View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0894_low_17 (Length: 265)

Name: NF0894_low_17
Description: NF0894
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0894_low_17
NF0894_low_17
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (22-165)||(23537745-23537888)
chr6 (25-158)||(27416625-27416756)
chr6 (25-158)||(27555390-27555521)
chr6 (25-164)||(23955210-23955350)
chr6 (65-158)||(2076219-2076312)
chr6 (25-158)||(22075488-22075619)
chr6 (25-102)||(23537886-23537962)
chr6 (25-119)||(4475683-4475776)
chr6 (25-158)||(12941071-12941202)
chr6 (25-158)||(27222682-27222813)
chr6 (66-158)||(14470814-14470906)
chr6 (71-158)||(23988236-23988323)
chr6 (25-119)||(28290992-28291085)
chr6 (65-158)||(31479515-31479608)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (25-158)||(10607418-10607550)
chr7 (25-158)||(13891479-13891611)
chr7 (34-158)||(7520323-7520446)
chr7 (25-152)||(13891868-13891994)
chr7 (25-158)||(39268411-39268543)
chr7 (25-158)||(9752689-9752821)
chr7 (25-158)||(16582270-16582402)
chr7 (25-159)||(834143-834275)
chr7 (25-159)||(838231-838363)
chr7 (25-159)||(1199323-1199455)
chr7 (25-159)||(1203411-1203543)
chr7 (65-158)||(13919465-13919558)
chr7 (25-158)||(18871147-18871278)
chr7 (25-157)||(146351-146481)
chr7 (71-146)||(18301304-18301379)
chr7 (25-159)||(16110073-16110205)
chr7 (65-158)||(1860074-1860167)
chr7 (25-158)||(11660132-11660263)
chr7 (34-158)||(18606185-18606307)
chr7 (25-164)||(41283486-41283626)
chr7 (65-152)||(25928424-25928511)
chr7 (25-158)||(15166100-15166231)
chr7 (26-158)||(10897995-10898125)
chr7 (25-151)||(14420644-14420768)
chr7 (25-158)||(16004854-16004985)
chr7 (65-158)||(39721128-39721221)
chr7 (71-158)||(15083158-15083245)
chr7 (65-142)||(834098-834175)
chr7 (65-142)||(1199278-1199355)
chr7 (65-158)||(18424168-18424261)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (25-158)||(22108546-22108678)
chr5 (25-158)||(22120689-22120821)
chr5 (25-158)||(38146516-38146647)
chr5 (25-164)||(33474029-33474169)
chr5 (25-158)||(23113500-23113631)
chr5 (25-158)||(41878749-41878881)
chr5 (25-158)||(19510312-19510443)
chr5 (63-158)||(42959478-42959572)
chr5 (25-146)||(22335344-22335463)
chr5 (25-146)||(22338874-22338993)
chr5 (25-146)||(37600106-37600224)
chr5 (65-158)||(15238170-15238263)
chr5 (65-158)||(22749095-22749187)
chr5 (65-158)||(24768615-24768708)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (25-158)||(23427675-23427807)
chr8 (63-158)||(44385962-44386057)
chr8 (25-164)||(8415074-8415214)
chr8 (65-158)||(23913198-23913291)
chr8 (25-164)||(11774137-11774277)
chr8 (25-158)||(363118-363249)
chr8 (25-158)||(8729707-8729838)
chr8 (25-119)||(27942783-27942876)
chr8 (65-152)||(14399145-14399232)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (25-158)||(17052543-17052675)
chr4 (25-158)||(13813930-13814062)
chr4 (25-158)||(13818502-13818634)
chr4 (25-158)||(20163996-20164127)
chr4 (25-158)||(22635024-22635156)
chr4 (63-158)||(12422798-12422893)
chr4 (25-159)||(30145632-30145764)
chr4 (25-158)||(20158545-20158676)
chr4 (25-158)||(24048566-24048697)
chr4 (65-146)||(631800-631881)
chr4 (25-158)||(18211454-18211585)
chr4 (25-158)||(20161221-20161352)
chr4 (26-158)||(36036802-36036932)
chr4 (28-164)||(28384692-28384829)
chr4 (25-158)||(49549181-49549312)
chr4 (25-127)||(24048482-24048583)
chr4 (25-146)||(15533081-15533200)
chr4 (99-146)||(10711781-10711828)
chr4 (99-146)||(10925551-10925598)
chr4 (65-144)||(14047266-14047344)
chr4 (65-158)||(15223479-15223572)
chr4 (65-142)||(30145732-30145809)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (25-158)||(8928965-8929097)
chr3 (25-158)||(12853461-12853593)
chr3 (25-158)||(17348825-17348957)
chr3 (25-158)||(12337106-12337237)
chr3 (25-158)||(10835039-10835170)
chr3 (25-158)||(11301763-11301894)
chr3 (25-119)||(13435706-13435799)
chr3 (65-158)||(15463811-15463904)
chr3 (25-158)||(18899300-18899431)
chr3 (25-152)||(23372641-23372766)
chr3 (65-159)||(23173230-23173323)
chr3 (28-164)||(40975-41112)
chr3 (25-158)||(3801820-3801951)
chr3 (25-146)||(51299395-51299514)
chr3 (25-158)||(54519447-54519578)
chr3 (25-158)||(38312955-38313085)
chr3 (25-158)||(9532108-9532239)
chr3 (25-158)||(14764893-14765024)
chr3 (25-92)||(16795418-16795484)
chr3 (64-158)||(20249980-20250073)
chr3 (25-151)||(29546036-29546160)
chr3 (99-158)||(4590236-4590295)
chr3 (65-158)||(5219780-5219873)
chr3 (65-142)||(13435767-13435844)
chr3 (65-158)||(14664358-14664451)
chr3 (65-158)||(14667522-14667615)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (25-158)||(18672-18804)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (25-158)||(25665-25797)
scaffold0124 (25-159)||(37630-37762)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (25-146)||(5687-5806)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (25-142)||(22132196-22132312)
chr1 (25-159)||(29533736-29533868)
chr1 (25-158)||(32648917-32649048)
chr1 (25-158)||(16370775-16370906)
chr1 (25-158)||(20439250-20439381)
chr1 (65-158)||(41801331-41801423)
chr1 (65-158)||(33795966-33796059)
chr1 (65-142)||(29533836-29533913)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (25-158)||(540-672)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (25-146)||(8837-8957)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (25-146)||(918-1037)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-158)||(224240-224371)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (25-158)||(70605-70736)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (25-158)||(21074605-21074736)
chr2 (25-157)||(9240525-9240655)
chr2 (25-164)||(37378877-37379017)
chr2 (25-158)||(6481634-6481765)
chr2 (25-158)||(6485101-6485232)
chr2 (25-158)||(10686344-10686475)
chr2 (25-146)||(19663655-19663774)
chr2 (25-146)||(20260119-20260238)
chr2 (65-130)||(9783955-9784020)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (25-158)||(33787-33918)
scaffold0080 (63-158)||(28361-28455)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (25-158)||(109451-109582)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (65-146)||(74384-74465)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (71-158)||(21390-21477)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (25-146)||(30-149)
scaffold0544 (25-146)||(3614-3733)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (25-158)||(11627-11758)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (25-158)||(10919-11051)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (65-158)||(7013-7106)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (25-146)||(115442-115561)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (25-158)||(50-181)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (25-152)||(5098-5223)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (65-146)||(5583-5664)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (65-158)||(14777-14870)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (65-158)||(11112-11205)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23537888 - 23537745
Alignment:
Q  22 tgagatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537888 tgagatgaatatttattattatgaactgatgacgtttacgaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattt 23537789  T
Q  122 ttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgatatcgat 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537788 ttattacgaattaatgatgttgttacgttgtttatgatatcgat 23537745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 27416625 - 27416756
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  27416625 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtataattgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 27416722  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27416723 ttacgaattaatgatgtcgttatgttgtatatga 27416756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27555521 - 27555390
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||  || |||||||||||| | |||    
T  27555521 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgtgatacttggtggagaaatgtta 27555424  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27555423 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 27555390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23955350 - 23955210
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  23955350 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 23955253  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  23955252 atacgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 23955210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2076312 - 2076219
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2076312 agttgataagttgttttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 2076219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 22075488 - 22075619
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| | |||    
T  22075488 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagaagcttggggaagaaatgtta 22075585  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22075586 ttacgaattaatgatgttgtcatgttgtatatga 22075619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23537962 - 23537886
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatga 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23537962 gatgaataattattattatgaattgatgatgtttatta-tagttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatga 23537886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4475776 - 4475683
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  4475776 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaat 4475683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12941202 - 12941071
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  12941202 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 12941104  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12941103 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 12941071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27222813 - 27222682
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||   |||    
T  27222813 gatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-ggtta 27222716  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27222715 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 27222682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14470906 - 14470814
Alignment:
Q  66 gttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14470906 gttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 14470814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23988323 - 23988236
Alignment:
Q  71 taagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23988323 taagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 23988236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 28290992 - 28291085
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||| |  |||| ||||||||||    
T  28290992 gatgaataattattattatgaaatgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcataagttgttaataaggtgctaggtggagaat 28291085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 31479515 - 31479608
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  || |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31479515 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 31479608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 10607418 - 10607550
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  10607418 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 10607516  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10607517 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 10607550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13891611 - 13891479
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  13891611 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 13891513  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13891512 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 13891479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Original strand, 7520323 - 7520446
Alignment:
Q  34 ttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagtt 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  7520323 ttattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaatt 7520421  T
Q  134 aatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  7520422 aatgatgttgttatgttgtatatga 7520446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13891994 - 13891868
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | |||    
T  13891994 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttgatggagaaatgtta 13891896  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgt 152  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13891895 ttacgaattaatgatgttgttatgttgt 13891868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 39268411 - 39268543
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  39268411 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaattgttg 39268509  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39268510 ttacgaaataatgatgttgttatgttgtatatga 39268543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 9752689 - 9752821
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  9752689 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttatcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatatta 9752787  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9752788 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 9752821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16582402 - 16582270
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  16582402 gatgaataattattattatgaaatgatgatgttatgta-tagttgctaagttgtcttctattcatgagatactaatgagatgcttggtggagaaatgtta 16582304  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16582303 ttacgaattaatgaggttgttatgttgtatatga 16582270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 834143 - 834275
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  834143 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 834240  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  834241 atacgaattaatgatgttgtcatgttgtatatgat 834275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 838231 - 838363
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  838231 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 838328  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  838329 atacgaattaatgatgttgtcatgttgtatatgat 838363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 1199323 - 1199455
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  1199323 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 1199420  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  1199421 atacgaattaatgatgttgtcatgttgtatatgat 1199455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 1203411 - 1203543
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  1203411 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 1203508  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  1203509 atacgaattaatgatgttgtcatgttgtatatgat 1203543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 13919465 - 13919558
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13919465 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 13919558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18871278 - 18871147
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  18871278 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 18871181  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18871180 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 18871147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 146481 - 146351
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||  || |    
T  146481 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagctgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaacgttaa 146383  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatg 157  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  146382 t-acgaattaatgatgttgttacgttgtttatg 146351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18301379 - 18301304
Alignment:
Q  71 taagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18301379 taagttgtcttctattcatgagctgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgtta 18301304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 16110073 - 16110205
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | |||    
T  16110073 gatgaataattattattatgaattgatgatg-ttacgtatagttgttaacttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgctgggtggagaa-tgtta 16110170  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  16110171 atacgaattaatgatgttattatgttgtatatgat 16110205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 1860074 - 1860167
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1860074 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 1860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11660263 - 11660132
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  11660263 gatgaataattattattatgaaattatgatgtt-acgtataattgctaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 11660166  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  11660165 atacaaattaatgatgtttttatgttgtatatga 11660132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18606307 - 18606185
Alignment:
Q  34 ttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagtt 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  18606307 ttattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgttaatacgaatt 18606210  T
Q  134 aatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18606209 aatgatgttgttatgttgtatatga 18606185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41283626 - 41283486
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  41283626 gatgaaaaattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 41283529  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  41283528 atacgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 41283486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Original strand, 25928424 - 25928511
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgt 152  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25928424 agttgataagttgttttttattcatgaattgctaatgagatgcttggttgagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgt 25928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15166231 - 15166100
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||   || |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  15166231 gatgaataattattattatgaaatgatgatgttgcgta-tagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 15166134  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15166133 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 15166100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 10897995 - 10898125
Alignment:
Q  26 atgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttat 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||  | ||    
T  10897995 atgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgcatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaatgctaat 10898093  T
Q  126 tacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10898094 -aggaattaatgatgttgttatgttgtatatga 10898125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14420768 - 14420644
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||| | |||    
T  14420768 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtataattgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgtttggtggagaa-tgtta 14420671  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttg 151  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14420670 atacgaattaatgatgttgttatgttg 14420644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16004985 - 16004854
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||   |||    
T  16004985 gatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-ggtta 16004888  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16004887 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 16004854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39721221 - 39721128
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39721221 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 39721128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15083245 - 15083158
Alignment:
Q  71 taagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15083245 taagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 15083158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Original strand, 834098 - 834175
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgtt 142  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| || || ||||||||    
T  834098 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt 834175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Original strand, 1199278 - 1199355
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgtt 142  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| || || ||||||||    
T  1199278 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt 1199355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18424261 - 18424168
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  || |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18424261 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 18424168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 22108546 - 22108678
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  22108546 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 22108644  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22108645 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 22108678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 22120689 - 22120821
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  22120689 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgatttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 22120787  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22120788 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 22120821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 38146516 - 38146647
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  38146516 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 38146613  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38146614 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 38146647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Original strand, 33474029 - 33474169
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  33474029 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctttattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 33474126  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  33474127 atacgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 33474169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 23113500 - 23113631
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  23113500 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 23113597  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  23113598 atacgaattaatgatgtagttatgttgtatatga 23113631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 41878749 - 41878881
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgc-ttggtggagaattttt 123  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  ||| ||||||||||| | ||    
T  41878749 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctttggtggagaa-tgtt 41878846  T
Q  124 attacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41878847 aatacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 41878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19510443 - 19510312
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  19510443 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 19510345  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19510344 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 19510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42959572 - 42959478
Alignment:
Q  63 atagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42959572 atagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaa-tgttaatacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 42959478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22335463 - 22335344
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  22335463 gatgaataattattattatgaaataatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 22335366  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  22335365 atacgaattaatgatgttgtta 22335344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22338993 - 22338874
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  22338993 gatgaataattattattatgaaataatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 22338896  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  22338895 atacgaattaatgatgttgtta 22338874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 37600106 - 37600224
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||| |  | |||||||| ||| |||| || ||||||||||| || | |||    
T  37600106 gatgaataattattattatgaaatgatgatg-ttacgtatagttgctaagttg-cccctattcatgagttgttaataaagtgcttggtggataa-tgtta 37600202  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  37600203 atacgaattaatgatgttgtta 37600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 15238170 - 15238263
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  || |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15238170 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 15238263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22749187 - 22749095
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22749187 agttgataagttgtcctatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaatgttaat-acgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 22749095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 24768615 - 24768708
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | ||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24768615 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 24768708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23427807 - 23427675
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  23427807 gatgaataattattattataaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 23427709  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23427708 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 23427675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Original strand, 44385962 - 44386057
Alignment:
Q  63 atagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44385962 atagttgctgagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggttgagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 44386057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Original strand, 8415074 - 8415214
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  8415074 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 8415171  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||| | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  8415172 ataccaattaatgatgttgttatgatgttgtttatgatatcga 8415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23913291 - 23913198
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23913291 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggacaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 23913198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11774277 - 11774137
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  11774277 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 11774180  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  11774179 atacgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 11774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 363249 - 363118
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  363249 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 363152  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  363151 atacgaattaatgatgtagttatgttgtatatga 363118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 8729707 - 8729838
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  8729707 gatgaataattattattatgaaatgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcactagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 8729804  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8729805 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 8729838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 27942783 - 27942876
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  27942783 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaat 27942876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Original strand, 14399145 - 14399232
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgt 152  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14399145 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaattaatgatgttgttatgttgt 14399232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 17052543 - 17052675
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  17052543 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 17052641  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17052642 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 17052675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 13813930 - 13814062
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  13813930 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgtta 13814028  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13814029 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 13814062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 13818502 - 13818634
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  13818502 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgtta 13818600  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13818601 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 13818634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 20163996 - 20164127
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  20163996 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 20164093  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20164094 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 20164127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 22635024 - 22635156
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  22635024 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgtta 22635122  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22635123 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 22635156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12422893 - 12422798
Alignment:
Q  63 atagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12422893 atagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttgatggagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 12422798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30145764 - 30145632
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  30145764 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 30145667  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30145666 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatgat 30145632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 20158545 - 20158676
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  20158545 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acttatagttgctaacttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttt 20158642  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20158643 ttacaaattaatgatgttgttatgttgtatatga 20158676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 24048566 - 24048697
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  24048566 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 24048663  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  24048664 atacgaattaatgatgtgattatgttgtatatga 24048697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 631800 - 631881
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  631800 agttgataagttgtattctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgtta 631881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18211585 - 18211454
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  18211585 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 18211488  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18211487 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 18211454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 20161221 - 20161352
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| |||||||||||| || | |||    
T  20161221 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctata-acgagttgctaatgagatgcttggtggaaaaatgtta 20161318  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20161319 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 20161352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36036932 - 36036802
Alignment:
Q  26 atgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttat 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||     
T  36036932 atgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acggatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgttaa 36036835  T
Q  126 tacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36036834 tacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 36036802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28384829 - 28384692
Alignment:
Q  28 gaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttatta 127  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  28384829 gaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgttaata 28384732  T
Q  128 cgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
    ||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  28384731 cgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 28384692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 49549181 - 49549312
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  49549181 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcatctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 49549278  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49549279 atacaaattaatgatgttgttatgttgtatatga 49549312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 24048482 - 24048583
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| || | |||| |||    
T  24048482 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattatta 24048580  T
Q  125 tta 127  Q
    |||    
T  24048581 tta 24048583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15533200 - 15533081
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  15533200 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 15533103  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  15533102 atacgaattaatgatgttgtta 15533081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10711828 - 10711781
Alignment:
Q  99 atgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10711828 atgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgtta 10711781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10925598 - 10925551
Alignment:
Q  99 atgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10925598 atgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgtta 10925551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14047344 - 14047266
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgt 144  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  14047344 agttgataagttgtattttattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tattaatacgaattaatgatgttgt 14047266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15223572 - 15223479
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  || |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15223572 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 15223479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 30145809 - 30145732
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgtt 142  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| || || ||||||||    
T  30145809 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt 30145732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 8928965 - 8929097
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  8928965 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 8929063  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  8929064 ttacgaattaatgatgttcttatgttgtatatga 8929097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 12853461 - 12853593
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  12853461 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgtta 12853559  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12853560 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 12853593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 17348825 - 17348957
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| | |||    
T  17348825 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatatttggtggagaaatgtta 17348923  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17348924 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 17348957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12337237 - 12337106
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  12337237 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtagagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 12337140  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12337139 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 12337106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 10835039 - 10835170
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| || | |||    
T  10835039 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatttatgagttgttaatgagatgcttggtggataa-tgtta 10835136  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10835137 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 10835170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 11301763 - 11301894
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |||    
T  11301763 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctattgtgatgcttggtggagaaatgtta 11301860  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11301861 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 11301894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13435799 - 13435706
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13435799 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttcaattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaat 13435706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15463904 - 15463811
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15463904 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 15463811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18899431 - 18899300
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  18899431 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctgagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tatta 18899334  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18899333 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 18899300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Original strand, 23372641 - 23372766
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  23372641 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 23372738  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgt 152  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23372739 atacgaattaatgatgttgttatgttgt 23372766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23173323 - 23173230
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23173323 agttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgttaatacgaattaatgatgttgttatgttgtatatgat 23173230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41112 - 40975
Alignment:
Q  28 gaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttatta 127  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  41112 gaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgttaata 41015  T
Q  128 cgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
    ||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  41014 cgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 40975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3801951 - 3801820
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  3801951 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 3801854  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3801853 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 3801820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 51299514 - 51299395
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  51299514 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 51299417  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  51299416 atacgaattaatgatgttgtta 51299395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54519578 - 54519447
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  54519578 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcatctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 54519481  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  54519480 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 54519447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 38312955 - 38313085
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  38312955 gatgaatatt-attattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 38313051  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38313052 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 38313085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9532239 - 9532108
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  9532239 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 9532141  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9532140 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 9532108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 14764893 - 14765024
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  14764893 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 14764991  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14764992 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 14765024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16795484 - 16795418
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgat 92  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16795484 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgat 16795418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 158
Target Start/End: Original strand, 20249980 - 20250073
Alignment:
Q  64 tagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20249980 tagttgctaagttgtcctatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgttaatacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 20250073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 29546036 - 29546160
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||   ||||||| ||||||||  || |||||||| ||| ||||||  || ||||||||||| | |||    
T  29546036 gatgaataattattattatgaaatgatgatg-ttatgtatagttgttaagttgtactctattcatgagttgttaatgaggtgtttggtggagaa-tgtta 29546133  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttg 151  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29546134 atacgaattaatgatgttgttatgttg 29546160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 4590236 - 4590295
Alignment:
Q  99 atgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4590236 atgagatgcttggtggagaaatgttattacaaattaatgatgttgttatgttgtatatga 4590295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5219873 - 5219780
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| | | ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5219873 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 5219780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13435844 - 13435767
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgtt 142  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| || || ||||||||    
T  13435844 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt 13435767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14664451 - 14664358
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |  ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14664451 agttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 14664358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14667615 - 14667522
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |  ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14667615 agttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 14667522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18804 - 18672
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  18804 gatgaataattgttattataaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgaaatgcttggtggaggaatgtta 18706  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18705 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 18672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 25665 - 25797
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  25665 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtctcctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 25763  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25764 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 25797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 37630 - 37762
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  37630 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 37727  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37728 atatgaattaatgatgttgttacgttgtatatgat 37762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5806 - 5687
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5806 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgaaatgcttggtggagaaatgtta 5709  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  5708 ttacgaattaatgatgttgtta 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Original strand, 22132196 - 22132312
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  22132196 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagatgctaagttgtcttccattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 22132294  T
Q  125 ttacgagttaatgatgtt 142  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22132295 ttacgaattaatgatgtt 22132312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29533868 - 29533736
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  29533868 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 29533771  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatgat 159  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29533770 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatgat 29533736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32649048 - 32648917
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  32649048 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 32648951  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32648950 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 32648917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16370906 - 16370775
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  16370906 gatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttatattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 16370809  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16370808 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 16370775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 20439250 - 20439381
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  20439250 gatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 20439347  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20439348 atacgaattaatgatgtagttatgttgtatatga 20439381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 41801331 - 41801423
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  41801331 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatattattacgaattaa-gatgttgttatgttgtatatga 41801423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33796059 - 33795966
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33796059 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 33795966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29533913 - 29533836
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgtt 142  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| || || ||||||||    
T  29533913 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt 29533836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 540
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  672 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttttattcatgaatcgataatgagatgcttggtggagaaatgtta 574  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  573 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 8837 - 8957
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||    
T  8837 gatgaataattattattataaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggaaaaatgtta 8935  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  8936 ttacgaattaaagatgttgtta 8957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 918 - 1037
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  918 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagtttctaagttgtcttctatt-atgatttgctaatgtgatgcttggtggagaaatgtta 1015  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  1016 ttacgaattaatgatgttgtta 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 224240 - 224371
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||| | |||    
T  224240 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtagagaa-tgtta 224337  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  224338 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 224371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 70736 - 70605
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  70736 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtataattgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgtta 70639  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  70638 ttacgaattaatgatgtcgttatgttgtatatga 70605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 21074605 - 21074736
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  21074605 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgttttctattcatgaattgttaatgagatgcttggtggagaa-tgtta 21074702  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     || || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21074703 atatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 21074736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9240655 - 9240525
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||  || |    
T  9240655 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaacgttaa 9240557  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatg 157  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9240556 t-acgaattaatgatgttgttacgttgtttatg 9240525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37379017 - 37378877
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | |||    
T  37379017 gatgaaaaattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaatgaggtgcttggtggagaa-tgtta 37378920  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtt---acgttgtttatgatatcga 164  Q
     ||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  37378919 atacgaattaatgatgctgttatgatgttgtttatgatatcga 37378877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6481765 - 6481634
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  6481765 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 6481667  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6481666 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 6481634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6485232 - 6485101
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  6485232 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 6485134  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6485133 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 6485101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 10686344 - 10686475
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||| || |    
T  10686344 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgctaggtggagaatgttaa 10686442  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
      | || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10686443 c-atgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 10686475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 19663655 - 19663774
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  19663655 gatgaataattattattatgaaatgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 19663752  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  19663753 atacgaattaatgatgttgtta 19663774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20260238 - 20260119
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| | |||    
T  20260238 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagttgttaataaggtgcttagtggagaa-tgtta 20260141  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  20260140 atacgaattaatgatgttgtta 20260119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9784020 - 9783955
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacga 130  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  9784020 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatcttattacga 9783955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33918 - 33787
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  33918 gatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttatatccatgagttgttaatgagatgcttggtggag-attgtta 33821  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  33820 atacgaattaatgatgtcgttatgttgtgtatga 33787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28455 - 28361
Alignment:
Q  63 atagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28455 atagttgctaagttgtcttatatccatgagttgttaatgagatgcttggtggag-attgttaatacgaattaatgatgtcgttatgttgtgtatga 28361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 109582 - 109451
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  109582 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 109485  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  109484 atacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 109451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 74384 - 74465
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  74384 agttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgttgtta 74465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21477
Alignment:
Q  71 taagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  21390 taagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgacgttgttatgttgtatatga 21477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 30 - 149
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  30 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 127  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  128 atacgaattaatgatgttgtta 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 3614 - 3733
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | |||    
T  3614 gatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtta 3711  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
     || || |||||||||||||||    
T  3712 atatgaattaatgatgttgtta 3733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11627
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||  |||||||||| |||| | |||    
T  11758 gatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgcgaagttgtcttctatt-ataagttgctaatgtgatgcttggtgaagaaatgtta 11661  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11660 ttacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 11627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 10919 - 11051
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgat-gacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| | ||    
T  10919 gatgaataattattattatgaaatgattgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtggagaa-tgtt 11016  T
Q  124 attacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11017 aatacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 11051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7106
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7013 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttagtgaagaaatgttattacgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 115442 - 115561
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  115442 gatgaataagtatttttatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctatt-atgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgtta 115539  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    |||| | || ||||||| ||||    
T  115540 ttacaaattgatgatgtggtta 115561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 181 - 50
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  || |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |  ||||||||| |||| | |||    
T  181 gatgaataattattattatgtaatgatgatgtt-acgtattgttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaataaggtgcttggtgtagaa-tgtta 84  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  83 atacgaattaatgatgtagttatgttgtatatga 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5223 - 5098
Alignment:
Q  25 gatgaatatttattattatgaactgatgacgtttactaatagttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaattttta 124  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |||| || ||||| |||  ||| |  ||||||||||||||| || |    
T  5223 gatgaataattattatgatgaattgatgatgtt-acatatagttgttaagttgccttctatacatgagttgtgaataaggtgcttggtggagaatgttaa 5125  T
Q  125 ttacgagttaatgatgttgttacgttgt 152  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  5124 t-acgaattaatgatgttgttatgttgt 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 5583 - 5664
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgtta 146  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  5583 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaattaatgatgttgtta 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14870 - 14777
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | |||| |||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  14870 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatattgttatgttgtatatga 14777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 11112 - 11205
Alignment:
Q  65 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgagttaatgatgttgttacgttgtttatga 158  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||| ||| || | ||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11112 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgttgttatgttgtatatga 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1116 times since January 2019
Visitors: 6710