View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0881_low_49 (Length: 252)

Name: NF0881_low_49
Description: NF0881
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0881_low_49
NF0881_low_49
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (11-245)||(34963364-34963598)
chr6 (11-232)||(25656633-25656854)
chr6 (11-245)||(30676647-30676881)
chr6 (11-232)||(2291117-2291338)
chr6 (11-232)||(12742321-12742542)
chr6 (11-232)||(24422551-24422772)
chr6 (11-232)||(33861798-33862019)
chr6 (11-232)||(33864282-33864503)
chr6 (11-232)||(8055033-8055254)
chr6 (11-232)||(18334529-18334750)
chr6 (11-232)||(19005050-19005271)
chr6 (11-232)||(19858856-19859077)
chr6 (11-232)||(22782231-22782452)
chr6 (11-232)||(1540848-1541069)
chr6 (14-231)||(25688507-25688724)
chr6 (11-232)||(26924577-26924798)
chr6 (22-232)||(1595553-1595763)
chr6 (44-232)||(25754813-25755001)
chr6 (44-232)||(20556864-20557050)
chr6 (57-220)||(18456735-18456898)
chr6 (62-232)||(16448514-16448685)
chr6 (58-232)||(3852001-3852175)
chr6 (87-220)||(18461895-18462028)
chr6 (74-241)||(18409782-18409950)
chr6 (57-245)||(19847932-19848122)
chr6 (77-238)||(29060541-29060703)
chr6 (114-238)||(20593774-20593899)
chr6 (74-238)||(25629310-25629475)
chr6 (114-238)||(19303536-19303660)
chr6 (132-238)||(17287809-17287916)
chr6 (134-238)||(20638298-20638403)
chr6 (140-220)||(18821866-18821946)
chr6 (11-74)||(12942363-12942426)
chr6 (134-238)||(16496245-16496350)
chr6 (134-238)||(20076701-20076805)
chr6 (74-238)||(20360915-20361080)
chr6 (132-238)||(22780240-22780347)
chr6 (181-245)||(23992421-23992485)
chr6 (74-224)||(25644335-25644487)
chr6 (11-65)||(28289272-28289326)
chr6 (178-238)||(25714418-25714478)
chr6 (11-66)||(18913997-18914052)
chr6 (11-66)||(18937255-18937310)
chr6 (57-165)||(8227448-8227557)
chr6 (12-73)||(15875469-15875530)
chr6 (59-224)||(20109153-20109322)
chr6 (11-53)||(31630584-31630626)
chr6 (178-238)||(27333277-27333338)
chr6 (178-238)||(27394017-27394078)
chr6 (141-245)||(25603406-25603512)
chr6 (141-245)||(25611744-25611850)
chr6 (186-238)||(1561304-1561356)
chr6 (187-245)||(16929658-16929716)
chr6 (187-245)||(16965378-16965436)
chr6 (178-232)||(21766698-21766752)
chr6 (181-209)||(19790842-19790870)
chr6 (118-220)||(23019425-23019528)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (11-245)||(32214858-32215092)
chr2 (11-232)||(18808947-18809168)
chr2 (11-232)||(23709469-23709690)
chr2 (11-232)||(23711950-23712171)
chr2 (11-232)||(39682317-39682538)
chr2 (11-232)||(6725999-6726220)
chr2 (11-232)||(21154997-21155218)
chr2 (11-232)||(23130866-23131087)
chr2 (11-232)||(23133333-23133554)
chr2 (11-232)||(34402459-34402680)
chr2 (12-232)||(571401-571621)
chr2 (11-232)||(23135594-23135815)
chr2 (11-232)||(32039435-32039656)
chr2 (11-232)||(24898132-24898354)
chr2 (11-232)||(24900615-24900837)
chr2 (11-232)||(24903092-24903314)
chr2 (11-232)||(24905569-24905791)
chr2 (11-232)||(24908044-24908266)
chr2 (11-228)||(24367782-24367999)
chr2 (11-232)||(26505383-26505604)
chr2 (11-232)||(26507861-26508082)
chr2 (11-232)||(28577103-28577324)
chr2 (11-232)||(45029791-45030012)
chr2 (11-232)||(22105416-22105638)
chr2 (11-232)||(38967378-38967599)
chr2 (58-232)||(43137303-43137477)
chr2 (57-232)||(24529511-24529687)
chr2 (11-151)||(24642791-24642933)
chr2 (74-238)||(23060514-23060679)
chr2 (59-238)||(19671831-19672010)
chr2 (74-238)||(22337116-22337281)
chr2 (74-238)||(23076443-23076608)
chr2 (160-232)||(24643036-24643108)
chr2 (11-74)||(20261381-20261444)
chr2 (134-238)||(22731249-22731354)
chr2 (74-220)||(7688-7835)
chr2 (134-238)||(23285866-23285967)
chr2 (140-238)||(38136-38234)
chr2 (44-113)||(22173799-22173868)
chr2 (134-232)||(298829-298929)
chr2 (134-238)||(22738195-22738299)
chr2 (181-245)||(25616179-25616243)
chr2 (134-238)||(23654401-23654506)
chr2 (74-238)||(23660024-23660188)
chr2 (178-238)||(23040249-23040309)
chr2 (59-224)||(23708558-23708725)
chr2 (178-232)||(7679592-7679647)
chr2 (11-73)||(10684700-10684764)
chr2 (134-225)||(28405990-28406083)
chr2 (11-73)||(23707259-23707323)
chr2 (11-73)||(24918196-24918260)
chr2 (11-52)||(25616365-25616406)
chr2 (178-238)||(8946658-8946718)
chr2 (57-97)||(29601478-29601518)
chr2 (59-144)||(22459501-22459587)
chr2 (138-238)||(23103416-23103515)
chr2 (181-209)||(24869906-24869934)
chr2 (178-225)||(25175864-25175912)
chr2 (181-209)||(25961597-25961625)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (11-245)||(16361908-16362143)
chr1 (11-237)||(21840766-21840992)
chr1 (12-232)||(23593672-23593893)
chr1 (11-232)||(13988870-13989091)
chr1 (11-232)||(21923228-21923449)
chr1 (11-232)||(29776692-29776913)
chr1 (11-232)||(21475024-21475245)
chr1 (11-232)||(29298141-29298361)
chr1 (11-232)||(31612317-31612538)
chr1 (11-232)||(22123004-22123226)
chr1 (11-232)||(15859945-15860167)
chr1 (11-232)||(16275300-16275522)
chr1 (57-238)||(13212844-13213026)
chr1 (57-232)||(21346965-21347141)
chr1 (62-232)||(40389158-40389329)
chr1 (57-232)||(21342100-21342276)
chr1 (57-232)||(21707171-21707346)
chr1 (57-232)||(21711713-21711888)
chr1 (44-220)||(45574812-45574989)
chr1 (57-232)||(433016-433190)
chr1 (74-241)||(50210168-50210336)
chr1 (111-245)||(22468688-22468823)
chr1 (114-232)||(34509787-34509906)
chr1 (141-245)||(20135181-20135286)
chr1 (74-238)||(22532270-22532435)
chr1 (74-238)||(27250684-27250849)
chr1 (178-245)||(20454613-20454680)
chr1 (57-220)||(21896193-21896358)
chr1 (138-238)||(20847173-20847274)
chr1 (67-165)||(21861518-21861616)
chr1 (20-73)||(43543214-43543267)
chr1 (11-51)||(22050826-22050866)
chr1 (134-223)||(21026696-21026786)
chr1 (67-224)||(16758664-16758823)
chr1 (178-224)||(33681022-33681069)
chr1 (181-239)||(24783155-24783213)
chr1 (186-235)||(21754049-21754098)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (11-245)||(19618109-19618343)
chr4 (11-245)||(14970644-14970878)
chr4 (11-232)||(3515011-3515232)
chr4 (11-232)||(15118289-15118510)
chr4 (12-232)||(52312514-52312734)
chr4 (11-232)||(19242703-19242925)
chr4 (11-232)||(12244-12465)
chr4 (11-232)||(18215211-18215432)
chr4 (11-232)||(44615292-44615513)
chr4 (11-236)||(15355261-15355487)
chr4 (11-232)||(18239356-18239577)
chr4 (11-232)||(50222276-50222497)
chr4 (11-232)||(1837446-1837667)
chr4 (11-232)||(44773020-44773245)
chr4 (44-232)||(51463838-51464026)
chr4 (57-238)||(15367691-15367873)
chr4 (57-238)||(15402704-15402886)
chr4 (44-232)||(23803235-23803423)
chr4 (57-238)||(15371203-15371385)
chr4 (57-238)||(15373484-15373666)
chr4 (60-238)||(16223533-16223712)
chr4 (57-238)||(15370019-15370200)
chr4 (67-232)||(44928872-44929038)
chr4 (21-232)||(7641139-7641340)
chr4 (57-232)||(44102218-44102393)
chr4 (44-232)||(12610954-12611135)
chr4 (62-232)||(20149833-20150004)
chr4 (57-220)||(21815568-21815731)
chr4 (118-232)||(14280320-14280434)
chr4 (74-232)||(14038655-14038814)
chr4 (93-232)||(54798728-54798868)
chr4 (137-232)||(8574887-8574981)
chr4 (132-238)||(7798775-7798882)
chr4 (74-231)||(16377478-16377634)
chr4 (132-238)||(52873380-52873487)
chr4 (134-238)||(7088878-7088983)
chr4 (63-163)||(22353910-22354010)
chr4 (74-237)||(22636437-22636601)
chr4 (132-238)||(7893704-7893811)
chr4 (74-238)||(12902758-12902923)
chr4 (74-238)||(16270191-16270355)
chr4 (11-74)||(15534343-15534406)
chr4 (11-73)||(36038033-36038095)
chr4 (74-238)||(6899892-6900056)
chr4 (57-220)||(13788-13953)
chr4 (11-73)||(14048740-14048802)
chr4 (134-238)||(44052830-44052935)
chr4 (111-238)||(16239962-16240089)
chr4 (11-73)||(15497008-15497070)
chr4 (11-73)||(49547711-49547773)
chr4 (11-72)||(52873115-52873176)
chr4 (59-224)||(43198492-43198661)
chr4 (154-238)||(3096294-3096379)
chr4 (134-234)||(23374374-23374475)
chr4 (57-224)||(52243131-52243302)
chr4 (11-53)||(362268-362310)
chr4 (186-238)||(39706356-39706408)
chr4 (11-73)||(14746554-14746618)
chr4 (21-73)||(19857607-19857659)
chr4 (76-158)||(15464888-15464970)
chr4 (140-238)||(14053323-14053421)
chr4 (178-238)||(15551818-15551879)
chr4 (178-225)||(12774021-12774069)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (11-234)||(16413253-16413476)
chr8 (11-232)||(1484406-1484627)
chr8 (11-232)||(5853229-5853450)
chr8 (11-232)||(20046132-20046353)
chr8 (11-232)||(20403231-20403452)
chr8 (11-232)||(14409381-14409602)
chr8 (11-232)||(22001757-22001978)
chr8 (11-232)||(15203168-15203389)
chr8 (11-232)||(4483285-4483505)
chr8 (11-232)||(4542310-4542531)
chr8 (11-236)||(45290631-45290857)
chr8 (11-232)||(19896269-19896494)
chr8 (11-232)||(14823778-14824000)
chr8 (57-232)||(41598192-41598367)
chr8 (11-232)||(19936940-19937164)
chr8 (11-223)||(15070571-15070785)
chr8 (57-241)||(26223914-26224098)
chr8 (59-209)||(19801367-19801516)
chr8 (44-232)||(25484245-25484426)
chr8 (11-123)||(24485981-24486093)
chr8 (74-238)||(6759259-6759421)
chr8 (118-238)||(16092341-16092462)
chr8 (11-113)||(32810054-32810156)
chr8 (132-238)||(23406380-23406487)
chr8 (141-245)||(23648547-23648652)
chr8 (114-241)||(28649039-28649167)
chr8 (132-238)||(7372779-7372886)
chr8 (68-238)||(18818358-18818529)
chr8 (93-232)||(26225267-26225405)
chr8 (57-236)||(13597554-13597735)
chr8 (94-238)||(21923903-21924048)
chr8 (74-238)||(22875066-22875230)
chr8 (93-232)||(26219721-26219859)
chr8 (57-236)||(13508022-13508203)
chr8 (74-238)||(20536209-20536374)
chr8 (134-238)||(21919015-21919120)
chr8 (74-238)||(22626737-22626901)
chr8 (181-245)||(18678165-18678229)
chr8 (140-238)||(31971258-31971356)
chr8 (67-238)||(17612058-17612230)
chr8 (181-245)||(32121726-32121790)
chr8 (156-238)||(18879268-18879351)
chr8 (57-158)||(20498644-20498746)
chr8 (11-53)||(38550048-38550090)
chr8 (178-238)||(6520369-6520430)
chr8 (140-238)||(16199666-16199764)
chr8 (178-238)||(38855310-38855371)
chr8 (140-238)||(45131019-45131116)
chr8 (134-230)||(21285606-21285703)
chr8 (11-52)||(32121912-32121953)
chr8 (21-73)||(1326990-1327042)
chr8 (181-235)||(39094987-39095041)
chr8 (178-238)||(17140917-17140978)
chr8 (11-52)||(18678002-18678043)
chr8 (186-235)||(20856492-20856541)
chr8 (178-238)||(21490996-21491057)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (11-237)||(10772-10998)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (11-245)||(13544016-13544250)
chr3 (11-245)||(12567551-12567785)
chr3 (11-232)||(16454218-16454439)
chr3 (11-232)||(17463182-17463403)
chr3 (11-232)||(45606844-45607065)
chr3 (11-232)||(7781284-7781505)
chr3 (11-232)||(8899098-8899319)
chr3 (11-232)||(34159330-34159551)
chr3 (11-232)||(55476495-55476716)
chr3 (11-232)||(6469071-6469292)
chr3 (11-232)||(10247660-10247881)
chr3 (11-232)||(16282748-16282969)
chr3 (11-232)||(28848548-28848769)
chr3 (11-232)||(13154192-13154414)
chr3 (11-232)||(9707544-9707765)
chr3 (11-228)||(38961828-38962045)
chr3 (11-232)||(13151727-13151949)
chr3 (13-232)||(41123894-41124110)
chr3 (34-232)||(17446615-17446812)
chr3 (12-232)||(8499522-8499744)
chr3 (44-228)||(50242830-50243014)
chr3 (11-232)||(15412433-15412656)
chr3 (71-232)||(29172580-29172741)
chr3 (57-232)||(17672630-17672805)
chr3 (57-220)||(53070636-53070799)
chr3 (11-232)||(53301441-53301665)
chr3 (57-232)||(12119707-12119883)
chr3 (105-232)||(15977519-15977646)
chr3 (44-220)||(43550448-43550625)
chr3 (11-232)||(27165254-27165477)
chr3 (132-232)||(55500946-55501046)
chr3 (74-232)||(40213676-40213834)
chr3 (74-238)||(14972855-14973020)
chr3 (93-232)||(36166602-36166740)
chr3 (93-226)||(21618459-21618591)
chr3 (133-232)||(10556989-10557088)
chr3 (74-238)||(17487857-17488022)
chr3 (74-238)||(17499339-17499504)
chr3 (57-238)||(24340660-24340843)
chr3 (137-232)||(44494813-44494908)
chr3 (74-238)||(13442275-13442440)
chr3 (74-238)||(25476340-25476505)
chr3 (74-225)||(14576788-14576939)
chr3 (74-221)||(42386428-42386576)
chr3 (68-231)||(43840940-43841104)
chr3 (132-238)||(18438535-18438642)
chr3 (134-238)||(12399210-12399315)
chr3 (134-238)||(20698450-20698555)
chr3 (111-238)||(23083353-23083481)
chr3 (138-232)||(17737240-17737337)
chr3 (57-221)||(23274705-23274871)
chr3 (132-238)||(26686888-26686995)
chr3 (11-73)||(54520985-54521047)
chr3 (11-71)||(29544779-29544839)
chr3 (181-245)||(46822259-46822323)
chr3 (140-238)||(11424781-11424879)
chr3 (11-66)||(12305315-12305370)
chr3 (94-232)||(24153184-24153322)
chr3 (140-225)||(14572603-14572688)
chr3 (141-245)||(30029834-30029939)
chr3 (181-245)||(12511051-12511115)
chr3 (57-120)||(17248224-17248287)
chr3 (178-238)||(14234488-14234549)
chr3 (57-165)||(37642202-37642311)
chr3 (59-158)||(2051138-2051238)
chr3 (15-73)||(15977696-15977754)
chr3 (67-165)||(22147473-22147571)
chr3 (183-232)||(45577947-45577996)
chr3 (59-220)||(52523666-52523831)
chr3 (178-232)||(28194697-28194752)
chr3 (181-235)||(3389999-3390053)
chr3 (11-73)||(11913987-11914051)
chr3 (178-239)||(14665397-14665458)
chr3 (11-52)||(46822445-46822486)
chr3 (181-235)||(3403019-3403073)
chr3 (11-53)||(10557091-10557133)
chr3 (181-239)||(14668553-14668611)
chr3 (178-232)||(23077537-23077591)
chr3 (178-235)||(32307681-32307739)
chr3 (178-225)||(12174318-12174366)
chr3 (186-238)||(13210395-13210447)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (11-237)||(9241-9467)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (11-232)||(4698-4919)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (11-232)||(24702242-24702463)
chr7 (11-232)||(456325-456546)
chr7 (11-232)||(11393224-11393445)
chr7 (11-232)||(15376650-15376871)
chr7 (11-232)||(16232524-16232745)
chr7 (11-232)||(20385060-20385281)
chr7 (11-232)||(21189532-21189753)
chr7 (11-232)||(32125495-32125716)
chr7 (11-232)||(41522921-41523142)
chr7 (11-232)||(41525383-41525604)
chr7 (11-232)||(14949059-14949280)
chr7 (11-232)||(16410063-16410284)
chr7 (11-232)||(18640276-18640497)
chr7 (11-232)||(27216864-27217085)
chr7 (11-232)||(11972500-11972721)
chr7 (11-232)||(16213688-16213909)
chr7 (11-238)||(18430710-18430937)
chr7 (11-232)||(24704692-24704910)
chr7 (11-232)||(13869350-13869573)
chr7 (57-232)||(44116513-44116688)
chr7 (58-232)||(3386337-3386511)
chr7 (87-245)||(24275162-24275320)
chr7 (11-232)||(26355918-26356152)
chr7 (11-232)||(26358370-26358604)
chr7 (57-200)||(12756654-12756797)
chr7 (44-220)||(13647344-13647521)
chr7 (59-232)||(20110560-20110723)
chr7 (57-232)||(17061898-17062073)
chr7 (57-232)||(38898359-38898535)
chr7 (110-232)||(13831377-13831499)
chr7 (11-143)||(15081884-15082019)
chr7 (117-232)||(48273396-48273512)
chr7 (114-232)||(3564359-3564478)
chr7 (74-232)||(18456368-18456526)
chr7 (11-91)||(13841157-13841237)
chr7 (57-224)||(2280056-2280225)
chr7 (74-238)||(38227482-38227646)
chr7 (11-74)||(11303409-11303472)
chr7 (74-238)||(12698832-12698998)
chr7 (11-85)||(18627717-18627791)
chr7 (134-238)||(9509190-9509295)
chr7 (134-223)||(10589055-10589145)
chr7 (11-73)||(16108626-16108688)
chr7 (134-223)||(26212012-26212102)
chr7 (11-73)||(14269999-14270061)
chr7 (57-238)||(10063760-10063938)
chr7 (133-224)||(15144052-15144143)
chr7 (11-73)||(8468803-8468865)
chr7 (19-73)||(23664898-23664952)
chr7 (186-232)||(14932802-14932848)
chr7 (186-232)||(15356237-15356283)
chr7 (186-232)||(15360351-15360397)
chr7 (118-238)||(22072914-22073036)
chr7 (178-238)||(67746-67807)
chr7 (181-245)||(15211450-15211515)
chr7 (57-165)||(19486681-19486790)
chr7 (11-73)||(29796771-29796835)
chr7 (11-73)||(29800590-29800654)
chr7 (59-158)||(12255730-12255830)
chr7 (68-152)||(15113031-15113114)
chr7 (186-238)||(47831808-47831860)
chr7 (59-152)||(15116568-15116661)
chr7 (11-73)||(8940335-8940399)
chr7 (11-73)||(38898165-38898229)
chr7 (186-238)||(15754955-15755007)
chr7 (214-245)||(16213622-16213653)
chr7 (181-239)||(2832504-2832562)
chr7 (134-224)||(16056343-16056433)
chr7 (178-238)||(28505357-28505418)
chr7 (178-238)||(34200787-34200848)
chr7 (186-238)||(16386316-16386368)
chr7 (178-225)||(18005660-18005708)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-245)||(11279-11514)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-245)||(501075-501309)
scaffold0001 (57-232)||(85562-85738)
scaffold0001 (134-225)||(160698-160790)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-232)||(20751-20972)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (11-232)||(37825-38046)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (11-232)||(94415-94636)
scaffold0023 (11-234)||(17377-17600)
scaffold0023 (77-232)||(44458-44614)
scaffold0023 (107-225)||(100388-100507)
scaffold0023 (181-232)||(38542-38593)
scaffold0023 (178-238)||(119876-119937)
scaffold0023 (189-225)||(40245-40281)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (11-232)||(264705-264926)
chr5 (11-232)||(42245302-42245523)
chr5 (11-232)||(39245140-39245361)
chr5 (11-232)||(39363388-39363609)
chr5 (11-232)||(10732877-10733098)
chr5 (11-232)||(20909016-20909237)
chr5 (11-232)||(29345984-29346205)
chr5 (11-232)||(32027397-32027618)
chr5 (11-232)||(29329938-29330156)
chr5 (11-232)||(29348457-29348678)
chr5 (11-232)||(29350930-29351151)
chr5 (11-232)||(20917889-20918106)
chr5 (59-232)||(11581184-11581357)
chr5 (11-232)||(38619438-38619661)
chr5 (57-232)||(2154596-2154772)
chr5 (11-232)||(23064515-23064738)
chr5 (62-232)||(18319021-18319192)
chr5 (57-232)||(20901991-20902168)
chr5 (57-232)||(36154766-36154938)
chr5 (57-232)||(31061072-31061248)
chr5 (62-232)||(24067111-24067282)
chr5 (69-232)||(10775670-10775834)
chr5 (131-238)||(21997546-21997654)
chr5 (74-238)||(1096468-1096633)
chr5 (134-238)||(23390511-23390616)
chr5 (74-238)||(9077953-9078118)
chr5 (74-238)||(25421533-25421698)
chr5 (114-232)||(24529227-24529346)
chr5 (74-219)||(25431414-25431560)
chr5 (134-238)||(8286857-8286963)
chr5 (134-238)||(21729079-21729184)
chr5 (134-238)||(21808404-21808509)
chr5 (74-238)||(24493570-24493734)
chr5 (181-245)||(17517264-17517328)
chr5 (93-232)||(22412191-22412330)
chr5 (134-223)||(22075035-22075125)
chr5 (74-238)||(13025312-13025476)
chr5 (74-238)||(13095496-13095660)
chr5 (13-73)||(9776521-9776581)
chr5 (93-181)||(20766094-20766181)
chr5 (74-220)||(22144068-22144215)
chr5 (141-229)||(18418590-18418678)
chr5 (57-158)||(40725935-40726037)
chr5 (178-238)||(21329556-21329617)
chr5 (12-73)||(37804841-37804902)
chr5 (11-52)||(17517101-17517142)
chr5 (178-238)||(21293029-21293089)
chr5 (177-232)||(20806845-20806900)
chr5 (178-236)||(37723906-37723965)
chr5 (178-238)||(19660894-19660955)
chr5 (193-238)||(21502231-21502276)
chr5 (178-225)||(22959591-22959639)
chr5 (181-209)||(26680608-26680636)
chr5 (181-209)||(26952215-26952243)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (19-245)||(12194-12420)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (11-232)||(13951-14172)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (11-232)||(136684-136905)
scaffold0028 (11-232)||(139153-139374)
scaffold0028 (11-232)||(144091-144312)
scaffold0028 (11-232)||(134215-134436)
scaffold0028 (11-232)||(141622-141843)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (11-232)||(13396-13617)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (11-232)||(40404-40625)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (44-232)||(110-298)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (57-232)||(158433-158608)
scaffold0003 (138-224)||(339968-340053)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (44-232)||(82076-82264)
scaffold0037 (59-224)||(22610-22776)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (57-232)||(16788-16963)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (57-228)||(2111-2283)
scaffold0247 (57-238)||(17964-18147)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (57-232)||(9753-9929)
scaffold0145 (74-238)||(32943-33107)
scaffold0145 (74-238)||(38762-38926)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (57-232)||(4301-4476)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (57-222)||(29946-30111)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (44-232)||(1250-1439)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (69-232)||(4218-4382)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (57-220)||(20363-20524)
scaffold0031 (74-238)||(128752-128916)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (44-232)||(12068-12250)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (57-220)||(79267-79430)
scaffold0056 (118-241)||(17214-17340)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (11-232)||(38593-38816)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (57-232)||(161072-161248)
scaffold0007 (57-157)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (74-232)||(22890-23048)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (93-232)||(44681-44821)
scaffold0122 (118-232)||(26064-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (74-238)||(3106-3270)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (93-232)||(116434-116572)
scaffold0022 (11-73)||(53809-53873)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (74-238)||(13212-13377)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (74-238)||(1852-2017)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (11-113)||(6070-6172)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (74-238)||(16555-16720)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (74-225)||(4522-4673)
scaffold0228 (74-225)||(12104-12255)
scaffold0228 (74-225)||(22056-22207)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (68-238)||(51914-52085)
scaffold0011 (89-238)||(167948-168098)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (137-241)||(3204-3309)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (134-238)||(28415-28520)
scaffold0046 (178-238)||(11293-11354)
scaffold0046 (186-238)||(1998-2050)
scaffold0046 (186-238)||(4553-4605)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (74-230)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (74-230)||(75170-75326)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (57-220)||(53486-53651)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (74-231)||(25904-26061)
scaffold0026 (74-238)||(39859-40023)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (134-238)||(4850-4955)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (79-152)||(13092-13165)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (134-238)||(32972-33076)
scaffold0120 (134-238)||(45929-46033)
scaffold0120 (133-238)||(16114-16220)
scaffold0120 (177-238)||(17388-17449)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (57-238)||(11465-11648)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (74-174)||(3485-3585)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (57-238)||(38193-38376)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (140-238)||(15485-15583)
scaffold0114 (11-66)||(27959-28014)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (89-238)||(1018-1168)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (11-73)||(1591-1653)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (11-73)||(3186-3248)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (125-238)||(39914-40027)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (74-238)||(3471-3636)
scaffold0292 (74-238)||(344-508)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (132-238)||(8480-8587)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (158-220)||(11982-12044)
scaffold0503 (68-127)||(12042-12101)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (140-232)||(11464-11557)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (68-238)||(8482-8649)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (140-223)||(13513-13596)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (140-238)||(32068-32165)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (134-238)||(6136-6244)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (59-224)||(8481-8650)
scaffold0621 (178-238)||(6536-6597)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (89-238)||(1953-2103)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (149-238)||(4713-4803)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (134-221)||(24317-24406)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (57-165)||(225482-225590)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (178-238)||(4893-4953)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (11-73)||(10824-10886)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (68-174)||(13158-13264)
scaffold0175 (183-231)||(281-329)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (15-73)||(36007-36065)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (68-165)||(16049-16146)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (68-165)||(27698-27795)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (186-238)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (186-238)||(6612-6664)
scaffold0333 (186-238)||(13992-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (186-238)||(6191-6243)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (74-158)||(27912-27996)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (178-238)||(121767-121827)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (186-238)||(15845-15897)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (57-158)||(7996-8098)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (186-232)||(29561-29607)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (178-232)||(15298-15352)
scaffold0106 (11-73)||(15209-15273)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (134-238)||(20911-21017)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (181-238)||(193039-193097)
scaffold0017 (181-235)||(15273-15327)
scaffold0017 (181-235)||(19795-19849)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (11-73)||(645-709)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (11-73)||(4240-4304)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (11-73)||(1263-1327)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (11-73)||(15083-15147)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (137-232)||(15668-15764)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (186-230)||(1091-1135)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (57-165)||(12643-12751)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (178-235)||(7330-7387)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (178-225)||(19278-19326)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (134-224)||(32551-32642)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (178-225)||(129919-129967)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34963598 - 34963364
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34963598 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 34963499  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34963498 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgag 34963399  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963398 tcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25656854 - 25656633
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656854 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 25656755  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25656754 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 25656655  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  25656654 tcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 30676647 - 30676881
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30676647 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 30676746  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30676747 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 30676846  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676847 tcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 2291117 - 2291338
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  2291117 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 2291216  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2291217 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 2291316  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  2291317 tcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12742542 - 12742321
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  12742542 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 12742443  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12742442 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12742343  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  12742342 tcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24422772 - 24422551
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24422772 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24422673  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24422672 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 24422573  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  24422572 tcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33862019 - 33861798
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  33862019 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 33861920  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33861919 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 33861820  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  33861819 tcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33864503 - 33864282
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  33864503 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 33864404  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33864403 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 33864304  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  33864303 tcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8055254 - 8055033
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  8055254 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 8055155  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8055154 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 8055055  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  8055054 tcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 18334529 - 18334750
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18334529 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 18334628  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18334629 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18334728  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18334729 tcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19005271 - 19005050
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  19005271 gatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 19005172  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19005171 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 19005072  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  19005071 tcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 19858856 - 19859077
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  19858856 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 19858955  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19858956 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 19859055  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  19859056 tcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22782452 - 22782231
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  22782452 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtg 22782353  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22782352 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 22782253  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22782252 tcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 1540848 - 1541069
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  1540848 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 1540947  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1540948 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 1541047  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  1541048 tcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25688724 - 25688507
Alignment:
Q  14 gaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688724 gaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtga 25688625  T
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattca 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  25688624 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 25688525  T
Q  214 gtctaagttgattaagat 231  Q
     |||||||||||||||||    
T  25688524 atctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 26924577 - 26924798
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  26924577 gatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 26924676  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26924677 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 26924776  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26924777 tcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595553
Alignment:
Q  22 atatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  122 gacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagt 221  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  222 tgattaagatg 232  Q
    |||||||||||    
T  1595563 tgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  62 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgtt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  161 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  58 tttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  158 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  87 tatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 186  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  187 tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 241  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848122
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaa-taattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || |||  || || | ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
     || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  77 gatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-t 175  Q
    ||||||||  ||| || |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  176 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593774
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  213 agtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     |||||||||||| |||||| |||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303660
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac-tgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  213 agtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     ||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Original strand, 17287809 - 17287916
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  17287809 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17287908  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  17287909 tgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638403
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  20638398 atgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12942426 - 12942363
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatatt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12942426 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16496350 - 16496245
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  16496350 ttgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 16496251  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  16496250 atgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076701
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20076707  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  20076706 atgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Original strand, 22780240 - 22780347
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 22780339  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  22780340 tgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23992485 - 23992421
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23992485 tgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||  | |||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  174 g-ttgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 28289272 - 28289326
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 65  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28289272 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 28289326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18914052 - 18913997
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18914052 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgtt 18913997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18937310 - 18937255
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18937310 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgtt 18937255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227557
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  156 atgttgtttt 165  Q
    ||| ||||||    
T  8227548 atgatgtttt 8227557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15875530 - 15875469
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15875530 atgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataat--tatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 31630584 - 31630626
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31630584 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg-attaagatgttgatg 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  239 atgatgt 245  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg-attaagatgttgatg 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  239 atgatgt 245  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929716
Alignment:
Q  187 tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16929716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965436
Alignment:
Q  187 tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766698
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 21766698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790870
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 19790870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagt 215  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||| | || ||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  216 ctaag 220  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 32214858 - 32215092
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32214858 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 32214957  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  32214958 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 32215057  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215058 tcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18809168 - 18808947
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18809168 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 18809069  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18809068 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18808969  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18808968 tcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 23709469 - 23709690
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  23709469 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 23709568  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23709569 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23709668  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23709669 tcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 23711950 - 23712171
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  23711950 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 23712049  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23712050 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23712149  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23712150 tcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39682538 - 39682317
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  39682538 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 39682439  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  39682438 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 39682339  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  39682338 tcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6726220 - 6725999
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  6726220 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 6726121  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6726120 tgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 6726021  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  6726020 tcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 21154997 - 21155218
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21154997 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 21155096  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21155097 tgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21155196  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21155197 tcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23131087 - 23130866
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  23131087 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 23130988  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23130987 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23130888  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23130887 tcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23133554 - 23133333
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  23133554 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 23133455  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23133454 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23133355  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23133354 tcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 34402459 - 34402680
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  34402459 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 34402558  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  34402559 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 34402658  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  34402659 tcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 571621 - 571401
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  571621 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 571522  T
Q  112 gaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgatt 211  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  571521 gaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 571422  T
Q  212 cagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  571421 cggtctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23135815 - 23135594
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  23135815 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 23135716  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23135715 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23135616  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23135615 tcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 32039435 - 32039656
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  32039435 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 32039534  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  32039535 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgag 32039634  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  32039635 ccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24898132 - 24898354
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24898132 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24898231  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24898232 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 24898331  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  24898332 gtcggtctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24900615 - 24900837
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24900615 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24900714  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24900715 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 24900814  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  24900815 gtcggtctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24903092 - 24903314
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24903092 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24903191  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24903192 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 24903291  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  24903292 gtcggtctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24905569 - 24905791
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24905569 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24905668  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24905669 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 24905768  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  24905769 gtcggtctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24908044 - 24908266
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24908044 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24908143  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24908144 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 24908243  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  24908244 gtcggtctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24367999 - 24367782
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24367999 gatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24367900  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24367899 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 24367800  T
Q  211 tcagtctaagttgattaa 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  24367799 tcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26505604 - 26505383
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  26505604 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 26505505  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26505504 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 26505405  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26505404 tcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26508082 - 26507861
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  26508082 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 26507983  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26507982 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 26507883  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26507882 tcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28577324 - 28577103
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  28577324 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 28577225  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28577224 tgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 28577125  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  28577124 tcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 45029791 - 45030012
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  45029791 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatg 45029890  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  45029891 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 45029990  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  45029991 tcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22105638 - 22105416
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  22105638 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 22105539  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22105538 tgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 22105439  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  22105438 gtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38967599 - 38967378
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  38967599 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatg 38967501  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  38967500 tgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatga 38967401  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  38967400 gtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  58 tttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  158 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529687
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaa-taattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 24642791 - 24642933
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24642791 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 24642890  T
Q  109 tgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattatta 151  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24642891 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  | |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  59 ttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  159 ttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || |||  || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Original strand, 24643036 - 24643108
Alignment:
Q  160 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24643036 tgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20261444 - 20261381
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatatt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20261444 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 22731249 - 22731354
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22731249 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 22731348  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  22731349 atgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  174 g-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23285967 - 23285866
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  23285967 ttgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  23285871 atgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38234
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtga 113  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 298829 - 298929
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  298829 ttgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298928  T
Q  232 g 232  Q
    |    
T  298929 g 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 22738195 - 22738299
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgt 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     ||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  22738195 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatga 22738294  T
Q  234 tgatg 238  Q
    |||||    
T  22738295 tgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25616243 - 25616179
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616243 tgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 23654401 - 23654506
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | || || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  23654401 ttgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  23654501 atgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   |||||| || ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatact 23660090  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040309
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||   | | ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  158 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  23708658 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679592
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 10684700 - 10684764
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10684700 gatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28406083 - 28405990
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28406083 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 23707259 - 23707323
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23707259 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24918260 - 24918196
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24918260 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 25616406 - 25616365
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgat 52  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25616406 gatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946658
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtatta 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 22459501 - 22459587
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgat 144  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  | |||| ||||||||    
T  22459501 ttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Original strand, 23103416 - 23103515
Alignment:
Q  138 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||    
T  23103416 atttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 23103513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869906
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 24869906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25175912 - 25175864
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25175912 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961625
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 25961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16362143 - 16361908
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  16362143 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattattt 16362044  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16362043 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatga 16361944  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361943 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21840992 - 21840766
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21840992 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatg 21840893  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21840892 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21840793  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21840792 tcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 23593672 - 23593893
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23593672 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 23593771  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23593772 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 23593871  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23593872 tcggtctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13989091 - 13988870
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  13989091 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 13988992  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13988991 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 13988892  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13988891 tcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 21923228 - 21923449
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21923228 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 21923327  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21923328 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21923427  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21923428 tcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29776913 - 29776692
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29776913 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29776814  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29776813 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 29776714  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29776713 tcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 21475024 - 21475245
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21475024 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 21475123  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21475124 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21475223  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  21475224 ttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29298361 - 29298141
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29298361 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29298262  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29298261 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 29298163  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29298162 tcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31612538 - 31612317
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  31612538 gatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 31612439  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31612438 tgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 31612339  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  31612338 tcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 22123004 - 22123226
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  22123004 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatg 22123103  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  22123104 tgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatga 22123203  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||| ||||||||||    
T  22123204 gtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 15859945 - 15860167
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||| ||    
T  15859945 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttg 15860044  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15860045 tgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 15860144  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || ||| |||||||||||||||    
T  15860145 gtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 16275300 - 16275522
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||    
T  16275300 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatg 16275399  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16275400 tgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatga 16275499  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  16275500 gtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213026
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346965
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  62 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgtt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  161 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433016
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  || | | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 241  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Original strand, 22468688 - 22468823
Alignment:
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||| ||| || | ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||  |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22468688 tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468788 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509787
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  213 agtctaagttgattaagatg 232  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20135286 - 20135181
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135286 tgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 20135187  T
Q  240 tgatgt 245  Q
    ||||||    
T  20135186 tgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||||||   |||||| || ||| ||| || | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  | |||| |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 245
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||| |||||  |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  138 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  237 tg 238  Q
    ||    
T  20847273 tg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 21861518 - 21861616
Alignment:
Q  67 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 165  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  21861518 tttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 21861616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  20 ttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 22050826 - 22050866
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttga 51  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22050826 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21026786 - 21026696
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  21026786 ttgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16758823 - 16758664
Alignment:
Q  67 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtt-tt 165  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  ||| || ||| ||   ||| |||||||||| |||| |||||   |  ||    
T  16758823 tttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtt 16758725  T
Q  166 tgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33681069 - 33681022
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33681069 tgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754049
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 19618109 - 19618343
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  19618109 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatagg 19618208  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19618209 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 19618308  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19618309 tcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 14970644 - 14970878
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14970644 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatg 14970743  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14970744 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 14970843  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14970844 ttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3515232 - 3515011
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3515232 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 3515133  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  3515132 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgag 3515033  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  3515032 tcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 15118289 - 15118510
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  15118289 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 15118388  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15118389 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15118488  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  15118489 tcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52312734 - 52312514
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  52312734 atgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 52312635  T
Q  112 gaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgatt 211  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52312634 gaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 52312535  T
Q  212 cagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  52312534 cggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19242925 - 19242703
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19242925 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 19242826  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19242825 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 19242726  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  19242725 gtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 12244 - 12465
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  12244 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 12343  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12344 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12443  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  12444 tcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 18215211 - 18215432
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18215211 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 18215310  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18215311 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18215410  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18215411 tcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44615513 - 44615292
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  44615513 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 44615414  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  44615413 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 44615314  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44615313 tcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15355261 - 15355487
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  15355261 gatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatg 15355360  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15355361 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 15355460  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  15355461 gtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 18239356 - 18239577
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18239356 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 18239455  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18239456 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18239555  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18239556 tcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 50222276 - 50222497
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  50222276 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 50222375  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50222376 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 50222475  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  50222476 tcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 1837446 - 1837667
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  1837446 gatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatg 1837545  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1837546 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 1837645  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1837646 tcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 44773020 - 44773245
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa----gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaatta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  44773020 gatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 44773119  T
Q  107 tatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgca 206  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44773120 tttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 44773219  T
Q  207 tgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  44773220 tgagtcggtctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  60 tgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  159 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Original strand, 44928872 - 44929038
Alignment:
Q  67 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44928872 tttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgttttt 44928971  T
Q  167 gtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44928972 gtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 7641139 - 7641340
Alignment:
Q  21 tatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattg 120  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7641139 tatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattg 7641238  T
Q  121 agacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7641239 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7641328  T
Q  221 ttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||    
T  7641329 ttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  62 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgtt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  161 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtct 217  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  218 aagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||   || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Original strand, 54798728 - 54798868
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 191  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798728 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgtta 54798827  T
Q  192 tttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54798828 ttcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Original strand, 8574887 - 8574981
Alignment:
Q  137 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  8574887 catttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7798882 - 7798775
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7798882 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7798783  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  7798782 tgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Original strand, 52873380 - 52873487
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  52873380 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 52873479  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  52873480 tgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7088983 - 7088878
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  7088983 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7088884  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  7088883 atgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353910
Alignment:
Q  63 tgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgt 162  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  163 t 163  Q
    |    
T  22353910 t 22353910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7893811 - 7893704
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7893811 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 7893712  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  7893711 tgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  | |||| |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||  | | || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15534406 - 15534343
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatatt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15534406 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 36038095 - 36038033
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36038095 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatact 6899958  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 14048802 - 14048740
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14048802 gatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44052935 - 44052830
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  44052935 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatg 44052836  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  44052835 atgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 16239962 - 16240089
Alignment:
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16239962 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatga 16240060  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  16240061 gttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 15497008 - 15497070
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15497008 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 49547711 - 49547773
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49547711 gatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 52873115 - 52873176
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttata 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  52873115 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||  | |||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  158 g--ttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |  ||| ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43198592 gaattg-ttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  154 tcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 23374374 - 23374475
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| | ||||||    
T  23374374 ttgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T
Q  233 tt 234  Q
    ||    
T  23374474 tt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||  |||||| ||| || | || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  156 atgttgt-ttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||   |  |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  52243231 atgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 362310 - 362268
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  362310 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706408
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 14746554 - 14746618
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14746554 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  21 tatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464970
Alignment:
Q  76 tgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||  |||||| ||| || | |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053421
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || | |||||| ||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551818
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12774069 - 12774021
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12774069 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 16413253 - 16413476
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16413253 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 16413352  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16413353 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16413452  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgtt 234  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  16413453 tcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1484627 - 1484406
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  1484627 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 1484528  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1484527 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 1484428  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1484427 tcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 5853229 - 5853450
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  5853229 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 5853328  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5853329 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 5853428  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5853429 tcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 20046132 - 20046353
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20046132 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 20046231  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20046232 taaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20046331  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20046332 tcggtctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20403452 - 20403231
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20403452 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 20403353  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20403352 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20403253  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20403252 tcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 14409381 - 14409602
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  14409381 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 14409480  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14409481 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 14409580  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14409581 tcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22001978 - 22001757
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  22001978 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 22001879  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22001878 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 22001779  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22001778 tcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 15203168 - 15203389
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  15203168 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 15203267  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15203268 tgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15203367  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  15203368 tcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4483505 - 4483285
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  4483505 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 4483406  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  4483405 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgag 4483307  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4483306 tcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 4542310 - 4542531
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||    
T  4542310 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatg 4542409  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4542410 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 4542509  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4542510 tcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 45290631 - 45290857
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  45290631 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatg 45290730  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45290731 tgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 45290830  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  45290831 gtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19896494 - 19896269
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttt-aagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  19896494 gatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19896395  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatatta---ttatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgca 206  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19896394 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 19896295  T
Q  207 tgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  19896294 tgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14824000 - 14823778
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  14824000 gatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 14823901  T
Q  109 tgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||    
T  14823900 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatg 14823801  T
Q  209 attcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |  |||||| ||||||||||||    
T  14823800 agt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598192
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 19936940 - 19937164
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || |||  |||||||||     
T  19936940 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatt 19937039  T
Q  109 tgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcat 207  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19937040 tgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcat 19937139  T
Q  208 gattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || || ||| |||||||||||||||    
T  19937140 gagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15070785 - 15070571
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| || | ||  ||||| |    
T  15070785 gatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatct 15070686  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15070685 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 15070586  T
Q  209 attcagtctaagttg 223  Q
    | || ||||||||||    
T  15070585 agtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 241  Q
    || | |||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801516
Alignment:
Q  59 ttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  159 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatga 19801516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 24485981 - 24486093
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24485981 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24486080  T
Q  111 tgaataattgaga 123  Q
    |||||||||||||    
T  24486081 tgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||  ||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 238
Target Start/End: Original strand, 16092341 - 16092462
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtc 216  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  16092341 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16092440  T
Q  217 taagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  16092441 taagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32810156 - 32810054
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  32810156 gatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 32810057  T
Q  111 tga 113  Q
    |||    
T  32810056 tga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23406487 - 23406380
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  23406487 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23406388  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  23406387 tgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23648652 - 23648547
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648652 tgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 23648553  T
Q  240 tgatgt 245  Q
    ||||||    
T  23648552 tgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 28649039 - 28649167
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28649039 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtc 28649138  T
Q  213 agtctaagttgattaagatgttgatgatg 241  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649139 ggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7372886 - 7372779
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7372886 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  7372786 tgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Original strand, 18818358 - 18818529
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18818358 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 18818457  T
Q  168 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  18818458 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Original strand, 26225267 - 26225405
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 192  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26225267 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597735
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
    ||| || ||||| || ||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923903 - 21924048
Alignment:
Q  94 attagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 192  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  21923903 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttat 21924002  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  21924003 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26219859 - 26219721
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 192  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26219859 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508203
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
    ||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 21919015 - 21919120
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21919114  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  21919115 atgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||||   |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22626803  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 18678165 - 18678229
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678165 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971258
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 17612058 - 17612230
Alignment:
Q  67 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 166  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||     
T  17612058 tttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt- 17612156  T
Q  167 gtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    | ||||||  | ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  17612157 gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32121790 - 32121726
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121790 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 18879268 - 18879351
Alignment:
Q  156 atgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  18879268 atgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498644
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  156 atg 158  Q
    |||    
T  20498646 atg 20498644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 38550048 - 38550090
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38550048 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6520430 - 6520369
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  6520430 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199764
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| ||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 38855310 - 38855371
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  38855310 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131116
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21285703 - 21285606
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21285703 ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 32121953 - 32121912
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgat 52  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32121953 gatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Original strand, 1326990 - 1327042
Alignment:
Q  21 tatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  1326990 tatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 39094987 - 39095041
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  39094987 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 39095041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17140978 - 17140917
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  17140978 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 18678002 - 18678043
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgat 52  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  18678002 gatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 20856492 - 20856541
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20856492 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 20856541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21491057 - 21490996
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  21491057 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10998 - 10772
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  10998 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatg 10899  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10898 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 10799  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  10798 tcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13544250 - 13544016
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13544250 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 13544151  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13544150 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 13544051  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13544050 tcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12567785 - 12567551
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12567785 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 12567686  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12567685 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12567586  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12567585 tcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 16454218 - 16454439
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  16454218 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 16454317  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16454318 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgag 16454417  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16454418 tcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17463403 - 17463182
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  17463403 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 17463304  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17463303 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 17463204  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  17463203 tcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 45606844 - 45607065
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  45606844 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 45606943  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  45606944 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45607043  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  45607044 tcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 7781284 - 7781505
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  7781284 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 7781383  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7781384 tgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 7781483  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  7781484 tcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8899319 - 8899098
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  8899319 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 8899220  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8899219 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 8899120  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  8899119 tcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34159551 - 34159330
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  34159551 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 34159452  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  34159451 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 34159352  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  34159351 tcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55476716 - 55476495
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  55476716 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 55476617  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  55476616 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 55476517  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  55476516 tcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 6469071 - 6469292
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  6469071 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatg 6469170  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6469171 tgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 6469270  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  6469271 tcggtctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 10247660 - 10247881
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  10247660 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 10247759  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||     
T  10247760 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgag 10247859  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  10247860 tcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 16282748 - 16282969
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  16282748 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 16282847  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16282848 tgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16282947  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16282948 tcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 28848548 - 28848769
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  28848548 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 28848647  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28848648 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 28848747  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  28848748 tcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 13154192 - 13154414
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  13154192 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 13154291  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13154292 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 13154391  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  13154392 gtcggtctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 9707544 - 9707765
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  9707544 gatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 9707643  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9707644 tgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 9707743  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  9707744 tcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 38961828 - 38962045
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  38961828 gatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 38961927  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38961928 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 38962027  T
Q  211 tcagtctaagttgattaa 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  38962028 tcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 13151727 - 13151949
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  13151727 gatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 13151826  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13151827 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatga 13151926  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  13151927 gtcggtctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41124110 - 41123894
Alignment:
Q  13 tgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  41124110 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtg 41124011  T
Q  113 aataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41124010 aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtc 41123914  T
Q  213 agtctaagttgattaagatg 232  Q
     |||||||||||||||||||    
T  41123913 ggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Original strand, 17446615 - 17446812
Alignment:
Q  34 gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaac 133  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  17446615 gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgac 17446714  T
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17446715 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8499744 - 8499522
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||| ||    
T  8499744 atgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctg 8499645  T
Q  111 tgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8499644 tgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 8499545  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  8499544 gtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15412656 - 15412433
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | ||  ||||| |    
T  15412656 gatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatct 15412557  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15412556 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 15412457  T
Q  209 attcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  15412456 agtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Original strand, 29172580 - 29172741
Alignment:
Q  71 tattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtat 170  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29172580 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 29172679  T
Q  171 actgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29172680 actgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 53301441 - 53301665
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  53301441 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatat 53301540  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgca 206  Q
     |||||| ||||||  || | | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  53301541 atgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgta 53301639  T
Q  207 tgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  53301640 tgagtcggtctaagttgattaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119883
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  105 tatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  205 catgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27165477 - 27165254
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | || || ||||||||    
T  27165477 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatat 27165378  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcat 207  Q
     |||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27165377 atgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcat 27165279  T
Q  208 gattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  27165278 gagtcggtctaagttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55501046 - 55500946
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  55501046 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 55500947  T
Q  232 g 232  Q
    |    
T  55500946 g 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| ||| |||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  174 gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || |||  ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36166740 - 36166602
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 192  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  36166740 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21618591 - 21618459
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 192  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21618591 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgatt 226  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  133 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340843
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| || || || ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  137 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||  | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  174 -gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
       ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386428
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||  |||||||||   |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagt 221  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43841104 - 43840940
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43841104 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 43841005  T
Q  168 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| |||||    
T  43841004 tatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18438642 - 18438535
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 18438543  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  18438542 tgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12399315 - 12399210
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  12399315 ttgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 12399216  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  12399215 atgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 20698450 - 20698555
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20698450 ttgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  20698550 atgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 23083353 - 23083481
Alignment:
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23083353 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 23083452  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     || |||||||||||| |||||| |||||    
T  23083453 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  138 atttgatattattatgtcatgttgtttttgta---tactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagt 221  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26686995 - 26686888
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaaga 26686896  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  26686895 tgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 54521047 - 54520985
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54521047 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 29544779 - 29544839
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttat 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29544779 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46822323 - 46822259
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822323 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424879
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12305370 - 12305315
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305370 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 232
Target Start/End: Original strand, 24153184 - 24153322
Alignment:
Q  94 attagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 192  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||| | |||||    
T  24153184 attatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttat 24153282  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24153283 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572603
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029834
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatga 30029840  T
Q  240 tgatgt 245  Q
    ||||||    
T  30029839 tgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12511115 - 12511051
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12511115 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattg 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14234549 - 14234488
Alignment:
Q  178 tgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14234549 tgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642311
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  156 atgttgtttt 165  Q
    ||| ||||||    
T  37642302 atgatgtttt 37642311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| || | |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  158 g 158  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15977754 - 15977696
Alignment:
Q  15 aagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  15977754 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 22147473 - 22147571
Alignment:
Q  67 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 165  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147473 tttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  183 ctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 220
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| || | ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  158 gttgt-ttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |   | ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  52523766 gaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 11913987 - 11914051
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11913987 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 46822486 - 46822445
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgat 52  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46822486 gatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 3403019 - 3403073
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3403019 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3403073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10557133 - 10557091
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgatt 53  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10557133 gatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32307739 - 32307681
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  32307739 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174366
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210447
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9467 - 9241
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  9467 gatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatg 9368  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9367 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 9268  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgat 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  9267 tcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4698
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4919 gatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 4820  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4819 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 4720  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  4719 tcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24702463 - 24702242
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24702463 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24702364  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24702363 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 24702264  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  24702263 tcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 456546 - 456325
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  456546 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 456447  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  456446 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 456347  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  456346 tcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 11393224 - 11393445
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  11393224 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 11393323  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11393324 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 11393423  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  11393424 tcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 15376650 - 15376871
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  15376650 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 15376749  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15376750 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15376849  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  15376850 tcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16232745 - 16232524
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  16232745 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 16232646  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16232645 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16232546  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16232545 tcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 20385060 - 20385281
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20385060 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 20385159  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20385160 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20385259  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20385260 tcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 21189532 - 21189753
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21189532 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 21189631  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21189632 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21189731  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21189732 tcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32125716 - 32125495
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  32125716 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 32125617  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32125616 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 32125517  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  32125516 tcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41523142 - 41522921
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41523142 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 41523043  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41523042 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 41522943  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  41522942 tcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41525604 - 41525383
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41525604 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 41525505  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41525504 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 41525405  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  41525404 tcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 14949059 - 14949280
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  14949059 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 14949158  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14949159 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 14949258  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14949259 tcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16410284 - 16410063
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16410284 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatg 16410185  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16410184 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16410085  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16410084 tcggtctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18640497 - 18640276
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18640497 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 18640398  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18640397 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18640298  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18640297 tcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27217085 - 27216864
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  27217085 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 27216986  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27216985 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 27216886  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  27216885 ttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11972721 - 11972500
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  11972721 gatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 11972622  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11972621 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 11972522  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  11972521 tcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16213909 - 16213688
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16213909 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 16213810  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16213809 tgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16213710  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16213709 tcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18430937 - 18430710
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18430937 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 18430838  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18430837 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 18430738  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||    
T  18430737 tcggtctaagttgattaagatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24704910 - 24704692
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  24704910 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 24704811  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24704810 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 24704714  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  24704713 tcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13869573 - 13869350
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | ||  ||||| |    
T  13869573 gatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatct 13869474  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13869473 ttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 13869374  T
Q  209 attcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  13869373 agtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116513
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  58 tttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  158 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  87 tatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 186  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  187 tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 26355918 - 26356152
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  26355918 gatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 26356017  T
Q  109 tgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtt-----------gctgttgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||    
T  26356018 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaac 26356117  T
Q  198 taagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26356118 tttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 26358370 - 26358604
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  26358370 gatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 26358469  T
Q  109 tgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtt-----------gctgttgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||    
T  26358470 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaac 26358569  T
Q  198 taagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26358570 tttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 200
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756797
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  59 ttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  159 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     ||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatg 232  Q
     || |||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 15081884 - 15082019
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattata 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  15081884 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattata 15081983  T
Q  109 tgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  15081984 tgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  117 attgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagt 215  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  216 ctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 3564359 - 3564478
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3564359 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 3564458  T
Q  213 agtctaagttgattaagatg 232  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  3564459 ggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 13841237 - 13841157
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatat 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13841237 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    ||| || ||||| ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    ||||||||||| |||| |  |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11303472 - 11303409
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatatt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303472 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatac 172  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  173 tg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18627791 - 18627717
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataatt 85  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18627791 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9509295 - 9509190
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  9509295 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 9509196  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  9509195 atgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10589145 - 10589055
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  10589145 ttgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 16108626 - 16108688
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16108626 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26212102 - 26212012
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  26212102 ttgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 14269999 - 14270061
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14269999 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063938
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| || || || |||| |  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 224
Target Start/End: Original strand, 15144052 - 15144143
Alignment:
Q  133 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15144052 cttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 8468865 - 8468803
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  8468865 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 23664898 - 23664952
Alignment:
Q  19 gttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23664898 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932848
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356283
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360397
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagt 215  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  216 ctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 67807 - 67746
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  67807 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15211515 - 15211450
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15211515 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486790
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  156 atgttgtttt 165  Q
    ||| ||||||    
T  19486781 atgatgtttt 19486790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29796835 - 29796771
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29796835 gatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29800654 - 29800590
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29800654 gatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255830
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| |  | || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  158 g 158  Q
    |    
T  12255830 g 12255830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831808
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15116661 - 15116568
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattat 152  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||    
T  15116661 ttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 8940399 - 8940335
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8940399 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 38898165 - 38898229
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38898165 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  214 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatga 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16056433 - 16056343
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||    
T  16056433 ttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505418
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34200848 - 34200787
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  34200848 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 16386316 - 16386368
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  16386316 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18005708 - 18005660
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  18005708 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11514 - 11279
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataa-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  11514 gatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatat 11415  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11414 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 11315  T
Q  210 ttcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11314 gtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 501309 - 501075
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  501309 gatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 501210  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  501209 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 501110  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  501109 tcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85738
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 160790 - 160698
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  160790 ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20972 - 20751
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20972 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 20873  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20872 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20773  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20772 tcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38046 - 37825
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  38046 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 37947  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37946 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 37847  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  37846 tcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 94636 - 94415
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  94636 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 94537  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  94536 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 94437  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  94436 tcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 17377 - 17600
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17377 gatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatg 17476  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  17477 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgag 17576  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatgtt 234  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  17577 tcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  77 gatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttg-tttttgtatactgt 175  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  176 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100388
Alignment:
Q  107 tatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttg 204  Q
    ||||| |||| |||||| ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  205 catgattcagtctaagttgat 225  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38593
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119876
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Original strand, 40245 - 40281
Alignment:
Q  189 ttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40245 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 264705 - 264926
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  264705 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 264804  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  264805 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 264904  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  264905 tcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 42245302 - 42245523
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  42245302 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 42245401  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42245402 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgag 42245501  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  42245502 tcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39245361 - 39245140
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  39245361 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 39245262  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  39245261 tgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 39245162  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  39245161 tcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39363609 - 39363388
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  39363609 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 39363510  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  39363509 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 39363410  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  39363409 tcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 10732877 - 10733098
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  10732877 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 10732976  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10732977 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 10733076  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  10733077 tcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20909237 - 20909016
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20909237 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 20909138  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20909137 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgag 20909038  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20909037 tcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29346205 - 29345984
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29346205 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29346106  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||     
T  29346105 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgag 29346006  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29346005 tcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32027618 - 32027397
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  32027618 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 32027519  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  32027518 tgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgag 32027419  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  32027418 tcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29330156 - 29329938
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29330156 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29330060  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29330059 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 29329960  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29329959 tcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29348678 - 29348457
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29348678 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29348579  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||     
T  29348578 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgag 29348479  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29348478 tcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29351151 - 29350930
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29351151 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 29351052  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||     
T  29351051 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgag 29350952  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  29350951 tcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 20917889 - 20918106
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||    
T  20917889 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatg 20917988  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20917989 tgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 20918084  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20918085 tcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  59 ttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  159 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38619661 - 38619438
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| || | ||  ||||| |    
T  38619661 gatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatct 38619562  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  38619561 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatg 38619462  T
Q  209 attcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  38619461 agtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154772
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaa-taattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23064738 - 23064515
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || | ||  ||||| |    
T  23064738 gatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatct 23064639  T
Q  110 gtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  23064638 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatg 23064539  T
Q  209 attcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  23064538 agtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  62 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgtt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  161 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902168
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaa-taattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg-attaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  62 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgtt 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  161 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 232
Target Start/End: Original strand, 10775670 - 10775834
Alignment:
Q  69 tatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  10775670 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggtttta 10775769  T
Q  168 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10775770 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Original strand, 21997546 - 21997654
Alignment:
Q  131 aacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||    
T  21997546 aacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  230 atgttgatg 238  Q
    ||| |||||    
T  21997646 atgatgatg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || |||  ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 23390511 - 23390616
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  23390511 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23390610  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  23390611 atgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   || |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529227
Alignment:
Q  114 ataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattc 212  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  213 agtctaagttgattaagatg 232  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||| | || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaa 219  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 8286857 - 8286963
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt-gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8286857 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8286956  T
Q  232 gttgatg 238  Q
    | |||||    
T  8286957 gatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 21729079 - 21729184
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  21729079 ttgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21729178  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  21729179 atgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 21808404 - 21808509
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  21808404 ttgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21808503  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  21808504 atgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || || | ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 17517264 - 17517328
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517264 tgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22412330 - 22412191
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 191  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||| | | ||||    
T  22412330 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgtta 22412232  T
Q  192 tttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  22412231 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22075125 - 22075035
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac-tgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  22075125 ttgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13025378  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13095562  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 9776581 - 9776521
Alignment:
Q  13 tgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9776581 tgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 20766094 - 20766181
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtt 181  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20766094 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| || | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  174 -gttgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
       | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  141 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt-aactaagttgcatgattcagtctaagttgattaag 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725935
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  156 atg 158  Q
    |||    
T  40725937 atg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329617
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 37804841 - 37804902
Alignment:
Q  12 atgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  37804841 atgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 17517101 - 17517142
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgat 52  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17517101 gatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 21293029 - 21293089
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||||    
T  21293029 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 232
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  177 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37723965 - 37723906
Alignment:
Q  178 tgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttga 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  37723965 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660955
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502276
Alignment:
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959639
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680608
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 26680608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952215
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatga 26952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12420
Alignment:
Q  19 gttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  119 tgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtcta 218  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  219 agttgattaagatgttgatgatgatgt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14172 - 13951
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  14172 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 14073  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  14072 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgag 13973  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13972 tcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 136905 - 136684
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  136905 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 136806  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  136805 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 136706  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  136705 tcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 139374 - 139153
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  139374 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 139275  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  139274 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 139175  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  139174 tcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 144312 - 144091
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  144312 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 144213  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  144212 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 144113  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  144112 tcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 134436 - 134215
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  134436 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 134337  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  134336 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 134237  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  134236 tcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 141843 - 141622
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  141843 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatg 141744  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  141743 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 141644  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  141643 tcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13617 - 13396
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  13617 gatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatg 13518  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13517 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 13418  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13417 tcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40625 - 40404
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||    
T  40625 gatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatg 40526  T
Q  111 tgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  40525 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgag 40426  T
Q  211 tcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  40425 tcggtctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158608
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Original strand, 339968 - 340053
Alignment:
Q  138 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  339968 atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||  ||||  |||||||| | ||| || |||||| |||  | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  158 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    | || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtta-ttaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18147
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9753
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaa-taattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38828  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagtt 222  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttg 142  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  143 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4382 - 4218
Alignment:
Q  69 tatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4382 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttg 4283  T
Q  168 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4282 tatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtttt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  174 gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  44 gatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  144 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtca 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  157 tgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17340
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt--gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcag 214  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 17313  T
Q  215 tctaagttgattaagatgttgatgatg 241  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17314 tctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 38593 - 38816
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | || |||||||||||    
T  38593 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatat 38692  T
Q  110 gtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcat 207  Q
     | |||| ||||||  ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38693 ataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcat 38791  T
Q  208 gattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  38792 gagtaggtctaagttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  57 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  156 at 157  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  174 gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Original strand, 44681 - 44821
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 191  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44681 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 44780  T
Q  192 tttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44781 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  118 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtc 216  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26163  T
Q  217 taagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26164 taagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 116572 - 116434
Alignment:
Q  93 tattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 192  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  116572 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  193 ttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 53809 - 53873
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53809 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6172 - 6070
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  6172 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatg 6073  T
Q  111 tga 113  Q
    |||    
T  6072 tga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51914
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  168 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168098
Alignment:
Q  89 tatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 187  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 241
Target Start/End: Original strand, 3204 - 3309
Alignment:
Q  137 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3303  T
Q  236 atgatg 241  Q
    ||||||    
T  3304 atgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28520 - 28415
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  28520 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 28421  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  28420 atgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11354 - 11293
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  11354 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1998
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4553
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  || ||| |||| ||||| ||||  |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  || ||| |||| ||||| ||||  |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4955 - 4850
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  4955 ttgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4856  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  4855 atgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  79 tataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattat 152  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 32972 - 33076
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  32972 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 33070  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  33071 atgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46033 - 45929
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  46033 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 45935  T
Q  233 ttgatg 238  Q
     |||||    
T  45934 atgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16220 - 16114
Alignment:
Q  133 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  16220 cttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16121  T
Q  232 gttgatg 238  Q
    | |||||    
T  16120 gatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17449
Alignment:
Q  177 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11465
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3585
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  174 g 174  Q
    |    
T  3585 g 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38376
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| || |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  156 atgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15583
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28014 - 27959
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28014 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgtt 27959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1168
Alignment:
Q  89 tatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 187  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1653 - 1591
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1653 gatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3186
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3248 gatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40027 - 39914
Alignment:
Q  125 gttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  40027 gttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttg 39929  T
Q  224 attaagatgttgatg 238  Q
    || |||||| |||||    
T  39928 atgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  174 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 173  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||   ||||| || ||| ||| || |||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  174 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |  | ||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8587 - 8480
Alignment:
Q  132 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  8587 acttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T
Q  231 tgttgatg 238  Q
    || |||||    
T  8487 tgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11982
Alignment:
Q  158 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaag 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  12044 gttgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12101 - 12042
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12101 ttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgtt 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8649
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8482 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 8581  T
Q  168 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
     ||||||  | ||||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  8582 -atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32068
Alignment:
Q  140 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6244
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg----ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaag 229  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||     |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||    
T  6136 ttgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 6235  T
Q  230 atgttgatg 238  Q
    ||| |||||    
T  6236 atgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  59 ttgatgtt-tttatattgtgatataat--tatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  156 atgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    ||| |||||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  8550 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6597 - 6536
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  6597 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  89 tatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 187  Q
    |||| |||| |||||| || | |||||| || ||| ||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  149 ttatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 24317 - 24406
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagt 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24317 ttgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  156 atgttgtttt 165  Q
    | | ||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4953
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 10824 - 10886
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  10824 gatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13264 - 13158
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13264 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 13165  T
Q  168 tatactg 174  Q
    |||||||    
T  13164 tatactg 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  183 ctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Original strand, 36007 - 36065
Alignment:
Q  15 aagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  36007 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 16049 - 16146
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 165  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||  |||||| ||| || | || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16049 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt 16146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 27698 - 27795
Alignment:
Q  68 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 165  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||  |||||| ||| || | || ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27698 ttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt 27795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1154
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6612
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13992
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6243
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27912
Alignment:
Q  74 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatg 158  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121767
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15897
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttgatg 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  || ||| ||| || | || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  156 atg 158  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29561
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15352
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 15209 - 15273
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15209 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21017 - 20911
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagat 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||| |  |||| || |||||||| | | |||||    
T  21017 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagat 20918  T
Q  232 gttgatg 238  Q
    |||||||    
T  20917 gttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Original strand, 193039 - 193097
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttg-attaagatgttgatg 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  193039 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 15273 - 15327
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  15273 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 19795 - 19849
Alignment:
Q  181 tgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19795 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 709 - 645
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  709 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 4240 - 4304
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4240 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 1263 - 1327
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1263 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15147 - 15083
Alignment:
Q  11 gatgaagtgttatatgtatataagatgtttta--agatgttgattaccatttgatgtttttatat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15147 gatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15668
Alignment:
Q  137 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatg 232  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  15764 cattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  186 ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaaga 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12643
Alignment:
Q  57 atttgatgtt-tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| | | || |||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  156 atgttgtttt 165  Q
    ||| ||||||    
T  12652 atgctgtttt 12643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7387
Alignment:
Q  178 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgattaagatgttg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | | ||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagattaataagatgttg 7387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19326 - 19278
Alignment:
Q  178 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  19326 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32642 - 32551
Alignment:
Q  134 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttga 224  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  32642 ttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 129967 - 129919
Alignment:
Q  178 tgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgattcagtctaagttgat 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  129967 tgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 796 times since January 2019
Visitors: 6719