View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0881_low_58 (Length: 245)

Name: NF0881_low_58
Description: NF0881
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0881_low_58
NF0881_low_58
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (11-245)||(19268-19502)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (7-245)||(67745-67982)
chr7 (11-245)||(18005650-18005884)
chr7 (11-242)||(44014182-44014409)
chr7 (7-245)||(16219600-16219835)
chr7 (7-245)||(47831807-47832045)
chr7 (11-245)||(811014-811248)
chr7 (22-244)||(16056343-16056564)
chr7 (7-241)||(22072913-22073149)
chr7 (22-243)||(12901338-12901560)
chr7 (7-245)||(34200786-34201021)
chr7 (7-245)||(15754772-15755008)
chr7 (7-174)||(16495402-16495567)
chr7 (7-245)||(11995913-11996148)
chr7 (7-245)||(28505184-28505419)
chr7 (7-184)||(2280061-2280238)
chr7 (26-244)||(20220073-20220290)
chr7 (10-133)||(18456408-18456530)
chr7 (7-133)||(38227481-38227606)
chr7 (7-133)||(12698831-12698958)
chr7 (22-198)||(1867923-1868101)
chr7 (10-129)||(3564363-3564482)
chr7 (29-130)||(12255789-12255892)
chr7 (7-167)||(13647325-13647487)
chr7 (22-193)||(14044761-14044935)
chr7 (22-193)||(14354791-14354965)
chr7 (10-167)||(17061919-17062077)
chr7 (7-167)||(18430709-18430870)
chr7 (10-129)||(48273392-48273511)
chr7 (7-133)||(9509189-9509315)
chr7 (10-167)||(456321-456479)
chr7 (10-167)||(11972496-11972654)
chr7 (10-167)||(14949126-14949284)
chr7 (10-167)||(15376717-15376875)
chr7 (10-167)||(16232520-16232678)
chr7 (10-167)||(18640272-18640430)
chr7 (7-202)||(19486668-19486865)
chr7 (10-167)||(20385127-20385285)
chr7 (10-167)||(21189599-21189757)
chr7 (10-167)||(24702238-24702396)
chr7 (10-167)||(32125491-32125649)
chr7 (10-167)||(41522917-41523075)
chr7 (10-167)||(41525379-41525537)
chr7 (25-133)||(10063813-10063921)
chr7 (11-167)||(11393291-11393448)
chr7 (7-133)||(26211995-26212122)
chr7 (7-133)||(16386242-16386369)
chr7 (10-167)||(16410059-16410217)
chr7 (10-167)||(24704688-24704843)
chr7 (10-167)||(27216860-27217018)
chr7 (10-167)||(44116509-44116667)
chr7 (14-129)||(24275175-24275289)
chr7 (30-184)||(15008441-15008597)
chr7 (10-122)||(16213684-16213795)
chr7 (9-126)||(40443393-40443509)
chr7 (7-126)||(10589039-10589158)
chr7 (10-69)||(3386333-3386391)
chr7 (10-60)||(13869346-13869396)
chr7 (10-60)||(20110556-20110606)
chr7 (7-77)||(27847881-27847951)
chr7 (115-188)||(9389636-9389709)
chr7 (10-60)||(13831373-13831423)
chr7 (92-244)||(15113028-15113180)
chr7 (176-245)||(16324175-16324243)
chr7 (22-129)||(15144037-15144143)
chr7 (14-60)||(38898489-38898535)
chr7 (35-135)||(14036282-14036384)
chr7 (35-135)||(14346312-14346414)
chr7 (13-76)||(18154894-18154956)
chr7 (11-60)||(14932802-14932851)
chr7 (92-244)||(15116565-15116717)
chr7 (11-60)||(15356237-15356286)
chr7 (11-60)||(15360351-15360400)
chr7 (10-60)||(26356106-26356156)
chr7 (10-60)||(26358558-26358608)
chr7 (33-79)||(48991206-48991252)
chr7 (8-60)||(2832509-2832561)
chr7 (11-76)||(12187019-12187083)
chr7 (11-76)||(17138113-17138177)
chr7 (11-60)||(19649557-19649606)
chr7 (28-76)||(9177718-9177766)
chr7 (92-128)||(16324135-16324171)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (7-242)||(6535-6769)
scaffold0621 (22-244)||(8481-8706)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (7-241)||(38855139-38855372)
chr8 (7-245)||(6520368-6520605)
chr8 (7-242)||(23760727-23760962)
chr8 (21-242)||(21673718-21673938)
chr8 (11-244)||(21285601-21285834)
chr8 (11-245)||(26355583-26355815)
chr8 (22-243)||(983287-983512)
chr8 (7-245)||(5866160-5866395)
chr8 (7-245)||(21490995-21491230)
chr8 (26-244)||(37116366-37116586)
chr8 (7-245)||(17140916-17141151)
chr8 (26-244)||(20498581-20498800)
chr8 (26-244)||(17266876-17267096)
chr8 (7-174)||(21249384-21249550)
chr8 (7-174)||(21255222-21255388)
chr8 (26-244)||(24353039-24353261)
chr8 (7-133)||(22626736-22626861)
chr8 (7-133)||(16092337-16092463)
chr8 (25-184)||(13508027-13508188)
chr8 (7-133)||(21918995-21919121)
chr8 (8-126)||(28649046-28649164)
chr8 (25-184)||(13597559-13597720)
chr8 (26-196)||(17439436-17439609)
chr8 (7-167)||(17612069-17612231)
chr8 (7-133)||(22875065-22875190)
chr8 (7-133)||(7372778-7372904)
chr8 (7-133)||(20536208-20536334)
chr8 (7-126)||(31971257-31971375)
chr8 (4-120)||(6759255-6759371)
chr8 (10-167)||(14409448-14409606)
chr8 (7-133)||(18818404-18818530)
chr8 (7-133)||(21923923-21924049)
chr8 (7-120)||(23406379-23406492)
chr8 (10-167)||(1484402-1484560)
chr8 (10-167)||(5853296-5853454)
chr8 (7-84)||(18879276-18879352)
chr8 (10-167)||(20046199-20046357)
chr8 (10-167)||(20403227-20403385)
chr8 (10-167)||(22001753-22001911)
chr8 (7-126)||(21395984-21396101)
chr8 (7-126)||(21790477-21790594)
chr8 (7-126)||(16199647-16199765)
chr8 (88-242)||(22364744-22364897)
chr8 (10-133)||(26219717-26219838)
chr8 (14-167)||(16413320-16413474)
chr8 (10-167)||(41598188-41598346)
chr8 (7-126)||(21389454-21389571)
chr8 (7-126)||(21778780-21778897)
chr8 (10-133)||(26225288-26225409)
chr8 (10-167)||(4483281-4483438)
chr8 (10-167)||(15203235-15203393)
chr8 (10-69)||(4542477-4542535)
chr8 (10-69)||(19896265-19896323)
chr8 (7-78)||(45131047-45131117)
chr8 (4-60)||(19937118-19937174)
chr8 (26-196)||(19154816-19154989)
chr8 (14-60)||(45290807-45290853)
chr8 (8-133)||(23648554-23648679)
chr8 (10-60)||(25484380-25484430)
chr8 (9-133)||(18678097-18678221)
chr8 (26-166)||(19801387-19801527)
chr8 (8-167)||(26223917-26224077)
chr8 (10-167)||(14823774-14823931)
chr8 (23-60)||(15070571-15070608)
chr8 (9-133)||(32121734-32121858)
chr8 (88-135)||(40492844-40492891)
chr8 (83-174)||(21383887-21383978)
chr8 (138-202)||(37515837-37515901)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (11-245)||(22921752-22921986)
chr1 (7-245)||(33681010-33681245)
chr1 (7-245)||(22237630-22237866)
chr1 (21-245)||(21754059-21754273)
chr1 (26-244)||(21861453-21861672)
chr1 (22-245)||(52927865-52928076)
chr1 (11-245)||(20248283-20248513)
chr1 (26-244)||(21896142-21896358)
chr1 (7-174)||(14295507-14295672)
chr1 (23-174)||(20918620-20918769)
chr1 (26-244)||(16368170-16368388)
chr1 (26-244)||(50613999-50614219)
chr1 (26-244)||(50621827-50622047)
chr1 (26-244)||(50686630-50686850)
chr1 (22-196)||(16758664-16758841)
chr1 (8-129)||(50210212-50210333)
chr1 (26-230)||(41049933-41050138)
chr1 (26-120)||(35261086-35261180)
chr1 (11-226)||(21161720-21161932)
chr1 (115-245)||(35981571-35981700)
chr1 (7-167)||(45574846-45575008)
chr1 (10-126)||(34509783-34509899)
chr1 (10-167)||(433012-433168)
chr1 (7-133)||(22532269-22532395)
chr1 (7-133)||(27250724-27250850)
chr1 (115-245)||(49261448-49261577)
chr1 (10-167)||(13988866-13989024)
chr1 (9-129)||(21840766-21840885)
chr1 (10-167)||(21923295-21923453)
chr1 (7-133)||(21026680-21026806)
chr1 (10-167)||(21475091-21475249)
chr1 (10-167)||(23593739-23593897)
chr1 (10-167)||(29298137-29298294)
chr1 (10-167)||(29776688-29776846)
chr1 (10-167)||(31612313-31612471)
chr1 (26-185)||(16093825-16093987)
chr1 (8-76)||(20454606-20454673)
chr1 (7-78)||(20847205-20847275)
chr1 (115-245)||(20636957-20637086)
chr1 (7-60)||(13212974-13213027)
chr1 (10-167)||(22123071-22123230)
chr1 (4-60)||(21342090-21342146)
chr1 (7-83)||(38801433-38801508)
chr1 (10-60)||(21346961-21347011)
chr1 (10-60)||(21707167-21707217)
chr1 (10-60)||(21711709-21711759)
chr1 (60-174)||(22130863-22130975)
chr1 (4-60)||(15860121-15860177)
chr1 (8-167)||(16361915-16362075)
chr1 (8-126)||(22468698-22468816)
chr1 (8-126)||(20135188-20135306)
chr1 (28-167)||(26064959-26065100)
chr1 (10-60)||(16275476-16275526)
chr1 (75-174)||(51130632-51130729)
chr1 (11-60)||(21714546-21714595)
chr1 (204-244)||(12271744-12271784)
chr1 (8-60)||(24783160-24783212)
chr1 (13-60)||(40389157-40389204)
chr1 (92-212)||(22124370-22124491)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (11-245)||(100378-100612)
scaffold0023 (11-245)||(40057-40291)
scaffold0023 (7-80)||(119875-119948)
scaffold0023 (10-167)||(94411-94569)
scaffold0023 (10-167)||(44454-44613)
scaffold0023 (14-167)||(17444-17598)
scaffold0023 (11-84)||(101503-101576)
scaffold0023 (11-60)||(38547-38596)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (11-245)||(25175854-25176088)
chr2 (12-245)||(28405981-28406215)
chr2 (26-243)||(7617-7835)
chr2 (22-243)||(18786787-18787009)
chr2 (11-168)||(7679589-7679746)
chr2 (8-161)||(22134175-22134326)
chr2 (26-244)||(23207296-23207515)
chr2 (26-243)||(23791292-23791511)
chr2 (10-133)||(298809-298933)
chr2 (7-174)||(23071905-23072070)
chr2 (10-167)||(22105412-22105571)
chr2 (7-167)||(19671830-19671991)
chr2 (7-184)||(23708561-23708738)
chr2 (26-244)||(25108906-25109126)
chr2 (7-133)||(23060513-23060639)
chr2 (7-133)||(22337115-22337241)
chr2 (7-133)||(23076442-23076568)
chr2 (7-133)||(23285865-23285987)
chr2 (7-133)||(23654381-23654507)
chr2 (7-105)||(38138-38235)
chr2 (7-133)||(23660023-23660148)
chr2 (10-167)||(18808943-18809101)
chr2 (26-167)||(20520152-20520295)
chr2 (10-167)||(23130862-23131020)
chr2 (10-167)||(23133329-23133487)
chr2 (10-167)||(23709536-23709694)
chr2 (10-167)||(23712017-23712175)
chr2 (10-167)||(26505379-26505537)
chr2 (10-167)||(26507857-26508015)
chr2 (10-167)||(34402526-34402684)
chr2 (10-167)||(39682313-39682471)
chr2 (7-126)||(20309108-20309225)
chr2 (7-133)||(22731229-22731355)
chr2 (7-129)||(23103396-23103516)
chr2 (10-164)||(23135590-23135745)
chr2 (10-167)||(571397-571555)
chr2 (10-167)||(6725995-6726153)
chr2 (10-167)||(24367774-24367932)
chr2 (10-167)||(28577099-28577257)
chr2 (8-167)||(32214925-32215085)
chr2 (13-167)||(21155064-21155219)
chr2 (26-196)||(24697536-24697709)
chr2 (10-167)||(24898199-24898358)
chr2 (10-167)||(24900682-24900841)
chr2 (10-167)||(24903159-24903318)
chr2 (10-167)||(24905636-24905795)
chr2 (10-167)||(24908111-24908270)
chr2 (7-84)||(8946657-8946733)
chr2 (26-184)||(22413078-22413240)
chr2 (10-167)||(32039502-32039660)
chr2 (7-71)||(23040247-23040310)
chr2 (7-133)||(22738175-22738300)
chr2 (12-167)||(43137301-43137457)
chr2 (10-60)||(38967374-38967424)
chr2 (10-60)||(45029966-45030016)
chr2 (13-69)||(24643054-24643109)
chr2 (92-244)||(22459445-22459598)
chr2 (26-161)||(23004767-23004905)
chr2 (10-60)||(24529641-24529691)
chr2 (26-76)||(32451981-32452031)
chr2 (14-133)||(25616192-25616311)
chr2 (28-78)||(23287384-23287433)
chr2 (28-77)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (11-245)||(2528-2762)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (21-242)||(5657-5877)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (11-245)||(14580-14814)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (7-242)||(21502041-21502277)
chr5 (7-244)||(21329381-21329618)
chr5 (7-245)||(26011918-26012154)
chr5 (11-245)||(21565546-21565780)
chr5 (26-244)||(20026824-20027043)
chr5 (11-242)||(22959421-22959649)
chr5 (7-245)||(19668898-19669135)
chr5 (7-245)||(19660721-19660956)
chr5 (26-244)||(22178103-22178323)
chr5 (7-108)||(36314577-36314678)
chr5 (7-133)||(21729059-21729185)
chr5 (7-133)||(21808384-21808510)
chr5 (26-167)||(22144068-22144211)
chr5 (10-133)||(22412187-22412309)
chr5 (7-133)||(24493569-24493694)
chr5 (7-132)||(8286838-8286964)
chr5 (7-133)||(23390491-23390617)
chr5 (7-133)||(13025311-13025436)
chr5 (7-133)||(13095495-13095620)
chr5 (7-133)||(1096467-1096593)
chr5 (7-129)||(9077952-9078074)
chr5 (7-113)||(21997549-21997655)
chr5 (7-133)||(25421532-25421658)
chr5 (10-167)||(264772-264930)
chr5 (10-167)||(10732944-10733102)
chr5 (10-167)||(11581203-11581361)
chr5 (10-167)||(20909012-20909170)
chr5 (10-126)||(24529223-24529339)
chr5 (10-167)||(29329934-29330092)
chr5 (10-167)||(39363384-39363542)
chr5 (7-202)||(40725853-40726050)
chr5 (7-133)||(22075018-22075145)
chr5 (10-167)||(42245369-42245527)
chr5 (10-167)||(36154787-36154942)
chr5 (10-167)||(20902012-20902172)
chr5 (115-174)||(21741486-21741545)
chr5 (10-167)||(2154617-2154776)
chr5 (7-131)||(25431395-25431518)
chr5 (10-167)||(29345980-29346138)
chr5 (10-69)||(20918052-20918110)
chr5 (10-69)||(39245136-39245194)
chr5 (10-60)||(38619434-38619484)
chr5 (11-60)||(23064512-23064561)
chr5 (10-167)||(29348453-29348611)
chr5 (10-167)||(29350926-29351084)
chr5 (60-161)||(29448055-29448159)
chr5 (10-58)||(10775790-10775838)
chr5 (13-167)||(18319037-18319193)
chr5 (7-78)||(21293020-21293090)
chr5 (10-60)||(31061068-31061118)
chr5 (10-167)||(32027393-32027551)
chr5 (26-79)||(37723922-37723975)
chr5 (10-60)||(20806854-20806904)
chr5 (11-60)||(26704075-26704124)
chr5 (11-60)||(26973808-26973857)
chr5 (9-60)||(17517269-17517320)
chr5 (13-60)||(24067110-24067157)
chr5 (17-126)||(18418590-18418697)
chr5 (23-77)||(26732884-26732937)
chr5 (74-133)||(20766115-20766174)
chr5 (26-77)||(26740697-26740747)
chr5 (26-76)||(15796438-15796487)
chr5 (60-126)||(18356367-18356432)
chr5 (11-76)||(21873254-21873318)
chr5 (11-76)||(22032323-22032387)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (7-238)||(39706179-39706409)
chr4 (22-243)||(12288094-12288316)
chr4 (11-245)||(12774011-12774235)
chr4 (26-244)||(13734-13953)
chr4 (11-245)||(8846360-8846610)
chr4 (7-174)||(15551817-15551982)
chr4 (22-130)||(52243192-52243302)
chr4 (26-244)||(53082035-53082254)
chr4 (22-242)||(43198438-43198661)
chr4 (26-244)||(46640339-46640558)
chr4 (10-129)||(16377522-16377639)
chr4 (7-126)||(7088877-7088996)
chr4 (10-133)||(14280316-14280438)
chr4 (115-245)||(15099457-15099586)
chr4 (115-245)||(15190424-15190553)
chr4 (10-133)||(54798749-54798872)
chr4 (7-133)||(7798774-7798900)
chr4 (45-245)||(16596686-16596883)
chr4 (7-133)||(6899891-6900016)
chr4 (7-133)||(16270231-16270356)
chr4 (7-132)||(52873363-52873488)
chr4 (10-167)||(18215278-18215436)
chr4 (10-167)||(44615288-44615446)
chr4 (10-167)||(44928883-44929042)
chr4 (10-133)||(8574864-8574985)
chr4 (7-133)||(12902757-12902883)
chr4 (8-167)||(19618176-19618336)
chr4 (7-133)||(16239965-16240090)
chr4 (10-167)||(12311-12469)
chr4 (10-167)||(15118356-15118514)
chr4 (10-167)||(44773091-44773249)
chr4 (10-167)||(51463872-51464030)
chr4 (10-167)||(52312510-52312668)
chr4 (14-133)||(23374354-23374473)
chr4 (7-133)||(7893703-7893829)
chr4 (7-133)||(44052829-44052955)
chr4 (7-84)||(3096293-3096369)
chr4 (9-133)||(22636437-22636561)
chr4 (10-167)||(50222343-50222501)
chr4 (7-79)||(17046487-17046559)
chr4 (4-167)||(19242693-19242857)
chr4 (12-129)||(14038653-14038770)
chr4 (10-164)||(18239426-18239581)
chr4 (10-167)||(1837513-1837671)
chr4 (10-167)||(3515007-3515165)
chr4 (10-122)||(23803316-23803427)
chr4 (10-69)||(7641286-7641344)
chr4 (10-69)||(12610950-12611008)
chr4 (14-167)||(15355328-15355483)
chr4 (10-60)||(44102214-44102264)
chr4 (7-124)||(14053306-14053422)
chr4 (26-76)||(6190481-6190531)
chr4 (8-129)||(14970751-14970871)
chr4 (9-167)||(22353835-22353995)
chr4 (199-241)||(14164741-14164783)
chr4 (7-60)||(15367690-15367743)
chr4 (7-60)||(15370018-15370071)
chr4 (7-60)||(15371202-15371255)
chr4 (7-60)||(15373483-15373536)
chr4 (7-60)||(15402703-15402756)
chr4 (89-130)||(15464929-15464970)
chr4 (7-60)||(16223532-16223585)
chr4 (199-241)||(14158036-14158078)
chr4 (26-167)||(21815589-21815731)
chr4 (8-60)||(20157527-20157579)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (11-245)||(2687-2923)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (7-245)||(15470927-15471161)
chr3 (11-245)||(16097332-16097566)
chr3 (7-245)||(14234487-14234727)
chr3 (11-245)||(16103784-16104017)
chr3 (11-238)||(12174152-12174376)
chr3 (21-161)||(32307691-32307830)
chr3 (7-174)||(13210283-13210448)
chr3 (11-160)||(49668044-49668193)
chr3 (11-158)||(9512924-9513067)
chr3 (11-158)||(9520899-9521042)
chr3 (26-244)||(37251051-37251270)
chr3 (10-133)||(27165250-27165373)
chr3 (26-184)||(52523669-52523831)
chr3 (21-245)||(1644567-1644780)
chr3 (10-133)||(53301545-53301669)
chr3 (7-133)||(12399209-12399335)
chr3 (26-244)||(22110235-22110454)
chr3 (7-202)||(24340647-24340844)
chr3 (7-126)||(18438534-18438653)
chr3 (25-133)||(23274705-23274813)
chr3 (7-133)||(14972854-14972980)
chr3 (10-133)||(24153204-24153326)
chr3 (10-133)||(36166598-36166719)
chr3 (26-167)||(43925977-43926121)
chr3 (7-133)||(13442274-13442400)
chr3 (7-105)||(11424783-11424880)
chr3 (10-167)||(17672626-17672784)
chr3 (10-167)||(29172587-29172745)
chr3 (7-202)||(37642189-37642386)
chr3 (25-133)||(42386428-42386536)
chr3 (7-126)||(20698437-20698556)
chr3 (7-133)||(17487856-17487982)
chr3 (7-133)||(17499338-17499464)
chr3 (7-133)||(23083356-23083482)
chr3 (10-72)||(28194693-28194755)
chr3 (116-245)||(49389513-49389642)
chr3 (10-167)||(7781351-7781509)
chr3 (10-167)||(9707611-9707769)
chr3 (10-167)||(17463178-17463336)
chr3 (10-167)||(34159326-34159484)
chr3 (10-167)||(45606911-45607069)
chr3 (10-167)||(55476491-55476649)
chr3 (10-129)||(40213720-40213838)
chr3 (7-167)||(43550482-43550644)
chr3 (12-167)||(16282815-16282971)
chr3 (10-133)||(21618449-21618570)
chr3 (7-129)||(25476384-25476506)
chr3 (7-133)||(26686887-26687013)
chr3 (26-129)||(606324-606428)
chr3 (9-167)||(13544024-13544183)
chr3 (10-164)||(28848618-28848773)
chr3 (10-167)||(8899094-8899252)
chr3 (14-167)||(12567564-12567718)
chr3 (10-167)||(16454285-16454443)
chr3 (10-167)||(38961895-38962053)
chr3 (10-129)||(6469178-6469296)
chr3 (21-133)||(14572603-14572714)
chr3 (10-124)||(55500942-55501055)
chr3 (10-167)||(13151794-13151953)
chr3 (10-167)||(13154259-13154418)
chr3 (115-188)||(1465350-1465423)
chr3 (10-167)||(10247727-10247885)
chr3 (10-167)||(17446659-17446816)
chr3 (10-167)||(50242822-50242980)
chr3 (10-129)||(15977515-15977633)
chr3 (10-69)||(17737236-17737294)
chr3 (7-184)||(22147467-22147646)
chr3 (7-133)||(43840932-43841058)
chr3 (10-60)||(8499518-8499568)
chr3 (10-60)||(10556985-10557035)
chr3 (10-60)||(15412429-15412479)
chr3 (12-167)||(41123892-41124045)
chr3 (10-60)||(45577950-45578000)
chr3 (26-123)||(12377940-12378039)
chr3 (21-133)||(14576828-14576939)
chr3 (10-60)||(12119837-12119887)
chr3 (10-60)||(44494809-44494859)
chr3 (26-167)||(53070657-53070799)
chr3 (69-184)||(2051141-2051260)
chr3 (9-133)||(46822267-46822391)
chr3 (177-244)||(43927304-43927370)
chr3 (9-60)||(12511059-12511110)
chr3 (11-76)||(856140-856204)
chr3 (11-76)||(23077530-23077594)
chr3 (8-60)||(14665398-14665450)
chr3 (8-60)||(14668554-14668606)
chr3 (198-245)||(12934195-12934242)
chr3 (198-245)||(49667968-49668015)
chr3 (28-78)||(13919350-13919399)
chr3 (11-60)||(15878119-15878168)
chr3 (11-59)||(26196500-26196548)
chr3 (8-60)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-244)||(10542-10764)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (65-245)||(2101-2281)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-242)||(6009-6244)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-245)||(6611-6849)
scaffold0333 (7-245)||(13991-14229)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (25-245)||(62216-62433)
scaffold0028 (11-245)||(132662-132889)
scaffold0028 (10-167)||(136680-136838)
scaffold0028 (10-167)||(139149-139307)
scaffold0028 (10-167)||(144087-144245)
scaffold0028 (10-167)||(134211-134369)
scaffold0028 (10-167)||(141618-141776)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-245)||(12766-13004)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (22-245)||(10424-10647)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (7-245)||(918-1155)
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (7-245)||(23019408-23019644)
chr6 (11-245)||(19652199-19652431)
chr6 (22-244)||(19668386-19668609)
chr6 (7-245)||(22080622-22080846)
chr6 (7-245)||(28496357-28496592)
chr6 (7-245)||(29808768-29809003)
chr6 (7-245)||(1561303-1561539)
chr6 (7-108)||(27333238-27333339)
chr6 (7-108)||(27393978-27394079)
chr6 (22-244)||(9098409-9098620)
chr6 (7-244)||(20109140-20109378)
chr6 (21-122)||(4185827-4185928)
chr6 (7-133)||(16496244-16496370)
chr6 (7-129)||(29060540-29060662)
chr6 (21-122)||(4186381-4186482)
chr6 (7-120)||(20076700-20076812)
chr6 (22-130)||(25644335-25644444)
chr6 (10-167)||(22782227-22782385)
chr6 (7-133)||(17287791-17287917)
chr6 (8-129)||(18409826-18409947)
chr6 (7-129)||(19303540-19303661)
chr6 (10-167)||(1595549-1595707)
chr6 (7-202)||(8227435-8227632)
chr6 (7-129)||(25629354-25629476)
chr6 (8-167)||(30676714-30676874)
chr6 (26-244)||(23076749-23076969)
chr6 (10-167)||(2291184-2291342)
chr6 (10-167)||(12742317-12742475)
chr6 (10-167)||(18334596-18334754)
chr6 (10-167)||(19005046-19005204)
chr6 (10-167)||(19858923-19859081)
chr6 (10-167)||(24422547-24422705)
chr6 (10-167)||(33861794-33861952)
chr6 (10-167)||(33864278-33864436)
chr6 (7-133)||(20360955-20361081)
chr6 (7-129)||(20593773-20593895)
chr6 (26-244)||(35008167-35008387)
chr6 (10-167)||(8055029-8055187)
chr6 (10-167)||(25754809-25754967)
chr6 (10-167)||(26924644-26924802)
chr6 (7-126)||(16920634-16920751)
chr6 (7-126)||(20638285-20638404)
chr6 (10-113)||(25656629-25656731)
chr6 (11-180)||(31155346-31155514)
chr6 (7-126)||(35245586-35245703)
chr6 (7-69)||(25714417-25714478)
chr6 (62-122)||(4668217-4668277)
chr6 (62-122)||(4675064-4675124)
chr6 (10-167)||(20556898-20557054)
chr6 (8-167)||(34963371-34963531)
chr6 (10-164)||(1540918-1541073)
chr6 (7-75)||(22831503-22831571)
chr6 (10-129)||(25688502-25688620)
chr6 (10-69)||(3852121-3852179)
chr6 (13-167)||(16448530-16448686)
chr6 (7-133)||(22780222-22780348)
chr6 (26-237)||(18199306-18199519)
chr6 (26-167)||(18456735-18456877)
chr6 (26-70)||(11185524-11185568)
chr6 (26-237)||(18177562-18177775)
chr6 (26-237)||(18204096-18204309)
chr6 (138-230)||(28103796-28103887)
chr6 (9-60)||(19848063-19848114)
chr6 (59-196)||(18706356-18706495)
chr6 (26-129)||(18461895-18461997)
chr6 (28-105)||(33443068-33443146)
chr6 (88-194)||(18696569-18696675)
chr6 (26-69)||(18821904-18821946)
chr6 (9-60)||(23992429-23992480)
chr6 (174-245)||(27333168-27333238)
chr6 (174-245)||(27393908-27393978)
chr6 (4-48)||(19008799-19008843)
chr6 (11-60)||(18907111-18907160)
chr6 (11-60)||(19862978-19863027)
chr6 (11-60)||(19873120-19873169)
chr6 (11-76)||(21766695-21766759)
chr6 (138-186)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-244)||(32538-32772)
scaffold0034 (26-76)||(51936-51985)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (21-245)||(129919-130143)
scaffold0010 (26-130)||(60713-60818)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (11-244)||(1086-1319)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (7-245)||(12942-13177)
scaffold0138 (88-244)||(18121-18277)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (21-245)||(6826-7047)
scaffold0556 (89-241)||(8097-8249)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-245)||(160688-160921)
scaffold0001 (14-167)||(501088-501242)
scaffold0001 (10-60)||(85692-85742)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (11-245)||(133-366)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-245)||(45675-45909)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (22-245)||(22557-22776)
scaffold0037 (10-167)||(82072-82230)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (22-244)||(7960-8180)
scaffold0218 (54-245)||(29163-29354)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (10-245)||(15664-15896)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (26-244)||(128853-129072)
scaffold0022 (30-241)||(78345-78556)
scaffold0022 (10-133)||(116430-116551)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (26-243)||(136252-136471)
scaffold0021 (26-243)||(144960-145179)
scaffold0021 (8-129)||(174767-174886)
scaffold0021 (7-77)||(121766-121835)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (7-245)||(1997-2232)
scaffold0046 (7-245)||(11292-11527)
scaffold0046 (7-126)||(28414-28533)
scaffold0046 (7-63)||(4552-4608)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (26-244)||(6166-6386)
scaffold0420 (26-73)||(13793-13840)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-242)||(12587-12803)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (30-244)||(38339-38555)
scaffold0139 (11-60)||(19980-20029)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-113)||(15792-15898)
scaffold0020 (199-245)||(15715-15761)
scaffold0020 (11-60)||(178898-178947)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (26-244)||(53432-53651)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (7-174)||(1025-1190)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-243)||(103523-103737)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (26-244)||(97024-97244)
scaffold0006 (26-244)||(106302-106522)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-114)||(23897-24001)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-243)||(7943-8161)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (11-245)||(32102-32329)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-133)||(38697-38820)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-133)||(3146-3271)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (7-245)||(34123-34358)
scaffold0175 (7-60)||(273-326)
scaffold0175 (57-133)||(13141-13218)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (26-244)||(19768-19987)
scaffold0080 (7-133)||(39913-40038)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (26-133)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-129)||(3185-3306)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (22-167)||(25121-25268)
scaffold0123 (88-196)||(619-727)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (9-133)||(39479-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-133)||(75210-75333)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (7-202)||(17951-18148)
scaffold0247 (10-60)||(2241-2291)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-133)||(32952-33077)
scaffold0120 (7-133)||(45928-46053)
scaffold0120 (7-129)||(16113-16235)
scaffold0120 (7-69)||(17389-17450)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-126)||(4849-4968)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (26-126)||(13147-13247)
scaffold0357 (22-130)||(16098-16206)
scaffold0357 (26-78)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (22-130)||(27747-27855)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (10-133)||(44702-44825)
scaffold0122 (14-129)||(26064-26179)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (57-244)||(54-243)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (7-184)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (7-184)||(38198-38377)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (26-244)||(569-787)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (8-129)||(17214-17337)
scaffold0056 (26-69)||(79388-79430)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-133)||(25896-26021)
scaffold0026 (7-133)||(39858-39983)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-133)||(13211-13337)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (7-133)||(1851-1977)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (7-133)||(32942-33067)
scaffold0145 (7-133)||(38761-38886)
scaffold0145 (5-167)||(9744-9908)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-244)||(267679-267898)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (7-126)||(10427-10544)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-126)||(1289-1406)
scaffold0106 (7-126)||(7266-7383)
scaffold0106 (10-76)||(15291-15356)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-133)||(3470-3596)
scaffold0292 (7-133)||(343-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-133)||(51913-52039)
scaffold0011 (7-133)||(167973-168099)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-129)||(10772-10891)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-167)||(20747-20905)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-167)||(16784-16942)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (10-167)||(37821-37979)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (7-133)||(8528-8650)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (10-167)||(158454-158612)
scaffold0003 (10-129)||(339949-340065)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (10-133)||(22886-23008)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-126)||(51582-51699)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (7-133)||(1043-1169)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (7-133)||(1952-2078)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-126)||(15466-15584)
scaffold0114 (11-76)||(7295-7359)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-126)||(32067-32184)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (26-244)||(1681-1900)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-133)||(6116-6245)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (10-164)||(13392-13547)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (7-124)||(16282-16397)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (10-167)||(4694-4852)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (10-167)||(13947-14105)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (11-91)||(28806-28887)
scaffold0211 (198-245)||(28694-28741)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-126)||(13497-13615)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-129)||(16599-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (25-133)||(24297-24406)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (10-126)||(5132-5246)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (9-129)||(9241-9360)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-84)||(4712-4788)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (10-167)||(40400-40558)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (7-126)||(8479-8598)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-126)||(1053-1170)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (62-122)||(9133-9193)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-126)||(20910-21030)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (26-167)||(20383-20524)
scaffold0031 (7-61)||(128751-128805)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (7-133)||(4508-4633)
scaffold0228 (7-133)||(12090-12215)
scaffold0228 (7-133)||(22042-22167)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (8-167)||(11286-11446)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-77)||(46995-47065)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (10-167)||(161093-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (10-167)||(106-264)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-129)||(4300-4415)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (8-167)||(12253-12413)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-74)||(4888-4954)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (10-167)||(12064-12216)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (26-114)||(2694-2784)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (10-167)||(4214-4373)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (13-60)||(1393-1440)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (7-124)||(11447-11564)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (10-167)||(29931-30090)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (28-133)||(4545-4650)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (11-60)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (11-60)||(36454-36503)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (76-245)||(2328-2494)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (65-184)||(225465-225585)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (26-69)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (11-60)||(29558-29607)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (138-212)||(675-749)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (119-161)||(2261-2303)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (11-61)||(289-339)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (28-78)||(206575-206624)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (140-237)||(157-252)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (11-76)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (11-60)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (11-76)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (11-60)||(21871-21920)
scaffold0210 (11-60)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-60)||(69794-69843)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (89-133)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: scaffold0102 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19502
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactg 19467  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19468 aaacaacaacatcaagataaacaacttagtttcta 19502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67982
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctc-aatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctc 67943  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67944 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 67982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005884
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 18005849  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005850 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 18005884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014409
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014282 caaatcaac---atctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 44014378  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44014379 aaacaacaacagcaagat-aacaacttagttt 44014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219600
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 16219739  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16219738 aatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggct 16219640  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219639 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 16219600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832045
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  || |||||||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggct 47832005  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47832006 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttcta 47832045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811014
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  811148 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 811050  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  811049 gaaactacaacagcaagataaataacttagtttcta 811014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056564
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  122 catctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaac 16056540  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  16056541 atcaagataaacaacttagtttct 16056564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073149
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagg 203  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcagg 22073111  T
Q  204 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22073112 cttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901560
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcac-aacatcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34201021
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  34200886 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 34200981  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200982 tactgggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 34201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754772
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggc 204  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  15754908 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcata-tgcatcagtc 15754813  T
Q  205 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754812 ttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttcta 15754772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495502 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995913
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  11996048 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 11995953  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||  |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11995952 tactgggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttcta 11995913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505184
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28505320  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
     ||  || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  28505319 gatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 28505224  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||   ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28505223 tactggaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttcta 28505184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280061
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220073
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||       
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca--- 20220194  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactggaacaacaacag 20220095  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  20220094 taagataagcaacttagtttct 20220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456408
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227606
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698958
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  105 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867923
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaa 198  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaa 1867923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255789
Alignment:
Q  29 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  127 caaa 130  Q
    ||||    
T  12255792 caaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647487
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  119 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 193  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  119 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 193  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430870
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509315
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456479
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972654
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949126
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376717
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232678
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640430
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486668
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 19486668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385127
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189599
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125649
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523075
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525537
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063813
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  125 ctcaaatat 133  Q
    |||||||||    
T  10063821 ctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393291
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212122
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  105 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386242
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | || | |||| |||||||| ||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410217
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704843
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  | || || |||| |||||| |||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217018
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116667
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  113 attcaacaacatctcaa 129  Q
    | |||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  128 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  109 tgcaattcaacaac 122  Q
    | ||| ||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443509
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |     
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaat 40443491  T
Q  109 tgcaattcaacaacatct 126  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  40443492 ttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386391
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 3386391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13869396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389636
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattaga 9389636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831423
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13831423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113180
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  |  ||||| |  ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  191 atattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15113128 atat-aaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttct 15113180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324243
Alignment:
Q  176 caacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttcta 16324243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||  |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  121 acatctcaa 129  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898489
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38898489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaat 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||     
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14036380  T
Q  132 atca 135  Q
    ||||    
T  14036381 atca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaat 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||     
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14346410  T
Q  132 atca 135  Q
    ||||    
T  14346411 atca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116717
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 190  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  || ||||| |  ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  191 atattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15116665 atat-acatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttct 15116717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  33 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 128
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6769
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctt 6734  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6735 actgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagttt 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8706
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  122 catctcaaata-tca-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaac 217  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcata-tacatcagtcttactggaacaac 8679  T
Q  218 aacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  8680 atcagcaagataaacaacttagtttct 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855139
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggctt 38855174  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855173 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 38855139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520605
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggctt 6520566  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6520567 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttcta 6520605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760727
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattg 23760866  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23760865 aattcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggctt 23760766  T
Q  207 actgaaacaac---aacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    |||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||    
T  23760765 actgaaacaacaacaacaacaaggtaaacaacttagttt 23760727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673938
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 21673817  T
Q  121 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21673818 acatctcaaatatcaatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaac 21673917  T
Q  221 agcaagataaacaacttagttt 242  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  21673918 aacaagat-aacaacttagttt 21673938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285834
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttact 21285799  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21285800 gaaacaacaacaacaagataaagcacttagtttct 21285834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355583
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||     
T  26355715 caa-tcaacaacatctcagccatcaacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacta 26355618  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26355617 gaacaataacaaaaagataaacaacttagtttcta 26355583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983287
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaaca 983315  T
Q  219 acagcaa---gataaacaacttagtttc 243  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||||    
T  983314 acaacaacatgataaacaacttagtttc 983287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866160
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  5866295 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 5866200  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866199 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 5866160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491230
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  21491095 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-ggcatcagtct 21491190  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491191 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 21491230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116586
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactgaaacaacaacag 37116564  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  37116565 taagataagcaacttagtttct 37116586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141151
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  17141016 aatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 17141111  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141112 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 17141151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498800
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatc 20498779  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20498780 aagataaacaacttagtttct 20498800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266876
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttct 17266876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249550
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-aacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249484 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255388
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-aacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21255322 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353261
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaaca---acaa 219  Q
    ||||||| |||  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaa 24353236  T
Q  220 cagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24353237 cagtaagataagcaacttagtttct 24353261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626861
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22626834  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092337
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918995
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    | |||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439436
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612069
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875190
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372904
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536334
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971375
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  31971356 attccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  103 atcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409448
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818404
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | || || |||||| ||||| ||||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923923
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  106 gaatgcaattcaaca 120  Q
     | ||||| ||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484560
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853296
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879276
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046199
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403385
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001911
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199647
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatca 16199667  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| | ||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 242
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  187 gatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||  |  |||| |||| |||||| |||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413320
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598346
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41598346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483438
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203235
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542477
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 4542477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896323
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131047
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937118
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154816
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||  ||||||| |||||| | ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
     || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  19154889 acttaaacatcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatatta 19154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290807
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45290807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648679
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  | ||| | || ||||| |||| ||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatca 23648652  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||    
T  23648653 tttgcaatacaacaacatcttaaatat 23648679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484380
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa 25484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678097
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | || || || |||| |||||| |    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 18678097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801387
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  126 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattata 166  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224077
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| | |||  | ||||| |||| ||||||     
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatat 26224077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823931
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14823931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070608
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15070608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121858
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | || || || |||| |||||| |    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 32121858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 37515837 - 37515901
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| |||| |||||    
T  37515837 ataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacattaaatcacattatatcag 37515901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921752
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatatcaacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 22921787  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921786 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 22921752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681245
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 33681106  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||    
T  33681107 aatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtct 33681205  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33681206 tactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcta 33681245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237866
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 22237726  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||    
T  22237727 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcata-tgtatcagtct 22237825  T
Q  206 tactgaaacaacaa-cagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22237826 cgctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttcta 22237866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754273
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 21754157  T
Q  121 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| |||||  ||    
T  21754158 acatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaatgac 21754248  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21754249 agcaagataaacaacttagtttcta 21754273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861453
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagc 21861474  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21861473 aagataaacaacttagtttct 21861453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927865
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------ 52927989  T
Q  122 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||     
T  52927988 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaat 52927890  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52927889 agcaagataaacaacttagtttcta 52927865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248513
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    ||||| |  ||||| ||||||    
T  20248383 caaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcata-tgcatcagtcttact 20248478  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20248479 g-gacaacaacatcaagataaataacttagtttcta 20248513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896142
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | | |||||||||||||||||||||   |    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactgaaacaacaa---c 21896163  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21896162 aagataaacaacttagtttct 21896142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 20918718  T
Q  123 atctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
      ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918719 --ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368170
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  16368191 taagataaacaacttaatttct 16368170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613999
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaagtaacaacgg 50614021  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  50614020 taagacaaacaacttagtttct 50613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621827
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaagtaacaacgg 50621849  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  50621848 taagacaaacaacttagtttct 50621827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686850
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 50686828  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  50686829 taagataagcaacttagtttct 50686850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758841
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    |||||| |||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41050038 tctc-aacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 41049941  T
Q  223 caagataa 230  Q
     |||||||    
T  41049940 taagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261086
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161932
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 21161818  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||| ||| | |  |||| ||||| |||    
T  21161819 caattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggatta-aacaaattaggctcact 21161915  T
Q  210 gaaacaacaacagcaag 226  Q
    | |||| ||||||||||    
T  21161916 ggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981571
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  214 caacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttcta 35981571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||||||| |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  109 tgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433168
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532395
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250724
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261577
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  || || ||||||||| ||     
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caattccggcttactggaag 49261546  T
Q  215 aacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  49261547 gacaacatcaaggtaaataacttagtttcta 49261577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989024
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923295
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026806
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475091
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593739
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298294
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776846
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29776846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612471
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 31612471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattc-aacaac 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  123 atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 185  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847205
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637086
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 214  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  || |||||||||||| ||     
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  215 aacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttcta 20637086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212974
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123071
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatat 22123071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342146
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21342146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 83  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347011
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707217
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21707217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711759
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21711759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatata 22130879  T
Q  159 caattatataccatta 174  Q
    |||||||||| |||||    
T  22130878 caattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860121
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362075
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatat 16362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | || ||||| || | ||||||     
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | |||||||| |||| ||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
      ||||||||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065100
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  126 tcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275476
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa 16275476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  75 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271784
Alignment:
Q  204 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttct 12271784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389204
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa 40389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 212
Target Start/End: Original strand, 22124370 - 22124491
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 190  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||    
T  22124370 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacatcaaatc 22124469  T
Q  191 atattaaatcaggcttactgaa 212  Q
    |||||| ||||| || ||||||    
T  22124470 atattatatcagactcactgaa 22124491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100612
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatattaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactg 100577  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100578 aaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcta 100612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40057
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactg 40092  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40091 aaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttcta 40057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 80  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94569
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44613
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17444
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176088
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 25176053  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176054 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 25176088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406215
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttacta 28406180  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406181 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 28406215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7617
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaac 7637  T
Q  224 aagataaacaacttagtttc 243  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  7636 atgataaacaacttagtttc 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786787
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18786909 aacgtcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcata-taatttaggcttactgaaacaaca 18786812  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  18786811 acagcatgataaacaacttagtttc 18786787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679746
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatata 168  Q
     || ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134175
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatatacaa 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207515
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  124 tctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||||   |  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||     
T  23207396 tctcaacattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttct 23207515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791511
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaa 23791490  T
Q  223 caagataaacaacttagtttc 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23791491 caagataaacaacttagtttc 23791511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298809
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| |     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 23071971  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||  || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071970 aatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105571
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671991
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || |||| | |||||||||||||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat--caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    | ||||| ||| | |||||||||| ||   || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109126
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 25109104  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  25109105 taagataagcaacttagtttct 25109126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060639
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337241
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076568
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285987
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | || || |||| ||||||     
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatca 23285960  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654381
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38138
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660148
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||| ||||||     
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatca 23660121  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809101
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520152
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131020
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133487
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709536
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712017
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505537
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26505537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508015
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26508015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402526
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682471
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731229
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |  |||||     
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135745
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571555
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726153
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367932
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577257
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214925
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155064
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  112 aattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697536
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    |||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||||||    
T  24697609 tctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898199
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900682
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903159
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905636
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908111
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946733
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataaca--atatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  122 catctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039502
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 71  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738175
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 22738175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137457
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 43137457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967424
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029966
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45029966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459445
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagat 189  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||  | |||  ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |  |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  190 catattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22459498 cgtat-acatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttct 22459445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004905
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529641
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaa 24529641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451981
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcag 32451981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616311
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | || || || |||| |||||| | ||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  25616291 attcaacaacatcttaaatat 25616311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2528
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 2563  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2562 aaacaacatcagcaagataaacaacttaatttcta 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5877
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 5756  T
Q  121 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5757 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaac 5856  T
Q  221 agcaagataaacaacttagttt 242  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
T  5857 aacaagataaa-aacttagttt 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14580
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactg 14615  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14614 aaacaacaacagcaagatatacaacttagtttcta 14580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502041
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 21502078  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502077 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329381
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||| ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggct 21329420  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21329419 tactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttct 21329381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011918
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||||||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggct 26011958  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26011957 tactgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttcta 26011918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565780
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 21565744  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565745 agaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcta 21565780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026824
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  124 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20026943 tcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacata-taattcaggcttactgaaacaactacaa 20026846  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20026845 caagataaacaacttagtttct 20026824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959421
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatg 22959550  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||   ||||| |  ||||| ||||||    
T  22959549 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcata-tgcatcagtcttact 22959454  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  22959453 ggaacaaaaacaacaagataaacaacttggttt 22959421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669135
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta--gatcatattaaatcagg 203  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||| |  |||||     
T  19668998 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcata-tgcatcagt 19669093  T
Q  204 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19669094 cttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttcta 19669135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660721
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcg 19660857  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||  || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  19660856 aatataaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 19660761  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660760 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 19660721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178103
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacag 22178125  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  22178124 taagataagcaacttagtttct 22178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314678
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 36314676  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  36314677 aa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729059
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808384
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144211
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412309
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493694
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286838
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  105 cgaatgcaattcaacaacatctcaaata 132  Q
    | | ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390491
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025436
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095620
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096593
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     | ||||| |||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997549
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  106 gaatgcaa 113  Q
     |||||||    
T  21997556 aaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421658
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264772
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732944
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581203
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909170
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  109 tgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330092
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363542
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726050
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 40726050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075145
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  105 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245369
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154787
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 36154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902012
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154617
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 2154617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431518
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaat 131  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346138
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918052
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245194
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 39245194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619484
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38619484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064561
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23064561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348611
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29348611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351084
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29351084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtata 156  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcata 29448154  T
Q  157 tacaa 161  Q
    |||||    
T  29448155 tacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775790
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319037
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  112 aattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319095 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061118
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 31061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027551
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32027551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067157
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa 24067157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418697
Alignment:
Q  17 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||   |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcatttgcaatt 18418687  T
Q  116 caacaacatct 126  Q
    | |||||||||    
T  18418688 c-acaacatct 18418697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766115
Alignment:
Q  74 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  60 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873318
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcag 21873318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706179
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39706309 aatgcaagtcatgaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggctt 39706211  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaactta 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706210 actaaaacaacaacagcaagataaacaactta 39706179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288094
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12288216 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaaca 12288119  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12288118 acagcaagataaacaacttagtttc 12288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774235
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 12774110  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||    
T  12774111 caa-tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactg 12774200  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774201 gaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 12774235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13734
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| |||||      
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacata 13755  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13754 aagataaacaacttagtttct 13734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846610
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgata--------------- 95  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                   
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatg 8846459  T
Q  96 -taacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 193  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||    
T  8846460 ctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 8846559  T
Q  194 ttaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     |  ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8846560 -tgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttcta 8846610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551982
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    || | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551917 aaggtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243192
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  120 aacatctcaaa 130  Q
    |||||||||||    
T  52243202 aacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082035
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 53082057  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  53082056 taagataagcaacttagtttct 53082035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198438
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  120 aacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaac 217  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||| |  || || ||||||| |||| |    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcata-tgcattagtcttactggaacatc 43198463  T
Q  218 aacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  43198462 aacaacaagataaacaacttagttt 43198438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640339
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  46640458 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacag 46640361  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  46640360 taagataagcaacttagtttct 46640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099586
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  214 caacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttcta 15099586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190553
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  214 caacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttcta 15190553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798749
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798900
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 245
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596883
Alignment:
Q  45 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  144 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  | |||    ||||| ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttata-agcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 16596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900016
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||   |||| ||||||     
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270231
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaata 132  Q
     | ||||| |||||| ||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215278
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615446
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928883
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902883
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | || |||||| |||||||| ||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618176
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239965
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12311
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118356
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773091
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463872
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 51463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312668
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893829
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052955
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096369
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636561
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222343
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 50222343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242857
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  103 atcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  111 caattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239426
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837513
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515165
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 3515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  109 tgcaattcaacaac 122  Q
    ||||| ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355328
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  113 attcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355385 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102264
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053306
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  107 aatgcaattcaacaacat 124  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  14053323 atttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190531
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcag 6190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353995
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| ||||||||||| |    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     | |||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22353995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 14164741 - 14164783
Alignment:
Q  199 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 241  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14164741 tcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 14164783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367743
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370071
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15370071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371255
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373536
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402756
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15402756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223585
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 16223585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 14158036 - 14158078
Alignment:
Q  199 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 241  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14158036 tcaggcttactagaacaacaacagcaagataaaaaacttagtt 14158078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815589
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21815633 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21815589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2687
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggctt 2726  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471161
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 15471023  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15471024 aatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggct 15471121  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15471122 tactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcta 15471161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097566
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 16097530  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097531 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 16097566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234727
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  || |||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggct 14234685  T
Q  206 tactga--aacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14234686 tactgaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttcta 14234727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104017
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  || || ||||||    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcata-tggattagtcttact 16103981  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103982 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 16104017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12174277  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||| |  ||||| ||||||    
T  12174276 caa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcata-tgcatcagtcttact 12174181  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaactta 238  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12174180 ggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307830
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaaca 32307789  T
Q  121 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32307790 acatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210283
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13210348 aatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668044
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  111 caattcaacaa-catctcaaatatcaacataattcatataatgtatataca 160  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  49668093 caat-caacaaacatctcatttatcaacataatccatttaaagtatataca 49668044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513067
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 158  Q
    ||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9513024 caat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9513067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521042
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 158  Q
    ||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9520999 caat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9521042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251051
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  37251170 tctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcagacttactggaacaacaacag 37251073  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  37251072 taagataaacaacttagtttct 37251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165373
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  124 tctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644567
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaaca 1644683  T
Q  121 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |||    
T  1644682 atatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaataac 1644592  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1644591 aacaagataaacaacttagtttcta 1644567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301545
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  110 gcaattca-acaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399335
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110235
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  22110354 tctc-aacatcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcata-caattcaggcttactgaaacaacaacag 22110257  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  22110256 taagataagcaacttagtttct 22110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340647
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 24340647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274813
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  125 ctcaaatat 133  Q
    |||||||||    
T  23274805 ctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972980
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153204
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442400
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424783
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672784
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172587
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642189
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 37642189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  124 tctcaaatat 133  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487982
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499464
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083356
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389513
Alignment:
Q  116 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  215 aacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttcta 49389513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781351
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707611
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463336
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159484
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606911
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476649
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282815
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618570
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 21618546  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  21618547 gcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687013
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaaca 606330  T
Q  124 tctcaa 129  Q
    ||||||    
T  606329 tctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544183
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848618
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899252
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567718
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454285
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961895
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572714
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  | ||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  121 acatctcaaatat 133  Q
    |||||| ||||||    
T  14572702 acatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  109 tgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||| ||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151794
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154259
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465350
Alignment:
Q  115 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattaga 1465350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247727
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446659
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242980
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 50242980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841058
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499568
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557035
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412479
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15412479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124045
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41124045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576828
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  121 acatctcaaatat 133  Q
    |||||| ||||||    
T  14576840 acatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119837
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaa 12119837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494859
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070657
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  69 ataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  165 tataccattaacaacaacat 184  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822391
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | || || || |||| |||||| |    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaa 46822365  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  46822366 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 46822391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927370
Alignment:
Q  177 aacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 43927370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12934242 - 12934195
Alignment:
Q  198 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12934242 atcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttcta 12934195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49668015 - 49667968
Alignment:
Q  198 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  49668015 atcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttcta 49667968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 59  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10764
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  122 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaac 10740  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10741 agcaagataaacaacttagtttct 10764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2101
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  165 tataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttcta 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6009
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||    
T  6144 aatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggct 6046  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6045 tactgaaacaataacagcaagataaataacttagttt 6009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6849
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  6711 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagct 6809  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6810 tactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattcta 6849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14229
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  14091 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagct 14189  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14190 tactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattcta 14229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62433
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacat 62312  T
Q  125 ctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  62313 ctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagca 62412  T
Q  225 agataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  62413 agataaacaacttagtttcta 62433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132889
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 132853  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  132854 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttcta 132889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136838
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139307
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144245
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134369
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141776
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 12766 - 13004
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggct 12964  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12965 tactggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttcta 13004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10424
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  122 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  10547 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaac 10449  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  10448 aacaagataaacaacttagtttcta 10424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 918
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   || |||||||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggct 958  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  957 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttcta 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019644
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggct 23019604  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019605 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 23019644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652431
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 210  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||    
T  19652299 caa-tcaacaacatctcaaacatcaacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactg 19652396  T
Q  211 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652397 gaacaataacagcaagataaacaacttagtttcta 19652431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668609
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    |||||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19668486 aacatcac-aacatcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcata-tacatcagacttactgaaacaaca 19668583  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19668584 acagcaagataaacaacttagtttct 19668609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080622
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcg 22080760  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 206  Q
    ||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||    
T  22080759 aatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggctt 22080661  T
Q  207 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22080660 actgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttcta 22080622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496357
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| |  ||||| ||    
T  28496492 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-tgcatcagtct 28496397  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28496396 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 28496357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808768
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| |  ||||| ||    
T  29808903 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-tgcatcagtct 29808808  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29808807 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 29808768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561539
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggc 204  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  1561403 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcata-tgcatcagtc 1561498  T
Q  205 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561499 ttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttcta 1561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333238
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27333240  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  27333239 aa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393978
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27393980  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  27393979 aa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098409
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  120 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat------------aacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaata 9098435  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  9098434 actgcaagataaacaaattagtttct 9098409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109378
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||     
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  | ||| || |||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgata-tacatcag 20109336  T
Q  203 gcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20109337 tcttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttct 20109378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185827
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4185829  T
Q  121 ac 122  Q
    ||    
T  4185828 ac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496370
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186482
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4186480  T
Q  121 ac 122  Q
    ||    
T  4186481 ac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  107 aatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||| ||||||    
T  20076799 aatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644444
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  121 acatctcaaa 130  Q
    ||||||||||    
T  25644435 acatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287791
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409826
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatca 19303563  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595707
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227435
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 8227435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676714
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076969
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-atatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| ||| |||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttct 23076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291184
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742475
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334596
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005204
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858923
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422705
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861952
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864436
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360955
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008387
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-atatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  35008366 taagataagcaacttagtttct 35008387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055187
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8055187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754967
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 25754967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924644
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26924644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920634
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| | ||||| ||||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638285
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||| | ||||||||    
T  20638305 aattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656731
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  109 tgcaa 113  Q
    |||||    
T  25656727 tgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155346
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaat 31155416  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 180  Q
    |||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155415 gcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245703
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatca 35245683  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556898
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963531
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540918
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 75  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852121
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaaca 3852121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448530
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  112 aattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448588 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780222
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||| || | ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 22780222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199306
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  124 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaaca 18199322  T
Q  222 gcaagataaacaactt 237  Q
    |||  |||| ||||||    
T  18199321 gcagtataagcaactt 18199306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456877
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  125 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18456877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177562
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  124 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaaca 18177578  T
Q  222 gcaagataaacaactt 237  Q
    |||  |||| ||||||    
T  18177577 gcagtataagcaactt 18177562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204309
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  124 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttacatcagacttactgaaacaacaaca 18204293  T
Q  222 gcaagataaacaactt 237  Q
    |||  |||| ||||||    
T  18204294 gcagtataagcaactt 18204309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 230  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706495
Alignment:
Q  59 aaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||    
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcat 18706454  T
Q  156 atacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 196  Q
    ||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||||||    
T  18706455 atacatttatatgacattattaacaacatcaaatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  125 ctcaa 129  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 194
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  187 gatcatat 194  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333168
Alignment:
Q  174 aacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttcta 27333168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393908
Alignment:
Q  174 aacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttcta 27393908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32772
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggct 32733  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32734 tactgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttct 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51936
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcag 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130143
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 130018  T
Q  121 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  130019 acatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaa 130117  T
Q  220 cagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  130118 cagcaagataaacaacttagtttcta 130143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60713
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  124 tctcaaa 130  Q
    |||||||    
T  60719 tctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1319
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||  ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||    
T  1186 caggtcatcaacatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttact 1284  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1285 ggaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttct 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13177
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcg 13038  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   || |||||||    
T  13039 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggct 13137  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13138 tactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttcta 13177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18121
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  187 gatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18177 aaacatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttct 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7047
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaaca 6925  T
Q  121 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 219  Q
    |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  6926 a---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaa 7021  T
Q  220 cagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7022 cagcaagataaacaacttagtttcta 7047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8249
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  188 atcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 241  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagtt 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160921
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||     
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 160885  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  160886 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcta 160921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501242
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  113 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 501242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85692
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 85692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 133 - 366
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| || |||    
T  233 caaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcata-tgtatcagtctcact 331  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  332 agaacaacaacagcaagat-aacaactcagtttcta 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45675
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  111 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
     || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  45809 taagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 45711  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45710 ggaacaattacagcaatataaacaacttagtttcta 45675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22557
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  122 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||| |  ||||| ||||||| |||| ||||    
T  22676 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----ata-tgcatcagtcttactggaacagcaac 22582  T
Q  221 agcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    
T  22581 atcaagacaaacaacttagtttcta 22557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82230
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 82230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7960
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 218  Q
    |||||| | || |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||    
T  8080 aacatcac-aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcata-taattcaggcttactga---aaca 7986  T
Q  219 acagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7985 acagcaagataaacaacttagtttct 7960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29163
Alignment:
Q  54 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatg 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  153 tatatacaattatatacc---attaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcata-agcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 29163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15896
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaat 15763  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttac 208  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   |||||| |||||    
T  15764 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcata-agaatcagtcttac 15859  T
Q  209 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15860 tggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 15896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128853
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  128874 taagataagcaacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78556
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  128 aaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaag 226  Q
     || |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  78444 -aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 78541  T
Q  227 ataaacaacttagtt 241  Q
    |||| ||||||||||    
T  78542 ataagcaacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136252
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 221  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 136274  T
Q  222 gcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  136273 gcaagataaacaacttagtttc 136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144960
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 221  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 144982  T
Q  222 gcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  144981 gcaagataaacaacttagtttc 144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| || |  ||||| |    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaa 174864  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  174865 attcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2232
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  2097 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagact 2192  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2193 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 2232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11527
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  11392 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 11487  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||  ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11488 tacttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttcta 11527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 63  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6166
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 6188  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
      |||||| |||||||||||||    
T  6187 tgagataagcaacttagtttct 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12803
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  126 tcaaata--tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    |||||||  |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||  | || || ||||||||||||||||||||    
T  12687 tcaaatacttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataata-cacattagacttactgaaacaacaacagc 12784  T
Q  224 aagataaacaacttagttt 242  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12785 aagataaacaacttagttt 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 244
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38555
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  128 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaag 226  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 38537  T
Q  227 ataaacaacttagtttct 244  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38538 ataagcaacttagtttct 38555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15792
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  107 aatgcaa 113  Q
    |||||||    
T  15798 aatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15715
Alignment:
Q  199 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53432
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| |||||      
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacata 53453  T
Q  224 aagataaacaacttagtttct 244  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53452 aagataaacaacttagtttct 53432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1090 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103523
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  120 aacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 219  Q
    ||||||      ||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  103637 aacatc------at--acataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  220 cagcaagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttc 103523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97244
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 97222  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     |||| || |||||||||||||    
T  97223 taagaaaagcaacttagtttct 97244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106522
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 106500  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     |||| || |||||||||||||    
T  106501 taagaaaagcaacttagtttct 106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23897
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 23905  T
Q  107 aatgcaat 114  Q
    ||||||||    
T  23904 aatgcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7943
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  126 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 223  Q
    | ||| | ||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtctcactggaacaacatcagc 7963  T
Q  224 aagataaacaacttagtttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7962 aagataaacaacttagtttc 7943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32329
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 209  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  32202 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 32293  T
Q  210 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32294 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttcta 32329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38697
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3146
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 3173  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34358
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 205  Q
    |||| || ||||||||   |||| |||||| | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  34223 aatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 34318  T
Q  206 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34319 tactggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 34358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 133
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13218
Alignment:
Q  57 acaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19768
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| |  |||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacag 19790  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  19789 taagataagcaacttagtttct 19768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40038
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 40011  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  126 tcaaatat 133  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25268
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  120 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  187 gatcatatta 196  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39602
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75210
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17951
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 202  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 17951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2241
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaa 2241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32952
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46053
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || || ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     |||||||  ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13247
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  126 t 126  Q
    |    
T  13247 t 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16098
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  122 catctcaaa 130  Q
    |||||||||    
T  16106 catctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27747
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  122 catctcaaa 130  Q
    |||||||||    
T  27755 catctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  113 attcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 54 - 243
Alignment:
Q  57 acaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||     
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgc 153  T
Q  154 atatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttct 244  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  154 atatacatttatataacattattaacaacatcaaatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttct 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 184  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 569 - 787
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    || | || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 765  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  766 ttagataaacaacttagtttct 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc---aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  105 cgaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79388
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 79388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26021
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 25994  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39983
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 39956  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13337
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1977
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33067
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 33040  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38886
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38859  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9908
Alignment:
Q  5 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  104 tcgaatgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 9908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267898
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | |  ||||||||||||||||||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||| ||| |||||||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttct 267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatca 10447  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  10446 atttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1406
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatca 1386  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7383
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatca 7363  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3596
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 343 - 468
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  | |||||  ||| ||||||     
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatca 441  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | || || |||||||||||| ||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52039
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167973
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20905
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16942
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37979
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8528
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||     
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158454
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  110 gcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23008
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51699
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  ||| |     
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataaca 51679  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1043
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2078
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15466
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32184
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatca 32164  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1681
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  124 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 222  Q
    |||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | | |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  1800 tctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactggaacaacaatag 1703  T
Q  223 caagataaacaacttagtttct 244  Q
     ||||||  |||||||||||||    
T  1702 taagataggcaacttagtttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6116
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | ||| || ||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  104 tcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    || | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13547
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 164  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16397
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 16379  T
Q  107 aatgcaattcaacaacat 124  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  16380 aattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4852
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14105
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28806
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 91  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28741 - 28694
Alignment:
Q  198 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28741 atcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttcta 28694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13615
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||     
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | | ||||| ||||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
     |||| || |||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  123 atctcaaatat 133  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5132
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  110 gcaattcaacaacatct 126  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5148 tcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaa 129  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4788
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40558
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacat--aattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8598
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1053
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatca 1073  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatct 126  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatct 126  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20383
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  126 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128805
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa 128805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4633
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12215
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22167
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11446
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161093
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  109 tgcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 106 - 264
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  112 aattcaacaacatctcaa 129  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12253
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || | ||| || ||||| | || ||||||     
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  107 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatat 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12216
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  109 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4373
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  109 tgcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
    ||||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4312 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1393
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  106 gaatgcaattcaacaacat 124  Q
     | | ||||||| ||||||    
T  11465 aatttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30090
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  108 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 167  Q
     || || |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 133
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4650
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T
Q  127 caaatat 133  Q
     ||||||    
T  4644 taaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2328
Alignment:
Q  76 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2494 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T
Q  175 acaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttcta 245  Q
      | ||||||||  |||||    ||||| ||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||||    
T  2397 taagcaacattaattcata-agcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttcta 2328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 162  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  163 tatataccattaacaacaacat 184  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 749 - 675
Alignment:
Q  138 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaa 212  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  749 ataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactatcaacatcagatcacattatatcaggcttactgaa 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 157 - 252
Alignment:
Q  140 aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactt 237  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  || ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  157 aattcacataatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactg-aacaacaatagtaatataaacaactt 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 617 times since January 2019
Visitors: 6718