View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0879_low_1 (Length: 426)

Name: NF0879_low_1
Description: NF0879
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0879_low_1
NF0879_low_1
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (62-365)||(42805494-42805797)
chr7 (64-229)||(47716431-47716596)
chr7 (64-230)||(21172008-21172170)
chr7 (64-200)||(46354166-46354302)
chr7 (64-232)||(42798641-42798807)
chr7 (64-231)||(43557444-43557612)
chr7 (64-229)||(2541019-2541183)
chr7 (64-228)||(11617589-11617751)
chr7 (64-231)||(32758233-32758396)
chr7 (64-229)||(48735122-48735284)
chr7 (64-231)||(27629606-27629771)
chr7 (64-229)||(10693073-10693234)
chr7 (74-231)||(42391098-42391251)
chr7 (64-231)||(19426888-19427052)
chr7 (66-225)||(33871914-33872070)
chr7 (93-231)||(7879639-7879775)
chr7 (230-365)||(42763053-42763191)
chr7 (68-230)||(40463853-40464012)
chr7 (64-229)||(22698967-22699133)
chr7 (64-227)||(35334818-35334977)
chr7 (68-228)||(16341254-16341413)
chr7 (68-228)||(29907393-29907552)
chr7 (62-228)||(42476843-42477005)
chr7 (68-229)||(23419674-23419833)
chr7 (68-231)||(19265791-19265950)
chr7 (64-231)||(34626206-34626370)
chr7 (68-220)||(28362155-28362304)
chr7 (83-231)||(38262194-38262340)
chr7 (64-231)||(47077853-47078016)
chr7 (93-227)||(18512455-18512586)
chr7 (93-230)||(31591108-31591241)
chr7 (64-229)||(14732821-14732985)
chr7 (78-228)||(18747472-18747621)
chr7 (68-228)||(3469176-3469338)
chr7 (75-231)||(32233133-32233286)
chr7 (96-220)||(21566439-21566562)
chr7 (71-228)||(11741774-11741927)
chr7 (64-170)||(1423967-1424073)
chr7 (68-205)||(48123508-48123643)
chr7 (68-165)||(12473280-12473377)
chr7 (68-208)||(19266426-19266564)
chr7 (64-215)||(5180169-5180320)
chr7 (64-189)||(8148985-8149109)
chr7 (68-185)||(14099050-14099165)
chr7 (68-185)||(14409067-14409182)
chr7 (64-150)||(18327006-18327091)
chr7 (67-230)||(39123865-39124031)
chr7 (67-184)||(7644931-7645047)
chr7 (67-231)||(13805077-13805237)
chr7 (114-221)||(38604549-38604654)
chr7 (144-231)||(27889314-27889399)
chr7 (72-210)||(28078151-28078286)
chr7 (64-219)||(2662946-2663094)
chr7 (117-230)||(35787268-35787378)
chr7 (62-150)||(7193055-7193143)
chr7 (64-149)||(7794582-7794669)
chr7 (93-184)||(35203440-35203531)
chr7 (122-231)||(1408487-1408594)
chr7 (69-165)||(6736867-6736962)
chr7 (144-229)||(45018923-45019010)
chr7 (64-147)||(42495916-42495998)
chr7 (68-214)||(42101899-42102044)
chr7 (68-149)||(5814447-5814528)
chr7 (182-231)||(36602535-36602584)
chr7 (135-232)||(39093436-39093532)
chr7 (128-232)||(13792147-13792250)
chr7 (122-229)||(23231587-23231692)
chr7 (135-226)||(33500556-33500645)
chr7 (64-138)||(21447562-21447636)
chr7 (114-227)||(27697459-27697572)
chr7 (167-232)||(23618974-23619039)
chr7 (67-159)||(22065563-22065654)
chr7 (68-164)||(44123685-44123780)
chr7 (167-231)||(45811920-45811983)
chr7 (64-149)||(29140438-29140523)
chr7 (198-231)||(44171635-44171668)
chr7 (129-185)||(17048859-17048914)
chr7 (123-230)||(23065924-23066029)
chr7 (167-231)||(25198799-25198863)
chr7 (123-218)||(25434050-25434144)
chr7 (123-216)||(21139761-21139851)
chr7 (178-226)||(42495865-42495913)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (64-231)||(13730600-13730767)
chr3 (64-231)||(40272810-40272975)
chr3 (71-230)||(13628789-13628948)
chr3 (62-230)||(29366719-29366887)
chr3 (64-231)||(46421032-46421200)
chr3 (64-227)||(8247688-8247852)
chr3 (114-231)||(49013471-49013588)
chr3 (64-232)||(1217084-1217248)
chr3 (64-212)||(9607197-9607345)
chr3 (68-232)||(53996562-53996725)
chr3 (71-231)||(5173717-5173876)
chr3 (128-227)||(353351-353450)
chr3 (64-230)||(12914034-12914198)
chr3 (78-231)||(516417-516571)
chr3 (68-228)||(22609764-22609921)
chr3 (64-231)||(26869701-26869865)
chr3 (114-229)||(14987001-14987116)
chr3 (69-232)||(34420640-34420802)
chr3 (64-229)||(39203510-39203671)
chr3 (81-228)||(45139479-45139624)
chr3 (65-228)||(22122918-22123077)
chr3 (68-227)||(26573125-26573282)
chr3 (64-218)||(6411833-6411984)
chr3 (116-229)||(45786214-45786327)
chr3 (91-219)||(45948848-45948974)
chr3 (64-231)||(52926217-52926373)
chr3 (98-229)||(10795423-10795554)
chr3 (88-231)||(54374343-54374485)
chr3 (114-232)||(54484734-54484851)
chr3 (73-231)||(7942993-7943149)
chr3 (64-230)||(16735435-16735598)
chr3 (99-229)||(31592878-31593004)
chr3 (64-231)||(4495674-4495827)
chr3 (69-231)||(25944468-25944629)
chr3 (81-230)||(54032570-54032705)
chr3 (122-231)||(15797274-15797379)
chr3 (64-230)||(25517169-25517336)
chr3 (134-232)||(34771361-34771457)
chr3 (64-228)||(7696893-7697048)
chr3 (72-209)||(30928167-30928302)
chr3 (81-213)||(33926094-33926224)
chr3 (68-166)||(45620889-45620988)
chr3 (64-151)||(10870028-10870114)
chr3 (68-225)||(19731000-19731155)
chr3 (167-231)||(24851299-24851363)
chr3 (169-230)||(30452892-30452953)
chr3 (115-219)||(829452-829555)
chr3 (122-229)||(9276316-9276419)
chr3 (77-231)||(12525414-12525566)
chr3 (116-225)||(55401222-55401330)
chr3 (116-191)||(47624088-47624160)
chr3 (122-232)||(44403552-44403661)
chr3 (66-228)||(33235526-33235687)
chr3 (115-231)||(50624951-50625065)
chr3 (174-230)||(10484615-10484671)
chr3 (167-231)||(24577930-24577994)
chr3 (167-231)||(24578020-24578084)
chr3 (122-232)||(26292384-26292490)
chr3 (114-228)||(31904857-31904970)
chr3 (167-231)||(35417999-35418063)
chr3 (68-144)||(53062036-53062112)
chr3 (76-209)||(8410887-8411016)
chr3 (68-225)||(19751576-19751731)
chr3 (67-165)||(26782363-26782461)
chr3 (181-231)||(47624208-47624258)
chr3 (30-67)||(10795876-10795913)
chr3 (64-162)||(21875014-21875106)
chr3 (72-161)||(39211992-39212081)
chr3 (114-215)||(43114882-43114983)
chr3 (78-165)||(52428539-52428627)
chr3 (196-231)||(40390365-40390400)
chr3 (167-230)||(40968613-40968676)
chr3 (68-142)||(35417914-35417988)
chr3 (187-231)||(6242283-6242327)
chr3 (114-165)||(31831243-31831292)
chr3 (187-231)||(43956470-43956514)
chr3 (187-229)||(31831301-31831343)
chr3 (170-231)||(10696211-10696272)
chr3 (196-229)||(14266372-14266405)
chr3 (107-228)||(16130312-16130432)
chr3 (196-229)||(23871490-23871523)
chr3 (76-165)||(29106555-29106644)
chr3 (69-177)||(32418221-32418329)
chr3 (167-215)||(46169981-46170029)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (64-230)||(20004089-20004255)
chr1 (64-230)||(30395725-30395891)
chr1 (64-231)||(18944638-18944806)
chr1 (64-231)||(46991799-46991964)
chr1 (64-231)||(46247951-46248116)
chr1 (64-224)||(23768325-23768483)
chr1 (64-230)||(34725097-34725259)
chr1 (64-230)||(10668215-10668386)
chr1 (88-230)||(35005142-35005284)
chr1 (62-231)||(27201640-27201809)
chr1 (64-230)||(32632556-32632719)
chr1 (65-231)||(6925096-6925260)
chr1 (68-230)||(14617037-14617197)
chr1 (64-232)||(18741954-18742124)
chr1 (64-231)||(38478280-38478443)
chr1 (64-231)||(45812535-45812698)
chr1 (64-231)||(47214506-47214669)
chr1 (64-227)||(19932755-19932915)
chr1 (64-230)||(41319805-41319969)
chr1 (71-235)||(9939463-9939628)
chr1 (64-230)||(12126836-12126998)
chr1 (64-231)||(45402090-45402256)
chr1 (64-230)||(27474276-27474439)
chr1 (68-209)||(18724565-18724704)
chr1 (62-230)||(19414432-19414596)
chr1 (68-229)||(35117765-35117927)
chr1 (83-232)||(35253184-35253329)
chr1 (130-229)||(4349699-4349796)
chr1 (69-207)||(25468285-25468421)
chr1 (69-231)||(19701570-19701731)
chr1 (64-231)||(8197038-8197203)
chr1 (68-231)||(35019229-35019389)
chr1 (93-217)||(45264411-45264534)
chr1 (68-219)||(2435796-2435946)
chr1 (114-231)||(23796510-23796625)
chr1 (114-231)||(31382212-31382326)
chr1 (155-231)||(50606487-50606563)
chr1 (122-231)||(1517309-1517417)
chr1 (68-219)||(27136661-27136811)
chr1 (68-209)||(11596512-11596650)
chr1 (101-227)||(22324925-22325049)
chr1 (133-231)||(42304205-42304303)
chr1 (67-230)||(6983810-6983969)
chr1 (69-226)||(39214961-39215117)
chr1 (135-231)||(43768205-43768299)
chr1 (69-220)||(44485119-44485267)
chr1 (67-227)||(15511150-15511311)
chr1 (67-232)||(20036218-20036381)
chr1 (134-226)||(10378738-10378828)
chr1 (68-184)||(17470390-17470505)
chr1 (71-175)||(22327101-22327204)
chr1 (68-180)||(33222983-33223093)
chr1 (68-231)||(50811938-50812100)
chr1 (66-165)||(4430088-4430187)
chr1 (68-199)||(25290162-25290300)
chr1 (64-184)||(22930114-22930230)
chr1 (114-215)||(43207540-43207640)
chr1 (125-230)||(20999849-20999952)
chr1 (132-222)||(31442396-31442485)
chr1 (68-166)||(50760287-50760385)
chr1 (114-230)||(19656104-19656219)
chr1 (133-232)||(6358185-6358283)
chr1 (68-137)||(2435983-2436052)
chr1 (167-224)||(4587568-4587625)
chr1 (169-230)||(33594130-33594191)
chr1 (69-165)||(24564344-24564440)
chr1 (115-227)||(34679217-34679331)
chr1 (116-234)||(20169084-20169200)
chr1 (137-218)||(15505632-15505710)
chr1 (88-230)||(19974073-19974213)
chr1 (88-220)||(23371143-23371271)
chr1 (141-217)||(7074588-7074663)
chr1 (167-231)||(30555211-30555275)
chr1 (64-120)||(34714618-34714674)
chr1 (114-220)||(34148969-34149073)
chr1 (132-231)||(46859129-46859227)
chr1 (79-231)||(31272379-31272522)
chr1 (64-110)||(40424737-40424783)
chr1 (68-226)||(52910216-52910379)
chr1 (174-231)||(16120819-16120876)
chr1 (167-217)||(1693222-1693273)
chr1 (193-232)||(21773636-21773675)
chr1 (176-226)||(28894561-28894611)
chr1 (133-185)||(21910693-21910743)
chr1 (187-232)||(24564450-24564495)
chr1 (115-156)||(25027989-25028030)
chr1 (167-231)||(41440600-41440664)
chr1 (196-232)||(50760237-50760273)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (64-231)||(7136525-7136692)
chr8 (64-231)||(6760794-6760961)
chr8 (62-230)||(26954102-26954271)
chr8 (64-230)||(39460993-39461159)
chr8 (64-232)||(28817623-28817789)
chr8 (62-230)||(36720766-36720932)
chr8 (64-232)||(25250494-25250662)
chr8 (64-230)||(44530121-44530285)
chr8 (64-231)||(35261651-35261816)
chr8 (64-231)||(12670248-12670411)
chr8 (64-229)||(29521685-29521848)
chr8 (114-231)||(20869945-20870062)
chr8 (64-231)||(30454095-30454258)
chr8 (64-231)||(8897762-8897927)
chr8 (64-230)||(12625861-12626026)
chr8 (64-229)||(13160674-13160836)
chr8 (68-223)||(20284075-20284232)
chr8 (68-223)||(21070703-21070861)
chr8 (65-228)||(45071238-45071398)
chr8 (68-216)||(44781517-44781665)
chr8 (64-229)||(17823548-17823711)
chr8 (67-229)||(2626494-2626657)
chr8 (122-229)||(16225049-16225156)
chr8 (96-220)||(8483947-8484069)
chr8 (72-231)||(18164758-18164914)
chr8 (64-206)||(20869523-20869659)
chr8 (98-232)||(5135287-5135418)
chr8 (114-227)||(29877116-29877227)
chr8 (64-229)||(28407388-28407538)
chr8 (74-230)||(31457155-31457308)
chr8 (68-232)||(44742515-44742678)
chr8 (68-217)||(22598133-22598279)
chr8 (122-232)||(10857858-10857967)
chr8 (69-218)||(24365071-24365218)
chr8 (122-226)||(17250879-17250982)
chr8 (153-232)||(16013515-16013594)
chr8 (93-219)||(389644-389770)
chr8 (134-230)||(19729382-19729476)
chr8 (71-184)||(35105902-35106014)
chr8 (116-189)||(43942348-43942421)
chr8 (152-231)||(26102577-26102654)
chr8 (68-228)||(42083699-42083858)
chr8 (122-224)||(5689661-5689761)
chr8 (64-185)||(11748271-11748392)
chr8 (78-229)||(23000228-23000365)
chr8 (64-230)||(40604905-40605068)
chr8 (68-208)||(14017989-14018128)
chr8 (64-210)||(24245423-24245565)
chr8 (116-229)||(33866973-33867087)
chr8 (180-231)||(27468090-27468141)
chr8 (169-228)||(27507985-27508044)
chr8 (167-230)||(35107310-35107373)
chr8 (70-165)||(36918102-36918197)
chr8 (139-231)||(26457776-26457864)
chr8 (71-151)||(30962849-30962929)
chr8 (68-181)||(11000997-11001109)
chr8 (168-228)||(36486567-36486627)
chr8 (67-110)||(40607841-40607884)
chr8 (187-229)||(23286337-23286379)
chr8 (167-231)||(2351719-2351780)
chr8 (174-231)||(18595918-18595975)
[»] chr4 (95 HSPs)
chr4 (64-231)||(16408599-16408766)
chr4 (64-226)||(21646936-21647098)
chr4 (64-231)||(23501765-23501926)
chr4 (64-233)||(13256395-13256560)
chr4 (64-229)||(20224956-20225117)
chr4 (64-232)||(5648231-5648396)
chr4 (64-228)||(6430627-6430788)
chr4 (243-365)||(33049064-33049187)
chr4 (64-230)||(16911534-16911700)
chr4 (64-231)||(48598823-48598986)
chr4 (65-229)||(44363130-44363294)
chr4 (64-231)||(47528528-47528691)
chr4 (64-231)||(30639352-30639516)
chr4 (114-231)||(20639656-20639772)
chr4 (68-231)||(35567146-35567307)
chr4 (64-231)||(11054146-11054309)
chr4 (67-219)||(19027823-19027973)
chr4 (64-231)||(10660376-10660543)
chr4 (64-231)||(10874521-10874688)
chr4 (137-229)||(20225119-20225211)
chr4 (64-229)||(20405065-20405224)
chr4 (65-228)||(40915802-40915962)
chr4 (93-231)||(47443958-47444094)
chr4 (72-232)||(54175043-54175203)
chr4 (64-228)||(8473621-8473783)
chr4 (72-231)||(17043393-17043549)
chr4 (64-231)||(5306658-5306826)
chr4 (64-230)||(14983806-14983970)
chr4 (70-232)||(9832310-9832468)
chr4 (64-215)||(37494823-37494972)
chr4 (78-232)||(25463108-25463259)
chr4 (114-232)||(25629071-25629187)
chr4 (123-229)||(48327763-48327869)
chr4 (88-227)||(29207900-29208035)
chr4 (70-229)||(30690176-30690340)
chr4 (68-231)||(54730225-54730389)
chr4 (64-231)||(30352578-30352754)
chr4 (68-226)||(54966997-54967151)
chr4 (114-231)||(9987832-9987947)
chr4 (67-231)||(25343162-25343326)
chr4 (70-213)||(30581481-30581624)
chr4 (73-231)||(39077794-39077948)
chr4 (152-231)||(33836485-33836564)
chr4 (68-211)||(39029078-39029220)
chr4 (116-230)||(51865037-51865149)
chr4 (68-220)||(487135-487294)
chr4 (71-211)||(49938611-49938746)
chr4 (68-231)||(20908634-20908797)
chr4 (70-229)||(32478792-32478942)
chr4 (71-218)||(30496333-30496476)
chr4 (64-178)||(14590809-14590922)
chr4 (168-231)||(32484307-32484370)
chr4 (64-229)||(55766466-55766629)
chr4 (134-220)||(16494259-16494345)
chr4 (114-224)||(21489109-21489218)
chr4 (75-216)||(41018807-41018945)
chr4 (164-229)||(38755908-38755973)
chr4 (114-228)||(7909281-7909393)
chr4 (167-231)||(38786682-38786746)
chr4 (68-152)||(43035224-43035308)
chr4 (68-151)||(42164225-42164307)
chr4 (75-206)||(7385499-7385628)
chr4 (129-232)||(10277754-10277855)
chr4 (68-191)||(47441568-47441689)
chr4 (64-229)||(55830721-55830884)
chr4 (80-230)||(7038041-7038188)
chr4 (167-229)||(11394925-11394987)
chr4 (167-229)||(11404652-11404714)
chr4 (68-154)||(17315372-17315457)
chr4 (133-231)||(36816382-36816479)
chr4 (178-232)||(56322984-56323038)
chr4 (70-231)||(23580206-23580365)
chr4 (168-229)||(40553937-40553998)
chr4 (168-229)||(44718641-44718702)
chr4 (69-209)||(3580860-3580994)
chr4 (167-231)||(28494224-28494288)
chr4 (114-208)||(49796820-49796911)
chr4 (136-229)||(2813169-2813263)
chr4 (116-228)||(12711450-12711561)
chr4 (169-231)||(19027986-19028048)
chr4 (167-229)||(25388249-25388311)
chr4 (72-164)||(51420553-51420646)
chr4 (179-231)||(35532077-35532129)
chr4 (114-226)||(36589765-36589876)
chr4 (67-191)||(44357195-44357318)
chr4 (164-231)||(50555654-50555721)
chr4 (161-230)||(47482849-47482918)
chr4 (101-184)||(17079696-17079777)
chr4 (77-213)||(32629285-32629418)
chr4 (164-215)||(8820578-8820629)
chr4 (126-185)||(35894505-35894563)
chr4 (62-108)||(5313113-5313159)
chr4 (68-137)||(54640429-54640498)
chr4 (168-228)||(21003410-21003469)
chr4 (177-229)||(34256982-34257034)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (64-230)||(4619103-4619269)
chr5 (64-230)||(38879553-38879719)
chr5 (64-230)||(41014291-41014454)
chr5 (64-231)||(24448862-24449027)
chr5 (64-232)||(43334174-43334342)
chr5 (72-228)||(12006329-12006485)
chr5 (101-229)||(13801767-13801895)
chr5 (67-230)||(27328727-27328890)
chr5 (64-232)||(8169981-8170145)
chr5 (64-231)||(35710285-35710448)
chr5 (114-228)||(20135626-20135740)
chr5 (79-230)||(32703411-32703558)
chr5 (68-230)||(28516432-28516593)
chr5 (64-229)||(1565403-1565566)
chr5 (68-220)||(208936-209086)
chr5 (62-209)||(22600424-22600569)
chr5 (68-220)||(39301099-39301249)
chr5 (114-226)||(7368420-7368528)
chr5 (95-220)||(43574609-43574732)
chr5 (75-231)||(1405170-1405324)
chr5 (117-229)||(16880647-16880757)
chr5 (64-229)||(22187257-22187422)
chr5 (68-151)||(23974756-23974839)
chr5 (96-189)||(41425952-41426043)
chr5 (67-231)||(19142941-19143102)
chr5 (114-230)||(29334417-29334532)
chr5 (138-229)||(34154814-34154903)
chr5 (88-229)||(42924830-42924973)
chr5 (158-229)||(25622524-25622595)
chr5 (153-230)||(16957375-16957450)
chr5 (64-225)||(30006297-30006456)
chr5 (64-157)||(37024626-37024717)
chr5 (76-219)||(1850624-1850764)
chr5 (116-217)||(7097772-7097870)
chr5 (96-231)||(11657697-11657835)
chr5 (170-231)||(16028622-16028683)
chr5 (68-206)||(2838754-2838890)
chr5 (114-229)||(12575660-12575775)
chr5 (114-209)||(24323725-24323818)
chr5 (114-209)||(24360349-24360442)
chr5 (132-230)||(3771379-3771475)
chr5 (134-219)||(9794388-9794471)
chr5 (64-230)||(22861668-22861829)
chr5 (169-230)||(39801591-39801652)
chr5 (165-229)||(30877564-30877628)
chr5 (77-189)||(22907904-22908014)
chr5 (114-229)||(5873322-5873434)
chr5 (173-231)||(10943843-10943900)
chr5 (88-150)||(22025539-22025601)
chr5 (128-217)||(31694120-31694207)
chr5 (154-210)||(10306493-10306548)
chr5 (116-231)||(24903694-24903807)
chr5 (178-230)||(32354211-32354263)
chr5 (167-226)||(21784335-21784394)
chr5 (143-217)||(12477132-12477205)
chr5 (70-230)||(24313571-24313732)
chr5 (70-230)||(24355908-24356069)
chr5 (72-220)||(34074573-34074717)
chr5 (72-149)||(10634224-10634301)
chr5 (67-108)||(31362454-31362495)
chr5 (196-228)||(29184062-29184094)
chr5 (165-217)||(29297862-29297914)
chr5 (167-217)||(4654427-4654477)
chr5 (193-227)||(11462924-11462958)
chr5 (182-224)||(18684361-18684403)
chr5 (68-110)||(39079883-39079925)
chr5 (129-182)||(2432342-2432395)
chr5 (187-228)||(19438759-19438800)
chr5 (175-231)||(19093894-19093950)
chr5 (153-225)||(39079755-39079826)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (64-230)||(12221913-12222080)
chr6 (75-232)||(29355852-29356009)
chr6 (64-231)||(2166408-2166575)
chr6 (64-231)||(2178041-2178208)
chr6 (64-231)||(1346936-1347099)
chr6 (64-230)||(1354756-1354918)
chr6 (68-231)||(9161099-9161261)
chr6 (68-225)||(14975094-14975239)
chr6 (64-197)||(6024205-6024338)
chr6 (64-231)||(1941827-1941992)
chr6 (156-231)||(12892071-12892146)
chr6 (114-232)||(26097182-26097296)
chr6 (114-232)||(25557747-25557861)
chr6 (64-222)||(3815084-3815240)
chr6 (88-229)||(7947371-7947511)
chr6 (68-165)||(13905041-13905138)
chr6 (148-230)||(12885967-12886049)
chr6 (69-230)||(32728156-32728314)
chr6 (64-160)||(8409215-8409311)
chr6 (64-207)||(14553484-14553626)
chr6 (93-231)||(18277191-18277327)
chr6 (67-162)||(20400642-20400737)
chr6 (64-231)||(24097553-24097714)
chr6 (68-229)||(12889402-12889562)
chr6 (64-227)||(15866041-15866200)
chr6 (68-228)||(2755422-2755583)
chr6 (122-220)||(19340858-19340954)
chr6 (97-218)||(33138838-33138957)
chr6 (166-231)||(6808467-6808532)
chr6 (70-230)||(28007604-28007761)
chr6 (88-229)||(17432336-17432483)
chr6 (116-231)||(9671082-9671196)
chr6 (70-230)||(23930126-23930283)
chr6 (88-231)||(3116127-3116262)
chr6 (155-232)||(13267788-13267863)
chr6 (141-212)||(32579474-32579543)
chr6 (153-229)||(383760-383834)
chr6 (174-231)||(20906784-20906841)
chr6 (64-211)||(24734605-24734760)
chr6 (114-185)||(11849075-11849145)
chr6 (70-157)||(22967149-22967235)
chr6 (78-227)||(23240826-23240971)
chr6 (70-157)||(23821158-23821244)
chr6 (120-182)||(32068121-32068182)
chr6 (169-229)||(10734905-10734965)
chr6 (93-157)||(17448325-17448389)
chr6 (149-222)||(16895704-16895778)
chr6 (194-232)||(25997749-25997787)
chr6 (152-219)||(16915996-16916064)
chr6 (114-182)||(31990096-31990163)
chr6 (125-231)||(24751066-24751176)
chr6 (196-231)||(30786372-30786407)
chr6 (169-219)||(11395836-11395886)
chr6 (133-227)||(18254559-18254651)
chr6 (170-232)||(33922854-33922916)
chr6 (114-234)||(12228380-12228498)
chr6 (64-120)||(8417444-8417500)
chr6 (131-163)||(14341134-14341166)
chr6 (174-210)||(29016301-29016337)
[»] chr2 (70 HSPs)
chr2 (64-229)||(14530290-14530455)
chr2 (64-229)||(10543670-10543835)
chr2 (64-230)||(8455315-8455479)
chr2 (70-230)||(5841006-5841166)
chr2 (58-230)||(24200622-24200794)
chr2 (64-230)||(11514408-11514571)
chr2 (64-231)||(17667974-17668139)
chr2 (64-230)||(21779260-21779422)
chr2 (64-229)||(25079717-25079881)
chr2 (67-229)||(40416871-40417031)
chr2 (68-230)||(9671156-9671315)
chr2 (67-231)||(25249736-25249897)
chr2 (64-231)||(17623536-17623701)
chr2 (83-231)||(10546153-10546300)
chr2 (66-230)||(39914305-39914467)
chr2 (64-229)||(23397738-23397899)
chr2 (83-231)||(14444720-14444865)
chr2 (64-232)||(17896231-17896398)
chr2 (70-232)||(31158436-31158598)
chr2 (64-219)||(12023929-12024081)
chr2 (64-231)||(7214506-7214673)
chr2 (67-209)||(32781308-32781448)
chr2 (68-232)||(21377071-21377232)
chr2 (64-232)||(27573593-27573758)
chr2 (68-209)||(33795261-33795400)
chr2 (64-191)||(22371029-22371151)
chr2 (114-231)||(36871515-36871628)
chr2 (64-231)||(19977712-19977877)
chr2 (64-231)||(24859986-24860149)
chr2 (114-229)||(40762234-40762347)
chr2 (68-226)||(4516354-4516510)
chr2 (67-230)||(44643497-44643659)
chr2 (70-184)||(5450263-5450376)
chr2 (81-217)||(19614981-19615116)
chr2 (67-229)||(14544038-14544201)
chr2 (68-210)||(44521392-44521532)
chr2 (69-213)||(99281-99421)
chr2 (64-164)||(17705467-17705567)
chr2 (132-216)||(24890451-24890533)
chr2 (64-234)||(26684615-26684785)
chr2 (68-191)||(23145736-23145857)
chr2 (68-191)||(23557526-23557647)
chr2 (127-229)||(25632544-25632644)
chr2 (63-146)||(44604825-44604907)
chr2 (72-229)||(17380238-17380391)
chr2 (114-231)||(30826059-30826172)
chr2 (169-230)||(34080176-34080237)
chr2 (68-165)||(29419947-29420048)
chr2 (155-230)||(23488544-23488619)
chr2 (77-231)||(25641487-25641638)
chr2 (168-227)||(41409936-41409995)
chr2 (175-229)||(3633708-3633762)
chr2 (86-219)||(17471542-17471675)
chr2 (168-228)||(40579750-40579810)
chr2 (101-231)||(15296404-15296533)
chr2 (169-231)||(34766330-34766392)
chr2 (178-231)||(39189502-39189555)
chr2 (116-217)||(44449395-44449495)
chr2 (141-228)||(13245096-13245181)
chr2 (165-230)||(1289093-1289159)
chr2 (181-230)||(22371199-22371248)
chr2 (69-231)||(45235815-45235976)
chr2 (174-229)||(8575975-8576030)
chr2 (167-226)||(31525779-31525838)
chr2 (167-221)||(31523304-31523358)
chr2 (181-225)||(124918-124962)
chr2 (135-229)||(19185743-19185837)
chr2 (182-232)||(23052962-23053012)
chr2 (167-216)||(4794875-4794924)
chr2 (93-165)||(12315714-12315785)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (67-231)||(46806-46968)
scaffold0057 (64-231)||(24770-24930)
scaffold0057 (139-215)||(46721-46796)
scaffold0057 (114-230)||(43681-43794)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (64-229)||(58949-59114)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (64-230)||(10782-10946)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (64-231)||(30551-30714)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (68-232)||(13021-13182)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (67-225)||(1591-1745)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (64-227)||(10052-10211)
scaffold0187 (64-227)||(20380-20539)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (101-230)||(48633-48758)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (64-229)||(11104-11264)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (64-191)||(4129-4257)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (140-231)||(24131-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (123-229)||(72867-72971)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (64-178)||(226456-226569)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (99-190)||(23606-23695)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (64-184)||(35062-35182)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (122-229)||(3574-3679)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (68-179)||(32906-33016)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (66-136)||(8865-8935)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (64-110)||(83847-83893)
[»] scaffold0194 (2 HSPs)
scaffold0194 (70-110)||(24642-24682)
scaffold0194 (140-231)||(24696-24785)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (64-136)||(43101-43173)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 62 - 365
Target Start/End: Original strand, 42805494 - 42805797
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42805494 gtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaataca 42805593  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtgaaaattataaaaataatatttctaac 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42805594 ccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtgaaaattataaaaataatatttctaag 42805693  T
Q  262 tgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaaccgcacactgtttcaaatgtctc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42805694 tgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaaccgcacactgtttcaaatgtctt 42805793  T
Q  362 tgct 365  Q
    ||||    
T  42805794 tgct 42805797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 47716431 - 47716596
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47716431 aactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 47716530  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47716531 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 47716596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21172170 - 21172008
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  21172170 aactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 21172073  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21172072 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21172008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 46354166 - 46354302
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46354166 aactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 46354265  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46354266 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 42798641 - 42798807
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42798641 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc 42798740  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42798741 a--aatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttttta 42798807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 43557444 - 43557612
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43557444 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatacacc 43557543  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43557544 aataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttttt 43557612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2541183 - 2541019
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaa-ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2541183 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtactatacac 2541084  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2541083 ca--aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttt 2541019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11617751 - 11617589
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11617751 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 11617652  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11617651 a--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 32758233 - 32758396
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  32758233 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgtgtacaatacacc 32758330  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32758331 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 32758396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48735284 - 48735122
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  48735284 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacac--ggtaaggctgcgtacaatacac 48735187  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48735186 caa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48735122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 27629606 - 27629771
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  27629606 aactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtaaaatacacc 27629705  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27629706 a--aatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 27629771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10693234 - 10693073
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  10693234 aactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaga--gggtaaggctgcgtacaatacacc 10693137  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10693136 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttt 10693073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391098
Alignment:
Q  74 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 173  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtg 42391156  T
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42391155 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 42391098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19427052 - 19426888
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  19427052 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacacc 19426953  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19426952 a--aatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 19426888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871914
Alignment:
Q  66 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacca- 33871973  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33871972 -aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcc 33871914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879775
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 7879736  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7879737 gcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 7879775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 365
Target Start/End: Original strand, 42763053 - 42763191
Alignment:
Q  230 ttagtgaaaattataaaaataatatttctaac---tgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcact 326  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||    
T  42763053 ttagtaaaaattataaaattaatatttctaaaaagtgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatctagctcttgcatatcttaagcgct 42763152  T
Q  327 ccataccttgaaccgcacactgtttcaaatgtctctgct 365  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  42763153 ccataccttgaactgcacacagtttcaaatgtctttgct 42763191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 40463853 - 40464012
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||  |    
T  40463853 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgcgtataatacacca--a 40463949  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40463950 atggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgccctttt 40464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22699133 - 22698967
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22699133 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 22699034  T
Q  164 aataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    || |||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22699033 aaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 22698967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35334977 - 35334818
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  35334977 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc--gtgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacacc 35334880  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
     |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35334879 ga--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaa-a 16341352  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16341353 atggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgt--catgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907493 -aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 42476843 - 42477005
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42476843 gtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 42476940  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||  |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42476941 cca--aatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23419833 - 23419674
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  23419833 ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--a 23419736  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  23419735 atggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttt 23419674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265950
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19265887  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19265888 atggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34626370 - 34626206
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | |||||||   ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  34626370 aactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgttcaatacacc 34626272  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34626271 aa--atggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttttt 34626206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28362304 - 28362155
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  28362304 ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtacaatacacca--a 28362207  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28362206 atggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagcttt-gtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262194
Alignment:
Q  83 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacacca--aatgatgggacccctt 38262243  T
Q  183 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||  || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38262242 cccgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 38262194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47078016 - 47077853
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  47078016 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaatagagtaaagttgcgtacaatacac- 47077920  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  47077919 -aaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgcctttttt 47077853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18512586 - 18512455
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  18512586 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaat-agggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttcccggaccct 18512490  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18512489 gcgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31591241 - 31591108
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||      
T  31591241 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagagtaaggctgcgtacaatacaataa--atggtgggaccccttcccggacctt 31591146  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31591145 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 31591108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14732985 - 14732821
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||   ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14732985 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggctgcgt-caatacacc 14732887  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    || |||||||  || |||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14732886 aaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccggattgtccttt 14732821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 176  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaat--tggtggga 18747569  T
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18747570 ccccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3469338 - 3469176
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa--cagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||    ||||||  |||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  3469338 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgtacaatacaccaa 3469239  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3469238 aaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233133
Alignment:
Q  75 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 174  Q
    |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||  |||||||    
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggcagcgtatattacaccaa--atggtgg 32233190  T
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32233189 gattccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttttt 32233133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  96 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 195  Q
    ||||| |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtaggaccccttcccgaaccctgca 21566537  T
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21566538 tatgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 228
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatg 11741869  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11741870 gtgggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1424073 - 1423967
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1424073 aactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgcatacactacacc 1423974  T
Q  164 aataatg 170  Q
    |||||||    
T  1423973 aataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48123643 - 48123508
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  48123643 ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcatacaatacacca--a 48123546  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggag 205  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||    
T  48123545 atggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 12473280 - 12473377
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12473280 ggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaa 12473377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 208
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266564
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||   | ||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19266523  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 208  Q
    || |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19266524 attgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5180320 - 5180169
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  5180320 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaagactgtgtacaacacacc 5180221  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    || |||| | ||||||||| ||| | ||  | ||||| ||||||||| ||||    
T  5180220 aaaaatgattggacccctttccaaatcctacgtatgcaggagctttaatgca 5180169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8149109 - 8148985
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtg-taaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||   | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  8149109 aactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacac 8149010  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagac 189  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  8149009 ca--aatggtgggaccccttcccagac 8148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099050
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14099068  T
Q  168 atggtgggaccccttccc 185  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14099067 atggtgggaccccttccc 14099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409067
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14409085  T
Q  168 atggtgggaccccttccc 185  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14409084 atggtgggaccccttccc 14409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 18327006 - 18327091
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18327006 aactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124031
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta----aggctgcatacaatacac 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    |||||   |||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaa-cagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcaccaagctgccctttt 39124031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaa- 7645029  T
Q  167 aatggtgggaccccttcc 184  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7645030 aattgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 13805077 - 13805237
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||      
T  13805077 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggtaaggctgtgtacaatacacca-- 13805173  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  13805174 aatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcactgggctacccttttt 13805237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Original strand, 38604549 - 38604654
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  38604549 ggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagt 38604645  T
Q  213 gcaccgggt 221  Q
    |||||||||    
T  38604646 gcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889314
Alignment:
Q  144 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttttt 27889314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28078286 - 28078151
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||  ||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  28078286 aagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgta-aaaaaacagggtaaggttgcatgcaatacacca--aatgg 28078190  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||    
T  28078189 tgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttta 28078151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2663094 - 2662946
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  2663094 aactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaata--gggtaaggctgcgtacaatacacc 2662999  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    |  |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2662998 a--aatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787268
Alignment:
Q  117 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | |||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcac 35787282  T
Q  217 cgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||    
T  35787281 cgggttgccctttt 35787268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 150
Target Start/End: Original strand, 7193055 - 7193143
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7193055 gtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaacaatatggtaaggctg 7193143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7794669 - 7794582
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggct 149  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  7794669 aactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaaaacagggtaaggct 7794582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Original strand, 35203440 - 35203531
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 184  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  35203440 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 1408487 - 1408594
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| |||||| |    
T  1408487 cctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaatctttagttcaccggat 1408584  T
Q  222 tgcccttttt 231  Q
    |||| |||||    
T  1408585 tgcctttttt 1408594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736962
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaa 6736962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018923
Alignment:
Q  144 aaggctgcatacaatacaccaataa--tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42495998 - 42495916
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  42495998 aactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggtaagg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||| |||| ||| | || |    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaa-a 42101946  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 214  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  42101945 gtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 149
Target Start/End: Original strand, 5814447 - 5814528
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 149  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5814447 ggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggct 5814528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602584
Alignment:
Q  182 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 36602584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093436
Alignment:
Q  135 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacacca-taatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttttta 39093436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792147
Alignment:
Q  128 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacaccca-aatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgagctgccct 13792152  T
Q  228 tttta 232  Q
    |||||    
T  13792151 tttta 13792147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 23231587 - 23231692
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23231587 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagt 23231684  T
Q  222 tgcccttt 229  Q
    | ||||||    
T  23231685 ttcccttt 23231692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500645
Alignment:
Q  135 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggatcttcagtg--ccgggttgccc 33500645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 21447562 - 21447636
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac 138  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||| |||||||||||||||||    
T  21447562 aactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 27697459 - 27697572
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt--gggacccctt-cccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |    
T  27697459 ggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctg--tgtaatacaccaa-aatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcgggagcttaa 27697555  T
Q  211 gtgcaccgggttgccct 227  Q
     ||||||||| ||||||    
T  27697556 atgcaccgggatgccct 27697572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23619039 - 23618974
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23619039 aatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgcccttttta 23618974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 159
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065654
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaata 159  Q
    ||||||||||||||||| || | || || |||| | ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgt-aaaaatagggtaaagctgcatacaata 22065654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123685
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggttgcatgaaatacacca 44123685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 45811920 - 45811983
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45811920 aatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgcccttttt 45811983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29140523 - 29140438
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||   | |||||| |||||  |||||||| | |||||||||    
T  29140523 aactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacacattcaagttttgaaaacaatctcttaggtaaaaaataaggtaaggct 29140438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44171668 - 44171635
Alignment:
Q  198 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44171668 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 44171635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17048914 - 17048859
Alignment:
Q  129 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 185  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17048914 tgtaaaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaa-aatggtggaaccccttccc 17048859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23066029 - 23065924
Alignment:
Q  123 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  23066029 ctcttgtttaaaaaacaggataaagttgcgtacaatacacca--tatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggatt 23065932  T
Q  223 gccctttt 230  Q
    ||||||||    
T  23065931 gccctttt 23065924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 25198799 - 25198863
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25198799 aatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcacttttt 25198863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 218
Target Start/End: Original strand, 25434050 - 25434144
Alignment:
Q  123 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25434050 ctcttgtgcaaaaaacatggtaagagtgcatacaacacaccaa-aatggtatgacttcttcttggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 25434144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  123 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  || | |  ||||||| |||||||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaa--atggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495865
Alignment:
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccccgttgccc 42495865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13730767 - 13730600
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13730767 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc 13730668  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13730667 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 13730600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40272975 - 40272810
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40272975 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 40272876  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40272875 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 40272810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13628948 - 13628789
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13628948 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 13628849  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13628848 gtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13628789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29366887 - 29366719
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29366887 gtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgtacaataca 29366788  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29366787 ccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccctttt 29366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46421200 - 46421032
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46421200 aactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 46421101  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46421100 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttttt 46421032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8247852 - 8247688
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8247852 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacc 8247753  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgccct 227  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8247752 aataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49013588 - 49013471
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49013588 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtg 49013489  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49013488 caccgggttgcccttttt 49013471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 1217084 - 1217248
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  1217084 aactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 1217181  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1217182 aa--atggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttta 1217248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 212
Target Start/End: Original strand, 9607197 - 9607345
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9607197 aacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtagaatacacc 9607296  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9607297 aataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996562
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaa-a 53996627  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53996626 atggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttta 53996562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5173876 - 5173717
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5173876 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-caaagtaaggttgcatgcaatacaccaaaaatg 5173778  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5173777 gtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 5173717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353351
Alignment:
Q  128 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12914198 - 12914034
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12914198 aactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcggcgtacaatacacc 12914099  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12914098 a--aatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccctttt 12914034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516571
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc-aataatggtggga 176  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 22609764 - 22609921
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||      
T  22609764 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-- 22609860  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22609861 atggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 26869701 - 26869865
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26869701 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 26869799  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26869800 a--aatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttttt 26869865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 14987001 - 14987116
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  14987001 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcgggagctttagtg 14987100  T
Q  214 caccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14987101 caccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420640
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaa-aa 34420704  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  34420703 tggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttttta 34420640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 39203510 - 39203671
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  39203510 aacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggttgcgtacaatacacc 39203607  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203608 aa--atggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139479
Alignment:
Q  81 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 180  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaacttt-gtgcaccgggctgccctt 45139479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22123077 - 22122918
Alignment:
Q  65 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123077 actggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 22122980  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22122979 a--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 26573125 - 26573282
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26573125 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat- 26573223  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
     |||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26573224 -tggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccct 26573282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6411984 - 6411833
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6411984 aactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 6411886  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6411885 a--aatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786214
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  216 ccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||    
T  45786227 ccgggttgcccttt 45786214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45948974 - 45948848
Alignment:
Q  91 ggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 190  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  45948974 ggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcggacc 45948877  T
Q  191 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  45948876 ctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52926373 - 52926217
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||         |||||||||| |||||||||||    
T  52926373 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaaggctgcgtacaatacacc 52926283  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52926282 aa--atggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttttt 52926217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795423
Alignment:
Q  98 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 197  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  198 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttt 10795423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54374485 - 54374343
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  54374485 actgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaa-aatggtgggaccccttcccgg 54374387  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||    
T  54374386 accctgcatatgcgggagctttagttcaccaggctgccattttt 54374343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 54484734 - 54484851
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  54484734 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagt 54484831  T
Q  213 gcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54484832 gcaccgggttgcccttttta 54484851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943149
Alignment:
Q  73 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatca--aatggt 7943090  T
Q  173 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7943091 gggatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcctttttt 7943149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 16735435 - 16735598
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16735435 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc 16735533  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16735534 aa--atggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccctttt 16735598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  99 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatat 198  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggactccttcccggaccctgcatat 31592973  T
Q  199 gcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31592974 gcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4495827 - 4495674
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4495827 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 4495728  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||            ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4495727 a--aatggtgg------------gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 4495674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944629
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||   ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaa-aa 25944566  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25944567 tggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgcccttttt 25944629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032570
Alignment:
Q  81 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||          
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtgg------ 54032614  T
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
          ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54032613 ------gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 54032570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Original strand, 15797274 - 15797379
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15797274 cctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggt 15797369  T
Q  222 tgcccttttt 231  Q
    ||||||||||    
T  15797370 tgcccttttt 15797379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25517336 - 25517169
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag--ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   ||||||| |||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||    
T  25517336 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagatatggctgcgtacaatac 25517237  T
Q  161 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    || ||  |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25517236 acaaa--atggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccctttt 25517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771361
Alignment:
Q  134 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttta 34771361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7697048 - 7696893
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7697048 aactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 7696951  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |  |||||     ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7696950 a--aatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928167
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||  |||    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaat--tgg 30928205  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  30928204 cgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 30928167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  81 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 180  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacaatacacca-taatggtgggacccc 33926191  T
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33926192 ttcctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45620988 - 45620889
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45620988 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 45620889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10870114 - 10870028
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10870114 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgc 10870028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 225
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||| ||||||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19731098 ttggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24851363 - 24851299
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851363 aatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 24851299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 230
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452953
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30452953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 829555 - 829452
Alignment:
Q  115 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  829555 gaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgc 829457  T
Q  215 accgg 219  Q
    |||||    
T  829456 accgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 9276316 - 9276419
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  9276316 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta-tgcgcagggt 9276411  T
Q  222 tgcccttt 229  Q
    ||||||||    
T  9276412 tgcccttt 9276419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 231
Target Start/End: Original strand, 12525414 - 12525566
Alignment:
Q  77 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 176  Q
    |||||||| | |||| |||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    | |||||||| ||||||||||    
T  12525414 gttgtcatatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgc--gaagtacaccaaaaatggtggga 12525511  T
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    | |||||| |||||| |  ||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  12525512 caccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctcttttt 12525566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Original strand, 55401222 - 55401330
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||||||||  ||||    
T  55401222 aaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaa-aatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcgggagcttttttgca 55401320  T
Q  216 ccgggttgcc 225  Q
    ||||| ||||    
T  55401321 ccgggctgcc 55401330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624160
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccc 47624160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44403661 - 44403552
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||| | |||||||||||||||||     
T  44403661 cctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaa-aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggc 44403563  T
Q  222 tgcccttttta 232  Q
    |||| ||||||    
T  44403562 tgcctttttta 44403552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Original strand, 33235526 - 33235687
Alignment:
Q  66 ctggtaaagttgttgtcatgtaac-tggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||| |   | ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||     
T  33235526 ctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacact 33235625  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||  |||||||||||||| | ||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33235626 aa--atggtgggacccct-cgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50625065 - 50624951
Alignment:
Q  115 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| |  ||||||||| ||||||  | ||| || || | ||||||||||||||    
T  50625065 gaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatt--tggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagctttagtgc 50624968  T
Q  215 accgggttgcccttttt 231  Q
    |||||| ||||||||||    
T  50624967 accgggctgcccttttt 50624951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484615
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10484615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 24577930 - 24577994
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24577930 aatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 24577994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 24578020 - 24578084
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24578020 aatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgcccttttt 24578084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 26292384 - 26292490
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26292384 cctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacgatacaccaa--atgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggt 26292479  T
Q  222 tgcccttttta 232  Q
    || ||||||||    
T  26292480 tgtccttttta 26292490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31904970 - 31904857
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||||||||||    
T  31904970 ggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacca--aatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagctttagt 31904873  T
Q  213 gcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||| || |||||||    
T  31904872 gcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 35417999 - 35418063
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  35417999 aatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgcccatttt 35418063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410887
Alignment:
Q  76 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 175  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||   ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacacca--actggtggg 8410921  T
Q  176 accccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8410920 acctcttctcagaccctgcataggcggaagcttt 8410887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 225
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751731
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||| || |||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19751673  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
     ||||||||||| |||||||||   |  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19751674 ttggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 26782363 - 26782461
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26782363 tggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgctgtataaaatacaccaa 26782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624258
Alignment:
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 47624258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10795913 - 10795876
Alignment:
Q  30 ctgacaatctttgctttaacttgtactctgatgtaact 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10795913 ctgacaatctttgctttaacttgtactctgatgtaact 10795876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 162
Target Start/End: Original strand, 21875014 - 21875106
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21875014 aactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaaggctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43114983 - 43114882
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagg-ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc-gcatatgcgggagcttta 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  43114983 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaa--atggtgggaccc-ttcctggacccctgcgtatgcgggagcttta 43114887  T
Q  211 gtgca 215  Q
    |||||    
T  43114886 gtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52428627 - 52428539
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52428627 ttgtcacgtagctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 52428539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 231
Target Start/End: Original strand, 40390365 - 40390400
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390365 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 40390400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 40968613 - 40968676
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  40968613 aatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgcatcgagctgccctttt 40968676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Original strand, 35417914 - 35417988
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 142  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35417914 ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6242327 - 6242283
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6242327 gaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 6242283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 31831243 - 31831292
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31831243 ggaaacagcctcttgtgtaaaata--gggtaaggctgcatacaatacaccaa 31831292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43956514 - 43956470
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43956514 gacccagcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 43956470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 31831301 - 31831343
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31831301 gaccctgcatatgcgggtgctctagtgcaccgggttgcccttt 31831343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10696272 - 10696211
Alignment:
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  10696272 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtctacgggagcattagtgcactaggctgcccttttt 10696211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14266405 - 14266372
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14266405 tatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Original strand, 16130312 - 16130432
Alignment:
Q  107 aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 206  Q
    |||||| | ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||  || ||  | |||||    
T  16130312 aagtgatgaaaacatcgtcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacaccaa-aatggtgggaccctgtcctagaccttgcgtacacaggagc 16130410  T
Q  207 tttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||  ||| |||||||    
T  16130411 tttagtgcattgggctgccctt 16130432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 229
Target Start/End: Original strand, 23871490 - 23871523
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23871490 tatgcgggaactttagtgcaccgggttgcccttt 23871523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 29106555 - 29106644
Alignment:
Q  76 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||    
T  29106555 tgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaa 29106644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 32418221 - 32418329
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||   ||| |||| |  |||||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||||||| || || ||    
T  32418221 gtaaagttgttgtcaagtgactgaaatgtcattagtttaagtcatagaaacaacctcttacataaaaatcaggataagactgcatacaataaacaaaaaa 32418320  T
Q  169 tggtgggac 177  Q
    |||||||||    
T  32418321 tggtgggac 32418329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46170029 - 46169981
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  46170029 aatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttcagtgca 46169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20004255 - 20004089
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20004255 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc 20004156  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20004155 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 20004089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30395891 - 30395725
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30395891 aactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 30395792  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30395791 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 30395725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 18944638 - 18944806
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18944638 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 18944737  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18944738 aacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttttt 18944806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 46991799 - 46991964
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46991799 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc 46991898  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46991899 --gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccatttt 46991964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46248116 - 46247951
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46248116 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 46248017  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46248016 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 46247951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23768483 - 23768325
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23768483 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 23768384  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 224  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23768383 a--aatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34725259 - 34725097
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||     
T  34725259 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacact 34725162  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34725161 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 34725097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 10668215 - 10668386
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaa-----ctggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  10668215 aactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaat 10668314  T
Q  159 acaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10668315 acaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Original strand, 35005142 - 35005284
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35005142 actgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccgg 35005241  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35005242 accctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgccctttt 35005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Original strand, 27201640 - 27201809
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27201640 gtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaaggctgcgtacaataca 27201739  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27201740 ccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttttt 27201809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32632719 - 32632556
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32632719 aactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 32632621  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32632620 a--aatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttccctttt 32632556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925260
Alignment:
Q  65 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
      ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcctttttt 6925260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 14617037 - 14617197
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  14617037 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaaggttgcgtacaatacacca--a 14617134  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14617135 atggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 14617197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18742124 - 18741954
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt-gagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||||  || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18742124 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaataca 18742025  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18742024 ccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttttta 18741954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38478443 - 38478280
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  38478443 aactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 38478346  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38478345 aa--atggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 38478280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45812698 - 45812535
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   | |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  45812698 aactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaaga--gggtaaggctgcatacaatacacc 45812601  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45812600 aa--atggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 45812535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 47214506 - 47214669
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  47214506 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaa--cagggtaaggttgcgtacaatacacc 47214603  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  47214604 aa--atggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattacccttttt 47214669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19932915 - 19932755
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19932915 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtt--ggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 19932819  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  || | |||||||||| |||||||||    
T  19932818 aaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41319969 - 41319805
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41319969 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 41319870  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  |||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  41319869 a--aatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccctttt 41319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 235
Target Start/End: Original strand, 9939463 - 9939628
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9939463 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttgcgtgcaatacaccaaaaatg 9939562  T
Q  171 gtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtg 235  Q
    |||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9939563 gtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttaagtg 9939628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12126998 - 12126836
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12126998 aactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 12126901  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  12126900 aa--attgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgccctttt 12126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 45402090 - 45402256
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt--aagg-ctgcatacaatac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||  |||| ||||||||    
T  45402090 aactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggttcaagttctgcgtacaatac 45402187  T
Q  161 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45402188 accaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccgtttt 45402256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 27474276 - 27474439
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||     
T  27474276 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggcaaagctgcgtacaatacact 27474374  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
     |  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27474375 ga--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 27474439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724565
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 18724607  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18724606 atcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagcttt 18724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 19414432 - 19414596
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    |||| | |||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19414432 gtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt--aaaacaggttaaggctgcgtacaataca 19414529  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19414530 cca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 19414596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcat-atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253184
Alignment:
Q  83 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccctt 35253234  T
Q  183 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35253233 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttta 35253184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349796
Alignment:
Q  130 gtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4349796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacca--aa 25468324  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 207  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25468323 tggttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701731
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaa-aa 19701668  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19701669 tggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctacccttttt 19701731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 8197038 - 8197203
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || ||   |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  8197038 aactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctacgtacagtacacc 8197137  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||| |||||||||| | ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8197138 aa--atggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 8197203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 35019229 - 35019389
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  35019229 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcatacaatacaccaat- 35019327  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
     |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35019328 -tggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgccattttt 35019389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45264534 - 45264411
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    ||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  45264534 aaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaa-aatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2435946 - 2435796
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  2435946 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtacaatacaccaa-a 2435848  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  2435847 atggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 23796510 - 23796625
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23796510 ggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagtg 23796607  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  23796608 caccgggctgcccttttt 23796625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31382326 - 31382212
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31382326 ggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttactg 31382230  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
     |||||||||||||||||    
T  31382229 taccgggttgcccttttt 31382212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606563
Alignment:
Q  155 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 50606563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1517417 - 1517309
Alignment:
Q  122 cctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  1517417 cctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T
Q  221 ttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||    
T  1517319 ttgcccttttt 1517309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaa-a 27136713  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596650
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||      
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtataatacaccaa-- 11596608  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  11596609 atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 11596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  101 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 200  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| || |||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgc 22325022  T
Q  201 gggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||    
T  22325023 gggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304205
Alignment:
Q  133 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 42304205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983810
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacaccaa- 6983873  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
     ||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6983872 -atggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccctttt 6983810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||| |||||| || |||  |||||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaa-aa 39215019  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  39215018 tggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768299
Alignment:
Q  135 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttttt 43768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485119
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 44485170  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||| |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  44485169 tggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagcttt-gtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511150
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc--atacaatacacca 164  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||   || ||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    | |||||||| |||||||||  ||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  15511211 a-aatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036381
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||| | ||||||||||     
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacca- 20036316  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20036317 -aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag-ttttgtgcaccgggctgctcttttta 20036381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10378828 - 10378738
Alignment:
Q  134 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10378828 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470390
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-a 17470407  T
Q  168 atggtgggaccccttcc 184  Q
    || ||||||||| ||||    
T  17470406 atagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 175
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327204
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaa-aatg 22327199  T
Q  171 gtggg 175  Q
    |||||    
T  22327200 gtggg 22327204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 180
Target Start/End: Original strand, 33222983 - 33223093
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  33222983 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtacaatacaccaa-a 33223080  T
Q  168 atggtgggacccc 180  Q
    |||||||||||||    
T  33223081 atggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 50811938 - 50812100
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||| ||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  50811938 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaa- 50812036  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||| ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  50812037 aatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttttt 50812100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4430187 - 4430088
Alignment:
Q  66 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   | |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4430187 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 4430088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Original strand, 25290162 - 25290300
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaa--acaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc-----tgcatacaatac 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||     ||  ||||||||    
T  25290162 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcaaggttgtgtacaatac 25290261  T
Q  161 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg 199  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  25290262 accaaaaatgataggaccccttcccagactctgcatatg 25290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22930230 - 22930114
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||    
T  22930230 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggtaaggttg-tgacaatacacc 22930133  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcc 184  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  22930132 a--aatggtgggaccccttcc 22930114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 43207540 - 43207640
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  43207540 ggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaa-attggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtg 43207638  T
Q  214 ca 215  Q
    ||    
T  43207639 ca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999849
Alignment:
Q  125 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 224  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||   |||| || || |||||||||||||||||||||| |||    
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacacca--aatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgc 20999855  T
Q  225 cctttt 230  Q
    ||||||    
T  20999854 cctttt 20999849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442396
Alignment:
Q  132 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760287
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaat 50760287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19656219 - 19656104
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  19656219 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaa-aatggtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaatg 19656121  T
Q  214 caccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19656120 caccgggctgccctttt 19656104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Original strand, 6358185 - 6358283
Alignment:
Q  133 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  6358185 aaaatcagggtaaagctgcgtacaaaacaccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtgatcggggctgcccttttta 6358283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435983
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 137  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4587625 - 4587568
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4587625 aatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594130
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctaccctttt 33594130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 24564344 - 24564440
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||| |||| ||| | || |||||| | | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  24564344 gtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagggtgcgtacaattcaccaa 24564440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34679331 - 34679217
Alignment:
Q  115 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac----cccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||  |||| | ||||||    || || |||||||||||||||    
T  34679331 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatca--aatggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagcttta 34679234  T
Q  211 gtgcaccgggttgccct 227  Q
    || ||||||| ||||||    
T  34679233 gtacaccgggctgccct 34679217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20169200 - 20169084
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||| |||||   |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||      
T  20169200 aaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatc--ggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagcttttgtgtc 20169103  T
Q  216 ccgggttgccctttttagt 234  Q
    || || |||||||| ||||    
T  20169102 cctggctgccctttatagt 20169084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505710
Alignment:
Q  137 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcaccg 15505710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19974213 - 19974073
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  19974213 actgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaat-agggcaaggttgcgtacaatacaccaa-aatgatgggacccattcccgg 19974116  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    || |    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19974115 actctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgccctttt 19974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Original strand, 23371143 - 23371271
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  23371143 actgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacaccaa--atgctgggaccccttcc-ag 23371238  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  23371239 accctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Original strand, 7074588 - 7074663
Alignment:
Q  141 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7074588 ggtatggctgcgtacaatacaccaa-aattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacc 7074663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 30555211 - 30555275
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  30555211 aatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgaccttttt 30555275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 34714618 - 34714674
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34714618 aactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaaca 34714674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34149073 - 34148969
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||    
T  34149073 ggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagacca--aatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagtg 34148976  T
Q  214 caccggg 220  Q
    || ||||    
T  34148975 caacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 231
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859227
Alignment:
Q  132 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||| ||  || |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtgggactcattttcaggccttgcgtatgtgggagttttagtgcaccgggcttcccttttt 46859227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272379
Alignment:
Q  79 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 178  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||       
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtacagcacatca--aatggtggg--- 31272429  T
Q  179 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
       | || ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  31272428 ---ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgcccttttt 31272379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Original strand, 40424737 - 40424783
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  40424737 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagt 40424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910379
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa- 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||  ||||||||||| |     
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  166 ---taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
       | |||||||||||||||||  || ||  | |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  52910316 tggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcaccaggctgccc 52910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 16120819 - 16120876
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16120819 ggaccccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttttt 16120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 217
Target Start/End: Original strand, 1693222 - 1693273
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1693222 aatggtgggaccccttcccagacccggcagatgcaggagcttttagtgcacc 1693273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21773675 - 21773636
Alignment:
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21773675 gcatatgtgggagctttggtgcaccgggttgcccttttta 21773636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28894611 - 28894561
Alignment:
Q  176 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  28894611 accccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21910743 - 21910693
Alignment:
Q  133 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 185  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21910743 aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttccc 21910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 232
Target Start/End: Original strand, 24564450 - 24564495
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24564450 gaccctgcctatgcaggagcgttagtgcaccgggttgcccttttta 24564495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 25027989 - 25028030
Alignment:
Q  115 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25027989 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacgaggtaaggctgcataca 25028030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41440664 - 41440600
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  41440664 aatggtggaaccccttcctagactctgtgtatgcgggagctttagtgaaccggactgcccttttt 41440600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50760273 - 50760237
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50760273 tatgcgggagctttaatgcaccgggctgcccttttta 50760237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7136692 - 7136525
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7136692 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacacc 7136593  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7136592 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttt 7136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 6760794 - 6760961
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6760794 aactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcttcgtacaatacacc 6760893  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6760894 aataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 26954102 - 26954271
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatac 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26954102 gtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 26954201  T
Q  161 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26954202 accaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttt 26954271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39461159 - 39460993
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39461159 aactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatacacc 39461060  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461059 aataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 39460993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28817789 - 28817623
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28817789 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 28817690  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28817689 --caatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttttta 28817623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 36720766 - 36720932
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36720766 gtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaataca 36720865  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36720866 cca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccctttt 36720932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 25250494 - 25250662
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  25250494 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggctgcgtacaatacacc 25250593  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25250594 aataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttttta 25250662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 44530121 - 44530285
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44530121 aactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 44530220  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44530221 a--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgacctttt 44530285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 35261651 - 35261816
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35261651 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacc 35261750  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261751 aa--atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 35261816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12670411 - 12670248
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12670411 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 12670314  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12670313 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttttt 12670248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29521848 - 29521685
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29521848 aactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 29521749  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |  |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29521748 a--aatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 20869945 - 20870062
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20869945 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagctttagtg 20870044  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20870045 caccgggttgcccttttt 20870062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30454258 - 30454095
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  30454258 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacgatacacc 30454161  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30454160 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30454095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8897927 - 8897762
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8897927 aactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacacc 8897828  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8897827 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttttt 8897762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 12625861 - 12626026
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12625861 aactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacac 12625960  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||  ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12625961 caa--atggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 13160674 - 13160836
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13160674 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc 13160772  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13160773 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttt 13160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20284232 - 20284075
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca--gggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20284232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 20284133  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20284132 taatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21070861 - 21070703
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca---gggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||    
T  21070861 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaaggctgcgtacaatacacca 21070762  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21070761 ataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Original strand, 45071238 - 45071398
Alignment:
Q  65 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45071238 actggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 45071336  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
      ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45071337 --aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44781665 - 44781517
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  44781665 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 44781566  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44781565 atgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 17823548 - 17823711
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||    
T  17823548 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataagactgcgtaaaatacacc 17823647  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17823648 a--aatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17823711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 2626494 - 2626657
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt---aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2626494 tggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 2626593  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  2626594 a--aatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 16225049 - 16225156
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225049 cctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 16225148  T
Q  222 tgcccttt 229  Q
    || |||||    
T  16225149 tgtccttt 16225156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8484069 - 8483947
Alignment:
Q  96 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 195  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  8484069 gtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccatcccagaccctgcg 8483972  T
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8483971 tatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18164914 - 18164758
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  | |     
T  18164914 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--agga 18164818  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18164817 tgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccattttt 18164758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20869659 - 20869523
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20869659 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc 20869562  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 206  Q
    ||    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20869561 aa----ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135287
Alignment:
Q  98 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 197  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgta 5135321  T
Q  198 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5135320 tgcaggagcttt-gtgcaccgggctgcccttttta 5135287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 29877116 - 29877227
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  29877116 ggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgttagtg 29877213  T
Q  214 caccgggttgccct 227  Q
    |||| || ||||||    
T  29877214 caccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 28407388 - 28407538
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||            ||||    
T  28407388 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaagg------------cacc 28407474  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28407475 a--aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457308
Alignment:
Q  74 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 173  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||| |||  |||||     
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaat-aggaaaaggctgcgtacaatacatcaa--atggta 31457251  T
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31457252 ggaccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 31457308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44742678 - 44742515
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||  || | || ||||||| | ||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  44742678 ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-a 44742580  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44742579 atggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgcccctttta 44742515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaat- 22598231  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  22598232 -tggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 10857858 - 10857967
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10857858 cctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T
Q  221 ttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||    
T  10857956 ttgcccttttta 10857967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365071
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||      
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaa-- 24365121  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  24365120 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccg 24365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17250982 - 17250879
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  17250982 cctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaaggagctttagtgca-cgggt 17250884  T
Q  222 tgccc 226  Q
    |||||    
T  17250883 tgccc 17250879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 16013515 - 16013594
Alignment:
Q  153 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16013515 tacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttttta 16013594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Original strand, 389644 - 389770
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 190  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  389644 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  191 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 19729382 - 19729476
Alignment:
Q  134 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19729382 aaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcactggattgccctttt 19729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106014
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatg 35106000  T
Q  171 gtgggaccccttcc 184  Q
    |||||||| |||||    
T  35106001 gtgggacctcttcc 35106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942421
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 189  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagac 43942421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 26102577 - 26102654
Alignment:
Q  152 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26102577 atacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 26102654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42083858 - 42083699
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||||| |    
T  42083858 ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtacagtataccaa-a 42083760  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  || | |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  42083759 atggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgccctt 42083699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Original strand, 5689661 - 5689761
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  5689661 cctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgggagctttagtgcaccggtt 5689758  T
Q  222 tgc 224  Q
    |||    
T  5689759 tgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 11748271 - 11748392
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||| ||     
T  11748271 aactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaagacagcgtacaatataca 11748370  T
Q  164 aataatggtgggaccccttccc 185  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  11748371 aaaaatggtaggaccccttccc 11748392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000228
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cacggtaaggttccatacaatacacca--aatggtgggac 23000271  T
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23000270 cccttcccgg---------atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23000228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40605068 - 40604905
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||     
T  40605068 aactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataaggttgcgtacaatacact 40604969  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  |||| | ||| ||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40604968 a--aatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgccctttt 40604905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14018128 - 14017989
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |    
T  14018128 ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacactaa-a 14018030  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 208  Q
     |||||||||| |||||  ||||| ||| |||||| |||||    
T  14018029 ttggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 24245423 - 24245565
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||   ||||| |||    ||||||||||| || | |||||| ||||    
T  24245423 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt----aacagggtaagactacgtacaatgcacc 24245517  T
Q  164 -aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
     || ||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  24245518 aaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttta 24245565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 33866973 - 33867087
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 214  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||  ||  ||||||  |||| || ||||| | |||||||||||    
T  33866973 aaacaactttttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgc 33867072  T
Q  215 accgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  33867073 accgggttgcccttt 33867087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468090
Alignment:
Q  180 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 27468090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508044
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgtcctt 27508044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35107373 - 35107310
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35107373 aatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccctttt 35107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918197
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa 36918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457864
Alignment:
Q  139 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtttcctttttt 26457864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962849
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 151  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgc 30962849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000997
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |   | |||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||      
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacacca-- 11001012  T
Q  167 aatggtgggacccct 181  Q
    |||||||||||||||    
T  11001011 aatggtgggacccct 11000997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486567
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccctt 36486567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 40607884 - 40607841
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  40607884 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaatgtcatgagttcaagt 40607841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23286379 - 23286337
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23286379 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 23286337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2351780 - 2351719
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2351780 aatggtgggaccc-ttcctagaccctgcat--gcgggagctttagtgcaccgagttgtccttttt 2351719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595975
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgcctttttt 18595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 95)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16408766 - 16408599
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16408766 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 16408667  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408666 aataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 16408599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 21646936 - 21647098
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  21646936 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatatacc 21647035  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647036 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 23501765 - 23501926
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |      || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23501765 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtca------cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacc 23501858  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23501859 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 23501926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13256560 - 13256395
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||   |||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13256560 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctggag----cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 13256465  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttag 233  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13256464 aataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttag 13256395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 20224956 - 20225117
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  20224956 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 20225053  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20225054 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 5648231 - 5648396
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5648231 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 5648329  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5648330 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttttta 5648396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6430788 - 6430627
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6430788 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 6430690  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6430689 a--aatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Original strand, 33049064 - 33049187
Alignment:
Q  243 taaaaataatatttct-aactgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaaccg 341  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33049064 taaaaataatatttcttaagtgaagttcaaaataagtaactgaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaacca 33049163  T
Q  342 cacactgtttcaaatgtctctgct 365  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  33049164 cacactgtttcaaatgtctttgct 33049187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 16911534 - 16911700
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16911534 aactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 16911633  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16911634 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccctttt 16911700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48598986 - 48598823
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48598986 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 48598889  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48598888 a--aatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 48598823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363130
Alignment:
Q  65 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 44363130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47528691 - 47528528
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  47528691 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 47528594  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47528593 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 47528528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 30639352 - 30639516
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30639352 aactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc 30639450  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30639451 aa--atggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttttt 30639516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20639772 - 20639656
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20639772 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 20639674  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20639673 caccgggttgcccttttt 20639656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567307
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacca--a 35567243  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35567244 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 35567307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11054309 - 11054146
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  11054309 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacacc 11054212  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11054211 aa--atggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 11054146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
      |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  19027923 --tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 10660376 - 10660543
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10660376 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcatacaatacacc 10660475  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  10660476 aataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcccctttt 10660543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 10874521 - 10874688
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10874521 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggctgcatacaatacacc 10874620  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  10874621 aataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcccctttt 10874688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225211
Alignment:
Q  137 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 20405065 - 20405224
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |       |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20405065 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggccta-------gaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagattgcgtacaatacac 20405157  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20405158 taataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  65 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 40915900  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
      |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40915901 --aatggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 47443958 - 47444094
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  47443958 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 47444055  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47444056 gcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttttt 47444094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 232
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175203
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaa-caacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatg 54175140  T
Q  171 gtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54175141 gtgggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttta 54175203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8473783 - 8473621
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8473783 aactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaa--cagggtaaggctgcatacaatacacc 8473686  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccag-acccc-gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473685 aa--atggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043393
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgg 17043452  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  17043451 tgggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta-tgcaccaggctgcccctttt 17043393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5306826 - 5306658
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  5306826 aactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacc 5306728  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg----cgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5306727 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttttt 5306658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 14983806 - 14983970
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||     
T  14983806 aactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcctacaatacact 14983905  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14983906 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgccctttt 14983970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832310
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 169  Q
    |||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--at 9832373  T
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9832372 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttttta 9832310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 37494823 - 37494972
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37494823 aactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcatacaatatacc 37494922  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    |  |||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  37494923 a--aatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 232
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463259
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacca--aatggtgggac 25463205  T
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  25463206 cccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccaggctacccttttta 25463259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 25629071 - 25629187
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25629071 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  214 caccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25629169 caccgggttgcccttttta 25629187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48327869 - 48327763
Alignment:
Q  123 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48327869 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggtt 48327770  T
Q  223 gcccttt 229  Q
     ||||||    
T  48327769 acccttt 48327763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29208035 - 29207900
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  29208035 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690176
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-------cagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30690240 caat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttt 30690176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 54730225 - 54730389
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  54730225 ggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataaggctgcgtataatacaccaat 54730324  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  54730325 aatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgaattacccttttt 54730389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30352754 - 30352578
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-----cagggtaag----gctgcata 154  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||||     |||||||||    ||||| ||    
T  30352754 aactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaagtaaagctgcgta 30352655  T
Q  155 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30352654 caatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttttt 30352578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 54966997 - 54967151
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |    
T  54966997 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc-tacaatatacca--a 54967093  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54967094 atggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgccc 54967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9987947 - 9987832
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||    
T  9987947 ggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacca--aatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggagctttaatg 9987850  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  9987849 caccgggctgcctttttt 9987832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343326
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || ||| ||||||||||| ||| || || |||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttagagcacccggctgcccctttt 25343326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaa-aa 30581526  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077794
Alignment:
Q  73 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 172  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatatacca--aatggt 39077853  T
Q  173 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    | |||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39077852 gagacatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 39077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33836564 - 33836485
Alignment:
Q  152 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33836564 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttttt 33836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029078
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaa-a 39029122  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 211  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag 39029078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865037
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgca 51865052  T
Q  216 ccgggttgccctttt 230  Q
    ||||  |||||||||    
T  51865051 ccggactgccctttt 51865037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487135
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  168 -------atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
           |||| ||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  487194 tggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938611
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cggggtaagg-tg--tacaatacaccaa-aatg 49938652  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49938651 gtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagctttag 49938611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908634
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||  |||||||| | ||||||| | |||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 20908699  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  20908698 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgcccttttt 20908634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478792
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 169  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     ||||||||||  ||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaa-cagggtaaggctg-----aatacaccaa--at 32478851  T
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32478850 ggtgggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagcttt-gtgcaccgggtggcccttt 32478792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30496476 - 30496333
Alignment:
Q  71 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30496476 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaaggctgcatacaatacacca--aatg 30496381  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    | ||||| ||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||    
T  30496380 gggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 178
Target Start/End: Original strand, 14590809 - 14590922
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14590809 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacat 14590908  T
Q  163 caataatggtgggacc 178  Q
    ||  ||||||||||||    
T  14590909 ca--aatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484370
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 32484370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55766629 - 55766466
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcac-gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||   |||||||   ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55766629 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 55766531  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
        |||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  55766530 --tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  134 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 21489109 - 21489218
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||    
T  21489109 ggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttcgtg 21489207  T
Q  214 caccgggttgc 224  Q
    ||| |||||||    
T  21489208 cactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  75 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 174  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacacca--aatagtgg 41018849  T
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||    
T  41018848 gaccccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38755973 - 38755908
Alignment:
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38755973 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38755908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7909393 - 7909281
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc-gggagctttagt 212  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  7909393 ggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttagt 7909297  T
Q  213 gcaccgggttgccctt 228  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7909296 gcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 38786682 - 38786746
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38786682 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 38786746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035308
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 152  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgca 43035308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164225
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 151  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgc 42164225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  75 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 174  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatggtgg 7385531  T
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 206  Q
    ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  7385530 gaccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10277855 - 10277754
Alignment:
Q  129 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  10277855 tgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcgggagttctagtgaaccggattgccctt 10277758  T
Q  229 ttta 232  Q
    ||||    
T  10277757 ttta 10277754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441568
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 47441592  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  47441591 atggttggaccccttcccggaccc 47441568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55830884 - 55830721
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgg-gttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  55830884 aactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaa-cagggtaatgctgcgtacaatacac 55830786  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
      |  ||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  55830785 tga--atggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038188
Alignment:
Q  80 gtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 179  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||   | ||||| | |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | |    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaa-aatggtggggcac 7038138  T
Q  180 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7038139 ctacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccctttt 7038188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 11394925 - 11394987
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394925 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 11404652 - 11404714
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404652 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17315457 - 17315372
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17315457 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcata 17315372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816382
Alignment:
Q  133 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 36816382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323038
Alignment:
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 56323038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580206
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 169  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||| |||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaa-aat 23580267  T
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || | |||||||||   || || |  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23580266 ggcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgcccttttt 23580206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553937
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718702
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttt 44718702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580860
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||  || ||    ||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||  ||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtctggaaa----cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacacca--aa 3580901  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    || | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  3580900 tgctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 3580860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 28494224 - 28494288
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  28494224 aatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcctttttt 28494288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Original strand, 49796820 - 49796911
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 208  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  49796820 ggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  136 aacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12711561 - 12711450
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  12711561 aaacaacatcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgc 12711464  T
Q  215 accgggttgccctt 228  Q
    |||  |||||||||    
T  12711463 acccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028048
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19028048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388311
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25388311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Original strand, 51420553 - 51420646
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||   | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51420553 aagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532129
Alignment:
Q  179 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 35532129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 36589765 - 36589876
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||    |||||||||||||| |||    
T  36589765 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttgacagtacaccaa-aatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtg 36589863  T
Q  214 caccgggttgccc 226  Q
    ||||||| |||||    
T  36589864 caccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357318
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    |||||||||| |||||||| ||| || ||||| |  | |||||||||||||     
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaa- 44357293  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44357294 aatggcgggacctcttcccagaccc 44357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50555721 - 50555654
Alignment:
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50555721 aataatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgcccttttt 50555654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47482918 - 47482849
Alignment:
Q  161 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  47482918 accaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaacgagctgccctttt 47482849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079696
Alignment:
Q  101 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 184  Q
    ||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgcta--aatggtgggaccctttcc 17079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629285
Alignment:
Q  77 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 176  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| ||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaa-attggcggga 32629322  T
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||||| ||||  || |||| ||||| |||||||    
T  32629321 ccccttcccggaccttgcgtatgtgggagttttagtg 32629285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 8820578 - 8820629
Alignment:
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8820578 aataatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894505
Alignment:
Q  126 ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 185  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 35894505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5313159 - 5313113
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5313159 gtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaa 5313113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 54640498 - 54640429
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 137  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  54640498 ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 21003410 - 21003469
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21003410 atggtgtgacctcttcccagaccctgcgtgtgcgggagcttt-gtgcaccgggctgccctt 21003469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34257034 - 34256982
Alignment:
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34257034 ccccttctcagaccttgcacatgcgggagctttagtgcaccgggctgctcttt 34256982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4619269 - 4619103
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4619269 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 4619170  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4619169 aataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 4619103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 38879553 - 38879719
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38879553 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 38879652  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38879653 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 38879719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 41014291 - 41014454
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41014291 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc 41014389  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014390 aa--atggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 41014454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 24448862 - 24449027
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24448862 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacacc 24448961  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24448962 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 24449027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 43334174 - 43334342
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43334174 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 43334273  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43334274 caaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 43334342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12006485 - 12006329
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12006485 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtctgg-aaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaatacaccaataatg 12006387  T
Q  171 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12006386 gtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801767
Alignment:
Q  101 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 200  Q
    ||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  201 gggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttt 13801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 27328727 - 27328890
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27328727 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 27328826  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  27328827 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcggattgccttttt 27328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8170145 - 8169981
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8170145 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 8170048  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8170047 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttttta 8169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 35710285 - 35710448
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  35710285 aactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggctgcgttcaatacacc 35710382  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35710383 a--aatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 35710448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 20135626 - 20135740
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20135626 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttcagtg 20135725  T
Q  214 caccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  20135726 caccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703558
Alignment:
Q  79 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 178  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacc 32703506  T
Q  179 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32703507 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 32703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516432
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaa-a 28516495  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28516494 atggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccctttt 28516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 1565403 - 1565566
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||| |||    
T  1565403 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatattaaggctgcgtacaatgcac 1565502  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1565503 ca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc-ttagtgcaccgggttgcccttt 1565566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaa-a 208989  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  208988 atggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 22600424 - 22600569
Alignment:
Q  62 gtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  22600424 gtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaaggctgtgtacaataca 22600523  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    |||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  22600524 cca--aatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 39301099 - 39301249
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||| |    
T  39301099 ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtataatgcaccaa-a 39301197  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  39301198 aaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 7368420 - 7368528
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  7368420 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtg 7368515  T
Q  214 caccgggttgccc 226  Q
    |||||||||||||    
T  7368516 caccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 220
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  95 ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgc 194  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatatacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgc 43574706  T
Q  195 atatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  43574707 gtatgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405324
Alignment:
Q  75 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacacca--aatggtgg 1405267  T
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1405268 gaccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttttt 1405324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880647
Alignment:
Q  117 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcac 16880660  T
Q  217 cgggttgcccttt 229  Q
    |||||| ||||||    
T  16880659 cgggtttcccttt 16880647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 22187257 - 22187422
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  22187257 aactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataagactgcgtacaatacacc 22187356  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    || ||   || |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  22187357 aaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttt 22187422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Original strand, 23974756 - 23974839
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23974756 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgc 23974839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426043
Alignment:
Q  96 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 189  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagac 41426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142941
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  || | ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacagtacaccaa- 19143005  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  19143004 -atggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgcccttttt 19142941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 29334417 - 29334532
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||| ||    
T  29334417 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatg 29334515  T
Q  214 caccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  29334516 caccgggctgccctttt 29334532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154814
Alignment:
Q  138 cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttt 34154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42924973 - 42924830
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  42924973 actgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttcccag 42924874  T
Q  188 --accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
      |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  42924873 acaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccggattgtccttt 42924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622595
Alignment:
Q  158 tacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Original strand, 16957375 - 16957450
Alignment:
Q  153 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16957375 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 16957450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 30006297 - 30006456
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||  | |||||||  || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||| |||||     
T  30006297 aactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgtgtacattacact 30006396  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006397 a--aatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37024717 - 37024626
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  37024717 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 219
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  76 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 175  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatca--aatggtggg 1850720  T
Q  176 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||| |||||  ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1850721 accacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097772
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 7097774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11657835 - 11657697
Alignment:
Q  96 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg----gtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |  |     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  11657835 gtcacgggttcaagttatggaaacaacctattatgtaaaatagtgtaactgtaaggctgcatacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccc 11657737  T
Q  192 cgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
     ||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11657736 tgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgcccttttt 11657697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028622
Alignment:
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 16028622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 206
Target Start/End: Original strand, 2838754 - 2838890
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaa-ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  2838754 ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca-- 2838850  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 206  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  2838851 aatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12575775 - 12575660
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  12575775 ggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagctttggt 12575677  T
Q  213 gcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12575676 gcaccgggctgcccttt 12575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24323818 - 24323725
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24323818 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24323725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24360442 - 24360349
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24360442 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24360349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 230
Target Start/End: Original strand, 3771379 - 3771475
Alignment:
Q  132 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3771379 aaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 3771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  134 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaa--atagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22861829 - 22861668
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    ||| ||  ||||||||||||| |    ||||| ||||  |||||||| |    
T  22861829 aactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaa---gtaagactgctcacaatacatc 22861733  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22861732 aa--atggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgccctttt 22861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 230
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801652
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttt 39801652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30877628 - 30877564
Alignment:
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30877628 ataaaggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30877564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907904
Alignment:
Q  77 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 176  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttgcatacaatacacca--aatggtggga 22907918  T
Q  177 cccct-tcccagac 189  Q
    ||||| ||||||||    
T  22907917 cccctctcccagac 22907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5873434 - 5873322
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  5873434 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggctaagtacactacaccaat--tggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagctttagtg 5873338  T
Q  214 caccgggttgcccttt 229  Q
    || |||| ||||||||    
T  5873337 catcgggatgcccttt 5873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943843
Alignment:
Q  173 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 10943843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 22025539 - 22025601
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 150  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22025539 actgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31694207 - 31694120
Alignment:
Q  128 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  31694207 gtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctat--tgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcacc 31694120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306493
Alignment:
Q  154 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 10306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24903807 - 24903694
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||    
T  24903807 aaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaat--tggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgca 24903710  T
Q  216 ccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||| || |||||||    
T  24903709 ccgggctgtccttttt 24903694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354263
Alignment:
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 32354263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21784394 - 21784335
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21784394 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  143 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||||||||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313571
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24313634  T
Q  169 tggtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313633 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgccctttt 24313571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355908
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24355971  T
Q  169 tggtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24355970 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgccctttt 24355908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074573
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacacca--aatgg 34074620  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
      || |||||||||| |||| || |||| ||||||  ||||||||||||    
T  34074619 cagggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagc--tagtgcaccggg 34074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10634301 - 10634224
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 149  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  10634301 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggct 10634224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29184094 - 29184062
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29184094 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29184062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Original strand, 29297862 - 29297914
Alignment:
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29297862 ataatggtgggatcccttcccggaccccgcaaatacgggtgctttagtgcacc 29297914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4654477 - 4654427
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4654477 aatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 4654427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 227
Target Start/End: Original strand, 11462924 - 11462958
Alignment:
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11462924 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11462958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 224
Target Start/End: Original strand, 18684361 - 18684403
Alignment:
Q  182 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18684361 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 18684403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39079925 - 39079883
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 110  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39079925 ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagt 39079883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2432395 - 2432342
Alignment:
Q  129 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2432395 tgtaaaaaacaaggcaagggtgcatataatacaccaaaaatggtggaacccctt 2432342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 19438759 - 19438800
Alignment:
Q  187 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19438759 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Original strand, 19093894 - 19093950
Alignment:
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19093894 gacccctacccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19093950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39079826 - 39079755
Alignment:
Q  153 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  39079826 tacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcacagggctgcc 39079755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12222080 - 12221913
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12222080 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 12221981  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12221980 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 12221913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29356009 - 29355852
Alignment:
Q  75 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 174  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29356009 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 29355910  T
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355909 gaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 29355852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2166575 - 2166408
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2166575 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2166476  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2166475 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 2166408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2178208 - 2178041
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2178208 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2178109  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178108 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 2178041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 1346936 - 1347099
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  1346936 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 1347033  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1347034 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 1347099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1354918 - 1354756
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  1354918 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc 1354821  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1354820 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 9161099 - 9161261
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  9161099 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggctgcgtacaatacatcaata 9161197  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9161198 atggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttttt 9161261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14975239 - 14975094
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||            |||||||||||||    
T  14975239 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaagg------------caatacaccaata 14975152  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14975151 atggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 197
Target Start/End: Original strand, 6024205 - 6024338
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  6024205 aactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtacaatacacc 6024304  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 197  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  6024305 aataatgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 1941827 - 1941992
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1941827 aactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 1941926  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
       |||||||||||||| |||  || |  |  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  1941927 --gaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgcccttttt 1941992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Original strand, 12892071 - 12892146
Alignment:
Q  156 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12892071 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 12892146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 26097182 - 26097296
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26097182 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  214 caccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttttta 26097296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 25557747 - 25557861
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25557747 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  214 caccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttttta 25557861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3815240 - 3815084
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||    
T  3815240 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacgactgcgtacaatacacc 3815141  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    |  ||||||||||||| |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3815140 a--aatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7947511 - 7947371
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7947511 actgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggcccccttcccgg 7947413  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7947412 accttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttt 7947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13905138 - 13905041
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13905138 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaattcaccaa 13905041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886049
Alignment:
Q  148 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12886049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728156
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  |    
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaa--a 32728217  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    | ||||  ||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  32728216 tagtggt-ccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgccctttt 32728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Original strand, 8409215 - 8409311
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatac 160  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8409215 aactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 14553484 - 14553626
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  14553484 aactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataatacacc 14553582  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 207  Q
    || | |||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  14553583 aaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18277327 - 18277191
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 192  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||| |     
T  18277327 aaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaa--atggtgggaccccttcctagactct 18277230  T
Q  193 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18277229 acgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtccttttt 18277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 162
Target Start/End: Original strand, 20400642 - 20400737
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  20400642 tggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacagtacac 20400737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 24097553 - 24097714
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||    
T  24097553 aactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----acc 24097648  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  24097649 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgcccttttt 24097714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889562
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacaccta-a 12889500  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    | | ||||||||||| || |||||    | || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12889501 acgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttt 12889562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15866200 - 15866041
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  15866200 aactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaaagctgcgt--aatacacc 15866103  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  15866102 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||   | ||||| |||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatat--gcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||  |||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 220
Target Start/End: Original strand, 19340858 - 19340954
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19340858 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaa-aatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacggg 19340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  97 tcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcat 196  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| |  |    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacca--aatggtgggacccttttccggaccctgtgt 33138935  T
Q  197 atgcgggagctttagtgcaccg 218  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  33138936 atgcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 6808467 - 6808532
Alignment:
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6808467 taatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6808532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007761
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaa--ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaa--cagggtcaggctgcgtacaatacacca--a 28007699  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  28007700 atgctgggaccccttccctaacctc-catatgcggaagctctagtgcaccggattaccctttt 28007761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Original strand, 17432336 - 17432483
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg------ctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 181  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||| || ||||||| ||||  |    
T  17432336 actgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagaccttt 17432435  T
Q  182 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||| || || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17432436 tcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17432483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9671196 - 9671082
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  9671196 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaa-aatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  216 ccgggttgcccttttt 231  Q
     |||| ||||||||||    
T  9671097 tcgggctgcccttttt 9671082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23930283 - 23930126
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttc-aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||| |||||||||||  ||  ||||||||| |||| |||| | |||||||  ||| ||||||||||||| | ||  | ||| ||||||||||||   |    
T  23930283 taaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gttgcgtacaatacaccag--a 23930188  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23930187 tggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 23930126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3116262 - 3116127
Alignment:
Q  88 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |        ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  3116262 actgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaatga--------ctgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcgg 3116171  T
Q  188 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3116170 accttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttttt 3116127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267863
Alignment:
Q  155 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttta 13267863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 32579474 - 32579543
Alignment:
Q  141 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32579474 ggtaagcctgcgtacaataccccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 383834 - 383760
Alignment:
Q  153 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  383834 tacaatacaccaa--attgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcccttt 383760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20906841 - 20906784
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  20906841 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgaaccaagttgctcttttt 20906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 24734605 - 24734760
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa---------aacagggtaaggctgcata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||         |||||||||||| ||| ||    
T  24734605 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacagggtaaggttgcgta 24734704  T
Q  155 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 211  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  24734705 caatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgc-ggagctttag 24734760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Original strand, 11849075 - 11849145
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11849075 ggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 11849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Original strand, 22967149 - 22967235
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22967149 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgt-aaaaataggataaggctgcatacaa 22967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  78 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 177  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaat--tggtgggac 23240876  T
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    ||||||   |||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23240875 cccttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23821244 - 23821158
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  23821244 taaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgta-aaaataggataaggctgcatacaa 23821158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Original strand, 32068121 - 32068182
Alignment:
Q  120 aacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32068121 aacctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaa-aatggtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734905
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgcccttt 10734905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 17448325 - 17448389
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 157  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17448325 aaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16895778 - 16895704
Alignment:
Q  149 tgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || || ||||||||||||||||    
T  16895778 tgcatacaatacactaaaaatggtgggacccccttcccggaccctacatatgtggaagttttagtgcaccgggtt 16895704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 232
Target Start/End: Original strand, 25997749 - 25997787
Alignment:
Q  194 catatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25997749 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttta 25997787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16916064 - 16915996
Alignment:
Q  152 atacaatacaccaataatggtgggacc-ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16916064 atacaatacactaaaaatggtaggacctccttcctagaccctacatatgtgggagctttagtgcaccgg 16915996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Original strand, 31990096 - 31990163
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31990096 ggaaacaatctcttgtgtaaaaaacggagcaagcttgcatacaatacaccaa-aatggcgggacccctt 31990163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751066
Alignment:
Q  125 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcg-----ggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |  |||  || ||||||     | ||||||||||||||||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaa-aatggtgagaccccttcacgaaccgtgcgtatgcgtatgagcagctttagtgcaccgg 24751078  T
Q  220 gttgcccttttt 231  Q
    |||||| |||||    
T  24751077 gttgccattttt 24751066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30786407 - 30786372
Alignment:
Q  196 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30786407 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttttt 30786372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395886
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Original strand, 18254559 - 18254651
Alignment:
Q  133 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |  | |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18254559 aaaaacagggtaaagctgcatacaatac-ccaa-aatagtgggaccccttcacagactctacgtatatgggagttttggtgcaccgggctgccct 18254651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33922916 - 33922854
Alignment:
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33922916 ggtggcaccccttcccggaccctgcttatgttggagctttagtgcacatggttgcccttttta 33922854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 234
Target Start/End: Original strand, 12228380 - 12228498
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| | ||  | || | ||||| |||||||    
T  12228380 ggaaacagactcttgtttaaaaaataggataaagttgcgtacaatacaccag--atagtgggaccccttcccataacctacgtaagtgggagttttagtg 12228477  T
Q  214 caccgggttgccctttttagt 234  Q
     || |||||||||||||||||    
T  12228478 tactgggttgccctttttagt 12228498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 8417444 - 8417500
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| || | |||||||    
T  8417444 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaaca 8417500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14341166 - 14341134
Alignment:
Q  131 taaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14341166 taaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29016337 - 29016301
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29016337 ggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttta 29016301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 70)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 14530290 - 14530455
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14530290 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctacgtacaatacacc 14530389  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14530390 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 14530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 10543670 - 10543835
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543670 aactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 10543769  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10543770 aaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8455479 - 8455315
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8455479 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcgtacaatacacc 8455380  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8455379 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccctttt 8455315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 5841006 - 5841166
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  5841006 taaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggatgcgtacaatacatcaataat 5841105  T
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5841106 ggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 5841166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24200794 - 24200622
Alignment:
Q  58 tgatgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24200794 tgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 24200695  T
Q  158 tacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24200694 tacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 24200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 11514408 - 11514571
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11514408 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaaggctgcgtacaatacacc 11514507  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11514508 a--aatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 11514571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 17667974 - 17668139
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17667974 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17668073  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  |||||||| |||||||| |  |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17668074 a--aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 17668139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21779422 - 21779260
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  21779422 aactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggttgcgtacaatacacc 21779325  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21779324 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21779260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25079881 - 25079717
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  25079881 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggatgcgtacaatacac 25079782  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25079781 cga--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416871
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
      || |||||||| ||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 40416871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 9671156 - 9671315
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||     
T  9671156 ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 9671252  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671253 -atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 9671315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25249897 - 25249736
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  25249897 tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-- 25249801  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249800 aatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttttt 25249736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 17623536 - 17623701
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17623536 aactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17623635  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  |||||||| ||||||||||  | || || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17623636 a--aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttttt 17623701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546300
Alignment:
Q  83 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 181  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccct 10546250  T
Q  182 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546251 tcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 10546300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39914467 - 39914305
Alignment:
Q  66 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  39914467 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacacc- 39914369  T
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
      |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39914368 -gaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 39914305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 23397738 - 23397899
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23397738 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggctacgtacaatacacc 23397835  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23397836 a--aatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 23397899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444865
Alignment:
Q  83 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacgatacaccaa--atggtgggacccctt 14444816  T
Q  183 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14444817 cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttttt 14444865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 17896231 - 17896398
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17896231 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatatac 17896330  T
Q  163 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17896331 caa--atggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttttta 17896398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158436
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  170 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacctgattgtccttttta 31158436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12024081 - 12023929
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12024081 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 12023983  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||| || |||  || ||||||| ||||||||    
T  12023982 a--aatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 7214506 - 7214673
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  7214506 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaca 7214605  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || ||||||| || |||||| | ||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7214606 aaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgcctttttt 7214673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32781448 - 32781308
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  32781448 tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca-- 32781351  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32781350 aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 32781308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377071
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacca--a 21377135  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21377134 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccgagctgcccttttta 21377071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 27573593 - 27573758
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27573593 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgcgtacaatacacc 27573691  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |  |||||||| |||  |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27573692 a--aatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttttta 27573758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795400
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatac-aatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 209  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 33795400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 22371029 - 22371151
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22371029 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 22371125  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22371126 a--aatggtgggaccccttcccggaccc 22371151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 36871515 - 36871628
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  36871515 ggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggacct-gcgtatgcgggagctttagtg 36871610  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36871611 caccgggttgcccttttt 36871628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19977877 - 19977712
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  19977877 aactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataaggttgcgtacaatacacc 19977778  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |  |||||||||| ||||||||  |||  |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  19977777 a--aatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattacccttttt 19977712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24860149 - 24859986
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  24860149 aactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggta-ggctgcgtacaatacacc 24860052  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||| | |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24860051 aa--atggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcctttttt 24859986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40762347 - 40762234
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||||||||||    
T  40762347 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaa--atggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  214 caccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  40762249 caccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4516510 - 4516354
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4516510 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtacaatacaccaat- 4516412  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  4516411 -tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643659
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||    |||| | ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtacca- 44643595  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44643596 -aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgccctttt 44643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 5450360  T
Q  169 tggtgggaccccttcc 184  Q
     |||||||||||||||    
T  5450361 gggtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 217
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  81 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 180  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 217  Q
    |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 14544038 - 14544201
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgta-aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  | ||    
T  14544038 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaagactgcgtgcaataaccaaa 14544137  T
Q  166 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
     |||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14544138 aaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttt 14544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521392
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacacca--a 44521435  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  44521434 atggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttta 44521392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctct--tgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacacca--aa 99326  T
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 17705467 - 17705567
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  17705467 aactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaaggctgtgtacaatacacc 17705566  T
Q  164 a 164  Q
    |    
T  17705567 a 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890533
Alignment:
Q  132 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26684785 - 26684615
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca-acctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||||   | ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |    
T  26684785 aactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggtaaggctgcgtacaatata 26684686  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagt 234  Q
    | ||  ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  26684685 ctaa--atggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtcctttttagt 26684615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23145759  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23145758 -tggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23557549  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23557548 -tggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632644
Alignment:
Q  127 tgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 25632641  T
Q  227 ttt 229  Q
    |||    
T  25632642 ttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 44604825 - 44604907
Alignment:
Q  63 taactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44604825 taactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380238
Alignment:
Q  72 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 171  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||     
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatga 17380295  T
Q  172 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17380294 tggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagcttt-gtgcaccgggcttcccttt 17380238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 30826059 - 30826172
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30826059 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtggaaccc-ttcccagaccctacatatgcgggagctttagtg 30826154  T
Q  214 caccgggttgcccttttt 231  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  30826155 caccagattgtccttttt 30826172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 230
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080237
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccctttt 34080237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419947
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg----taaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  164 aa 165  Q
    ||    
T  29419948 aa 29419947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 23488544 - 23488619
Alignment:
Q  155 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23488544 caatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctctttt 23488619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 231
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641638
Alignment:
Q  77 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 176  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgt-gaaaacagggtaaagttgcgtacaatacacca--aattgtggga 25641583  T
Q  177 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||  | || || |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  25641584 ccccttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtccttttt 25641638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633708
Alignment:
Q  175 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 3633708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Original strand, 17471542 - 17471675
Alignment:
Q  86 taactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 184  Q
    |||||| || ||||| |||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  17471542 taactgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaa-aatgatgagaccccttcc 17471640  T
Q  185 cagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 219  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17471641 ctgaccctgcctatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296404
Alignment:
Q  101 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 200  Q
    ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||| || ||||     
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaa-aatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgt 15296435  T
Q  201 gggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    || |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15296434 ggaagctttggtgcgccaggctgcccttttt 15296404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766392
Alignment:
Q  169 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttttt 34766392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189502
Alignment:
Q  178 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 39189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44449495 - 44449395
Alignment:
Q  116 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | || ||||| |||| ||||    
T  44449495 aaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa-aatagtgggaccccttcccggaccctgcgtttgtgggagttttaatgca 44449397  T
Q  216 cc 217  Q
    ||    
T  44449396 cc 44449395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13245181 - 13245096
Alignment:
Q  141 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13245181 ggtaaggctgcgtacattacactaa--atggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagctttagtgtatcgggttgccctt 13245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 230
Target Start/End: Original strand, 1289093 - 1289159
Alignment:
Q  165 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1289093 ataatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgccctttt 1289159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371248
Alignment:
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 22371248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235815
Alignment:
Q  69 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    ||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| | |  ||||||| ||      
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaa-- 45235879  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  45235878 atggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgcccctttt 45235815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576030
Alignment:
Q  174 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 8576030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 31525779 - 31525838
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 226  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31525779 aatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 31523304 - 31523358
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31523304 aatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggt 31523358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124918
Alignment:
Q  181 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124962 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 124918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19185837 - 19185743
Alignment:
Q  135 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  19185837 aaacatggtaaagttgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttt 19185743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23053012 - 23052962
Alignment:
Q  182 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23053012 tcccagaccctgcgtatgcaggagcttttgtgcaccgggctgcccttttta 23052962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Original strand, 4794875 - 4794924
Alignment:
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  4794875 aatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgcac 4794924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12315785 - 12315714
Alignment:
Q  93 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 165  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  12315785 aaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttat-taaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaa 12315714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 46806 - 46968
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||      
T  46806 tggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca-- 46903  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46904 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 46968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24930 - 24770
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24930 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtca-----acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaacacacc 24836  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24835 aa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttttt 24770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46721
Alignment:
Q  139 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 46721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 43681 - 43794
Alignment:
Q  114 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc-cagaccccgcatatgcgggagctttagt 212  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43681 ggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagctctagt 43776  T
Q  213 gcaccgggttgccctttt 230  Q
    |||| | |||||||||||    
T  43777 gcactgagttgccctttt 43794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 58949 - 59114
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  58949 aactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 59048  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  59049 aaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 10782 - 10946
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  10782 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtccaatacacc 10881  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10882 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctctttt 10946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 30551 - 30714
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  30551 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtagggctgcgtacaatacacc 30648  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30649 aa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13021
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |      
T  13182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccga-- 13086  T
Q  168 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13085 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttttta 13021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1591
Alignment:
Q  67 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  1745 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcatacaatacacca-- 1650  T
Q  167 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 225  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1649 aatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10052
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10211 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagactgcgtacaatacacc 10114  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10113 a--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20539 - 20380
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  20539 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagactgcgtacaatacacc 20442  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 227  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20441 a--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48633
Alignment:
Q  101 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 200  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 48663  T
Q  201 gggagctttagtgcaccgggttgccctttt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48662 gggagctctagtgcaccgggttgccctttt 48633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 11104 - 11264
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||    
T  11104 aactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaag--taaggctgcttacaatacacc 11200  T
Q  164 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 229  Q
    ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11201 aa--atggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4257
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 163  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  4129 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 4228  T
Q  164 aataa-tggtgggaccccttcccagaccc 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4229 aataattggtgggaccccttcccggaccc 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24131
Alignment:
Q  140 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 24131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 72971 - 72867
Alignment:
Q  123 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  72971 ctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctacaatacaccaa--atggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggtt 72874  T
Q  223 gcccttt 229  Q
    |||||||    
T  72873 gcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 226569 - 226456
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  226569 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacat 226470  T
Q  163 caataatggtgggacc 178  Q
    ||  ||||||||||||    
T  226469 ca--aatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Original strand, 23606 - 23695
Alignment:
Q  99 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 190  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23606 acgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagca--aatggtgggaccccttcccagacc 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35182 - 35062
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttg-ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaataca 161  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35182 aactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaataca 35083  T
Q  162 ccaataatggtgggaccccttcc 184  Q
    |||  ||||||||||||| ||||    
T  35082 cca--aatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 3574 - 3679
Alignment:
Q  122 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 221  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3574 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagt 3671  T
Q  222 tgcccttt 229  Q
    | ||||||    
T  3672 ttcccttt 3679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  68 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 167  Q
    |||| |||||||| || || |||  ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaa-a 33004  T
Q  168 atggtgggaccc 179  Q
     |||||||||||    
T  33005 ttggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8935
Alignment:
Q  66 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Original strand, 83847 - 83893
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  83847 aactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt 83893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Original strand, 24642 - 24682
Alignment:
Q  70 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 110  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24642 taaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagt 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 231
Target Start/End: Original strand, 24696 - 24785
Alignment:
Q  140 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 231  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||  || ||||  |||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24696 gggtaagactgcgtataatacaccaa--atagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgcccttttt 24785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Original strand, 43101 - 43173
Alignment:
Q  64 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| ||    |||||| |||||||||||||||    
T  43101 aactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 42 times since January 2019
Visitors: 6700