtatttattactctttattccttcaattctttcatttatctt |
26882878 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
T |
26882879 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
26882977 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
26882978 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
26883007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29494988 - 29494760
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
29494988 |
tatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaataccttcatttatctt |
29494889 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|
T |
29494888 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29494790 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29494789 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29494760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30088823 - 30088595
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
30088823 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
30088724 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
T |
30088723 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
30088625 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30088624 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30088595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 35836108 - 35836336
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
|
T |
35836108 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattattctctcttctttcaaatcttttatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
T |
35836208 |
tccaatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
35836306 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
35836307 |
aacgtcatacaatttgggacggatggagta |
35836336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 56038641 - 56038413
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
56038641 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|
T |
56038541 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
56038443 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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T |
56038442 |
aacgtcatataatttgtgacggagggagta |
56038413 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27956049 - 27955827
Alignment:
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111 |
Q |
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|||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
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atatatcgctttaaaataccaatgcaac-------ttacttttcctattataaccttaattatttattactctattttctttcaattctttcatttatct |
27955957 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
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T |
27955956 |
ttcccatatta-tttattaagaacaaatttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
27955858 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
27955857 |
aaacatcatacaatttgggacggagagagta |
27955827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41458919 - 41458692
Alignment:
Q |
14 |
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113 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
41458919 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattcattcatttatcttt |
41458820 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
41458819 |
ctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaa |
41458721 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
41458720 |
acgtcatacaatttgtgacggagggagta |
41458692 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 20180426 - 20180651
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Q |
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115 |
Q |
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T |
20180426 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcc |
20180525 |
T |
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Q |
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catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20180526 |
catatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
20180624 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
20180625 |
gtcatacaatttgggacggaaggagta |
20180651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 37912502 - 37912724
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
37912502 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
37912601 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |
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T |
37912602 |
ttctcatatta-tttattaaggataattttgtaaaac----cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgctca |
37912696 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
37912697 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25367469 - 25367241
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Q |
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112 |
Q |
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T |
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25367370 |
T |
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Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
25367369 |
tcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaa |
25367271 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25367270 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25367241 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36878663 - 36878443
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
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T |
36878663 |
gtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcc |
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T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
36878563 |
catatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatccctttttcatacaatattaattgtattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaac |
36878465 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
36878464 |
gtcttacaatttgggacggagg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 42168333 - 42168561
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Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
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T |
42168333 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctt |
42168432 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42168433 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
42168531 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42168532 |
aacatcatacaatttgggacggagggagta |
42168561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20788362 - 20788179
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
20788362 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
20788263 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
20788262 |
tttccatatt-atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcatttcctcacaatattaattgcatttcttaata |
20788179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
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Target Start/End: Original strand, 13880506 - 13880732
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
13880506 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatct |
13880605 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
13880606 |
ttcccatatcaatt-attgaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaagccca |
13880704 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13880705 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggga |
13880732 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21634624 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactctatcttctttcaattcattcatttatct |
21634722 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21634723 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat-ctttttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
21634820 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21634821 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
21634852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29290336 - 29290098
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29290336 |
tatgtcactttagaatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaattatttattactctttattttttcaattctttcatttatctt |
29290237 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29290236 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
29290138 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta-caattttga |
251 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
29290137 |
aacatcatacaatttgggacggagagagtatcaattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 14 - 243
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
37669971 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
37670070 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
37670071 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgttaaatgccca |
37670169 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
37670170 |
aaacatcatacaatttgggacggagagagtac |
37670201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52808881 |
ctttacaataccaatgcaacattaacgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccata |
52808980 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatc |
218 |
Q |
|
|
||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| || |
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T |
52808981 |
tta-tttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattgtatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaacgtc |
52809079 |
T |
 |
Q |
219 |
atataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52809080 |
atacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
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|
|
|||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
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T |
23137744 |
gtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcc |
23137843 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23137844 |
aatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
23137942 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
23137943 |
gtcatacaatttgggacgaagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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|
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T |
33244995 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatct |
33244896 |
T |
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Q |
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211 |
Q |
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T |
33244895 |
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33244797 |
T |
 |
Q |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33244796 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33244766 |
T |
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Target: chr4; HSP #38
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Q |
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T |
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T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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|
T |
41988089 |
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41987991 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
41987990 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41987960 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49235984 - 49235759
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Q |
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112 |
Q |
|
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T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctt |
49235885 |
T |
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Q |
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212 |
Q |
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T |
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49235786 |
T |
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Q |
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239 |
Q |
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|| |||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
49235785 |
aacatcatacaatttgggacggaggga |
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T |
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Target: chr4; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 5388214 - 5388442
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Q |
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T |
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T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
5388314 |
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5388412 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
5388413 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
5388442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 22019146 - 22019374
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Q |
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Q |
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T |
22019146 |
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T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
22019246 |
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22019344 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
22019345 |
aacgtcatacaattttggacggagggagta |
22019374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 26740443 - 26740215
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Q |
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111 |
Q |
|
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T |
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26740344 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
26740343 |
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26740245 |
T |
 |
Q |
212 |
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241 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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T |
26740244 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagt |
26740215 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27383659 - 27383432
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
|
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T |
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T |
 |
Q |
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
27383559 |
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27383462 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
27383461 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
27383432 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29832768 - 29832540
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Q |
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112 |
Q |
|
|
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|
T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
29832668 |
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29832570 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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T |
29832569 |
aacgtcatacaatttggaacggagggagta |
29832540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42629807 - 42629579
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Q |
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112 |
Q |
|
|
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|
T |
42629807 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
42629708 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
42629707 |
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42629609 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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|
|| ||||| ||||||||| |||||||||| |
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T |
42629608 |
aacgtcatacaatttgggatggagggagta |
42629579 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
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Q |
|
|
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T |
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tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttt |
48380728 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
48380729 |
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48380827 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
48380828 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
48380857 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
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||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
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ctttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcata |
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T |
 |
Q |
120 |
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219 |
Q |
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| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
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T |
42507654 |
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42507556 |
T |
 |
Q |
220 |
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236 |
Q |
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|
|
T |
42507555 |
tacaatttgggacggag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
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Q |
|
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T |
2401290 |
tacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttcccatatta |
2401389 |
T |
 |
Q |
123 |
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222 |
Q |
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T |
2401390 |
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2401488 |
T |
 |
Q |
223 |
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242 |
Q |
|
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T |
2401489 |
aatttgggatggaaggagta |
2401508 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
18052768 |
tatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
18052867 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat---tccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
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T |
18052868 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
18052966 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
18052967 |
ccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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T |
41858768 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
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T |
41858868 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatat-ctttttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcc |
41858965 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
41858966 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1607017 - 1606788
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
|
|
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|
T |
1607017 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattgtaaccttaacgatttattactctcttttttttcaattatttcatttatct |
1606918 |
T |
 |
Q |
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ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
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Q |
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T |
1606917 |
ttttcatatta-tttatttaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacgatattaattgaatttcttaatatgtttgaaatgctca |
1606819 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
|
|
||| || || |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1606818 |
aaacgtcgtacaatttgagacggagggagta |
1606788 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23511313 - 23511092
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
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|
T |
23511313 |
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23511214 |
T |
 |
Q |
120 |
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219 |
Q |
|
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| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
23511213 |
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23511115 |
T |
 |
Q |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23511114 |
tacaatttgggacggagggagta |
23511092 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34735974 - 34736203
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
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T |
34735974 |
atatgtcgttttaaaatatcaatgcaacattaatgatatttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
34736073 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
34736074 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacgcaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
34736172 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34736173 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
34736203 |
T |
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Target: chr4; HSP #54
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Target Start/End: Original strand, 44197307 - 44197523
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115 |
Q |
|
|
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T |
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gtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcc |
44197406 |
T |
 |
Q |
116 |
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213 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
T |
44197407 |
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44197505 |
T |
 |
Q |
214 |
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231 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||| |
|
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T |
44197506 |
acgtcatacaatttggga |
44197523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47869267 - 47869038
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
47869267 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattccttcatttatct |
47869168 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
47869167 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
47869069 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |
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|
T |
47869068 |
aaacgtcatacaatttggaacgtaaggagta |
47869038 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
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Q |
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128 |
Q |
|
|
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|
T |
15986582 |
accaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaactatttattattattttttctttcaattctttcatttatctttcccatatta-tttat |
15986484 |
T |
 |
Q |
129 |
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228 |
Q |
|
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| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
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|
T |
15986483 |
taaggataattttgtaaaacaactcataatatctttcttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttg |
15986384 |
T |
 |
Q |
229 |
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242 |
Q |
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|
|||||||||||||| |
|
|
T |
15986383 |
ggacggagggagta |
15986370 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25771203 - 25770975
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
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|
T |
25771203 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacatcaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttt |
25771104 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
25771103 |
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25771005 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
25771004 |
aacgtcgtacaatttgggacagagggagta |
25770975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13252379 - 13252164
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Q |
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gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttccca |
117 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
13252379 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattact-------atctcttctttcatttatttttcc-a |
13252288 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatat |
217 |
Q |
|
|
||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |
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T |
13252287 |
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13252189 |
T |
 |
Q |
218 |
catataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13252188 |
catataatttgggacggagggagta |
13252164 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 13494159 - 13494372
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13494159 |
tatgtctctttataataccattgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
13494258 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
13494259 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaa |
13494357 |
T |
 |
Q |
213 |
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227 |
Q |
|
|
|| || ||| ||||| |
|
|
T |
13494358 |
aacattatacaattt |
13494372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17609204 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattatttcatttatct |
17609105 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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T |
17609104 |
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17609006 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
T |
17609005 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
17608975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 18 - 242
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
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|
T |
36871471 |
gtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcagttccttcatttatctttct |
36871372 |
T |
 |
Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
36871371 |
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36871273 |
T |
 |
Q |
216 |
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242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
36871272 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
36871246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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Q |
|
|
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|
T |
7258134 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttagctatttattactctttcttctttcaattctttcatttatttt |
7258035 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
7258034 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttccgacactgtattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
7257936 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7257935 |
aacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
7257906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
52920809 |
tatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattgtttcttttttcaattctttcatttatctt |
52920710 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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T |
52920709 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
52920611 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
52920610 |
aacatcatacaatttgggacggatggagta |
52920581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
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Q |
|
|
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|
T |
55968597 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
55968697 |
tctcatatca-tttattaatgataattttgtaaaataaatcataatatctctttcccacacaatattaattacacttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
55968795 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
55968796 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
55968825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
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Q |
15 |
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Q |
|
|
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|
|
T |
55984339 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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T |
55984239 |
tcccatatca-tttattaatgataattttgtaaaataaatcataatatctctttcccacacaatattaattacacttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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T |
55984140 |
aacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 3506066 - 3506289
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
3506066 |
tatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaattattttttactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
3506165 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3506166 |
tcccatatta-tttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatataatattaattacatttttaaatatgtgtgaaatgcccaa |
3506264 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3506265 |
aacgtcatacaatttgggacggagg |
3506289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34447687 - 34447915
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
34447687 |
atatgtcgcttcacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
34447786 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcac-aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34447787 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacaccaatattaattacatttcttaat--gtgtgaaatgccc |
34447883 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34447884 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34447915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20540479 - 20540249
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
20540479 |
atatgtcgttttataatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatct |
20540380 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20540379 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
20540281 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
20540280 |
aaacgtcatacaatttgggacagagggagtac |
20540249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3086281 - 3086052
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
3086281 |
atatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcccattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattctttaatttatct |
3086182 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
3086181 |
ttctcatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgccta |
3086083 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
3086082 |
aaacgtcatacaatttgggaaggagggagta |
3086052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 6628925 - 6629154
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6628925 |
atatgtcactttagaatatcaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcctttttcaattctttcatttatct |
6629024 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
T |
6629025 |
ttctcatat-aatttaataaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
6629123 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6629124 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6629154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26483212 - 26482976
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
26483212 |
tatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttaccttttctattatatacttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctt |
26483113 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
26483112 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacagtattaattacatttcttaacatgtgtgaaatgcccaa |
26483014 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaattttga |
251 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||| || |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
26483013 |
aacatcatacaatttgaga-ggagggagtataattttga |
26482976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31648559 - 31648338
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
T |
31648559 |
tatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttt |
31648460 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31648459 |
tcccatatca-tttattgaggacaattgtgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgagtgaaatgcccaa |
31648361 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31648360 |
aacgtcatacaatttgggacgga |
31648338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34246810 - 34247039
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
34246810 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctataatatccttaactatttattactctttcttttttcaattatttcatttatct |
34246909 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
34246910 |
tttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
34247008 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34247009 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34247039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 46390762 - 46390990
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
46390762 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
46390860 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
46390861 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
46390959 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
46390960 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
46390990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10555321 - 10555093
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10555321 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctt |
10555222 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
10555221 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
10555123 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
10555122 |
aacgtcatacaatatgggacggatggagta |
10555093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34491908 - 34491680
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
34491908 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatttt |
34491809 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
34491808 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccccacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
34491710 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
34491709 |
aacgtcatataatttgagacgaagggagta |
34491680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 388099 - 388322
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
388099 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattagtgttacttttcctattatatccttcactatttattgcattctctacttccaagtcattcatttatctt |
388198 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
388199 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
388297 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
388298 |
aacgtcatacaatttgggacggagg |
388322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 37787932 - 37788159
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
37787932 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctcttctttcaattatttcatttatcctt |
37788031 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
37788032 |
tccatacca-tttattagggataattttgtaaaataactcataatttctctttcccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggccaaa |
37788130 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37788131 |
acgtcatataatttgggacggagggagta |
37788159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49651072 - 49650846
Alignment:
Q |
17 |
tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49651072 |
tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattcttatctcttctttcaattctttcatttatctttc |
49650973 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||||| || ||| || | |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
49650972 |
tcatatta-tttattaagaacagttctgtaaaacaattcataacatcttttttccacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgtccaaaa |
49650874 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
49650873 |
cgtcatacaatttgggacggatggagta |
49650846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51487773 - 51487546
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| | |
|
|
T |
51487773 |
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51487674 |
T |
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211 |
Q |
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T |
51487673 |
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51487577 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
|
|
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T |
51487576 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
51487546 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
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Target Start/End: Original strand, 31486910 - 31487137
Alignment:
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112 |
Q |
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T |
31486910 |
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31487009 |
T |
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Q |
113 |
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Q |
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T |
31487010 |
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31487107 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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|| ||||| | |||||||||||||||||| |
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T |
31487108 |
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31487137 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33600009 - 33599781
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
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33599910 |
T |
 |
Q |
113 |
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211 |
Q |
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T |
33599909 |
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33599812 |
T |
 |
Q |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
33599811 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33599781 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
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Target Start/End: Original strand, 36937253 - 36937482
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Q |
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111 |
Q |
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T |
36937253 |
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36937352 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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T |
36937353 |
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36937451 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
36937452 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36937482 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42133786 - 42133555
Alignment:
Q |
14 |
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109 |
Q |
|
|
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|
T |
42133786 |
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42133687 |
T |
 |
Q |
110 |
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209 |
Q |
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T |
42133686 |
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T |
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242 |
Q |
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|||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
42133587 |
taaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
42133555 |
T |
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Target: chr4; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 43587721 - 43587949
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Q |
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112 |
Q |
|
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T |
43587721 |
tatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttttatttatctt |
43587820 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
43587821 |
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43587919 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| ||||| |||||| |
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T |
43587920 |
aacgtcatataatttggaacggaaggagta |
43587949 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51234929 - 51234709
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
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|||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
51234929 |
tttagaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatat |
51234830 |
T |
 |
Q |
121 |
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220 |
Q |
|
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T |
51234829 |
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51234731 |
T |
 |
Q |
221 |
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242 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| |||||| |
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|
T |
51234730 |
ataatttggaacggaaggagta |
51234709 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 6920659 - 6920876
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
6920659 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
6920758 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|
T |
6920759 |
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6920846 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
6920847 |
aacgtcatacaatttgggacggaggtagta |
6920876 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 56299740 - 56299967
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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T |
56299740 |
atatgtcgttttacaatacaaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattaatctctcttctttcaatttcttcatttatct |
56299839 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
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T |
56299840 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttttttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
56299938 |
T |
 |
Q |
212 |
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240 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
56299939 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggag |
56299967 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Target Start/End: Original strand, 39417854 - 39418083
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
39417854 |
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39417953 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|
||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
39417954 |
ttctcatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
39418052 |
T |
 |
Q |
212 |
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242 |
Q |
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T |
39418053 |
aaatgtcgtacaatttgggacggagggagta |
39418083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 43609327 - 43609528
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Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
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T |
43609327 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatatgttactctttctt--caattctttcatttatttttcccatatta |
43609424 |
T |
 |
Q |
123 |
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222 |
Q |
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T |
43609425 |
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43609523 |
T |
 |
Q |
223 |
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227 |
Q |
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||||| |
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|
T |
43609524 |
aattt |
43609528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 56513677 - 56513452
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Q |
18 |
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115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |
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|
T |
56513677 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcgtttatcttttc |
56513578 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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T |
56513577 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccgcacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
56513479 |
T |
 |
Q |
216 |
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242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
56513478 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
56513452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Original strand, 26855399 - 26855603
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Q |
39 |
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136 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
26855399 |
aacattaatgttacttttcctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatac-aatttattaaggaca |
26855497 |
T |
 |
Q |
137 |
attttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
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|
T |
26855498 |
attttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcctaaaacatcatacaatttgggacggag |
26855597 |
T |
 |
Q |
237 |
ggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
26855598 |
ggagta |
26855603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
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Q |
8 |
cgaataatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcat |
105 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
32397502 |
cgaattatatgtcgttttacaatacctatgtaacattaatgttattttttctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattcttttat |
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T |
 |
Q |
106 |
ttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
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T |
32397402 |
ttatttttcccatatta-tttattaaggacaattttttaaaacatttcataatatttcttttccacacaatattaattatatttcttaatgtgtgtaaaa |
32397304 |
T |
 |
Q |
206 |
tgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||| ||| ||||||||| |
|
|
T |
32397303 |
tgccgaaaaagtaatacaatctgggacgga |
32397274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 37390570 - 37390782
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Q |
34 |
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131 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
T |
37390570 |
aatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcttttatctttcccatatca-tttattaa |
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T |
 |
Q |
132 |
ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
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T |
37390669 |
ggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttggga |
37390768 |
T |
 |
Q |
232 |
cggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |
|
|
T |
37390769 |
cggagggagtacaa |
37390782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8591904 - 8591685
Alignment:
Q |
25 |
tacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatatta |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |
|
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T |
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tacaataccaatgaaatatcaatgttacctttcctattatatccttagctatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca |
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T |
 |
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
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|||||| | || |||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
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T |
8591804 |
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8591706 |
T |
 |
Q |
223 |
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243 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||| |
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|
T |
8591705 |
aatttggaacgaagggagtac |
8591685 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38794037 - 38793818
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38794037 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
38793938 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
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| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
38793937 |
tca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac--tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
38793841 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
38793840 |
tacaatttaggacggaaggagta |
38793818 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 51625009 - 51625121
Alignment:
Q |
130 |
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229 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
51625009 |
taggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgg |
51625108 |
T |
 |
Q |
230 |
gacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||| |
|
|
T |
51625109 |
gacggagggagta |
51625121 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1788820 - 1788592
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
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T |
1788820 |
atatgtcgctttacaataccgataaaacattaatgttacttttcctattatatcgttaattatctattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
1788721 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||| ||| |
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|
T |
1788720 |
atctcatatca-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatcactttccagcacaaaattaattaca-ttcttaatacgtgcgaaatgacca |
1788623 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
1788622 |
aaacatcatacaatttgggacagagggagta |
1788592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10125707 - 10125478
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10125707 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
10125608 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
10125607 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
10125509 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10125508 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
10125478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 19877808 - 19878033
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
19877808 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaaagttacttttctcattatatccttaactatttattactctctattctttcaattatttaatttatct |
19877907 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
19877908 |
ttcccatac-aacttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgccta |
19878006 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggg |
238 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19878007 |
aaacgtcatataatttgggacggaggg |
19878033 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22100970 - 22101199
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
22100970 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
22101069 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
22101070 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcca |
22101168 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22101169 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
22101199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33924938 - 33924709
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
T |
33924938 |
atatgtcactttacaattccaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactctttcttctttcaattcttttatttattt |
33924839 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33924838 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacataatattaattacatttcctaatatgtgtgaaatgccca |
33924740 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||| || |||||| |
|
|
T |
33924739 |
aatcgtcgtacaatttgggacagatggagta |
33924709 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 13800386 - 13800614
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
13800386 |
tatgtcgctttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
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|
T |
13800486 |
ttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaa |
13800584 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13800585 |
aacgtcatacaatttggaacggagggagta |
13800614 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 23222527 - 23222755
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23222527 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctgttatatccttaactatctattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
23222626 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| | ||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |
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|
T |
23222627 |
tctcgtatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctattttccacacaatattaattatatttcttaatatatgttaaatgctcaa |
23222725 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
23222726 |
aacgtcgtacaatttgggacggagtgagta |
23222755 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 54315109 - 54315337
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||| || ||||||||| || |
|
|
T |
54315109 |
tatgtcgcattacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgctttctctacttccaagtcattcatttatttt |
54315208 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || | |
|
|
T |
54315209 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgtccta |
54315307 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54315308 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
54315337 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 33501378 - 33501622
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Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
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atgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaagtcttttatttatcttt |
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T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttc----------------cgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33501478 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacatattaatttttcacacaatattaattacatttcttaata |
33501576 |
T |
 |
Q |
197 |
tgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33501577 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33501622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
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Query Start/End: Original strand, 94 - 235
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193 |
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|
|
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|
T |
34018808 |
caattctttcatttatctttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaactacatttctta |
34018906 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34018907 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacgga |
34018948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |
|
|
T |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatatta |
180 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
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193 |
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|
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
29832855 |
caattctttcatttatctttcctatatca-tttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttctta |
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T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
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Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29832954 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcataaaatttgggacggagggagta |
29833002 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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Target Start/End: Original strand, 17678582 - 17678810
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
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|||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
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T |
17678582 |
tatgtcactttacaatactaatgaaaacattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttcatttatca |
17678681 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |
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|
T |
17678682 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcgtaatat-ctttttccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcaca |
17678779 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
17678780 |
aaaagtcatacaatttgggacggatggagta |
17678810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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Q |
18 |
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115 |
Q |
|
|
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|
T |
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gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
27851325 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |
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T |
27851326 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcactttcccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
27851424 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||||| ||||| | |||||||||||| |
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|
T |
27851425 |
gtcatacaatttagaacggagggagta |
27851451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 30418759 - 30418988
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
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T |
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atatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaattatttcatttatct |
30418858 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
30418859 |
tttccata-ccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctcttccacccacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
30418957 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
30418958 |
aaacgttatacaatttgggacggagggagta |
30418988 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43050220 - 43050449
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
43050220 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttcttttaattatttcatttatct |
43050319 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
43050320 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
43050418 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |
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T |
43050419 |
aaacgtcatacaatttaggacggaggaagta |
43050449 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 52183910 - 52184139
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
52183910 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
52184009 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
52184010 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
52184108 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| || ||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
52184109 |
aaacgtcgtataatttgggacggagggagta |
52184139 |
T |
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Target: chr4; HSP #115
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 55925716 - 55925945
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111 |
Q |
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T |
55925716 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccttattctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
55925816 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacaattcttaataagtgtgaaatgacca |
55925914 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
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T |
55925915 |
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55925945 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 56235208 - 56235433
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
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|
T |
56235208 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
56235307 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
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|
T |
56235308 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
56235406 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
T |
56235407 |
gtcatacaatttgagatggagggagta |
56235433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 596367 - 596163
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Q |
23 |
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120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
596367 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatat |
596268 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
596267 |
ca-tttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccaaaaatgtcat |
596169 |
T |
 |
Q |
221 |
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226 |
Q |
|
|
| |||| |
|
|
T |
596168 |
acaatt |
596163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42179674 - 42179460
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
42179674 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattgatgttacttttcctattataaccttaactattcattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
42179575 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
42179574 |
tcccata------------gaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
42179487 |
T |
 |
Q |
213 |
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239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
42179486 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
42179460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
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Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29977120 - 29976906
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
29977120 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattgat---acttttcctattataaccttaattatttacc-ctttcttctttcaattctttcatttaatttt |
29977025 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
29977024 |
ctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaatattaattgtatttcttaatatatgtgaaatgcccaaa |
29976926 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
| |||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
29976925 |
acatcatacaatttaggacg |
29976906 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 30035516 - 30035292
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
30035516 |
ctttacaataccaatgcaacattaatattaatttctctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatttttcc-ata |
30035418 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtg---aaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||| |
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|
T |
30035417 |
tta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattgtattttttaatatgtgtgatcaaatgcctaaaacg |
30035319 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
30035318 |
tcatacaatttaggacggaggaagtac |
30035292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35877068 - 35876833
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
T |
35877068 |
tatgtcactttccaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttgtttcaattcttttatttaattt |
35876969 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
35876968 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacccaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
35876870 |
T |
 |
Q |
213 |
a-----atatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35876869 |
aacatcatataatataatttgggacggagggagtaca |
35876833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44622443 - 44622215
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
44622443 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctcttttttcaattatttcatttattttt |
44622344 |
T |
 |
Q |
114 |
c-ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||| | |||||| || | |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
44622343 |
ttccatacca-tttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggccaa |
44622245 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44622244 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44622215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46481553 - 46481428
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
46481553 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtcaaatgctcaaaacgtcatac |
46481454 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
46481453 |
agtttgagacggagggagtataattt |
46481428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47170911 - 47170684
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
47170911 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactaataattattctctcttctttcaattatttcatttatct |
47170812 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
47170811 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccgcacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
47170713 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
47170712 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggag |
47170684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50690643 - 50690425
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcattt-atct |
111 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
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tatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcattttatca |
50690544 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
50690543 |
ttcccataaca-tttata-aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattacttacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
50690446 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
50690445 |
aaacatcatacaatttgggac |
50690425 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
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Target Start/End: Original strand, 34498209 - 34498356
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Q |
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
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|
|
T |
34498209 |
caattctttcatttatctttcccatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatataatattaattacatttctta |
34498307 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34498308 |
atatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
34498356 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 50534202 - 50534348
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
T |
50534202 |
caattccttcatttatctttctcatatta-tttattgaggacaattttgtaatacaactcataatatat-ttttccacacaatattaattacatttctta |
50534299 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
50534300 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacgttatacaatttaggacggaaggagta |
50534348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 16032345 - 16032574
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
16032345 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccctaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
16032444 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
16032445 |
tttccat-gccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatgacca |
16032543 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
16032544 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16032574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 16605242 - 16605471
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
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|
T |
16605242 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactcttttttctttcaattatttcatttatct |
16605341 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |
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|
T |
16605342 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcaa |
16605440 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16605441 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16605471 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22496679 - 22496458
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | || ||| || || |||||||||||||||| |
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|
T |
22496679 |
ctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcgctatttattgcattctctacttccaagtcatttatttatctttcccata |
22496580 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |
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|
T |
22496579 |
tca-tttattaaggacaattttgtaaaacgactcataatatatctttcccacataaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgcccaaaacgtca |
22496481 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||| |||| |
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|
T |
22496480 |
tacaatttggaacggaggaagta |
22496458 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 23138090 - 23138291
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23138090 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
23138189 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
23138190 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
23138288 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
23138289 |
aaa |
23138291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 53690293 - 53690522
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
53690293 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
53690392 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
53690393 |
tttccatacca-tttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
53690491 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53690492 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
53690522 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 23662582 - 23662809
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
23662582 |
tatgtcactttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcctaatatatcattaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatttt |
23662681 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
23662682 |
tcc-atatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttcttaatataaatgaaatgtccaa |
23662779 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
23662780 |
aacgtcatacaatttgtgacggaggaagta |
23662809 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39915825 - 39916049
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39915825 |
atatgtcgctttccaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattctttcatttatct |
39915924 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||| |||| | |
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|
T |
39915925 |
ttctcatatt-atttattaagatcaattttataaaacaactcataatatctcattttcacacaaaatatattacatttcttaatatatgt----tgccta |
39916019 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
39916020 |
aaacatcatacaattt-ggacggagggagta |
39916049 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 243
Target Start/End: Original strand, 23138354 - 23138502
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
23138354 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaatattaattacatttctta |
23138452 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23138453 |
atacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
23138502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29753180 - 29752953
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Q |
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atgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc--nnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
29753180 |
atgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattactctttcttctttcaattatttcatttatcttt |
29753081 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
29753080 |
tccata-caatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaaaagccaaa |
29752982 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
29752981 |
acgtcttacaatttgggacggagggagta |
29752953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 288399 - 288633
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
288399 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
288498 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
288499 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgggca |
288597 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |
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|
T |
288598 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagtataatt |
288633 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41414293 - 41414063
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
41414293 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcac-aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
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T |
41414193 |
ttttcata-ccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacgaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtc |
41414095 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
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T |
41414094 |
aaaatgtcatacaatttgagacggagggagta |
41414063 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 51779588 - 51779817
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Q |
14 |
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Q |
|
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|||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| | |
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T |
51779588 |
atatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattctctcttcttttaattccttcatttaatt |
51779687 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
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T |
51779688 |
ttctcatatca-tttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatat-ctttttcctacacaatattaattgcatttcttaacatgtgtaaaatgctc |
51779785 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| | ||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
51779786 |
aaaacgtaatacaatttgggactgagggagta |
51779817 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22128775 - 22129004
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111 |
Q |
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T |
22128775 |
atatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatcttttctattatatcattaactatttattactctattttcttttaattctttcatttatct |
22128874 |
T |
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Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
22128875 |
ttccggtatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaagtcataatttctcttttccatacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgctca |
22128973 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
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T |
22128974 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
22129004 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41947790 - 41947561
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
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T |
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tatgtcactttacaataccaatgaataattaatgtttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
41947690 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaataccca |
41947592 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |||| |
|
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T |
41947591 |
aaacgtcttacaatttgggacggaggaagta |
41947561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16833830 - 16833601
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattacataattaactattaattactctctcttctttctattcattcatttattt |
16833731 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |
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T |
16833730 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcaaataatattaattacattttttaatacgtgtgaaatgtcca |
16833632 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
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T |
16833631 |
aacaatcatacaatttgggacggagggagta |
16833601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22320584 - 22320813
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Q |
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111 |
Q |
|
|
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|
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T |
22320584 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
22320683 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |
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T |
22320684 |
tttccata-ccatttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatggtca |
22320782 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| | ||| |||| || |||||||||||| |
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|
T |
22320783 |
aaatgttatacaattcggaacggagggagta |
22320813 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22842960 - 22843189
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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T |
22842960 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
22843059 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
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|
T |
22843060 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgtca |
22843158 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
22843159 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
22843189 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23153710 - 23153938
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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T |
23153710 |
atatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctgttatgtcattaactatttattactctctcgtctttcaattctttaatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
23153810 |
ttctcatacta-tttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaaaattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
23153908 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | ||||| |||||||||||| ||||||| |
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T |
23153909 |
aact-tcatacaatttgggacggtgggagta |
23153938 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25063836 - 25063607
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
25063736 |
tttttatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaattgcca |
25063638 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
25063637 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
25063607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 30049522 - 30049751
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30049522 |
atatgttgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
30049621 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| || |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
30049622 |
tttccatgcta-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
30049720 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
30049721 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
30049751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
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Q |
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|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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T |
34002226 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
34002326 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
34002424 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34002425 |
aaacgtcttacaatttgagacggagggagta |
34002455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
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T |
38852863 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
38852763 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgcca |
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T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||| |||||||||||||| |
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T |
38852664 |
aaacgtcttacaatttaggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
50098326 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctatgcaatattaataacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
50098424 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
50098425 |
aaacgtcttacaatttggaacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
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|
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T |
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T |
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Q |
200 |
gtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
32859820 |
gtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #152
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 |
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112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
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|
|
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|
T |
6284136 |
tttccata-tcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatctatgtctcatacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccta |
6284234 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
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T |
6284235 |
aaacgtcatacaatttgggacggatggagtac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 54270824 - 54271053
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|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
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|
T |
54270824 |
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T |
 |
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ttcccata--ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
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|
|
|| ||||| ||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
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|
T |
54270924 |
tttccatacctta---tattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacagaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggc |
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 |
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210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
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|
|
||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
54271021 |
caatacatcatacaatttgggacggaggaagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 243
Target Start/End: Original strand, 23621800 - 23621907
Alignment:
Q |
136 |
aattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
23621800 |
aattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
23621899 |
T |
 |
Q |
236 |
gggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
23621900 |
gggagtac |
23621907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 30609285 - 30609514
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30609285 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctgttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
30609384 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |
|
|
T |
30609385 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgcgaaatgctca |
30609483 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
30609484 |
aaacgtcttacaatttgggacggaggaagta |
30609514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37175396 - 37175167
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
37175396 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
37175297 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || |
|
|
T |
37175296 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgcaaaatggtca |
37175198 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37175197 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
37175167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 7770591 - 7770739
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| || | |||| |
|
|
T |
7770591 |
caattccttcatttatctttcccatatca-tttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaca-tcctta |
7770688 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgt-gtgaaatgcccaaaatatcatataattt-gggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
7770689 |
atatgtggtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttggggacggagggagta |
7770739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8178191 - 8178044
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
8178191 |
atatgttgctttacaataccaataaaacattaatgtaatttttcatattatatcctttactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatct |
8178092 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8178091 |
ttcccatat-aatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatat |
8178044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30649813 - 30649583
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacc-ttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || || ||| | || ||| || | ||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
30649813 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattttatcctttaactcttaattgctccctattctttcaattattttatttatc |
30649714 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
30649713 |
ttttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcc |
30649615 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30649614 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30649583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 28002569 - 28002770
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
28002569 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
28002668 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
28002669 |
tttccatact-atttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcagtattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
28002767 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
28002768 |
aaa |
28002770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 32882176 - 32882247
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32882176 |
atatatcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactc |
32882247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9583781 - 9583561
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
9583781 |
atatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctcttctttcaatttttttatttatcttt |
9583682 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||| | |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
9583681 |
cccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt-ttaatacgtgtgaaatatccaaa |
9583584 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
9583583 |
atgtcgtacgatttgggacggag |
9583561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9589476 - 9589256
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
9589476 |
atatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctcttctttcaatttttttatttatcttt |
9589377 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||| | |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
9589376 |
cccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt-ttaatacgtgtgaaatatccaaa |
9589279 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
9589278 |
atgtcgtacgatttgggacggag |
9589256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32385560 - 32385357
Alignment:
Q |
39 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta-ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaa |
137 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| || |
|
|
T |
32385560 |
aacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattatctctcttctttcaattctttaatttatctttctcatacca-tttattaaggaaaa |
32385462 |
T |
 |
Q |
138 |
ttttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|||| ||||| || ||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||| | |
|
|
T |
32385461 |
ttttgtaaaataattcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtctaaaacgtcatacaatttgagacggatg |
32385362 |
T |
 |
Q |
238 |
gagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
32385361 |
gagta |
32385357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38052418 - 38052299
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
38052418 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatgtattttccatgcaaaattaactacatttcttaatagatgtgaaatgtccaaaatatcatat |
38052319 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || ||||| |
|
|
T |
38052318 |
aatttggaacgaagagagta |
38052299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 44570848 - 44570918
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
T |
44570848 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
44570918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9542591 - 9542390
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||| || |
|
|
T |
9542591 |
atatgtcactttgcaataccaatgaaacattaacgttaattttcctattatgtccctaactatttgttactctctcttctttcaattctttcatttaact |
9542492 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
9542491 |
tttccatatca-tttattaagaacaatttagtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatatcaattatatttcttaatacgtgtgaaatgctca |
9542393 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
9542392 |
aaa |
9542390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 23621693 - 23621763
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
23621693 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatcatttattactc |
23621763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 14965393 - 14965621
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
14965393 |
tatgtcgctttgcaatactaatgaagcattaatgttatttttcctattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctt |
14965492 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| | ||||| | | || |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |
|
|
T |
14965493 |
tcccata-tcatttactaaagataattttgtaaaacaattcaaaatatccattttccacgcaaaattaattatatttcttaatacgtatgaaatgctcaa |
14965591 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||| |||| |||| |
|
|
T |
14965592 |
aacgtcatacaatttaggacagaggaagta |
14965621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32860844 - 32860794
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32860844 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
32860794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
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Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataac |
67 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14604254 |
atatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataac |
14604307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
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Alignment:
Q |
324 |
gttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatgatga |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19630480 |
gttcatacaagtgataggctcggtgacaattgaagaatgatgatga |
19630525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 50533824 - 50533881
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
50533824 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
50533881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 51624917 - 51624974
Alignment:
Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
51624917 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactc |
51624974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Original strand, 9036737 - 9036808
Alignment:
Q |
171 |
cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
T |
9036737 |
cacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgctcaaaatgtcatataacttgggacgaagcgagta |
9036808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 46481645 - 46481574
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
46481645 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttatttttcttattgtaaccttaacgatttattactc |
46481574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52397918 - 52397689
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
52397918 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcttattatatcattaactattaattactttctcttctttcaattatttcatttatca |
52397819 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
52397818 |
ttttcatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatgacca |
52397720 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
52397719 |
aaacgtcttacaatttgtgacggaggaagta |
52397689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 9033656 - 9033721
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9033656 |
caattctttcatttatctttttcatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
9033721 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18872439 - 18872369
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
18872439 |
atatgtcgttttataataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattact |
18872369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 29832491 - 29832541
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29832491 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
29832541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37041136 - 37041086
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattat |
64 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37041136 |
atatgtcgctttacaataccactgaagcattaatgttacttttcctattat |
37041086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 46674916 - 46674986
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
46674916 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatctattactc |
46674986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13394531 - 13394412
Alignment:
Q |
42 |
attaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaatt |
139 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||| |
|
|
T |
13394531 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca-tttattgaagacaatt |
13394433 |
T |
 |
Q |
140 |
ttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13394432 |
ttgtaaaacaactcataatat |
13394412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13397670 - 13397551
Alignment:
Q |
42 |
attaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaatt |
139 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||| |
|
|
T |
13397670 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca-tttattgaagacaatt |
13397572 |
T |
 |
Q |
140 |
ttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13397571 |
ttgtaaaacaactcataatat |
13397551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 18316828 - 18316881
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18316828 |
gtcgctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattataccctta |
18316881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23949763 - 23949551
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctat----tataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcattt |
107 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||| |
|
|
T |
23949763 |
atatgtcgctttacaatataaatgcaacattaatgttattttttctattatatataaccttaactatttatcactctcttttcttttaattatttctttt |
23949664 |
T |
 |
Q |
108 |
atctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatg |
207 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
23949663 |
atctttctaatatt-atttattaagaacaattttttaaaacaactcatgatatctctttttaaaacaatattaattgcatttcttaatagatgtgaagtg |
23949565 |
T |
 |
Q |
208 |
cccaaaatatcata |
221 |
Q |
|
|
| ||| | |||||| |
|
|
T |
23949564 |
ctcaagacatcata |
23949551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51817169 - 51817023
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
51817169 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactcttttttttttcaattcttttatttatctt |
51817070 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| || | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
51817069 |
tcccagatca-tttataaaggataattttgtaaaacaactcataatat |
51817023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10699349 - 10699275
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttcc |
169 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
10699349 |
caattctttaatttatctttcgcatagta-tttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttcc |
10699275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10913119 - 10913045
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttcc |
169 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
10913119 |
caattctttaatttatctttcgcatagta-tttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttcc |
10913045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 32882655 - 32882706
Alignment:
Q |
191 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32882655 |
ttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttgagacggagggagta |
32882706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30152933 - 30152819
Alignment:
Q |
136 |
aattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | || | ||||| |||||| |||| | |
|
|
T |
30152933 |
aattttgtaaaacaattcacaatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtaggaaatgtctaatacgtcatacaatttgagacgta |
30152834 |
T |
 |
Q |
236 |
gggagtacaattttg |
250 |
Q |
|
|
| |||||| |||||| |
|
|
T |
30152833 |
gagagtactattttg |
30152819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32295387 - 32295341
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattat |
64 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
32295387 |
gtcgccttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattat |
32295341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36507544 - 36507404
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccat |
118 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
36507544 |
gctttacaataccaatgaaacattaattttatttttcctattatatatttaactatttattactttatctcattccaagtcattcatttatcttttccat |
36507445 |
T |
 |
Q |
119 |
attaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
36507444 |
a-tcatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatat |
36507404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #194
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Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19684317 - 19684276
Alignment:
Q |
324 |
gttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatg |
365 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19684317 |
gttcataccagtgataggttcagtgacaattgaagaatgatg |
19684276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #195
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Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6154199 - 6154155
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
6154199 |
gctttacaatatcaatgaaacattaatgttaattttcctattata |
6154155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #196
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Target Start/End: Original strand, 10754551 - 10754638
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
10754551 |
caattctttaatttatctttcgcatggt-atttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaat |
10754638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 182
Target Start/End: Original strand, 10968320 - 10968407
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
10968320 |
caattctttaatttatctttcgcatggt-atttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaat |
10968407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 29462726 - 29462514
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
29462726 |
ctttacaataccaatgaaac-ttaatgttacttttccta-tatacccttaactatttattactttaacttttttcaattttttaatttatctttcctata |
29462629 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| ||||||| | ||||||||| || || |||||||||||| |||| | | || |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |
|
|
T |
29462628 |
-tcatttattaaagacaattttgtagaataactcataatatctctttctcatagaaaattaattagatttcttaatacatgttaaatacccaaaacatcc |
29462530 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
29462529 |
tataatttgggacgga |
29462514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31372470 - 31372390
Alignment:
Q |
134 |
acaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
T |
31372470 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatatcttaatacgtgtaaaatgaccaaaa |
31372390 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51817000 - 51816928
Alignment:
Q |
173 |
caatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
51817000 |
caatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtttaaaaagtcatacaatttggaacggagggagtacaa |
51816928 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 13967728 - 13967791
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata-accttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13967728 |
tttacaataccaatgaaacatcaatgttacttttcttattacataccttaagtatttattactc |
13967791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5907839 - 5907741
Alignment:
Q |
138 |
ttttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||| | | ||||||| ||||||| |
|
|
T |
5907839 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttacacacaaaattaattacatttcttaatacgcgtaaaatgaccaaaatgacttgtaatttgagacggag |
5907741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 6893258 - 6893323
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6893258 |
caattatttcatttatctttccaatatca-tttattaagtataattttgtaaaacaactcataatat |
6893323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 24323243 - 24323293
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattat |
64 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24323243 |
atatgtcgttttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattat |
24323293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 7770508 - 7770564
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
7770508 |
atatgtcactttacaatac-aaggaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
7770564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11116462 - 11116365
Alignment:
Q |
145 |
aaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| | |||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
11116462 |
aaacaactcataatatctctttcctatacaaaattaattacatttttgaatacgtgtgaaatgtctaaaatatcttctaatttgggacggatggagta |
11116365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Original strand, 44570956 - 44571025
Alignment:
Q |
171 |
cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
44570956 |
cacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgatcaaaacgtgttacaatttgggacggagggag |
44571025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26478012 - 26477940
Alignment:
Q |
171 |
cacaatattaatagcattt-cttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26478012 |
cacaatattaattacattttcttaatacgtgtgaaatggctaaagcgtcatacaatttgggacggagggagta |
26477940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 46675088 - 46675128
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatt |
226 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
46675088 |
atttcttaatatgtgtgaaatacccaaaatattataaaatt |
46675128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 55852207 - 55852171
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgtt |
50 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
55852207 |
atatgtcgctttataataccaatgcaaaattaatgtt |
55852171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 201)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4822906 - 4822678
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4822906 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacat-aatgttacttttcctattataaccttagttatttattactttcttttctttcaattctttcatttatct |
4822808 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4822807 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttctacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
4822709 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4822708 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
4822678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33610313 - 33610088
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33610313 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccatcttctttcaattatttcatttatctttcc |
33610214 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33610213 |
catatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcatttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
33610115 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33610114 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
33610088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 11363104 - 11363329
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11363104 |
atatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactcttcttt--caattctttcatttatcttt |
11363201 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |
|
|
T |
11363202 |
ctcatatta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattgcatttcttaatatgtgcggaatgcctaaa |
11363300 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11363301 |
acgtcatataatttgggacggagggagta |
11363329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1672920 - 1672723
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1672920 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcc |
1672821 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1672820 |
catatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
1672723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29756748 - 29756519
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
29756748 |
atatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
29756649 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29756648 |
ttctcgtatta-tttattaaggacaaatttgtaaaacgactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
29756550 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29756549 |
aaatgtcatacaatttgggacggagggagta |
29756519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 49818333 - 49818557
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
49818333 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttctct |
49818432 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
49818433 |
ttaccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccca |
49818531 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
49818532 |
aaacgtcatacaatttgggacggagg |
49818557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 5925354 - 5925581
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5925354 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctcttctttcaattctttcatttatcttt |
5925453 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5925454 |
ctcatatta-tttattaaggataattttgtaaaataattcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
5925552 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
5925553 |
acgtcatacaatttgggacggatggagta |
5925581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 37056672 - 37056898
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
37056672 |
tatgtcgctttacaataccaatacaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtctcttatttcaattctttcatttatttttc |
37056771 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
37056772 |
ccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgcatttcttgatatgtgtgaaatgccaaaaa |
37056870 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37056871 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
37056898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40710739 - 40710510
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
40710739 |
atatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaattttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
40710640 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40710639 |
ttcccatgtta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
40710541 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40710540 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40710510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 51571807 - 51572037
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
51571807 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
51571906 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51571907 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
51572005 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
51572006 |
aaaacgtcgtacaatttgggacggaggaagta |
51572037 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 10659259 - 10659484
Alignment:
Q |
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115 |
Q |
|
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T |
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gtcgcttaacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcc |
10659358 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10659359 |
catat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
10659457 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10659458 |
aacatacaatttgggacggagggagta |
10659484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51166509 - 51166280
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
51166410 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51166409 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttataaaataactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
51166311 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
51166310 |
aaacgtcgtacaatttgggatggagggagta |
51166280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 17378227 - 17378455
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
17378227 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
17378326 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17378327 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
17378425 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17378426 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
17378455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 335918 - 335692
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
335918 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
335819 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
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|
T |
335818 |
ttcccatat-aatttatcgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatggtca |
335720 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
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||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
335719 |
aaacgtcatacaatttaggacggaggga |
335692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13759865 - 13759636
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13759865 |
atatgtcactttacgataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatct |
13759766 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
13759765 |
ttctcatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatgccca |
13759667 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
13759666 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13759636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 30190378 - 30190607
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
30190378 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatct |
30190477 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30190478 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
30190576 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30190577 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30190607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 44035197 - 44035426
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
44035197 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatattacttttccaattataactttaattaattattactccatcttctttcaattctttcatttatct |
44035296 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44035297 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
44035395 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44035396 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44035426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52060498 - 52060269
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
52060498 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactccctcttctttcaattctttcatttatct |
52060399 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52060398 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
52060300 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52060299 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
52060269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 21272684 - 21272912
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
21272684 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctcttttatttcaattctttcatttatttt |
21272783 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
21272784 |
tcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatccattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
21272882 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
21272883 |
aacgtcttacaatttgggacggagggagta |
21272912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29361554 - 29361326
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
T |
29361554 |
tatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactctcttttatttcaattctttaatttatttt |
29361455 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
29361454 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
29361356 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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|
|
T |
29361355 |
aacgtcatacaatttgggacggagagagta |
29361326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53655192 - 53654964
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
53655192 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
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|
T |
53655092 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
53654994 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
53654993 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
53654964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 15019833 - 15020063
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14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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Q |
|
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|
T |
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atatgtcgctttacaataccaacgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
15019933 |
ttctcatatca-tttattgaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
15020031 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
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T |
15020032 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagtac |
15020063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 48333765 - 48333992
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
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T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
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|
T |
48333865 |
cccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaa |
48333963 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| | ||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
48333964 |
acgttatacaatttgggacggagggagta |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33593177 - 33592964
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Q |
15 |
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T |
33592978 |
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33592964 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33600308 - 33600095
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
33600308 |
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33600209 |
T |
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Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
33600208 |
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33600110 |
T |
 |
Q |
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227 |
Q |
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||| ||||| ||||| |
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T |
33600109 |
aatgtcatacaattt |
33600095 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4047304 - 4047076
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
4047105 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4047076 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23609459 - 23609231
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
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23609360 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
|
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
23609260 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23609231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 47054052 - 47054280
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
47054052 |
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47054151 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
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242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
47054251 |
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47054280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32048049 - 32048277
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn-caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
32048049 |
atatatcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactcctcttctttcgattctttcatttatctt |
32048148 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
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32048247 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
32048248 |
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32048277 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49893168 - 49892965
Alignment:
Q |
36 |
tgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatttatttagg |
133 |
Q |
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T |
49893168 |
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49893070 |
T |
 |
Q |
134 |
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233 |
Q |
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T |
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49892970 |
T |
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Q |
234 |
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238 |
Q |
|
|
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|
T |
49892969 |
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49892965 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38783668 - 38783439
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
38783668 |
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38783569 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
38783568 |
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38783470 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
38783469 |
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38783439 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43175789 - 43176018
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
43175789 |
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43175888 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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|
T |
43175889 |
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43175987 |
T |
 |
Q |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
43175988 |
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43176018 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 51865748 - 51865973
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
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T |
51865748 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcc |
51865847 |
T |
 |
Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
51865848 |
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51865946 |
T |
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Q |
216 |
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242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
51865947 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
51865973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33840026 - 33839796
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn----caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
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|
T |
33840026 |
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33839927 |
T |
 |
Q |
111 |
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210 |
Q |
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|
T |
33839926 |
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33839828 |
T |
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242 |
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|
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|||| ||||||||||||||| |||||||||| |
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|
T |
33839827 |
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33839796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33193188 - 33192961
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
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T |
33193188 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacctttcatattatatctttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatattt |
33193089 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
33193088 |
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33192990 |
T |
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214 |
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242 |
Q |
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| |||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
33192989 |
acatcatacaatttaggacggagggagta |
33192961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38483559 - 38483329
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
38483559 |
atatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatct |
38483460 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
38483459 |
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38483361 |
T |
 |
Q |
212 |
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243 |
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|
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T |
38483360 |
aaacatcatataatttgggacggaggaagtac |
38483329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 53722211 - 53722441
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
53722211 |
atatatcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatatcttctttcaattatttcatttatct |
53722310 |
T |
 |
Q |
112 |
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210 |
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|
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||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |
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T |
53722311 |
ttcccatgtta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttttcacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaacgccc |
53722409 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53722410 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
53722441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2510252 - 2510023
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
2510252 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatct |
2510153 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
2510152 |
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2510054 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
2510053 |
aaacgtcttacaatttgggacggagagagta |
2510023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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Target Start/End: Original strand, 34663485 - 34663714
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
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|
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|
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T |
34663485 |
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34663584 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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T |
34663585 |
ttcccatatca-tttattgagaataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
34663683 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
34663684 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34663714 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37331415 - 37331186
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
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T |
37331415 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttcaattataacattaactatttattatgatctcttctttcaattctttcatttatct |
37331316 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|
|
T |
37331315 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
37331217 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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| | ||||| ||||||||| ||| |||||| |
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|
T |
37331216 |
agacgtcatacaatttgggatggaaggagta |
37331186 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41751156 - 41751385
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Q |
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111 |
Q |
|
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T |
41751156 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcctttatttatct |
41751255 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
41751256 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggcca |
41751354 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41751355 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41751385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46195854 - 46195625
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
46195854 |
atatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
46195755 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
46195754 |
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46195656 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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|
T |
46195655 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
46195625 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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Target Start/End: Original strand, 46336752 - 46336974
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
46336752 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcttattataacc------atttattactctctcttcttccaattctttcatttatctt |
46336845 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
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T |
46336846 |
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46336944 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
46336945 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46336974 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 30358774 - 30358999
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
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|
T |
30358774 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatctttc |
30358873 |
T |
 |
Q |
115 |
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214 |
Q |
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||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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T |
30358874 |
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30358972 |
T |
 |
Q |
215 |
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241 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||||| |||| |
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|
T |
30358973 |
cgtcatacaatttaggacggagagagt |
30358999 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 30744908 - 30745136
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30744908 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
30745007 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
30745008 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
30745106 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
30745107 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30745136 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43408322 - 43408543
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
43408322 |
atatgttgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
43408421 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
43408422 |
ttcccatatt-atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatt--------tgtgtgaaatgccca |
43408512 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43408513 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43408543 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 47142265 - 47142485
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Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
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|
T |
47142265 |
tttacaataccaatgcaacattaacgttactttttctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
47142364 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
|| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
47142365 |
ta-tttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
47142463 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| | ||||||| |||| |
|
|
T |
47142464 |
acaatttagaacggaggaagta |
47142485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9151410 - 9151183
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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|
T |
9151410 |
atatgtcattttacaatatcaatgcaacatcaatgatacttttactattataatcttagttatttattactctctcttctttcaattctttaatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccat-----attaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
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||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9151310 |
ttctcatggtgtatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaagtgcatttcttaatatgtgtgaaat |
9151212 |
T |
 |
Q |
207 |
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235 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9151211 |
gcccaaaacgtcatataatttgggacgga |
9151183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 23307831 - 23308062
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
23307831 |
atatgttgttttacaatactaatgtaacattaatgttactttttctattataactttaactatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatct |
23307930 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
23307931 |
ttcccatatta-tttattaatcacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgttca |
23308029 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23308030 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtaca |
23308062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 15 - 233
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31786851 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcgttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
31786950 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
31786951 |
tcctatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
31787049 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
31787050 |
aacgtcatacaatttgggacg |
31787070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Original strand, 38096085 - 38096316
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
38096085 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacattttctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
38096185 |
tctcatatca-tttattgatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
38096283 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38096284 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagtacaa |
38096316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4392557 - 4392325
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
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|
|
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|
|
T |
4392557 |
tatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
4392458 |
T |
 |
Q |
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tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat---tccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4392457 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
4392359 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4392358 |
ccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4392325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9508731 - 9508501
Alignment:
Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
9508731 |
atatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
9508632 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc- |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
9508631 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
9508533 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9508532 |
aaaacatcatataatttgggacggagggagta |
9508501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9516706 - 9516476
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9516706 |
atatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
9516607 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc- |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
9516606 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtagaaaaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
9516508 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9516507 |
aaaacatcatataatttgggacggagggagta |
9516476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23513118 - 23512891
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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T |
23513118 |
atatgtcgttttataacacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
23513019 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23513018 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaa--caactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
23512922 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||| || |||||| |
|
|
T |
23512921 |
aaacgtcatacaatttgggactgatggagta |
23512891 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 39259313 - 39259527
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
39259313 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
39259412 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
39259413 |
ttcccaagtta-tttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttatacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
39259511 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |
|
|
T |
39259512 |
aaacgtcatacaattt |
39259527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 31725677 - 31725906
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
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T |
31725677 |
atatttcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcatttatct |
31725776 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
31725777 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtcca |
31725875 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31725876 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
31725906 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 43600923 - 43601116
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
43600923 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttatattataaccttagctatttattactctctattcttttaattctttcatttatct |
43601022 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
43601023 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaatattaattgcattttttaatatatgtgaaat |
43601116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45824112 - 45823884
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
45824112 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
45824014 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45824013 |
ttcccatatca-tttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
45823915 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45823914 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45823884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 8108491 - 8108719
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8108491 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatgttacctttcctattatatccctaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
8108590 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8108591 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
8108689 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8108690 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8108719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19961051 - 19960823
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
19961051 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctt |
19960952 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19960951 |
tctcatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
19960853 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19960852 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19960823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 29343258 - 29343486
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29343258 |
tatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
29343357 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
29343358 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcgcaa |
29343456 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29343457 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29343486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52040475 - 52040240
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
52040475 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaacgatacttttcctattatatccttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctt |
52040376 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
T |
52040375 |
tctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
52040277 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
52040276 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtaccatttt |
52040240 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42939802 - 42939580
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
42939802 |
atatgtcactttacaataccaatgaagcattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatct |
42939703 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
42939702 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgccca |
42939604 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
42939603 |
aaacgtcatacaatttgggacgga |
42939580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24089383 - 24089612
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
24089383 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
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|
T |
24089483 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttttaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatacgtgaaatgccca |
24089581 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
24089582 |
aaacgtcatacaatttaagacggagggagta |
24089612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32100300 - 32100079
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22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
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Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
32100300 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccata |
32100201 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |
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|
T |
32100200 |
tca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatttgtgtgaaatgctcaaaacgtca |
32100102 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32100101 |
tacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41637110 - 41636879
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Q |
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109 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
T |
41637110 |
atatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttttctttcaattccttcatttat |
41637011 |
T |
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Q |
110 |
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209 |
Q |
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41637010 |
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41636912 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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T |
41636911 |
caaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
41636879 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48584110 - 48583881
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
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T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
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211 |
Q |
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T |
48584010 |
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48583912 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
48583911 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
48583881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3645932 - 3645702
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
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atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccatcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
3645832 |
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3645734 |
T |
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Q |
212 |
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243 |
Q |
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T |
3645733 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagtac |
3645702 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48574865 - 48574639
Alignment:
Q |
18 |
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115 |
Q |
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T |
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gtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatattattttttctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcc |
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T |
 |
Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
48574765 |
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48574667 |
T |
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Q |
216 |
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243 |
Q |
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T |
48574666 |
atcatacaatttgagacggagggagtac |
48574639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 52262287 - 52262508
Alignment:
Q |
22 |
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119 |
Q |
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T |
52262287 |
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52262386 |
T |
 |
Q |
120 |
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218 |
Q |
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T |
52262387 |
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52262484 |
T |
 |
Q |
219 |
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242 |
Q |
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T |
52262485 |
atacaatttgggacggagggagta |
52262508 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 19602234 - 19602455
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
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T |
19602234 |
ctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttattttttccata |
19602333 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
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T |
19602334 |
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19602432 |
T |
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Q |
220 |
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242 |
Q |
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T |
19602433 |
tacaatttgggacggatggagta |
19602455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20394214 - 20393989
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
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T |
20394214 |
gtcgctttacaataccgatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttccctacttccaagttattcatttatctttct |
20394115 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
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T |
20394114 |
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20394016 |
T |
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Q |
216 |
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242 |
Q |
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T |
20394015 |
atcatacaatttgggacggagggagta |
20393989 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 23782128 - 23782349
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
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T |
23782128 |
ctttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttctcata |
23782227 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
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T |
23782228 |
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23782326 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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|
|| ||||||||||||| |||||| |
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|
T |
23782327 |
tacaatttgggacggatggagta |
23782349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35084564 - 35084335
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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T |
35084564 |
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35084465 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
35084464 |
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35084366 |
T |
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Q |
212 |
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242 |
Q |
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||| || || |||||| ||||||||||||| |
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T |
35084365 |
aaacgtcttacaatttgagacggagggagta |
35084335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42662684 - 42662455
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
42662684 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctt |
42662585 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
42662584 |
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42662486 |
T |
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Q |
213 |
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243 |
Q |
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T |
42662485 |
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42662455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43599625 - 43599853
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|
T |
43599625 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tattacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
43599723 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
43599724 |
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43599822 |
T |
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Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
43599823 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43599853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54747934 - 54747708
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
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T |
54747934 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaattgtttattgctatcttctttcaattccttcatttatcttt |
54747835 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
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T |
54747834 |
ctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgctcaaa |
54747736 |
T |
 |
Q |
214 |
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241 |
Q |
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|
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|
T |
54747735 |
atatcatacaatttgagacggatggagt |
54747708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18019675 - 18019456
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
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|
T |
18019675 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaaaattaattttacttttcctattacaaccttaaccatttattactct-------ctattttttcatttatctttc |
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T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
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T |
18019582 |
ccatatta-tttattaaggacaattttgttaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttttcaatatgtgtaaaatgcccaaag |
18019484 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
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T |
18019483 |
cgtcgtacaatttggtacggaggaagta |
18019456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25904134 - 25903906
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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T |
25904134 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcttgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
25904034 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttataatatgtgtgaaatgctcaa |
25903936 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
25903935 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25903906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29652048 - 29652282
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Q |
14 |
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105 |
Q |
|
|
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|
T |
29652048 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattactattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcat |
29652147 |
T |
 |
Q |
106 |
ttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
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|
|
T |
29652148 |
ttatctttcacatatca-tttattaaggacaatttg-taaaacaactcataatatttcttttccgtacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaa |
29652245 |
T |
 |
Q |
206 |
tgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
29652246 |
tgcccaaaacatcatacaatttgggacggagagagta |
29652282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54241051 - 54240823
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
54241051 |
tatgtcgttttacaataccgatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttatcaccctctattctttcaattacttcatttatctt |
54240952 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54240951 |
tctcatatca-tttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
54240853 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54240852 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
54240823 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27848911 - 27848688
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27848911 |
tatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
27848812 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
27848811 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
27848713 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
27848712 |
aacgtcatacaatttaagacggagg |
27848688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 45218772 - 45218970
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45218772 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatcttt |
45218871 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
45218872 |
-ccata-tcatttattgatgacaattttgtaaaacaacttataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaa |
45218969 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52679813 - 52679587
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52679813 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactcttttttctttcaattctttcatttatctt |
52679714 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
52679713 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatataatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgctcaa |
52679615 |
T |
 |
Q |
213 |
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240 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
52679614 |
aacgtcatacaatttgaaacggagggag |
52679587 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 54677669 - 54677891
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
54677669 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatct |
54677768 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
T |
54677769 |
ttcccatatca-tttattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttccctacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgctca |
54677867 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
54677868 |
aaacgtcatacaatttgggacgga |
54677891 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28686381 - 28686160
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28686381 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttaaattctttcatttatctttcccata |
28686282 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
28686281 |
tca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcaaacaaaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
28686183 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
28686182 |
tacaatttgggacggagagagta |
28686160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29227396 - 29227183
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29227396 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacataaatgttactttttctattatatccttaattatttattactctttcttatttcaattctttcatttatctt |
29227297 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
29227296 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
29227198 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |
|
|
T |
29227197 |
aacgtcatacaattt |
29227183 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Original strand, 35846951 - 35847093
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
35846951 |
aattctttcatttatctttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaa |
35847049 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggg |
238 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35847050 |
tatatgtgaaatgcccaaaacgccatagaatttgggacggaggg |
35847093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41935963 - 41936192
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || ||||||||||| |
|
|
T |
41935963 |
atatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttaattttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatct |
41936062 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
41936063 |
tttccatat-aatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatgcgtgtgaaataccca |
41936161 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41936162 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41936192 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 44048154 - 44048383
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaaca-ttaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44048154 |
tatgtcgctttacaatactaatgaaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
44048253 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
44048254 |
ttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
44048352 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
44048353 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagta |
44048383 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 47241225 - 47241446
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
47241225 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcata |
47241324 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
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|
T |
47241325 |
tca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtca |
47241423 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
47241424 |
tacaatttaggacggagggagta |
47241446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54080329 - 54080108
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Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
54080329 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttctcata |
54080230 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
54080229 |
tca-tttattagagataattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatgcccaaaacgtca |
54080131 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54080130 |
tacaatttgggacggagggagta |
54080108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 240699 - 240471
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
240699 |
tatgtcactttacaatactaatgaaacattaatatcattttttctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaagtcttttatttatctt |
240600 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
T |
240599 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatatcttttccatacaatattaattatattttttaatatctgtgacatgtccaa |
240501 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
240500 |
aatgtcatataatttgggacggagggagta |
240471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2929915 - 2929691
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2929915 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
2929816 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2929815 |
tctcatat-aatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctctttcccacacaatataaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
2929717 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggg |
238 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| | |||||||| |
|
|
T |
2929716 |
aacgtcatacaatttagaacggaggg |
2929691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8096831 - 8096611
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8096831 |
atatgtcgttttacaatagcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttc-------ttctttcatttatcttt |
8096739 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
8096738 |
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8096640 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
8096639 |
atgtcatacaatttagaacggagggagta |
8096611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21216892 - 21216664
Alignment:
Q |
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112 |
Q |
|
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|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
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T |
21216892 |
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21216793 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
21216792 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
21216694 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
21216693 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
21216664 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 36669204 - 36669432
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
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|
T |
36669204 |
tatgttgctttacaatatcaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
36669303 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
36669304 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
36669402 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| || || ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
36669403 |
aacgtcgtacaatttaggacggaggaagta |
36669432 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49384471 - 49384251
Alignment:
Q |
23 |
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120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
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|
T |
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tttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctgctttcaattccttcatttatctttctcatat |
49384372 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |
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T |
49384371 |
ca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttgttaatatgtgtgaaatggctaaaacgtcat |
49384273 |
T |
 |
Q |
221 |
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242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49384272 |
acaatttgggacggagggagta |
49384251 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34817131 - 34816896
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
34817131 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttgtcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
34817032 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
34817031 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
34816933 |
T |
 |
Q |
212 |
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248 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
34816932 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtataattt |
34816896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6466478 - 6466331
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
6466478 |
caattctttcatttatcttttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattatatttctta |
6466380 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6466379 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6466331 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29674914 - 29675147
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29674914 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
29675013 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
29675014 |
tttccatacca-tttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
29675112 |
T |
 |
Q |
212 |
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246 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29675113 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtacaat |
29675147 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 38550929 - 38551130
Alignment:
Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
38550929 |
atatgtcgctttataataccaatgcaatattaatgttatttttcctattataaccttaactgtttattactctctcttctttcaattttttcatttattt |
38551028 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
38551029 |
ttcccatat-aatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaatattaattgcatttcttaatacgtatgaaatgccca |
38551127 |
T |
 |
Q |
212 |
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214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
38551128 |
aaa |
38551130 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41979930 - 41980158
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
41979930 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttatttttcctatcatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattcattcatttatct |
41980028 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
41980029 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctca |
41980127 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
41980128 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
41980158 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43185399 - 43185628
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
43185399 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactcccaattctttcaattatttcatttatct |
43185498 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
43185499 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
43185597 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43185598 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43185628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47109289 - 47109060
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
47109289 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
47109190 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
47109189 |
ttctcatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
47109091 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
47109090 |
aaacgtcatacaatttgggacggatggagta |
47109060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52870664 - 52870435
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
52870664 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattcttaattactccctattctttcaattatttcatttatct |
52870565 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
52870564 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
52870466 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52870465 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
52870435 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8333668 - 8333460
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
8333668 |
atatgttgttttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatttattt |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | || |
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|
T |
8333568 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactgataatatctcttttccacacaatatcaattgcatgtcttaatatgtgtgaaatcctca |
8333470 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcata |
221 |
Q |
|
|
||| |||||| |
|
|
T |
8333469 |
aaacatcata |
8333460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
28227027 |
tatgtcactttaggataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
28227126 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
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T |
28227127 |
tcacatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtctgaaatgcccaa |
28227225 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| | |||||| ||||| |
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|
T |
28227226 |
aacgtcatacaatttagtacggagtgagta |
28227255 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
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Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 40643372 - 40643600
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40643372 |
tatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattttttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
40643472 |
tccgatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatctttcatacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
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T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
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T |
40643571 |
aacgtcatacaatttgggacagagggagta |
40643600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43190715 - 43190481
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||| | ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
43190715 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcattaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctt |
43190616 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
43190615 |
tccgatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccattttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
43190517 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43190516 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagtacaattt |
43190481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45674264 - 45674117
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
45674264 |
caattcctttatttatctttctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacatttctta |
45674166 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45674165 |
atatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45674117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 22926095 - 22926320
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
22926095 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttc |
22926194 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
22926195 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgccaaaac |
22926293 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22926294 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
22926320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29517440 - 29517239
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29517440 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
29517341 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
29517340 |
ttcccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccgcacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
29517242 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
29517241 |
aaa |
29517239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 38999500 - 38999725
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
38999500 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctt |
38999599 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
38999600 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
38999698 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38999699 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
38999725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47498131 - 47497902
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
47498131 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
47498032 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
47498031 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacagctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
47497933 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
47497932 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
47497902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 50622728 - 50622499
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |
|
|
T |
50622728 |
atatgtcgttttacgataccaatgaaaaaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttctttatttatct |
50622629 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
50622628 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcgacataatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgttca |
50622530 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
50622529 |
aaacatcgtacaatttaggacggagggagta |
50622499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31289301 - 31289081
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
31289301 |
tttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatat |
31289202 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| || | |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
31289201 |
ca-tttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctcttttccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcat |
31289103 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
31289102 |
acaatttaggacggagggagta |
31289081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 32078074 - 32078306
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
32078074 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattactctatcttatttcaattctttaatttatct |
32078173 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
32078174 |
ttctcatac-aatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaattatattttttaatatgtgtgaaatgtcta |
32078272 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
32078273 |
aaacgtcatacaatttgagacggagggagtacaa |
32078306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 52915079 - 52915307
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
52915079 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
52915178 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
52915179 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacaaaatattaattacatttcttaatatggattaaatgcccaa |
52915277 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
52915278 |
aacgtcatacaatttaagacgaagggagta |
52915307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54103974 - 54103757
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
54103974 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
54103875 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
54103874 |
tttcata------------ggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgttcaa |
54103787 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
54103786 |
aacgtcatacaatttgggacggatggagta |
54103757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 390754 - 390525
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaatacc-aatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||||| |
|
|
T |
390754 |
tatgtcgctttacaatacccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctactttcaagtcattcatttatct |
390655 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
390654 |
ttcacatatca-tttattaaagacaattttataaaacaactcataatatctcttctccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
390556 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
390555 |
aaacgttatataatttgggacggaaggagta |
390525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3671606 - 3671377
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
3671606 |
tatgtcacgttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatatcattatgtatttattactctttattccttcaattctttcatttatatt |
3671507 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||| | | || |||||| |||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
3671506 |
tcctatatca-tttagtaaagataattttgtaaaactacttgtaatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
3671408 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataa-tttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
3671407 |
aacatcatacaattttgggacggagggagta |
3671377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41265566 - 41265795
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
41265566 |
atatgttgttttacaataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatct |
41265665 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
41265666 |
tttccatac-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
41265764 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41265765 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41265795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46741171 - 46740943
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
46741171 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
46741072 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
46741071 |
ttcccatacca-tttattaacgataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatggcca |
46740973 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
46740972 |
aaatatcatacaa-ttgggacggagggagta |
46740943 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
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Target Start/End: Complemental strand, 27942152 - 27942030
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Q |
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ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
27942152 |
ttaaattattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttttttcccaaacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatgtca |
27942053 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27942052 |
tacaatttgggacggagggagta |
27942030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 24978885 - 24979117
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Q |
15 |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24978885 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctt |
24978984 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| || | |||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
24978985 |
tcctatatca-tttattaagaataattttgtagaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattatatttcttaatatttgtgaaatacccaa |
24979083 |
T |
 |
Q |
213 |
a----atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24979084 |
aatagatatcgtacaatttgggacggagggagta |
24979117 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27039107 - 27038890
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
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tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
27039008 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
27039007 |
tctcata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaaaatgtgtgaaatgtccaa |
27038920 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
27038919 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagta |
27038890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40164187 - 40164041
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Q |
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193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
40164187 |
caattctttcatttatcttttccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattacatttctta |
40164089 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
40164088 |
atatgtgtgaaatggcaaaaacatcatacaattt-ggacgaagggagta |
40164041 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32758523 - 32758752
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
T |
32758523 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttattctttcaattcatttatttatct |
32758622 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
32758623 |
ttctaatatca-tttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaataagtgtgaaatatcca |
32758721 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| | ||||| |||| |
|
|
T |
32758722 |
aaatatcataaaatttggaagggaggtagta |
32758752 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 43109651 - 43109876
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Q |
18 |
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115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
43109651 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactcttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaattatttcatttatcttttc |
43109750 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
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|
T |
43109751 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
43109849 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
43109850 |
gtcatacaatttaggacggaaggagta |
43109876 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48962795 - 48962566
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
48962795 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
48962696 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
48962695 |
tttccatac-aatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcca |
48962597 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| | ||| ||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
48962596 |
aaacgtaatacaatttggaacggaaggagta |
48962566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5137697 - 5137529
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5137697 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
5137598 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
T |
5137597 |
tcccatatt-atttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaat |
5137529 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 31170440 - 31170668
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||| || ||||||||| || |
|
|
T |
31170440 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcattatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatttt |
31170539 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| | || |
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|
T |
31170540 |
tctcatatt-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaaaattaagtatatttcttaatacgtgttaaatgtctaa |
31170638 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
31170639 |
aacgtcatataatttgggacgaaggaagta |
31170668 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21815905 - 21815784
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Q |
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taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21815905 |
taatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgccaaaaatatcat |
21815806 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
21815805 |
acaatttaggatggagggagta |
21815784 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
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Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45347222 - 45347003
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45347222 |
gtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttagttttcctattatctccttaactatttattactctatcttttttcaattctttcatttatctttct |
45347123 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
45347122 |
catatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcgtaatatctctttaccacataatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgttcaaaac |
45347024 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
45347023 |
gtcatacaatttaggacggag |
45347003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 49384534 - 49384650
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
49384534 |
atttattaagaacaattttataaaacaactcataatatctattttcaatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatat |
49384633 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||| |
|
|
T |
49384634 |
aatctgggacggaggga |
49384650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
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Q |
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attaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaatt |
139 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| || |||||| |
|
|
T |
9783238 |
attaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcctttatcttttccatatca-tttattgagaacaatt |
9783140 |
T |
 |
Q |
140 |
ttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||| |||||| |
|
|
T |
9783139 |
ttgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaatattagttacatttcttaatatgtgtgaaatacccaagacgtcatacaatttgagacagaggga |
9783040 |
T |
 |
Q |
240 |
gta |
242 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
9783039 |
gta |
9783037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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14 |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
12569347 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
12569446 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
12569447 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatataaattacattttttaatac-tgtgaaatgacca |
12569544 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12569545 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12569575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13545811 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
13545910 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
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Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
13545911 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatataaattacattttttaatac-tgtgaaatgacca |
13546008 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13546009 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13546039 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15999045 - 15998845
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Q |
14 |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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|
T |
15999045 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgctacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatct |
15998947 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |
|
|
T |
15998946 |
ttctcatatca-tttattgagtacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcctaatatatgtgaaatgctca |
15998848 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
15998847 |
aaa |
15998845 |
T |
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Target: chr3; HSP #142
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Target Start/End: Original strand, 42490461 - 42490580
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222 |
Q |
|
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||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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T |
42490461 |
atttattaaggataattttgtaaaacgactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
42490560 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
42490561 |
aatttgggacggaggaagta |
42490580 |
T |
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Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
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Target Start/End: Complemental strand, 49610173 - 49609944
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
49610173 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatct |
49610074 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
49610073 |
ttttcatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
49609975 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49609974 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
49609944 |
T |
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Target: chr3; HSP #144
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Target Start/End: Original strand, 3835381 - 3835499
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Q |
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tttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatata |
223 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |
|
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T |
3835381 |
tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccaaaaacgtcataca |
3835480 |
T |
 |
Q |
224 |
atttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
T |
3835481 |
atttaggacggagggagta |
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T |
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Target: chr3; HSP #145
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Target Start/End: Complemental strand, 7674044 - 7673903
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Q |
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ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |
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|
T |
7674044 |
ttcatttatctttctcatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtg |
7673946 |
T |
 |
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
7673945 |
tgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgagacggagggagtac |
7673903 |
T |
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Target: chr3; HSP #146
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Target Start/End: Original strand, 8104286 - 8104454
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Q |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8104286 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
8104385 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
T |
8104386 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaat |
8104454 |
T |
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Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16661495 - 16661267
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |
|
|
T |
16661495 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacatttattttactttttctattatatctttaactatttattaccttttcttcttttaattctttcatttatttt |
16661396 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
T |
16661395 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatcttttttccacacaatattaattacatttcttaatacgtttgaaatatccaa |
16661297 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16661296 |
aacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
16661267 |
T |
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Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48910565 - 48910363
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn----caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
48910565 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaactatttattactctttcttttttttcaattatttcatttatc |
48910466 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
48910465 |
tttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaccaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctc |
48910367 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaa |
214 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
48910366 |
aaaa |
48910363 |
T |
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Target: chr3; HSP #149
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193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
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caattctttcatttatttttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttctta |
1540885 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
1540886 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttggga |
1540923 |
T |
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Target: chr3; HSP #150
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Target Start/End: Original strand, 23656314 - 23656513
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Q |
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139 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |||| |
|
|
T |
23656314 |
attaatgttacttttcctattataaccataattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatatta-tttattaaagataatt |
23656412 |
T |
 |
Q |
140 |
ttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
23656413 |
ttgtaagacaactcataatatctcttttccacacattattaattgtattttttaatatgtatgaaatatttaaaatgtcatacaatttggaacggaagga |
23656512 |
T |
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Target: chr3; HSP #151
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Target Start/End: Original strand, 14781030 - 14781177
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14781030 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttctta |
14781128 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14781129 |
atatgtgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14781177 |
T |
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Target: chr3; HSP #152
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Target Start/End: Original strand, 23782352 - 23782468
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
T |
23782352 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttccaacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccgaaaacgttatac |
23782451 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
23782452 |
aatttgggacggaggga |
23782468 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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Q |
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Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
52804911 |
atatgtcgctttataataccaatgaaatatcgatgttatttttcctattatatccttaactatttattattttctcttctttcaattccttcatttattt |
52804812 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttc-cgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
52804811 |
ttcccatat-aatttattaaggacaattttgtaaaataattcataata-tctttttcaaacacaatattaattacatatcttaatatgtgtgaaatgtcc |
52804714 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
52804713 |
aaaacgtcttacaatttaggatggagggagta |
52804682 |
T |
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Target: chr3; HSP #154
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8724334 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
8724433 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
8724434 |
tttccatacca-tttattagggataattttataaaataactcataatttatcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
8724532 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8724533 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
8724563 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #155
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
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atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
9076321 |
tttccatacca-tttattagggataattttataaaataactcataatttatcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
9076419 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9076420 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
9076450 |
T |
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Target: chr3; HSP #156
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31171616 |
atatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
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T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
31171516 |
tttccatacta-tttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgcca |
31171418 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31171417 |
aaacgtcttacaatttggaacggagggagta |
31171387 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32852190 - 32851964
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc----nnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
32852190 |
gtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatgcccttaactatttattactctattttttttttcaattatttaatttatcttt |
32852091 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
32852090 |
ctcata-ccatttattgaggacaattttgtaaaacaactc-ccatatctttttcccaaacaaaattagttacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaa |
32851993 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
32851992 |
acatcatataatttgggacggatggagta |
32851964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39144633 - 39144404
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
39144633 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctcttatttcaattctttaatttatct |
39144534 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
39144533 |
ttctcata-tcacttatcaaggacaattttgtaaaacaactctaaatatctctttctcatacaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaatgccca |
39144435 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| || ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
39144434 |
aaacctcatacaagttggggcggagggagta |
39144404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49780453 - 49780224
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
49780453 |
atatgccgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttaattttcctattatattcttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
49780354 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| | ||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |
|
|
T |
49780353 |
tttctatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatagcta |
49780255 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49780254 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49780224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40500989 - 40500838
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatatta---atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttc |
190 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| |
|
|
T |
40500989 |
caattttttcatttatctttctcatattattaatttattaaggagaattttgaaaaacaactcataatatctctttttcagataatattaattacatttc |
40500890 |
T |
 |
Q |
191 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40500889 |
ttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcgtacagtttaagacggagggagta |
40500838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48897185 - 48897037
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctt |
192 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
48897185 |
caattctttcatttatctttctcatatca-tttattaaggacaatttcgtaaaaacaactcataatatctatttctcacacaatattaattacatttctt |
48897087 |
T |
 |
Q |
193 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48897086 |
aatatgtataaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
48897037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51380173 - 51380026
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
51380173 |
caattatttcatttatctttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttctta |
51380075 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
51380074 |
atacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacattttggaacggagggagta |
51380026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 38808142 - 38808371
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38808142 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaatcactctctcttctttcaattatttcatttatct |
38808241 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
38808242 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaataactaataatttttcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
38808340 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| ||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
38808341 |
aaacgtcatgcaatttggaacggaaggagta |
38808371 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 9795290 - 9795437
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
9795290 |
caattatttcatttatcttttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacataatattaattacatttctta |
9795388 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9795389 |
atacgtgtgaaattgccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
9795437 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 49102488 - 49102717
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
49102488 |
atatatcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttttttcaattatttcatttatct |
49102587 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | || ||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |
|
|
T |
49102588 |
ttttcatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacataatattaattacatttcttaataggtatgaaatggtca |
49102686 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49102687 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49102717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 3835305 - 3835375
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3835305 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
3835375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3429068 - 3428854
Alignment:
Q |
17 |
tgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
3429068 |
tgtcgttttacaataccaatgaagtattaatgttatttttcttattatatcctaa-ttatttattactctctcttctttcaattctttaatttatcattt |
3428970 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3428969 |
tcatacca-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcatgcaaaattaattaaatttattaatacgtgtgaaatgcccaaaa |
3428871 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
3428870 |
tatcatataatttggga |
3428854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50106104 - 50106015
Alignment:
Q |
143 |
taaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
50106104 |
taaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaataagtgtaaaatgtctaaaacgtcatacaatttgggac |
50106015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27942241 - 27942170
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
27942241 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcatattatatccttaactatttattactc |
27942170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 39290591 - 39290662
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
39290591 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttctcattatatccttaactatttattactc |
39290662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47916048 - 47915855
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
47916048 |
atatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattatttaatttatct |
47915949 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
47915948 |
ttctcata-caatttattaaggataattttataaaacaactaataatatatatttttcacacaaaattaattatatttctcaatatatgtgaaat |
47915855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14343906 - 14343773
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
14343906 |
caattctttaatttatccttctcatat-aatttattaaggacaatattgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaattaattacatttctta |
14343808 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
||| ||| ||||| | |||| ||| ||||||||| |
|
|
T |
14343807 |
atacatgtaaaatgactaaaacatcgtataatttg |
14343773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42490097 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
44976365 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattacattctcttctttcaattatttcatttatcttttccata- |
44976463 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataat |
158 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
44976464 |
ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataat |
44976501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
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Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 49384142 - 49384212
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
49384142 |
atatgtcgctttacaataccaatacaatattaatgttatttttcctattataactttaactttttattact |
49384212 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
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Q |
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ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatatt |
121 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
50106272 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattttatccttaactatttatcactctcttctttcaattctttaatttatctttcccata-c |
50106174 |
T |
 |
Q |
122 |
aatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
50106173 |
catttattaaggataattttgtaaaacaattcataatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
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Q |
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85 |
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|
|
T |
4756364 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 49615375 - 49615571
Alignment:
Q |
34 |
aatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttagg |
133 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| | |||||| ||| |
|
|
T |
49615375 |
aatgaaacattaatgttacttt-cctattatatccttaactatttattactctatttttttaactctttcttttatctttctcgtatca-tttattaagg |
49615472 |
T |
 |
Q |
134 |
acaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||||||||| | || | | ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
49615473 |
ataatttctcaaaacaactcataatat-ctttcttcacacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatctccaaaatgtcatataatttgagacg |
49615571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 23781960 - 23782030
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
23781960 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaattttatttttcctattatatctttaactatttattactc |
23782030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4493418 - 4493365
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
4493418 |
gtcgctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattataccctta |
4493365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 9794527 - 9794584
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
71 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
9794527 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctta |
9794584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40164249 - 40164201
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta |
63 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40164249 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
40164201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 47895597 - 47895697
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgca--caatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
47895597 |
aggacaattttgtaaagcaactcataatata--ttttcctcatacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcacaaaacgtcatacaatttg |
47895694 |
T |
 |
Q |
229 |
gga |
231 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
47895695 |
gga |
47895697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3442736 - 3442665
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
3442736 |
atttattaaggaccattttataaaacaacacataatatatttttcccacacaatattaataacatttcttaa |
3442665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4255360 - 4255306
Alignment:
Q |
188 |
ttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
4255360 |
ttcttaatttgtgtgaaatgatcaaaatgtcatataatttgggatggagggagta |
4255306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35958053 - 35957933
Alignment:
Q |
41 |
cattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaat |
138 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |
|
|
T |
35958053 |
cattaatgctacttttcctattatacccttaactatttattactttctcttttttcaattttttattttatctttctcatatca-tttattaaggacaat |
35957955 |
T |
 |
Q |
139 |
tttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
35957954 |
tttgtaaaacaactcataatat |
35957933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45207641 - 45207584
Alignment:
Q |
101 |
ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataata |
159 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
45207641 |
ttcatttatttttcccatatta-tttattaaagacaattttgtaaaacaactcataata |
45207584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30767834 - 30767702
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
T |
30767834 |
caattctttcatttatctttctcata-tcatttattaaagacaattttgtaaaattactcataatatctctttcctacacaaaattaattacatttttta |
30767736 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
|| || || ||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
30767735 |
ttacgtttggaatacctaaaacatcatataattt |
30767702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Original strand, 42938100 - 42938232
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||| |||| ||| |
|
|
T |
42938100 |
caattctttcatttacttttcacatatca-tttattaaggataattttataaaacaactcataacatctatttctcacacacgattaattatatttttta |
42938198 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
42938199 |
atacgtgtgaaatgctcaaaacatcatatcattt |
42938232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Original strand, 47895187 - 47895256
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
47895187 |
tatgtcgttttacaatatcaatgaataattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
47895256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49903593 - 49903536
Alignment:
Q |
185 |
catttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
49903593 |
cattttttaatacgtgtgaaatgcccaaaatattgtataatttgggacagagagagta |
49903536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4276972 - 4276928
Alignment:
Q |
191 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4276972 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
4276928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 27834374 - 27834496
Alignment:
Q |
39 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggaca |
136 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||| | |||| | |
|
|
T |
27834374 |
aacattaatgttatttttcctatcatatccttaattatttattactctctcttcttttaattctttcatttatctatcacata-tcatttagtaaggata |
27834472 |
T |
 |
Q |
137 |
attttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
27834473 |
attttgtaaaacaactcataatat |
27834496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7554567 - 7554484
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
7554567 |
atttattaaggataattatgtaaaacaactcataatatatcttttccatacaaaattaattacatctcttaatatttgtgaaat |
7554484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21817569 - 21817498
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
21817569 |
atatgtcgttttaccataccaatgaaacattaatgttatttttcccgttatattcttaactatttattactc |
21817498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26367320 - 26367255
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttat-aaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
26367320 |
aattccttcatttatctttcccata-taatttattaagaacaatttggtaaaaacaactcataatat |
26367255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 161
Target Start/End: Original strand, 30696518 - 30696556
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatatt |
161 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30696518 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatt |
30696556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5136969 - 5136909
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
5136969 |
atttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcata-aatttaggacagagggagtaaaatt |
5136909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Original strand, 27549896 - 27550005
Alignment:
Q |
133 |
gacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || || |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |
|
|
T |
27549896 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctatttttcacataaaattaattatattttttaatacatgtgaaatacccaaaatttcatacaatttaagac |
27549995 |
T |
 |
Q |
233 |
ggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |
|
|
T |
27549996 |
ggagagagta |
27550005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30744074 - 30744014
Alignment:
Q |
25 |
tacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
30744074 |
tacaatatcaatgaaatattaattttacttttcttattatactcttagctatttattactc |
30744014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Original strand, 34344491 - 34344546
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaa |
150 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
34344491 |
caattctttaatttatctttctcatacta-tttattaaagacaattttataaaacaa |
34344546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 184)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 39938652 - 39938867
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
39938652 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactct-------ctcttctttcatttatcttt |
39938744 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
39938745 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaa |
39938843 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
39938844 |
atgtcatacaatttgggacggagg |
39938867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 22369559 - 22369794
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22369559 |
atatgtcgctttacaataccaatggaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattctttcatttatct |
22369658 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
22369659 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataaaatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgccta |
22369757 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22369758 |
aaacgtcatataatttggaacggagggagtacaattt |
22369794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22326752 - 22326523
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
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|
T |
22326752 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttttttcaattctttcatttattt |
22326653 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
22326652 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
22326554 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
22326553 |
aaacgccatacaatttgggacggtgggagta |
22326523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26838199 - 26837970
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
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T |
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atatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactatcacttctttcaattctttcatttatct |
26838100 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
26838099 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttataaaacaactcataatacctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
26838001 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26838000 |
aaacgtcatccaatttgggacggagggagta |
26837970 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39983488 - 39983259
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
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|
T |
39983488 |
atatgtcgctttaaaatactaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattctttcatttatat |
39983389 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
39983388 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccta |
39983290 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
39983289 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
39983259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 18975994 - 18976222
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
T |
18975994 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcgttcaattctttcatttatct |
18976093 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
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T |
18976094 |
ttctcatatta--ttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatatcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgagtgaaatgtcca |
18976191 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
18976192 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18976222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 31502863 - 31503092
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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|
T |
31502863 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttaatttatct |
31502962 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
31502963 |
ttcccatgtta-tttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
31503061 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
31503062 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
31503092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32328068 - 32327835
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |
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|
T |
32328068 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatatttttcctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaattctttcatttattt |
32327969 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
32327968 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
32327870 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaat |
246 |
Q |
|
|
||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |
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T |
32327869 |
aaacatcatacaatctgggacggagggagtacaat |
32327835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43073957 - 43073737
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| |
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|
T |
43073957 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaccct-------ctcttctttcatttatcttt |
43073865 |
T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
|
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| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |
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T |
43073864 |
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43073766 |
T |
 |
Q |
214 |
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242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43073765 |
acgtcatataatttgggacggagggagta |
43073737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32267746 - 32267527
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
T |
32267746 |
tttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattctttcatttatctttctcatat |
32267647 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
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|
T |
32267646 |
ta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatg-ccaaaacgtcat |
32267549 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32267548 |
acaatttgggacggagggagta |
32267527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 2887308 - 2887537
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
2887308 |
atatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattgatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
2887407 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
T |
2887408 |
ttcccgtatta-tttattaaggacaaatttgtaaaacgacttataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccca |
2887506 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2887507 |
aaatgtcatacaatttgggacggagggagta |
2887537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24302817 - 24302588
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
24302817 |
atatgtcgctttacaatacccatgcaacgttaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactcactcttctttcaattctttcatttatct |
24302718 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
24302717 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatatcca |
24302619 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
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T |
24302618 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
24302588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28586990 - 28587218
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
28586990 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctat-ataactttaactatttattattctcttttctttcaattctttcatttatct |
28587088 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28587089 |
ttctcatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
28587187 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28587188 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
28587218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29410312 - 29410083
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
29410312 |
atatgtcattttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatct |
29410213 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
29410212 |
tacccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccaa |
29410114 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29410113 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
29410083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 41877755 - 41877984
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
41877755 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatct |
41877854 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
T |
41877855 |
tttccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaaatgcatttcttaatatgcgtgaaatgccca |
41877953 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41877954 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41877984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42912436 - 42912208
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |
|
|
T |
42912436 |
tatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaattcttccatttatttt |
42912337 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42912336 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
42912238 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42912237 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42912208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 44186938 - 44187166
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
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44187166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2849997 - 2849763
Alignment:
Q |
14 |
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113 |
Q |
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T |
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T |
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2849763 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 46774165 - 46774393
Alignment:
Q |
15 |
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112 |
Q |
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T |
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242 |
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|| ||||| |||||||||||||||||||| |
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T |
46774364 |
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46774393 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16875889 - 16875659
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
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16875790 |
T |
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Q |
112 |
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T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
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16875659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 29409385 - 29409606
Alignment:
Q |
18 |
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115 |
Q |
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29409385 |
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29409484 |
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Q |
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T |
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29409583 |
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29409606 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 3945186 - 3945415
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Q |
14 |
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111 |
Q |
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T |
3945186 |
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3945285 |
T |
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Q |
112 |
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Q |
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T |
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3945384 |
T |
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Q |
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242 |
Q |
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T |
3945385 |
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3945415 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 37115787 - 37116016
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
37115787 |
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37115886 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
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T |
37115887 |
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242 |
Q |
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T |
37115986 |
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37116016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29155719 - 29155491
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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T |
29155719 |
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29155620 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
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T |
29155619 |
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29155521 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
29155520 |
aatatcatacaatttagaacggatggagta |
29155491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 38589481 - 38589713
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
38589481 |
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38589580 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
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T |
38589581 |
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Q |
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|| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
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T |
38589680 |
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38589713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43468499 - 43468271
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
43468499 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
43468400 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|
T |
43468399 |
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43468301 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
43468300 |
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43468271 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 44481042 - 44481270
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
44481042 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
44481141 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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T |
44481142 |
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44481240 |
T |
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Q |
213 |
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242 |
Q |
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T |
44481241 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44481270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47988430 - 47988206
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
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atatgtcactttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataactttaattaattattactccctcttctttcaattctttcatttatct |
47988331 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
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T |
47988330 |
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47988232 |
T |
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Q |
212 |
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237 |
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T |
47988231 |
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47988206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 25428235 - 25428464
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn---caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|
T |
25428235 |
tatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttttcaattctttcatttatct |
25428334 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
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T |
25428335 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtacaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
25428433 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
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T |
25428434 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25428464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41887797 - 41887570
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
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T |
41887797 |
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41887698 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
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T |
41887697 |
cccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaatttataatatctcttttccacacaatattaattacattttttaaaatgtgtgaaatgttcaaa |
41887599 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||||||||| ||||||||||||| |
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T |
41887598 |
acgtcatataatttgagacggagggagta |
41887570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 46578669 - 46578897
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
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Q |
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T |
46578669 |
atatgtcgcattacaatactcatgcaacattaatgttactttttcaattataaccttaattaattattactccttcttctttcaattctttcatttatct |
46578768 |
T |
 |
Q |
112 |
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211 |
Q |
|
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T |
46578769 |
ttcccatat--atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaataccca |
46578866 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
46578867 |
aaacgtcatacaatttgggacggagtgagta |
46578897 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39403925 - 39403697
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
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|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
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T |
39403925 |
tatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
39403826 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|
|
T |
39403825 |
tctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcgcacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
39403727 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| |||||||| |
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T |
39403726 |
aacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
39403697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42584559 - 42584330
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
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T |
42584559 |
atatgtcgcttaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatct |
42584460 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|
T |
42584459 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
42584361 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||| ||||||| |||||| |
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T |
42584360 |
aaacgtcgtacaattttggacggatggagta |
42584330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 3225491 - 3225719
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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|
T |
3225491 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatatattactcttttttctttcaattccttcatttatctt |
3225590 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
3225591 |
tctcatgtca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
3225689 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3225690 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
3225719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33938440 - 33938212
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
T |
33938440 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctt |
33938341 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
33938340 |
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33938242 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| |||||||||||| |
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|
T |
33938241 |
aacatcatataatttggaacggagggagta |
33938212 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 37411127 - 37411359
Alignment:
Q |
15 |
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108 |
Q |
|
|
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|
T |
37411127 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcattcattta |
37411226 |
T |
 |
Q |
109 |
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208 |
Q |
|
|
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|
T |
37411227 |
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37411325 |
T |
 |
Q |
209 |
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242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
37411326 |
ccaaaacgtcatacaatttaggacagagggagta |
37411359 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 38074557 - 38074785
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
38074557 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccctaactatttattattctttctcctttcaattatttcatttatctt |
38074656 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
T |
38074657 |
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38074755 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38074756 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
38074785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 40020357 - 40020585
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnca-attctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
T |
40020357 |
atatctcgttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactccctcttcttttaatccttcatttatctt |
40020456 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
40020457 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgcgaaatgcccaa |
40020555 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40020556 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
40020585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Original strand, 2648956 - 2649190
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2648956 |
tatgtcactttacaatgccaaagaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
2649055 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
2649056 |
tcatatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
2649154 |
T |
 |
Q |
213 |
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248 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
2649155 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtataattt |
2649190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Original strand, 44452263 - 44452461
Alignment:
Q |
45 |
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142 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44452263 |
aatgttacttttcctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatta-tttattaaggacaattttg |
44452361 |
T |
 |
Q |
143 |
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242 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44452362 |
taaaacaactcataatatctcttttccatacgatattaattgcatttcttaatatgtgtaaaatacttaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44452461 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45823184 - 45822957
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatt-tatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
45823184 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctcttctttcaattctttcattgtatcttt |
45823085 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
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|
T |
45823084 |
cccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcttacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaa |
45822986 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45822985 |
acgtcgtacaatttgggacggagggagta |
45822957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 35542016 - 35542241
Alignment:
Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |
|
|
T |
35542016 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaattacttcatttatttt |
35542115 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
35542116 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
35542214 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
35542215 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
35542241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44894800 - 44894571
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44894800 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatct |
44894701 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
44894700 |
ttcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgctca |
44894602 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44894601 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
44894571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47578905 - 47578684
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
T |
47578905 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctattttctttcatttccttcatttatctt |
47578806 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47578805 |
tctcatatca-tttattgaggacaattttataaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
47578707 |
T |
 |
Q |
213 |
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235 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
47578706 |
aacgtcatacaatttgggacgga |
47578684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 18234941 - 18235169
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18234941 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttaattttcctattatatccttaactatttattactgtttcttttttcaattctttcatttatctt |
18235040 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
18235041 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
18235139 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18235140 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18235169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23726601 - 23726373
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
T |
23726601 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattactttttctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattccttaatttatctt |
23726502 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
23726501 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtaaaatgcccaa |
23726403 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23726402 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23726373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10657208 - 10656986
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
10657208 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattatttcatttattt |
10657109 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttat-aaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
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|
T |
10657108 |
ttcccatatt-attta---aggataattttgtaaaaataactcataatatatcttttccacgtaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgctc |
10657013 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
10657012 |
aaattatcatacaatttaggacggagg |
10656986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9417829 - 9417595
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || ||||||||||| |
|
|
T |
9417829 |
atatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaaatcattcatttatct |
9417730 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9417729 |
ttctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccca |
9417631 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaatt |
247 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| |
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|
T |
9417630 |
aaacatcatacaatttgggacggaggtagtataatt |
9417595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 30264482 - 30264651
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
30264482 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
30264581 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaat |
182 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
30264582 |
ttctcatatt-atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcctttt-cacacaatattaat |
30264651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45780875 - 45780659
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
T |
45780875 |
tatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactct-------ctcttctttca---atctttc |
45780786 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45780785 |
ccatatca-tttattgaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
45780687 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45780686 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
45780659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 584602 - 584373
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
584602 |
atatgtcactttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataaccttaattatttattactctctcttttttcaattttttcatttatct |
584503 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |
|
|
T |
584502 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttatccacacaatattaattgtatttcttaatatatgtgaaatatcta |
584404 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |
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|
T |
584403 |
aaacgtcatacaatttggaacggatggagta |
584373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6696847 - 6696618
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6696847 |
atatttcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttttattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattatttcatttatct |
6696748 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6696747 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgccca |
6696649 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6696648 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
6696618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8611868 - 8612097
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
T |
8611868 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcctttatttatct |
8611967 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8611968 |
ttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
8612066 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
8612067 |
aaacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
8612097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 10316604 - 10316832
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
10316604 |
atatttcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattttttcatttatct |
10316703 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatatta---atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
10316704 |
ttcccctattatttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaagattaattacattttttaatatgtgtgaaatac |
10316803 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||| || ||||| |
|
|
T |
10316804 |
ccaaaacgtcatacaatttgagatggagg |
10316832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 12804437 - 12804655
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
12804437 |
atatgtcactttacaatactcatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccatc-------ttctttcatttattttt |
12804529 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
12804530 |
cccatatta-tttattaaggacagttttgtaaaacagctcataatatctattttcc--acaatattaatttcatttcttaatatgtgtgaaatacccaaa |
12804626 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12804627 |
acgtcgtacaatttgggacggagggagta |
12804655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28234367 - 28234138
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
28234367 |
atatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaattatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
28234268 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28234267 |
ttctcatatca-tttagtaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgccca |
28234169 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28234168 |
aaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
28234138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29985995 - 29985782
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
29985995 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
29985896 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
29985895 |
tcccatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccaaa |
29985797 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |
|
|
T |
29985796 |
aatgtcatacaattt |
29985782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4513585 - 4513357
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4513585 |
tatgtcgttttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
4513486 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
4513485 |
tcccatatca-tttatagaggacaatttagtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
4513387 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| |||||||||||||| |
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|
T |
4513386 |
aacgtcatacaatttaggacggagggagta |
4513357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24685653 - 24685425
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24685653 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
24685554 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
24685553 |
tccaatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacactatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
24685455 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
24685454 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
24685425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 25756400 - 25756628
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25756400 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaacgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
25756499 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
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|
|
T |
25756500 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttctcacacaatactaattacattttttaatacgtgtggaatgcccaa |
25756598 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
25756599 |
aacgtcatacaatttggaacggagagagta |
25756628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42688743 - 42688523
Alignment:
Q |
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120 |
Q |
|
|
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|
|
T |
42688743 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatat |
42688644 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
42688643 |
ca-tttattgatgacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgcccaaaacgtcat |
42688545 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
42688544 |
acaatttgggacggatggagta |
42688523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46373228 - 46373000
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
46373228 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
46373129 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
46373128 |
ttccatatca-tttattgagaacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
46373030 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46373029 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46373000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21849875 - 21849642
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta---taaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcattta |
108 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
T |
21849875 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactatttctattagtataaccttaactatttattactatctcttctatcaatactttcattta |
21849776 |
T |
 |
Q |
109 |
tctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
21849775 |
tctttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaattttaattgcatttcttaatatatgtgaaatgt |
21849677 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
21849676 |
ccaaaacgccatacaatttgggacggagagagtac |
21849642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23059125 - 23059355
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
23059125 |
atatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttattt |
23059224 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaa-caactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23059225 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcct |
23059323 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23059324 |
aaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23059355 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 37798103 - 37798332
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
37798103 |
atatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttattt |
37798202 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
37798203 |
ttcccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccttacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgtcca |
37798301 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || ||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
37798302 |
aaacattatacaatttgggacgaagggagta |
37798332 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42149749 - 42149599
Alignment:
Q |
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caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
42149749 |
caattctttcatttatctttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttctta |
42149651 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42149650 |
atatgtgtaaaattcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtacaa |
42149599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47834378 - 47834149
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
47834378 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttatttcaattccttcatttttct |
47834279 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47834278 |
ttcccatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
47834180 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47834179 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
47834149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1643731 - 1643503
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1643731 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctt |
1643632 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1643631 |
tctcatatca-tttattaaggatagttttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
1643533 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1643532 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
1643503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 22624370 - 22624598
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22624370 |
tatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcttttctttttcaattctttcatttatctt |
22624469 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
22624470 |
tcccatatca-tttaataaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
22624568 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
22624569 |
aacatcatacaatttgggatggagtgagta |
22624598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22918228 - 22918446
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
22918228 |
atatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatct |
22918327 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
22918328 |
ttctcata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
22918415 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22918416 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
22918446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 36916726 - 36916950
Alignment:
Q |
19 |
tcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
36916726 |
tcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatattatattcttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttccc |
36916825 |
T |
 |
Q |
117 |
atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
36916826 |
atatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacg |
36916924 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36916925 |
tcatacaatttgggacggagggagta |
36916950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 39199102 - 39199302
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39199102 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctt |
39199201 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39199202 |
tcttatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
39199300 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
39199301 |
aa |
39199302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 42121956 - 42122180
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
42121956 |
atatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttattt |
42122055 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaa-tattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42122056 |
ttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaatagctcataatatctcttttccacacaaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
42122154 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
42122155 |
aaaacgtcatacaatttgggagggag |
42122180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22706989 - 22706760
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
22706989 |
tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
22706889 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
22706791 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| | ||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
22706790 |
aacgtgatacaatttgagatggagggagtac |
22706760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35144313 - 35144084
Alignment:
Q |
14 |
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111 |
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T |
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211 |
Q |
|
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T |
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35144115 |
T |
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242 |
Q |
|
|
||| | ||| |||||||||| ||||||||| |
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T |
35144114 |
aaacgtaatacaatttgggacagagggagta |
35144084 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #76
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Target Start/End: Original strand, 5528448 - 5528668
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120 |
Q |
|
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T |
5528448 |
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T |
 |
Q |
121 |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
221 |
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Q |
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| |||||||||||||| ||||| |
|
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T |
5528647 |
acaatttgggacggagagagta |
5528668 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27119073 - 27118845
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
113 |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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242 |
Q |
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|
T |
27118874 |
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27118845 |
T |
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Target: chr7; HSP #78
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Target Start/End: Complemental strand, 32827845 - 32827622
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112 |
Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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T |
32827745 |
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32827647 |
T |
 |
Q |
213 |
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237 |
Q |
|
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|| ||||| ||||||||||||||| |
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|
T |
32827646 |
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32827622 |
T |
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Target: chr7; HSP #79
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8565988 - 8565761
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Q |
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113 |
Q |
|
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T |
8565988 |
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T |
 |
Q |
114 |
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213 |
Q |
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T |
8565888 |
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T |
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Q |
214 |
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242 |
Q |
|
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| ||||| ||||||||| |||||||||| |
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|
T |
8565789 |
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8565761 |
T |
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Target: chr7; HSP #80
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Target Start/End: Complemental strand, 10439420 - 10439196
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Q |
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117 |
Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
118 |
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216 |
Q |
|
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||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
10439321 |
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10439224 |
T |
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Q |
217 |
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242 |
Q |
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T |
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tcgtatacaatttgggacggaggaagta |
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T |
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Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10453130 - 10452906
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Q |
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117 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
10453130 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttgttactctcttctttcaattccttcatttatctttccca |
10453032 |
T |
 |
Q |
118 |
tattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccg-cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
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||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
10453031 |
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10452934 |
T |
 |
Q |
217 |
tc--atataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|| ||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
10452933 |
tcgtatacaatttgggacggaggaagta |
10452906 |
T |
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Target: chr7; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 21177266 - 21177496
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Q |
14 |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
21177266 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatttcatttatct |
21177365 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
21177366 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
21177464 |
T |
 |
Q |
212 |
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243 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21177465 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
21177496 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46944633 - 46944486
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193 |
Q |
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|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| |
|
|
T |
46944633 |
caattctttcatttatatttcccatatca-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttttta |
46944535 |
T |
 |
Q |
194 |
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242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46944534 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46944486 |
T |
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Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Q |
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|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |
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T |
 |
Q |
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208 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
19785708 |
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19785610 |
T |
 |
Q |
209 |
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243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19785609 |
ccaaaacatcgtaaaatttaggacggagggagtac |
19785575 |
T |
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115 |
Q |
|
|
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|
T |
31466107 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
31466206 |
T |
 |
Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
31466207 |
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31466305 |
T |
 |
Q |
216 |
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242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
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|
T |
31466306 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
31466332 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
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T |
31582205 |
tatgtcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcactatttattgccttctctactcccaaatcattcatttatctt |
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T |
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Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
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T |
31582105 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaa |
31582007 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31582006 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
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Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
34275680 |
tatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctt |
34275581 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |
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|
T |
34275580 |
tcccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgttcaa |
34275482 |
T |
 |
Q |
213 |
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235 |
Q |
|
|
|| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
34275481 |
aacgtcgtacaatttgggacgga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
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|
T |
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tatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
T |
19866402 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgatatgcccaa |
19866304 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
19866303 |
aacgtcatacaatttgggacggaaggagta |
19866274 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5680427 - 5680210
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Q |
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Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |
|
|
T |
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tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagttttttatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
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Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5680327 |
ttccata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
5680240 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
5680239 |
aacgtcatacaatttgggacgaatggagta |
5680210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5705479 - 5705262
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |
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|
T |
5705479 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagttttttatttatctt |
5705380 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
5705379 |
ttccata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
5705292 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
5705291 |
aacgtcatacaatttgggacgaatggagta |
5705262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11910658 - 11910431
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
11910658 |
atatgccgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgttctcttctttcaattccttcatttattttt |
11910559 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
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||||||| | | |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |
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T |
11910558 |
cccatatca-tatattgaagacaattttgtaaaacaactcaaaatatctctttcccacacaatattaattatattttttaatatgtatgaaatgcccaaa |
11910460 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11910459 |
acttcatacaatttgggacggagggagta |
11910431 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12118837 - 12118616
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatat |
120 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
12118837 |
tttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttctcatat |
12118738 |
T |
 |
Q |
121 |
taatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcat |
220 |
Q |
|
|
| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | |
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|
T |
12118737 |
ca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaaacgtcgt |
12118639 |
T |
 |
Q |
221 |
ataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
12118638 |
acaatttaggacggagggagtac |
12118616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38510136 - 38509907
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
38510136 |
atatgtcgctttacaataccaataaaagattaatgttacttttcctattatattcttaacaatttattacactctcttctttcaattccttcatttatct |
38510037 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
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|
T |
38510036 |
tttccatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcacaatatctctttcccacataatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgccca |
38509938 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
38509937 |
aaacatcatacaatttaggatggagggagta |
38509907 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28472293 - 28472066
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
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|
|
T |
28472293 |
tatgtcgctttacaatac-aatgaaacattaatgttacttttcctattacatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatatt |
28472195 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
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|
T |
28472194 |
tcccat-gacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctattttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgttcaa |
28472096 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
28472095 |
aacgtcatataatttaggacggaggaagta |
28472066 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 35497712 - 35497940
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
35497712 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaaccatttattactctctcttctatcaattccttcatttatctt |
35497811 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| | |||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
35497812 |
ttctatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
35497910 |
T |
 |
Q |
213 |
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242 |
Q |
|
|
|| ||| || ||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
35497911 |
aacatcgtacaatttggaacggatggagta |
35497940 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24923492 - 24923375
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
24923492 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
24923393 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggag |
240 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |
|
|
T |
24923392 |
aatttgggacggagggag |
24923375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9603803 - 9603656
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Q |
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193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
9603803 |
caattctttcatttatctttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttctca |
9603705 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9603704 |
atatatgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
9603656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9831374 - 9831227
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
9831374 |
caattctttcatttatctttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttctca |
9831276 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9831275 |
atatatgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
9831227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 9818144 - 9818373
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |
|
|
T |
9818144 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttccttcatttatct |
9818243 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
9818244 |
ttctcatatca-tttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
9818342 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
9818343 |
aaacgtcatacaattcgggacggatggagta |
9818373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
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Query Start/End: Original strand, 14 - 242
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |
|
|
T |
10720069 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttccttcatttatct |
10720168 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
10720169 |
ttctcatatca-tttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
10720267 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
10720268 |
aaacgtcatacaattcgggacggatggagta |
10720298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17611531 - 17611302
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17611531 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
17611432 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |
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|
T |
17611431 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttactacgtgtgaaatgacca |
17611333 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17611332 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
17611302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
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Target Start/End: Original strand, 17832968 - 17833197
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17832968 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaattatttcatttatct |
17833067 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |
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|
T |
17833068 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtca |
17833166 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
17833167 |
aaacatcatacaatttgggatggagggagta |
17833197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 39430136 - 39430365
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
39430136 |
atatgtcgcttgacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatattctttcaattatttcatttatct |
39430235 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| | || | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
39430236 |
ttttcgtacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
39430334 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39430335 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39430365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40353857 - 40353631
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
40353857 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccttcttt-caattatttcatttatcttt |
40353759 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
40353758 |
tccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaa |
40353660 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
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|
T |
40353659 |
acgtcttataatttgggacagagggagta |
40353631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5114087 - 5113860
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
5114087 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattccctcttctttcaattctttcattcatct |
5113988 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||| | || | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
5113987 |
ttcgcatatca---tagtaagggtaattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacaaaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaattccca |
5113891 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
5113890 |
aaacgtcatataatttaggacggagagagta |
5113860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 19293190 - 19293330
Alignment:
Q |
101 |
ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
19293190 |
ttcatttatctttctcatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatattcctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtg |
19293288 |
T |
 |
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19293289 |
tgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19293330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 12263705 - 12263934
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
12263705 |
atatgtcgctttacaagaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaattatttcatttatct |
12263804 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
12263805 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
12263903 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12263904 |
aaacgtcatacaatttggg-gggagggagtac |
12263934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 7979052 - 7979277
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
7979052 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
7979151 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
7979152 |
tatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacactatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaaac |
7979250 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7979251 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
7979277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24161689 - 24161918
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24161689 |
atatgtcattttacgataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattattctctcttctttcaattatttcatttatct |
24161788 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
24161789 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
24161887 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24161888 |
aaacatcatacaatttgggacggagggagta |
24161918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24166831 - 24166610
Alignment:
Q |
22 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccata |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
24166831 |
ctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttctcattctaatcttaactatttattattctctcttctttcaattctttcatttgtctttctcata |
24166732 |
T |
 |
Q |
120 |
ttaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatca |
219 |
Q |
|
|
|| || | | || |||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
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|
T |
24166731 |
ttt-ttcactaagaacaattttgtaaaataacttataatatcttgttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgagaaatgcccaaaatttcg |
24166633 |
T |
 |
Q |
220 |
tataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24166632 |
tacaatttggaacggagggagta |
24166610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28536748 - 28536629
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
28536748 |
atttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatac |
28536649 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
28536648 |
aatttaggacggagggagta |
28536629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 28703598 - 28703827
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
28703598 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaattatttcatttatct |
28703697 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
28703698 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
28703796 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28703797 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
28703827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32827330 - 32827101
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32827330 |
atatgtctctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
32827231 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
32827230 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggtca |
32827132 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32827131 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32827101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 40704444 - 40704672
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
T |
40704444 |
atatgtcgctttacaataccaatg-aatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattacatttatct |
40704542 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
40704543 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
40704641 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40704642 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40704672 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43884352 - 43884123
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
T |
43884352 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaattatatcatttatct |
43884253 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
43884252 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactgataatttctcttccccaaacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
43884154 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43884153 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
43884123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22369075 - 22368942
Alignment:
Q |
101 |
ttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtg |
200 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
22369075 |
ttcatttatttttctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
22368977 |
T |
 |
Q |
201 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
22368976 |
tgaaatgctcaaaatatcatacaatttggaacgga |
22368942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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Target Start/End: Complemental strand, 35379301 - 35379214
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Q |
278 |
atattatatatacacaaatcaagcatgcaaaaatgaaagnnnnnnngttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatg |
365 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35379301 |
atattatatatacacaaatcaagcatgcaaaaatgaaagaaaaaaagttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatg |
35379214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 45042030 - 45042258
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
45042030 |
tatgtcgctttagaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcactatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctt |
45042129 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |
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|
T |
45042130 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgttcaa |
45042228 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45042229 |
aacatcatataatttgggacggagggagta |
45042258 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 6882895 - 6883125
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttt-cctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
6882895 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtcattttttcctattatatccttaactatttattattctctcttctttcaattcattcatttatc |
6882994 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
6882995 |
tttctcatatca-tttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattacattttttaacatgtgtgaaatatcc |
6883093 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
6883094 |
aaaacgtcatgcaatttgagacggagagagta |
6883125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39693923 - 39693806
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Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
39693923 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaata--tgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
39693826 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
39693825 |
aatttgggacggatggagta |
39693806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40768702 - 40768556
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
40768702 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctt |
40768603 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
40768602 |
tcccata-tcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatat |
40768556 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42808471 - 42808241
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
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|
T |
42808471 |
atatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaattattaattacttcctcttctttcaattatttcatttatct |
42808372 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttagg-acaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
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|| ||||| | |||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |
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T |
42808371 |
tttccatacca-tttattaagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtaaaatggcc |
42808273 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42808272 |
aaaacatcatacaatttggaacggagggagta |
42808241 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40537007 - 40536782
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatcttt |
113 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | || || ||||||||| |
|
|
T |
40537007 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttagttttcctattatatccttaagtattaattactctctctt--cttttaattattttatcttt |
40536910 |
T |
 |
Q |
114 |
cccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
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|
T |
40536909 |
tccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaa |
40536811 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40536810 |
acgtcatacaatttgggacggagggagta |
40536782 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 42940944 - 42941173
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42940944 |
atatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
42941043 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
42941044 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
42941142 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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T |
42941143 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
42941173 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 43576792 - 43577021
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||||| |
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|
T |
43576792 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaattattttatttatct |
43576891 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
43576892 |
tttccata-ccatttattagggataattttataaaacaactcataatttctcttccccaagcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
43576990 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
43576991 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
43577021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25547936 - 25547736
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||| |
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|
T |
25547936 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatattacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttctatcagttccttcgtttatctt |
25547837 |
T |
 |
Q |
113 |
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212 |
Q |
|
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| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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T |
25547836 |
ttccatatca-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaa |
25547738 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
25547737 |
aa |
25547736 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25651101 - 25650968
Alignment:
Q |
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194 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
25651101 |
aattctttcatttatttttcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatcttttttctacacaatattaattacatttcttaa |
25651003 |
T |
 |
Q |
195 |
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229 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |
|
|
T |
25651002 |
tatgtgtgaaatgtccaaaacatcgtacaatttgg |
25650968 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 242
Target Start/End: Original strand, 13446134 - 13446251
Alignment:
Q |
125 |
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224 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
13446134 |
ttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
13446233 |
T |
 |
Q |
225 |
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242 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| |
|
|
T |
13446234 |
tttaagacggaaggagta |
13446251 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 33616433 - 33616663
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33616433 |
atatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
33616532 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
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|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
33616533 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
33616631 |
T |
 |
Q |
212 |
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243 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33616632 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagtac |
33616663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3458559 - 3458330
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
3458559 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattattctctattctttcaattatttcatttatct |
3458460 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| | ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
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T |
3458459 |
tttctata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggcca |
3458361 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3458360 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
3458330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 23709614 - 23709847
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23709614 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcatctttcaattatttcatttatct |
23709713 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
23709714 |
tttccata-ccatttattagagataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
23709812 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaat |
246 |
Q |
|
|
||| || || ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
23709813 |
aaacgtcttacaatttggaacggagggagtacaat |
23709847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29669327 - 29669556
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
29669327 |
atatgtcgctttacaataacaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattattttatttatct |
29669426 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| | | |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
29669427 |
tttccatacca-tttattaggaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
29669525 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
29669526 |
aaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
29669556 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36669754 - 36669526
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |
|
|
T |
36669754 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttattt |
36669655 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| | ||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
36669654 |
tttc-atacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgcaatattaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
36669557 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36669556 |
aaacatcgtacaatttgggacggagggagta |
36669526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 37277739 - 37277968
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14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
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|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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T |
37277739 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
37277838 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
37277839 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaatcatatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
37277937 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
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|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
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T |
37277938 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
37277968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47604707 - 47604478
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
T |
47604707 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
47604608 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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T |
47604607 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
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T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
47604508 |
aaacgtcttacaatttgggacggaggaagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 9140709 - 9140850
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
9140709 |
caattccttcatttatctttctaat-ttcatttattaaggacaattttataaaacaaatcataatatctctttaccacataatattaattacatttctta |
9140807 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||| |
|
|
T |
9140808 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtacaattcgggacggag |
9140850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27059765 - 27059540
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
27059765 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
27059666 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| || |||| |||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
27059665 |
tttccatacta---tattaagga--attttgtaaaataactcataatttctcttccccgcacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
27059571 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
27059570 |
aaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
27059540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30440622 - 30440396
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
30440622 |
atatgttgctttacaatactaatgcaatattaatgttattttttcttttataccattaactatttattattctctcttctttcaattctttcatttat-- |
30440525 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
30440524 |
-tctcatgtta-tttattatggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctcttttccatgcaatattaattgcatttcttaatatgtgtaaaatgtcca |
30440427 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
30440426 |
aaacgtcatacaatttaggacggaaggagta |
30440396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4503856 - 4503626
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4503856 |
atatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatct |
4503757 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttattta-ggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
|
|
T |
4503756 |
tttccata-ccatttattaagggataattttgtaaatcaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtc |
4503658 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
4503657 |
aaaacgtcgtacaatttgggacggatggagta |
4503626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32466384 - 32466154
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaac-attaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatc |
110 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32466384 |
atatgtcgctttacaataccaataaaaatattaatgttacttttcctattatattcttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatc |
32466285 |
T |
 |
Q |
111 |
tttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |
|
|
T |
32466284 |
tttctcatacca-tttattaaggataattttataaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaacggcc |
32466186 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| || || | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
32466185 |
aaaacgtcgtacattttgggacggagggagta |
32466154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27116639 - 27116410
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
27116639 |
atatatcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
27116540 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
27116539 |
ttttcatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggtca |
27116441 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27116440 |
aaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
27116410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 41820917 - 41820988
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
41820917 |
atatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactc |
41820988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 3264413 - 3264627
Alignment:
Q |
28 |
aataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcccatattaatt |
125 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |
|
|
T |
3264413 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatc-ttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcaaatca-tt |
3264510 |
T |
 |
Q |
126 |
tatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataat |
225 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |
|
|
T |
3264511 |
tattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacgcaatattaattatatttcttaataagtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaat |
3264610 |
T |
 |
Q |
226 |
ttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | |||||||||||| |
|
|
T |
3264611 |
ttagaacggagggagta |
3264627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 32467862 - 32468092
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32467862 |
atatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
32467961 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttt-tccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa-tgcc |
209 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
32467962 |
ttcccatacta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataat-ttcttttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaacggcc |
32468059 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32468060 |
aaaaacgtcatacattttgagacggagggagta |
32468092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 46342793 - 46343019
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| | |
|
|
T |
46342793 |
gtcgctttacaataccattgaaacagtaatgttactttttctattataaccttgactatttattgttctattttctttcaattctttaatttatcttttc |
46342892 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tc-cttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
213 |
Q |
|
|
|| | | |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
46342893 |
cacaaca-tttattaaggacaattttttaaaacaagt-ataatatatctctttcccgtacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaa |
46342990 |
T |
 |
Q |
214 |
atatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
46342991 |
acgtcatataatttgggatggaggaagta |
46343019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26913799 - 26913581
Alignment:
Q |
29 |
ataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcccatattaatttat |
128 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |
|
|
T |
26913799 |
ataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatca-tttat |
26913701 |
T |
 |
Q |
129 |
ttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaa------tattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
26913700 |
taagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatatatttattaattacatttcttaaaatgcgtgaaataatcaaaacatcatat |
26913601 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
26913600 |
aatttaggacggagggagta |
26913581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 32777943 - 32778090
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
32777943 |
caattctttaatttatccttcccatacca-tttatgatggacgattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacataattaattacatttctta |
32778041 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
32778042 |
atacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggacgaagggagta |
32778090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 48339501 - 48339702
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
48339501 |
atatgtcgttttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactatcgcttctttcaattatttcatttatct |
48339600 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
48339601 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
48339699 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
48339700 |
aaa |
48339702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35354785 - 35354706
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Q |
290 |
cacaaatcaagcatgcaaaaatgaaagnnnnnnngttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatgatga |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
35354785 |
cacaaatcaagcatgcaaaaatgaaagaaaaaaagttcatacaagtgataggctcagtaacaattgaagaatggtgatga |
35354706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 31542472 - 31542596
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Q |
106 |
ttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
T |
31542472 |
ttatctttcctatatca-tttattaaggaaaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttcttaatagatatgaaa |
31542570 |
T |
 |
Q |
206 |
tgcccaaaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31542571 |
tgcctaaaatatcatataatttggga |
31542596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35421730 - 35421659
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Q |
171 |
cacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35421730 |
cacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
35421659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Original strand, 41821006 - 41821081
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Q |
164 |
ttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
41821006 |
ttttccacataatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggatggaggga |
41821081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13439376 |
gtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaattatttattact |
13439442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 35421840 - 35421770
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
35421840 |
tatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactc |
35421770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39961110 - 39960887
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttc-----ctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatt |
106 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
39961110 |
atatgtcgctttacaatacttatgcaacattaatgttttttttttttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttttaattcttt-att |
39961012 |
T |
 |
Q |
107 |
tatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||| || | |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39961011 |
tatctttctcatatta-tttattaagaataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacgcaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaat |
39960913 |
T |
 |
Q |
207 |
gcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
| |||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
T |
39960912 |
gtccaaaacgtcatacaatttcggac |
39960887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 27045218 - 27045337
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
27045218 |
atttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatcgctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatatccaaaacgtcatac |
27045317 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
27045318 |
aatttaggatggagggagta |
27045337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28536987 - 28536920
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatt |
81 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
28536987 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttatt |
28536920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35380727 - 35380684
Alignment:
Q |
244 |
aattttgaatgttatttatcaaactttcatgtctatattatata |
287 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35380727 |
aattttgaatgttatttatcaaactttcatgtctatattatata |
35380684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24924397 - 24924328
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
24924397 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatccttaactatttattact |
24924328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Original strand, 42259262 - 42259381
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
42259262 |
caattctttcttttatctttctcgtatca-tttattaaggacaattttgtaaaacgacttataatatctgtttcctacacaatattaattaaatttctta |
42259360 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
42259361 |
atatgtgtgaaatgtccaaaa |
42259381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 30803339 - 30803410
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
30803339 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatattacttttcctattatatccttaactattaattactc |
30803410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 42149818 - 42149771
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctat |
61 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42149818 |
atatgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgctacttttcctat |
42149771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 42520133 - 42520200
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
42520133 |
gtcgctttacaatatcattgaaacattaatgttacttttcctataatacccttaactatttattactc |
42520200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 4089311 - 4089360
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctatta |
63 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4089311 |
atatgtagctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
4089360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 8670429 - 8670572
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
8670429 |
gtcgctttacaatacaaataaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatttttcc |
8670528 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
T |
8670529 |
gata-taattttttaaggacaattttgtaaaaaaaatcataatat |
8670572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26941404 - 26941173
Alignment:
Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
26941404 |
gtcgctttacactatcaataaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactttatcttctttcaattatttaatttatctttta |
26941305 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
| || | ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
26941304 |
ctta-tcatttattaaggacaactttgtaaaacaacttataatatatatttttcatacaagattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaagc |
26941206 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
26941205 |
gttatataatttgggacggaaggagtataattt |
26941173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35369896 - 35369855
Alignment:
Q |
324 |
gttcatacaagtgataggctcagtgacaattgaagaatgatg |
365 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35369896 |
gttcatacaagtgacaggctcagtgacaattgaagaatgatg |
35369855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 4089678 - 4089825
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||| |||| || |||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
4089678 |
caattcttttatttttctttttcatacta-tttattaacgataattttgcaaaacaactcataatatcttttttccatacaaaattaattacatttctta |
4089776 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4089777 |
atacgtatgaaatatccaaaacgtcatacaatttggaacggagggagta |
4089825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27131462 - 27131351
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
27131462 |
caatttttttatttatctttctcatacta-tttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaaaattaattatatttctta |
27131364 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
||| ||||||||| |
|
|
T |
27131363 |
atacgtgtgaaat |
27131351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 39004030 - 39004176
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| || |||| |||||| |||||| || |
|
|
T |
39004030 |
caattctttaatttatctttcccatacca-tttattaaagacaattttgtaaaacaagtcatagtat-cttttcccatacaaaattaattacatttcata |
39004127 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39004128 |
atacacgtgaaatgaccaaaacgacttataatttgggacggagggagta |
39004176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10200534 - 10200483
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
10200534 |
atatgttgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
10200483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24729720 - 24729649
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactc |
85 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
24729720 |
atatgttgttttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactc |
24729649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28696216 - 28696142
Alignment:
Q |
131 |
aggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaat |
206 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
28696216 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatt-tttttccgaacaaaattaattacatttcttaatacatgtgaaat |
28696142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 17196433 - 17196491
Alignment:
Q |
174 |
aatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
17196433 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggac |
17196491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 25651212 - 25651162
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattata |
65 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25651212 |
tatgtcactttgcaataccaatgaaacattaattttacttttcctattata |
25651162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 48250460 - 48250501
Alignment:
Q |
191 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48250460 |
ttaatatgtgtggaatgtccaaaatatcatataatttgggac |
48250501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 553938 - 554042
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |
|
|
T |
553938 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttctcatacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgagatatccaaaatgccatat |
554037 |
T |
 |
Q |
223 |
aattt |
227 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
554038 |
aattt |
554042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 22603955 - 22604050
Alignment:
Q |
100 |
tttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaata |
196 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
22603955 |
tttcatttatcttttccatatcactt-attaaggataattttataaaacaactcataatacatatttcccccacaaaattaattacatttcttaata |
22604050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Original strand, 6202983 - 6203124
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||| |||| || |
|
|
T |
6202983 |
caattctttcgtttatctttttcacat-aatttattaaggacacttttttaaagcaactcataatatatctttacgacacaaaactaattaaattttttt |
6203081 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6203082 |
a-atacgtgaaatgtccaaaatatcatataatttggaacggagg |
6203124 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 6186588 - 6186653
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6186588 |
caattttttcatttatctttttcacatga-tttattaaggacaattttttaaaacaactcataatat |
6186653 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 6193104 - 6193169
Alignment:
Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat |
160 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6193104 |
caattttttcatttatctttttcacatga-tttattaaggacaattttttaaaacaactcataatat |
6193169 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #182
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Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 7399753 - 7399793
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttt |
55 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7399753 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttt |
7399793 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 27330433 - 27330489
Alignment:
Q |
172 |
acaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttg |
228 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
27330433 |
acaaaattaattacatttcttaatatgcatgaaatgcctaaaataccatataatttg |
27330489 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48841251 - 48841195
Alignment:
Q |
23 |
tttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttattta |
79 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
48841251 |
tttacaatatcaatgaagcattaatgttaattttcttattatatccttaattattta |
48841195 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0380 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:
Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 16007
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
16229 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttatctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
16130 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16129 |
ttcccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
16031 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacgga |
235 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
16030 |
aaacgtcatacaatttgggacgga |
16007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1236
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
1462 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
1363 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1362 |
ttctcatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
1264 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
1263 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggga |
1236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15957 - 15789
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
15957 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatct |
15858 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaa |
181 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
15857 |
ttctcatatt-atttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaa |
15789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15379 - 15313
Alignment:
Q |
173 |
caatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15379 |
caatagtaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggaggga |
15313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18904 - 18676
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |
|
|
T |
18904 |
tatgtctctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttctcttatttcaattctttcatttatttt |
18805 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18804 |
tcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
18706 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18705 |
aacgttttacaatttgggacggagggagta |
18676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:
Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 6621 - 6853
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6621 |
atatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttcatttatct |
6720 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
T |
6721 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaaaagcta |
6819 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
6820 |
aaacgtcatacaatttggaacggagggagtacaa |
6853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4205 - 4005
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4205 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctt |
4106 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
4105 |
tgtcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaa |
4007 |
T |
 |
Q |
213 |
aa |
214 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
4006 |
aa |
4005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0734 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:
Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 6322 - 6536
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6322 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatct |
6421 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
6422 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcaattccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
6520 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataattt |
227 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| |
|
|
T |
6521 |
aaacatcatacaattt |
6536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 151695 - 151924
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
151695 |
atatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaagcatttattactccatcttctttcaattatttcatttatct |
151794 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
151795 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgcgaaatgccca |
151893 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
151894 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
151924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1335 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1335
Description:
Target: scaffold1335; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1395 - 1170
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
1395 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttccaattctttcatttatct |
1296 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1295 |
ttcctatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgccca |
1197 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggaggg |
238 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
1196 |
aaacgccatagaatttgggacggaggg |
1170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0983 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:
Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1296 - 1067
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |
|
|
T |
1296 |
atatgtcgcttcacaatatcaatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatat |
1197 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
1196 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcgacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
1098 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1097 |
aaatgtcatacaatttaagacggagggagta |
1067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0789 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:
Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 3366 - 3595
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
3366 |
atatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattctttcatttattt |
3465 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
3466 |
ttcccatatca-tttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtatgaaatgacca |
3564 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3565 |
aaacgtcatataatttgggacggagggagta |
3595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0768 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0768
Description:
Target: scaffold0768; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6127 - 5897
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6127 |
atatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaattatttcatttatct |
6028 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat-tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccc |
210 |
Q |
|
|
|| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6027 |
tttccatgtta-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatgccg |
5929 |
T |
 |
Q |
211 |
aaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5928 |
aaaacgtcataaaatttgggacggagggagta |
5897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
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Target Start/End: Original strand, 98917 - 99141
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111 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
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atatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttttatttatct |
99016 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
99017 |
ttcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
99115 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagg |
237 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
99116 |
aaacgtcatacaatttgggacggagg |
99141 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:
Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 280 - 49
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Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
280 |
atatgtcgttttacagtaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaattctttcatttatct |
181 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatat--tccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
180 |
ttcccatatta-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttttttcacgcaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
82 |
T |
 |
Q |
210 |
caaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
81 |
caaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13029 - 12800
Alignment:
Q |
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111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13029 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
12930 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
12929 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggcca |
12831 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
12830 |
aaacgtcttacaatttagaacggagggagta |
12800 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0427 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:
Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Q |
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112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5287 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
5386 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
5387 |
tcccatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcctaa |
5485 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5486 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 25986 - 25758
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25986 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctt |
25887 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25886 |
tctcatatca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaa |
25788 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25787 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Original strand, 63400 - 63628
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Q |
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112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
63400 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctt |
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T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
63500 |
tcccatatca-tttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaa |
63598 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
| |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
63599 |
tacatcatacaatttgagacggagggagta |
63628 |
T |
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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1526
Alignment:
Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||| |
|
|
T |
1297 |
atatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattgattactctctcttctttcaaatatttcatttatct |
1396 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
1397 |
tttccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
1495 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
1496 |
aaacgtcatacaatttgggacggagtgagta |
1526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13902 - 13673
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13902 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaattatttcatttatct |
13803 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||| |
|
|
T |
13802 |
tttccatact-atttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaaaattaattatatttcttaatacgtatgaaatagcca |
13704 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
13703 |
aaacgtcatacaatttagaacggagggagta |
13673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0308 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:
Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 20723 - 20949
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Q |
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111 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
20723 |
atatgtcgctttaaaataccaatgcaatattaatgctactttttctattataaccttaactatttattaccctctcttctttcaattctttcagttatct |
20822 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
20823 |
ttcccatatta-tttactaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctctt---caaacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
20918 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
20919 |
aaatgtcatacaatttgggacggagagagta |
20949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1515 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1515
Description:
Target: scaffold1515; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
1500 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttaattttcctattatattcttaactatttattactttgtcttctttcaattccttcatttatct |
1599 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1600 |
ttcccatatta-tttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
1698 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
1699 |
aaa |
1701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18419 - 18190
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
18419 |
atatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaccctcttttctttcaattccttcatttatct |
18320 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
18319 |
tttccatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaacgaataatatcactttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
18221 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18220 |
aaacattatacaatttggaacggagggagta |
18190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0654 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:
Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3055 - 2826
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaaca---ttaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcattta |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3055 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaataatattaatgctactttttccattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattctttcattta |
2956 |
T |
 |
Q |
109 |
tctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2955 |
tctttcccatatta-tttactaaggactattttgtaaaacaactcataatatctctt---cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
2860 |
T |
 |
Q |
209 |
ccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
2859 |
ccaaaacgtcatacaatttgggacggagagagta |
2826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 7654 - 7879
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
7654 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttc |
7753 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
7754 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
7852 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7853 |
gtcatacaatttgggacggagggagta |
7879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 2979 - 3213
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Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
T |
2979 |
atatgtcgttttacaataccattgcaacaat--tgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctctcctttcaattctttcgtttattt |
3076 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
3077 |
ttcccatatta-tttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctattttgcactcaatattaattgtattttttaatatatgtgaaatgccca |
3175 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagtacaatttt |
249 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
T |
3176 |
aaacgtcatacaatttggaatagagggagtataatttt |
3213 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
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Target: scaffold0330; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 13925 - 13698
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Q |
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tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnncaattctttcatttatctttc |
114 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13925 |
tatgtcactttacaatacaaatgaaacgttaatgttacttttcctattatatccttaactattttactctttcttctttcaattctttcatttatctttc |
13826 |
T |
 |
Q |
115 |
ccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
214 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
13825 |
ccatatca-tttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatcactttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaa |
13727 |
T |
 |
Q |
215 |
tatcatataatttgggacggagggagtac |
243 |
Q |
|
|
||||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
13726 |
cgtcatacaatttggaacggaggaagtac |
13698 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0027 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11219 - 10994
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac--tcnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
11219 |
tatgtcgctttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctt |
11120 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
11119 |
tcccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacaattcttaatacgtgtgaaatgcccaa |
11021 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11020 |
aacgtcatacaatttgggacggaggga |
10994 |
T |
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Target: scaffold0496 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:
Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12772 - 12640
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Q |
106 |
ttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaa |
205 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12772 |
ttatctttctcatatca-tttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
12674 |
T |
 |
Q |
206 |
tgcccaaaatatcatataatttgggacggaggga |
239 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12673 |
tgcccaaaacatcatacaatttgggacggaggga |
12640 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
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Target: scaffold0009; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 8491 - 8720
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Q |
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atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8491 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaattttatttttcctattatatccttaactattaattattctctcttctttcaattatttcatttatct |
8590 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
8591 |
ttcccatacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccacacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgacca |
8689 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
8690 |
aaacatcatacaatttgggacgaagggagta |
8720 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0475 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:
Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 5234 - 5383
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
5234 |
caattctttcatttattctttctatatctatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat-cttttcccacacaatattaattacatttctta |
5332 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtaca |
244 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5333 |
atatgtgtgaaatgctcaaaatgtcatacaatttgagacggagggagtaca |
5383 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21652 - 21424
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
21652 |
tatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattttttactctttcttctttcaattctttcatttatttt |
21553 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
21552 |
ccccatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatttcttttttccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgtacaa |
21454 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
21453 |
aacgtcatacaatttgagacggagggagta |
21424 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23574 - 23345
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23574 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
23475 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
23474 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccgcacaatattaattaaatttcttaatacatgtgaaattgcca |
23376 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23375 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23345 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23100 - 22875
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
23100 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactactaattattctctcttgtttcaattatttcatttatcttttc |
23001 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
23000 |
catacca-tttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttacccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaac |
22902 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22901 |
gtcgtacaatttgggacggagggagta |
22875 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Original strand, 17517 - 17742
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Q |
18 |
gtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnn--caattctttcatttatctttcc |
115 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
17517 |
gtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttccctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttc |
17616 |
T |
 |
Q |
116 |
catattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaat |
215 |
Q |
|
|
|||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
17617 |
catacca-tttattaaggataatttggtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaac |
17715 |
T |
 |
Q |
216 |
atcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17716 |
atcttacaatttgggacggagggagta |
17742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 45836 - 45977
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Q |
94 |
caattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttctta |
193 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
45836 |
caattatttcatttatctttcacatatta-tttattaaggacaattttgtaaaacagctcataatatctcttttccacgtaatattaattgcatttctta |
45934 |
T |
 |
Q |
194 |
atatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggag |
236 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
45935 |
atatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattttagacggag |
45977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 45636 - 45706
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
45636 |
atatgtcgtgttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattact |
45706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 3813 - 4042
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||| |
|
|
T |
3813 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatatcatttatct |
3912 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
3913 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtataacaactgataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
4011 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
4012 |
aaacgtcatacaatttaggatggagggagta |
4042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20743
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Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact--cnnnnnnnncaattctttcatttatctt |
112 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| | ||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
20513 |
tatgtcgttttacaataccaatgaattattaatgttaccttttctattatatctttact-atttattactttctcttcttccaattcattcatttatctt |
20611 |
T |
 |
Q |
113 |
tcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
212 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||| || |||||| || || |
|
|
T |
20612 |
tctcatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccaaacaaaattaattacatttcttaatacgtatgaaatacctaa |
20710 |
T |
 |
Q |
213 |
aatatcatataatttgggacggagggagtacaa |
245 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20711 |
aacgtcatacaatttgggacggagggagtacaa |
20743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 13365 - 13592
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattactcnnnnnnnnc--aattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
13365 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata--cttaactattaattactctctcttcttttaattatttcatttatct |
13462 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
13463 |
tttccatacca-tttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatgacca |
13561 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13562 |
aaacgtcatacaatttgggacggaggaagta |
13592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0459 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:
Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11722 - 11493
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Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |
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T |
11722 |
atatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatct |
11623 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
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|
|
T |
11622 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatggcca |
11524 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||| || || ||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
11523 |
aaacgtcttacaatttagaacggagggagta |
11493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18266 - 18114
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
18266 |
aattcttttatttatttttcctatatca-tttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaa |
18168 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagtacaattt |
248 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |
|
|
T |
18167 |
tatgtgtaaaatatccaaaacgtcatacaatttagaatggagggagtataattt |
18114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 188815 - 188745
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattact |
84 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
188815 |
atatgtcgatttacaataccaatgcaacattaatattatttttcctattataaccttaactatttattact |
188745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 20327 - 20527
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
20327 |
atatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttactttttctattatatcctta-ctattaactactctcttttctttcaattatttcatttatct |
20425 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
20426 |
tttccata-ccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
20524 |
T |
 |
Q |
212 |
aaa |
214 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
20525 |
aaa |
20527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0533 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:
Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 7262 - 7480
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatct |
111 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
7262 |
atatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttctattatttcatttatct |
7361 |
T |
 |
Q |
112 |
ttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
211 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
7362 |
tttccata-ccatttattagggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacagtattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggcca |
7460 |
T |
 |
Q |
212 |
aaatatcatataatttggga |
231 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
7461 |
aaacgtcatacaatttggga |
7480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 213124 - 213071
Alignment:
Q |
14 |
atatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataac |
67 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
213124 |
atatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataac |
213071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Original strand, 524347 - 524415
Alignment:
Q |
15 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagttatttattac |
83 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
524347 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattac |
524415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:
Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10512 - 10298
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagtta--tttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |
|
|
T |
10512 |
gctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctc |
10413 |
T |
 |
Q |
117 |
atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |
|
|
T |
10412 |
ata-ccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatctattttctatataaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcctcaaaca |
10314 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| |
|
|
T |
10313 |
tcttataatttgggac |
10298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20840 - 20626
Alignment:
Q |
21 |
gctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagtta--tttatta--ctcnnnnnnnncaattctttcatttatctttccc |
116 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |
|
|
T |
20840 |
gctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctc |
20741 |
T |
 |
Q |
117 |
atattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaata |
216 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |
|
|
T |
20740 |
ata-ccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatctattttctatataaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcctcaaaca |
20642 |
T |
 |
Q |
217 |
tcatataatttgggac |
232 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| |
|
|
T |
20641 |
tcttataatttgggac |
20626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 39907 - 40044
Alignment:
Q |
95 |
aattctttcatttatctttcccatattaatttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| || |||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
39907 |
aattctttaatttatctatccaatacaaatt-attaaggacaattttgtaaaacaattcatagcatctttttaccatacaaaattaattacatttcttaa |
40005 |
T |
 |
Q |
195 |
tatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacg |
233 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
40006 |
tatgtgtgaaatgtccaaaacatataataatttgggacg |
40044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0939 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0939
Description:
Target: scaffold0939; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Original strand, 851 - 917
Alignment:
Q |
176 |
tattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
851 |
tattaattacatttcttagtatatgtgaaatgatcaaaacttcatacaatttgggacggagggagta |
917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0024 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:
Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Original strand, 42701 - 42806
Alignment:
Q |
123 |
atttatttaggacaattttataaaacaactcataatattccttttccgcacaatattaatagcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatat |
222 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||| |
|
|
T |
42701 |
atttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttacatataaaattaattacatttcttaatacgtttgaaatgttcaaaacgttatat |
42800 |
T |
 |
Q |
223 |
aatttg |
228 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
42801 |
aatttg |
42806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1989 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1989
Description:
Target: scaffold1989; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 828 - 884
Alignment:
Q |
186 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatataatttgggacggagggagta |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| |
|
|
T |
828 |
atttcttaatgtgtgtgaaatgctcaaaacatcatacaatttaggatggagagagta |
884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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